SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_085772095.1 NCBI__GCF_002117405.1:WP_085772095.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7mjfA Crystal structure of candidatus liberibacter solanacearum dihydrodipicolinate synthase with pyruvate and succinic semi-aldehyde bound in active site
38% identity, 81% coverage: 48:310/325 of query aligns to 11:275/296 of 7mjfA

query
sites
7mjfA
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
T
E
 
K
D
 
D
D
 
N
-
 
L
I
 
I
A
 
D
E
 
E
D
 
D
A
 
S
F
 
F
A
 
V
R
 
D
Y
 
H
V
 
I
A
 
E
W
 
W
Q
 
Q
I
 
I
D
 
S
E
 
E
G
 
G
C
 
S
G
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
G
 
A
G
 
G
A
x
T
M
x
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
Y
R
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
C
R
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
L
A
 
C
A
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
A
S
 
A
R
 
G
R
 
R
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
M
V
 
A
A
 
G
T
 
A
G
 
G
T
 
S
N
 
N
C
 
N
T
 
T
R
 
K
E
 
E
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
A
E
 
Q
A
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
M
 
N
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
V
T
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
N
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
H
F
 
F
Q
 
G
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
Y
I
 
I
E
x
Y
I
 
N
D
 
N
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
A
 
V
V
 
I
D
 
E
I
 
M
G
 
D
P
 
V
E
 
D
T
 
T
L
 
M
T
 
A
Q
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
K
-
 
T
I
 
Y
P
 
S
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
V
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
R
L
 
I
A
 
E
S
 
L
L
 
A
R
 
S
K
 
G
R
 
Q
G
 
R
P
 
I
S
 
A
A
 
C
Q
 
G
P
 
S
N
 
D
S
 
F
A
 
I
H
 
Q
L
 
L
C
 
S
G
|
G
S
 
D
D
 
D
D
 
S
A
 
S
C
 
A
A
 
L
Q
 
G
F
 
F
C
 
N
L
 
V
A
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
W
 
C
I
 
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
I
W
 
C
S
 
A
A
 
E
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
V
 
I
D
 
S
A
 
E
K
 
G
Q
 
D
W
 
Y
D
 
R
R
 
Q
A
 
A
M
 
L
L
 
E
I
 
Y
E
 
Q
M
 
D
A
 
K
L
 
L
Q
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
H
F
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
R
 
I
E
 
E
S
 
P
G
 
S
A
 
I
A
 
S
P
 
S
L
 
V
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
G
P
 
R
W
 
N
F
 
V
S
 
S
P
 
L
Q
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
V
P
 
S
V
 
I

Sites not aligning to the query:

7lvlA Dihydrodipicolinate synthase bound with allosteric inhibitor (s)- lysine from candidatus liberibacter solanacearum
38% identity, 81% coverage: 48:310/325 of query aligns to 11:275/296 of 7lvlA

query
sites
7lvlA
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
T
E
 
K
D
 
D
D
 
N
-
 
L
I
 
I
A
 
D
E
 
E
D
 
D
A
 
S
F
 
F
A
 
V
R
 
D
Y
 
H
V
 
I
A
 
E
W
 
W
Q
 
Q
I
 
I
D
 
S
E
 
E
G
 
G
C
 
S
G
 
S
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
G
 
A
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
x
S
A
x
S
T
 
T
L
|
L
S
 
S
R
 
Y
R
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
C
R
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
L
A
 
C
A
 
V
E
 
K
T
 
T
A
 
A
S
 
A
R
 
G
R
 
R
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
M
V
 
A
A
 
G
T
 
A
G
 
G
T
 
S
N
 
N
C
 
N
T
 
T
R
 
K
E
 
E
S
 
S
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
A
E
 
Q
A
 
Y
A
 
A
Q
 
Q
M
 
N
A
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
V
T
 
V
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
N
Q
 
K
R
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
A
H
 
H
F
 
F
Q
 
G
E
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
N
A
 
A
V
 
V
D
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
Y
I
 
I
E
x
Y
I
 
N
D
 
N
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
A
 
V
V
 
I
D
 
E
I
 
M
G
 
D
P
 
V
E
 
D
T
 
T
L
 
M
T
 
A
Q
 
E
L
 
L
A
 
V
E
 
K
-
 
T
I
 
Y
P
 
S
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
V
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
R
L
 
I
A
 
E
S
 
L
L
 
A
R
 
S
K
 
G
R
 
Q
G
 
R
P
 
I
S
 
A
A
 
C
Q
 
G
P
 
S
N
 
D
S
 
F
A
 
I
H
 
Q
L
 
L
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
S
A
 
S
C
 
A
A
 
L
Q
 
G
F
 
F
C
 
N
L
 
V
A
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
W
 
C
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
I
W
 
C
S
 
A
A
 
E
L
 
F
Q
 
Q
R
 
K
A
 
A
V
 
I
D
 
S
A
 
E
K
 
G
Q
 
D
W
 
Y
D
 
R
R
 
Q
A
 
A
M
 
L
L
 
E
I
 
Y
E
 
Q
M
 
D
A
 
K
L
 
L
Q
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
H
F
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
R
 
I
E
 
E
S
 
P
G
 
S
A
 
I
A
 
S
P
 
S
L
 
V
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
R
L
 
L
H
 
G
P
 
R
W
 
N
F
 
V
S
 
S
P
 
L
Q
 
V
V
 
V
R
 
R
L
 
A
P
 
P
L
 
M
T
 
V
P
 
S
V
 
I

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
42% identity, 76% coverage: 48:293/325 of query aligns to 11:258/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
T
E
 
D
D
 
N
-
 
G
D
 
S
I
 
V
A
 
D
E
 
E
D
 
K
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
A
Y
 
H
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Q
 
Q
I
 
I
D
 
A
E
 
E
G
 
G
C
 
S
G
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
G
 
V
G
 
G
A
 
T
M
x
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
A
x
P
T
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
H
R
 
D
E
 
E
R
x
H
L
 
K
R
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
L
A
 
C
A
 
I
E
 
E
T
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
A
G
 
G
T
 
S
N
|
N
C
 
N
T
 
T
R
 
D
E
|
E
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
A
E
 
L
A
 
H
A
 
A
Q
 
Q
M
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
A
H
 
H
F
 
F
Q
 
S
E
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
V
I
 
I
E
 
Y
I
 
N
D
 
I
P
 
P
A
 
P
R
 
R
T
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
M
G
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
M
T
 
G
Q
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
I
 
A
-
 
H
P
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
V
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
K
L
 
L
A
 
D
S
 
R
L
 
V
R
 
S
K
 
E
R
 
Q
G
 
R
P
 
I
S
 
S
A
 
C
Q
 
G
P
 
K
N
 
D
S
 
F
A
 
V
H
 
Q
L
 
L
C
 
S
G
 
G
S
 
E
D
 
D
D
 
G
A
 
T
C
 
A
A
 
L
Q
 
G
F
 
F
C
 
N
L
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
W
 
C
I
 
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
W
 
C
S
 
S
A
 
E
L
 
F
Q
 
Q
R
 
A
A
 
A
V
 
M
D
 
L
A
 
A
K
 
G
Q
 
D
W
 
Y
D
 
A
R
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
E
I
 
Y
E
 
Q
M
 
D
A
 
R
L
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
H
F
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
F
R
 
M
E
 
E
S
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
C
P
 
G
L
 
T
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
S

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
42% identity, 76% coverage: 48:293/325 of query aligns to 11:258/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
T
E
 
D
D
 
N
D
 
G
-
 
A
I
 
V
A
 
D
E
 
E
D
 
Q
A
 
A
F
 
F
A
 
A
R
 
A
Y
 
H
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Q
 
Q
I
 
I
D
 
A
E
 
E
G
 
G
C
 
S
G
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
x
S
A
x
P
T
 
T
L
|
L
S
 
S
R
 
H
R
 
D
E
 
E
R
x
H
L
 
K
R
 
R
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
L
A
 
C
A
 
I
E
 
E
T
 
V
A
 
A
S
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
A
G
 
G
T
 
S
N
|
N
C
 
N
T
 
T
R
 
D
E
|
E
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
A
E
 
L
A
 
H
A
 
A
Q
 
Q
M
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
L
L
 
L
L
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
A
H
 
H
F
 
F
Q
 
S
E
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
V
I
 
I
E
x
Y
I
 
N
D
 
I
P
 
P
A
 
P
R
|
R
T
 
S
A
 
V
V
 
V
D
 
D
I
 
M
G
 
S
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
M
T
 
G
Q
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
I
 
A
-
 
H
P
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
V
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
K
L
 
L
A
 
D
S
 
R
L
 
V
R
 
S
K
 
E
R
 
Q
G
 
R
P
 
I
S
 
S
A
 
C
Q
 
G
P
 
K
N
 
D
S
 
F
A
 
I
H
 
Q
L
 
L
C
 
S
G
 
G
S
 
E
D
 
D
D
 
S
A
 
T
C
 
A
A
 
L
Q
 
G
F
 
F
C
 
N
L
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
V
G
 
G
W
 
C
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
S
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
L
W
 
C
S
 
S
A
 
E
L
 
F
Q
 
Q
R
 
A
A
 
A
V
 
M
D
 
L
A
 
A
K
 
G
Q
 
D
W
 
Y
D
 
A
R
 
K
A
 
A
M
 
L
L
 
E
I
 
Y
E
 
Q
M
 
D
A
 
R
L
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
H
F
 
R
A
 
A
L
 
I
Q
 
F
R
 
M
E
 
E
S
 
P
G
 
G
A
 
V
A
 
C
P
 
G
L
 
T
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
S

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
38% identity, 86% coverage: 43:322/325 of query aligns to 6:285/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
L
 
I
T
 
V
A
 
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
E
 
K
D
 
D
D
 
G
I
 
G
A
 
V
E
 
D
-
 
W
D
 
K
A
 
S
F
 
L
A
 
E
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Q
 
H
I
 
I
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
C
 
T
G
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
R
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
R
 
Q
L
 
V
I
 
I
E
 
K
I
 
E
A
 
I
A
 
I
E
 
R
T
 
V
A
 
A
S
 
N
R
 
K
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
I
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
T
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
M
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
T
|
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
Y
Q
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
x
N
D
x
V
P
|
P
A
 
G
R
|
R
T
|
T
A
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
T
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
D
L
 
V
A
 
P
S
 
R
L
 
G
R
 
K
K
 
A
R
 
L
G
 
I
P
 
D
S
 
A
A
 
L
Q
 
N
P
 
G
N
 
K
S
 
M
A
 
A
H
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
T
C
 
A
A
 
W
Q
 
E
F
 
L
C
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
D
G
 
G
W
 
N
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
W
 
M
S
 
S
A
 
E
L
 
V
Q
 
C
R
 
A
A
 
V
V
 
A
D
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
D
W
 
E
D
 
Q
R
 
Q
A
 
A
M
 
K
L
 
T
I
 
L
E
 
N
M
 
N
A
 
K
L
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
T
 
H
F
 
N
A
 
I
L
 
L
Q
 
F
R
 
C
E
 
E
S
 
S
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
L
 
M
H
 
G
P
 
-
W
 
L
F
 
I
S
 
D
P
 
T
Q
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
T
 
Y
A
 
R
R
 
E
E
 
P
I
 
L
R
 
R
A
 
N
C
 
A
F
 
L

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
38% identity, 86% coverage: 43:322/325 of query aligns to 6:285/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
L
 
I
T
 
V
A
|
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
E
 
K
D
 
D
D
 
G
I
 
G
A
 
V
E
 
D
-
 
W
D
 
K
A
 
S
F
 
L
A
 
E
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Q
 
H
I
 
I
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
C
 
T
G
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
G
 
V
G
|
G
A
x
T
M
x
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
R
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
R
 
Q
L
 
V
I
 
I
E
 
K
I
 
E
A
 
I
A
 
I
E
 
R
T
 
V
A
 
A
S
 
N
R
 
K
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
I
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
T
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
M
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
A
L
|
L
L
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
Y
Q
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
A
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
T
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
D
L
 
V
A
 
P
S
 
R
L
 
G
R
 
K
K
 
A
R
 
L
G
 
I
P
 
D
S
 
A
A
 
L
Q
 
N
P
 
G
N
 
K
S
 
M
A
 
A
H
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
T
C
 
A
A
 
W
Q
 
E
F
 
L
C
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
D
G
 
G
W
 
N
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
W
 
M
S
 
S
A
 
E
L
 
V
Q
 
C
R
 
A
A
 
V
V
 
A
D
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
D
W
 
E
D
 
Q
R
 
Q
A
 
A
M
 
K
L
 
T
I
 
L
E
 
N
M
 
N
A
 
K
L
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
T
 
H
F
 
N
A
 
I
L
 
L
Q
 
F
R
 
C
E
 
E
S
 
S
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
L
 
M
H
 
G
P
 
-
W
 
L
F
 
I
S
 
D
P
 
T
Q
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
T
 
Y
A
 
R
R
 
E
E
 
P
I
 
L
R
 
R
A
 
N
C
 
A
F
 
L

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
38% identity, 86% coverage: 43:322/325 of query aligns to 6:285/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
L
 
I
T
 
V
A
|
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
E
 
K
D
 
D
D
 
G
I
 
G
A
 
V
E
 
D
-
 
W
D
 
K
A
 
S
F
 
L
A
 
E
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Q
 
H
I
 
I
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
C
 
T
G
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
x
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
R
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
R
 
Q
L
 
V
I
 
I
E
 
K
I
 
E
A
 
I
A
 
I
E
 
R
T
 
V
A
 
A
S
 
N
R
 
K
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
I
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
T
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
M
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
Y
Q
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
A
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
T
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
D
L
 
V
A
 
P
S
 
R
L
 
G
R
 
K
K
 
A
R
 
L
G
 
I
P
 
D
S
 
A
A
 
L
Q
 
N
P
 
G
N
 
K
S
 
M
A
 
A
H
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
T
C
 
A
A
 
W
Q
 
E
F
 
L
C
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
D
G
 
G
W
 
N
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
W
 
M
S
 
S
A
 
E
L
 
V
Q
 
C
R
 
A
A
 
V
V
 
A
D
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
D
W
 
E
D
 
Q
R
 
Q
A
 
A
M
 
K
L
 
T
I
 
L
E
 
N
M
 
N
A
 
K
L
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
T
 
H
F
 
N
A
 
I
L
 
L
Q
 
F
R
 
C
E
 
E
S
 
S
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
L
 
M
H
 
G
P
 
-
W
 
L
F
 
I
S
 
D
P
 
T
Q
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
T
 
Y
A
 
R
R
 
E
E
 
P
I
 
L
R
 
R
A
 
N
C
 
A
F
 
L

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
38% identity, 86% coverage: 43:322/325 of query aligns to 6:285/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
L
 
I
T
 
V
A
 
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
E
 
K
D
 
D
D
 
G
I
 
G
A
 
V
E
 
D
-
 
W
D
 
K
A
 
S
F
 
L
A
 
E
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Q
 
H
I
 
I
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
C
 
T
G
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
A
x
S
T
 
T
L
|
L
S
 
S
R
 
M
R
 
E
E
 
E
R
x
H
L
 
T
R
 
Q
L
 
V
I
 
I
E
 
K
I
 
E
A
 
I
A
 
I
E
 
R
T
 
V
A
 
A
S
 
N
R
 
K
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
I
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
T
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
M
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
Y
Q
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
A
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
T
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
D
L
 
V
A
 
P
S
 
R
L
 
G
R
 
K
K
 
A
R
 
L
G
 
I
P
 
D
S
 
A
A
 
L
Q
 
N
P
 
G
N
 
K
S
 
M
A
 
A
H
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
T
C
 
A
A
 
W
Q
 
E
F
 
L
C
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
D
G
 
G
W
 
N
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
W
 
M
S
 
S
A
 
E
L
 
V
Q
 
C
R
 
A
A
 
V
V
 
A
D
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
D
W
 
E
D
 
Q
R
 
Q
A
 
A
M
 
K
L
 
T
I
 
L
E
 
N
M
 
N
A
 
K
L
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
T
 
H
F
 
N
A
 
I
L
 
L
Q
 
F
R
 
C
E
 
E
S
 
S
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
L
 
M
H
 
G
P
 
-
W
 
L
F
 
I
S
 
D
P
 
T
Q
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
T
 
Y
A
 
R
R
 
E
E
 
P
I
 
L
R
 
R
A
 
N
C
 
A
F
 
L

3rk8A Crystal structure of the chloride inhibited dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with pyruvate at 1.8 a resolution
38% identity, 86% coverage: 43:322/325 of query aligns to 6:285/291 of 3rk8A

query
sites
3rk8A
L
 
I
T
 
V
A
 
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
E
 
K
D
 
D
D
 
G
I
 
G
A
 
V
E
 
D
-
 
W
D
 
K
A
 
S
F
 
L
A
 
E
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Q
 
H
I
 
I
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
C
 
T
G
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
R
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
R
 
Q
L
 
V
I
 
I
E
 
K
I
 
E
A
 
I
A
 
I
E
 
R
T
 
V
A
 
A
S
 
N
R
 
K
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
I
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
T
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
M
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
Y
Q
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
A
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
T
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
D
L
 
V
A
 
P
S
 
R
L
 
G
R
 
K
K
 
A
R
 
L
G
 
I
P
 
D
S
 
A
A
 
L
Q
 
N
P
 
G
N
 
K
S
 
M
A
 
A
H
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
|
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
T
C
 
A
A
 
W
Q
 
E
F
 
L
C
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
D
G
 
G
W
 
N
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
W
 
M
S
 
S
A
 
E
L
 
V
Q
 
C
R
 
A
A
 
V
V
 
A
D
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
D
W
 
E
D
 
Q
R
 
Q
A
 
A
M
 
K
L
 
T
I
 
L
E
 
N
M
 
N
A
 
K
L
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
T
 
H
F
 
N
A
 
I
L
 
L
Q
x
F
R
 
C
E
 
E
S
 
S
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
L
 
M
H
 
G
P
 
-
W
 
L
F
 
I
S
 
D
P
 
T
Q
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
T
 
Y
A
 
R
R
 
E
E
 
P
I
 
L
R
 
R
A
 
N
C
 
A
F
 
L

3pueB Crystal structure of the complex of dhydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with lysine at 2.6a resolution
38% identity, 86% coverage: 43:322/325 of query aligns to 6:285/291 of 3pueB

query
sites
3pueB
L
 
I
T
 
V
A
 
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
L
E
 
K
D
 
D
D
 
G
I
 
G
A
 
V
E
 
D
-
 
W
D
 
K
A
 
S
F
 
L
A
 
E
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Q
 
H
I
 
I
D
 
E
E
 
Q
G
 
G
C
 
T
G
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
A
A
 
S
T
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
M
R
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
T
R
 
Q
L
 
V
I
 
I
E
 
K
I
 
E
A
 
I
A
 
I
E
 
R
T
 
V
A
 
A
S
 
N
R
 
K
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
I
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
T
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
M
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
Y
Q
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
E
L
 
L
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
A
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
L
G
 
S
P
 
N
E
 
D
T
 
T
L
 
A
T
 
V
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
I
 
I
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
D
L
 
V
A
 
P
S
 
R
L
 
G
R
 
K
K
 
A
R
 
L
G
 
I
P
 
D
S
 
A
A
 
L
Q
 
N
P
 
G
N
 
K
S
 
M
A
 
A
H
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
E
A
 
T
C
 
A
A
 
W
Q
 
E
F
 
L
C
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
D
G
 
G
W
 
N
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
A
W
 
M
S
 
S
A
 
E
L
 
V
Q
 
C
R
 
A
A
 
V
V
 
A
D
 
I
A
 
A
K
 
K
Q
 
D
W
 
E
D
 
Q
R
 
Q
A
 
A
M
 
K
L
 
T
I
 
L
E
 
N
M
 
N
A
 
K
L
 
I
Q
 
A
P
 
N
L
 
L
T
 
H
F
 
N
A
 
I
L
 
L
Q
x
F
R
 
C
E
 
E
S
 
S
G
x
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
L
 
M
H
 
G
P
 
-
W
 
L
F
 
I
S
 
D
P
 
T
Q
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
P
V
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
Q
T
 
Y
A
 
R
R
 
E
E
 
P
I
 
L
R
 
R
A
 
N
C
 
A
F
 
L

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
39% identity, 85% coverage: 43:318/325 of query aligns to 6:281/292 of Q07607

query
sites
Q07607
L
 
I
T
 
T
A
 
A
A
 
L
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
A
E
 
D
D
 
D
D
 
R
I
 
I
A
 
D
E
 
E
D
 
V
A
 
A
F
 
L
A
 
H
R
 
D
Y
 
L
V
 
V
A
 
E
W
 
W
Q
 
Q
I
 
I
D
 
E
E
 
E
G
 
G
C
 
S
G
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
G
 
C
G
 
G
A
 
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
S
R
 
K
R
 
S
E
 
E
R
 
H
L
 
E
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
E
 
E
I
 
I
A
 
T
A
 
I
E
 
K
T
 
T
A
 
A
S
 
N
R
 
G
R
 
R
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
A
G
 
G
T
 
S
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
I
E
 
A
R
 
F
T
 
V
E
 
R
A
 
H
A
 
A
Q
 
Q
M
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
I
A
 
V
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
F
Q
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
S
D
 
T
L
 
I
P
 
P
L
 
I
I
 
I
I
 
V
E
 
Y
I
 
N
D
 
I
P
 
P
A
 
G
R
 
R
T
 
S
A
 
A
V
 
I
D
 
E
I
 
I
G
 
H
P
 
V
E
 
E
T
 
T
L
 
L
T
 
A
Q
 
R
L
 
I
A
 
F
E
 
E
-
 
D
I
 
C
P
 
P
N
 
N
I
 
V
V
 
K
A
 
G
I
 
V
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
L
-
 
R
-
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
E
K
 
R
R
 
M
G
 
A
P
 
C
S
 
G
A
 
E
Q
 
D
P
 
F
N
 
N
S
 
L
A
 
-
H
 
-
L
 
L
C
 
T
G
 
G
S
 
E
D
 
D
D
 
G
A
 
T
C
 
A
A
 
L
Q
 
G
F
 
Y
C
 
M
L
 
A
A
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
H
G
 
G
W
 
C
I
 
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
W
 
C
S
 
A
A
 
D
L
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
A
 
A
V
 
C
D
 
L
A
 
N
K
 
G
Q
 
D
W
 
F
D
 
A
R
 
A
A
 
A
M
 
L
L
 
K
I
 
L
E
 
Q
M
 
D
A
 
R
L
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
H
F
 
R
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
R
 
L
E
 
E
S
 
T
G
 
N
A
 
P
A
 
A
P
 
G
L
 
A
K
 
K
Y
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
L
 
R
L
 
L
H
 
-
P
 
G
W
 
R
F
 
M
S
 
R
P
 
G
Q
 
D
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
A
 
P
E
 
S
T
 
F
A
 
Q
R
 
E
E
 
E
I
 
I

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
31% identity, 86% coverage: 44:322/325 of query aligns to 7:288/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
T
 
T
A
 
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
K
E
 
N
D
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
D
E
 
L
D
 
E
A
 
S
F
 
Y
A
 
E
R
 
R
Y
 
L
V
 
V
A
 
R
W
 
Y
Q
 
Q
I
 
L
D
 
E
E
 
N
G
 
G
C
 
V
G
 
N
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
 
L
G
 
G
A
 
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
V
S
 
N
R
 
E
R
 
D
E
 
E
R
 
R
L
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
S
I
 
R
A
 
T
A
 
L
E
 
E
T
 
I
A
 
V
S
 
D
R
 
G
R
 
K
A
 
I
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
G
T
 
A
G
 
G
T
 
T
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
E
E
 
K
S
 
T
I
 
L
E
 
K
R
 
L
T
 
V
E
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
E
M
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
N
A
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
Y
Q
 
K
E
 
Y
I
 
I
A
 
S
R
 
E
A
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
G
L
 
I
I
 
V
I
 
V
E
 
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
 
R
T
 
T
A
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
V
G
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
A
T
 
A
Q
 
R
L
 
I
-
 
A
A
 
A
E
 
D
I
 
L
P
 
K
N
 
N
I
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
 
K
H
 
E
A
 
A
D
 
N
G
 
P
G
x
D
L
x
I
A
x
D
S
 
Q
L
 
I
-
 
D
R
 
R
K
 
T
R
 
V
G
 
S
P
 
L
S
 
T
A
 
K
Q
 
Q
P
 
A
N
 
R
S
 
S
A
 
D
H
 
F
L
 
M
C
 
V
-
 
W
-
 
S
G
 
G
S
 
N
D
 
D
D
 
D
A
 
R
C
 
T
A
 
F
Q
 
Y
F
 
L
C
 
L
L
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
D
G
 
G
W
 
V
I
 
I
S
 
S
S
 
V
T
 
V
A
 
S
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
Q
W
 
M
S
 
V
A
 
E
L
 
L
Q
 
C
R
 
A
A
 
E
V
 
Y
D
 
F
A
 
S
K
 
G
Q
 
N
W
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
S
M
 
R
L
 
E
I
 
V
E
 
H
M
 
R
A
 
K
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
M
F
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
R
 
V
E
 
E
S
 
T
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
L
L
 
M
H
 
G
P
 
-
W
 
F
F
 
I
S
 
E
P
 
N
Q
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
P
 
P
V
 
A
A
 
S
A
 
E
E
 
K
T
 
T
A
 
V
R
 
E
E
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
N
C
 
V
F
 
L

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
31% identity, 86% coverage: 44:322/325 of query aligns to 8:289/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
T
 
T
A
 
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
K
E
 
N
D
 
G
D
 
E
I
 
L
A
 
D
E
 
L
D
 
E
A
 
S
F
 
Y
A
 
E
R
 
R
Y
 
L
V
 
V
A
 
R
W
 
Y
Q
 
Q
I
 
L
D
 
E
E
 
N
G
 
G
C
 
V
G
 
N
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
V
G
 
L
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
V
S
 
N
R
 
E
R
 
D
E
 
E
R
 
R
L
 
E
R
 
K
L
 
L
I
 
V
E
 
S
I
 
R
A
 
T
A
 
L
E
|
E
T
 
I
A
 
V
S
x
D
R
 
G
R
 
K
A
 
I
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
V
A
 
G
T
 
A
G
 
G
T
 
T
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
E
E
 
K
S
 
T
I
 
L
E
 
K
R
 
L
T
 
V
E
 
K
A
 
Q
A
 
A
Q
 
E
M
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
N
A
 
G
A
 
V
L
 
L
L
 
V
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
Y
Q
 
K
E
 
Y
I
 
I
A
 
S
R
 
E
A
 
R
V
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
G
L
 
I
I
 
V
I
 
V
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
A
 
G
V
 
V
D
 
N
I
 
V
G
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
A
T
 
A
Q
 
R
L
 
I
-
 
A
A
 
A
E
 
D
I
 
L
P
 
K
N
 
N
I
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
E
A
 
A
D
 
N
G
 
P
G
 
D
L
 
I
A
 
D
S
 
Q
L
 
I
-
 
D
R
 
R
K
 
T
R
 
V
G
 
S
P
 
L
S
 
T
A
 
K
Q
 
Q
P
 
A
N
 
R
S
 
S
A
 
D
H
 
F
L
 
M
C
 
V
-
 
W
-
 
S
G
 
G
S
 
N
D
 
D
D
 
D
A
 
R
C
 
T
A
 
F
Q
 
Y
F
 
L
C
 
L
L
 
C
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
D
G
 
G
W
 
V
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
V
A
 
S
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
K
L
 
Q
W
 
M
S
 
V
A
 
E
L
 
L
Q
 
C
R
 
A
A
 
E
V
 
Y
D
 
F
A
 
S
K
 
G
Q
 
N
W
 
L
D
 
E
R
 
K
A
 
S
M
 
R
L
 
E
I
 
V
E
 
H
M
 
R
A
 
K
L
 
L
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
T
 
M
F
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
R
 
V
E
 
E
S
 
T
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
A
A
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
L
L
 
M
H
 
G
P
 
-
W
 
F
F
 
I
S
 
E
P
 
N
Q
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
P
 
P
V
 
A
A
 
S
A
 
E
E
 
K
T
 
T
A
 
V
R
 
E
E
 
L
I
 
L
R
 
R
A
 
N
C
 
V
F
 
L

3s8hA Structure of dihydrodipicolinate synthase complexed with 3- hydroxypropanoic acid(hpa)at 2.70 a resolution
38% identity, 82% coverage: 43:308/325 of query aligns to 6:271/292 of 3s8hA

query
sites
3s8hA
L
 
M
T
 
V
A
|
A
A
x
L
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
-
 
D
A
 
A
E
 
Q
D
 
G
D
 
R
I
 
L
A
 
D
E
 
W
D
 
D
A
 
S
F
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
D
W
 
F
Q
 
H
I
 
L
D
 
Q
E
 
D
G
 
G
C
 
T
G
 
N
G
 
A
L
 
I
V
|
V
V
 
A
G
 
V
G
|
G
A
x
T
M
x
T
G
|
G
E
 
E
G
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
D
R
 
V
R
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
I
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
E
 
R
I
 
R
A
 
V
A
 
V
E
 
D
T
 
Q
A
 
V
S
 
K
R
 
G
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
A
I
 
V
E
 
A
R
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
M
 
S
A
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
C
L
 
L
L
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
F
Q
 
R
E
 
H
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
A
 
S
V
 
C
D
 
D
I
 
M
G
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
T
 
E
Q
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
K
I
 
V
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
D
L
 
L
A
 
Q
S
 
R
L
 
A
R
 
K
K
 
E
R
 
V
G
 
I
P
 
E
S
 
R
A
 
V
Q
 
G
P
 
K
N
 
D
S
 
F
A
 
L
H
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
A
A
 
T
C
 
A
A
 
V
Q
 
E
F
 
L
C
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
K
G
 
G
W
 
N
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
A
W
 
M
S
 
S
A
 
D
L
 
L
Q
 
C
R
 
A
A
 
A
V
 
A
D
 
M
A
 
R
K
 
G
Q
 
D
W
 
A
D
 
A
R
 
A
A
 
A
M
 
R
L
 
A
I
 
I
E
 
N
M
 
D
A
 
R
L
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
H
F
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
R
 
I
E
 
E
S
 
S
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
L
 
M
H
 
-
P
 
-
W
 
G
F
 
L
S
 
I
P
 
P
Q
 
E
-
 
G
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T

3puoA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from pseudomonas aeruginosa(psdhdps)complexed with l-lysine at 2.65a resolution (see paper)
38% identity, 82% coverage: 43:308/325 of query aligns to 6:271/292 of 3puoA

query
sites
3puoA
L
 
M
T
 
V
A
 
A
A
 
L
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
-
 
D
A
 
A
E
 
Q
D
 
G
D
 
R
I
 
L
A
 
D
E
 
W
D
 
D
A
 
S
F
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
D
W
 
F
Q
 
H
I
 
L
D
 
Q
E
 
D
G
 
G
C
 
T
G
 
N
G
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
A
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
x
S
A
|
A
T
 
T
L
|
L
S
x
D
R
x
V
R
 
E
E
 
E
R
 
H
L
 
I
R
 
Q
L
 
V
I
 
V
E
 
R
I
 
R
A
 
V
A
 
V
E
 
D
T
 
Q
A
 
V
S
 
K
R
 
G
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
C
 
S
T
 
T
R
 
R
E
 
E
S
 
A
I
 
V
E
 
A
R
 
L
T
 
T
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Q
 
K
M
 
S
A
 
G
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
C
L
 
L
L
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
T
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
M
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
F
Q
 
R
E
 
H
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
A
 
S
V
 
C
D
 
D
I
 
M
G
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
T
 
E
Q
 
R
L
 
L
A
 
S
E
 
K
I
 
V
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
D
L
 
L
A
 
Q
S
 
R
L
 
A
R
 
K
K
 
E
R
 
V
G
 
I
P
 
E
S
 
R
A
 
V
Q
 
G
P
 
K
N
 
D
S
 
F
A
 
L
H
 
V
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
A
A
 
T
C
 
A
A
 
V
Q
 
E
F
 
L
C
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
K
G
 
G
W
 
N
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
R
L
 
A
W
 
M
S
 
S
A
 
D
L
 
L
Q
 
C
R
 
A
A
 
A
V
 
A
D
 
M
A
 
R
K
 
G
Q
 
D
W
 
A
D
 
A
R
 
A
A
 
A
M
 
R
L
 
A
I
 
I
E
 
N
M
 
D
A
 
R
L
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
H
F
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
R
 
I
E
 
E
S
 
S
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
L
S
 
H
L
 
E
L
 
M
H
 
-
P
 
-
W
 
G
F
 
L
S
 
I
P
 
P
Q
 
E
-
 
G
V
x
I
R
 
R
L
|
L
P
 
P
L
|
L
T
|
T

3di1B Crystal structure of the staphylococcus aureus dihydrodipicolinate synthase-pyruvate complex (see paper)
33% identity, 86% coverage: 45:325/325 of query aligns to 11:289/291 of 3di1B

query
sites
3di1B
A
|
A
A
 
L
P
 
T
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
T
E
 
N
D
 
N
D
 
K
I
 
V
A
 
N
E
 
I
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
R
 
T
Y
 
H
V
 
V
A
 
N
W
 
F
Q
 
L
I
 
L
D
 
E
E
 
N
G
 
N
C
 
A
G
 
Q
G
 
A
L
 
I
V
 
I
V
 
V
G
 
N
G
|
G
A
x
T
M
x
T
G
 
A
E
 
E
G
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
T
R
 
T
R
 
D
E
 
E
R
 
K
L
 
E
R
 
R
L
 
I
I
 
L
E
 
K
I
 
T
A
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
L
A
 
V
S
 
D
R
 
K
R
 
R
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
N
 
N
C
 
D
T
 
T
R
 
E
E
 
K
S
 
S
I
 
I
E
 
Q
R
 
A
T
 
S
E
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
K
M
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
I
L
 
M
L
 
L
A
 
I
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
T
G
 
N
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
V
S
 
K
H
 
H
F
 
F
Q
 
E
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
V
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
A
 
N
V
 
M
D
 
T
I
 
I
G
 
E
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
T
 
E
Q
 
I
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
I
 
H
P
 
P
N
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
L
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
N
G
 
D
L
 
F
A
 
E
S
 
Y
L
 
L
R
 
E
K
 
E
R
 
V
G
 
K
P
 
K
S
 
R
A
 
I
Q
 
D
P
 
T
N
 
N
S
 
S
-
 
F
A
 
A
H
 
L
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
N
D
 
D
D
 
D
A
 
N
C
 
V
A
 
V
Q
 
E
F
 
Y
C
 
Y
L
 
Q
A
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
W
 
V
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
I
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
K
L
 
E
W
 
F
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
Q
Q
 
Q
W
 
-
D
 
-
R
 
S
A
 
G
M
 
L
L
 
D
I
 
I
E
 
Q
M
 
D
A
 
Q
L
 
F
Q
 
K
P
 
P
-
 
I
-
 
G
-
 
T
L
 
L
T
 
L
F
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
R
 
V
E
 
D
S
 
I
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
I
K
 
K
Y
 
-
A
 
A
L
 
L
S
 
T
L
 
S
L
 
Y
H
 
L
P
 
G
W
 
F
F
 
G
S
 
N
P
 
Y
Q
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
P
 
S
V
 
L
A
 
E
A
 
D
E
 
T
T
 
D
A
 
T
R
 
K
E
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
E
C
 
T
F
 
Y
A
 
D
R
 
T
F
 
F

Q5HG25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Staphylococcus aureus (strain COL) (see paper)
33% identity, 86% coverage: 45:325/325 of query aligns to 11:289/295 of Q5HG25

query
sites
Q5HG25
A
 
A
A
 
L
P
 
T
T
 
T
P
 
P
F
 
F
A
 
T
E
 
N
D
 
N
D
 
K
I
 
V
A
 
N
E
 
I
D
 
E
A
 
A
F
 
L
A
 
K
R
 
T
Y
 
H
V
 
V
A
 
N
W
 
F
Q
 
L
I
 
L
D
 
E
E
 
N
G
 
N
C
 
A
G
 
Q
G
 
A
L
 
I
V
 
I
V
 
V
G
 
N
G
 
G
A
 
T
M
x
T
G
 
A
E
 
E
G
 
S
A
 
P
T
 
T
L
 
L
S
 
T
R
 
T
R
 
D
E
 
E
R
 
K
L
 
E
R
 
R
L
 
I
I
 
L
E
 
K
I
 
T
A
 
V
A
 
I
E
 
D
T
 
L
A
 
V
S
 
D
R
 
K
R
 
R
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
T
N
 
N
C
 
D
T
 
T
R
 
E
E
 
K
S
 
S
I
 
I
E
 
Q
R
 
A
T
 
S
E
 
I
A
 
Q
A
 
A
Q
 
K
M
 
A
A
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
D
A
 
A
A
 
I
L
 
M
L
 
L
A
 
I
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
T
G
 
N
Q
 
Q
R
 
R
G
 
G
L
 
L
L
 
V
S
 
K
H
 
H
F
 
F
Q
 
E
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
D
A
 
A
V
 
V
D
 
K
L
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
V
I
 
L
E
 
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
S
R
 
R
T
 
T
A
 
N
V
 
M
D
 
T
I
 
I
G
 
E
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
T
 
E
Q
 
I
L
 
L
A
 
S
E
 
Q
I
 
H
P
 
P
N
 
Y
I
 
I
V
 
V
A
 
A
I
 
L
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
N
G
 
D
L
 
F
A
 
E
S
 
Y
L
 
L
R
 
E
K
 
E
R
 
V
G
 
K
P
 
K
S
 
R
A
 
I
Q
 
D
P
 
T
N
 
N
S
 
S
-
 
F
A
 
A
H
 
L
L
 
Y
C
 
S
G
 
G
S
 
N
D
 
D
D
 
D
A
 
N
C
 
V
A
 
V
Q
 
E
F
 
Y
C
 
Y
L
 
Q
A
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
W
 
V
I
 
I
S
 
S
S
 
V
T
 
I
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
K
L
 
E
W
 
F
S
 
Q
A
 
A
L
 
L
Q
 
-
R
 
-
A
 
-
V
 
Y
D
 
D
A
 
A
K
 
Q
Q
 
Q
W
 
-
D
 
-
R
 
S
A
 
G
M
 
L
L
 
D
I
 
I
E
 
Q
M
 
D
A
 
Q
L
 
F
Q
 
K
P
 
P
-
 
I
-
 
G
-
 
T
L
 
L
T
 
L
F
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
S
R
 
V
E
 
D
S
 
I
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
I
K
 
K
Y
 
-
A
 
A
L
 
L
S
 
T
L
 
S
L
 
Y
H
 
L
P
 
G
W
 
F
F
 
G
S
 
N
P
 
Y
Q
 
E
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
V
P
 
S
V
 
L
A
 
E
A
 
D
E
 
T
T
 
D
A
 
T
R
 
K
E
 
V
I
 
L
R
 
R
A
 
E
C
 
T
F
 
Y
A
 
D
R
 
T
F
 
F

4pfmA Shewanella benthica dhdps with lysine and pyruvate
36% identity, 83% coverage: 43:313/325 of query aligns to 7:278/295 of 4pfmA

query
sites
4pfmA
L
 
I
T
 
V
A
 
A
A
 
L
P
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
L
A
 
N
E
 
S
D
 
D
D
 
G
I
 
T
A
 
V
E
 
D
-
 
Y
D
 
T
A
 
S
F
 
L
A
 
E
R
 
K
Y
 
L
V
 
V
A
 
E
W
 
Y
Q
 
H
I
 
I
D
 
T
E
 
E
G
 
G
C
 
T
G
 
D
G
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
A
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
x
S
A
|
A
T
 
T
L
|
L
S
 
P
R
 
I
R
 
S
E
 
E
R
x
H
L
 
I
R
 
A
L
 
V
I
 
V
E
 
G
I
 
Q
A
 
T
A
 
V
E
 
K
T
 
F
A
 
A
S
 
S
R
 
G
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
G
A
 
G
T
 
N
G
 
G
T
 
A
N
|
N
C
 
A
T
 
T
R
 
A
E
|
E
S
 
A
I
 
I
E
 
E
R
 
L
T
 
T
E
 
K
A
 
A
A
 
Q
Q
 
N
M
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
M
L
 
L
L
 
G
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
K
P
 
P
G
 
S
Q
 
P
R
 
K
G
 
G
L
 
L
L
 
I
S
 
A
H
 
H
F
 
Y
Q
 
T
E
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
A
A
 
S
V
 
T
D
 
D
L
 
I
P
 
P
L
 
Q
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
G
R
|
R
T
 
T
A
 
A
V
 
V
D
 
D
I
 
M
G
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
I
T
 
A
Q
 
Q
L
 
L
A
 
V
E
 
E
I
 
V
P
 
P
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
V
A
x
K
H
 
D
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
D
L
 
V
A
 
A
S
 
R
L
 
V
R
 
K
K
 
Q
R
 
L
G
 
-
P
 
R
S
 
D
A
 
L
Q
 
C
P
 
G
N
 
N
S
 
D
A
 
F
H
 
L
L
 
L
C
 
Y
G
 
S
S
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
C
 
T
A
 
A
-
 
R
Q
 
E
F
 
F
C
 
L
L
 
T
A
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
D
G
 
G
W
 
V
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
A
A
 
N
N
 
N
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
K
L
 
L
W
 
F
S
 
K
A
 
L
L
 
M
Q
 
C
R
 
D
A
 
A
V
 
A
D
 
L
A
 
A
K
 
G
Q
 
D
W
 
T
D
 
Q
R
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
A
I
 
A
E
 
E
M
 
D
A
 
Q
L
 
I
Q
 
K
P
 
G
L
 
L
T
 
F
F
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
F
R
 
C
E
 
E
S
 
A
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
A
S
 
H
L
 
K
L
 
M
H
 
G
P
 
L
W
 
I
F
 
S
S
 
Q
P
 
G
Q
 
D
V
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
T
 
T
P
 
E
V
 
L
A
 
S
A
 
T
E
 
E

2atsA Dihydrodipicolinate synthase co-crystallised with (s)-lysine
31% identity, 86% coverage: 43:322/325 of query aligns to 6:286/292 of 2atsA

query
sites
2atsA
L
 
I
T
 
V
A
 
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
D
E
 
E
D
 
K
-
 
G
D
 
N
I
 
V
A
 
C
E
 
R
D
 
A
A
 
S
F
 
L
A
 
K
R
 
K
Y
 
L
V
 
I
A
 
D
W
 
Y
Q
 
H
I
 
V
D
 
A
E
 
S
G
 
G
C
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
S
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
 
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
A
|
A
T
 
T
L
|
L
S
 
N
R
x
H
R
 
D
E
 
E
R
x
H
L
 
A
R
 
D
L
 
V
I
 
V
E
 
M
I
 
M
A
 
T
A
 
L
E
 
D
T
 
L
A
 
A
S
 
D
R
 
G
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
|
N
C
 
A
T
 
T
R
 
A
E
|
E
S
 
A
I
 
I
E
 
S
R
 
L
T
 
T
E
 
Q
A
 
R
A
 
F
Q
 
N
M
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
S
 
V
A
 
G
A
 
C
L
 
L
L
 
T
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
G
 
S
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
F
Q
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
H
V
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
A
 
G
V
 
C
D
 
D
I
 
L
G
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
T
 
G
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
I
 
V
P
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
T
S
 
R
L
 
V
R
 
N
K
 
Q
R
 
I
G
 
K
P
 
E
S
 
L
A
 
V
Q
 
S
P
 
D
N
 
D
S
 
F
A
 
V
H
 
L
L
 
L
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
A
A
 
S
C
 
A
A
 
L
Q
 
D
F
 
F
C
 
M
L
 
Q
A
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
H
G
 
G
W
 
V
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
A
A
 
R
L
 
D
W
 
M
S
 
A
A
 
Q
L
 
M
Q
 
C
R
 
K
A
 
L
V
 
A
D
 
A
A
 
E
K
 
G
Q
 
H
W
 
F
D
 
A
R
 
E
A
 
A
M
 
R
L
 
V
I
 
I
E
 
N
M
 
Q
A
 
R
L
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
H
F
 
N
A
 
K
L
 
L
Q
 
F
R
 
V
E
 
E
S
 
P
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
C
S
 
K
L
 
E
L
 
L
H
 
G
P
 
L
W
 
V
F
 
A
S
 
T
P
 
D
Q
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
I
A
 
T
A
 
D
E
 
S
T
 
G
A
 
R
R
 
E
E
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
C
 
A
F
 
L

P0A6L2 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
31% identity, 86% coverage: 43:322/325 of query aligns to 6:286/292 of P0A6L2

query
sites
P0A6L2
L
 
I
T
 
V
A
 
A
A
 
I
P
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
A
 
D
E
 
E
D
 
K
-
 
G
D
 
N
I
 
V
A
 
C
E
 
R
D
 
A
A
 
S
F
 
L
A
 
K
R
 
K
Y
 
L
V
 
I
A
 
D
W
 
Y
Q
 
H
I
 
V
D
 
A
E
 
S
G
 
G
C
 
T
G
 
S
G
 
A
L
 
I
V
 
V
V
 
S
G
 
V
G
 
G
A
x
T
M
x
T
G
 
G
E
 
E
G
 
S
A
 
A
T
 
T
L
 
L
S
 
N
R
 
H
R
 
D
E
 
E
R
 
H
L
 
A
R
 
D
L
 
V
I
 
V
E
 
M
I
 
M
A
 
T
A
 
L
E
 
D
T
 
L
A
 
A
S
 
D
R
 
G
R
 
R
A
 
I
V
 
P
V
 
V
I
 
I
V
 
A
A
 
G
T
 
T
G
 
G
T
 
A
N
 
N
C
 
A
T
 
T
R
 
A
E
 
E
S
 
A
I
 
I
E
 
S
R
 
L
T
 
T
E
 
Q
A
 
R
A
 
F
Q
 
N
M
 
D
A
 
S
G
 
G
A
 
I
S
 
V
A
 
G
A
 
C
L
 
L
L
 
T
A
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
N
 
N
K
 
R
P
 
P
G
 
S
Q
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
S
 
Q
H
 
H
F
 
F
Q
 
K
E
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
A
 
H
V
 
T
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
I
 
I
I
 
L
E
x
Y
I
 
N
D
 
V
P
 
P
A
 
S
R
|
R
T
 
T
A
 
G
V
 
C
D
 
D
I
 
L
G
 
L
P
 
P
E
 
E
T
 
T
L
 
V
T
 
G
Q
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
K
I
 
V
P
 
K
N
 
N
I
 
I
V
 
I
A
 
G
I
 
I
A
x
K
H
 
E
A
 
A
D
 
T
G
 
G
G
 
N
L
 
L
A
 
T
S
 
R
L
 
V
R
 
N
K
 
Q
R
 
I
G
 
K
P
 
E
S
 
L
A
 
V
Q
 
S
P
 
D
N
 
D
S
 
F
A
 
V
H
 
L
L
 
L
C
 
S
G
 
G
S
 
D
D
 
D
D
 
A
A
 
S
C
 
A
A
 
L
Q
 
D
F
 
F
C
 
M
L
 
Q
A
x
L
G
 
G
G
 
G
S
 
H
G
 
G
W
 
V
I
|
I
S
 
S
S
 
V
T
 
T
A
 
A
N
 
N
I
 
V
V
 
A
P
 
A
A
 
R
L
 
D
W
 
M
S
 
A
A
 
Q
L
 
M
Q
 
C
R
 
K
A
 
L
V
 
A
D
 
A
A
 
E
K
 
G
Q
 
H
W
 
F
D
 
A
R
 
E
A
 
A
M
 
R
L
 
V
I
 
I
E
 
N
M
 
Q
A
 
R
L
 
L
Q
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
H
F
 
N
A
 
K
L
 
L
Q
 
F
R
 
V
E
 
E
S
 
P
G
 
N
A
 
P
A
 
I
P
 
P
L
 
V
K
 
K
Y
 
W
A
 
A
L
 
C
S
 
K
L
 
E
L
 
L
H
 
G
P
 
L
W
 
V
F
 
A
S
 
T
P
 
D
Q
 
T
V
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
M
T
 
T
P
 
P
V
 
I
A
 
T
A
 
D
E
 
S
T
 
G
A
 
R
R
 
E
E
 
T
I
 
V
R
 
R
A
 
A
C
 
A
F
 
L

Query Sequence

>WP_085772095.1 NCBI__GCF_002117405.1:WP_085772095.1
MLASLFKRRQHPSLFGLPGADEEAEPQPPTRLARIVARDRIWLTAAPTPFAEDDIAEDAF
ARYVAWQIDEGCGGLVVGGAMGEGATLSRRERLRLIEIAAETASRRAVVIVATGTNCTRE
SIERTEAAQMAGASAALLATPYYNKPGQRGLLSHFQEIARAVDLPLIIEIDPARTAVDIG
PETLTQLAEIPNIVAIAHADGGLASLRKRGPSAQPNSAHLCGSDDACAQFCLAGGSGWIS
STANIVPALWSALQRAVDAKQWDRAMLIEMALQPLTFALQRESGAAPLKYALSLLHPWFS
PQVRLPLTPVAAETAREIRACFARF

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory