SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_087507677.1 NCBI__GCF_002165625.1:WP_087507677.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07913 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
81% identity, 99% coverage: 1:340/344 of query aligns to 1:340/341 of P07913

query
sites
P07913
M
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
S
K
 
K
L
 
L
K
 
K
A
 
A
E
 
E
P
 
E
G
 
G
I
 
I
W
 
W
M
 
M
T
 
T
E
 
D
V
 
V
P
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
L
G
 
G
H
 
H
N
 
N
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
I
K
 
K
I
 
I
H
 
R
K
 
K
T
 
T
A
 
A
I
 
I
C
|
C
G
 
G
T
 
T
D
 
D
L
 
V
H
 
H
I
 
I
Y
 
Y
K
 
N
W
 
W
D
 
D
Q
 
E
W
 
W
S
 
S
Q
 
Q
Q
 
K
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
P
 
P
M
 
M
V
 
V
V
 
V
G
 
G
H
 
H
E
 
E
Y
 
Y
A
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
R
 
K
G
 
G
F
 
F
E
 
K
I
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
G
 
G
H
 
H
I
 
I
T
 
T
C
 
C
G
 
G
H
 
H
C
 
C
R
 
R
N
 
N
C
 
C
R
 
R
A
 
G
G
 
G
R
 
R
R
 
T
H
 
H
L
 
L
C
 
C
R
 
R
N
 
N
T
 
T
T
 
I
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
R
 
R
P
 
P
G
 
G
C
 
C
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
F
K
 
K
L
 
I
A
 
P
D
 
D
D
 
N
I
 
I
S
 
S
D
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
F
D
 
D
P
 
P
F
 
F
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
D
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
V
T
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
I
 
I
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
K
H
 
H
S
 
V
G
 
G
A
 
A
R
 
R
H
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
V
N
 
N
R
 
E
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
K
M
 
M
G
 
G
A
 
I
S
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
N
V
 
V
S
 
A
Q
 
K
Q
 
E
S
 
N
L
 
L
D
 
N
E
 
D
V
 
V
M
 
M
T
 
A
E
 
E
L
 
L
G
 
G
M
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
G
M
 
L
E
 
E
M
 
M
S
 
S
G
 
G
V
 
A
P
 
P
A
 
P
A
 
A
F
 
F
C
 
R
D
 
T
L
 
M
L
 
L
A
 
D
K
 
T
M
 
M
N
 
N
H
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
M
L
 
L
G
 
G
I
 
I
P
 
P
P
 
P
S
 
S
S
 
D
M
 
M
P
 
S
I
 
I
D
 
D
W
 
W
N
 
T
Q
 
K
V
 
V
I
 
I
F
 
F
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
F
I
 
I
K
 
K
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
 
E
M
 
M
F
 
F
E
 
E
T
 
T
W
 
W
Y
 
Y
K
 
K
M
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
M
 
I
L
 
I
T
 
T
H
 
H
H
 
R
Y
 
F
K
 
S
V
 
I
D
 
D
D
 
D
F
 
F
Q
 
Q
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
D
A
 
A
M
 
M
L
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
C
 
S
G
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
S
W
 
W

5kiaA Crystal structure of l-threonine 3-dehydrogenase from burkholderia thailandensis
76% identity, 99% coverage: 1:340/344 of query aligns to 2:338/339 of 5kiaA

query
sites
5kiaA
M
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
-
A
 
-
E
 
E
P
 
P
G
 
G
I
 
L
W
 
T
M
 
L
T
 
T
E
 
R
V
 
V
P
 
K
V
 
K
P
 
P
E
 
E
L
 
V
G
 
G
H
 
H
N
 
N
D
 
D
L
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
K
I
 
I
H
 
R
K
 
R
T
 
T
A
 
A
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
|
T
D
 
D
L
 
I
H
|
H
I
 
I
Y
 
W
K
 
K
W
 
W
D
 
D
Q
 
D
W
 
W
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
T
 
T
I
 
I
P
 
P
V
 
V
P
 
-
M
 
M
V
 
H
V
 
V
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
Y
A
 
V
G
 
G
E
 
E
V
 
I
V
 
V
A
 
E
I
 
M
G
 
G
Q
 
Q
E
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
F
 
F
E
 
S
I
 
I
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
E
G
 
G
H
 
H
I
 
I
T
 
T
C
|
C
G
 
G
H
 
F
C
|
C
R
 
R
N
 
N
C
|
C
R
 
R
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
H
 
H
L
 
L
C
|
C
R
 
R
N
 
N
T
 
T
T
x
V
G
 
G
V
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
R
 
R
P
 
E
G
 
G
C
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
L
V
 
A
I
 
I
P
 
P
A
 
A
Y
 
F
N
 
N
A
 
A
F
 
F
K
 
K
L
 
I
A
 
P
D
 
P
D
 
E
I
 
I
S
 
S
D
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
F
D
|
D
P
|
P
F
 
F
G
 
G
N
|
N
A
|
A
V
 
T
H
 
H
T
 
T
A
 
A
L
 
L
S
 
S
F
 
F
D
 
N
L
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
E
D
 
D
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
I
 
V
M
 
M
A
 
A
A
 
V
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
K
H
 
H
S
 
V
G
 
G
A
 
A
R
 
R
H
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
D
 
D
V
 
I
N
 
N
R
 
D
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
D
 
D
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
M
 
M
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
V
D
 
N
V
 
V
S
 
S
Q
 
R
Q
 
E
S
 
S
L
 
L
D
 
R
E
 
D
V
 
V
M
 
M
T
 
A
E
 
D
L
 
L
G
 
H
M
 
M
T
 
T
E
 
E
G
 
G
F
 
F
D
 
D
V
 
V
G
 
G
M
 
L
E
 
E
M
 
M
S
 
S
G
 
G
V
 
V
P
 
P
A
 
S
A
 
A
F
 
F
C
 
T
D
 
S
L
 
L
L
 
L
A
 
E
K
 
S
M
 
M
N
 
N
H
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
P
 
P
P
 
P
S
 
A
S
 
Q
M
 
T
P
 
A
I
 
I
D
 
D
W
 
W
N
 
N
Q
 
Q
V
 
V
I
 
I
F
 
F
K
 
K
G
 
G
L
 
L
T
 
E
I
 
I
K
 
K
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
E
|
E
M
 
M
F
 
F
E
 
E
T
 
T
W
 
W
Y
 
Y
K
 
K
M
 
M
A
 
V
S
 
A
L
 
M
V
 
L
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
M
 
I
L
 
I
T
 
T
H
 
H
H
 
R
Y
 
F
K
 
A
V
 
V
D
 
D
D
 
D
F
 
Y
Q
 
E
Q
 
K
G
 
G
F
 
F
D
 
A
A
 
A
M
 
M
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
E
C
 
S
G
 
G
K
|
K
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D
W
 
W

2dfvA Hyperthermophilic threonine dehydrogenase from pyrococcus horikoshii (see paper)
44% identity, 98% coverage: 1:338/344 of query aligns to 3:343/346 of 2dfvA

query
sites
2dfvA
M
 
M
K
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
M
K
 
K
L
 
T
K
 
K
A
 
P
E
 
G
P
 
Y
G
 
G
I
 
A
W
 
E
M
 
L
T
 
V
E
 
E
V
 
V
P
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
K
L
 
P
G
 
G
H
 
P
N
 
G
D
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
K
I
 
V
H
 
L
K
 
A
T
 
T
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
|
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
I
 
I
Y
 
Y
K
 
E
W
 
W
D
 
N
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
S
T
 
R
I
 
I
P
 
K
V
 
P
P
 
P
M
 
Q
V
 
I
V
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
G
Q
 
P
E
 
G
V
 
V
R
 
E
G
 
G
F
 
I
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
S
 
S
G
 
V
E
 
E
G
 
T
H
 
H
I
 
I
T
 
V
C
|
C
G
 
G
H
 
K
C
|
C
R
 
Y
N
 
A
C
|
C
R
 
R
A
 
R
G
 
G
R
 
Q
R
 
Y
H
 
H
L
 
V
C
|
C
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
T
x
K
G
 
I
V
 
F
G
 
G
V
 
V
N
 
D
R
 
T
P
 
D
G
 
G
C
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
A
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
Y
 
Q
N
 
N
A
 
I
F
 
W
K
 
K
L
 
N
A
 
P
D
 
K
D
 
S
I
 
I
S
 
P
D
 
P
D
 
E
L
 
Y
A
 
A
A
 
T
I
 
L
F
 
Q
D
 
E
P
|
P
F
 
L
G
 
G
N
 
N
A
|
A
V
 
V
H
 
D
T
 
T
A
 
V
L
 
L
S
 
A
F
 
G
D
 
P
L
 
I
V
 
S
G
 
G
E
 
K
D
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
I
x
L
G
 
G
I
 
L
M
 
L
A
 
G
A
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
K
H
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
H
 
P
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
 
S
D
x
E
V
x
P
N
 
S
R
 
D
Y
 
F
R
|
R
L
 
R
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
M
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
Y
A
 
V
V
 
I
D
 
N
V
 
P
S
 
F
Q
 
E
Q
 
E
S
 
D
L
 
V
D
 
V
E
 
K
V
 
E
M
 
V
T
 
M
E
 
D
L
 
I
G
 
T
M
 
D
T
 
G
E
 
N
G
 
G
F
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
F
M
 
L
E
 
E
M
x
F
S
|
S
G
 
G
V
x
A
P
 
P
A
 
K
A
 
A
F
 
L
C
 
E
D
 
Q
L
 
G
L
 
L
A
 
Q
K
 
A
M
 
V
N
 
T
H
 
P
G
 
A
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
S
L
 
L
L
|
L
G
|
G
I
x
L
P
 
Y
P
 
P
S
 
G
S
 
K
M
 
V
P
 
T
I
 
I
D
 
D
W
 
F
N
 
N
Q
 
N
-
 
L
V
 
I
I
 
I
F
 
F
K
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
K
 
Y
G
 
G
I
|
I
Y
x
T
G
 
G
R
 
R
E
 
H
M
 
L
F
 
W
E
 
E
T
 
T
W
 
W
Y
 
Y
K
 
T
M
 
V
A
 
S
S
 
R
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
-
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
P
M
 
I
L
 
I
T
 
T
H
 
H
H
 
K
Y
 
Y
K
 
K
-
 
G
V
 
F
D
 
D
D
 
K
F
 
Y
Q
 
E
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
E
A
 
L
M
 
M
L
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
K
C
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
V
I
 
V
L
 
F

O58389 L-threonine 3-dehydrogenase; L-ThrDH; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Pyrococcus horikoshii (strain ATCC 700860 / DSM 12428 / JCM 9974 / NBRC 100139 / OT-3) (see 2 papers)
44% identity, 98% coverage: 1:338/344 of query aligns to 5:345/348 of O58389

query
sites
O58389
M
 
M
K
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
M
K
 
K
L
 
T
K
 
K
A
 
P
E
 
G
P
 
Y
G
 
G
I
 
A
W
 
E
M
 
L
T
 
V
E
 
E
V
 
V
P
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
K
L
 
P
G
 
G
H
 
P
N
 
G
D
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
K
I
 
V
H
 
L
K
 
A
T
 
T
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
 
G
T
|
T
D
 
D
L
 
L
H
 
H
I
 
I
Y
 
Y
K
 
E
W
 
W
D
 
N
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
S
T
 
R
I
 
I
P
 
K
V
 
P
P
 
P
M
 
Q
V
 
I
V
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
E
I
 
I
G
 
G
Q
 
P
E
 
G
V
 
V
R
 
E
G
 
G
F
 
I
E
 
E
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
V
S
 
S
G
 
V
E
 
E
G
 
T
H
 
H
I
 
I
T
 
V
C
|
C
G
 
G
H
 
K
C
|
C
R
 
Y
N
 
A
C
|
C
R
 
R
A
 
R
G
 
G
R
 
Q
R
 
Y
H
 
H
L
 
V
C
|
C
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
T
 
K
G
 
I
V
 
F
G
 
G
V
 
V
N
 
D
R
 
T
P
 
D
G
 
G
C
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
A
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
Y
 
Q
N
 
N
A
 
I
F
 
W
K
 
K
L
 
N
A
 
P
D
 
K
D
 
S
I
 
I
S
 
P
D
 
P
D
 
E
L
 
Y
A
 
A
A
 
T
I
 
L
F
 
Q
D
x
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
H
 
D
T
 
T
A
 
V
L
 
L
S
 
A
F
 
G
D
 
P
L
 
I
V
 
S
G
 
G
E
 
K
D
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
I
x
L
G
 
G
I
 
L
M
 
L
A
 
G
A
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
K
H
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
H
 
P
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
 
S
D
x
E
V
 
P
N
 
S
R
 
D
Y
 
F
R
|
R
L
 
R
D
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
M
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
Y
A
 
V
V
 
I
D
 
N
V
 
P
S
 
F
Q
 
E
Q
 
E
S
 
D
L
 
V
D
 
V
E
 
K
V
 
E
M
 
V
T
 
M
E
 
D
L
 
I
G
 
T
M
 
D
T
 
G
E
 
N
G
 
G
F
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
F
M
 
L
E
 
E
M
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
A
P
 
P
A
 
K
A
 
A
F
 
L
C
 
E
D
 
Q
L
 
G
L
 
L
A
 
Q
K
 
A
M
 
V
N
 
T
H
 
P
G
 
A
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
S
L
 
L
L
|
L
G
|
G
I
x
L
P
 
Y
P
 
P
S
 
G
S
 
K
M
 
V
P
 
T
I
 
I
D
 
D
W
 
F
N
 
N
Q
 
N
-
 
L
V
 
I
I
 
I
F
 
F
K
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
T
I
 
I
K
 
Y
G
 
G
I
|
I
Y
x
T
G
 
G
R
|
R
E
 
H
M
 
L
F
 
W
E
 
E
T
 
T
W
 
W
Y
 
Y
K
 
T
M
 
V
A
 
S
S
 
R
L
 
L
V
 
L
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
-
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
P
M
 
I
L
 
I
T
 
T
H
 
H
H
 
K
Y
 
Y
K
 
K
-
 
G
V
 
F
D
 
D
D
 
K
F
 
Y
Q
 
E
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
E
A
 
L
M
 
M
L
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
K
C
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
V
L
 
F

Q5JI69 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; L-threonine dehydrogenase; EC 1.1.1.103 from Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) (Pyrococcus kodakaraensis (strain KOD1)) (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:338/344 of query aligns to 5:345/350 of Q5JI69

query
sites
Q5JI69
M
 
M
K
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
M
K
 
K
L
 
T
K
 
K
A
 
P
E
 
A
P
 
Y
G
 
G
I
 
A
W
 
E
M
 
L
T
 
V
E
 
E
V
 
V
P
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
K
L
 
P
G
 
G
H
 
P
N
 
G
D
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
K
I
 
V
H
 
L
K
 
A
T
 
T
A
 
S
I
 
I
C
 
C
G
 
G
T
 
T
D
 
D
L
 
L
H
 
H
I
 
I
Y
 
Y
K
 
E
W
 
W
D
 
N
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
S
T
 
R
I
 
I
P
 
K
V
 
P
P
 
P
M
 
Q
V
 
I
V
 
M
G
 
G
H
 
H
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
E
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
E
 
G
V
 
V
R
 
E
G
 
D
F
 
L
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
S
 
S
G
 
V
E
 
E
G
 
T
H
 
H
I
 
I
T
 
V
C
 
C
G
 
G
H
 
K
C
 
C
R
 
Y
N
 
A
C
 
C
R
 
K
A
 
H
G
 
N
R
 
R
R
 
Y
H
 
H
L
 
V
C
 
C
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
T
 
K
G
 
I
V
 
F
G
 
G
V
 
V
N
 
D
R
 
M
P
 
D
G
 
G
C
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
H
Y
 
Y
L
 
A
V
 
I
I
 
V
P
 
P
A
 
A
Y
 
K
N
 
N
A
 
A
F
 
W
K
 
K
L
 
N
A
 
P
D
 
K
D
 
D
I
 
M
S
 
P
D
 
P
D
 
E
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
F
 
Q
D
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
H
 
D
T
 
T
A
 
V
L
 
L
S
 
A
F
 
G
D
 
P
L
 
I
V
 
A
G
 
G
E
 
R
D
 
S
V
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
I
x
L
G
 
G
I
 
L
M
 
L
A
 
G
A
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
K
H
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
H
 
P
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
 
S
D
x
E
V
 
P
N
 
S
R
 
E
Y
 
F
R
|
R
L
 
R
D
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
M
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
Y
A
 
V
V
 
V
D
 
N
V
 
P
S
 
F
Q
 
E
Q
 
E
S
 
D
L
 
P
D
 
V
E
 
K
V
 
F
M
 
V
T
 
M
E
 
D
L
 
I
G
 
T
M
 
D
T
 
G
E
 
A
G
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
V
G
 
F
M
 
L
E
 
E
M
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
A
P
 
P
A
 
K
A
 
A
F
 
L
C
 
E
D
 
Q
L
 
G
L
 
L
A
 
K
K
 
A
M
 
V
N
 
T
H
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
S
L
 
L
L
|
L
G
|
G
I
x
L
P
 
F
P
 
P
S
 
R
S
 
E
M
 
V
P
 
T
I
 
I
D
 
D
W
 
F
N
 
N
Q
 
N
-
 
L
V
 
I
I
 
I
F
 
F
K
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
E
I
 
V
K
 
H
G
 
G
I
|
I
Y
x
T
G
 
G
R
 
R
E
 
H
M
 
L
F
 
W
E
 
E
T
 
T
W
 
W
Y
 
Y
K
 
T
M
 
V
A
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
-
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
P
M
 
I
L
 
I
T
 
T
H
 
H
H
 
K
Y
 
Y
K
 
K
-
 
G
V
 
F
D
 
D
D
 
K
F
 
F
Q
 
E
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
E
A
 
L
M
 
M
L
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
K
C
 
T
G
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
V
L
 
F

3gfbA L-threonine dehydrogenase (tktdh) from the hyperthermophilic archaeon thermococcus kodakaraensis (see paper)
43% identity, 98% coverage: 1:338/344 of query aligns to 3:343/347 of 3gfbA

query
sites
3gfbA
M
 
M
K
 
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
M
K
 
K
L
 
T
K
 
K
A
 
P
E
 
A
P
 
Y
G
 
G
I
 
A
W
 
E
M
 
L
T
 
V
E
 
E
V
 
V
P
 
D
V
 
V
P
 
P
E
 
K
L
 
P
G
 
G
H
 
P
N
 
G
D
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
K
I
 
V
H
 
L
K
 
A
T
 
T
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
|
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
I
 
I
Y
 
Y
K
 
E
W
 
W
D
 
N
Q
 
E
W
 
W
S
 
A
Q
 
Q
Q
 
S
T
 
R
I
 
I
P
 
K
V
 
P
P
 
P
M
 
Q
V
 
I
V
 
M
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
V
A
 
A
G
 
G
E
 
E
V
 
V
V
 
V
A
 
E
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
E
 
G
V
 
V
R
 
E
G
 
D
F
 
L
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
Y
V
 
I
S
 
S
G
 
V
E
 
E
G
 
T
H
 
H
I
 
I
T
 
V
C
|
C
G
 
G
H
 
K
C
|
C
R
 
Y
N
 
A
C
|
C
R
 
K
A
 
H
G
 
N
R
 
R
R
 
Y
H
 
H
L
 
V
C
|
C
R
 
Q
N
 
N
T
 
T
T
x
K
G
 
I
V
 
F
G
 
G
V
 
V
N
 
D
R
 
M
P
 
D
G
 
G
C
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
H
Y
 
Y
L
 
A
V
 
I
I
 
V
P
 
P
A
 
A
Y
 
K
N
 
N
A
 
A
F
 
W
K
 
K
L
 
N
A
 
P
D
 
K
D
 
D
I
 
M
S
 
P
D
 
P
D
 
E
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
I
 
L
F
 
Q
D
 
E
P
|
P
F
 
L
G
 
G
N
 
N
A
|
A
V
 
V
H
 
D
T
 
T
A
 
V
L
 
L
S
 
A
F
 
G
D
 
P
L
 
I
V
 
A
G
 
G
E
 
R
D
 
S
V
 
T
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
I
x
L
G
 
G
I
 
L
M
 
L
A
 
G
A
 
I
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
K
H
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
H
 
P
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
x
S
D
x
E
V
x
P
N
 
S
R
 
E
Y
 
F
R
|
R
L
 
R
D
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
M
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
D
R
 
Y
A
 
V
V
 
V
D
 
N
V
 
P
S
 
F
Q
 
E
Q
 
E
S
 
D
L
 
P
D
 
V
E
 
K
V
 
F
M
 
V
T
 
M
E
 
D
L
 
I
G
 
T
M
 
D
T
 
G
E
 
A
G
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
V
G
 
F
M
 
L
E
 
E
M
x
F
S
|
S
G
 
G
V
x
A
P
 
P
A
 
K
A
 
A
F
 
L
C
 
E
D
 
Q
L
 
G
L
 
L
A
 
K
K
 
A
M
 
V
N
 
T
H
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
R
V
 
V
A
 
S
L
 
L
L
|
L
G
|
G
I
x
L
P
 
F
P
 
P
S
 
R
S
 
E
M
 
V
P
 
T
I
 
I
D
 
D
W
 
F
N
 
N
Q
 
N
-
 
L
V
 
I
I
 
I
F
 
F
K
 
K
G
 
A
L
 
L
T
 
E
I
 
V
K
 
H
G
 
G
I
|
I
Y
x
T
G
 
G
R
 
R
E
 
H
M
 
L
F
 
W
E
 
E
T
 
T
W
 
W
Y
 
Y
K
 
T
M
 
V
A
 
S
S
 
S
L
 
L
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
G
 
G
-
 
K
L
 
L
D
 
N
L
 
L
S
 
D
P
 
P
M
 
I
L
 
I
T
 
T
H
 
H
H
 
K
Y
 
Y
K
 
K
-
 
G
V
 
F
D
 
D
D
 
K
F
 
F
Q
 
E
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
E
A
 
L
M
 
M
L
 
R
S
 
A
G
 
G
Q
 
K
C
 
T
G
 
G
K
|
K
V
 
V
I
 
V
L
 
F

2ejvA Crystal structure of threonine 3-dehydrogenase complexed with NAD+
45% identity, 99% coverage: 1:339/344 of query aligns to 1:340/343 of 2ejvA

query
sites
2ejvA
M
 
M
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
A
A
 
P
E
 
E
P
 
E
G
 
G
I
 
L
W
 
T
M
 
L
T
 
V
E
 
D
V
 
R
P
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
P
G
 
G
H
 
P
N
 
G
D
 
E
L
 
I
L
 
L
I
 
V
K
 
R
I
 
V
H
 
E
K
 
A
T
 
A
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
|
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
I
 
I
Y
 
W
K
 
K
W
 
W
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
S
 
A
Q
 
R
Q
 
G
T
 
R
I
 
I
P
 
R
V
 
P
P
 
P
M
 
L
V
 
V
V
 
T
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
F
A
 
S
G
 
G
E
 
V
V
 
V
V
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
E
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
R
F
 
P
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
S
 
S
G
 
L
E
 
E
G
 
S
H
 
H
I
 
I
T
 
V
C
|
C
G
 
H
H
 
A
C
|
C
R
 
P
N
 
A
C
|
C
R
 
R
A
 
T
G
 
G
R
 
N
R
 
Y
H
 
H
L
 
V
C
|
C
R
 
L
N
 
N
T
 
T
T
x
Q
G
 
I
V
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
D
R
 
R
P
 
D
G
 
G
C
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
Y
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
W
K
 
V
L
 
N
A
 
P
D
 
K
D
 
D
I
 
L
S
 
P
D
 
F
D
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
L
D
 
E
P
|
P
F
 
F
G
 
G
N
 
N
A
|
A
V
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
S
 
A
F
 
G
D
 
S
L
 
G
V
 
V
-
 
S
G
 
G
E
 
K
D
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
G
|
G
P
|
P
I
|
I
G
 
G
I
 
L
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
M
V
 
V
A
 
V
R
 
R
H
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
G
H
 
P
V
 
I
V
 
L
I
 
V
T
x
S
D
|
D
V
x
P
N
 
N
R
 
P
Y
 
Y
R
|
R
L
 
L
D
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
P
M
 
Y
G
 
-
A
 
A
S
 
D
R
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
N
V
 
P
S
 
L
Q
 
E
Q
 
E
S
 
D
L
 
L
D
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
V
T
 
R
E
 
R
L
 
V
G
 
-
M
 
T
T
 
G
E
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
V
G
 
L
M
 
L
E
 
E
M
x
F
S
|
S
G
 
G
V
x
N
P
 
E
A
 
A
A
|
A
F
 
I
C
 
H
D
 
Q
L
 
G
L
 
L
A
 
M
K
 
A
M
 
L
N
 
I
H
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
E
V
 
A
A
 
R
L
 
I
L
|
L
G
|
G
I
|
I
P
 
P
P
 
S
S
 
D
S
 
P
M
 
I
P
 
R
I
 
F
D
 
D
W
 
L
-
 
A
N
 
G
Q
 
E
V
 
L
I
 
V
F
 
M
K
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
T
I
 
A
K
 
F
G
 
G
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
R
M
 
L
F
 
W
E
 
Q
T
 
T
W
 
W
Y
 
M
K
 
Q
M
 
G
A
 
T
S
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
Y
S
 
S
G
 
G
-
 
R
L
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
M
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
R
Y
 
L
K
 
P
V
 
L
D
 
S
D
 
R
F
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
A
 
L
M
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
C
 
A
G
 
V
K
|
K
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D

2dq4A Crystal structure of threonine 3-dehydrogenase
45% identity, 99% coverage: 1:339/344 of query aligns to 1:340/343 of 2dq4A

query
sites
2dq4A
M
 
M
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
A
A
 
P
E
 
E
P
 
E
G
 
G
I
 
L
W
 
T
M
 
L
T
 
V
E
 
D
V
 
R
P
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
P
G
 
G
H
 
P
N
 
G
D
 
E
L
 
I
L
 
L
I
 
V
K
 
R
I
 
V
H
 
E
K
 
A
T
 
A
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
|
T
D
 
D
L
 
L
H
|
H
I
 
I
Y
 
W
K
 
K
W
 
W
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
S
 
A
Q
 
R
Q
 
G
T
 
R
I
 
I
P
 
R
V
 
P
P
 
P
M
 
L
V
 
V
V
 
T
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
F
A
 
S
G
 
G
E
 
V
V
 
V
V
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
E
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
R
F
 
P
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
S
 
S
G
 
L
E
 
E
G
 
S
H
 
H
I
 
I
T
 
V
C
|
C
G
 
H
H
 
A
C
|
C
R
 
P
N
 
A
C
|
C
R
 
R
A
 
T
G
 
G
R
 
N
R
 
Y
H
 
H
L
 
V
C
|
C
R
 
L
N
 
N
T
 
T
T
x
Q
G
 
I
V
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
D
R
 
R
P
 
D
G
 
G
C
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
Y
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
W
K
 
V
L
 
N
A
 
P
D
 
K
D
 
D
I
 
L
S
 
P
D
 
F
D
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
L
D
 
E
P
|
P
F
 
F
G
 
G
N
 
N
A
|
A
V
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
S
 
A
F
 
G
D
 
S
L
 
G
V
 
V
-
 
S
G
 
G
E
 
K
D
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
M
V
 
V
A
 
V
R
 
R
H
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
G
H
 
P
V
 
I
V
 
L
I
 
V
T
 
S
D
 
D
V
 
P
N
 
N
R
 
P
Y
 
Y
R
 
R
L
 
L
D
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
P
M
 
Y
G
 
-
A
 
A
S
 
D
R
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
N
V
 
P
S
 
L
Q
 
E
Q
 
E
S
 
D
L
 
L
D
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
V
T
 
R
E
 
R
L
 
V
G
 
-
M
 
T
T
 
G
E
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
V
G
 
L
M
 
L
E
 
E
M
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
N
P
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
I
C
 
H
D
 
Q
L
 
G
L
 
L
A
 
M
K
 
A
M
 
L
N
 
I
H
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
E
V
 
A
A
 
R
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
P
 
P
P
 
S
S
 
D
S
 
P
M
 
I
P
 
R
I
 
F
D
 
D
W
 
L
-
 
A
N
 
G
Q
 
E
V
 
L
I
 
V
F
 
M
K
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
T
I
 
A
K
 
F
G
 
G
I
 
I
Y
 
A
G
 
G
R
 
R
E
 
R
M
 
L
F
 
W
E
 
Q
T
 
T
W
 
W
Y
 
M
K
 
Q
M
 
G
A
 
T
S
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
Y
S
 
S
G
 
G
-
 
R
L
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
M
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
R
Y
 
L
K
 
P
V
 
L
D
 
S
D
 
R
F
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
A
 
L
M
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
C
 
A
G
 
V
K
|
K
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D

Q5SKS4 L-threonine 3-dehydrogenase; TDH; EC 1.1.1.103 from Thermus thermophilus (strain ATCC 27634 / DSM 579 / HB8)
45% identity, 99% coverage: 1:339/344 of query aligns to 1:340/343 of Q5SKS4

query
sites
Q5SKS4
M
 
M
K
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
K
 
K
L
 
L
K
 
A
A
 
P
E
 
E
P
 
E
G
 
G
I
 
L
W
 
T
M
 
L
T
 
V
E
 
D
V
 
R
P
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
E
L
 
P
G
 
G
H
 
P
N
 
G
D
 
E
L
 
I
L
 
L
I
 
V
K
 
R
I
 
V
H
 
E
K
 
A
T
 
A
A
 
S
I
 
I
C
|
C
G
 
G
T
 
T
D
 
D
L
 
L
H
 
H
I
 
I
Y
 
W
K
 
K
W
 
W
D
 
D
Q
 
A
W
 
W
S
 
A
Q
 
R
Q
 
G
T
 
R
I
 
I
P
 
R
V
 
P
P
 
P
M
 
L
V
 
V
V
 
T
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
F
A
 
S
G
 
G
E
 
V
V
 
V
V
 
E
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
P
E
 
G
V
 
V
R
 
R
G
 
R
F
 
P
E
 
Q
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
H
V
 
V
S
 
S
G
 
L
E
 
E
G
 
S
H
 
H
I
 
I
T
 
V
C
|
C
G
 
H
H
 
A
C
|
C
R
 
P
N
 
A
C
|
C
R
 
R
A
 
T
G
 
G
R
 
N
R
 
Y
H
 
H
L
 
V
C
|
C
R
 
L
N
 
N
T
 
T
T
 
Q
G
 
I
V
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
D
R
 
R
P
 
D
G
 
G
C
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
V
 
V
I
 
V
P
 
P
A
 
A
Y
 
E
N
 
N
A
 
A
F
 
W
K
 
V
L
 
N
A
 
P
D
 
K
D
 
D
I
 
L
S
 
P
D
 
F
D
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
L
D
 
E
P
 
P
F
 
F
G
 
G
N
 
N
A
 
A
V
 
V
H
 
H
T
 
T
A
 
V
L
 
Y
S
 
A
F
 
G
D
 
S
L
 
G
V
 
V
-
 
S
G
 
G
E
 
K
D
 
S
V
 
V
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
I
|
I
G
 
G
I
 
L
M
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
M
V
 
V
A
 
V
R
 
R
H
 
A
S
 
S
G
 
G
A
 
A
R
 
G
H
 
P
V
 
I
V
 
L
I
 
V
T
 
S
D
|
D
V
 
P
N
 
N
R
 
P
Y
 
Y
R
|
R
L
 
L
D
 
A
L
 
F
A
 
A
R
 
R
Q
 
P
M
 
Y
G
 
-
A
 
A
S
 
D
R
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
N
V
 
P
S
 
L
Q
 
E
Q
 
E
S
 
D
L
 
L
D
 
L
E
 
E
V
 
V
M
 
V
T
 
R
E
 
R
L
 
V
G
 
-
M
 
T
T
 
G
E
 
S
G
 
G
F
 
V
D
 
E
V
 
V
G
 
L
M
 
L
E
 
E
M
 
F
S
 
S
G
 
G
V
 
N
P
 
E
A
 
A
A
 
A
F
 
I
C
 
H
D
 
Q
L
 
G
L
 
L
A
 
M
K
 
A
M
 
L
N
 
I
H
 
P
G
 
G
G
 
G
K
 
E
V
 
A
A
 
R
L
 
I
L
|
L
G
|
G
I
|
I
P
 
P
P
 
S
S
 
D
S
 
P
M
 
I
P
 
R
I
 
F
D
 
D
W
 
L
-
 
A
N
 
G
Q
 
E
V
 
L
I
 
V
F
 
M
K
 
R
G
 
G
L
 
I
T
 
T
I
 
A
K
 
F
G
 
G
I
|
I
Y
x
A
G
|
G
R
 
R
E
 
R
M
 
L
F
 
W
E
 
Q
T
 
T
W
 
W
Y
 
M
K
 
Q
M
 
G
A
 
T
S
 
A
L
 
L
V
 
V
Q
 
Y
S
 
S
G
 
G
-
 
R
L
 
V
D
 
D
L
 
L
S
 
S
P
 
P
M
 
L
L
 
L
T
 
T
H
 
H
H
 
R
Y
 
L
K
 
P
V
 
L
D
 
S
D
 
R
F
 
Y
Q
 
R
Q
 
E
G
 
A
F
 
F
D
 
G
A
 
L
M
 
L
L
 
A
S
 
S
G
 
G
Q
 
Q
C
 
A
G
 
V
K
 
K
V
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
D

4ejmA Crystal structure of a putative zinc-binding dehydrogenase (target psi-012003) from sinorhizobium meliloti 1021 bound to NADP
32% identity, 93% coverage: 1:320/344 of query aligns to 4:322/342 of 4ejmA

query
sites
4ejmA
M
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
-
K
 
R
L
 
L
K
 
E
A
 
S
E
 
V
P
 
G
G
 
N
I
 
I
W
 
S
M
 
V
T
 
R
E
 
N
V
 
V
P
 
G
V
 
I
P
 
P
E
 
E
L
 
P
G
 
G
H
 
P
N
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
V
K
 
K
I
 
V
H
 
E
K
 
A
T
 
C
A
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
|
T
D
 
D
L
 
R
H
|
H
I
 
L
Y
 
L
K
 
H
W
 
G
D
 
E
Q
 
F
W
 
P
S
 
S
Q
 
T
Q
 
P
T
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
P
M
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
F
A
 
C
G
 
G
E
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
E
I
 
A
G
 
G
Q
 
S
E
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
D
F
 
I
E
 
A
I
 
P
G
 
G
D
 
A
R
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
G
E
 
D
G
 
P
H
 
N
I
 
I
T
 
S
C
|
C
G
 
G
H
 
R
C
|
C
R
 
P
N
 
Q
C
|
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
V
H
 
N
L
 
L
C
|
C
R
 
R
N
 
N
T
 
L
T
x
R
G
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
H
R
 
R
P
 
D
G
 
G
C
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
V
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
R
Y
 
K
N
 
Q
A
 
A
F
 
F
K
 
E
L
 
I
A
 
P
D
 
L
D
 
T
I
 
L
S
 
D
D
 
P
D
 
V
L
 
H
A
 
G
A
 
A
I
 
F
F
 
C
D
 
E
P
|
P
F
 
L
G
 
A
N
 
C
A
x
C
V
 
L
H
 
H
T
 
G
A
 
V
-
 
D
L
 
L
S
 
S
F
 
G
D
 
I
L
 
K
V
 
A
G
 
G
E
 
S
D
 
T
V
 
V
L
 
A
I
 
I
T
 
L
G
|
G
A
 
G
G
|
G
P
x
V
I
|
I
G
 
G
I
 
L
M
 
L
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
H
 
T
V
 
V
V
 
I
I
 
L
T
 
S
D
x
T
V
x
R
N
x
Q
R
 
A
Y
 
T
R
x
K
L
 
R
D
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
E
Q
 
E
M
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
A
A
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
S
Q
 
A
Q
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
V
E
 
E
V
 
A
M
 
I
T
 
A
-
 
G
E
 
P
L
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
V
E
 
P
-
 
G
G
 
G
F
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
V
M
 
I
E
 
E
M
x
C
S
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
A
x
E
A
x
T
F
 
V
C
 
K
D
 
Q
L
 
S
L
 
T
A
 
R
K
 
L
M
 
A
N
 
K
H
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
T
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
|
L
G
 
G
I
x
V
P
 
L
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
S
 
E
S
 
K
M
 
V
P
 
E
I
 
I
D
 
E
W
 
P
N
 
F
Q
 
D
V
 
I
I
 
L
F
 
F
K
 
R
G
 
E
L
 
L
T
 
R
I
 
V
K
 
L
G
 
G
I
 
S
Y
 
F
G
x
I
R
 
N
E
 
P
M
 
F
F
 
V
E
 
-
T
 
-
W
 
H
Y
 
R
K
 
R
M
 
A
A
 
A
S
 
D
L
 
L
V
 
V
Q
 
A
S
 
T
G
 
G
-
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
I
S
 
D
P
 
R
M
 
M
L
 
I
T
 
S
H
 
R
H
 
R
Y
 
I
K
 
S
V
 
L
D
 
D
D
 
E

Sites not aligning to the query:

4ej6A Crystal structure of a putative zinc-binding dehydrogenase (target psi-012003) from sinorhizobium meliloti 1021
32% identity, 93% coverage: 1:320/344 of query aligns to 4:322/343 of 4ej6A

query
sites
4ej6A
M
 
M
K
 
K
A
 
A
L
 
V
A
 
-
K
 
R
L
 
L
K
 
E
A
 
S
E
 
V
P
 
G
G
 
N
I
 
I
W
 
S
M
 
V
T
 
R
E
 
N
V
 
V
P
 
G
V
 
I
P
 
P
E
 
E
L
 
P
G
 
G
H
 
P
N
 
D
D
 
D
L
 
L
L
 
L
I
 
V
K
 
K
I
 
V
H
 
E
K
 
A
T
 
C
A
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
|
T
D
 
D
L
 
R
H
|
H
I
 
L
Y
 
L
K
 
H
W
 
G
D
 
E
Q
 
F
W
 
P
S
 
S
Q
 
T
Q
 
P
T
 
-
I
 
-
P
 
-
V
 
-
P
 
P
M
 
V
V
 
T
V
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
F
A
 
C
G
 
G
E
 
I
V
 
V
V
 
V
A
 
E
I
 
A
G
 
G
Q
 
S
E
 
A
V
 
V
R
 
R
G
 
D
F
 
I
E
 
A
I
 
P
G
 
G
D
 
A
R
 
R
V
 
I
S
 
T
G
 
G
E
 
D
G
 
P
H
 
N
I
 
I
T
 
S
C
|
C
G
 
G
H
 
R
C
|
C
R
 
P
N
 
Q
C
|
C
R
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
V
H
 
N
L
 
L
C
|
C
R
 
R
N
 
N
T
 
L
T
x
R
G
 
A
V
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
H
R
 
R
P
 
D
G
 
G
C
 
G
F
 
F
A
 
A
E
 
E
Y
 
Y
L
 
V
V
 
L
I
 
V
P
 
P
A
 
R
Y
 
K
N
 
Q
A
 
A
F
 
F
K
 
E
L
 
I
A
 
P
D
 
L
D
 
T
I
 
L
S
 
D
D
 
P
D
 
V
L
 
H
A
 
G
A
 
A
I
 
F
F
 
C
D
 
E
P
|
P
F
 
L
G
 
A
N
 
C
A
x
C
V
 
L
H
 
H
T
 
G
A
 
V
-
 
D
L
 
L
S
 
S
F
 
G
D
 
I
L
 
K
V
 
A
G
 
G
E
 
S
D
 
T
V
 
V
L
 
A
I
 
I
T
 
L
G
 
G
A
 
G
G
 
G
P
 
V
I
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
L
A
 
T
A
 
V
A
 
Q
V
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
L
S
 
A
G
 
G
A
 
A
R
 
T
H
 
T
V
 
V
V
 
I
I
 
L
T
 
S
D
 
T
V
 
R
N
 
Q
R
 
A
Y
 
T
R
 
K
L
 
R
D
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
E
Q
 
E
M
 
V
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
A
A
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
P
S
 
S
Q
 
A
Q
 
G
S
 
D
L
 
V
D
 
V
E
 
E
V
 
A
M
 
I
T
 
A
-
 
G
E
 
P
L
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
V
E
 
P
-
 
G
G
 
G
F
 
V
D
 
D
V
 
V
G
 
V
M
 
I
E
 
E
M
 
C
S
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
A
A
 
E
A
 
T
F
 
V
C
 
K
D
 
Q
L
 
S
L
 
T
A
 
R
K
 
L
M
 
A
N
 
K
H
 
A
G
 
G
G
 
G
K
 
T
V
 
V
A
 
V
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
L
P
 
P
-
 
Q
-
 
G
S
 
E
S
 
K
M
 
V
P
 
E
I
 
I
D
 
E
W
 
P
N
 
F
Q
 
D
V
 
I
I
 
L
F
 
F
K
 
R
G
 
E
L
 
L
T
 
R
I
 
V
K
 
L
G
 
G
I
 
S
Y
 
F
G
 
I
R
 
N
E
 
P
M
 
F
F
 
V
E
 
-
T
 
-
W
 
H
Y
 
R
K
 
R
M
 
A
A
 
A
S
 
D
L
 
L
V
 
V
Q
 
A
S
 
T
G
 
G
-
 
A
L
 
I
D
 
E
L
 
I
S
 
D
P
 
R
M
 
M
L
 
I
T
 
S
H
 
R
H
 
R
Y
 
I
K
 
S
V
 
L
D
 
D
D
 
E

Sites not aligning to the query:

5vm2A Crystal structure of eck1772, an oxidoreductase/dehydrogenase of unknown specificity involved in membrane biogenesis from escherichia coli
28% identity, 96% coverage: 2:332/344 of query aligns to 5:335/347 of 5vm2A

query
sites
5vm2A
K
 
K
A
 
A
L
 
I
A
 
L
K
 
Q
L
 
V
K
 
P
A
 
G
E
 
T
P
 
M
G
 
K
I
 
I
W
 
I
M
 
S
T
 
A
E
 
E
V
 
I
P
 
P
V
 
V
P
 
P
E
 
K
L
 
-
G
 
-
H
 
E
N
 
D
D
 
E
L
 
V
L
 
L
I
 
I
K
 
K
I
 
V
H
 
E
K
 
Y
T
 
V
A
 
G
I
 
I
C
|
C
G
|
G
T
x
S
D
 
D
L
 
V
H
|
H
I
 
G
Y
 
F
K
 
E
W
 
S
D
 
G
Q
 
P
W
 
F
S
 
I
Q
 
P
Q
 
P
T
 
K
I
 
D
P
 
P
V
 
N
P
 
Q
M
 
E
V
 
I
-
 
G
V
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
C
A
 
A
G
 
G
E
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
A
I
 
V
G
 
G
Q
 
S
E
 
R
V
 
V
R
 
R
G
 
K
F
 
F
E
 
K
I
 
P
G
 
G
D
 
D
R
 
R
V
 
V
S
 
N
G
 
I
E
 
E
G
 
P
H
 
G
I
 
V
T
 
P
C
|
C
G
 
G
H
 
H
C
|
C
R
 
R
N
 
Y
C
|
C
R
 
L
A
 
E
G
 
G
R
 
K
R
 
Y
H
 
N
L
 
I
C
|
C
R
 
P
N
 
D
T
 
V
T
x
D
G
 
F
V
 
M
G
 
A
V
 
T
-
 
Q
-
 
P
N
 
N
R
 
Y
P
 
R
G
 
G
C
 
A
F
 
L
A
 
T
E
 
H
Y
 
Y
L
 
L
V
 
C
I
 
H
P
 
P
A
 
E
Y
 
S
N
 
F
A
 
T
F
 
Y
K
 
K
L
 
L
A
 
P
D
 
D
D
 
N
I
 
M
S
 
D
D
 
T
D
 
M
L
 
E
A
 
G
A
 
T
I
 
L
F
 
V
D
x
E
P
|
P
F
 
A
G
 
A
N
 
V
A
x
G
V
 
M
H
 
H
T
 
A
A
 
A
L
 
M
S
 
L
F
 
A
D
 
D
L
 
V
V
 
K
-
 
P
G
 
G
E
 
K
D
 
K
V
 
I
L
 
I
I
 
I
T
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
C
I
 
I
G
 
G
I
 
L
M
 
M
A
 
T
A
 
L
A
 
Q
V
 
A
A
 
C
R
 
K
H
 
C
S
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
T
H
 
E
V
 
I
V
 
A
I
 
V
T
 
V
D
 
D
V
 
V
N
 
L
R
 
E
Y
 
K
R
 
R
L
 
L
D
 
A
L
 
M
A
 
A
R
 
E
Q
 
Q
M
 
L
G
 
G
A
 
A
S
 
T
R
 
V
A
 
V
V
 
I
D
 
N
V
 
G
S
 
A
Q
 
K
Q
 
E
S
 
D
L
 
T
D
 
I
E
 
A
V
 
R
M
 
C
T
 
Q
E
 
Q
L
 
F
G
 
T
M
 
E
T
 
D
E
 
M
G
 
G
F
 
A
D
 
D
V
 
I
G
 
V
M
 
F
E
 
E
M
 
T
S
 
A
G
 
G
V
 
S
P
 
A
A
 
V
A
 
T
F
 
V
C
 
K
D
 
Q
L
 
A
L
 
P
A
 
Y
K
 
L
M
 
V
N
 
M
H
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
K
V
 
I
A
 
M
L
 
I
L
 
V
G
 
G
I
 
T
P
 
V
P
 
P
S
 
G
S
 
A
M
 
S
P
 
A
I
 
I
D
 
N
W
 
F
N
 
L
Q
 
K
V
 
-
I
 
I
F
 
N
K
 
R
G
 
E
L
 
V
T
 
T
I
 
I
K
 
Q
G
 
T
I
 
V
Y
 
F
G
 
-
R
 
R
E
 
Y
M
 
A
F
 
N
E
 
R
T
 
Y
W
 
P
Y
 
V
K
 
T
M
 
I
A
 
E
S
 
A
L
 
I
V
 
S
Q
 
S
S
 
G
G
 
R
L
 
F
D
 
D
L
 
V
S
 
K
P
 
S
M
 
M
L
 
V
T
 
T
H
 
H
H
 
I
Y
 
Y
K
 
D
V
 
Y
D
 
R
D
 
D
F
 
V
Q
 
Q
Q
 
Q
G
 
A
F
 
F
D
 
E
A
 
E
M
 
S
L
 
V
S
 
N
G
 
N
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

7y9pA Xylitol dehydrogenase s96c/s99c/y102c mutant(thermostabilized form) from pichia stipitis (see paper)
30% identity, 91% coverage: 21:332/344 of query aligns to 22:347/357 of 7y9pA

query
sites
7y9pA
P
 
P
E
 
E
L
 
I
G
 
S
H
 
E
-
 
P
N
 
T
D
 
D
L
 
V
L
 
L
I
 
V
K
 
Q
I
 
V
H
 
K
K
 
K
T
 
T
A
 
G
I
 
I
C
|
C
G
 
G
T
 
S
D
 
D
L
 
I
H
 
H
I
 
F
Y
 
Y
K
 
A
W
 
H
D
 
G
Q
 
R
W
 
I
S
 
G
Q
 
N
Q
 
F
T
 
V
I
 
L
P
 
T
V
 
K
P
 
P
M
 
M
V
 
V
V
 
L
G
 
G
H
|
H
E
|
E
Y
 
S
A
 
A
G
 
G
E
 
T
V
 
V
V
 
V
A
 
Q
I
 
V
G
 
G
Q
 
K
E
 
G
V
 
V
R
 
T
G
 
S
F
 
L
E
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
N
V
 
V
S
 
A
G
 
I
E
 
E
G
 
P
H
 
G
I
 
I
T
 
P
C
|
C
G
 
R
H
 
F
C
|
C
R
 
D
N
 
E
C
|
C
R
 
K
A
 
S
G
 
G
R
 
H
R
 
Y
H
 
N
L
 
L
C
|
C
R
 
P
N
 
H
-
 
M
-
 
A
-
 
F
-
 
A
T
 
A
T
 
T
G
 
P
V
 
N
G
 
E
V
 
P
N
 
N
R
 
P
P
 
P
G
 
G
C
 
T
F
 
L
A
 
C
E
 
K
Y
 
Y
L
 
F
V
 
K
I
 
S
P
 
P
A
 
E
Y
 
D
N
 
F
A
 
L
F
 
V
K
 
K
L
 
L
A
 
P
D
 
D
D
 
H
I
 
V
S
 
S
D
 
L
D
 
E
L
 
L
A
 
G
A
 
A
I
 
L
F
 
V
D
 
E
P
 
P
F
 
L
G
 
S
N
 
V
A
 
G
V
 
V
H
 
H
T
 
A
A
 
S
-
 
K
L
 
L
S
 
G
F
 
S
D
 
V
L
 
A
V
 
F
G
 
G
E
 
D
D
 
Y
V
 
V
L
 
A
I
 
V
T
 
F
G
 
G
A
 
A
G
 
G
P
 
P
I
 
V
G
 
G
I
 
L
M
 
L
A
 
A
A
 
A
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
K
H
 
T
S
 
F
G
 
G
A
 
A
R
 
K
H
 
G
V
 
V
V
 
I
I
 
V
T
 
V
D
 
D
V
 
I
N
 
F
R
 
D
Y
 
N
R
 
K
L
 
L
D
 
K
L
 
M
A
 
A
R
 
K
Q
 
D
M
 
I
G
 
G
A
 
A
S
 
A
R
 
T
A
 
H
V
 
T
D
 
F
V
 
N
S
 
S
Q
 
K
Q
 
T
S
 
G
L
 
G
D
 
S
E
 
E
V
 
E
M
 
L
T
 
I
E
 
K
L
 
A
<