SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_086509457.1 NCBI__GCF_002151265.1:WP_086509457.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
37% identity, 98% coverage: 5:251/251 of query aligns to 1:247/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
M
 
M
D
 
Y
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
N
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
N
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
A
M
 
T
A
 
A
L
 
K
A
 
R
F
 
F
A
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
Y
V
 
V
T
 
F
I
 
I
I
 
V
G
 
G
R
|
R
R
|
R
R
 
R
E
 
K
P
 
E
L
 
L
E
 
E
T
 
Q
T
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
E
-
 
I
H
 
G
P
 
R
A
 
N
I
 
V
A
 
T
C
 
A
E
 
V
I
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
K
E
 
L
A
 
E
D
 
D
M
 
L
V
 
D
A
 
R
L
 
L
F
 
Y
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
R
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
E
 
S
V
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
A
 
A
A
 
I
E
 
E
S
 
Q
A
 
K
P
 
T
L
 
L
A
 
E
R
 
E
T
 
I
G
 
T
L
 
P
D
 
E
Q
 
H
W
 
Y
Q
 
D
R
 
R
M
 
T
L
 
F
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
G
 
G
V
 
L
F
 
I
L
 
F
T
 
T
L
 
V
R
 
Q
E
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
P
R
 
L
V
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
S
L
 
V
I
 
I
A
 
L
V
 
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
L
G
 
G
Y
 
L
A
 
Q
Y
 
A
V
x
H
A
 
D
P
 
T
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
A
V
 
V
V
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
W
A
 
T
Q
 
T
E
 
E
V
 
L
A
 
K
E
 
G
R
 
R
D
 
S
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
S
P
 
P
G
|
G
F
 
A
T
x
I
E
 
D
T
|
T
P
 
P
L
x
I
L
 
I
E
 
E
A
 
N
S
 
Q
V
 
V
A
 
S
T
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
T
 
T
G
x
Q
Q
 
E
S
 
E
P
 
A
A
 
D
Q
 
E
A
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
K
L
 
F
Q
 
A
S
 
A
T
 
A
N
 
T
P
 
P
S
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
G
Q
 
R
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
V
L
 
L
W
 
F
L
 
L
C
 
A
G
 
S
P
 
D
H
 
D
S
 
S
G
 
S
A
 
Y
I
 
V
H
 
A
G
 
G
Q
 
I
A
 
E
I
 
L
S
 
F
I
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
L
T
 
T

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
37% identity, 98% coverage: 5:251/251 of query aligns to 1:247/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
M
 
M
D
 
Y
R
 
R
L
 
L
I
 
L
G
 
N
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
G
x
N
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
A
M
 
T
A
 
A
L
 
K
A
 
R
F
 
F
A
 
V
E
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
Y
V
 
V
T
 
F
I
 
I
I
 
V
G
 
G
R
|
R
R
|
R
R
 
R
E
 
K
P
 
E
L
 
L
E
 
E
T
 
Q
T
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
E
-
 
I
H
 
G
P
 
R
A
 
N
I
 
V
A
 
T
C
 
A
E
 
V
I
 
K
A
 
A
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
K
E
 
L
A
 
E
D
 
D
M
 
L
V
 
D
A
 
R
L
 
L
F
 
Y
-
 
A
-
 
I
-
 
V
-
 
R
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
G
 
G
E
 
S
V
 
I
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
F
A
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
A
 
A
A
 
V
E
 
E
S
 
Q
A
 
K
P
 
T
L
 
L
A
 
E
R
 
E
T
 
I
G
 
T
L
 
P
D
 
E
Q
 
H
W
 
Y
Q
 
D
R
 
R
M
 
T
L
 
F
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
G
 
G
V
 
L
F
 
I
L
 
F
T
 
T
L
 
V
R
 
Q
E
 
K
G
 
A
L
 
L
K
 
P
R
 
L
V
 
L
R
 
R
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
S
L
 
V
I
 
I
A
 
L
V
x
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
V
K
 
L
G
 
G
Y
 
L
A
 
Q
Y
 
A
V
x
H
A
 
D
P
 
T
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
A
V
 
V
V
 
R
G
 
S
L
 
L
V
 
A
R
 
R
A
 
T
L
 
W
A
 
T
Q
 
T
E
 
E
V
 
L
A
 
K
E
 
G
R
 
R
D
 
S
I
 
I
T
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
S
P
|
P
G
|
G
F
x
A
T
x
I
E
 
D
T
|
T
P
 
P
L
x
S
L
|
L
E
 
E
A
 
N
S
 
N
V
 
V
A
 
S
T
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
T
 
T
G
 
Q
Q
 
E
S
 
E
P
 
A
A
 
D
Q
 
E
A
 
L
R
 
R
A
 
A
H
 
K
L
 
A
Q
 
A
S
 
A
T
 
A
N
 
T
P
 
P
S
 
L
G
 
G
R
 
R
L
 
V
I
 
G
Q
 
R
P
 
P
A
 
E
E
 
E
V
 
L
T
 
A
A
 
A
T
 
A
A
 
V
L
 
L
W
 
F
L
 
L
C
 
A
G
 
S
P
 
D
H
 
D
S
 
S
G
 
S
A
 
Y
I
 
V
H
 
A
G
 
G
Q
 
I
A
 
E
I
 
L
S
 
F
I
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
x
L
T
 
T

2rh4A Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
37% identity, 94% coverage: 14:249/251 of query aligns to 6:253/257 of 2rh4A

query
sites
2rh4A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
E
M
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
D
 
R
V
 
V
T
 
F
I
 
V
I
 
C
G
x
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
E
 
E
P
 
G
L
 
L
E
 
R
T
 
T
T
 
T
-
 
L
-
 
K
A
 
E
C
 
L
R
 
R
H
 
E
P
 
A
A
 
G
I
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
R
A
 
T
C
|
C
E
x
D
I
x
V
A
 
R
D
 
S
V
 
V
T
 
P
R
 
E
-
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
L
M
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
V
F
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
E
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
R
A
 
P
E
 
G
S
 
G
A
 
G
P
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
E
T
 
L
G
 
A
L
 
D
D
 
E
Q
 
L
W
 
W
Q
 
L
R
 
D
M
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
R
 
K
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
K
R
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
E
R
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
|
T
A
 
G
G
 
G
L
 
K
K
x
Q
G
 
G
Y
x
V
A
 
V
Y
 
H
V
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Q
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
T
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
|
F
T
x
V
E
 
E
T
|
T
P
 
P
L
 
-
L
x
M
E
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
R
T
 
E
I
 
H
V
x
Y
A
 
S
K
 
D
T
 
I
G
 
W
Q
 
E
-
 
V
S
 
S
P
 
T
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
F
A
 
D
H
 
R
L
 
I
Q
 
T
S
 
A
T
 
R
N
 
V
P
 
P
S
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
P
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
E
T
 
M
A
 
V
L
 
A
W
 
Y
L
 
L
C
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
I
 
V
H
 
T
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
S
 
N
I
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1xr3A Actinorhodin polyketide ketoreductase with NADP and the inhibitor isoniazid bound (see paper)
37% identity, 94% coverage: 14:249/251 of query aligns to 5:252/256 of 1xr3A

query
sites
1xr3A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
E
M
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
D
 
R
V
 
V
T
 
F
I
 
V
I
 
C
G
x
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
E
 
E
P
 
G
L
 
L
E
 
R
T
 
T
T
 
T
-
 
L
-
 
K
A
 
E
C
 
L
R
 
R
H
 
E
P
 
A
A
 
G
I
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
R
A
 
T
C
|
C
E
x
D
I
x
V
A
 
R
D
 
S
V
 
V
T
 
P
R
 
E
-
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
L
M
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
V
F
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
E
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
R
A
 
P
E
 
G
S
 
G
A
 
G
P
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
E
T
 
L
G
 
A
L
 
D
D
 
E
Q
 
L
W
 
W
Q
 
L
R
 
D
M
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
R
 
K
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
K
R
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
E
R
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
|
T
A
x
G
G
 
G
L
 
K
K
 
Q
G
 
G
Y
x
V
A
 
V
Y
 
H
V
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Q
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
T
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
 
P
G
|
G
F
 
F
T
x
V
E
 
E
T
|
T
P
|
P
L
 
-
L
 
M
E
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
R
T
 
E
I
 
H
V
x
Y
A
 
S
K
 
D
T
 
I
G
 
W
Q
 
E
-
 
V
S
 
S
P
 
T
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
F
A
 
D
H
 
R
L
 
I
Q
 
T
S
 
A
T
 
R
N
 
V
P
 
P
S
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
P
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
E
T
 
M
A
 
V
L
 
A
W
 
Y
L
 
L
C
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
I
 
V
H
 
T
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
S
 
N
I
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G

P16544 Putative ketoacyl reductase; EC 1.3.1.- from Streptomyces coelicolor (strain ATCC BAA-471 / A3(2) / M145) (see 2 papers)
37% identity, 94% coverage: 14:249/251 of query aligns to 10:257/261 of P16544

query
sites
P16544
V
 
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
G
x
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
|
G
A
x
L
D
x
E
M
x
I
A
|
A
L
x
R
A
x
R
F
x
L
A
x
G
E
x
K
A
x
E
G
|
G
A
x
L
D
x
R
V
|
V
T
x
F
I
x
V
I
x
C
G
x
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
E
 
E
P
 
G
L
 
L
E
 
R
T
 
T
T
 
T
-
 
L
-
 
K
A
 
E
C
 
L
R
 
R
H
 
E
P
 
A
A
 
G
I
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
R
A
 
T
C
 
C
E
x
D
I
 
V
A
 
R
D
 
S
V
 
V
T
 
P
R
 
E
-
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
L
M
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
V
F
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
E
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
R
A
 
P
E
 
G
S
 
G
A
 
G
P
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
E
T
 
L
G
 
A
L
 
D
D
 
E
Q
 
L
W
 
W
Q
 
L
R
 
D
M
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
R
 
K
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
K
R
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
E
R
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
N
V
 
I
A
 
A
S
 
S
T
 
T
A
 
G
G
 
G
L
 
K
K
 
Q
G
 
G
Y
 
V
A
 
V
Y
 
H
V
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
 
Y
C
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Q
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
T
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
F
T
 
V
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
-
L
 
M
E
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
R
T
 
E
I
 
H
V
 
Y
A
 
S
K
 
D
T
 
I
G
 
W
Q
 
E
-
 
V
S
 
S
P
 
T
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
F
A
 
D
H
 
R
L
 
I
Q
 
T
S
 
A
T
 
R
N
 
V
P
 
P
S
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
P
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
E
T
 
M
A
 
V
L
 
A
W
 
Y
L
 
L
C
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
I
 
V
H
 
T
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
S
 
N
I
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G

1w4zA Structure of actinorhodin polyketide (actiii) reductase (see paper)
37% identity, 94% coverage: 14:249/251 of query aligns to 8:255/259 of 1w4zA

query
sites
1w4zA
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
E
M
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
D
 
R
V
 
V
T
 
F
I
 
V
I
 
C
G
 
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
E
 
E
P
 
G
L
 
L
E
 
R
T
 
T
T
 
T
-
 
L
-
 
K
A
 
E
C
 
L
R
 
R
H
 
E
P
 
A
A
 
G
I
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
R
A
 
T
C
 
C
E
x
D
I
x
V
A
 
R
D
 
S
V
 
V
T
 
P
R
 
E
-
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
L
M
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
V
F
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
E
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
R
A
 
P
E
 
G
S
 
G
A
 
G
P
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
E
T
 
L
G
 
A
L
 
D
D
 
E
Q
 
L
W
 
W
Q
 
L
R
 
D
M
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
R
 
K
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
K
R
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
E
R
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
T
A
 
G
G
 
G
L
 
K
K
 
Q
G
 
G
Y
 
V
A
 
V
Y
 
H
V
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Q
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
T
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
 
F
T
x
V
E
 
E
T
|
T
P
 
P
L
 
-
L
 
M
E
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
R
T
 
E
I
 
H
V
x
Y
A
 
S
K
 
D
T
 
I
G
 
W
Q
 
E
-
 
V
S
 
S
P
 
T
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
F
A
 
D
H
 
R
L
 
I
Q
 
T
S
 
A
T
 
R
N
 
V
P
 
P
S
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
P
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
E
T
 
M
A
 
V
L
 
A
W
 
Y
L
 
L
C
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
I
 
V
H
 
T
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
S
 
N
I
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G

2rh4B Actinorhodin ketoreductase, actkr, with NADPH and inhibitor emodin (see paper)
37% identity, 94% coverage: 14:249/251 of query aligns to 17:264/268 of 2rh4B

query
sites
2rh4B
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
E
M
 
I
A
 
A
L
 
R
A
 
R
F
 
L
A
 
G
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
L
D
 
R
V
 
V
T
 
F
I
 
V
I
 
C
G
x
A
R
|
R
R
x
G
R
 
E
E
 
E
P
 
G
L
 
L
E
 
R
T
 
T
T
 
T
-
 
L
-
 
K
A
 
E
C
 
L
R
 
R
H
 
E
P
 
A
A
 
G
I
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
G
-
 
R
A
 
T
C
|
C
E
x
D
I
x
V
A
 
R
D
 
S
V
 
V
T
 
P
R
 
E
-
 
I
E
 
E
A
 
A
D
 
L
M
 
V
V
 
A
A
 
A
L
 
V
F
 
V
E
 
E
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
E
 
P
V
 
V
D
 
D
I
 
V
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
A
 
R
A
 
P
E
 
G
S
 
G
A
 
G
P
 
A
L
 
T
A
 
A
R
 
E
T
 
L
G
 
A
L
 
D
D
 
E
Q
 
L
W
 
W
Q
 
L
R
 
D
M
 
V
L
 
V
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
R
T
 
V
L
 
T
R
 
K
E
 
Q
G
 
V
L
 
L
K
 
K
R
 
A
-
 
G
-
 
G
-
 
M
-
 
L
V
 
E
R
 
R
D
 
G
G
 
T
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
V
A
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
T
A
 
G
G
 
G
L
 
K
K
 
Q
G
 
G
Y
 
V
A
 
V
Y
 
H
V
 
A
A
 
A
P
 
P
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
G
Q
 
L
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
T
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
C
P
 
P
G
|
G
F
 
F
T
x
V
E
 
E
T
|
T
P
 
P
L
 
-
L
x
M
E
 
A
A
 
A
S
 
S
V
 
V
A
 
R
T
 
E
I
 
H
V
x
Y
A
 
S
K
 
D
T
 
I
G
 
W
Q
 
E
-
 
V
S
 
S
P
 
T
A
 
E
Q
 
E
A
 
A
R
 
F
A
 
D
H
 
R
L
 
I
Q
 
T
S
 
A
T
 
R
N
 
V
P
 
P
S
 
I
G
 
G
R
 
R
L
 
Y
I
 
V
Q
 
Q
P
 
P
A
 
S
E
 
E
V
 
V
T
 
A
A
 
E
T
 
M
A
 
V
L
 
A
W
 
Y
L
 
L
C
 
I
G
 
G
P
 
P
H
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
A
I
 
V
H
 
T
G
 
A
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
S
 
N
I
 
V
S
 
C
G
 
G
G
 
G

5yssB Crystal structure of aminocaproic acid cyclase in complex with NAD (+) (see paper)
35% identity, 97% coverage: 7:249/251 of query aligns to 1:251/255 of 5yssB

query
sites
5yssB
R
 
N
L
 
L
I
 
T
G
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
G
M
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
V
F
 
L
A
 
A
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
T
V
 
L
T
 
I
I
 
L
I
 
N
G
|
G
R
x
F
R
 
G
R
 
D
E
 
V
P
 
D
L
 
A
E
 
A
T
 
K
T
 
D
A
 
A
C
 
V
-
 
A
-
 
Q
-
 
Y
-
 
G
R
 
K
H
 
T
P
 
P
A
 
G
I
 
Y
-
 
H
A
 
G
C
 
A
E
 
D
I
x
L
A
 
S
D
 
D
V
 
E
T
 
A
R
 
Q
E
 
I
A
 
A
D
 
D
M
 
M
V
 
M
A
 
R
L
 
Y
F
 
A
E
 
E
-
 
S
R
 
E
L
 
F
G
 
G
E
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
x
I
A
 
Q
E
 
H
S
 
V
A
 
S
P
 
P
L
 
I
A
 
E
R
 
T
T
 
F
G
 
P
L
 
V
D
 
D
Q
 
K
W
 
W
Q
 
N
R
 
A
M
 
I
L
 
I
D
 
A
V
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
T
L
 
T
R
 
R
E
 
L
G
 
A
L
 
L
K
 
P
-
 
G
-
 
M
R
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
N
G
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
 
I
A
|
A
S
 
S
T
 
V
A
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
A
Y
 
S
A
 
K
Y
 
E
V
 
K
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
I
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
Q
R
 
T
D
 
E
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
 
W
T
x
V
E
 
L
T
|
T
P
 
P
L
 
L
L
 
V
E
 
Q
A
 
Q
S
 
Q
V
 
I
A
 
D
T
 
K
I
 
R
V
 
I
A
 
A
K
 
E
T
 
G
G
 
A
Q
 
E
S
 
P
P
 
E
A
 
A
Q
 
A
A
 
R
R
 
D
A
 
A
H
 
L
L
 
L
Q
 
A
S
 
E
T
 
K
N
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
R
R
 
E
L
 
F
I
 
V
Q
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
L
T
 
G
A
 
N
T
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
S
P
 
D
H
 
G
S
 
A
G
 
A
A
 
Q
I
 
V
H
 
R
G
 
G
Q
 
V
A
 
A
I
 
W
S
 
N
I
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
G

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
35% identity, 97% coverage: 8:251/251 of query aligns to 2:258/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
L
 
L
I
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
T
A
 
E
F
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
V
I
 
I
I
 
N
G
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
E
R
 
R
R
 
E
R
 
R
E
 
S
P
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
S
T
 
K
-
 
F
A
 
G
C
 
V
R
 
K
H
 
A
P
 
Y
A
 
Y
I
 
L
A
 
N
C
 
A
E
x
D
I
x
L
A
 
S
D
 
D
V
 
A
T
 
Q
R
 
A
E
 
T
A
 
R
D
 
D
M
 
F
V
 
I
A
 
A
-
 
K
L
 
A
F
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
I
A
x
Q
E
 
H
S
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
E
R
 
E
T
 
F
G
 
P
L
 
V
D
 
D
Q
 
K
W
 
W
Q
 
N
R
 
A
M
 
I
L
 
I
D
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
G
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
G
L
 
T
R
 
A
E
 
A
G
 
A
L
 
L
K
 
P
-
 
I
-
 
M
R
 
Q
V
 
K
R
 
Q
D
 
G
G
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
T
 
A
A
x
H
G
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
A
Y
 
S
A
 
V
Y
 
N
V
x
K
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
V
 
N
A
 
A
E
 
G
R
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
x
W
T
x
V
E
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
x
V
E
 
E
A
 
K
S
x
Q
V
 
I
A
 
E
T
 
A
I
|
I
V
 
S
A
 
Q
K
 
Q
T
 
K
G
 
G
-
 
I
Q
 
D
S
 
I
P
 
E
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
H
 
L
L
 
L
Q
 
A
S
 
E
T
 
K
N
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
Q
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
L
T
 
G
A
 
G
T
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
S
G
 
S
P
 
A
H
 
A
S
 
A
G
 
D
A
 
Q
I
 
M
H
 
T
G
 
G
Q
 
T
A
 
T
I
 
L
S
 
S
I
 
L
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
W
T
 
T

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
35% identity, 97% coverage: 8:251/251 of query aligns to 2:258/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
L
 
L
I
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
T
A
 
E
F
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
V
I
 
I
I
 
N
G
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
E
R
 
R
R
 
E
R
 
R
E
 
S
P
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
S
T
 
K
-
 
F
A
 
G
C
 
V
R
 
K
H
 
A
P
 
Y
A
 
Y
I
 
L
A
 
N
C
x
A
E
x
D
I
x
L
A
 
S
D
 
D
V
 
A
T
 
Q
R
 
A
E
 
T
A
 
R
D
 
D
M
 
F
V
 
I
A
 
A
-
 
K
L
 
A
F
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
x
Q
E
 
H
S
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
E
R
 
E
T
 
F
G
 
P
L
 
V
D
 
D
Q
 
K
W
 
W
Q
 
N
R
 
A
M
 
I
L
 
I
D
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
G
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
G
L
 
T
R
 
A
E
 
A
G
 
A
L
 
L
K
 
P
-
 
I
-
 
M
R
 
Q
V
 
K
R
 
Q
D
 
G
G
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
A
A
x
H
G
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
A
Y
 
S
A
 
V
Y
 
N
V
x
K
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
V
 
N
A
 
A
E
 
G
R
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
x
W
T
x
V
E
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
x
V
E
 
E
A
 
K
S
x
Q
V
 
I
A
 
E
T
 
A
I
|
I
V
 
S
A
 
Q
K
 
Q
T
 
K
G
 
G
-
 
I
Q
 
D
S
 
I
P
 
E
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
H
 
L
L
 
L
Q
 
A
S
 
E
T
 
K
N
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
Q
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
L
T
 
G
A
 
G
T
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
S
G
 
S
P
 
A
H
 
A
S
 
A
G
 
D
A
 
Q
I
 
M
H
 
T
G
 
G
Q
 
T
A
 
T
I
 
L
S
 
S
I
 
L
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
x
W
T
 
T

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
35% identity, 97% coverage: 8:251/251 of query aligns to 2:258/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
L
 
L
I
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
T
A
 
E
F
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
V
I
 
I
I
 
N
G
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
E
R
 
R
R
 
E
R
 
R
E
 
S
P
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
S
T
 
K
-
 
F
A
 
G
C
 
V
R
 
K
H
 
A
P
 
Y
A
 
Y
I
 
L
A
 
N
C
 
A
E
x
D
I
x
L
A
 
S
D
 
D
V
 
A
T
 
Q
R
 
A
E
 
T
A
 
R
D
 
D
M
 
F
V
 
I
A
 
A
-
 
K
L
 
A
F
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
x
Q
E
 
H
S
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
E
R
 
E
T
 
F
G
 
P
L
 
V
D
 
D
Q
 
K
W
 
W
Q
 
N
R
 
A
M
 
I
L
 
I
D
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
G
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
G
L
 
T
R
 
A
E
 
A
G
 
A
L
 
L
K
 
P
-
 
I
-
 
M
R
 
Q
V
 
K
R
 
Q
D
 
G
G
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
A
A
x
H
G
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
A
Y
 
S
A
 
V
Y
 
N
V
x
K
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
V
 
N
A
 
A
E
 
G
R
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
C
P
 
P
G
|
G
F
x
W
T
x
V
E
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
x
V
E
 
E
A
 
K
S
x
Q
V
 
I
A
 
E
T
 
A
I
|
I
V
 
S
A
 
Q
K
 
Q
T
 
K
G
 
G
-
 
I
Q
 
D
S
 
I
P
 
E
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
H
 
L
L
 
L
Q
 
A
S
 
E
T
 
K
N
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
Q
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
L
T
 
G
A
 
G
T
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
S
G
 
S
P
 
A
H
 
A
S
 
A
G
 
D
A
 
Q
I
 
M
H
 
T
G
 
G
Q
 
T
A
 
T
I
 
L
S
 
S
I
 
L
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
x
W
T
 
T

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
35% identity, 97% coverage: 8:251/251 of query aligns to 2:258/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
L
 
L
I
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
K
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
T
A
 
E
F
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
V
T
 
V
I
 
I
I
 
N
G
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
E
R
 
R
R
 
E
R
 
R
E
 
S
P
 
T
L
 
L
E
 
E
T
 
S
T
 
K
-
 
F
A
 
G
C
 
V
R
 
K
H
 
A
P
 
Y
A
 
Y
I
 
L
A
 
N
C
 
A
E
x
D
I
x
L
A
 
S
D
 
D
V
 
A
T
 
Q
R
 
A
E
 
T
A
 
R
D
 
D
M
 
F
V
 
I
A
 
A
-
 
K
L
 
A
F
 
A
E
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
E
 
G
V
 
L
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
x
Q
E
 
H
S
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
E
R
 
E
T
 
F
G
 
P
L
 
V
D
 
D
Q
 
K
W
 
W
Q
 
N
R
 
A
M
 
I
L
 
I
D
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
G
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
G
L
 
T
R
 
A
E
 
A
G
 
A
L
 
L
K
 
P
-
 
I
-
 
M
R
 
Q
V
 
K
R
 
Q
D
 
G
G
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
T
 
A
A
x
H
G
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
A
Y
 
S
A
 
V
Y
 
N
V
x
K
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
V
 
N
A
 
A
E
 
G
R
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
x
W
T
x
V
E
 
R
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
x
V
E
 
E
A
 
K
S
x
Q
V
 
I
A
 
E
T
 
A
I
|
I
V
 
S
A
 
Q
K
 
Q
T
 
K
G
 
G
-
 
I
Q
 
D
S
 
I
P
 
E
A
 
A
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
H
 
L
L
 
L
Q
 
A
S
 
E
T
 
K
N
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
Q
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
L
T
 
G
A
 
G
T
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
S
G
 
S
P
 
A
H
 
A
S
 
A
G
 
D
A
 
Q
I
 
M
H
 
T
G
 
G
Q
 
T
A
 
T
I
 
L
S
 
S
I
 
L
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
W
T
 
T

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
35% identity, 98% coverage: 5:251/251 of query aligns to 1:259/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
M
 
M
D
 
T
R
 
K
L
 
L
I
 
L
-
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
E
M
 
I
A
 
A
L
 
K
A
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
A
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
T
 
V
I
 
I
I
 
S
G
x
D
R
x
M
R
 
N
R
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
C
E
 
Q
T
 
E
T
 
T
A
 
A
C
 
N
R
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
H
 
F
P
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
S
-
 
A
-
 
P
C
 
C
E
x
D
I
x
V
A
 
T
D
 
D
V
 
E
T
 
D
R
 
A
E
 
Y
A
 
K
D
 
Q
M
 
A
V
 
I
A
 
E
L
 
L
F
 
T
E
 
Q
R
 
K
-
 
T
L
 
F
G
 
G
E
 
T
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
F
A
x
Q
E
 
H
S
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
E
R
 
E
T
 
F
G
 
P
L
 
T
D
 
A
Q
 
V
W
 
F
Q
 
Q
R
 
K
M
 
L
L
 
V
D
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
I
T
 
G
L
 
I
R
 
K
E
 
H
G
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
I
K
 
M
R
 
K
V
 
A
R
 
Q
D
 
K
G
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
T
 
I
A
x
N
G
 
G
L
 
L
K
 
I
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
Y
 
G
V
x
K
A
 
A
P
 
G
Y
|
Y
C
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
V
 
C
A
 
A
E
 
R
R
 
D
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
T
x
V
E
 
D
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
 
V
E
 
R
A
 
G
S
x
Q
V
 
I
A
 
A
T
 
D
I
 
L
V
 
A
A
 
K
K
 
T
T
 
R
G
 
N
Q
 
V
S
 
S
P
 
L
A
 
D
Q
 
S
A
 
A
R
 
L
A
 
E
H
 
D
-
 
V
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
T
 
M
N
 
V
P
 
P
S
 
Q
G
 
K
R
 
R
L
 
L
I
 
L
Q
 
S
P
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
D
T
 
Y
A
 
A
L
 
I
W
 
F
L
 
L
C
 
A
G
 
S
P
 
S
H
 
K
S
 
A
G
 
G
A
 
G
I
 
V
H
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
S
 
V
I
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
T
 
T

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
35% identity, 97% coverage: 8:251/251 of query aligns to 4:258/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
L
 
L
I
 
D
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
E
M
 
I
A
 
A
L
 
K
A
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
Q
A
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
T
 
V
I
 
I
I
 
S
G
x
D
R
x
M
R
 
N
R
 
A
E
 
E
P
 
K
L
 
C
E
 
Q
T
 
E
T
 
T
A
 
A
C
 
N
R
 
S
-
 
L
-
 
K
-
 
E
-
 
Q
-
 
G
H
 
F
P
 
D
A
 
A
I
 
L
A
 
S
-
 
A
-
 
P
C
 
C
E
x
D
I
x
V
A
 
T
D
 
D
V
 
E
T
 
D
R
 
A
E
 
Y
A
 
K
D
 
Q
M
 
A
V
 
I
A
 
E
L
 
L
F
 
T
E
 
Q
R
 
K
-
 
T
L
 
F
G
 
G
E
 
T
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
F
A
x
Q
E
 
H
S
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
I
A
 
E
R
 
E
T
 
F
G
 
P
L
 
T
D
 
A
Q
 
V
W
 
F
Q
 
Q
R
 
K
M
 
L
L
 
V
D
 
Q
V
 
V
N
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
I
T
 
G
L
 
I
R
 
K
E
 
H
G
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
I
K
 
M
R
 
K
V
 
A
R
 
Q
D
 
K
G
 
Y
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
T
 
I
A
 
N
G
 
G
L
 
L
K
 
I
G
 
G
Y
 
F
A
 
A
Y
 
G
V
x
K
A
 
A
P
 
G
Y
|
Y
C
 
N
A
 
S
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
A
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
V
 
C
A
 
A
E
 
R
R
 
D
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
L
C
 
C
P
 
P
G
 
G
F
x
Y
T
x
V
E
 
D
T
|
T
P
 
P
L
 
L
L
 
V
E
 
R
A
 
G
S
x
Q
V
 
I
A
 
A
T
 
D
I
 
L
V
 
A
A
 
K
K
 
T
T
 
R
G
 
N
Q
 
V
S
 
S
P
 
L
A
 
D
Q
 
S
A
 
A
R
 
L
A
 
E
H
 
D
-
 
V
L
 
I
Q
 
L
S
 
A
T
 
M
N
 
V
P
 
P
S
 
Q
G
 
K
R
 
R
L
 
L
I
 
L
Q
 
S
P
 
V
A
 
E
E
 
E
V
 
I
T
 
A
A
 
D
T
 
Y
A
 
A
L
 
I
W
 
F
L
 
L
C
 
A
G
 
S
P
 
S
H
 
K
S
 
A
G
 
G
A
 
G
I
 
V
H
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
V
S
 
V
I
 
M
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Y
T
 
T

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
36% identity, 96% coverage: 8:249/251 of query aligns to 2:251/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
L
 
L
I
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
x
T
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
G
M
 
I
A
 
A
L
 
Q
A
 
V
F
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
N
V
 
I
T
 
V
I
 
L
I
 
N
G
 
G
R
x
F
R
 
G
R
 
-
E
 
D
P
 
P
L
 
A
E
 
P
-
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
R
-
 
H
-
 
G
T
 
V
T
 
K
A
 
A
C
 
V
R
 
H
H
 
H
P
 
P
A
 
A
I
 
-
A
 
-
C
 
-
E
x
D
I
x
L
A
 
S
D
 
D
V
 
V
T
 
A
R
 
Q
E
 
I
A
 
E
D
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
A
L
 
L
F
 
A
E
 
E
R
 
R
-
 
E
L
 
F
G
 
G
E
 
G
V
 
V
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
A
 
I
A
 
Q
E
 
H
S
 
V
A
 
A
P
 
P
L
 
V
A
 
E
R
 
Q
T
 
F
G
 
P
L
 
L
D
 
E
Q
 
S
W
 
W
Q
 
D
R
 
K
M
 
I
L
 
I
D
 
A
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
G
L
 
T
R
 
R
E
 
L
G
 
A
L
 
L
K
 
P
-
 
G
-
 
M
R
 
R
V
 
A
R
 
R
D
 
N
G
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
T
 
V
A
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
G
Y
 
S
A
 
T
Y
 
G
V
 
K
A
 
A
P
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
L
V
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
V
A
 
G
Q
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
T
R
 
S
D
 
N
I
 
V
T
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
C
P
|
P
G
|
G
F
x
W
T
x
V
E
 
L
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
x
V
E
 
Q
A
 
K
S
 
Q
V
 
I
A
 
D
T
 
D
I
x
R
V
 
A
A
 
A
K
 
N
T
 
G
G
 
G
Q
 
-
S
 
D
P
 
P
A
 
L
Q
 
Q
A
 
A
R
 
Q
A
 
H
H
 
D
L
 
L
Q
 
L
S
 
A
-
 
E
T
 
K
N
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
L
R
 
A
L
 
F
I
 
V
Q
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
H
V
 
L
T
 
G
A
 
E
T
 
L
A
 
V
L
 
L
W
 
F
L
 
L
C
 
C
G
 
S
P
 
E
H
 
A
S
 
G
G
 
S
A
 
Q
I
 
V
H
 
R
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
W
S
 
N
I
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
31% identity, 98% coverage: 5:249/251 of query aligns to 2:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
D
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
Q
G
 
D
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
E
M
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
V
F
 
F
A
 
M
E
 
K
A
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
K
V
 
V
T
 
V
I
 
I
I
 
A
G
x
D
R
x
F
R
 
N
R
 
E
E
 
A
P
 
A
L
 
G
E
 
K
T
 
E
T
 
A
A
 
V
C
 
E
R
 
A
H
 
N
P
 
P
A
 
G
I
 
V
A
 
V
C
 
F
E
 
I
I
 
R
A
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
R
 
D
E
 
R
A
 
E
D
 
S
M
 
V
V
 
H
A
 
R
L
 
L
F
 
V
E
 
E
-
 
N
-
 
V
-
 
A
-
 
E
R
 
R
L
 
F
G
 
G
E
 
K
V
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
I
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
x
I
A
 
T
E
 
R
S
x
D
A
 
S
P
 
M
L
 
L
A
 
S
R
x
K
T
 
M
G
 
T
L
 
V
D
 
D
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
R
 
Q
M
 
V
L
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
C
L
 
T
R
 
Q
E
 
A
G
 
V
L
 
L
K
 
P
R
 
Y
V
 
M
R
 
A
D
 
E
-
 
Q
-
 
G
G
 
K
G
 
G
R
 
K
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
T
 
V
A
 
T
G
 
G
L
 
T
K
 
Y
G
 
G
Y
x
N
A
x
V
Y
 
G
V
x
Q
A
 
T
P
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
I
G
 
G
L
 
M
V
 
T
R
 
K
A
 
T
L
 
W
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
V
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
K
D
 
G
I
 
I
T
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
L
 
V
C
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
T
|
T
E
 
E
T
|
T
P
 
A
L
x
M
L
 
V
E
 
-
A
 
-
S
 
-
V
 
-
A
 
-
T
 
-
I
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
A
Q
 
E
S
 
V
P
 
P
A
 
E
Q
 
K
A
 
V
R
 
I
A
 
E
H
x
K
L
 
M
Q
 
K
S
 
A
T
 
Q
N
 
V
P
 
P
S
 
M
G
 
G
R
 
R
L
 
L
I
 
G
Q
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
N
T
 
A
A
 
Y
L
 
L
W
 
F
L
 
L
C
 
A
G
 
S
P
 
H
H
 
E
S
 
S
G
 
D
A
 
Y
I
 
V
H
 
N
G
 
G
Q
 
H
A
 
V
I
 
L
S
 
H
I
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
33% identity, 97% coverage: 8:251/251 of query aligns to 2:258/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
L
 
L
I
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
S
G
 
T
S
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
L
D
 
G
M
 
I
A
 
A
L
 
T
A
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
I
T
 
V
I
 
L
I
 
N
G
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
E
R
 
K
R
 
V
R
 
R
E
 
A
P
 
G
L
 
L
E
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
A
C
 
A
R
 
Q
H
 
H
P
 
G
A
 
V
-
 
K
I
 
V
A
 
L
C
 
Y
E
 
D
I
 
G
A
 
A
D
 
D
V
x
L
T
 
S
R
 
K
E
 
G
A
 
E
D
 
A
M
 
V
V
 
R
A
 
G
L
 
L
F
 
V
E
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
V
-
 
R
R
 
Q
L
 
M
G
 
G
E
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
x
Q
E
 
H
S
 
T
A
 
A
P
 
L
L
 
I
A
 
E
R
 
D
T
 
F
G
 
P
L
 
T
D
 
E
Q
 
K
W
 
W
Q
 
D
R
 
A
M
 
I
L
 
L
D
 
A
V
x
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
G
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
G
L
 
T
R
 
A
E
 
A
G
 
A
L
 
L
K
 
P
R
 
H
V
 
M
R
 
K
D
 
K
G
 
Q
G
 
G
-
 
F
-
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
A
A
x
H
G
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
A
Y
 
S
A
 
A
Y
 
N
V
x
K
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
G
R
 
Q
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
F
x
W
T
x
V
E
 
R
T
|
T
P
 
P
L
 
L
L
x
V
E
 
E
A
 
K
S
x
Q
V
 
I
A
 
S
T
 
A
I
x
L
V
 
A
A
 
E
K
 
K
T
 
N
G
 
G
-
 
V
Q
 
D
S
 
Q
P
 
E
A
 
T
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
H
 
L
L
 
L
Q
 
S
S
 
E
T
 
K
N
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
Q
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
L
T
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
A
G
 
S
P
 
D
H
 
A
S
 
A
G
 
A
A
 
Q
I
 
I
H
 
T
G
 
G
Q
 
T
A
 
T
I
 
V
S
 
S
I
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
W
T
 
T

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
33% identity, 97% coverage: 8:251/251 of query aligns to 2:258/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
L
 
L
I
 
K
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
S
G
 
T
S
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
A
 
L
D
 
G
M
 
I
A
 
A
L
 
T
A
 
A
F
 
L
A
 
A
E
 
A
A
 
Q
G
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
I
T
 
V
I
 
L
I
 
N
G
 
G
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
E
R
 
K
R
 
V
R
 
R
E
 
A
P
 
G
L
 
L
E
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
A
C
 
A
R
 
Q
H
 
H
P
 
G
A
 
V
-
 
K
I
 
V
A
 
L
C
 
Y
E
 
D
I
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
G
A
 
E
D
 
A
M
 
V
V
 
R
A
 
G
L
 
L
F
 
V
E
 
D
-
 
N
-
 
A
-
 
V
-
 
R
R
 
Q
L
 
M
G
 
G
E
 
R
V
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
V
A
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
I
A
 
Q
E
 
H
S
 
T
A
 
A
P
 
L
L
 
I
A
 
E
R
 
D
T
 
F
G
 
P
L
 
T
D
 
E
Q
 
K
W
 
W
Q
 
D
R
 
A
M
 
I
L
 
L
D
 
A
V
 
L
N
|
N
L
 
L
T
 
S
G
 
A
V
 
V
F
 
F
L
 
H
T
 
G
L
 
T
R
 
A
E
 
A
G
 
A
L
 
L
K
 
P
R
 
H
V
 
M
R
 
K
D
 
K
G
 
Q
G
 
G
-
 
F
-
 
G
R
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
T
 
A
A
 
H
G
 
G
L
 
L
K
 
V
G
 
A
Y
 
S
A
 
A
Y
 
N
V
 
K
A
 
S
P
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
V
V
 
V
G
 
G
L
 
F
V
 
T
R
 
K
A
 
V
L
 
T
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
V
 
T
A
 
A
E
 
G
R
 
Q
D
 
G
I
 
I
T
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
L
 
I
C
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
W
T
 
V
E
 
R
T
 
T
P
 
P
L
 
L
L
 
V
E
 
E
A
 
K
S
 
Q
V
 
I
A
 
S
T
 
A
I
x
L
V
 
A
A
 
E
K
 
K
T
 
N
G
 
G
-
 
V
Q
 
D
S
 
Q
P
 
E
A
 
T
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
E
H
 
L
L
 
L
Q
 
S
S
 
E
T
 
K
N
 
Q
P
 
P
S
 
S
G
 
L
R
 
Q
L
 
F
I
 
V
Q
 
T
P
 
P
A
 
E
E
 
Q
V
 
L
T
 
G
A
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
V
W
 
F
L
 
L
C
 
A
G
 
S
P
 
D
H
 
A
S
 
A
G
 
A
A
 
Q
I
 
I
H
 
T
G
 
G
Q
 
T
A
 
T
I
 
V
S
 
S
I
 
V
S
 
D
G
 
G
G
 
G
E
x
W
T
 
T

6zzpA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
32% identity, 96% coverage: 8:249/251 of query aligns to 8:261/265 of 6zzpA

query
sites
6zzpA
L
 
L
I
 
T
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
D
 
D
M
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
V
T
 
G
I
 
I
I
 
A
G
x
D
-
x
I
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
R
 
K
R
 
T
R
 
V
E
 
D
P
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
A
T
 
A
A
 
G
C
 
G
R
 
R
H
 
A
P
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
C
x
M
E
 
-
I
 
-
A
 
-
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
S
E
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
N
D
 
D
M
 
G
V
 
V
A
 
Q
-
 
R
L
 
L
F
 
V
E
 
D
R
 
T
L
 
F
G
 
G
E
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
V
A
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
x
Q
E
 
I
S
 
I
A
 
D
P
 
P
L
 
I
A
 
H
R
 
K
T
 
M
G
 
A
L
 
F
D
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
K
R
 
K
M
 
M
L
 
L
D
 
A
V
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
D
G
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
T
L
 
T
R
 
K
E
 
A
G
 
A
L
 
I
K
 
Q
R
 
H
V
 
M
R
 
Y
D
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
Y
V
x
M
A
 
G
S
|
S
T
 
V
A
x
H
G
 
S
L
 
H
K
 
E
G
 
A
Y
 
S
A
 
L
Y
 
F
V
x
K
A
 
A
P
 
P
Y
|
Y
C
 
V
A
 
T
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
C
R
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
V
 
G
A
 
A
E
 
V
R
 
H
D
 
N
I
 
V
T
 
R
V
 
S
N
 
H
A
 
V
L
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
F
|
F
T
x
V
E
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
x
V
E
 
E
A
 
K
S
x
Q
V
 
I
A
 
P
T
 
Q
I
 
Q
V
 
A
A
 
A
K
 
E
T
 
K
G
 
G
Q
 
I
S
 
S
P
 
E
A
 
E
Q
 
S
A
 
V
R
 
V
A
 
N
H
 
D
L
 
I
Q
 
M
S
 
L
T
 
V
N
 
N
P
 
T
S
 
V
G
 
D
R
 
K
-
 
E
L
 
F
I
 
T
Q
 
T
P
 
V
A
 
D
E
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
F
L
 
L
C
 
A
G
 
A
P
 
F
H
 
P
S
 
T
G
 
N
A
 
V
I
 
F
H
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
S
I
 
I
S
 
V
I
 
A
S
 
S
G
 
H
G
 
G

6zzoC Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from psychrobacter arcticus complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
32% identity, 96% coverage: 8:249/251 of query aligns to 8:261/265 of 6zzoC

query
sites
6zzoC
L
 
L
I
 
T
G
 
G
K
 
K
R
 
V
V
 
A
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
G
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
A
 
R
D
 
D
M
 
I
A
 
A
L
 
E
A
 
T
F
 
Y
A
 
A
E
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
A
V
 
V
T
 
G
I
 
I
I
 
A
G
x
D
-
x
I
-
 
N
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
Q
R
 
K
R
 
T
R
 
V
E
 
D
P
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
A
T
 
A
A
 
G
C
 
G
R
 
R
H
 
A
P
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
C
x
M
E
 
-
I
 
-
A
 
-
D
|
D
V
|
V
T
 
T
R
 
S
E
 
E
A
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
N
D
 
D
M
 
G
V
 
V
A
 
Q
-
 
R
L
 
L
F
 
V
E
 
D
R
 
T
L
 
F
G
 
G
E
 
G
V
 
I
D
 
D
I
 
I
V
 
L
I
 
V
A
 
S
N
|
N
A
|
A
G
|
G
A
 
I
A
x
Q
E
 
I
S
 
I
A
 
D
P
 
P
L
 
I
A
 
H
R
 
K
T
 
M
G
 
A
L
 
F
D
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
K
R
 
K
M
 
M
L
 
L
D
 
A
V
 
I
N
 
H
L
 
L
T
 
D
G
 
G
V
 
A
F
 
F
L
 
L
T
 
T
L
 
T
R
 
K
E
 
A
G
 
A
L
 
I
K
 
Q
R
 
H
V
 
M
R
 
Y
D
 
K
-
 
D
-
 
D
-
 
K
G
 
G
G
 
G
R
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
Y
V
x
M
A
 
G
S
 
S
T
 
V
A
x
H
G
 
S
L
 
H
K
 
E
G
 
A
Y
 
S
A
 
L
Y
 
F
V
x
K
A
 
A
P
 
P
Y
|
Y
C
 
V
A
 
T
A
 
A
K
|
K
H
 
H
G
 
G
V
 
L
V
 
L
G
 
G
L
 
L
V
 
C
R
 
R
A
 
V
L
 
L
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
V
 
G
A
 
A
E
 
V
R
 
H
D
 
N
I
 
V
T
 
R
V
 
S
N
 
H
A
 
V
L
 
I
C
 
C
P
|
P
G
 
G
F
|
F
T
x
V
E
 
K
T
|
T
P
 
P
L
|
L
L
x
V
E
 
E
A
 
K
S
x
Q
V
 
I
A
 
P
T
 
Q
I
 
Q
V
 
A
A
 
A
K
 
E
T
 
K
G
 
G
Q
 
I
S
 
S
P
 
E
A
 
E
Q
 
S
A
 
V
R
 
V
A
 
N
H
 
D
L
 
I
Q
 
M
S
 
L
T
 
V
N
 
N
P
 
T
S
 
V
G
 
D
R
 
K
-
 
E
L
 
F
I
 
T
Q
 
T
P
 
V
A
 
D
E
 
D
V
 
I
T
 
A
A
 
Q
T
 
L
A
 
A
L
 
L
W
 
F
L
 
L
C
 
A
G
 
A
P
 
F
H
 
P
S
 
T
G
 
N
A
 
V
I
 
F
H
 
T
G
 
G
Q
 
Q
A
 
S
I
 
I
S
 
V
I
 
A
S
 
S
G
 
H
G
 
G

Query Sequence

>WP_086509457.1 NCBI__GCF_002151265.1:WP_086509457.1
MDVIMDRLIGKRVVITGGGSGIGADMALAFAEAGADVTIIGRRREPLETTACRHPAIACE
IADVTREADMVALFERLGEVDIVIANAGAAESAPLARTGLDQWQRMLDVNLTGVFLTLRE
GLKRVRDGGRLIAVASTAGLKGYAYVAPYCAAKHGVVGLVRALAQEVAERDITVNALCPG
FTETPLLEASVATIVAKTGQSPAQARAHLQSTNPSGRLIQPAEVTATALWLCGPHSGAIH
GQAISISGGET

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory