SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_085640649.1 NCBI__GCF_002115805.1:WP_085640649.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1g6hA Crystal structure of the adp conformation of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
33% identity, 99% coverage: 1:249/251 of query aligns to 2:254/254 of 1g6hA

query
sites
1g6hA
M
 
M
G
 
E
L
 
I
L
 
L
E
 
R
V
 
T
K
 
E
D
 
N
V
 
I
N
 
V
K
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
D
N
 
G
V
 
V
N
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
N
E
 
K
N
 
G
T
 
D
C
 
V
H
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
L
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
F
L
 
L
I
 
K
P
 
A
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
R
V
 
V
M
 
Y
F
 
F
D
 
E
G
 
N
Q
 
K
S
 
D
V
 
I
L
 
T
G
 
N
R
 
K
T
 
E
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
L
N
 
Y
Q
 
H
M
 
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
V
R
 
R
V
 
T
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
I
 
P
F
 
L
G
 
K
D
 
E
L
 
M
T
 
T
V
 
V
M
 
L
E
 
E
N
 
N
M
 
L
L
 
L
I
 
I
P
 
G
C
 
E
F
 
I
A
 
C
K
 
P
R
 
G
D
 
E
G
 
S
S
 
P
F
 
L
-
 
N
A
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
Y
I
 
K
R
 
K
S
 
W
V
 
I
L
 
P
S
 
K
E
 
E
G
 
E
E
 
E
L
 
M
R
 
V
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
E
 
F
Q
 
K
M
 
I
L
 
L
D
 
E
D
 
F
V
 
L
N
 
K
M
 
L
L
 
S
D
 
H
K
 
L
R
 
Y
N
 
D
M
 
R
H
 
K
S
 
A
A
 
G
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
M
 
I
A
 
G
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
M
Q
 
T
N
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
A
R
 
P
A
 
G
D
 
L
T
 
A
N
 
H
N
 
D
T
 
I
I
 
F
D
 
N
L
 
H
L
 
V
K
 
L
E
 
E
I
 
L
K
 
K
E
 
A
K
 
K
R
 
-
D
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
F
A
 
L
I
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
H
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
Y
A
 
I
E
 
D
R
 
H
I
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
A
 
F
Q
 
N
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
L
 
I
V
 
A
E
 
E
D
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
N
 
N
I
 
V
K
 
L
G
 
S
H
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
K
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G
E
 
E

1g9xB Characterization of the twinning structure of mj1267, an atp-binding cassette of an abc transporter (see paper)
32% identity, 99% coverage: 1:248/251 of query aligns to 2:253/253 of 1g9xB

query
sites
1g9xB
M
 
M
G
 
E
L
 
I
L
 
L
E
 
R
V
 
T
K
 
E
D
 
N
V
 
I
N
 
V
K
 
K
R
 
Y
F
|
F
G
 
G
G
 
E
L
x
F
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
D
N
 
G
V
 
V
N
 
S
L
 
I
S
 
S
V
 
V
A
 
C
E
 
K
N
 
G
T
 
D
C
 
V
H
 
T
A
 
L
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
N
C
 
V
L
 
I
V
 
T
G
 
G
K
 
F
L
 
L
I
 
K
P
 
A
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
R
V
 
V
M
 
Y
F
 
F
D
 
E
G
 
N
Q
 
K
S
 
D
V
 
I
L
 
T
G
 
N
R
 
K
T
 
E
P
 
P
F
 
A
E
 
E
I
 
L
N
 
Y
Q
 
H
M
 
Y
G
 
G
I
 
I
S
 
V
R
 
R
V
 
T
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
I
 
P
F
 
L
G
 
K
D
 
E
L
 
M
T
 
T
V
 
V
M
 
L
E
 
E
N
 
N
M
 
L
L
 
L
I
 
I
P
 
G
C
 
E
F
 
I
A
 
N
K
 
P
R
 
G
D
 
E
G
 
S
S
 
P
F
 
L
-
 
N
A
 
S
L
 
L
H
 
F
G
 
Y
I
 
K
R
 
K
S
 
W
V
 
I
L
 
P
S
 
K
E
 
E
G
 
E
E
 
E
L
 
M
R
 
V
D
 
E
Q
 
K
A
 
A
E
 
F
Q
 
K
M
 
I
L
 
L
D
 
E
D
 
F
V
 
L
N
 
K
M
 
L
L
 
S
D
 
H
K
 
L
R
 
Y
N
 
D
M
 
R
H
 
K
S
 
A
A
 
G
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
M
R
 
K
R
 
L
L
 
V
E
 
E
M
 
I
A
 
G
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
M
Q
 
T
N
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
M
L
 
I
L
 
V
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
I
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
A
R
 
P
A
 
G
D
 
L
T
 
A
N
 
H
N
 
D
T
 
I
I
 
F
D
 
N
L
 
H
L
 
V
K
 
L
E
 
E
I
 
L
K
 
K
E
 
A
K
 
K
R
 
-
D
 
G
I
 
I
T
 
T
I
 
F
A
 
L
I
 
I
I
 
I
E
 
E
H
 
H
D
 
R
M
 
L
H
 
D
V
 
I
V
 
V
F
 
L
S
 
N
L
 
Y
A
 
I
E
 
D
R
 
H
I
 
L
T
 
Y
V
 
V
L
 
M
A
 
F
Q
 
N
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
L
 
I
V
 
A
E
 
E
D
 
G
T
 
R
P
 
G
E
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
N
 
N
I
 
V
K
 
L
G
 
S
H
 
D
P
 
P
K
 
K
V
 
V
K
 
V
E
 
E
A
 
I
Y
 
Y
L
 
I
G
 
G

1oxvD Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
30% identity, 94% coverage: 6:240/251 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvD

query
sites
1oxvD
V
 
V
K
 
K
D
 
N
V
 
V
N
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
N
N
 
G
T
 
E
C
 
R
H
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
D
I
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
L
M
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
D
Q
 
R
S
 
L
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
T
 
V
P
 
P
F
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
Q
 
K
M
 
I
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
F
Q
|
Q
T
 
T
P
 
W
E
 
A
I
 
L
F
 
Y
G
 
P
D
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
M
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
L
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
L
F
 
T
A
 
N
K
 
M
R
 
K
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
M
S
 
S
E
 
K
G
 
E
E
 
E
L
 
I
R
 
R
D
 
K
Q
 
R
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
M
 
V
L
 
A
D
 
K
D
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
L
 
H
D
 
H
K
 
V
R
 
L
N
 
N
M
 
H
H
 
F
S
 
P
A
 
R
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
L
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
N
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
A
 
D
R
 
A
A
 
R
D
 
M
T
 
R
N
 
D
N
 
S
T
 
A
I
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
I
 
V
K
 
Q
E
 
S
K
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
H
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
S
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
K
P
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
Y
G
 
D
H
 
N
P
 
P

1oxvA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
30% identity, 94% coverage: 6:240/251 of query aligns to 6:232/353 of 1oxvA

query
sites
1oxvA
V
 
V
K
 
K
D
 
N
V
 
V
N
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
N
N
 
G
T
 
E
C
 
R
H
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
D
I
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
L
M
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
D
Q
 
R
S
 
L
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
T
 
V
P
 
P
F
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
Q
 
K
M
 
I
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
W
E
 
A
I
 
L
F
 
Y
G
 
P
D
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
M
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
L
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
L
F
 
T
A
 
N
K
 
M
R
 
K
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
M
S
 
S
E
 
K
G
 
E
E
 
E
L
 
I
R
 
R
D
 
K
Q
 
R
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
M
 
V
L
 
A
D
 
K
D
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
L
 
H
D
 
H
K
 
V
R
 
L
N
 
N
M
 
H
H
 
F
S
 
P
A
 
R
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
L
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
N
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
A
 
D
R
 
A
A
 
R
D
 
M
T
 
R
N
 
D
N
 
S
T
 
A
I
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
I
 
V
K
 
Q
E
 
S
K
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
H
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
S
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
K
P
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
Y
G
 
D
H
 
N
P
 
P

1oxuA Crystal structure of glcv, the abc-atpase of the glucose abc transporter from sulfolobus solfataricus (see paper)
30% identity, 94% coverage: 6:240/251 of query aligns to 6:232/353 of 1oxuA

query
sites
1oxuA
V
 
V
K
 
K
D
 
N
V
 
V
N
 
S
K
 
K
R
 
V
F
|
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
|
A
L
 
L
G
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
N
N
 
G
T
 
E
C
 
R
H
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
D
I
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
L
M
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
D
Q
 
R
S
 
L
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
T
 
V
P
 
P
F
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
Q
 
K
M
 
I
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
W
E
 
A
I
 
L
F
 
Y
G
 
P
D
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
M
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
L
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
L
F
 
T
A
 
N
K
 
M
R
 
K
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
M
S
 
S
E
 
K
G
 
E
E
 
E
L
 
I
R
 
R
D
 
K
Q
 
R
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
M
 
V
L
 
A
D
 
K
D
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
L
 
H
D
 
H
K
 
V
R
 
L
N
 
N
M
 
H
H
 
F
S
 
P
A
 
R
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
L
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
N
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
A
 
D
R
 
A
A
 
R
D
 
M
T
 
R
N
 
D
N
 
S
T
 
A
I
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
I
 
V
K
 
Q
E
 
S
K
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
H
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
S
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
K
P
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
Y
G
 
D
H
 
N
P
 
P

Q97UY8 Glucose import ATP-binding protein GlcV; EC 7.5.2.- from Saccharolobus solfataricus (strain ATCC 35092 / DSM 1617 / JCM 11322 / P2) (Sulfolobus solfataricus) (see paper)
30% identity, 94% coverage: 6:240/251 of query aligns to 6:232/353 of Q97UY8

query
sites
Q97UY8
V
 
V
K
 
K
D
 
N
V
 
V
N
 
S
K
 
K
R
 
V
F
 
F
-
 
K
-
 
K
G
 
G
G
 
K
L
 
V
Q
 
V
A
 
A
L
 
L
G
 
D
N
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
I
S
 
N
V
 
I
A
 
E
E
 
N
N
 
G
T
 
E
C
 
R
H
 
F
A
 
G
I
 
I
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
F
L
 
M
N
 
R
C
 
I
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
D
I
 
V
P
 
P
D
 
S
T
 
T
G
 
G
S
 
E
V
 
L
M
 
Y
F
 
F
D
 
D
G
 
D
Q
 
R
S
 
L
V
 
V
L
 
A
G
 
S
R
 
N
-
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
I
T
 
V
P
 
P
F
 
P
E
 
E
I
 
D
N
 
R
Q
 
K
M
 
I
G
 
G
I
 
M
S
 
-
R
 
-
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
T
P
 
W
E
 
A
I
 
L
F
 
Y
G
 
P
D
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
A
M
 
F
E
 
E
N
 
N
M
 
I
L
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
L
F
 
T
A
 
N
K
 
M
R
 
K
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
M
S
 
S
E
 
K
G
 
E
E
 
E
L
 
I
R
 
R
D
 
K
Q
 
R
A
 
V
E
 
E
Q
 
E
M
 
V
L
 
A
D
 
K
D
 
I
V
 
L
N
 
D
M
 
I
L
 
H
D
 
H
K
 
V
R
 
L
N
 
N
M
 
H
H
 
F
S
 
P
A
 
R
S
 
E
M
 
L
S
|
S
R
 
G
G
|
G
D
 
Q
K
 
Q
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
L
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
K
N
 
D
P
 
P
K
 
S
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
S
G
 
N
M
 
L
A
 
D
R
 
A
A
 
R
D
 
M
T
 
R
N
 
D
N
 
S
T
 
A
I
 
R
D
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
K
E
 
E
I
 
V
K
 
Q
E
 
S
K
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
V
T
 
T
I
 
L
A
 
L
I
 
V
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
P
H
 
A
V
 
D
V
 
I
F
 
F
S
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
V
Q
 
K
G
 
G
T
 
K
P
 
L
L
 
V
V
 
Q
E
 
V
D
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
N
 
D
I
 
L
K
 
Y
G
 
D
H
 
N
P
 
P

6z5uK Cryo-em structure of the a. Baumannii mlabdef complex bound to appnhp (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:250/251 of query aligns to 2:242/253 of 6z5uK

query
sites
6z5uK
L
 
L
L
 
I
E
 
E
V
 
V
K
 
K
D
 
N
V
 
L
N
 
S
K
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
L
 
R
Q
 
V
A
 
I
L
 
Y
G
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
A
 
R
E
 
R
N
 
G
T
 
Q
C
 
I
H
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
T
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
L
 
I
V
 
G
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
S
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
S
 
D
V
 
I
-
 
A
-
 
Q
L
 
M
G
 
S
R
 
R
T
 
Q
P
 
E
F
 
L
E
 
F
I
 
A
N
 
A
Q
 
R
M
 
A
G
 
R
I
 
M
S
 
G
R
 
M
V
 
L
F
 
F
Q
|
Q
T
 
S
P
 
G
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
T
D
 
D
L
 
M
T
 
S
V
 
V
M
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
V
L
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
I
F
 
R
A
 
A
K
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
H
S
 
T
V
 
K
L
 
L
S
 
S
E
 
E
G
 
N
E
 
L
L
 
I
R
 
A
D
 
E
Q
 
L
A
 
V
E
 
A
Q
 
L
M
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
S
V
 
V
N
 
G
M
 
L
L
 
R
D
 
G
K
 
T
R
 
E
N
 
Q
M
 
L
H
 
M
S
 
P
A
 
T
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
M
K
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
L
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
I
V
 
A
Q
 
L
N
 
D
P
 
P
K
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
A
 
D
R
 
P
A
 
I
D
 
V
T
 
K
N
 
G
N
 
V
T
 
L
I
 
T
D
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
S
I
 
L
K
 
R
E
 
E
K
 
A
R
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
T
I
 
T
A
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
S
H
|
H
D
 
D
M
 
V
H
 
P
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
S
L
 
I
A
 
A
E
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
I
L
 
Q
V
 
G
E
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
E
I
 
L
K
 
Q
G
 
A
H
 
Y
-
 
A
-
 
S
P
 
P
K
 
F
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
S
A
 
A

7d0aB Acinetobacter mlafedb complex in adp-vanadate trapped vclose conformation (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:250/251 of query aligns to 4:244/263 of 7d0aB

query
sites
7d0aB
L
 
L
L
 
I
E
 
E
V
 
V
K
 
K
D
 
N
V
 
L
N
 
S
K
 
F
R
 
N
F
 
R
G
 
G
G
 
E
L
 
R
Q
 
V
A
 
I
L
 
Y
G
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
A
 
R
E
 
R
N
 
G
T
 
Q
C
 
I
H
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
 
G
A
x
T
G
|
G
K
|
K
S
 
T
T
 
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
L
 
I
V
 
G
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
S
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
S
 
D
V
 
I
-
 
A
-
 
Q
L
 
M
G
 
S
R
 
R
T
 
Q
P
 
E
F
 
L
E
 
F
I
 
A
N
 
A
Q
 
R
M
 
A
G
 
R
I
 
M
S
 
G
R
 
M
V
 
L
F
 
F
Q
 
Q
T
 
S
P
 
G
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
T
D
 
D
L
 
M
T
 
S
V
 
V
M
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
V
L
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
I
F
 
R
A
 
A
K
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
H
S
 
T
V
 
K
L
 
L
S
 
S
E
 
E
G
 
N
E
 
L
L
 
I
R
 
A
D
 
E
Q
 
L
A
 
V
E
 
A
Q
 
L
M
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
S
V
 
V
N
 
G
M
 
L
L
 
R
D
 
G
K
 
T
R
 
E
N
 
Q
M
 
L
H
 
M
S
 
P
A
 
T
S
x
E
M
 
L
S
|
S
R
 
G
G
 
G
D
x
M
K
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
L
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
I
V
 
A
Q
 
L
N
 
D
P
 
P
K
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
A
 
D
R
 
P
A
 
I
D
 
V
T
 
K
N
 
G
N
 
V
T
 
L
I
 
T
D
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
S
I
 
L
K
 
R
E
 
E
K
 
A
R
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
T
I
 
T
A
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
H
 
P
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
S
L
 
I
A
 
A
E
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
I
L
 
Q
V
 
G
E
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
E
I
 
L
K
 
Q
G
 
A
H
 
Y
-
 
A
-
 
S
P
 
P
K
 
F
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
S
A
 
A

7d08B Acinetobacter mlafedb complex in atp-bound vtrans1 conformation (see paper)
29% identity, 99% coverage: 3:250/251 of query aligns to 4:244/263 of 7d08B

query
sites
7d08B
L
 
L
L
 
I
E
 
E
V
 
V
K
 
K
D
 
N
V
 
L
N
 
S
K
 
F
R
 
N
F
x
R
G
 
G
G
 
E
L
x
R
Q
 
V
A
 
I
L
 
Y
G
 
D
N
 
N
V
 
I
N
 
S
L
 
L
S
 
N
V
 
I
A
 
R
E
 
R
N
 
G
T
 
Q
C
 
I
H
 
T
A
 
A
I
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
T
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
L
L
 
I
V
 
G
G
 
G
K
 
Q
L
 
L
I
 
V
P
 
P
D
 
D
T
 
Q
G
 
G
S
 
E
V
 
V
M
 
L
F
 
L
D
 
D
G
 
G
Q
 
K
S
 
D
V
 
I
-
 
A
-
 
Q
L
 
M
G
 
S
R
 
R
T
 
Q
P
 
E
F
 
L
E
 
F
I
 
A
N
 
A
Q
 
R
M
 
A
G
 
R
I
 
M
S
 
G
R
 
M
V
 
L
F
 
F
Q
 
Q
T
 
S
P
 
G
E
 
A
I
 
L
F
 
F
G
 
T
D
 
D
L
 
M
T
 
S
V
 
V
M
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
V
L
 
A
I
 
F
P
 
P
C
 
I
F
 
R
A
 
A
K
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
H
S
 
T
V
 
K
L
 
L
S
 
S
E
 
E
G
 
N
E
 
L
L
 
I
R
 
A
D
 
E
Q
 
L
A
 
V
E
 
A
Q
 
L
M
 
K
L
 
L
D
 
E
D
 
S
V
 
V
N
 
G
M
 
L
L
 
R
D
 
G
K
 
T
R
 
E
N
 
Q
M
 
L
H
 
M
S
 
P
A
 
T
S
 
E
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
M
K
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
L
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
I
V
 
A
Q
 
L
N
 
D
P
 
P
K
 
D
L
 
L
L
 
I
L
 
M
L
 
Y
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
Q
A
 
D
R
 
P
A
 
I
D
 
V
T
 
K
N
 
G
N
 
V
T
 
L
I
 
T
D
 
R
L
 
L
L
 
I
K
 
R
E
 
S
I
 
L
K
 
R
E
 
E
K
 
A
R
 
L
D
 
D
I
 
L
T
 
T
I
 
T
A
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
S
H
 
H
D
 
D
M
 
V
H
 
P
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
S
L
 
I
A
 
A
E
 
D
R
 
Y
I
 
I
T
 
Y
V
 
V
L
 
V
A
 
A
Q
 
E
G
 
G
T
 
K
P
 
I
L
 
Q
V
 
G
E
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
E
I
 
L
K
 
Q
G
 
A
H
 
Y
-
 
A
-
 
S
P
 
P
K
 
F
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
A
 
F
Y
 
L
L
 
T
G
 
G
E
 
S
A
 
A

6mjpA Lptb(e163q)fgc from vibrio cholerae (see paper)
28% identity, 99% coverage: 2:249/251 of query aligns to 1:236/240 of 6mjpA

query
sites
6mjpA
G
 
A
L
 
I
L
 
L
E
 
K
V
 
A
K
 
Q
D
 
H
V
 
L
N
 
A
K
 
K
R
 
S
F
 
Y
G
 
K
G
 
K
L
 
R
Q
 
K
A
 
V
L
 
V
G
 
S
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
Q
V
 
V
A
 
E
E
 
S
N
 
G
T
 
Q
C
 
I
H
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
S
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
I
V
 
V
G
 
G
K
 
L
L
 
V
I
 
A
P
 
R
D
 
D
T
 
E
G
 
G
S
 
T
V
 
I
M
 
T
F
 
I
D
 
D
G
 
D
Q
 
N
S
 
D
V
 
I
L
 
S
G
 
I
R
 
L
T
 
P
P
 
M
F
 
H
E
 
S
I
 
R
N
 
S
Q
 
R
M
 
M
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
Y
V
 
L
F
 
P
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
E
 
S
I
 
I
F
 
F
G
 
R
D
 
K
L
 
L
T
 
S
V
 
V
M
 
E
E
 
D
N
 
N
M
 
I
L
 
M
I
 
-
P
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
V
H
 
L
G
 
Q
I
 
T
R
 
R
S
 
E
V
 
E
L
 
L
S
 
T
E
 
H
G
x
E
E
 
E
L
 
R
R
 
Q
D
|
D
Q
 
K
A
 
L
E
 
E
Q
 
D
M
 
L
L
 
L
D
 
E
D
 
E
V
 
F
N
 
H
M
 
I
L
 
Q
D
 
H
K
 
I
R
 
R
N
 
K
M
 
S
H
 
A
S
 
G
A
 
M
S
 
A
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
E
K
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
M
 
I
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
A
Q
 
A
N
 
N
P
 
P
K
 
Q
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
P
N
 
I
N
 
S
T
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
K
K
 
K
E
 
I
I
 
I
K
 
E
E
 
H
K
 
L
R
 
R
D
 
D
-
 
R
-
 
G
I
 
L
T
 
G
I
 
V
A
 
L
I
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
H
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
D
L
 
V
A
 
C
E
 
E
R
 
K
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
R
P
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
Q
N
 
D
I
 
V
K
 
L
G
 
N
H
 
N
P
 
E
K
 
Q
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
30% identity, 95% coverage: 3:241/251 of query aligns to 1:233/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
M
L
 
I
E
 
K
V
 
L
K
 
S
D
 
N
V
 
I
N
 
T
K
 
K
R
 
V
F
 
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
N
N
 
N
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
H
V
 
V
A
 
P
E
 
A
N
 
G
T
 
Q
C
 
I
H
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
R
C
 
C
L
 
V
V
 
N
G
 
L
K
 
L
L
 
E
I
 
R
P
 
P
D
 
T
T
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
M
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
T
R
 
L
T
 
S
P
 
E
F
 
S
E
 
E
I
 
L
N
 
T
Q
 
K
M
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
Q
I
 
I
S
 
G
R
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
T
 
H
P
 
F
E
 
N
I
 
L
F
 
L
G
 
S
D
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
F
E
 
G
N
 
N
M
 
V
L
 
A
I
 
L
P
 
P
C
 
L
F
 
-
A
 
-
K
 
E
R
 
L
D
 
D
G
 
N
S
 
T
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
P
E
 
K
G
 
D
E
 
E
L
 
V
R
 
K
D
 
R
Q
 
R
A
 
V
E
 
T
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
D
 
S
D
 
L
V
 
V
N
 
G
M
 
L
L
 
G
D
 
D
K
 
K
R
 
H
N
 
D
M
 
S
H
 
Y
S
 
P
A
 
S
S
 
N
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
I
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
N
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
A
 
D
R
 
P
A
 
A
D
 
T
T
 
T
N
 
R
N
 
S
T
 
I
I
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
N
E
 
R
K
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
H
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
K
S
 
R
L
 
I
A
 
C
E
 
D
R
 
C
I
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
T
 
E
P
 
L
L
 
I
V
 
E
E
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
N
 
E
I
 
V
K
 
F
G
 
S
H
 
H
P
 
P
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
30% identity, 95% coverage: 3:241/251 of query aligns to 2:234/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
M
L
 
I
E
 
K
V
 
L
K
 
S
D
 
N
V
 
I
N
 
T
K
 
K
R
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
N
N
 
N
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
H
V
 
V
A
 
P
E
 
A
N
 
G
T
 
Q
C
 
I
H
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
R
C
 
C
L
 
V
V
 
N
G
 
L
K
 
L
L
 
E
I
 
R
P
 
P
D
 
T
T
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
M
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
T
R
 
L
T
 
S
P
 
E
F
 
S
E
 
E
I
 
L
N
 
T
Q
 
K
M
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
Q
I
 
I
S
 
G
R
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
T
 
H
P
 
F
E
 
N
I
 
L
F
 
L
G
 
S
D
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
F
E
 
G
N
 
N
M
 
V
L
 
A
I
 
L
P
 
P
C
 
L
F
 
-
A
 
-
K
 
E
R
 
L
D
 
D
G
 
N
S
 
T
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
P
E
 
K
G
 
D
E
 
E
L
 
V
R
 
K
D
 
R
Q
 
R
A
 
V
E
 
T
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
D
 
S
D
 
L
V
 
V
N
 
G
M
 
L
L
 
G
D
 
D
K
 
K
R
 
H
N
 
D
M
 
S
H
 
Y
S
 
P
A
 
S
S
 
N
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
I
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
N
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
A
 
D
R
 
P
A
 
A
D
 
T
T
 
T
N
 
R
N
 
S
T
 
I
I
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
N
E
 
R
K
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
H
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
K
S
 
R
L
 
I
A
 
C
E
 
D
R
 
C
I
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
T
 
E
P
 
L
L
 
I
V
 
E
E
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
N
 
E
I
 
V
K
 
F
G
 
S
H
 
H
P
 
P
K
 
K

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
30% identity, 95% coverage: 3:241/251 of query aligns to 2:234/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
M
L
 
I
E
 
K
V
 
L
K
 
S
D
 
N
V
 
I
N
 
T
K
 
K
R
 
V
F
|
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
 
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
N
N
 
N
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
H
V
 
V
A
 
P
E
 
A
N
 
G
T
 
Q
C
 
I
H
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
R
C
 
C
L
 
V
V
 
N
G
 
L
K
 
L
L
 
E
I
 
R
P
 
P
D
 
T
T
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
M
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
T
R
 
L
T
 
S
P
 
E
F
 
S
E
 
E
I
 
L
N
 
T
Q
 
K
M
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
Q
I
 
I
S
 
G
R
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
T
 
H
P
 
F
E
 
N
I
 
L
F
 
L
G
 
S
D
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
F
E
 
G
N
 
N
M
 
V
L
 
A
I
 
L
P
 
P
C
 
L
F
 
-
A
 
-
K
 
E
R
 
L
D
 
D
G
 
N
S
 
T
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
P
E
 
K
G
 
D
E
 
E
L
 
V
R
 
K
D
 
R
Q
 
R
A
 
V
E
 
T
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
D
 
S
D
 
L
V
 
V
N
 
G
M
 
L
L
 
G
D
 
D
K
 
K
R
 
H
N
 
D
M
 
S
H
 
Y
S
 
P
A
 
S
S
 
N
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
I
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
N
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
A
 
D
R
 
P
A
 
A
D
 
T
T
 
T
N
 
R
N
 
S
T
 
I
I
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
N
E
 
R
K
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
 
H
D
 
E
M
 
M
H
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
K
S
 
R
L
 
I
A
 
C
E
 
D
R
 
C
I
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
T
 
E
P
 
L
L
 
I
V
 
E
E
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
N
 
E
I
 
V
K
 
F
G
 
S
H
 
H
P
 
P
K
 
K

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
30% identity, 95% coverage: 3:241/251 of query aligns to 2:234/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
M
L
 
I
E
 
K
V
 
L
K
 
S
D
 
N
V
 
I
N
 
T
K
 
K
R
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
G
 
T
L
x
I
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
N
N
 
N
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
H
V
 
V
A
 
P
E
 
A
N
 
G
T
 
Q
C
 
I
H
 
Y
A
 
G
I
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
N
 
R
C
 
C
L
 
V
V
 
N
G
 
L
K
 
L
L
 
E
I
 
R
P
 
P
D
 
T
T
 
E
G
 
G
S
 
S
V
 
V
M
 
L
F
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
V
 
L
L
 
T
G
 
T
R
 
L
T
 
S
P
 
E
F
 
S
E
 
E
I
 
L
N
 
T
Q
 
K
M
 
A
-
 
R
-
 
R
G
 
Q
I
 
I
S
 
G
R
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
T
 
H
P
 
F
E
 
N
I
 
L
F
 
L
G
 
S
D
 
S
L
 
R
T
 
T
V
 
V
M
 
F
E
 
G
N
 
N
M
 
V
L
 
A
I
 
L
P
 
P
C
 
L
F
 
-
A
 
-
K
 
E
R
 
L
D
 
D
G
 
N
S
 
T
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
P
E
 
K
G
 
D
E
 
E
L
 
V
R
 
K
D
 
R
Q
 
R
A
 
V
E
 
T
Q
 
E
M
 
L
L
 
L
D
 
S
D
 
L
V
 
V
N
 
G
M
 
L
L
 
G
D
 
D
K
 
K
R
 
H
N
 
D
M
 
S
H
 
Y
S
 
P
A
 
S
S
x
N
M
 
L
S
|
S
R
 
G
G
 
G
D
x
Q
K
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
V
E
 
A
M
 
I
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
A
Q
 
S
N
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
A
 
D
R
 
P
A
 
A
D
 
T
T
 
T
N
 
R
N
 
S
T
 
I
I
 
L
D
 
E
L
 
L
L
 
L
K
 
K
E
 
D
I
 
I
K
 
N
E
 
R
K
 
R
R
 
L
D
 
G
I
 
L
T
 
T
I
 
I
A
 
L
I
 
L
I
 
I
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
H
 
D
V
 
V
V
 
V
F
 
K
S
 
R
L
 
I
A
 
C
E
 
D
R
 
C
I
 
V
T
 
A
V
 
V
L
 
I
A
 
S
Q
 
N
G
 
G
T
 
E
P
 
L
L
 
I
V
 
E
E
 
Q
D
 
D
T
 
T
P
 
V
E
 
S
N
 
E
I
 
V
K
 
F
G
 
S
H
 
H
P
 
P
K
 
K

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
30% identity, 93% coverage: 3:236/251 of query aligns to 1:223/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
M
L
 
I
E
 
F
V
 
V
K
 
N
D
 
D
V
 
V
N
 
Y
K
 
K
R
 
N
F
|
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
Q
 
E
A
x
V
L
 
L
G
 
K
N
 
G
V
 
V
N
 
T
L
 
L
S
 
K
V
 
V
A
 
N
E
 
K
N
 
G
T
 
E
C
 
V
H
 
V
A
 
V
I
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
N
 
R
C
 
C
L
 
I
V
 
N
G
 
L
K
 
L
L
 
E
I
 
E
P
 
P
D
 
T
T
 
K
G
 
G
S
 
E
V
 
V
M
 
F
F
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
V
 
I
-
 
N
L
 
N
G
 
G
R
 
K
T
 
V
P
 
N
F
 
I
E
 
N
I
 
K
N
 
V
Q
 
R
M
 
Q
G
 
K
I
 
V
S
 
G
R
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
T
 
H
P
 
F
E
 
N
I
 
L
F
 
F
G
 
P
D
 
H
L
 
L
T
 
T
V
 
A
M
 
I
E
 
E
N
 
N
M
 
I
-
 
T
L
 
L
I
 
A
P
 
P
C
 
V
F
 
K
A
 
V
K
 
K
R
 
K
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
M
S
 
N
E
 
K
G
 
K
E
 
E
L
 
A
R
 
E
D
 
E
Q
 
L
A
 
A
E
 
V
Q
 
D
M
 
L
L
 
L
D
 
A
D
 
K
V
 
V
N
 
G
M
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
K
R
 
K
N
 
D
M
 
Q
H
 
Y
S
 
P
A
 
I
S
 
K
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
Q
K
 
K
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
E
 
A
M
 
I
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
A
Q
 
M
N
 
Q
P
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
A
 
S
G
 
A
M
 
L
A
 
D
R
 
P
A
 
E
D
 
M
T
 
V
N
 
K
N
 
E
T
 
V
I
 
L
D
 
N
L
 
V
L
 
M
K
 
K
E
 
Q
I
 
L
K
 
A
E
 
N
K
 
E
R
 
-
D
 
G
I
 
M
T
 
T
I
 
M
A
 
V
I
 
V
I
 
V
E
 
T
H
|
H
D
 
E
M
 
M
H
 
G
V
 
F
V
 
A
F
 
R
S
 
E
L
 
V
A
 
G
E
 
D
R
 
R
I
 
V
T
 
I
V
 
F
L
 
M
A
 
D
Q
 
D
G
 
G
T
 
V
P
 
I
L
 
V
V
 
E
E
 
E
D
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
E
N
 
E
I
 
I

1ji0A Crystal structure analysis of the abc transporter from thermotoga maritima
28% identity, 99% coverage: 3:250/251 of query aligns to 6:240/240 of 1ji0A

query
sites
1ji0A
L
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
V
K
 
Q
D
 
S
V
 
L
N
 
H
K
 
V
R
 
Y
F
x
Y
G
 
G
G
 
A
L
 
I
Q
 
H
A
 
A
L
 
I
G
 
K
N
 
G
V
 
I
N
 
D
L
 
L
S
 
K
V
 
V
A
 
P
E
 
R
N
 
G
T
 
Q
C
 
I
H
 
V
A
 
T
I
 
L
I
 
I
G
 
G
P
 
A
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
L
N
 
S
C
 
A
L
 
I
V
 
A
G
 
G
K
 
L
L
 
V
I
 
R
P
 
A
D
 
Q
T
 
K
G
 
G
S
 
K
V
 
I
M
 
I
F
 
F
D
 
N
G
 
G
Q
 
Q
S
 
D
V
 
I
L
 
T
G
 
N
R
 
K
T
 
P
P
 
A
F
 
H
E
 
V
I
 
I
N
 
N
Q
 
R
M
 
M
G
 
G
I
 
I
S
 
A
R
 
L
V
 
V
F
 
P
Q
x
E
T
 
G
P
 
R
E
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
P
D
 
E
L
 
L
T
 
T
V
 
V
M
 
Y
E
 
E
N
 
N
M
 
L
L
 
M
I
 
M
P
 
G
C
 
A
F
 
Y
A
 
N
K
 
R
R
 
K
D
 
D
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
L
 
-
H
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
S
 
K
E
 
E
G
 
G
E
 
I
L
 
K
R
 
R
D
 
D
Q
 
-
A
 
L
E
 
E
Q
 
W
M
 
I
L
 
F
D
 
S
D
 
L
V
 
F
N
 
P
M
 
R
L
 
L
D
 
K
K
 
E
R
 
R
-
 
L
N
 
K
M
 
Q
H
 
L
S
 
G
A
 
G
S
 
T
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
E
K
 
Q
R
 
Q
R
 
M
L
 
L
E
 
A
M
 
I
A
 
G
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
M
Q
 
S
N
 
R
P
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
L
L
 
M
L
 
M
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
S
A
 
L
G
 
G
M
 
L
A
 
A
R
 
P
A
 
I
D
 
L
T
 
V
N
 
S
N
 
E
T
 
V
I
 
F
D
 
E
L
 
V
L
 
I
K
 
Q
E
 
K
I
 
I
K
 
N
E
 
Q
K
 
E
R
 
-
D
 
G
I
 
T
T
 
T
I
 
I
A
 
L
I
 
L
I
 
V
E
 
E
H
 
Q
D
 
N
M
 
A
H
 
L
V
 
G
V
 
A
F
 
L
S
 
K
L
 
V
A
 
A
E
 
H
R
 
Y
I
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
L
A
 
E
Q
 
T
G
 
G
T
 
Q
P
 
I
L
 
V
V
 
L
E
 
E
D
 
G
T
 
K
P
 
A
E
 
S
N
 
E
I
 
L
K
 
L
G
 
D
H
 
N
P
 
E
K
 
M
V
 
V
K
 
R
E
 
K
A
 
A
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
V
A
 
A

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 3:236/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
L
 
L
E
 
T
V
 
A
K
 
K
D
 
N
V
 
L
N
 
A
K
 
K
R
 
A
F
 
Y
G
 
K
G
 
G
L
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
V
G
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
A
 
N
E
 
S
N
 
G
T
 
E
C
 
I
H
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
V
I
 
P
P
 
R
D
 
D
T
 
A
G
 
G
S
 
N
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
Q
 
D
S
 
D
V
 
I
L
 
S
G
 
L
R
 
L
T
 
P
P
 
L
F
 
H
E
 
A
I
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
Y
V
 
L
F
 
P
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
E
 
S
I
 
I
F
 
F
G
x
R
D
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
L
L
 
M
I
 
-
P
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
V
H
 
L
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
S
 
D
V
 
D
L
 
L
S
 
S
E
 
A
G
 
E
E
 
Q
L
 
R
R
 
E
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
E
 
N
Q
 
E
M
 
L
L
 
M
D
 
E
D
 
E
V
 
F
N
 
H
M
 
I
L
 
E
D
 
H
K
 
L
R
 
R
N
 
D
M
 
S
H
x
M
S
x
G
A
x
Q
S
 
S
M
 
L
S
 
S
R
 
G
G
 
G
D
 
E
K
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
M
 
I
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
A
Q
 
A
N
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
P
N
 
I
N
 
S
T
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
K
K
 
R
E
 
I
I
 
I
K
 
E
E
 
H
K
 
L
R
 
R
D
 
D
-
 
S
-
 
G
I
 
L
T
 
G
I
 
V
A
 
L
I
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
H
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
C
E
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
H
D
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
N
 
E
I
 
I
K
 
L
G
 
Q
H
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 3:236/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
L
 
L
E
 
T
V
 
A
K
 
K
D
 
N
V
 
L
N
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
V
G
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
A
 
N
E
 
S
N
 
G
T
 
E
C
 
I
H
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
V
I
 
P
P
 
R
D
 
D
T
 
A
G
 
G
S
 
N
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
Q
 
D
S
 
D
V
 
I
L
 
S
G
 
L
R
 
L
T
 
P
P
 
L
F
 
H
E
 
A
I
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
Y
V
 
L
F
 
P
Q
|
Q
T
 
E
P
 
A
E
 
S
I
 
I
F
 
F
G
 
R
D
 
R
L
 
L
T
 
S
V
 
V
M
 
Y
E
 
D
N
 
N
M
 
L
L
 
M
I
 
-
P
 
-
C
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
A
L
 
V
H
 
L
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
S
 
D
V
 
D
L
 
L
S
 
S
E
 
A
G
 
E
E
 
Q
L
 
R
R
 
E
D
 
D
Q
 
R
A
 
A
E
 
N
Q
 
E
M
 
L
L
 
M
D
 
E
D
 
E
V
 
F
N
 
H
M
 
I
L
 
E
D
 
H
K
 
L
R
 
R
N
 
D
M
 
S
H
 
M
S
 
G
A
 
Q
S
|
S
M
 
L
S
|
S
R
 
G
G
 
G
D
x
E
K
 
R
R
 
R
R
 
R
L
 
V
E
 
E
M
 
I
A
 
A
M
 
R
C
 
A
L
 
L
V
 
A
Q
 
A
N
 
N
P
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
F
A
 
A
G
 
G
M
 
V
A
 
-
R
 
-
A
 
-
D
 
D
T
 
P
N
 
I
N
 
S
T
 
V
I
 
I
D
 
D
L
 
I
L
 
K
K
 
R
E
 
I
I
 
I
K
 
E
E
 
H
K
 
L
R
 
R
D
 
D
-
 
S
-
 
G
I
 
L
T
 
G
I
 
V
A
 
L
I
 
I
I
 
T
E
 
D
H
 
H
D
 
N
M
 
V
H
 
R
V
 
E
V
 
T
F
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
C
E
 
E
R
 
R
I
 
A
T
 
Y
V
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
G
 
G
T
 
H
P
 
L
L
 
I
V
 
A
E
 
H
D
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
T
N
 
E
I
 
I
K
 
L
G
 
Q
H
 
D
P
 
E
K
 
H
V
 
V
K
 
K
E
 
R
A
 
V
Y
 
Y
L
 
L
G
 
G
E
 
E

6mbnA Lptb e163q in complex with atp (see paper)
30% identity, 98% coverage: 4:249/251 of query aligns to 4:237/241 of 6mbnA

query
sites
6mbnA
L
 
L
E
 
T
V
 
A
K
 
K
D
 
N
V
 
L
N
 
A
K
 
K
R
 
A
F
x
Y
G
 
K
G
 
G
L
x
R
Q
 
R
A
x
V
L
 
V
G
 
E
N
 
D
V
 
V
N
 
S
L
 
L
S
 
T
V
 
V
A
 
N
E
 
S
N
 
G
T
 
E
C
 
I
H
 
V
A
 
G
I
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
T
L
 
F
N
 
Y
C
 
M
L
 
V
V
 
V
G
 
G
K
 
I
L
 
V
I
 
P
P
 
R
D
 
D
T
 
A
G
 
G
S
 
N
V
 
I
M
 
I
F
 
I
D
 
D
G
 
D
Q
 
D
S
 
D
V
 
I
L
 
S
G
 
L
R
 
L
T
 
P
P
 
L
F
 
H
E
 
A
I
 
R
N
 
A
Q
 
R
M
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
G
R
 
Y
V
 
L
F
 
P
Q
 
Q
T
 
E
P
 
A
E
 
S
I
 
I
F
 
F
G