SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_085984982.1 NCBI__GCF_000022085.1:WP_085984982.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2zsjA Crystal structure of threonine synthase from aquifex aeolicus vf5
32% identity, 99% coverage: 3:309/309 of query aligns to 26:332/350 of 2zsjA

query
sites
2zsjA
E
 
E
G
 
G
C
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
N
-
 
L
-
 
A
R
 
R
P
 
A
W
 
I
G
 
G
-
 
F
D
 
K
L
 
G
R
 
K
P
 
I
F
 
Y
F
 
L
K
 
K
L
 
Y
E
 
E
W
 
G
F
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
L
M
 
A
L
 
I
S
 
S
F
 
K
L
 
A
R
 
V
Q
 
E
I
 
A
G
 
G
V
 
K
D
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
E
 
C
D
 
A
S
 
S
S
x
T
G
 
G
N
|
N
G
 
T
G
 
S
S
 
A
S
 
S
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
L
R
 
R
V
 
A
K
 
Y
I
 
V
L
 
L
A
 
L
P
 
P
-
 
K
A
 
G
Y
 
A
T
 
V
S
 
A
P
 
I
A
 
G
K
 
K
I
 
L
A
 
S
Q
 
Q
V
 
A
R
 
M
A
 
I
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
V
Q
 
L
L
 
A
V
 
I
E
 
Q
G
 
G
P
 
T
R
 
F
E
 
D
E
 
D
S
 
A
E
 
-
A
 
L
E
 
N
A
 
I
I
 
V
R
 
R
Q
 
K
S
 
I
G
 
G
Q
 
E
T
 
N
F
 
F
Y
 
P
A
 
V
S
 
E
-
 
I
-
 
V
H
 
N
N
 
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
I
W
 
C
E
 
D
D
 
T
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
E
V
 
A
P
 
P
D
 
D
N
 
Y
I
 
H
I
 
F
I
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
A
x
N
G
x
A
S
x
G
S
x
N
L
 
I
L
 
T
G
 
A
C
 
Y
A
 
W
F
 
K
G
 
G
F
 
F
R
 
K
E
 
I
L
 
Y
M
 
Y
K
 
E
A
 
E
G
 
G
Q
 
K
I
 
I
T
 
T
K
 
K
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
M
F
 
M
V
 
G
A
 
W
Q
|
Q
P
 
A
L
 
E
N
 
G
C
x
A
S
 
A
P
 
P
I
 
I
D
 
V
A
 
K
S
 
G
F
 
Y
Q
 
P
A
 
-
G
 
-
V
 
I
D
 
K
T
 
N
P
 
P
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
H
 
-
K
 
Q
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
T
G
x
A
T
 
I
A
 
K
I
 
I
K
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
Y
R
 
S
L
 
W
R
 
K
E
 
S
I
 
A
I
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
Q
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
K
T
 
I
I
 
D
A
 
A
L
 
V
T
 
S
E
 
D
E
 
S
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
Y
A
 
A
L
 
Y
R
 
K
R
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
S
-
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
P
T
 
A
C
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
S
A
 
V
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
I
T
 
K
L
 
L
S
 
V
S
 
R
A
 
E
G
 
G
S
 
F
I
 
F
K
 
K
A
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
V
T
 
V
V
 
T
V
 
C
I
 
T
V
 
L
T
|
T
G
|
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
D
T
 
T
V
 
A
A
 
I
D
 
K
V
 
V
V
 
C
Q
 
E

1uimA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8, orthorhombic crystal form (see paper)
33% identity, 99% coverage: 3:309/309 of query aligns to 26:332/350 of 1uimA

query
sites
1uimA
E
 
E
G
 
G
C
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
A
R
 
R
P
 
K
W
 
K
G
 
G
D
 
-
L
 
I
R
 
R
P
 
L
F
 
Y
F
 
A
K
 
K
L
 
Y
E
 
E
W
 
G
F
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
L
M
 
A
L
 
V
S
 
S
F
 
K
L
 
A
R
 
V
Q
 
E
I
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
A
E
 
C
D
 
A
S
 
S
S
x
T
G
 
G
N
|
N
G
 
T
G
 
A
S
 
A
S
 
S
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
L
V
 
A
K
 
I
I
 
V
L
 
V
A
 
L
P
 
P
A
 
A
-
 
G
Y
 
Y
T
 
V
S
 
A
P
 
L
A
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
R
 
L
A
 
V
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
I
Q
 
V
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
G
 
G
P
 
N
R
 
F
E
 
D
E
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
L
S
 
T
G
 
Q
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
Y
 
E
A
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
L
S
 
V
H
 
N
N
 
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
H
F
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
V
W
 
V
E
 
D
D
 
E
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
D
V
 
A
P
 
P
D
 
H
N
 
Y
I
 
H
I
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
V
G
|
G
A
x
N
G
x
A
S
x
G
S
x
N
L
 
I
L
 
T
G
 
A
C
 
H
A
 
W
F
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
E
 
A
L
 
Y
M
 
H
K
 
A
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
I
 
A
T
 
K
K
 
R
L
 
L
P
|
P
R
 
R
L
 
M
F
 
L
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
N
 
-
C
 
-
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
S
x
G
F
 
F
Q
|
Q
A
 
A
G
 
A
V
 
G
D
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
V
-
 
L
-
 
G
R
 
R
E
 
P
V
 
V
H
 
E
K
 
R
-
 
P
-
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
T
G
x
A
T
 
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
Q
E
 
G
I
 
A
I
 
V
A
 
R
A
 
A
L
 
K
R
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
V
T
 
I
I
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
F
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
R
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
F
 
F
A
 
C
E
|
E
P
 
P
T
 
A
C
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
F
T
 
K
L
 
L
S
 
L
S
 
R
A
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
L
K
 
E
A
 
P
G
 
E
E
 
S
S
 
T
T
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
T
V
 
L
T
|
T
G
|
G
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
E
D
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
E

3aexA Catalytic intermediate analogue of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
33% identity, 99% coverage: 3:309/309 of query aligns to 26:332/351 of 3aexA

query
sites
3aexA
E
 
E
G
 
G
C
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
E
Q
 
A
R
 
R
P
 
K
W
 
K
G
 
G
D
 
-
L
 
I
R
 
R
P
 
L
F
 
Y
F
 
A
K
 
K
L
 
Y
E
 
E
W
 
G
F
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
L
M
 
A
L
 
V
S
 
S
F
 
K
L
 
A
R
 
V
Q
 
E
I
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
A
E
 
C
D
 
A
S
|
S
S
x
T
G
 
G
N
|
N
G
x
T
G
 
A
S
 
A
S
 
S
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
L
V
 
A
K
 
I
I
 
V
L
 
V
A
 
L
P
 
P
A
 
A
-
 
G
Y
 
Y
T
 
V
S
 
A
P
 
L
A
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
R
 
L
A
 
V
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
I
Q
 
V
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
G
 
G
P
 
N
R
 
F
E
 
D
E
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
L
S
 
T
G
 
Q
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
Y
 
E
A
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
L
S
 
V
H
x
N
N
x
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
H
F
x
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
V
W
 
V
E
 
D
D
 
E
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
D
V
 
A
P
 
P
D
 
H
N
 
Y
I
 
H
I
 
A
I
 
L
P
 
P
V
|
V
G
|
G
A
x
N
G
x
A
S
x
G
S
x
N
L
 
I
L
 
T
G
 
A
C
 
H
A
 
W
F
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
E
 
A
L
 
Y
M
 
H
K
 
A
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
I
 
A
T
 
K
K
 
R
L
 
L
P
|
P
R
 
R
L
 
M
F
 
L
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
N
 
-
C
 
-
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
S
x
G
F
 
F
Q
|
Q
A
 
A
G
 
A
V
 
G
D
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
V
-
 
L
-
 
G
R
 
R
E
 
P
V
 
V
H
 
E
K
 
R
-
 
P
-
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
T
G
x
A
T
x
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
Q
E
 
G
I
 
A
I
 
V
A
 
R
A
 
A
L
 
K
R
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
V
T
 
I
I
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
F
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
R
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
F
 
F
A
 
C
E
|
E
P
 
P
T
 
A
C
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
F
T
 
K
L
 
L
S
 
L
S
 
R
A
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
L
K
 
E
A
 
P
G
 
E
E
 
S
S
 
T
T
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
T
V
 
L
T
|
T
G
 
G
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
E
D
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
E

1v7cA Crystal structure of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 in complex with a substrate analogue (see paper)
33% identity, 99% coverage: 3:309/309 of query aligns to 26:332/351 of 1v7cA

query
sites
1v7cA
E
 
E
G
 
G
C
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
E
Q
 
A
R
 
R
P
 
K
W
 
K
G
 
G
D
 
-
L
 
I
R
 
R
P
 
L
F
 
Y
F
 
A
K
 
K
L
 
Y
E
 
E
W
 
G
F
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
L
M
 
A
L
 
V
S
 
S
F
 
K
L
 
A
R
 
V
Q
 
E
I
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
A
E
 
C
D
 
A
S
|
S
S
x
T
G
 
G
N
|
N
G
x
T
G
 
A
S
 
A
S
 
S
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
L
V
 
A
K
 
I
I
 
V
L
 
V
A
 
L
P
 
P
A
 
A
-
 
G
Y
 
Y
T
 
V
S
 
A
P
 
L
A
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
R
 
L
A
 
V
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
I
Q
 
V
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
G
 
G
P
 
N
R
x
F
E
 
D
E
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
L
S
 
T
G
 
Q
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
Y
 
E
A
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
L
S
 
V
H
x
N
N
x
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
H
F
x
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
V
W
 
V
E
 
D
D
 
E
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
D
V
 
A
P
 
P
D
 
H
N
 
Y
I
 
H
I
 
A
I
 
L
P
 
P
V
|
V
G
|
G
A
x
N
G
x
A
S
x
G
S
x
N
L
 
I
L
 
T
G
 
A
C
 
H
A
 
W
F
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
E
 
A
L
 
Y
M
 
H
K
 
A
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
I
 
A
T
 
K
K
 
R
L
 
L
P
|
P
R
 
R
L
 
M
F
 
L
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
N
 
-
C
 
-
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
S
x
G
F
 
F
Q
|
Q
A
 
A
G
 
A
V
 
G
D
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
V
-
 
L
-
 
G
R
 
R
E
 
P
V
 
V
H
 
E
K
 
R
-
 
P
-
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
T
G
x
A
T
x
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
Q
E
 
G
I
 
A
I
 
V
A
 
R
A
 
A
L
 
K
R
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
V
T
 
I
I
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
F
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
R
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
F
 
F
A
 
C
E
|
E
P
 
P
T
 
A
C
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
F
T
 
K
L
 
L
S
 
L
S
 
R
A
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
L
K
 
E
A
 
P
G
 
E
E
 
S
S
 
T
T
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
T
V
 
L
T
|
T
G
 
G
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
E
D
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
E

3aeyA Apo form of threonine synthase from thermus thermophilus hb8 (see paper)
33% identity, 99% coverage: 3:309/309 of query aligns to 25:331/350 of 3aeyA

query
sites
3aeyA
E
 
E
G
 
G
C
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
P
-
 
L
-
 
K
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
E
-
 
A
R
 
R
P
 
K
W
 
K
G
 
G
D
 
-
L
 
I
R
 
R
P
 
L
F
 
Y
F
 
A
K
 
K
L
 
Y
E
 
E
W
 
G
F
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
L
M
 
A
L
 
V
S
 
S
F
 
K
L
 
A
R
 
V
Q
 
E
I
 
G
G
 
G
V
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
A
E
 
C
D
 
A
S
 
S
S
x
T
G
|
G
N
|
N
G
x
T
G
 
A
S
 
A
S
 
S
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
L
V
 
A
K
 
I
I
 
V
L
 
V
A
 
L
P
 
P
A
 
A
-
 
G
Y
 
Y
T
 
V
S
 
A
P
 
L
A
 
G
K
 
K
I
 
V
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
R
 
L
A
 
V
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
R
V
 
I
Q
 
V
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
G
 
G
P
 
N
R
 
F
E
 
D
E
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
D
A
 
A
I
 
L
R
 
R
Q
 
L
S
 
T
G
 
Q
Q
 
K
T
 
L
F
 
T
Y
 
E
A
 
A
-
 
F
-
 
P
-
 
V
-
 
A
-
 
L
S
 
V
H
 
N
N
x
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
H
F
x
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
L
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
V
W
 
V
E
 
D
D
 
E
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
D
V
 
A
P
 
P
D
 
H
N
 
Y
I
 
H
I
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
A
x
N
G
 
A
S
 
G
S
 
N
L
 
I
L
 
T
G
 
A
C
 
H
A
 
W
F
 
M
G
 
G
F
 
Y
R
 
K
E
 
A
L
 
Y
M
 
H
K
 
A
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
I
 
A
T
 
K
K
 
R
L
 
L
P
|
P
R
 
R
L
 
M
F
 
L
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
N
 
-
C
 
-
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
-
A
 
-
S
x
G
F
 
F
Q
|
Q
A
 
A
G
 
A
V
 
G
D
 
A
T
 
A
P
 
P
L
 
L
T
 
V
-
 
L
-
 
G
R
|
R
E
 
P
V
|
V
H
x
E
K
x
R
-
 
P
-
 
E
T
 
T
I
 
L
A
 
A
E
 
T
G
x
A
T
 
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
Q
E
 
G
I
 
A
I
 
V
A
 
R
A
 
A
L
 
K
R
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
G
G
 
G
G
 
V
T
 
I
I
 
E
A
 
A
L
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
F
A
 
A
L
 
Y
R
 
R
R
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
I
F
 
F
A
 
C
E
 
E
P
 
P
T
 
A
C
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
A
A
 
M
A
 
A
A
 
G
L
 
V
D
 
F
T
 
K
L
 
L
S
 
L
S
 
R
A
 
E
G
 
G
S
 
R
I
 
L
K
 
E
A
 
P
G
 
E
E
 
S
S
 
T
T
 
V
V
 
V
V
 
L
I
 
T
V
 
L
T
|
T
G
 
G
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
A
T
 
T
V
 
A
A
 
E
D
 
R
V
 
V
V
 
A
Q
 
E

6cgqA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:307/309 of query aligns to 21:318/339 of 6cgqA

query
sites
6cgqA
M
 
L
G
 
H
E
 
E
G
 
G
C
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
H
R
 
L
P
 
P
W
 
K
G
 
L
D
 
S
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
L
 
I
R
 
E
P
 
L
F
 
H
F
 
V
K
 
K
L
 
T
E
 
E
W
 
G
F
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
V
V
 
M
M
 
A
L
 
V
S
 
A
F
 
K
L
 
A
R
 
K
Q
 
E
I
 
E
G
 
G
V
 
N
D
 
D
A
 
T
V
 
I
L
 
M
E
 
C
D
 
A
S
 
S
S
x
T
G
 
G
N
|
N
G
 
T
G
 
S
S
 
A
S
 
A
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
N
V
 
M
R
 
K
V
 
C
K
 
I
I
 
V
L
 
I
A
 
I
P
 
-
A
 
-
Y
 
-
T
 
-
S
 
-
P
 
P
A
 
N
K
 
K
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
R
 
V
A
 
M
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
Q
 
I
L
 
A
V
 
I
E
 
D
G
 
G
P
 
N
R
 
F
E
 
D
E
 
D
S
 
A
E
 
-
A
 
L
E
 
K
A
 
I
I
 
V
R
 
R
Q
 
S
S
 
I
G
 
C
Q
 
E
T
 
K
-
 
S
-
 
P
F
 
I
Y
 
A
A
 
L
S
 
V
H
 
N
N
 
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
V
W
 
C
E
 
E
D
 
Q
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
E
V
 
A
P
 
P
D
 
D
N
 
V
I
 
L
I
 
A
I
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
A
x
N
G
x
A
S
x
G
S
x
N
L
 
I
L
 
S
G
 
A
C
 
Y
A
 
W
F
 
K
G
 
G
F
 
F
R
 
K
E
 
E
L
 
Y
M
 
H
K
 
E
A
 
K
G
 
N
Q
 
G
I
 
-
T
 
T
K
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
M
F
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
N
 
-
C
 
-
S
 
R
P
 
G
I
 
F
D
x
E
A
 
A
S
 
E
F
 
G
Q
x
S
A
 
A
G
 
A
V
 
I
D
 
V
T
 
R
P
 
N
L
 
E
T
 
V
R
 
I
E
 
E
V
 
N
H
 
P
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
T
G
x
A
T
 
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
D
E
 
K
I
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
N
G
 
G
G
 
K
T
 
I
I
 
D
A
 
E
L
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
H
A
 
A
L
 
Y
R
 
Q
R
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
-
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
|
E
P
 
P
-
 
G
T
 
S
C
 
C
A
 
A
S
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
G
A
 
V
L
 
L
D
 
K
T
 
Q
L
 
V
S
 
K
S
 
S
A
 
-
G
 
G
S
 
E
I
 
I
K
 
P
A
 
K
G
 
G
E
 
S
S
 
K
T
 
V
V
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
L
T
|
T
G
|
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
N
T
 
T
V
 
A
A
 
V
D
 
D
V
 
I

6nmxA Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and appa (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:307/309 of query aligns to 25:328/350 of 6nmxA

query
sites
6nmxA
M
 
L
G
 
H
E
 
E
G
 
G
C
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
H
R
 
L
P
 
P
W
 
K
G
 
L
D
 
S
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
L
 
I
R
 
E
P
 
L
F
 
H
F
 
V
K
 
K
L
 
T
E
 
E
W
 
G
F
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
V
V
 
M
M
 
A
L
 
V
S
 
A
F
 
K
L
 
A
R
 
K
Q
 
E
I
 
E
G
 
G
V
 
N
D
 
D
A
 
T
V
 
I
L
 
M
E
 
C
D
 
A
S
|
S
S
x
T
G
 
G
N
|
N
G
x
T
G
 
S
S
 
A
S
 
A
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
N
V
 
M
R
 
K
V
 
C
K
 
I
I
 
V
L
 
I
A
 
I
P
 
P
-
 
N
A
 
G
Y
 
K
T
 
I
S
 
A
P
 
F
A
 
G
K
 
K
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
R
 
V
A
 
M
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
Q
 
I
L
 
A
V
 
I
E
 
D
G
 
G
P
 
N
R
x
F
E
 
D
E
 
D
S
 
A
E
 
-
A
 
L
E
 
K
A
 
I
I
 
V
R
 
R
Q
 
S
S
 
I
G
 
C
Q
 
E
T
 
K
-
 
S
-
 
P
F
 
I
Y
 
A
A
 
L
S
 
V
H
x
N
N
x
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
x
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
V
W
 
C
E
 
E
D
 
Q
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
E
V
 
A
P
 
P
D
 
D
N
 
V
I
 
L
I
 
A
I
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
A
x
N
G
x
A
S
x
G
S
x
N
L
 
I
L
 
S
G
 
A
C
 
Y
A
 
W
F
 
K
G
 
G
F
 
F
R
 
K
E
 
E
L
 
Y
M
 
H
K
 
E
A
 
K
G
 
N
Q
 
G
I
 
-
T
 
T
K
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
M
F
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
N
 
-
C
 
-
S
 
R
P
 
G
I
 
F
D
x
E
A
 
A
S
 
E
F
 
G
Q
x
S
A
 
A
G
 
A
V
 
I
D
 
V
T
 
R
P
 
N
L
 
E
T
 
V
R
 
I
E
 
E
V
 
N
H
 
P
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
T
G
x
A
T
x
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
D
E
 
K
I
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
N
G
 
G
G
 
K
T
 
I
I
 
D
A
 
E
L
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
H
A
 
A
L
 
Y
R
 
Q
R
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
-
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
|
E
P
 
P
-
 
G
T
 
S
C
 
C
A
 
A
S
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
G
A
 
V
L
 
L
D
 
K
T
 
Q
L
 
V
S
 
K
S
 
S
A
 
-
G
 
G
S
 
E
I
 
I
K
 
P
A
 
K
G
 
G
E
 
S
S
 
K
T
 
V
V
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
L
T
|
T
G
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
N
T
 
T
V
 
A
A
 
V
D
 
D
V
 
I

6cgqB Threonine synthase from bacillus subtilis atcc 6633 with plp and plp- ala (see paper)
30% identity, 99% coverage: 1:307/309 of query aligns to 23:326/345 of 6cgqB

query
sites
6cgqB
M
 
L
G
 
H
E
 
E
G
 
G
C
 
N
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
H
R
 
L
P
 
P
W
 
K
G
 
L
D
 
S
-
 
E
-
 
Q
-
 
L
-
 
G
L
 
I
R
 
E
P
 
L
F
 
H
F
 
V
K
 
K
L
 
T
E
 
E
W
 
G
F
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
V
V
 
M
M
 
A
L
 
V
S
 
A
F
 
K
L
 
A
R
 
K
Q
 
E
I
 
E
G
 
G
V
 
N
D
 
D
A
 
T
V
 
I
L
 
M
E
 
C
D
 
A
S
|
S
S
x
T
G
 
G
N
|
N
G
x
T
G
 
S
S
 
A
S
 
A
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
N
V
 
M
R
 
K
V
 
C
K
 
I
I
 
V
L
 
I
A
 
I
P
 
P
-
 
N
A
 
G
Y
 
K
T
 
I
S
 
A
P
 
F
A
 
G
K
 
K
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
R
 
V
A
 
M
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
E
V
 
I
Q
 
I
L
 
A
V
 
I
E
 
D
G
 
G
P
 
N
R
 
F
E
 
D
E
 
D
S
 
A
E
 
-
A
 
L
E
 
K
A
 
I
I
 
V
R
 
R
Q
 
S
S
 
I
G
 
C
Q
 
E
T
 
K
-
 
S
-
 
P
F
 
I
Y
 
A
A
 
L
S
 
V
H
x
N
N
x
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
x
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
V
W
 
C
E
 
E
D
 
Q
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
E
V
 
A
P
 
P
D
 
D
N
 
V
I
 
L
I
 
A
I
 
I
P
 
P
V
|
V
G
|
G
A
x
N
G
x
A
S
 
G
S
x
N
L
 
I
L
 
S
G
 
A
C
 
Y
A
 
W
F
 
K
G
 
G
F
 
F
R
 
K
E
 
E
L
 
Y
M
 
H
K
 
E
A
 
K
G
 
N
Q
 
G
I
 
-
T
 
T
K
 
S
L
 
L
P
 
P
R
 
K
L
 
M
F
 
-
V
 
-
A
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
N
 
-
C
 
-
S
 
R
P
 
G
I
 
F
D
x
E
A
 
A
S
 
E
F
 
G
Q
x
S
A
 
A
G
 
A
V
 
I
D
 
V
T
 
R
P
 
N
L
 
E
T
 
V
R
 
I
E
 
E
V
 
N
H
 
P
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
T
G
x
A
T
x
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
N
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
D
E
 
K
I
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
A
R
 
E
E
 
E
S
 
S
G
 
N
G
 
G
G
 
K
T
 
I
I
 
D
A
 
E
L
 
V
T
 
T
E
 
D
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
H
A
 
A
L
 
Y
R
 
Q
R
 
L
L
 
I
A
 
A
R
 
R
-
 
E
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
F
 
F
A
 
A
E
|
E
P
 
P
-
 
G
T
 
S
C
 
C
A
 
A
S
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
G
A
 
V
L
 
L
D
 
K
T
 
Q
L
 
V
S
 
K
S
 
S
A
 
-
G
 
G
S
 
E
I
 
I
K
 
P
A
 
K
G
 
G
E
 
S
S
 
K
T
 
V
V
 
V
V
 
A
I
 
V
V
 
L
T
|
T
G
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
N
T
 
T
V
 
A
A
 
V
D
 
D
V
 
I

A0R220 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see paper)
32% identity, 97% coverage: 3:303/309 of query aligns to 36:335/360 of A0R220

query
sites
A0R220
E
 
E
G
 
G
C
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
L
V
 
I
Q
 
H
-
 
A
R
 
K
P
 
R
W
 
I
G
 
S
D
 
E
L
 
L
R
 
T
-
 
G
-
 
C
-
 
T
P
 
V
F
 
H
F
 
L
K
 
K
L
 
V
E
 
E
W
 
G
F
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
A
L
 
V
S
 
T
F
 
E
L
 
S
R
 
L
Q
 
A
I
 
R
G
 
G
V
 
Q
D
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
C
D
 
A
S
 
S
S
 
T
G
 
G
N
 
N
G
 
T
G
 
S
S
 
A
S
 
S
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
C
K
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
I
P
 
P
-
 
Q
A
 
G
Y
 
K
T
 
I
S
 
A
P
 
M
A
 
G
K
 
K
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
R
 
V
A
 
M
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
I
Q
 
I
L
 
Q
V
 
V
E
 
D
G
 
G
P
 
N
R
 
F
E
 
D
E
 
D
S
 
C
E
 
L
A
 
E
E
 
L
A
 
A
I
 
R
R
x
K
Q
 
L
S
 
T
G
 
A
Q
 
D
-
 
F
-
 
P
T
 
T
F
 
I
Y
 
A
A
 
L
S
 
V
H
 
N
N
 
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
Y
F
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
I
W
 
V
E
 
D
D
 
A
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
T
V
 
A
P
 
P
D
 
D
N
 
V
I
 
H
I
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
N
G
 
A
S
 
G
S
 
N
L
 
I
L
 
T
G
 
A
C
 
Y
A
 
W
F
 
K
G
 
G
F
 
Y
R
 
S
E
 
E
L
 
Y
M
 
H
K
 
R
A
 
D
G
 
G
Q
 
V
I
 
S
T
 
D
K
 
R
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
M
F
 
L
V
 
G
A
 
T
Q
 
Q
P
 
A
L
 
A
N
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
D
 
V
A
 
T
S
 
G
F
 
-
Q
 
-
A
 
A
G
 
P
V
 
V
D
 
K
T
 
D
P
 
P
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
H
 
-
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
T
G
 
A
T
 
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
S
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
N
E
 
S
I
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
S
 
S
G
 
D
G
 
G
G
 
R
T
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
A
T
 
T
E
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
R
 
H
R
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
-
 
T
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
F
 
F
A
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
A
C
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
L
T
 
K
L
 
S
S
 
V
S
 
E
A
 
D
G
 
G
S
 
W
I
 
V
K
 
K
A
 
R
G
 
G
E
 
S
S
 
T
T
 
V
V
 
V
V
 
C
I
 
T
V
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
D
T
 
T

P9WG59 Threonine synthase; TS; EC 4.2.3.1 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see 2 papers)
31% identity, 92% coverage: 19:303/309 of query aligns to 56:335/360 of P9WG59

query
sites
P9WG59
F
 
H
F
 
L
K
 
K
L
 
V
E
 
E
W
 
G
F
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
M
M
 
A
L
 
V
S
 
T
F
 
D
L
 
A
R
 
L
Q
 
A
I
 
H
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
C
D
 
A
S
 
S
S
 
T
G
 
G
N
|
N
G
 
T
G
 
S
S
 
A
S
 
S
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
C
K
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
I
P
 
P
-
 
Q
A
 
G
Y
 
K
T
 
I
S
 
A
P
 
M
A
 
G
K
 
K
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
R
 
V
A
 
M
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
I
Q
 
I
L
 
Q
V
 
I
E
 
D
G
 
G
P
 
N
R
 
F
E
 
D
E
 
D
S
 
C
E
 
L
A
 
E
E
 
L
A
 
A
I
 
R
R
x
K
Q
 
M
S
 
A
G
 
A
Q
 
D
-
 
F
-
 
P
T
 
T
F
 
I
Y
 
S
A
 
L
S
 
V
H
 
N
N
 
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
V
F
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
I
W
 
V
E
 
D
D
 
V
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
T
V
 
A
P
 
P
D
 
D
N
 
V
I
 
H
I
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
V
G
|
G
A
x
N
G
x
A
S
x
G
S
x
N
L
 
I
L
 
T
G
 
A
C
 
Y
A
 
W
F
 
K
G
 
G
F
 
Y
R
 
T
E
 
E
L
 
Y
M
 
H
K
 
Q
A
 
L
G
 
G
Q
 
L
I
 
I
T
 
D
K
 
K
L
 
L
P
 
P
R
 
R
L
 
M
F
 
L
V
 
G
A
 
T
Q
 
Q
P
 
A
L
 
A
N
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
D
 
V
A
 
-
S
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
L
D
 
G
T
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
S
R
 
H
E
 
P
V
 
-
H
 
-
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
T
G
 
A
T
 
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
S
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
T
E
 
S
I
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
S
 
S
G
 
K
G
 
G
G
 
R
T
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
A
T
 
S
E
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
R
 
H
R
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
-
 
V
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
F
 
F
A
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
A
C
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
L
T
 
K
L
 
A
S
 
I
S
 
D
A
 
D
G
 
G
S
 
W
I
 
V
K
 
A
A
 
R
G
 
G
E
 
S
S
 
T
T
 
V
V
 
V
V
 
C
I
 
T
V
 
V
T
|
T
G
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
D
T
 
T

2d1fA Structure of mycobacterium tuberculosis threonine synthase (see paper)
31% identity, 92% coverage: 19:303/309 of query aligns to 47:326/349 of 2d1fA

query
sites
2d1fA
F
 
H
F
 
L
K
 
K
L
 
V
E
 
E
W
 
G
F
 
L
N
 
N
P
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
R
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
M
M
 
A
L
 
V
S
 
T
F
 
D
L
 
A
R
 
L
Q
 
A
I
 
H
G
 
G
V
 
Q
D
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
L
E
 
C
D
 
A
S
 
S
S
x
T
G
 
G
N
|
N
G
 
T
G
 
S
S
 
A
S
 
S
M
 
A
A
 
A
G
 
A
F
 
Y
G
 
A
A
 
A
A
 
R
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
T
V
 
C
K
 
A
I
 
V
L
 
L
A
 
I
P
 
P
-
 
Q
A
 
G
Y
 
K
T
 
I
S
 
A
P
 
M
A
 
G
K
 
K
I
 
L
A
 
A
Q
 
Q
V
 
A
R
 
V
A
 
M
Y
 
H
G
 
G
A
 
A
E
 
K
V
 
I
Q
 
I
L
 
Q
V
 
I
E
 
D
G
 
G
P
 
N
R
 
F
E
 
D
E
 
D
S
 
C
E
 
L
A
 
E
E
 
L
A
 
A
I
 
R
R
 
K
Q
 
M
S
 
A
G
 
A
Q
 
D
-
 
F
-
 
P
T
 
T
F
 
I
Y
 
S
A
 
L
S
 
V
H
 
N
N
 
S
W
 
V
Q
 
N
P
 
P
F
 
V
F
 
R
L
 
I
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
F
E
 
E
L
 
I
W
 
V
E
 
D
D
 
V
F
 
L
G
 
G
F
 
-
K
 
T
V
 
A
P
 
P
D
 
D
N
 
V
I
 
H
I
 
A
I
 
L
P
 
P
V
|
V
G
|
G
A
x
N
G
x
A
S
x
G
S
x
N
L
 
I
L
 
T
G
 
A
C
 
Y
A
 
W
F
 
K
G
 
G
F
 
Y
R
 
T
E
 
E
L
 
Y
M
 
H
K
 
Q
A
 
L
G
 
G
Q
 
L
I
 
I
T
x
D
K
 
K
L
 
L
P
 
P
R
|
R
L
 
M
F
x
L
V
 
G
A
 
T
Q
 
Q
P
 
A
L
 
A
N
 
G
C
 
A
S
 
A
P
 
P
I
 
L
D
 
V
A
 
-
S
 
-
F
 
-
Q
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
L
D
 
G
T
 
E
P
 
P
L
 
V
T
 
S
R
 
H
E
 
P
V
 
-
H
 
-
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
T
G
x
A
T
 
I
A
 
R
I
 
I
K
 
G
H
 
S
P
 
P
L
 
A
R
 
S
L
 
W
R
 
T
E
 
S
I
 
A
I
 
V
A
 
E
A
 
A
L
 
Q
R
 
Q
E
 
Q
S
 
S
G
 
K
G
 
G
G
 
R
T
 
F
I
 
L
A
 
A
L
 
A
T
 
S
E
 
D
E
 
E
E
 
E
I
 
I
I
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
Y
R
 
H
R
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
R
-
 
V
Q
 
E
G
 
G
L
 
V
F
 
F
A
 
V
E
 
E
P
 
P
T
 
A
C
 
S
A
 
A
S
 
A
A
 
S
A
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
 
L
T
 
K
L
 
A
S
 
I
S
 
D
A
 
D
G
 
G
S
 
W
I
 
V
K
 
A
A
 
R
G
 
G
E
 
S
S
 
T
T
 
V
V
 
V
V
 
C
I
 
T
V
 
V
T
|
T
G
 
G
T
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
A
 
P
S
 
D
T
 
T

2c2bA Crystallographic structure of arabidopsis thaliana threonine synthase complexed with pyridoxal phosphate and s-adenosylmethionine (see paper)
28% identity, 90% coverage: 28:306/309 of query aligns to 124:409/444 of 2c2bA

query
sites
2c2bA
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
D
R
 
L
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
L
 
V
S
 
S
F
 
Q
L
 
V
R
 
N
Q
 
R
I
 
L
G
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
P
V
 
V
D
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
G
E
 
C
D
 
A
S
 
S
S
 
T
G
 
G
N
x
D
G
 
T
G
 
S
S
 
A
S
 
A
M
 
L
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
G
 
C
A
 
A
A
 
S
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
P
V
 
S
K
 
I
I
 
V
L
 
F
A
 
L
P
 
P
A
 
A
Y
 
N
-
 
K
T
 
I
S
 
S
P
 
M
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
V
 
P
R
 
I
A
 
A
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
F
V
 
V
Q
 
L
L
 
S
V
 
I
E
 
D
G
 
T
P
 
D
R
 
F
E
 
D
E
 
G
S
 
C
E
 
-
A
 
M
E
 
K
A
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
E
-
 
I
-
 
T
S
 
A
G
 
E
Q
 
L
T
 
P
F
 
I
Y
 
Y
A
 
L
S
 
A
H
 
N
N
 
S
W
 
L
Q
 
N
P
 
S
F
 
L
F
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
I
E
 
E
L
 
I
W
 
L
E
 
Q
D
x
Q
F
|
F
G
 
D
F
 
W
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
N
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
P
V
x
G
G
|
G
A
x
N
G
x
L
S
x
G
S
x
N
L
 
I
L
 
Y
G
 
A
C
 
F
A
 
Y
F
 
K
G
 
G
F
 
F
R
 
K
E
 
M
L
 
C
M
 
Q
K
 
E
A
 
L
G
 
G
Q
 
L
I
 
V
T
 
D
K
 
R
L
 
I
P
 
P
R
 
R
L
 
M
F
 
V
V
 
C
A
 
A
Q
 
Q
P
 
A
L
 
A
N
 
N
C
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
L
D
 
Y
A
 
L
S
 
H
F
 
Y
Q
 
K
A
 
S
G
 
G
V
 
W
D
 
K
T
 
D
P
 
F
L
 
K
T
 
P
R
 
M
E
 
T
V
 
A
H
 
S
K
 
T
T
 
T
I
 
F
A
 
A
E
 
S
G
x
A
T
 
I
A
 
Q
I
 
I
K
 
G
H
 
D
P
 
P
L
 
V
R
 
S
L
 
I
R
 
D
E
 
R
I
 
A
I
 
V
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
K
S
 
C
G
 
N
G
 
G
G
 
I
T
 
V
I
 
E
A
 
E
L
 
A
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
A
R
 
Q
L
 
A
A
 
D
R
 
S
Q
 
T
G
 
G
L
 
M
F
 
F
A
 
I
E
 
C
P
 
P
T
x
H
C
 
T
A
 
G
S
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
F
T
 
K
L
 
L
S
 
R
S
 
N
A
 
Q
G
 
G
S
 
V
I
 
I
K
 
A
A
 
P
G
 
T
E
 
D
S
 
R
T
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
S
T
|
T
G
 
A
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
F
A
 
T
S
 
Q
T
 
S
V
 
K
A
 
I
D
 
D

Sites not aligning to the query:

Q9S7B5 Threonine synthase 1, chloroplastic; Protein METHIONINE OVER-ACCUMULATOR 2; EC 4.2.3.1 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
28% identity, 90% coverage: 28:306/309 of query aligns to 199:484/526 of Q9S7B5

query
sites
Q9S7B5
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
D
R
x
L
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
L
 
V
S
 
S
F
 
Q
L
 
V
R
 
N
Q
 
R
I
 
L
G
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
P
V
 
V
D
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
G
E
 
C
D
 
A
S
 
S
S
 
T
G
 
G
N
 
D
G
 
T
G
 
S
S
 
A
S
 
A
M
 
L
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
G
 
C
A
 
A
A
 
S
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
P
V
 
S
K
 
I
I
 
V
L
 
F
A
 
L
P
 
P
A
 
A
Y
 
N
T
 
K
-
 
I
S
 
S
P
 
M
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
V
 
P
R
 
I
A
 
A
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
F
V
 
V
Q
 
L
L
 
S
V
 
I
E
 
D
G
 
T
P
 
D
R
 
F
E
 
D
E
 
G
S
 
C
E
 
-
A
 
M
E
 
K
A
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
E
-
 
I
-
 
T
S
 
A
G
 
E
Q
 
L
T
 
P
F
 
I
Y
 
Y
A
 
L
S
 
A
H
 
N
N
 
S
W
 
L
Q
 
N
P
 
S
F
 
L
F
 
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
I
E
 
E
L
 
I
W
 
L
E
 
Q
D
 
Q
F
 
F
G
 
D
F
 
W
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
N
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
P
V
 
G
G
 
G
A
 
N
G
 
L
S
 
G
S
 
N
L
 
I
L
 
Y
G
 
A
C
 
F
A
 
Y
F
 
K
G
 
G
F
 
F
R
 
K
E
 
M
L
 
C
M
 
Q
K
 
E
A
 
L
G
 
G
Q
 
L
I
 
V
T
 
D
K
 
R
L
 
I
P
 
P
R
 
R
L
 
M
F
 
V
V
 
C
A
 
A
Q
 
Q
P
 
A
L
 
A
N
 
N
C
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
L
D
 
Y
A
 
L
S
 
H
F
 
Y
Q
 
K
A
 
S
G
 
G
V
 
W
D
 
K
T
 
D
P
 
F
L
 
K
T
 
P
R
 
M
E
 
T
V
 
A
H
 
S
K
 
T
T
 
T
I
 
F
A
 
A
E
 
S
G
 
A
T
 
I
A
 
Q
I
 
I
K
 
G
H
 
D
P
 
P
L
 
V
R
 
S
L
 
I
R
 
D
E
 
R
I
 
A
I
 
V
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
K
S
 
C
G
 
N
G
 
G
G
 
I
T
 
V
I
 
E
A
 
E
L
 
A
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
A
R
 
Q
L
 
A
A
 
D
R
 
S
Q
 
T
G
 
G
L
 
M
F
 
F
A
 
I
E
 
C
P
 
P
T
 
H
C
 
T
A
 
G
S
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
F
T
 
K
L
 
L
S
 
R
S
 
N
A
 
Q
G
 
G
S
 
V
I
 
I
K
 
A
A
 
P
G
 
T
E
 
D
S
 
R
T
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
S
T
 
T
G
 
A
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
F
A
 
T
S
 
Q
T
 
S
V
 
K
A
 
I
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2c2gA Crystal structure of threonine synthase from arabidopsis thaliana in complex with its cofactor pyridoxal phosphate (see paper)
26% identity, 90% coverage: 28:306/309 of query aligns to 142:411/448 of 2c2gA

query
sites
2c2gA
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
D
R
 
L
G
 
G
S
 
M
S
 
T
V
 
V
M
 
L
L
 
V
S
 
S
F
 
Q
L
 
V
R
 
N
Q
 
R
I
 
L
G
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
K
-
 
R
-
 
P
V
 
V
D
 
V
A
 
G
V
 
V
L
 
G
E
 
C
D
 
A
S
|
S
S
 
T
G
 
G
N
 
D
G
x
T
G
 
S
S
 
A
S
 
A
M
 
L
A
 
S
G
 
A
F
 
Y
G
 
C
A
 
A
A
 
S
G
 
A
G
 
G
V
 
I
R
 
P
V
 
S
K
 
I
I
 
V
L
 
F
A
 
L
P
 
P
A
 
A
Y
 
N
T
 
K
-
 
I
S
 
S
P
 
M
A
 
A
K
 
Q
I
 
L
A
 
V
Q
 
Q
V
 
P
R
 
I
A
 
A
Y
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
F
V
 
V
Q
 
L
L
 
S
V
 
I
E
 
D
G
 
T
P
 
D
R
 
F
E
 
D
E
 
G
S
 
C
E
 
-
A
 
M
E
 
K
A
 
L
I
 
I
R
 
R
Q
 
E
-
 
I
-
 
T
S
 
A
G
 
E
Q
 
L
T
 
P
F
 
I
Y
 
Y
A
 
L
S
 
A
H
 
N
N
x
S
W
 
L
Q
 
N
P
 
S
F
 
L
F
x
R
L
 
L
E
 
E
G
 
G
T
 
Q
K
 
K
S
 
T
L
 
A
A
 
A
Y
 
I
E
 
E
L
 
I
W
 
L
E
 
Q
D
 
Q
F
 
F
G
 
D
F
 
W
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
D
 
D
N
 
W
I
 
V
I
 
I
I
 
V
P
 
P
V
 
G
G
 
G
A
x
N
G
 
L
S
 
G
S
 
N
L
 
I
L
 
Y
G
 
A
C
 
F
A
 
Y
F
 
K
G
 
G
F
 
F
R
 
K
E
 
M
L
 
C
M
 
Q
K
 
E
A
 
L
G
 
G
Q
 
L
I
 
V
T
 
D
K
 
R
L
 
I
P
 
P
R
 
R
L
 
M
F
 
V
V
 
C
A
 
A
Q
 
Q
P
 
A
L
 
A
N
 
N
C
 
A
S
 
N
P
 
P
I
 
L
D
 
Y
A
 
L
S
 
H
F
 
Y
Q
 
K
A
 
S
G
 
G
V
 
W
D
 
K
T
 
D
P
 
-
L
 
-
T
 
-
R
 
-
E
 
-
V
 
-
H
 
-
K
 
-
T
 
-
I
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
-
K
 
F
H
 
K
P
 
P
L
 
V
R
 
S
L
 
I
R
 
D
E
 
R
I
 
A
I
 
V
A
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
K
E
 
K
S
 
C
G
 
N
G
 
G
G
 
I
T
 
V
I
 
E
A
 
E
L
 
A
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
E
I
 
L
I
 
M
A
 
D
A
 
A
L
 
M
R
 
A
R
 
Q
L
 
A
A
 
D
R
 
S
Q
 
T
G
 
G
L
 
M
F
 
F
A
 
I
E
 
C
P
 
P
T
 
H
C
 
T
A
 
G
S
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
T
A
 
A
L
 
L
D
 
F
T
 
K
L
 
L
S
 
R
S
 
N
A
 
Q
G
 
G
S
 
V
I
 
I
K
 
A
A
 
P
G
 
T
E
 
D
S
 
R
T
 
T
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
S
T
 
T
G
 
A
T
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
F
A
 
T
S
 
Q
T
 
S
V
 
K
A
 
I
D
 
D

6zspAAA serine racemase bound to atp and malonate. (see paper)
29% identity, 83% coverage: 19:274/309 of query aligns to 40:283/320 of 6zspAAA

query
sites
6zspAAA
F
 
F
F
 
F
K
 
K
L
 
C
E
 
E
W
 
L
F
 
F
N
 
Q
P
x
K
T
|
T
G
 
G
S
 
S
F
 
F
K
|
K
D
 
I
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
-
V
 
-
M
 
-
L
 
L
S
 
N
F
 
A
L
 
V
R
 
R
Q
 
S
I
 
L
G
 
K
V
 
P
D
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
T
D
 
H
S
|
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
G
x
H
G
 
G
S
x
Q
S
 
A
M
 
L
A
 
T
G
 
Y
F
 
A
G
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
P
V
 
A
K
 
Y
I
 
I
L
 
V
A
 
V
P
 
P
A
 
Q
Y
 
T
T
 
A
S
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
I
 
K
A
 
L
Q
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
Q
 
V
L
 
Y
V
 
C
E
 
E
G
 
P
P
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
S
S
x
R
E
 
E
A
 
N
E
 
V
A
 
A
I
 
K
R
 
R
Q
 
V
S
 
T
G
 
E
Q
 
E
T
 
T
-
 
E
-
 
G
F
 
I
Y
 
M
A
 
V
S
 
H
H
 
P
N
 
N
W
 
Q
Q
 
E
P
 
P
F
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
G
S
 
T
L
 
I
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
L
 
V
W
 
L
E
 
N
D
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
V
D
 
D
N
 
A
I
 
L
I
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
G
 
G
A
 
G
G
 
G
S
 
G
S
 
M
L
 
L
L
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
F
 
I
G
 
T
F
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
L
M
 
K
K
 
P
A
 
S
G
 
V
Q
 
K
I
 
V
T
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
Y
V
 
A
A
 
A
Q
x
E
P
 
P
L
 
S
N
 
N
C
x
A
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
D
A
x
D
S
 
C
F
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
G
 
K
V
 
L
D
 
K
T
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
M
R
 
P
E
 
N
V
 
L
H
 
Y
-
 
P
-
 
P
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
D
G
|
G
T
 
V
A
 
K
I
x
S
K
 
S
H
 
I
P
 
G
L
 
L
R
 
N
L
 
T
R
 
W
E
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
D
S
 
L
G
 
V
G
 
D
G
 
D
T
 
I
I
 
F
A
 
T
L
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
L
 
T
R
 
Q
R
 
L
L
 
V
-
 
W
A
x
E
R
|
R
Q
 
M
G
x
K
L
 
L
F
 
L
A
 
I
E
 
E
P
 
P
T
 
T
C
 
A
A
 
G
S
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7nbgAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z52314092, XChem fragment screen (see paper)
29% identity, 83% coverage: 19:274/309 of query aligns to 40:290/322 of 7nbgAAA

query
sites
7nbgAAA
F
 
F
F
 
F
K
 
K
L
 
C
E
 
E
W
 
L
F
 
F
N
 
Q
P
 
K
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
I
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
-
V
 
-
M
 
-
L
 
L
S
 
N
F
 
A
L
 
V
R
 
R
Q
 
S
I
 
L
G
 
V
V
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
K
-
 
P
-
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
T
D
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
G
 
H
G
|
G
S
x
Q
S
 
A
M
 
L
A
 
T
G
 
Y
F
 
A
G
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
P
V
 
A
K
 
Y
I
|
I
L
 
V
A
 
V
P
 
P
A
 
Q
Y
 
T
T
 
A
S
 
P
P
 
D
A
 
C
K
|
K
I
 
K
A
 
L
Q
 
A
V
x
I
R
 
Q
A
 
A
Y
|
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
Q
 
V
L
 
Y
V
 
C
E
 
E
G
 
P
P
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
S
S
 
R
E
 
E
A
 
N
E
 
V
A
 
A
I
 
K
R
 
R
Q
 
V
S
 
T
G
 
E
Q
 
E
T
 
T
-
 
E
-
 
G
F
 
I
Y
 
M
A
 
V
S
 
H
H
 
P
N
 
N
W
 
Q
Q
 
E
P
 
P
F
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
G
S
 
T
L
 
I
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
L
 
V
W
 
L
E
 
N
D
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
V
D
 
D
N
 
A
I
 
L
I
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
A
x
G
G
|
G
S
x
G
S
x
M
L
 
L
L
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
F
 
I
G
 
T
F
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
L
M
 
K
K
 
P
A
 
S
G
 
V
Q
 
K
I
 
V
T
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
Y
V
 
A
A
 
A
Q
x
E
P
 
P
L
 
S
N
 
N
C
x
A
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
D
A
x
D
S
 
C
F
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
G
 
K
V
 
L
D
 
K
T
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
M
R
 
P
E
 
N
V
 
L
H
 
Y
-
 
P
-
 
P
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
D
G
|
G
T
x
V
A
 
K
I
 
S
K
 
S
H
 
I
P
 
G
L
 
L
R
 
N
L
 
T
R
 
W
E
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
D
S
 
L
G
 
V
G
 
D
G
 
D
T
 
I
I
 
F
A
 
T
L
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
L
 
T
R
 
Q
R
 
L
L
 
V
-
 
W
A
 
E
R
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
F
 
L
A
 
I
E
 
E
P
 
P
T
|
T
C
 
A
A
 
G
S
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7nbfAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z126932614, XChem fragment screen (see paper)
29% identity, 83% coverage: 19:274/309 of query aligns to 40:290/323 of 7nbfAAA

query
sites
7nbfAAA
F
 
F
F
 
F
K
 
K
L
 
C
E
 
E
W
 
L
F
|
F
N
 
Q
P
 
K
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
I
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
-
V
 
-
M
 
-
L
 
L
S
 
N
F
 
A
L
 
V
R
 
R
Q
 
S
I
 
L
G
 
V
V
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
K
-
 
P
-
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
T
D
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
G
 
H
G
 
G
S
 
Q
S
 
A
M
 
L
A
 
T
G
 
Y
F
 
A
G
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
P
V
 
A
K
 
Y
I
 
I
L
 
V
A
 
V
P
 
P
A
 
Q
Y
 
T
T
 
A
S
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
I
 
K
A
 
L
Q
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
Q
 
V
L
 
Y
V
 
C
E
 
E
G
 
P
P
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
S
S
 
R
E
 
E
A
 
N
E
 
V
A
 
A
I
 
K
R
 
R
Q
 
V
S
 
T
G
 
E
Q
 
E
T
 
T
-
 
E
-
 
G
F
 
I
Y
 
M
A
 
V
S
 
H
H
 
P
N
 
N
W
 
Q
Q
 
E
P
 
P
F
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
G
S
 
T
L
 
I
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
L
 
V
W
 
L
E
 
N
D
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
V
D
 
D
N
 
A
I
 
L
I
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
A
x
G
G
|
G
S
x
G
S
x
M
L
 
L
L
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
F
 
I
G
 
T
F
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
L
M
 
K
K
 
P
A
 
S
G
 
V
Q
 
K
I
 
V
T
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
Y
V
 
A
A
 
A
Q
x
E
P
 
P
L
 
S
N
 
N
C
x
A
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
D
A
x
D
S
 
C
F
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
G
 
K
V
 
L
D
 
K
T
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
M
R
 
P
E
 
N
V
 
L
H
 
Y
-
 
P
-
 
P
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
D
G
|
G
T
x
V
A
 
K
I
 
S
K
 
S
H
 
I
P
 
G
L
 
L
R
x
N
L
 
T
R
 
W
E
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
D
S
 
L
G
 
V
G
 
D
G
 
D
T
 
I
I
 
F
A
 
T
L
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
L
 
T
R
 
Q
R
 
L
L
 
V
-
 
W
A
 
E
R
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
F
 
L
A
 
I
E
 
E
P
 
P
T
|
T
C
 
A
A
 
G
S
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7nbdAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z235449082, XChem fragment screen (see paper)
29% identity, 83% coverage: 19:274/309 of query aligns to 40:290/323 of 7nbdAAA

query
sites
7nbdAAA
F
 
F
F
 
F
K
 
K
L
 
C
E
 
E
W
 
L
F
 
F
N
 
Q
P
 
K
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
I
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
-
V
 
-
M
 
-
L
 
L
S
 
N
F
 
A
L
 
V
R
 
R
Q
 
S
I
 
L
G
 
V
V
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
K
-
 
P
-
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
T
D
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
G
 
H
G
 
G
S
 
Q
S
 
A
M
 
L
A
 
T
G
 
Y
F
 
A
G
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
P
V
 
A
K
 
Y
I
 
I
L
 
V
A
 
V
P
 
P
A
 
Q
Y
 
T
T
 
A
S
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
I
 
K
A
 
L
Q
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
Q
 
V
L
 
Y
V
 
C
E
 
E
G
 
P
P
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
S
S
 
R
E
 
E
A
 
N
E
 
V
A
 
A
I
 
K
R
 
R
Q
 
V
S
 
T
G
 
E
Q
 
E
T
 
T
-
 
E
-
 
G
F
 
I
Y
 
M
A
 
V
S
 
H
H
 
P
N
 
N
W
 
Q
Q
 
E
P
 
P
F
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
G
S
 
T
L
 
I
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
L
 
V
W
 
L
E
 
N
D
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
V
D
 
D
N
 
A
I
 
L
I
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
A
x
G
G
|
G
S
x
G
S
x
M
L
 
L
L
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
F
 
I
G
 
T
F
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
L
M
 
K
K
 
P
A
 
S
G
 
V
Q
 
K
I
 
V
T
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
Y
V
 
A
A
 
A
Q
x
E
P
 
P
L
 
S
N
 
N
C
x
A
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
D
A
x
D
S
 
C
F
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
G
 
K
V
 
L
D
 
K
T
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
M
R
 
P
E
 
N
V
 
L
H
 
Y
-
 
P
-
 
P
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
D
G
|
G
T
x
V
A
 
K
I
 
S
K
 
S
H
 
I
P
 
G
L
 
L
R
x
N
L
 
T
R
 
W
E
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
D
S
 
L
G
 
V
G
 
D
G
 
D
T
 
I
I
 
F
A
 
T
L
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
L
 
T
R
 
Q
R
 
L
L
 
V
-
x
W
A
 
E
R
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
F
x
L
A
 
I
E
|
E
P
 
P
T
|
T
C
 
A
A
 
G
S
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7nbcCCC structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z2856434779, XChem fragment screen (see paper)
29% identity, 83% coverage: 19:274/309 of query aligns to 40:290/323 of 7nbcCCC

query
sites
7nbcCCC
F
 
F
F
 
F
K
 
K
L
 
C
E
 
E
W
 
L
F
 
F
N
 
Q
P
 
K
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
I
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
-
V
 
-
M
 
-
L
 
L
S
 
N
F
 
A
L
 
V
R
 
R
Q
 
S
I
 
L
G
 
V
V
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
K
-
 
P
-
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
E
x
T
D
x
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
G
x
H
G
 
G
S
 
Q
S
 
A
M
 
L
A
 
T
G
 
Y
F
 
A
G
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
P
V
 
A
K
 
Y
I
 
I
L
 
V
A
 
V
P
 
P
A
 
Q
Y
 
T
T
 
A
S
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
I
 
K
A
 
L
Q
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
Q
 
V
L
 
Y
V
 
C
E
 
E
G
 
P
P
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
S
S
 
R
E
 
E
A
 
N
E
 
V
A
 
A
I
 
K
R
 
R
Q
 
V
S
 
T
G
 
E
Q
 
E
T
 
T
-
 
E
-
 
G
F
 
I
Y
 
M
A
x
V
S
x
H
H
x
P
N
 
N
W
 
Q
Q
 
E
P
 
P
F
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
G
S
 
T
L
 
I
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
L
 
V
W
 
L
E
 
N
D
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
V
D
 
D
N
 
A
I
 
L
I
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
A
x
G
G
|
G
S
x
G
S
x
M
L
 
L
L
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
F
 
I
G
 
T
F
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
L
M
 
K
K
 
P
A
 
S
G
 
V
Q
 
K
I
 
V
T
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
Y
V
 
A
A
 
A
Q
x
E
P
 
P
L
 
S
N
 
N
C
x
A
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
D
A
x
D
S
 
C
F
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
G
 
K
V
 
L
D
 
K
T
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
M
R
 
P
E
 
N
V
 
L
H
 
Y
-
 
P
-
 
P
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
D
G
|
G
T
x
V
A
 
K
I
 
S
K
 
S
H
 
I
P
 
G
L
 
L
R
 
N
L
 
T
R
 
W
E
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
D
S
 
L
G
 
V
G
 
D
G
 
D
T
 
I
I
 
F
A
 
T
L
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
L
 
T
R
 
Q
R
 
L
L
 
V
-
 
W
A
 
E
R
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
F
 
L
A
 
I
E
 
E
P
 
P
T
|
T
C
 
A
A
 
G
S
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7nbcAAA structure of human serine racemase in complex with DSiP fragment Z2856434779, XChem fragment screen (see paper)
29% identity, 83% coverage: 19:274/309 of query aligns to 40:290/323 of 7nbcAAA

query
sites
7nbcAAA
F
 
F
F
 
F
K
 
K
L
 
C
E
 
E
W
 
L
F
 
F
N
 
Q
P
 
K
T
 
T
G
 
G
S
 
S
F
|
F
K
|
K
D
 
I
R
 
R
G
 
G
S
 
A
S
 
-
V
 
-
M
 
-
L
 
L
S
 
N
F
 
A
L
 
V
R
 
R
Q
 
S
I
 
L
G
 
V
V
 
P
D
 
D
-
 
A
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
K
-
 
P
-
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
V
E
 
T
D
 
H
S
 
S
S
|
S
G
 
G
N
|
N
G
 
H
G
 
G
S
 
Q
S
 
A
M
 
L
A
 
T
G
 
Y
F
 
A
G
 
A
A
 
K
A
 
L
G
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
P
V
 
A
K
 
Y
I
 
I
L
 
V
A
 
V
P
 
P
A
 
Q
Y
 
T
T
 
A
S
 
P
P
 
D
A
 
C
K
 
K
I
 
K
A
 
L
Q
 
A
V
 
I
R
 
Q
A
 
A
Y
 
Y
G
 
G
A
 
A
E
 
S
V
 
I
Q
 
V
L
 
Y
V
 
C
E
 
E
G
 
P
P
 
S
R
 
D
E
 
E
E
 
S
S
 
R
E
 
E
A
 
N
E
 
V
A
 
A
I
 
K
R
 
R
Q
 
V
S
 
T
G
 
E
Q
 
E
T
 
T
-
 
E
-
 
G
F
 
I
Y
 
M
A
 
V
S
 
H
H
 
P
N
 
N
W
 
Q
Q
 
E
P
 
P
F
 
A
F
 
V
L
 
I
E
 
A
G
 
G
T
 
Q
K
 
G
S
 
T
L
 
I
A
 
A
Y
 
L
E
 
E
L
 
V
W
 
L
E
 
N
D
 
-
F
 
-
G
 
-
F
 
-
K
 
Q
V
 
V
P
 
P
-
 
L
-
 
V
D
 
D
N
 
A
I
 
L
I
 
V
I
 
V
P
 
P
V
 
V
G
|
G
A
x
G
G
|
G
S
x
G
S
x
M
L
 
L
L
 
A
G
 
G
C
 
I
A
 
A
F
 
I
G
 
T
F
 
V
R
 
K
E
 
A
L
 
L
M
 
K
K
 
P
A
 
S
G
 
V
Q
 
K
I
 
V
T
 
-
K
 
-
L
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
F
 
Y
V
 
A
A
 
A
Q
x
E
P
 
P
L
 
S
N
 
N
C
x
A
S
 
-
P
 
-
I
 
-
D
 
D
A
x
D
S
 
C
F
 
Y
Q
 
Q
A
 
S
G
 
K
V
 
L
D
 
K
T
 
G
P
 
K
L
 
L
T
 
M
R
 
P
E
 
N
V
 
L
H
 
Y
-
 
P
-
 
P
K
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
E
 
D
G
|
G
T
x
V
A
 
K
I
 
S
K
 
S
H
 
I
P
 
G
L
 
L
R
x
N
L
 
T
R
 
W
E
 
P
I
 
I
I
 
I
A
 
-
A
 
-
L
 
-
R
 
R
E
 
D
S
 
L
G
 
V
G
 
D
G
 
D
T
 
I
I
 
F
A
 
T
L
 
V
T
 
T
E
 
E
E
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
K
A
 
C
A
 
A
L
 
T
R
 
Q
R
 
L
L
 
V
-
 
W
A
 
E
R
 
R
Q
 
M
G
 
K
L
 
L
F
 
L
A
 
I
E
 
E
P
 
P
T
|
T
C
 
A
A
 
G
S
 
V
A
 
G
A
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_085984982.1 NCBI__GCF_000022085.1:WP_085984982.1
MGEGCTPLVQRPWGDLRPFFKLEWFNPTGSFKDRGSSVMLSFLRQIGVDAVLEDSSGNGG
SSMAGFGAAGGVRVKILAPAYTSPAKIAQVRAYGAEVQLVEGPREESEAEAIRQSGQTFY
ASHNWQPFFLEGTKSLAYELWEDFGFKVPDNIIIPVGAGSSLLGCAFGFRELMKAGQITK
LPRLFVAQPLNCSPIDASFQAGVDTPLTREVHKTIAEGTAIKHPLRLREIIAALRESGGG
TIALTEEEIIAALRRLARQGLFAEPTCASAAAALDTLSSAGSIKAGESTVVIVTGTGLKA
ASTVADVVQ

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory