SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_090447608.1 NCBI__GCF_900100495.1:WP_090447608.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
44% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 4:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
Q
 
R
L
 
L
Q
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
 
A
Q
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
M
 
A
G
 
A
E
 
R
Y
 
V
L
 
F
A
 
M
A
 
K
K
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
F
N
 
N
Q
 
E
E
 
A
K
 
A
L
 
G
D
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
V
A
 
E
A
 
A
C
 
N
K
 
P
A
 
G
L
 
V
G
 
-
V
 
V
E
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
-
Y
 
-
L
 
-
C
x
V
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
D
E
 
R
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
T
 
H
H
 
R
M
 
L
V
 
V
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
A
 
A
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
K
I
 
I
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
|
D
G
 
S
L
 
M
T
 
-
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
L
S
 
S
K
|
K
M
 
M
S
 
T
L
 
V
A
 
D
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
S
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
H
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
P
K
 
Y
M
 
M
I
 
A
E
 
E
L
 
-
Q
 
Q
S
 
G
Q
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
T
-
 
G
R
 
T
A
 
Y
G
 
G
N
|
N
I
x
V
G
 
G
Q
|
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
M
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
|
F
I
x
T
E
 
E
T
|
T
E
 
A
M
|
M
T
 
V
L
 
A
S
 
E
M
 
V
K
 
P
P
 
E
D
 
K
A
 
V
L
 
I
E
 
E
K
|
K
M
 
M
T
 
K
S
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
M
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
A
V
 
Y
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
H
E
 
E
N
 
S
D
 
D
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
N
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
I
R
 
M
L
 
M

P73826 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
42% identity, 98% coverage: 1:248/252 of query aligns to 4:236/240 of P73826

query
sites
P73826
M
 
L
Q
 
G
L
 
L
Q
 
E
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
C
 
N
Q
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
A
A
 
A
M
 
I
G
 
V
E
 
K
Y
 
L
L
 
L
A
 
Q
A
 
E
K
 
M
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
T
D
 
D
L
 
L
N
 
A
Q
 
T
E
 
D
K
 
G
L
 
G
D
 
N
E
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
T
K
 
E
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
V
E
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
-
L
 
V
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
T
N
 
D
E
 
L
E
 
E
Q
 
S
V
 
M
T
 
T
H
 
A
M
 
A
V
 
A
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
K
F
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
V
N
 
Y
G
 
G
L
 
V
V
 
V
N
 
A
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
N
L
 
F
T
 
-
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
F
S
 
P
K
 
K
M
 
L
S
 
T
L
 
P
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
L
D
 
N
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
A
L
 
Y
C
 
S
T
 
I
R
 
K
E
 
P
V
 
F
A
 
I
A
 
E
K
 
G
M
 
M
I
 
Y
E
 
E
L
 
R
Q
 
K
S
 
A
Q
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
A
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
I
S
 
S
-
 
G
R
 
E
A
 
R
G
 
G
N
 
N
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
M
T
 
M
V
 
K
V
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
G
A
 
A
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
A
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
D
T
 
T
E
 
E
M
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
E
D
 
D
A
 
I
L
 
R
E
 
E
K
 
K
M
 
I
T
 
T
S
 
K
G
 
E
I
 
I
P
 
P
L
 
F
R
 
R
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
K
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
W
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
L
E
 
S
-
 
P
-
 
V
-
 
A
N
 
S
D
 
S
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
V
L
 
L
E
 
R
L
 
V
D
 
N
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
40% identity, 98% coverage: 6:252/252 of query aligns to 5:246/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
V
 
S
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
C
 
S
Q
 
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
M
 
I
G
 
A
E
 
L
Y
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
E
G
 
G
V
 
Y
K
 
N
L
 
V
A
 
A
L
 
V
-
 
N
V
 
Y
D
 
A
L
 
G
N
 
S
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
A
D
 
E
E
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
S
R
 
F
A
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
K
H
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
D
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
I
 
L
N
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
Q
E
 
E
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
E
 
K
V
 
A
A
 
T
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
I
 
L
E
 
R
L
 
-
Q
 
Q
S
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
A
-
 
V
G
 
G
N
 
N
I
 
P
G
 
G
Q
|
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
L
T
 
T
V
 
K
V
 
S
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
D
S
 
A
M
 
L
K
 
S
P
 
D
D
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
E
K
 
Q
M
 
M
T
 
L
S
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
A
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

P73574 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; EC 1.1.1.100 from Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) (see paper)
43% identity, 98% coverage: 3:250/252 of query aligns to 4:244/247 of P73574

query
sites
P73574
L
 
L
Q
 
T
D
 
A
K
 
Q
V
 
V
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
 
G
G
x
A
C
 
S
Q
 
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
M
 
T
G
 
A
E
 
L
Y
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
T
G
 
G
V
 
M
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
V
V
 
V
D
 
N
L
 
Y
N
 
A
Q
 
Q
E
 
S
K
 
S
L
 
T
-
 
A
-
 
A
D
 
D
E
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
A
A
 
E
C
 
I
K
 
I
A
 
A
L
 
N
G
 
G
V
 
G
E
 
E
A
 
A
R
 
I
A
 
A
Y
 
V
L
 
Q
C
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
A
N
 
N
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
D
H
 
Q
M
 
L
V
 
I
A
 
K
Q
 
T
V
 
T
A
 
L
E
 
D
D
 
K
F
 
F
G
 
S
A
 
R
I
 
I
N
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
T
 
L
I
 
L
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
L
A
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
K
K
 
L
M
 
M
I
 
L
E
 
K
L
 
-
Q
 
Q
S
 
K
Q
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
T
S
 
S
I
 
V
S
 
A
-
 
G
R
 
M
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
x
P
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
F
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
|
F
I
 
I
E
 
A
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
E
S
 
N
M
 
L
K
x
N
P
 
A
D
 
E
A
 
P
L
 
I
E
 
L
K
 
Q
M
 
F
T
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
G
S
 
T
V
 
I
A
 
R
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
T
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
F
E
 
N
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

3sj7A Structure of beta-ketoacetyl-coa reductase (fabg) from staphylococcus aureus complex with NADPH (see paper)
41% identity, 98% coverage: 6:252/252 of query aligns to 2:239/239 of 3sj7A

query
sites
3sj7A
K
 
K
V
 
S
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
S
M
 
I
G
 
A
E
 
L
Y
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
E
G
 
G
V
 
Y
K
 
N
L
 
V
A
 
A
L
 
V
-
x
N
V
x
Y
D
x
A
L
x
G
N
x
S
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
A
D
 
E
E
 
A
A
 
V
V
 
V
A
 
E
A
 
E
C
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
D
A
 
S
R
 
F
A
 
A
Y
 
I
L
 
Q
C
x
A
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
D
E
 
A
E
 
D
Q
 
E
V
 
V
T
 
K
H
 
A
M
 
M
V
 
I
A
 
K
Q
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
S
D
 
Q
F
 
F
G
 
G
A
 
S
I
 
L
N
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
Q
E
 
E
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
x
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
C
T
 
I
R
 
Q
E
 
K
V
 
A
A
 
T
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
I
 
L
E
 
R
L
 
-
Q
 
Q
S
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
V
R
 
G
A
 
A
-
 
V
G
 
G
N
 
N
I
 
P
G
 
G
Q
|
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
L
T
 
T
V
 
K
V
 
S
W
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
V
T
 
S
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
D
S
 
E
M
 
L
K
 
K
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
K
 
Q
M
 
M
T
 
L
S
 
T
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
A
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
D
A
 
T
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
T
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
K
-
 
A
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

Q8N4T8 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase; 3-ketoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase beta subunit; KAR beta subunit; Carbonyl reductase family member 4; CBR4; Quinone reductase CBR4; Short chain dehydrogenase/reductase family 45C member 1; EC 1.1.1.100; EC 1.6.5.10 from Homo sapiens (Human) (see 4 papers)
41% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 2:235/237 of Q8N4T8

query
sites
Q8N4T8
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
C
I
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
V
G
 
A
E
 
Q
Y
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
D
 
A
L
x
R
N
|
N
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
E
 
G
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
G
A
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
G
E
 
D
A
 
H
R
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
S
C
 
C
N
x
D
V
 
V
A
 
A
N
 
K
E
 
E
E
 
H
Q
 
D
V
 
V
T
 
Q
H
 
N
M
 
T
V
 
F
A
 
E
Q
 
E
V
x
L
A
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
V
N
 
N
G
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
V
K
 
R
V
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
E
E
 
D
M
 
M
S
 
V
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
-
S
 
S
V
 
Q
I
 
L
D
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
V
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
T
 
C
R
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
R
K
 
T
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
L
 
-
Q
 
Q
S
 
Q
Q
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
S
 
G
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
S
G
 
G
Q
 
Q
A
 
S
N
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
D
 
F
T
 
S
V
 
R
V
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
|
R
Y
x
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
x
V
E
x
H
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
K
S
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
D
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
T
A
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
H
S
 
A
V
 
V
A
 
V
Y
 
F
I
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
L
 
L

4cqmF Crystal structure of heterotetrameric human ketoacyl reductase complexed with NAD and NADP (see paper)
41% identity, 98% coverage: 5:252/252 of query aligns to 6:239/241 of 4cqmF

query
sites
4cqmF
D
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
C
I
 
A
I
 
V
T
 
F
G
|
G
G
 
G
C
 
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
V
G
 
A
E
 
Q
Y
 
L
L
 
M
A
 
A
A
 
R
K
 
K
G
 
G
V
 
Y
K
 
R
L
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
D
x
A
L
x
R
N
|
N
Q
 
-
E
 
-
K
 
-
L
 
L
D
 
E
E
 
G
A
 
A
V
 
K
A
 
A
A
 
A
C
 
A
K
 
G
A
 
D
L
 
L
G
 
G
V
 
G
E
 
D
A
 
H
R
 
L
A
 
A
Y
 
F
L
 
S
C
 
C
N
x
D
V
|
V
A
 
A
N
 
K
E
 
E
E
 
H
Q
 
D
V
 
V
T
 
Q
H
 
N
M
 
T
V
 
F
A
 
E
Q
 
E
V
 
L
A
 
E
E
 
K
D
 
H
F
 
L
G
 
G
A
 
R
I
 
V
N
 
N
G
 
F
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
x
A
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
V
K
 
R
V
 
T
K
 
K
D
 
T
G
 
E
E
 
D
M
 
M
S
 
V
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
-
Q
 
-
S
 
S
V
 
Q
I
 
L
D
 
H
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
L
G
 
G
V
 
S
F
 
M
L
 
L
C
 
T
T
 
C
R
 
K
E
 
A
V
 
A
A
 
M
A
 
R
K
 
T
M
 
M
I
 
I
E
 
Q
L
 
-
Q
 
Q
S
 
Q
Q
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
I
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
K
G
 
G
N
 
N
I
 
S
G
 
G
Q
|
Q
A
 
S
N
 
V
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
V
A
 
G
D
 
F
T
 
S
V
 
R
V
 
A
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
R
Y
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
x
V
E
 
H
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
L
 
K
S
 
D
M
 
L
K
 
K
P
 
E
D
 
E
A
 
H
L
 
L
E
 
K
K
 
K
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
N
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
E
P
 
T
A
 
I
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
H
S
 
A
V
 
V
A
 
V
Y
 
F
I
 
L
L
 
L
E
 
E
N
 
S
D
 
P
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
H
I
 
V
L
 
L
E
 
V
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
Q
L
 
L

4nbwA Crystal structure of fabg from plesiocystis pacifica (see paper)
43% identity, 97% coverage: 6:250/252 of query aligns to 2:249/253 of 4nbwA

query
sites
4nbwA
K
 
R
V
 
V
I
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
 
A
Q
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
T
G
 
A
E
 
L
Y
 
E
L
 
F
A
 
A
A
 
Q
K
 
A
G
 
G
V
 
Y
K
 
H
L
 
V
A
 
V
L
 
A
V
 
W
D
|
D
L
|
L
N
 
A
Q
 
E
E
 
E
K
 
A
L
 
G
D
 
A
E
 
A
A
 
L
V
 
I
A
 
A
A
 
E
C
 
I
K
 
A
A
 
D
L
 
A
G
 
G
V
 
G
E
 
S
A
 
A
R
 
D
A
 
F
Y
 
A
L
 
R
C
x
V
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
A
E
 
A
E
 
E
Q
 
S
V
 
V
T
 
E
H
 
A
M
 
A
V
 
V
A
 
A
Q
 
E
V
 
I
A
 
I
E
 
A
D
 
E
F
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
V
N
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
L
R
 
H
D
 
D
G
 
G
L
 
Q
T
 
L
I
 
V
K
 
K
V
 
V
K
 
K
D
 
G
G
 
G
E
 
E
M
 
V
-
 
V
S
 
K
K
 
K
M
 
M
S
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
W
 
F
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
S
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
Q
E
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
P
K
 
H
M
 
M
I
 
I
E
 
A
L
 
A
Q
 
K
S
 
-
Q
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
L
N
 
N
I
 
A
S
 
S
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
Y
G
 
G
N
 
N
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
S
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
M
T
 
T
V
 
K
V
 
V
W
 
W
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
G
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
E
M
 
M
T
 
V
L
 
Q
S
 
Q
M
 
M
K
 
P
P
 
E
D
 
R
A
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
A
M
 
M
T
 
V
S
 
A
G
 
R
I
 
T
P
 
P
L
 
V
R
 
G
R
 
R
M
 
I
G
 
G
K
 
D
P
 
P
A
 
V
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
R
S
 
A
V
 
Y
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
I
T
 
S
G
 
G
R
 
T
I
 
T
L
 
L
E
 
S
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
41% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
Q
 
T
L
 
L
Q
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
M
 
I
G
 
A
E
 
I
Y
 
N
L
 
L
A
 
A
A
 
K
K
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
N
L
 
I
A
 
F
L
 
F
-
x
N
V
x
Y
D
x
N
L
x
G
N
x
S
Q
 
P
E
 
E
K
 
A
L
 
A
D
 
E
E
 
E
A
 
T
V
 
A
A
 
K
A
 
L
C
 
V
K
 
A
A
 
E
L
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
V
R
 
E
A
 
A
Y
 
M
L
 
K
C
 
A
N
|
N
V
|
V
A
 
A
N
 
I
E
 
A
E
 
E
Q
 
D
V
 
V
T
 
D
H
 
A
M
 
F
V
 
F
A
 
K
Q
 
Q
V
 
A
A
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
V
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
D
E
 
E
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
D
S
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
T
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
S
A
 
R
K
 
T
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
-
Q
 
Q
S
 
R
Q
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
A
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
L
A
 
I
G
 
G
N
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
|
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
L
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
T
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
P
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
T
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
D
S
 
K
M
 
L
K
 
D
P
 
E
D
 
K
A
 
T
L
 
K
E
 
E
K
 
A
M
 
M
T
 
L
S
 
A
G
 
Q
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
A
M
 
Y
G
 
G
K
 
T
P
 
T
A
 
E
E
 
D
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
D
-
 
A
-
 
S
D
 
K
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
L
E
 
S
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
37% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 4:247/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
Q
 
K
L
 
L
Q
 
A
D
 
S
K
 
K
V
 
T
I
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
 
A
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
F
A
 
G
M
 
I
G
 
A
E
 
Q
Y
 
V
L
 
L
A
 
A
A
 
R
K
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
R
L
 
V
A
 
I
L
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
R
N
 
D
Q
 
A
E
 
H
K
 
G
L
 
-
D
 
E
E
 
A
A
 
A
V
 
A
A
 
A
A
 
S
C
 
L
K
 
R
A
 
E
L
 
S
G
 
G
V
 
A
E
 
Q
A
 
A
R
 
L
A
 
F
Y
 
I
L
 
S
C
|
C
N
 
N
V
x
I
A
 
A
N
 
E
E
 
K
E
 
T
Q
 
Q
V
 
V
T
 
E
H
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
S
Q
 
Q
V
 
A
A
 
E
E
 
E
D
 
A
F
 
F
G
 
G
A
 
P
I
 
V
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
N
R
 
R
D
 
D
G
 
A
L
 
M
T
 
-
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
L
S
 
H
K
 
K
M
 
L
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
D
W
 
W
Q
 
D
S
 
T
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
|
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
T
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
M
R
 
Q
E
 
Q
V
 
A
A
 
A
A
 
I
K
 
R
M
 
M
I
 
R
E
 
E
L
 
-
Q
 
R
S
 
G
Q
 
A
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
A
S
 
S
R
 
W
A
 
L
G
 
G
N
 
N
I
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
V
A
 
G
D
 
M
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
A
A
 
C
K
 
R
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
K
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
D
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
|
T
L
 
R
S
 
G
M
 
V
K
 
P
P
 
E
D
 
N
A
 
V
L
 
W
E
 
Q
K
 
I
M
 
M
T
 
V
S
 
S
G
 
K
I
 
I
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
Y
M
 
A
G
 
G
K
 
E
P
 
A
A
 
K
E
 
D
I
 
V
A
 
G
H
 
E
S
 
C
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
G
-
 
A
-
 
R
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
V
L
 
I
E
 
N
L
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
V
L
 
L

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
39% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 2:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
Q
 
K
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
C
 
A
Q
x
K
G
|
G
L
|
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
L
Y
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
K
 
E
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
A
V
 
G
D
|
D
L
|
L
N
 
G
Q
 
D
E
 
L
K
 
T
L
 
Y
D
 
S
E
 
H
A
 
P
V
 
-
A
 
-
A
 
-
C
 
-
K
 
-
A
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
N
A
 
V
R
 
E
A
 
G
Y
 
M
L
 
Y
C
x
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
D
E
 
V
E
 
T
Q
 
G
V
 
V
T
 
E
H
 
K
M
 
F
V
 
Y
A
 
Q
Q
 
S
V
 
V
A
 
I
E
 
D
D
 
K
F
 
Y
G
 
G
A
 
K
I
 
I
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
L
 
T
R
 
K
D
 
D
G
 
A
L
 
M
T
 
T
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
S
 
R
K
 
K
M
 
M
S
 
T
L
 
E
A
 
A
Q
 
Q
W
 
W
Q
 
D
S
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
N
C
 
L
T
 
T
R
 
R
E
 
L
V
 
V
A
 
G
A
 
P
K
 
Q
M
 
M
I
 
-
E
 
Q
L
 
T
Q
 
N
S
 
G
Q
 
Y
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
V
A
 
F
G
 
G
N
 
N
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
L
T
 
T
V
 
M
V
 
T
W
 
W
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
L
Y
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
|
I
E
 
M
T
|
T
E
 
D
M
 
I
T
 
L
L
 
K
S
 
T
M
 
V
K
 
P
P
 
Q
D
 
D
A
 
L
L
 
L
E
 
D
K
 
K
M
 
F
T
 
A
S
 
A
G
 
L
I
 
T
P
 
M
L
 
L
R
 
N
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
K
S
 
V
V
 
A
A
 
L
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
D
-
 
A
-
 
S
Y
 
Y
Y
 
V
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
T
L
 
I
E
 
N
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
R
L
 
L

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
Q
 
N
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
 
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
G
V
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
Q
 
E
E
 
S
K
 
G
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
K
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
D
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
M
L
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
N
E
 
P
E
 
E
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
H
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
Q
 
A
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
G
I
 
V
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
E
E
 
E
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
S
S
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
R
K
 
G
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
-
Q
 
K
S
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
F
T
 
T
V
 
K
V
 
S
W
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
L
 
K
S
 
A
M
 
L
K
 
N
P
 
D
D
 
E
A
 
Q
L
 
R
E
 
T
K
 
A
M
 
T
T
 
L
S
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
A
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

7emgB Carbonyl reductase variant 4 (r123c/l209p/f183y/v61k) from serratia marcescens complexed with NADP+ (see paper)
36% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 1:242/243 of 7emgB

query
sites
7emgB
Q
 
S
L
 
F
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
V
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
T
L
 
F
A
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
-
L
 
I
V
 
G
D
 
T
L
 
A
N
x
T
Q
 
S
E
 
E
K
 
S
L
 
G
D
 
A
E
 
E
A
 
A
V
 
I
A
 
S
A
 
G
C
 
Y
K
 
-
A
 
-
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
F
L
 
M
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
K
N
 
D
E
 
A
E
 
Q
Q
 
S
V
 
I
T
 
D
H
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
A
Q
 
S
V
 
I
A
 
R
E
 
A
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
I
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
D
E
 
E
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
E
S
 
D
V
 
I
I
 
L
D
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
M
A
 
C
K
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
-
Q
 
K
S
 
R
Q
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
A
 
G
D
 
F
T
 
S
V
 
K
V
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
Y
I
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
R
S
 
A
M
 
L
K
 
T
P
 
D
D
 
D
A
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
M
 
I
T
 
L
S
 
S
G
 
S
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
N
R
 
R
M
 
P
G
 
G
K
 
D
P
 
A
A
 
K
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
E
-
 
A
-
 
G
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
41% identity, 99% coverage: 1:250/252 of query aligns to 1:237/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
M
 
L
Q
 
P
L
 
L
Q
 
T
D
 
D
K
 
R
V
 
I
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
L
Y
 
E
L
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
A
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
N
D
 
Y
L
x
A
N
x
S
Q
x
S
E
 
A
K
 
G
L
 
A
D
 
A
E
 
D
A
 
E
V
 
V
A
 
V
A
 
A
C
 
A
K
 
I
A
 
A
L
 
A
G
 
A
V
 
G
E
 
G
A
 
E
R
 
A
A
 
F
Y
 
A
L
 
V
-
 
K
C
x
A
N
x
D
V
|
V
A
 
S
N
 
Q
E
 
E
E
 
S
Q
 
E
V
 
V
T
 
E
H
 
A
M
 
L
V
 
F
A
 
A
Q
 
A
V
 
V
A
 
I
E
 
E
D
 
R
F
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
L
N
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
T
L
 
L
T
 
L
I
 
L
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
R
G
 
D
E
 
D
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
Q
S
 
S
V
 
V
I
 
L
D
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
L
 
L
C
 
C
T
 
S
R
 
R
E
 
-
V
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
M
 
I
I
 
M
E
 
L
L
 
K
Q
 
Q
S
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
E
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
 
P
G
 
G
Q
|
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
L
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
V
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
L
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
A
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
L
 
-
S
 
-
M
 
-
K
 
-
P
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
S
M
 
L
T
 
L
S
 
E
G
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
G
R
 
R
M
 
Y
G
 
G
K
 
E
P
 
A
A
 
A
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
G
S
 
V
V
 
V
A
 
R
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
A
N
 
D
D
 
P
-
 
A
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
Q
I
 
V
L
 
I
E
 
N
L
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
L

5vmlA Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b with bound NADP
37% identity, 98% coverage: 6:252/252 of query aligns to 3:244/245 of 5vmlA

query
sites
5vmlA
K
 
R
V
 
I
I
 
A
I
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
C
 
M
Q
x
G
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
T
A
 
S
M
 
I
G
 
C
E
 
Q
Y
 
R
L
 
L
A
 
H
A
 
K
K
 
D
G
 
G
V
 
F
K
 
R
L
 
V
-
 
V
A
 
A
L
 
G
V
x
C
D
x
G
L
 
P
N
 
N
Q
 
S
E
 
P
K
x
R
L
 
R
D
 
V
E
 
K
A
 
W
V
 
L
A
 
E
A
 
D
C
 
Q
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
G
V
 
F
E
 
D
A
 
F
R
 
Y
A
 
A
Y
 
S
L
 
E
C
x
G
N
|
N
V
|
V
A
 
G
N
 
D
E
 
W
E
 
D
Q
 
S
V
 
T
T
 
K
H
 
Q
M
 
A
V
 
F
A
 
D
Q
 
K
V
 
V
A
 
K
E
 
A
D
 
E
F
 
V
G
 
G
A
 
E
I
 
I
N
 
D
G
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
V
L
 
V
T
 
-
I
 
-
K
 
-
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
F
S
 
R
K
 
K
M
 
M
S
 
T
L
 
R
A
 
E
Q
 
D
W
 
W
Q
 
Q
S
 
A
V
 
V
I
 
I
D
 
D
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
L
F
 
F
L
 
N
C
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
Q
V
 
V
A
 
I
A
 
D
K
 
G
M
 
M
I
 
V
E
 
E
L
 
-
Q
 
R
S
 
G
Q
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
I
S
 
S
S
|
S
I
 
V
S
 
N
-
 
G
R
 
Q
A
 
K
G
 
G
N
 
Q
I
 
F
G
 
G
Q
 
Q
A
 
T
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
T
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
I
A
 
H
A
 
G
D
 
F
T
 
T
V
 
M
V
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
Q
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
T
Y
 
K
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
F
 
Y
I
|
I
E
 
G
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
V
L
 
K
S
 
A
M
 
I
K
 
R
P
 
P
D
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
K
 
K
M
 
I
T
 
V
S
 
A
G
 
T
I
 
I
P
 
P
L
 
V
R
 
R
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
S
P
 
P
A
 
D
E
 
E
I
 
I
A
 
G
H
 
S
S
 
I
V
 
V
A
 
A
Y
 
W
I
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
E
E
 
E
N
 
S
D
 
G
Y
 
F
Y
 
S
T
 
T
G
 
G
R
 
A
I
 
D
L
 
F
E
 
S
L
 
L
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
L
R
 
H
L
 
M

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 4:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
M
 
M
Q
 
N
L
 
L
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
L
L
 
L
A
 
A
A
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
G
V
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
Q
 
E
E
 
S
K
 
G
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
K
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
D
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
M
L
 
A
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
N
E
 
P
E
 
E
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
H
 
A
M
 
V
V
 
L
A
 
K
Q
 
A
V
 
I
A
 
T
E
 
D
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
G
I
 
V
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
E
G
 
E
E
 
E
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
S
S
 
D
V
 
I
I
 
M
D
 
E
V
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
V
 
I
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
R
K
 
G
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
-
Q
 
K
S
 
R
Q
 
Q
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
V
S
x
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
|
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
A
 
G
D
 
F
T
 
T
V
 
K
V
 
S
W
 
M
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
 
M
T
 
N
L
 
D
S
 
E
M
 
Q
K
 
R
P
 
T
D
 
A
A
 
T
L
 
L
E
 
A
K
 
Q
M
 
-
T
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
D
P
 
P
A
 
R
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
P
E
 
E
N
 
A
D
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 1:243/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
Q
 
S
L
 
F
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
T
L
 
L
A
 
V
A
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
G
V
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
Q
 
E
E
 
S
K
 
G
L
 
-
D
 
-
E
 
-
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
K
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
L
L
 
M
C
x
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
D
E
 
P
E
 
A
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
H
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
E
Q
 
N
V
 
V
A
 
R
E
 
A
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
V
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
D
E
 
E
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
M
A
 
R
K
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
-
Q
 
K
S
 
R
Q
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
 
A
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
A
 
G
D
 
F
T
 
S
V
 
K
V
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
 
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
R
S
 
A
M
 
L
K
 
T
P
 
D
D
 
E
A
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
M
 
T
T
 
L
S
 
A
G
 
A
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
T
P
 
P
A
 
N
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
S
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
-
 
S
-
 
D
E
 
E
N
 
A
D
 
S
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
35% identity, 100% coverage: 1:252/252 of query aligns to 1:243/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
M
 
M
Q
 
N
L
 
F
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
C
x
S
Q
x
R
G
 
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
G
V
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
Q
 
E
E
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
N
E
 
G
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
K
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
L
L
 
M
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
D
E
 
P
E
 
A
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
H
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
E
Q
 
K
V
 
I
A
 
R
E
 
A
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
V
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
E
E
 
E
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
M
A
 
R
K
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
-
Q
 
K
S
 
R
Q
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
x
A
A
|
A
A
|
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
A
 
G
D
 
F
T
 
S
V
 
K
V
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
R
S
 
A
M
 
L
K
 
S
P
 
D
D
 
D
A
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
M
 
I
T
 
L
S
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
G
P
 
A
A
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
E
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
x
E
I
 
T
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

9clyB Crystal structure of the 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, cylg, from streptococcus agalactiae 2603v/r
38% identity, 97% coverage: 6:250/252 of query aligns to 4:239/242 of 9clyB

query
sites
9clyB
K
 
K
V
 
V
I
 
A
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
C
 
T
Q
x
R
G
|
G
L
x
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
G
 
T
E
 
K
Y
 
E
L
 
L
A
 
Y
A
 
K
K
 
E
G
 
G
V
 
Y
K
 
K
-
 
V
L
 
I
A
 
A
L
 
I
V
x
Y
D
x
N
L
x
S
N
 
N
Q
 
D
E
 
A
K
 
K
L
 
A
D
 
R
E
 
A
A
 
L
V
 
Q
A
 
E
A
 
E
C
 
L
K
 
P
A
 
K
L
 
L
G
 
D
V
 
V
E
 
-
A
 
-
R
 
-
A
 
-
Y
 
Y
L
 
K
C
|
C
N
|
N
V
x
I
A
 
S
N
 
D
E
 
A
E
 
K
Q
 
A
V
 
V
T
 
Q
H
 
K
M
 
L
V
 
V
A
 
T
Q
 
K
V
 
I
A
 
F
E
 
R
D
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
G
I
 
I
N
 
D
G
 
C
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
L
 
V
R
 
R
D
 
D
G
 
G
L
 
F
T
 
F
I
 
L
K
 
M
V
 
-
K
 
-
D
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
M
S
 
S
L
 
K
A
 
E
Q
 
K
W
 
W
Q
 
M
S
 
D
V
 
V
I
 
I
D
 
N
V
 
I
N
 
N
L
 
I
T
 
M
G
 
G
V
 
L
F
 
V
L
 
N
C
 
M
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
L
A
 
K
K
 
I
M
 
M
I
 
K
E
 
A
L
 
K
Q
 
R
S
 
I
Q
 
Q
G
 
G
A
 
K
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
S
S
|
S
I
 
T
S
 
S
R
 
G
-
 
I
A
 
A
G
 
G
N
 
Q
I
 
I
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
S
A
 
A
A
 
T
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
I
A
 
I
A
 
S
D
 
I
T
 
T
V
 
K
V
 
T
W
 
L
A
 
A
K
 
K
E
 
E
L
 
F
A
 
A
R
 
S
Y
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
I
A
 
N
G
 
C
V
 
V
A
 
S
P
 
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
|
T
E
 
D
M
|
M
T
 
T
-
 
N
-
 
E
L
 
L
S
 
Q
M
 
N
K
 
K
P
 
E
D
 
E
A
 
L
L
 
K
E
 
E
K
 
H
M
 
L
T
 
-
S
 
-
G
 
-
I
 
I
P
 
P
L
 
L
R
 
K
R
 
R
M
 
F
G
 
G
K
 
Q
P
 
P
A
 
E
E
 
E
I
 
V
A
 
A
H
 
W
S
 
L
V
 
V
A
 
S
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
E
-
 
K
-
 
A
D
 
N
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
 
K
I
 
N
L
 
I
E
 
V
L
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
L
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 100% coverage: 2:252/252 of query aligns to 1:242/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
Q
 
N
L
 
F
Q
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
I
I
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
C
x
S
Q
x
R
G
|
G
L
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
G
 
A
E
 
E
Y
 
T
L
 
L
A
 
A
A
 
A
K
 
R
G
 
G
V
 
A
K
 
K
L
 
V
A
 
I
L
 
G
V
 
T
D
 
A
L
x
T
N
 
S
Q
 
E
E
 
-
K
 
-
L
 
-
D
 
N
E
 
G
A
 
A
V
 
Q
A
 
A
A
 
I
C
 
S
K
 
D
A
 
Y
L
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
N
A
 
G
R
 
K
A
 
G
Y
 
L
L
 
M
C
 
L
N
|
N
V
|
V
A
 
T
N
 
D
E
 
P
E
 
A
Q
 
S
V
 
I
T
 
E
H
 
S
M
 
V
V
 
L
A
 
E
Q
 
K
V
 
I
A
 
R
E
 
A
D
 
E
F
 
F
G
 
G
A
 
E
I
 
V
N
 
D
G
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
L
 
T
R
 
R
D
 
D
G
 
N
L
 
L
T
 
L
I
 
M
K
 
R
V
 
M
K
 
K
D
 
D
G
 
E
E
|
E
M
 
-
S
 
-
K
 
-
M
 
-
S
 
-
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
W
 
W
Q
 
N
S
 
D
V
 
I
I
 
I
D
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
V
 
V
F
 
F
L
 
R
C
 
L
T
 
S
R
 
K
E
 
A
V
 
V
A
 
M
A
 
R
K
 
A
M
 
M
I
 
M
E
 
K
L
 
-
Q
 
K
S
 
R
Q
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
I
 
V
-
 
V
S
 
G
R
 
T
A
 
M
G
 
G
N
 
N
I
 
G
G
 
G
Q
|
Q
A
 
A
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
A
 
G
D
 
F
T
 
S
V
 
K
V
 
S
W
 
L
A
 
A
K
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
A
R
 
S
Y
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
A
 
N
G
 
V
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
F
 
F
I
|
I
E
 
E
T
 
T
E
 
D
M
 
M
T
 
T
L
 
R
S
 
A
M
 
L
K
 
S
P
 
D
D
 
D
A
 
Q
L
 
R
E
 
A
K
 
G
M
 
I
T
 
L
S
 
A
G
 
Q
I
 
V
P
 
P
L
 
A
R
 
G
R
 
R
M
 
L
G
 
G
K
 
G
P
 
A
A
 
Q
E
 
E
I
 
I
A
 
A
H
 
N
S
 
A
V
 
V
A
 
A
Y
 
F
I
 
L
L
 
A
E
 
S
N
 
D
D
 
E
-
 
A
-
 
A
Y
 
Y
Y
 
I
T
 
T
G
 
G
R
x
E
I
x
T
L
 
L
E
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
L
 
M
R
 
Y
L
 
M

Query Sequence

>WP_090447608.1 NCBI__GCF_900100495.1:WP_090447608.1
MQLQDKVIIITGGCQGLGRAMGEYLAAKGVKLALVDLNQEKLDEAVAACKALGVEARAYL
CNVANEEQVTHMVAQVAEDFGAINGLVNNAGILRDGLTIKVKDGEMSKMSLAQWQSVIDV
NLTGVFLCTREVAAKMIELQSQGAIVNISSISRAGNIGQANYSAAKAGVAADTVVWAKEL
ARYGIRVAGVAPGFIETEMTLSMKPDALEKMTSGIPLRRMGKPAEIAHSVAYILENDYYT
GRILELDGGLRL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory