SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_090274570.1 NCBI__GCF_900105005.1:WP_090274570.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 12 hits to proteins with known functional sites (download)

3dmeA Crystal structure of conserved exported protein from bordetella pertussis. Northeast structural genomics target ber141
51% identity, 99% coverage: 3:367/370 of query aligns to 2:365/366 of 3dmeA

query
sites
3dmeA
D
 
D
I
 
I
E
 
D
V
 
C
I
 
I
V
 
V
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
|
V
V
|
V
G
 
G
L
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
R
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
A
G
 
G
G
 
G
R
 
H
D
 
E
V
 
V
M
 
L
I
 
V
L
 
A
E
|
E
R
x
A
E
 
A
A
 
E
S
 
G
I
 
I
G
 
G
E
 
T
H
 
G
A
x
T
S
|
S
S
 
S
R
|
R
N
|
N
S
|
S
E
 
E
V
|
V
I
 
I
H
|
H
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
P
S
 
A
G
 
D
S
 
S
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
C
L
 
V
D
 
R
G
 
G
R
 
K
D
 
H
R
 
L
L
 
L
Y
 
Y
A
 
E
W
 
Y
C
 
C
E
 
A
A
 
A
H
 
R
R
 
G
V
 
V
P
 
P
H
 
H
R
 
Q
R
 
R
I
 
L
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
S
D
 
D
D
 
A
E
 
E
L
 
A
P
 
S
A
 
Q
L
 
L
E
 
D
Q
 
S
L
 
I
R
 
A
F
 
R
N
 
R
A
 
A
Q
 
G
A
 
A
C
 
N
G
 
G
V
 
V
Q
 
D
-
 
D
L
 
L
Q
 
Q
S
 
H
L
 
I
N
 
D
A
 
G
A
 
A
Q
 
A
V
 
A
H
 
R
E
 
R
L
 
L
E
 
E
P
 
P
A
 
A
V
 
L
T
 
H
A
 
C
V
 
T
G
 
A
G
 
A
L
 
L
F
 
V
S
 
S
P
 
P
L
 
S
T
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
S
H
 
H
A
 
A
L
 
L
M
 
M
Q
 
L
S
 
A
F
 
Y
E
 
Q
T
 
G
V
 
D
L
 
A
L
 
E
G
 
S
Q
 
D
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
L
 
L
C
 
V
L
 
F
R
 
H
T
 
T
R
x
P
V
x
L
-
 
I
-
 
A
D
 
G
R
 
R
V
 
V
E
 
R
R
 
P
Q
 
E
G
 
G
E
 
G
R
 
F
W
 
E
L
 
L
V
 
D
Q
 
F
G
 
G
Q
 
G
S
 
A
S
 
-
G
 
-
Q
 
E
P
 
P
F
 
M
A
 
T
V
 
L
S
 
S
C
 
C
R
 
R
W
 
V
L
 
L
I
 
I
N
 
N
A
 
A
G
x
A
G
 
G
L
 
L
F
 
H
A
 
A
Q
 
P
Q
 
G
L
 
L
A
 
A
H
 
R
S
 
R
I
 
I
D
 
E
C
 
G
Y
 
I
P
 
P
A
 
R
A
 
D
L
 
S
I
 
I
P
 
P
P
 
P
L
 
E
H
 
Y
Y
 
L
C
 
C
Q
 
K
G
 
G
R
 
S
Y
 
Y
F
 
F
S
 
T
Y
 
L
S
 
A
G
 
G
S
 
R
S
 
A
P
 
P
F
 
F
R
 
S
H
 
R
L
 
L
V
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
V
P
 
P
E
 
Q
P
 
-
N
 
-
A
 
H
V
 
A
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
H
A
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
D
L
 
L
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
L
 
A
R
 
K
F
 
F
G
 
G
P
 
P
D
 
D
V
 
T
R
 
E
Y
 
W
T
 
I
D
 
A
S
 
T
I
 
E
D
 
D
Y
 
Y
Q
 
T
V
 
L
D
 
D
A
 
P
G
 
R
S
 
R
G
 
A
E
 
D
S
 
V
F
 
F
A
 
Y
R
 
A
S
 
A
I
 
V
Q
 
R
R
 
S
Y
 
Y
W
 
W
P
 
P
E
 
A
C
 
L
R
 
P
A
 
D
E
 
G
R
 
A
L
 
L
Q
 
A
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
A
 
T
G
 
G
V
x
I
R
|
R
A
 
P
K
 
K
L
 
I
S
 
S
G
 
G
P
 
P
G
 
H
A
 
E
A
 
P
A
 
A
A
 
A
D
 
D
F
 
F
M
 
A
I
 
I
Q
 
A
G
 
G
P
 
P
A
 
A
I
 
S
H
 
H
G
 
G
L
 
V
Q
 
A
G
 
G
V
 
L
V
 
V
S
 
N
L
 
L
F
 
Y
G
 
G
I
|
I
E
|
E
S
|
S
P
|
P
G
|
G
L
|
L
T
|
T
A
 
A
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
T
A
 
L
G
 
A
Q
 
R
L
 
L

8w78A Structure of drosophila melanogaster l-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with fad and 2-oxoglutarate (see paper)
30% identity, 92% coverage: 29:369/370 of query aligns to 30:405/410 of 8w78A

query
sites
8w78A
V
 
V
M
 
A
I
 
V
L
 
L
E
|
E
R
x
K
E
 
E
A
 
C
S
 
K
I
 
L
G
 
A
E
 
K
H
|
H
A
x
Q
S
|
S
S
 
G
R
 
H
N
|
N
S
|
S
E
 
G
V
|
V
I
 
I
H
|
H
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
K
S
 
P
G
 
G
S
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
C
L
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
M
D
 
H
R
 
L
L
 
A
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
C
 
L
E
 
D
A
 
E
H
 
K
R
 
K
V
 
I
P
 
P
H
 
Y
R
 
K
R
 
K
I
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
E
D
 
K
E
 
E
L
 
V
P
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
D
L
 
L
R
 
E
F
 
K
N
 
R
A
 
G
Q
 
I
A
 
A
C
 
N
G
 
N
V
 
V
-
 
P
Q
 
D
L
 
L
Q
 
R
S
 
M
L
 
I
N
 
E
A
 
G
A
 
S
Q
 
E
V
 
I
H
 
Q
E
 
E
L
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
V
 
C
T
 
Q
A
 
G
V
 
V
G
 
M
G
 
A
L
 
L
F
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
H
T
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
W
H
 
G
A
 
L
L
 
V
M
 
T
Q
 
E
S
 
H
F
 
Y
E
 
G
T
 
Q
V
 
D
L
 
F
L
 
K
G
 
Q
Q
 
C
G
 
G
G
 
G
Q
 
D
L
 
I
C
 
Y
L
 
L
R
 
D
T
 
F
R
 
N
V
|
V
D
 
S
R
 
K
V
 
F
E
 
T
R
 
E
Q
 
T
G
 
D
E
 
Y
R
 
P
W
 
V
L
 
T
V
 
I
Q
 
H
G
 
G
Q
 
A
S
 
K
S
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
-
F
 
-
A
 
T
V
 
V
S
 
R
C
 
T
R
 
K
W
 
N
L
 
V
I
 
L
N
 
T
A
 
C
G
|
G
G
|
G
L
 
L
F
x
Q
A
 
S
Q
 
D
Q
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
E
S
 
K
I
 
T
D
 
G
C
 
C
Y
 
P
P
 
R
A
 
D
A
 
P
L
 
R
I
 
I
P
 
V
P
 
P
L
 
F
H
 
-
Y
 
-
C
 
-
Q
 
R
G
 
G
R
 
E
Y
 
Y
F
 
L
S
 
L
Y
 
L
S
 
T
G
 
K
S
 
E
S
 
K
P
 
-
F
 
-
R
 
Q
H
 
H
L
 
M
V
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
I
Y
|
Y
P
 
P
M
 
V
P
 
P
E
 
D
P
 
P
N
 
R
A
 
F
V
 
P
G
x
F
L
|
L
G
 
G
V
 
V
H
|
H
A
 
F
T
 
T
L
 
P
D
 
R
L
 
M
G
 
D
G
 
G
Q
 
S
L
 
I
R
 
W
F
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
N
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
W
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
A
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
A
T
 
S
D
 
K
S
 
Y
I
 
I
D
 
G
Y
 
F
Q
 
G
V
 
L
D
 
S
A
 
E
G
 
M
S
 
S
G
 
K
E
 
S
S
 
W
F
 
F
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
Q
A
 
I
R
 
K
S
 
A
I
 
L
Q
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
W
 
I
P
 
P
E
 
D
C
 
I
R
 
T
A
 
E
E
 
Y
R
 
D
L
 
I
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
Y
 
P
A
 
A
G
 
G
V
 
V
R
|
R
A
 
A
K
 
Q
-
 
A
L
 
M
S
 
D
G
 
L
P
 
D
G
 
G
A
 
N
A
 
L
A
 
V
A
 
D
D
 
D
F
 
F
M
 
V
I
 
F
-
 
D
Q
 
R
G
 
G
P
 
Q
A
 
G
I
 
S
H
 
G
G
 
A
L
 
L
-
 
A
Q
 
K
G
 
R
V
 
V
V
 
L
S
 
H
L
 
C
F
 
R
G
 
N
I
 
A
E
 
P
S
 
S
P
|
P
G
|
G
L
x
A
T
|
T
A
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
K
E
 
M
V
 
I
A
 
A
G
 
D
Q
 
K
L
 
I
D
 
E
N
 
N

Sites not aligning to the query:

8w7fB Structure of drosophila melanogaster l-2-hydroxyglutarate dehydrogenase bound with fad and a sulfate ion (see paper)
30% identity, 92% coverage: 29:369/370 of query aligns to 30:407/412 of 8w7fB

query
sites
8w7fB
V
 
V
M
 
A
I
 
V
L
 
L
E
|
E
R
x
K
E
 
E
A
 
C
S
 
K
I
 
L
G
 
A
E
 
K
H
|
H
A
x
Q
S
|
S
S
 
G
R
x
H
N
|
N
S
|
S
E
 
G
V
|
V
I
 
I
H
|
H
A
 
A
G
 
G
I
 
I
Y
 
Y
Y
 
Y
P
 
K
S
 
P
G
 
G
S
 
T
L
 
L
K
 
K
A
 
A
R
 
R
L
 
L
C
 
C
L
 
V
D
 
E
G
 
G
R
 
M
D
 
H
R
 
L
L
 
A
Y
 
Y
A
 
A
W
 
Y
C
 
L
E
 
D
A
 
E
H
 
K
R
 
K
V
 
I
P
 
P
H
 
Y
R
 
K
R
 
K
I
 
T
G
 
G
K
 
K
L
 
L
L
 
I
V
 
V
A
 
A
T
 
T
A
 
D
D
 
E
D
 
K
E
 
E
L
 
V
P
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
K
Q
 
D
L
 
L
R
 
E
F
 
K
N
 
R
A
 
G
Q
 
I
A
 
A
C
 
N
G
 
N
V
 
V
-
 
P
Q
 
D
L
 
L
Q
 
R
S
 
M
L
 
I
N
 
E
A
 
G
A
 
S
Q
 
E
V
 
I
H
 
Q
E
 
E
L
 
I
E
 
E
P
 
P
A
 
Y
V
 
C
T
 
Q
A
 
G
V
 
V
G
 
M
G
 
A
L
 
L
F
 
H
S
 
S
P
 
P
L
 
H
T
 
T
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
S
 
W
H
 
G
A
 
L
L
 
V
M
 
T
Q
 
E
S
 
H
F
 
Y
E
 
G
T
 
Q
V
 
D
L
 
F
L
 
K
G
 
Q
Q
 
C
G
 
G
G
 
G
Q
 
D
L
 
I
C
 
Y
L
 
L
R
 
D
T
 
F
R
 
N
V
|
V
D
 
S
R
 
K
V
 
F
E
 
T
R
 
E
Q
 
T
G
 
K
E
 
T
R
 
D
W
 
Y
-
 
P
-
 
V
L
 
T
V
 
I
Q
 
H
G
 
G
Q
 
A
S
 
K
S
 
P
G
 
G
Q
 
Q
P
 
-
F
 
-
A
 
T
V
 
V
S
 
R
C
 
T
R
 
K
W
 
N
L
 
V
I
 
L
N
 
T
A
 
C
G
|
G
G
|
G
L
 
L
F
x
Q
A
 
S
Q
 
D
Q
 
L
L
 
L
A
 
A
H
 
E
S
 
K
I
 
T
D
 
G
C
 
C
Y
 
P
P
 
R
A
 
D
A
 
P
L
 
R
I
 
I
P
 
V
P
 
P
L
 
F
H
 
-
Y
 
-
C
 
-
Q
 
R
G
 
G
R
 
E
Y
|
Y
F
 
L
S
 
L
Y
 
L
S
 
T
G
 
K
S
 
E
S
 
K
P
 
-
F
 
-
R
 
Q
H
 
H
L
 
M
V
 
V
-
 
K
-
 
G
-
 
N
-
 
I
Y
 
Y
P
 
P
M
 
V
P
 
P
E
 
D
P
 
P
N
 
R
A
 
F
V
 
P
G
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
V
H
 
H
A
 
F
T
 
T
L
 
P
D
 
R
L
 
M
G
 
D
G
 
G
Q
 
S
L
 
I
R
 
W
F
 
L
G
 
G
P
 
P
D
 
N
-
 
A
-
 
V
-
 
L
-
 
A
-
 
L
-
 
K
-
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
W
-
 
G
-
 
D
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
F
-
 
D
-
 
A
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
V
-
 
K
-
 
M
-
 
A
T
 
S
D
 
K
S
 
Y
I
 
I
D
 
G
Y
 
F
Q
 
G
V
 
L
D
 
S
A
 
E
G
 
M
S
 
S
G
 
K
E
 
S
S
 
W
F
 
F
-
 
I
-
 
N
-
 
L
-
 
Q
A
 
I
R
 
K
S
 
A
I
 
L
Q
 
Q
R
 
K
Y
 
Y
W
 
I
P
 
P
E
 
D
C
 
I
R
 
T
A
 
E
E
 
Y
R
 
D
L
 
I
Q
 
Q
P
 
R
G
 
G
Y
 
P
A
 
A
G
 
G
V
|
V
R
|
R
A
 
A
K
 
Q
-
 
A
L
 
M
S
 
D
G
 
L
P
 
D
G
 
G
A
 
N
A
 
L
A
 
V
A
 
D
D
 
D
F
 
F
M
 
V
I
 
F
-
 
D
Q
 
R
G
 
G
P
 
Q
A
 
G
I
 
S
H
 
G
G
 
A
L
 
L
-
 
A
Q
 
K
G
 
R
V
 
V
V
 
L
S
 
H
L
 
C
F
 
R
G
 
N
I
 
A
E
 
P
S
 
S
P
|
P
G
|
G
L
x
A
T
|
T
A
 
S
S
 
S
L
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
E
 
K
E
 
M
V
 
I
A
 
A
G
 
D
Q
 
K
L
 
I
D
 
E
N
 
N

Sites not aligning to the query:

6j39A Crystal structure of cmis2 with inhibitor (see paper)
26% identity, 62% coverage: 14:241/370 of query aligns to 11:237/368 of 6j39A

query
sites
6j39A
V
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
S
I
 
V
A
 
A
-
 
W
Q
 
Q
R
 
A
L
 
L
A
 
E
S
 
R
G
 
G
G
 
L
R
 
R
D
 
V
V
 
T
M
 
V
I
x
V
L
x
D
E
x
P
R
x
E
E
 
P
A
 
A
S
 
S
I
x
K
G
x
A
E
x
S
H
 
H
A
x
V
S
|
S
S
x
A
R
x
G
N
x
M
S
 
L
E
x
P
V
 
A
I
 
A
H
x
N
A
 
E
G
 
M
I
 
L
Y
 
Y
Y
 
S
P
 
Q
S
 
E
G
 
D
S
 
L
L
 
L
K
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
A
G
 
S
R
 
R
D
 
E
R
 
R
L
 
Y
Y
 
P
A
 
S
W
 
F
C
 
V
E
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
S
A
 
G
H
 
T
R
 
S
V
 
A
P
 
G
H
 
Y
R
 
R
R
 
R
I
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
L
L
 
D
V
 
A
A
 
A
T
 
F
A
 
D
D
 
D
D
 
E
E
 
S
L
 
L
P
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
F
 
N
N
 
F
A
 
L
Q
 
A
A
 
P
C
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
A
L
 
V
Q
 
A
S
 
P
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
R
Q
 
R
V
 
C
H
 
R
E
 
E
L
 
H
E
 
E
P
 
P
-
 
M
-
 
L
A
 
A
V
 
E
T
 
S
A
 
V
V
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
L
S
 
G
P
 
P
L
 
D
T
 
D
G
 
G
I
 
A
V
 
V
D
 
N
S
 
P
H
 
R
A
 
E
L
 
L
M
 
T
Q
 
A
S
 
A
F
 
L
E
 
L
T
 
A
V
 
A
L
 
I
L
 
D
G
 
V
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
C
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
R
G
x
A
E
 
T
R
 
E
W
 
F
L
 
L
V
 
A
Q
 
D
G
 
E
Q
 
R
S
 
T
S
 
P
G
 
G
Q
 
V
P
 
L
F
 
L
A
 
E
V
 
N
S
 
G
C
 
C
R
 
A
W
 
V
L
 
H
I
 
G
N
 
D
A
 
R
G
 
V
G
 
V
L
 
L
F
 
S
A
|
A
Q
 
G
Q
 
C
L
x
W
A
 
T
H
 
H
S
 
R
I
 
L
D
 
A
C
 
G
Y
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
G
L
 
A
I
 
V
P
 
P
P
 
E
L
 
I
H
 
A
Y
 
P
C
 
A
Q
 
K
G
 
G
R
 
Q
Y
x
I
F
 
L
S
 
R
Y
 
L
S
 
R
G
 
S
S
 
A
S
 
A
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

6j38A Crystal structure of cmis2 (see paper)
26% identity, 62% coverage: 14:241/370 of query aligns to 11:237/368 of 6j38A

query
sites
6j38A
V
x
I
G
 
G
L
 
L
A
 
S
I
 
V
A
 
A
-
 
W
Q
 
Q
R
 
A
L
 
L
A
 
E
S
 
R
G
 
G
G
 
L
R
 
R
D
 
V
V
 
T
M
 
V
I
x
V
L
x
D
E
x
P
R
 
E
E
 
P
A
 
A
S
 
S
I
x
K
G
x
A
E
x
S
H
 
H
A
 
V
S
|
S
S
x
A
R
x
G
N
x
M
S
 
L
E
 
P
V
 
A
I
 
A
H
 
N
A
 
E
G
 
M
I
 
L
Y
 
Y
Y
 
S
P
 
Q
S
 
E
G
 
D
S
 
L
L
 
L
K
 
-
A
 
-
R
 
R
L
 
L
C
 
C
L
 
L
D
 
A
G
 
S
R
 
R
D
 
E
R
 
R
L
 
Y
Y
 
P
A
 
S
W
 
F
C
 
V
E
 
K
-
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
S
A
 
G
H
 
T
R
 
S
V
 
A
P
 
G
H
 
Y
R
 
R
R
 
R
I
 
D
G
 
G
K
 
V
L
 
L
L
 
D
V
 
A
A
 
A
T
 
F
A
 
D
D
 
D
D
 
E
E
 
S
L
 
L
P
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
Q
 
G
L
 
L
R
 
R
F
 
N
N
 
F
A
 
L
Q
 
A
A
 
P
C
 
L
G
 
G
V
 
V
Q
 
A
L
 
V
Q
 
A
S
 
P
L
 
L
N
 
N
A
 
A
A
 
R
Q
 
R
V
 
C
H
 
R
E
 
E
L
 
H
E
 
E
P
 
P
-
 
M
-
 
L
A
 
A
V
 
E
T
 
S
A
 
V
V
 
R
G
 
G
G
 
G
L
 
L
F
 
L
S
 
G
P
 
P
L
 
D
T
 
D
G
 
G
I
 
A
V
 
V
D
 
N
S
 
P
H
 
R
A
 
E
L
 
L
M
 
T
Q
 
A
S
 
A
F
 
L
E
 
L
T
 
A
V
 
A
L
 
I
L
 
D
G
 
V
Q
 
R
G
 
G
G
 
G
Q
 
T
L
 
L
C
 
-
L
 
-
R
 
-
T
 
-
R
 
-
V
 
-
D
 
-
R
 
-
V
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
R
G
x
A
E
 
T
R
 
E
W
 
F
L
 
L
V
 
A
Q
 
D
G
 
E
Q
 
R
S
 
T
S
 
P
G
 
G
Q
 
V
P
 
L
F
 
L
A
 
E
V
 
N
S
 
G
C
 
C
R
 
A
W
 
V
L
 
H
I
 
G
N
 
D
A
 
R
G
 
V
G
 
V
L
 
L
F
 
S
A
|
A
Q
 
G
Q
 
C
L
x
W
A
 
T
H
 
H
S
 
R
I
 
L
D
 
A
C
 
G
Y
 
L
P
 
P
A
 
A
A
 
G
L
 
A
I
 
V
P
 
P
P
 
E
L
 
I
H
 
A
Y
 
P
C
 
A
Q
 
K
G
|
G
R
 
Q
Y
 
I
F
 
L
S
 
R
Y
 
L
S
 
R
G
 
S
S
 
A
S
 
A
P
 
P
F
 
F

Sites not aligning to the query:

Q9HXE3 FAD-dependent catabolic D-arginine dehydrogenase DauA; D-arginine dehydrogenase; DADH; D-arginine utilization protein A; Dau; EC 1.4.99.6 from Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) (see 2 papers)
25% identity, 60% coverage: 1:223/370 of query aligns to 1:219/375 of Q9HXE3

query
sites
Q9HXE3
M
 
M
A
 
I
D
 
E
I
 
A
E
 
D
V
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
 
I
G
 
G
A
 
A
G
 
G
V
 
I
V
x
A
G
 
G
L
 
A
A
 
S
I
 
T
A
 
G
Q
 
Y
R
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
A
G
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
-
V
 
V
M
 
V
I
 
V
L
 
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
A
 
A
S
 
Q
I
 
P
G
 
G
E
 
Y
H
 
H
A
x
S
S
x
T
S
x
G
R
|
R
N
x
S
S
x
A
E
 
-
V
 
-
I
x
A
H
|
H
A
 
Y
G
 
T
I
 
V
Y
 
A
Y
 
Y
P
 
G
S
 
T
G
 
P
S
 
Q
L
 
V
K
 
R
A
 
A
R
 
-
L
 
-
C
 
-
L
 
L
D
 
T
G
 
A
R
 
A
D
 
S
R
 
R
L
 
A
Y
 
F
-
 
F
-
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
A
A
 
G
W
 
F
C
 
C
E
 
E
A
 
H
H
 
P
R
 
L
V
 
L
P
 
S
H
 
P
R
 
R
R
 
-
I
 
-
G
 
P
K
x
E
L
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
D
T
 
F
A
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
P
L
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
F
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
N
 
S
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
C
 
L
G
 
V
V
 
P
Q
 
Q
L
 
M
Q
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
V
 
A
H
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
T
F
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
T
T
 
G
G
 
A
I
 
D
V
 
I
D
 
D
S
 
T
H
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
H
Q
 
Q
S
 
G
F
 
Y
E
 
L
T
 
R
V
 
G
L
 
I
L
 
R
G
 
R
Q
 
N
G
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
 
L
L
 
C
R
 
N
T
 
H
R
 
E
V
x
A
D
 
L
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
V
G
 
D
E
 
G
R
 
A
W
 
W
L
 
E
V
 
V
Q
 
R
G
 
C
Q
 
D
S
 
A
S
 
G
G
 
S
Q
 
Y
P
 
R
F
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
-
C
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
A
F
 
W
A
 
C
Q
 
D
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
G
S
 
L
I
 
A
D
 
G
C
 
V
Y
 
R
P
 
P
A
 
L
A
 
G
L
 
L
I
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

7rdfA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa d-arginine dehydrogenase y249f co-crystallized in the presence of d-arginine (see paper)
25% identity, 60% coverage: 1:223/370 of query aligns to 1:219/375 of 7rdfA

query
sites
7rdfA
M
 
M
A
 
I
D
 
E
I
 
A
E
 
D
V
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
I
V
x
A
G
 
G
L
 
A
A
 
S
I
 
T
A
 
G
Q
 
Y
R
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
A
G
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
-
V
 
V
M
 
V
I
 
V
L
|
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
A
 
A
S
 
Q
I
 
P
G
 
G
E
 
Y
H
|
H
A
x
S
S
x
T
S
 
G
R
|
R
N
x
S
S
x
A
E
 
-
V
 
-
I
 
A
H
|
H
A
 
Y
G
 
T
I
 
V
Y
 
A
Y
|
Y
P
 
G
S
 
T
G
 
P
S
 
Q
L
 
V
K
 
R
A
 
A
R
 
-
L
 
-
C
 
-
L
 
L
D
 
T
G
 
A
R
 
A
D
 
S
R
 
R
L
 
A
Y
 
F
-
 
F
-
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
A
A
 
G
W
 
F
C
 
C
E
 
E
A
 
H
H
 
P
R
 
L
V
 
L
P
 
S
H
 
P
R
 
R
R
 
-
I
 
-
G
 
P
K
x
E
L
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
D
T
 
F
A
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
P
L
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
F
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
N
 
S
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
C
 
L
G
 
V
V
 
P
Q
 
Q
L
 
M
Q
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
V
 
A
H
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
T
F
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
T
T
 
G
G
 
A
I
 
D
V
 
I
D
 
D
S
 
T
H
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
H
Q
 
Q
S
 
G
F
 
Y
E
 
L
T
 
R
V
 
G
L
 
I
L
 
R
G
 
R
Q
 
N
G
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
 
L
L
 
C
R
 
N
T
 
H
R
x
E
V
x
A
D
 
L
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
V
G
 
D
E
 
G
R
 
A
W
 
W
L
 
E
V
 
V
Q
 
R
G
 
C
Q
 
D
S
 
A
S
 
G
G
 
S
Q
 
Y
P
 
R
F
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
-
C
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
G
x
A
G
|
G
L
 
A
F
x
W
A
 
C
Q
 
D
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
G
S
 
L
I
 
A
D
 
G
C
 
V
Y
 
R
P
 
P
A
 
L
A
 
G
L
 
L
I
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6pldA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa d-arginine dehydrogenase y249f variant with 6-oh-fad - green fraction (see paper)
25% identity, 60% coverage: 1:223/370 of query aligns to 1:219/375 of 6pldA

query
sites
6pldA
M
 
M
A
 
I
D
 
E
I
 
A
E
 
D
V
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
I
V
x
A
G
 
G
L
 
A
A
 
S
I
 
T
A
 
G
Q
 
Y
R
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
A
G
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
-
V
 
V
M
 
V
I
 
V
L
|
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
A
 
A
S
 
Q
I
 
P
G
 
G
E
 
Y
H
|
H
A
x
S
S
x
T
S
 
G
R
|
R
N
x
S
S
x
A
E
 
-
V
 
-
I
 
A
H
|
H
A
 
Y
G
 
T
I
 
V
Y
 
A
Y
 
Y
P
 
G
S
 
T
G
 
P
S
 
Q
L
 
V
K
 
R
A
 
A
R
 
-
L
 
-
C
 
-
L
 
L
D
 
T
G
 
A
R
 
A
D
 
S
R
 
R
L
 
A
Y
 
F
-
 
F
-
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
A
A
 
G
W
 
F
C
 
C
E
 
E
A
 
H
H
 
P
R
 
L
V
 
L
P
 
S
H
 
P
R
 
R
R
 
-
I
 
-
G
 
P
K
 
E
L
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
D
T
 
F
A
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
P
L
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
F
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
N
 
S
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
C
 
L
G
 
V
V
 
P
Q
 
Q
L
 
M
Q
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
V
 
A
H
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
T
F
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
T
T
 
G
G
 
A
I
 
D
V
 
I
D
 
D
S
 
T
H
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
H
Q
 
Q
S
 
G
F
 
Y
E
 
L
T
 
R
V
 
G
L
 
I
L
 
R
G
 
R
Q
 
N
G
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
 
L
L
 
C
R
 
N
T
 
H
R
x
E
V
x
A
D
 
L
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
V
G
 
D
E
 
G
R
 
A
W
 
W
L
 
E
V
 
V
Q
 
R
G
 
C
Q
 
D
S
 
A
S
 
G
G
 
S
Q
 
Y
P
 
R
F
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
-
C
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
G
x
A
G
|
G
L
 
A
F
x
W
A
 
C
Q
 
D
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
G
S
 
L
I
 
A
D
 
G
C
 
V
Y
 
R
P
 
P
A
 
L
A
 
G
L
 
L
I
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

6p9dA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa d-arginine dehydrogenase y249f variant with fad - yellow fraction (see paper)
25% identity, 60% coverage: 1:223/370 of query aligns to 1:219/375 of 6p9dA

query
sites
6p9dA
M
 
M
A
 
I
D
 
E
I
 
A
E
 
D
V
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
I
V
x
A
G
 
G
L
 
A
A
 
S
I
 
T
A
 
G
Q
 
Y
R
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
A
G
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
-
V
 
V
M
 
V
I
 
V
L
 
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
A
 
A
S
 
Q
I
 
P
G
 
G
E
 
Y
H
|
H
A
x
S
S
x
T
S
 
G
R
|
R
N
x
S
S
x
A
E
 
-
V
 
-
I
x
A
H
|
H
A
 
Y
G
 
T
I
 
V
Y
 
A
Y
 
Y
P
 
G
S
 
T
G
 
P
S
 
Q
L
 
V
K
 
R
A
 
A
R
 
-
L
 
-
C
 
-
L
 
L
D
 
T
G
 
A
R
 
A
D
 
S
R
 
R
L
 
A
Y
 
F
-
 
F
-
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
A
A
 
G
W
 
F
C
 
C
E
 
E
A
 
H
H
 
P
R
 
L
V
 
L
P
 
S
H
 
P
R
 
R
R
 
-
I
 
-
G
 
P
K
 
E
L
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
D
T
 
F
A
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
P
L
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
F
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
N
 
S
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
C
 
L
G
 
V
V
 
P
Q
 
Q
L
 
M
Q
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
V
 
A
H
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
T
F
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
T
T
 
G
G
 
A
I
 
D
V
 
I
D
 
D
S
 
T
H
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
H
Q
 
Q
S
 
G
F
 
Y
E
 
L
T
 
R
V
 
G
L
 
I
L
 
R
G
 
R
Q
 
N
G
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
 
L
L
 
C
R
 
N
T
 
H
R
x
E
V
x
A
D
 
L
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
V
G
 
D
E
 
G
R
 
A
W
 
W
L
 
E
V
 
V
Q
 
R
G
 
C
Q
 
D
S
 
A
S
 
G
G
 
S
Q
 
Y
P
 
R
F
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
-
C
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
G
x
A
G
|
G
L
 
A
F
x
W
A
 
C
Q
 
D
Q
 
A
L
 
I
A
 
A
H
 
G
S
 
L
I
 
A
D
 
G
C
 
V
Y
 
R
P
 
P
A
 
L
A
 
G
L
 
L
I
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3sm8A Crystal structure of pseudomonas aeruginosa d-arginine dehydrogenase in complex with an (n5) flavin adduct (see paper)
25% identity, 60% coverage: 3:223/370 of query aligns to 9:225/381 of 3sm8A

query
sites
3sm8A
D
 
E
I
 
A
E
 
D
V
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
I
V
x
A
G
 
G
L
 
A
A
 
S
I
 
T
A
 
G
Q
 
Y
R
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
A
G
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
-
V
 
V
M
 
V
I
 
V
L
|
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
A
 
A
S
 
Q
I
 
P
G
 
G
E
 
Y
H
|
H
A
x
S
S
x
T
S
 
G
R
|
R
N
x
S
S
x
A
E
 
-
V
 
-
I
 
A
H
|
H
A
 
Y
G
 
T
I
 
V
Y
 
A
Y
|
Y
P
 
G
S
 
T
G
 
P
S
 
Q
L
 
V
K
 
R
A
 
A
R
 
-
L
 
-
C
 
-
L
 
L
D
 
T
G
 
A
R
 
A
D
 
S
R
 
R
L
 
A
Y
 
F
-
 
F
-
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
A
A
 
G
W
 
F
C
 
C
E
 
E
A
 
H
H
 
P
R
 
L
V
 
L
P
 
S
H
 
P
R
 
R
R
 
-
I
 
-
G
 
P
K
 
E
L
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
D
T
 
F
A
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
P
L
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
F
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
N
 
S
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
C
 
L
G
 
V
V
 
P
Q
 
Q
L
 
M
Q
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
V
 
A
H
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
T
F
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
T
T
 
G
G
 
A
I
 
D
V
 
I
D
 
D
S
 
T
H
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
H
Q
 
Q
S
 
G
F
 
Y
E
 
L
T
 
R
V
 
G
L
 
I
L
 
R
G
 
R
Q
 
N
G
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
 
L
L
 
C
R
 
N
T
 
H
R
x
E
V
x
A
D
 
L
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
V
G
 
D
E
 
G
R
 
A
W
 
W
L
 
E
V
 
V
Q
 
R
G
 
C
Q
 
D
S
 
A
S
 
G
G
 
S
Q
 
Y
P
 
R
F
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
-
C
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
G
x
A
G
|
G
L
 
A
F
x
W
A
 
C
Q
 
D
Q
 
A
L
x
I
A
 
A
H
 
G
S
 
L
I
 
A
D
 
G
C
 
V
Y
 
R
P
 
P
A
 
L
A
 
G
L
 
L
I
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3nyfA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa d-arginine dehydrogenase in complex with imino-histidine (see paper)
25% identity, 60% coverage: 3:223/370 of query aligns to 9:225/381 of 3nyfA

query
sites
3nyfA
D
 
E
I
 
A
E
 
D
V
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
I
V
x
A
G
 
G
L
 
A
A
 
S
I
 
T
A
 
G
Q
 
Y
R
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
A
G
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
-
V
 
V
M
 
V
I
 
V
L
|
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
A
 
A
S
 
Q
I
 
P
G
 
G
E
 
Y
H
|
H
A
x
S
S
x
T
S
 
G
R
|
R
N
x
S
S
x
A
E
 
-
V
 
-
I
 
A
H
|
H
A
 
Y
G
x
T
I
 
V
Y
 
A
Y
|
Y
P
 
G
S
 
T
G
 
P
S
 
Q
L
 
V
K
 
R
A
 
A
R
 
-
L
 
-
C
 
-
L
 
L
D
 
T
G
 
A
R
 
A
D
 
S
R
 
R
L
 
A
Y
 
F
-
 
F
-
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
A
A
 
G
W
 
F
C
 
C
E
 
E
A
 
H
H
 
P
R
 
L
V
 
L
P
 
S
H
 
P
R
 
R
R
 
-
I
 
-
G
 
P
K
x
E
L
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
D
T
 
F
A
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
P
L
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
F
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
N
 
S
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
C
 
L
G
 
V
V
 
P
Q
 
Q
L
 
M
Q
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
V
 
A
H
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
T
F
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
T
T
 
G
G
 
A
I
 
D
V
 
I
D
 
D
S
 
T
H
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
H
Q
 
Q
S
 
G
F
 
Y
E
 
L
T
 
R
V
 
G
L
 
I
L
 
R
G
 
R
Q
 
N
G
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
 
L
L
 
C
R
 
N
T
 
H
R
x
E
V
x
A
D
 
L
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
V
G
 
D
E
 
G
R
 
A
W
 
W
L
 
E
V
 
V
Q
 
R
G
 
C
Q
 
D
S
 
A
S
 
G
G
 
S
Q
 
Y
P
 
R
F
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
-
C
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
G
x
A
G
|
G
L
 
A
F
x
W
A
 
C
Q
 
D
Q
 
A
L
x
I
A
 
A
H
 
G
S
 
L
I
 
A
D
 
G
C
 
V
Y
 
R
P
 
P
A
 
L
A
 
G
L
 
L
I
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3nycA Crystal structure of pseudomonas aeruginosa d-arginine dehydrogenase (see paper)
25% identity, 60% coverage: 3:223/370 of query aligns to 9:225/381 of 3nycA

query
sites
3nycA
D
 
E
I
 
A
E
 
D
V
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
x
I
G
|
G
A
 
A
G
|
G
V
x
I
V
x
A
G
 
G
L
 
A
A
 
S
I
 
T
A
 
G
Q
 
Y
R
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
A
G
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
-
V
 
V
M
 
V
I
 
V
L
|
L
E
|
E
R
|
R
E
 
E
A
 
A
S
 
Q
I
 
P
G
 
G
E
 
Y
H
|
H
A
x
S
S
x
T
S
 
G
R
|
R
N
x
S
S
 
A
E
 
-
V
 
-
I
x
A
H
|
H
A
 
Y
G
 
T
I
 
V
Y
 
A
Y
|
Y
P
 
G
S
 
T
G
 
P
S
 
Q
L
 
V
K
 
R
A
 
A
R
 
-
L
 
-
C
 
-
L
 
L
D
 
T
G
 
A
R
 
A
D
 
S
R
 
R
L
 
A
Y
 
F
-
 
F
-
 
D
-
 
N
-
 
P
-
 
P
-
 
A
A
 
G
W
 
F
C
 
C
E
 
E
A
 
H
H
 
P
R
 
L
V
 
L
P
 
S
H
 
P
R
 
R
R
 
-
I
 
-
G
 
P
K
x
E
L
 
M
L
 
V
V
 
V
A
 
D
T
 
F
A
 
S
D
 
D
D
 
D
E
 
P
L
 
-
P
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
E
L
 
L
R
 
R
F
 
R
-
 
Q
-
 
Y
-
 
E
N
 
S
A
 
G
Q
 
K
A
 
A
C
 
L
G
 
V
V
 
P
Q
 
Q
L
 
M
Q
 
R
S
 
L
L
 
L
N
 
D
A
 
A
A
 
E
Q
 
Q
V
 
A
H
 
C
E
 
S
L
 
I
E
 
V
P
 
P
A
 
V
V
 
L
-
 
R
-
 
R
-
 
D
T
 
K
A
 
V
V
 
F
G
 
G
G
 
A
L
 
T
F
 
Y
S
 
D
P
 
P
L
 
T
T
 
G
G
 
A
I
 
D
V
 
I
D
 
D
S
 
T
H
 
D
A
 
A
L
 
L
M
 
H
Q
 
Q
S
 
G
F
 
Y
E
 
L
T
 
R
V
 
G
L
 
I
L
 
R
G
 
R
Q
 
N
G
 
Q
G
 
G
Q
 
Q
L
 
V
C
 
L
L
 
C
R
 
N
T
 
H
R
x
E
V
x
A
D
 
L
R
 
E
V
 
I
E
 
R
R
 
R
Q
 
V
G
 
D
E
 
G
R
 
A
W
 
W
L
 
E
V
 
V
Q
 
R
G
 
C
Q
 
D
S
 
A
S
 
G
G
 
S
Q
 
Y
P
 
R
F
 
A
A
 
A
V
 
V
S
 
-
C
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
I
 
V
N
 
N
A
 
A
G
x
A
G
|
G
L
 
A
F
x
W
A
 
C
Q
 
D
Q
 
A
L
x
I
A
 
A
H
 
G
S
 
L
I
 
A
D
 
G
C
 
V
Y
 
R
P
 
P
A
 
L
A
 
G
L
 
L
I
 
Q
P
 
P

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_090274570.1 NCBI__GCF_900105005.1:WP_090274570.1
MADIEVIVVGAGVVGLAIAQRLASGGRDVMILEREASIGEHASSRNSEVIHAGIYYPSGS
LKARLCLDGRDRLYAWCEAHRVPHRRIGKLLVATADDELPALEQLRFNAQACGVQLQSLN
AAQVHELEPAVTAVGGLFSPLTGIVDSHALMQSFETVLLGQGGQLCLRTRVDRVERQGER
WLVQGQSSGQPFAVSCRWLINAGGLFAQQLAHSIDCYPAALIPPLHYCQGRYFSYSGSSP
FRHLVYPMPEPNAVGLGVHATLDLGGQLRFGPDVRYTDSIDYQVDAGSGESFARSIQRYW
PECRAERLQPGYAGVRAKLSGPGAAAADFMIQGPAIHGLQGVVSLFGIESPGLTASLALA
EEVAGQLDNL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory