SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_086510332.1 NCBI__GCF_002151265.1:WP_086510332.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
57% identity, 99% coverage: 3:241/242 of query aligns to 1:239/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
I
 
M
I
 
I
E
 
F
F
 
V
R
 
N
N
 
D
V
 
V
S
 
Y
K
 
K
H
 
N
F
|
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
K
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
E
 
G
V
 
V
D
 
T
L
 
L
T
 
K
I
 
V
D
 
N
R
 
K
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
E
I
 
P
T
 
T
G
 
K
G
 
G
D
 
E
L
 
V
V
 
F
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
V
S
 
K
V
 
I
L
 
N
A
 
N
G
 
G
N
 
K
A
 
V
R
 
N
L
 
I
R
 
N
E
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
Q
E
 
K
A
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
L
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
I
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
V
H
 
K
V
 
V
R
 
K
G
 
K
V
 
M
N
 
N
R
 
K
T
 
K
Q
 
E
A
 
A
R
 
E
E
 
E
Q
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
D
L
 
L
L
 
L
D
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
L
A
 
D
Q
 
K
A
 
K
E
 
D
Q
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
D
 
I
S
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
M
K
 
Q
P
 
P
K
 
E
V
 
V
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
K
 
V
Q
 
K
K
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
N
V
 
V
M
 
M
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
I
F
 
F
M
 
M
E
 
D
H
 
D
G
 
G
K
 
V
I
 
I
A
 
V
V
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
T
P
 
P
R
 
E
D
 
E
M
 
I
I
 
F
S
 
Y
A
 
R
P
 
A
T
 
K
N
 
N
P
 
E
R
 
R
L
 
T
K
 
R
D
 
E
F
 
F
L
 
L
R
 
S
H
 
K
V
 
I

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
56% identity, 100% coverage: 1:241/242 of query aligns to 1:241/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
L
S
 
Q
I
 
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
R
 
H
N
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
H
 
S
F
|
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
K
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
E
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
D
 
R
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
D
I
 
F
T
 
D
G
 
E
G
 
G
D
 
E
L
 
I
V
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
S
 
N
V
 
L
L
 
K
A
 
A
G
 
K
N
 
D
A
 
T
R
 
N
L
 
L
R
 
N
E
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
M
H
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
K
V
 
W
N
 
P
R
 
R
T
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
Q
 
K
A
 
A
E
 
H
Q
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
K
 
V
Q
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
S
V
 
V
M
 
M
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
E
 
D
H
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
A
 
I
V
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
M
 
L
I
 
F
S
 
D
A
 
R
P
 
P
T
 
Q
N
 
H
P
 
E
R
 
R
L
 
T
K
 
K
D
 
A
F
 
F
L
 
L
R
 
S
H
 
K
V
 
V

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
56% identity, 100% coverage: 1:241/242 of query aligns to 1:241/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
L
S
 
Q
I
 
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
R
 
H
N
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
H
 
S
F
|
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
K
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
E
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
D
 
R
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
D
I
 
F
T
 
D
G
 
E
G
 
G
D
 
E
L
 
I
V
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
S
 
N
V
 
L
L
 
K
A
 
A
G
 
K
N
 
D
A
 
T
R
 
N
L
 
L
R
 
N
E
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
M
H
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
K
V
 
W
N
 
P
R
 
R
T
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
Q
 
K
A
 
A
E
 
H
Q
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
K
 
V
Q
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
S
V
 
V
M
 
M
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
E
 
D
H
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
A
 
I
V
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
M
 
L
I
 
F
S
 
D
A
 
R
P
 
P
T
 
Q
N
 
H
P
 
E
R
 
R
L
 
T
K
 
K
D
 
A
F
 
F
L
 
L
R
 
S
H
 
K
V
 
V

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
56% identity, 100% coverage: 1:241/242 of query aligns to 1:241/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
L
S
 
Q
I
 
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
R
 
H
N
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
H
 
S
F
|
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
K
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
E
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
D
 
R
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
D
I
 
F
T
 
D
G
 
E
G
 
G
D
 
E
L
 
I
V
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
S
 
N
V
 
L
L
 
K
A
 
A
G
 
K
N
 
D
A
 
T
R
 
N
L
 
L
R
 
N
E
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
M
H
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
K
V
 
W
N
 
P
R
 
R
T
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
Q
 
K
A
 
A
E
 
H
Q
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
K
 
V
Q
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
S
V
 
V
M
 
M
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
E
 
D
H
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
A
 
I
V
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
M
 
L
I
 
F
S
 
D
A
 
R
P
 
P
T
 
Q
N
 
H
P
 
E
R
 
R
L
 
T
K
 
K
D
 
A
F
 
F
L
 
L
R
 
S
H
 
K
V
 
V

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
56% identity, 100% coverage: 1:241/242 of query aligns to 1:241/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
L
S
 
Q
I
 
M
I
 
I
E
 
D
F
 
V
R
 
H
N
 
Q
V
 
L
S
 
K
K
 
K
H
 
S
F
|
F
G
 
G
S
 
S
L
 
L
K
 
E
V
|
V
L
 
L
D
 
K
E
 
G
V
 
I
D
 
N
L
 
V
T
 
H
I
 
I
D
 
R
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
L
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
D
I
 
F
T
 
D
G
 
E
G
 
G
D
 
E
L
 
I
V
 
I
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
I
S
 
N
V
 
L
L
 
K
A
 
A
G
 
K
N
 
D
A
 
T
R
 
N
L
 
L
R
 
N
E
 
K
I
 
V
R
 
R
Q
 
E
E
 
E
A
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
R
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
N
N
 
N
V
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
M
H
 
K
V
 
V
R
 
R
G
 
K
V
 
W
N
 
P
R
 
R
T
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
M
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
D
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
D
Q
 
K
A
 
A
E
 
H
Q
 
A
Y
 
Y
P
 
P
D
 
D
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
A
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
K
 
V
Q
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
S
V
 
V
M
 
M
R
 
K
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
E
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
S
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
F
 
F
M
 
M
E
 
D
H
 
G
G
 
G
K
 
Y
I
 
I
A
 
I
V
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
K
P
 
P
R
 
E
D
 
D
M
 
L
I
 
F
S
 
D
A
 
R
P
 
P
T
 
Q
N
 
H
P
 
E
R
 
R
L
 
T
K
 
K
D
 
A
F
 
F
L
 
L
R
 
S
H
 
K
V
 
V

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
59% identity, 99% coverage: 3:241/242 of query aligns to 2:239/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
I
 
I
I
 
I
E
 
R
F
 
I
R
 
R
N
 
N
V
 
L
S
 
H
K
 
K
H
 
W
F
|
F
G
 
G
S
 
P
L
 
L
K
 
H
V
|
V
L
 
L
D
 
K
E
 
G
V
 
I
D
 
H
L
 
L
T
 
E
I
 
V
D
 
A
R
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
K
V
 
L
V
 
V
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
S
|
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
T
I
 
I
N
 
N
G
 
R
L
 
L
E
 
E
M
 
D
I
 
F
T
 
Q
G
 
E
G
 
G
D
 
E
L
 
V
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
L
 
L
S
 
S
V
 
V
L
 
K
A
 
D
G
 
D
N
 
R
A
 
A
R
 
-
L
 
L
R
 
R
E
 
E
I
 
I
R
 
R
Q
 
R
E
 
E
A
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
T
F
 
L
G
 
A
P
 
P
R
 
M
H
 
R
V
 
V
R
 
R
G
 
R
V
 
W
N
 
P
R
 
R
T
 
E
Q
 
K
A
 
A
R
 
E
E
 
K
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
E
K
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
 
L
A
 
D
Q
 
Q
A
 
A
E
 
R
Q
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
A
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
K
V
 
I
M
 
M
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
M
K
 
V
Q
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
D
V
 
V
M
 
M
R
 
R
T
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
Q
E
 
G
G
 
G
M
 
M
T
 
T
M
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
V
 
V
G
 
A
S
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
V
F
 
F
M
 
M
E
 
D
H
 
G
G
 
G
K
 
Q
I
 
I
A
 
V
V
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
R
P
 
P
R
 
E
D
 
E
M
 
I
I
 
F
S
 
T
A
 
R
P
 
P
T
 
K
N
 
E
P
 
E
R
 
R
L
 
T
K
 
R
D
 
S
F
 
F
L
 
L
R
 
Q
H
 
R
V
 
V

P02915 Histidine/lysine/arginine/ornithine transport ATP-binding protein HisP; EC 7.4.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
50% identity, 96% coverage: 8:239/242 of query aligns to 11:254/258 of P02915

query
sites
P02915
N
 
D
V
 
L
S
 
H
K
 
K
H
 
R
F
 
Y
G
 
G
S
 
G
L
 
H
K
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
K
E
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
Q
I
 
A
D
 
R
R
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
S
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
G
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
K
I
 
P
T
 
S
G
 
E
G
 
G
D
 
A
L
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
N
G
 
G
L
 
Q
S
 
N
V
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
D
N
 
K
A
 
N
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
L
I
 
L
R
 
R
Q
 
T
E
 
R
A
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
Q
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
M
F
 
E
G
 
A
P
 
P
R
 
I
H
 
Q
V
 
V
R
 
L
G
 
G
V
 
L
N
 
S
R
 
K
T
 
H
Q
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
Y
L
 
L
D
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
 
D
A
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
Q
-
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
V
S
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
D
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
V
Q
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
R
V
 
I
M
 
M
R
 
Q
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
H
V
 
V
G
 
S
S
 
S
R
 
H
L
 
V
I
 
I
F
 
F
M
 
L
E
 
H
H
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
E
V
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
E
D
 
Q
M
 
V
I
 
F
S
 
G
A
 
N
P
 
P
T
 
Q
N
 
S
P
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
Q
D
 
Q
F
 
F
L
 
L
R
 
K

1b0uA Atp-binding subunit of the histidine permease from salmonella typhimurium (see paper)
50% identity, 96% coverage: 8:239/242 of query aligns to 7:250/258 of 1b0uA

query
sites
1b0uA
N
 
D
V
 
L
S
 
H
K
 
K
H
 
R
F
x
Y
G
 
G
S
 
G
L
x
H
K
 
E
V
 
V
L
 
L
D
 
K
E
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
Q
I
 
A
D
 
R
R
 
A
G
 
G
E
 
D
V
 
V
V
 
I
V
 
S
L
 
I
I
 
I
G
 
G
P
 
S
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
R
 
R
C
 
C
I
 
I
N
 
N
G
 
F
L
 
L
E
 
E
M
 
K
I
 
P
T
 
S
G
 
E
G
 
G
D
 
A
L
 
I
V
 
I
V
 
V
D
 
N
G
 
G
L
 
Q
S
 
N
V
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
D
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
Q
-
 
L
-
 
K
L
 
V
A
 
A
G
 
D
N
 
K
A
 
N
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
E
 
L
I
 
L
R
 
R
Q
 
T
E
 
R
A
 
L
G
 
T
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
W
P
 
S
Q
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
M
F
 
E
G
 
A
P
 
P
R
 
I
H
 
Q
V
 
V
R
 
L
G
 
G
V
 
L
N
 
S
R
 
K
T
 
H
Q
 
D
A
 
A
R
 
R
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
Y
L
 
L
D
 
A
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
I
K
 
D
A
 
E
Q
 
R
A
 
A
E
 
Q
-
 
G
Q
 
K
Y
 
Y
P
 
P
D
 
V
S
 
H
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
M
K
 
E
P
 
P
K
 
D
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
E
L
 
L
K
 
V
Q
 
G
K
 
E
V
 
V
L
 
L
N
 
R
V
 
I
M
 
M
R
 
Q
T
 
Q
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
M
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
G
F
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
H
V
 
V
G
 
S
S
 
S
R
 
H
L
 
V
I
 
I
F
 
F
M
 
L
E
 
H
H
 
Q
G
 
G
K
 
K
I
 
I
A
 
E
V
 
E
D
 
E
G
 
G
D
 
D
P
 
P
R
 
E
D
 
Q
M
 
V
I
 
F
S
 
G
A
 
N
P
 
P
T
 
Q
N
 
S
P
 
P
R
 
R
L
 
L
K
 
Q
D
 
Q
F
 
F
L
 
L
R
 
K

5lilA Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atpys (p21) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 1:234/242 of query aligns to 1:238/615 of 5lilA

query
sites
5lilA
M
 
M
S
 
N
I
 
I
I
 
I
E
 
E
F
 
I
R
 
K
N
 
Q
V
 
L
S
 
N
K
 
R
H
 
Y
F
|
F
G
 
G
S
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
R
L
 
V
K
 
H
V
|
V
L
 
L
D
 
K
E
 
D
V
 
I
D
 
S
L
 
L
T
 
S
I
 
I
D
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
F
V
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
R
 
N
C
 
I
I
 
I
N
 
G
G
 
C
L
 
L
E
 
D
M
 
T
I
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
D
 
S
L
 
S
V
 
K
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
K
S
 
E
V
 
T
L
 
I
A
 
E
-
 
L
G
 
T
N
 
N
A
 
D
R
 
Q
L
 
L
R
 
S
E
 
D
I
 
L
R
 
R
-
 
S
Q
 
Q
E
 
K
A
 
F
G
 
G
M
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
R
F
 
Y
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
-
P
 
P
R
 
A
H
 
I
V
 
Y
R
 
A
G
 
G
V
 
M
N
 
P
R
 
Q
T
 
S
Q
 
Q
A
 
R
R
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
E
K
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
G
A
 
D
Q
x
K
A
 
W
E
 
Q
Q
 
N
Y
 
K
P
 
P
D
 
N
S
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
V
 
N
K
 
G
P
 
G
K
 
E
V
 
I
M
 
I
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
L
 
S
K
 
G
Q
 
E
K
 
N
V
 
V
L
 
M
N
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
R
T
 
Q
L
 
L
A
 
H
E
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
H
T
 
T
M
 
I
V
 
I
V
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
K
S
 
H
F
 
I
A
 
A
R
 
A
Q
 
S
V
 
-
G
 
A
S
 
N
R
 
R
L
 
I
I
 
I
F
 
E
M
 
I
E
 
K
H
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
I
A
 
I
V
 
S
D
 
D
G
 
T
D
 
Q
P
 
K
R
 
R
D
 
Q
M
 
V
I
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
V
T
 
K
N
 
N
P
 
P
R
 
S
L
 
V

5lj7A Structure of aggregatibacter actinomycetemcomitans macb bound to atp (p21) (see paper)
41% identity, 97% coverage: 1:234/242 of query aligns to 1:238/592 of 5lj7A

query
sites
5lj7A
M
 
M
S
 
N
I
 
I
I
 
I
E
 
E
F
 
I
R
 
K
N
 
Q
V
 
L
S
 
N
K
 
R
H
 
Y
F
 
F
G
 
G
S
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
N
-
 
R
L
 
V
K
 
H
V
|
V
L
 
L
D
 
K
E
 
D
V
 
I
D
 
S
L
 
L
T
 
S
I
 
I
D
 
E
R
 
R
G
 
G
E
 
D
V
 
F
V
 
V
V
 
A
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
Q
S
|
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
M
R
 
N
C
 
I
I
 
I
N
 
G
G
 
C
L
 
L
E
 
D
M
 
T
I
 
A
T
 
T
G
 
G
G
 
G
D
 
S
L
 
S
V
 
K
V
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
K
S
 
E
V
 
T
L
 
I
A
 
E
-
 
L
G
 
T
N
 
N
A
 
D
R
 
Q
L
 
L
R
 
S
E
 
D
I
 
L
R
 
R
-
 
S
Q
 
Q
E
 
K
A
 
F
G
 
G
M
 
F
V
 
I
F
 
F
Q
|
Q
Q
 
R
F
 
Y
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
Q
 
S
L
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
-
P
 
P
R
 
A
H
 
I
V
 
Y
R
 
A
G
 
G
V
 
M
N
 
P
R
 
Q
T
 
S
Q
 
Q
A
 
R
R
 
L
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
K
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
D
 
E
K
 
K
V
 
L
G
 
G
L
 
L
K
 
G
A
 
D
Q
x
K
A
 
W
E
 
Q
Q
 
N
Y
 
K
P
 
P
D
 
N
S
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
V
 
N
K
 
G
P
 
G
K
 
E
V
 
I
M
 
I
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
H
L
 
S
K
 
G
Q
 
E
K
 
N
V
 
V
L
 
M
N
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
R
T
 
Q
L
 
L
A
 
H
E
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
H
T
 
T
M
 
I
V
 
I
V
 
M
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
K
S
 
H
F
 
I
A
 
A
R
 
A
Q
 
S
V
 
-
G
 
A
S
 
N
R
 
R
L
 
I
I
 
I
F
 
E
M
 
I
E
 
K
H
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
I
A
 
I
V
 
S
D
 
D
G
 
T
D
 
Q
P
 
K
R
 
R
D
 
Q
M
 
V
I
 
K
S
 
S
A
 
A
P
 
V
T
 
K
N
 
N
P
 
P
R
 
S
L
 
V

P69874 Spermidine/putrescine import ATP-binding protein PotA; EC 7.6.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
38% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 17:252/378 of P69874

query
sites
P69874
I
 
L
I
 
V
E
 
Q
F
 
L
R
 
A
N
 
G
V
 
I
S
 
R
K
 
K
H
x
C
F
|
F
G
 
D
S
 
G
L
 
K
K
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
P
E
 
Q
V
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
D
 
N
R
 
N
G
 
G
E
 
E
V
x
F
V
 
L
V
 
T
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
x
C
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
L
 
V
L
|
L
R
 
R
C
 
L
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
T
I
 
V
T
 
D
G
 
S
G
 
G
D
 
R
L
 
I
V
 
M
V
x
L
D
 
D
G
 
N
L
 
E
S
 
D
V
 
I
L
 
T
A
 
H
G
 
V
N
 
P
A
 
A
R
 
E
L
 
N
R
 
R
E
 
Y
I
 
V
R
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
N
M
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
L
R
 
R
H
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
M
N
 
Q
R
 
K
T
 
T
Q
 
P
A
 
A
R
 
A
E
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
P
Q
 
R
A
 
V
L
 
M
A
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
R
K
 
M
V
|
V
G
 
Q
L
 
L
K
 
E
A
 
T
Q
 
F
A
 
A
E
 
Q
Q
 
R
Y
 
K
P
 
P
D
 
H
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
V
 
N
K
 
K
P
 
P
K
 
R
V
 
L
M
 
L
L
 
L
F
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
S
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
K
L
 
L
K
 
R
Q
 
K
K
 
Q
V
 
M
L
 
Q
N
 
N
V
 
E
M
 
L
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
E
 
K
-
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
T
M
 
F
V
 
V
V
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
S
 
E
F
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
T
V
 
M
G
 
S
S
 
D
R
 
R
L
 
I
I
 
V
F
 
V
M
 
M
E
 
R
H
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
I
A
 
E
V
 
Q
D
 
D
G
 
G
D
 
T
P
 
P
R
 
R
D
 
E
M
 
I
I
 
Y
S
 
E
A
 
E
P
 
P
T
 
K
N
 
N
P
 
L
R
 
F
L
 
V
K
 
A
D
 
G
F
 
F
L
 
I
R
 
G
H
 
E
V
 
I
H
 
N

Sites not aligning to the query:

8y5iA Cryo-em structure of e.Coli spermidine transporter potd-potabc in translocation intermidiate state (see paper)
38% identity, 99% coverage: 3:242/242 of query aligns to 2:237/358 of 8y5iA

query
sites
8y5iA
I
 
L
I
 
V
E
 
Q
F
 
L
R
 
A
N
 
G
V
 
I
S
 
R
K
 
K
H
 
C
F
|
F
G
 
D
S
 
G
L
x
K
K
 
E
V
 
V
L
 
I
D
 
P
E
 
Q
V
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
D
 
N
R
 
N
G
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
L
V
 
T
L
 
L
I
 
L
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
C
G
 
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
L
 
V
L
 
L
R
 
R
C
 
L
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
T
I
 
V
T
 
D
G
 
S
G
 
G
D
 
R
L
 
I
V
 
M
V
 
L
D
 
D
G
 
N
L
 
E
S
 
D
V
 
I
L
 
T
A
 
H
G
 
V
N
 
P
A
 
A
R
 
E
L
 
N
R
 
R
E
 
Y
I
 
V
R
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
N
M
 
T
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
 
L
F
 
F
P
 
P
Q
 
H
L
 
M
T
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
P
 
L
R
 
R
H
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
-
V
 
M
N
 
Q
R
 
K
T
 
T
Q
 
P
A
 
A
R
 
A
E
 
E
-
 
I
-
 
T
-
 
P
Q
 
R
A
 
V
L
 
M
A
 
E
L
 
A
L
 
L
D
 
R
K
 
M
V
 
V
G
 
Q
L
 
L
K
 
E
A
 
T
Q
 
F
A
 
A
E
 
Q
Q
x
R
Y
 
K
P
 
P
D
 
H
S
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
V
 
N
K
 
K
P
 
P
K
 
R
V
 
L
M
 
L
L
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
Q
P
 
S
T
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
Y
E
 
K
L
 
L
K
 
R
Q
 
K
K
 
Q
V
 
M
L
 
Q
N
 
N
V
 
E
M
 
L
R
 
K
T
 
A
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
E
 
K
-
 
L
G
 
G
M
 
I
T
 
T
M
 
F
V
 
V
V
 
F
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
S
 
E
F
 
E
A
 
A
R
 
L
Q
 
T
V
 
M
G
 
S
S
 
D
R
 
R
L
 
I
I
 
V
F
 
V
M
 
M
E
 
R
H
 
D
G
 
G
K
 
R
I
 
I
A
 
E
V
 
Q
D
 
D
G
 
G
D
 
T
P
 
P
R
 
R
D
 
E
M
 
I
I
 
Y
S
 
E
A
 
E
P
 
P
T
 
K
N
 
N
P
 
L
R
 
F
L
 
V
K
 
A
D
 
G
F
 
F
L
 
I
R
 
G
H
 
E
V
 
I
H
 
N

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
36% identity, 98% coverage: 3:239/242 of query aligns to 1:242/343 of P30750

query
sites
P30750
I
 
M
I
 
I
E
 
K
F
 
L
R
 
S
N
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
H
 
V
F
 
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
S
 
T
L
 
I
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
N
E
 
N
V
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
D
 
P
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
V
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
R
I
 
P
T
 
T
G
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
-
N
 
E
A
 
S
R
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
K
I
 
A
R
 
R
Q
 
R
E
 
Q
A
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
Q
 
S
L
 
R
T
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
-
P
 
P
R
 
L
H
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
N
V
 
T
N
 
P
R
 
K
T
 
D
Q
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
T
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
A
 
D
Q
 
K
A
 
H
E
 
D
Q
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
S
K
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
K
 
T
Q
 
R
K
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
E
V
 
L
M
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
Q
 
R
V
 
I
G
 
C
S
 
D
R
 
C
L
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
E
 
S
H
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
A
 
I
V
 
E
D
 
Q
G
 
D
D
 
T
P
 
V
R
 
S
D
 
E
M
 
V
I
 
F
S
 
S
A
 
H
P
 
P
T
 
K
N
 
T
P
 
P
R
 
L
L
 
A
K
 
Q
D
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
36% identity, 98% coverage: 3:239/242 of query aligns to 2:243/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
I
 
M
I
 
I
E
 
K
F
 
L
R
 
S
N
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
H
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
S
 
T
L
 
I
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
N
E
 
N
V
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
D
 
P
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
V
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
R
I
 
P
T
 
T
G
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
-
N
 
E
A
 
S
R
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
K
I
 
A
R
 
R
Q
 
R
E
 
Q
A
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
Q
 
S
L
 
R
T
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
-
P
 
P
R
 
L
H
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
N
V
 
T
N
 
P
R
 
K
T
 
D
Q
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
T
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
A
 
D
Q
 
K
A
 
H
E
 
D
Q
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
S
K
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
K
 
T
Q
 
R
K
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
E
V
 
L
M
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
Q
 
R
V
 
I
G
 
C
S
 
D
R
 
C
L
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
E
 
S
H
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
A
 
I
V
 
E
D
 
Q
G
 
D
D
 
T
P
 
V
R
 
S
D
 
E
M
 
V
I
 
F
S
 
S
A
 
H
P
 
P
T
 
K
N
 
T
P
 
P
R
 
L
L
 
A
K
 
Q
D
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
Q

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
36% identity, 98% coverage: 3:239/242 of query aligns to 2:243/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
I
 
M
I
 
I
E
 
K
F
 
L
R
 
S
N
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
H
 
V
F
|
F
G
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
S
 
T
L
 
I
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
N
E
 
N
V
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
D
 
P
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
V
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
 
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
R
I
 
P
T
 
T
G
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
-
N
 
E
A
 
S
R
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
K
I
 
A
R
 
R
Q
 
R
E
 
Q
A
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
Q
 
S
L
 
R
T
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
-
P
 
P
R
 
L
H
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
N
V
 
T
N
 
P
R
 
K
T
 
D
Q
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
T
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
A
 
D
Q
 
K
A
 
H
E
 
D
Q
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
S
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
S
K
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
K
 
T
Q
 
R
K
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
E
V
 
L
M
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
 
H
E
 
E
M
 
M
S
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
Q
 
R
V
 
I
G
 
C
S
 
D
R
 
C
L
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
E
 
S
H
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
A
 
I
V
 
E
D
 
Q
G
 
D
D
 
T
P
 
V
R
 
S
D
 
E
M
 
V
I
 
F
S
 
S
A
 
H
P
 
P
T
 
K
N
 
T
P
 
P
R
 
L
L
 
A
K
 
Q
D
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
Q

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
36% identity, 98% coverage: 3:239/242 of query aligns to 2:243/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
I
 
M
I
 
I
E
 
K
F
 
L
R
 
S
N
 
N
V
 
I
S
 
T
K
 
K
H
 
V
F
|
F
G
 
H
-
x
Q
-
 
G
-
 
T
-
 
R
S
 
T
L
x
I
K
 
Q
V
 
A
L
 
L
D
 
N
E
 
N
V
 
V
D
 
S
L
 
L
T
 
H
I
 
V
D
 
P
R
 
A
G
 
G
E
 
Q
V
 
I
V
 
Y
V
 
G
L
 
V
I
 
I
G
 
G
P
 
A
S
|
S
G
|
G
S
x
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
R
 
R
C
 
C
I
 
V
N
 
N
G
 
L
L
 
L
E
 
E
M
 
R
I
 
P
T
 
T
G
 
E
G
 
G
D
 
S
L
 
V
V
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
-
 
Q
-
 
E
L
 
L
S
 
T
V
 
T
L
 
L
A
 
S
G
 
-
N
 
E
A
 
S
R
 
E
L
 
L
R
 
T
E
 
K
I
 
A
R
 
R
Q
 
R
E
 
Q
A
 
I
G
 
G
M
 
M
V
 
I
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
H
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
L
P
 
S
Q
 
S
L
 
R
T
 
T
A
 
V
A
 
F
E
 
G
N
 
N
V
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
-
P
 
P
R
 
L
H
 
E
V
 
L
R
 
D
G
 
N
V
 
T
N
 
P
R
 
K
T
 
D
Q
 
E
A
 
V
R
 
K
E
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
T
A
 
E
L
 
L
L
 
L
D
 
S
K
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
G
A
 
D
Q
 
K
A
 
H
E
 
D
Q
 
S
Y
 
Y
P
 
P
D
 
S
S
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
Q
 
K
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
S
K
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
L
F
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
A
L
 
T
K
 
T
Q
 
R
K
 
S
V
 
I
L
 
L
N
 
E
V
 
L
M
 
L
R
 
K
T
 
D
L
 
I
A
 
N
E
 
R
E
 
R
-
 
L
G
 
G
M
 
L
T
 
T
M
 
I
V
 
L
V
 
L
V
 
I
T
 
T
H
|
H
E
 
E
M
 
M
S
 
D
F
 
V
A
 
V
R
 
K
Q
 
R
V
 
I
G
 
C
S
 
D
R
 
C
L
 
V
I
 
A
F
 
V
M
 
I
E
 
S
H
 
N
G
 
G
K
 
E
I
 
L
A
 
I
V
 
E
D
 
Q
G
 
D
D
 
T
P
 
V
R
 
S
D
 
E
M
 
V
I
 
F
S
 
S
A
 
H
P
 
P
T
 
K
N
 
T
P
 
P
R
 
L
L
 
A
K
 
Q
D
 
K
F
 
F
L
 
I
R
 
Q

P19566 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:238/242 of query aligns to 1:234/369 of P19566

query
sites
P19566
M
 
M
S
 
A
I
 
S
I
 
V
E
 
Q
F
 
L
R
 
R
N
 
N
V
 
V
S
 
T
K
 
K
H
 
A
F
 
W
G
 
G
S
 
D
L
 
V
K
 
V
V
 
V
L
 
S
D
 
K
E
 
D
V
 
I
D
 
N
L
 
L
T
 
D
I
 
I
D
 
H
R
 
D
G
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
T
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
E
A
 
T
R
 
R
L
 
M
R
 
N
E
 
D
I
 
I
-
 
P
-
 
P
-
 
A
R
 
E
Q
 
R
E
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
 
A
L
|
L
F
 
Y
P
 
P
Q
 
H
L
 
L
T
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
M
A
 
S
F
 
F
G
 
G
P
 
L
R
 
K
H
 
-
V
 
L
R
 
A
G
 
G
V
 
A
N
 
K
R
 
K
T
 
E
Q
 
V
A
 
M
R
 
N
E
 
Q
Q
 
R
A
 
V
L
 
N
A
 
Q
L
 
V
L
 
A
D
 
E
K
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
K
 
A
A
 
H
Q
 
L
A
 
L
E
 
E
Q
 
R
Y
 
K
P
 
P
D
 
K
S
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
V
 
A
K
 
E
P
 
P
K
 
R
V
 
V
M
 
F
L
 
L
F
 
L
D
 
D
E
 
E
P
|
P
T
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
|
D
P
 
A
E
 
A
L
 
L
K
 
R
-
 
V
Q
 
Q
K
 
M
V
 
R
L
 
I
N
 
E
V
 
I
M
 
S
R
 
R
T
 
L
L
 
H
A
 
K
E
 
R
E
 
L
G
 
G
M
 
R
T
 
T
M
 
M
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
S
 
V
F
 
E
A
 
A
R
 
M
Q
 
T
V
 
L
G
 
A
S
 
D
R
 
K
L
 
I
I
 
V
F
 
V
M
 
L
E
 
D
H
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
A
 
A
V
 
Q
D
 
V
G
 
G
D
 
K
P
 
P
R
 
L
D
 
E
M
 
L
I
 
Y
S
 
H
A
 
Y
P
 
P
T
 
A
N
 
D
P
 
R
R
 
F
L
 
V
K
 
A
D
 
G
F
 
F
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
41% identity, 88% coverage: 3:216/242 of query aligns to 1:223/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
I
 
M
I
 
I
E
 
K
F
 
L
R
 
K
N
 
N
V
 
V
S
 
T
K
 
K
H
 
T
F
x
Y
G
 
K
S
 
M
-
 
G
-
 
E
-
 
E
-
 
I
L
 
I
K
 
Y
V
 
A
L
 
L
D
 
K
E
 
N
V
 
V
D
 
N
L
 
L
T
 
N
I
 
I
D
 
K
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
V
 
S
L
 
I
I
 
M
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
M
L
 
L
R
 
N
C
 
I
I
 
I
N
 
G
G
 
C
L
 
L
E
 
D
M
 
K
I
 
P
T
 
T
G
 
E
G
 
G
D
 
E
L
 
V
V
 
Y
V
 
I
D
 
D
G
 
N
L
 
I
S
 
K
V
 
T
-
 
N
-
 
D
L
 
L
A
 
D
G
 
D
N
 
D
A
 
E
R
 
L
L
 
T
R
 
K
E
 
I
I
 
R
R
 
R
Q
 
D
E
 
K
A
 
I
G
 
G
M
 
F
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
F
 
F
N
 
N
L
 
L
F
 
I
P
 
P
Q
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
A
 
L
E
 
E
N
 
N
V
 
V
A
 
E
F
 
L
G
 
-
P
 
P
-
 
L
-
 
I
-
 
F
R
 
K
H
 
Y
V
 
R
R
 
G
G
 
A
V
 
M
N
 
S
R
 
G
T
 
E
Q
 
E
A
 
R
R
 
R
E
 
K
Q
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
E
L
 
C
L
 
L
D
 
K
K
 
M
V
 
A
G
 
E
L
 
L
K
 
E
A
 
E
Q
 
R
-
 
F
A
 
A
E
 
N
Q
 
H
Y
 
K
P
 
P
D
 
N
S
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
N
K
 
N
P
 
P
K
 
P
V
 
I
M
 
I
L
 
L
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
S
E
 
K
L
 
T
K
 
G
Q
 
E
K
 
K
V
 
I
L
 
M
N
 
Q
V
 
L
M
 
L
R
 
K
T
 
K
L
 
L
A
 
N
E
 
E
E
 
E
-
 
D
G
 
G
M
 
K
T
 
T
M
 
V
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
I
S
 
N
F
 
V
A
 
A
R
 
R
Q
 
-
V
 
F
G
 
G
S
 
E
R
 
R
L
 
I
I
 
I
F
 
Y
M
 
L
E
 
K
H
 
D
G
 
G
K
 
E
I
 
V

P68187 Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein MalK; EC 7.5.2.1 from Escherichia coli (strain K12) (see 5 papers)
36% identity, 98% coverage: 1:238/242 of query aligns to 1:234/371 of P68187

query
sites
P68187
M
 
M
S
 
A
I
 
S
I
 
V
E
 
Q
F
 
L
R
 
Q
N
 
N
V
 
V
S
 
T
K
 
K
H
 
A
F
 
W
G
 
G
S
 
E
L
 
V
K
 
V
V
 
V
L
 
S
D
 
K
E
 
D
V
 
I
D
 
N
L
 
L
T
 
D
I
 
I
D
 
H
R
 
E
G
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
V
V
 
V
L
 
F
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
S
 
C
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
R
 
R
C
 
M
I
 
I
N
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
M
 
T
I
 
I
T
 
T
G
 
S
G
 
G
D
 
D
L
 
L
V
 
F
V
 
I
D
 
-
G
 
-
L
 
-
S
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
N
 
E
A
 
K
R
 
R
L
 
M
R
 
N
E
 
D
I
 
T
-
 
P
-
 
P
-
 
A
R
 
E
Q
 
R
E
 
G
A
 
V
G
 
G
M
 
M
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
S
F
 
Y
N
x
A
L
 
L
F
 
Y
P
 
P
Q
 
H
L
 
L
T
 
S
A
 
V
A
 
A
E
 
E
N
 
N
V
 
M
A
 
S
F
 
F
G
 
G
P
 
L
R
 
K
H
 
-
V
 
L
R
 
A
G
 
G
V
 
A
N
x
K
R
 
K
T
 
E
Q
 
V
A
 
I
R
 
N
E
 
Q
Q
 
R
A
x
V
L
 
N
A
 
Q
L
x
V
L
 
A
D
x
E
K
 
V
V
 
L
G
 
Q
L
 
L
K
x
A
A
 
H
Q
 
L
A
 
L
E
 
D
Q
 
R
Y
 
K
P
 
P
D
 
K
S
 
A
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
Q
Q
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
I
 
I
A
 
G
R
 
R
A
 
T
L
 
L
A
 
V
V
 
A
K
 
E
P
 
P
K
 
S
V
 
V
M
 
F
L
 
L
F
 
L
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
L
S
 
S
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
A
E
 
A
L
 
L
K
 
R
-
 
V
Q
 
Q
K
 
M
V
 
R
L
 
I
N
 
E
V
 
I
M
 
S
R
 
R
T
 
L
L
 
H
A
 
K
E
 
R
E
 
L
G
 
G
M
 
R
T
 
T
M
 
M
V
 
I
V
 
Y
V
 
V
T
 
T
H
 
H
E
 
D
M
 
Q
S
 
V
F
 
E
A
 
A
R
 
M
Q
 
T
V
 
L
G
 
A
S
 
D
R
 
K
L
 
I
I
 
V
F
 
V
M
 
L
E
 
D
H
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
V
A
 
A
V
 
Q
D
 
V
G
 
G
D
 
K
P
 
P
R
 
L
D
 
E
M
 
L
I
 
Y
S
 
H
A
 
Y
P
 
P
T
 
A
N
 
D
P
x
R
R
 
F
L
 
V
K
 
A
D
 
G
F
 
F
L
 
I

Sites not aligning to the query:

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
36% identity, 90% coverage: 1:219/242 of query aligns to 1:220/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
M
 
M
S
 
S
I
 
I
I
 
I
E
 
E
F
 
M
R
 
R
N
 
D
V
 
V
S
 
V
K
 
K
H
 
K
F
x
Y
G
 
D
S
 
N
-
 
G
L
x
T
K
 
T
V
x
A
L
 
L
D
 
R
E
 
G
V
 
V
D
 
S
L
 
V
T
 
S
I
 
V
D
 
Q
R
 
P
G
 
G
E
 
E
V
 
F
V
 
A
V
 
Y
L
 
I
I
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
|
G
S
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
R
 
R
C
 
S
I
 
L
N
 
Y
G
 
R
L
 
E
E
 
V
M
 
K
I
 
I
T
 
D
G
 
K
G
 
G
D
 
S
L
 
L
V
 
S
V
 
V
D
 
A
G
 
G
L
 
F
S
 
N
V
 
L
L
 
V
A
 
K
G
 
I
N
 
K
A
 
K
R
 
K
-
 
D
L
 
V
R
 
P
E
 
L
I
 
L
R
 
R
Q
 
R
E
 
S
A
 
V
G
 
G
M
 
V
V
 
V
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
D
F
 
Y
N
 
K
L
 
L
F
 
L
P
 
P
Q
 
K
L
 
K
T
 
T
A
 
V
A
 
Y
E
 
E
N
 
N
V
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
A
P
 
-
R
 
M
H
 
E
V
 
V
R
 
I
G
 
G
V
 
E
N
 
N
R
 
R
T
 
R
Q
 
N
A
 
I
R
 
K
E
 
R
Q
 
R
A
 
V
L
 
M
A
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
D
K
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
K
 
K
A
 
H
Q
 
K
A
 
V
E
 
R
Q
 
S
Y
 
F
P
 
P
D
 
N
S
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
E
Q
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
V
 
N
K
 
N
P
 
P
K
 
K
V
 
V
M
 
L
L
 
I
F
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
G
A
 
N
L
 
L
D
 
D
P
 
P
E
 
D
L
 
N
K
 
S
Q
 
W
K
 
E
V
 
I
L
 
M
N
 
N
V
 
L
M
 
L
R
 
E
T
 
R
L
 
I
A
 
N
E
 
L
E
 
Q
G
 
G
M
 
T
T
 
T
M
 
I
V
 
L
V
 
M
V
 
A
T
 
T
H
 
H
E
 
N
M
 
S
S
 
Q
F
 
I
A
 
V
R
 
N
Q
 
T
V
 
L
G
 
R
S
 
H
R
 
R
L
 
V
I
 
I
F
 
A
M
 
I
E
 
E
H
 
N
G
 
G
K
 
R
I
 
V
A
 
V
V
 
R
D
 
D

Query Sequence

>WP_086510332.1 NCBI__GCF_002151265.1:WP_086510332.1
MSIIEFRNVSKHFGSLKVLDEVDLTIDRGEVVVLIGPSGSGKSTLLRCINGLEMITGGDL
VVDGLSVLAGNARLREIRQEAGMVFQQFNLFPQLTAAENVAFGPRHVRGVNRTQAREQAL
ALLDKVGLKAQAEQYPDSLSGGQQQRVAIARALAVKPKVMLFDEPTSALDPELKQKVLNV
MRTLAEEGMTMVVVTHEMSFARQVGSRLIFMEHGKIAVDGDPRDMISAPTNPRLKDFLRH
VH

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory