SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_084932454.1 NCBI__GCF_002095475.1:WP_084932454.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4xgiA Crystal structure of glutamate dehydrogenase from burkholderia thailandensis
63% identity, 99% coverage: 6:424/424 of query aligns to 4:416/416 of 4xgiA

query
sites
4xgiA
S
 
S
Y
 
Y
V
 
L
S
 
H
E
 
A
D
 
D
P
 
D
H
 
L
S
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
G
T
 
N
Y
 
Y
L
 
L
A
 
Q
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
A
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
S
L
 
L
S
 
S
R
 
R
W
 
W
A
 
I
D
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
K
H
 
R
P
 
P
K
 
K
R
 
R
A
 
I
F
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
V
P
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
L
D
 
D
D
 
N
G
 
G
T
 
T
V
 
V
R
 
A
H
 
H
F
 
F
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
N
 
N
L
 
V
S
 
S
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
G
K
|
K
G
 
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
Q
D
 
D
V
 
V
N
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
A
W
 
W
M
|
M
T
 
S
V
 
V
K
|
K
C
 
N
A
 
A
V
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
V
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
S
I
 
R
K
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
V
T
 
T
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
G
 
G
N
 
I
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Q
 
N
R
 
T
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
V
|
V
G
 
N
T
 
T
N
 
N
A
 
E
Q
 
Q
V
 
I
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
T
W
 
Y
S
 
S
M
 
M
N
 
N
A
 
Q
G
 
G
A
 
Q
T
 
T
S
 
A
T
 
T
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
|
R
V
 
K
T
 
E
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
V
T
 
V
G
 
G
R
 
C
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
K
I
 
K
G
 
G
L
 
V
T
 
E
V
 
I
E
 
E
R
 
G
S
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
|
G
F
 
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
S
 
G
V
 
I
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
L
F
 
F
Q
 
Q
E
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
V
V
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
D
|
D
H
|
H
S
 
T
T
 
G
T
 
T
L
 
I
W
 
H
N
 
Q
N
 
P
E
 
A
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
T
P
 
A
A
 
K
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
W
 
H
Q
 
V
Q
 
G
K
 
R
H
 
T
G
 
G
A
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
P
I
 
M
S
 
P
S
 
N
E
 
D
D
 
E
F
 
F
W
 
W
L
 
T
K
 
V
D
 
E
F
 
T
D
 
E
I
 
I
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
|
A
A
|
A
L
 
L
E
 
E
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
K
R
 
N
A
 
A
H
 
S
K
 
K
L
 
I
T
 
R
C
 
T
K
 
K
L
 
I
V
 
I
L
 
V
E
 
E
G
 
G
A
|
A
N
|
N
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
T
E
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
A
R
 
N
G
 
G
V
 
V
T
 
L
I
 
V
V
 
I
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
I
C
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
-
F
 
-
S
 
-
S
 
-
Y
 
-
F
 
-
W
 
W
G
 
T
E
 
E
D
 
D
E
 
E
I
 
I
N
 
N
S
 
H
R
 
R
L
 
L
D
 
E
M
 
R
I
 
V
M
 
M
S
 
R
Q
 
E
A
 
A
F
 
F
E
 
A
A
 
G
V
 
V
W
 
W
Q
 
A
K
 
V
A
 
A
E
 
E
S
 
E
L
 
H
G
 
K
V
 
V
T
 
S
L
 
V
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
F
A
 
I
V
 
V
G
 
A
C
 
C
E
 
K
R
 
R
I
 
I
L
 
L
I
 
M
A
 
A
R
 
R
K
 
E
E
 
M
R
 
R
G
 
G
I
 
L
Y
 
Y
P
 
P

3aoeB Crystal structure of hetero-hexameric glutamate dehydrogenase from thermus thermophilus (leu bound form)
60% identity, 100% coverage: 2:424/424 of query aligns to 3:424/424 of 3aoeB

query
sites
3aoeB
S
 
S
K
 
E
P
 
P
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
V
 
L
S
 
G
E
 
K
D
 
D
P
 
-
H
 
G
S
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
E
T
 
I
Y
 
F
L
 
T
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
P
W
 
L
A
 
A
D
 
E
T
 
S
L
 
L
R
 
K
H
 
R
P
 
P
K
 
K
R
 
R
A
 
V
F
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
V
P
 
P
L
 
V
E
 
R
M
 
L
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
V
R
 
A
H
 
Y
F
 
F
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
Q
 
H
H
 
H
N
 
N
L
 
T
S
x
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
G
W
 
W
M
 
M
T
 
T
V
 
I
K
 
K
C
 
N
A
 
A
V
 
A
I
 
V
N
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
S
I
 
P
K
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
G
 
G
N
 
I
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
D
R
 
R
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
N
T
 
T
N
 
G
A
 
E
Q
 
R
V
 
E
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
T
W
 
Y
S
 
S
M
 
M
N
 
N
A
 
V
G
 
G
A
 
R
T
 
T
S
 
V
T
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
R
T
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
A
R
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
E
N
 
K
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
Q
V
 
V
E
 
E
R
 
G
S
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
S
 
N
V
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
R
L
 
A
F
 
F
Q
 
H
E
 
D
A
 
H
G
 
G
A
 
A
H
 
R
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
H
 
H
S
 
T
T
 
G
T
 
T
L
 
V
W
 
Y
N
 
N
N
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
P
P
 
Y
A
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
R
W
 
H
Q
 
V
Q
 
Q
K
 
E
H
 
F
G
 
G
A
 
G
I
 
V
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
G
 
K
A
 
A
R
 
E
V
 
P
I
 
L
S
 
P
S
 
A
E
 
A
D
 
D
F
 
F
W
 
W
L
 
G
K
 
L
D
 
P
F
 
V
D
 
E
I
 
F
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
Q
R
 
N
A
 
A
H
 
W
K
 
R
L
 
I
T
 
R
C
 
A
K
 
R
L
 
I
V
 
V
L
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
P
E
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
L
Q
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
L
I
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
I
C
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
S
 
N
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
W
 
W
G
 
T
E
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
I
N
 
N
S
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
E
M
 
R
I
 
V
M
 
L
S
 
R
Q
 
N
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
A
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
K
 
V
A
 
A
E
 
Q
S
 
E
L
 
K
G
 
K
V
 
I
T
 
P
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
V
 
V
G
 
A
C
 
A
E
 
T
R
 
R
I
 
V
L
 
L
I
 
E
A
 
A
R
|
R
K
 
A
E
 
L
R
|
R
G
|
G
I
 
L
Y
|
Y
P
 
P

3aogA Crystal structure of glutamate dehydrogenase (gdhb) from thermus thermophilus (glu bound form)
60% identity, 100% coverage: 3:424/424 of query aligns to 1:421/421 of 3aogA

query
sites
3aogA
K
 
E
P
 
P
L
 
L
S
 
S
Y
 
Y
V
 
L
S
 
G
E
 
K
D
 
D
P
 
-
H
 
G
S
 
G
P
 
P
W
 
W
A
 
E
T
 
I
Y
 
F
L
 
T
A
 
E
Q
 
Q
V
 
V
D
 
D
R
 
R
V
 
V
M
 
V
P
 
P
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
D
 
R
L
 
L
S
 
A
R
 
P
W
 
L
A
 
A
D
 
E
T
 
S
L
 
L
R
 
K
H
 
R
P
 
P
K
 
K
R
 
R
A
 
V
F
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
I
 
V
P
 
P
L
 
V
E
 
R
M
 
L
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
V
R
 
A
H
 
Y
F
 
F
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
V
 
V
Q
 
H
H
 
H
N
 
N
L
 
T
S
x
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
A
K
 
K
G
 
G
G
|
G
I
 
V
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
E
V
 
V
M
 
M
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
G
W
 
W
M
|
M
T
 
T
V
 
I
K
 
K
C
 
N
A
 
A
V
 
A
I
 
V
N
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
R
E
 
K
L
 
L
S
 
S
I
 
P
K
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
R
Y
 
Y
T
 
T
S
 
S
E
 
E
I
 
I
G
 
G
N
 
I
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
Q
 
D
R
 
R
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
|
P
D
|
D
V
 
V
G
 
N
T
 
T
N
 
G
A
 
E
Q
 
R
V
 
E
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
M
M
 
M
D
|
D
T
 
T
W
 
Y
S
 
S
M
|
M
N
 
N
A
 
V
G
 
G
A
 
R
T
 
T
S
 
V
T
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
R
T
 
D
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
A
R
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
E
N
 
K
I
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
Q
V
 
V
E
 
E
R
 
G
S
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
S
 
N
V
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
R
L
 
A
F
 
F
Q
 
H
E
 
D
A
 
H
G
 
G
A
 
A
H
 
R
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
H
 
H
S
 
T
T
 
G
T
 
T
L
 
V
W
 
Y
N
 
N
N
 
E
E
 
A
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
P
P
 
Y
A
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
R
W
 
H
Q
 
V
Q
 
Q
K
 
E
H
 
F
G
 
G
A
 
G
I
 
V
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
G
 
K
A
 
A
R
 
E
V
 
P
I
 
L
S
 
P
S
 
A
E
 
A
D
 
D
F
 
F
W
 
W
L
 
G
K
 
L
D
 
P
F
 
V
D
 
E
I
 
F
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
K
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
Q
R
 
N
A
 
A
H
 
W
K
 
R
L
 
I
T
 
R
C
 
A
K
 
R
L
 
I
V
 
V
L
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
P
E
 
A
A
 
A
D
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
L
Q
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
L
I
 
V
V
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
I
C
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
D
F
 
F
S
 
N
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
W
 
W
G
 
T
E
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
I
N
 
N
S
 
A
R
 
R
L
 
L
D
 
E
M
 
R
I
 
V
M
 
L
S
 
R
Q
 
N
A
 
A
F
 
F
E
 
E
A
 
A
V
 
V
W
 
W
Q
 
Q
K
 
V
A
 
A
E
 
Q
S
 
E
L
 
K
G
 
K
V
 
I
T
 
P
L
 
L
R
 
R
T
 
T
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
V
 
V
G
 
A
C
 
A
E
 
T
R
 
R
I
 
V
L
 
L
I
 
E
A
 
A
R
 
R
K
 
A
E
 
L
R
|
R
G
|
G
I
x
L
Y
|
Y
P
 
P

8xd5A Cryo-em structure of glutamate dehydrogenase from thermococcus profundus in complex with NADP and glu in the steady stage of reaction (see paper)
47% identity, 96% coverage: 14:421/424 of query aligns to 5:415/419 of 8xd5A

query
sites
8xd5A
S
 
D
P
 
P
W
 
F
A
 
E
T
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
E
R
 
R
V
 
A
M
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
G
 
-
D
 
D
L
 
I
S
 
S
R
 
E
W
 
E
A
 
A
-
 
L
D
 
E
T
 
W
L
 
L
R
 
K
H
 
K
P
 
P
K
 
M
R
 
R
A
 
I
F
 
V
I
 
E
V
 
V
D
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
V
R
 
K
H
 
V
F
 
F
E
 
T
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
N
 
N
L
 
W
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
T
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
|
R
Y
 
W
H
 
H
P
 
P
D
 
A
V
 
E
N
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
T
V
 
V
M
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
T
W
 
W
M
|
M
T
 
T
V
 
W
K
 
K
C
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
I
V
 
V
D
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
I
 
E
K
 
R
E
 
E
L
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
A
Y
 
Y
T
 
I
S
 
R
E
 
A
I
 
V
G
 
Y
N
 
D
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Q
 
W
R
 
T
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
V
|
V
G
x
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
P
Q
 
K
V
 
I
M
 
M
A
 
G
W
 
W
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
E
-
 
T
-
 
I
M
 
M
N
 
R
A
 
R
G
 
K
A
 
G
T
 
P
S
 
A
T
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
G
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
A
F
 
I
V
 
F
T
 
T
G
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
D
V
 
L
E
 
K
R
 
G
S
 
K
R
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
x
Y
G
|
G
N
|
N
V
x
A
G
 
G
S
 
Y
V
 
Y
A
 
T
V
 
A
G
 
K
L
 
L
F
 
A
Q
 
K
E
 
E
A
 
Q
-
 
L
G
 
G
A
 
M
H
 
T
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
S
S
 
R
T
 
G
T
 
G
L
 
I
W
 
Y
N
 
N
N
 
P
E
 
D
G
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
P
P
 
D
A
 
E
L
 
V
Q
 
L
S
 
K
W
 
W
Q
x
K
Q
 
R
K
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
S
I
 
V
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
N
I
 
I
S
 
T
S
x
N
E
 
E
D
 
E
F
 
L
W
 
L
L
 
E
K
 
L
D
 
E
F
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
A
P
 
P
A
|
A
A
|
A
L
x
I
E
 
E
G
 
E
Q
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
K
R
 
N
A
 
A
H
 
D
K
 
N
L
 
I
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
I
V
 
V
L
 
A
E
 
E
G
 
V
A
 
A
N
|
N
G
 
G
P
 
P
T
 
V
L
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
A
D
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
D
 
D
V
 
F
L
 
L
C
 
C
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
N
S
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
W
 
W
G
 
T
E
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
V
N
 
R
S
 
E
R
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
K
I
 
K
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
W
A
 
E
V
 
V
W
 
Y
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
E
 
K
S
 
D
L
 
K
G
 
N
V
 
I
T
 
H
L
 
M
R
 
R
T
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
V
 
V
G
 
A
C
 
V
E
 
S
R
 
R
I
 
V
L
 
Y
I
 
Q
A
 
A
R
 
M
K
 
K
E
 
D
R
 
R
G
 
G

8xcsA Cryo-em structure of glutamate dehydrogenase from thermococcus profundus in complex with NADPH, akg and nh4 in the initial stage of reaction (see paper)
47% identity, 96% coverage: 14:421/424 of query aligns to 4:414/418 of 8xcsA

query
sites
8xcsA
S
 
D
P
 
P
W
 
F
A
 
E
T
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
E
R
 
R
V
 
A
M
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
G
 
-
D
 
D
L
 
I
S
 
S
R
 
E
W
 
E
A
 
A
-
 
L
D
 
E
T
 
W
L
 
L
R
 
K
H
 
K
P
 
P
K
 
M
R
 
R
A
 
I
F
 
V
I
 
E
V
 
V
D
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
V
R
 
K
H
 
V
F
 
F
E
 
T
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
N
 
N
L
 
W
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
T
K
|
K
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
|
R
Y
 
W
H
 
H
P
 
P
D
 
A
V
 
E
N
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
T
V
 
V
M
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
T
W
 
W
M
|
M
T
 
T
V
 
W
K
|
K
C
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
G
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
I
V
 
V
D
 
N
P
 
P
R
x
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
I
 
E
K
 
R
E
 
E
L
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
A
Y
 
Y
T
 
I
S
 
R
E
 
A
I
 
V
G
 
Y
N
 
D
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Q
 
W
R
 
T
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
|
A
P
|
P
D
|
D
V
|
V
G
x
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
P
Q
 
K
V
 
I
M
 
M
A
 
G
W
 
W
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
E
-
 
T
-
 
I
M
 
M
N
 
R
A
 
R
G
 
K
A
 
G
T
 
P
S
 
A
T
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
G
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
A
F
 
I
V
 
F
T
 
T
G
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
D
V
 
L
E
 
K
R
 
G
S
 
K
R
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
x
Y
G
|
G
N
|
N
V
x
A
G
 
G
S
 
Y
V
 
Y
A
 
T
V
 
A
G
 
K
L
 
L
F
 
A
Q
 
K
E
 
E
A
 
Q
-
 
L
G
 
G
A
 
M
H
 
T
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
S
S
 
R
T
 
G
T
 
G
L
 
I
W
 
Y
N
 
N
N
 
P
E
 
D
G
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
P
P
 
D
A
 
E
L
 
V
Q
 
L
S
 
K
W
 
W
Q
x
K
Q
 
R
K
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
S
I
 
V
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
N
E
 
E
D
 
E
F
 
L
W
 
L
L
 
E
K
 
L
D
 
E
F
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
A
P
 
P
A
 
A
A
|
A
L
x
I
E
 
E
G
 
E
Q
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
K
R
 
N
A
 
A
H
 
D
K
 
N
L
 
I
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
I
V
 
V
L
 
A
E
 
E
G
 
V
A
 
A
N
|
N
G
 
G
P
 
P
T
 
V
L
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
A
D
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
D
 
D
V
 
F
L
 
L
C
 
C
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
|
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
N
S
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
W
 
W
G
 
T
E
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
V
N
 
R
S
 
E
R
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
K
I
 
K
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
W
A
 
E
V
 
V
W
 
Y
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
E
 
K
S
 
D
L
 
K
G
 
N
V
 
I
T
 
H
L
 
M
R
 
R
T
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
V
 
V
G
 
A
C
 
V
E
 
S
R
 
R
I
 
V
L
 
Y
I
 
Q
A
 
A
R
 
M
K
 
K
E
 
D
R
 
R
G
 
G

P39633 Catabolic NAD-specific glutamate dehydrogenase RocG; NAD-GDH; Glutamate dehydrogenase; GlutDH; Trigger enzyme RocG; EC 1.4.1.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see 2 papers)
46% identity, 95% coverage: 18:421/424 of query aligns to 23:422/424 of P39633

query
sites
P39633
T
 
T
Y
 
I
L
 
I
A
 
K
Q
x
E
V
 
A
D
 
L
R
 
R
V
 
K
M
 
L
P
 
G
Y
 
Y
L
 
P
G
 
G
D
 
D
L
 
M
S
 
Y
R
 
-
W
 
-
A
 
-
D
 
E
T
 
L
L
 
M
R
 
K
H
 
E
P
 
P
K
 
Q
R
 
R
A
 
M
F
 
L
I
 
T
V
 
V
D
 
R
I
 
I
P
 
P
L
 
V
E
 
K
M
 
M
D
 
D
D
 
N
G
 
G
T
 
S
V
 
V
R
 
K
H
 
V
F
 
F
E
 
T
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
V
 
S
Q
 
Q
H
 
H
N
 
N
L
 
D
S
 
A
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
T
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
Y
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
N
L
 
E
E
 
E
E
|
E
V
 
V
M
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
I
W
 
W
M
 
M
T
 
T
V
 
L
K
 
K
C
 
C
A
 
G
V
 
I
I
 
A
N
 
N
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
I
V
 
C
D
|
D
P
 
P
R
 
R
E
 
T
L
 
M
S
 
S
I
 
F
K
 
G
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
S
R
 
R
R
 
G
Y
 
Y
T
 
V
S
 
R
E
 
A
I
 
I
G
 
S
N
x
Q
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
P
Q
 
T
R
 
K
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
G
x
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
I
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
R
N
 
L
A
 
R
G
 
E
A
 
F
T
 
D
S
 
S
T
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
Q
G
 
G
R
 
R
V
 
E
T
 
T
A
 
A
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
V
F
 
T
V
 
I
T
 
C
G
 
I
R
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
V
K
 
K
N
 
K
I
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
K
V
 
L
E
 
Q
R
 
N
S
 
A
R
 
R
V
 
I
A
 
I
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
S
|
S
V
 
F
A
 
L
V
 
A
G
 
K
L
 
F
F
 
M
Q
 
H
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
V
V
 
I
A
 
G
V
 
I
Q
 
S
D
 
D
H
 
A
S
 
N
T
 
G
T
 
G
L
 
L
W
 
Y
N
 
N
N
 
P
E
 
D
G
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
W
 
K
Q
 
R
Q
 
D
K
 
S
H
 
F
G
 
G
A
 
M
I
 
V
A
 
T
G
 
N
F
 
L
P
 
-
G
 
F
A
 
T
R
 
D
V
 
V
I
 
I
S
 
T
S
 
N
E
 
E
D
 
E
F
 
L
W
 
L
L
 
E
K
 
K
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
S
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
A
E
 
K
R
 
N
A
 
A
H
 
H
K
 
N
L
 
I
T
 
Q
C
 
A
K
 
S
L
 
I
V
 
V
L
 
V
E
 
E
G
x
A
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
I
E
 
D
A
 
A
D
 
T
D
 
K
I
 
I
L
 
L
R
 
N
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
V
 
V
T
 
L
I
 
L
V
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
A
N
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
N
S
 
Q
S
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
W
 
W
G
 
S
E
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
V
N
 
A
S
 
E
R
 
K
L
 
L
D
 
R
M
 
S
I
 
V
M
 
M
S
 
V
Q
 
S
A
 
S
F
 
F
E
 
E
A
 
T
V
 
I
W
 
Y
Q
 
Q
K
 
T
A
 
A
E
 
A
S
 
T
L
 
H
G
 
K
V
 
V
T
 
D
L
 
M
R
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
M
V
 
T
G
 
G
C
 
I
E
 
R
R
 
K
I
 
S
L
 
A
I
 
E
A
 
A
R
 
S
K
 
R
E
 
F
R
 
R
G
 
G

8xcoA Cryo-em structure of glutamate dehydrogenase from thermococcus profundus incorporating NADPH in the initial stage of reaction (see paper)
47% identity, 96% coverage: 14:421/424 of query aligns to 2:412/416 of 8xcoA

query
sites
8xcoA
S
 
D
P
 
P
W
 
F
A
 
E
T
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
E
R
 
R
V
 
A
M
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
G
 
-
D
 
D
L
 
I
S
 
S
R
 
E
W
 
E
A
 
A
-
 
L
D
 
E
T
 
W
L
 
L
R
 
K
H
 
K
P
 
P
K
 
M
R
 
R
A
 
I
F
 
V
I
 
E
V
 
V
D
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
V
R
 
K
H
 
V
F
 
F
E
 
T
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
N
 
N
L
 
W
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
T
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
W
H
 
H
P
 
P
D
 
A
V
 
E
N
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
T
V
 
V
M
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
T
W
 
W
M
 
M
T
 
T
V
 
W
K
 
K
C
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
I
V
 
V
D
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
I
 
E
K
 
R
E
 
E
L
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
A
Y
 
Y
T
 
I
S
 
R
E
 
A
I
 
V
G
 
Y
N
 
D
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Q
 
W
R
 
T
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
G
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
P
Q
 
K
V
 
I
M
 
M
A
 
G
W
 
W
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
E
-
 
T
-
 
I
M
 
M
N
 
R
A
 
R
G
 
K
A
 
G
T
 
P
S
 
A
T
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
G
T
 
T
A
 
A
T
|
T
G
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
A
F
 
I
V
 
F
T
 
T
G
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
D
V
 
L
E
 
K
R
 
G
S
 
K
R
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
x
Y
G
|
G
N
|
N
V
x
A
G
 
G
S
 
Y
V
 
Y
A
 
T
V
 
A
G
 
K
L
 
L
F
 
A
Q
 
K
E
 
E
A
 
Q
-
 
L
G
 
G
A
 
M
H
 
T
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
S
S
 
R
T
 
G
T
 
G
L
 
I
W
 
Y
N
 
N
N
 
P
E
 
D
G
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
P
P
 
D
A
 
E
L
 
V
Q
 
L
S
 
K
W
 
W
Q
x
K
Q
 
R
K
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
S
I
 
V
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
N
E
 
E
D
 
E
F
 
L
W
 
L
L
 
E
K
 
L
D
 
E
F
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
A
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
x
I
E
 
E
G
 
E
Q
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
K
R
 
N
A
 
A
H
 
D
K
 
N
L
 
I
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
I
V
 
V
L
 
A
E
 
E
G
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
V
L
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
A
D
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
D
 
D
V
 
F
L
 
L
C
 
C
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
N
S
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
W
 
W
G
 
T
E
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
V
N
 
R
S
 
E
R
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
K
I
 
K
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
W
A
 
E
V
 
V
W
 
Y
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
E
 
K
S
 
D
L
 
K
G
 
N
V
 
I
T
 
H
L
 
M
R
 
R
T
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
V
 
V
G
 
A
C
 
V
E
 
S
R
 
R
I
 
V
L
 
Y
I
 
Q
A
 
A
R
 
M
K
 
K
E
 
D
R
 
R
G
 
G

8zneA Cryo-em structure of w89f mutated glutamate dehydrogenase from thermococcus profundus in complex with NADP and glu in the steady stage of reaction
47% identity, 96% coverage: 14:421/424 of query aligns to 2:412/416 of 8zneA

query
sites
8zneA
S
 
D
P
 
P
W
 
F
A
 
E
T
 
M
Y
 
A
L
 
V
A
 
K
Q
 
Q
V
 
L
D
 
E
R
 
R
V
 
A
M
 
A
P
 
Q
Y
 
Y
L
 
M
G
 
-
D
 
D
L
 
I
S
 
S
R
 
E
W
 
E
A
 
A
-
 
L
D
 
E
T
 
W
L
 
L
R
 
K
H
 
K
P
 
P
K
 
M
R
 
R
A
 
I
F
 
V
I
 
E
V
 
V
D
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
I
E
 
E
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
V
R
 
K
H
 
V
F
 
F
E
 
T
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
N
 
N
L
 
W
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
T
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
W
H
 
H
P
 
P
D
 
A
V
 
E
N
 
T
L
 
L
E
 
S
E
 
T
V
 
V
M
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
T
W
 
F
M
|
M
T
 
T
V
 
W
K
|
K
C
 
V
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
I
V
 
V
D
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
E
L
 
L
S
 
S
I
 
E
K
 
R
E
 
E
L
 
Q
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
R
R
 
A
Y
 
Y
T
 
I
S
 
R
E
 
A
I
 
V
G
 
Y
N
 
D
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
Q
 
W
R
 
T
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
V
 
V
G
 
Y
T
 
T
N
 
N
A
 
P
Q
 
K
V
 
I
M
 
M
A
 
G
W
 
W
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
E
-
 
T
-
 
I
M
 
M
N
 
R
A
 
R
G
 
K
A
 
G
T
 
P
S
 
A
T
 
F
G
 
G
V
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
S
L
 
I
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
G
T
 
T
A
 
A
T
 
T
G
 
A
R
 
Q
G
 
G
V
 
A
F
 
I
V
 
F
T
 
T
G
 
I
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
A
I
 
L
G
 
G
L
 
I
T
 
D
V
 
L
E
 
K
R
 
G
S
 
K
R
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
|
G
F
x
Y
G
|
G
N
|
N
V
x
A
G
 
G
S
 
Y
V
 
Y
A
 
T
V
 
A
G
 
K
L
 
L
F
 
A
Q
 
K
E
 
E
A
 
Q
-
 
L
G
 
G
A
 
M
H
 
T
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
S
S
 
R
T
 
G
T
 
G
L
 
I
W
 
Y
N
 
N
N
 
P
E
 
D
G
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
P
P
 
D
A
 
E
L
 
V
Q
 
L
S
 
K
W
 
W
Q
 
K
Q
 
R
K
 
E
H
 
H
G
 
G
A
 
S
I
 
V
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
T
V
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
N
E
 
E
D
 
E
F
 
L
W
 
L
L
 
E
K
 
L
D
 
E
F
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
A
P
 
P
A
 
A
A
|
A
L
x
I
E
 
E
G
 
E
Q
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
K
R
 
N
A
 
A
H
 
D
K
 
N
L
 
I
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
I
V
 
V
L
 
A
E
 
E
G
 
V
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
V
L
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
A
D
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
R
 
R
Q
 
E
R
 
K
G
 
G
V
 
I
T
 
L
I
 
Q
V
 
I
P
 
P
D
 
D
V
 
F
L
 
L
C
 
C
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
N
S
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
W
 
W
G
 
T
E
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
V
N
 
R
S
 
E
R
 
K
L
 
L
D
 
D
M
 
K
I
 
K
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
W
A
 
E
V
 
V
W
 
Y
Q
 
N
K
 
T
A
 
H
E
 
K
S
 
D
L
 
K
G
 
N
V
 
I
T
 
H
L
 
M
R
 
R
T
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
V
 
V
G
 
A
C
 
V
E
 
S
R
 
R
I
 
V
L
 
Y
I
 
Q
A
 
A
R
 
M
K
 
K
E
 
D
R
 
R
G
 
G

6yeiF Arabidopsis thaliana glutamate dehydrogenase isoform 1 in complex with NAD (see paper)
48% identity, 92% coverage: 30:421/424 of query aligns to 18:408/410 of 6yeiF

query
sites
6yeiF
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
L
A
 
E
D
 
K
T
x
S
L
|
L
R
 
L
H
x
I
P
|
P
K
x
F
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
L
R
 
A
H
 
S
F
 
F
E
 
V
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
|
K
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
|
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
|
M
T
 
T
V
 
W
K
|
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
A
N
 
K
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
D
P
 
P
R
 
S
E
 
K
L
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
T
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
V
x
M
G
 
G
T
 
T
N
 
G
A
 
P
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
Y
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
D
T
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
M
V
 
F
T
 
G
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
L
K
 
N
N
 
E
I
 
H
G
 
G
L
 
K
T
 
T
V
 
I
E
 
S
R
 
G
S
 
Q
R
 
R
V
 
F
A
 
V
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
L
F
 
I
Q
 
S
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
I
S
 
T
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
K
N
 
N
N
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
S
 
K
W
 
H
Q
 
T
Q
 
K
K
 
E
H
 
H
G
 
R
A
 
G
I
 
V
A
 
K
G
 
G
F
 
F
P
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
P
I
 
I
S
 
D
S
 
P
E
 
N
D
 
S
F
 
I
W
 
L
L
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
|
A
A
|
A
L
 
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
I
T
 
N
A
 
R
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
N
K
 
E
L
 
I
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
A
A
|
A
N
|
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
I
L
 
Y
C
 
A
N
|
N
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
|
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
E
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
D
R
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
T
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
R
A
 
S
F
 
F
E
 
K
A
 
D
V
 
L
W
 
K
Q
 
E
K
 
M
A
 
C
E
 
K
S
 
T
L
 
H
G
 
S
V
 
C
T
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
Q
A
 
A
R
 
T
K
 
I
E
 
L
R
 
R
G
 
G

6yeiA Arabidopsis thaliana glutamate dehydrogenase isoform 1 in complex with NAD (see paper)
48% identity, 92% coverage: 30:421/424 of query aligns to 17:407/409 of 6yeiA

query
sites
6yeiA
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
L
A
 
E
D
 
K
T
x
S
L
|
L
R
 
L
H
x
I
P
|
P
K
 
F
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
L
R
 
A
H
 
S
F
 
F
E
 
V
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
 
M
T
 
T
V
 
W
K
 
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
A
N
 
K
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
D
P
 
P
R
 
S
E
 
K
L
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
T
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
M
G
 
G
T
 
T
N
 
G
A
 
P
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
Y
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
D
T
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
M
V
 
F
T
 
G
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
L
K
 
N
N
 
E
I
 
H
G
 
G
L
 
K
T
 
T
V
 
I
E
 
S
R
 
G
S
 
Q
R
 
R
V
 
F
A
 
V
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
S
 
S
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
L
F
 
I
Q
 
S
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
I
S
 
T
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
K
N
 
N
N
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
S
 
K
W
 
H
Q
 
T
Q
 
K
K
 
E
H
 
H
G
 
R
A
 
G
I
 
V
A
 
K
G
 
G
F
 
F
P
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
P
I
 
I
S
 
D
S
 
P
E
 
N
D
 
S
F
 
I
W
 
L
L
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
A
A
|
A
L
|
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
I
T
 
N
A
 
R
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
N
K
 
E
L
 
I
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
A
A
|
A
N
|
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
I
L
 
Y
C
 
A
N
|
N
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
E
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
D
R
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
T
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
R
A
 
S
F
 
F
E
 
K
A
 
D
V
 
L
W
 
K
Q
 
E
K
 
M
A
 
C
E
 
K
S
 
T
L
 
H
G
 
S
V
 
C
T
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
Q
A
 
A
R
 
T
K
 
I
E
 
L
R
 
R
G
 
G

6yehA Arabidopsis thaliana glutamate dehydrogenase isoform 1 in apo form (see paper)
48% identity, 92% coverage: 30:421/424 of query aligns to 17:407/410 of 6yehA

query
sites
6yehA
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
L
A
 
E
D
 
K
T
x
S
L
|
L
R
 
L
H
x
I
P
|
P
K
 
F
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
L
R
 
A
H
 
S
F
 
F
E
 
V
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
N
x
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
 
M
T
 
T
V
 
W
K
 
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
A
N
 
K
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
D
P
 
P
R
 
S
E
 
K
L
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
T
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
M
G
 
G
T
 
T
N
 
G
A
 
P
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
Y
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
D
T
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
M
V
 
F
T
 
G
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
L
K
 
N
N
 
E
I
 
H
G
 
G
L
 
K
T
 
T
V
 
I
E
 
S
R
 
G
S
 
Q
R
 
R
V
 
F
A
 
V
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
L
F
 
I
Q
 
S
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
I
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
 
D
H
 
I
S
 
T
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
K
N
 
N
N
 
K
E
 
D
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
S
 
K
W
 
H
Q
 
T
Q
 
K
K
 
E
H
 
H
G
 
R
A
 
G
I
 
V
A
 
K
G
 
G
F
 
F
P
 
D
G
 
G
A
 
A
R
 
D
V
 
P
I
 
I
S
 
D
S
 
P
E
 
N
D
 
S
F
 
I
W
 
L
L
 
V
K
 
E
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
I
T
 
N
A
 
R
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
N
K
 
E
L
 
I
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
A
A
 
A
N
 
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
V
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
I
L
 
Y
C
 
A
N
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
E
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
D
R
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
T
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
R
A
 
S
F
 
F
E
 
K
A
 
D
V
 
L
W
 
K
Q
 
E
K
 
M
A
 
C
E
 
K
S
 
T
L
 
H
G
 
S
V
 
C
T
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
Q
A
 
A
R
 
T
K
 
I
E
 
L
R
 
R
G
 
G

P50735 Cryptic catabolic NAD-specific glutamate dehydrogenase GudB; NAD-GDH; EC 1.4.1.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
44% identity, 98% coverage: 7:421/424 of query aligns to 9:425/427 of P50735

query
sites
P50735
Y
 
H
V
 
T
S
 
E
E
 
E
D
 
D
P
 
K
H
 
L
S
 
D
P
 
V
W
 
L
A
 
K
T
 
S
Y
 
T
L
 
Q
A
 
T
Q
 
V
V
 
I
D
 
H
R
 
K
V
 
A
M
 
L
P
 
E
Y
 
K
L
 
L
G
 
G
D
 
Y
L
 
P
S
 
E
R
 
E
W
 
V
A
 
Y
D
 
E
T
 
L
L
 
L
R
 
K
H
 
E
P
 
P
K
 
M
R
 
R
A
 
L
F
 
L
I
 
T
V
 
V
D
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
V
E
 
R
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
V
R
 
K
H
 
I
F
 
F
E
 
T
G
 
G
F
 
Y
R
 
R
V
 
A
Q
 
Q
H
 
H
N
 
N
L
 
D
S
 
S
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
T
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
N
V
 
V
N
 
T
L
 
E
E
 
K
E
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
A
-
x
V
-
x
K
-
x
A
L
 
L
S
 
S
A
 
I
W
 
W
M
 
M
T
 
S
V
 
L
K
 
K
C
 
C
A
 
G
V
 
I
I
 
I
N
 
D
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
V
V
 
C
D
 
D
P
 
P
R
 
R
E
 
D
L
 
M
S
 
S
I
 
F
K
 
R
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
S
R
 
R
R
 
G
Y
 
Y
T
 
V
S
 
R
E
 
A
I
 
I
G
 
S
N
 
Q
I
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
P
Q
 
T
R
 
K
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
G
 
F
T
 
T
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
I
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
M
M
 
M
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
R
N
 
I
A
 
D
G
 
E
A
 
F
T
 
N
S
 
S
T
 
P
G
 
G
V
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
L
H
 
V
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
H
G
 
G
R
 
R
V
 
E
T
 
S
A
 
A
T
 
T
G
 
A
R
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
T
V
 
I
T
 
C
G
 
I
R
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
K
N
 
K
I
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
D
V
 
I
E
 
K
R
 
G
S
 
A
R
 
R
V
 
V
A
 
V
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
A
G
 
G
S
 
S
V
 
Y
A
 
L
V
 
A
G
 
K
L
 
F
F
 
M
Q
 
H
E
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
G
V
 
I
Q
 
S
D
 
D
H
 
A
S
 
Y
T
 
G
T
 
G
L
 
L
W
 
Y
N
 
D
N
 
P
E
 
E
G
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
P
 
D
A
 
Y
L
 
L
Q
 
L
S
 
D
W
 
R
Q
 
R
Q
 
D
K
 
S
H
 
F
G
 
G
A
 
T
I
 
V
A
 
T
G
 
K
F
 
L
P
 
F
G
 
N
A
 
D
R
 
T
V
 
I
I
 
T
S
 
N
S
 
Q
E
 
E
D
 
L
F
 
L
W
 
E
L
 
L
K
 
-
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
I
E
 
E
G
 
N
Q
 
Q
I
 
I
T
 
T
A
 
E
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
H
K
 
N
L
 
I
T
 
R
C
 
A
K
 
K
L
 
I
V
 
V
L
 
V
E
 
E
G
 
A
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
L
E
 
E
A
 
G
D
 
T
D
 
K
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
D
R
 
R
G
 
D
V
 
I
T
 
L
I
 
L
V
 
V
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
L
C
 
A
N
 
S
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
N
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
Y
W
 
W
G
 
S
E
 
E
D
 
E
E
 
E
I
 
V
N
 
E
S
 
E
R
 
K
L
 
L
D
 
E
M
 
K
I
 
M
M
 
M
S
 
V
Q
 
K
A
 
S
F
 
F
E
 
N
A
 
N
V
 
I
W
 
Y
Q
 
E
K
 
M
A
 
A
E
 
N
S
 
N
L
 
R
G
 
R
V
 
I
T
 
D
L
 
M
R
 
R
T
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
A
 
M
V
 
V
G
 
G
C
 
V
E
 
R
R
 
K
I
 
M
L
 
A
I
 
E
A
 
A
R
 
S
K
 
R
E
 
F
R
 
R
G
 
G

P28997 NAD-specific glutamate dehydrogenase; NAD-GDH; EC 1.4.1.2 from Peptoniphilus asaccharolyticus (Peptostreptococcus asaccharolyticus) (see 2 papers)
46% identity, 91% coverage: 38:423/424 of query aligns to 30:421/421 of P28997

query
sites
P28997
D
 
E
T
 
L
L
 
L
R
 
K
H
 
E
P
 
P
K
 
Q
R
 
R
A
 
V
F
 
I
I
 
E
V
 
I
D
 
S
I
 
I
P
 
P
L
 
V
E
 
K
M
 
M
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
V
R
 
K
H
 
V
F
 
F
E
 
K
G
 
G
F
 
W
R
 
R
V
 
S
Q
 
A
H
 
H
N
 
S
L
 
S
S
 
A
R
 
V
G
 
G
P
 
P
G
 
S
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
V
R
 
R
Y
 
F
H
 
H
P
 
P
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
M
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
S
A
 
L
W
 
W
M
 
M
T
 
T
V
 
F
K
 
K
C
 
G
A
 
G
V
 
A
I
 
L
N
 
G
L
 
L
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
G
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
C
V
 
V
D
 
D
P
 
P
R
 
A
E
 
E
L
 
L
S
 
S
I
 
E
K
 
R
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
Q
L
 
L
T
 
S
R
 
R
R
 
G
Y
 
W
T
 
V
S
 
R
E
 
G
I
 
L
G
 
Y
N
 
K
I
 
Y
I
 
L
G
 
G
P
 
D
Q
 
R
R
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
V
G
 
N
T
 
T
N
 
N
A
 
G
Q
 
Q
V
 
I
M
 
M
A
 
S
W
 
W
I
 
F
M
 
V
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
-
 
V
S
 
K
M
 
L
N
 
N
A
 
G
G
 
E
A
 
R
T
 
M
S
 
D
T
 
I
G
 
G
V
 
T
V
 
F
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
V
H
 
A
L
 
F
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
N
T
 
E
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
F
G
 
G
V
 
V
F
 
A
V
 
V
T
 
V
G
 
V
R
 
R
A
 
E
A
 
S
A
 
A
K
 
K
N
 
R
I
 
F
G
 
G
L
 
I
T
 
K
V
 
M
E
 
E
R
 
D
S
 
A
R
 
K
V
 
I
A
 
A
V
 
V
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
S
 
T
V
 
F
A
 
T
V
 
V
G
 
K
L
 
N
F
 
I
Q
 
E
E
 
R
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
V
V
 
C
A
 
A
V
 
I
-
 
A
-
x
E
-
x
W
-
x
D
-
 
R
Q
 
N
D
 
E
H
 
G
S
 
N
T
 
Y
T
 
A
L
 
L
W
 
Y
N
 
N
N
 
E
E
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
F
P
 
K
A
 
E
L
 
L
Q
 
L
S
 
A
W
 
Y
Q
 
K
Q
 
E
K
 
A
H
 
N
G
 
K
A
 
T
I
 
L
A
 
I
G
 
G
F
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
E
V
 
R
I
 
I
S
 
T
S
 
D
E
 
E
D
 
E
F
 
F
W
 
W
L
 
T
K
 
K
D
 
E
F
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
I
I
 
V
P
 
P
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
N
Q
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
G
E
 
E
R
 
R
A
 
A
H
 
K
K
 
T
L
 
I
T
 
N
C
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
V
L
 
C
E
 
E
G
 
A
A
 
A
N
 
N
G
 
G
P
 
P
T
 
T
L
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
G
D
 
D
D
 
K
I
 
V
L
 
L
R
 
T
Q
 
E
R
 
R
G
 
G
V
 
I
T
 
N
I
 
L
V
 
T
P
 
P
D
 
D
V
 
I
L
 
L
C
 
T
N
 
N
A
 
S
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
L
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
Q
S
 
Y
S
 
G
Y
 
Y
F
 
Y
W
 
W
G
 
T
E
 
E
D
 
A
E
 
E
I
 
V
N
 
E
S
 
E
R
 
K
L
 
Q
D
 
E
M
 
A
I
 
D
M
 
M
S
 
M
Q
 
K
A
 
A
F
 
I
E
 
K
A
 
G
V
 
V
W
 
F
Q
 
A
K
 
V
A
 
A
E
 
D
S
 
E
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
T
 
T
L
 
L
R
 
R
T
 
E
A
 
A
A
 
V
Y
 
Y
A
 
M
V
 
Y
G
 
A
C
 
I
E
 
K
R
 
S
I
 
I
L
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
M
K
 
K
E
 
L
R
 
R
G
 
G
I
 
W
Y
 
Y

8s39C Crystal structure of medicago truncatula glutamate dehydrogenase 2 in complex with isophthalic acid and NAD (see paper)
45% identity, 94% coverage: 25:421/424 of query aligns to 15:410/413 of 8s39C

query
sites
8s39C
R
 
R
V
 
A
M
 
S
P
 
R
Y
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
L
A
 
E
D
 
K
T
 
S
L
 
L
R
 
L
H
 
I
P
 
P
K
 
Y
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
L
R
 
V
H
 
S
F
 
Y
E
 
V
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
I
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
|
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
|
M
T
 
T
V
 
W
K
|
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
|
A
P
|
P
D
|
D
V
x
M
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
H
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
|
R
V
 
E
T
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
V
V
 
F
T
 
A
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
F
K
 
A
N
 
E
I
 
Y
G
 
G
L
 
K
T
 
S
V
 
I
E
 
S
R
 
D
S
 
M
R
 
T
V
 
F
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
S
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
A
F
 
I
Q
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
I
S
 
N
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
S
N
 
N
N
 
P
E
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
S
 
K
W
 
H
Q
 
K
Q
 
A
K
 
G
H
 
N
G
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
S
G
 
G
A
 
G
R
 
D
V
 
A
I
 
M
S
 
N
S
 
P
E
 
N
D
 
D
F
 
L
W
 
L
L
 
V
K
 
H
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
C
A
|
A
L
 
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
L
T
 
N
A
 
K
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
N
K
 
D
L
 
V
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
A
A
|
A
N
|
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
I
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
C
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
D
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
Q
R
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
R
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
N
A
 
D
V
 
I
W
 
K
Q
 
A
K
 
N
A
 
C
E
 
K
S
 
T
L
 
H
G
 
N
V
 
C
T
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
L
E
 
L
R
 
R
G
 
G

8s3dA Crystal structure of medicago truncatula glutamate dehydrogenase 2 in complex with 2-amino-2-hydroxyglutarate (reaction intermediate) and NAD (see paper)
45% identity, 94% coverage: 25:421/424 of query aligns to 14:409/412 of 8s3dA

query
sites
8s3dA
R
 
R
V
 
A
M
 
S
P
 
R
Y
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
L
A
 
E
D
 
K
T
x
S
L
 
L
R
 
L
H
x
I
P
 
P
K
 
Y
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
L
R
 
V
H
 
S
F
 
Y
E
 
V
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
I
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
|
K
G
|
G
G
|
G
I
 
I
R
|
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
|
M
T
 
T
V
 
W
K
|
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
|
A
P
|
P
D
|
D
V
x
M
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
H
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
|
R
V
 
E
T
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
V
V
 
F
T
 
A
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
F
K
 
A
N
 
E
I
 
Y
G
 
G
L
 
K
T
 
S
V
 
I
E
 
S
R
 
D
S
 
M
R
 
T
V
 
F
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
S
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
A
F
 
I
Q
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
I
S
 
N
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
S
N
 
N
N
 
P
E
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
S
 
K
W
 
H
Q
 
K
Q
 
A
K
 
G
H
 
N
G
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
S
G
 
G
A
 
G
R
 
D
V
 
A
I
 
M
S
 
N
S
 
P
E
 
N
D
 
D
F
 
L
W
 
L
L
 
V
K
 
H
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
x
C
A
|
A
L
 
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
L
T
 
N
A
 
K
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
N
K
 
D
L
 
V
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
A
A
|
A
N
|
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
I
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
C
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
|
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
D
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
Q
R
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
R
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
N
A
 
D
V
 
I
W
 
K
Q
 
A
K
 
N
A
 
C
E
 
K
S
 
T
L
 
H
G
 
N
V
 
C
T
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
L
E
 
L
R
 
R
G
 
G

8s3aE Crystal structure of medicago truncatula glutamate dehydrogenase 2 in complex with 2,6-pyridinedicarboxylic acid and NAD (see paper)
45% identity, 94% coverage: 25:421/424 of query aligns to 14:409/412 of 8s3aE

query
sites
8s3aE
R
 
R
V
 
A
M
 
S
P
 
R
Y
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
L
A
 
E
D
 
K
T
 
S
L
 
L
R
 
L
H
 
I
P
 
P
K
 
Y
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
L
R
 
V
H
 
S
F
 
Y
E
 
V
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
I
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
|
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
|
M
T
 
T
V
 
W
K
|
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
|
A
P
|
P
D
|
D
V
x
M
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
H
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
|
R
V
 
E
T
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
V
V
 
F
T
 
A
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
F
K
 
A
N
 
E
I
 
Y
G
 
G
L
 
K
T
 
S
V
 
I
E
 
S
R
 
D
S
 
M
R
 
T
V
 
F
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
S
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
A
F
 
I
Q
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
I
S
 
N
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
S
N
 
N
N
 
P
E
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
S
 
K
W
 
H
Q
 
K
Q
 
A
K
 
G
H
 
N
G
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
S
G
 
G
A
 
G
R
 
D
V
 
A
I
 
M
S
 
N
S
 
P
E
 
N
D
 
D
F
 
L
W
 
L
L
 
V
K
 
H
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
x
C
A
|
A
L
 
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
L
T
 
N
A
 
K
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
N
K
 
D
L
 
V
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
A
A
|
A
N
|
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
I
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
C
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
D
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
Q
R
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
R
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
N
A
 
D
V
 
I
W
 
K
Q
 
A
K
 
N
A
 
C
E
 
K
S
 
T
L
 
H
G
 
N
V
 
C
T
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
L
E
 
L
R
 
R
G
 
G

8s38B Crystal structure of medicago truncatula glutamate dehydrogenase 2 in complex with citrate and NAD (see paper)
45% identity, 94% coverage: 25:421/424 of query aligns to 16:411/414 of 8s38B

query
sites
8s38B
R
 
R
V
 
A
M
 
S
P
 
R
Y
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
L
A
 
E
D
 
K
T
x
S
L
|
L
R
 
L
H
x
I
P
 
P
K
 
Y
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
L
R
 
V
H
 
S
F
 
Y
E
 
V
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
I
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
 
M
T
 
T
V
 
W
K
 
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
M
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
H
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
E
T
 
A
A
 
A
T
 
T
G
 
G
R
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
V
V
 
F
T
 
A
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
F
K
 
A
N
 
E
I
 
Y
G
 
G
L
 
K
T
 
S
V
 
I
E
 
S
R
 
D
S
 
M
R
 
T
V
 
F
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
 
F
G
 
G
N
 
N
V
 
V
G
 
G
S
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
A
F
 
I
Q
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
 
D
H
 
I
S
 
N
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
S
N
 
N
N
 
P
E
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
S
 
K
W
 
H
Q
 
K
Q
 
A
K
 
G
H
 
N
G
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
S
G
 
G
A
 
G
R
 
D
V
 
A
I
 
M
S
 
N
S
 
P
E
 
N
D
 
D
F
 
L
W
 
L
L
 
V
K
 
H
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
C
A
 
A
L
 
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
L
T
 
N
A
 
K
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
N
K
 
D
L
 
V
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
A
A
 
A
N
 
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
I
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
C
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
D
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
Q
R
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
R
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
N
A
 
D
V
 
I
W
 
K
Q
 
A
K
 
N
A
 
C
E
 
K
S
 
T
L
 
H
G
 
N
V
 
C
T
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
L
E
 
L
R
 
R
G
 
G

8s3bA Glutamate dehydrogenase (see paper)
45% identity, 94% coverage: 25:421/424 of query aligns to 12:407/410 of 8s3bA

query
sites
8s3bA
R
 
R
V
 
A
M
 
S
P
 
R
Y
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
L
A
 
E
D
 
K
T
x
S
L
 
L
R
 
L
H
x
I
P
 
P
K
 
Y
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
L
R
 
V
H
 
S
F
 
Y
E
 
V
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
I
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
|
K
G
|
G
G
|
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
|
M
T
 
T
V
 
W
K
 
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
V
 
M
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
H
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
E
T
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
V
V
 
F
T
 
A
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
F
K
 
A
N
 
E
I
 
Y
G
 
G
L
 
K
T
 
S
V
 
I
E
 
S
R
 
D
S
 
M
R
 
T
V
 
F
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
S
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
A
F
 
I
Q
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
I
S
 
N
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
S
N
 
N
N
 
P
E
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
S
 
K
W
 
H
Q
 
K
Q
 
A
K
 
G
H
 
N
G
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
S
G
 
G
A
 
G
R
 
D
V
 
A
I
 
M
S
 
N
S
 
P
E
 
N
D
 
D
F
 
L
W
 
L
L
 
V
K
 
H
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
 
C
A
|
A
L
 
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
L
T
 
N
A
 
K
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
N
K
 
D
L
 
V
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
A
A
|
A
N
|
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
I
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
C
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
|
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
D
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
Q
R
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
R
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
N
A
 
D
V
 
I
W
 
K
Q
 
A
K
 
N
A
 
C
E
 
K
S
 
T
L
 
H
G
 
N
V
 
C
T
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
L
E
 
L
R
 
R
G
 
G

8s38A Crystal structure of medicago truncatula glutamate dehydrogenase 2 in complex with citrate and NAD (see paper)
45% identity, 94% coverage: 25:421/424 of query aligns to 9:404/407 of 8s38A

query
sites
8s38A
R
 
R
V
 
A
M
 
S
P
 
R
Y
 
I
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
L
A
 
E
D
 
K
T
 
S
L
 
L
R
 
L
H
 
I
P
 
P
K
 
Y
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
S
V
 
L
R
 
V
H
 
S
F
 
Y
E
 
V
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
I
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
 
M
T
 
T
V
 
W
K
 
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
V
N
 
D
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
N
P
 
P
R
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
S
I
 
I
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
R
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
 
A
P
 
P
D
 
D
V
 
M
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
S
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
H
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
 
R
V
 
E
T
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
 
L
G
 
G
V
 
V
F
 
V
V
 
F
T
 
A
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
F
K
 
A
N
 
E
I
 
Y
G
 
G
L
 
K
T
 
S
V
 
I
E
 
S
R
 
D
S
 
M
R
 
T
V
 
F
A
 
A
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
S
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
A
F
 
I
Q
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
I
S
 
N
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
S
N
 
N
N
 
P
E
 
N
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
L
S
 
K
W
 
H
Q
 
K
Q
 
A
K
 
G
H
 
N
G
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
S
G
 
G
A
 
G
R
 
D
V
 
A
I
 
M
S
 
N
S
 
P
E
 
N
D
 
D
F
 
L
W
 
L
L
 
V
K
 
H
D
 
D
F
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
x
C
A
|
A
L
|
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
L
T
 
N
A
 
K
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
N
K
 
D
L
 
V
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
I
E
 
E
G
 
A
A
|
A
N
|
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
I
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
V
L
 
Y
C
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
T
 
T
V
 
V
S
 
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
D
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
Q
R
 
E
L
 
L
D
 
K
M
 
R
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
K
A
 
A
F
 
F
E
 
N
A
 
D
V
 
I
W
 
K
Q
 
A
K
 
N
A
 
C
E
 
K
S
 
T
L
 
H
G
 
N
V
 
C
T
 
D
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
L
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
L
E
 
L
R
 
R
G
 
G

8owmC Crystal structure of glutamate dehydrogenase 2 from arabidopsis thaliana binding ca, NAD and 2,2-dihydroxyglutarate (see paper)
46% identity, 92% coverage: 30:421/424 of query aligns to 20:410/413 of 8owmC

query
sites
8owmC
L
 
L
G
 
G
D
 
L
L
 
D
S
 
S
R
 
K
W
 
I
A
 
E
D
 
R
T
x
S
L
 
L
R
 
M
H
x
I
P
 
P
K
 
F
R
 
R
A
 
E
F
 
I
I
 
K
V
 
V
D
 
E
I
 
C
P
 
T
L
 
I
E
 
P
M
 
K
D
 
D
D
 
D
G
 
G
T
 
T
V
 
L
R
 
V
H
 
S
F
 
Y
E
 
I
G
 
G
F
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
H
 
H
N
 
D
L
 
N
S
 
A
R
 
R
G
 
G
P
 
P
G
 
M
K
|
K
G
 
G
G
|
G
I
 
I
R
 
R
Y
 
Y
H
 
H
P
 
P
D
 
E
V
 
V
N
 
D
L
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
M
 
N
A
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
Q
W
 
L
M
|
M
T
 
T
V
 
W
K
|
K
C
 
T
A
 
A
V
 
V
I
 
A
N
 
D
L
 
I
P
 
P
F
 
Y
G
 
G
G
 
G
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
G
V
 
C
D
 
S
P
 
P
R
 
R
E
 
D
L
 
L
S
 
S
I
 
L
K
 
S
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
R
 
V
Y
 
F
T
 
T
S
 
Q
E
 
K
I
 
I
G
 
H
N
 
D
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
I
Q
 
H
R
 
T
D
 
D
I
 
V
P
 
P
A
|
A
P
 
P
D
|
D
V
x
M
G
 
G
T
 
T
N
 
N
A
 
A
Q
 
Q
V
 
T
M
 
M
A
 
A
W
 
W
I
 
I
M
 
L
D
 
D
T
 
E
W
 
Y
S
 
S
M
 
K
N
 
F
A
 
H
G
 
G
A
 
-
T
 
H
S
 
S
T
 
P
G
 
A
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
V
 
I
H
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
L
 
L
G
 
G
R
|
R
V
 
E
T
 
A
A
 
A
T
|
T
G
 
G
R
 
R
G
 
G
V
 
V
F
 
V
V
 
F
T
 
A
G
 
T
R
 
E
A
 
A
A
 
L
A
 
L
K
 
A
N
 
E
I
 
Y
G
 
G
L
 
K
T
 
S
V
 
I
E
 
Q
R
 
G
S
 
L
R
 
T
V
 
F
A
 
V
V
 
I
Q
 
Q
G
 
G
F
|
F
G
|
G
N
|
N
V
|
V
G
 
G
S
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
A
G
 
K
L
 
L
F
 
I
Q
 
H
E
 
E
A
 
K
G
 
G
A
 
G
H
 
K
I
 
V
V
 
V
A
 
A
V
 
V
Q
 
S
D
|
D
H
x
I
S
 
T
T
 
G
T
 
A
L
 
I
W
 
R
N
 
N
N
 
P
E
 
E
G
 
G
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
N
A
 
A
L
 
L
Q
 
I
S
 
K
W
 
H
Q
 
K
Q
 
D
K
 
A
H
 
T
G
 
G
A
 
S
I
 
L
A
 
N
G
 
D
F
 
F
P
 
N
G
 
G
A
 
G
R
 
D
V
 
A
I
 
M
S
 
N
S
 
S
E
 
D
D
 
E
F
 
L
W
 
L
L
 
I
K
 
H
D
 
E
F
 
C
D
 
D
I
 
V
L
 
L
I
 
I
P
 
P
A
x
C
A
|
A
L
 
L
E
 
G
G
 
G
Q
 
V
I
 
L
T
 
N
A
 
K
E
 
E
R
 
N
A
 
A
H
 
G
K
 
D
L
 
V
T
 
K
C
 
A
K
 
K
L
 
F
V
 
I
L
 
V
E
 
E
G
 
A
A
|
A
N
|
N
G
 
H
P
 
P
T
 
T
L
 
D
P
 
P
E
 
D
A
 
A
D
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
L
R
 
S
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
I
I
 
I
V
 
L
P
 
P
D
 
D
V
 
I
L
 
Y
C
 
A
N
|
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
|
V
T
 
T
V
 
V
S
|
S
Y
 
Y
F
 
F
E
 
E
W
 
W
V
 
V
Q
 
Q
D
 
N
F
 
I
S
 
Q
S
 
G
Y
 
F
F
 
M
W
 
W
G
 
E
E
 
E
D
 
E
E
 
K
I
 
V
N
 
N
S
 
L
R
 
E
L
 
L
D
 
Q
M
 
K
I
 
Y
M
 
M
S
 
T
Q
 
R
A
 
A
F
 
F
E
 
H
A
 
N
V
 
I
W
 
K
Q
 
T
K
 
M
A
 
C
E
 
H
S
 
T
L
 
H
G
 
S
V
 
C
T
 
N
L
 
L
R
 
R
T
 
M
A
 
G
A
 
A
Y
 
F
A
 
T
V
 
L
G
 
G
C
 
V
E
 
N
R
 
R
I
 
V
L
 
A
I
 
R
A
 
A
R
 
T
K
 
Q
E
 
L
R
 
R
G
 
G

Query Sequence

>WP_084932454.1 NCBI__GCF_002095475.1:WP_084932454.1
MSKPLSYVSEDPHSPWATYLAQVDRVMPYLGDLSRWADTLRHPKRAFIVDIPLEMDDGTV
RHFEGFRVQHNLSRGPGKGGIRYHPDVNLEEVMALSAWMTVKCAVINLPFGGAKGGIRVD
PRELSIKELERLTRRYTSEIGNIIGPQRDIPAPDVGTNAQVMAWIMDTWSMNAGATSTGV
VTGKPVHLGGSLGRVTATGRGVFVTGRAAAKNIGLTVERSRVAVQGFGNVGSVAVGLFQE
AGAHIVAVQDHSTTLWNNEGIDIPALQSWQQKHGAIAGFPGARVISSEDFWLKDFDILIP
AALEGQITAERAHKLTCKLVLEGANGPTLPEADDILRQRGVTIVPDVLCNAGGVTVSYFE
WVQDFSSYFWGEDEINSRLDMIMSQAFEAVWQKAESLGVTLRTAAYAVGCERILIARKER
GIYP

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory