SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_084936450.1 NCBI__GCF_002095475.1:WP_084936450.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1gvhA The x-ray structure of ferric escherichia coli flavohemoglobin reveals an unespected geometry of the distal heme pocket (see paper)
62% identity, 100% coverage: 1:394/394 of query aligns to 1:396/396 of 1gvhA

query
sites
1gvhA
M
 
M
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
A
S
 
T
L
 
I
P
 
P
A
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
E
V
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
K
L
 
L
T
 
T
G
 
A
H
 
H
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
L
 
F
T
 
T
Q
 
H
H
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
I
F
|
F
N
 
N
M
 
M
N
x
S
N
 
N
Q
|
Q
R
 
R
S
x
N
G
 
G
N
 
D
Q
|
Q
R
 
R
E
 
E
A
|
A
L
|
L
F
 
F
N
 
N
A
|
A
I
|
I
V
 
A
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
S
 
S
N
 
N
L
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
V
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
I
|
I
A
 
A
Q
 
Q
K
|
K
H
|
H
T
 
T
S
 
S
L
 
F
N
 
Q
I
|
I
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
A
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
I
 
L
K
 
D
E
 
E
L
 
M
L
 
F
N
 
S
P
 
P
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
A
W
 
W
G
 
G
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
L
|
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
|
F
I
 
I
Q
 
N
R
 
R
E
 
E
E
 
A
A
 
E
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
N
A
 
E
S
 
N
E
 
A
E
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
W
 
W
R
 
E
G
 
G
P
 
T
R
 
R
D
 
D
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
I
 
K
H
 
T
A
 
P
E
 
R
S
 
S
A
 
A
V
 
L
I
 
I
K
 
T
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
L
V
 
E
P
 
P
N
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
E
F
 
Y
L
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
L
A
 
G
V
 
V
S
 
W
L
 
L
R
 
K
P
 
P
A
 
E
G
 
G
N
 
F
E
 
P
N
 
H
I
 
Q
Q
 
E
H
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
T
 
T
H
 
R
L
 
K
P
 
P
N
 
D
G
 
G
Q
 
K
S
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
|
A
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
E
 
E
H
 
G
G
|
G
S
x
Q
V
|
V
S
|
S
G
 
N
W
 
W
L
 
L
H
 
H
A
 
N
N
 
H
A
 
A
K
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
V
I
 
V
Q
 
K
C
 
L
A
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
F
L
 
M
Q
 
A
T
 
V
E
 
A
P
 
D
A
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Q
 
Q
T
|
T
P
 
P
M
 
M
L
 
L
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
D
N
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
A
Q
 
G
H
 
H
A
 
T
G
 
A
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
W
 
W
L
 
F
H
 
H
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
G
 
G
S
 
D
Q
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
F
A
 
A
N
 
D
E
 
E
V
 
V
K
 
K
D
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
Q
R
 
S
L
 
L
S
 
P
H
 
R
F
 
F
S
 
T
S
 
A
H
 
H
I
 
T
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
E
 
S
S
 
E
T
 
A
D
 
D
N
 
R
D
 
A
R
 
K
-
 
G
-
 
Q
Y
 
F
D
 
D
A
 
S
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
K
V
 
L
S
 
E
S
 
G
E
 
A
L
 
F
N
 
S
Q
 
D
P
 
P
E
 
T
R
 
M
Q
 
Q
F
 
F
W
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
V
A
 
G
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
K
A
 
Q
D
 
E
R
 
N
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
|
E
V
 
C
F
|
F
G
 
G
P
 
P
H
|
H
K
 
K
V
 
V
L
 
L

P24232 Flavohemoprotein; Flavohemoglobin; HMP; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
62% identity, 100% coverage: 1:394/394 of query aligns to 1:396/396 of P24232

query
sites
P24232
M
 
M
L
 
L
D
 
D
A
 
A
Q
 
Q
T
 
T
I
 
I
A
 
A
T
 
T
V
 
V
K
 
K
S
 
A
S
 
T
L
 
I
P
 
P
A
 
L
I
 
L
A
 
V
Q
 
E
V
 
T
G
 
G
P
 
P
E
 
K
L
 
L
T
 
T
G
 
A
H
 
H
F
 
F
Y
|
Y
Q
 
D
R
 
R
L
 
M
L
 
F
T
 
T
Q
 
H
H
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
E
V
 
I
F
 
F
N
 
N
M
 
M
N
 
S
N
 
N
Q
 
Q
R
 
R
S
 
N
G
 
G
N
 
D
Q
 
Q
R
 
R
E
 
E
A
 
A
L
 
L
F
 
F
N
 
N
A
 
A
I
 
I
V
 
A
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
S
 
S
N
 
N
L
 
I
E
 
E
N
 
N
L
 
L
A
 
P
V
 
A
L
 
L
L
 
L
P
 
P
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
I
 
I
A
 
A
Q
 
Q
K
 
K
H
 
H
T
 
T
S
 
S
L
 
F
N
 
Q
I
 
I
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
 
Q
Y
|
Y
A
 
N
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
T
I
 
L
K
 
D
E
 
E
L
 
M
L
 
F
N
 
S
P
 
P
G
 
G
D
 
Q
E
 
E
V
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
A
W
 
W
G
 
G
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
A
N
 
N
V
 
V
F
 
F
I
 
I
Q
 
N
R
 
R
E
|
E
E
 
A
A
 
E
I
 
I
Y
 
Y
Q
 
N
A
 
E
S
 
N
E
 
A
E
 
S
K
 
K
A
 
A
G
 
G
G
 
G
W
 
W
R
 
E
G
 
G
P
 
T
R
 
R
D
 
D
F
 
F
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
I
 
K
H
 
T
A
 
P
E
 
R
S
 
S
A
 
A
V
 
L
I
 
I
K
 
T
S
 
S
F
 
F
E
 
E
L
 
L
V
 
E
P
 
P
N
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
E
F
 
Y
L
 
R
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
L
A
 
G
V
 
V
S
 
W
L
 
L
R
 
K
P
 
P
A
 
E
G
 
G
N
 
F
E
 
P
N
 
H
I
 
Q
Q
 
E
H
 
I
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
T
 
T
H
 
R
L
 
K
P
 
P
N
 
D
G
 
G
Q
 
K
S
 
G
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
 
E
E
 
E
H
 
G
G
 
G
S
 
Q
V
 
V
S
 
S
G
 
N
W
 
W
L
 
L
H
 
H
A
 
N
N
 
H
A
 
A
K
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
V
I
 
V
Q
 
K
C
 
L
A
 
V
A
 
A
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
F
L
 
M
Q
 
A
T
 
V
E
 
A
P
 
D
A
 
D
T
 
T
P
 
P
V
 
V
T
 
T
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
M
 
M
L
 
L
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
D
N
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
A
Q
 
G
H
 
H
A
 
T
G
 
A
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
W
 
W
L
 
F
H
 
H
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
G
 
G
S
 
D
Q
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
F
A
 
A
N
 
D
E
 
E
V
 
V
K
 
K
D
 
E
L
 
L
G
 
G
S
 
Q
R
 
S
L
 
L
S
 
P
H
 
R
F
 
F
S
 
T
S
 
A
H
 
H
I
 
T
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
Q
P
 
P
E
 
S
S
 
E
T
 
A
D
 
D
N
 
R
D
 
A
R
 
K
-
 
G
-
 
Q
Y
 
F
D
 
D
A
 
S
Q
 
E
G
 
G
L
 
L
M
 
M
D
 
D
L
 
L
A
 
S
R
 
K
V
 
L
S
 
E
S
 
G
E
 
A
L
 
F
N
 
S
Q
 
D
P
 
P
E
 
T
R
 
M
Q
 
Q
F
 
F
W
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
V
A
 
G
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
F
 
F
I
 
T
A
 
A
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
I
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
K
A
 
Q
D
 
E
R
 
N
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
 
C
F
 
F
G
 
G
P
 
P
H
 
H
K
 
K
V
 
V
L
 
L

3ozwA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with ketoconazole (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:390/394 of query aligns to 1:398/403 of 3ozwA

query
sites
3ozwA
M
 
M
L
 
L
D
 
T
A
 
Q
Q
 
K
T
 
T
I
 
K
A
 
D
T
 
I
V
 
V
K
 
K
S
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
P
A
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
V
 
H
G
 
G
P
 
Y
E
 
D
L
 
I
T
 
I
G
 
K
H
 
C
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
L
 
M
L
 
F
T
 
E
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
N
V
|
V
F
|
F
N
 
N
M
 
M
N
x
A
N
 
H
Q
 
Q
R
 
E
S
x
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
|
Q
R
 
Q
E
 
Q
A
|
A
L
 
L
F
 
A
N
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
E
N
 
D
L
 
P
A
 
N
V
 
S
L
 
L
L
 
M
P
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
K
K
 
N
I
|
I
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
H
|
H
T
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
A
 
P
V
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
|
L
L
 
L
A
 
A
T
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
G
P
 
N
G
 
A
-
 
A
-
 
T
D
 
D
E
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
S
A
 
A
W
 
W
G
 
A
K
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
V
 
N
L
 
L
A
|
A
N
 
D
V
 
V
F
x
L
I
 
M
Q
 
G
R
 
M
E
 
E
E
 
S
A
 
E
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
A
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
R
 
K
G
 
G
P
 
W
R
 
R
D
 
T
F
 
F
R
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
E
I
 
K
H
 
R
A
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
V
 
V
I
 
I
K
 
T
S
 
S
F
 
F
E
 
I
L
 
L
V
 
E
P
 
P
N
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
L
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
T
A
 
S
V
 
V
S
 
A
L
 
I
R
 
D
P
 
V
A
 
P
G
 
A
N
 
L
E
 
G
N
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
H
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
T
 
S
H
 
D
L
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
x
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
Q
E
x
P
H
 
P
G
|
G
S
x
Y
V
|
V
S
|
S
G
 
N
W
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
N
 
H
A
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
Q
I
 
V
Q
 
K
C
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
Y
 
H
L
 
I
Q
 
D
T
 
V
E
 
D
P
 
A
A
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
T
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Q
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
L
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
A
 
-
N
 
K
L
 
V
A
 
A
E
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
P
A
 
P
G
 
R
A
 
Q
V
 
V
N
 
V
W
 
F
L
 
V
H
 
H
A
 
G
A
 
A
E
 
R
N
 
N
G
 
S
S
 
A
Q
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
N
 
D
E
 
R
V
 
L
K
 
R
D
 
E
L
 
A
G
 
A
S
 
K
R
 
T
L
 
Y
S
 
E
H
 
N
F
 
L
S
 
D
S
 
L
H
 
F
I
 
V
W
 
F
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
Q
-
 
P
-
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
D
T
 
V
D
 
Q
N
 
G
D
 
R
R
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Y
Q
 
P
G
 
G
L
 
L
M
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
K
R
 
Q
V
 
I
S
 
E
S
 
K
E
 
S
L
 
I
N
 
L
Q
 
L
P
 
P
E
 
D
R
 
A
Q
 
D
F
 
Y
W
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
I
A
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
F
 
M
I
 
Q
A
 
H
R
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
K
D
 
N
A
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
A
 
E
D
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
|
V
F
|
F
G
 
G
P
|
P

3ozvA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with econazole (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:390/394 of query aligns to 1:398/403 of 3ozvA

query
sites
3ozvA
M
 
M
L
 
L
D
 
T
A
 
Q
Q
 
K
T
 
T
I
 
K
A
 
D
T
 
I
V
 
V
K
 
K
S
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
P
A
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
V
 
H
G
 
G
P
 
Y
E
 
D
L
x
I
T
 
I
G
 
K
H
 
C
F
|
F
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
L
 
M
L
 
F
T
 
E
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
N
V
 
V
F
|
F
N
|
N
M
 
M
N
x
A
N
 
H
Q
|
Q
R
 
E
S
 
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
|
L
F
 
A
N
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
E
N
 
D
L
 
P
A
 
N
V
 
S
L
 
L
L
 
M
P
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
K
K
 
N
I
|
I
A
 
A
Q
 
N
K
|
K
H
|
H
T
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
A
 
P
V
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
|
L
L
 
L
A
 
A
T
 
A
I
|
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
G
P
 
N
G
 
A
-
 
A
-
 
T
D
 
D
E
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
S
A
 
A
W
 
W
G
 
A
K
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
V
 
N
L
 
L
A
|
A
N
 
D
V
 
V
F
x
L
I
 
M
Q
 
G
R
 
M
E
 
E
E
 
S
A
 
E
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
A
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
R
 
K
G
 
G
P
 
W
R
 
R
D
 
T
F
 
F
R
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
E
I
 
K
H
 
R
A
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
V
 
V
I
 
I
K
 
T
S
 
S
F
 
F
E
 
I
L
 
L
V
 
E
P
 
P
N
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
L
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
T
A
 
S
V
 
V
S
 
A
L
 
I
R
 
D
P
 
V
A
 
P
G
 
A
N
 
L
E
 
G
N
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
H
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
T
 
S
H
 
D
L
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
x
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
Q
E
x
P
H
 
P
G
|
G
S
x
Y
V
|
V
S
|
S
G
 
N
W
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
N
 
H
A
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
Q
I
 
V
Q
 
K
C
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
Y
 
H
L
 
I
Q
 
D
T
 
V
E
 
D
P
 
A
A
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
T
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Q
 
L
T
|
T
P
 
P
M
 
M
L
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
A
 
-
N
 
K
L
 
V
A
 
A
E
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
P
A
 
P
G
 
R
A
 
Q
V
 
V
N
 
V
W
 
F
L
 
V
H
 
H
A
 
G
A
 
A
E
 
R
N
 
N
G
 
S
S
 
A
Q
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
N
 
D
E
 
R
V
 
L
K
 
R
D
 
E
L
 
A
G
 
A
S
 
K
R
 
T
L
 
Y
S
 
E
H
 
N
F
 
L
S
 
D
S
 
L
H
 
F
I
 
V
W
 
F
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
Q
-
 
P
-
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
D
T
 
V
D
 
Q
N
 
G
D
 
R
R
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Y
Q
 
P
G
 
G
L
 
L
M
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
K
R
 
Q
V
 
I
S
 
E
S
 
K
E
 
S
L
 
I
N
 
L
Q
 
L
P
 
P
E
 
D
R
 
A
Q
 
D
F
 
Y
W
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
I
A
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
F
 
M
I
 
Q
A
 
H
R
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
K
D
 
N
A
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
A
 
E
D
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P

3ozuA The crystal structure of flavohemoglobin from r. Eutrophus in complex with miconazole (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:390/394 of query aligns to 1:398/403 of 3ozuA

query
sites
3ozuA
M
 
M
L
 
L
D
 
T
A
 
Q
Q
 
K
T
 
T
I
 
K
A
 
D
T
 
I
V
 
V
K
 
K
S
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
P
A
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
V
 
H
G
 
G
P
 
Y
E
 
D
L
 
I
T
x
I
G
 
K
H
 
C
F
|
F
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
L
 
M
L
 
F
T
 
E
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
N
V
 
V
F
|
F
N
|
N
M
 
M
N
x
A
N
x
H
Q
 
Q
R
 
E
S
 
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
A
|
A
L
|
L
F
 
A
N
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
E
N
 
D
L
 
P
A
 
N
V
 
S
L
 
L
L
 
M
P
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
K
K
 
N
I
|
I
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
H
|
H
T
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
A
 
P
V
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
|
L
L
 
L
A
 
A
T
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
G
P
 
N
G
 
A
-
 
A
-
 
T
D
 
D
E
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
S
A
 
A
W
|
W
G
 
A
K
 
Q
A
|
A
Y
|
Y
G
 
G
V
 
N
L
|
L
A
|
A
N
 
D
V
 
V
F
x
L
I
 
M
Q
 
G
R
 
M
E
 
E
E
 
S
A
 
E
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
A
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
R
 
K
G
 
G
P
 
W
R
 
R
D
 
T
F
 
F
R
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
E
I
 
K
H
 
R
A
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
V
 
V
I
 
I
K
 
T
S
 
S
F
 
F
E
 
I
L
 
L
V
 
E
P
 
P
N
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
L
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
T
A
 
S
V
 
V
S
 
A
L
 
I
R
 
D
P
 
V
A
 
P
G
 
A
N
 
L
E
 
G
N
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
H
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
T
 
S
H
 
D
L
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
x
S
V
|
V
K
|
K
R
 
R
E
|
E
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
Q
E
x
P
H
 
P
G
|
G
S
x
Y
V
|
V
S
|
S
G
 
N
W
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
N
 
H
A
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
Q
I
 
V
Q
 
K
C
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
Y
 
H
L
 
I
Q
 
D
T
 
V
E
 
D
P
 
A
A
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
T
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
L
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
A
 
-
N
 
K
L
 
V
A
 
A
E
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
P
A
 
P
G
 
R
A
 
Q
V
 
V
N
 
V
W
 
F
L
 
V
H
 
H
A
 
G
A
 
A
E
 
R
N
 
N
G
 
S
S
 
A
Q
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
N
 
D
E
 
R
V
 
L
K
 
R
D
 
E
L
 
A
G
 
A
S
 
K
R
 
T
L
 
Y
S
 
E
H
 
N
F
 
L
S
 
D
S
 
L
H
 
F
I
 
V
W
 
F
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
Q
-
 
P
-
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
D
T
 
V
D
 
Q
N
 
G
D
 
R
R
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Y
Q
 
P
G
 
G
L
 
L
M
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
K
R
 
Q
V
 
I
S
 
E
S
 
K
E
 
S
L
 
I
N
 
L
Q
 
L
P
 
P
E
 
D
R
 
A
Q
 
D
F
 
Y
W
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
I
A
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
F
 
M
I
 
Q
A
 
H
R
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
K
D
 
N
A
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
A
 
E
D
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
|
E
V
|
V
F
 
F
G
|
G
P
|
P

P39662 Flavohemoprotein; FHP; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:390/394 of query aligns to 1:398/403 of P39662

query
sites
P39662
M
 
M
L
 
L
D
 
T
A
 
Q
Q
 
K
T
 
T
I
 
K
A
 
D
T
 
I
V
 
V
K
 
K
S
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
P
A
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
V
 
H
G
 
G
P
 
Y
E
 
D
L
 
I
T
 
I
G
 
K
H
 
C
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
L
 
M
L
 
F
T
 
E
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
N
V
 
V
F
 
F
N
 
N
M
 
M
N
 
A
N
 
H
Q
 
Q
R
 
E
S
 
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
A
N
 
R
A
|
A
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
E
N
 
D
L
 
P
A
 
N
V
 
S
L
 
L
L
 
M
P
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
K
K
 
N
I
 
I
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
H
 
H
T
 
A
S
 
S
L
 
L
N
 
G
I
 
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
P
V
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
G
P
 
N
G
 
A
-
 
A
-
 
T
D
 
D
E
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
S
A
 
A
W
 
W
G
 
A
K
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
N
L
 
L
A
 
A
N
 
D
V
 
V
F
 
L
I
 
M
Q
 
G
R
 
M
E
 
E
E
 
S
A
 
E
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
A
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
R
 
K
G
 
G
P
 
W
R
 
R
D
 
T
F
 
F
R
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
E
I
 
K
H
 
R
A
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
V
 
V
I
 
I
K
 
T
S
 
S
F
 
F
E
 
I
L
 
L
V
 
E
P
 
P
N
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
L
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
 
Y
L
 
T
A
 
S
V
 
V
S
 
A
L
 
I
R
 
D
P
 
V
A
 
P
G
 
A
N
 
L
E
 
G
N
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
H
 
I
R
 
R
Q
 
Q
Y
 
Y
S
 
S
L
 
L
T
 
S
H
 
D
L
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
S
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
 
Q
E
 
P
H
 
P
G
 
G
S
 
Y
V
 
V
S
 
S
G
 
N
W
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
N
 
H
A
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
Q
I
 
V
Q
 
K
C
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
Y
 
H
L
 
I
Q
 
D
T
 
V
E
 
D
P
 
A
A
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
T
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
L
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
A
 
-
N
 
K
L
 
V
A
 
A
E
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
P
A
 
P
G
 
R
A
 
Q
V
 
V
N
 
V
W
 
F
L
 
V
H
 
H
A
 
G
A
 
A
E
 
R
N
 
N
G
 
S
S
 
A
Q
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
N
 
D
E
 
R
V
 
L
K
 
R
D
 
E
L
 
A
G
 
A
S
 
K
R
 
T
L
 
Y
S
 
E
H
 
N
F
 
L
S
 
D
S
 
L
H
 
F
I
 
V
W
 
F
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
Q
-
 
P
-
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
D
T
 
V
D
 
Q
N
 
G
D
 
R
R
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Y
Q
 
P
G
 
G
L
 
L
M
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
K
R
 
Q
V
 
I
S
 
E
S
 
K
E
 
S
L
 
I
N
 
L
Q
 
L
P
 
P
E
 
D
R
 
A
Q
 
D
F
 
Y
W
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
I
A
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
F
 
M
I
 
Q
A
 
H
R
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
K
D
 
N
A
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
A
 
E
D
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P

1cqxA Crystal structure of the flavohemoglobin from alcaligenes eutrophus at 1.75 a resolution (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:390/394 of query aligns to 1:398/403 of 1cqxA

query
sites
1cqxA
M
 
M
L
 
L
D
 
T
A
 
Q
Q
 
K
T
 
T
I
 
K
A
 
D
T
 
I
V
 
V
K
 
K
S
 
A
S
 
T
L
 
A
P
 
P
A
 
V
I
 
L
A
 
A
Q
 
E
V
 
H
G
 
G
P
 
Y
E
 
D
L
 
I
T
 
I
G
 
K
H
 
C
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
Q
R
 
R
L
 
M
L
 
F
T
 
E
Q
 
A
H
 
H
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
K
D
 
N
V
 
V
F
|
F
N
|
N
M
 
M
N
x
A
N
x
H
Q
 
Q
R
 
E
S
 
Q
G
 
G
N
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
L
F
 
A
N
 
R
A
 
A
I
 
V
V
 
Y
A
 
A
Y
 
Y
G
 
A
S
 
E
N
 
N
L
 
I
E
 
E
N
 
D
L
 
P
A
 
N
V
 
S
L
 
L
L
 
M
P
 
A
A
 
V
V
 
L
E
 
K
K
 
N
I
|
I
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
H
|
H
T
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
V
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
|
Q
Y
|
Y
A
 
P
V
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
T
 
H
L
 
L
L
 
L
A
 
A
T
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
G
P
 
N
G
 
A
-
 
A
-
 
T
D
 
D
E
 
D
V
 
I
L
 
I
E
 
S
A
 
A
W
 
W
G
 
A
K
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
V
 
N
L
|
L
A
|
A
N
 
D
V
 
V
F
x
L
I
 
M
Q
 
G
R
 
M
E
 
E
E
 
S
A
 
E
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
E
A
 
R
S
 
S
E
 
A
E
 
E
K
 
Q
A
 
P
G
 
G
G
 
G
W
 
W
R
 
K
G
 
G
P
 
W
R
 
R
D
 
T
F
 
F
R
 
V
I
 
I
R
 
R
A
 
E
I
 
K
H
 
R
A
 
P
E
 
E
S
 
S
A
 
D
V
 
V
I
 
I
K
 
T
S
 
S
F
 
F
E
 
I
L
 
L
V
 
E
P
 
P
N
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
P
V
 
V
A
 
V
D
 
N
F
 
F
L
 
E
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
T
A
 
S
V
 
V
S
 
A
L
 
I
R
 
D
P
 
V
A
 
P
G
 
A
N
 
L
E
 
G
N
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
H
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
T
 
S
H
 
D
L
 
M
P
 
P
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
T
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
x
S
V
 
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
P
-
x
Q
E
x
P
H
 
P
G
|
G
S
x
Y
V
|
V
S
|
S
G
 
N
W
 
L
L
 
L
H
 
H
A
 
D
N
 
H
A
 
V
K
 
N
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
Q
I
 
V
Q
 
K
C
 
L
A
 
A
A
 
A
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
D
 
S
F
 
F
Y
 
H
L
 
I
Q
 
D
T
 
V
E
 
D
P
 
A
A
 
K
T
 
T
P
 
P
V
 
I
T
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
G
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
L
T
 
T
P
 
P
M
 
M
L
 
V
A
 
S
M
 
M
L
 
L
A
 
-
N
 
K
L
 
V
A
 
A
E
 
L
Q
 
Q
Q
 
A
H
 
P
A
 
P
G
 
R
A
 
Q
V
 
V
N
 
V
W
 
F
L
 
V
H
 
H
A
 
G
A
 
A
E
 
R
N
 
N
G
 
S
S
 
A
Q
 
V
H
 
H
A
 
A
F
 
M
A
 
R
N
 
D
E
 
R
V
 
L
K
 
R
D
 
E
L
 
A
G
 
A
S
 
K
R
 
T
L
 
Y
S
 
E
H
 
N
F
 
L
S
 
D
S
 
L
H
 
F
I
 
V
W
 
F
Y
 
Y
R
 
D
Q
 
Q
-
 
P
-
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
D
T
 
V
D
 
Q
N
 
G
D
 
R
R
 
D
Y
 
Y
D
 
D
A
 
Y
Q
 
P
G
 
G
L
 
L
M
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
K
R
 
Q
V
 
I
S
 
E
S
 
K
E
 
S
L
 
I
N
 
L
Q
 
L
P
 
P
E
 
D
R
 
A
Q
 
D
F
 
Y
W
 
Y
L
 
I
C
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
I
A
 
P
F
 
F
M
 
M
Q
 
R
F
 
M
I
 
Q
A
 
H
R
 
D
Q
 
A
L
 
L
I
 
K
D
 
N
A
 
L
G
 
G
I
 
I
T
 
H
A
 
E
D
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
|
V
F
 
F
G
|
G
P
|
P

4g1bA X-ray structure of yeast flavohemoglobin in complex with econazole (see paper)
34% identity, 99% coverage: 1:390/394 of query aligns to 1:392/398 of 4g1bA

query
sites
4g1bA
M
 
M
L
 
L
D
 
A
A
 
E
Q
 
K
T
 
T
I
 
R
A
 
S
T
 
I
V
 
I
K
 
K
S
 
A
S
 
T
L
 
V
P
 
P
A
 
V
I
 
L
A
 
E
Q
 
Q
V
 
Q
G
 
G
P
 
T
E
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
R
H
 
T
F
|
F
Y
|
Y
Q
 
K
R
 
N
L
 
M
L
 
L
T
 
T
Q
 
E
H
 
H
P
 
T
E
 
E
L
 
L
K
 
L
D
 
N
V
x
I
F
|
F
N
|
N
M
 
R
N
x
T
N
|
N
Q
 
Q
R
 
K
S
x
V
G
 
G
N
 
A
Q
 
Q
R
 
P
E
 
N
A
|
A
L
|
L
F
 
A
N
 
T
A
x
T
I
 
V
V
 
L
A
 
A
Y
 
A
G
 
A
S
 
K
N
 
N
L
 
I
E
 
D
N
 
D
L
 
L
A
 
S
V
 
V
L
 
L
L
 
M
P
 
D
A
 
H
V
 
V
E
 
K
K
x
Q
I
|
I
A
 
G
Q
 
H
K
|
K
H
|
H
T
 
R
S
 
A
L
|
L
N
 
Q
I
|
I
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
Q
x
H
Y
|
Y
A
 
P
V
 
I
V
|
V
G
 
G
E
 
E
T
 
Y
L
|
L
L
 
L
A
 
K
T
 
A
I
 
I
K
 
K
E
 
E
L
 
V
L
 
L
N
 
-
P
 
-
G
 
G
D
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
P
E
 
E
V
 
I
L
 
I
E
 
N
A
 
A
W
 
W
G
 
G
K
 
E
A
 
A
Y
|
Y
G
 
Q
V
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
D
V
 
I
F
|
F
I
 
I
Q
 
T
R
 
V
E
 
E
E
 
K
A
 
K
I
 
M
Y
 
Y
Q
 
E
A
 
E
S
 
A
E
 
-
E
 
-
K
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
L
W
 
W
R
 
P
G
 
G
P
 
W
R
 
K
D
 
P
F
 
F
R
 
E
I
 
I
R
 
T
A
 
A
I
 
K
H
 
E
A
 
Y
E
 
V
S
 
A
A
 
S
V
 
D
I
 
I
K
 
V
S
 
E
F
 
F
E
 
T
L
 
V
V
 
K
P
 
P
N
 
K
D
 
F
G
 
G
Q
 
S
P
 
G
V
 
I
A
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
S
-
 
L
D
 
P
F
 
I
L
 
T
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
I
A
 
T
V
 
V
S
 
N
L
 
T
R
 
H
P
 
P
A
 
I
G
 
R
N
 
Q
E
 
E
N
 
N
I
 
-
Q
 
Q
H
 
Y
-
 
D
-
 
A
-
 
L
R
|
R
Q
x
H
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
T
 
C
H
 
S
L
 
A
P
 
S
N
 
T
G
 
K
Q
 
N
S
 
G
Y
 
L
R
 
R
I
 
F
A
|
A
V
 
V
K
|
K
R
 
M
E
|
E
E
 
A
-
 
A
-
 
R
-
 
E
-
 
N
-
x
F
-
x
P
H
 
A
G
|
G
S
x
L
V
|
V
S
|
S
G
 
E
W
 
Y
L
 
L
H
 
H
A
 
K
N
 
D
A
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
E
I
 
I
Q
 
K
C
 
L
A
 
S
A
 
A
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
A
L
 
I
Q
 
N
T
 
K
E
 
E
-
 
L
-
 
I
-
 
H
-
 
Q
P
 
N
A
 
E
T
 
V
P
 
P
V
 
L
T
 
V
L
 
L
I
 
L
S
 
S
A
 
S
G
 
G
V
|
V
G
 
G
Q
 
V
T
 
T
P
 
P
M
 
L
L
 
L
A
 
A
M
 
M
L
 
L
A
 
E
N
 
E
L
 
Q
A
 
V
E
 
K
Q
 
C
Q
 
N
H
 
P
A
 
N
G
 
R
A
 
P
V
 
I
N
 
Y
W
 
W
L
 
I
H
 
Q
A
 
S
A
 
S
E
 
Y
N
 
D
G
 
E
S
 
K
Q
 
T
H
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
K
N
 
K
E
 
H
V
 
V
K
 
D
D
 
E
L
 
L
G
 
L
S
 
A
R
 
E
L
 
C
S
 
A
H
 
N
F
 
V
S
 
D
S
 
K
H
 
I
I
 
I
W
 
V
Y
 
H
R
 
T
Q
 
D
P
 
T
E
 
E
S
 
P
T
 
L
D
 
I
N
 
N
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
-
L
 
-
M
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
A
R
 
A
V
 
F
S
 
L
S
 
K
E
 
E
L
 
K
N
 
S
Q
 
P
P
 
A
E
 
H
R
 
A
Q
 
D
F
 
V
W
 
Y
L
 
T
C
 
C
G
 
G
P
 
S
L
 
L
A
 
A
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
F
 
A
I
 
M
A
 
I
R
 
G
Q
 
H
L
 
L
I
 
K
D
 
E
A
 
L
G
 
E
I
 
H
T
 
R
A
 
D
D
 
D
R
 
M
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
 
E
V
 
P
F
|
F
G
 
G
P
|
P

Sites not aligning to the query:

4eh1A Crystal structure of the flavohem-like-fad/NAD binding domain of nitric oxide dioxygenase from vibrio cholerae o1 biovar el tor
46% identity, 61% coverage: 150:390/394 of query aligns to 1:237/237 of 4eh1A

query
sites
4eh1A
R
 
R
G
 
D
P
 
G
R
 
R
D
 
T
F
 
F
R
 
V
I
 
V
R
 
R
A
 
E
I
 
K
H
 
Q
A
 
V
E
 
E
S
 
S
A
 
A
V
 
Y
I
 
V
K
 
T
S
 
S
F
 
F
E
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
N
 
A
D
 
D
G
 
G
Q
 
G
P
 
A
V
 
V
A
 
L
D
 
D
F
 
Y
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
I
A
 
G
V
 
I
S
 
E
L
 
V
R
 
T
P
 
P
A
 
E
G
 
G
N
 
S
E
 
D
N
 
Y
I
 
R
Q
 
E
H
 
I
R
|
R
Q
|
Q
Y
|
Y
S
|
S
L
 
L
T
 
S
H
 
H
L
 
A
P
 
S
N
 
N
G
 
G
Q
 
R
S
 
E
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
x
S
V
|
V
K
 
K
R
 
R
E
|
E
E
 
G
H
 
V
G
 
G
S
 
S
-
 
D
-
x
N
-
 
P
-
x
G
-
x
L
V
|
V
S
|
S
G
 
H
W
 
Y
L
 
L
H
 
H
A
 
N
N
 
N
A
 
V
K
 
K
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
S
I
 
V
Q
 
K
C
 
L
A
 
Y
A
 
A
P
 
P
A
 
A
G
 
G
D
 
D
F
 
F
Y
 
F
L
 
Y
Q
 
-
T
 
V
E
 
E
P
 
R
A
 
E
T
 
R
P
 
P
V
 
V
T
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
Q
 
A
T
|
T
P
 
P
M
 
M
L
 
Q
A
 
A
M
 
I
L
 
L
A
 
H
N
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
K
Q
 
Q
Q
 
N
H
 
K
A
 
S
G
 
G
A
 
-
V
 
V
N
 
T
W
 
Y
L
 
L
H
 
Y
A
 
A
A
 
C
E
 
N
N
 
S
G
 
A
S
 
K
Q
 
E
H
 
H
A
 
T
F
 
F
A
 
A
N
 
Q
E
 
E
V
 
T
K
 
A
D
 
Q
L
 
L
G
 
I
S
 
A
R
 
Q
L
 
-
S
 
Q
H
 
G
F
 
W
S
 
M
S
 
Q
H
 
Q
I
 
V
W
 
W
Y
 
Y
R
 
R
Q
 
D
P
 
-
E
 
E
S
 
S
T
 
A
D
 
D
N
 
D
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
D
 
V
A
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
E
M
 
M
D
 
Q
L
 
L
A
 
A
R
 
-
V
 
-
S
 
-
S
 
-
E
 
E
L
 
L
N
 
I
Q
 
L
P
 
P
-
 
I
-
 
E
E
 
D
R
 
G
Q
 
D
F
 
F
W
 
Y
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
I
A
 
G
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
F
 
Y
I
 
V
A
 
V
R
 
K
Q
 
Q
L
 
L
I
 
L
D
 
A
A
 
L
G
 
G
I
 
V
T
 
D
A
 
K
D
 
A
R
 
R
I
 
I
H
 
H
Y
 
Y
E
|
E
V
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P

6o0aA Crystal structure of flavohemoglobin from malassezia yamatoensis with bound fad and heme determined by iron sad phasing (see paper)
29% identity, 98% coverage: 2:389/394 of query aligns to 3:383/383 of 6o0aA

query
sites
6o0aA
L
 
L
D
 
S
A
 
T
Q
 
K
T
 
S
I
 
Q
A
 
P
T
 
V
V
 
I
K
 
Q
S
 
A
S
 
T
L
 
L
P
 
P
A
 
V
I
 
I
A
 
A
Q
 
E
V
 
R
G
 
I
P
 
P
E
 
H
L
 
I
T
 
T
G
 
P
H
 
V
F
 
F
Y
 
Y
Q
 
G
R
 
D
L
 
M
L
 
L
T
 
Q
Q
 
A
H
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
L
K
 
L
D
 
D
-
 
G
V
x
M
F
|
F
N
x
S
M
 
R
N
x
S
N
 
A
Q
 
Q
R
|
R
S
x
D
G
 
G
N
 
T
Q
 
Q
R
 
A
E
 
R
A
 
A
L
|
L
F
 
A
N
 
G
A
x
S
I
 
I
V
 
A
A
 
I
Y
 
F
G
 
A
S
 
Q
N
 
W
L
 
I
E
 
L
N
 
Q
L
 
H
A
 
P
V
 
N
L
 
T
L
 
F
P
 
P
-
 
E
-
 
E
A
 
M
V
 
L
E
 
S
K
x
R
I
x
V
A
 
A
Q
 
N
K
 
K
H
|
H
T
 
A
S
 
S
L
|
L
N
 
G
I
x
L
Q
 
Q
P
 
P
A
 
D
Q
x
E
Y
|
Y
A
 
D
V
 
T
V
|
V
G
 
Y
E
 
K
T
 
Y
L
 
L
L
 
F
A
 
G
T
 
A
I
 
I
K
 
A
E
 
K
L
 
D
L
 
L
N
 
-
P
 
-
G
 
G
D
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
T
-
 
P
E
 
D
V
 
I
L
 
V
E
 
E
A
 
A
W
 
W
G
 
T
K
 
E
A
 
V
Y
|
Y
G
 
W
V
 
L
L
|
L
A
 
A
N
 
R
V
 
A
F
 
L
I
 
I
Q
 
N
R
 
L
E
 
E
E
 
R
A
 
K
I
 
L
Y
 
Y
Q
 
-
A
 
-
S
 
A
E
 
Q
E
 
Q
K
 
A
A
 
N
G
 
N
G
 
I
W
 
V
R
 
R
G
 
A
P
 
K
R
 
F
D
 
K
F
 
L
R
 
V
I
 
K
R
 
R
A
 
T
I
 
Q
H
 
V
A
 
T
E
 
K
S
 
D
A
 
V
V
 
V
I
 
D
K
 
M
S
 
V
F
 
F
E
 
E
L
 
-
V
 
-
P
 
P
N
 
A
D
 
D
G
 
N
Q
 
T
P
 
A
V
 
M
A
 
T
D
 
P
F
 
G
L
 
K
P
 
A
G
 
G
Q
 
Q
Y
|
Y
L
 
I
A
 
S
V
 
I
S
 
Y
L
 
A
R
 
R
P
 
-
A
 
T
G
 
S
N
 
D
E
 
G
N
 
L
I
 
L
Q
 
Q
H
 
P
R
|
R
Q
|
Q
Y
x
F
S
x
T
L
 
L
T
 
-
H
 
-
L
 
L
P
 
P
N
 
S
G
 
E
Q
 
E
S
 
T
-
 
Q
Y
 
R
R
 
R
I
 
I
A
 
A
V
 
I
K
|
K
R
 
L
E
x
D
E
 
P
H
|
H
G
|
G
S
x
E
V
x
M
S
x
T
G
 
T
W
 
-
L
 
I
H
 
F
A
 
Q
N
 
N
A
 
Q
K
 
E
V
 
V
G
 
G
D
 
A
I
 
L
I
 
L
Q
 
D
C
 
I
A
 
S
A
 
N
P
 
P
A
 
Y
G
 
G
D
 
D
F
 
M
Y
 
T
L
 
L
Q
 
E
T
 
T
-
 
L
-
 
E
-
 
T
E
 
D
P
 
P
A
 
N
T
 
S
P
 
P
V
 
L
T
 
V
L
 
L
I
 
I
S
 
C
A
 
A
G
 
G
V
 
I
G
 
G
Q
 
V
T
|
T
P
 
P
M
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
F
L
 
V
A
 
E
N
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
H
 
S
A
 
E
G
 
R
A
 
E
V
 
V
N
 
M
W
 
I
L
 
I
H
 
A
A
 
S
A
 
S
E
 
R
N
 
S
G
 
L
S
 
A
Q
 
E
H
 
A
A
 
P
F
 
L
A
 
R
N
 
G
E
 
E
V
 
L
K
 
L
D
 
E
L
 
R
G
 
A
S
 
K
R
 
E
L
 
L
S
 
K
H
 
K
F
 
-
S
 
-
S
 
A
H
 
K
I
 
V
W
 
L
Y
 
Y
R
 
G
Q
 
T
P
 
T
E
 
Q
S
 
E
T
 
K
D
 
D
N
 
G
D
 
D
R
 
F
Y
 
V
D
 
-
A
 
-
Q
 
-
G
 
G
L
 
R
M
 
I
D
 
D
L
 
V
A
 
S
R
 
T
V
 
L
S
 
D
S
 
I
E
 
P
L
 
A
N
 
N
Q
 
A
P
 
-
E
 
-
R
 
-
Q
 
S
F
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
K
F
 
F
M
 
M
Q
 
Q
F
 
E
I
 
M
A
 
R
R
 
S
Q
 
H
L
 
L
I
 
V
D
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
I
T
 
A
A
 
K
D
 
H
R
 
K
I
 
I
H
 
F
Y
 
Y
E
|
E
V
 
I
F
|
F
G
|
G

Q03331 Flavohemoprotein; Flavohemoglobin; Hemoglobin-like protein; Nitric oxide dioxygenase; NO oxygenase; NOD; EC 1.14.12.17 from Candida norvegensis (Yeast) (Candida mycoderma) (see paper)
27% identity, 99% coverage: 2:390/394 of query aligns to 13:385/390 of Q03331

query
sites
Q03331
L
 
L
D
 
T
A
 
P
Q
 
T
T
 
E
I
 
I
A
 
N
T
 
F
V
 
L
K
 
Q
S
 
S
S
 
L
L
 
A
P
 
P
A
 
V
I
 
V
A
 
K
Q
 
E
V
 
H
G
 
G
P
 
V
E
 
T
L
 
V
T
 
T
G
 
S
H
 
T
F
 
M
Y
 
Y
Q
 
K
R
 
Y
L
 
M
L
 
F
T
 
Q
Q
 
T
H
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
V
K
 
R
D
 
S
V
 
Y
F
 
F
N
 
N
M
 
M
N
 
T
N
 
N
Q
 
Q
R
 
K
S
 
T
G
 
G
N
 
R
Q
 
Q
R
 
P
E
 
K
A
 
V
L
 
L
F
 
A
N
 
F
A
 
S
I
 
L
V
 
Y
A
 
Q
Y
 
Y
G
 
I
S
 
L
N
 
H
L
 
L
E
 
N
N
 
D
L
 
L
A
 
T
V
 
P
L
 
I
L
 
S
P
 
G
A
 
F
V
 
V
E
 
N
K
 
Q
I
 
I
A
 
V
Q
 
L
K
 
K
H
 
H
T
 
C
S
 
G
L
 
L
N
 
G
I
 
I
Q
 
K
P
 
P
A
 
D
Q
 
Q
Y
 
Y
A
 
P
V
 
V
V
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
S
L
 
L
L
 
V
A
 
Q
T
 
A
I
 
F
K
 
K
E
 
M
L
 
V
L
 
L
-
 
G
N
 
E
P
 
A
G
 
A
D
 
D
E
 
E
-
 
H
V
 
F
L
 
V
E
 
E
A
 
V
W
 
F
G
 
K
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
V
 
N
L
 
L
A
 
A
N
 
Q
V
 
T
F
 
L
I
 
I
Q
 
D
R
 
A
E
 
E
E
 
A
A
 
S
I
 
V
Y
 
Y
Q
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
E
 
-
K
 
K
A
 
T
G
 
L
G
 
A
W
 
W
R
 
E
G
 
E
P
 
F
R
 
K
D
 
D
F
 
F
R
 
R
I
 
V
R
 
T
A
 
K
I
 
L
H
 
V
A
 
K
E
 
E
S
 
A
A
 
E
V
 
D
I
 
V
K
 
T
S
 
S
F
 
V
E
 
Y
L
 
L
V
 
T
P
 
P
N
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
F
P
 
K
V
 
L
A
 
K
D
 
P
F
 
I
L
 
I
P
 
P
G
 
G
Q
 
E
Y
 
Y
L
 
I
A
 
S
V
 
F
-
 
R
-
 
W
S
 
D
L
 
I
R
 
H
P
 
N
A
 
P
G
 
D
N
 
I
E
 
T
N
 
D
I
 
I
Q
 
Q
H
 
P
R
 
R
Q
 
E
Y
 
Y
S
 
S
L
 
I
T
 
S
H
 
Q
L
 
D
P
 
V
N
 
K
G
 
E
Q
 
N
S
 
E
Y
 
Y
R
 
R
I
 
I
A
 
S
V
 
V
K
 
R
R
 
-
E
 
-
E
 
D
H
 
I
G
 
G
S
 
I
V
 
V
S
 
S
G
 
D
W
 
Y
L
 
I
H
 
N
A
 
K
N
 
K
A
 
L
K
 
Q
V
 
V
G
 
G
D
 
D
I
 
I
I
 
V
Q
 
P
C
 
V
A
 
H
A
 
A
P
 
P
A
 
V
G
 
G
D
 
T
F
 
M
-
 
K
Y
 
Y
L
 
D
Q
 
S
T
 
I
E
 
S
P
 
K
A
 
K
T
 
G
P
 
K
V
 
V
T
 
A
L
 
V
I
 
L
S
 
A
A
 
G
G
 
G
V
 
I
G
 
G
Q
 
I
T
 
T
P
 
P
M
 
M
L
 
I
A
 
P
M
 
I
L
 
I
A
 
E
N
 
H
L
 
A
A
 
L
E
 
K
Q
 
D
Q
 
G
H
 
K
A
 
D
G
 
V
A
 
E
V
 
L
N
 
Y
W
 
Y
L
 
S
H
 
N
A
 
R
A
 
S
E
 
Y
N
 
Q
G
 
S
S
 
E
-
 
P
-
 
F
Q
 
R
H
 
E
A
 
F
F
 
F
A
 
S
N
 
N
E
 
L
V
 
E
K
 
K
D
 
E
L
 
N
G
 
N
S
 
G
R
 
K
L
 
F
S
 
K
H
 
-
F
 
L
S
 
N
S
 
N
H
 
Y
I
 
I
W
 
-
Y
 
-
R
 
-
Q
 
-
P
 
-
E
 
-
S
 
S
T
 
A
D
 
E
N
 
N
D
 
Q
R
 
K
Y
 
L
D
 
Q
A
 
V
Q
 
K
G
 
D
L
 
L
M
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
R
 
-
V
 
-
S
 
-
S
 
E
E
 
H
L
 
I
N
 
N
Q
 
P
P
 
D
E