SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_086510087.1 NCBI__GCF_002151265.1:WP_086510087.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3kboA 2.14 angstrom crystal structure of putative oxidoreductase (ycdw) from salmonella typhimurium in complex with NADP
40% identity, 100% coverage: 1:311/311 of query aligns to 1:312/312 of 3kboA

query
sites
3kboA
M
 
M
R
 
E
I
 
I
L
 
I
L
 
F
H
 
Y
I
 
H
D
 
P
D
 
T
I
 
F
E
 
N
A
 
A
-
 
A
-
 
W
W
 
W
R
 
V
D
 
N
A
 
A
L
 
L
A
 
E
E
 
K
R
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
H
A
 
A
E
 
R
I
 
V
-
 
R
-
 
E
-
 
W
-
 
K
V
 
V
T
 
G
A
 
D
D
x
N
D
 
N
P
 
P
A
 
A
D
 
D
K
 
-
R
 
-
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
Y
L
 
A
A
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
Q
P
 
P
P
 
P
E
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
L
A
|
A
E
 
G
Q
x
R
T
 
-
R
|
R
A
 
L
R
 
K
G
 
A
I
 
V
V
 
F
N
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
K
-
 
L
-
 
N
-
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
E
A
 
M
L
 
L
P
 
D
A
 
A
G
 
S
V
 
I
P
 
P
I
 
L
V
 
F
K
x
R
L
 
L
R
 
E
D
 
D
A
 
T
G
 
G
M
|
M
A
 
G
E
 
L
L
 
Q
I
x
M
G
 
Q
D
 
E
Y
 
Y
V
 
A
R
 
V
Y
 
S
G
 
Q
V
 
V
L
 
L
H
 
H
F
 
W
Q
 
F
R
 
R
D
 
R
F
 
F
D
 
D
R
 
D
Y
 
Y
R
 
Q
R
 
A
Q
 
L
Q
 
K
A
 
N
S
 
Q
R
 
A
E
 
L
W
 
W
H
 
K
E
 
P
H
 
L
N
 
P
V
 
E
T
 
Y
A
 
T
K
 
R
R
 
E
D
 
E
W
 
F
P
 
S
V
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
M
G
|
G
L
x
A
G
|
G
A
x
V
I
x
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
S
I
 
L
A
 
Q
A
 
A
D
 
W
G
 
G
F
 
F
P
 
P
V
 
L
H
 
R
G
 
C
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
|
S
P
 
R
K
|
K
S
 
S
L
 
W
E
 
P
G
 
G
I
 
V
T
 
E
C
 
S
H
 
Y
H
 
V
G
 
G
D
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
R
E
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
N
Q
 
Q
V
 
T
R
 
R
T
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
N
L
|
L
L
 
L
P
|
P
G
 
N
T
 
T
N
 
A
S
 
Q
T
 
T
R
 
V
H
 
G
I
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
S
A
 
E
A
 
L
L
 
L
A
 
D
A
 
Q
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
Y
L
 
V
I
 
L
N
 
N
P
x
L
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
V
L
 
H
I
 
V
D
 
Q
E
 
E
A
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
L
R
 
K
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
S
E
 
Q
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
S
 
E
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
R
H
 
H
P
 
P
R
 
R
I
 
V
W
 
A
V
 
M
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
I
A
 
A
G
x
A
P
 
V
T
 
T
P
 
R
L
 
P
D
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
I
D
 
D
Q
 
Y
V
 
I
A
 
S
E
 
R
A
 
T
I
 
I
R
 
T
A
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
E
E
 
P
V
 
V
E
 
T
-
 
G
S
 
Q
V
 
V
D
 
D
P
 
R
E
 
A
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

5vg6B Crystal structure of d-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase from xanthobacter autotrophicus py2 in complex with NADPH and mes.
41% identity, 98% coverage: 7:311/311 of query aligns to 11:315/315 of 5vg6B

query
sites
5vg6B
I
 
V
D
 
D
D
 
I
I
 
G
E
 
Q
A
 
D
W
 
W
R
 
K
D
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
A
R
 
A
L
 
H
P
 
P
G
 
G
A
 
L
E
 
D
I
 
V
V
 
R
T
 
I
A
 
A
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
D
-
 
G
-
 
H
-
 
V
-
 
E
D
 
G
D
 
D
P
 
P
A
 
E
D
 
E
K
 
V
R
 
R
R
 
-
D
 
-
A
 
-
D
 
-
Y
 
Y
L
 
A
A
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
K
P
 
P
P
 
P
E
 
H
A
 
G
L
 
F
L
 
F
A
 
A
E
 
R
Q
 
F
T
 
P
R
 
N
A
 
L
R
 
K
G
 
L
I
 
V
V
 
I
N
 
N
L
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
V
S
 
A
N
 
R
P
 
D
A
 
D
L
 
L
P
 
P
A
 
-
G
 
D
V
 
V
P
 
P
I
 
V
V
 
T
K
x
R
L
 
L
R
 
S
D
 
D
A
 
P
G
 
N
M
|
M
A
 
S
E
 
Q
L
 
M
I
x
M
G
 
A
D
 
S
Y
 
F
V
 
V
R
 
L
Y
 
F
G
 
C
V
 
V
L
 
L
H
 
R
F
 
H
Q
 
A
R
 
R
D
 
D
F
 
I
D
 
P
R
 
T
Y
 
F
R
 
E
R
 
R
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
R
S
 
E
R
 
G
E
 
R
W
 
W
H
 
H
E
 
Y
H
 
V
N
 
H
V
 
P
T
 
R
A
 
T
K
 
A
R
 
A
D
 
E
W
 
I
P
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
D
I
x
L
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
L
M
 
E
I
 
L
A
 
A
A
 
R
D
 
H
G
 
G
F
 
F
P
 
D
V
 
V
H
 
R
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
P
 
P
K
|
K
S
 
A
L
 
L
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
S
C
 
C
H
 
F
H
 
H
G
 
G
D
 
L
E
 
E
G
 
A
L
 
L
V
 
P
E
 
G
L
 
F
L
 
L
G
 
A
Q
 
G
V
 
S
R
 
E
T
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
V
L
 
M
L
|
L
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
P
S
 
E
T
|
T
R
 
R
H
 
G
I
 
L
I
 
M
N
 
N
A
 
A
A
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
H
L
 
L
P
 
P
E
 
R
G
 
G
A
 
A
S
 
K
L
 
F
I
 
I
N
 
N
P
x
V
G
 
A
R
|
R
G
 
G
S
 
P
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
R
E
 
S
G
 
G
R
 
H
L
 
I
R
 
A
G
 
E
A
 
A
I
 
T
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
V
S
 
G
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
A
H
 
M
P
 
D
R
 
N
I
 
V
W
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
L
A
|
A
G
x
S
P
 
I
T
 
A
P
 
I
L
 
P
D
 
R
E
 
T
A
 
A
V
 
A
D
 
P
Q
 
Q
V
 
I
A
 
V
E
 
E
A
 
N
I
 
I
R
 
R
A
 
R
F
 
I
E
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
E
E
 
P
V
 
V
-
 
L
E
 
N
S
 
Q
V
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
R
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

7jqiA Structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with alpha-ketoglutarate and NADP+
41% identity, 97% coverage: 9:311/311 of query aligns to 11:312/312 of 7jqiA

query
sites
7jqiA
D
 
D
I
 
T
E
 
Q
A
 
W
W
 
W
R
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
K
R
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
Q
A
 
A
E
 
R
I
 
-
V
 
V
T
 
R
A
 
A
D
 
W
D
 
K
P
 
S
A
 
G
D
 
D
K
 
N
R
 
D
R
 
-
D
 
S
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
A
A
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
H
P
 
P
P
 
P
E
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
G
Q
 
R
T
 
D
R
 
-
A
 
L
R
 
K
G
 
A
I
 
V
V
 
F
N
 
A
L
 
L
G
|
G
A
|
A
G
|
G
V
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
K
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
E
A
 
M
L
 
L
P
 
N
A
 
P
G
 
S
V
 
V
P
 
P
I
 
L
V
 
F
K
x
R
L
 
L
R
 
E
D
 
D
A
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
G
E
 
E
L
 
Q
I
x
M
G
 
Q
D
 
E
Y
 
Y
V
 
A
R
 
V
Y
 
S
G
 
Q
V
 
V
L
 
L
H
 
H
F
 
W
Q
 
F
R
 
R
D
 
R
F
 
F
D
 
D
R
 
D
Y
 
Y
R
 
R
R
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
N
S
 
S
R
 
S
E
 
H
W
 
W
H
 
Q
E
 
P
H
 
L
N
 
P
V
 
E
T
 
Y
A
 
H
K
 
R
R
 
E
D
 
D
W
 
F
P
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
x
A
G
|
G
A
x
V
I
x
L
G
 
G
A
 
S
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
M
 
S
I
 
L
A
 
Q
A
 
T
D
 
W
G
 
R
F
 
F
P
 
P
V
 
L
H
 
R
G
 
C
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
P
 
R
K
|
K
S
 
S
L
 
W
E
 
P
G
 
G
I
 
V
T
 
Q
C
 
S
H
 
F
H
 
A
G
 
G
D
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
S
E
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
V
 
C
R
 
R
T
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
N
L
 
L
L
|
L
P
|
P
G
 
N
T
 
T
N
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
V
H
 
G
I
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
N
P
x
L
G
 
A
R
|
R
G
 
G
S
 
V
L
 
H
I
 
V
D
 
V
E
 
E
A
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
V
R
 
K
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
L
D
 
D
A
 
V
F
 
F
P
 
N
E
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
P
S
 
E
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
R
 
R
I
 
V
W
 
T
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
 
A
G
x
A
P
 
I
T
 
T
P
 
R
L
 
P
D
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
E
Q
 
Y
V
 
I
A
 
S
E
 
R
A
 
T
I
 
I
R
 
A
A
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
V
E
 
C
-
 
G
S
 
Q
V
 
V
D
 
D
P
 
R
E
 
A
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

6p35A 2.5 angstrom structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with 2-keto arginine and NADP
41% identity, 97% coverage: 9:311/311 of query aligns to 11:312/312 of 6p35A

query
sites
6p35A
D
|
D
I
 
T
E
 
Q
A
 
W
W
|
W
R
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
K
R
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
Q
A
 
A
E
 
R
I
 
-
V
 
V
T
 
R
A
 
A
D
 
W
D
 
K
P
 
S
A
 
G
D
 
D
K
 
N
R
 
D
R
 
-
D
 
S
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
A
A
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
H
P
 
P
P
 
P
E
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
G
Q
 
R
T
 
D
R
 
-
A
 
L
R
 
K
G
 
A
I
 
V
V
 
F
N
 
A
L
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
K
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
E
A
 
M
L
 
L
P
 
N
A
 
P
G
 
S
V
 
V
P
 
P
I
 
L
V
 
F
K
x
R
L
 
L
R
 
E
D
 
D
A
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
G
E
 
E
L
 
Q
I
x
M
G
 
Q
D
 
E
Y
 
Y
V
 
A
R
 
V
Y
 
S
G
 
Q
V
 
V
L
 
L
H
 
H
F
 
W
Q
 
F
R
 
R
D
 
R
F
 
F
D
 
D
R
 
D
Y
 
Y
R
 
R
R
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
N
S
 
S
R
 
S
E
 
H
W
 
W
H
 
Q
E
 
P
H
 
L
N
 
P
V
 
E
T
 
Y
A
 
H
K
 
R
R
 
E
D
 
D
W
 
F
P
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
x
A
G
|
G
A
x
V
I
x
L
G
 
G
A
 
S
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
M
 
S
I
 
L
A
 
Q
A
 
T
D
 
W
G
 
R
F
 
F
P
 
P
V
 
L
H
 
R
G
 
C
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
P
 
R
K
|
K
S
 
S
L
 
W
E
 
P
G
 
G
I
 
V
T
 
Q
C
 
S
H
 
F
H
 
A
G
 
G
D
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
S
E
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
V
 
C
R
 
R
T
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
N
L
 
L
L
|
L
P
|
P
G
 
N
T
 
T
N
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
V
H
 
G
I
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
N
P
x
L
G
 
A
R
|
R
G
 
G
S
 
V
L
 
H
I
 
V
D
 
V
E
 
E
A
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
V
R
 
K
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
L
D
 
D
A
 
V
F
 
F
P
 
N
E
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
P
S
 
E
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
R
 
R
I
 
V
W
 
T
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
|
A
G
x
A
P
 
I
T
|
T
P
 
R
L
 
P
D
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
E
Q
 
Y
V
 
I
A
 
S
E
 
R
A
 
T
I
 
I
R
 
A
A
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
V
E
 
C
-
 
G
S
 
Q
V
 
V
D
 
D
P
 
R
E
 
A
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

Sites not aligning to the query:

7jqhA Structure of wild type glyoxylate/hydroxypyruvate reductase a from escherichia coli in complex with phosphate and NADP+
41% identity, 97% coverage: 9:311/311 of query aligns to 12:313/313 of 7jqhA

query
sites
7jqhA
D
 
D
I
 
T
E
 
Q
A
 
W
W
 
W
R
 
I
D
 
E
A
 
A
L
 
L
A
 
R
E
 
K
R
 
A
L
 
I
P
 
P
G
 
Q
A
 
A
E
 
R
I
 
-
V
 
V
T
 
R
A
 
A
D
 
W
D
 
K
P
 
S
A
 
G
D
 
D
K
 
N
R
 
D
R
 
-
D
 
S
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
L
 
A
A
 
L
V
 
V
W
 
W
K
 
H
P
 
P
P
 
P
E
 
V
A
 
E
L
 
M
L
 
L
A
 
A
E
 
G
Q
 
R
T
 
D
R
 
-
A
 
L
R
 
K
G
 
A
I
 
V
V
 
F
N
 
A
L
 
L
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
S
L
 
I
L
 
L
S
 
S
N
 
K
-
 
L
-
 
Q
-
 
A
-
 
H
-
 
P
P
 
E
A
 
M
L
 
L
P
 
N
A
 
P
G
 
S
V
 
V
P
 
P
I
 
L
V
 
F
K
x
R
L
 
L
R
 
E
D
 
D
A
 
T
G
 
G
M
 
M
A
 
G
E
 
E
L
 
Q
I
x
M
G
 
Q
D
 
E
Y
 
Y
V
 
A
R
 
V
Y
 
S
G
 
Q
V
 
V
L
 
L
H
 
H
F
 
W
Q
 
F
R
 
R
D
 
R
F
 
F
D
 
D
R
 
D
Y
 
Y
R
 
R
R
 
I
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
N
S
 
S
R
 
S
E
 
H
W
 
W
H
 
Q
E
 
P
H
 
L
N
 
P
V
 
E
T
 
Y
A
 
H
K
 
R
R
 
E
D
 
D
W
 
F
P
 
T
V
 
I
G
 
G
V
 
I
L
 
L
G
 
G
L
x
A
G
|
G
A
x
V
I
x
L
G
 
G
A
 
S
R
 
K
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
M
 
S
I
 
L
A
 
Q
A
 
T
D
 
W
G
 
R
F
 
F
P
 
P
V
 
L
H
 
R
G
 
C
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
P
 
R
K
|
K
S
 
S
L
 
W
E
 
P
G
 
G
I
 
V
T
 
Q
C
 
S
H
 
F
H
 
A
G
 
G
D
 
R
E
 
E
G
 
E
L
 
L
V
 
S
E
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
S
Q
 
Q
V
 
C
R
 
R
T
 
V
L
 
L
V
 
I
L
 
N
L
 
L
L
|
L
P
|
P
G
 
N
T
 
T
N
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
V
H
 
G
I
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
Q
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
A
 
E
A
 
K
L
 
L
P
 
P
E
 
D
G
 
G
A
 
A
S
 
Y
L
 
L
I
 
L
N
 
N
P
x
L
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
V
L
 
H
I
 
V
D
 
V
E
 
E
A
 
D
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
K
L
 
V
R
 
K
G
 
G
A
 
A
I
 
M
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
N
E
 
R
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
P
S
 
E
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
Q
H
 
H
P
 
P
R
 
R
I
 
V
W
 
T
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
 
A
G
x
A
P
 
I
T
 
T
P
 
R
L
 
P
D
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
V
D
 
E
Q
 
Y
V
 
I
A
 
S
E
 
R
A
 
T
I
 
I
R
 
A
A
 
Q
F
 
L
E
 
E
A
 
K
G
 
G
D
 
E
E
 
K
V
 
V
E
 
C
-
 
G
S
 
Q
V
 
V
D
 
D
P
 
R
E
 
A
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

4zqbB Crystal structure of NADP-dependent dehydrogenase from rhodobactersphaeroides in complex with NADP and sulfate
40% identity, 96% coverage: 13:311/311 of query aligns to 21:316/316 of 4zqbB

query
sites
4zqbB
W
 
W
R
 
A
D
 
G
A
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
R
R
 
A
L
 
L
P
 
P
G
 
G
A
 
E
E
 
R
I
 
I
-
 
D
-
 
G
V
 
F
T
 
R
A
 
E
D
 
L
D
 
S
P
 
P
A
 
A
D
 
E
K
 
-
R
 
R
R
 
A
D
 
E
A
 
V
D
 
D
Y
 
I
L
 
A
A
 
I
V
 
V
W
 
A
K
 
N
P
 
P
P
 
D
E
 
P
A
 
A
L
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
L
T
 
P
R
 
N
A
 
L
R
 
V
G
 
W
I
 
I
V
 
H
N
 
S
L
 
L
G
 
W
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
E
A
 
R
L
 
L
L
 
V
S
 
A
N
 
E
P
 
L
A
 
G
L
 
H
P
 
L
A
 
A
G
 
R
V
 
-
P
 
P
I
 
I
V
 
V
K
x
R
L
 
L
R
 
V
D
 
D
A
 
P
G
 
E
M
x
L
A
 
A
E
 
R
L
 
T
I
x
M
G
 
A
D
 
E
Y
 
A
V
 
A
R
 
L
Y
 
A
G
 
W
V
 
T
L
 
Y
H
 
Y
F
 
L
Q
 
F
R
 
R
D
 
D
F
 
M
D
 
P
R
 
A
Y
 
Y
R
 
A
R
 
A
Q
 
Q
Q
 
Q
A
 
R
S
 
A
R
 
R
E
 
V
W
 
W
H
 
K
E
 
G
H
 
L
N
 
P
V
 
Y
T
 
K
A
 
R
K
 
P
R
 
E
D
 
R
W
 
T
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
L
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
E
I
x
L
G
 
G
A
 
A
R
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
L
M
 
R
I
 
L
A
 
R
A
 
D
D
 
A
G
 
G
F
 
F
P
 
D
V
 
V
H
 
H
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
|
S
P
 
P
K
|
K
S
 
E
L
 
I
E
 
A
G
 
G
I
 
V
T
 
T
C
 
C
H
 
H
H
 
A
G
 
G
D
 
E
E
 
E
G
 
T
L
 
L
V
 
E
E
 
R
L
 
M
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
V
 
V
R
 
E
T
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
C
L
 
L
L
|
L
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
G
S
 
E
T
 
T
R
 
R
H
 
G
I
 
L
I
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
R
A
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
C
L
 
L
P
 
P
E
 
E
G
 
G
A
 
A
S
 
Q
L
 
I
I
 
V
N
 
N
P
x
F
G
 
A
R
|
R
G
 
G
S
 
P
L
 
I
I
 
L
D
 
D
E
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
R
L
 
I
R
 
G
G
 
H
A
 
A
I
 
V
L
 
L
D
 
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
A
S
 
S
P
 
P
L
 
F
W
 
W
R
 
G
H
 
H
P
 
P
R
 
K
I
 
V
W
 
T
V
 
V
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
I
A
x
S
G
x
A
P
 
A
T
 
T
P
 
D
L
 
P
D
 
E
E
 
T
A
 
A
V
 
S
D
 
A
Q
 
I
V
 
V
A
 
G
E
 
A
A
 
H
I
 
V
R
 
A
A
 
D
F
 
Y
E
 
R
A
 
A
G
 
T
D
 
G
E
 
R
V
 
I
-
 
P
E
 
P
S
 
S
V
 
V
D
 
D
P
 
L
E
 
T
A
 
R
G
 
G
Y
|
Y

4z0pA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc02828 (smghra) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
37% identity, 95% coverage: 16:311/311 of query aligns to 18:316/316 of 4z0pA

query
sites
4z0pA
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
G
R
 
A
L
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
R
E
 
E
I
 
V
V
 
I
T
 
D
A
 
L
D
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
A
D
 
H
K
 
Q
R
 
E
R
 
R
D
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
G
A
 
I
D
 
D
Y
 
Y
L
 
A
A
 
V
V
 
V
W
|
W
K
 
K
P
 
S
P
 
A
E
 
P
A
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
S
E
 
R
Q
 
A
T
 
P
R
 
D
A
 
L
R
 
K
G
 
V
I
 
V
V
 
F
N
 
S
L
 
G
G
|
G
A
|
A
G
|
G
V
 
V
D
 
D
A
 
H
L
 
V
L
 
L
S
 
T
N
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
-
G
 
D
V
 
V
P
 
P
I
 
L
V
 
V
K
x
R
L
 
F
R
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
T
M
x
L
A
 
T
E
 
T
L
 
R
I
x
M
G
 
S
D
 
E
Y
 
W
V
 
V
R
 
M
Y
 
M
G
 
Q
V
 
C
L
 
L
H
 
L
F
 
H
Q
 
L
R
 
R
D
 
Q
F
x
H
D
x
R
R
 
A
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
Q
 
L
Q
 
A
A
 
K
S
 
K
R
 
H
E
 
E
W
 
W
H
 
R
E
 
D
H
 
L
N
 
S
V
 
Q
T
 
P
A
 
E
K
 
A
R
 
A
D
 
D
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
M
G
 
G
L
x
M
G
|
G
A
x
V
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
A
A
 
R
M
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
M
G
 
G
F
 
F
P
 
K
V
 
V
H
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
|
S
P
 
K
K
x
R
S
 
V
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
E
C
 
T
H
 
Y
H
 
D
G
 
A
D
 
-
E
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
D
E
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
T
R
 
D
T
 
F
L
 
L
V
 
V
L
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
P
S
 
D
T
 
T
R
 
R
H
 
G
I
 
I
I
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
A
 
A
A
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
R
-
 
N
-
 
G
P
 
P
E
 
F
G
 
G
A
 
A
-
 
P
S
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
P
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
G
L
 
S
I
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
D
L
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
C
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
V
L
 
L
R
x
G
G
 
G
A
 
A
I
 
S
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
S
E
 
P
S
 
E
S
 
S
P
 
R
L
 
F
W
 
W
R
 
D
H
 
M
P
 
P
R
 
N
I
 
V
W
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
|
A
G
x
A
P
 
S
T
 
S
P
 
D
L
 
V
D
 
R
E
 
A
A
 
L
V
 
F
D
 
V
Q
 
H
V
 
V
A
 
E
E
 
H
A
 
Q
I
 
I
R
 
A
A
 
R
F
 
F
E
 
E
A
 
S
G
 
G
D
 
L
E
 
P
V
 
L
E
 
E
S
 
H
-
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
K
E
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

4weqA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc02828 (smghra) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and sulfate (see paper)
37% identity, 95% coverage: 16:311/311 of query aligns to 18:316/316 of 4weqA

query
sites
4weqA
A
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
G
R
 
A
L
 
F
P
 
P
G
 
G
A
 
R
E
 
E
I
 
V
V
 
I
T
 
D
A
 
L
D
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
A
D
 
H
K
 
Q
R
 
E
R
 
R
D
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
G
A
 
I
D
 
D
Y
 
Y
L
 
A
A
 
V
V
 
V
W
 
W
K
 
K
P
 
S
P
 
A
E
 
P
A
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
S
E
 
R
Q
 
A
T
 
P
R
 
D
A
 
L
R
 
K
G
 
V
I
 
V
V
 
F
N
 
S
L
 
G
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
H
L
 
V
L
 
L
S
 
T
N
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
-
G
 
D
V
 
V
P
 
P
I
 
L
V
 
V
K
x
R
L
 
F
R
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
T
M
x
L
A
 
T
E
 
T
L
 
R
I
x
M
G
 
S
D
 
E
Y
 
W
V
 
V
R
 
M
Y
 
M
G
 
Q
V
 
C
L
 
L
H
 
L
F
 
H
Q
 
L
R
 
R
D
 
Q
F
 
H
D
 
R
R
 
A
Y
 
Y
R
 
E
R
 
A
Q
 
L
Q
 
A
A
 
K
S
 
K
R
 
H
E
 
E
W
 
W
H
 
R
E
 
D
H
 
L
N
 
S
V
 
Q
T
 
P
A
 
E
K
 
A
R
 
A
D
 
D
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
M
G
 
G
L
x
M
G
|
G
A
x
V
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
A
A
 
R
M
 
K
I
 
L
A
 
A
A
 
A
D
 
M
G
 
G
F
 
F
P
 
K
V
 
V
H
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
|
S
P
 
K
K
x
R
S
 
V
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
E
C
 
T
H
 
Y
H
 
D
G
 
A
D
 
-
E
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
D
E
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
V
 
T
R
 
D
T
 
F
L
 
L
V
 
V
L
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
P
S
 
D
T
 
T
R
 
R
H
 
G
I
 
I
I
 
F
N
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
L
L
 
F
A
 
A
A
 
K
L
 
L
-
 
S
-
 
R
-
 
N
-
 
G
P
 
P
E
 
F
G
 
G
A
 
A
-
 
P
S
 
V
L
 
F
I
 
I
N
 
N
P
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
G
L
 
S
I
 
Q
D
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
D
L
 
I
L
 
L
A
 
E
A
 
C
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
D
E
 
S
G
 
G
R
 
V
L
 
L
R
x
G
G
 
G
A
 
A
I
 
S
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
R
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
S
E
 
P
S
 
E
S
 
S
P
 
R
L
 
F
W
 
W
R
 
D
H
 
M
P
 
P
R
 
N
I
 
V
W
 
Y
V
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
|
A
G
 
A
P
 
S
T
 
S
P
 
D
L
 
V
D
 
R
E
 
A
A
 
L
V
 
F
D
 
V
Q
 
H
V
 
V
A
 
E
E
 
H
A
 
Q
I
 
I
R
 
A
A
 
R
F
 
F
E
 
E
A
 
S
G
 
G
D
 
L
E
 
P
V
 
L
E
 
E
S
 
H
-
 
V
V
 
V
D
 
D
P
 
K
E
 
V
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

5bqfA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADP, hepes and l(+)-tartaric acid
33% identity, 90% coverage: 31:311/311 of query aligns to 34:317/317 of 5bqfA

query
sites
5bqfA
D
 
D
P
 
P
A
 
A
D
 
N
K
 
R
R
 
E
R
 
R
D
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
E
A
 
T
D
 
E
Y
 
Y
L
 
A
A
 
L
V
 
L
W
 
W
K
 
K
P
 
P
P
 
D
E
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
R
E
 
R
Q
 
A
T
 
P
R
 
N
A
 
L
R
 
K
G
 
V
I
 
I
V
 
F
N
 
S
L
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
G
N
 
M
P
 
A
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
-
G
 
D
V
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
V
K
x
R
L
 
F
R
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
S
M
 
L
A
 
T
E
 
T
L
 
R
I
x
M
G
 
S
D
 
E
Y
 
W
V
 
V
R
 
V
Y
 
M
G
 
Q
V
 
C
L
 
L
H
 
M
F
 
H
Q
 
L
R
 
R
D
 
G
F
 
Q
D
 
Y
R
 
G
Y
 
H
R
 
D
R
 
S
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
R
S
 
R
R
 
R
E
 
E
W
 
W
H
 
A
E
 
K
H
 
L
N
 
I
V
 
A
T
 
P
A
 
E
K
 
A
R
 
A
D
 
E
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
I
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
V
A
 
A
M
 
K
I
 
L
A
 
K
A
 
V
D
 
M
G
 
G
F
 
F
P
 
N
V
 
V
H
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
P
 
R
K
 
K
S
 
T
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
E
C
 
T
H
 
F
H
 
D
G
 
A
D
 
G
E
 
E
G
 
-
L
 
L
V
 
D
E
 
R
L
 
F
L
 
L
G
 
A
Q
 
K
V
 
T
R
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
T
H
 
G
I
 
F
I
 
Y
N
 
D
A
 
S
A
 
E
A
 
L
L
 
F
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
R
E
 
R
G
 
D
A
 
G
S
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
V
-
 
F
I
 
I
N
 
N
P
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
K
L
 
S
I
 
Q
D
 
I
E
 
E
A
 
T
A
 
D
L
 
I
L
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
V
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
T
L
 
L
R
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
T
S
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
E
H
 
L
P
 
E
R
 
N
I
 
V
W
 
F
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
D
A
 
A
G
x
A
P
 
V
T
 
S
P
 
E
L
 
E
D
 
N
E
 
A
A
 
L
V
 
F
D
 
R
Q
 
H
V
 
V
A
 
E
E
 
M
A
 
Q
I
 
I
R
 
A
A
 
R
F
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
P
V
 
L
E
 
Q
S
 
F
V
 
V
-
 
I
D
 
D
P
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

4xcvA Probable 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH
33% identity, 90% coverage: 31:311/311 of query aligns to 34:317/317 of 4xcvA

query
sites
4xcvA
D
 
D
P
 
P
A
 
A
D
 
N
K
 
R
R
 
E
R
 
R
D
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
E
A
 
T
D
 
E
Y
 
Y
L
 
A
A
 
L
V
 
L
W
 
W
K
 
K
P
 
P
P
 
D
E
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
R
E
 
R
Q
 
A
T
 
P
R
 
N
A
 
L
R
 
K
G
 
V
I
 
I
V
 
F
N
 
S
L
 
G
G
 
G
A
|
A
G
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
G
N
 
M
P
 
A
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
-
G
 
D
V
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
V
K
x
R
L
 
F
R
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
S
M
 
L
A
 
T
E
 
T
L
 
R
I
x
M
G
 
S
D
 
E
Y
 
W
V
 
V
R
 
V
Y
 
M
G
 
Q
V
 
C
L
 
L
H
 
M
F
 
H
Q
 
L
R
 
R
D
 
G
F
 
Q
D
 
Y
R
 
G
Y
 
H
R
 
D
R
 
S
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
R
S
 
R
R
 
R
E
 
E
W
 
W
H
 
A
E
 
K
H
 
L
N
 
I
V
 
A
T
 
P
A
 
E
K
 
A
R
 
A
D
 
E
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
I
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
V
A
 
A
M
 
K
I
 
L
A
 
K
A
 
V
D
 
M
G
 
G
F
 
F
P
 
N
V
 
V
H
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
P
 
R
K
|
K
S
 
T
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
E
C
 
T
H
 
F
H
 
D
G
 
A
D
 
G
E
 
E
G
 
-
L
 
L
V
 
D
E
 
R
L
 
F
L
 
L
G
 
A
Q
 
K
V
 
T
R
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
T
H
 
G
I
 
F
I
 
Y
N
 
D
A
 
S
A
 
E
A
 
L
L
 
F
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
R
E
 
R
G
 
D
A
 
G
S
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
V
-
 
F
I
 
I
N
 
N
P
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
K
L
 
S
I
 
Q
D
 
I
E
 
E
A
 
T
A
 
D
L
 
I
L
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
V
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
T
L
 
L
R
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
S
L
 
L
D
 
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
T
S
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
E
H
 
L
P
 
E
R
 
N
I
 
V
W
 
F
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
D
A
 
A
G
x
A
P
 
V
T
 
S
P
 
E
L
 
E
D
 
N
E
 
A
A
 
L
V
 
F
D
 
R
Q
 
H
V
 
V
A
 
E
E
 
M
A
 
Q
I
 
I
R
 
A
A
 
R
F
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
P
V
 
L
E
 
Q
S
 
F
V
 
V
-
 
I
D
 
D
P
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

5tsdA Crystal structure of NADPH-dependent 2-hydroxyacid dehydrogenase from rhizobium etli cfn 42 in complex with NADPH and oxalate
33% identity, 90% coverage: 31:311/311 of query aligns to 33:316/316 of 5tsdA

query
sites
5tsdA
D
 
D
P
 
P
A
 
A
D
 
N
K
 
R
R
 
E
R
 
R
D
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
E
A
 
T
D
 
E
Y
 
Y
L
 
A
A
 
L
V
 
L
W
|
W
K
 
K
P
 
P
P
 
D
E
 
A
A
 
D
L
 
L
L
 
F
A
 
R
E
 
R
Q
 
A
T
 
P
R
 
N
A
 
L
R
 
K
G
 
V
I
 
I
V
 
F
N
 
S
L
 
G
G
|
G
A
|
A
G
|
G
V
 
V
D
 
D
A
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
G
N
 
M
P
 
A
A
 
G
L
 
L
P
 
P
A
 
-
G
 
D
V
 
I
P
 
P
I
 
I
V
 
V
K
x
R
L
 
F
R
 
V
D
 
D
A
 
R
G
 
S
M
 
L
A
 
T
E
 
T
L
 
R
I
x
M
G
 
S
D
 
E
Y
 
W
V
 
V
R
 
V
Y
 
M
G
 
Q
V
 
C
L
 
L
H
 
M
F
 
H
Q
 
L
R
 
R
D
 
G
F
 
Q
D
 
Y
R
 
G
Y
 
H
R
 
D
R
 
S
Q
 
H
Q
 
Q
A
 
R
S
 
R
R
 
R
E
 
E
W
 
W
H
 
A
E
 
K
H
 
L
N
 
I
V
 
A
T
 
P
A
 
E
K
 
A
R
 
A
D
 
E
W
 
V
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
V
L
 
M
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
I
I
x
L
G
 
G
A
 
Q
R
 
D
V
 
A
A
 
V
A
 
A
M
 
K
I
 
L
A
 
K
A
 
V
D
 
M
G
 
G
F
 
F
P
 
N
V
 
V
H
 
I
G
 
G
W
|
W
S
|
S
R
|
R
S
x
T
P
 
R
K
|
K
S
 
T
L
 
I
E
 
E
G
 
G
I
 
V
T
 
E
C
 
T
H
 
F
H
 
D
G
 
A
D
 
G
E
 
E
G
 
-
L
 
L
V
 
D
E
 
R
L
 
F
L
 
L
G
 
A
Q
 
K
V
 
T
R
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
G
L
 
L
L
|
L
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
P
S
 
E
T
 
T
R
 
T
H
 
G
I
 
F
I
 
Y
N
 
D
A
 
S
A
 
E
A
 
L
L
 
F
A
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
R
E
 
R
G
 
D
A
 
G
S
 
A
L
 
L
-
 
G
-
 
Q
-
 
P
-
 
V
-
 
F
I
 
I
N
 
N
P
x
A
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
K
L
 
S
I
 
Q
D
 
I
E
 
E
A
 
T
A
 
D
L
 
I
L
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
V
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
T
L
 
L
R
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
S
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
V
E
|
E
P
 
P
L
 
L
P
 
A
E
 
T
S
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
E
H
 
L
P
 
E
R
 
N
I
 
V
W
 
F
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
D
A
 
A
G
 
A
P
 
V
T
 
S
P
 
E
L
 
E
D
 
N
E
 
A
A
 
L
V
 
F
D
 
R
Q
 
H
V
 
V
A
 
E
E
 
M
A
 
Q
I
 
I
R
 
A
A
 
R
F
 
F
E
 
E
A
 
R
G
 
G
D
 
E
E
 
P
V
 
L
E
 
Q
S
 
F
V
 
V
-
 
I
D
 
D
P
 
R
E
 
A
A
 
A
G
 
G
Y
|
Y

5mh6A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-ketohexanoic acid and NAD+ (1.35 a resolution)
33% identity, 68% coverage: 95:304/311 of query aligns to 93:303/306 of 5mh6A

query
sites
5mh6A
I
 
V
G
 
G
D
 
E
Y
 
T
V
 
V
R
 
A
Y
 
G
G
 
Y
V
 
M
L
 
L
H
 
T
F
 
F
Q
 
A
R
 
R
D
 
R
F
 
L
D
 
H
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
H
S
 
D
R
 
H
E
 
A
W
 
W
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
R
H
 
Y
E
 
E
H
 
E
N
 
P
V
 
F
T
|
T
A
 
L
K
x
A
R
 
G
D
 
E
W
 
R
P
 
-
V
 
V
G
 
C
V
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
G
|
G
A
x
T
I
x
L
G
 
G
A
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
D
M
 
R
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
L
G
 
G
F
 
M
P
 
E
V
 
V
H
 
V
G
 
G
W
 
V
S
 
R
R
|
R
S
 
S
P
 
G
K
 
D
S
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
N
I
 
V
T
 
S
C
 
T
H
 
V
H
 
Y
G
 
T
D
 
P
E
 
D
G
 
R
L
 
L
V
 
H
E
 
E
L
 
A
L
 
I
G
 
A
Q
 
D
V
 
A
R
 
R
T
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
A
L
 
T
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
D
S
 
E
T
|
T
R
 
E
H
 
G
I
 
M
I
 
V
N
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
E
L
x
F
A
x
E
A
 
T
L
x
M
P
 
R
E
 
E
G
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
P
x
V
G
x
A
R
|
R
G
|
G
S
x
P
L
 
V
I
x
V
D
 
V
E
|
E
A
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
D
E
 
S
G
 
G
E
x
D
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
V
F
 
F
P
x
S
E
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
D
H
 
F
P
 
E
R
 
D
I
 
V
W
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
x
S
G
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
S
L
 
K
-
x
Y
-
 
H
D
 
E
E
 
D
A
 
V
V
 
A
D
 
A
Q
 
L
V
 
I
A
 
R
E
 
E
A
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
K
F
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
L
E
 
T
S
 
N

Sites not aligning to the query:

5mhaB D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
33% identity, 68% coverage: 95:304/311 of query aligns to 95:305/308 of 5mhaB

query
sites
5mhaB
I
 
V
G
 
G
D
 
E
Y
 
T
V
 
V
R
 
A
Y
 
G
G
 
Y
V
 
M
L
 
L
H
 
T
F
 
F
Q
 
A
R
 
R
D
 
R
F
 
L
D
 
H
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
H
S
 
D
R
 
H
E
 
A
W
 
W
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
R
H
 
Y
E
 
E
H
 
E
N
 
P
V
 
F
T
 
T
A
 
L
K
 
A
R
 
G
D
 
E
W
 
R
P
 
-
V
 
V
G
 
C
V
 
V
L
 
V
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
T
I
x
L
G
 
G
A
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
D
M
 
R
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
L
G
 
G
F
 
M
P
 
E
V
 
V
H
 
V
G
 
G
W
 
V
S
x
R
R
|
R
S
|
S
P
 
G
K
 
D
S
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
N
I
 
V
T
 
S
C
 
T
H
 
V
H
 
Y
G
 
T
D
x
P
E
 
D
G
 
R
L
 
L
V
 
H
E
 
E
L
 
A
L
 
I
G
 
A
Q
 
D
V
 
A
R
 
R
T
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
A
L
x
T
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
D
S
 
E
T
|
T
R
 
E
H
 
G
I
 
M
I
 
V
N
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
E
L
x
F
A
x
E
A
 
T
L
x
M
P
 
R
E
 
E
G
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
P
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
P
L
 
V
I
 
V
D
 
V
E
 
E
A
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
D
E
 
S
G
 
G
E
x
D
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
V
F
 
F
P
 
S
E
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
D
H
 
F
P
 
E
R
 
D
I
 
V
W
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
x
S
G
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
S
L
 
K
-
x
Y
-
 
H
D
 
E
E
 
D
A
 
V
V
 
A
D
 
A
Q
 
L
V
 
I
A
 
R
E
 
E
A
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
K
F
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
L
E
 
T
S
 
N

Sites not aligning to the query:

5mhaA D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with a mixture of 2-ketohexanoic acid and 2-hydroxyhexanoic acid, and NADPH (1.57 a resolution)
33% identity, 68% coverage: 95:304/311 of query aligns to 95:305/308 of 5mhaA

query
sites
5mhaA
I
 
V
G
 
G
D
 
E
Y
 
T
V
 
V
R
 
A
Y
 
G
G
 
Y
V
 
M
L
 
L
H
 
T
F
 
F
Q
 
A
R
 
R
D
 
R
F
 
L
D
 
H
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
H
S
 
D
R
 
H
E
 
A
W
 
W
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
R
H
 
Y
E
 
E
H
 
E
N
 
P
V
 
F
T
|
T
A
 
L
K
x
A
R
 
G
D
 
E
W
 
R
P
 
-
V
 
V
G
 
C
V
 
V
L
 
V
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
T
I
x
L
G
 
G
A
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
D
M
 
R
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
L
G
 
G
F
 
M
P
 
E
V
 
V
H
 
V
G
 
G
W
 
V
S
x
R
R
|
R
S
|
S
P
 
G
K
 
D
S
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
N
I
 
V
T
 
S
C
 
T
H
 
V
H
 
Y
G
 
T
D
x
P
E
 
D
G
 
R
L
 
L
V
 
H
E
 
E
L
 
A
L
 
I
G
 
A
Q
 
D
V
 
A
R
 
R
T
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
A
L
x
T
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
D
S
 
E
T
|
T
R
 
E
H
 
G
I
 
M
I
 
V
N
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
E
L
 
F
A
 
E
A
 
T
L
 
M
P
 
R
E
 
E
G
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
P
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
P
L
 
V
I
 
V
D
 
V
E
 
E
A
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
D
E
 
S
G
 
G
E
 
D
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
V
F
 
F
P
 
S
E
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
D
H
 
F
P
 
E
R
 
D
I
 
V
W
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
x
S
G
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
S
L
 
K
-
x
Y
-
 
H
D
 
E
E
 
D
A
 
V
V
 
A
D
 
A
Q
 
L
V
 
I
A
 
R
E
 
E
A
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
K
F
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
L
E
 
T
S
 
N

Sites not aligning to the query:

5mh5A D-2-hydroxyacid dehydrogenases (d2-hdh) from haloferax mediterranei in complex with 2-keto-hexanoic acid and NADP+ (1.4 a resolution)
33% identity, 68% coverage: 95:304/311 of query aligns to 95:305/308 of 5mh5A

query
sites
5mh5A
I
 
V
G
 
G
D
 
E
Y
 
T
V
 
V
R
 
A
Y
 
G
G
 
Y
V
 
M
L
 
L
H
 
T
F
 
F
Q
 
A
R
 
R
D
 
R
F
 
L
D
 
H
R
 
A
Y
 
Y
R
 
R
R
 
D
Q
 
A
Q
 
Q
A
 
H
S
 
D
R
 
H
E
 
A
W
 
W
-
 
D
-
 
L
-
 
P
-
 
R
H
 
Y
E
 
E
H
 
E
N
 
P
V
 
F
T
|
T
A
 
L
K
x
A
R
 
G
D
 
E
W
 
R
P
 
-
V
 
V
G
 
C
V
 
V
L
 
V
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
T
I
x
L
G
 
G
A
 
R
R
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
D
M
 
R
I
 
A
A
 
A
A
 
A
D
 
L
G
 
G
F
 
M
P
 
E
V
 
V
H
 
V
G
 
G
W
 
V
S
x
R
R
|
R
S
|
S
P
 
G
K
 
D
S
 
P
L
 
V
E
 
D
G
 
N
I
 
V
T
 
S
C
 
T
H
 
V
H
 
Y
G
 
T
D
 
P
E
 
D
G
 
R
L
 
L
V
 
H
E
 
E
L
 
A
L
 
I
G
 
A
Q
 
D
V
 
A
R
 
R
T
 
F
L
 
V
V
 
V
L
 
L
L
 
A
L
x
T
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
D
S
 
E
T
|
T
R
 
E
H
 
G
I
 
M
I
 
V
N
 
A
A
 
A
A
 
P
A
 
E
L
x
F
A
x
E
A
 
T
L
x
M
P
 
R
E
 
E
G
 
D
A
 
A
S
 
S
L
 
L
I
 
V
N
 
N
P
x
V
G
x
A
R
|
R
G
 
G
S
 
P
L
 
V
I
 
V
D
 
V
E
 
E
A
 
S
A
 
D
L
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
G
 
D
E
 
S
G
 
G
E
x
D
Q
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
V
F
 
F
P
 
S
E
 
E
E
 
E
P
 
P
L
 
L
P
 
P
E
 
E
S
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
W
 
W
R
 
D
H
 
F
P
 
E
R
 
D
I
 
V
W
 
L
V
 
I
T
 
T
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
x
S
G
 
A
P
 
A
T
 
T
P
 
S
L
 
K
-
x
Y
-
 
H
D
 
E
E
 
D
A
 
V
V
 
A
D
 
A
Q
 
L
V
 
I
A
 
R
E
 
E
A
 
N
I
 
I
R
 
E
A
 
K
F
 
I
E
 
A
A
 
T
G
 
G
D
 
D
E
 
E
V
 
L
E
 
T
S
 
N

Sites not aligning to the query:

5v6qB Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and malonate (see paper)
37% identity, 56% coverage: 131:305/311 of query aligns to 141:310/319 of 5v6qB

query
sites
5v6qB
R
 
R
D
 
G
W
 
R
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
R
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
R
M
 
R
I
 
L
A
 
E
A
 
A
D
 
F
G
 
G
F
 
V
P
 
S
V
 
I
H
 
A
G
 
Y
W
 
H
S
x
T
R
|
R
S
 
T
P
 
P
K
 
R
S
 
E
L
 
G
E
 
L
G
 
G
I
 
F
T
 
T
C
 
Y
H
 
H
H
 
P
G
 
T
D
 
L
E
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
A
E
 
E
L
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
A
V
 
V
R
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
V
L
 
I
L
x
V
P
|
P
G
 
G
T
 
T
N
 
A
S
|
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
I
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
G
E
 
P
G
 
K
A
 
G
S
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
P
x
V
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
L
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
Q
E
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
N
E
|
E
P
 
P
-
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
A
S
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
L
R
 
S
H
 
F
P
 
P
R
 
N
I
 
V
W
 
S
V
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
|
A
G
 
S
P
 
A
T
 
S
P
 
V
L
 
V
-
 
T
-
 
R
D
 
N
E
 
A
A
 
M
V
 
S
D
 
D
Q
 
L
V
 
V
A
 
V
E
 
D
A
 
N
I
 
L
R
 
K
A
 
A
-
 
W
F
 
F
E
 
S
A
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
A
V
 
L
E
 
T
S
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5v7nA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADP and 2-keto-d-gluconic acid (see paper)
37% identity, 56% coverage: 131:305/311 of query aligns to 140:309/319 of 5v7nA

query
sites
5v7nA
R
 
R
D
 
G
W
 
R
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
R
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
R
M
 
R
I
 
L
A
 
E
A
 
A
D
 
F
G
 
G
F
 
V
P
 
S
V
 
I
H
 
A
G
 
Y
W
 
H
S
x
T
R
|
R
S
 
T
P
 
P
K
 
R
S
 
E
L
 
G
E
 
L
G
 
G
I
 
F
T
 
T
C
 
Y
H
 
H
H
 
P
G
 
T
D
 
L
E
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
A
E
 
E
L
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
A
V
 
V
R
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
V
L
 
I
L
x
V
P
|
P
G
 
G
T
 
T
N
 
A
S
|
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
I
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
G
E
 
P
G
 
K
A
 
G
S
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
P
x
V
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
L
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
Q
E
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
N
E
|
E
P
 
P
-
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
A
S
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
L
R
 
S
H
 
F
P
 
P
R
 
N
I
 
V
W
 
S
V
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
|
A
G
x
S
P
 
A
T
 
S
P
 
V
L
 
V
-
 
T
-
x
R
D
 
N
E
 
A
A
 
M
V
 
S
D
 
D
Q
 
L
V
 
V
A
 
V
E
 
D
A
 
N
I
 
L
R
 
K
A
 
A
-
 
W
F
 
F
E
 
S
A
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
A
V
 
L
E
 
T
S
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5v7gA Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with NADPH and oxalate (see paper)
37% identity, 56% coverage: 131:305/311 of query aligns to 139:308/317 of 5v7gA

query
sites
5v7gA
R
 
R
D
 
G
W
 
R
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
L
L
x
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
R
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
R
M
 
R
I
 
L
A
 
E
A
 
A
D
 
F
G
 
G
F
 
V
P
 
S
V
 
I
H
 
A
G
 
Y
W
 
H
S
x
T
R
|
R
S
 
T
P
 
P
K
 
R
S
 
E
L
 
G
E
 
L
G
 
G
I
 
F
T
 
T
C
 
Y
H
 
H
H
 
P
G
 
T
D
 
L
E
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
A
E
 
E
L
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
A
V
 
V
R
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
V
L
 
I
L
x
V
P
|
P
G
 
G
T
 
T
N
 
A
S
|
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
I
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
G
E
 
P
G
 
K
A
 
G
S
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
P
x
V
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
L
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
Q
E
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
N
E
|
E
P
 
P
-
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
A
S
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
L
R
 
S
H
 
F
P
 
P
R
 
N
I
 
V
W
 
S
V
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
|
A
G
 
S
P
 
A
T
 
S
P
 
V
L
 
V
-
 
T
-
 
R
D
 
N
E
 
A
A
 
M
V
 
S
D
 
D
Q
 
L
V
 
V
A
 
V
E
 
D
A
 
N
I
 
L
R
 
K
A
 
A
-
 
W
F
 
F
E
 
S
A
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
A
V
 
L
E
 
T
S
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

5j23A Crystal structure of NADPH-dependent glyoxylate/hydroxypyruvate reductase smc04462 (smghrb) from sinorhizobium meliloti in complex with 2'-phospho-adp-ribose (see paper)
37% identity, 56% coverage: 131:305/311 of query aligns to 139:308/318 of 5j23A

query
sites
5j23A
R
 
R
D
 
G
W
 
R
P
 
T
V
 
V
G
 
G
V
 
L
L
 
F
G
 
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
R
 
A
V
 
I
A
 
A
A
 
R
M
 
R
I
 
L
A
 
E
A
 
A
D
 
F
G
 
G
F
 
V
P
 
S
V
 
I
H
 
A
G
 
Y
W
 
H
S
x
T
R
|
R
S
 
T
P
 
P
K
 
R
S
 
E
L
 
G
E
 
L
G
 
G
I
 
F
T
 
T
C
 
Y
H
 
H
H
 
P
G
 
T
D
 
L
E
 
V
G
 
G
L
 
M
V
 
A
E
 
E
L
 
-
L
 
-
G
 
-
Q
 
A
V
 
V
R
 
D
T
 
T
L
 
L
V
 
I
L
 
V
L
 
I
L
 
V
P
|
P
G
 
G
T
 
T
N
 
A
S
|
S
T
|
T
R
 
L
H
 
K
I
 
A
I
 
V
N
 
N
A
 
A
A
 
D
A
 
V
L
 
L
A
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
G
E
 
P
G
 
K
A
 
G
S
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
P
 
V
G
 
G
R
|
R
G
 
G
S
 
S
L
 
T
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
Q
E
 
N
G
 
G
R
 
T
L
 
I
R
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
N
E
|
E
P
 
P
-
 
N
L
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
A
S
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
L
R
 
S
H
 
F
P
 
P
R
 
N
I
 
V
W
 
S
V
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
 
A
G
 
S
P
 
A
T
 
S
P
 
V
L
 
V
-
 
T
-
 
R
D
 
N
E
 
A
A
 
M
V
 
S
D
 
D
Q
 
L
V
 
V
A
 
V
E
 
D
A
 
N
I
 
L
R
 
K
A
 
A
-
 
W
F
 
F
E
 
S
A
 
T
G
 
G
D
 
E
E
 
A
V
 
L
E
 
T
S
 
P
V
 
V

Sites not aligning to the query:

3bazA Structure of hydroxyphenylpyruvate reductase from coleus blumei in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 57% coverage: 103:280/311 of query aligns to 113:282/311 of 3bazA

query
sites
3bazA
V
 
V
L
 
L
H
 
R
F
 
R
Q
 
I
R
 
C
D
 
E
F
 
C
D
 
D
R
 
K
Y
 
Y
R
 
V
R
 
R
Q
 
R
Q
 
G
A
 
A
S
 
W
R
 
K
E
 
-
W
 
F
H
 
G
E
 
D
H
 
F
N
 
K
V
 
L
T
 
T
A
 
T
K
 
K
R
 
F
D
 
S
W
 
G
P
 
K
-
 
R
V
 
V
G
 
G
V
 
I
L
 
I
G
|
G
L
|
L
G
|
G
A
x
R
I
|
I
G
 
G
A
 
L
R
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
E
M
 
R
I
 
A
A
 
E
A
 
A
D
 
F
G
 
D
F
 
C
P
 
P
V
 
I
H
 
S
G
 
Y
W
 
F
S
|
S
R
|
R
S
|
S
P
 
K
K
 
K
S
 
P
L
 
N
E
 
T
G
 
N
I
 
Y
T
 
T
C
 
-
H
 
Y
H
 
Y
G
 
G
D
 
S
E
 
-
G
 
-
L
 
V
V
 
V
E
 
E
L
 
L
L
 
A
G
 
S
Q
 
N
V
 
S
R
 
D
T
 
I
L
 
L
V
 
V
L
 
V
L
 
A
L
x
C
P
|
P
G
 
L
T
 
T
N
 
P
S
 
E
T
|
T
R
 
T
H
 
H
I
 
I
I
 
I
N
 
N
A
 
R
A
 
E
A
 
V
L
 
I
A
 
D
A
 
A
L
 
L
P
 
G
E
 
P
G
 
K
A
 
G
S
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
P
x
I
G
|
G
R
|
R
G
 
G
S
 
P
L
 
H
I
 
V
D
 
D
E
 
E
A
 
P
A
 
E
L
 
L
L
 
V
A
 
S
A
 
A
L
 
L
G
 
-
E
 
-
G
 
-
E
 
-
Q
 
V
E
 
E
G
 
G
R
 
R
L
 
L
R
 
G
G
 
G
A
|
A
I
 
G
L
 
L
D
|
D
A
 
V
F
 
F
P
 
E
E
 
R
E
|
E
P
 
P
-
 
E
L
 
V
P
 
P
E
 
E
S
 
K
S
 
-
P
 
-
L
 
L
W
 
F
R
 
G
H
 
L
P
 
E
R
 
N
I
 
V
W
 
V
V
 
L
T
 
L
P
 
P
H
|
H
M
 
V
A
x
G
G
 
S
P
 
G
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_086510087.1 NCBI__GCF_002151265.1:WP_086510087.1
MRILLHIDDIEAWRDALAERLPGAEIVTADDPADKRRDADYLAVWKPPEALLAEQTRARG
IVNLGAGVDALLSNPALPAGVPIVKLRDAGMAELIGDYVRYGVLHFQRDFDRYRRQQASR
EWHEHNVTAKRDWPVGVLGLGAIGARVAAMIAADGFPVHGWSRSPKSLEGITCHHGDEGL
VELLGQVRTLVLLLPGTNSTRHIINAAALAALPEGASLINPGRGSLIDEAALLAALGEGE
QEGRLRGAILDAFPEEPLPESSPLWRHPRIWVTPHMAGPTPLDEAVDQVAEAIRAFEAGD
EVESVDPEAGY

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory