SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_086510656.1 NCBI__GCF_002151265.1:WP_086510656.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P08955 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Mesocricetus auratus (Golden hamster) (see paper)
44% identity, 92% coverage: 1:314/342 of query aligns to 1922:2222/2225 of P08955

query
sites
P08955
M
 
V
S
 
G
R
 
Q
H
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
K
S
 
Q
L
 
F
T
 
T
R
 
K
D
 
D
S
 
Q
V
 
M
N
 
S
H
 
H
L
 
L
M
 
F
H
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
H
R
 
T
M
 
L
E
 
R
P
 
M
I
 
M
A
 
V
Q
 
Q
R
 
K
R
 
E
Q
 
R
V
 
S
T
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
H
 
A
T
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
C
 
L
D
 
S
T
 
F
T
 
S
G
 
E
F
 
A
T
 
T
F
 
-
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
Q
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
S
 
V
R
 
Q
V
 
T
M
 
M
S
 
S
G
 
C
Y
 
Y
C
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
P
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
H
T
 
C
H
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
R
K
 
E
E
 
E
F
 
L
T
 
G
R
 
T
L
 
V
G
 
N
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
M
H
 
T
V
 
I
L
 
T
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
C
L
 
L
L
 
L
S
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
D
 
-
P
 
-
M
 
-
R
 
R
I
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
Y
V
 
V
A
 
A
P
 
P
P
 
P
G
 
S
L
 
L
E
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
S
L
 
V
I
 
W
D
 
D
L
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
H
 
T
R
 
K
I
 
Q
E
 
E
Q
 
E
R
 
F
T
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
A
Y
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
-
 
G
-
 
S
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
M
 
Y
S
 
E
E
 
A
G
 
C
F
 
F
S
 
G
L
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
Q
F
 
F
T
 
I
V
 
L
D
 
T
R
 
P
A
 
H
F
 
I
M
 
M
D
 
-
K
 
T
R
 
R
C
 
A
G
 
K
R
 
K
D
 
K
T
 
M
I
 
V
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
N
G
 
G
I
 
M
P
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
V
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5g1nE Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to pala (see paper)
44% identity, 91% coverage: 3:314/342 of query aligns to 6:304/307 of 5g1nE

query
sites
5g1nE
R
 
Q
H
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
S
 
Q
L
 
F
T
 
T
R
 
K
D
 
D
S
 
Q
V
 
M
N
 
S
H
 
H
L
 
L
M
 
F
H
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
H
R
 
T
M
 
L
E
 
R
P
 
M
I
 
M
A
 
V
Q
 
Q
R
 
K
R
 
E
Q
 
R
V
 
S
T
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
H
 
A
T
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
C
 
L
D
 
S
T
 
F
T
 
S
G
 
E
F
 
A
T
 
T
F
 
-
S
 
S
S
|
S
M
 
V
A
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
S
 
V
R
 
Q
V
 
T
M
 
M
S
 
S
G
 
C
Y
 
Y
C
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
V
M
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
P
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
H
T
 
C
H
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
R
K
 
E
E
 
E
F
 
L
T
 
G
R
 
T
L
 
V
G
 
N
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
M
H
 
T
V
 
I
L
 
T
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
C
L
 
L
L
 
L
S
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
D
 
-
P
 
-
M
 
-
R
 
R
I
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
Y
V
 
V
A
 
A
P
 
P
P
 
P
G
 
S
L
 
L
E
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
T
L
 
V
I
 
R
D
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
R
 
R
G
 
G
H
 
T
R
 
K
I
 
Q
E
 
E
Q
 
E
R
 
F
T
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
A
Y
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
-
 
G
-
 
S
T
 
T
A
 
Q
E
 
E
M
 
Y
S
 
E
E
 
A
G
 
C
F
 
F
S
 
G
L
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
Q
F
 
F
T
 
I
V
 
L
D
 
T
R
 
P
A
 
H
F
 
I
M
 
M
D
 
T
K
 
-
R
 
R
C
 
A
G
 
K
R
 
K
D
 
K
T
 
M
I
 
V
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
x
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
N
G
|
G
I
 
M
P
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
V
L
 
L

P27708 Multifunctional protein CAD; Carbamoyl phosphate synthetase 2-aspartate transcarbamylase-dihydroorotase; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
44% identity, 92% coverage: 1:314/342 of query aligns to 1922:2222/2225 of P27708

query
sites
P27708
M
x
V
S
x
G
R
x
Q
H
|
H
L
x
I
L
|
L
S
|
S
V
|
V
D
x
Q
S
x
Q
L
x
F
T
|
T
R
x
K
D
|
D
S
x
Q
V
x
M
N
x
S
H
|
H
L
|
L
M
x
F
H
x
N
V
|
V
A
|
A
A
x
H
R
x
T
M
x
L
E
x
R
P
x
M
I
x
M
A
x
V
Q
|
Q
R
x
K
R
x
E
Q
x
R
V
x
S
T
x
L
R
x
D
V
x
I
L
|
L
E
x
K
G
|
G
A
x
K
V
|
V
L
x
M
G
x
A
N
x
S
L
x
M
F
|
F
F
x
Y
E
|
E
A
x
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
x
S
V
x
S
S
|
S
F
|
F
H
x
A
T
x
A
A
|
A
F
x
M
C
x
A
R
|
R
L
|
L
G
|
G
G
|
G
S
x
A
V
|
V
C
x
L
D
x
S
T
x
F
T
x
S
G
x
E
F
x
A
T
|
T
F
 
-
S
|
S
S
|
S
M
x
V
A
x
Q
K
|
K
G
|
G
E
|
E
S
|
S
L
|
L
Y
x
A
D
|
D
T
x
S
S
x
V
R
x
Q
V
x
T
M
|
M
S
|
S
G
x
C
Y
|
Y
C
x
A
D
|
D
A
x
V
I
x
V
V
|
V
M
x
L
R
|
R
H
|
H
P
|
P
D
x
Q
Q
x
P
G
|
G
S
x
A
V
|
V
A
x
E
E
x
L
F
x
A
A
|
A
A
x
K
A
x
H
T
x
C
H
x
R
V
x
R
P
|
P
V
|
V
I
|
I
N
|
N
G
x
A
G
|
G
D
|
D
G
|
G
P
x
V
G
|
G
E
|
E
H
|
H
P
|
P
S
x
T
Q
|
Q
A
|
A
L
|
L
L
|
L
D
|
D
F
x
I
Y
x
F
T
|
T
I
|
I
D
x
R
K
x
E
E
|
E
F
x
L
T
x
G
R
x
T
L
x
V
G
x
N
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
|
G
A
x
M
H
x
T
V
x
I
L
x
T
L
x
M
T
x
V
G
|
G
D
|
D
L
|
L
K
|
K
Y
x
H
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
|
V
H
|
H
S
|
S
L
|
L
I
x
A
K
x
C
L
|
L
L
|
L
S
x
T
L
x
Q
Y
|
Y
D
 
-
P
 
-
M
 
-
R
|
R
I
x
V
T
x
S
L
|
L
-
x
R
-
x
Y
V
|
V
A
|
A
P
|
P
P
|
P
G
x
S
L
|
L
E
x
R
M
|
M
P
|
P
D
x
P
Y
x
T
L
x
V
I
x
R
D
x
A
L
x
F
V
|
V
A
|
A
S
|
S
R
|
R
G
|
G
H
x
T
R
x
K
I
x
Q
E
|
E
Q
x
E
R
x
F
T
x
E
S
|
S
L
x
I
A
x
E
D
x
E
D
x
A
Y
x
L
A
x
P
D
|
D
V
x
T
D
|
D
V
|
V
V
x
L
Y
|
Y
T
x
M
T
|
T
R
|
R
I
|
I
Q
|
Q
K
|
K
E
|
E
R
|
R
F
|
F
-
x
G
-
x
S
T
|
T
A
x
Q
E
|
E
M
x
Y
S
x
E
E
x
A
G
x
C
F
|
F
S
x
G
L
 
-
S
 
-
R
 
-
D
x
Q
F
|
F
T
x
I
V
x
L
D
x
T
R
x
P
A
x
H
F
x
I
M
|
M
D
 
-
K
x
T
R
|
R
C
x
A
G
x
K
R
x
K
D
x
K
T
x
M
I
x
V
V
|
V
M
|
M
H
|
H
P
|
P
L
x
M
P
|
P
R
|
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
x
V
N
|
N
D
x
E
L
x
I
D
x
S
V
|
V
D
x
E
L
x
V
N
x
D
G
x
S
D
|
D
P
|
P
R
|
R
L
x
A
A
|
A
I
x
Y
F
|
F
R
|
R
Q
|
Q
T
x
A
D
x
E
N
|
N
G
|
G
I
x
M
P
x
Y
V
x
I
R
|
R
M
|
M
A
|
A
I
x
L
F
x
L
A
|
A
T
|
T
L
x
V
L
|
L

Sites not aligning to the query:

4eknB Structure of the catalytic chain of methanococcus jannaschii aspartate transcarbamoylase in a hexagonal crystal form (see paper)
41% identity, 92% coverage: 3:318/342 of query aligns to 2:304/304 of 4eknB

query
sites
4eknB
R
 
K
H
 
H
L
 
L
L
 
I
S
 
S
V
 
M
D
 
K
S
 
D
L
 
I
T
 
G
R
 
K
D
 
E
S
 
E
V
 
I
N
 
L
H
 
E
L
 
I
M
 
L
H
 
D
V
 
E
A
 
A
A
 
R
R
 
K
M
 
M
E
 
E
P
 
E
I
 
L
A
 
L
Q
 
N
R
 
T
R
 
K
Q
 
R
V
 
P
T
 
L
R
 
K
V
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
A
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
T
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
I
D
 
T
T
 
M
T
 
T
G
 
D
F
 
L
T
 
K
F
 
S
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
I
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
G
Y
 
Y
C
 
A
D
 
D
A
 
I
I
 
I
V
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
S
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
S
A
 
E
A
 
Y
T
 
S
H
 
Q
V
 
V
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
D
 
M
K
 
R
E
 
E
F
 
I
T
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
I
H
 
K
V
 
I
L
 
A
L
 
F
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
|
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
V
K
 
Y
L
 
A
L
 
L
S
 
S
L
 
L
Y
 
F
D
 
E
P
 
N
M
 
V
R
 
E
I
 
M
T
 
Y
L
 
F
V
 
V
A
 
S
P
 
P
P
 
K
G
 
E
L
 
L
E
 
R
M
 
L
P
 
P
D
 
K
Y
 
D
L
 
I
I
 
I
D
 
E
L
 
D
V
 
L
A
 
K
S
 
A
R
 
K
G
 
N
H
 
I
R
 
K
I
 
F
E
 
Y
Q
 
E
R
 
K
T
 
E
S
 
S
L
 
L
A
 
D
D
 
D
D
 
L
Y
 
D
A
 
D
D
 
D
V
 
I
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
T
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
-
A
 
P
E
 
D
M
 
P
S
 
N
E
 
E
G
 
Y
F
 
E
S
 
K
L
 
V
S
 
K
R
 
G
D
 
S
F
 
Y
T
 
K
V
 
I
D
 
K
R
 
R
A
 
E
F
 
Y
M
 
V
D
 
E
K
 
-
R
 
-
C
 
-
G
 
G
R
 
K
D
 
K
T
 
F
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
D
V
 
Y
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
D
D
 
L
P
 
P
R
 
Q
L
 
A
A
 
K
I
 
Y
F
 
F
R
 
K
Q
 
Q
T
 
S
D
 
F
N
 
Y
G
|
G
I
 
I
P
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
I
F
 
L
A
 
K
T
 
K
L
 
L
L
 
I
Q
 
E
V
 
D
D
 
N
E
 
E

5g1pA Aspartate transcarbamoylase domain of human cad bound to carbamoyl phosphate (see paper)
43% identity, 91% coverage: 3:314/342 of query aligns to 3:289/292 of 5g1pA

query
sites
5g1pA
R
 
Q
H
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
Q
S
 
Q
L
 
F
T
 
T
R
 
K
D
 
D
S
 
Q
V
 
M
N
 
S
H
 
H
L
 
L
M
 
F
H
 
N
V
 
V
A
 
A
A
 
H
R
 
T
M
 
L
E
 
R
P
 
M
I
 
M
A
 
V
Q
 
Q
R
 
K
R
 
E
Q
 
R
V
 
S
T
 
L
R
 
D
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
M
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
V
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
S
V
 
S
S
 
S
F
 
F
H
 
A
T
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
A
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
C
 
L
D
 
S
T
 
F
T
 
S
G
 
E
F
 
A
T
 
T
F
 
-
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
Q
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
S
S
 
V
R
 
Q
V
 
T
M
 
M
S
 
S
G
 
C
Y
 
Y
C
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
V
M
 
L
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
P
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
E
E
 
L
F
 
A
A
 
A
A
 
K
A
 
H
T
 
C
H
 
R
V
 
R
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
R
K
 
E
E
 
E
F
 
L
T
 
G
R
 
T
L
 
V
G
 
N
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
M
H
 
T
V
 
I
L
 
T
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
C
L
 
L
L
 
L
S
 
T
L
 
Q
Y
 
Y
D
 
-
P
 
-
M
 
-
R
 
R
I
 
V
T
 
S
L
 
L
-
 
R
-
 
Y
V
 
V
A
 
A
P
 
P
P
 
P
G
 
S
L
 
L
E
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
P
Y
 
T
L
 
V
I
 
R
D
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
A
S
 
S
R
 
-
G
 
G
H
 
T
R
 
K
I
 
Q
E
 
E
Q
 
E
R
 
F
T
 
E
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
A
Y
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
-
A
 
-
E
 
-
M
 
-
S
 
-
E
 
-
G
 
-
F
 
-
S
 
-
L
 
-
S
 
-
R
 
-
D
 
Q
F
 
F
T
 
I
V
 
L
D
 
T
R
 
P
A
 
H
F
 
I
M
 
M
D
 
T
K
 
-
R
 
R
C
 
A
G
 
K
R
 
K
D
 
K
T
 
M
I
 
V
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
x
M
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
N
D
 
E
L
 
I
D
 
S
V
 
V
D
 
E
L
 
V
N
 
D
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
N
G
|
G
I
 
M
P
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
T
L
 
V
L
 
L

1ml4A The pala-liganded aspartate transcarbamoylase catalytic subunit from pyrococcus abyssi (see paper)
40% identity, 92% coverage: 3:316/342 of query aligns to 5:306/307 of 1ml4A

query
sites
1ml4A
R
 
R
H
 
D
L
 
V
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
R
S
 
D
L
 
F
T
 
S
R
 
K
D
 
E
S
 
D
V
 
I
N
 
E
H
 
T
L
 
V
M
 
L
H
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
E
R
 
R
M
 
L
E
 
E
P
 
R
I
 
E
A
 
L
Q
 
K
R
 
E
R
 
K
Q
 
G
V
 
Q
T
 
L
R
 
E
V
 
Y
L
 
A
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
I
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
A
V
 
V
C
 
I
D
 
G
T
 
F
T
 
A
G
 
E
F
 
A
T
 
S
F
 
T
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
K
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
R
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
K
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
Q
Y
 
Y
C
 
C
D
 
D
A
 
V
I
 
I
V
 
V
M
 
I
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
K
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
L
F
 
A
A
 
A
A
 
E
A
 
V
T
 
A
H
 
E
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
D
 
K
K
 
K
E
 
E
F
 
F
T
 
G
R
 
R
L
 
I
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
L
H
 
K
V
 
I
L
 
G
L
 
L
T
 
L
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
E
L
 
A
L
 
L
S
 
T
L
 
F
Y
 
Y
D
 
D
P
 
-
M
 
V
R
 
E
I
 
L
T
 
Y
L
 
L
V
 
I
A
 
S
P
 
P
P
 
E
G
 
L
L
 
L
E
 
R
M
 
M
P
 
P
D
 
R
Y
 
H
L
 
I
I
 
V
D
 
E
L
 
E
V
 
L
A
 
R
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
M
R
 
K
I
 
V
E
 
V
Q
 
E
R
 
T
T
 
T
S
 
T
L
 
L
A
 
E
D
 
D
D
 
V
Y
 
I
A
 
G
D
 
K
V
 
L
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
T
 
V
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
P
A
 
D
E
 
E
M
 
-
S
 
Q
E
 
E
G
 
Y
F
 
L
S
 
K
L
 
V
S
 
K
R
 
G
D
 
S
F
 
Y
T
 
Q
V
 
V
D
 
N
R
 
L
A
 
K
F
 
V
M
 
L
D
 
E
K
 
K
R
 
-
C
 
-
G
 
A
R
 
K
D
 
D
T
 
E
I
 
L
-
 
R
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
H
V
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
G
 
N
D
 
T
P
 
K
R
 
H
L
 
A
A
 
I
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
V
D
 
F
N
 
N
G
|
G
I
 
V
P
 
P
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
Q
 
G
V
 
V

6ys6B Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with pala (see paper)
43% identity, 88% coverage: 13:314/342 of query aligns to 17:309/312 of 6ys6B

query
sites
6ys6B
R
 
R
D
 
E
S
 
M
V
 
L
N
 
S
H
 
A
L
 
I
M
 
F
H
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
R
R
 
E
M
 
M
E
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
E
Q
 
K
R
 
S
R
 
S
Q
 
S
V
 
Q
T
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
L
D
 
T
T
 
T
-
 
E
T
 
N
G
 
A
F
 
R
T
 
E
F
 
F
S
 
S
S
|
S
M
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
G
Y
 
Y
C
 
S
D
 
D
A
 
I
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
D
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
T
T
 
A
H
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
S
E
 
E
F
 
I
T
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
S
V
 
V
L
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
K
P
 
D
M
 
V
R
 
K
I
 
I
T
 
Y
L
 
F
V
 
V
A
 
S
P
 
P
P
 
E
G
 
I
L
 
V
E
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
Y
 
D
L
 
I
I
 
K
D
 
D
L
 
Y
V
 
L
A
 
T
S
 
S
R
 
S
G
 
G
H
 
V
R
 
E
I
 
W
E
 
E
Q
 
E
R
 
S
T
 
S
S
 
D
L
 
L
A
 
M
D
 
E
D
 
V
Y
 
A
A
 
S
D
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
Q
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
G
A
 
E
E
 
R
M
 
L
S
 
D
E
 
L
G
 
Y
F
 
E
S
 
A
L
 
A
S
 
R
R
 
G
D
 
K
F
 
F
T
 
I
V
 
V
D
 
D
R
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
L
A
 
G
F
 
V
M
 
M
D
 
Q
K
 
K
R
 
K
C
 
A
G
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
L
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
T
V
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
I
 
L
P
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
K
T
 
L
L
 
L
L
 
L

6ypoA Arabidopsis aspartate transcarbamoylase bound to ump (see paper)
43% identity, 88% coverage: 13:314/342 of query aligns to 17:309/312 of 6ypoA

query
sites
6ypoA
R
 
R
D
 
E
S
 
M
V
 
L
N
 
S
H
 
A
L
 
I
M
 
F
H
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
R
R
 
E
M
 
M
E
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
E
Q
 
K
R
 
S
R
 
S
Q
 
S
V
 
Q
T
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
L
D
 
T
T
 
T
-
 
E
T
 
N
G
 
A
F
 
R
T
 
E
F
 
F
S
 
S
S
 
S
M
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
G
Y
 
Y
C
 
S
D
 
D
A
 
I
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
D
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
T
T
 
A
H
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
S
E
 
E
F
 
I
T
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
S
V
 
V
L
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
Y
 
N
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
K
P
 
D
M
 
V
R
 
K
I
 
I
T
 
Y
L
 
F
V
 
V
A
 
S
P
 
P
P
 
E
G
 
I
L
 
V
E
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
Y
 
D
L
 
I
I
 
K
D
 
D
L
 
Y
V
 
L
A
 
T
S
 
S
R
 
S
G
 
G
H
 
V
R
 
E
I
 
W
E
 
E
Q
 
E
R
 
S
T
 
S
S
 
D
L
 
L
A
 
M
D
 
E
D
 
V
Y
 
A
A
 
S
D
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
Q
T
|
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
G
A
 
E
E
 
R
M
 
L
S
 
D
E
 
L
G
 
Y
F
 
E
S
 
A
L
 
A
S
 
R
R
 
G
D
 
K
F
 
F
T
 
I
V
 
V
D
 
D
R
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
L
A
 
G
F
 
V
M
 
M
D
 
Q
K
 
K
R
 
K
C
 
A
G
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
|
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
L
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
T
V
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
I
 
L
P
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
K
T
 
L
L
 
L
L
 
L

6yvbC Arabidopsis aspartate transcarbamoylase complex with carbamoyl phosphate (see paper)
43% identity, 88% coverage: 13:314/342 of query aligns to 29:321/324 of 6yvbC

query
sites
6yvbC
R
 
R
D
 
E
S
 
M
V
 
L
N
 
S
H
 
A
L
 
I
M
 
F
H
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
R
R
 
E
M
 
M
E
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
E
Q
 
K
R
 
S
R
 
S
Q
 
S
V
 
Q
T
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
L
D
 
T
T
 
T
-
 
E
T
 
N
G
 
A
F
 
R
T
 
E
F
 
F
S
 
S
S
 
S
M
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
G
Y
 
Y
C
 
S
D
 
D
A
 
I
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
D
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
T
T
 
A
H
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
S
E
 
E
F
 
I
T
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
S
V
 
V
L
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
K
P
 
D
M
 
V
R
 
K
I
 
I
T
 
Y
L
 
F
V
 
V
A
 
S
P
 
P
P
 
E
G
 
I
L
 
V
E
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
Y
 
D
L
 
I
I
 
K
D
 
D
L
 
Y
V
 
L
A
 
T
S
 
S
R
 
S
G
 
G
H
 
V
R
 
E
I
 
W
E
 
E
Q
 
E
R
 
S
T
 
S
S
 
D
L
 
L
A
 
M
D
 
E
D
 
V
Y
 
A
A
 
S
D
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
Q
T
|
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
G
A
 
E
E
 
R
M
 
L
S
 
D
E
 
L
G
 
Y
F
 
E
S
 
A
L
 
A
S
 
R
R
 
G
D
 
K
F
 
F
T
 
I
V
 
V
D
 
D
R
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
L
A
 
G
F
 
V
M
 
M
D
 
Q
K
 
K
R
 
K
C
 
A
G
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
L
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
T
V
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
K
N
 
N
G
|
G
I
 
L
P
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
K
T
 
L
L
 
L
L
 
L

P20054 Multifunctional protein pyr1-3; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Dictyostelium discoideum (Social amoeba)
40% identity, 90% coverage: 3:311/342 of query aligns to 1923:2218/2225 of P20054

query
sites
P20054
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
F
S
 
S
V
 
V
D
 
K
S
 
Q
L
 
F
T
 
N
R
 
R
D
 
K
S
 
Q
V
 
L
N
 
H
H
 
A
L
 
L
M
 
F
H
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
H
R
 
E
M
 
M
E
 
R
P
 
I
I
 
L
A
 
V
Q
 
K
R
 
R
R
 
S
Q
 
G
V
 
G
T
 
S
R
 
D
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
V
 
C
S
 
S
F
 
F
H
 
T
T
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
Q
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
T
T
 
V
T
 
D
G
 
N
F
 
V
T
 
S
F
 
-
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
I
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
Q
V
 
T
M
 
L
S
 
E
G
 
S
Y
 
Y
C
 
C
D
 
D
A
 
A
I
 
V
V
 
C
M
 
M
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
A
Q
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
V
A
 
E
E
 
S
F
 
A
A
 
I
A
 
Q
A
 
V
T
 
A
H
 
K
V
 
K
P
 
P
V
 
I
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
V
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
R
K
 
E
E
 
E
F
 
L
T
 
G
R
 
T
L
 
V
G
 
N
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
L
H
 
T
V
 
I
L
 
T
L
 
V
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
H
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
V
K
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
N
Y
 
Y
D
 
Q
P
 
-
M
 
V
R
 
K
I
 
I
T
 
N
L
 
Y
V
 
V
A
 
S
P
 
P
P
 
S
G
 
S
L
 
L
E
 
S
M
 
M
P
 
P
D
 
T
Y
 
E
L
 
I
I
 
I
D
 
K
L
 
E
V
 
L
A
 
N
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
I
R
 
E
I
 
Q
E
 
K
Q
 
E
R
 
Y
T
 
T
S
 
N
L
 
I
A
 
E
D
 
S
D
 
I
Y
 
L
A
 
P
D
 
T
V
 
T
D
 
N
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
T
 
V
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
Q
A
 
S
E
 
-
M
 
-
S
 
I
E
 
E
G
 
E
F
 
Y
S
 
E
L
 
K
S
 
V
R
 
K
D
 
D
F
 
S
T
 
F
V
 
I
D
 
I
R
 
T
A
 
P
F
 
H
M
 
T
D
 
L
K
 
T
R
 
K
C
 
A
G
 
S
R
 
D
D
 
N
T
 
M
I
 
I
V
 
V
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
I
N
 
N
D
 
E
L
 
I
D
 
S
V
 
P
D
 
E
L
 
V
N
 
D
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
M
D
 
E
N
 
N
G
 
G
I
 
L
P
 
Y
V
 
V
R
 
R
M
 
M
A
 
S
I
 
L
F
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P49077 Aspartate carbamoyltransferase, chloroplastic; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
43% identity, 88% coverage: 13:314/342 of query aligns to 95:387/390 of P49077

query
sites
P49077
R
 
R
D
 
E
S
 
M
V
 
L
N
 
S
H
 
A
L
 
I
M
 
F
H
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
R
R
 
E
M
 
M
E
 
E
P
 
K
I
 
I
A
 
E
Q
 
K
R
 
S
R
 
S
Q
 
S
V
 
Q
T
 
S
R
 
E
V
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
G
A
 
Y
V
 
L
L
 
M
G
 
A
N
 
T
L
 
L
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
P
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
S
A
 
A
F
 
M
C
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
E
V
 
V
C
 
L
D
 
T
T
 
T
-
 
E
T
 
N
G
 
A
F
 
R
T
 
E
F
 
F
S
 
S
S
 
S
M
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
R
V
 
T
M
 
V
S
 
E
G
 
G
Y
 
Y
C
 
S
D
 
D
A
 
I
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
F
D
 
E
Q
 
S
G
 
G
S
 
A
V
 
A
A
 
R
E
 
K
F
 
A
A
 
A
A
 
A
A
 
T
T
 
A
H
 
N
V
 
I
P
 
P
V
 
V
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
P
G
 
G
E
 
E
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
V
Y
 
Y
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
S
E
 
E
F
 
I
T
 
G
R
 
-
L
 
-
G
 
-
K
 
-
K
 
K
L
 
L
A
 
D
G
 
G
A
 
I
H
 
S
V
 
V
L
 
A
L
 
L
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
A
Y
 
N
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
R
S
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
Y
L
 
L
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
K
P
 
D
M
 
V
R
 
K
I
 
I
T
 
Y
L
 
F
V
 
V
A
 
S
P
 
P
P
 
E
G
 
I
L
 
V
E
 
K
M
 
M
P
 
K
D
 
D
Y
 
D
L
 
I
I
 
K
D
 
D
L
 
Y
V
 
L
A
 
T
S
 
S
R
 
S
G
 
G
H
 
V
R
 
E
I
 
W
E
 
E
Q
 
E
R
 
S
T
 
S
S
 
D
L
 
L
A
 
M
D
 
E
D
 
V
Y
 
A
A
 
S
D
 
K
V
 
C
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Y
 
Y
T
 
Q
T
 
T
R
|
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
G
A
 
E
E
 
R
M
 
L
S
 
D
E
 
L
G
 
Y
F
 
E
S
 
A
L
 
A
S
 
R
R
 
G
D
 
K
F
 
Y
T
 
I
V
 
V
D
 
D
R
 
K
-
 
D
-
 
L
-
 
L
A
 
G
F
 
V
M
 
M
D
 
Q
K
 
K
R
 
K
C
 
A
G
 
-
R
 
-
D
 
-
T
 
-
I
 
I
V
 
I
M
 
M
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
L
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
T
V
 
A
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
A
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
K
N
 
N
G
 
G
I
 
L
P
 
F
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
K
T
 
L
L
 
L
L
 
L

P05990 Multifunctional protein r; Protein rudimentary; EC 6.3.5.5; EC 3.5.1.2; EC 6.3.4.16; EC 2.1.3.2; EC 3.5.2.3 from Drosophila melanogaster (Fruit fly) (see 2 papers)
40% identity, 92% coverage: 1:314/342 of query aligns to 1916:2217/2224 of P05990

query
sites
P05990
M
 
M
S
 
G
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
L
S
 
A
V
 
V
D
 
D
S
 
M
L
 
F
T
 
N
R
 
K
D
 
D
S
 
H
V
 
L
N
 
N
H
 
D
L
 
I
M
 
F
H
 
N
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
R
 
L
M
 
L
E
 
K
P
 
L
I
 
R
A
 
G
Q
 
T
R
 
K
-
 
D
R
 
R
Q
 
P
V
 
V
T
 
D
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
P
G
 
G
A
 
K
V
 
I
L
 
M
G
 
A
N
 
S
L
 
V
F
 
F
F
 
Y
E
 
E
A
 
V
S
 
S
T
 
T
R
 
R
T
 
T
R
 
Q
V
 
C
S
 
S
F
 
F
H
 
A
T
 
A
A
 
A
F
 
M
C
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
R
V
 
V
C
 
I
D
 
S
T
 
M
T
 
D
G
 
N
F
 
I
T
 
T
F
 
-
S
 
S
S
 
S
M
 
V
A
 
K
K
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
E
D
 
D
T
 
S
S
 
I
R
 
K
V
 
V
M
 
V
S
 
S
G
 
S
Y
 
Y
C
 
A
D
 
D
A
 
V
I
 
V
V
 
V
M
 
L
R
 
R
H
 
H
P
 
P
D
 
S
Q
 
P
G
 
G
S
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
R
F
 
A
A
 
A
A
 
T
A
 
F
T
 
S
H
 
R
V
 
K
P
 
P
V
 
L
I
 
I
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
V
G
 
G
E
 
E
H
 
H
P
 
P
S
 
T
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
I
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
R
K
 
E
E
 
E
F
 
F
T
 
G
R
 
T
L
 
V
G
 
N
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
L
H
 
T
V
 
I
L
 
T
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
N
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
A
K
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
T
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
P
 
-
M
 
V
R
 
N
I
 
L
T
 
Q
L
 
Y
V
 
V
A
 
A
P
 
P
P
 
N
G
 
S
L
 
L
E
 
Q
M
 
M
P
 
P
D
 
D
Y
 
E
L
 
V
I
 
V
D
 
Q
L
 
F
V
 
V
A
 
H
S
 
Q
R
 
R
G
 
G
H
 
V
R
 
K
I
 
Q
E
 
L
Q
 
F
R
 
A
T
 
R
S
 
D
L
 
L
A
 
K
D
 
N
D
 
V
Y
 
L
A
 
P
D
 
D
V
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
I
Q
 
Q
K
 
R
E
 
E
R
 
R
F
 
F
T
 
-
A
 
-
E
 
D
M
 
N
S
 
V
E
 
E
G
 
D
F
 
Y
S
 
E
L
 
K
S
 
C
R
 
C
D
 
G
F
 
H
T
 
L
V
 
V
D
 
L
R
 
T
A
 
P
F
 
E
M
 
H
D
 
M
K
 
M
R
 
R
C
 
A
G
 
K
R
 
K
D
 
R
T
 
S
I
 
I
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
L
N
 
N
D
 
E
L
 
I
D
 
S
V
 
R
D
 
E
L
 
I
N
 
D
G
 
S
D
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
A
A
 
A
I
 
Y
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
T
 
A
D
 
E
N
 
Y
G
 
G
I
 
M
P
 
Y
V
 
I
R
 
R
M
 
M
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
M
L
 
V
L
 
V

Sites not aligning to the query:

2at1A Crystal structures of phosphonoacetamide ligated t and phosphonoacetamide and malonate ligated r states of aspartate carbamoyltransferase at 2.8-angstroms resolution and neutral ph (see paper)
39% identity, 92% coverage: 3:317/342 of query aligns to 7:307/310 of 2at1A

query
sites
2at1A
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
N
S
 
D
L
 
L
T
 
S
R
 
R
D
 
D
S
 
D
V
 
L
N
 
N
H
 
L
L
 
V
M
 
L
H
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
I
 
N
A
 
P
Q
 
Q
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
P
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
V
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
Q
T
 
T
A
 
S
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
F
 
S
T
 
A
F
 
N
S
 
T
S
 
S
M
 
L
A
 
G
K
 
K
-
x
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
S
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
C
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
G
A
 
-
T
 
-
H
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
Q
E
 
T
F
 
E
T
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
N
A
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
A
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
K
 
Q
L
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
G
M
 
N
R
 
R
I
 
F
T
 
Y
L
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
D
G
 
A
L
 
L
E
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
E
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
D
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
D
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
I
R
 
A
I
 
W
E
 
S
Q
 
L
R
 
H
T
 
S
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
T
 
-
A
 
-
E
 
D
M
 
P
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
F
 
A
S
 
N
L
 
V
S
 
K
R
 
A
D
 
Q
F
 
F
T
 
V
V
 
L
D
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
S
M
 
D
D
 
L
K
 
H
R
 
N
C
 
A
G
 
K
R
 
A
D
 
N
T
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
A
V
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
V
 
R
D
 
D

1at1A Crystal structures of phosphonoacetamide ligated t and phosphonoacetamide and malonate ligated r states of aspartate carbamoyltransferase at 2.8-angstroms resolution and neutral p H (see paper)
39% identity, 92% coverage: 3:317/342 of query aligns to 7:307/310 of 1at1A

query
sites
1at1A
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
N
S
 
D
L
 
L
T
 
S
R
 
R
D
 
D
S
 
D
V
 
L
N
 
N
H
 
L
L
 
V
M
 
L
H
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
I
 
N
A
 
P
Q
 
Q
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
P
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
V
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
Q
T
 
T
A
 
S
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
F
 
S
T
 
A
F
 
N
S
 
T
S
 
S
M
 
L
A
 
G
K
 
K
-
x
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
S
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
C
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
G
A
 
-
T
 
-
H
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
Q
E
 
T
F
 
E
T
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
N
A
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
A
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
K
 
Q
L
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
G
M
 
N
R
 
R
I
 
F
T
 
Y
L
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
D
G
 
A
L
 
L
E
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
E
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
D
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
D
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
I
R
 
A
I
 
W
E
 
S
Q
 
L
R
 
H
T
 
S
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
T
 
-
A
 
-
E
 
D
M
 
P
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
F
 
A
S
 
N
L
 
V
S
 
K
R
 
A
D
 
Q
F
 
F
T
 
V
V
 
L
D
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
S
M
 
D
D
 
L
K
 
H
R
 
N
C
 
A
G
 
K
R
 
A
D
 
N
T
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
 
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
A
V
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
V
 
R
D
 
D

2hseA Structure of d236a e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of phosphonoacetamide and l-aspartate at 2.60 a resolution
39% identity, 92% coverage: 3:317/342 of query aligns to 7:307/310 of 2hseA

query
sites
2hseA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
N
S
 
D
L
 
L
T
 
S
R
 
R
D
 
D
S
 
D
V
 
L
N
 
N
H
 
L
L
 
V
M
 
L
H
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
I
 
N
A
 
P
Q
 
Q
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
P
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
V
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
|
S
F
 
F
H
 
E
T
 
T
A
 
S
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
F
 
S
T
 
A
F
 
N
S
 
T
S
 
S
M
 
L
A
 
G
K
 
K
-
x
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
S
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
C
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
G
A
 
-
T
 
-
H
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
E
E
 
T
F
 
Q
T
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
N
A
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
A
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
K
 
Q
L
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
G
M
 
N
R
 
R
I
 
F
T
 
Y
L
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
D
G
 
A
L
 
L
E
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
D
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
D
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
I
R
 
A
I
 
W
E
 
S
Q
 
L
R
 
H
T
 
S
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
|
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
T
 
A
A
 
P
E
 
-
M
 
-
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
F
 
A
S
 
N
L
 
V
S
 
K
R
 
A
D
 
Q
F
 
F
T
 
V
V
 
L
D
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
S
M
 
D
D
 
L
K
 
H
R
 
N
C
 
A
G
 
K
R
 
A
D
 
N
T
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
A
V
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
T
x
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
P
 
F
V
 
A
R
|
R
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
V
 
R
D
 
D

2a0fA Structure of d236a mutant e. Coli aspartate transcarbamoylase in presence of phosphonoacetamide at 2.90 a resolution (see paper)
39% identity, 92% coverage: 3:317/342 of query aligns to 7:307/310 of 2a0fA

query
sites
2a0fA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
N
S
 
D
L
 
L
T
 
S
R
 
R
D
 
D
S
 
D
V
 
L
N
 
N
H
 
L
L
 
V
M
 
L
H
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
I
 
N
A
 
P
Q
 
Q
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
P
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
V
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
T
A
 
S
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
F
 
S
T
 
A
F
 
N
S
 
T
S
 
S
M
 
L
A
 
G
K
 
K
-
x
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
S
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
C
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
G
A
 
-
T
 
-
H
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
E
E
 
T
F
 
Q
T
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
N
A
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
A
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
K
 
Q
L
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
G
M
 
N
R
 
R
I
 
F
T
 
Y
L
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
D
G
 
A
L
 
L
E
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
D
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
D
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
I
R
 
A
I
 
W
E
 
S
Q
 
L
R
 
H
T
 
S
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
|
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
T
 
A
A
 
P
E
 
-
M
 
-
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
F
 
A
S
 
N
L
 
V
S
 
K
R
 
A
D
 
Q
F
 
F
T
 
V
V
 
L
D
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
S
M
 
D
D
 
L
K
 
H
R
 
N
C
 
A
G
 
K
R
 
A
D
 
N
T
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
A
V
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
V
 
R
D
 
D

P0A786 Aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit; Aspartate transcarbamylase; ATCase; EC 2.1.3.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
39% identity, 92% coverage: 3:317/342 of query aligns to 8:308/311 of P0A786

query
sites
P0A786
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
N
S
 
D
L
 
L
T
 
S
R
 
R
D
 
D
S
 
D
V
 
L
N
 
N
H
 
L
L
 
V
M
 
L
H
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
I
 
N
A
 
P
Q
 
Q
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
P
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
V
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
T
A
 
S
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
F
 
S
T
 
A
F
 
N
S
 
T
S
 
S
M
 
L
A
 
G
K
 
K
-
 
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
S
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
C
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
G
A
 
-
T
 
-
H
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
E
E
 
T
F
 
Q
T
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
N
A
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
A
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
K
 
Q
L
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
G
M
 
N
R
 
R
I
 
F
T
 
Y
L
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
D
G
 
A
L
 
L
E
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
D
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
D
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
I
R
 
A
I
 
W
E
 
S
Q
 
L
R
 
H
T
 
S
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
 
T
R
 
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
T
 
-
A
 
-
E
 
D
M
 
P
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
F
 
A
S
 
N
L
 
V
S
 
K
R
 
A
D
 
Q
F
 
F
T
 
V
V
 
L
D
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
S
M
 
D
D
 
L
K
 
H
R
 
N
C
 
A
G
 
K
R
 
A
D
 
N
T
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
 
P
L
|
L
P
|
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
A
V
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
A
D
 
G
N
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
V
 
R
D
 
D

Sites not aligning to the query:

2ipoA E. Coli aspartate transcarbamoylase complexed with n-phosphonacetyl-l- asparagine (see paper)
39% identity, 92% coverage: 3:317/342 of query aligns to 7:307/310 of 2ipoA

query
sites
2ipoA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
N
S
 
D
L
 
L
T
 
S
R
 
R
D
 
D
S
 
D
V
 
L
N
 
N
H
 
L
L
 
V
M
 
L
H
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
I
 
N
A
 
P
Q
 
Q
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
P
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
V
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
T
A
 
S
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
F
 
S
T
 
A
F
 
N
S
 
T
S
 
S
M
 
L
A
 
G
K
 
K
-
x
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
S
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
C
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
G
A
 
-
T
 
-
H
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
E
E
 
T
F
 
Q
T
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
N
A
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
A
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
K
 
Q
L
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
G
M
 
N
R
 
R
I
 
F
T
 
Y
L
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
D
G
 
A
L
 
L
E
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
D
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
D
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
I
R
 
A
I
 
W
E
 
S
Q
 
L
R
 
H
T
 
S
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
T
 
-
A
 
-
E
 
D
M
 
P
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
F
 
A
S
 
N
L
 
V
S
 
K
R
 
A
D
 
Q
F
 
F
T
 
V
V
 
L
D
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
S
M
 
D
D
 
L
K
 
H
R
 
N
C
 
A
G
 
K
R
 
A
D
 
N
T
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
A
V
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
V
 
R
D
 
D

2h3eA Structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in the presence of n-phosphonacetyl-l-isoasparagine at 2.3a resolution (see paper)
39% identity, 92% coverage: 3:317/342 of query aligns to 7:307/310 of 2h3eA

query
sites
2h3eA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
N
S
 
D
L
 
L
T
 
S
R
 
R
D
 
D
S
 
D
V
 
L
N
 
N
H
 
L
L
 
V
M
 
L
H
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
I
 
N
A
 
P
Q
 
Q
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
P
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
V
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
|
S
T
|
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
T
A
 
S
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
F
 
S
T
 
A
F
 
N
S
 
T
S
 
S
M
 
L
A
 
G
K
 
K
-
x
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
S
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
C
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
G
A
 
-
T
 
-
H
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
E
E
 
T
F
 
Q
T
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
N
A
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
A
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
|
R
T
 
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
K
 
Q
L
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
G
M
 
N
R
 
R
I
 
F
T
 
Y
L
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
D
G
 
A
L
 
L
E
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
D
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
D
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
I
R
 
A
I
 
W
E
 
S
Q
 
L
R
 
H
T
 
S
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
T
 
-
A
 
-
E
 
D
M
 
P
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
F
 
A
S
 
N
L
 
V
S
 
K
R
 
A
D
 
Q
F
 
F
T
 
V
V
 
L
D
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
S
M
 
D
D
 
L
K
 
H
R
 
N
C
 
A
G
 
K
R
 
A
D
 
N
T
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
A
V
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
P
 
F
V
 
A
R
 
R
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
V
 
R
D
 
D

2fzkA The structure of wild-type e. Coli aspartate transcarbamoylase in complex with novel t state inhibitors at 2.50 resolution (see paper)
39% identity, 92% coverage: 3:317/342 of query aligns to 7:307/310 of 2fzkA

query
sites
2fzkA
R
 
K
H
 
H
L
 
I
L
 
I
S
 
S
V
 
I
D
 
N
S
 
D
L
 
L
T
 
S
R
 
R
D
 
D
S
 
D
V
 
L
N
 
N
H
 
L
L
 
V
M
 
L
H
 
A
V
 
T
A
 
A
A
 
A
R
 
K
M
 
L
E
 
K
P
 
A
I
 
N
A
 
P
Q
 
Q
R
 
-
R
 
-
Q
 
-
V
 
-
T
 
P
R
 
E
V
 
L
L
 
L
E
 
K
G
 
H
A
 
K
V
 
V
L
 
I
G
 
A
N
 
S
L
 
C
F
 
F
F
 
F
E
 
E
A
 
A
S
 
S
T
 
T
R
|
R
T
|
T
R
 
R
V
 
L
S
 
S
F
 
F
H
 
E
T
 
T
A
 
S
F
 
M
C
 
H
R
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
A
S
 
S
V
 
V
C
 
V
D
 
G
T
 
F
T
 
S
G
 
D
F
 
S
T
 
A
F
 
N
S
 
T
S
 
S
M
 
L
A
 
G
K
 
K
-
x
K
G
 
G
E
 
E
S
 
T
L
 
L
Y
 
A
D
 
D
T
 
T
S
 
I
R
 
S
V
 
V
M
 
I
S
 
S
G
 
T
Y
 
Y
C
 
V
D
 
D
A
 
A
I
 
I
V
 
V
M
 
M
R
|
R
H
 
H
P
 
P
D
 
Q
Q
 
E
G
 
G
S
 
A
V
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
A
A
 
T
E
 
E
F
 
F
A
 
S
A
 
G
A
 
-
T
 
-
H
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
V
I
 
L
N
 
N
G
 
A
G
 
G
D
 
D
G
 
G
P
 
S
G
 
N
E
 
Q
H
|
H
P
 
P
S
 
T
Q
|
Q
A
 
T
L
 
L
L
 
L
D
 
D
F
 
L
Y
 
F
T
 
T
I
 
I
D
 
Q
K
 
E
E
 
T
F
 
Q
T
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
D
K
 
-
K
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
N
A
 
L
H
 
H
V
 
V
L
 
A
L
 
M
T
 
V
G
 
G
D
 
D
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
T
|
T
V
 
V
H
 
H
S
 
S
L
 
L
I
 
T
K
 
Q
L
 
A
L
 
L
S
 
A
L
 
K
Y
 
F
D
 
D
P
 
G
M
 
N
R
 
R
I
 
F
T
 
Y
L
 
F
V
 
I
A
 
A
P
 
P
P
 
D
G
 
A
L
 
L
E
 
A
M
 
M
P
 
P
D
 
Q
Y
 
Y
L
 
I
I
 
L
D
 
D
L
 
M
V
 
L
A
 
D
S
 
E
R
 
K
G
 
G
H
 
I
R
 
A
I
 
W
E
 
S
Q
 
L
R
 
H
T
 
S
S
 
S
L
 
I
A
 
E
D
 
E
D
 
V
Y
 
M
A
 
A
D
 
E
V
 
V
D
 
D
V
 
I
V
 
L
Y
 
Y
T
 
M
T
|
T
R
|
R
I
 
V
Q
 
Q
K
 
K
E
 
E
R
 
R
F
 
L
T
 
-
A
 
-
E
 
D
M
 
P
S
 
S
E
 
E
G
 
Y
F
 
A
S
 
N
L
 
V
S
 
K
R
 
A
D
 
Q
F
 
F
T
 
V
V
 
L
D
 
-
R
 
R
A
 
A
F
 
S
M
 
D
D
 
L
K
 
H
R
 
N
C
 
A
G
 
K
R
 
A
D
 
N
T
 
M
I
 
K
V
 
V
M
 
L
H
 
H
P
|
P
L
|
L
P
 
P
R
 
R
D
 
-
S
 
-
R
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
V
N
 
D
D
 
E
L
 
I
D
 
A
V
 
T
D
 
D
L
 
V
N
 
D
G
 
K
D
 
T
P
 
P
R
 
H
L
 
A
A
 
W
I
 
Y
F
 
F
R
 
Q
Q
 
Q
T
 
A
D
 
G
N
 
N
G
|
G
I
 
I
P
 
F
V
 
A
R
|
R
M
 
Q
A
 
A
I
 
L
F
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
V
L
 
L
Q
 
N
V
 
R
D
 
D

Query Sequence

>WP_086510656.1 NCBI__GCF_002151265.1:WP_086510656.1
MSRHLLSVDSLTRDSVNHLMHVAARMEPIAQRRQVTRVLEGAVLGNLFFEASTRTRVSFH
TAFCRLGGSVCDTTGFTFSSMAKGESLYDTSRVMSGYCDAIVMRHPDQGSVAEFAAATHV
PVINGGDGPGEHPSQALLDFYTIDKEFTRLGKKLAGAHVLLTGDLKYGRTVHSLIKLLSL
YDPMRITLVAPPGLEMPDYLIDLVASRGHRIEQRTSLADDYADVDVVYTTRIQKERFTAE
MSEGFSLSRDFTVDRAFMDKRCGRDTIVMHPLPRDSRPEANDLDVDLNGDPRLAIFRQTD
NGIPVRMAIFATLLQVDELIEKDLRPVRWFVPERVGVDDSAL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory