SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_090272859.1 NCBI__GCF_900105005.1:WP_090272859.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3jz4A Crystal structure of e. Coli NADP dependent enzyme (see paper)
62% identity, 99% coverage: 5:484/486 of query aligns to 1:480/481 of 3jz4A

query
sites
3jz4A
R
 
K
L
 
L
K
 
N
S
 
D
P
 
S
R
 
N
L
 
L
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
Q
C
 
A
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
L
N
 
D
A
 
A
S
 
N
S
 
N
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
I
A
 
D
V
 
V
D
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
G
 
G
D
 
D
V
 
K
L
 
L
G
 
G
H
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
K
L
 
M
S
 
G
A
 
A
A
 
D
E
 
E
V
 
T
G
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
N
S
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
P
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
K
 
A
R
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
T
C
 
I
L
 
L
L
 
R
A
 
N
W
 
W
H
 
F
D
 
N
L
 
L
M
 
M
L
 
M
E
 
E
H
 
H
K
 
Q
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
L
M
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
A
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
S
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
R
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
K
R
 
R
M
 
I
Y
 
Y
G
 
G
E
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
H
R
 
Q
I
 
A
G
 
D
Q
 
K
H
 
R
I
 
L
V
 
I
V
 
V
T
 
I
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
A
A
 
A
M
 
M
I
 
I
T
 
T
R
 
R
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
I
 
M
I
 
V
V
 
L
K
|
K
P
 
P
A
|
A
S
|
S
A
 
Q
T
 
T
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
I
E
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
H
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
S
A
|
A
G
 
G
E
 
A
I
 
V
S
x
G
E
 
N
V
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
S
S
 
N
P
 
P
V
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
K
L
 
L
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
D
 
E
V
x
I
G
 
G
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
M
 
M
A
 
E
Q
 
Q
C
 
C
S
 
A
E
 
K
H
 
D
I
 
I
Q
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
L
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
S
 
D
R
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
L
V
 
A
C
 
S
K
 
K
F
 
F
R
 
R
N
 
N
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
C
|
C
V
 
V
C
 
C
A
 
A
N
 
N
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
V
H
 
Y
D
 
D
K
 
R
F
 
F
V
 
A
A
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
M
 
M
G
 
S
K
 
K
L
 
L
R
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
G
F
 
L
E
 
D
P
 
N
G
 
G
V
 
V
T
 
T
Q
 
I
S
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
D
G
 
E
D
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
A
K
|
K
V
 
V
I
 
E
E
 
E
H
 
H
F
 
I
D
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
L
A
 
E
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
R
R
 
V
V
 
V
C
 
C
G
 
G
P
 
G
A
 
K
P
 
A
D
 
H
A
 
E
D
 
R
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
V
 
F
Q
 
Q
P
 
P
V
 
T
L
 
I
L
 
L
T
 
V
D
 
D
I
 
V
N
 
P
T
 
A
N
 
N
M
 
A
T
 
K
L
 
V
C
 
S
H
 
K
E
 
E
E
|
E
T
 
T
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
P
V
 
L
L
 
F
R
 
R
F
 
F
D
 
K
T
 
D
E
 
E
E
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
E
 
A
L
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
D
T
 
T
P
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
S
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
L
H
 
S
R
 
R
V
 
V
W
 
F
R
 
R
V
 
V
A
 
G
D
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
T
G
 
G
L
 
I
I
 
I
S
 
S
N
 
N
P
 
E
M
 
V
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
K
 
K
E
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
|
E
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
D
 
E
E
 
D
Y
 
Y
T
 
L
E
 
E
L
 
I
K
 
K
Y
 
Y
L
 
M
C
 
C
M
 
I
G
 
G

P25526 Succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP(+)] GabD; SSDH; Glutarate-semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.79; EC 1.2.1.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
62% identity, 99% coverage: 5:484/486 of query aligns to 2:481/482 of P25526

query
sites
P25526
R
 
K
L
 
L
K
 
N
S
 
D
P
 
S
R
 
N
L
 
L
F
 
F
R
 
R
Q
 
Q
Q
 
Q
C
 
A
Y
 
L
V
 
I
N
 
N
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
L
N
 
D
A
 
A
S
 
N
S
 
N
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
I
A
 
D
V
 
V
D
 
T
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
N
G
 
G
D
 
D
V
 
K
L
 
L
G
 
G
H
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
K
L
 
M
S
 
G
A
 
A
A
 
D
E
 
E
V
 
T
G
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
N
S
 
R
A
 
A
L
 
L
R
 
P
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
K
 
A
R
 
L
T
 
T
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
T
C
 
I
L
 
L
L
 
R
A
 
N
W
 
W
H
 
F
D
 
N
L
 
L
M
 
M
L
 
M
E
 
E
H
 
H
K
 
Q
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
L
M
 
M
T
 
T
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
A
Q
 
K
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
S
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
S
 
S
F
 
F
I
 
I
R
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
G
R
 
K
R
 
R
M
 
I
Y
 
Y
G
 
G
E
 
D
T
 
T
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
H
R
 
Q
I
 
A
G
 
D
Q
 
K
H
 
R
I
 
L
V
 
I
V
 
V
T
 
I
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
T
A
 
A
A
 
A
I
 
I
T
 
T
P
 
P
W
|
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
A
A
 
A
M
 
M
I
 
I
T
 
T
R
 
R
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
I
 
M
I
 
V
V
 
L
K
|
K
P
|
P
A
|
A
S
|
S
A
 
Q
T
 
T
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
I
E
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
H
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
S
A
 
A
G
 
G
E
 
A
I
 
V
S
 
G
E
 
N
V
 
E
L
 
L
T
 
T
R
 
S
S
 
N
P
 
P
V
 
L
V
 
V
R
 
R
K
 
K
L
 
L
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
D
 
E
V
 
I
G
 
G
R
 
R
R
 
Q
L
 
L
M
 
M
A
 
E
Q
 
Q
C
 
C
S
 
A
E
 
K
H
 
D
I
 
I
Q
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
S
 
D
R
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
L
V
 
A
C
 
S
K
 
K
F
 
F
R
 
R
N
 
N
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
C
 
C
V
 
V
C
 
C
A
 
A
N
 
N
R
 
R
F
 
L
L
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
V
H
 
Y
D
 
D
K
 
R
F
 
F
V
 
A
A
 
E
A
 
K
L
 
L
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
M
 
V
G
 
S
K
 
K
L
 
L
R
 
H
I
 
I
G
 
G
D
 
D
G
 
G
F
 
L
E
 
D
P
 
N
G
 
G
V
 
V
T
 
T
Q
 
I
S
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
D
G
 
E
D
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
E
E
 
E
H
 
H
F
 
I
D
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
L
A
 
E
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
R
R
 
V
V
 
V
C
 
C
G
 
G
P
 
G
A
 
K
P
 
A
D
 
H
A
 
E
D
 
R
R
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
V
 
F
Q
 
Q
P
 
P
V
 
T
L
 
I
L
 
L
T
 
V
D
 
D
I
 
V
N
 
P
T
 
A
N
 
N
M
 
A
T
 
K
L
 
V
C
 
S
H
 
K
E
 
E
E
|
E
T
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
P
V
 
L
L
 
F
R
 
R
F
 
F
D
 
K
T
 
D
E
 
E
E
 
A
E
 
D
A
 
V
I
 
I
E
 
A
L
 
Q
A
 
A
N
 
N
A
 
D
T
 
T
P
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
S
 
A
R
 
R
D
 
D
I
 
L
H
 
S
R
 
R
V
 
V
W
 
F
R
 
R
V
 
V
A
 
G
D
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
Y
G
 
G
I
 
I
I
 
V
G
 
G
I
 
I
N
 
N
E
 
T
G
 
G
L
 
I
I
 
I
S
 
S
N
 
N
P
 
E
M
 
V
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
K
 
K
E
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
D
 
E
E
 
D
Y
 
Y
T
 
L
E
 
E
L
 
I
K
 
K
Y
 
Y
L
 
M
C
 
C
M
 
I
G
 
G

8of1A Structure of aldh5f1 from moss physcomitrium patens in complex with NAD+ in the contracted conformation
52% identity, 99% coverage: 2:484/486 of query aligns to 16:498/505 of 8of1A

query
sites
8of1A
T
 
T
L
 
M
S
 
V
R
 
Q
L
 
L
K
 
N
S
 
E
P
 
A
R
 
G
L
 
L
F
 
F
R
 
K
Q
 
S
Q
 
Q
C
 
G
Y
 
L
V
 
I
N
 
G
G
 
D
Q
 
K
W
 
W
Q
 
V
N
 
D
A
 
A
S
 
E
S
 
N
G
 
G
E
 
H
T
 
T
L
 
L
A
 
P
V
 
V
D
 
N
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
I
L
 
L
G
 
T
H
 
S
V
 
V
P
 
P
V
 
F
L
 
M
S
 
G
A
 
K
A
 
R
E
 
E
V
 
A
G
 
E
A
 
K
A
 
A
V
 
I
D
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
S
S
 
Q
A
 
A
L
 
F
R
 
T
Q
 
S
W
 
W
R
 
S
K
 
K
R
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
N
E
 
D
R
 
R
A
 
S
D
 
K
C
 
I
L
 
L
L
 
R
A
 
Q
W
 
W
H
 
F
D
 
N
L
 
L
M
 
L
L
 
I
E
 
K
H
 
N
K
 
K
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
G
T
 
K
L
 
L
M
 
I
T
 
V
L
 
L
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
A
Q
 
V
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
V
Y
 
Y
A
 
G
A
 
A
S
 
A
F
 
F
I
 
V
R
 
E
W
 
Y
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
R
M
 
V
Y
 
Y
G
 
G
E
 
D
T
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
S
A
 
P
R
 
F
I
 
P
G
 
E
Q
 
K
H
 
R
I
 
M
V
 
L
V
 
V
T
 
M
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
C
 
V
A
 
A
A
 
A
I
|
I
T
x
A
P
|
P
W
|
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
A
 
L
A
 
A
M
 
M
I
 
I
T
 
T
R
 
R
K
 
K
A
 
V
G
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
I
 
V
I
 
V
V
 
I
K
|
K
P
 
P
A
 
S
S
 
E
A
 
L
T
 
T
P
 
P
F
 
L
S
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
A
A
 
A
V
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
L
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
P
G
 
G
V
 
V
F
 
V
N
 
N
V
 
V
V
 
V
T
 
M
G
 
G
K
 
D
A
|
A
G
 
K
E
 
G
I
 
I
S
 
G
E
 
D
V
 
A
L
 
M
T
 
L
R
 
D
S
 
S
P
 
T
V
 
E
V
 
V
R
 
R
K
 
K
L
 
I
S
 
T
F
|
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
D
 
G
V
|
V
G
 
G
R
 
K
R
x
M
L
 
L
M
 
L
A
 
A
Q
 
G
C
 
A
S
 
G
E
 
K
H
 
T
I
 
V
Q
 
K
K
 
K
V
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
L
|
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
C
I
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
N
I
 
L
S
 
D
R
 
V
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
G
A
 
V
M
 
L
V
 
A
C
 
G
K
 
K
F
 
Y
R
 
R
N
 
N
T
 
S
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
C
|
C
V
 
V
C
 
C
A
 
I
N
 
N
R
 
K
F
 
I
L
 
F
V
 
V
Q
 
Q
S
 
D
G
 
G
V
 
I
H
 
Y
D
 
D
K
 
K
F
 
F
V
 
A
A
 
E
A
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
K
A
 
A
M
 
V
G
 
S
K
 
G
L
 
L
R
 
R
I
 
A
G
 
G
D
 
N
G
 
G
F
 
L
E
 
E
P
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
Q
 
Q
S
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
N
G
 
E
D
 
T
A
 
A
V
 
L
E
 
E
K
|
K
V
 
V
I
 
E
E
 
R
H
 
H
F
 
V
D
 
Q
D
 
D
A
 
A
M
 
V
A
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
K
R
 
V
V
 
L
C
 
V
G
 
G
P
 
G
A
 
K
P
 
R
D
 
H
A
 
S
D
 
L
R
 
G
G
 
R
N
 
T
Y
 
F
V
 
Y
Q
 
E
P
 
P
V
 
T
L
 
I
L
 
L
T
 
G
D
 
N
I
 
A
N
 
S
T
 
D
N
 
E
M
 
M
T
 
L
L
 
I
C
 
F
H
 
R
E
 
E
E
|
E
T
 
V
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
A
 
A
A
 
P
V
 
L
L
 
V
R
 
R
F
 
F
D
 
N
T
 
T
E
 
D
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
K
L
 
L
A
 
A
N
 
N
A
 
N
T
 
S
P
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
F
 
A
Y
 
F
S
 
T
R
 
E
D
 
N
I
 
I
H
 
T
R
 
R
V
 
G
W
 
W
R
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
S
L
 
L
E
 
E
A
 
F
G
 
G
I
 
M
I
 
V
G
 
G
I
 
L
N
 
N
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
S
N
 
T
P
 
E
M
 
V
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
M
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
T
 
L
E
 
E
L
 
M
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
C
 
C
M
 
L
G
 
G

P51649 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial; Aldehyde dehydrogenase family 5 member A1; NAD(+)-dependent succinic semialdehyde dehydrogenase; EC 1.2.1.24 from Homo sapiens (Human) (see 5 papers)
55% identity, 98% coverage: 8:484/486 of query aligns to 55:533/535 of P51649

query
sites
P51649
S
 
S
P
 
A
R
 
A
L
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
T
Q
 
D
C
 
S
Y
 
F
V
 
V
N
 
G
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
Q
 
L
N
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
A
G
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
Q
N
 
D
P
 
P
A
 
A
N
 
S
G
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
M
V
 
V
P
 
A
V
 
D
L
x
C
S
 
G
A
 
V
A
 
R
E
 
E
V
 
A
G
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
Y
S
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
C
Q
 
R
W
 
W
R
 
R
K
 
E
R
 
V
T
 
S
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
S
C
 
L
L
 
L
L
 
R
A
 
K
W
 
W
H
 
Y
D
 
N
L
 
L
M
 
M
L
 
I
E
 
Q
H
 
N
K
 
K
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
I
M
 
I
T
 
T
L
 
A
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
K
E
 
E
S
 
A
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
F
F
 
F
I
 
L
R
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
R
M
 
V
Y
 
Y
G
|
G
E
 
D
T
 
I
I
 
I
P
x
H
G
 
T
A
x
P
R
 
A
I
 
K
G
 
D
Q
 
R
H
 
R
I
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
L
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
I
T
 
T
P
 
P
W
 
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
A
 
S
A
 
A
M
 
M
I
 
I
T
 
T
R
|
R
K
 
K
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
|
C
T
 
T
I
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
|
P
A
|
A
S
x
E
A
 
D
T
|
T
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
|
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
S
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
N
|
N
V
 
V
V
 
I
T
 
P
-
 
C
-
 
S
-
 
R
G
 
K
K
 
N
A
 
A
G
 
K
E
 
E
I
 
V
S
x
G
E
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
C
R
 
T
S
 
D
P
 
P
V
 
L
V
 
V
R
 
S
K
 
K
L
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
|
T
D
x
T
V
x
T
G
|
G
R
 
K
R
 
I
L
 
L
M
 
L
A
 
H
Q
 
H
C
 
A
S
 
A
E
 
N
H
 
S
I
 
V
Q
 
K
K
 
R
V
 
V
S
 
S
L
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
A
 
A
D
 
N
I
 
V
S
 
D
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
M
V
 
A
C
 
S
K
 
K
F
 
F
R
|
R
N
|
N
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
C
|
C
V
 
V
C
|
C
A
 
S
N
 
N
R
 
Q
F
 
F
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
S
 
R
G
 
G
V
 
I
H
 
H
D
 
D
K
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
K
K
 
K
-
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
V
G
 
G
D
x
N
G
 
G
F
 
F
E
 
E
P
 
E
G
 
G
V
 
T
T
 
T
Q
 
Q
S
 
G
A
x
P
L
 
L
I
 
I
N
 
N
G
 
E
D
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
V
 
V
I
 
E
E
 
K
H
 
Q
F
 
V
D
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
V
A
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
T
R
x
V
V
 
V
C
 
T
G
|
G
P
 
G
A
 
K
P
 
R
D
 
H
A
 
Q
D
 
L
R
 
G
G
 
K
N
 
N
Y
 
F
V
 
F
Q
 
E
P
 
P
V
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
C
D
 
N
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
N
 
D
M
 
M
T
 
L
L
 
C
C
 
T
H
 
H
E
 
E
E
 
E
T
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
P
V
 
V
L
 
I
R
 
K
F
 
F
D
 
D
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
A
P
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
R
 
Q
D
 
D
I
 
P
H
 
A
R
 
Q
V
 
I
W
 
W
R
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
V
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
|
S
N
 
S
P
 
V
M
 
E
A
 
C
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
T
 
L
E
 
E
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
C
 
C
M
 
Y
G
|
G

Sites not aligning to the query:

8c54A Cryo-em structure of nadh bound sla dehydrogenase rlgabd from rhizobium leguminosarum bv. Trifolii srd1565 (see paper)
53% identity, 99% coverage: 6:484/486 of query aligns to 2:480/482 of 8c54A

query
sites
8c54A
L
 
L
K
 
K
S
 
D
P
 
P
R
 
A
L
 
L
F
 
L
R
 
T
Q
 
D
Q
 
K
C
 
A
Y
 
F
V
 
V
N
 
A
G
 
G
Q
 
A
W
 
W
Q
 
I
N
 
G
A
 
A
S
 
P
S
 
D
G
 
G
E
 
K
T
 
S
L
 
I
A
 
A
V
 
V
D
 
T
N
 
D
P
 
P
A
 
F
N
 
D
G
 
G
D
 
A
V
 
L
L
 
I
G
 
A
H
 
N
V
 
V
P
 
P
V
 
D
L
 
L
S
 
G
A
 
Q
A
 
A
E
 
V
V
 
V
G
 
A
A
 
Q
A
 
A
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
S
 
A
S
 
E
A
 
A
L
 
Q
R
 
K
Q
 
L
W
 
W
R
 
E
K
 
R
R
 
R
T
 
T
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
Q
C
 
V
L
 
L
L
 
K
A
 
R
W
 
W
H
 
Y
D
 
D
L
 
L
M
 
I
L
 
V
E
 
E
H
 
N
K
 
A
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
L
L
 
I
M
 
L
T
 
T
L
 
T
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
A
E
 
E
S
 
A
Q
 
R
G
 
G
E
 
E
I
 
V
D
 
V
Y
 
S
A
 
N
A
 
A
S
 
A
F
 
Y
I
 
L
R
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
K
R
 
R
M
 
I
Y
 
D
G
 
G
E
 
D
T
 
I
I
 
I
P
 
P
G
 
G
A
 
P
R
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
H
 
R
I
 
I
V
 
M
V
 
V
T
 
L
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
C
 
C
A
 
A
A
 
A
I
|
I
T
|
T
P
|
P
W
 
W
N
 
N
F
 
F
P
 
P
A
 
N
A
 
G
M
 
M
I
 
I
T
 
T
R
 
R
K
 
K
A
 
A
G
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
S
I
 
M
I
 
I
V
 
L
K
|
K
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
Q
T
 
T
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
R
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
H
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
N
 
S
V
 
V
V
 
V
T
 
T
G
 
G
K
 
E
A
|
A
G
x
K
E
 
P
I
 
I
S
 
G
E
 
L
V
 
E
L
 
F
T
 
C
R
 
H
S
 
N
P
 
P
V
 
R
V
 
I
R
 
A
K
 
K
L
 
I
S
 
T
F
|
F
T
|
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
D
 
G
V
|
V
G
 
G
R
 
R
R
x
W
L
 
L
M
 
M
A
 
K
Q
 
E
C
 
A
S
 
A
E
 
G
H
 
G
I
 
I
Q
 
K
K
 
R
V
 
L
S
 
S
L
 
L
E
 
E
L
 
L
G
|
G
G
 
G
N
 
N
A
 
A
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
L
S
 
D
R
 
A
A
 
A
V
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
M
 
M
V
 
I
C
 
S
K
 
K
F
 
F
R
 
R
N
 
N
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
C
 
C
V
 
V
C
 
C
A
 
A
N
 
N
R
 
R
F
 
I
L
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
S
 
E
G
 
S
V
 
V
H
 
A
D
 
A
K
 
A
F
 
F
V
 
T
A
 
E
A
 
R
L
 
L
A
 
L
E
 
A
A
 
K
M
 
V
G
 
S
K
 
G
L
 
L
R
 
S
I
 
L
G
 
G
D
 
R
G
 
G
F
 
T
E
 
D
P
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
S
Q
 
Q
S
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
D
G
 
E
D
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
A
K
 
K
V
 
M
I
 
E
E
 
E
H
 
H
F
 
I
D
 
A
D
 
D
A
 
A
M
 
M
A
 
A
K
 
N
G
 
G
A
 
G
K
 
T
R
 
V
V
 
L
C
 
T
G
 
G
P
 
G
A
 
K
P
 
R
D
 
S
A
 
V
D
 
L
R
 
G
G
 
G
N
 
T
Y
 
F
V
 
F
Q
 
E
P
 
P
V
 
T
L
 
V
L
 
V
T
 
T
D
 
G
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
N
 
T
M
 
M
T
 
K
L
 
V
C
 
A
H
 
K
E
 
E
E
 
E
T
 
T
F
 
F
G
 
A
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
P
V
 
I
L
 
I
R
 
S
F
 
F
D
 
K
T
 
H
E
 
E
E
 
N
E
 
D
A
 
V
I
 
I
E
 
A
L
 
M
A
 
A
N
 
N
A
 
D
T
 
S
P
 
E
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
S
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
S
 
A
R
 
K
D
 
D
I
 
M
H
 
A
R
 
R
V
 
I
W
 
W
R
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
A
G
 
G
I
 
M
I
 
V
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
T
G
 
G
L
 
M
I
 
I
S
 
A
N
 
N
P
 
E
M
 
M
A
 
A
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
I
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
T
G
 
G
R
 
R
E
 
E
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
D
 
E
E
 
G
Y
 
F
T
 
L
E
 
E
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
C
 
A
M
 
L
G
 
G

2w8rA The crystal structure of human ssadh in complex with NAD+ (see paper)
55% identity, 98% coverage: 8:484/486 of query aligns to 5:483/485 of 2w8rA

query
sites
2w8rA
S
 
S
P
 
A
R
 
A
L
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
T
Q
 
D
C
 
S
Y
 
F
V
 
V
N
 
G
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
Q
 
L
N
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
A
G
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
Q
N
 
D
P
 
P
A
 
A
N
 
S
G
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
M
V
 
V
P
 
A
V
 
D
L
 
C
S
 
G
A
 
V
A
 
R
E
 
E
V
 
A
G
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
Y
S
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
C
Q
 
R
W
 
W
R
 
R
K
 
E
R
 
V
T
 
S
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
S
C
 
L
L
 
L
L
 
R
A
 
K
W
 
W
H
 
Y
D
 
N
L
 
L
M
 
M
L
 
I
E
 
Q
H
 
N
K
 
K
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
I
M
 
I
T
 
T
L
 
A
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
K
E
 
E
S
 
A
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
F
F
 
F
I
 
L
R
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
R
M
 
V
Y
 
Y
G
 
G
E
 
D
T
 
I
I
 
I
P
 
H
G
 
T
A
 
P
R
 
A
I
 
K
G
 
D
Q
 
R
H
 
R
I
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
L
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
I
T
|
T
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
S
A
 
A
M
 
M
I
 
I
T
 
T
R
 
R
K
 
K
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
I
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
 
A
S
 
E
A
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
S
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
N
 
N
V
 
V
V
 
I
T
 
P
-
 
C
-
 
S
-
 
R
G
 
K
K
 
N
A
|
A
G
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
G
E
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
C
R
 
T
S
 
D
P
 
P
V
 
L
V
 
V
R
 
S
K
 
K
L
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
|
S
T
 
T
D
 
T
V
x
T
G
 
G
R
 
K
R
 
I
L
 
L
M
 
L
A
 
H
Q
 
H
C
 
A
S
 
A
E
 
N
H
 
S
I
 
V
Q
 
K
K
 
R
V
 
V
S
 
S
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
A
 
A
D
 
N
I
 
V
S
 
D
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
M
V
 
A
C
 
S
K
 
K
F
 
F
R
 
R
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
C
x
A
V
 
V
C
 
C
A
 
S
N
 
N
R
 
Q
F
 
F
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
S
 
R
G
 
G
V
 
I
H
 
H
D
 
D
K
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
K
K
 
K
-
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
N
G
 
G
F
 
F
E
 
E
P
 
E
G
 
G
V
 
T
T
 
T
Q
 
Q
S
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
N
G
 
E
D
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
V
 
V
I
 
E
E
 
K
H
 
Q
F
 
V
D
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
V
A
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
T
R
 
V
V
 
V
C
 
T
G
 
G
P
 
G
A
 
K
P
 
R
D
 
H
A
 
Q
D
 
L
R
 
G
G
 
K
N
 
N
Y
 
F
V
 
F
Q
 
E
P
 
P
V
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
C
D
 
N
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
N
 
D
M
 
M
T
 
L
L
 
C
C
 
T
H
 
H
E
 
E
E
|
E
T
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
P
V
 
V
L
 
I
R
 
K
F
 
F
D
 
D
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
A
P
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
R
 
Q
D
 
D
I
 
P
H
 
A
R
 
Q
V
 
I
W
 
W
R
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
V
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
 
S
N
 
S
P
 
V
M
 
E
A
 
C
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
|
E
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
T
 
L
E
 
E
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
C
 
C
M
 
Y
G
 
G

2w8qA The crystal structure of human ssadh in complex with ssa. (see paper)
55% identity, 98% coverage: 8:484/486 of query aligns to 5:483/485 of 2w8qA

query
sites
2w8qA
S
 
S
P
 
A
R
 
A
L
 
L
F
 
L
R
 
R
Q
 
T
Q
 
D
C
 
S
Y
 
F
V
 
V
N
 
G
G
 
G
Q
 
R
W
 
W
Q
 
L
N
 
P
A
 
A
S
 
A
S
 
A
G
 
-
E
 
-
T
 
T
L
 
F
A
 
P
V
 
V
D
 
Q
N
 
D
P
 
P
A
 
A
N
 
S
G
 
G
D
 
A
V
 
A
L
 
L
G
 
G
H
 
M
V
 
V
P
 
A
V
 
D
L
 
C
S
 
G
A
 
V
A
 
R
E
 
E
V
 
A
G
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
V
D
 
R
A
 
A
A
 
A
S
 
Y
S
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
C
Q
 
R
W
 
W
R
 
R
K
 
E
R
 
V
T
 
S
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
S
D
 
S
C
 
L
L
 
L
L
 
R
A
 
K
W
 
W
H
 
Y
D
 
N
L
 
L
M
 
M
L
 
I
E
 
Q
H
 
N
K
 
K
E
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
A
T
 
R
L
 
I
M
 
I
T
 
T
L
 
A
E
 
E
Q
 
S
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
K
E
 
E
S
 
A
Q
 
H
G
 
G
E
 
E
I
 
I
D
 
L
Y
 
Y
A
 
S
A
 
A
S
 
F
F
 
F
I
 
L
R
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
R
M
 
V
Y
 
Y
G
 
G
E
 
D
T
 
I
I
 
I
P
 
H
G
 
T
A
 
P
R
 
A
I
 
K
G
 
D
Q
 
R
H
 
R
I
 
A
V
 
L
V
 
V
T
 
L
R
 
K
Q
 
Q
P
 
P
V
 
I
G
 
G
V
 
V
C
 
A
A
 
A
A
 
V
I
 
I
T
 
T
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
S
A
 
A
M
 
M
I
 
I
T
 
T
R
|
R
K
 
K
A
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
T
I
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
 
A
S
 
E
A
 
D
T
 
T
P
 
P
F
 
F
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
A
 
A
V
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
S
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
I
 
I
P
 
P
H
 
S
G
 
G
V
 
V
F
 
Y
N
 
N
V
 
V
V
 
I
T
 
P
-
 
C
-
 
S
-
 
R
G
 
K
K
 
N
A
 
A
G
 
K
E
 
E
I
 
V
S
 
G
E
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
C
R
 
T
S
 
D
P
 
P
V
 
L
V
 
V
R
 
S
K
 
K
L
 
I
S
 
S
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
D
 
T
V
 
T
G
 
G
R
 
K
R
 
I
L
 
L
M
 
L
A
 
H
Q
 
H
C
 
A
S
 
A
E
 
N
H
 
S
I
 
V
Q
 
K
K
 
R
V
 
V
S
 
S
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
L
A
 
A
P
 
P
F
 
F
I
 
I
V
 
V
F
 
F
D
 
D
D
 
S
A
 
A
D
 
N
I
 
V
S
 
D
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
E
 
A
G
 
G
A
 
A
M
 
M
V
 
A
C
 
S
K
 
K
F
 
F
R
|
R
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
C
x
A
V
 
V
C
 
C
A
 
S
N
 
N
R
 
Q
F
 
F
L
 
L
V
 
V
Q
 
Q
S
 
R
G
 
G
V
 
I
H
 
H
D
 
D
K
 
A
F
 
F
V
 
V
A
 
K
A
 
A
L
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
M
 
M
G
 
K
K
 
K
-
 
N
L
 
L
R
 
R
I
 
V
G
 
G
D
 
N
G
 
G
F
 
F
E
 
E
P
 
E
G
 
G
V
 
T
T
 
T
Q
 
Q
S
 
G
A
 
P
L
 
L
I
 
I
N
 
N
G
 
E
D
 
K
A
 
A
V
 
V
E
 
E
K
 
K
V
 
V
I
 
E
E
 
K
H
 
Q
F
 
V
D
 
N
D
 
D
A
 
A
M
 
V
A
 
S
K
 
K
G
 
G
A
 
A
K
 
T
R
 
V
V
 
V
C
 
T
G
 
G
P
 
G
A
 
K
P
 
R
D
 
H
A
 
Q
D
 
L
R
 
G
G
 
K
N
 
N
Y
 
F
V
 
F
Q
 
E
P
 
P
V
 
T
L
 
L
L
 
L
T
 
C
D
 
N
I
 
V
N
 
T
T
 
Q
N
 
D
M
 
M
T
 
L
L
 
C
C
 
T
H
 
H
E
 
E
E
|
E
T
 
T
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
L
A
 
A
A
 
P
V
 
V
L
 
I
R
 
K
F
 
F
D
 
D
T
 
T
E
 
E
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
I
A
 
A
N
 
N
A
 
A
T
 
A
P
 
D
F
 
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
F
 
F
Y
 
Y
S
 
S
R
 
Q
D
 
D
I
 
P
H
 
A
R
 
Q
V
 
I
W
 
W
R
 
R
V
 
V
A
 
A
D
 
E
A
 
Q
L
 
L
E
 
E
A
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
V
G
 
G
I
 
V
N
 
N
E
 
E
G
 
G
L
 
L
I
 
I
S
|
S
N
 
S
P
 
V
M
 
E
A
 
C
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
E
 
Q
S
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
R
 
R
E
|
E
G
 
G
S
 
S
R
 
K
H
 
Y
G
 
G
L
 
I
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
T
 
L
E
 
E
L
 
L
K
 
K
Y
 
Y
L
 
V
C
 
C
M
 
Y
G
 
G

5x5uA Crystal structure of alpha-ketoglutarate-semialdehyde dehydrogenase (kgsadh) complexed with NAD (see paper)
41% identity, 97% coverage: 15:485/486 of query aligns to 6:476/476 of 5x5uA

query
sites
5x5uA
Q
 
Q
C
 
L
Y
 
L
V
 
I
N
 
D
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
V
N
x
D
A
|
A
S
x
A
S
 
S
G
|
G
E
 
K
T
 
T
L
 
I
A
 
D
V
 
V
D
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
P
L
 
I
G
 
G
H
 
R
V
 
V
P
 
A
V
 
H
L
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
E
 
D
V
 
L
G
 
D
A
 
R
A
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
S
 
S
A
 
G
L
 
F
R
 
E
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
K
 
K
R
 
V
T
 
P
A
 
A
Q
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
A
C
 
T
L
 
M
L
 
R
A
 
K
W
 
A
H
 
A
D
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
R
E
 
E
H
 
R
K
 
A
E
 
D
D
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
M
 
M
T
 
T
L
 
Q
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
T
E
 
E
S
 
A
Q
 
R
G
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
L
Y
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
D
F
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
D
E
 
E
A
 
G
R
 
R
R
 
R
M
 
V
Y
 
Y
G
 
G
E
 
R
T
 
I
I
 
V
P
 
P
G
 
P
A
 
R
R
 
N
I
 
L
G
 
G
Q
 
A
H
 
Q
I
 
Q
V
 
T
V
 
V
T
 
V
R
 
K
Q
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
P
C
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
F
T
 
T
P
|
P
W
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
N
M
 
Q
I
 
V
T
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
T
 
S
I
 
F
I
 
L
V
 
V
K
|
K
P
 
A
A
 
P
S
 
E
A
 
E
T
 
T
P
 
P
F
 
A
S
 
S
A
 
P
L
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
R
L
 
A
A
 
F
E
 
V
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
H
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
I
N
 
G
V
 
L
V
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
D
A
x
P
G
x
A
E
 
E
I
 
I
S
|
S
E
 
S
V
 
Y
L
 
L
T
 
I
R
 
P
S
 
H
P
 
P
V
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
K
L
 
V
S
 
T
F
 
F
T
 
T
G
|
G
S
|
S
T
 
T
D
 
P
V
|
V
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
M
 
A
A
 
S
Q
 
L
C
 
A
S
 
G
E
 
L
H
 
H
I
 
M
Q
 
K
K
 
R
V
 
A
S
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
V
I
 
I
V
 
V
F
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
S
 
A
R
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
A
A
 
A
M
 
G
V
 
G
C
 
A
K
 
K
F
 
F
R
 
R
N
 
N
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
C
|
C
V
 
I
C
 
S
A
 
P
N
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
V
 
V
Q
 
H
S
 
N
G
 
S
V
 
I
H
 
R
D
 
D
K
 
E
F
 
F
V
 
T
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
A
 
H
M
 
A
G
 
E
K
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
N
G
 
G
F
 
L
E
 
E
P
 
E
G
 
G
V
 
T
T
 
T
Q
 
L
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
A
N
 
N
G
 
P
D
x
R
A
x
R
V
 
L
E
 
T
K
 
A
V
 
M
I
 
A
E
 
S
H
 
V
F
 
I
D
 
D
D
 
N
A
 
A
M
 
R
A
 
K
K
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
S
R
 
I
V
 
E
C
 
T
G
 
G
P
 
G
A
 
E
P
 
R
D
 
I
A
 
G
D
 
S
R
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
V
 
F
Q
 
A
P
 
P
V
 
T
L
 
V
L
 
I
T
 
A
D
 
N
I
 
V
N
 
P
T
 
L
N
 
D
M
 
A
T
 
D
L
 
V
C
 
F
H
 
N
E
 
N
E
|
E
T
 
P
F
|
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
R
R
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
K
E
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
E
A
 
A
N
 
N
A
 
R
T
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
F
 
A
Y
 
F
S
 
T
R
 
R
D
 
S
I
 
F
H
 
A
R
 
N
V
 
V
W
 
H
R
 
L
V
 
L
A
 
T
D
 
Q
A
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
L
G
 
W
I
 
I
N
 
N
E
 
Q
G
 
P
L
 
A
I
 
T
S
 
P
N
 
W
P
 
P
M
 
E
A
 
M
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
E
 
D
S
 
S
G
 
G
L
 
Y
G
 
G
R
 
S
E
|
E
G
 
G
S
 
G
R
 
P
H
 
E
G
 
A
L
 
L
D
 
E
E
 
P
Y
 
Y
T
 
L
E
 
V
L
 
T
K
 
K
Y
 
S
L
 
V
C
 
T
M
 
V
G
 
M
A
 
A

5x5tA Crystal structure of alpha-ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase (kgsadh) from azospirillum brasilense (see paper)
41% identity, 97% coverage: 15:485/486 of query aligns to 6:476/476 of 5x5tA

query
sites
5x5tA
Q
 
Q
C
 
L
Y
 
L
V
 
I
N
 
D
G
 
G
Q
 
E
W
 
W
Q
 
V
N
 
D
A
 
A
S
 
A
S
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
T
L
 
I
A
 
D
V
 
V
D
 
V
N
 
N
P
 
P
A
 
A
N
 
T
G
 
G
D
 
K
V
 
P
L
 
I
G
 
G
H
 
R
V
 
V
P
 
A
V
 
H
L
 
A
S
 
G
A
 
I
A
 
A
E
 
D
V
 
L
G
 
D
A
 
R
A
 
A
V
 
L
D
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
Q
S
 
S
A
 
G
L
 
F
R
 
E
Q
 
A
W
 
W
R
 
R
K
 
K
R
 
V
T
 
P
A
 
A
Q
 
H
E
 
E
R
 
R
A
 
A
D
 
A
C
 
T
L
 
M
L
 
R
A
 
K
W
 
A
H
 
A
D
 
A
L
 
L
M
 
V
L
 
R
E
 
E
H
 
R
K
 
A
E
 
D
D
 
A
L
 
I
A
 
A
T
 
Q
L
 
L
M
 
M
T
 
T
L
 
Q
E
 
E
Q
 
Q
G
 
G
K
 
K
P
 
P
L
 
L
V
 
T
E
 
E
S
 
A
Q
 
R
G
 
V
E
 
E
I
 
V
D
 
L
Y
 
S
A
 
A
A
 
A
S
 
D
F
 
I
I
 
I
R
 
E
W
 
W
F
 
F
A
 
A
E
 
D
E
 
E
A
 
G
R
 
R
R
 
R
M
 
V
Y
 
Y
G
 
G
E
 
R
T
 
I
I
 
V
P
 
P
G
 
P
A
 
R
R
 
N
I
 
L
G
 
G
Q
 
A
H
 
Q
I
 
Q
V
 
T
V
 
V
T
 
V
R
 
K
Q
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
P
C
 
V
A
 
A
A
 
A
I
 
F
T
 
T
P
 
P
W
 
W
N
|
N
F
 
F
P
 
P
A
 
V
A
 
N
M
 
Q
I
 
V
T
 
V
R
 
R
K
 
K
A
 
L
G
 
S
A
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
T
G
 
G
C
 
C
T
 
S
I
 
F
I
 
L
V
 
V
K
|
K
P
 
A
A
 
P
S
 
E
A
 
E
T
 
T
P
 
P
F
 
A
S
 
S
A
 
P
L
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
R
L
 
A
A
 
F
E
 
V
E
 
D
A
 
A
G
 
G
I
 
V
P
 
P
H
 
A
G
 
G
V
 
V
F
 
I
N
 
G
V
 
L
V
 
V
T
 
Y
G
 
G
K
 
D
A
 
P
G
 
A
E
 
E
I
 
I
S
 
S
E
 
S
V
 
Y
L
 
L
T
 
I
R
 
P
S
 
H
P
 
P
V
 
V
V
 
I
R
 
R
K
 
K
L
 
V
S
 
T
F
 
F
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
D
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
L
 
L
M
x
A
A
 
S
Q
 
L
C
 
A
S
 
G
E
 
L
H
 
H
I
 
M
Q
 
K
K
 
R
V
 
A
S
 
T
L
 
M
E
|
E
L
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
H
A
 
A
P
 
P
F
 
V
I
 
I
V
 
V
F
 
A
D
 
E
D
 
D
A
 
A
D
 
D
I
 
V
S
 
A
R
 
L
A
 
A
V
 
V
E
 
K
G
 
A
A
 
A
M
 
G
V
 
G
C
 
A
K
 
K
F
 
F
R
 
R
N
 
N
T
 
A
G
 
G
Q
 
Q
T
 
V
C
|
C
V
 
I
C
 
S
A
 
P
N
 
T
R
 
R
F
 
F
L
 
L
V
 
V
Q
 
H
S
 
N
G
 
S
V
 
I
H
 
R
D
 
D
K
 
E
F
 
F
V
 
T
A
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
V
E
 
K
A
 
H
M
 
A
G
 
E
K
 
G
L
 
L
R
 
K
I
 
V
G
 
G
D
 
N
G
 
G
F
 
L
E
 
E
P
 
E
G
 
G
V
 
T
T
 
T
Q
 
L
S
 
G
A
 
A
L
 
L
I
 
A
N
 
N
G
 
P
D
 
R
A
 
R
V
 
L
E
 
T
K
 
A
V
 
M
I
 
A
E
 
S
H
 
V
F
 
I
D
 
D
D
 
N
A
 
A
M
 
R
A
 
K
K
 
V
G
 
G
A
 
A
K
 
S
R
 
I
V
 
E
C
 
T
G
 
G
P
 
G
A
 
E
P
 
R
D
 
I
A
 
G
D
 
S
R
 
E
G
 
G
N
 
N
Y
 
F
V
 
F
Q
 
A
P
 
P
V
 
T
L
 
V
L
 
I
T
 
A
D
 
N
I
 
V
N
 
P
T
 
L
N
 
D
M
 
A
T
 
D
L
 
V
C
 
F
H
 
N
E
 
N
E
|
E
T
 
P
F
 
F
G
 
G
P
 
P
L
 
V
A
 
A
A
 
A
V
 
I
L
 
R
R
 
G
F
 
F
D
 
D
T
 
K
E
 
L
E
 
E
E
 
E
A
 
A
I
 
I
E
 
A
L
 
E
A
 
A
N
 
N
A
 
R
T
 
L
P
 
P
F
 
F
G
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
Y
 
Y
F
 
A
Y
 
F
S
 
T
R
 
R
D
 
S
I
 
F
H
 
A
R
 
N
V
 
V
W
 
H
R
 
L
V
 
L
A
 
T
D
 
Q
A
 
R
L
 
L
E
 
E
A
 
V
G
 
G
I
 
M
I
 
L
G
 
W
I
 
I
N
 
N
E
 
Q
G
 
P
L
 
A
I
 
T
S
 
P
N
 
W
P
 
P
M
 
E
A
 
M
P
 
P
F
 
F
G
 
G
G
 
G
V
 
V
K
 
K
E
 
D
S
 
S
G
 
G
L
x
Y
G
 
G
R
 
S
E
|
E
G
 
G
S
 
G
R
 
P
H
 
E
G
 
A
L
 
L
D
 
E
E
 
P
Y
 
Y
T
 
L
E
 
V
L
 
T
K
 
K
Y
 
S
L
 
V
C
 
T
M
 
V
G
 
M
A
 
A

4pxlA Structure of zm aldh2-3 (rf2c) in complex with NAD (see paper)
40% identity, 96% coverage: 15:479/486 of query aligns to 7:474/486 of 4pxlA

query
sites
4pxlA
Q
 
K
C
 
L
Y
 
F
V
 
I
N
 
D
G
 
G
Q
 
K
W
 
F
Q
 
V
N
 
D
A
 
A
S
 
V
S
 
S
G
 
G
E
 
K
T
 
T
L
 
F
A
 
E
V
 
T
D
 
R
N
 
D
P
 
P
A
 
R
N
 
T
G
 
G
D
 
E
V
 
V
L
 
I
G
 
A
H
 
S
V
 
I
P
 
A
V
 
E
L
 
G
S
 
D
A
 
K
A
 
A
E
 
D
V
 
V
G
 
D
A
 
L
A
 
A
V
 
V
D
 
K
A
 
A
A
 
A
S
 
R
S
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
D
Q
 
N
-
 
G
-
 
P
W
 
W
R
 
P
K
 
R
R
 
M
T
 
T
A
 
G
Q
 
Y
E
 
E
R
 
R
A
 
G
D
 
R
C
 
I
L
 
L
L
 
H
A
 
R
W
 
F
H
 
A
D
 
D
L
 
L
M
 
I
L
 
D
E
 
E
H
 
H
K
 
V
E
 
E
D
 
E
L
 
L
A
 
A
T
 
A
L
 
L
M
 
D
T
 
T
L
 
V
E
 
D
Q
 
A
G
 
G
K
 
K
P
 
L
L
 
F
-
 
A
V
 
V
E
 
G
S
 
K
Q
 
A
G
 
R
E
 
D
I
 
I
D
 
P
Y
 
G
A
 
A
A
 
A
S
 
H
F
 
L
I
 
L
R
 
R
W
 
Y
F
 
Y
A
 
A
E
 
G
E
 
A
A
 
A
R
 
D
R
 
K
M
 
V
Y
 
H
G
 
G
E
 
A
T
 
T
I
 
L
P
 
K
G
 
M
A
 
A
R
 
Q
I
 
-
G
 
R
Q
 
M
H
 
H
I
 
G
V
 
Y
V
 
T
T
 
L
R
 
K
Q
 
E
P
 
P
V
 
V
G
 
G
V
 
V
C
 
V
A
 
G
A
 
H
I
|
I
T
x
V
P
|
P
W
|
W
N
|
N
F
 
Y
P
 
P
A
 
T
A
 
T
M
 
M
I
 
F
T
 
F
R
 
F
K
 
K
A
 
V
G
 
G
A
 
P
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
G
 
G
C
 
C
T
 
A
I
 
V
I
 
V
V
 
V
K
|
K
P
 
P
A
 
A
S
x
E
A
 
Q
T
 
T
P
 
P
F
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
L
A
 
F
L
 
Y
A
 
A
V
 
H
L
 
L
A
 
A
E
 
R
E
 
E
A