SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_085120951.1 NCBI__GCF_900177295.1:WP_085120951.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3h81A Crystal structure of enoyl-coa hydratase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
57% identity, 99% coverage: 3:258/258 of query aligns to 2:256/256 of 3h81A

query
sites
3h81A
F
 
Y
E
 
E
D
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
K
 
D
G
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
N
T
 
S
P
 
Q
L
 
V
I
 
M
D
 
N
E
 
E
L
 
V
G
 
T
Q
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
D
A
 
D
D
 
D
E
 
P
A
 
D
I
 
I
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
K
 
A
E
 
D
K
 
L
S
 
T
Y
 
F
A
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
F
D
x
T
E
 
A
D
 
D
F
 
F
I
x
F
T
 
-
G
 
A
D
 
T
W
 
W
E
 
G
V
 
K
V
 
L
A
 
A
H
 
A
C
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
D
L
 
L
C
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
R
M
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
D
G
 
D
F
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
R
K
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
S
S
 
Q
Y
 
M
S
 
S
L
 
A
P
 
S
V
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
S
L
 
L
A
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
L
L
|
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
L
F
 
F
H
 
H
G
 
S
T
 
A
F
|
F
A
 
A
L
 
T
E
 
E
D
 
D
R
x
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
N
 
Q
F
 
F
K
 
T
H
 
H
R
 
R

1dubA 2-enoyl-coa hydratase, data collected at 100 k, ph 6.5 (see paper)
58% identity, 98% coverage: 3:256/258 of query aligns to 3:258/260 of 1dubA

query
sites
1dubA
F
 
F
E
 
Q
D
 
Y
I
 
I
L
 
I
V
 
T
E
 
E
R
 
K
K
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
P
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
E
D
 
D
E
 
P
A
 
A
I
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
K
 
Q
E
 
N
K
 
R
S
 
T
Y
 
F
A
 
Q
D
 
D
V
 
C
L
 
Y
D
x
S
E
 
G
D
 
K
F
 
F
I
x
L
T
 
S
G
 
-
D
 
H
W
 
W
E
 
D
V
 
H
V
 
I
A
 
T
H
 
R
C
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
F
x
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
L
L
|
L
G
 
G
T
|
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Y
 
E
L
 
M
C
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
V
E
 
E
G
 
T
F
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
K
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
N
Y
 
N
S
 
S
L
 
K
P
 
I
V
 
I
L
 
V
R
 
A
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
N
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
T
 
L
F
|
F
H
 
Y
G
 
S
T
 
T
F
|
F
A
 
A
L
 
T
E
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
S
A
 
A
F
|
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
N
 
N
F
 
F
K
 
K

1ey3A Structure of enoyl-coa hydratase complexed with the substrate dac-coa (see paper)
58% identity, 98% coverage: 3:256/258 of query aligns to 1:256/258 of 1ey3A

query
sites
1ey3A
F
 
F
E
 
Q
D
 
Y
I
 
I
L
 
I
V
 
T
E
 
E
R
 
K
K
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
P
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
E
D
 
D
E
 
P
A
 
A
I
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
K
 
Q
E
 
N
K
 
R
S
 
T
Y
 
F
A
 
Q
D
 
D
V
 
C
L
 
Y
D
x
S
E
 
G
D
 
K
F
 
F
I
x
L
T
 
S
G
 
-
D
 
H
W
|
W
E
 
D
V
 
H
V
 
I
A
 
T
H
 
R
C
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
L
L
|
L
G
 
G
T
|
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Y
 
E
L
 
M
C
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
V
E
 
E
G
 
T
F
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
K
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
N
Y
 
N
S
 
S
L
 
K
P
 
I
V
 
I
L
 
V
R
 
A
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
N
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
T
 
L
F
 
F
H
 
Y
G
 
S
T
 
T
F
|
F
A
 
A
L
 
T
E
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
N
 
N
F
 
F
K
 
K

P14604 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial; mECH; mECH1; Enoyl-CoA hydratase 1; ECHS1; Short-chain enoyl-CoA hydratase; SCEH; EC 4.2.1.17; EC 5.3.3.8 from Rattus norvegicus (Rat) (see 3 papers)
58% identity, 98% coverage: 3:256/258 of query aligns to 33:288/290 of P14604

query
sites
P14604
F
 
F
E
 
Q
D
 
Y
I
 
I
L
 
I
V
 
T
E
 
E
R
 
K
K
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
K
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
P
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
E
D
 
D
E
 
P
A
 
A
I
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
 
M
K
 
Q
E
 
N
K
 
R
S
 
T
Y
 
F
A
 
Q
D
 
D
V
 
C
L
 
Y
D
 
S
E
 
G
D
 
K
F
 
F
I
 
L
T
 
S
G
 
-
D
 
H
W
 
W
E
 
D
V
 
H
V
 
I
A
 
T
H
 
R
C
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
E
|
E
I
 
I
K
 
L
L
 
L
G
 
G
T
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Y
 
E
L
 
M
C
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
V
E
 
E
G
 
T
F
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
K
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
N
Y
 
N
S
 
S
L
 
K
P
 
I
V
 
I
L
 
V
R
 
A
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
N
L
 
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
T
 
L
F
 
F
H
 
Y
G
 
S
T
 
T
F
 
F
A
 
A
L
 
T
E
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
N
 
N
F
 
F
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3q0jC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase in complex with the inhibitor acetoacetylcoa
57% identity, 99% coverage: 1:255/258 of query aligns to 1:254/255 of 3q0jC

query
sites
3q0jC
M
 
M
A
 
T
F
 
Y
E
 
E
D
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
K
 
D
G
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
x
Q
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
N
T
 
S
P
 
Q
L
 
V
I
 
M
D
 
N
E
 
E
L
 
V
G
 
T
Q
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
D
A
 
D
D
 
D
E
 
P
A
 
D
I
 
I
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
K
 
A
E
 
D
K
 
L
S
 
T
Y
 
F
A
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
F
D
x
T
E
 
A
D
 
D
F
 
F
I
x
F
T
 
-
G
 
A
D
 
T
W
 
W
E
 
G
V
 
K
V
 
L
A
 
A
H
 
A
C
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
x
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
D
L
 
L
C
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
R
M
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
D
G
 
D
F
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
R
K
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
S
S
 
Q
Y
 
M
S
 
S
L
 
A
P
 
S
V
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
S
L
 
L
A
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
L
L
|
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
L
F
 
F
H
 
H
G
 
S
T
 
A
F
|
F
A
 
A
L
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
N
 
Q
F
 
F

3q0gC Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
57% identity, 99% coverage: 1:255/258 of query aligns to 1:254/255 of 3q0gC

query
sites
3q0gC
M
 
M
A
 
T
F
 
Y
E
 
E
D
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
K
 
D
G
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
N
T
 
S
P
 
Q
L
 
V
I
 
M
D
 
N
E
 
E
L
 
V
G
 
T
Q
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
D
A
 
D
D
 
D
E
 
P
A
 
D
I
 
I
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
K
 
A
E
 
D
K
 
L
S
 
T
Y
 
F
A
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
F
D
x
T
E
 
A
D
 
D
F
 
F
I
x
F
T
 
-
G
 
A
D
 
T
W
 
W
E
 
G
V
 
K
V
 
L
A
 
A
H
 
A
C
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
x
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
K
L
|
L
G
 
G
T
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
D
L
 
L
C
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
R
M
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
D
G
 
D
F
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
R
K
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
S
S
 
Q
Y
 
M
S
 
S
L
 
A
P
 
S
V
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
S
L
 
L
A
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
L
L
|
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
L
F
 
F
H
 
H
G
 
S
T
 
A
F
|
F
A
 
A
L
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
A
A
 
A
F
 
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
N
 
Q
F
 
F

2dubA Enoyl-coa hydratase complexed with octanoyl-coa (see paper)
57% identity, 98% coverage: 3:256/258 of query aligns to 2:252/254 of 2dubA

query
sites
2dubA
F
 
F
E
 
Q
D
 
Y
I
 
I
L
 
I
V
 
T
E
 
E
R
 
K
K
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
P
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
E
D
 
D
E
 
P
A
 
A
I
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
|
K
E
 
E
M
|
M
K
 
Q
E
 
N
K
 
R
S
 
T
Y
 
F
A
 
Q
D
 
D
V
 
C
L
 
Y
D
x
S
E
 
H
D
 
-
F
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
W
E
 
D
V
 
H
V
 
I
A
 
T
H
 
R
C
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
L
L
 
L
G
 
G
T
|
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
|
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Y
 
E
L
 
M
C
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
V
E
 
E
G
 
T
F
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
K
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
N
Y
 
N
S
 
S
L
 
K
P
 
I
V
 
I
L
 
V
R
 
A
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
N
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
T
 
L
F
 
F
H
 
Y
G
 
S
T
 
T
F
|
F
A
 
A
L
 
T
E
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
N
 
N
F
 
F
K
 
K

2hw5C The crystal structure of human enoyl-coenzyme a (coa) hydratase short chain 1, echs1
58% identity, 99% coverage: 3:258/258 of query aligns to 3:260/260 of 2hw5C

query
sites
2hw5C
F
 
F
E
 
E
D
 
Y
I
 
I
L
 
I
V
 
A
E
 
E
R
 
K
K
 
R
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
N
A
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
D
P
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
D
E
 
E
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
I
L
 
F
E
 
E
A
 
E
D
 
D
E
 
P
A
 
A
I
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
D
K
|
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
K
 
Q
E
 
N
K
 
L
S
 
S
Y
 
F
A
 
Q
D
 
D
V
 
C
L
 
Y
D
x
S
E
 
S
D
 
K
F
 
F
I
x
L
T
 
K
G
 
-
D
 
H
W
 
W
E
 
D
V
 
H
V
 
L
A
 
T
H
 
Q
C
 
V
R
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
L
x
F
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
A
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
L
L
 
I
G
 
G
T
|
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Y
 
E
L
 
M
C
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
C
P
 
P
A
 
V
E
 
E
G
 
T
F
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
K
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
S
Y
 
N
S
 
S
L
 
K
P
 
I
V
 
V
L
 
V
R
 
A
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
S
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
T
 
L
F
 
F
H
 
Y
G
 
S
T
 
T
F
|
F
A
 
A
L
 
T
E
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
T
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
N
 
N
F
 
F
K
 
K
H
 
D
R
 
Q

1mj3A Crystal structure analysis of rat enoyl-coa hydratase in complex with hexadienoyl-coa (see paper)
57% identity, 98% coverage: 3:256/258 of query aligns to 3:256/258 of 1mj3A

query
sites
1mj3A
F
 
F
E
 
Q
D
 
Y
I
 
I
L
 
I
V
 
T
E
 
E
R
 
K
K
 
K
G
 
G
-
 
K
-
 
N
-
 
S
A
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
L
V
 
I
T
 
Q
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
|
K
A
|
A
L
|
L
N
 
N
A
|
A
L
 
L
C
 
C
T
 
N
P
 
G
L
 
L
I
 
I
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
T
L
 
F
E
 
E
A
 
E
D
 
D
E
 
P
A
 
A
I
 
V
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
V
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
K
 
Q
E
 
N
K
 
R
S
 
T
Y
 
F
A
 
Q
D
 
D
V
 
C
L
 
Y
D
x
S
E
 
G
D
 
-
F
 
-
I
 
-
T
x
L
G
 
S
D
 
H
W
 
W
E
 
D
V
 
H
V
 
I
A
 
T
H
 
R
C
 
I
R
 
K
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
I
I
 
I
L
 
Y
A
 
A
A
 
G
E
 
E
T
 
K
A
 
A
R
 
Q
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
L
L
|
L
G
 
G
T
|
T
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
V
G
 
G
K
 
K
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
M
Y
 
E
L
 
M
C
 
V
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
R
I
 
I
D
 
S
A
 
A
E
 
Q
T
 
D
A
 
A
L
 
K
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
K
V
 
I
L
 
F
P
 
P
A
 
V
E
 
E
G
 
T
F
 
L
L
 
V
D
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
I
K
 
Q
V
 
C
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
N
Y
 
N
S
 
S
L
 
K
P
 
I
V
 
I
L
 
V
R
 
A
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
S
V
 
V
N
 
N
R
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
M
T
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
N
L
x
K
F
 
L
E
 
E
R
 
K
R
 
K
T
 
L
F
 
F
H
 
Y
G
 
S
T
 
T
F
|
F
A
 
A
L
 
T
E
 
D
D
 
D
R
 
R
K
 
R
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
V
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
K
P
 
A
N
 
N
F
 
F
K
 
K

3q0gD Crystal structure of the mycobacterium tuberculosis crotonase bound to a reaction intermediate derived from crotonyl coa
57% identity, 98% coverage: 3:255/258 of query aligns to 2:249/250 of 3q0gD

query
sites
3q0gD
F
 
Y
E
 
E
D
 
T
I
 
I
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
K
 
D
G
 
Q
A
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
I
V
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
N
T
 
S
P
 
Q
L
 
V
I
 
M
D
 
N
E
 
E
L
 
V
G
 
T
Q
 
S
A
 
A
L
 
A
A
 
T
E
 
E
L
 
L
E
 
D
A
 
D
D
 
D
E
 
P
A
 
D
I
 
I
R
 
G
C
 
A
I
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
|
A
D
 
D
I
 
I
K
 
K
E
 
E
M
|
M
K
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
Y
 
F
A
 
A
D
 
D
V
 
A
L
 
F
D
x
T
E
 
A
D
 
D
F
 
F
I
x
F
T
 
-
G
 
A
D
 
T
W
 
W
E
 
G
V
 
K
V
 
L
A
 
A
H
 
A
C
 
V
R
 
R
K
 
T
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
C
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
V
I
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
T
 
T
A
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
K
L
 
L
G
 
G
T
x
V
I
 
L
P
|
P
G
|
G
A
 
M
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
M
Y
 
D
L
 
L
C
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
R
M
 
T
I
 
M
D
 
D
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
E
R
 
R
A
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
S
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
D
G
 
D
F
 
L
L
 
L
D
 
T
E
 
E
V
 
A
M
 
R
K
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
S
S
 
Q
Y
 
M
S
 
S
L
 
A
P
 
S
V
 
A
L
 
A
R
 
R
T
 
M
C
 
A
K
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
T
 
S
T
 
S
L
 
L
A
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
L
L
|
L
F
 
Y
E
 
E
R
 
R
R
 
R
T
 
L
F
|
F
H
 
H
G
 
S
T
 
A
F
|
F
A
 
A
L
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
Q
K
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
M
E
 
A
A
 
A
F
|
F
A
 
I
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
N
 
Q
F
 
F

5zaiC Crystal structure of 3-hydroxypropionyl-coa dehydratase from metallosphaera sedula (see paper)
43% identity, 100% coverage: 1:258/258 of query aligns to 1:259/259 of 5zaiC

query
sites
5zaiC
M
 
M
A
 
E
F
 
F
E
 
E
D
 
T
I
 
I
L
 
E
V
 
T
E
 
K
R
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
N
V
 
L
G
 
F
V
 
W
V
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
D
A
x
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
N
T
 
A
P
 
K
L
 
L
I
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
D
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
S
E
 
Q
L
 
A
E
 
E
A
 
S
D
 
D
E
 
P
A
 
E
I
 
I
R
 
R
C
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
K
E
 
G
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
|
A
G
|
G
A
|
A
D
|
D
I
|
I
K
 
T
E
 
Q
M
x
F
K
 
N
E
 
Q
K
 
L
S
 
T
Y
 
P
A
 
A
D
 
E
V
 
A
L
 
W
D
 
K
E
 
-
D
 
-
F
 
F
I
x
S
T
 
K
G
 
K
D
 
G
W
x
R
E
 
E
V
 
I
-
 
M
-
 
D
-
 
K
V
 
I
A
 
E
H
 
A
C
 
L
R
 
S
K
 
K
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
M
V
 
I
A
 
N
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
|
G
G
 
G
C
 
L
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
I
I
 
R
L
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
Q
F
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
|
P
E
|
E
I
 
I
K
 
N
L
 
L
G
 
G
T
x
I
I
 
Y
P
|
P
G
|
G
A
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
T
R
 
R
S
 
V
V
 
I
G
 
G
K
 
K
S
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
L
Y
 
E
L
 
M
C
 
M
L
 
M
S
 
T
G
 
G
D
 
D
M
x
R
I
 
I
D
 
P
A
 
G
E
 
K
T
 
D
A
 
A
L
 
E
R
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
N
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
E
 
A
G
 
N
F
 
L
L
 
E
D
 
Q
E
 
E
V
 
T
M
 
R
K
 
K
V
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
K
I
 
I
A
 
A
S
 
K
Y
 
K
S
 
S
L
 
P
P
 
I
V
 
S
L
 
L
R
 
A
T
 
L
C
 
I
K
 
K
E
 
E
A
 
V
V
 
V
N
 
N
R
 
R
A
 
G
Y
 
L
E
 
D
T
 
S
T
 
P
L
 
L
A
 
L
E
 
S
G
 
G
V
 
L
L
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
S
R
 
V
T
 
G
F
 
W
H
 
G
G
 
V
T
 
V
F
|
F
A
 
S
L
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
K
K
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
V
E
 
S
A
 
A
F
|
F
A
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
E
P
 
P
N
 
T
F
 
F
K
 
K
H
 
G
R
 
K

5jbxB Crystal structure of liuc in complex with coenzyme a and malonic acid (see paper)
35% identity, 97% coverage: 8:258/258 of query aligns to 9:261/261 of 5jbxB

query
sites
5jbxB
V
 
V
E
 
D
R
 
A
K
 
R
G
 
G
A
 
P
V
 
I
G
 
E
V
 
I
V
 
W
T
 
T
L
 
I
N
 
D
R
 
G
P
 
E
K
x
S
A
x
R
L
x
R
N
 
N
A
|
A
L
 
I
C
 
S
T
 
R
P
 
A
L
 
M
I
 
L
D
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
G
Q
 
E
A
 
L
L
 
V
A
 
T
E
 
R
L
 
V
E
 
S
A
 
S
D
 
S
E
 
R
A
 
D
I
 
V
R
 
R
C
 
A
I
 
V
V
 
V
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
A
-
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
|
A
G
 
G
A
|
A
D
|
D
I
x
L
K
|
K
E
 
E
M
x
R
K
 
A
E
 
T
K
 
M
S
 
A
Y
 
E
A
 
D
D
 
E
V
 
V
L
 
-
D
 
-
E
 
R
D
 
A
F
 
F
I
x
L
T
 
D
G
 
G
D
 
L
W
x
R
E
 
R
V
 
T
V
 
F
A
 
R
H
 
A
C
 
I
R
 
E
K
 
K
P
 
S
T
 
D
-
 
C
-
 
V
-
 
F
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
N
G
 
G
F
 
A
A
 
A
L
|
L
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
T
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
L
I
 
R
L
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
P
T
 
A
A
 
A
R
 
E
F
 
L
G
 
G
Q
 
L
P
x
T
E
|
E
I
 
V
K
 
K
L
|
L
G
 
G
T
x
I
I
 
I
P
|
P
G
|
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
A
R
 
R
S
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
P
S
 
G
L
 
R
A
 
A
M
 
K
Y
 
D
L
 
L
C
 
I
L
 
L
S
 
T
G
 
A
D
 
R
M
x
R
I
 
I
D
 
N
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
A
A
 
N
K
 
R
V
 
L
L
 
A
P
 
P
A
 
E
E
 
G
G
 
H
F
 
L
L
 
L
D
 
A
E
 
V
V
 
A
M
 
Y
K
 
G
V
 
L
A
 
A
E
 
E
T
 
S
I
 
V
A
 
V
S
 
E
Y
 
N
S
 
A
L
 
P
P
 
I
V
 
A
L
 
V
R
 
A
T
 
T
C
 
A
K
 
K
E
 
H
A
 
A
V
 
I
N
 
D
R
 
E
A
 
G
Y
 
T
E
 
G
T
 
L
T
 
E
L
 
L
A
 
D
E
 
D
G
 
A
V
 
L
L
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
L
R
 
R
T
 
K
F
 
Y
H
 
E
G
 
E
T
 
I
F
x
L
A
 
K
L
 
T
E
 
E
D
 
D
R
 
R
K
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
L
E
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
N
 
V
F
 
Y
K
 
K
H
 
G
R
 
R

6slaAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 6:258/258 of query aligns to 2:245/245 of 6slaAAA

query
sites
6slaAAA
I
 
I
L
 
L
V
 
K
E
 
E
R
 
R
K
 
Q
G
 
D
A
 
G
V
 
V
G
 
L
V
 
V
V
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
E
A
 
K
L
|
L
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
T
T
 
G
P
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
A
L
 
L
G
 
Y
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
G
E
 
E
A
 
E
D
 
D
E
 
R
A
 
E
I
 
V
R
 
R
C
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
G
K
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
Q
D
|
D
I
x
L
K
 
T
E
 
E
M
 
A
K
 
H
E
x
L
K
 
R
S
 
R
Y
|
Y
A
x
N
D
 
R
V
 
V
L
 
V
D
 
-
E
 
-
D
 
-
F
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
E
V
 
A
V
 
L
A
 
S
H
 
G
C
 
L
R
 
E
K
 
K
P
 
P
T
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
F
 
V
A
 
A
L
x
A
G
|
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
V
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
W
C
 
G
D
 
D
M
 
L
I
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
V
T
 
G
A
 
A
R
 
S
F
 
F
G
 
T
Q
 
T
P
x
A
E
x
F
I
 
V
K
 
R
L
x
I
G
 
G
T
x
L
I
 
V
P
|
P
G
x
N
A
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
T
 
P
R
 
R
S
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
L
S
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
Q
Y
 
E
L
 
L
C
 
L
L
 
L
S
 
L
G
 
S
D
 
P
M
 
R
I
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
T
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
H
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
G
 
K
F
 
L
L
 
M
D
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
L
K
 
S
V
 
L
A
 
A
E
 
K
T
 
E
I
 
L
A
 
A
S
 
Q
Y
 
G
S
 
P
L
 
T
P
 
R
V
 
A
L
 
Y
R
 
A
T
 
L
C
 
T
K
 
K
E
 
K
A
 
L
V
 
L
N
 
L
R
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
R
T
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
T
E
 
E
G
 
A
V
 
L
L
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
A
R
 
V
T
 
L
F
 
Q
H
 
G
G
 
Q
T
 
A
F
x
G
A
 
Q
L
 
T
E
 
Q
D
 
D
R
 
H
K
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
V
E
 
R
A
 
A
F
|
F
A
 
R
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
N
 
R
F
 
F
K
 
Q
H
 
G
R
 
R

O53561 Enoyl-CoA hydratase EchA19; EC 4.2.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
36% identity, 98% coverage: 5:258/258 of query aligns to 9:266/266 of O53561

query
sites
O53561
D
 
D
I
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
E
R
 
R
K
 
R
G
 
G
A
 
H
V
 
T
G
 
L
V
 
I
V
 
V
T
 
T
L
 
M
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
A
A
 
A
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
S
T
 
T
P
 
E
L
 
M
I
 
M
D
 
R
E
 
I
L
 
M
G
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
W
A
 
D
E
 
R
L
 
V
E
 
D
A
 
N
D
 
D
E
 
P
A
 
D
I
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
C
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
G
K
 
G
A
 
Y
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
M
D
 
D
I
 
L
K
 
K
E
 
A
M
 
A
K
 
T
E
 
Q
K
 
K
S
 
P
Y
 
P
A
 
G
D
 
D
V
 
S
L
 
F
D
 
-
E
 
K
D
 
D
F
 
G
I
 
S
T
 
Y
G
 
G
D
 
P
W
 
S
E
 
R
V
 
I
V
 
D
A
 
A
H
 
L
C
 
L
R
 
K
-
 
G
-
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
T
K
 
K
P
 
P
T
 
L
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
E
G
 
G
F
 
P
A
 
A
L
 
I
G
 
A
G
 
G
G
 
G
C
 
T
E
 
E
V
 
I
A
 
L
M
 
Q
M
 
G
C
 
T
D
 
D
M
 
I
I
 
R
L
 
V
A
 
A
A
 
G
E
 
E
T
 
S
A
 
A
R
x
K
F
|
F
G
|
G
Q
x
I
P
x
S
E
|
E
I
x
A
K
|
K
L
 
W
G
 
S
T
 
L
I
 
Y
P
 
P
G
 
M
A
 
G
G
 
G
G
 
S
T
 
A
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
V
R
 
R
S
 
Q
V
 
I
G
 
P
K
 
Y
S
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
C
Y
 
D
L
 
L
C
 
L
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
R
M
 
H
I
 
I
D
 
T
A
 
A
E
 
A
T
 
E
A
 
A
L
 
K
R
 
E
A
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
G
K
 
H
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
D
E
 
G
G
 
Q
F
 
A
L
 
L
D
 
T
E
 
K
V
 
A
M
 
L
K
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
D
T
 
A
I
 
I
A
 
S
S
 
A
Y
 
N
S
 
G
-
 
P
-
 
L
-
 
A
-
 
V
L
 
Q
P
 
A
V
 
I
L
 
L
R
 
R
T
 
S
C
 
I
K
 
R
E
 
E
A
 
T
-
 
E
-
 
C
-
 
M
-
 
P
V
 
E
N
 
N
R
 
E
A
 
A
Y
 
F
E
 
K
T
 
I
T
 
D
L
 
T
A
 
Q
E
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
-
F
 
-
E
 
-
R
 
-
R
 
-
T
 
-
F
 
-
H
 
-
G
 
K
T
 
V
F
 
F
A
 
L
L
 
S
E
 
D
D
 
D
R
 
A
K
 
K
E
 
E
G
 
G
M
 
P
E
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
A
P
 
P
N
 
N
F
 
F
K
 
Q
H
 
N
R
 
R

6slbAAA Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase (see paper)
35% identity, 98% coverage: 6:258/258 of query aligns to 5:257/257 of 6slbAAA

query
sites
6slbAAA
I
 
I
L
 
L
V
 
K
E
 
E
R
 
R
K
 
Q
G
 
D
A
 
G
V
 
V
G
 
L
V
 
V
V
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
E
A
 
K
L
 
L
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
T
T
 
G
P
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
D
E
 
A
L
 
L
G
 
Y
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
E
L
 
G
E
 
E
A
 
E
D
 
D
E
 
R
A
 
E
I
 
V
R
 
R
C
 
A
I
 
L
V
 
L
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
G
K
x
R
A
 
A
F
 
F
A
 
S
A
|
A
G
 
G
A
x
Q
D
|
D
I
x
L
K
 
T
E
 
E
M
x
F
K
 
G
E
 
D
K
 
R
S
 
K
Y
 
P
A
 
D
D
x
Y
V
 
E
L
 
A
D
 
H
E
x
L
D
 
R
F
 
R
I
 
Y
T
x
N
G
 
R
D
 
V
W
 
V
E
 
E
V
 
A
V
 
L
A
 
S
H
 
G
C
 
L
R
 
E
K
 
K
P
 
P
T
 
L
I
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
N
G
 
G
F
 
V
A
 
A
L
 
A
G
 
G
G
x
A
G
 
G
C
 
M
E
x
S
V
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
W
C
 
G
D
 
D
M
 
L
I
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
V
T
 
G
A
 
A
R
 
S
F
 
F
G
 
T
Q
 
T
P
x
A
E
x
F
I
 
V
K
 
R
L
 
I
G
 
G
T
x
L
I
 
V
P
|
P
G
x
D
A
 
S
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
F
R
 
L
L
 
L
T
 
P
R
 
R
S
 
L
V
 
V
G
 
G
K
 
L
S
 
A
L
 
K
A
 
A
M
 
Q
Y
 
E
L
 
L
C
 
L
L
 
L
S
 
L
G
 
S
D
 
P
M
 
R
I
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
T
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
A
A
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
H
K
 
R
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
A
E
 
E
G
 
K
F
 
L
L
 
M
D
 
E
E
 
E
V
 
A
M
 
L
K
 
S
V
 
L
A
 
A
E
 
K
T
 
E
I
 
L
A
 
A
S
 
Q
Y
 
G
S
 
P
L
 
T
P
 
R
V
 
A
L
 
Y
R
 
A
T
 
L
C
 
T
K
 
K
E
 
K
A
 
L
V
 
L
N
 
L
R
 
E
A
 
T
Y
 
Y
E
 
R
T
 
L
T
 
S
L
 
L
A
 
T
E
 
E
G
 
A
V
 
L
L
x
A
F
 
L
E
 
E
R
 
A
R
 
V
T
 
L
F
 
Q
H
 
G
G
 
Q
T
 
A
F
x
G
A
 
Q
L
 
T
E
 
Q
D
 
D
R
 
H
K
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
V
E
 
R
A
 
A
F
 
F
A
 
R
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
N
 
R
F
 
F
K
 
Q
H
 
G
R
 
R

3p85A Crystal structure enoyl-coa hydratase from mycobacterium avium (see paper)
35% identity, 83% coverage: 14:227/258 of query aligns to 11:210/224 of 3p85A

query
sites
3p85A
V
 
V
G
 
R
V
 
T
V
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
A
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
S
T
 
A
P
 
A
L
 
L
I
 
R
D
 
D
E
 
R
L
 
F
G
 
F
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
E
A
 
T
D
|
D
E
 
D
A
x
D
I
 
V
R
 
D
C
 
V
I
 
V
V
 
I
L
 
I
T
 
T
G
 
G
S
 
A
E
 
D
K
 
P
A
 
V
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
x
L
D
 
D
I
 
L
K
 
K
E
 
E
M
x
L
K
x
P
E
 
D
K
 
-
S
 
-
Y
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
D
 
-
F
 
-
I
 
I
T
 
S
G
 
P
D
 
R
W
 
W
E
 
P
V
 
A
V
 
L
A
 
T
H
 
-
C
 
-
R
 
-
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
I
A
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
N
G
 
G
F
 
A
A
 
A
L
 
V
G
 
T
G
|
G
G
 
G
C
 
L
E
|
E
V
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
Y
C
 
C
D
 
D
M
 
I
I
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
S
E
 
E
T
 
N
A
 
A
R
 
R
F
 
F
G
 
A
Q
 
D
P
x
T
E
x
H
I
 
A
K
 
R
L
 
V
G
 
G
T
x
L
I
 
L
P
|
P
G
x
T
A
 
W
G
 
G
G
 
L
T
 
S
Q
 
V
R
 
R
L
 
L
T
 
P
R
 
Q
S
 
K
V
 
V
G
 
G
K
 
I
S
 
G
L
 
L
A
 
A
M
 
R
Y
 
R
L
 
M
C
 
S
L
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
D
M
 
Y
I
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
A
T
 
D
A
 
A
L
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
T
K
 
E
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
H
E
 
D
G
 
Q
F
 
L
L
 
L
D
 
G
E
 
A
V
 
A
M
 
R
K
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
A
T
 
S
I
 
I
A
 
V
S
 
G
Y
 
N
S
 
N
L
 
Q
P
 
N
V
 
A
L
 
V
R
 
R
T
 
A
C
 
L
K
 
L
E
 
T
A
 
S
V
 
Y
N
 
H
R
 
R
A
 
I
Y
 
D
E
 
D
T
 
A
T
 
Q
L
 
T
A
 
S
E
 
A
G
 
G
V
 
L
L
x
W
F
 
Q
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4elxA Structure of apo e.Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coa synthases with cl (see paper)
34% identity, 98% coverage: 2:255/258 of query aligns to 18:261/268 of 4elxA

query
sites
4elxA
A
 
G
F
 
F
E
 
E
D
 
D
I
 
I
L
 
R
V
 
Y
E
 
E
R
 
K
K
 
S
-
 
T
G
 
D
A
 
G
V
 
I
G
 
A
V
 
K
V
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
V
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
C
 
R
T
 
P
P
 
L
L
 
T
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
R
A
 
Y
D
 
D
E
 
D
A
 
N
I
 
I
R
 
G
C
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
-
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
 
S
G
 
G
A
x
G
D
 
D
I
 
-
K
 
-
E
 
-
M
 
-
K
 
-
E
 
Q
K
 
K
S
 
H
Y
x
H
A
 
L
D
 
N
V
 
V
L
|
L
D
 
D
E
 
F
D
 
Q
F
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
R
V
 
Q
V
 
I
A
 
R
H
 
T
C
 
C
R
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
S
L
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
V
 
L
A
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
I
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
T
 
N
A
 
A
R
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
 
T
E
x
G
I
 
P
K
 
K
L
 
V
G
 
G
T
x
S
I
 
F
P
x
D
G
|
G
A
 
G
G
 
W
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
T
 
A
R
 
R
S
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
K
L
 
K
A
 
A
M
 
R
Y
 
E
L
 
I
C
x
W
L
 
F
S
 
L
G
 
C
D
 
R
M
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
E
 
K
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
D
A
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
N
K
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
E
 
A
G
 
D
F
 
L
L
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
T
M
 
V
K
 
R
V
 
W
A
 
C
E
 
R
T
 
E
I
 
M
A
 
L
S
 
Q
Y
 
N
S
 
S
L
 
P
P
 
M
V
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
C
C
 
L
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
L
N
 
N
R
 
A
A
 
D
Y
 
C
E
 
D
T
 
G
T
 
Q
L
 
A
A
 
G
E
 
L
G
 
Q
V
 
E
L
 
L
F
x
A
E
 
G
R
 
N
R
 
A
T
 
T
F
 
M
H
 
L
G
 
-
T
 
F
F
x
Y
A
 
M
L
 
T
E
 
E
D
 
E
R
 
G
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
E
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
N
 
D
F
 
F

Q13825 Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial; 3-MG-CoA hydratase; AU-specific RNA-binding enoyl-CoA hydratase; AU-binding protein/enoyl-CoA hydratase; Itaconyl-CoA hydratase; EC 4.2.1.18; EC 4.2.1.56 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
38% identity, 96% coverage: 9:256/258 of query aligns to 85:337/339 of Q13825

query
sites
Q13825
E
 
E
R
 
N
K
 
R
G
 
G
A
 
I
V
 
V
G
 
-
V
 
V
V
 
L
T
 
G
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
A
K
 
Y
A
 
G
L
 
K
N
 
N
A
 
S
L
 
L
C
 
S
T
x
K
P
x
N
L
|
L
I
|
I
D
x
K
E
x
M
L
|
L
G
x
S
Q
x
K
A
|
A
L
x
V
A
x
D
E
x
A
L
|
L
E
x
K
A
 
S
D
 
D
E
 
K
A
 
K
I
 
V
R
 
R
C
 
T
I
 
I
V
 
I
L
 
I
T
 
R
G
 
S
S
 
E
E
 
V
K
 
P
A
 
G
-
 
I
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
I
 
L
K
 
K
E
 
E
M
 
R
K
 
A
E
 
K
K
 
M
S
 
S
Y
 
S
A
 
S
D
 
E
V
 
V
L
 
-
D
 
-
E
 
G
D
 
P
F
 
F
I
 
V
T
 
S
G
 
K
D
 
I
W
 
R
E
 
A
V
 
V
V
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
I
A
 
A
H
 
N
C
 
L
R
 
P
K
 
V
P
 
P
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
D
G
 
G
F
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
C
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
M
 
L
M
 
A
C
 
C
D
 
D
M
 
I
I
 
R
L
 
V
A
 
A
A
 
A
E
 
S
T
 
S
A
 
A
R
 
K
F
 
M
G
 
G
Q
 
L
P
 
V
E
 
E
I
 
T
K
 
K
L
 
L
G
 
A
T
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
G
G
 
G
G
 
G
T
 
T
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
T
 
P
R
 
R
S
 
A
V
 
I
G
 
G
K
 
M
S
 
S
L
 
L
A
 
A
M
 
K
Y
 
E
L
 
L
C
 
I
L
 
F
S
 
S
G
x
A
D
 
R
M
 
V
I
 
L
D
 
D
A
 
G
E
 
K
T
 
E
A
 
A
L
 
K
R
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
I
A
 
S
K
 
H
V
 
V
L
 
L
P
 
E
A
 
Q
E
 
N
G
 
Q
F
 
E
L
 
G
D
 
D
E
 
A
V
 
A
M
 
Y
K
 
R
V
 
K
A
 
A
E
 
L
T
 
D
I
 
L
A
 
A
S
 
R
Y
 
E
S
 
F
L
 
L
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
-
 
P
-
 
V
V
 
A
L
 
M
R
 
R
T
 
V
C
 
A
K
 
K
E
 
L
A
 
A
V
 
I
N
 
N
R
 
Q
A
 
G
Y
 
M
E
 
E
T
 
V
T
 
D
L
 
L
A
 
V
E
 
T
G
 
G
V
 
L
L
 
A
F
 
I
E
 
E
R
 
E
R
 
A
T
 
C
F
 
Y
H
 
A
G
 
Q
T
 
T
F
 
I
A
 
P
L
 
T
E
 
K
D
 
D
R
 
R
K
 
L
E
 
E
G
 
G
M
 
L
E
 
L
A
 
A
F
 
F
A
 
K
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
N
 
R
F
 
Y
K
 
K

Sites not aligning to the query:

4elwA Structure of e. Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coenzyme a synthases (menb) in complex with nitrate (see paper)
34% identity, 98% coverage: 2:255/258 of query aligns to 18:260/267 of 4elwA

query
sites
4elwA
A
 
G
F
 
F
E
 
E
D
 
D
I
 
I
L
 
R
V
 
Y
E
 
E
R
 
K
K
 
S
-
 
T
G
 
D
A
 
G
V
 
I
G
 
A
V
 
K
V
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
V
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
C
 
R
T
 
P
P
 
L
L
 
T
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
R
A
 
Y
D
 
D
E
 
D
A
 
N
I
 
I
R
 
G
C
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
A
-
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
 
S
G
 
G
A
x
G
D
 
D
I
 
Q
K
 
K
E
 
H
M
 
L
K
 
-
E
 
-
K
 
-
S
 
-
Y
 
-
A
 
-
D
 
N
V
 
V
L
|
L
D
 
D
E
 
F
D
 
Q
F
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
R
V
 
Q
V
 
I
A
 
R
H
 
T
C
 
C
R
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
S
L
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
V
 
L
A
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
I
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
D
T
 
N
A
 
A
R
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
P
x
T
E
x
G
I
 
P
K
 
K
L
 
V
G
 
G
T
x
S
I
x
F
P
x
D
G
|
G
A
 
G
G
 
W
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
T
 
A
R
 
R
S
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
K
L
 
K
A
 
A
M
 
R
Y
 
E
L
 
I
C
x
W
L
 
F
S
 
L
G
 
C
D
 
R
M
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
E
 
K
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
D
A
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
N
K
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
E
 
A
G
 
D
F
 
L
L
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
T
M
 
V
K
 
R
V
 
W
A
 
C
E
 
R
T
 
E
I
 
M
A
 
L
S
 
Q
Y
 
N
S
 
S
L
 
P
P
 
M
V
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
C
C
 
L
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
L
N
 
N
R
 
A
A
 
D
Y
 
C
E
 
D
T
 
G
T
 
Q
L
 
A
A
 
G
E
 
L
G
 
Q
V
 
E
L
 
L
F
x
A
E
 
G
R
 
N
R
 
A
T
 
T
F
 
M
H
 
L
G
 
-
T
 
F
F
x
Y
A
 
M
L
 
T
E
 
E
D
 
E
R
 
G
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
E
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
N
 
D
F
 
F

3h02A 2.15 angstrom resolution crystal structure of naphthoate synthase from salmonella typhimurium.
33% identity, 98% coverage: 2:255/258 of query aligns to 17:259/266 of 3h02A

query
sites
3h02A
A
 
G
F
 
Y
E
 
T
D
 
D
I
 
I
L
 
R
V
 
Y
E
 
E
R
 
K
K
 
S
-
 
T
G
 
D
A
 
G
V
 
I
G
 
A
V
 
K
V
 
I
T
 
T
L
 
I
N
 
N
R
 
R
P
 
P
K
 
Q
A
 
V
L
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
C
 
R
T
 
P
P
 
L
L
 
T
I
 
V
D
 
K
E
 
E
L
 
M
G
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
D
L
 
A
E
 
R
A
 
Y
D
 
D
E
 
D
A
 
N
I
 
V
R
 
G
C
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
T
 
T
G
 
G
-
 
E
S
 
G
E
 
D
K
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
C
A
 
A
G
 
G
A
x
G
D
 
D
I
 
-
K
 
-
E
 
-
M
 
-
K
 
-
E
 
-
K
 
Q
S
 
H
Y
x
H
A
 
L
D
 
N
V
 
V
L
|
L
D
 
D
E
 
F
D
 
Q
F
 
-
I
 
-
T
 
-
G
 
-
D
 
-
W
 
-
E
 
R
V
 
Q
V
 
I
A
 
R
H
 
T
C
 
C
R
 
P
K
 
K
P
 
P
T
 
V
I
 
V
A
 
A
A
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
S
L
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
C
 
H
E
x
V
V
 
L
A
 
H
M
 
M
M
 
M
C
 
C
D
 
D
M
 
L
I
 
T
L
 
I
A
 
A
A
 
A
E
 
E
T
 
N
A
 
A
R
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
P
 
T
E
x
G
I
 
P
K
 
K
L
 
V
G
 
G
T
x
S
I
 
F
P
x
D
G
|
G
A
 
G
G
 
W
G
 
G
T
 
A
Q
 
S
R
 
Y
L
 
M
T
 
A
R
 
R
S
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
Q
S
 
K
L
 
K
A
 
A
M
 
R
Y
 
E
L
 
I
C
x
W
L
 
F
S
 
L
G
 
C
D
 
R
M
 
Q
I
 
Y
D
 
D
A
 
A
E
 
Q
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
D
A
 
M
G
 
G
L
 
L
V
 
V
A
 
N
K
 
T
V
 
V
L
 
V
P
 
P
A
 
L
E
 
A
G
 
D
F
 
L
L
 
E
D
 
K
E
 
E
V
 
T
M
 
V
K
 
R
V
 
W
A
 
C
E
 
R
T
 
E
I
 
M
A
 
L
S
 
Q
Y
 
N
S
 
S
L
 
P
P
 
M
V
 
A
L
 
L
R
 
R
T
 
C
C
 
L
K
 
K
E
 
A
A
 
A
V
 
L
N
 
N
R
 
A
A
 
D
Y
 
C
E
 
D
T
 
G
T
 
Q
L
 
A
A
 
G
E
 
L
G
 
Q
V
 
E
L
 
L
F
x
A
E
 
G
R
 
N
R
 
A
T
 
T
F
 
M
H
 
L
G
 
-
T
 
F
F
x
Y
A
 
M
L
 
T
E
 
E
D
 
E
R
 
G
K
 
Q
E
 
E
G
 
G
M
 
R
E
 
N
A
 
A
F
 
F
A
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
N
 
D
F
 
F

Query Sequence

>WP_085120951.1 NCBI__GCF_900177295.1:WP_085120951.1
MAFEDILVERKGAVGVVTLNRPKALNALCTPLIDELGQALAELEADEAIRCIVLTGSEKA
FAAGADIKEMKEKSYADVLDEDFITGDWEVVAHCRKPTIAAVAGFALGGGCEVAMMCDMI
LAAETARFGQPEIKLGTIPGAGGTQRLTRSVGKSLAMYLCLSGDMIDAETALRAGLVAKV
LPAEGFLDEVMKVAETIASYSLPVLRTCKEAVNRAYETTLAEGVLFERRTFHGTFALEDR
KEGMEAFAEKRKPNFKHR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory