SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_085121732.1 NCBI__GCF_900177295.1:WP_085121732.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4hpnA Crystal structure of a proposed galactarolactone cycloisomerase from agrobacterium tumefaciens, target efi-500704, with bound ca, ordered loops (see paper)
37% identity, 96% coverage: 7:375/383 of query aligns to 2:373/378 of 4hpnA

query
sites
4hpnA
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
K
 
A
V
 
V
E
 
R
G
 
T
F
 
H
E
 
L
V
 
L
T
 
E
C
 
H
R
 
R
L
 
L
P
 
D
R
 
T
P
 
P
V
x
F
G
 
E
N
 
S
S
 
A
M
 
S
R
 
M
T
 
R
F
 
F
D
 
D
R
 
R
R
 
R
S
 
A
S
 
H
L
 
V
I
 
L
V
 
V
R
 
E
I
 
I
T
 
E
T
 
C
R
 
D
S
 
D
G
 
G
A
 
T
V
 
V
G
 
G
W
 
W
G
 
G
E
 
E
T
 
C
W
 
L
A
x
G
F
 
-
P
 
P
E
 
A
A
x
R
A
 
P
G
 
N
S
 
A
L
 
A
I
 
V
R
 
V
S
 
Q
N
 
A
L
 
Y
A
 
S
P
 
G
A
 
W
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
Q
D
 
D
A
 
P
T
 
R
A
 
Q
P
 
T
R
 
E
T
 
K
V
 
I
Q
 
W
A
 
A
R
 
V
M
 
L
V
 
Y
A
 
N
P
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
D
D
 
Q
-
 
G
R
 
Q
R
 
R
G
 
G
Q
 
L
C
 
S
H
 
L
M
 
T
A
 
A
I
 
L
S
 
S
A
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
I
W
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
H
A
 
Y
G
 
G
Q
 
A
P
 
S
I
 
I
H
 
S
A
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
W
R
 
R
D
 
E
R
 
S
V
 
V
P
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
x
T
G
 
G
P
 
S
F
 
F
L
 
K
E
 
R
A
 
D
A
 
N
P
 
V
D
 
D
R
 
R
Y
 
V
G
 
S
A
 
D
L
 
N
A
 
A
G
 
S
E
 
E
V
 
M
E
 
A
R
 
E
Y
 
R
A
 
R
A
 
A
A
 
E
G
 
G
F
 
F
R
 
H
A
 
A
I
 
C
K
|
K
L
 
I
R
x
K
V
 
I
G
 
G
T
 
F
D
 
G
L
 
V
A
 
E
T
 
E
D
 
D
A
 
L
S
 
R
A
 
V
I
 
I
R
 
A
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
M
L
 
R
L
 
L
M
 
M
A
 
I
D
|
D
L
 
A
N
|
N
E
 
H
G
 
G
S
 
Y
T
 
T
V
 
V
R
 
T
D
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
T
L
 
L
T
 
G
E
x
D
A
 
R
V
 
A
A
 
A
D
 
G
A
 
F
R
 
G
L
 
I
S
 
D
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
V
H
 
P
D
 
E
D
 
Q
L
 
L
P
 
D
G
 
A
Y
 
Y
R
 
A
R
 
R
L
 
V
A
 
R
Q
 
A
L
x
G
L
 
Q
S
 
P
L
 
I
P
 
P
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
|
G
E
|
E
S
x
T
F
 
W
S
 
H
G
 
G
T
 
R
Q
 
Y
A
 
G
F
 
M
R
 
W
D
 
Q
F
 
A
L
 
L
A
 
S
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
A
 
C
I
 
G
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
F
T
 
S
E
 
E
G
 
I
L
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
T
A
 
L
F
 
H
E
 
G
T
 
V
A
 
R
V
 
I
A
 
V
P
 
P
H
|
H
V
|
V
W
|
W
G
 
G
T
 
T
G
 
G
I
 
V
N
 
Q
F
 
I
L
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
L
Q
 
Q
F
 
F
A
 
M
A
 
A
V
 
A
L
 
M
T
 
T
P
 
P
-
 
D
-
 
P
-
 
V
R
|
R
R
 
V
G
 
N
P
 
P
V
 
I
P
 
E
F
 
-
P
 
P
L
 
I
F
 
M
E
|
E
Y
x
F
D
 
D
M
 
R
G
 
T
I
x
H
N
 
N
P
 
P
L
 
F
R
 
R
S
 
Q
A
 
A
-
 
V
L
 
L
Y
 
R
D
 
E
P
 
P
Q
 
L
P
 
E
D
 
A
R
 
V
D
 
N
G
 
G
R
 
V
L
 
V
A
 
T
V
 
I
P
 
P
D
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
I
 
I
S
 
N
I
 
R
D
 
D
R
 
A
L
 
L
A
 
T
D
 
E
Y
 
F

3bjsB Crystal structure of a member of enolase superfamily from polaromonas sp. Js666
34% identity, 96% coverage: 7:375/383 of query aligns to 2:366/376 of 3bjsB

query
sites
3bjsB
Q
 
K
V
 
I
V
 
T
K
 
K
V
 
I
E
 
N
G
 
A
F
 
I
E
 
P
V
 
L
T
 
S
C
 
Y
R
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
T
P
 
-
V
|
V
G
 
T
N
 
M
S
 
G
M
 
V
R
 
G
T
 
S
F
 
T
D
 
I
R
 
K
R
 
R
S
 
D
S
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
I
R
 
R
I
 
V
T
 
E
T
 
T
R
 
S
S
 
E
G
 
G
A
 
I
V
 
T
G
 
G
W
 
Y
G
 
G
E
 
E
T
 
A
W
 
H
A
x
P
-
 
G
-
 
R
F
x
S
P
 
P
E
 
G
A
 
A
A
 
I
G
 
T
S
 
S
L
 
L
I
 
I
R
 
H
S
 
N
N
 
T
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
M
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
M
D
 
K
A
 
A
T
 
T
A
 
D
P
 
C
R
 
V
T
 
G
V
 
A
Q
 
W
A
 
Q
R
 
R
M
 
-
V
 
V
A
 
H
P
 
R
L
 
M
A
 
Q
I
 
L
D
 
S
R
 
S
R
 
H
G
 
G
-
x
L
-
 
G
-
 
A
Q
 
G
C
 
A
H
 
A
M
 
L
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
G
L
 
I
D
 
D
I
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
I
W
 
R
G
 
G
R
 
K
I
 
A
A
 
A
G
 
N
Q
 
M
P
 
P
I
 
L
H
 
Y
A
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
K
R
 
R
D
 
-
R
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
x
G
G
 
G
P
 
I
F
 
A
L
 
L
E
 
G
A
 
Y
A
 
Q
P
 
P
D
 
K
R
 
E
Y
 
-
G
 
-
A
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
Q
R
 
E
Y
 
Y
A
 
I
A
 
A
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
I
 
L
K
|
K
L
 
L
R
|
R
V
 
I
G
 
G
T
 
D
D
 
A
L
 
A
A
 
R
T
 
V
D
 
D
A
 
I
S
 
E
A
 
R
I
 
V
R
 
R
Q
 
H
A
 
V
R
 
R
S
 
K
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
D
E
 
E
A
 
V
L
 
D
L
 
I
M
 
L
A
 
T
D
|
D
L
 
A
N
|
N
E
 
T
G
 
A
S
 
Y
T
 
T
V
 
M
R
 
A
D
 
D
A
 
A
V
 
R
A
 
R
L
 
V
T
 
L
E
 
P
A
 
V
V
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
I
R
 
Q
L
 
A
S
 
G
W
 
W
I
 
L
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
F
P
 
A
H
 
C
D
 
N
D
 
D
L
 
F
P
 
A
G
 
S
Y
 
Y
R
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
K
L
 
I
L
 
T
S
 
P
L
 
L
-
 
V
P
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
A
G
|
G
E
|
E
S
x
N
F
 
H
S
 
Y
G
 
T
T
 
R
Q
 
F
A
 
E
F
 
F
R
 
G
D
 
Q
F
 
M
L
 
L
A
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
V
D
 
Q
I
 
V
V
 
W
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
L
A
 
S
I
 
K
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
G
 
G
L
 
I
R
 
R
V
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
M
A
 
A
D
 
S
A
 
A
F
 
Y
E
 
R
T
 
I
A
 
P
V
 
I
A
 
N
P
 
A
H
|
H
V
x
S
W
x
S
G
 
A
T
 
T
G
 
G
I
 
L
N
 
N
F
 
H
L
 
A
A
 
A
S
 
T
L
 
I
Q
 
H
F
 
F
A
 
L
A
 
A
V
 
A
L
 
-
T
 
T
P
 
E
R
 
N
R
 
A
G
 
G
P
 
Y
V
 
F
P
x
E
F
 
A
P
x
C
L
 
V
F
 
S
E
x
K
Y
 
F
D
 
-
M
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
N
P
 
P
L
 
F
R
 
R
S
 
D
A
 
M
L
 
F
Y
 
G
D
 
T
P
 
F
Q
 
E
P
 
I
D
 
G
R
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
C
L
 
V
A
 
E
V
 
P
P
 
P
D
 
D
G
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
I
 
V
S
 
D
I
 
E
D
 
S
R
 
I
L
 
F
A
 
E
D
 
K
Y
 
Y

5olcC Crystal structure of the 3,6-anhydro-d-galactonate cycloisomerase from zobellia galactanivorans (see paper)
32% identity, 93% coverage: 22:376/383 of query aligns to 7:349/351 of 5olcC

query
sites
5olcC
R
 
E
P
 
P
V
 
Y
G
 
V
N
 
I
S
 
S
M
 
H
R
 
K
T
 
L
F
 
D
D
 
D
R
 
T
R
 
R
S
 
K
S
 
I
L
 
C
I
 
I
V
 
V
R
 
K
I
 
I
T
 
T
T
 
L
R
 
D
S
 
D
G
 
G
A
 
T
V
 
Y
G
 
G
W
 
W
G
 
G
E
 
E
T
 
G
W
 
Y
A
 
G
F
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
P
G
 
A
S
 
A
L
 
V
I
 
I
R
 
K
S
 
S
N
 
G
L
 
I
-
 
D
-
 
F
-
 
F
A
 
T
P
 
P
A
 
F
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
K
D
 
E
A
 
A
T
 
I
A
 
G
P
 
H
R
 
E
T
 
V
V
 
L
Q
 
W
A
 
Q
R
 
E
M
 
M
V
 
Y
A
 
R
-
 
R
P
 
S
L
 
M
A
 
D
I
 
Y
D
 
A
R
 
R
R
 
S
G
 
G
Q
 
V
C
 
L
H
 
Q
M
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
V
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
I
W
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
L
A
 
L
G
 
N
Q
 
L
P
 
P
I
 
V
H
 
S
A
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
V
L
 
K
R
 
N
D
 
P
R
 
I
V
 
I
P
 
E
A
 
P
Y
 
Y
A
 
A
S
 
T
G
 
G
P
 
L
F
 
Y
L
 
L
E
 
E
A
 
E
A
 
L
P
 
-
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
V
G
 
E
E
 
E
V
 
A
E
 
L
R
 
L
Y
 
Y
A
 
K
A
 
S
A
 
Q
G
 
G
F
 
F
R
 
K
A
 
A
I
 
T
K
|
K
L
 
M
R
x
K
V
 
V
G
 
G
T
 
L
D
 
G
L
 
I
A
 
E
T
 
Q
D
 
D
A
 
L
S
 
K
A
 
Y
I
 
I
R
 
A
Q
 
A
A
 
I
R
 
R
S
 
K
I
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
M
L
 
R
L
 
L
M
 
M
A
 
I
D
|
D
L
 
S
N
|
N
E
 
H
G
 
A
S
 
Y
T
 
C
V
 
Y
R
 
K
D
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
E
L
 
L
T
 
A
E
 
R
A
 
K
V
 
A
A
 
E
D
 
K
A
 
F
R
 
D
L
 
I
S
 
S
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
S
H
 
P
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
P
 
D
G
 
G
Y
 
Y
R
 
K
R
 
R
L
 
L
A
 
R
Q
 
Q
L
 
N
L
 
T
S
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
I
A
 
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
S
 
C
F
 
E
S
 
Y
G
 
L
T
 
K
Q
 
Y
A
 
G
F
 
F
R
 
K
D
 
R
F
 
L
L
 
F
A
 
D
A
 
K
G
 
D
A
 
C
L
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
A
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
I
A
 
C
I
 
A
C
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
L
T
 
T
E
 
E
G
 
V
L
 
K
R
 
K
V
 
I
A
 
A
A
 
T
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
A
 
T
F
 
Y
E
 
N
T
 
V
A
 
D
V
 
L
A
 
V
P
 
P
H
|
H
V
 
T
W
 
W
G
 
G
T
 
T
G
 
W
I
 
I
N
 
A
F
 
I
L
 
S
A
 
A
S
 
A
L
 
V
Q
 
H
F
 
L
A
 
V
A
 
A
V
 
N
L
 
L
T
 
D
P
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
L
P
 
P
L
 
T
F
 
M
E
|
E
Y
 
L
D
 
D
M
 
R
G
 
T
I
x
E
N
 
N
P
 
A
L
 
L
R
 
R
S
 
D
A
 
E
L
 
V
Y
 
T
D
 
L
P
 
H
Q
 
K
P
 
I
D
 
K
-
 
L
R
 
E
D
 
N
G
 
G
R
 
H
L
 
L
A
 
E
V
 
V
P
 
P
D
 
C
G
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
D
I
 
V
S
 
D
I
 
M
D
 
D
R
 
K
L
 
L
A
 
E
D
 
H
Y
 
Y
V
 
L

3sjnA Crystal structure of enolase spea_3858 (target efi-500646) from shewanella pealeana with magnesium bound
33% identity, 89% coverage: 34:375/383 of query aligns to 25:370/373 of 3sjnA

query
sites
3sjnA
R
 
E
S
 
D
S
 
A
L
 
V
I
 
I
V
 
V
R
 
K
I
 
V
T
 
H
T
 
T
R
 
D
S
 
K
G
 
G
A
 
I
V
 
V
G
 
G
W
 
V
G
 
G
E
 
E
T
 
A
W
 
D
A
x
S
F
 
S
P
 
P
E
x
L
A
 
V
A
 
V
G
 
Q
S
 
A
L
 
C
I
 
I
R
 
E
-
 
A
-
 
P
-
 
Q
-
 
T
-
 
N
-
 
F
-
 
Y
-
 
C
S
 
N
N
 
G
L
 
L
A
 
K
P
 
R
A
 
L
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
N
A
 
A
T
 
L
A
 
E
P
 
I
R
 
E
T
 
R
V
 
L
Q
 
W
A
 
N
R
 
K
M
 
M
V
 
Y
-
 
W
A
 
G
P
 
S
L
 
N
A
 
Y
I
 
M
D
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
Q
 
A
C
 
G
H
 
I
M
 
H
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
I
W
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
F
A
 
Y
G
 
G
Q
 
V
P
 
P
I
 
V
H
 
H
A
 
T
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
K
V
 
I
P
 
R
A
 
C
Y
 
Y
A
 
-
S
 
-
G
 
G
P
x
T
F
 
F
L
 
I
E
 
P
A
 
A
-
 
D
A
 
K
P
 
P
D
 
E
R
 
D
Y
 
N
G
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
V
E
 
Q
R
 
G
Y
 
L
A
 
K
A
 
D
A
 
Q
G
 
G
F
 
F
R
 
S
A
 
S
I
 
I
K
|
K
L
 
F
-
x
G
-
 
G
-
 
G
R
 
V
V
x
M
G
 
G
T
 
D
D
 
D
L
 
P
A
 
D
T
 
T
D
 
D
A
 
Y
S
 
A
A
 
I
I
 
V
R
 
K
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
A
L
 
A
G
 
G
A
 
P
E
 
E
A
 
M
L
 
E
L
 
V
M
 
Q
A
 
I
D
|
D
L
 
L
-
x
A
N
 
S
E
 
K
G
 
W
S
 
H
T
 
T
V
 
C
R
 
G
D
 
H
A
 
S
V
 
A
A
 
M
L
 
M
T
 
A
E
 
K
A
 
R
V
 
L
A
 
E
D
 
E
A
 
F
R
 
N
L
 
L
S
 
N
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
L
H
 
A
D
 
D
D
 
S
L
 
L
P
 
I
G
 
S
Y
 
Y
R
 
E
R
 
K
L
 
L
A
 
S
Q
 
R
L
 
Q
L
 
V
S
 
S
L
 
Q
P
 
K
L
x
I
A
 
A
G
 
G
G
|
G
E
|
E
S
|
S
F
 
L
S
 
T
G
 
T
T
 
R
Q
 
Y
A
 
E
F
 
F
R
 
Q
D
 
E
F
 
F
L
 
I
A
 
T
A
 
K
G
 
S
A
 
N
L
 
A
D
 
D
I
 
I
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
I
A
 
T
I
 
R
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
G
 
M
L
 
K
R
 
K
V
 
I
A
 
Y
A
 
D
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
M
F
 
N
E
 
G
T
 
T
A
 
Q
V
 
L
A
 
I
P
 
P
H
|
H
V
x
G
W
x
F
G
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
I
N
 
L
F
 
L
L
 
H
A
 
A
S
 
S
L
 
V
Q
 
H
F
 
F
A
 
L
A
 
A
V
 
A
L
 
C
T
 
-
P
 
-
R
 
E
R
 
Q
G
 
G
P
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
T
L
 
L
F
x
M
E
|
E
Y
 
F
D
 
S
M
x
Q
G
 
S
I
x
S
N
 
S
P
 
P
L
 
L
R
 
F
S
 
T
A
 
S
L
 
L
Y
 
V
D
 
K
P
 
N
Q
 
Q
P
 
L
D
 
Q
R
 
F
D
 
D
-
 
N
G
 
G
R
 
F
L
 
V
A
 
A
V
 
V
P
 
S
D
 
D
G
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
E
I
 
L
S
 
D
I
 
E
D
 
E
R
 
L
L
 
I
A
 
A
D
 
K
Y
 
Y

3n4eA Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing protein from paracoccus denitrificans pd1222
34% identity, 90% coverage: 35:377/383 of query aligns to 17:362/368 of 3n4eA

query
sites
3n4eA
S
 
T
S
 
S
L
 
A
I
 
F
V
 
V
R
 
R
I
 
I
T
 
T
T
 
A
R
 
E
S
 
D
G
 
G
A
 
T
V
 
V
G
 
G
W
 
W
G
 
G
E
 
E
T
 
A
W
 
S
A
 
P
F
 
M
P
 
L
E
 
G
A
 
G
A
 
I
G
 
A
S
 
S
L
 
L
-
 
G
-
 
V
I
 
V
R
 
A
S
 
R
N
 
D
L
 
I
A
 
A
P
 
P
A
 
F
I
 
L
L
 
E
G
 
G
A
 
Q
D
 
E
A
 
V
T
 
L
A
 
D
P
 
H
R
 
A
T
 
V
V
 
L
Q
 
L
A
 
D
R
 
R
M
 
M
V
 
M
A
 
H
P
 
R
L
 
L
A
 
V
-
 
K
I
 
L
D
 
G
R
 
P
R
 
E
G
 
G
Q
 
I
C
 
A
H
 
T
M
 
A
A
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
C
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
L
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
A
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
A
L
 
W
R
 
R
D
 
T
R
 
R
V
 
L
P
 
P
A
 
C
Y
 
Y
A
 
S
S
|
S
-
 
I
G
 
G
P
 
G
F
 
N
L
 
A
E
 
A
A
 
R
A
 
S
P
 
V
D
 
D
-
 
E
-
 
V
-
 
V
R
 
R
Y
 
E
G
 
V
A
 
A
L
 
R
A
 
R
G
 
V
E
 
E
V
 
A
E
 
E
R
 
Q
Y
 
P
A
 
A
A
 
A
A
 
V
G
x
K
F
 
I
R
|
R
-
 
W
-
 
D
A
 
G
I
 
D
K
 
R
L
 
T
R
 
R
V
 
C
G
 
D
T
x
V
D
 
D
L
 
I
A
 
P
T
 
G
D
 
D
A
 
I
S
 
A
A
 
K
I
 
A
R
 
R
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
A
L
 
V
L
 
I
M
 
G
A
 
F
D
|
D
L
 
A
N
|
N
E
 
N
G
 
G
S
 
Y
T
 
S
V
 
V
R
 
G
D
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
R
L
 
V
T
 
G
E
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
E
D
 
D
A
 
L
R
 
G
L
 
Y
S
 
S
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
Q
H
 
H
D
 
Y
D
 
H
L
 
V
P
 
G
G
 
A
Y
 
M
R
 
G
R
 
E
L
 
V
A
 
A
Q
 
Q
L
 
R
L
 
L
S
 
D
L
 
I
P
 
T
L
 
V
A
 
S
G
 
A
G
|
G
E
|
E
S
 
Q
F
 
T
S
 
Y
G
 
T
T
 
L
Q
 
Q
A
 
A
F
 
L
R
 
K
D
 
D
F
 
L
L
 
I
A
 
L
A
 
S
G
 
G
A
 
-
L
 
V
D
 
R
I
 
M
V
 
V
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
I
A
 
V
I
 
K
C
 
M
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
G
G
 
M
L
 
M
R
 
Q
V
 
C
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
H
A
 
A
F
 
H
E
 
G
T
 
V
A
 
E
V
 
F
A
 
V
P
 
P
H
|
H
V
x
Q
W
x
T
G
 
Q
T
 
P
G
|
G
I
 
V
N
 
G
F
 
H
L
 
F
A
 
A
S
 
N
L
 
I
Q
 
H
F
 
V
A
 
L
A
 
S
V
 
T
L
 
L
T
 
M
P
 
H
R
 
M
R
 
T
G
 
K
P
|
P
V
|
V
P
x
E
F
x
L
P
 
A
L
 
-
F
 
D
E
 
R
Y
 
W
D
 
D
M
x
R
G
 
G
I
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
R
S
 
P
A
 
V
L
 
F
Y
 
R
D
 
N
P
 
P
Q
 
A
P
 
E
D
 
P
R
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
H
L
 
F
A
 
A
V
 
L
P
 
G
D
 
D
G
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
V
I
x
V
S
 
D
I
x
E
D
 
D
R
 
E
L
 
L
A
 
A
D
 
S
Y
 
R
V
 
A
T
 
T

3op2A Crystal structure of putative mandelate racemase from bordetella bronchiseptica rb50 complexed with 2-oxoglutarate/phosphate
38% identity, 71% coverage: 102:373/383 of query aligns to 100:365/375 of 3op2A

query
sites
3op2A
A
 
A
I
 
M
S
 
S
A
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
A
A
 
M
G
 
N
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
F
R
 
H
D
 
T
R
 
R
-
 
G
V
 
V
P
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
|
S
G
 
S
P
 
I
F
 
Y
L
 
W
E
 
D
A
 
L
A
 
T
P
 
P
D
 
D
R
 
Q
Y
 
A
G
 
A
-
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
W
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
T
A
 
A
I
 
A
K
|
K
L
 
L
R
x
K
V
 
V
G
 
G
T
 
R
D
 
A
L
 
P
A
 
R
T
 
K
D
 
D
A
 
A
S
 
A
A
 
N
I
 
L
R
 
R
Q
 
A
A
 
M
R
 
R
S
 
Q
I
 
R
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
E
L
 
I
M
 
L
A
 
V
D
|
D
L
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
S
S
 
L
T
 
G
V
 
R
R
 
H
D
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
L
E
 
R
A
 
I
V
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
G
L
 
C
S
 
Y
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
L
P
 
S
H
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
I
P
 
E
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
R
 
I
L
 
L
-
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
G
L
 
T
S
 
P
L
 
V
P
 
R
L
 
I
A
 
A
G
 
T
G
|
G
E
|
E
S
x
N
F
 
L
S
 
Y
G
 
T
T
 
R
Q
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
L
 
I
A
 
R
A
 
N
G
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
P
 
A
D
|
D
L
 
A
A
 
S
I
 
R
C
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
S
A
 
A
D
 
A
A
 
S
F
 
A
E
 
H
T
 
L
A
 
A
V
 
W
A
 
N
P
 
P
H
|
H
V
x
T
W
x
F
G
 
N
T
 
D
G
 
I
I
 
I
N
 
T
F
 
V
L
 
A
A
 
A
S
 
N
L
 
L
Q
 
H
F
 
L
A
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
S
P
 
P
F
 
H
P
 
P
-
 
A
L
 
M
F
 
F
E
|
E
Y
 
W
D
 
D
M
x
I
G
 
T
I
x
H
N
 
N
P
 
D
L
 
L
-
 
M
-
 
T
R
 
R
S
 
L
A
 
A
L
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
L
Q
 
K
P
 
L
D
 
E
R
 
-
D
 
N
G
 
G
R
 
L
L
 
V
A
 
Q
V
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
E
I
 
I
S
 
D
I
 
W
D
 
D
R
 
F
L
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3ozmA Crystal structure of enolase superfamily member from bordetella bronchiseptica complexed with mg, m-xylarate and l-lyxarate
38% identity, 71% coverage: 102:373/383 of query aligns to 105:370/386 of 3ozmA

query
sites
3ozmA
A
 
A
I
 
M
S
 
S
A
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
A
A
 
M
G
 
N
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
F
R
 
H
D
 
T
R
 
R
-
 
G
V
 
V
P
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
|
S
G
 
S
P
 
I
F
x
Y
L
 
W
E
 
D
A
 
L
A
 
T
P
 
P
D
 
D
R
 
Q
Y
 
A
G
 
A
-
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
W
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
T
A
 
A
I
 
A
K
|
K
L
 
L
R
x
K
V
 
V
G
 
G
T
 
R
D
 
A
L
 
P
A
 
R
T
 
K
D
 
D
A
 
A
S
 
A
A
 
N
I
 
L
R
 
R
Q
 
A
A
 
M
R
 
R
S
 
Q
I
 
R
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
E
L
 
I
M
 
L
A
 
V
D
|
D
L
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
S
S
 
L
T
 
G
V
 
R
R
 
H
D
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
L
E
 
R
A
 
I
V
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
G
L
 
C
S
 
Y
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
L
P
 
S
H
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
I
P
 
E
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
R
 
I
L
 
L
-
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
G
L
 
T
S
 
P
L
 
V
P
 
R
L
 
I
A
 
A
G
 
T
G
|
G
E
|
E
S
x
N
F
 
L
S
 
Y
G
 
T
T
 
R
Q
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
L
 
I
A
 
R
A
 
N
G
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
P
 
A
D
|
D
L
 
A
A
 
S
I
 
R
C
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
S
A
 
A
D
 
A
A
 
S
F
 
A
E
 
H
T
 
L
A
 
A
V
 
W
A
 
N
P
 
P
H
|
H
V
x
T
W
x
F
G
 
N
T
 
D
G
 
I
I
 
I
N
 
T
F
 
V
L
 
A
A
 
A
S
 
N
L
 
L
Q
 
H
F
 
L
A
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
S
P
 
P
F
 
H
P
 
P
-
 
A
L
 
M
F
 
F
E
|
E
Y
 
W
D
 
D
M
x
I
G
 
T
I
x
H
N
 
N
P
 
D
L
 
L
-
 
M
-
 
T
R
 
R
S
 
L
A
 
A
L
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
L
Q
 
K
P
 
L
D
 
E
R
 
-
D
 
N
G
 
G
R
 
L
L
 
V
A
 
Q
V
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
E
I
 
I
S
 
D
I
 
W
D
 
D
R
 
F
L
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3ozmD Crystal structure of enolase superfamily member from bordetella bronchiseptica complexed with mg, m-xylarate and l-lyxarate
38% identity, 71% coverage: 102:373/383 of query aligns to 105:370/381 of 3ozmD

query
sites
3ozmD
A
 
A
I
 
M
S
 
S
A
 
G
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
K
G
 
G
R
 
R
I
 
A
A
 
M
G
 
N
Q
 
Q
P
 
P
I
 
I
H
 
Y
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
F
R
 
H
D
 
T
R
 
R
-
 
G
V
 
V
P
 
R
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
S
|
S
G
 
S
P
 
I
F
 
Y
L
 
W
E
 
D
A
 
L
A
 
T
P
 
P
D
 
D
R
 
Q
Y
 
A
G
 
A
-
 
D
A
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
E
 
W
V
 
V
E
 
E
R
 
Q
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
T
A
 
A
I
 
A
K
|
K
L
 
L
R
x
K
V
 
V
G
 
G
T
 
R
D
 
A
L
 
P
A
 
R
T
 
K
D
 
D
A
 
A
S
 
A
A
 
N
I
 
L
R
 
R
Q
 
A
A
 
M
R
 
R
S
 
Q
I
 
R
L
 
V
G
 
G
A
 
A
E
 
D
A
 
V
L
 
E
L
 
I
M
 
L
A
 
V
D
|
D
L
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
S
S
 
L
T
 
G
V
 
R
R
 
H
D
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
M
T
 
L
E
 
R
A
 
I
V
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
A
R
 
G
L
 
C
S
 
Y
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
L
P
 
S
H
 
I
D
 
D
D
 
D
L
 
I
P
 
E
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
R
 
I
L
 
L
-
 
R
A
 
A
Q
 
Q
L
 
G
L
 
T
S
 
P
L
 
V
P
 
R
L
 
I
A
 
A
G
 
T
G
|
G
E
|
E
S
x
N
F
 
L
S
 
Y
G
 
T
T
 
R
Q
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
N
D
 
D
F
 
Y
L
 
I
A
 
R
A
 
N
G
 
D
A
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
P
 
A
D
|
D
L
 
A
A
 
S
I
 
R
C
 
A
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
E
G
 
A
L
 
L
R
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
A
L
 
S
A
 
A
D
 
A
A
 
S
F
 
A
E
 
H
T
 
L
A
 
A
V
 
W
A
 
N
P
 
P
H
|
H
V
x
T
W
x
F
G
 
N
T
 
D
G
 
I
I
 
I
N
 
T
F
 
V
L
 
A
A
 
A
S
 
N
L
 
L
Q
 
H
F
 
L
A
 
V
A
 
A
V
 
A
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
G
 
-
P
 
-
V
 
S
P
 
P
F
 
H
P
 
P
-
 
A
L
 
M
F
 
F
E
|
E
Y
 
W
D
 
D
M
x
I
G
 
T
I
x
H
N
 
N
P
 
D
L
 
L
-
 
M
-
 
T
R
 
R
S
 
L
A
 
A
L
 
S
Y
 
Y
D
 
D
P
 
L
Q
 
K
P
 
L
D
 
E
R
 
-
D
 
N
G
 
G
R
 
L
L
 
V
A
 
Q
V
 
P
P
 
P
D
 
Q
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
F
E
 
E
I
 
I
S
 
D
I
 
W
D
 
D
R
 
F
L
 
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3ck5A Crystal structure of a racemase from streptomyces coelicolor a3(2) with bound magnesium
34% identity, 93% coverage: 18:372/383 of query aligns to 16:352/357 of 3ck5A

query
sites
3ck5A
C
 
T
R
 
R
L
 
L
P
x
T
R
 
D
P
 
S
V
 
T
G
 
H
N
 
G
S
 
A
M
 
M
R
 
M
T
 
D
F
 
F
D
 
E
R
 
L
R
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
I
I
 
T
V
 
V
R
 
R
I
 
I
T
 
E
T
 
D
R
 
S
S
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
T
G
 
G
W
 
L
G
 
G
E
 
Y
T
 
T
W
 
Y
A
x
T
F
 
V
P
 
N
E
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
S
 
T
L
 
M
I
 
V
R
 
D
S
 
K
N
 
D
L
 
L
A
 
R
P
 
G
A
 
C
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
Q
P
 
I
R
 
E
T
 
K
V
 
I
Q
 
W
A
 
Q
R
 
S
M
 
M
V
 
W
A
 
W
P
 
R
L
 
L
A
 
H
I
 
Y
-
 
A
D
 
G
R
 
R
R
 
G
G
 
G
Q
 
H
C
 
A
H
 
T
M
 
S
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
K
G
 
G
R
 
I
I
 
R
A
 
A
G
 
R
Q
 
T
P
 
P
I
 
L
H
 
W
A
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
-
L
 
Y
R
 
D
D
 
P
R
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
S
x
G
G
 
G
P
 
I
F
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
P
P
 
-
D
 
-
R
 
-
Y
 
V
G
 
A
A
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
Q
V
 
A
E
 
D
R
 
R
Y
 
F
A
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
A
 
A
I
 
I
K
|
K
L
 
M
R
x
K
V
 
V
G
 
G
T
 
R
-
 
P
D
 
D
L
 
L
A
 
K
T
 
E
D
 
D
A
 
V
S
 
D
A
 
R
I
 
V
R
 
S
Q
 
A
A
 
L
R
 
R
S
 
E
I
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
D
E
 
S
A
 
F
L
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
V
D
|
D
L
 
A
N
|
N
E
 
M
G
 
K
S
 
W
T
 
T
V
 
V
R
 
D
D
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
R
L
 
A
T
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
P
A
 
F
R
 
D
L
 
L
S
 
H
W
 
W
I
|
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
T
P
 
I
H
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
L
P
 
V
G
 
G
Y
 
N
R
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
V
Q
 
R
L
 
E
L
 
S
S
 
G
L
 
H
P
 
T
L
x
I
A
 
A
G
 
G
G
|
G
E
|
E
S
 
N
F
 
L
S
 
H
G
 
T
T
 
L
Q
 
Y
A
 
D
F
 
F
R
 
H
D
 
N
F
 
A
L
 
V
A
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
S
L
 
L
D
 
T
I
 
L
V
 
P
Q
x
E
P
 
P
D
|
D
L
 
V
A
 
S
I
 
N
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
E
 
T
G
 
F
L
 
R
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
N
E
 
N
T
 
M
A
 
L
V
 
L
A
 
T
P
 
S
H
|
H
V
 
-
W
 
-
G
 
-
T
 
-
G
|
G
I
x
V
N
 
H
F
 
D
L
 
L
A
 
T
S
 
V
L
 
H
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
S
V
 
V
L
 
-
T
 
-
P
 
P
R
 
H
R
 
R
G
 
T
P
x
Y
V
 
M
P
x
E
F
 
A
P
 
H
L
 
L
F
 
H
E
 
A
Y
 
Y
D
 
-
M
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
M
Y
 
A
D
 
E
P
 
P
Q
 
M
P
 
A
D
 
V
R
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
C
L
 
V
A
 
S
V
 
A
P
 
P
D
 
D
G
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
V
I
 
L
S
 
D
I
 
F
D
 
E
R
 
R
L
 
L

Q9RKF7 3,6-anhydro-alpha-L-galactonate cycloisomerase; AHGA cycloisomerase; EC 5.5.1.25 from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145)
33% identity, 94% coverage: 18:378/383 of query aligns to 16:361/361 of Q9RKF7

query
sites
Q9RKF7
C
 
T
R
 
R
L
 
L
P
 
T
R
 
D
P
 
S
V
 
T
G
 
H
N
 
G
S
 
A
M
 
M
R
 
M
T
 
D
F
 
F
D
 
E
R
 
L
R
 
-
S
 
-
S
 
-
L
 
I
I
 
T
V
 
V
R
 
R
I
 
I
T
 
E
T
 
D
R
 
S
S
 
D
G
 
G
A
 
A
V
 
T
G
 
G
W
 
L
G
 
G
E
 
Y
T
 
T
W
 
Y
A
 
T
F
 
V
P
 
N
E
 
H
-
 
G
-
 
G
-
 
A
A
 
A
A
 
V
G
 
A
S
 
T
L
 
M
I
 
V
R
 
D
S
 
K
N
 
D
L
 
L
A
 
R
P
 
G
A
 
C
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
E
A
 
Q
P
 
I
R
 
E
T
 
K
V
 
I
Q
 
W
A
 
Q
R
 
S
M
 
M
V
 
W
A
 
W
P
 
R
L
 
L
A
 
H
I
 
Y
-
 
A
D
 
G
R
 
R
R
 
G
G
 
G
Q
 
H
C
 
A
H
 
T
M
 
S
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
K
G
 
G
R
 
I
I
 
R
A
 
A
G
 
R
Q
 
T
P
 
P
I
 
L
H
 
W
A
 
K
L
 
L
L
 
F
G
 
G
G
 
G
A
 
-
L
 
Y
R
 
D
D
 
P
R
 
V
V
 
V
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
S
 
G
G
 
G
P
 
I
F
 
D
L
 
L
E
 
E
A
 
L
A
 
P
P
 
-
D
 
-
R
 
-
Y
 
V
G
 
A
A
 
D
L
 
L
A
 
K
G
 
T
E
 
Q
V
 
A
E
 
D
R
 
R
Y
 
F
A
 
L
A
 
A
A
 
G
G
 
G
F
 
F
R
 
R
A
 
A
I
 
I
K
 
K
L
 
M
R
 
K
V
 
V
G
 
G
T
 
R
-
 
P
D
 
D
L
 
L
A
 
K
T
 
E
D
 
D
A
 
V
S
 
D
A
 
R
I
 
V
R
 
S
Q
 
A
A
 
L
R
 
R
S
 
E
I
 
H
L
 
L
G
 
G
A
 
D
E
 
S
A
 
F
L
 
P
L
 
L
M
 
M
A
 
V
D
|
D
L
 
A
N
 
N
E
 
M
G
 
K
S
 
W
T
 
T
V
 
V
R
 
D
D
 
G
A
 
A
V
 
I
A
 
R
L
 
A
T
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
A
D
 
P
A
 
F
R
 
D
L
 
L
S
 
H
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
T
P
 
I
H
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
L
P
 
V
G
 
G
Y
 
N
R
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
V
Q
 
R
L
 
E
L
 
S
S
 
G
L
 
H
P
 
T
L
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G
E
|
E
S
 
N
F
 
L
S
 
H
G
 
T
T
 
L
Q
 
Y
A
 
D
F
 
F
R
 
H
D
 
N
F
 
A
L
 
V
A
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
S
L
 
L
D
 
T
I
 
L
V
 
P
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
L
 
V
A
 
S
I
 
N
C
 
I
G
 
G
G
 
G
L
 
Y
T
 
T
E
 
T
G
 
F
L
 
R
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
N
E
 
N
T
 
M
A
 
L
V
 
L
A
 
T
P
 
S
H
 
H
V
 
-
W
 
-
G
 
-
T
 
-
G
 
G
I
 
V
N
 
H
F
 
D
L
 
L
A
 
T
S
 
V
L
 
H
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
A
 
S
V
 
V
L
 
-
T
 
-
P
 
P
R
 
H
R
 
R
G
 
T
P
 
Y
V
 
M
P
 
E
F
 
A
P
 
H
L
 
G
F
 
F
E
 
-
Y
 
-
D
 
-
M
 
-
G
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
G
L
 
L
R
 
H
S
 
A
A
 
Y
L
 
M
Y
 
A
D
 
E
P
 
P
Q
 
M
P
 
A
D
 
V
R
 
T
D
 
D
G
 
G
R
 
C
L
 
V
A
 
S
V
 
A
P
 
P
D
 
D
G
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
H
G
 
G
I
 
V
E
 
V
I
 
L
S
 
D
I
 
F
D
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
G
D
 
R
Y
 
L
V
 
A
T
 
V
G
 
G

4dn1A Crystal structure of an enolase (mandelate racemase subgroup member) from agrobacterium tumefaciens (target efi-502088) with bound mg and formate
34% identity, 89% coverage: 30:368/383 of query aligns to 49:379/389 of 4dn1A

query
sites
4dn1A
T
 
T
F
 
F
D
 
D
R
 
R
R
 
-
S
 
-
S
 
S
L
 
V
I
 
L
V
 
V
R
 
R
I
 
M
T
 
T
T
 
T
R
 
E
S
 
A
G
 
G
A
 
T
V
 
V
G
 
G
W
 
W
G
 
G
E
 
E
T
 
T
W
 
Y
A
 
G
F
 
I
-
 
V
-
 
A
P
 
P
E
 
G
A
 
A
A
 
V
G
 
A
S
 
A
L
 
L
I
 
I
R
 
N
S
 
D
N
 
L
L
 
L
A
 
A
P
 
G
A
 
F
I
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
R
D
 
D
A
 
A
T
 
S
A
 
D
P
 
P
R
 
S
T
 
A
V
 
V
Q
 
Y
A
 
D
R
 
D
M
 
L
V
 
Y
A
 
D
P
 
M
L
 
M
A
 
R
I
 
V
-
 
R
D
 
G
R
 
Y
R
 
T
G
 
G
Q
 
G
C
 
F
H
 
Y
M
 
V
-
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
I
W
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
P
 
S
I
 
I
H
 
R
A
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
G
L
 
V
R
 
-
D
 
D
R
 
S
V
 
F
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
S
 
S
G
 
G
P
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
L
P
 
P
D
 
E
R
 
R
Y
 
T
G
 
L
A
 
K
L
 
A
A
 
R
G
 
G
E
 
E
V
 
L
E
 
A
R
 
K
Y
 
Y
-
 
W
A
 
Q
A
 
D
A
 
R
G
 
G
F
|
F
R
 
N
A
|
A
I
 
F
K
|
K
L
 
F
R
 
-
V
 
-
G
x
A
T
 
T
D
 
P
L
 
V
A
 
A
T
 
D
D
 
D
-
 
G
-
 
P
A
 
A
S
 
A
A
 
E
I
 
I
R
 
A
Q
 
N
A
 
L
R
 
R
S
 
Q
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
P
E
 
Q
A
 
A
L
 
K
L
 
I
M
x
A
A
 
A
D
|
D
L
 
M
N
x
H
E
 
W
G
 
N
S
 
Q
T
 
T
V
 
P
R
 
E
D
 
R
A
 
A
V
 
L
A
 
E
L
 
L
T
 
I
E
 
A
A
 
E
V
 
M
A
 
Q
D
 
P
A
 
F
R
 
D
L
 
P
S
 
W
W
 
F
I
 
A
E
|
E
E
 
A
P
 
P
I
 
V
P
 
W
H
 
T
D
 
E
D
 
D
L
 
I
P
 
A
G
 
G
Y
 
L
R
 
E
R
 
K
L
 
V
A
 
S
Q
 
K
L
 
N
L
 
T
S
 
D
L
 
V
P
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
V
G
|
G
E
|
E
S
 
E
F
 
W
S
 
R
G
 
T
T
 
H
Q
 
W
A
 
D
F
 
M
R
 
R
D
 
A
F
 
R
L
 
I
A
 
E
A
 
R
G
 
C
A
 
R
L
 
I
D
 
A
I
 
I
V
 
V
Q
|
Q
P
|
P
D
x
E
L
 
M
A
 
G
I
 
-
C
 
H
G
 
K
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
N
G
 
F
L
 
I
R
 
R
V
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
L
A
 
A
D
 
A
A
 
E
F
 
H
E
 
G
T
 
I
A
 
D
V
 
V
A
 
I
P
 
P
H
|
H
-
 
A
V
x
T
W
 
V
G
 
G
T
 
A
G
 
G
I
 
I
N
 
F
F
 
L
L
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
F
 
A
A
 
S
A
 
S
V
 
T
L
 
L
T
 
S
P
 
M
R
 
L
R
 
K
G
 
G
P
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
P
 
-
L
 
-
F
 
H
E
|
E
Y
 
F
D
 
Q
M
 
H
G
 
S
I
 
I
-
 
F
N
 
E
P
 
P
L
 
N
R
 
R
S
 
R
A
 
L
L
 
L
Y
 
D
D
 
G
P
 
D
Q
 
M
P
 
D
D
 
C
R
 
R
D
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
A
 
H
V
 
L
P
 
P
D
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
V
E
 
R
I
 
P
S
 
S

3stpA Crystal structure of a putative galactonate dehydratase
29% identity, 92% coverage: 25:375/383 of query aligns to 36:386/390 of 3stpA

query
sites
3stpA
G
 
G
N
 
D
S
 
A
M
 
M
R
 
S
T
 
S
F
 
F
D
 
R
R
 
F
R
 
H
S
 
Q
S
 
W
L
 
L
I
 
T
V
 
C
R
 
E
I
 
V
T
 
E
T
 
T
R
 
E
S
 
D
G
 
G
A
 
T
V
 
I
G
 
G
W
 
I
G
 
G
E
 
N
T
 
A
W
 
A
A
x
L
F
 
A
P
 
P
E
x
S
A
 
V
A
 
V
G
 
K
S
 
K
L
 
V
I
 
I
R
 
D
S
 
D
N
 
W
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
A
 
L
I
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
D
A
 
P
T
 
F
A
 
D
P
 
Y
R
 
A
T
 
Y
V
 
I
Q
 
W
A
 
E
R
 
K
M
 
M
V
 
Y
A
 
R
-
 
R
P
 
S
L
 
H
A
 
A
I
 
W
D
 
G
R
 
R
R
 
K
G
 
G
Q
 
I
C
 
G
H
 
M
M
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
I
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
M
G
 
G
R
 
K
I
 
L
A
 
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
V
H
 
F
A
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
T
R
 
K
D
 
D
R
 
R
V
 
I
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
A
 
Y
S
|
S
G
 
K
P
 
L
F
 
Y
L
 
A
E
 
G
A
 
S
A
 
I
P
 
E
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
A
L
 
M
A
 
Q
G
 
K
E
 
E
V
 
A
E
 
E
R
 
E
Y
 
A
A
 
M
A
 
K
A
 
G
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
A
 
A
I
 
F
K
|
K
L
 
S
R
|
R
V
 
F
G
 
G
T
 
Y
D
 
G
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
M
-
x
P
-
 
G
L
 
M
A
 
R
T
 
E
D
 
N
A
 
L
S
 
K
A
 
R
I
 
V
R
 
E
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
Y
E
 
D
A
 
N
L
 
D
L
 
L
M
 
M
A
 
L
D
x
E
L
 
C
N
x
Y
E
 
M
G
 
G
S
 
W
T
 
N
V
 
L
R
 
D
D
 
Y
A
 
A
V
 
K
A
 
R
L
 
M
T
 
L
E
 
P
A
 
K
V
 
L
A
 
A
D
 
P
A
 
Y
R
 
E
L
 
P
S
 
R
W
 
W
I
 
L
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
I
H
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
V
P
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
A
R
 
E
L
 
L
A
 
N
Q
 
A
L
 
M
L
 
N
S
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
I
A
 
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
S
x
H
F
 
E
S
 
F
G
 
S
T
 
V
Q
 
I
A
 
G
F
 
C
R
 
A
D
 
E
F
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
G
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
S
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
P
 
Y
D
|
D
L
 
T
A
 
N
I
 
R
C
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
A
G
 
A
L
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
A
E
 
Q
T
x
I
A
 
P
V
 
V
A
 
I
P
 
P
H
|
H
V
 
A
W
 
-
G
 
G
T
 
Q
G
 
M
I
 
H
N
 
N
F
 
Y
L
 
-
A
 
-
S
 
H
L
 
L
Q
 
T
F
 
M
A
 
A
A
 
N
V
 
T
L
 
N
T
 
C
P
 
P
R
 
I
R
 
S
G
x
E
P
 
-
V
 
-
P
 
Y
F
 
F
P
 
P
L
 
V
F
|
F
E
 
D
Y
 
V
D
 
E
M
 
V
G
 
G
I
 
-
N
 
N
P
 
E
L
 
L
R
 
F
S
 
Y
A
 
Y
L
 
I
Y
 
F
D
 
E
P
 
G
Q
 
D
P
 
P
D
 
E
R
 
A
-
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
A
 
Q
V
 
L
P
 
D
D
 
D
G
 
D
-
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
A
I
 
I
S
 
S
I
 
D
D
 
K
R
 
H
L
 
L
A
 
Q
D
 
H
Y
 
F

3toyA Crystal structure of enolase brado_4202 (target efi-501651) from bradyrhizobium sp. Ors278 with calcium and acetate bound
33% identity, 75% coverage: 16:302/383 of query aligns to 13:298/359 of 3toyA

query
sites
3toyA
V
 
V
T
 
I
C
 
T
R
 
P
L
 
M
P
 
K
R
 
R
P
 
P
V
x
L
G
 
R
N
 
N
S
 
A
M
 
F
R
 
G
T
 
V
F
 
I
D
 
D
R
 
S
R
 
G
S
 
P
S
 
L
L
 
V
I
 
L
V
 
I
R
 
D
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
D
S
 
Q
G
 
G
A
 
V
V
 
T
G
 
G
W
 
H
G
 
S
E
 
Y
T
 
L
W
 
F
A
|
A
F
 
Y
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
T
R
|
R
S
 
L
N
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
P
A
 
L
I
 
V
-
 
H
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
V
P
 
P
R
 
V
T
 
D
V
 
L
Q
 
M
A
 
K
R
 
A
M
 
M
V
 
D
A
 
A
P
 
K
L
 
F
-
 
R
A
 
L
I
 
L
D
 
G
R
 
W
R
x
Q
G
 
G
Q
 
L
C
 
V
H
 
G
M
 
M
A
 
A
I
 
V
S
 
S
A
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
M
A
 
A
L
 
F
W
 
W
D
 
D
A
 
A
W
 
L
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
V
H
 
V
A
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
A
R
 
R
D
 
P
R
 
-
V
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
A
 
D
S
|
S
G
 
Y
P
 
G
F
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
R
P
 
D
D
 
D
R
 
E
Y
 
R
G
 
T
A
 
L
L
 
R
A
 
T
G
 
A
E
 
C
V
 
D
E
 
E
R
 
H
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
R
A
 
A
I
 
I
K
|
K
L
 
S
R
x
K
V
 
G
G
 
G
T
 
H
-
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
M
I
 
I
R
 
K
Q
 
G
A
 
L
R
 
R
S
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
I
L
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
L
D
|
D
L
 
F
N
|
N
E
 
Q
G
 
S
S
 
L
T
 
D
V
 
P
R
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
T
A
 
R
L
 
R
T
 
I
E
 
A
A
 
R
V
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
Y
R
 
D
L
 
L
S
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
P
H
 
Q
D
 
E
D
 
N
L
 
L
P
 
S
G
 
G
Y
 
H
R
 
A
R
 
A
L
 
V
A
x
R
Q
 
E
L
 
R
L
x
S
S
 
E
L
 
I
P
 
P
L
 
I
A
 
Q
G
 
A
G
|
G
E
|
E
S
x
N
F
 
W
S
 
W
G
 
F
T
 
P
Q
 
R
A
 
G
F
 
F
R
 
A
D
 
E
F
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
Q
x
M
P
 
P
D
|
D
L
 
L
A
 
M
I
 
K
C
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
G
G
 
W
L
 
L
R
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
A
E
 
S
T
x
I
A
 
P
V
 
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
V
x
I

Sites not aligning to the query:

3tteA Crystal structure of enolase brado_4202 (target efi-501651) from bradyrhizobium complexed with magnesium and mandelic acid
33% identity, 75% coverage: 16:302/383 of query aligns to 15:300/361 of 3tteA

query
sites
3tteA
V
 
V
T
 
I
C
 
T
R
 
P
L
 
M
P
 
K
R
 
R
P
 
P
V
x
L
G
 
R
N
 
N
S
 
A
M
 
F
R
 
G
T
 
V
F
 
I
D
 
D
R
 
S
R
 
G
S
 
P
S
 
L
L
 
V
I
 
L
V
 
I
R
 
D
I
 
V
T
 
T
T
 
T
R
 
D
S
 
Q
G
 
G
A
 
V
V
 
T
G
 
G
W
 
H
G
 
S
E
 
Y
T
 
L
W
 
F
A
|
A
F
 
Y
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
L
 
-
I
 
T
R
|
R
S
 
L
N
 
A
L
 
L
A
 
K
P
 
P
A
 
L
I
 
V
-
 
H
-
 
L
-
 
V
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
G
-
 
R
-
 
E
L
 
L
G
 
A
A
 
G
D
 
K
A
 
A
T
 
L
A
 
V
P
 
P
R
 
V
T
 
D
V
 
L
Q
 
M
A
 
K
R
 
A
M
 
M
V
 
D
A
 
A
P
 
K
L
 
F
-
 
R
A
 
L
I
 
L
D
 
G
R
 
W
R
x
Q
G
 
G
Q
 
L
C
 
V
H
 
G
M
 
M
A
 
A
I
 
V
S
 
S
A
 
G
L
 
L
D
 
D
I
 
M
A
 
A
L
 
F
W
 
W
D
 
D
A
 
A
W
 
L
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
A
 
A
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
V
H
 
V
A
 
E
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
A
R
 
R
D
 
P
R
 
-
V
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
Y
A
 
D
S
|
S
G
 
Y
P
 
G
F
 
V
L
 
L
E
 
D
A
 
A
A
 
R
P
 
D
D
 
D
R
 
E
Y
 
R
G
 
T
A
 
L
L
 
R
A
 
T
G
 
A
E
 
C
V
 
D
E
 
E
R
 
H
Y
 
-
A
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
G
F
 
F
R
 
R
A
 
A
I
 
I
K
|
K
L
 
S
R
x
K
V
 
G
G
 
G
T
 
H
-
 
G
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
T
D
 
D
A
 
E
S
 
A
A
 
M
I
 
I
R
 
K
Q
 
G
A
 
L
R
 
R
S
 
A
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
I
L
 
A
L
 
L
M
 
M
A
 
L
D
|
D
L
 
F
N
|
N
E
 
Q
G
 
S
S
 
L
T
 
D
V
 
P
R
 
A
D
 
E
A
 
A
V
 
T
A
 
R
L
 
R
T
 
I
E
 
A
A
 
R
V
 
L
A
 
A
D
 
D
A
 
Y
R
 
D
L
 
L
S
 
T
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
P
H
 
Q
D
 
E
D
 
N
L
 
L
P
 
S
G
 
G
Y
 
H
R
 
A
R
 
A
L
 
V
A
 
R
Q
 
E
L
 
R
L
 
S
S
 
E
L
 
I
P
 
P
L
 
I
A
 
Q
G
 
A
G
|
G
E
|
E
S
x
N
F
 
W
S
 
W
G
 
F
T
 
P
Q
 
R
A
 
G
F
 
F
R
 
A
D
 
E
F
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
S
D
 
D
I
 
F
V
 
I
Q
x
M
P
 
P
D
|
D
L
 
L
A
 
M
I
 
K
C
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
G
G
 
W
L
 
L
R
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
Q
A
 
A
D
 
D
A
 
A
F
 
A
E
 
S
T
x
I
A
 
P
V
 
M
A
 
S
P
 
S
H
|
H
V
x
I

Sites not aligning to the query:

2ggeD Crystal structure of mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme from bacillus subtilis complexed with mg++ at 1.8 a
28% identity, 96% coverage: 7:375/383 of query aligns to 4:366/376 of 2ggeD

query
sites
2ggeD
Q
 
K
V
 
I
V
 
V
K
 
R
V
 
I
E
 
E
G
 
T
F
 
F
E
 
P
V
 
L
T
 
F
C
 
H
R
 
R
L
 
L
P
 
E
R
 
K
P
 
P
V
x
Y
G
 
G
N
 
D
S
 
A
M
 
N
R
 
G
T
 
F
F
 
K
D
 
R
R
 
Y
R
 
R
S
 
T
S
 
C
L
 
Y
I
 
L
V
 
I
R
 
R
I
 
I
T
 
I
T
 
T
R
 
E
S
 
S
G
 
G
A
 
I
V
 
D
G
 
G
W
 
W
G
 
G
E
 
E
T
 
C
W
 
V
A
 
D
F
 
W
P
 
L
E
 
P
A
 
A
A
 
L
G
 
H
S
 
V
L
 
G
I
 
F
R
 
T
S
 
K
N
 
R
L
 
I
A
 
I
P
 
P
A
 
F
I
 
L
L
 
L
G
 
G
A
 
K
D
 
Q
A
 
A
T
 
G
A
 
S
P
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
Q
 
-
A
 
-
R
 
R
M
 
L
V
 
S
A
 
L
P
 
V
L
 
R
A
 
T
I
 
I
D
 
Q
R
 
K
R
 
W
G
 
H
Q
 
Q
C
 
-
H
 
-
M
 
R
A
 
A
I
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
S
I
 
M
A
 
A
L
 
L
W
 
T
D
 
E
A
 
I
W
 
A
G
 
A
R
 
K
I
 
A
A
 
A
G
 
D
Q
 
C
P
 
S
I
 
V
H
 
C
A
 
E
L
 
L
L
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
Y
R
 
R
D
 
E
R
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
S
|
S
G
 
F
P
 
Q
F
 
S
L
 
Y
E
 
S
A
 
D
A
 
S
P
 
P
D
 
Q
R
 
W
Y
 
I
G
 
S
A
 
R
L
 
S
A
 
V
G
 
S
E
 
N
V
 
V
E
 
E
R
 
A
Y
 
Q
A
 
L
A
 
K
A
 
K
G
 
G
F
 
F
R
 
E
A
 
Q
I
 
I
K
|
K
L
 
V
R
x
K
V
 
I
G
 
G
-
 
G
T
 
T
D
 
S
L
 
F
A
 
K
T
 
E
D
 
D
A
 
V
S
 
R
A
 
H
I
 
I
R
 
N
Q
 
A
A
 
L
R
 
Q
S
 
H
I
 
T
L
 
A
G
 
G
A
 
S
E
 
S
A
 
I
L
 
T
L
 
M
M
 
I
A
 
L
D
|
D
L
 
A
N
|
N
E
 
Q
G
 
S
S
 
Y
T
 
D
V
 
A
R
 
A
D
 
A
A
 
A
V
 
F
A
 
K
L
 
W
T
 
E
E
 
R
A
 
Y
V
 
F
A
 
S
D
 
E
-
 
W
A
 
T
R
 
N
L
 
I
S
 
G
W
 
W
I
 
L
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
L
P
 
P
H
 
F
D
 
D
D
 
Q
L
 
P
P
 
Q
G
 
D
Y
 
Y
R
 
A
R
 
M
L
 
L
A
 
R
Q
 
S
L
 
R
L
 
L
S
 
S
L
 
V
P
 
P
L
 
V
A
 
A
G
 
G
G
|
G
E
|
E
S
 
N
F
 
M
S
 
K
G
 
G
T
 
P
Q
 
A
A
 
Q
F
 
Y
R
 
V
D
 
P
F
 
L
L
 
L
A
 
S
A
 
Q
G
 
R
A
 
C
L
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
I
Q
 
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
V
A
 
M
I
 
H
C
 
V
G
 
N
G
 
G
L
 
I
T
 
D
E
 
E
G
 
F
L
 
R
R
 
D
V
 
C
A
 
L
A
 
Q
L
 
L
A
 
A
D
 
R
A
 
Y
F
 
F
E
 
G
T
 
V
A
 
R
V
 
A
A
 
S
P
 
A
H
|
H
V
 
A
W
 
Y
G
 
D
T
 
G
G
 
S
I
 
L
N
 
S
F
 
R
L
 
L
A
 
Y
S
 
A
L
 
L
Q
 
F
F
 
A
A
 
Q
A
 
A
V
 
C
L
 
L
T
 
P
P
 
P
-
 
W
-
 
S
R
 
K
R
 
M
G
 
K
P
x
N
V
x
D
P
 
H
F
 
I
P
 
E
L
 
P
F
 
I
E
|
E
Y
 
W
D
 
D
M
 
V
G
 
M
I
 
E
N
 
N
P
 
P
L
 
F
R
 
-
S
 
T
A
 
D
L
 
L
Y
 
V
D
 
S
P
 
L
Q
 
Q
P
 
P
D
 
S
R
 
K
D
 
-
G
 
G
R
 
M
L
 
V
A
 
H
V
 
I
P
 
P
D
 
K
G
 
G
P
 
K
G
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
T
E
 
E
I
 
I
S
 
N
I
 
M
D
 
E
R
 
I
L
 
V
A
 
N
D
 
R
Y
 
Y

3sqsA Crystal structure of a putative mandelate racemase/muconate lactonizing protein from dinoroseobacter shibae dfl 12
28% identity, 90% coverage: 30:375/383 of query aligns to 37:382/386 of 3sqsA

query
sites
3sqsA
T
 
S
F
 
F
D
 
R
R
 
F
R
 
H
S
 
Q
S
 
W
L
 
L
I
 
T
V
 
C
R
 
E
I
 
V
T
 
E
T
 
T
R
 
E
S
 
D
G
 
G
A
 
T
V
 
I
G
 
G
W
 
I
G
 
G
E
 
N
T
 
A
W
 
A
A
x
L
F
 
A
P
 
P
E
x
N
A
 
V
A
 
V
G
 
K
S
 
Q
L
 
A
I
 
I
R
 
D
S
 
E
N
 
W
L
 
Y
A
 
A
P
 
P
A
 
L
I
 
V
L
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
D
A
 
P
T
 
F
A
 
D
P
 
Y
R
 
A
T
 
Y
V
 
L
Q
 
W
A
 
E
R
 
K
M
 
M
V
 
Y
A
 
R
-
 
R
P
 
T
L
 
H
A
 
A
I
 
W
D
 
G
R
 
R
R
 
K
G
 
G
Q
 
I
C
 
G
H
 
M
M
 
T
A
 
A
I
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
I
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
I
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
M
G
 
G
R
 
K
I
 
L
A
 
V
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
I
 
V
H
 
F
A
 
K
L
 
L
L
 
L
G
 
G
G
 
G
A
 
R
L
 
T
R
 
K
D
 
E
R
 
K
V
 
I
P
 
P
A
 
V
Y
 
Y
A
 
Y
S
|
S
G
 
K
P
 
L
F
 
Y
L
 
A
E
 
D
A
 
S
A
 
I
P
 
P
D
 
-
R
 
-
Y
 
-
G
 
-
A
 
A
L
 
M
A
 
Q
G
 
A
E
 
E
V
 
A
E
 
E
R
 
E
Y
 
A
A
 
Q
A
 
K
A
 
H
G
 
G
F
 
Y
R
 
Q
A
 
G
I
 
Y
K
|
K
L
 
T
R
|
R
V
 
F
G
|
G
T
 
Y
D
x
G
L
 
P
A
x
K
T
 
D
D
 
G
A
 
P
S
x
A
A
 
G
I
 
M
R
 
R
Q
 
E
A
 
N
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
L
R
 
R
S
 
E
I
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
Y
E
 
D
A
 
V
L
 
D
L
 
L
M
 
M
A
 
L
D
x
E
L
 
C
N
x
Y
E
 
M
G
 
G
S
 
W
T
 
N
V
 
L
R
 
D
D
 
Y
A
 
T
V
 
K
A
 
R
L
 
M
T
 
L
E
 
P
A
 
K
V
 
L
A
 
E
D
 
R
A
 
F
R
 
E
L
 
P
S
 
R
W
 
W
I
 
L
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
V
P
 
I
H
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
V
P
 
A
G
 
G
Y
 
Y
R
 
A
R
 
E
L
 
L
A
 
N
Q
 
A
L
 
M
L
 
G
S
 
I
L
 
V
P
 
P
L
 
I
A
 
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
S
x
H
F
 
E
S
 
F
G
 
S
T
 
V
Q
 
M
A
 
G
F
 
C
R
 
A
D
 
E
F
 
L
L
 
I
A
 
N
A
 
R
G
 
K
A
 
A
L
 
V
D
 
S
I
 
V
V
 
L
Q
|
Q
P
 
Y
D
|
D
L
 
T
A
 
N
I
 
R
C
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
A
G
 
A
L
 
Q
R
 
K
V
 
I
A
 
N
A
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
A
E
 
Q
T
x
I
A
 
I
V
 
V
A
 
I
P
 
P
H
|
H
V
 
A
W
 
-
G
|
G
T
 
Q
G
 
M
I
 
H
N
 
N
F
 
Y
L
 
-
A
 
-
S
 
H
L
 
L
Q
 
T
F
 
M
A
 
A
A
 
N
V
 
M
L
 
N
T
 
C
P
 
P
R
 
I
R
 
S
G
x
E
P
 
-
V
 
-
P
 
Y
F
 
F
P
 
P
L
 
V
F
|
F
E
 
D
Y
 
V
D
 
E
M
 
V
G
 
G
I
 
-
N
 
N
P
 
E
L
 
L
R
 
F
S
x
Y
A
 
Y
L
 
I
Y
x
F
D
|
D
P
 
G
Q
 
D
P
 
P
D
 
E
R
 
A
-
 
V
D
 
D
G
 
G
R
 
Y
L
 
L
A
 
Q
V
 
L
P
 
D
D
 
D
G
 
D
-
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
I
E
 
T
I
 
I
S
 
S
I
 
D
D
 
A
R
 
H
L
 
L
A
 
K
D
 
H
Y
 
F

5xd8B Crystal structure analysis of 3,6-anhydro-l-galactonate cycloisomerase (see paper)
29% identity, 83% coverage: 62:379/383 of query aligns to 63:364/367 of 5xd8B

query
sites
5xd8B
S
 
A
L
 
M
I
 
L
R
 
E
S
 
Y
N
 
D
L
 
I
A
 
Q
P
 
P
A
 
A
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
K
D
 
D
A
 
A
T
 
T
A
 
Q
P
 
I
R
 
E
T
 
E
V
 
I
Q
 
Y
A
 
D
R
 
F
M
 
M
V
 
E
A
 
W
P
 
H
L
 
I
A
 
H
-
 
Y
I
 
V
D
 
G
R
 
R
R
 
G
G
 
G
Q
 
I
C
 
S
H
 
T
M
 
F
A
 
A
I
 
M
S
 
S
A
 
A
L
 
V
D
 
D
I
 
I
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
R
A
 
E
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
I
 
L
H
 
W
A
 
K
L
 
M
L
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
K
L
 
-
R
 
N
D
 
N
R
 
T
V
 
C
P
 
K
A
 
A
Y
 
Y
A
 
C
S
x
G
G
 
G
P
 
I
F
 
D
L
 
L
E
 
Q
A
 
F
A
 
P
P
 
L
D
 
E
R
 
K
Y
 
-
G
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
L
G
 
N
E
 
N
V
 
I
E
 
C
R
 
G
Y
 
Y
A
 
L
A
 
E
A
 
S
G
 
G
F
 
F
R
 
N
A
 
A
I
 
V
K
|
K
L
 
I
R
x
K
V
 
I
G
 
G
-
 
R
T
 
E
D
 
N
L
 
M
A
 
Q
T
 
E
D
 
D
A
 
I
S
 
D
A
 
R
I
 
I
R
 
K
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
I
L
 
T
L
 
F
M
 
M
A
 
I
D
|
D
L
 
A
N
|
N
E
 
Y
G
 
S
S
 
L
T
 
T
V
 
V
R
 
E
D
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
K
L
 
L
T
 
S
E
 
K
A
 
A
V
 
V
A
 
E
D
 
Q
A
 
Y
R
 
D
L
 
I
S
 
T
W
 
W
I
 
F
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
T
P
 
L
H
 
P
D
 
D
D
 
D
L
 
Y
P
 
K
G
 
G
Y
 
F
R
 
A
R
 
E
L
 
I
A
 
A
Q
 
D
L
 
N
L
 
T
S
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
L
A
 
A
G
 
M
G
|
G
E
|
E
S
 
N
F
 
L
S
 
H
G
 
T
T
 
I
Q
 
H
A
 
E
F
 
F
R
 
G
D
 
Y
F
 
A
L
 
M
A
 
D
A
 
Q
G
 
A
A
 
K
L
 
L
D
 
G
I
 
Y
V
 
C
Q
|
Q
P
 
P
D
|
D
L
 
A
A
 
S
I
 
N
C
 
C
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
G
G
 
W
L
 
L
R
 
K
V
 
A
A
 
A
A
 
D
L
 
L
A
 
I
D
 
T
A
 
E
F
 
H
E
 
N
T
 
I
A
 
P
V
 
V
A
 
C
P
 
T
H
|
H
V
 
-
W
 
-
G
 
-
T
 
-
G
|
G
I
x
M
N
 
Q
F
 
E
L
 
L
A
 
H
S
 
V
L
 
S
Q
 
L
F
 
V
A
 
S
A
 
A
V
 
F
L
 
D
T
 
T
P
 
G
R
x
W
R
 
L
G
x
E
P
 
V
V
 
H
P
 
S
F
 
F
P
|
P
L
 
I
F
 
D
E
 
E
Y
 
Y
D
 
T
M
 
K
G
 
-
I
 
-
N
 
-
P
 
-
L
 
-
R
 
-
S
 
-
A
 
-
L
 
-
Y
 
-
D
 
R
P
 
P
Q
 
L
P
 
V
D
 
V
R
 
E
D
 
N
G
 
F
R
 
R
L
 
A
A
 
V
V
 
A
P
 
S
D
 
N
G
 
E
P
 
P
G
 
G
L
 
I
G
 
G
I
 
V
E
 
E
I
 
F
S
 
D
I
 
W
D
 
D
R
 
K
L
 
I
A
 
A
D
 
Q
Y
 
Y
V
 
E
T
 
V
G
 
H
H
 
H

Sites not aligning to the query:

4hclA Crystal structure of d-glucarate dehydratase from agrobacterium tumefaciens complexed with magnesium and l-lyxarohydroxamate
32% identity, 86% coverage: 41:369/383 of query aligns to 40:375/384 of 4hclA

query
sites
4hclA
I
 
L
T
 
T
T
 
V
R
 
R
S
 
T
G
 
E
A
 
D
V
 
G
G
 
Q
W
 
E
G
 
G
E
 
H
T
 
S
W
 
F
A
 
T
F
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
I
A
 
V
G
 
R
-
 
P
S
 
H
L
 
V
I
 
I
R
 
E
S
 
K
N
 
F
L
 
V
A
 
K
P
 
K
A
 
V
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
D
A
 
H
T
 
R
A
 
D
P
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
Q
 
R
A
 
E
R
 
R
M
 
L
V
 
W
A
 
Q
P
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
H
D
 
W
R
 
Q
R
 
R
G
 
G
Q
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
C
 
T
H
 
D
M
 
R
A
 
T
I
 
L
S
 
A
A
 
V
L
 
V
D
 
D
I
 
C
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
S
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
H
 
Y
A
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
-
L
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
K
V
 
V
P
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
G
S
|
S
-
 
I
-
 
M
-
x
C
G
 
G
P
 
D
F
 
E
L
 
L
E
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
L
A
 
A
A
 
T
P
 
P
D
 
E
R
 
D
Y
 
Y
G
 
G
A
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
E
R
 
T
Y
 
L
A
 
V
A
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
A
 
G
I
 
I
K
|
K
L
 
L
R
x
H
V
 
T
-
 
W
-
 
M
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
W
G
 
A
T
x
P
D
 
D
L
 
V
A
 
K
T
 
M
D
 
D
A
 
L
S
 
K
A
 
A
I
 
C
R
 
A
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
I
L
 
R
L
 
L
M
 
M
A
 
I
D
|
D
L
 
A
N
x
F
E
x
H
G
 
W
S
 
Y
T
 
S
V
 
R
R
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
G
E
 
R
A
 
G
V
 
L
A
 
E
D
 
K
A
 
L
R
 
G
L
 
F
S
 
D
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
M
P
 
D
H
 
E
D
 
Q
D
 
S
L
 
L
P
 
S
G
 
S
Y
 
Y
R
 
K
R
 
W
L
 
L
A
x
S
Q
 
D
L
 
N
L
|
L
S
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
A
 
V
G
 
G
G
x
P
E
|
E
S
 
S
F
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
K
Q
 
H
A
 
W
F
 
H
R
 
R
-
 
A
D
 
E
F
 
W
L
 
I
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
L
Q
x
R
P
 
T
D
x
G
L
 
V
A
 
N
I
 
D
C
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
P
G
 
A
L
 
L
R
 
K
V
 
T
A
 
M
A
 
H
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
F
E
 
G
T
 
M
A
 
E
V
 
C
A
 
E
P
 
V
H
|
H
V
x
G
W
 
-
G
x
N
T
 
T
G
 
A
I
 
M
N
 
N
F
 
L
L
 
H
A
 
V
S
 
V
L
 
A
Q
 
A
F
 
T
A
 
K
A
 
N
V
 
C
L
 
R
T
 
W
P
 
Y
R
x
E
R
 
R
G
|
G
P
 
-
V
 
L
P
 
L
F
 
H
P
 
P
L
 
F
F
 
L
E
|
E
Y
 
Y
D
 
D
M
 
D
G
 
G
I
 
H
N
 
D
P
 
Y
L
 
L
R
 
K
S
 
S
A
 
-
L
 
L
Y
 
S
D
 
D
P
 
P
Q
 
M
P
 
-
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
F
L
 
V
A
 
H
V
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
E
E
 
D
I
 
I
S
 
D
I
 
F

Sites not aligning to the query:

4hcdA Crystal structure of d-glucarate dehydratase from agrobacterium tumefaciens complexed with magnesium
32% identity, 86% coverage: 41:369/383 of query aligns to 40:375/384 of 4hcdA

query
sites
4hcdA
I
 
L
T
 
T
T
 
V
R
 
R
S
 
T
G
 
E
A
 
D
V
 
G
G
 
Q
W
 
E
G
 
G
E
 
H
T
 
S
W
 
F
A
 
T
F
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
I
A
 
V
G
 
R
-
 
P
S
 
H
L
 
V
I
 
I
R
 
E
S
 
K
N
 
F
L
 
V
A
 
K
P
 
K
A
 
V
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
D
A
 
H
T
 
R
A
 
D
P
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
Q
 
R
A
 
E
R
 
R
M
 
L
V
 
W
A
 
Q
P
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
H
D
 
W
R
 
Q
R
 
R
G
 
G
Q
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
C
 
T
H
 
D
M
 
R
A
 
T
I
 
L
S
 
A
A
 
V
L
 
V
D
 
D
I
 
C
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
S
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
H
 
Y
A
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
-
L
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
K
V
 
V
P
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
G
S
|
S
-
 
I
-
 
M
-
 
C
G
 
G
P
 
D
F
 
E
L
 
L
E
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
L
A
 
A
A
 
T
P
 
P
D
 
E
R
 
D
Y
 
Y
G
 
G
A
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
E
R
 
T
Y
 
L
A
 
V
A
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
A
 
G
I
 
I
K
|
K
L
 
L
R
x
H
V
 
T
-
 
W
-
 
M
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
W
G
 
A
T
x
P
D
 
D
L
 
V
A
 
K
T
 
M
D
 
D
A
 
L
S
 
K
A
 
A
I
 
C
R
 
A
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
I
L
 
R
L
 
L
M
 
M
A
 
I
D
|
D
L
 
A
N
x
F
E
 
H
G
 
W
S
 
Y
T
 
S
V
 
R
R
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
G
E
 
R
A
 
G
V
 
L
A
 
E
D
 
K
A
 
L
R
 
G
L
 
F
S
 
D
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
M
P
 
D
H
 
E
D
 
Q
D
 
S
L
 
L
P
 
S
G
 
S
Y
 
Y
R
 
K
R
 
W
L
 
L
A
x
S
Q
 
D
L
 
N
L
|
L
S
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
A
 
V
G
 
G
G
x
P
E
|
E
S
 
S
F
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
K
Q
 
H
A
 
W
F
 
H
R
 
R
-
 
A
D
 
E
F
 
W
L
 
I
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
L
Q
x
R
P
 
T
D
x
G
L
 
V
A
 
N
I
 
D
C
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
P
G
 
A
L
 
L
R
 
K
V
 
T
A
 
M
A
 
H
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
F
E
 
G
T
 
M
A
 
E
V
 
C
A
 
E
P
 
V
H
|
H
V
x
G
W
 
-
G
x
N
T
 
T
G
 
A
I
 
M
N
 
N
F
 
L
L
 
H
A
 
V
S
 
V
L
 
A
Q
 
A
F
 
T
A
 
K
A
 
N
V
 
C
L
 
R
T
 
W
P
 
Y
R
x
E
R
 
R
G
|
G
P
 
-
V
 
L
P
 
L
F
 
H
P
 
P
L
 
F
F
 
L
E
|
E
Y
 
Y
D
 
D
M
 
D
G
 
G
I
x
H
N
 
D
P
 
Y
L
|
L
R
 
K
S
 
S
A
 
-
L
 
L
Y
 
S
D
 
D
P
 
P
Q
 
M
P
 
-
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
F
L
 
V
A
 
H
V
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
E
E
 
D
I
 
I
S
 
D
I
 
F

4mmwA Crystal structure of d-glucarate dehydratase from agrobacterium tumefaciens complexed with magnesium, l-xylarohydroxamate and l- lyxarohydroxamate
32% identity, 86% coverage: 41:369/383 of query aligns to 38:373/381 of 4mmwA

query
sites
4mmwA
I
 
L
T
 
T
T
 
V
R
 
R
S
 
T
G
 
E
A
 
D
V
 
G
G
 
Q
W
 
E
G
 
G
E
 
H
T
 
S
W
 
F
A
 
T
F
 
A
P
 
P
E
 
E
A
 
I
A
 
V
G
 
R
-
 
P
S
 
H
L
 
V
I
 
I
R
 
E
S
 
K
N
 
F
L
 
V
A
 
K
P
 
K
A
 
V
I
 
L
L
 
I
G
 
G
A
 
E
D
 
D
A
 
H
T
 
R
A
 
D
P
 
-
R
 
-
T
 
-
V
 
-
Q
 
R
A
 
E
R
 
R
M
 
L
V
 
W
A
 
Q
P
 
D
L
 
L
A
 
A
I
 
H
D
 
W
R
 
Q
R
 
R
G
 
G
Q
 
S
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
L
C
 
T
H
 
D
M
 
R
A
 
T
I
 
L
S
 
A
A
 
V
L
 
V
D
 
D
I
 
C
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
D
A
 
L
W
 
A
G
 
G
R
 
R
I
 
S
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
I
 
V
H
 
Y
A
 
K
L
 
L
L
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
-
L
 
Y
R
 
R
D
 
D
R
 
K
V
 
V
P
 
L
A
 
A
Y
 
Y
A
 
G
S
|
S
-
 
I
-
 
M
-
x
C
G
 
G
P
 
D
F
 
E
L
 
L
E
 
E
-
 
G
-
 
G
-
 
L
A
 
A
A
 
T
P
 
P
D
 
E
R
 
D
Y
 
Y
G
 
G
A
 
R
L
 
F
A
 
A
G
 
-
E
 
-
V
 
-
E
 
E
R
 
T
Y
 
L
A
 
V
A
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
A
 
G
I
 
I
K
|
K
L
 
L
R
x
H
V
 
T
-
 
W
-
 
M
-
 
P
-
 
P
-
 
V
-
 
S
-
 
W
G
 
A
T
x
P
D
 
D
L
 
V
A
 
K
T
 
M
D
 
D
A
 
L
S
 
K
A
 
A
I
 
C
R
 
A
Q
 
A
A
 
V
R
 
R
S
 
E
I
 
A
L
 
V
G
 
G
A
 
P
E
 
D
A
 
I
L
 
R
L
 
L
M
 
M
A
 
I
D
|
D
L
 
A
N
x
F
E
x
H
G
 
W
S
 
Y
T
 
S
V
 
R
R
 
T
D
 
D
A
 
A
V
 
L
A
 
A
L
 
L
T
 
G
E
 
R
A
 
G
V
 
L
A
 
E
D
 
K
A
 
L
R
 
G
L
 
F
S
 
D
W
 
W
I
 
I
E
|
E
E
 
E
P
 
P
I
 
M
P
 
D
H
 
E
D
 
Q
D
 
S
L
 
L
P
 
S
G
 
S
Y
 
Y
R
 
K
R
 
W
L
 
L
A
x
S
Q
 
D
L
 
N
L
|
L
S
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
V
A
 
V
G
 
G
G
x
P
E
|
E
S
 
S
F
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
K
Q
 
H
A
 
W
F
 
H
R
 
R
-
 
A
D
 
E
F
 
W
L
 
I
A
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
L
 
C
D
 
D
I
 
I
V
 
L
Q
x
R
P
 
T
D
x
G
L
 
V
A
 
N
I
 
D
C
 
V
G
 
G
G
 
G
L
 
I
T
 
T
E
 
P
G
 
A
L
 
L
R
 
K
V
 
T
A
 
M
A
 
H
L
 
L
A
 
A
D
 
E
A
 
A
F
 
F
E
 
G
T
 
M
A
 
E
V
 
C
A
 
E
P
 
V
H
|
H
V
x
G
W
 
-
G
x
N
T
 
T
G
 
A
I
 
M
N
 
N
F
 
L
L
 
H
A
 
V
S
 
V
L
 
A
Q
 
A
F
 
T
A
 
K
A
 
N
V
 
C
L
 
R
T
 
W
P
 
Y
R
x
E
R
 
R
G
|
G
P
 
-
V
 
L
P
 
L
F
 
H
P
 
P
L
 
F
F
 
L
E
|
E
Y
 
Y
D
 
D
M
 
D
G
 
G
I
 
H
N
 
D
P
 
Y
L
 
L
R
 
K
S
 
S
A
 
-
L
 
L
Y
 
S
D
 
D
P
 
P
Q
 
M
P
 
-
D
 
D
R
 
R
D
 
D
G
 
G
R
 
F
L
 
V
A
 
H
V
 
V
P
 
P
D
 
D
G
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
G
 
G
I
 
E
E
 
D
I
 
I
S
 
D
I
 
F

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_085121732.1 NCBI__GCF_900177295.1:WP_085121732.1
MADPAHQVVKVEGFEVTCRLPRPVGNSMRTFDRRSSLIVRITTRSGAVGWGETWAFPEAA
GSLIRSNLAPAILGADATAPRTVQARMVAPLAIDRRGQCHMAISALDIALWDAWGRIAGQ
PIHALLGGALRDRVPAYASGPFLEAAPDRYGALAGEVERYAAAGFRAIKLRVGTDLATDA
SAIRQARSILGAEALLMADLNEGSTVRDAVALTEAVADARLSWIEEPIPHDDLPGYRRLA
QLLSLPLAGGESFSGTQAFRDFLAAGALDIVQPDLAICGGLTEGLRVAALADAFETAVAP
HVWGTGINFLASLQFAAVLTPRRGPVPFPLFEYDMGINPLRSALYDPQPDRDGRLAVPDG
PGLGIEISIDRLADYVTGHWTLE

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory