SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_090274005.1 NCBI__GCF_900105005.1:WP_090274005.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

2bkxA Structure and kinetics of a monomeric glucosamine-6-phosphate deaminase: missing link of the nagb superfamily (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:239/240 of query aligns to 1:240/242 of 2bkxA

query
sites
2bkxA
M
 
M
K
 
K
I
 
V
I
 
M
T
 
E
V
 
C
N
 
Q
N
 
T
Y
 
Y
N
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
Q
T
 
I
A
 
A
G
 
A
Q
 
R
I
 
I
I
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
T
V
 
I
S
 
K
S
 
E
N
 
K
P
 
P
R
 
D
C
 
A
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
|
A
T
|
T
G
|
G
S
x
G
T
|
T
P
 
P
L
 
E
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
Y
 
Q
L
 
L
V
 
I
K
 
R
R
 
L
Y
 
H
Q
 
Q
A
 
T
G
 
E
D
 
N
I
 
L
S
 
S
F
 
F
K
 
Q
D
 
N
V
 
I
Q
 
T
T
 
T
F
 
V
N
 
N
L
 
L
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
S
R
 
S
T
 
D
H
 
D
P
 
P
E
 
N
S
 
S
Y
 
Y
F
 
H
R
 
F
F
 
Y
M
 
M
H
 
N
D
 
D
N
 
R
L
 
F
F
 
F
S
 
Q
H
 
H
V
 
I
N
 
D
I
 
S
Q
 
K
M
 
P
Q
 
S
N
 
R
R
 
H
H
 
F
I
 
I
P
 
P
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
D
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
R
A
 
R
Y
 
Y
N
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
V
R
 
D
Q
 
S
-
 
L
A
 
G
T
 
D
V
 
T
D
 
D
L
 
I
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
|
G
I
 
I
G
 
G
S
 
R
N
|
N
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
|
G
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
P
 
S
F
 
F
D
 
K
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
H
L
 
V
T
 
V
Q
 
T
L
 
L
A
 
N
E
 
E
K
 
Q
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
D
 
A
N
 
N
Q
 
A
R
|
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
P
S
 
S
L
 
I
E
 
D
E
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
K
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
Q
N
 
T
I
 
I
M
 
L
Q
 
S
A
 
S
K
 
K
S
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
L
A
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
K
G
 
S
K
|
K
A
 
A
E
 
E
C
 
A
I
 
V
S
 
R
Q
 
K
M
 
L
V
 
L
N
 
E
G
 
G
P
 
N
V
 
I
T
 
S
E
 
E
A
 
D
V
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
H
Q
 
L
H
 
H
P
 
S
N
 
D
A
 
V
T
 
T
I
 
V
I
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L

2bkvB Structure and kinetics of a monomeric glucosamine-6-phosphate deaminase: missing link of the nagb superfamily (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:239/240 of query aligns to 1:240/242 of 2bkvB

query
sites
2bkvB
M
 
M
K
 
K
I
 
V
I
 
M
T
 
E
V
 
C
N
 
Q
N
 
T
Y
 
Y
N
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
Q
T
 
I
A
 
A
G
 
A
Q
 
R
I
 
I
I
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
T
V
 
I
S
 
K
S
 
E
N
 
K
P
 
P
R
 
D
C
 
A
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
|
G
S
x
G
T
|
T
P
 
P
L
 
E
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
Y
 
Q
L
 
L
V
 
I
K
 
R
R
 
L
Y
 
H
Q
 
Q
A
 
T
G
 
E
D
 
N
I
 
L
S
 
S
F
 
F
K
 
Q
D
 
N
V
 
I
Q
 
T
T
 
T
F
 
V
N
 
N
L
 
L
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
S
R
 
S
T
 
D
H
 
D
P
 
P
E
 
N
S
 
S
Y
 
Y
F
 
H
R
 
F
F
 
Y
M
 
M
H
 
N
D
 
D
N
 
R
L
 
F
F
 
F
S
 
Q
H
 
H
V
 
I
N
 
D
I
 
S
Q
 
K
M
 
P
Q
 
S
N
 
R
R
 
H
H
 
F
I
 
I
P
 
P
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
D
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
R
A
 
R
Y
 
Y
N
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
V
R
 
D
Q
 
S
-
 
L
A
 
G
T
 
D
V
 
T
D
 
D
L
 
I
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
R
N
|
N
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
 
G
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
P
 
S
F
 
F
D
 
K
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
H
L
 
V
T
 
V
Q
 
T
L
 
L
A
 
N
E
 
E
K
 
Q
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
D
 
A
N
 
N
Q
 
A
R
 
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
P
S
 
S
L
 
I
E
 
D
E
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
K
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
Q
N
 
T
I
 
I
M
 
L
Q
 
S
A
 
S
K
 
K
S
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
L
A
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
K
G
 
S
K
|
K
A
 
A
E
 
E
C
 
A
I
 
V
S
 
R
Q
 
K
M
 
L
V
 
L
N
 
E
G
 
G
P
 
N
V
 
I
T
 
S
E
 
E
A
 
D
V
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
H
Q
 
L
H
 
H
P
 
S
N
 
D
A
 
V
T
 
T
I
 
V
I
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L

O35000 Glucosamine-6-phosphate deaminase 1; GlcN6P deaminase 1; GNPDA 1; Glucosamine-6-phosphate isomerase 1; EC 3.5.99.6 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
45% identity, 100% coverage: 1:239/240 of query aligns to 1:240/242 of O35000

query
sites
O35000
M
 
M
K
 
K
I
 
V
I
 
M
T
 
E
V
 
C
N
 
Q
N
 
T
Y
 
Y
N
 
E
E
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
Q
T
 
I
A
 
A
G
 
A
Q
 
R
I
 
I
I
 
T
A
 
A
D
 
D
L
 
T
V
 
I
S
 
K
S
 
E
N
 
K
P
 
P
R
 
D
C
 
A
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
|
T
G
 
G
S
x
G
T
|
T
P
 
P
L
 
E
G
 
G
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
R
Y
 
Q
L
 
L
V
 
I
K
 
R
R
 
L
Y
 
H
Q
 
Q
A
 
T
G
 
E
D
 
N
I
 
L
S
 
S
F
 
F
K
 
Q
D
 
N
V
 
I
Q
 
T
T
 
T
F
 
V
N
 
N
L
 
L
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
A
G
 
G
L
 
L
P
 
S
R
 
S
T
 
D
H
 
D
P
 
P
E
 
N
S
 
S
Y
 
Y
F
 
H
R
 
F
F
 
Y
M
 
M
H
 
N
D
 
D
N
 
R
L
 
F
F
 
F
S
 
Q
H
 
H
V
 
I
N
 
D
I
 
S
Q
 
K
M
 
P
Q
 
S
N
 
R
R
 
H
H
 
F
I
 
I
P
 
P
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
D
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
R
A
 
R
Y
 
Y
N
 
E
A
 
Q
L
 
L
L
 
V
R
 
D
Q
 
S
-
 
L
A
 
G
T
 
D
V
 
T
D
 
D
L
 
I
Q
 
Q
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
R
N
 
N
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
|
G
F
 
F
C
 
N
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
P
 
S
F
 
F
D
 
K
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
H
L
 
V
T
 
V
Q
 
T
L
 
L
A
 
N
E
 
E
K
 
Q
T
 
T
R
 
R
Q
 
Q
D
 
A
N
 
N
Q
 
A
R
|
R
F
 
Y
F
 
F
N
 
P
S
 
S
L
 
I
E
 
D
E
 
S
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
K
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
M
G
 
G
I
 
I
K
 
Q
N
 
T
I
 
I
M
 
L
Q
 
S
A
 
S
K
 
K
S
 
R
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
L
A
 
I
S
 
S
G
 
G
K
 
K
G
 
S
K
|
K
A
 
A
E
 
E
C
 
A
I
 
V
S
 
R
Q
 
K
M
 
L
V
 
L
N
 
E
G
 
G
P
 
N
V
 
I
T
 
S
E
 
E
A
 
D
V
 
F
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
H
Q
 
L
H
 
H
P
 
S
N
 
D
A
 
V
T
 
T
I
 
V
I
 
L
V
 
I
D
 
D
E
 
R
E
 
E
A
 
A
A
 
A
S
 
S
L
 
L

1ne7A Human glucosamine-6-phosphate deaminase isomerase at 1.75 a resolution complexed with n-acetyl-glucosamine-6-phosphate and 2-deoxy-2-amino- glucitol-6-phosphate (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:236/240 of query aligns to 1:243/281 of 1ne7A

query
sites
1ne7A
M
|
M
K
|
K
I
 
L
I
 
I
T
 
I
V
 
L
N
 
E
N
 
H
Y
 
Y
N
 
S
E
 
Q
L
 
A
S
 
S
S
 
E
T
 
W
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
I
 
Y
I
 
I
A
 
R
D
 
N
-
 
R
L
 
I
V
 
I
S
 
Q
S
x
F
N
 
N
P
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
x
K
R
 
Y
C
 
F
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
x
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
|
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
C
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
K
L
 
L
V
 
I
K
 
E
R
 
Y
Y
 
Y
Q
 
K
A
 
N
G
 
G
D
 
D
I
 
L
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
Y
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
F
 
F
N
 
N
L
x
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
T
 
D
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
F
 
H
R
 
S
F
 
F
M
 
M
H
 
W
D
 
N
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
K
H
 
H
V
 
I
N
 
D
I
 
I
Q
 
H
M
 
P
Q
 
E
N
 
N
R
 
T
H
 
H
I
 
I
P
 
L
C
 
D
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
N
 
E
A
 
E
L
 
K
L
 
I
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
-
 
G
T
 
G
V
 
I
D
 
E
L
 
L
Q
 
F
L
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
P
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
x
A
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
T
x
S
P
x
S
F
 
L
D
 
V
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
x
R
L
x
V
T
x
K
Q
x
T
L
 
L
A
 
A
E
 
M
K
 
D
T
 
T
R
 
I
Q
 
L
D
 
A
N
 
N
Q
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
N
 
D
-
 
G
S
 
E
L
 
L
E
 
T
E
 
K
V
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
M
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
V
K
 
G
N
 
T
I
 
V
M
 
M
Q
 
D
A
 
A
K
 
R
S
 
E
I
 
V
L
 
M
L
 
I
I
 
L
A
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
A
G
 
H
K
|
K
A
 
A
E
 
F
C
 
A
I
 
L
S
 
Y
Q
 
K
M
 
A
V
 
I
N
 
E
G
 
E
P
 
G
V
 
V
T
 
N
E
 
H
A
 
M
V
 
W
P
 
T
A
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
N
 
R
A
 
T
T
 
V
I
 
F
I
 
V
V
 
C
D
 
D
E
 
E
E
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

P46926 Glucosamine-6-phosphate deaminase 1; GlcN6P deaminase 1; Glucosamine-6-phosphate isomerase 1; Protein oscillin; EC 3.5.99.6 from Homo sapiens (Human) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:236/240 of query aligns to 1:243/289 of P46926

query
sites
P46926
M
 
M
K
 
K
I
 
L
I
 
I
T
 
I
V
 
L
N
 
E
N
 
H
Y
 
Y
N
 
S
E
 
Q
L
 
A
S
 
S
S
 
E
T
 
W
A
 
A
G
 
A
Q
 
K
I
 
Y
I
 
I
A
 
R
D
 
N
-
 
R
L
 
I
V
 
I
S
 
Q
S
 
F
N
 
N
P
 
P
-
 
G
-
 
P
-
 
E
-
 
K
R
 
Y
C
 
F
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
T
P
 
P
L
 
L
G
 
G
T
 
C
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
K
L
 
L
V
 
I
K
 
E
R
 
Y
Y
 
Y
Q
 
K
A
 
N
G
 
G
D
 
D
I
 
L
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
Y
V
 
V
Q
 
K
T
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
D
 
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
R
T
 
D
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
F
 
H
R
 
S
F
 
F
M
 
M
H
 
W
D
 
N
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
K
H
 
H
V
 
I
N
 
D
I
 
I
Q
 
H
M
 
P
Q
 
E
N
 
N
R
 
T
H
 
H
I
 
I
P
 
L
C
 
D
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
D
A
 
A
Y
 
F
N
 
E
A
 
E
L
 
K
L
 
I
R
 
K
Q
 
A
A
 
A
-
 
G
T
 
G
V
 
I
D
 
E
L
 
L
Q
 
F
L
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
P
N
 
D
G
 
G
H
 
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
C
 
N
E
 
E
P
 
P
G
 
G
T
 
S
P
 
S
F
 
L
D
 
V
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
R
L
 
V
T
 
K
Q
 
T
L
 
L
A
 
A
E
 
M
K
 
D
T
 
T
R
 
I
Q
 
L
D
 
A
N
 
N
Q
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
N
 
D
-
 
G
S
 
E
L
 
L
E
 
T
E
 
K
V
 
V
P
 
P
T
 
T
T
 
M
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
V
K
 
G
N
 
T
I
 
V
M
 
M
Q
 
D
A
 
A
K
 
R
S
 
E
I
 
V
L
 
M
L
 
I
I
 
L
A
 
I
S
 
T
G
 
G
K
 
A
G
 
H
K
 
K
A
 
A
E
 
F
C
 
A
I
 
L
S
 
Y
Q
 
K
M
 
A
V
 
I
N
 
E
G
 
E
P
 
G
V
 
V
T
 
N
E
 
H
A
 
M
V
 
W
P
 
T
A
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
F
Q
 
Q
Q
 
Q
H
 
H
P
 
P
N
 
R
A
 
T
T
 
V
I
 
F
I
 
V
V
 
C
D
 
D
E
 
E
E
 
D
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2ri1A Crystal structure of glucosamine 6-phosphate deaminase (nagb) with glcn6p from s. Mutans (see paper)
45% identity, 99% coverage: 1:238/240 of query aligns to 3:233/235 of 2ri1A

query
sites
2ri1A
M
 
M
K
 
K
I
 
T
I
 
I
T
 
K
V
 
V
N
 
K
N
 
N
Y
 
K
N
 
T
E
 
E
L
 
G
S
 
S
S
 
K
T
 
V
A
 
A
G
 
F
Q
 
R
I
 
M
I
 
L
A
 
E
D
 
E
L
 
E
V
 
I
S
 
T
S
 
F
N
 
G
P
 
A
R
 
K
C
 
-
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
A
T
 
T
G
 
G
S
|
S
T
|
T
P
 
P
L
 
L
G
 
E
T
 
L
Y
 
Y
Q
 
-
Y
 
-
L
 
-
V
 
-
K
 
K
R
 
E
Y
 
I
Q
 
R
A
 
E
G
 
S
D
 
H
I
 
L
S
 
D
F
 
F
K
 
S
D
 
D
V
 
M
Q
 
V
T
 
S
F
 
I
N
 
N
L
 
L
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
S
R
 
A
T
 
D
H
 
D
P
 
K
E
 
Q
S
 
S
Y
 
Y
F
 
A
R
 
Y
F
 
F
M
 
M
H
 
K
D
 
Q
N
 
N
L
 
L
F
 
F
S
 
A
H
 
A
V
 
K
N
 
-
I
 
-
Q
 
P
M
 
F
Q
 
K
N
 
K
R
 
S
H
 
Y
I
 
L
P
 
P
C
 
N
A
 
G
E
 
L
G
 
A
G
 
A
D
 
D
L
 
L
Q
 
A
S
 
K
Q
 
E
C
 
T
D
 
E
A
 
Y
Y
 
Y
N
 
D
A
 
Q
L
 
I
L
 
L
R
 
A
Q
 
Q
A
 
Y
T
 
P
V
 
I
D
 
D
L
 
L
Q
 
Q
L
 
I
L
 
L
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
R
N
|
N
G
 
A
H
|
H
I
 
I
G
 
G
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
T
 
T
P
 
A
F
 
F
D
 
S
Q
 
S
E
 
Q
T
 
T
F
 
H
L
 
L
T
 
V
Q
 
D
L
 
L
A
 
T
E
 
P
K
 
S
T
 
T
R
 
I
Q
 
A
D
 
A
N
 
N
Q
 
S
R
 
R
F
 
F
F
 
F
N
 
E
S
 
K
L
 
A
E
 
E
E
 
D
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
Q
A
 
A
I
 
I
T
 
S
M
 
M
G
 
G
I
 
L
K
 
A
N
 
S
I
 
I
M
 
M
Q
 
S
A
 
A
K
 
K
S
 
M
I
 
I
L
 
L
L
 
L
I
 
M
A
 
A
S
 
F
G
 
G
K
 
E
G
 
E
K
|
K
A
 
A
E
 
E
C
 
A
I
 
V
S
 
A
Q
 
A
M
 
M
V
 
V
N
 
K
G
 
G
P
 
P
V
 
V
T
 
T
E
 
E
A
 
E
V
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
S
A
 
I
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
T
H
 
H
P
 
P
N
 
K
A
 
V
T
 
I
I
 
L
I
 
I
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
K
A
 
A
A
 
G
S
 
A

5hj5B Crystal structure of tertiary complex of glucosamine-6-phosphate deaminase from vibrio cholerae with beta-d-glucose-6-phosphate and fructose-6-phosphate
40% identity, 85% coverage: 31:234/240 of query aligns to 36:241/267 of 5hj5B

query
sites
5hj5B
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
P
T
|
T
G
|
G
S
x
G
T
|
T
P
 
P
L
 
L
G
 
A
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
A
L
 
L
V
 
I
K
 
E
R
 
M
Y
 
H
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
E
I
 
V
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
H
V
 
V
Q
 
V
T
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
A
R
 
A
T
 
D
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
F
 
R
R
 
S
F
 
F
M
 
M
H
 
Y
D
 
N
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
N
H
 
H
V
 
I
N
 
D
I
 
I
Q
 
Q
M
 
E
Q
 
E
N
 
N
R
 
I
H
 
N
I
 
L
P
 
L
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
T
G
 
D
D
 
D
L
 
H
Q
 
E
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
K
A
 
R
Y
 
Y
N
 
E
A
 
D
L
 
K
L
 
I
R
 
K
Q
 
S
-
 
Y
A
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
N
L
 
L
Q
 
F
L
 
M
L
 
G
G
|
G
I
x
V
G
 
G
S
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
x
A
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
T
 
S
P
 
S
F
 
L
D
 
S
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
R
L
 
I
T
 
K
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
E
K
 
D
T
 
T
R
 
R
Q
 
I
D
 
A
N
 
N
Q
 
S
R
|
R
F
 
F
F
 
F
N
 
D
-
 
G
S
 
D
L
 
I
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
Y
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
I
G
 
G
I
 
V
K
 
G
N
 
T
I
 
L
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
K
 
Q
S
 
E
I
 
I
L
 
M
L
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
T
G
 
G
K
 
H
G
 
N
K
|
K
A
 
A
E
 
L
C
 
A
I
 
L
S
 
Q
Q
 
A
M
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
G
P
 
S
V
 
V
T
 
N
E
 
H
A
 
L
V
 
W
P
 
T
A
 
V
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
N
 
K
A
 
A
T
 
V
I
 
I
I
 
V
V
 
C
D
 
D
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2wu1A Glucosamine-6-phosphate deaminase complexed with the allosteric activator n-acetyl-glucoamine-6-phosphate both in the active and allosteric sites.
36% identity, 98% coverage: 1:234/240 of query aligns to 1:241/266 of 2wu1A

query
sites
2wu1A
M
 
M
K
 
R
I
 
L
I
 
I
T
 
P
V
 
L
N
 
T
N
 
T
Y
 
A
N
 
E
E
 
Q
L
 
V
S
 
G
S
 
K
T
 
W
A
 
A
G
 
A
Q
 
R
I
 
H
I
 
I
A
 
V
D
 
N
L
 
R
V
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
P
S
 
T
S
 
A
N
 
D
P
 
R
R
 
P
C
 
F
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
G
T
|
T
P
 
P
L
 
M
G
 
T
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
E
R
 
M
Y
 
H
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
V
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
H
V
 
V
Q
 
V
T
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
R
 
S
F
 
F
M
 
M
H
 
H
D
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
H
 
H
V
 
V
N
 
D
I
 
I
Q
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
R
 
I
H
 
N
I
 
L
P
 
L
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
P
D
 
D
L
 
I
Q
 
D
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
R
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
E
A
 
E
L
 
K
L
 
I
R
 
R
Q
 
S
-
 
Y
A
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
H
L
 
L
Q
 
F
L
 
M
L
 
G
G
 
G
I
x
V
G
|
G
S
x
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
T
 
S
P
 
S
F
 
L
D
 
A
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
R
L
 
I
T
 
K
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
H
K
 
D
T
 
T
R
 
R
Q
 
V
D
x
A
N
|
N
Q
 
S
R
|
R
F
 
F
F
 
F
-
 
D
N
 
N
S
 
D
L
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
Y
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
V
K
 
G
N
 
T
I
 
L
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
K
 
E
S
 
E
I
 
V
L
 
M
L
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
L
G
 
G
K
 
S
G
 
Q
K
|
K
A
 
A
E
 
L
C
 
A
I
 
L
S
 
Q
Q
 
A
M
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
G
P
 
C
V
 
V
T
 
N
E
 
H
A
 
M
V
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
C
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
N
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
M
I
 
V
V
 
C
D
 
D
E
 
E

1horA Structure and catalytic mechanism of glucosamine 6-phosphate deaminase from escherichia coli at 2.1 angstroms resolution (see paper)
36% identity, 98% coverage: 1:234/240 of query aligns to 1:241/266 of 1horA

query
sites
1horA
M
 
M
K
 
R
I
 
L
I
 
I
T
 
P
V
 
L
N
 
T
N
 
T
Y
 
A
N
 
E
E
 
Q
L
 
V
S
 
G
S
 
K
T
 
W
A
 
A
G
 
A
Q
 
R
I
 
H
I
 
I
A
 
V
D
 
N
L
 
R
V
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
P
S
 
T
S
 
A
N
 
D
P
 
R
R
 
P
C
 
F
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
x
P
T
|
T
G
|
G
S
x
G
T
|
T
P
 
P
L
 
M
G
 
T
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
E
R
 
M
Y
 
H
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
V
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
H
V
 
V
Q
 
V
T
 
T
F
 
F
N
 
N
L
x
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
R
 
S
F
 
F
M
 
M
H
 
H
D
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
H
 
H
V
 
V
N
 
D
I
 
I
Q
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
R
 
I
H
 
N
I
 
L
P
 
L
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
P
D
 
D
L
 
I
Q
 
D
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
R
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
E
A
 
E
L
 
K
L
 
I
R
 
R
Q
 
S
-
 
Y
A
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
H
L
 
L
Q
 
F
L
 
M
L
 
G
G
|
G
I
x
V
G
 
G
S
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
x
A
F
|
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
T
 
S
P
 
S
F
 
L
D
 
A
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
R
L
 
I
T
 
K
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
H
K
 
D
T
 
T
R
 
R
Q
 
V
D
 
A
N
 
N
Q
 
S
R
 
R
F
 
F
F
 
F
-
 
D
N
 
N
S
 
D
L
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
Y
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
V
K
 
G
N
 
T
I
 
L
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
K
 
E
S
 
E
I
 
V
L
 
M
L
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
L
G
 
G
K
 
S
G
 
Q
K
|
K
A
 
A
E
 
L
C
 
A
I
 
L
S
 
Q
Q
 
A
M
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
G
P
 
C
V
 
V
T
 
N
E
 
H
A
 
M
V
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
C
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
N
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
M
I
 
V
V
 
C
D
 
D
E
 
E

1fqoA Glucosamine 6-phosphate deaminase complexed with the substrate of the reverse reaction fructose 6-phosphate (open form) (see paper)
36% identity, 98% coverage: 1:234/240 of query aligns to 1:241/266 of 1fqoA

query
sites
1fqoA
M
 
M
K
 
R
I
 
L
I
 
I
T
 
P
V
 
L
N
 
T
N
 
T
Y
 
A
N
 
E
E
 
Q
L
 
V
S
 
G
S
 
K
T
 
W
A
 
A
G
 
A
Q
 
R
I
 
H
I
 
I
A
 
V
D
 
N
L
 
R
V
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
P
S
 
T
S
 
A
N
 
D
P
 
R
R
 
P
C
 
F
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
P
T
|
T
G
|
G
S
x
G
T
|
T
P
 
P
L
 
M
G
 
T
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
E
R
 
M
Y
 
H
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
V
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
H
V
 
V
Q
 
V
T
 
T
F
 
F
N
 
N
L
x
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
R
 
S
F
 
F
M
 
M
H
 
H
D
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
H
 
H
V
 
V
N
 
D
I
 
I
Q
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
R
 
I
H
 
N
I
 
L
P
 
L
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
P
D
 
D
L
 
I
Q
 
D
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
R
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
E
A
 
E
L
 
K
L
 
I
R
 
R
Q
 
S
-
 
Y
A
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
H
L
 
L
Q
 
F
L
 
M
L
 
G
G
|
G
I
x
V
G
 
G
S
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
x
A
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
T
x
S
P
x
S
F
 
L
D
 
A
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
x
R
L
x
I
T
x
K
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
H
K
 
D
T
 
T
R
 
R
Q
 
V
D
 
A
N
 
N
Q
 
S
R
 
R
F
 
F
F
 
F
-
 
D
N
 
N
S
 
D
L
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
Y
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
V
K
 
G
N
 
T
I
 
L
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
K
 
E
S
 
E
I
 
V
L
 
M
L
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
L
G
 
G
K
 
S
G
 
Q
K
|
K
A
 
A
E
 
L
C
 
A
I
 
L
S
 
Q
Q
 
A
M
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
G
P
 
C
V
 
V
T
 
N
E
 
H
A
 
M
V
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
C
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
N
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
M
I
 
V
V
 
C
D
 
D
E
 
E

1deaA Structure and catalytic mechanism of glucosamine 6-phosphate deaminase from escherichia coli at 2.1 angstroms resolution (see paper)
36% identity, 98% coverage: 1:234/240 of query aligns to 1:241/266 of 1deaA

query
sites
1deaA
M
 
M
K
 
R
I
 
L
I
 
I
T
 
P
V
 
L
N
 
T
N
 
T
Y
 
A
N
 
E
E
 
Q
L
 
V
S
 
G
S
 
K
T
 
W
A
 
A
G
 
A
Q
 
R
I
 
H
I
 
I
A
 
V
D
 
N
L
 
R
V
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
P
S
 
T
S
 
A
N
 
D
P
 
R
R
 
P
C
 
F
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
P
T
 
T
G
|
G
S
x
G
T
|
T
P
 
P
L
 
M
G
 
T
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
E
R
 
M
Y
 
H
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
V
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
H
V
 
V
Q
 
V
T
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
R
 
S
F
 
F
M
 
M
H
 
H
D
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
H
 
H
V
 
V
N
 
D
I
 
I
Q
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
R
 
I
H
 
N
I
 
L
P
 
L
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
P
D
 
D
L
 
I
Q
 
D
S
 
A
Q
 
E
C
 
C
D
 
R
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
E
A
 
E
L
 
K
L
 
I
R
 
R
Q
 
S
-
 
Y
A
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
H
L
 
L
Q
 
F
L
 
M
L
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
S
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
T
 
S
P
 
S
F
 
L
D
 
A
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
R
L
 
I
T
 
K
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
H
K
 
D
T
 
T
R
 
R
Q
 
V
D
 
A
N
 
N
Q
 
S
R
|
R
F
 
F
F
 
F
-
 
D
N
 
N
S
 
D
L
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
Y
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
V
K
 
G
N
 
T
I
 
L
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
K
 
E
S
 
E
I
 
V
L
 
M
L
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
L
G
 
G
K
 
S
G
 
Q
K
 
K
A
 
A
E
 
L
C
 
A
I
 
L
S
 
Q
Q
 
A
M
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
G
P
 
C
V
 
V
T
 
N
E
 
H
A
 
M
V
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
C
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
N
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
M
I
 
V
V
 
C
D
 
D
E
 
E

P0A759 Glucosamine-6-phosphate deaminase; GlcN6P deaminase; GNPDA; Glucosamine-6-phosphate isomerase; EC 3.5.99.6 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
36% identity, 98% coverage: 1:234/240 of query aligns to 1:241/266 of P0A759

query
sites
P0A759
M
 
M
K
 
R
I
 
L
I
 
I
T
 
P
V
 
L
N
 
T
N
 
T
Y
 
A
N
 
E
E
 
Q
L
 
V
S
 
G
S
 
K
T
 
W
A
 
A
G
 
A
Q
 
R
I
 
H
I
 
I
A
 
V
D
 
N
L
 
R
V
 
I
-
 
N
-
 
A
-
 
F
-
 
K
-
 
P
S
 
T
S
 
A
N
 
D
P
 
R
R
 
P
C
 
F
T
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
G
T
 
T
P
 
P
L
 
M
G
 
T
T
 
T
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
A
L
 
L
V
 
V
K
 
E
R
 
M
Y
 
H
Q
 
K
A
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
V
S
 
S
F
 
F
K
 
K
D
 
H
V
 
V
Q
 
V
T
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
V
G
 
G
L
 
L
P
 
P
R
 
K
T
 
E
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
F
 
Y
R
 
S
F
 
F
M
 
M
H
 
H
D
 
R
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
D
H
 
H
V
 
V
N
 
D
I
 
I
Q
 
P
M
 
A
Q
 
E
N
 
N
R
 
I
H
 
N
I
 
L
P
 
L
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
P
D
 
D
L
 
I
Q
 
D
S
 
A
Q
 
E
C
|
C
D
 
R
A
 
Q
Y
 
Y
N
 
E
A
 
E
L
 
K
L
 
I
R
 
R
Q
 
S
-
 
Y
A
 
G
T
 
K
V
 
I
D
 
H
L
 
L
Q
 
F
L
 
M
L
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
S
 
N
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
A
T
 
S
P
 
S
F
 
L
D
 
A
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
R
L
 
I
T
 
K
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
H
K
 
D
T
 
T
R
 
R
Q
 
V
D
 
A
N
 
N
Q
 
S
R
 
R
F
 
F
F
 
F
-
 
D
N
 
N
S
 
D
L
 
V
E
 
N
E
 
Q
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
Y
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
V
K
 
G
N
 
T
I
 
L
M
 
L
Q
 
D
A
 
A
K
 
E
S
 
E
I
 
V
L
 
M
L
 
I
I
 
L
A
 
V
S
 
L
G
 
G
K
 
S
G
 
Q
K
 
K
A
 
A
E
 
L
C
 
A
I
 
L
S
 
Q
Q
 
A
M
 
A
V
 
V
N
 
E
G
 
G
P
x
C
V
 
V
T
 
N
E
 
H
A
 
M
V
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
C
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
L
H
 
H
P
 
P
N
 
K
A
 
A
T
 
I
I
 
M
I
 
V
V
x
C
D
 
D
E
 
E

3hn6A Crystal structure of glucosamine-6-phosphate deaminase from borrelia burgdorferi
36% identity, 98% coverage: 1:236/240 of query aligns to 4:246/271 of 3hn6A

query
sites
3hn6A
M
 
M
K
 
R
I
 
L
I
 
I
T
 
I
V
 
R
N
 
P
N
 
T
Y
 
Y
N
 
E
E
 
D
L
 
I
S
 
S
S
 
K
T
 
W
A
 
A
G
 
A
Q
 
N
I
 
H
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
L
 
K
V
 
I
S
 
N
S
 
E
-
 
F
-
 
S
-
 
P
-
 
T
-
 
K
-
 
E
N
 
N
P
 
P
R
 
-
C
 
F
T
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
A
 
P
T
 
T
G
 
G
S
 
S
T
 
S
P
 
P
L
 
I
G
 
G
T
 
M
Y
 
Y
Q
 
K
Y
 
N
L
 
L
V
 
I
K
 
E
R
 
L
Y
 
N
Q
 
K
A
 
N
G
 
K
D
 
K
I
 
I
S
 
S
F
 
F
K
 
Q
D
 
N
V
 
V
Q
 
I
T
 
T
F
 
F
N
 
N
L
 
M
D
|
D
E
 
E
Y
 
Y
C
 
I
G
 
G
L
 
I
P
 
E
R
 
E
T
 
N
H
 
H
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
Y
F
 
H
R
 
S
F
 
F
M
 
M
H
 
W
D
 
N
N
 
N
L
 
F
F
 
F
S
 
S
H
 
H
V
 
I
N
 
D
I
 
I
Q
 
K
M
 
K
Q
 
E
N
 
N
R
 
I
H
 
N
I
 
I
P
 
L
C
 
N
A
 
G
E
 
N
G
 
A
G
 
S
D
 
N
L
 
L
Q
 
K
S
 
K
Q
 
E
C
 
C
D
 
E
A
 
E
Y
 
Y
N
 
E
A
 
K
L
 
K
L
 
I
R
 
K
Q
 
S
-
 
F
A
 
G
T
 
G
V
 
I
D
 
M
L
 
L
Q
 
F
L
 
V
L
 
G
G
 
G
I
 
I
G
 
G
S
 
P
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
I
G
 
A
F
 
F
C
 
N
E
|
E
P
 
P
G
 
G
T
 
S
P
 
S
F
 
L
D
 
T
Q
 
S
E
 
R
T
 
T
F
 
R
L
 
I
T
 
K
Q
 
T
L
 
L
A
 
T
E
 
Q
K
 
D
T
 
T
R
 
I
Q
 
I
D
 
A
N
 
N
Q
 
S
R
 
R
F
 
F
F
 
F
N
 
E
-
 
G
S
 
D
L
 
V
E
 
N
E
 
K
V
 
V
P
 
P
T
 
K
T
 
N
A
 
A
I
 
L
T
 
T
M
 
V
G
 
G
I
 
I
K
 
G
N
 
T
I
 
I
M
 
M
Q
 
D
A
 
S
K
 
Q
S
 
E
I
 
V
L
 
L
L
 
I
I
 
I
A
 
V
S
 
N
G
 
G
K
 
H
G
 
N
K
 
K
A
 
A
E
x
R
C
 
A
I
 
L
S
x
K
Q
x
H
M
 
A
V
 
I
N
 
E
G
 
K
P
 
G
V
 
V
T
 
N
E
 
H
A
 
M
V
 
W
P
 
T
A
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
Q
 
L
H
 
H
P
 
K
N
 
N
A
 
A
T
 
I
I
 
I
I
 
V
V
 
S
D
 
D
E
 
K
E
 
N
A
 
A

P56201 GDH/6PGL endoplasmic bifunctional protein; EC 1.1.1.47; EC 1.1.1.363; EC 3.1.1.31 from Oryctolagus cuniculus (Rabbit) (see paper)
28% identity, 72% coverage: 32:203/240 of query aligns to 593:759/797 of P56201

query
sites
P56201
L
 
L
G
 
A
L
 
L
A
 
S
T
 
G
G
 
G
S
 
S
T
 
S
P
 
P
L
 
I
G
 
A
T
 
L
Y
 
F
Q
 
Q
Y
 
Q
L
 
L
V
 
A
K
 
-
R
 
-
Y
 
-
Q
 
-
A
 
S
G
 
G
D
 
H
I
 
Y
S
 
G
F
 
F
K
 
P
D
 
W
V
 
A
Q
 
H
T
 
T
-
 
H
-
 
L
F
 
W
N
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
E
Y
 
R
C
 
C
G
 
-
L
 
V
P
 
P
R
 
L
T
 
S
H
 
D
P
 
P
E
 
E
S
 
S
Y
 
N
F
 
F
R
 
Q
F
 
G
M
 
L
H
 
Q
D
 
A
N
 
H
L
 
L
F
 
L
S
 
Q
H
 
H
V
 
V
N
 
R
I
 
V
Q
 
P
M
 
Y
Q
 
Y
N
 
N
R
 
I
H
 
H
-
 
P
I
 
M
P
 
P
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
H
-
 
Q
-
 
R
-
 
L
C
 
C
A
 
A
E
 
E
G
 
E
G
 
D
-
 
R
D
 
G
L
 
A
Q
 
Q
S
 
A
Q
 
Y
C
 
A
D
 
S
A
 
E
Y
 
I
N
 
S
A
 
A
L
 
L
L
 
V
R
 
T
Q
 
N
A
 
C
T
 
S
V
 
F
D
 
D
L
 
L
Q
 
V
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
T
N
 
D
G
 
G
H
 
H
I
 
T
G
 
A
F
 
S
C
 
L
E
 
F
P
 
P
G
 
Q
T
 
S
P
 
P
-
 
T
-
 
G
F
 
L
D
 
D
Q
 
G
E
 
E
T
 
Q
F
 
-
L
 
L
T
 
V
Q
 
V
L
 
L
A
 
T
E
 
E
K
 
S
T
 
P
R
 
S
Q
 
R
D
 
P
N
 
H
Q
 
Q
R
 
R
F
 
-
F
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
M
T
 
S
M
 
L
G
 
S
I
 
L
K
 
P
N
 
L
I
 
I
M
 
N
Q
 
R
A
 
A
K
 
K
S
 
K
I
 
V
L
 
A
L
 
V
I
 
L
A
 
V
S
 
M
G
 
G
K
 
R
G
 
T
K
 
K
A
 
R
E
 
D

Sites not aligning to the query:

O95479 GDH/6PGL endoplasmic bifunctional protein; EC 1.1.1.47; EC 1.1.1.363; EC 3.1.1.31 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
29% identity, 72% coverage: 32:203/240 of query aligns to 587:753/791 of O95479

query
sites
O95479
L
|
L
G
x
A
L
|
L
A
x
S
T
x
G
G
|
G
S
|
S
T
x
S
P
|
P
L
x
V
G
x
A
T
x
L
Y
x
F
Q
|
Q
Y
x
Q
L
|
L
V
x
A
K
x
T
R
x
A
Y
x
H
Q
x
Y
A
x
G
G
 
-
D
 
-
I
x
F
S
x
P
F
x
W
K
x
A
D
x
H
V
x
T
Q
x
H
T
x
L
F
x
W
N
x
L
L
x
V
D
|
D
E
|
E
Y
x
R
C
|
C
G
 
-
L
x
V
P
|
P
R
x
L
T
x
S
H
x
D
P
|
P
E
|
E
S
|
S
Y
x
N
F
|
F
R
x
Q
F
x
G
M
x
L
H
x
Q
D
x
A
N
x
H
L
|
L
F
x
L
S
x
Q
H
|
H
V
|
V
N
x
R
I
|
I
Q
x
P
M
x
Y
Q
x
Y
N
|
N
R
x
I
H
|
H
-
x
P
I
x
M
P
|
P
-
x
V
-
x
H
-
x
L
-
x
Q
-
x
Q
-
x
R
-
x
L
C
|
C
A
|
A
E
|
E
G
x
E
G
 
-
D
|
D
L
x
Q
Q
x
G
S
x
A
Q
|
Q
C
x
I
D
x
Y
A
|
A
-
x
R
-
x
E
Y
x
I
N
x
S
A
|
A
L
|
L
L
x
V
R
x
A
Q
x
N
A
x
S
T
x
S
V
x
F
D
|
D
L
|
L
Q
x
V
L
|
L
L
|
L
G
|
G
I
x
M
G
|
G
S
x
A
N
x
D
G
|
G
H
|
H
I
x
T
G
x
A
F
x
S
C
x
L
E
x
F
P
|
P
G
x
Q
T
x
S
P
|
P
-
x
T
-
x
G
F
x
L
D
|
D
Q
x
G
E
|
E
T
 
-
F
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
|
Q
L
|
L
A
x
V
E
x
V
K
x
L
T
|
T
R
x
T
Q
x
S
D
x
P
N
x
S
Q
|
Q
R
 
-
F
 
-
F
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
P
|
P
T
x
H
T
x
R
A
x
R
I
x
M
T
x
S
M
x
L
G
x
S
I
x
L
K
x
P
N
x
L
I
|
I
M
x
N
Q
x
R
A
|
A
K
|
K
S
x
K
I
x
V
L
x
A
L
x
V
I
x
L
A
x
V
S
x
M
G
|
G
K
x
R
G
x
M
K
|
K
A
x
R
E
|
E

Sites not aligning to the query:

4tm7A Crystal structure of 6-phosphogluconolactonase from mycobacterium smegmatis n131d mutant soaked with cuso4 (see paper)
25% identity, 80% coverage: 50:240/240 of query aligns to 54:243/243 of 4tm7A

query
sites
4tm7A
R
 
R
Y
 
E
Q
 
R
A
 
S
G
 
G
D
 
E
I
 
I
S
 
D
F
 
W
K
 
S
D
 
K
V
 
V
Q
x
H
T
 
I
F
 
Y
N
 
W
L
 
G
D
 
D
E
 
E
Y
 
R
C
 
F
G
 
-
L
 
V
P
 
P
R
 
Q
T
 
D
H
 
D
P
 
D
E
 
E
S
 
R
Y
 
N
F
 
D
R
 
K
F
 
Q
M
 
A
H
 
R
D
 
E
N
 
A
L
 
L
F
 
L
S
 
D
H
 
H
V
 
I
N
 
G
I
 
I
Q
 
P
M
 
P
Q
 
V
N
 
N
R
 
V
H
|
H
I
 
A
P
 
M
C
 
A
A
 
A
E
 
S
G
 
D
G
 
G
-
 
E
-
 
F
-
 
G
-
 
D
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
S
 
A
Q
 
A
C
 
A
D
 
A
A
 
G
Y
 
Y
N
 
A
A
 
Q
L
 
L
L
 
L
R
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
F
Q
 
D
A
 
S
T
 
S
V
 
V
-
 
P
-
 
G
-
 
F
D
 
D
L
 
V
Q
 
H
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
G
N
 
E
G
 
G
H
 
H
I
 
V
G
 
N
F
 
S
C
 
L
E
 
F
P
 
P
G
 
D
T
 
T
P
 
D
F
 
A
D
 
V
Q
 
R
E
 
E
T
 
T
F
 
-
L
 
-
T
 
-
Q
 
-
L
 
-
A
 
-
E
 
-
K
 
-
T
 
-
R
 
-
Q
 
-
D
 
-
N
 
-
Q
 
E
R
 
R
F
 
L
F
 
V
N
 
V
S
 
G
L
 
V
E
 
S
E
 
D
V
 
S
P
 
P
T
 
K
T
 
P
A
 
P
-
 
P
-
 
R
-
 
R
I
 
I
T
 
T
M
 
L
G
 
T
I
 
L
K
 
P
N
 
A
I
 
V
M
 
Q
Q
 
N
A
 
S
K
 
R
S
 
E
I
 
V
L
 
W
L
 
L
I
 
V
A
 
V
S
 
S
G
 
G
K
 
E
G
 
A
K
 
K
A
 
A
E
 
D
C
 
A
I
 
V
S
 
A
Q
 
A
M
 
A
V
 
V
N
 
G
G
 
G
P
 
A
V
 
D
T
 
P
E
 
V
A
 
D
V
 
I
P
 
P
A
 
A
S
 
A
A
 
G
L
 
A
Q
 
V
Q
 
G
H
 
R
P
 
E
N
 
R
A
 
T
T
 
V
I
 
W
I
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
E
E
 
A
A
 
A
A
 
A
S
 
A
L
 
K
L
 
L

Q84WW2 6-phosphogluconolactonase 3, chloroplastic; 6PGL3; Protein EMBRYO DEFECTIVE 2024; EC 3.1.1.31 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
21% identity, 86% coverage: 34:240/240 of query aligns to 117:325/325 of Q84WW2

query
sites
Q84WW2
L
 
V
A
 
V
T
 
S
G
 
G
S
 
G
T
 
S
P
 
L
L
 
I
G
 
K
T
 
S
Y
 
L
Q
 
R
Y
 
K
L
 
L
V
 
V
K
 
E
R
 
S
Y
 
P
Q
 
Y
A
 
V
G
 
D
D
 
S
I
 
I
S
 
D
F
 
W
K
 
A
D
 
R
V
 
W
Q
 
H
T
 
F
F
 
F
N
 
W
L
 
V
D
|
D
E
 
E
Y
 
R
C
 
V
G
 
-
L
 
V
P
 
P
R
 
K
T
 
N
H
 
H
P
 
D
E
 
D
S
 
S
Y
 
N
F
 
Y
R
 
K
F
 
L
M
 
A
H
 
Y
D
 
D
N
 
S
L
 
F
F
 
L
S
 
S
H
 
K
V
 
V
N
 
P
I
 
I
Q
 
P
M
 
P
Q
 
G
N
 
N
R
 
V
H
 
Y
I
 
A
P
 
-
C
 
I
A
 
N
E
 
E
G
 
A
G
 
L
D
 
S
L
 
A
Q
 
E
S
 
A
Q
 
A
C
 
A
D
 
D
A
 
D
Y
 
Y
N
 
E
A
 
T
L
 
C
L
 
L
R
 
K
Q
 
H
-
 
L
-
 
V
-
 
N
-
 
T
-
 
N
-
 
I
-
 
L
-
 
R
-
 
V
-
 
S
-
 
E
-
 
S
-
 
T
-
 
G
-
 
F
A
 
P
T
 
K
V
 
F
D
 
D
L
 
L
Q
 
M
L
 
L
L
 
L
G
 
G
I
 
M
G
 
G
S
 
P
N
x
D
G
 
G
H
|
H
I
 
V
G
 
A
F
 
S
C
 
L
E
 
F
P
 
P
G
 
G
T
 
H
P
 
G
F
 
L
D
 
C
Q
 
N
E
 
E
T
 
S
-
 
K
-
 
K
F
 
W
L
 
V
T
 
V
Q
 
S
L
 
I
A
 
S
E
 
D
K
 
S
T
 
P
R
 
K
Q
 
P
D
 
P
N
 
S
Q
 
E
R
 
R
F
 
-
F
 
-
N
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
-
E
 
-
V
 
-
P
 
-
T
 
-
T
 
-
A
 
-
I
 
I
T
 
T
M
 
F
G
 
T
I
 
F
K
 
P
N
 
V
I
 
I
M
 
N
Q
 
S
A
 
S
K
 
A
S
 
H
I
 
V
L
 
A
L
 
L
I
 
V
A
 
V
S
 
C
G
 
G
K
 
S
G
 
G
K
 
K
A
 
A
E
 
E
C
 
A
I
 
V
S
 
E
Q
 
A
M
 
A
V
 
L
N
 
K
G
 
K
P
 
-
V
 
T
T
 
G
E
 
N
A
 
V
V
 
P
P
 
P
A
 
A
S
 
G
A
 
S
L
 
V
Q
 
S
Q
 
A
H
 
E
P
 
D
N
 
E
A
 
L
T
 
V
I
 
W
I
 
F
V
 
L
D
 
D
E
 
K
E
 
P
A
 
A
A
 
S
S
|
S
L
x
K
L
|
L

Query Sequence

>WP_090274005.1 NCBI__GCF_900105005.1:WP_090274005.1
MKIITVNNYNELSSTAGQIIADLVSSNPRCTLGLATGSTPLGTYQYLVKRYQAGDISFKD
VQTFNLDEYCGLPRTHPESYFRFMHDNLFSHVNIQMQNRHIPCAEGGDLQSQCDAYNALL
RQATVDLQLLGIGSNGHIGFCEPGTPFDQETFLTQLAEKTRQDNQRFFNSLEEVPTTAIT
MGIKNIMQAKSILLIASGKGKAECISQMVNGPVTEAVPASALQQHPNATIIVDEEAASLL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory