SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_089300513.1 NCBI__GCF_900188115.1:WP_089300513.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8pnyA Crystal structure of d-amino acid aminotransferase from blastococcus saxobsidens complexed with phenylhydrazine and in its apo form (see paper)
52% identity, 88% coverage: 17:265/283 of query aligns to 20:266/278 of 8pnyA

query
sites
8pnyA
P
 
P
Q
 
V
V
 
V
R
 
T
V
 
A
D
 
F
D
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
|
F
E
 
E
T
x
S
V
 
V
L
 
A
V
 
V
S
 
V
G
 
A
G
 
G
H
 
R
A
 
T
R
 
P
E
 
H
L
 
L
D
 
A
K
 
A
H
 
H
L
 
L
D
 
T
R
|
R
L
 
L
E
 
T
R
 
R
S
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
L
L
 
L
D
 
G
M
 
L
D
 
P
T
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
D
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
 
M
R
 
E
A
 
M
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
L
E
 
A
R
 
D
W
 
W
P
 
P
E
 
A
G
 
A
S
 
L
E
 
E
M
 
G
A
 
V
L
 
C
K
 
R
L
 
L
V
 
F
Y
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
L
-
 
G
D
 
D
S
 
G
D
 
T
P
 
P
S
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
P
T
 
T
A
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
L
I
 
A
E
 
P
V
 
V
S
 
P
E
 
A
G
 
D
L
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
S
V
 
V
V
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
G
R
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
P
T
 
A
D
 
D
L
 
F
A
 
R
A
 
A
R
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
W
L
 
L
L
 
L
L
 
G
G
 
G
A
 
A
K
|
K
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
|
Y
G
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
R
 
R
E
 
H
A
 
A
E
 
H
R
 
D
R
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
D
 
D
V
 
V
I
 
V
F
 
F
T
 
T
A
 
S
G
 
L
D
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
L
L
 
L
E
|
E
G
|
G
P
|
P
I
x
T
A
x
S
N
x
T
V
 
V
V
 
V
V
 
W
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
H
T
 
T
P
 
P
P
 
P
P
 
V
S
 
E
I
 
T
G
 
G
I
 
I
L
|
L
P
 
P
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
Q
A
 
A
G
 
R
L
 
L
F
 
F
R
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
A
A
 
D
G
 
G
W
 
W
S
 
P
T
 
T
K
 
S
I
 
V
E
 
T
P
 
P
L
 
G
R
 
T
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
V
F
 
W
L
 
L
T
 
L
S
|
S
S
x
G
I
 
V
R
 
R
K
 
G
V
 
A
T
 
A
R
 
V
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
R
P
 
G
D
 
D

8pnwA Crystal structure of d-amino acid aminotransferase from blastococcus saxobsidens in holo form with plp (see paper)
52% identity, 88% coverage: 17:265/283 of query aligns to 20:266/278 of 8pnwA

query
sites
8pnwA
P
 
P
Q
 
V
V
 
V
R
 
T
V
 
A
D
 
F
D
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
L
L
 
G
R
 
R
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
I
F
 
F
E
 
E
T
 
S
V
 
V
L
 
A
V
 
V
S
 
V
G
 
A
G
 
G
H
 
R
A
 
T
R
 
P
E
 
H
L
 
L
D
 
A
K
 
A
H
 
H
L
 
L
D
 
T
R
|
R
L
 
L
E
 
T
R
 
R
S
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
L
L
 
L
D
 
G
M
 
L
D
 
P
T
 
A
P
 
P
D
 
G
R
 
D
Q
 
Q
A
 
A
W
 
W
Q
 
M
R
 
E
A
 
M
V
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
L
E
 
A
R
 
D
W
 
W
P
 
P
E
 
A
G
 
A
S
 
L
E
 
E
M
 
G
A
 
V
L
 
C
K
 
R
L
 
L
V
 
F
Y
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
L
-
 
G
D
 
D
S
 
G
D
 
T
P
 
P
S
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
P
T
 
T
A
 
A
F
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
L
I
 
A
E
 
P
V
 
V
S
 
P
E
 
A
G
 
D
L
 
T
L
 
L
R
 
R
A
 
Q
R
 
R
A
 
A
E
 
E
G
 
G
I
 
I
A
 
S
V
 
V
V
 
A
T
 
T
L
 
L
E
 
G
R
 
L
G
 
G
I
 
V
D
 
P
T
 
A
D
 
D
L
 
F
A
 
R
A
 
A
R
 
G
A
 
A
P
 
P
W
 
W
L
 
L
L
 
L
L
 
G
G
 
G
A
 
A
K
|
K
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
|
Y
G
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
A
M
 
Q
R
 
R
E
 
H
A
 
A
E
 
H
R
 
D
R
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
D
 
D
V
 
V
I
 
V
F
 
F
T
 
T
A
 
S
G
 
L
D
 
E
G
 
G
T
 
R
V
 
L
L
 
L
E
|
E
G
 
G
P
|
P
I
x
T
A
x
S
N
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
W
A
 
A
D
 
A
G
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
L
Y
 
H
T
 
T
P
 
P
P
 
P
P
 
V
S
 
E
I
 
T
G
 
G
I
 
I
L
|
L
P
 
P
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
Q
A
 
A
G
 
R
L
 
L
F
 
F
R
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
A
R
 
A
A
 
D
G
 
G
W
 
W
S
 
P
T
 
T
K
 
S
I
 
V
E
 
T
P
 
P
L
 
G
R
 
T
I
 
V
E
 
D
D
 
D
L
 
L
R
 
H
G
 
A
A
 
A
D
 
D
G
 
A
V
 
V
F
 
W
L
 
L
T
 
L
S
 
S
S
x
G
I
 
V
R
 
R
K
 
G
V
 
A
T
 
A
R
 
V
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
G
V
 
V
Q
 
R
L
 
R
P
 
G
D
 
D

6q1rB A hypothetical aminotransferase from mycobacterium tuberculosis, plp- bound form
44% identity, 96% coverage: 3:275/283 of query aligns to 3:273/284 of 6q1rB

query
sites
6q1rB
V
 
M
L
 
V
I
 
V
H
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
G
S
 
E
V
 
I
A
 
L
D
 
Q
P
 
P
D
 
G
A
 
M
P
 
P
Q
 
L
V
 
L
R
 
H
V
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
A
L
 
A
L
 
V
R
 
R
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
T
 
T
V
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
R
G
 
D
G
 
G
H
 
R
A
 
A
R
 
C
E
 
L
L
 
V
D
 
E
K
 
A
H
 
H
L
 
L
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
E
 
T
R
 
Q
S
 
S
A
 
A
S
 
R
M
 
L
L
 
M
D
 
D
M
 
L
D
 
P
T
 
E
P
 
P
D
 
D
R
 
L
Q
 
P
A
 
R
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
V
A
 
A
I
 
T
E
 
Q
R
 
R
W
 
W
P
 
V
E
 
A
G
 
S
S
 
T
-
 
A
-
 
D
E
 
E
M
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
T
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
R
D
 
E
S
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
G
A
 
S
G
 
A
P
 
P
T
 
T
A
 
A
F
 
Y
A
 
V
L
 
M
G
 
V
I
 
S
E
 
P
V
 
V
S
 
P
E
 
A
G
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
R
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
S
V
 
A
V
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
I
 
L
D
 
P
T
 
A
D
 
D
L
 
G
A
 
G
A
 
D
R
 
A
A
 
M
P
 
P
W
 
W
L
 
L
L
 
I
L
 
A
G
 
S
A
 
A
K
|
K
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
|
Y
G
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
V
M
 
L
R
 
R
E
 
H
A
 
A
E
 
A
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
F
 
F
T
 
V
A
 
S
G
 
T
D
 
D
G
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
L
E
|
E
G
 
G
P
|
P
I
 
R
A
x
S
N
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
D
 
T
G
 
D
G
 
P
T
 
C
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
P
 
P
P
 
P
P
 
P
S
 
W
I
 
Y
G
 
P
I
 
I
L
 
L
P
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
A
L
 
L
F
 
F
R
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
R
R
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
Y
S
 
D
T
 
C
K
 
D
I
 
Y
E
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
V
E
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
F
G
 
D
A
 
S
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
F
 
W
L
 
L
T
 
V
S
|
S
S
|
S
I
 
M
R
 
T
K
 
L
V
 
A
T
 
A
R
 
R
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
R
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
-
S
 
-
R
 
R
T
 
T
L
 
P
H
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
V
A
 
F
A
 
A

6q1sA A hypothetical aminotransferase from mycobacterium tuberculosis, alpha-ketoglutarate and pmp bound form
44% identity, 96% coverage: 3:275/283 of query aligns to 2:272/283 of 6q1sA

query
sites
6q1sA
V
 
M
L
 
V
I
 
V
H
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
G
S
 
E
V
 
I
A
 
L
D
 
Q
P
 
P
D
 
G
A
 
M
P
 
P
Q
 
L
V
 
L
R
 
H
V
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
A
L
 
A
L
 
V
R
 
R
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
T
|
T
V
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
R
G
 
D
G
 
G
H
 
R
A
 
A
R
 
C
E
 
L
L
 
V
D
 
E
K
 
A
H
 
H
L
 
L
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
E
 
T
R
 
Q
S
 
S
A
 
A
S
 
R
M
 
L
L
 
M
D
 
D
M
 
L
D
 
P
T
 
E
P
 
P
D
 
D
R
 
L
Q
 
P
A
 
R
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
V
A
 
A
I
 
T
E
 
Q
R
 
R
W
 
W
P
 
V
E
 
A
G
 
S
S
 
T
-
 
A
-
 
D
E
 
E
M
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
T
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
R
D
 
E
S
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
G
A
 
S
G
 
A
P
 
P
T
 
T
A
 
A
F
 
Y
A
 
V
L
 
M
G
 
V
I
 
S
E
 
P
V
 
V
S
 
P
E
 
A
G
x
R
L
 
V
L
 
I
R
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
R
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
S
V
 
A
V
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
I
 
L
D
 
P
T
 
A
D
 
D
L
 
G
A
 
G
A
 
D
R
 
A
A
 
M
P
 
P
W
 
W
L
 
L
L
 
I
L
 
A
G
 
S
A
 
A
K
|
K
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
|
Y
G
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
V
M
 
L
R
 
R
E
 
H
A
 
A
E
 
A
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
F
 
F
T
 
V
A
 
S
G
 
T
D
 
D
G
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
L
E
|
E
G
 
G
P
|
P
I
x
R
A
x
S
N
x
T
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
D
 
T
G
 
D
G
 
P
T
 
C
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
P
 
P
P
 
P
P
 
P
S
 
W
I
 
Y
G
 
P
I
 
I
L
|
L
P
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
A
L
 
L
F
 
F
R
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
R
R
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
Y
S
 
D
T
 
C
K
 
D
I
 
Y
E
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
V
E
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
F
G
 
D
A
 
S
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
F
 
W
L
 
L
T
 
V
S
|
S
S
|
S
I
x
M
R
x
T
K
 
L
V
 
A
T
 
A
R
 
R
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
R
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
-
S
 
-
R
 
R
T
 
T
L
 
P
H
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
V
A
 
F
A
 
A

Q79FW0 Bifunctional aminodeoxychorismate lyase / D-amino acid transaminase; Bifunctional ADCL/DAAT; EC 2.6.1.21; EC 4.1.3.38 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
44% identity, 96% coverage: 3:275/283 of query aligns to 1:278/289 of Q79FW0

query
sites
Q79FW0
V
 
M
L
 
V
I
 
V
H
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
G
S
 
E
V
 
I
A
 
L
D
 
Q
P
 
P
D
 
G
A
 
M
P
 
P
Q
 
L
V
 
L
R
 
H
V
 
A
D
 
D
D
 
D
L
 
L
G
 
A
L
 
A
L
 
V
R
|
R
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
T
 
T
V
 
L
L
 
L
V
 
V
S
 
R
G
 
D
G
 
G
H
 
R
A
 
A
R
 
C
E
 
L
L
 
V
D
 
E
K
 
A
H
 
H
L
 
L
D
 
Q
R
|
R
L
 
L
E
 
T
R
 
Q
S
 
S
A
 
A
S
 
R
M
 
L
L
 
M
D
 
D
M
 
L
D
 
P
T
 
E
P
 
P
D
 
D
R
 
L
Q
 
P
A
 
R
W
 
W
Q
 
R
R
 
R
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
V
A
 
A
I
 
T
E
 
Q
R
 
R
W
 
W
P
 
V
E
 
A
G
 
S
S
 
T
-
 
A
-
 
D
E
 
E
M
 
G
A
 
A
L
 
L
K
 
R
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
T
 
S
R
 
R
G
 
G
L
 
R
D
 
E
S
 
G
D
 
-
P
 
-
S
 
G
A
 
S
G
 
A
P
 
P
T
 
T
A
 
A
F
 
Y
A
 
V
L
 
M
G
 
V
I
 
S
E
 
P
V
 
V
S
 
P
E
 
A
G
 
R
L
 
V
L
 
I
R
 
G
A
 
A
R
 
R
A
 
R
E
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
S
V
 
A
V
 
I
T
 
T
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
I
 
L
D
 
P
T
 
A
D
 
D
L
 
G
A
 
G
A
 
D
R
 
A
A
 
M
P
 
P
W
 
W
L
 
L
L
 
I
L
 
A
G
 
S
A
 
A
K
|
K
S
 
T
L
 
L
S
 
S
Y
|
Y
G
 
A
I
 
V
N
 
N
M
 
M
A
 
A
A
 
V
M
 
L
R
 
R
E
 
H
A
 
A
E
 
A
R
 
R
R
 
Q
G
 
G
A
 
A
E
 
G
D
 
D
V
 
V
I
 
I
F
 
F
T
 
V
A
 
S
G
 
T
D
 
D
G
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
L
E
 
E
G
 
G
P
 
P
I
 
R
A
 
S
N
 
T
V
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
D
 
T
G
 
D
G
 
G
-
 
D
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
G
-
 
N
-
 
P
T
 
C
L
 
L
Y
 
L
T
 
T
P
 
P
P
 
P
P
 
P
S
 
W
I
 
Y
G
 
P
I
 
I
L
 
L
P
 
R
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
A
L
 
L
F
 
F
R
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
R
R
 
A
A
 
K
G
 
G
W
 
Y
S
 
D
T
 
C
K
 
D
I
 
Y
E
 
R
P
 
A
L
 
L
R
 
R
I
 
V
E
 
A
D
 
D
L
 
L
R
 
F
G
 
D
A
 
S
D
 
Q
G
 
G
V
 
I
F
 
W
L
 
L
T
 
V
S
|
S
S
|
S
I
x
M
R
x
T
K
 
L
V
 
A
T
 
A
R
 
R
V
 
V
H
 
H
T
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
G
V
 
R
Q
 
R
L
 
L
P
 
P
D
 
-
S
 
-
R
 
R
T
 
T
L
 
P
H
 
I
A
 
A
E
 
E
L
 
V
A
 
F
A
 
A

5k3wA Structural characterisation of fold iv-transaminase, cputa1, from curtobacterium pusillum (see paper)
45% identity, 94% coverage: 11:275/283 of query aligns to 24:288/298 of 5k3wA

query
sites
5k3wA
V
 
L
A
 
A
D
 
D
P
 
F
D
 
G
A
 
A
P
 
P
Q
 
Q
V
 
V
R
 
R
V
 
I
D
 
T
D
 
D
L
 
L
G
 
G
L
 
I
L
 
T
R
 
R
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
 
F
E
 
E
T
 
T
V
 
I
L
 
A
V
 
V
S
 
I
G
 
D
G
 
G
H
 
H
A
 
P
R
 
Q
E
 
A
L
 
L
D
 
E
K
 
L
H
 
H
L
 
L
D
 
G
R
|
R
L
 
L
E
 
A
R
 
H
S
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
L
L
 
L
D
 
D
M
 
L
D
 
P
T
 
E
P
 
P
D
 
D
R
 
A
Q
 
A
A
 
V
W
 
W
Q
 
R
R
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
A
A
 
G
I
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
Y
-
 
R
E
 
S
R
 
R
W
 
N
P
 
G
E
 
D
G
 
G
S
 
G
E
 
E
M
 
L
A
 
F
L
 
A
K
 
K
L
 
L
V
 
I
Y
 
L
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
I
D
 
E
S
 
G
D
 
E
P
 
G
S
 
R
A
 
P
G
 
S
P
 
G
T
 
W
A
 
V
F
 
F
A
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
V
E
 
D
V
 
E
S
 
G
E
 
E
G
 
D
L
 
F
L
 
S
R
 
Q
A
 
Q
R
 
R
A
 
L
E
 
-
G
 
G
I
 
I
A
 
R
V
 
V
V
 
V
T
 
T
L
 
L
E
 
D
R
 
R
G
 
G
I
 
Y
D
 
R
T
 
H
D
 
D
L
 
V
A
 
A
A
 
E
R
 
T
A
 
S
P
 
P
W
 
W
L
 
L
L
 
L
L
 
A
G
 
G
A
 
A
K
|
K
S
 
S
L
 
L
S
 
S
Y
|
Y
G
 
A
I
 
T
N
 
N
M
 
R
A
 
A
A
 
A
M
 
G
R
 
R
E
 
E
A
 
A
E
 
A
R
 
R
R
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
D
D
 
D
V
 
V
I
 
I
F
 
F
T
 
V
A
 
S
G
 
S
D
 
D
G
 
G
T
 
Y
V
 
A
L
 
L
E
|
E
G
 
G
P
|
P
I
x
T
A
x
S
N
|
N
V
 
V
V
 
I
V
 
V
A
 
L
D
 
A
G
 
D
G
 
G
T
 
V
L
 
V
Y
 
R
T
 
T
P
 
P
P
 
Q
P
 
T
S
 
D
I
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
|
L
P
 
A
G
 
G
T
|
T
T
|
T
Q
 
Q
A
 
A
G
 
A
L
 
V
F
 
F
R
 
D
A
 
F
A
 
F
E
 
E
R
 
E
A
 
R
G
 
G
W
 
Y
S
 
P
T
 
T
K
 
E
I
 
Y
E
 
R
P
 
R
L
 
I
R
 
S
I
 
A
E
 
D
D
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
D
A
 
A
D
 
E
G
 
A
V
 
L
F
 
W
L
 
L
T
 
V
S
 
S
S
|
S
I
 
V
R
 
R
K
 
Q
V
 
A
T
 
A
R
 
P
V
 
I
H
 
T
T
 
A
L
 
L
D
 
D
G
 
D
V
 
R
Q
 
E
L
 
Y
P
 
P
D
 
V
S
 
D
R
 
A
T
 
A
L
 
L
H
 
T
A
 
A
E
 
D
L
 
L
A
 
N
A
 
A

5mr0D Thermophilic archaeal branched-chain amino acid transaminases from geoglobus acetivorans and archaeoglobus fulgidus: biochemical and structural characterisation (see paper)
28% identity, 98% coverage: 3:280/283 of query aligns to 2:284/290 of 5mr0D

query
sites
5mr0D
V
 
L
L
 
Y
I
 
V
H
 
Y
L
 
M
D
 
D
G
 
G
S
 
E
V
 
F
A
 
V
D
 
P
P
 
E
D
 
N
A
 
E
P
 
A
Q
 
K
V
 
V
R
 
S
V
 
I
D
 
F
D
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
F
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
|
F
E
 
E
T
x
G
V
 
I
L
 
R
V
 
A
S
 
Y
G
 
N
G
 
G
H
 
R
A
 
V
R
 
F
E
 
R
L
 
L
D
 
K
K
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
E
 
Y
R
 
D
S
 
S
A
 
A
S
 
K
M
 
A
L
 
I
D
 
D
M
 
L
D
 
E
T
 
I
P
 
P
D
 
I
R
 
T
Q
 
K
A
 
E
W
 
E
Q
 
F
R
 
M
A
 
E
V
 
I
A
 
I
A
 
L
A
 
E
I
 
T
E
 
L
R
 
R
W
 
K
P
 
N
E
 
N
G
 
L
S
 
R
E
 
D
M
 
A
A
 
Y
L
 
I
K
 
R
L
 
P
V
 
I
Y
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
D
L
 
L
D
x
G
S
x
L
D
 
D
P
 
P
S
 
R
A
 
K
G
 
C
P
 
Q
T
 
N
A
 
P
F
 
S
A
 
I
L
 
I
G
 
V
I
 
I
E
 
T
V
 
K
S
 
P
E
 
W
G
 
G
L
 
K
L
 
L
R
 
Y
A
 
G
-
 
D
-
 
L
R
 
Y
A
 
E
E
 
K
G
 
G
I
 
L
A
 
T
V
 
A
V
 
I
T
 
T
L
 
V
E
 
A
R
 
V
G
 
R
I
 
R
D
 
N
T
 
S
D
 
-
L
 
F
A
 
D
A
 
A
R
 
L
A
 
P
P
 
P
W
 
N
L
 
I
L
 
-
L
 
-
G
 
-
A
 
-
K
|
K
S
 
S
L
 
L
S
 
N
Y
|
Y
G
 
L
I
 
N
N
 
N
M
 
I
A
 
L
A
 
A
M
 
K
R
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
N
R
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
G
E
 
D
D
 
E
V
 
A
I
 
I
F
 
F
T
 
L
A
 
D
G
 
R
D
 
N
G
 
G
T
 
Y
V
 
V
L
 
S
E
|
E
G
 
G
P
 
S
I
x
G
A
x
D
N
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
V
A
 
V
D
 
K
G
 
N
G
 
G
T
 
A
L
 
I
Y
 
-
T
 
T
P
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
T
I
 
I
G
 
N
I
 
N
L
|
L
P
 
R
G
 
G
T
x
I
T
|
T
Q
 
R
A
 
E
G
 
A
L
 
V
F
 
I
R
 
E
A
 
I
A
 
I
E
 
N
R
 
R
A
 
L
G
 
G
W
 
I
S
 
P
T
 
F
K
 
K
I
 
E
E
 
T
P
 
N
L
 
I
R
 
G
I
 
L
E
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
Y
G
 
T
A
 
A
D
 
D
G
 
E
V
 
V
F
 
F
L
 
V
T
 
T
S
x
G
S
x
T
I
 
A
R
 
A
K
 
E
V
 
I
T
 
A
R
 
P
V
 
I
H
 
V
T
 
V
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
R
Q
 
K
L
 
I
P
 
G
D
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
G
-
 
E
-
 
I
S
 
T
R
 
R
T
 
K
L
 
L
H
 
M
A
 
E
E
 
E
L
 
F
A
 
S
A
 
K
A
 
L
Y
 
T
E
 
E
S
 
S
E
 
E

5e25A Crystal structure of branched-chain aminotransferase from thermophilic archaea geoglobus acetivorans complexed with alpha-ketoglutarate (see paper)
27% identity, 91% coverage: 3:260/283 of query aligns to 3:259/290 of 5e25A

query
sites
5e25A
V
 
L
L
 
L
I
 
V
H
 
Y
L
 
M
D
 
N
G
 
G
S
 
E
V
 
F
A
 
V
D
 
P
P
 
E
D
 
S
A
 
Q
P
 
A
Q
 
K
V
 
V
R
 
S
V
 
V
D
 
F
D
 
D
L
 
H
G
 
G
L
 
F
L
 
L
R
 
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
|
F
E
 
E
T
x
G
V
 
I
L
 
R
V
 
A
S
 
Y
G
 
N
G
 
G
H
 
K
A
 
V
R
 
F
E
 
K
L
 
L
D
 
Y
K
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
E
 
Y
R
 
D
S
 
C
A
 
A
S
 
R
M
 
V
L
 
I
D
 
D
M
 
L
D
 
K
T
 
I
P
 
P
-
 
L
D
 
S
R
 
K
Q
 
E
A
 
E
W
 
F
Q
 
A
R
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
L
A
 
E
A
 
T
I
 
L
E
 
R
R
 
R
W
 
-
P
 
N
E
 
N
G
 
L
S
 
R
E
 
D
M
 
A
A
x
Y
L
 
I
K
 
R
L
 
P
V
 
I
Y
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
D
L
 
L
D
 
G
S
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
R
A
 
K
G
 
C
P
 
P
T
 
S
A
 
P
F
 
N
A
 
V
L
 
I
G
 
I
I
 
I
E
 
T
V
 
K
S
 
P
E
 
W
G
 
G
-
 
K
-
 
L
-
 
Y
-
 
G
-
 
D
L
 
L
L
 
Y
R
 
E
A
 
K
R
 
G
A
 
L
E
 
K
G
 
A
I
 
I
A
 
T
V
 
V
V
 
A
T
 
I
L
 
R
E
 
R
R
 
N
G
 
A
I
 
I
D
 
D
T
 
S
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
L
L
 
P
L
 
P
G
 
N
A
 
I
K
|
K
S
 
S
L
 
L
S
 
N
Y
|
Y
G
 
L
I
 
N
N
 
N
M
 
I
A
 
L
A
 
A
M
 
K
R
 
I
E
 
E
A
 
A
E
 
N
R
 
A
R
 
K
G
 
G
A
 
G
E
 
D
D
 
E
V
 
A
I
 
I
F
 
F
T
 
L
A
 
D
G
 
H
D
 
N
G
 
G
T
 
Y
V
 
I
L
 
S
E
|
E
G
 
G
P
 
S
I
x
G
A
x
D
N
 
N
V
 
I
V
 
F
V
 
I
A
 
V
D
 
K
G
 
N
G
 
G
T
 
T
L
 
I
Y
 
-
T
 
T
P
 
T
P
 
P
P
 
P
S
 
T
I
 
L
G
 
N
I
 
N
L
|
L
P
 
K
G
|
G
T
x
I
T
|
T
Q
 
R
A
 
Q
G
 
V
L
 
V
F
 
I
R
 
E
A
 
L
A
 
I
E
 
N
R
 
E
A
 
L
G
 
E
W
 
I
S
 
P
T
 
F
K
 
R
I
 
E
E
 
A
P
 
N
L
 
I
R
 
G
I
 
L
E
 
F
D
 
D
L
 
L
R
 
Y
G
 
S
A
 
A
D
 
D
G
 
E
V
 
I
F
 
F
L
 
V
T
 
T
S
x
G
S
x
T
I
x
A
R
 
A
K
 
E
V
 
I
T
 
A
R
 
P
V
 
V
H
 
T
T
 
Y
L
 
I
D
 
D
G
 
G

P19938 D-alanine aminotransferase; D-amino acid aminotransferase; D-amino acid transaminase; DAAT; D-aspartate aminotransferase; EC 2.6.1.21 from Bacillus sp. (strain YM-1) (see 5 papers)
26% identity, 94% coverage: 18:282/283 of query aligns to 15:278/283 of P19938

query
sites
P19938
Q
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
E
D
 
D
L
 
R
G
 
G
L
 
Y
L
 
Q
R
 
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
x
Y
E
 
E
T
 
V
V
 
V
L
 
K
V
 
V
S
 
Y
G
 
N
G
 
G
H
 
E
A
 
M
R
 
F
E
 
T
L
 
V
D
 
N
K
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
E
 
Y
R
 
A
S
 
S
A
 
A
S
 
E
M
 
K
L
 
I
D
 
R
M
 
I
D
 
T
T
 
I
P
 
P
-
 
Y
D
 
T
R
 
K
Q
 
D
A
 
K
W
 
F
Q
 
H
R
 
Q
A
 
L
V
 
L
A
 
H
A
 
E
A
 
L
I
 
V
E
 
E
R
 
K
W
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
N
E
 
E
M
 
L
A
 
N
L
 
T
K
 
G
L
 
H
V
 
I
Y
 
Y
-
 
F
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
T
D
 
S
S
 
P
D
x
R
P
 
A
S
x
H
A
 
Q
G
 
F
P
 
P
T
 
E
A
 
N
F
 
T
A
 
V
L
 
K
G
 
P
I
 
V
E
 
I
V
 
I
S
 
-
E
 
-
G
 
G
L
 
Y
L
 
T
R
 
K
A
 
E
R
 
N
A
 
P
E
 
R
G
 
P
I
 
L
A
 
E
V
 
-
V
 
-
T
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
K
T
 
A
D
 
T
L
 
F
A
 
V
A
 
E
R
 
D
A
 
I
P
 
R
W
 
W
L
 
L
L
 
R
L
 
C
G
 
D
A
 
I
K
|
K
S
 
S
L
 
L
S
 
N
Y
 
L
G
 
L
I
 
G
N
 
A
M
 
V
A
 
L
A
 
A
M
 
K
R
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
H
R
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
C
E
 
Y
D
 
E
V
 
A
I
 
I
F
 
L
T
 
H
A
 
R
G
 
N
D
 
N
G
 
-
T
 
T
V
 
V
L
 
T
E
|
E
G
 
G
P
 
S
I
 
S
A
 
S
N
 
N
V
 
V
V
 
F
V
 
G
A
 
I
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
P
 
H
P
 
P
P
 
A
S
 
N
I
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
P
 
K
G
 
G
T
 
I
T
 
T
Q
 
R
A
 
D
G
 
V
L
 
V
F
 
I
R
 
A
A
 
C
A
 
A
E
 
N
R
 
E
A
 
I
G
 
N
W
 
M
S
 
P
T
 
V
K
 
K
I
 
E
E
 
I
P
 
P
L
 
F
R
 
T
I
 
T
E
 
H
D
 
E
L
 
A
R
 
L
G
 
K
A
 
M
D
 
D
G
 
E
V
 
L
F
 
F
L
 
V
T
 
T
S
 
S
S
 
T
I
 
T
R
 
S
K
 
E
V
 
I
T
 
T
R
 
P
V
 
V
H
 
I
T
 
E
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
K
Q
 
L
L
 
I
P
 
R
D
 
D
S
 
G
R
 
K
T
 
V
-
 
G
-
 
E
L
 
W
H
 
T
A
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
K
A
 
Q
Y
 
F
E
 
E
S
 
T
E
 
K
Y
 
I
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3lqsA Complex structure of d-amino acid aminotransferase and 4-amino-4,5- dihydro-thiophenecarboxylic acid (adta) (see paper)
26% identity, 94% coverage: 18:282/283 of query aligns to 14:277/280 of 3lqsA

query
sites
3lqsA
Q
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
E
D
 
D
L
 
R
G
 
G
L
 
Y
L
 
Q
R
 
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
x
Y
E
 
E
T
x
V
V
 
V
L
 
K
V
 
V
S
 
Y
G
 
N
G
 
G
H
 
E
A
 
M
R
 
F
E
 
T
L
 
V
D
 
N
K
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
E
 
Y
R
 
A
S
 
S
A
 
A
S
 
E
M
 
K
L
 
I
D
 
R
M
 
I
D
 
T
T
 
I
P
 
P
-
 
Y
D
 
T
R
 
K
Q
 
D
A
 
K
W
 
F
Q
 
H
R
 
Q
A
 
L
V
 
L
A
 
H
A
 
E
A
 
L
I
 
V
E
 
E
R
 
K
W
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
N
E
 
E
M
 
L
A
 
N
L
 
T
K
 
G
L
 
H
V
 
I
Y
 
Y
-
 
F
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
T
D
 
S
S
 
P
D
 
R
P
 
A
S
 
H
A
 
Q
G
 
F
P
 
P
T
 
E
A
 
N
F
 
T
A
 
V
L
 
K
G
 
P
I
 
V
E
 
I
V
 
I
S
 
G
E
 
Y
G
 
T
L
 
K
L
 
E
R
 
N
A
 
P
R
 
R
A
 
P
E
 
-
G
 
-
I
 
-
A
 
-
V
 
L
V
 
E
T
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
K
T
 
A
D
 
T
L
 
F
A
 
V
A
 
E
R
 
D
A
 
I
P
 
R
W
 
W
L
 
L
L
 
R
L
 
C
G
 
D
A
 
I
K
|
K
S
 
S
L
 
L
S
 
N
Y
 
L
G
 
L
I
 
G
N
 
A
M
 
V
A
 
L
A
 
A
M
 
K
R
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
H
R
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
C
E
 
Y
D
 
E
V
 
A
I
 
I
F
 
L
T
 
H
A
 
R
G
 
N
D
 
N
G
 
-
T
 
T
V
 
V
L
 
T
E
|
E
G
 
G
P
 
S
I
x
S
A
x
S
N
|
N
V
 
V
V
 
F
V
 
G
A
 
I
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
P
 
H
P
 
P
P
 
A
S
 
N
I
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
P
 
K
G
|
G
T
x
I
T
|
T
Q
 
R
A
 
D
G
 
V
L
 
V
F
 
I
R
 
A
A
 
C
A
 
A
E
 
N
R
 
E
A
 
I
G
 
N
W
 
M
S
 
P
T
 
V
K
 
K
I
 
E
E
 
I
P
 
P
L
 
F
R
 
T
I
 
T
E
 
H
D
 
E
L
 
A
R
 
L
G
 
K
A
 
M
D
 
D
G
 
E
V
 
L
F
 
F
L
 
V
T
 
T
S
|
S
S
x
T
I
x
T
R
 
S
K
 
E
V
 
I
T
 
T
R
 
P
V
 
V
H
 
I
T
 
E
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
K
Q
 
L
L
 
I
P
 
R
D
 
D
S
 
G
R
 
K
T
 
V
-
 
G
-
 
E
L
 
W
H
 
T
A
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
K
A
 
Q
Y
 
F
E
 
E
S
 
T
E
 
K
Y
 
I
P
 
P

7p7xA Crystal structure of d-amino acid transaminase from haliscomenobacter hydrossis (holo form). (see paper)
26% identity, 90% coverage: 6:259/283 of query aligns to 7:251/282 of 7p7xA

query
sites
7p7xA
H
 
N
L
 
I
D
 
N
G
 
G
S
 
Q
V
 
Q
A
 
V
D
 
P
P
 
V
D
 
E
A
 
N
P
 
A
Q
 
T
V
 
L
R
 
H
V
 
V
D
 
S
D
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
G
 
G
V
 
I
F
 
F
E
 
D
T
 
Y
V
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
R
G
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
P
R
 
L
E
 
F
L
|
L
D
|
D
K
 
D
H
 
Y
L
 
L
D
 
N
R
|
R
L
 
F
E
 
Y
R
 
R
S
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
E
L
 
L
D
 
Y
M
 
L
D
 
E
T
 
I
P
 
P
D
 
F
R
 
D
Q
 
K
A
 
A
W
 
E
Q
 
L
R
|
R
A
 
R
V
 
Q
A
 
I
A
 
Y
A
 
A
I
 
L
E
 
L
R
 
Q
W
 
A
P
 
N
E
 
E
G
 
V
S
 
R
E
 
E
M
 
A
A
 
G
L
 
I
K
 
R
L
 
L
V
 
V
Y
 
L
T
 
T
R
 
G
G
 
G
L
 
Y
D
 
S
S
 
P
D
 
D
-
 
G
-
 
Y
P
 
T
S
 
P
A
 
V
G
 
N
P
 
P
T
 
N
A
 
L
F
 
L
A
 
I
L
 
M
G
 
M
I
 
Y
E
 
D
V
 
L
S
 
P
E
 
A
G
 
S
L
 
A
L
 
W
R
 
E
A
 
F
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
T
-
 
H
-
 
P
L
 
F
E
 
Q
R
|
R
G
 
E
I
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
L
 
L
L
 
P
G
 
E
A
 
V
K
|
K
S
 
T
L
 
I
S
 
N
Y
|
Y
G
 
S
I
 
T
N
 
G
M
 
I
A
 
R
A
 
M
M
 
L
R
 
K
E
 
T
A
 
I
E
 
K
R
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
T
D
 
D
V
 
L
I
 
I
F
 
Y
T
 
V
A
 
D
G
 
Q
D
 
G
G
 
E
T
 
W
V
 
I
L
 
R
E
|
E
G
 
S
P
x
A
I
x
R
A
x
S
N
 
N
-
 
F
V
 
F
V
 
L
V
 
V
A
 
M
D
 
P
G
 
D
G
 
N
T
 
T
L
 
I
Y
 
V
T
 
T
P
 
A
P
 
D
P
 
E
S
 
K
I
 
-
G
 
-
I
 
I
L
|
L
P
 
W
G
|
G
T
x
I
T
|
T
Q
 
R
A
 
R
G
 
Q
L
 
V
F
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
G
W
 
Y
S
 
A
T
 
V
K
 
E
I
 
E
E
 
R
P
 
R
L
 
I
R
 
H
I
 
I
E
 
T
D
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
Q
A
 
A
D
 
R
G
 
E
V
 
A
F
 
F
L
 
F
T
 
T
S
 
S
S
x
T
I
 
I
R
 
K
K
 
G
V
 
V
T
 
M
R
 
A
V
 
I
H
 
G
T
 
Q
L
 
I
D
 
D

Sites not aligning to the query:

8ahuA Crystal structure of d-amino acid aminotrensferase from haliscomenobacter hydrossis complexed with d-cycloserine (see paper)
26% identity, 90% coverage: 6:259/283 of query aligns to 8:252/283 of 8ahuA

query
sites
8ahuA
H
 
N
L
 
I
D
 
N
G
 
G
S
 
Q
V
 
Q
A
 
V
D
 
P
P
 
V
D
 
E
A
 
N
P
 
A
Q
 
T
V
 
L
R
 
H
V
 
V
D
 
S
D
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
G
 
G
V
 
I
F
|
F
E
 
D
T
 
Y
V
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
R
G
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
P
R
 
L
E
 
F
L
 
L
D
 
D
K
 
D
H
 
Y
L
 
L
D
 
N
R
|
R
L
 
F
E
 
Y
R
 
R
S
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
E
L
 
L
D
 
Y
M
 
L
D
 
E
T
 
I
P
 
P
D
 
F
R
 
D
Q
 
K
A
 
A
W
 
E
Q
 
L
R
 
R
A
 
R
V
 
Q
A
 
I
A
 
Y
A
 
A
I
 
L
E
 
L
R
 
Q
W
 
A
P
 
N
E
 
E
G
 
V
S
 
R
E
 
E
M
 
A
A
 
G
L
 
I
K
 
R
L
 
L
V
 
V
Y
 
L
T
 
T
R
 
G
G
 
G
L
 
Y
D
 
S
S
 
P
D
 
D
-
 
G
-
 
Y
P
 
T
S
 
P
A
 
V
G
 
N
P
 
P
T
 
N
A
 
L
F
 
L
A
 
I
L
 
M
G
 
M
I
 
Y
E
 
D
V
 
L
S
 
P
E
 
A
G
 
S
L
 
A
L
 
W
R
 
E
A
 
F
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
T
-
 
H
-
 
P
L
 
F
E
 
Q
R
|
R
G
 
E
I
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
L
 
L
L
 
P
G
 
E
A
 
V
K
|
K
S
 
T
L
 
I
S
 
N
Y
|
Y
G
 
S
I
 
T
N
 
G
M
 
I
A
 
R
A
 
M
M
 
L
R
 
K
E
 
T
A
 
I
E
 
K
R
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
T
D
 
D
V
 
L
I
 
I
F
 
Y
T
 
V
A
 
D
G
 
Q
D
 
G
G
 
E
T
 
W
V
 
I
L
 
R
E
|
E
G
 
S
P
x
A
I
x
R
A
x
S
N
 
N
-
 
F
V
 
F
V
 
L
V
 
V
A
 
M
D
 
P
G
 
D
G
 
N
T
 
T
L
 
I
Y
 
V
T
 
T
P
 
A
P
 
D
P
 
E
S
 
K
I
 
-
G
 
-
I
 
I
L
|
L
P
 
W
G
|
G
T
x
I
T
|
T
Q
 
R
A
 
R
G
 
Q
L
 
V
F
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
G
W
 
Y
S
 
A
T
 
V
K
 
E
I
 
E
E
 
R
P
 
R
L
 
I
R
 
H
I
 
I
E
 
T
D
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
Q
A
 
A
D
 
R
G
 
E
V
 
A
F
 
F
L
 
F
T
 
T
S
|
S
S
x
T
I
 
I
R
 
K
K
 
G
V
 
V
T
 
M
R
 
A
V
 
I
H
 
G
T
 
Q
L
 
I
D
 
D

3daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase inactivated by pyridoxyl-d-alanine (see paper)
26% identity, 94% coverage: 18:282/283 of query aligns to 14:277/277 of 3daaA

query
sites
3daaA
Q
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
E
D
 
D
L
 
R
G
 
G
L
 
Y
L
 
Q
R
 
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
x
Y
E
 
E
T
x
V
V
 
V
L
 
K
V
 
V
S
 
Y
G
 
N
G
 
G
H
 
E
A
 
M
R
 
F
E
 
T
L
 
V
D
 
N
K
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
E
 
Y
R
 
A
S
 
S
A
 
A
S
 
E
M
 
K
L
 
I
D
 
R
M
 
I
D
 
T
T
 
I
P
 
P
-
 
Y
D
 
T
R
 
K
Q
 
D
A
 
K
W
 
F
Q
 
H
R
 
Q
A
 
L
V
 
L
A
 
H
A
 
E
A
 
L
I
 
V
E
 
E
R
 
K
W
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
N
E
 
E
M
 
L
A
 
N
L
 
T
K
 
G
L
 
H
V
 
I
Y
 
Y
-
 
F
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
T
D
 
S
S
 
P
D
 
R
P
 
A
S
 
H
A
 
Q
G
 
F
P
 
P
T
 
E
A
 
N
F
 
T
A
 
V
L
 
K
G
 
P
I
 
V
E
 
I
V
 
I
S
 
-
E
 
-
G
 
G
L
 
Y
L
 
T
R
 
K
A
 
E
R
 
N
A
 
P
E
 
R
G
 
P
I
 
L
A
 
E
V
 
-
V
 
-
T
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
K
T
 
A
D
 
T
L
 
F
A
 
V
A
 
E
R
 
D
A
 
I
P
 
R
W
 
W
L
 
L
L
 
R
L
 
C
G
 
D
A
 
I
K
|
K
S
 
S
L
 
L
S
 
N
Y
 
L
G
 
L
I
 
G
N
 
A
M
 
V
A
 
L
A
 
A
M
 
K
R
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
H
R
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
C
E
 
Y
D
 
E
V
 
A
I
 
I
F
 
L
T
 
H
A
 
R
G
 
N
D
 
N
G
 
-
T
 
T
V
 
V
L
 
T
E
|
E
G
 
G
P
 
S
I
x
S
A
x
S
N
 
N
V
 
V
V
 
F
V
 
G
A
 
I
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
P
 
H
P
 
P
P
 
A
S
 
N
I
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
P
 
K
G
|
G
T
x
I
T
|
T
Q
 
R
A
 
D
G
 
V
L
 
V
F
 
I
R
 
A
A
 
C
A
 
A
E
 
N
R
 
E
A
 
I
G
 
N
W
 
M
S
 
P
T
 
V
K
 
K
I
 
E
E
 
I
P
 
P
L
 
F
R
 
T
I
 
T
E
 
H
D
 
E
L
 
A
R
 
L
G
 
K
A
 
M
D
 
D
G
 
E
V
 
L
F
 
F
L
 
V
T
 
T
S
|
S
S
x
T
I
 
T
R
 
S
K
 
E
V
 
I
T
 
T
R
 
P
V
 
V
H
 
I
T
 
E
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
K
Q
 
L
L
 
I
P
 
R
D
 
D
S
 
G
R
 
K
T
 
V
-
 
G
-
 
E
L
 
W
H
 
T
A
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
K
A
 
Q
Y
 
F
E
 
E
S
 
T
E
 
K
Y
 
I
P
 
P

2daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase inactivated by d-cycloserine
26% identity, 94% coverage: 18:282/283 of query aligns to 14:277/277 of 2daaA

query
sites
2daaA
Q
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
E
D
 
D
L
 
R
G
 
G
L
 
Y
L
 
Q
R
 
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
x
Y
E
 
E
T
x
V
V
 
V
L
 
K
V
 
V
S
 
Y
G
 
N
G
 
G
H
 
E
A
 
M
R
 
F
E
 
T
L
 
V
D
 
N
K
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
E
 
Y
R
 
A
S
 
S
A
 
A
S
 
E
M
 
K
L
 
I
D
 
R
M
 
I
D
 
T
T
 
I
P
 
P
-
 
Y
D
 
T
R
 
K
Q
 
D
A
 
K
W
 
F
Q
 
H
R
 
Q
A
 
L
V
 
L
A
 
H
A
 
E
A
 
L
I
 
V
E
 
E
R
 
K
W
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
N
E
 
E
M
 
L
A
 
N
L
 
T
K
 
G
L
 
H
V
 
I
Y
 
Y
-
 
F
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
T
D
 
S
S
 
P
D
x
R
P
 
A
S
x
H
A
 
Q
G
 
F
P
 
P
T
 
E
A
 
N
F
 
T
A
 
V
L
 
K
G
 
P
I
 
V
E
 
I
V
 
I
S
 
-
E
 
-
G
 
G
L
 
Y
L
 
T
R
 
K
A
 
E
R
 
N
A
 
P
E
 
R
G
 
P
I
 
L
A
 
E
V
 
-
V
 
-
T
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
K
T
 
A
D
 
T
L
 
F
A
 
V
A
 
E
R
 
D
A
 
I
P
 
R
W
 
W
L
 
L
L
 
R
L
 
C
G
 
D
A
 
I
K
|
K
S
 
S
L
 
L
S
 
N
Y
 
L
G
 
L
I
 
G
N
 
A
M
 
V
A
 
L
A
 
A
M
 
K
R
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
H
R
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
C
E
 
Y
D
 
E
V
 
A
I
 
I
F
 
L
T
 
H
A
 
R
G
 
N
D
 
N
G
 
-
T
 
T
V
 
V
L
 
T
E
|
E
G
 
G
P
 
S
I
x
S
A
x
S
N
|
N
V
 
V
V
 
F
V
 
G
A
 
I
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
P
 
H
P
 
P
P
 
A
S
 
N
I
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
P
 
K
G
|
G
T
x
I
T
|
T
Q
 
R
A
 
D
G
 
V
L
 
V
F
 
I
R
 
A
A
 
C
A
 
A
E
 
N
R
 
E
A
 
I
G
 
N
W
 
M
S
 
P
T
 
V
K
 
K
I
 
E
E
 
I
P
 
P
L
 
F
R
 
T
I
 
T
E
 
H
D
 
E
L
 
A
R
 
L
G
 
K
A
 
M
D
 
D
G
 
E
V
 
L
F
 
F
L
 
V
T
 
T
S
 
S
S
x
T
I
 
T
R
 
S
K
 
E
V
 
I
T
 
T
R
 
P
V
 
V
H
 
I
T
 
E
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
K
Q
 
L
L
 
I
P
 
R
D
 
D
S
 
G
R
 
K
T
 
V
-
 
G
-
 
E
L
 
W
H
 
T
A
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
K
A
 
Q
Y
 
F
E
 
E
S
 
T
E
 
K
Y
 
I
P
 
P

1daaA Crystallographic structure of d-amino acid aminotransferase complexed with pyridoxal-5'-phosphate (see paper)
26% identity, 94% coverage: 18:282/283 of query aligns to 14:277/277 of 1daaA

query
sites
1daaA
Q
 
E
V
 
V
R
 
K
V
 
I
D
 
D
-
 
K
-
 
E
D
 
D
L
 
R
G
 
G
L
 
Y
L
 
Q
R
 
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
V
 
V
F
x
Y
E
 
E
T
x
V
V
 
V
L
 
K
V
 
V
S
 
Y
G
 
N
G
 
G
H
 
E
A
 
M
R
 
F
E
 
T
L
 
V
D
 
N
K
 
E
H
 
H
L
 
I
D
 
D
R
|
R
L
 
L
E
 
Y
R
 
A
S
 
S
A
 
A
S
 
E
M
 
K
L
 
I
D
 
R
M
 
I
D
 
T
T
 
I
P
 
P
-
 
Y
D
 
T
R
 
K
Q
 
D
A
 
K
W
 
F
Q
 
H
R
 
Q
A
 
L
V
 
L
A
 
H
A
 
E
A
 
L
I
 
V
E
 
E
R
 
K
W
 
-
P
 
-
E
 
-
G
 
-
S
 
N
E
 
E
M
 
L
A
 
N
L
 
T
K
 
G
L
 
H
V
 
I
Y
 
Y
-
 
F
-
 
Q
-
 
V
T
 
T
R
 
R
G
 
G
L
 
T
D
 
S
S
 
P
D
 
R
P
 
A
S
 
H
A
 
Q
G
 
F
P
 
P
T
 
E
A
 
N
F
 
T
A
 
V
L
 
K
G
 
P
I
 
V
E
 
I
V
 
I
S
 
-
E
 
-
G
 
G
L
 
Y
L
 
T
R
 
K
A
 
E
R
 
N
A
 
P
E
 
R
G
 
P
I
 
L
A
 
E
V
 
-
V
 
-
T
 
N
L
 
L
E
 
E
R
 
K
G
 
G
I
 
V
D
 
K
T
 
A
D
 
T
L
 
F
A
 
V
A
 
E
R
 
D
A
 
I
P
 
R
W
 
W
L
 
L
L
 
R
L
 
C
G
 
D
A
 
I
K
|
K
S
 
S
L
 
L
S
 
N
Y
 
L
G
 
L
I
 
G
N
 
A
M
 
V
A
 
L
A
 
A
M
 
K
R
 
Q
E
 
E
A
 
A
E
 
H
R
 
E
R
 
K
G
 
G
A
 
C
E
 
Y
D
 
E
V
 
A
I
 
I
F
 
L
T
 
H
A
 
R
G
 
N
D
 
N
G
 
-
T
 
T
V
 
V
L
 
T
E
|
E
G
 
G
P
 
S
I
x
S
A
x
S
N
 
N
V
 
V
V
 
F
V
 
G
A
 
I
D
 
K
G
 
D
G
 
G
T
 
I
L
 
L
Y
 
Y
T
 
T
P
 
H
P
 
P
P
 
A
S
 
N
I
 
N
G
 
M
I
 
I
L
|
L
P
 
K
G
|
G
T
x
I
T
|
T
Q
 
R
A
 
D
G
 
V
L
 
V
F
 
I
R
 
A
A
 
C
A
 
A
E
 
N
R
 
E
A
 
I
G
 
N
W
 
M
S
 
P
T
 
V
K
 
K
I
 
E
E
 
I
P
 
P
L
 
F
R
 
T
I
 
T
E
 
H
D
 
E
L
 
A
R
 
L
G
 
K
A
 
M
D
 
D
G
 
E
V
 
L
F
 
F
L
 
V
T
 
T
S
|
S
S
x
T
I
 
T
R
 
S
K
 
E
V
 
I
T
 
T
R
 
P
V
 
V
H
 
I
T
 
E
L
 
I
D
 
D
G
 
G
V
 
K
Q
 
L
L
 
I
P
 
R
D
 
D
S
 
G
R
 
K
T
 
V
-
 
G
-
 
E
L
 
W
H
 
T
A
 
R
E
 
K
L
 
L
A
 
Q
A
 
K
A
 
Q
Y
 
F
E
 
E
S
 
T
E
 
K
Y
 
I
P
 
P

8raiA Crystal structure of d-amino acid transaminase from haliscomenobacter hydrossis point mutant r90i complexed with phenylhydrazine (see paper)
26% identity, 90% coverage: 6:259/283 of query aligns to 7:251/282 of 8raiA

query
sites
8raiA
H
 
N
L
 
I
D
 
N
G
 
G
S
 
Q
V
 
Q
A
 
V
D
 
P
P
 
V
D
 
E
A
 
N
P
 
A
Q
 
T
V
 
L
R
 
H
V
 
V
D
 
S
D
 
D
L
 
L
G
 
S
L
 
I
L
 
L
R
 
R
G
 
G
D
 
Y
G
 
G
V
 
I
F
|
F
E
 
D
T
 
Y
V
 
F
L
 
L
V
 
A
S
 
R
G
 
E
G
 
G
H
 
H
A
 
P
R
 
L
E
 
F
L
 
L
D
 
D
K
 
D
H
 
Y
L
 
L
D
 
N
R
|
R
L
 
F
E
 
Y
R
 
R
S
 
S
A
 
A
S
 
A
M
 
E
L
 
L
D
 
Y
M
 
L
D
 
E
T
 
I
P
 
P
D
 
F
R
 
D
Q
 
K
A
 
A
W
 
E
Q
 
L
R
 
R
A
 
R
V
 
Q
A
 
I
A
 
Y
A
 
A
I
 
L
E
 
L
R
 
Q
W
 
A
P
 
N
E
 
E
G
 
V
S
 
R
E
 
E
M
 
A
A
 
G
L
 
I
K
 
I
L
 
L
V
 
V
Y
 
L
T
 
T
R
 
G
G
 
G
L
 
Y
D
 
S
S
 
P
D
 
D
-
 
G
-
 
Y
P
 
T
S
 
P
A
 
V
G
 
N
P
 
P
T
 
N
A
 
L
F
 
L
A
 
I
L
 
M
G
 
M
I
 
Y
E
 
D
V
 
L
S
 
P
E
 
A
G
 
S
L
 
A
L
 
W
R
 
E
A
 
F
R
 
S
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
A
 
K
V
 
I
V
 
I
T
 
T
-
 
H
-
 
P
L
 
F
E
 
Q
R
|
R
G
 
E
I
 
-
D
 
-
T
 
-
D
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
P
 
-
W
 
-
L
 
-
L
 
L
L
 
P
G
 
E
A
 
V
K
|
K
S
 
T
L
 
I
S
 
N
Y
|
Y
G
 
S
I
 
T
N
 
G
M
 
I
A
 
R
A
 
M
M
 
L
R
 
K
E
 
T
A
 
I
E
 
K
R
 
E
R
 
R
G
 
G
A
 
A
E
 
T
D
 
D
V
 
L
I
 
I
F
 
Y
T
 
V
A
 
D
G
 
Q
D
 
G
G
 
E
T
 
W
V
 
I
L
 
R
E
|
E
G
 
S
P
x
A
I
x
R
A
x
S
N
|
N
-
 
F
V
 
F
V
 
L
V
 
V
A
 
M
D
 
P
G
 
D
G
 
N
T
 
T
L
 
I
Y
 
V
T
 
T
P
 
A
P
 
D
P
 
E
S
 
K
I
 
-
G
 
-
I
 
I
L
|
L
P
 
W
G
|
G
T
x
I
T
|
T
Q
 
R
A
 
R
G
 
Q
L
 
V
F
 
I
R
 
D
A
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
E
A
 
A
G
 
G
W
 
Y
S
 
A
T
 
V
K
 
E
I
 
E
E
 
R
P
 
R
L
 
I
R
 
H
I
 
I
E
 
T
D
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
Q
A
 
A
D
 
R
G
 
E
V
 
A
F
 
F
L
 
F
T
 
T
S
 
S
S
x
T
I
 
I
R
 
K
K
 
G
V
 
V
T
 
M
R
 
A
V
 
I
H
 
G