SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Other sequence analysis tools:

Find papers: PaperBLAST

Search for conserved domains

Find the best match in UniProt

Compare to protein structures

Predict transmenbrane helices: Phobius

Predict protein localization: PSORTb

Find homologs in fast.genomics

Fitness BLAST: loading...

Comparing WP_089214372.1 NCBI__GCF_900188185.1:WP_089214372.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ju8A Crystal structure of succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa.
54% identity, 94% coverage: 3:456/483 of query aligns to 17:473/486 of 3ju8A

query
sites
3ju8A
E
 
E
E
 
T
L
 
L
I
 
E
S
 
S
H
 
L
E
 
D
P
 
P
A
 
V
T
 
G
G
 
Q
A
 
G
E
 
V
L
 
V
W
 
W
R
 
S
G
 
G
G
 
R
I
 
G
S
 
A
D
 
D
-
 
A
-
 
T
-
 
Q
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
C
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
A
 
A
W
 
F
P
 
P
G
 
A
W
 
W
A
 
A
A
 
R
K
 
R
P
 
P
L
 
L
A
 
E
Y
 
Q
R
 
R
A
 
I
E
 
E
T
 
L
L
 
L
R
 
E
R
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
A
R
 
T
V
 
L
K
 
K
A
 
S
D
 
R
A
 
A
E
 
D
S
 
E
F
 
L
A
 
A
D
 
R
L
 
V
I
 
I
A
 
G
R
 
E
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
W
 
W
E
 
E
A
 
S
R
 
A
T
 
T
E
 
E
V
 
V
E
 
T
S
 
S
V
 
M
A
 
V
A
 
N
K
 
K
V
 
V
D
 
A
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
Q
A
 
A
Y
 
F
A
 
R
E
 
E
R
 
R
T
 
T
P
 
G
N
 
E
R
 
K
R
 
-
I
 
-
E
 
S
G
 
G
A
 
P
M
 
L
G
 
A
L
 
D
R
 
A
H
 
T
A
 
A
V
 
V
-
 
L
R
 
R
H
 
H
K
 
K
P
 
P
H
 
H
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
F
G
|
G
P
 
P
Y
|
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
G
H
 
H
L
|
L
P
 
P
N
 
N
G
 
G
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
C
V
 
V
I
 
V
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
 
E
K
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
K
V
 
V
G
 
A
A
 
E
K
 
L
L
 
T
A
 
L
Q
 
K
L
 
A
F
 
W
H
 
I
S
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
N
L
 
L
V
 
V
I
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
R
D
 
E
Q
 
T
G
 
G
K
 
V
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
A
H
 
H
D
 
R
G
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
F
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
S
R
 
R
T
|
T
G
 
G
V
 
N
A
 
L
L
 
L
N
 
H
R
 
S
Q
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
G
R
 
Q
P
 
P
G
 
Q
K
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
M
|
M
G
|
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
L
V
 
V
V
 
V
W
 
E
D
 
E
T
 
V
P
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
V
M
 
Y
L
 
T
V
 
I
V
 
I
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
I
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
P
Q
 
Q
T
 
G
V
 
A
-
 
W
A
 
G
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
L
D
 
A
E
 
R
V
 
L
R
 
V
N
 
A
L
 
V
T
 
S
N
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
R
V
 
V
D
 
G
H
 
R
P
 
F
H
 
D
A
 
E
D
 
Q
P
 
P
A
 
A
P
 
P
Y
 
F
M
 
M
G
 
G
P
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
N
 
L
E
 
S
A
 
A
A
 
A
D
 
E
G
 
H
L
 
L
T
 
L
E
 
K
S
 
A
F
 
Q
L
 
E
I
 
H
L
 
L
M
 
I
S
 
G
N
 
K
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
V
 
P
I
 
L
R
 
L
H
 
A
M
 
M
T
 
T
R
 
Q
P
 
P
I
 
I
A
 
D
D
 
G
R
 
A
P
 
A
F
 
L
L
 
L
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
I
I
 
L
D
 
D
V
 
V
T
 
S
A
 
A
M
 
V
P
 
A
E
 
E
R
 
R
P
 
P
D
 
D
I
 
E
E
|
E
L
 
F
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
Q
L
 
V
V
 
I
R
 
R
V
 
Y
D
 
S
S
 
D
F
 
F
E
 
A
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
R
E
 
E
A
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
A
 
Q
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
I
 
L
G
 
S
G
 
D
T
 
S
P
 
R
Q
 
E
L
 
R
Y
 
F
D
 
E
Q
 
Q
F
 
F
W
 
L
A
 
V
N
 
E
A
 
S
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
V
N
 
N
W
 
W
N
 
N
R
 
K
P
 
Q
T
 
L
N
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
A
S
 
S
A
 
S
A
 
A
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
L
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
R
 
R
P
|
P
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
Y
 
Y
P
 
P
V
 
V
A
 
A
S
 
S
S
 
L
E
 
E
S
 
S

5u0mA Fatty aldehyde dehydrogenase from marinobacter aquaeolei vt8 and cofactor complex (see paper)
51% identity, 93% coverage: 7:456/483 of query aligns to 22:473/488 of 5u0mA

query
sites
5u0mA
S
 
S
H
 
V
E
 
Q
P
 
P
A
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
E
E
 
T
L
 
V
W
 
W
R
 
D
G
 
G
G
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
S
I
 
L
S
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
E
A
 
A
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
F
P
 
L
G
 
A
W
 
W
A
 
R
A
 
R
K
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
Q
E
 
A
T
 
V
L
 
I
R
 
E
R
 
A
F
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
A
D
 
N
A
 
K
E
 
E
S
 
E
F
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
W
 
W
E
 
E
A
 
S
R
 
R
T
 
T
E
 
E
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
M
A
 
M
A
 
G
K
 
K
V
 
I
D
 
P
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
A
 
N
E
 
E
R
 
R
T
 
T
P
 
G
N
 
H
R
 
T
R
 
E
I
 
S
E
 
D
G
 
V
A
 
A
M
 
G
G
 
G
L
 
-
R
 
-
H
 
H
A
 
A
V
 
V
-
 
L
R
 
R
H
 
H
K
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
L
x
F
G
 
G
P
 
P
Y
|
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
G
H
 
H
L
 
L
P
 
P
N
 
N
G
 
G
H
 
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
K
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
G
V
 
V
G
 
A
A
 
E
K
 
L
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
F
 
W
H
 
E
S
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
D
E
 
G
V
 
V
L
 
I
R
 
N
L
 
L
V
 
V
I
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
S
D
 
D
Q
 
T
G
|
G
K
 
K
A
 
C
L
 
L
A
 
A
G
 
R
H
 
H
D
 
S
G
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
F
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
S
R
 
T
T
x
V
G
 
G
V
 
H
A
 
L
L
 
L
N
 
H
R
 
E
Q
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
G
R
 
Q
P
 
P
G
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
M
|
M
G
|
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
L
V
 
I
V
 
V
W
 
Q
D
 
N
T
 
V
P
 
S
D
 
D
I
 
L
R
 
D
T
 
G
A
 
A
A
 
V
M
 
H
L
 
H
V
 
A
V
 
L
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
V
 
V
-
 
P
R
 
K
Q
 
G
T
 
K
V
 
K
A
 
G
E
 
D
A
 
E
L
 
F
I
 
L
D
 
A
E
 
R
V
 
L
R
 
V
N
 
E
L
 
V
T
 
A
N
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
T
V
 
V
D
 
A
H
 
E
P
 
F
H
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
P
 
P
Y
 
F
M
 
M
G
 
G
P
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
S
N
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
N
G
 
Q
L
 
L
T
 
L
E
 
K
S
 
A
F
 
Q
L
 
A
I
 
A
L
 
M
M
 
L
S
 
E
N
 
K
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
S
I
 
L
R
 
L
H
 
E
M
 
M
T
 
K
R
 
Q
P
 
L
I
 
K
A
 
P
D
 
D
R
 
T
P
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
I
I
 
V
D
 
D
V
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
I
P
 
-
E
 
E
R
 
L
P
 
E
D
 
D
I
 
Q
E
|
E
L
 
F
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
L
 
V
V
 
Y
R
 
R
V
 
Y
D
 
K
S
 
G
F
 
F
E
 
D
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
E
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
N
T
 
T
A
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
S
G
 
D
T
 
D
P
 
R
Q
 
K
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
Q
 
R
F
 
L
W
 
V
A
 
E
N
 
E
A
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
V
N
 
N
W
 
W
N
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
L
N
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
S
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
R
 
R
P
|
P
S
 
S
A
 
A
F
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
Y
 
W
P
 
P
V
 
M
A
 
A
S
 
S
S
 
L
E
 
E
S
 
A

5u0lA X-ray crystal structure of fatty aldehyde dehydrogenase enzymes from marinobacter aquaeolei vt8 complexed with a substrate (see paper)
51% identity, 93% coverage: 7:456/483 of query aligns to 22:473/488 of 5u0lA

query
sites
5u0lA
S
 
S
H
 
V
E
 
Q
P
 
P
A
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
E
E
 
T
L
 
V
W
 
W
R
 
D
G
 
G
G
 
N
-
 
A
-
 
A
-
 
S
I
 
L
S
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
E
A
 
A
R
 
R
Q
 
K
A
 
A
W
 
F
P
 
L
G
 
A
W
 
W
A
 
R
A
 
R
K
 
K
P
 
S
L
 
L
A
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
Q
E
 
A
T
 
V
L
 
I
R
 
E
R
 
A
F
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
A
D
 
N
A
 
K
E
 
E
S
 
E
F
 
L
A
 
A
D
 
H
L
 
Q
I
 
I
A
 
G
R
 
L
E
 
E
T
 
T
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
W
 
W
E
 
E
A
 
S
R
 
R
T
 
T
E
 
E
V
 
V
E
 
A
S
 
A
V
 
M
A
 
M
A
 
G
K
|
K
V
 
I
D
 
P
I
 
I
S
 
S
V
 
V
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
A
 
N
E
 
E
R
 
R
T
 
T
P
 
G
N
 
H
R
 
T
R
 
E
I
 
S
E
 
D
G
 
V
A
 
A
M
 
G
G
 
G
L
 
-
R
 
-
H
 
H
A
 
A
V
 
V
-
 
L
R
 
R
H
 
H
K
 
R
P
 
P
H
 
H
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
A
V
 
V
L
 
F
G
 
G
P
 
P
Y
 
Y
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
G
H
|
H
L
|
L
P
 
P
N
 
N
G
|
G
H
|
H
I
 
I
V
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
K
 
L
T
 
T
P
 
P
A
 
G
V
 
V
G
 
A
A
 
E
K
 
L
L
 
T
A
 
V
Q
 
R
L
 
L
F
 
W
H
 
E
S
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
D
E
 
G
V
 
V
L
 
I
R
 
N
L
 
L
V
 
V
I
 
Q
G
 
G
G
 
G
P
 
S
D
 
D
Q
 
T
G
 
G
K
 
K
A
 
C
L
 
L
A
 
A
G
 
R
H
 
H
D
 
S
G
 
L
I
 
I
D
 
D
G
 
G
L
 
L
L
 
F
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
A
 
S
R
 
T
T
 
V
G
 
G
V
 
H
A
 
L
L
 
L
N
 
H
R
 
E
Q
 
Q
F
 
F
A
 
G
D
 
G
R
 
Q
P
 
P
G
 
E
K
 
K
I
 
I
L
 
L
A
 
A
L
 
L
E
|
E
M
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
N
N
 
N
P
 
P
I
 
L
V
 
I
V
 
V
W
 
Q
D
 
N
T
 
V
P
 
S
D
 
D
I
 
L
R
 
D
T
 
G
A
 
A
A
 
V
M
 
H
L
 
H
V
 
A
V
 
L
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
C
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
L
V
 
V
-
 
P
R
 
K
Q
 
G
T
 
K
V
 
K
A
 
G
E
 
D
A
 
E
L
 
F
I
 
L
D
 
A
E
 
R
V
 
L
R
 
V
N
 
E
L
 
V
T
 
A
N
 
A
R
 
R
L
 
I
I
 
T
V
 
V
D
 
A
H
 
E
P
 
F
H
 
D
A
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
Q
P
 
P
Y
 
F
M
 
M
G
 
G
P
 
S
V
 
V
I
 
I
D
 
S
N
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
D
 
N
G
 
Q
L
 
L
T
 
L
E
 
K
S
 
A
F
 
Q
L
 
A
I
 
A
L
 
M
M
 
L
S
 
E
N
 
K
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
S
I
 
L
R
 
L
H
 
E
M
 
M
T
 
K
R
 
Q
P
 
L
I
 
K
A
 
P
D
 
D
R
 
T
P
 
G
F
 
L
L
 
L
T
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
I
I
 
V
D
 
D
V
 
A
T
 
T
A
 
G
M
 
I
P
 
-
E
 
E
R
 
L
P
 
E
D
 
D
I
 
Q
E
|
E
L
 
F
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
L
 
L
Q
 
T
L
 
V
V
 
Y
R
 
R
V
 
Y
D
 
K
S
 
G
F
 
F
E
 
D
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
E
E
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
N
T
 
T
A
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
S
G
 
D
T
 
D
P
 
R
Q
 
K
L
 
L
Y
 
Y
D
 
N
Q
 
R
F
 
L
W
 
V
A
 
E
N
 
E
A
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
I
I
 
V
N
 
N
W
 
W
N
 
N
R
 
R
P
 
P
T
 
L
N
 
T
G
 
G
A
 
A
S
 
S
S
 
S
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
N
H
 
H
R
 
R
P
|
P
S
|
S
A
|
A
F
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
D
 
D
Y
 
Y
C
 
C
A
 
A
Y
 
W
P
 
P
V
 
M
A
 
A
S
 
S
S
 
L
E
 
E
S
 
A

3hazA Crystal structure of bifunctional proline utilization a (puta) protein (see paper)
33% identity, 83% coverage: 37:435/483 of query aligns to 557:956/983 of 3hazA

query
sites
3hazA
G
 
G
W
 
W
A
 
S
A
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
A
A
 
G
Y
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
A
T
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
Q
F
 
A
A
 
A
D
 
H
R
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
S
D
 
R
A
 
S
E
 
A
S
 
H
F
 
F
A
 
I
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
R
 
R
E
 
E
T
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
T
L
 
L
W
 
D
E
 
D
A
 
A
R
 
L
T
 
S
E
 
E
V
 
L
E
 
R
S
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
D
K
 
F
V
 
C
D
 
R
I
 
Y
S
 
Y
V
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
K
 
K
A
 
L
Y
 
F
A
 
G
E
 
S
R
 
E
T
 
T
P
 
A
N
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
M
E
 
P
G
 
G
A
 
P
M
 
T
G
 
G
L
 
E
R
 
S
H
 
N
A
 
A
V
 
L
R
 
T
H
 
M
K
 
R
P
 
G
H
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
F
A
 
V
V
 
A
L
x
I
G
x
S
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
L
H
 
A
L
x
I
P
 
F
N
 
L
G
 
G
H
 
Q
I
 
V
V
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
I
 
V
F
 
A
K
|
K
P
|
P
S
x
A
E
 
E
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
R
V
 
I
G
 
A
A
 
R
K
 
E
L
 
A
A
 
V
Q
 
A
L
 
L
F
 
L
H
 
H
S
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
E
 
K
E
 
S
V
 
A
L
 
L
R
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
T
G
 
G
G
 
D
P
x
G
D
 
R
Q
 
I
G
|
G
K
x
A
A
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
A
H
 
H
D
 
P
G
 
D
I
 
I
D
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
V
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
R
 
E
T
x
V
G
 
A
V
 
R
A
 
S
L
x
I
N
 
N
R
 
R
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
K
P
 
D
G
 
G
K
 
P
I
 
I
L
 
V
A
 
P
L
 
L
-
 
I
-
 
A
E
|
E
M
x
T
G
 
G
G
 
G
N
 
I
N
 
N
P
 
A
I
 
M
V
 
I
V
 
A
W
 
D
D
 
A
T
 
T
P
 
A
D
 
L
I
 
P
R
 
E
T
 
Q
A
 
V
A
 
A
M
 
D
L
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
S
N
 
A
A
 
L
R
 
R
R
 
L
L
 
L
I
 
F
V
 
V
R
 
Q
Q
 
E
T
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
R
L
 
M
I
 
I
D
 
E
E
 
M
V
 
V
R
 
A
N
 
G
L
 
A
T
 
A
N
 
R
R
 
E
L
 
L
I
 
K
V
 
I
D
 
G
H
 
D
P
 
P
H
 
-
A
 
S
D
 
D
P
 
V
A
 
A
P
 
T
Y
 
H
M
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
D
N
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
K
D
 
Q
G
 
R
L
 
L
T
 
-
E
 
D
S
 
A
F
 
H
L
 
I
I
 
A
L
 
R
M
 
M
S
 
K
N
 
T
G
 
E
G
 
A
Q
 
R
V
 
L
I
 
-
R
 
-
H
 
H
M
 
F
T
 
A
R
 
G
P
 
P
I
 
A
A
 
P
D
 
E
R
 
G
P
 
C
F
 
F
L
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
H
I
 
I
I
 
F
D
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
E
M
 
A
P
 
G
E
 
Q
R
 
L
P
 
T
D
 
E
I
 
-
E
|
E
L
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
I
L
 
L
Q
 
H
L
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
Y
-
 
R
-
 
P
D
 
E
S
 
N
F
 
L
E
 
E
A
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
R
E
 
A
A
 
I
N
 
E
N
 
R
T
 
T
A
 
G
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
T
A
 
L
A
 
G
L
 
V
I
 
H
G
 
S
G
 
R
T
 
I
P
 
D
Q
 
D
L
 
S
Y
 
I
D
 
E
Q
 
A
F
 
I
W
 
I
A
 
D
N
 
R
A
 
V
R
 
Q
A
 
V
G
 
G
V
 
N
I
 
I
N
 
Y
W
 
V
N
 
N
R
 
R
P
 
N
T
 
M
N
 
I
G
 
G
A
 
A
-
 
V
S
 
V
S
 
G
A
 
V
A
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
I
 
N
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
T

Sites not aligning to the query:

P17202 Aminoaldehyde dehydrogenase BADH; 4-trimethylammoniobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Aminobutyraldehyde dehydrogenase BADH; Betaine aldehyde dehydrogenase; SoBADH; EC 1.2.1.-; EC 1.2.1.47; EC 1.2.1.19; EC 1.2.1.8 from Spinacia oleracea (Spinach) (see 3 papers)
29% identity, 90% coverage: 2:437/483 of query aligns to 32:466/497 of P17202

query
sites
P17202
S
 
T
E
 
E
E
 
E
L
 
I
I
 
I
S
 
G
H
 
D
E
 
I
P
 
P
A
 
A
T
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
E
L
 
-
W
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
V
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
W
 
F
-
 
R
-
 
R
P
 
N
G
 
N
W
 
W
A
 
S
A
 
A
K
 
T
P
 
S
L
 
G
A
 
A
Y
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
T
T
 
Y
L
 
L
R
 
R
R
 
A
F
 
I
A
 
A
D
 
A
R
 
K
V
 
I
K
 
T
A
 
E
D
 
K
A
 
K
E
 
D
S
 
H
F
 
F
A
 
V
D
 
K
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
I
E
x
D
T
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
F
W
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
V
T
 
L
E
 
D
V
 
I
E
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
S
K
 
C
V
 
F
D
 
E
-
 
Y
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
A
I
 
L
S
 
D
V
 
G
K
 
K
A
 
Q
Y
 
K
A
 
A
E
 
P
R
 
V
T
 
T
-
 
L
P
 
P
N
 
M
R
 
E
R
 
R
I
 
F
E
 
K
G
 
S
A
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
H
A
 
V
V
 
L
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
P
 
P
H
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
L
L
 
I
G
x
S
P
|
P
Y
x
W
N
 
N
F
x
Y
P
 
P
A
 
L
H
 
L
L
 
M
P
 
A
N
 
T
G
x
W
H
 
K
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
S
 
T
V
 
A
I
 
V
F
 
L
K
|
K
P
|
P
S
|
S
E
|
E
K
x
L
T
 
A
P
 
S
A
 
V
V
 
T
G
 
C
A
 
L
K
 
E
L
 
F
A
 
G
Q
 
E
L
 
V
F
 
C
H
 
N
S
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
P
E
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
N
L
 
I
V
 
L
I
 
T
G
 
G
-
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
D
Q
 
A
G
 
G
K
 
A
A
 
P
L
 
L
A
 
V
G
 
S
H
 
H
D
 
P
G
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
K
L
 
I
L
 
A
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
A
x
S
R
x
A
T
|
T
G
 
G
V
 
S
A
 
K
L
 
V
N
 
M
R
 
A
Q
 
S
F
 
-
A
 
A
D
 
A
R
 
Q
P
 
L
G
x
V
K
 
K
I
 
P
L
 
V
A
 
T
L
 
L
E
 
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
S
P
 
P
I
 
I
V
 
V
V
 
V
W
 
F
D
 
E
T
 
D
P
 
V
D
 
D
I
 
I
R
 
D
T
 
K
A
 
V
A
 
V
M
 
E
L
 
W
V
 
T
V
 
I
Q
 
F
S
 
G
A
 
C
F
 
F
L
x
W
S
 
T
A
 
N
G
 
G
Q
 
Q
R
 
I
C
 
C
T
 
S
N
 
A
A
 
T
R
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
H
Q
 
E
T
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
E
L
 
F
I
 
V
D
 
D
E
 
K
V
 
L
R
 
V
N
 
K
L
 
W
T
 
T
N
 
K
R
 
N
L
 
I
I
 
K
V
 
I
D
 
S
H
 
D
P
 
P
H
 
F
A
 
E
D
 
E
P
 
G
A
 
C
P
 
-
Y
 
R
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
S
N
 
K
E
 
G
A
 
Q
A
 
Y
D
 
D
G
 
K
L
 
I
T
 
M
E
 
K
S
 
F
F
 
I
L
 
S
I
 
T
L
 
A
M
 
K
S
 
S
N
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
I
I
 
L
R
 
Y
H
 
G
M
 
G
T
 
S
R
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
H
I
 
L
A
 
K
D
 
K
R
 
G
P
 
Y
F
 
Y
L
 
I
T
 
E
P
 
P
G
 
T
I
 
I
I
 
V
-
 
T
D
 
D
V
 
I
T
 
S
A
 
T
M
 
S
P
 
M
E
 
Q
R
 
I
P
 
W
D
 
K
I
 
E
E
|
E
L
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
L
Q
 
C
L
 
V
V
 
K
R
 
T
V
 
F
D
 
S
S
 
S
F
 
E
E
 
D
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
A
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
F
G
 
S
G
 
N
T
 
D
P
 
L
Q
 
E
L
 
R
Y
 
C
D
 
E
Q
 
R
F
 
I
W
 
T
A
 
K
N
 
A
A
 
L
R
 
E
A
 
V
G
 
G
V
x
A
I
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
V
R
 
N
P
 
C
T
 
S
N
 
Q
G
 
P
A
x
C
S
 
F
S
 
V
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
x
W
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
x
K
L
 
R
S
 
S
G
 
G
N
 
F
H
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4pxnA Structure of zm aldh7 in complex with NAD (see paper)
28% identity, 88% coverage: 14:437/483 of query aligns to 44:471/498 of 4pxnA

query
sites
4pxnA
A
 
A
E
 
E
L
 
V
W
 
V
R
 
E
G
 
A
G
 
S
I
 
V
S
 
H
D
 
D
V
 
Y
D
 
E
A
 
E
E
 
G
V
 
M
A
 
R
A
 
A
A
 
C
R
 
F
Q
 
D
A
 
A
W
 
A
P
 
K
G
 
T
W
 
W
A
 
M
A
 
A
K
 
I
P
 
P
L
 
A
A
 
P
Y
 
K
R
 
R
A
 
G
E
 
E
T
 
I
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
F
 
I
A
 
G
D
 
D
R
 
A
V
 
L
K
 
R
A
 
A
D
 
K
A
 
L
E
 
H
S
 
H
F
 
L
A
 
G
D
 
R
L
 
L
I
 
V
A
 
S
R
 
L
E
 
E
T
 
M
G
 
G
K
 
K
P
 
I
L
 
L
W
 
P
E
 
E
A
 
G
R
 
I
T
 
G
E
 
E
V
 
V
E
 
Q
S
 
E
V
 
I
A
 
I
A
 
D
K
 
M
V
 
C
D
 
D
I
 
Y
S
 
A
V
 
V
K
 
G
A
 
L
Y
 
-
A
 
-
E
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
N
 
S
R
 
R
R
 
Q
I
 
L
E
 
N
G
 
G
A
 
S
M
 
I
G
 
I
L
 
P
R
 
S
H
 
E
A
 
R
V
 
P
R
 
N
H
 
H
-
 
M
-
 
M
-
 
M
-
 
E
-
 
V
-
 
W
K
 
N
P
 
P
H
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
V
L
x
I
G
x
T
P
x
A
Y
x
F
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
C
H
 
A
L
 
V
P
 
L
N
 
G
G
 
W
H
 
N
I
 
A
V
 
C
P
 
I
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
C
G
 
G
N
 
N
S
 
C
V
 
V
I
 
V
F
 
W
K
|
K
P
 
G
S
 
A
E
 
P
K
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
L
V
 
I
G
 
T
A
 
I
K
 
A
L
 
M
A
 
T
Q
 
K
L
 
I
F
 
V
H
 
A
S
 
S
A
 
V
-
 
L
-
 
E
-
 
K
-
 
N
G
 
N
V
 
L
P
 
P
E
 
G
E
 
A
V
 
I
L
 
F
R
 
T
L
 
S
V
 
F
I
 
C
G
 
G
G
 
G
P
x
T
D
 
E
Q
 
I
G
|
G
K
x
Q
A
 
A
L
 
I
A
 
A
G
 
L
H
 
D
D
 
I
G
 
R
I
 
I
D
 
P
G
 
L
L
 
V
L
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
R
 
R
T
x
A
G
 
G
V
 
L
A
 
M
L
x
V
N
 
Q
R
 
Q
Q
 
Q
F
 
V
A
 
S
D
 
A
R
 
R
P
 
F
G
 
G
K
 
K
I
 
C
L
 
L
A
 
-
L
 
L
E
|
E
M
x
L
G
x
S
G
 
G
N
 
N
N
 
N
P
 
A
I
 
I
V
 
I
V
 
V
W
 
M
D
 
D
T
 
D
P
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
Q
T
 
L
A
 
A
A
 
V
M
 
R
L
 
S
V
 
V
V
 
L
Q
 
F
S
 
A
A
 
A
F
 
V
L
 
G
S
 
T
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
|
C
T
 
T
N
 
T
A
 
C
R
 
R
R
 
R
L
 
L
I
 
I
V
 
L
R
 
H
Q
 
E
T
 
N
V
 
I
A
 
Y
E
 
Q
A
 
T
L
 
F
I
 
L
D
 
D
E
 
Q
V
 
L
R
 
V
N
 
E
L
 
V
T
 
Y
N
 
K
R
 
Q
L
 
V
I
 
R
V
 
I
D
 
G
H
 
D
P
 
P
H
 
-
A
 
L
D
 
E
P
 
K
A
 
G
P
 
T
Y
 
L
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
H
D
 
T
N
 
P
E
 
A
A
 
S
A
 
K
D
 
E
G
 
N
L
 
F
T
 
L
E
 
K
S
 
G
F
 
I
L
 
Q
I
 
T
L
 
I
M
 
K
S
 
S
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
Q
 
K
V
 
I
I
 
L
R
 
F
H
 
G
M
 
G
T
 
S
R
 
A
P
 
I
I
 
E
A
 
S
D
 
E
R
 
G
P
 
N
F
 
F
L
 
V
T
 
Q
P
 
P
G
 
T
I
 
I
I
 
V
D
 
E
V
 
I
T
 
T
A
 
-
M
 
-
P
 
P
E
 
S
R
 
A
P
 
P
D
 
V
I
 
V
-
 
K
-
 
E
E
|
E
L
 
L
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
L
Q
 
Y
L
 
V
V
 
M
R
 
K
V
 
F
D
 
Q
S
 
T
F
 
L
E
 
K
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
E
 
I
A
 
N
N
 
N
N
 
S
T
 
V
A
 
P
F
 
Q
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
S
A
 
S
L
 
I
I
 
F
G
 
T
G
 
K
T
 
R
P
 
P
Q
 
D
L
 
I
Y
 
I
D
 
F
Q
 
K
F
 
W
W
 
L
A
 
G
-
 
P
-
 
H
N
 
G
A
 
S
R
 
D
A
 
C
G
 
G
V
 
I
I
 
V
N
 
N
W
 
V
N
 
N
R
 
I
P
 
P
T
 
T
N
 
N
G
 
G
A
 
A
S
 
E
S
 
I
A
 
G
A
 
G
P
 
A
F
|
F
G
 
G
G
 
G
I
 
E
G
 
K
L
 
A
S
 
T
G
 
G
N
 
G
H
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

4o6rA Crystal structure of a putative aldehyde dehydrogenase from burkholderia cenocepacia
30% identity, 88% coverage: 23:446/483 of query aligns to 42:469/489 of 4o6rA

query
sites
4o6rA
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
A
V
 
V
A
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
T
Q
 
R
A
 
A
W
 
F
P
 
P
G
 
A
W
 
W
A
 
S
A
 
A
K
 
M
P
 
P
L
 
A
A
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
G
E
 
R
T
 
L
L
 
L
R
 
L
R
 
R
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
A
V
 
I
K
 
E
A
 
A
D
 
N
A
 
T
E
 
E
S
 
A
F
 
L
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
E
A
 
S
R
 
L
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
H
P
 
P
L
 
I
W
 
R
E
 
D
A
 
S
R
 
R
T
 
A
E
 
L
V
 
D
E
 
V
S
 
P
V
 
R
A
 
T
A
 
A
K
 
A
V
 
C
D
 
F
I
 
R
S
 
Y
V
 
F
K
 
G
A
 
G
Y
 
M
A
 
A
E
 
D
R
 
K
T
 
L
P
 
Q
N
 
G
R
 
S
R
 
V
I
 
I
E
 
P
G
 
V
A
 
D
M
 
T
G
 
G
L
 
F
R
 
L
H
 
N
A
 
Y
V
 
V
R
 
Q
H
 
R
K
 
A
P
 
P
H
 
I
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
Q
L
x
I
G
x
V
P
 
P
Y
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
L
H
 
M
L
 
F
P
 
T
N
 
S
G
 
W
H
 
K
I
 
M
V
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
F
 
L
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
 
E
K
 
I
T
 
T
P
 
P
A
 
L
V
 
S
G
 
T
A
 
L
K
 
R
L
 
I
A
 
V
Q
 
E
L
 
L
F
 
M
H
 
A
S
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
F
P
 
P
E
 
A
E
 
G
V
 
V
L
 
V
R
 
N
L
 
I
V
 
V
I
 
P
G
 
G
-
 
Y
G
|
G
P
 
H
D
 
T
Q
 
A
G
|
G
K
x
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
E
H
 
H
D
 
P
G
 
G
I
 
V
D
 
G
G
 
K
L
 
I
L
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
R
 
A
T
|
T
G
 
G
V
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
R
R
|
R
Q
 
I
F
 
V
A
 
E
D
 
A
R
 
S
P
 
Q
G
 
G
K
 
N
I
 
L
-
 
K
-
 
R
L
 
V
A
 
Q
L
 
L
E
|
E
M
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
G
P
 
A
I
 
N
V
 
I
V
 
V
W
 
F
D
 
D
T
 
D
P
 
A
D
 
N
I
 
L
R
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
I
M
 
N
L
 
G
V
 
A
V
 
A
Q
 
W
S
 
A
A
 
I
F
 
F
L
 
H
S
 
N
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
A
C
|
C
T
 
I
N
 
A
A
 
G
R
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
V
V
 
L
R
 
H
Q
 
E
T
 
R
V
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
F
I
 
L
D
 
E
E
 
R
V
 
F
R
 
V
N
 
A
L
 
L
T
 
A
N
 
S
R
 
S
L
 
I
I
 
R
V
 
I
D
 
G
H
 
N
P
 
P
H
 
-
A
 
L
D
 
D
P
 
P
A
 
N
P
 
T
Y
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
T
D
 
S
N
 
K
E
 
Q
A
 
H
A
 
L
D
 
D
G
 
R
L
 
V
T
 
L
E
 
S
S
 
Y
F
 
V
L
 
D
I
 
V
L
 
A
M
 
R
S
 
E
N
 
Q
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
V
 
V
I
 
L
R
 
T
H
 
G
M
 
G
T
 
S
R
 
A
P
 
P
-
 
Q
-
 
D
-
 
P
-
 
A
I
 
L
A
 
A
D
 
N
R
 
G
P
 
Y
F
 
Y
L
 
V
T
 
R
P
 
P
G
 
T
I
 
I
I
 
V
D
 
E
V
 
A
T
 
K
A
 
H
M
 
A
P
 
T
E
 
D
R
 
R
-
 
V
P
 
A
D
 
Q
I
 
E
E
|
E
L
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
F
L
 
V
Q
 
T
L
 
V
V
 
L
R
 
R
V
 
F
D
 
G
S
 
S
F
 
D
E
 
D
A
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
E
 
I
A
 
A
N
 
N
N
 
A
T
 
T
A
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
S
A
 
G
L
 
L
I
 
W
G
 
T
G
 
N
T
 
D
P
 
L
Q
 
S
L
 
R
Y
 
A
D
 
H
Q
 
R
F
 
M
W
 
A
A
 
A
N
 
R
A
 
I
R
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
M
I
 
C
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
C
T
 
Y
N
 
K
G
 
R
A
 
V
S
 
N
S
 
P
A
 
G
A
 
S
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
L
 
K
S
 
S
G
 
G
N
 
Y
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
M
A
 
G
F
 
F
Y
 
E
A
 
A
A
 
M
-
 
H
D
 
D
Y
 
Y

5ekcE Thermostable aldehyde dehydrogenase from pyrobaculum sp.1860 complexed with NADP+
29% identity, 90% coverage: 14:449/483 of query aligns to 37:470/490 of 5ekcE

query
sites
5ekcE
A
 
A
E
 
E
L
 
V
W
 
P
R
 
R
G
 
S
G
 
G
I
 
R
S
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
R
A
 
E
E
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
F
Q
 
E
A
 
A
W
 
L
P
 
K
G
 
A
W
 
W
A
 
A
A
 
N
K
 
I
P
 
P
L
 
A
A
 
I
Y
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
T
 
Y
L
 
L
R
 
Y
R
 
K
F
 
M
A
 
L
D
 
E
R
 
V
V
 
F
K
 
R
A
 
Q
D
 
M
A
 
K
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
M
D
 
K
L
 
I
I
 
L
A
 
T
R
 
V
E
 
E
T
 
G
G
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
Y
K
 
R
P
 
K
L
 
V
W
 
W
E
 
G
A
 
E
R
 
V
T
 
V
E
 
F
V
 
T
E
 
E
S
 
R
V
 
L
A
 
I
A
 
Q
K
 
N
V
 
A
D
 
A
I
 
E
S
 
L
V
 
A
K
 
R
A
 
H
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
G
R
 
R
T
 
V
P
 
L
N
 
Q
R
 
S
R
 
D
I
 
S
E
 
E
G
 
S
A
 
T
M
 
I
G
 
S
L
 
V
R
 
-
H
 
-
A
 
-
V
 
V
R
 
F
H
 
K
K
 
R
P
 
S
H
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
V
L
x
I
G
x
T
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
A
 
L
H
 
S
L
 
I
P
 
S
N
 
M
G
 
K
H
 
K
I
 
I
V
 
A
P
 
H
A
 
T
L
 
L
L
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
F
 
Y
K
|
K
P
 
P
S
 
A
E
x
S
K
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
W
K
 
L
L
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
F
 
V
H
 
A
S
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
K
E
 
G
V
 
V
L
 
F
R
 
N
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
-
 
P
G
|
G
P
 
P
D
 
V
Q
 
V
G
|
G
K
 
E
A
 
E
L
 
I
A
 
V
G
 
T
H
 
H
D
 
K
G
 
R
I
 
V
D
 
A
G
 
H
L
 
V
L
 
T
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
E
A
 
S
R
 
S
T
|
T
G
 
G
V
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
R
Q
 
E
F
 
I
A
 
A
D
 
A
R
 
K
P
 
A
G
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
L
K
 
K
I
 
T
L
 
V
A
 
T
L
 
L
E
|
E
M
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
S
N
 
D
P
 
P
I
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
L
D
 
D
T
 
D
P
 
V
D
 
D
I
 
V
R
 
D
T
 
Y
A
 
A
A
 
A
M
 
R
L
 
L
V
 
A
V
 
V
Q
 
F
S
 
A
A
 
S
F
 
L
L
 
F
S
 
H
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
I
C
|
C
T
 
T
N
 
S
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
H
Q
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
I
D
 
E
E
 
R
V
 
Y
R
 
V
N
 
H
L
 
Y
T
 
V
N
 
K
R
 
M
L
 
L
I
 
R
V
 
I
D
 
D
H
 
D
P
 
P
H
 
R
A
 
K
D
 
D
P
 
E
A
 
K
P
 
V
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
I
D
x
N
N
 
E
E
x
R
A
x
Q
A
 
V
D
 
A
G
 
L
L
 
M
T
 
K
E
 
E
S
 
F
F
 
V
L
 
D
I
 
D
L
 
A
M
 
V
S
 
S
N
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
-
H
 
-
M
 
-
T
 
-
R
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
G
D
 
G
R
 
R
P
 
S
-
 
W
-
 
G
-
 
N
F
 
F
L
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
A
I
 
I
-
 
F
I
 
V
D
 
D
V
 
V
T
 
D
A
 
R
M
 
N
P
 
F
E
 
R
R
 
I
P
 
M
D
 
R
I
 
E
E
|
E
L
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
R
Q
 
P
L
 
I
V
 
V
R
 
V
V
 
V
D
 
E
S
 
N
F
 
D
E
 
D
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
E
E
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
V
I
 
L
G
 
T
G
 
N
T
 
N
P
 
V
Q
 
N
L
 
R
Y
 
A
D
 
F
Q
 
R
F
 
I
W
 
A
A
 
E
N
 
A
A
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
F
N
 
H
W
 
I
N
 
N
R
 
D
P
 
V
T
 
T
N
 
F
G
 
L
A
 
E
S
 
E
S
 
S
A
 
H
A
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
K
L
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
V
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
G
A
 
G
F
 
E
Y
 
W
A
 
S
A
 
F
D
 
H
Y
 
E
C
 
T
A
 
T
Y
 
Y

5ek6A Thermostable aldehyde dehydrogenase from pyrobaculum sp. 1860 complexed with NADP and isobutyraldehyde (see paper)
29% identity, 90% coverage: 14:449/483 of query aligns to 30:463/482 of 5ek6A

query
sites
5ek6A
A
 
A
E
 
E
L
 
V
W
 
P
R
 
R
G
 
S
G
 
G
I
 
R
S
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
R
A
 
E
E
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
F
Q
 
E
A
 
A
W
 
L
P
 
K
G
 
A
W
 
W
A
 
A
A
 
N
K
 
I
P
 
P
L
 
A
A
 
I
Y
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
T
 
Y
L
 
L
R
 
Y
R
 
K
F
 
M
A
 
L
D
 
E
R
 
V
V
 
F
K
 
R
A
 
Q
D
 
M
A
 
K
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
M
D
 
K
L
 
I
I
 
L
A
 
T
R
 
V
E
 
E
T
 
G
G
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
Y
K
 
R
P
 
K
L
 
V
W
 
W
E
 
G
A
 
E
R
 
V
T
 
V
E
 
F
V
 
T
E
 
E
S
 
R
V
 
L
A
 
I
A
 
Q
K
 
N
V
 
A
D
 
A
I
 
E
S
 
L
V
 
A
K
 
R
A
 
H
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
G
R
 
R
T
 
V
P
 
L
N
 
Q
R
 
S
R
 
D
I
 
S
E
 
E
G
 
S
A
 
T
M
 
I
G
 
S
L
 
V
R
 
-
H
 
-
A
 
-
V
 
V
R
 
F
H
 
K
K
 
R
P
 
S
H
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
V
L
x
I
G
x
T
P
 
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
A
 
L
H
 
S
L
x
I
P
 
S
N
 
M
G
x
K
H
 
K
I
 
I
V
 
A
P
 
H
A
 
T
L
 
L
L
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
F
 
Y
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
x
S
K
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
W
K
 
L
L
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
F
 
V
H
 
A
S
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
K
E
 
G
V
 
V
L
 
F
R
 
N
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
-
x
P
G
|
G
P
 
P
D
 
V
Q
 
V
G
|
G
K
 
E
A
 
E
L
 
I
A
 
V
G
 
T
H
 
H
D
 
K
G
 
R
I
 
V
D
 
A
G
 
H
L
 
V
L
 
T
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
E
A
 
S
R
 
S
T
|
T
G
 
G
V
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
R
Q
 
E
F
x
I
A
 
A
D
 
A
R
 
K
P
 
A
G
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
L
K
 
K
I
 
T
L
 
V
A
 
T
L
 
L
E
|
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
S
N
 
D
P
 
P
I
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
L
D
 
D
T
 
D
P
 
V
D
 
D
I
 
V
R
 
D
T
 
Y
A
 
A
A
 
A
M
 
R
L
 
L
V
 
A
V
 
V
Q
 
F
S
 
A
A
 
S
F
 
L
L
 
F
S
 
H
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
I
C
|
C
T
 
T
N
 
S
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
H
Q
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
I
D
 
E
E
 
R
V
 
Y
R
 
V
N
 
H
L
 
Y
T
 
V
N
 
K
R
 
M
L
 
L
I
 
R
V
 
I
D
 
D
H
 
D
P
 
P
H
 
R
A
 
K
D
 
D
P
 
E
A
 
K
P
 
V
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
I
D
 
N
N
 
E
E
 
R
A
 
Q
A
 
V
D
 
A
G
 
L
L
 
M
T
 
K
E
 
E
S
 
F
F
 
V
L
 
D
I
 
D
L
 
A
M
 
V
S
 
S
N
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
-
H
 
-
M
 
-
T
 
-
R
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
G
D
 
G
R
 
R
P
 
S
-
 
W
-
 
G
-
 
N
F
 
F
L
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
A
I
 
I
-
 
F
I
 
V
D
 
D
V
 
V
T
 
D
A
 
R
M
 
N
P
 
F
E
 
R
R
 
I
P
 
M
D
 
R
I
 
E
E
|
E
L
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
R
Q
 
P
L
 
I
V
 
V
R
 
V
V
 
V
D
 
E
S
 
N
F
 
D
E
 
D
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
E
E
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
V
I
 
L
G
 
T
G
 
N
T
 
N
P
 
V
Q
 
N
L
 
R
Y
 
A
D
 
F
Q
 
R
F
 
I
W
 
A
A
 
E
N
 
A
A
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
F
N
 
H
W
 
I
N
 
N
R
 
D
P
 
V
T
 
T
N
 
F
G
 
L
A
 
E
S
 
E
S
 
S
A
 
H
A
 
V
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
K
L
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
V
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
G
A
 
G
F
 
E
Y
 
W
A
 
S
A
 
F
D
 
H
Y
 
E
C
 
T
A
 
T
Y
 
Y

4h73A Thermostable aldehyde dehydrogenase from pyrobaculum sp. Complexed with NADP+
29% identity, 90% coverage: 14:449/483 of query aligns to 30:463/482 of 4h73A

query
sites
4h73A
A
 
A
E
 
E
L
 
V
W
 
P
R
 
R
G
 
S
G
 
G
I
 
R
S
 
E
D
 
D
V
 
A
D
 
R
A
 
E
E
 
A
V
 
I
A
 
D
A
 
S
A
 
A
R
 
F
Q
 
E
A
 
A
W
 
L
P
 
K
G
 
A
W
 
W
A
 
A
A
 
N
K
 
I
P
 
P
L
 
A
A
 
I
Y
 
R
R
 
R
A
 
A
E
 
E
T
 
Y
L
 
L
R
 
Y
R
 
K
F
 
M
A
 
L
D
 
E
R
 
V
V
 
F
K
 
R
A
 
Q
D
 
M
A
 
K
E
 
E
S
 
D
F
 
F
A
 
M
D
 
K
L
 
I
I
 
L
A
 
T
R
 
V
E
 
E
T
 
G
G
 
G
-
 
G
-
 
T
-
 
Y
K
 
R
P
 
K
L
 
V
W
 
W
E
 
G
A
 
E
R
 
V
T
 
V
E
 
F
V
 
T
E
 
E
S
 
R
V
 
L
A
 
I
A
 
Q
K
 
N
V
 
A
D
 
A
I
 
E
S
 
L
V
 
A
K
 
R
A
 
H
Y
 
Y
A
 
Q
E
 
G
R
 
R
T
 
V
P
 
L
N
 
Q
R
 
S
R
 
D
I
 
S
E
 
E
G
 
S
A
 
T
M
 
I
G
 
S
L
 
V
R
 
-
H
 
-
A
 
-
V
 
V
R
 
F
H
 
K
K
 
R
P
 
S
H
 
K
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
V
L
x
I
G
x
T
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
A
 
L
H
 
S
L
 
I
P
 
S
N
 
M
G
 
K
H
 
K
I
 
I
V
 
A
P
 
H
A
 
T
L
 
L
L
 
A
A
 
V
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
F
 
Y
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
x
S
K
 
D
T
 
T
P
 
P
A
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
W
K
 
L
L
 
I
A
 
A
Q
 
Q
L
 
M
F
 
V
H
 
A
S
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
K
E
 
G
V
 
V
L
 
F
R
 
N
L
 
L
V
 
V
I
 
I
G
 
G
-
 
P
G
|
G
P
 
P
D
 
V
Q
 
V
G
|
G
K
 
E
A
 
E
L
 
I
A
 
V
G
 
T
H
 
H
D
 
K
G
 
R
I
 
V
D
 
A
G
 
H
L
 
V
L
 
T
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
E
A
 
S
R
 
S
T
|
T
G
 
G
V
 
-
A
 
-
L
 
-
N
 
-
R
 
R
Q
 
E
F
 
I
A
 
A
D
 
A
R
 
K
P
 
A
G
 
A
-
 
G
-
 
T
-
 
L
K
 
K
I
 
T
L
 
V
A
 
T
L
 
L
E
|
E
M
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
S
N
 
D
P
 
P
I
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
L
D
 
D
T
 
D
P
 
V
D
 
D
I
 
V
R
 
D
T
 
Y
A
 
A
A
 
A
M
 
R
L
 
L
V
 
A
V
 
V
Q
 
F
S
 
A
A
 
S
F
 
L
L
 
F
S
 
H
A
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
R
 
I
C
|
C
T
 
T
N
 
S
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
H
Q
 
K
T
 
A
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
K
L
 
F
I
 
I
D
 
E
E
 
R
V
 
Y
R
 
V
N
 
H
L
 
Y
T
 
V
N
 
K
R
 
M
L
 
L
I
 
R
V
 
I
D
 
D
H
 
D
P
 
P
H
 
R
A
 
K
D
 
D
P
 
E
A
 
K
P
 
V
Y
 
D
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
I
D
 
N
N
 
E
E
 
R
A
 
Q
A
 
V
D
 
A
G
 
L
L
 
M
T
 
K
E
 
E
S
 
F
F
 
V
L
 
D
I
 
D
L
 
A
M
 
V
S
 
S
N
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
I
 
L
R
 
-
H
 
-
M
 
-
T
 
-
R
 
-
P
 
-
I
 
I
A
 
G
D
 
G
R
 
R
P
 
S
-
 
W
-
 
G
-
 
N
F
 
F
L
 
F
T
 
E
P
 
P
G
 
A
I
 
I
-
 
F
I
 
V
D
 
D
V
 
V
T
 
D
A
 
R
M
 
N
P
 
F
E
 
R
R
 
I
P
 
M
D
 
R
I
 
E
E
|
E
L
 
V
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
R
Q
 
P
L
 
I
V
 
V
R
 
V
V
 
V
D
 
E
S
 
N
F
 
D
E
 
D
A
 
Q
A
 
A
I
 
V
A
 
E
E
 
V
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
A
 
D
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
S
A
 
G
A
 
A
L
 
V
I
 
L
G
 
T
G
 
N
T
 
N
P
 
V
Q
 
N
L
 
R
Y
 
A
D
 
F
Q
 
R
F
 
I
W
 
A
A
 
E
N
 
A
A
 
V
R
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
M
I
 
F
N
 
H
W
 
I
N
 
N
R
 
D
P
 
V
T
 
T
N
 
F
G
 
L
A
 
E
S
 
E
S
 
S
A
 
H
A
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
K
L
 
A
S
 
S
G
 
G
N
 
V
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
G
A
 
G
F
 
E
Y
 
W
A
 
S
A
 
F
D
 
H
Y
 
E
C
 
T
A
 
T
Y
 
Y

6bsnA Structure of proline utilization a (puta) with proline bound in remote sites (see paper)
32% identity, 86% coverage: 21:435/483 of query aligns to 520:947/973 of 6bsnA

query
sites
6bsnA
I
 
L
S
 
T
D
 
D
V
 
V
D
 
K
A
 
A
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
D
A
 
A
-
 
T
-
 
P
-
 
D
-
 
Q
-
 
A
-
 
H
-
 
A
-
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
A
R
 
R
Q
 
A
A
 
G
W
 
F
P
 
A
G
 
G
W
 
W
A
 
S
A
 
R
K
 
T
P
 
P
L
 
A
A
 
G
Y
 
I
R
 
R
A
 
A
E
 
A
T
 
A
L
 
L
R
 
E
R
 
Q
F
 
A
A
 
A
D
 
H
R
 
L
V
 
L
K
 
E
A
 
S
D
 
R
A
 
S
E
 
A
S
 
H
F
 
F
A
 
I
D
 
A
L
 
L
I
 
L
A
 
Q
R
 
R
E
 
E
T
 
G
G
 
G
K
 
K
P
 
T
L
 
L
W
 
D
E
 
D
A
 
A
R
 
L
T
 
S
E
 
E
V
 
L
E
 
R
S
 
E
V
 
A
A
 
A
A
 
D
K
 
F
V
 
C
D
 
R
I
 
Y
S
 
Y
V
 
A
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
R
K
 
K
A
 
L
Y
 
F
A
 
G
E
 
S
R
 
E
T
 
T
P
 
A
N
 
-
R
 
-
R
 
-
I
 
M
E
 
P
G
 
G
A
 
P
M
 
T
G
 
G
L
 
E
R
 
S
H
 
N
A
 
A
V
 
L
R
 
T
H
x
M
K
 
R
P
 
G
H
 
R
G
 
G
A
 
V
L
 
F
A
 
V
V
 
A
L
 
I
G
 
S
P
 
P
Y
x
W
N
|
N
F
|
F
P
 
P
A
 
L
H
 
A
L
 
I
P
 
F
N
 
L
G
 
G
H
 
Q
I
 
V
V
 
T
P
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
M
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
S
V
 
V
I
 
V
F
 
A
K
 
K
P
 
P
S
 
A
E
 
E
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
R
V
 
I
G
 
A
A
 
R
K
 
E
L
 
A
A
 
V
Q
 
A
L
 
L
F
 
L
H
 
H
S
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
E
 
K
E
 
S
V
 
A
L
 
L
R
 
Y
L
 
L
V
 
V
I
 
T
G
 
G
G
 
D
P
 
G
D
 
R
Q
 
I
G
 
G
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
T
G
 
A
H
 
H
D
 
P
G
 
D
I
 
I
D
 
A
G
 
G
L
 
V
L
 
V
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
 
S
A
 
T
R
 
E
T
 
V
G
 
A
V
 
R
A
 
S
L
 
I
N
 
N
R
 
R
Q
 
A
F
 
L
A
 
A
D
 
A
R
 
K
P
 
D
G
 
G
K
 
P
I
 
I
L
 
V
A
 
P
L
 
L
-
 
I
-
 
A
E
|
E
M
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
I
N
 
N
P
 
A
I
 
M
V
 
I
V
 
A
W
 
D
D
 
A
T
 
T
P
 
A
D
 
L
I
 
P
R
 
E
T
 
Q
A
 
V
A
 
A
M
 
D
L
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
T
S
 
S
A
 
A
F
 
F
L
 
R
S
 
S
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
R
|
R
C
x
A
T
x
S
N
 
A
A
 
L
R
 
R
R
 
L
L
 
L
I
 
F
V
 
V
R
 
Q
Q
 
E
T
 
D
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
R
L
 
M
I
 
I
D
 
E
E
 
M
V
 
V
R
 
A
N
 
G
L
 
A
T
 
A
N
 
R
R
 
E
L
 
L
I
 
K
V
 
I
D
 
G
H
 
D
P
 
P
H
 
-
A
 
S
D
 
D
P
 
V
A
 
A
P
 
T
Y
 
H
M
 
V
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
D
N
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
K
D
 
Q
G
 
R
L
 
L
T
 
-
E
 
D
S
 
A
F
 
H
L
 
I
I
 
A
L
 
R
M
 
M
S
 
K
N
 
T
G
 
E
G
 
A
Q
 
R
V
 
L
I
 
-
R
 
-
H
 
H
M
 
F
T
 
A
R
 
G
P
 
P
I
 
A
A
 
P
D
 
E
R
 
G
P
 
C
F
 
F
L
 
V
T
 
A
P
 
P
G
 
H
I
 
I
I
 
F
D
 
E
V
 
L
T
 
T
A
 
E
M
 
A
P
 
G
E
 
Q
R
 
L
P
 
T
D
 
E
I
 
-
E
 
E
L
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
I
L
 
L
Q
 
H
L
 
V
V
 
V
R
 
R
V
 
Y
-
 
R
-
 
P
D
 
E
S
 
N
F
 
L
E
 
E
A
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
R
E
 
A
A
 
I
N
 
E
N
 
R
T
 
T
A
 
G
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
T
A
 
L
A
 
G
L
 
V
I
 
H
G
 
S
G
 
R
T
 
I
P
 
D
Q
 
D
L
 
S
Y
 
I
D
 
E
Q
 
A
F
 
I
W
 
I
A
 
D
N
 
R
A
 
V
R
 
Q
A
 
V
G
 
G
V
 
N
I
 
I
N
 
Y
W
 
V
N
 
N
R
 
R
P
 
N
T
 
M
N
x
I
G
|
G
A
|
A
-
 
V
S
 
V
S
 
G
A
 
V
A
 
Q
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
I
 
N
G
 
G
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
T

Sites not aligning to the query:

4v37A Crystal structure of betaine aldehyde dehydrogenase from spinach showing a thiohemiacetal with 3-aminopropionaldehyde
29% identity, 90% coverage: 2:437/483 of query aligns to 30:464/495 of 4v37A

query
sites
4v37A
S
 
T
E
 
E
E
 
E
L
 
I
I
 
I
S
 
G
H
 
D
E
 
I
P
 
P
A
 
A
T
 
A
G
 
T
A
 
A
E
 
E
L
 
-
W
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
-
I
 
-
S
 
-
D
 
D
V
 
V
D
 
E
A
 
V
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
R
A
 
A
W
 
F
-
 
R
-
 
R
P
 
N
G
 
N
W
 
W
A
 
S
A
 
A
K
 
T
P
 
S
L
 
G
A
 
A
Y
 
H
R
 
R
A
 
A
E
 
T
T
 
Y
L
 
L
R
 
R
R
 
A
F
 
I
A
 
A
D
 
A
R
 
K
V
 
I
K
 
T
A
 
E
D
 
K
A
 
K
E
 
D
S
 
H
F
 
F
A
 
V
D
 
K
L
 
L
I
 
E
A
 
T
R
 
I
E
 
D
T
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
F
W
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
V
T
 
L
E
 
D
V
 
I
E
 
D
S
 
D
V
 
V
A
 
A
A
 
S
K
 
C
V
 
F
D
 
E
-
 
Y
-
 
F
-
 
A
-
 
G
-
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
A
I
 
L
S
 
D
V
 
G
K
 
K
A
 
Q
Y
 
K
A
 
A
E
 
P
R
 
V
T
 
T
-
 
L
P
 
P
N
 
M
R
 
E
R
 
R
I
 
F
E
 
K
G
 
S
A
 
-
M
 
-
G
 
-
L
 
-
R
 
-
H
 
H
A
 
V
V
 
L
R
 
R
H
 
-
K
 
Q
P
 
P
H
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
L
L
x
I
G
x
S
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
A
 
L
H
 
L
L
x
M
P
 
A
N
 
T
G
 
W
H
 
K
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
S
 
T
V
 
A
I
 
V
F
 
L
K
|
K
P
 
P
S
|
S
E
|
E
K
 
L
T
 
A
P
 
S
A
 
V
V
 
T
G
 
C
A
 
L
K
 
E
L
 
F
A
 
G
Q
 
E
L
 
V
F
 
C
H
 
N
S
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
P
E
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
N
L
 
I
V
 
L
I
 
T
G
 
G
-
 
L
G
|
G
P
 
P
D
 
D
Q
 
A
G
|
G
K
x
A
A
 
P
L
 
L
A
 
V
G
 
S
H
 
H
D
 
P
G
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
K
L
 
I
L
 
A
F
 
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
S
R
 
A
T
|
T
G
 
G
V
 
S
A
 
K
L
 
V
N
 
M
R
 
A
Q
 
S
F
 
-
A
 
A
D
 
A
R
 
Q
P
 
L
G
 
V
K
 
K
I
 
P
L
 
V
A
 
T
L
 
L
E
|
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
S
P
 
P
I
 
I
V
 
V
V
 
V
W
 
F
D
 
E
T
 
D
P
 
V
D
 
D
I
 
I
R
 
D
T
 
K
A
 
V
A
 
V
M
 
E
L
 
W
V
 
T
V
 
I
Q
 
F
S
 
G
A
 
C
F
 
F
L
 
W
S
 
T
A
 
N
G
 
G
Q
 
Q
R
 
I
C
x
A
T
 
S
N
 
A
A
 
T
R
 
S
R
 
R
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
H
Q
 
E
T
 
S
V
 
I
A
 
A
E
 
A
A
 
E
L
 
F
I
 
V
D
 
D
E
 
K
V
 
L
R
 
V
N
 
K
L
 
W
T
 
T
N
 
K
R
 
N
L
 
I
I
 
K
V
 
I
D
 
S
H
 
D
P
 
P
H
 
F
A
 
E
D
 
E
P
 
G
A
 
C
P
 
-
Y
 
R
M
 
L
G
 
G
P
 
P
V
 
V
I
 
I
D
 
S
N
 
K
E
 
G
A
 
Q
A
 
Y
D
 
D
G
 
K
L
 
I
T
 
M
E
 
K
S
 
F
F
 
I
L
 
S
I
 
T
L
 
A
M
 
K
S
 
S
N
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
I
I
 
L
R
 
Y
H
 
G
M
 
G
T
 
S
R
 
R
P
 
P
-
 
E
-
 
H
I
 
L
A
 
K
D
 
K
R
 
G
P
 
Y
F
 
Y
L
 
I
T
 
E
P
 
P
G
 
T
I
 
I
I
 
V
-
 
T
D
 
D
V
 
I
T
 
S
A
 
T
M
 
S
P
 
M
E
 
Q
R
 
I
P
 
W
D
 
K
I
 
E
E
|
E
L
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
L
Q
 
C
L
 
V
V
 
K
R
 
T
V
 
F
D
 
S
S
 
S
F
 
E
E
 
D
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
A
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
V
I
 
F
G
 
S
G
 
N
T
 
D
P
 
L
Q
 
E
L
 
R
Y
 
C
D
 
E
Q
 
R
F
 
I
W
 
T
A
 
K
N
 
A
A
 
L
R
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
A
I
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
V
R
 
N
P
 
C
T
 
S
N
 
Q
G
 
P
A
x
C
S
 
F
S
 
V
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
F
x
W
G
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
K
L
 
R
S
 
S
G
 
G
N
 
F
H
 
G
R
 
R

Sites not aligning to the query:

5gtlA NADPH complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
30% identity, 88% coverage: 23:445/483 of query aligns to 55:478/491 of 5gtlA

query
sites
5gtlA
D
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
S
A
 
A
W
 
F
P
 
E
G
 
S
-
 
G
-
 
P
W
 
W
A
 
A
A
 
E
K
 
M
P
 
T
L
 
T
A
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
H
T
 
L
L
 
I
R
 
Y
R
 
K
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
L
V
 
I
K
 
E
A
 
E
D
 
H
A
 
R
E
 
E
S
 
E
F
 
L
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
D
T
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
Y
W
 
Q
E
 
V
A
 
A
R
 
L
T
 
D
E
 
D
V
 
-
E
 
-
S
 
D
V
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
T
V
 
V
D
 
E
I
 
-
S
 
N
V
 
Y
K
 
R
A
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
G
R
 
W
T
 
T
P
 
T
N
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
G
R
 
Q
R
 
T
I
 
I
E
 
P
G
 
I
A
 
S
M
 
K
G
 
D
L
 
Y
R
 
L
H
 
N
A
 
Y
V
 
T
R
 
R
H
 
H
K
 
E
P
 
P
H
 
V
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
Q
L
x
I
G
 
I
P
|
P
Y
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
L
H
 
V
L
 
M
P
 
S
N
 
S
G
 
W
H
 
K
I
 
M
V
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
T
G
 
G
N
 
C
S
 
T
V
 
I
I
 
V
F
 
L
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
|
E
K
x
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
L
V
 
S
G
 
L
A
 
L
K
 
Y
L
 
A
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
F
 
F
H
 
K
S
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
E
 
N
E
 
G
V
 
V
L
 
V
R
 
N
L
 
F
V
 
V
I
 
P
G
 
G
-
 
F
G
|
G
P
 
P
D
 
E
Q
 
A
G
|
G
K
 
A
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
N
H
 
H
D
 
H
G
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
K
L
 
V
L
 
A
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
R
 
V
T
|
T
G
 
G
V
 
K
A
 
Y
L
 
I
N
 
M
R
 
R
Q
 
Q
F
 
S
A
 
A
D
 
E
R
 
M
P
 
I
G
 
-
K
 
K
I
 
H
L
 
V
A
 
T
L
 
L
E
|
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
S
P
 
P
I
 
N
V
 
I
V
 
I
W
 
L
D
 
E
T
 
D
P
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
I
M
 
N
L
 
G
V
 
A
V
 
F
Q
 
Q
S
 
G
A
 
I
F
 
M
L
 
Y
S
 
N
A
 
H
G
 
G
Q
 
Q
R
 
N
C
|
C
T
 
S
N
 
A
A
 
G
R
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
F
V
 
V
R
 
H
Q
 
R
T
 
K
V
 
H
A
 
Y
E
 
E
A
 
T
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
A
V
 
L
R
 
V
N
 
K
L
 
M
T
 
A
N
 
N
R
 
N
L
 
V
I
 
K
V
 
L
D
 
G
H
 
-
P
 
A
H
 
G
A
 
M
D
 
E
P
 
K
A
 
E
P
 
T
Y
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
N
 
K
E
 
K
A
 
Q
A
 
Q
D
 
E
G
 
R
L
 
V
T
 
L
E
 
N
S
 
Y
F
 
I
L
 
E
I
 
Q
L
 
G
M
 
K
S
 
K
N
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
I
 
A
R
 
A
H
 
G
M
 
G
T
 
E
R
 
R
P
 
A
I
 
L
A
 
E
D
 
K
R
 
G
P
 
Y
F
 
F
L
 
V
T
 
K
P
 
P
G
 
T
I
 
V
I
 
F
-
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
D
M
 
D
P
 
M
E
 
T
R
 
I
P
 
V
D
 
K
I
 
E
E
|
E
L
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
V
Q
 
V
L
 
V
V
 
L
R
 
P
V
 
F
D
 
D
S
 
S
F
 
T
E
 
E
A
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
E
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
N
T
 
S
A
 
S
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
V
I
 
W
G
 
T
G
 
Q
T
 
N
P
 
I
Q
 
K
L
 
T
Y
 
G
D
 
H
Q
 
Q
F
 
V
W
 
A
A
 
N
N
 
K
A
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
T
I
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
D
T
 
Y
N
 
N
G
 
L
A
 
E
S
 
N
S
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
G
 
K
L
 
Q
S
 
S
G
 
G
N
 
I
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
L
A
 
G
F
 
S
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
D
 
D

5gtkA NAD+ complex structure of aldehyde dehydrogenase from bacillus cereus
30% identity, 88% coverage: 23:445/483 of query aligns to 55:478/491 of 5gtkA

query
sites
5gtkA
D
 
D
V
 
I
D
 
D
A
 
A
E
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
S
A
 
A
W
 
F
P
 
E
G
 
S
-
 
G
-
 
P
W
 
W
A
 
A
A
 
E
K
 
M
P
 
T
L
 
T
A
 
A
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
H
T
 
L
L
 
I
R
 
Y
R
 
K
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
L
V
 
I
K
 
E
A
 
E
D
 
H
A
 
R
E
 
E
S
 
E
F
 
L
A
 
A
D
 
Q
L
 
L
I
 
E
A
 
A
R
 
L
E
 
D
T
 
N
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
Y
W
 
Q
E
 
V
A
 
A
R
 
L
T
 
D
E
 
D
V
 
-
E
 
-
S
 
D
V
 
I
A
 
S
A
 
A
K
 
T
V
 
V
D
 
E
I
 
-
S
 
N
V
 
Y
K
 
R
A
 
Y
Y
 
Y
A
 
A
E
 
G
R
 
W
T
 
T
P
 
T
N
 
K
-
 
I
-
 
I
-
 
G
R
 
Q
R
 
T
I
 
I
E
 
P
G
 
I
A
 
S
M
 
K
G
 
D
L
 
Y
R
 
L
H
 
N
A
 
Y
V
 
T
R
 
R
H
 
H
K
 
E
P
 
P
H
 
V
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
Q
L
x
I
G
x
I
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
L
H
 
V
L
 
M
P
 
S
N
 
S
G
 
W
H
 
K
I
 
M
V
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
T
G
 
G
N
 
C
S
 
T
V
 
I
I
 
V
F
 
L
K
|
K
P
 
P
S
 
A
E
|
E
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
L
V
 
S
G
 
L
A
 
L
K
 
Y
L
 
A
A
 
A
Q
 
K
L
 
L
F
 
F
H
 
K
S
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
F
P
 
P
E
 
N
E
 
G
V
 
V
L
 
V
R
 
N
L
 
F
V
 
V
I
 
P
G
 
G
-
 
F
G
|
G
P
 
P
D
 
E
Q
 
A
G
|
G
K
x
A
A
 
A
L
 
I
A
 
V
G
 
N
H
 
H
D
 
H
G
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
K
L
 
V
L
 
A
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
R
 
V
T
|
T
G
 
G
V
 
K
A
x
Y
L
 
I
N
 
M
R
 
R
Q
 
Q
F
 
S
A
 
A
D
 
E
R
 
M
P
 
I
G
 
-
K
 
K
I
 
H
L
 
V
A
 
T
L
 
L
E
|
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
S
P
 
P
I
 
N
V
 
I
V
 
I
W
 
L
D
 
E
T
 
D
P
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
E
T
 
E
A
 
A
A
 
I
M
 
N
L
 
G
V
 
A
V
 
F
Q
 
Q
S
 
G
A
 
I
F
 
M
L
 
Y
S
 
N
A
 
H
G
 
G
Q
 
Q
R
 
N
C
|
C
T
 
S
N
 
A
A
 
G
R
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
F
V
 
V
R
 
H
Q
 
R
T
 
K
V
 
H
A
 
Y
E
 
E
A
 
T
L
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
A
V
 
L
R
 
V
N
 
K
L
 
M
T
 
A
N
 
N
R
 
N
L
 
V
I
 
K
V
 
L
D
 
G
H
 
-
P
 
A
H
 
G
A
 
M
D
 
E
P
 
K
A
 
E
P
 
T
Y
 
E
M
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
V
D
 
S
N
 
K
E
 
K
A
x
Q
A
 
Q
D
 
E
G
x
R
L
 
V
T
 
L
E
 
N
S
 
Y
F
 
I
L
 
E
I
 
Q
L
 
G
M
 
K
S
 
K
N
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
I
 
A
R
 
A
H
 
G
M
 
G
T
 
E
R
 
R
P
 
A
I
 
L
A
 
E
D
 
K
R
 
G
P
 
Y
F
 
F
L
 
V
T
 
K
P
 
P
G
 
T
I
 
V
I
 
F
-
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
T
A
 
D
M
 
D
P
 
M
E
 
T
R
 
I
P
 
V
D
 
K
I
 
E
E
|
E
L
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
V
Q
 
V
L
 
V
V
 
L
R
 
P
V
 
F
D
 
D
S
 
S
F
 
T
E
 
E
A
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
E
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
N
T
 
S
A
 
S
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
V
I
 
W
G
 
T
G
 
Q
T
 
N
P
 
I
Q
 
K
L
 
T
Y
 
G
D
 
H
Q
 
Q
F
 
V
W
 
A
A
 
N
N
 
K
A
 
L
R
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
T
I
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
D
T
 
Y
N
 
N
G
 
L
A
 
E
S
 
N
S
 
A
A
 
A
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
G
 
K
L
 
Q
S
 
S
G
 
G
N
 
I
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
L
A
 
G
F
 
S
Y
 
Y
A
 
A
A
 
L
D
 
D

Q59931 NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase; Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase [NADP(+)]; Non-phosphorylating glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase; Triosephosphate dehydrogenase; EC 1.2.1.9 from Streptococcus mutans serotype c (strain ATCC 700610 / UA159) (see 3 papers)
29% identity, 89% coverage: 4:434/483 of query aligns to 19:451/475 of Q59931

query
sites
Q59931
E
 
E
L
 
I
I
 
K
S
 
I
H
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
W
 
G
R
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
A
G
 
M
G
 
S
I
 
T
S
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
Y
E
 
V
V
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
A
 
A
W
 
Q
P
 
P
G
 
A
W
 
W
A
 
R
A
 
S
K
 
L
P
 
S
L
 
Y
A
 
I
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
A
T
 
Y
L
 
L
R
 
H
R
 
K
F
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
I
V
 
L
K
 
M
A
 
R
D
 
D
A
 
K
E
 
E
S
 
K
F
 
I
A
 
G
D
 
A
L
 
V
I
 
L
A
 
S
R
 
K
E
 
E
T
 
V
G
 
A
K
 
K
P
 
G
L
 
Y
W
 
K
E
 
S
A
 
A
R
 
V
T
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
V
S
x
R
V
 
T
A
 
A
A
 
E
K
 
I
V
 
I
D
 
N
I
 
Y
S
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
V
 
L
K
 
R
A
 
M
Y
 
E
A
 
G
E
 
E
R
 
V
T
 
L
P
 
E
N
 
G
R
 
G
R
 
S
I
 
F
E
 
E
G
 
A
A
 
A
M
 
S
G
 
K
L
 
K
R
 
K
H
 
I
A
 
A
V
 
V
-
 
V
R
 
R
H
 
R
K
 
E
P
 
P
H
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
V
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
x
S
P
 
P
Y
 
F
N
 
N
F
 
Y
P
 
P
A
 
V
H
 
N
L
 
L
P
 
A
N
 
G
G
 
S
H
 
K
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
V
V
 
I
I
 
A
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
 
P
E
x
T
K
 
Q
T
 
G
P
 
S
A
 
I
V
 
S
G
 
G
A
 
L
K
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
L
 
A
F
 
F
H
 
A
S
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
G
V
 
V
L
 
F
R
 
N
L
 
T
V
 
I
I
 
T
G
 
G
-
 
R
G
 
G
P
 
S
D
 
E
Q
 
I
G
 
G
K
x
D
A
 
Y
L
 
I
A
 
V
G
 
E
H
 
H
D
 
Q
G
 
A
I
 
V
D
 
N
G
 
F
L
 
I
L
 
N
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
x
T
R
x
G
T
x
I
G
|
G
V
x
E
A
x
R
L
x
I
N
x
G
R
x
K
Q
x
M
F
x
A
A
x
G
D
x
M
R
|
R
P
|
P
G
 
-
K
 
-
I
 
-
L
x
I
A
x
M
L
|
L
E
|
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
D
P
 
S
I
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
L
D
 
E
T
 
D
P
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
E
T
 
L
A
 
T
A
 
A
M
 
K
L
 
N
V
 
I
V
 
I
Q
 
A
S
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
G
S
 
Y
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
C
 
C
T
 
T
N
 
A
A
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
V
I
 
L
V
 
V
R
 
M
Q
 
E
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
K
V
 
I
R
 
R
N
 
E
L
 
K
T
 
V
N
 
L
R
 
A
L
 
L
I
 
T
V
 
I
D
 
G
H
 
N
P
 
P
H
 
E
A
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
D
P
 
-
Y
 
-
M
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
T
E
 
K
A
 
S
A
 
A
D
 
D
G
 
Y
L
 
V
T
 
E
E
 
G
S
 
L
F
 
I
L
 
N
I
 
D
L
 
A
M
 
N
S
 
D
N
 
K
G
 
G
G
 
A
Q
 
A
V
 
A
I
 
L
R
 
T
H
 
E
M
 
I
T
 
K
R
 
R
P
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
E
R
 
G
P
 
N
F
 
L
L
 
I
T
 
C
P
 
P
G
 
I
I
 
L
I
 
F
D
 
D
V
 
K
T
 
V
A
 
T
M
 
T
P
 
D
E
 
M
R
 
R
P
 
L
D
 
A
I
 
W
E
 
E
L
x
E
-
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
L
Q
 
P
L
 
I
V
 
I
R
 
R
V
 
V
D
 
T
S
 
S
F
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
E
 
I
A
 
S
N
 
N
N
 
K
T
 
S
A
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
I
I
 
F
G
 
T
G
 
N
T
 
D
-
 
F
P
 
P
Q
 
R
L
 
A
Y
 
F
D
 
G
Q
 
-
F
 
I
W
 
A
A
 
E
N
 
Q
A
 
L
R
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
T
I
 
V
N
 
H
W
 
I
N
 
N
R
 
N
P
 
K
T
 
T
N
 
Q
G
x
R
A
 
G
S
 
T
S
 
D
A
 
N
A
 
F
P
 
P
F
 
F
G
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
K
L
 
K
S
 
S
G
 
G

4pz2B Structure of zm aldh2-6 (rf2f) in complex with NAD (see paper)
30% identity, 94% coverage: 7:462/483 of query aligns to 30:491/494 of 4pz2B

query
sites
4pz2B
S
 
T
H
 
R
E
 
D
P
 
P
A
 
R
T
 
T
G
 
G
-
 
G
-
 
V
-
 
I
A
 
A
E
 
S
L
 
V
W
 
A
R
 
E
G
 
A
G
 
D
I
 
K
S
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
A
V
 
V
A
 
R
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
A
A
 
A
W
 
F
P
 
D
-
 
H
-
 
G
G
 
E
W
 
W
A
 
P
A
 
R
K
 
M
P
 
S
L
 
G
A
 
S
Y
 
E
R
 
R
A
 
G
E
 
R
T
 
I
L
 
M
R
 
A
R
 
R
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
L
V
 
V
K
 
E
A
 
E
D
 
H
A
 
A
E
 
G
S
 
E
F
 
L
A
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
E
A
 
S
R
 
L
E
 
D
T
 
A
G
 
G
K
 
K
-
 
H
P
 
P
L
 
A
W
 
V
E
 
T
A
 
R
R
 
A
T
 
V
E
 
D
V
 
V
E
 
G
S
 
N
V
 
A
A
 
A
A
 
G
K
 
S
V
 
L
D
 
R
I
 
Y
S
 
F
V
 
A
K
 
G
A
 
A
Y
 
-
A
 
A
E
 
D
R
 
K
T
 
I
P
 
H
N
 
G
R
 
E
R
 
T
I
 
L
E
 
K
G
 
M
A
 
P
M
 
G
G
 
Q
L
 
F
R
 
Q
H
 
G
A
 
H
V
 
T
R
 
L
H
 
R
K
 
E
P
 
P
H
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
A
A
 
G
V
 
V
L
x
I
G
x
I
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
S
H
 
T
L
x
M
P
 
F
N
 
A
G
 
V
H
 
K
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
S
 
A
V
 
L
I
 
V
F
 
V
K
|
K
P
 
P
S
x
A
E
|
E
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
L
V
 
S
G
 
A
A
 
L
K
 
Y
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
L
 
L
F
 
A
H
 
K
S
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
E
 
D
E
 
G
V
 
V
L
 
I
R
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
P
G
 
G
-
 
F
G
|
G
P
 
P
D
 
T
Q
 
A
G
|
G
K
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
S
H
 
H
D
 
M
G
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
M
L
 
V
L
 
S
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
R
 
E
T
x
V
G
 
G
V
 
R
A
 
L
L
 
I
N
 
M
R
 
K
Q
 
A
F
 
S
A
 
A
D
 
E
R
 
S
P
 
N
G
 
L
K
 
K
I
 
P
L
 
V
A
 
Y
L
 
L
E
|
E
M
x
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
S
P
 
P
I
 
L
V
 
I
V
 
V
W
 
F
D
 
D
T
 
D
P
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
D
T
 
M
A
 
A
A
 
V
M
 
E
L
 
L
V
 
A
V
 
V
Q
 
G
S
 
A
A
 
S
F
 
F
L
 
F
S
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
R
 
A
C
|
C
T
 
V
N
 
A
A
 
A
R
 
S
R
 
R
L
 
V
I
 
Y
V
 
V
R
 
Q
Q
 
E
T
 
R
V
 
V
A
 
Y
E
 
D
A
 
R
L
 
F
I
 
E
D
 
E
E
 
R
V
 
L
R
 
A
N
 
E
L
 
R
T
 
M
N
 
R
R
 
S
L
 
W
I
 
V
V
 
V
D
 
G
H
 
D
P
 
P
H
 
F
A
 
S
D
 
D
P
 
P
A
 
R
P
 
A
Y
 
D
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
Q
I
 
V
D
 
D
N
 
K
E
 
A
A
 
Q
A
 
Y
D
 
E
G
 
R
L
 
V
T
 
L
E
 
-
S
 
S
F
 
Y
L
 
I
I
 
D
L
 
H
M
 
G
S
 
K
N
 
R
G
 
E
G
 
G
Q
 
A
V
 
T
I
 
L
R
 
L
H
 
T
M
 
G
T
 
G
R
 
R
P
 
P
I
 
C
A
 
A
D
 
P
R
 
E
P
 
G
-
 
K
-
 
G
-
 
Y
F
 
Y
L
 
I
T
 
E
P
 
P
G
 
T
I
 
V
I
 
F
D
 
-
V
 
-
T
 
T
A
 
N
M
 
V
P
 
K
E
 
E
R
 
D
P
 
M
D
 
I
I
 
I
-
 
A
-
 
K
-
 
E
E
|
E
L
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
C
L
 
L
V
 
M
R
 
K
V
 
F
D
 
K
S
 
T
F
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
A
E
 
R
A
 
A
N
 
N
N
 
D
T
 
T
A
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
T
G
 
R
T
 
D
P
 
L
Q
 
D
L
 
V
Y
 
A
D
 
N
Q
 
R
F
 
V
W
 
V
A
 
R
N
 
S
A
 
V
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
V
R
 
N
P
 
C
T
 
Y
N
 
F
G
 
A
A
 
M
S
 
G
S
 
S
A
 
D
A
 
C
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
R
G
 
K
L
 
M
S
 
S
G
 
G
N
 
F
H
 
G
R
 
K
P
x
D
S
 
E
A
 
G
F
 
M
Y
 
H
A
 
A
A
 
L
D
 
D
Y
 
-
C
 
-
A
 
K
Y
 
Y
P
 
L
V
 
A
A
 
V
S
 
K
S
 
S
E
 
V
S
 
V
D
 
T
A
 
P
L
 
L
R
 
R
A
 
A
S
 
S

2esdA Crystal structure of thioacylenzyme intermediate of an NADP dependent aldehyde dehydrogenase (see paper)
29% identity, 89% coverage: 4:434/483 of query aligns to 18:450/474 of 2esdA

query
sites
2esdA
E
 
E
L
 
I
I
 
K
S
 
I
H
 
Y
E
 
E
P
 
P
A
 
A
T
 
S
G
 
G
A
 
A
E
 
E
L
 
L
W
 
G
R
 
S
-
 
V
-
 
P
-
 
A
G
 
M
G
 
S
I
 
T
S
 
E
D
 
E
V
 
V
D
 
D
A
 
Y
E
 
V
V
 
Y
A
 
A
A
 
S
A
 
A
R
 
K
Q
 
K
A
 
A
W
 
Q
P
 
P
G
 
A
W
 
W
A
 
R
A
 
A
K
 
L
P
 
S
L
 
Y
A
 
I
Y
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
A
T
 
Y
L
 
L
R
 
H
R
 
K
F
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
I
V
 
L
K
 
M
A
 
R
D
 
D
A
 
K
E
 
E
S
 
K
F
 
I
A
 
G
D
 
A
L
 
I
I
 
L
A
 
S
R
 
K
E
 
E
T
 
V
G
 
A
K
 
K
P
 
G
L
 
Y
W
 
K
E
 
S
A
 
A
R
 
V
T
 
S
E
 
E
V
 
V
E
 
V
S
x
R
V
 
T
A
 
A
A
 
E
K
 
I
V
 
I
D
 
N
I
 
Y
S
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
G
V
 
L
K
 
R
A
 
M
Y
 
E
A
 
G
E
 
E
R
 
V
T
 
L
P
 
E
N
 
G
R
 
G
R
 
S
I
 
F
E
 
E
G
 
A
A
 
A
M
 
S
G
 
K
L
 
K
R
 
K
H
 
I
A
 
A
V
 
V
-
 
V
R
 
R
H
 
R
K
 
E
P
 
P
H
 
V
G
 
G
A
 
L
L
 
V
A
 
L
V
 
A
L
 
I
G
 
S
P
 
P
Y
x
F
N
|
N
F
x
Y
P
 
P
A
 
V
H
 
N
L
 
L
P
 
A
N
 
G
G
 
S
H
 
K
I
 
I
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
N
S
 
V
V
 
I
I
 
A
F
 
F
K
|
K
P
 
P
S
x
P
E
x
T
K
 
Q
T
 
G
P
 
S
A
 
I
V
 
S
G
 
G
A
 
L
K
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
L
 
A
F
 
F
H
 
A
S
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
L
P
 
P
E
 
A
E
 
G
V
 
V
L
 
F
R
 
N
L
 
T
V
 
I
I
 
T
G
 
G
-
 
R
G
|
G
P
 
S
D
 
E
Q
 
I
G
|
G
K
x
D
A
 
Y
L
 
I
A
 
V
G
 
E
H
 
H
D
 
Q
G
 
A
I
 
V
D
 
N
G
 
F
L
 
I
L
 
N
F
|
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
A
 
T
R
 
G
T
x
I
G
 
G
V
 
E
A
 
R
L
 
I
N
 
G
R
 
K
Q
 
M
F
 
A
A
 
G
D
 
M
R
 
R
P
 
P
G
 
-
K
 
-
I
 
-
L
 
I
A
 
M
L
 
L
E
x
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
K
N
 
D
P
 
S
I
 
A
V
 
I
V
 
V
W
 
L
D
 
E
T
 
D
P
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
E
T
 
L
A
 
T
A
 
A
M
 
K
L
 
N
V
 
I
V
 
I
Q
 
A
S
 
G
A
 
A
F
 
F
L
 
G
S
 
Y
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
|
R
C
|
C
T
|
T
N
 
A
A
 
V
R
 
K
R
 
R
L
 
V
I
 
L
V
 
V
R
 
M
Q
 
E
T
 
S
V
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
E
L
 
L
I
 
V
D
 
E
E
 
K
V
 
I
R
 
R
N
 
E
L
 
K
T
 
V
N
 
L
R
 
A
L
 
L
I
 
T
V
 
I
D
 
G
H
 
N
P
 
P
H
 
E
A
 
D
D
 
D
P
 
A
A
 
D
P
 
-
Y
 
-
M
 
I
G
 
T
P
 
P
V
 
L
I
 
I
D
 
D
N
 
T
E
x
K
A
x
S
A
 
A
D
 
D
G
x
Y
L
 
V
T
 
E
E
 
G
S
 
L
F
 
I
L
 
N
I
 
D
L
 
A
M
 
N
S
 
D
N
 
K
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
A
I
 
L
R
 
T
H
 
E
M
 
I
T
 
K
R
 
R
P
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
E
R
 
G
P
 
N
F
 
L
L
 
I
T
 
C
P
 
P
G
 
I
I
 
L
I
 
F
D
 
D
V
 
K
T
 
V
A
 
T
M
 
T
P
 
D
E
 
M
R
 
R
P
 
L
D
 
A
I
 
W
E
 
E
L
x
E
-
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
L
Q
 
P
L
 
I
V
 
I
R
 
R
V
 
V
D
 
T
S
 
S
F
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
E
E
 
I
A
 
S
N
 
N
N
 
K
T
 
S
A
 
E
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
Q
A
 
A
A
 
S
L
 
I
I
 
F
G
 
T
G
 
N
T
 
D
-
 
F
P
 
P
Q
 
R
L
 
A
Y
 
F
D
 
G
Q
 
-
F
 
I
W
 
A
A
 
E
N
 
Q
A
 
L
R
 
E
A
 
V
G
 
G
V
 
T
I
 
V
N
 
H
W
 
I
N
 
N
R
 
N
P
 
K
T
 
T
N
x
Q
G
x
R
A
 
G
S
 
T
S
 
D
A
 
N
A
 
F
P
 
P
F
 
F
G
 
L
G
 
G
I
 
A
G
 
K
L
 
K
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4pxlA Structure of zm aldh2-3 (rf2c) in complex with NAD (see paper)
29% identity, 89% coverage: 7:434/483 of query aligns to 25:457/486 of 4pxlA

query
sites
4pxlA
S
 
T
H
 
R
E
 
D
P
 
P
A
 
R
T
 
T
G
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
I
A
 
A
E
 
S
L
 
I
W
 
A
R
 
E
G
 
G
G
 
D
I
 
K
S
 
A
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
L
E
 
A
V
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A
R
 
R
Q
 
E
A
 
A
W
 
F
P
 
D
G
 
N
-
 
G
-
 
P
W
 
W
A
 
P
A
 
R
K
 
M
P
 
T
L
 
G
A
 
Y
Y
 
E
R
 
R
A
 
G
E
 
R
T
 
I
L
 
L
R
 
H
R
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
D
R
 
L
V
 
I
K
 
D
A
 
E
D
 
H
A
 
V
E
 
E
S
 
E
F
 
L
A
 
A
D
 
A
L
 
L
I
 
D
A
 
T
R
 
V
E
 
D
T
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
L
L
 
F
W
 
A
E
 
V
A
 
G
R
 
K
T
 
A
E
 
R
V
 
D
E
 
I
S
 
P
V
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
H
V
 
L
D
 
L
I
 
R
S
 
Y
V
 
Y
K
 
A
A
 
G
Y
 
A
A
 
A
E
 
D
R
 
K
T
 
V
P
 
H
N
 
G
R
 
A
R
 
T
I
 
L
E
 
K
G
 
M
A
 
A
M
 
Q
G
 
R
L
 
M
R
 
H
H
 
G
A
 
Y
V
 
T
R
 
L
H
 
K
K
 
E
P
 
P
H
 
V
G
 
G
A
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
H
L
x
I
G
x
V
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
A
 
T
H
 
T
L
 
M
P
 
F
N
 
F
G
 
F
H
 
K
I
 
V
V
 
G
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
A
G
 
G
N
 
C
S
 
A
V
 
V
I
 
V
F
 
V
K
|
K
P
 
P
S
 
A
E
|
E
K
 
Q
T
 
T
P
 
P
A
 
L
V
 
S
G
 
A
A
 
L
K
 
F
L
 
Y
A
 
A
Q
 
H
L
 
L
F
 
A
H
 
R
S
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
E
 
A
E
 
G
V
 
V
L
 
L
R
 
N
L
 
V
V
 
V
I
 
P
G
 
G
-
 
F
G
|
G
P
 
P
D
 
T
Q
 
A
G
|
G
K
x
A
A
 
A
L
 
V
A
 
A
G
 
A
H
 
H
D
 
M
G
 
D
I
 
V
D
 
D
G
 
K
L
 
V
L
 
S
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
A
 
T
R
 
E
T
x
V
G
 
G
V
 
R
A
 
L
L
 
V
N
 
M
R
 
R
Q
 
A
F
 
A
A
 
A
D
 
E
R
 
S
P
 
N
G
 
L
K
 
K
I
 
P
L
 
V
A
 
S
L
 
L
E
|
E
M
 
L
G
|
G
G
 
G
N
 
K
N
 
S
P
 
P
I
 
V
V
 
I
V
 
V
W
 
F
D
 
D
T
 
D
P
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
D
T
 
M
A
 
A
A
 
V
M
 
N
L
 
L
V
 
V
V
 
N
Q
 
F
S
 
A
A
 
T
F
 
Y
L
 
T
S
 
N
A
 
K
G
 
G
Q
 
E
R
 
I
C
|
C
T
 
V
N
 
A
A
 
G
R
 
T
R
 
R
L
 
I
I
 
Y
V
 
V
R
 
Q
Q
 
E
T
 
G
V
 
I
A
 
Y
E
 
D
A
 
E
L
 
F
I
 
V
D
 
K
E
 
K
V
 
A
R
 
A
N
 
E
L
 
L
T
 
A
N
 
S
R
 
K
L
 
S
I
 
V
V
 
V
D
 
G
H
 
D
P
 
P
H
 
F
A
 
-
D
 
N
P
 
P
A
 
S
P
 
V
Y
 
S
M
 
Q
G
 
G
P
 
P
V
 
Q
I
 
V
D
 
D
N
 
K
E
 
D
A
x
Q
A
 
Y
D
 
E
G
x
K
L
 
V
T
 
L
E
 
R
S
 
Y
F
 
I
L
 
D
I
 
I
L
 
G
M
 
K
S
 
R
N
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
L
I
 
V
R
 
T
H
 
G
M
 
-
T
 
G
R
 
K
P
 
P
I
 
C
A
 
G
D
 
D
R
 
K
-
 
G
P
 
Y
F
 
Y
L
 
I
T
 
E
P
 
P
G
 
T
I
 
I
I
 
F
-
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
K
A
 
D
M
 
D
P
 
M
E
 
T
R
 
I
P
 
A
D
 
Q
I
 
D
E
|
E
L
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
M
Q
 
A
L
 
L
V
 
M
R
 
K
V
 
F
D
 
K
S
 
T
F
 
V
E
 
E
A
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
Q
E
 
K
A
 
A
N
 
N
N
 
N
T
 
T
A
 
R
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
I
I
 
V
G
 
T
G
 
K
T
 
N
P
 
I
Q
 
D
L
 
V
Y
 
A
D
 
N
Q
 
T
F
 
V
W
 
S
A
 
R
N
 
S
A
 
I
R
 
R
A
 
A
G
 
G
V
 
A
I
 
I
N
 
-
W
 
W
N
 
I
R
 
N
P
 
C
T
 
Y
N
 
F
G
 
A
A
 
F
S
 
D
S
 
P
A
 
D
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
Y
G
 
K
L
 
M
S
 
S
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4npiA 1.94 angstroms x-ray crystal structure of NAD- and intermediate- bound alpha-aminomuconate-epsilon-semialdehyde dehydrogenase from pseudomonas fluorescens (see paper)
27% identity, 90% coverage: 14:446/483 of query aligns to 30:472/483 of 4npiA

query
sites
4npiA
A
 
S
E
 
D
L
 
V
W
 
F
R
 
E
G
 
A
G
 
D
I
 
A
S
 
K
D
 
Q
V
 
V
D
 
N
A
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
Q
 
N
A
 
A
W
 
L
P
 
K
G
 
G
-
 
P
W
 
W
A
 
G
A
 
K
K
 
L
P
 
S
L
 
V
A
 
Q
Y
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
A
T
 
L
L
 
I
R
 
H
R
 
K
F
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
G
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
D
 
R
A
 
F
E
 
E
S
 
E
F
 
F
A
 
V
D
 
A
L
 
A
I
 
E
A
 
V
R
 
A
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
P
L
 
V
W
 
H
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
T
 
T
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
x
R
E
 
A
V
 
I
E
 
A
S
 
N
V
 
F
A
 
R
A
 
T
K
 
F
V
 
A
D
 
D
I
 
L
S
 
A
V
 
K
K
 
T
A
 
S
Y
 
H
A
 
T
E
 
D
R
 
L
T
 
F
P
 
E
N
 
M
R
 
S
R
 
T
I
 
S
E
 
D
G
 
G
A
 
S
M
 
G
G
 
A
L
 
L
R
 
N
H
 
Y
A
 
T
V
 
V
R
 
R
H
 
-
K
 
K
P
 
P
H
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
I
A
 
G
V
 
V
L
x
I
G
x
S
P
|
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
L
P
 
P
A
 
L
H
 
L
L
|
L
P
 
F
N
 
T
G
x
W
H
 
K
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
C
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
F
 
A
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
K
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
S
V
 
S
G
 
A
A
 
T
K
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
L
 
V
F
 
M
H
 
H
S
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
E
 
P
E
 
G
V
 
V
L
 
F
R
 
N
L
 
L
V
 
I
I
 
H
G
 
G
-
 
F
G
|
G
P
 
K
D
 
D
Q
 
S
-
 
A
G
|
G
K
x
E
A
 
F
L
 
L
A
 
T
G
 
Q
H
 
H
D
 
P
G
 
G
I
 
I
D
 
S
G
 
A
L
 
L
L
 
T
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
x
E
A
 
S
R
 
K
T
|
T
G
 
G
V
 
S
A
 
T
L
 
I
N
 
M
R
 
K
Q
 
A
F
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
G
P
 
V
G
 
-
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
S
L
 
F
E
|
E
M
 
L
G
|
G
G
 
G
N
 
K
N
 
N
P
 
A
I
 
A
V
 
V
V
 
V
W
 
F
D
 
A
T
 
D
P
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
I
M
 
E
L
 
G
V
 
V
V
 
L
Q
 
R
S
 
S
A
 
S
F
 
F
L
 
T
S
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
|
C
T
 
L
N
 
C
A
 
S
R
 
E
R
 
R
L
 
V
I
 
Y
V
 
V
R
 
H
Q
 
R
T
 
S
V
 
I
A
 
F
E
 
D
A
 
E
L
 
F
I
 
V
D
 
S
E
 
G
V
 
L
R
 
K
N
 
V
L
 
E
T
 
A
N
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
V
V
 
V
D
 
G
H
 
Y
P
 
P
H
 
D
A
 
Q
D
 
D
P
 
G
A
 
V
P
 
N
Y
 
-
M
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
I
D
 
S
N
 
H
E
 
G
A
 
H
A
 
R
D
 
D
G
x
K
L
 
V
T
 
L
E
 
S
S
 
Y
F
 
Y
L
 
R
I
 
L
L
 
A
M
 
V
S
 
D
N
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
I
 
V
R
 
T
H
 
G
M
 
G
T
 
G
R
 
V
P
 
P
I
 
K
A
 
F
D
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
R
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
V
R
 
Q
P
 
P
F
 
T
L
 
I
T
 
W
P
 
T
G
 
G
I
 
L
I
 
S
D
 
D
V
 
K
T
 
A
A
 
R
M
 
C
P
 
V
E
 
T
R
 
E
P
 
-
D
 
-
I
 
-
E
|
E
L
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
C
Q
 
H
L
 
I
V
 
S
R
 
P
V
 
F
D
 
D
S
 
D
F
 
E
E
 
D
A
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
N
E
 
R
A
 
V
N
 
N
N
 
D
T
 
S
A
 
N
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
C
A
 
A
L
 
I
I
 
W
G
 
T
G
 
T
T
 
N
P
 
L
Q
 
S
L
 
R
Y
 
A
D
 
H
Q
 
R
F
 
V
W
 
S
A
 
R
N
 
Q
A
 
I
R
 
H
A
 
V
G
 
G
V
 
L
I
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
V
R
 
N
P
 
T
T
 
W
N
x
Y
G
 
L
A
x
R
S
 
D
S
 
L
A
 
R
A
 
T
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
L
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
G
A
 
G
F
 
R
Y
 
F
A
 
S
A
 
M
D
 
D
Y
 
F

4i2rA 2.15 angstroms x-ray crystal structure of NAD- and alternative substrate-bound 2-aminomuconate 6-semialdehyde dehydrogenase from pseudomonas fluorescens (see paper)
27% identity, 90% coverage: 14:446/483 of query aligns to 30:472/483 of 4i2rA

query
sites
4i2rA
A
 
S
E
 
D
L
 
V
W
 
F
R
 
E
G
 
A
G
 
D
I
 
A
S
 
K
D
 
Q
V
 
V
D
 
N
A
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
V
A
 
A
A
 
A
R
 
Q
Q
 
N
A
 
A
W
 
L
P
 
K
G
 
G
-
 
P
W
 
W
A
 
G
A
 
K
K
 
L
P
 
S
L
 
V
A
 
Q
Y
 
D
R
 
R
A
 
A
E
 
A
T
 
L
L
 
I
R
 
H
R
 
K
F
 
I
A
 
A
D
 
D
R
 
G
V
 
I
K
 
Q
A
 
A
D
 
R
A
 
F
E
 
E
S
 
E
F
 
F
A
 
V
D
 
A
L
 
A
I
 
E
A
 
V
R
 
A
E
 
D
T
 
T
G
 
G
K
 
R
P
 
P
L
 
V
W
 
H
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
T
 
T
-
 
L
-
 
D
-
 
I
-
 
P
-
x
R
E
 
A
V
 
I
E
 
A
S
 
N
V
 
F
A
 
R
A
 
T
K
 
F
V
 
A
D
 
D
I
 
L
S
 
A
V
 
K
K
 
T
A
 
S
Y
 
H
A
 
T
E
 
D
R
 
L
T
 
F
P
 
E
N
 
M
R
 
S
R
 
T
I
 
S
E
 
D
G
 
G
A
 
S
M
 
G
G
 
A
L
 
L
R
 
N
H
 
Y
A
 
T
V
 
V
R
 
R
H
 
-
K
 
K
P
 
P
H
 
L
G
 
G
A
 
V
L
 
I
A
 
G
V
 
V
L
x
I
G
x
S
P
 
P
Y
x
W
N
|
N
F
 
L
P
 
P
A
 
L
H
 
L
L
|
L
P
 
F
N
 
T
G
 
W
H
 
K
I
 
V
V
 
A
P
 
P
A
 
A
L
 
L
L
 
A
A
 
C
G
 
G
N
 
N
S
 
T
V
 
V
I
 
V
F
 
A
K
|
K
P
 
P
S
 
S
E
|
E
K
 
E
T
 
S
P
 
P
A
 
S
V
 
S
G
 
A
A
 
T
K
 
L
L
 
L
A
 
A
Q
 
E
L
 
V
F
 
M
H
 
H
S
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
P
E
 
P
E
 
G
V
 
V
L
 
F
R
 
N
L
 
L
V
 
I
I
 
H
G
 
G
-
 
F
G
|
G
P
 
K
D
 
D
Q
 
S
-
 
A
G
 
G
K
 
E
A
 
F
L
 
L
A
 
T
G
 
Q
H
 
H
D
 
P
G
 
G
I
 
I
D
 
S
G
 
A
L
 
L
L
 
T
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
x
E
A
 
S
R
 
K
T
|
T
G
 
G
V
 
S
A
 
T
L
 
I
N
 
M
R
 
K
Q
 
A
F
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
G
P
 
V
G
 
-
K
 
K
I
 
E
L
 
V
A
 
S
L
 
F
E
|
E
M
x
L
G
|
G
G
 
G
N
 
K
N
 
N
P
 
A
I
 
A
V
 
V
V
 
V
W
 
F
D
 
A
T
 
D
P
 
A
D
 
D
I
 
L
R
 
D
T
 
A
A
 
A
A
 
I
M
 
E
L
 
G
V
 
V
V
 
L
Q
 
R
S
 
S
A
 
S
F
 
F
L
 
T
S
 
N
A
 
S
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
C
|
C
T
 
L
N
 
C
A
 
S
R
 
E
R
 
R
L
 
V
I
 
Y
V
 
V
R
 
H
Q
 
R
T
 
S
V
 
I
A
 
F
E
 
D
A
 
E
L
 
F
I
 
V
D
 
S
E
 
G
V
 
L
R
 
K
N
 
V
L
 
E
T
 
A
N
 
E
R
 
R
L
 
L
I
 
V
V
 
V
D
 
G
H
 
Y
P
 
P
H
 
D
A
 
Q
D
 
D
P
 
G
A
 
V
P
 
N
Y
 
-
M
 
M
G
 
G
P
 
P
V
 
L
I
 
I
D
 
S
N
 
H
E
 
G
A
 
H
A
 
R
D
 
D
G
 
K
L
 
V
T
 
L
E
 
S
S
 
Y
F
 
Y
L
 
R
I
 
L
L
 
A
M
 
V
S
 
D
N
 
E
G
 
G
G
 
A
Q
 
T
V
 
V
I
 
V
R
 
T
H
 
G
M
 
G
T
 
G
R
 
V
P
 
P
I
 
K
A
 
F
D
 
N
-
 
D
-
 
E
-
 
R
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
V
R
 
Q
P
 
P
F
 
T
L
 
I
T
 
W
P
 
T
G
 
G
I
 
L
I
 
S
D
 
D
V
 
K
T
 
A
A
 
R
M
 
C
P
 
V
E
 
T
R
 
E
P
 
-
D
 
-
I
 
-
E
|
E
L
 
I
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
L
 
C
Q
 
H
L
 
I
V
 
S
R
 
P
V
 
F
D
 
D
S
 
D
F
 
E
E
 
D
A
 
E
A
 
V
I
 
I
A
 
N
E
 
R
A
 
V
N
 
N
N
 
D
T
 
S
A
 
N
F
 
Y
G
 
G
L
 
L
S
 
A
A
 
C
A
 
A
L
 
I
I
 
W
G
 
T
G
 
T
T
 
N
P
 
L
Q
 
S
L
 
R
Y
 
A
D
 
H
Q
 
R
F
 
V
W
 
S
A
 
R
N
 
Q
A
 
I
R
 
H
A
 
V
G
 
G
V
 
L
I
 
V
N
 
-
W
 
W
N
 
V
R
 
N
P
 
T
T
 
W
N
x
Y
G
 
L
A
x
R
S
 
D
S
 
L
A
 
R
A
 
T
P
 
P
F
|
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
N
 
L
H
 
G
R
 
R
P
x
E
S
 
G
A
 
G
F
 
R
Y
 
F
A
 
S
A
 
M
D
 
D
Y
 
F

Query Sequence

>WP_089214372.1 NCBI__GCF_900188185.1:WP_089214372.1
MSEELISHEPATGAELWRGGISDVDAEVAAARQAWPGWAAKPLAYRAETLRRFADRVKAD
AESFADLIARETGKPLWEARTEVESVAAKVDISVKAYAERTPNRRIEGAMGLRHAVRHKP
HGALAVLGPYNFPAHLPNGHIVPALLAGNSVIFKPSEKTPAVGAKLAQLFHSAGVPEEVL
RLVIGGPDQGKALAGHDGIDGLLFTGSARTGVALNRQFADRPGKILALEMGGNNPIVVWD
TPDIRTAAMLVVQSAFLSAGQRCTNARRLIVRQTVAEALIDEVRNLTNRLIVDHPHADPA
PYMGPVIDNEAADGLTESFLILMSNGGQVIRHMTRPIADRPFLTPGIIDVTAMPERPDIE
LFGPLLQLVRVDSFEAAIAEANNTAFGLSAALIGGTPQLYDQFWANARAGVINWNRPTNG
ASSAAPFGGIGLSGNHRPSAFYAADYCAYPVASSESDALRASIGVGLRESDHDAPKLVRK
GFL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory