SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_089300691.1 NCBI__GCF_900188115.1:WP_089300691.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P9WP25 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
60% identity, 85% coverage: 15:301/338 of query aligns to 12:298/300 of P9WP25

query
sites
P9WP25
F
 
L
G
 
G
R
 
T
V
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
S
S
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
E
 
A
R
 
T
A
 
A
G
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
N
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
S
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
S
 
T
D
 
D
R
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
E
M
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
R
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
A
H
 
H
S
 
S
V
 
I
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
 
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
 
R
S
 
S
V
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
H
P
 
P
R
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
A
E
 
Q
V
 
I
I
 
M
A
 
A
N
 
D
T
 
T
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
S
x
A
V
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
G
V
 
F
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
H
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
A
 
E
M
 
L
I
 
L
E
 
S
A
 
A
Y
 
F
E
 
G
N
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
S
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
T
 
K
N
 
I
H
 
N
R
 
I
G
 
A
M
 
V
L
 
A
A
 
P
V
 
L
L
 
C
R
 
N
A
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
L
A
 
S
K
 
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
F
 
I
E
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
V
 
V
P
 
A
A
 
A
S
 
T
E
 
P
D
 
E
V
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
M
T
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V

5j5dA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from mycobacterium tuberculosis in complex with alpha-ketopimelic acid (see paper)
60% identity, 85% coverage: 15:301/338 of query aligns to 9:295/297 of 5j5dA

query
sites
5j5dA
F
 
L
G
 
G
R
 
T
V
 
L
L
 
L
T
 
T
A
|
A
M
 
M
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
S
S
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
E
 
A
R
 
T
A
 
A
G
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
N
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
S
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
S
 
T
D
 
D
R
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
E
M
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
R
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
A
H
 
H
S
 
S
V
 
I
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
S
V
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
H
P
 
P
R
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
A
E
 
Q
V
 
I
I
 
M
A
 
A
N
 
D
T
 
T
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
G
|
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
S
 
A
V
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
H
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
A
 
E
M
 
L
I
 
L
E
 
S
A
 
A
Y
 
F
E
 
G
N
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
S
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
T
 
K
N
 
I
H
 
N
R
 
I
G
 
A
M
 
V
L
 
A
A
 
P
V
 
L
L
 
C
R
 
N
A
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
L
A
 
S
K
 
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
F
 
I
E
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
V
 
V
P
 
A
A
 
A
S
 
T
E
 
P
D
 
E
V
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
M
T
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V

1xxxA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis (see paper)
60% identity, 85% coverage: 15:301/338 of query aligns to 8:294/296 of 1xxxA

query
sites
1xxxA
F
 
L
G
 
G
R
 
T
V
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
S
S
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
E
 
A
R
 
T
A
 
A
G
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
N
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
S
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
S
 
T
D
 
D
R
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
E
M
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
R
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
A
H
 
H
S
 
S
V
 
I
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
S
V
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
|
A
E
 
S
H
|
H
P
 
P
R
 
N
I
|
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
A
E
 
Q
V
 
I
I
 
M
A
 
A
N
 
D
T
 
T
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
S
 
A
V
 
M
G
 
G
A
 
A
A
 
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
H
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
A
 
E
M
 
L
I
 
L
E
 
S
A
 
A
Y
 
F
E
 
G
N
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
S
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
T
 
K
N
 
I
H
 
N
R
 
I
G
 
A
M
 
V
L
 
A
A
 
P
V
 
L
L
 
C
R
 
N
A
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
L
A
 
S
K
 
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
F
 
I
E
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
V
 
V
P
 
A
A
 
A
S
 
T
E
 
P
D
 
E
V
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
M
T
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V

3l21B The crystal structure of a dimeric mutant of dihydrodipicolinate synthase (dapa, rv2753c) from mycobacterium tuberculosis - dhdps- a204r
60% identity, 85% coverage: 15:301/338 of query aligns to 7:293/295 of 3l21B

query
sites
3l21B
F
 
L
G
 
G
R
 
T
V
 
L
L
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
S
S
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
S
L
 
L
D
 
D
T
 
T
E
 
A
R
 
T
A
 
A
G
 
A
E
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
N
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
Q
 
Q
G
 
G
N
 
C
D
 
D
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
S
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
T
S
 
T
D
 
D
R
 
G
E
 
E
K
 
K
A
 
I
D
 
E
M
 
L
V
 
L
R
 
R
A
 
A
V
 
V
V
 
L
E
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
G
D
 
D
R
 
R
A
 
A
T
 
R
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
A
 
A
H
 
H
S
 
S
V
 
I
E
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
A
A
 
C
E
 
A
K
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
H
G
 
G
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
S
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
R
G
 
G
L
 
L
H
 
Q
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
T
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
D
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
S
V
 
A
V
 
V
P
 
P
I
 
I
E
 
E
V
 
P
D
 
D
T
 
T
L
 
I
R
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
E
 
S
H
 
H
P
 
P
R
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
K
G
 
A
D
 
D
L
 
L
L
 
H
T
 
S
G
 
G
S
 
A
E
 
Q
V
 
I
I
 
M
A
 
A
N
 
D
T
 
T
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
N
L
 
L
P
 
P
W
 
W
L
 
L
S
 
R
V
 
M
G
 
G
A
 
A
A
x
T
G
 
G
V
 
F
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
I
G
 
A
H
 
H
V
 
L
V
 
A
A
 
A
G
 
G
R
 
Q
I
 
L
R
 
R
A
 
E
M
 
L
I
x
L
E
 
S
A
 
A
Y
 
F
E
 
G
N
 
S
G
 
G
D
 
D
T
 
I
S
 
A
T
 
T
A
 
A
R
 
R
T
 
K
N
 
I
H
 
N
R
 
I
G
 
A
M
 
V
L
 
A
A
 
P
V
 
L
L
 
C
R
 
N
A
 
A
F
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
L
G
 
G
G
 
G
V
 
V
V
 
T
F
 
L
A
 
S
K
 
K
T
 
A
A
 
G
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
F
 
I
E
 
D
I
 
V
G
 
G
G
 
D
P
 
P
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
Q
V
 
V
P
 
A
A
 
A
S
 
T
E
 
P
D
 
E
V
 
Q
V
 
I
E
 
D
A
 
A
I
 
L
S
 
A
A
 
A
D
 
D
L
 
M
T
 
R
Q
 
A
A
 
A
G
 
S
V
 
V

5ktlA Dihydrodipicolinate synthase from the industrial and evolutionarily important cyanobacteria anabaena variabilis. (see paper)
41% identity, 83% coverage: 15:294/338 of query aligns to 5:287/295 of 5ktlA

query
sites
5ktlA
F
 
F
G
 
G
R
 
T
V
 
V
L
 
L
T
 
T
A
 
A
M
 
M
A
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
K
S
 
A
E
 
D
G
 
G
V
 
S
L
 
V
D
 
N
T
 
Y
E
 
A
R
 
V
A
 
A
G
 
A
E
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
H
L
 
L
V
 
V
E
 
D
Q
 
N
G
 
G
N
 
T
D
 
D
G
 
T
L
 
L
V
 
V
V
 
V
N
 
C
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
P
 
P
T
 
T
T
x
L
S
 
S
D
 
W
R
 
D
E
 
E
K
x
E
A
 
Y
D
 
N
M
 
L
V
 
F
R
 
V
A
x
E
V
 
V
V
 
L
E
x
Q
A
 
T
V
 
V
G
 
A
D
 
G
R
 
K
A
 
A
T
 
K
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
C
G
 
G
T
 
S
Y
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
K
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
A
L
 
A
A
 
T
R
 
Q
E
 
K
A
 
A
E
 
A
K
 
K
A
 
I
G
 
G
A
 
V
H
 
H
G
 
G
L
 
T
L
 
L
V
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
L
 
L
H
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
T
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
Q
A
 
A
T
 
C
-
 
P
E
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
L
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
V
 
G
V
 
Q
P
 
N
I
 
L
E
 
S
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
V
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
D
R
 
N
I
 
I
L
 
I
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
E
A
 
A
K
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
L
L
 
D
T
 
Q
G
 
A
S
 
G
E
 
E
V
 
I
I
 
R
A
 
R
N
 
S
T
 
T
-
 
P
-
 
K
Q
 
E
L
 
F
A
 
Q
Y
 
I
Y
 
Y
S
 
A
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
S
L
 
L
N
 
T
L
 
L
P
 
P
W
 
L
L
 
L
S
 
A
V
 
I
G
 
G
A
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
V
V
|
V
S
 
S
V
 
V
I
 
A
G
 
S
H
 
H
V
 
L
V
 
V
A
 
G
G
 
N
R
 
Q
I
 
L
R
 
Q
A
 
Q
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
Y
 
F
E
 
N
N
 
S
G
 
G
D
 
Q
T
 
V
S
 
T
T
 
V
A
 
A
R
 
S
T
 
D
N
 
I
H
 
H
R
 
L
G
 
R
M
 
L
L
 
L
A
 
P
V
 
L
L
 
F
R
 
K
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
I
V
 
T
G
 
T
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
I
K
 
K
T
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
K
L
 
L
R
 
Q
G
 
G
F
 
W
E
 
E
I
 
V
G
 
G
G
 
S
P
 
T
R
 
R
L
 
P
P
 
P
L
 
L
V
 
S
P
 
D
A
 
A
S
 
D
E
 
A
D
 
E
V
 
V
V
 
S
E
 
Q
A
 
K
I
 
L
S
 
E
A
 
A

5ud6C Crystal structure of dhdps from cyanidioschyzon merolae with lysine bound
41% identity, 86% coverage: 15:304/338 of query aligns to 4:296/299 of 5ud6C

query
sites
5ud6C
F
 
F
G
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
I
T
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
K
S
 
L
E
 
T
G
 
G
V
 
V
-
 
E
L
 
V
D
 
D
T
 
Y
E
 
G
R
 
V
A
 
A
G
 
E
E
 
S
L
 
L
A
 
A
E
 
A
H
 
H
L
 
L
V
 
A
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
N
 
S
D
 
D
G
 
A
L
 
I
V
 
I
V
 
V
N
x
A
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
P
x
A
T
 
T
T
 
L
S
 
T
D
x
W
R
 
S
E
 
E
K
x
E
A
 
Y
D
 
E
M
 
L
V
 
F
R
 
R
A
 
V
V
 
V
V
 
K
E
 
S
A
 
A
V
 
V
-
 
A
G
 
G
D
 
T
R
 
K
A
 
C
T
 
R
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
|
G
A
 
A
G
 
G
T
 
S
Y
x
N
D
 
S
T
 
T
A
 
E
H
x
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
A
A
 
T
R
 
K
E
 
K
A
 
S
E
 
A
K
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
L
H
 
D
G
 
G
L
 
T
L
 
L
V
 
Q
V
 
V
T
 
V
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
P
Q
 
Q
A
 
Q
G
 
G
L
 
I
H
 
M
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
R
A
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
N
A
 
A
T
 
A
-
 
P
E
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
M
M
 
M
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
V
 
G
V
 
I
P
 
N
I
 
M
E
 
T
V
 
A
D
 
E
T
 
T
L
 
S
R
 
I
R
 
K
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
M
-
 
C
P
 
P
R
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
A
V
 
L
K
|
K
D
 
E
A
 
A
K
 
S
G
 
G
D
 
N
L
 
L
L
 
E
T
 
Q
G
 
F
S
 
A
E
 
R
V
 
I
I
 
R
A
 
R
N
 
A
T
 
T
Q
 
S
-
 
P
-
 
D
L
 
F
A
 
A
Y
 
L
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
N
 
T
L
 
L
P
 
P
W
 
L
L
 
L
S
 
S
V
 
L
G
 
G
A
 
G
A
 
N
G
 
G
V
 
V
V
|
V
S
 
S
V
 
V
I
 
A
G
 
S
H
 
H
V
 
F
V
 
I
A
 
G
G
 
P
R
 
E
I
 
I
R
 
Q
A
 
R
M
 
M
I
 
I
E
 
E
A
 
H
Y
 
F
E
 
V
N
 
D
-
 
L
G
 
G
D
 
N
T
 
P
S
 
E
T
 
E
A
 
A
R
 
F
T
 
R
N
 
I
H
 
H
R
 
C
G
 
R
M
 
Y
L
 
M
A
 
D
V
 
L
L
 
F
R
 
E
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
V
V
 
M
G
 
A
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
A
K
 
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
R
L
 
L
R
 
L
G
 
G
F
 
W
E
 
P
I
 
V
G
 
G
G
 
P
P
 
T
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
-
A
 
-
S
 
-
E
 
-
D
 
D
V
 
I
V
 
T
E
 
A
A
 
S
I
 
A
S
 
E
A
 
Q
D
 
Q
L
 
L
T
 
R
Q
 
Q
A
 
A
G
 
M
V
 
I
P
 
A
L
 
A
G
 
G

4fhaA Structure of dihydrodipicolinate synthase from streptococcus pneumoniae,bound to pyruvate and lysine
35% identity, 82% coverage: 17:292/338 of query aligns to 9:286/307 of 4fhaA

query
sites
4fhaA
R
 
K
V
 
I
L
 
I
T
 
T
A
 
A
M
 
F
A
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
H
S
 
E
E
 
D
G
 
G
V
 
S
L
 
I
D
 
N
T
 
F
E
 
D
R
 
A
A
 
I
G
 
P
E
 
A
L
 
L
A
 
I
E
 
E
H
 
H
L
 
L
V
 
L
E
 
A
Q
 
H
G
 
H
N
 
T
D
 
D
G
 
G
L
 
I
V
 
L
V
 
L
N
 
A
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
A
E
 
E
S
|
S
P
|
P
T
 
T
T
x
L
S
 
T
D
x
H
R
 
D
E
 
E
K
x
E
A
 
L
D
 
E
M
 
L
V
 
F
R
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
Q
E
 
K
A
 
V
V
 
V
G
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
L
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
V
G
 
G
T
 
T
Y
 
N
D
 
D
T
 
T
A
 
R
H
 
D
S
 
S
V
 
I
E
 
E
L
 
F
A
 
V
R
 
K
E
 
E
-
 
V
A
 
A
E
 
E
K
 
F
A
 
G
G
 
G
A
 
F
H
 
A
G
 
A
L
 
G
L
 
L
V
 
A
V
 
I
T
 
V
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
S
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
M
H
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
T
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
D
A
 
A
T
 
S
E
 
D
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
I
L
 
I
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
 
R
S
 
V
V
 
V
V
 
V
P
 
E
I
 
L
E
 
T
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
M
R
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
D
H
 
H
P
 
P
R
 
N
I
 
I
L
 
I
A
 
G
V
 
V
K
 
K
D
 
E
A
 
C
K
 
T
G
 
S
D
 
-
L
 
L
L
 
A
T
 
N
G
 
M
S
 
A
E
 
Y
V
 
L
I
 
I
A
 
E
N
 
H
T
 
K
-
 
P
-
 
E
Q
 
E
L
 
F
A
 
L
Y
 
I
Y
 
Y
S
 
T
G
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
G
L
 
D
N
 
A
L
 
F
P
 
H
W
 
A
L
 
M
S
 
N
V
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
A
G
 
S
H
 
H
V
 
T
V
 
N
A
 
G
G
 
D
R
 
E
I
 
M
R
 
H
A
 
E
M
 
M
I
 
F
E
 
T
A
 
A
Y
 
I
E
 
A
N
 
E
G
 
S
D
 
D
T
 
M
S
 
K
T
 
K
A
 
A
R
 
A
T
 
A
N
 
I
H
 
Q
R
 
R
G
 
K
M
 
F
L
 
I
A
 
P
V
 
K
L
 
V
R
 
N
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
S
V
 
Y
G
 
P
G
 
S
V
 
P
V
 
A
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
I
L
 
L
R
 
N
L
 
Y
R
 
M
G
 
G
F
 
F
E
 
E
I
 
A
G
 
G
G
 
P
P
 
T
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
D
V
 
V
E
 
K
A
 
R
I
 
I

1o5kA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase (tm1521) from thermotoga maritima at 1.80 a resolution
35% identity, 85% coverage: 15:301/338 of query aligns to 3:294/295 of 1o5kA

query
sites
1o5kA
F
 
F
G
 
R
R
 
G
V
 
V
L
 
G
T
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
K
S
 
N
E
 
-
G
 
G
V
 
E
L
 
L
D
 
D
T
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
Y
G
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
R
H
 
Y
L
 
Q
V
 
L
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
N
 
V
D
 
N
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
V
N
 
L
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
V
S
 
N
D
 
E
R
 
D
E
 
E
K
 
R
A
 
E
D
 
K
M
 
L
V
 
V
R
 
S
A
 
R
V
 
T
V
 
L
E
|
E
A
 
I
V
 
V
G
x
D
D
 
G
R
 
K
A
 
I
T
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
Y
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
E
H
 
K
S
 
T
V
 
L
E
 
K
L
 
L
A
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
H
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
A
 
Y
V
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
G
V
 
I
M
 
V
L
 
V
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
V
 
G
V
 
V
P
 
N
I
 
V
E
 
L
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
I
-
 
A
A
 
A
E
 
D
H
 
L
P
 
K
R
 
N
I
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
E
A
 
A
K
 
N
G
 
P
D
 
D
L
 
I
L
 
D
T
 
Q
G
 
I
S
 
D
E
 
R
V
 
T
I
 
V
A
 
S
N
 
L
T
 
T
Q
 
K
L
 
Q
A
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
F
-
 
M
Y
 
V
Y
 
W
S
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
A
 
D
L
 
R
N
 
T
L
 
F
P
 
Y
W
 
L
L
 
L
S
 
C
V
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
S
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
Q
I
 
M
R
 
V
A
 
E
M
 
L
I
 
C
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
E
 
F
N
 
S
G
 
G
D
 
N
T
 
L
S
 
E
T
 
K
A
 
S
R
 
R
T
 
E
N
 
V
H
 
H
R
 
R
G
 
K
M
 
L
L
 
R
A
 
P
V
 
L
L
 
M
R
 
K
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
V
V
 
E
G
 
T
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
N
L
 
L
R
 
M
G
 
G
F
 
F
E
 
I
I
 
E
G
 
N
G
 
E
P
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
S
E
 
E
D
 
K
V
 
T
V
 
V
E
 
E
A
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
N
D
 
V
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
L

Q9X1K9 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
35% identity, 85% coverage: 15:301/338 of query aligns to 2:293/294 of Q9X1K9

query
sites
Q9X1K9
F
 
F
G
 
R
R
 
G
V
 
V
L
 
G
T
 
T
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
K
S
 
N
E
 
-
G
 
G
V
 
E
L
 
L
D
 
D
T
 
L
E
 
E
R
 
S
A
 
Y
G
 
E
E
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
R
H
 
Y
L
 
Q
V
 
L
E
 
E
Q
 
N
G
 
G
N
 
V
D
 
N
G
 
A
L
 
L
V
 
I
V
 
V
N
 
L
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
V
S
 
N
D
 
E
R
 
D
E
 
E
K
 
R
A
 
E
D
 
K
M
 
L
V
 
V
R
 
S
A
 
R
V
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
I
V
 
V
G
 
D
D
 
G
R
 
K
A
 
I
T
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
T
Y
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
E
H
 
K
S
 
T
V
 
L
E
 
K
L
 
L
A
 
V
R
 
K
E
 
Q
A
 
A
E
 
E
K
 
K
A
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
N
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
H
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
A
 
Y
V
 
I
A
 
S
D
 
E
A
 
R
T
 
T
E
 
D
L
 
L
P
 
G
V
 
I
M
 
V
L
 
V
Y
 
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
 
R
S
 
T
V
 
G
V
 
V
P
 
N
I
 
V
E
 
L
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
A
R
 
A
R
 
R
L
 
I
-
 
A
A
 
A
E
 
D
H
 
L
P
 
K
R
 
N
I
 
V
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
 
K
D
 
E
A
 
A
K
 
N
G
 
P
D
|
D
L
x
I
L
x
D
T
 
Q
G
 
I
S
 
D
E
 
R
V
 
T
I
 
V
A
 
S
N
 
L
T
 
T
Q
 
K
L
 
Q
A
 
A
-
 
R
-
 
S
-
 
D
-
 
F
-
 
M
Y
 
V
Y
 
W
S
 
S
G
 
G
D
 
N
D
 
D
A
 
D
L
 
R
N
 
T
L
 
F
P
 
Y
W
 
L
L
 
L
S
 
C
V
 
A
G
 
G
A
 
G
A
 
D
G
 
G
V
 
V
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
V
G
 
S
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
Q
I
 
M
R
 
V
A
 
E
M
 
L
I
 
C
E
 
A
A
 
E
Y
 
Y
E
 
F
N
 
S
G
 
G
D
 
N
T
 
L
S
 
E
T
 
K
A
 
S
R
 
R
T
 
E
N
 
V
H
 
H
R
 
R
G
 
K
M
 
L
L
 
R
A
 
P
V
 
L
L
 
M
R
 
K
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
V
V
 
E
G
 
T
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
A
A
 
A
L
 
L
R
 
N
L
 
L
R
 
M
G
 
G
F
 
F
E
 
I
I
 
E
G
 
N
G
 
E
P
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
P
A
 
A
S
 
S
E
 
E
D
 
K
V
 
T
V
 
V
E
 
E
A
 
L
I
 
L
S
 
R
A
 
N
D
 
V
L
 
L
T
 
K
Q
 
E
A
 
S
G
 
G
V
 
L

Q07607 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; Protein MosA; EC 4.3.3.7 from Rhizobium meliloti (Ensifer meliloti) (Sinorhizobium meliloti) (see paper)
36% identity, 86% coverage: 15:303/338 of query aligns to 2:292/292 of Q07607

query
sites
Q07607
F
 
F
G
 
E
R
 
G
V
 
S
L
 
I
T
 
T
A
 
A
M
 
L
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
-
S
 
A
E
 
D
G
 
D
V
 
R
L
 
I
D
 
D
T
 
E
E
 
V
R
 
A
A
 
L
G
 
H
E
 
D
L
 
L
A
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
Q
V
 
I
E
 
E
Q
 
E
G
 
G
N
 
S
D
 
F
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
N
 
C
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
 
P
T
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
K
R
 
S
E
 
E
K
 
H
A
 
E
D
 
Q
M
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
I
V
 
T
V
 
I
E
 
K
A
 
T
V
 
A
G
 
N
D
 
G
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
S
Y
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
A
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
A
L
 
F
A
 
V
R
 
R
E
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
G
L
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
V
T
 
S
P
 
P
Y
 
Y
Y
 
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
I
H
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
F
T
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
D
D
 
A
A
 
A
T
 
S
E
 
T
L
 
I
P
 
P
V
 
I
M
 
I
L
 
V
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
G
R
 
R
S
 
S
V
 
A
V
 
I
P
 
E
I
 
I
E
 
H
V
 
V
D
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
A
R
 
R
L
 
I
A
 
F
E
 
E
H
 
D
-
 
C
P
 
P
R
 
N
I
 
V
L
 
K
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
N
L
 
L
L
 
L
T
 
R
G
 
P
S
 
S
-
 
L
-
 
E
E
 
R
V
 
M
I
 
A
A
 
C
N
 
G
T
 
E
Q
 
D
L
 
F
A
 
N
Y
 
L
Y
 
L
S
 
T
G
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
G
L
 
T
N
 
A
L
 
L
P
 
G
W
 
Y
L
 
M
S
 
A
V
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
H
G
 
G
V
 
C
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
A
R
 
L
I
 
C
R
 
A
A
 
D
M
 
F
I
 
Q
E
 
Q
A
 
A
Y
 
C
E
 
L
N
 
N
G
 
G
D
 
D
T
 
F
S
 
A
T
 
A
A
 
A
R
 
L
T
 
K
N
 
L
H
 
Q
R
 
D
G
 
R
M
 
L
L
 
M
A
 
P
V
 
L
L
 
H
R
 
R
A
 
A
F
 
L
S
 
F
R
 
L
V
 
E
G
 
T
G
 
N
V
 
P
V
 
A
F
 
G
A
 
A
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
L
 
L
R
 
Q
L
 
R
R
 
L
G
 
G
F
 
R
E
 
M
I
 
R
G
 
G
G
 
D
P
 
L
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
V
P
 
T
A
 
I
S
 
S
E
 
P
D
 
S
V
 
F
V
 
Q
E
 
E
A
 
E
I
 
I
S
 
D
A
 
D
D
 
A
L
 
M
T
 
R
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
L
L
 
L

Q8UGL3 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; HTPA synthase; EC 4.3.3.7 from Agrobacterium fabrum (strain C58 / ATCC 33970) (Agrobacterium tumefaciens (strain C58)) (see paper)
38% identity, 85% coverage: 15:301/338 of query aligns to 2:292/294 of Q8UGL3

query
sites
Q8UGL3
F
 
F
G
 
K
R
 
G
V
 
S
L
 
I
T
 
P
A
 
A
M
 
L
A
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
T
S
 
D
E
 
N
G
 
G
V
 
S
L
 
V
D
 
D
T
 
E
E
 
K
R
 
A
A
 
F
G
 
A
E
 
A
L
 
H
A
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
Q
V
 
I
E
 
A
Q
 
E
G
 
G
N
 
S
D
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
N
 
V
G
 
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
S
P
|
P
T
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
H
R
 
D
E
 
E
K
x
H
A
 
K
D
 
R
M
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
L
V
 
C
V
 
I
E
 
E
A
 
V
V
 
A
G
 
A
D
 
K
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
S
Y
x
N
D
 
N
T
 
T
A
 
D
H
x
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
 
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
L
 
L
H
 
F
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
V
L
 
I
Y
 
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
P
R
 
R
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
D
I
 
M
E
 
S
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
M
R
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
-
 
A
H
 
H
P
 
K
R
 
N
I
 
I
L
 
I
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
L
L
 
D
T
 
R
G
 
V
S
 
S
E
 
E
-
 
Q
-
 
R
V
 
I
I
 
S
A
 
C
N
 
G
T
 
K
Q
 
D
L
 
F
A
 
V
Y
 
Q
Y
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
G
L
 
T
N
 
A
L
 
L
P
 
G
W
 
F
L
 
N
S
 
A
V
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
C
V
 
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
R
R
 
L
I
 
C
R
 
S
A
 
E
M
 
F
I
 
Q
E
 
A
A
 
A
Y
 
M
E
 
L
N
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
S
 
A
T
 
K
A
 
A
R
 
L
T
 
E
N
 
Y
H
 
Q
R
 
D
G
 
R
M
 
L
L
 
M
A
 
P
V
 
L
L
 
H
R
 
R
A
 
A
F
 
I
S
 
F
R
 
M
V
 
E
G
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
C
F
 
G
A
 
T
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
L
 
L
-
 
S
R
 
K
L
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
-
E
 
-
I
 
-
G
 
G
G
 
N
P
 
R
R
 
R
L
 
V
-
 
R
-
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
M
P
 
S
A
 
T
S
 
L
E
 
E
D
 
P
V
 
A
V
 
T
E
 
E
-
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
D
A
 
A
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
L

4i7wA Agrobacterium tumefaciens dhdps with lysine and pyruvate
38% identity, 85% coverage: 15:301/338 of query aligns to 2:292/294 of 4i7wA

query
sites
4i7wA
F
 
F
G
 
K
R
 
G
V
 
S
L
 
I
T
 
P
A
 
A
M
 
L
A
 
I
T
 
T
P
 
P
F
 
F
D
 
T
S
 
D
E
 
N
G
 
G
V
 
A
L
 
V
D
 
D
T
 
E
E
 
Q
R
 
A
A
 
F
G
 
A
E
 
A
L
 
H
A
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
Q
V
 
I
E
 
A
Q
 
E
G
 
G
N
 
S
D
 
N
G
 
G
L
 
L
V
 
V
V
 
P
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
|
S
P
|
P
T
 
T
T
x
L
S
 
S
D
 
H
R
 
D
E
 
E
K
x
H
A
 
K
D
 
R
M
 
V
V
 
V
R
 
E
A
 
L
V
 
C
V
 
I
E
 
E
A
 
V
V
 
A
G
 
A
D
 
K
R
 
R
A
 
V
T
 
P
V
 
V
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
A
G
 
G
T
 
S
Y
x
N
D
 
N
T
 
T
A
 
D
H
x
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
L
E
 
H
A
 
A
E
 
Q
K
 
D
A
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
L
L
 
L
V
 
V
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
K
G
 
G
L
 
L
H
 
F
A
 
A
H
 
H
F
 
F
T
 
S
A
 
A
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
K
L
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
V
L
 
I
Y
|
Y
D
 
N
I
 
I
P
 
P
P
 
P
R
|
R
S
 
S
V
 
V
V
 
V
P
 
D
I
 
M
E
 
S
V
 
P
D
 
E
T
 
T
L
 
M
R
 
G
R
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
-
 
A
H
 
H
P
 
K
R
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
V
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
K
L
 
L
L
 
D
T
 
R
G
 
V
S
 
S
E
 
E
-
 
Q
-
 
R
V
 
I
I
 
S
A
 
C
N
 
G
T
 
K
Q
 
D
L
 
F
A
 
I
Y
 
Q
Y
 
L
S
 
S
G
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
S
L
 
T
N
 
A
L
 
L
P
 
G
W
 
F
L
 
N
S
 
A
V
 
H
G
 
G
A
 
G
A
 
V
G
 
G
V
 
C
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
S
G
 
A
H
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
P
G
 
R
R
 
L
I
 
C
R
 
S
A
 
E
M
 
F
I
 
Q
E
 
A
A
 
A
Y
 
M
E
 
L
N
 
A
G
 
G
D
 
D
T
 
Y
S
 
A
T
 
K
A
 
A
R
 
L
T
 
E
N
 
Y
H
 
Q
R
 
D
G
 
R
M
 
L
L
 
M
A
 
P
V
 
L
L
 
H
R
 
R
A
 
A
F
 
I
S
 
F
R
 
M
V
 
E
G
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
C
F
 
G
A
 
T
K
 
K
T
 
Y
A
 
A
L
 
L
-
 
S
R
 
K
L
 
T
R
 
R
G
 
G
F
 
C
E
 
N
I
 
-
G
 
R
G
 
K
P
 
V
R
 
R
L
 
S
P
 
P
L
 
L
V
 
M
P
 
S
A
 
T
S
 
L
E
 
E
D
 
P
V
 
A
V
 
T
E
 
E
-
 
A
A
 
A
I
 
I
S
 
D
A
 
A
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
H
A
 
A
G
 
G
V
 
L

4dxvA Crystal structure of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii complexed with mg and cl ions at 1.80 a resolution
34% identity, 84% coverage: 19:301/338 of query aligns to 6:290/291 of 4dxvA

query
sites
4dxvA
L
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
S
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
V
D
 
D
T
 
W
E
 
K
R
 
S
A
 
L
G
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
 
S
T
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
M
R
 
E
E
 
E
K
 
H
A
 
T
D
 
Q
M
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
Y
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
V
T
|
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
H
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
x
N
I
x
V
P
|
P
P
 
G
R
|
R
S
x
T
V
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
T
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
Q
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P
 
E
W
 
L
L
 
M
S
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
S
A
 
E
M
 
V
I
 
C
E
 
A
A
 
V
Y
 
A
E
 
I
N
 
A
G
 
K
D
 
D
T
 
E
S
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
T
N
 
L
H
 
N
R
 
N
G
 
K
M
 
I
L
 
A
A
 
N
V
 
L
L
 
H
R
 
N
A
 
I
F
 
L
S
 
F
R
 
C
V
 
E
G
 
S
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
E
R
 
M
G
 
G
F
 
L
E
 
I
I
 
D
G
 
T
G
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
E
D
 
Q
V
 
Y
V
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
L
S
 
R
A
 
N
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I

3u8gA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with oxalic acid at 1.80 a resolution
34% identity, 84% coverage: 19:301/338 of query aligns to 6:290/291 of 3u8gA

query
sites
3u8gA
L
 
I
T
 
V
A
|
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
S
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
V
D
 
D
T
 
W
E
 
K
R
 
S
A
 
L
G
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
 
S
T
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
M
R
 
E
E
 
E
K
 
H
A
 
T
D
 
Q
M
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
Y
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
|
L
V
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
H
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
V
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
T
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
Q
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P
 
E
W
 
L
L
 
M
S
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
S
A
 
E
M
 
V
I
 
C
E
 
A
A
 
V
Y
 
A
E
 
I
N
 
A
G
 
K
D
 
D
T
 
E
S
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
T
N
 
L
H
 
N
R
 
N
G
 
K
M
 
I
L
 
A
A
 
N
V
 
L
L
 
H
R
 
N
A
 
I
F
 
L
S
 
F
R
 
C
V
 
E
G
 
S
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
E
R
 
M
G
 
G
F
 
L
E
 
I
I
 
D
G
 
T
G
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
E
D
 
Q
V
 
Y
V
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
L
S
 
R
A
 
N
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I

3tdfA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 2-ketobutanoic acid at 1.99 a resolution
34% identity, 84% coverage: 19:301/338 of query aligns to 6:290/291 of 3tdfA

query
sites
3tdfA
L
 
I
T
 
V
A
|
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
S
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
V
D
 
D
T
 
W
E
 
K
R
 
S
A
 
L
G
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
 
S
T
 
T
T
 
L
S
 
S
D
 
M
R
 
E
E
 
E
K
 
H
A
 
T
D
 
Q
M
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
Y
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
 
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
H
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
V
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
T
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
Q
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P
 
E
W
 
L
L
 
M
S
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
D
G
 
G
V
 
N
V
x
I
S
 
S
V
 
V
I
 
T
G
 
A
H
 
N
V
 
I
V
 
A
A
 
P
G
 
K
R
 
A
I
 
M
R
 
S
A
 
E
M
 
V
I
 
C
E
 
A
A
 
V
Y
 
A
E
 
I
N
 
A
G
 
K
D
 
D
T
 
E
S
 
Q
T
 
Q
A
 
A
R
 
K
T
 
T
N
 
L
H
 
N
R
 
N
G
 
K
M
 
I
L
 
A
A
 
N
V
 
L
L
 
H
R
 
N
A
 
I
F
 
L
S
 
F
R
 
C
V
 
E
G
 
S
G
 
N
V
 
P
V
 
I
F
 
P
A
 
V
K
 
K
T
 
W
A
 
A
L
 
L
R
 
H
L
 
E
R
 
M
G
 
G
F
 
L
E
 
I
I
 
D
G
 
T
G
 
G
P
 
I
R
 
R
L
 
L
P
 
P
L
 
L
V
 
T
P
 
P
A
 
L
S
 
A
E
 
E
D
 
Q
V
 
Y
V
 
R
E
 
E
A
 
P
I
 
L
S
 
R
A
 
N
D
 
A
L
 
L
T
 
K
Q
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
I

3tceA Crystal structure of the complex of dihydrodipicolinate synthase from acinetobacter baumannii with 5-hydroxylysine at 2.6 a resolution
34% identity, 84% coverage: 19:301/338 of query aligns to 6:290/291 of 3tceA

query
sites
3tceA
L
 
I
T
 
V
A
 
A
M
 
I
A
 
V
T
 
T
P
 
P
F
 
M
D
 
L
S
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
G
L
 
V
D
 
D
T
 
W
E
 
K
R
 
S
A
 
L
G
 
E
E
 
K
L
 
L
A
 
V
E
 
E
H
 
W
L
 
H
V
 
I
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
N
 
T
D
 
N
G
 
S
L
 
I
V
 
V
V
 
A
N
 
V
G
 
G
T
|
T
T
 
T
G
 
G
E
 
E
S
 
A
P
x
S
T
 
T
T
x
L
S
 
S
D
 
M
R
 
E
E
 
E
K
x
H
A
 
T
D
 
Q
M
 
V
V
 
I
R
 
K
A
 
E
V
 
I
V
 
I
E
 
R
A
 
V
V
 
A
G
 
N
D
 
K
R
 
R
A
 
I
T
 
P
V
 
I
V
 
I
S
 
A
G
 
G
A
 
T
G
 
G
T
 
A
Y
 
N
D
 
S
T
 
T
A
 
R
H
 
E
S
 
A
V
 
I
E
 
E
L
 
L
A
 
T
R
 
K
E
 
A
A
 
A
E
 
K
K
 
D
A
 
L
G
 
G
A
 
A
H
 
D
G
 
A
L
 
A
L
 
L
V
 
L
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Y
|
Y
Y
|
Y
S
 
N
R
 
K
P
 
P
T
 
T
Q
 
Q
A
 
E
G
 
G
L
 
L
H
 
Y
A
 
Q
H
 
H
F
 
Y
T
 
K
A
 
A
V
 
I
A
 
A
D
 
E
A
 
A
T
 
V
E
 
E
L
 
L
P
 
P
V
 
L
M
 
I
L
 
L
Y
|
Y
D
 
N
I
 
V
P
 
P
P
 
G
R
|
R
S
 
T
V
 
G
V
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
S
V
 
N
D
 
D
T
 
T
L
 
A
R
 
V
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
H
 
I
P
 
P
R
 
N
I
 
I
L
 
V
A
 
G
V
 
I
K
|
K
D
 
D
A
 
A
K
 
T
G
 
G
D
 
D
L
 
V
L
 
P
T
 
R
G
 
G
S
 
K
E
 
A
V
 
L
I
 
I
-
 
D
-
 
A
A
 
L
N
 
N
T
 
G
Q
 
K
L
 
M
A
 
A
Y
 
V
Y
 
Y
S
 
S
G
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
T
N
 
A
L
 
W
P<