SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_090561024.1 NCBI__GCF_900101615.1:WP_090561024.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
36% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 2:255/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
V
V
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
 
T
G
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
M
 
I
A
 
A
D
 
T
G
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
A
C
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
I
F
 
V
L
 
L
C
 
N
D
 
G
V
x
F
D
 
G
Q
 
D
E
 
A
A
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
P
 
H
Y
 
G
P
 
V
S
 
K
M
 
V
V
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
G
A
 
A
D
 
D
M
x
L
E
 
S
S
 
K
V
 
G
E
 
E
G
 
A
C
 
V
E
 
R
G
 
G
F
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
R
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
L
V
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
F
T
 
P
P
 
T
E
 
E
A
 
K
L
 
W
S
 
D
R
 
A
T
 
I
L
 
L
K
 
A
I
x
L
D
x
N
L
 
L
E
 
S
A
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
H
C
 
G
A
 
T
R
 
A
R
 
A
A
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
|
S
A
 
A
A
x
H
G
 
G
R
 
L
F
 
V
G
 
A
F
 
S
P
 
A
L
 
N
R
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
T
G
 
A
P
 
G
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
G
 
G
L
x
W
V
|
V
A
 
R
G
x
T
D
 
P
R
 
L
I
x
V
R
 
E
R
 
K
V
x
Q
L
 
I
E
 
S
A
 
A
K
x
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
K
N
 
N
G
 
G
-
 
V
-
 
D
R
 
Q
S
 
E
F
 
T
A
 
A
E
 
A
Q
 
R
E
 
E
A
 
L
E
 
L
A
 
S
L
 
E
R
 
K
P
 
Q
V
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
C
 
-
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
A
 
G
N
 
G
M
 
T
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
F
 
A
G
 
A
A
 
A
T
 
Q
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
36% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 2:255/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
V
V
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
T
A
 
G
G
 
S
A
 
T
G
 
S
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
M
 
I
A
 
A
D
 
T
G
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
A
C
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
I
F
 
V
L
 
L
C
 
N
D
 
G
V
 
F
D
 
G
Q
 
D
E
 
A
A
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
P
 
H
Y
 
G
P
 
V
S
 
K
M
 
V
V
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
G
A
 
A
D
 
D
M
 
L
E
 
S
S
 
K
V
 
G
E
 
E
G
 
A
C
 
V
E
 
R
G
 
G
F
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
R
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
L
V
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
F
T
 
P
P
 
T
E
 
E
A
 
K
L
 
W
S
 
D
R
 
A
T
 
I
L
 
L
K
 
A
I
 
L
D
x
N
L
 
L
E
 
S
A
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
H
C
 
G
A
 
T
R
 
A
R
 
A
A
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
|
S
A
 
A
A
 
H
G
 
G
R
 
L
F
 
V
G
 
A
F
 
S
P
 
A
L
 
N
R
 
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
T
G
 
A
P
 
G
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
 
P
G
 
G
L
 
W
V
 
V
A
 
R
G
 
T
D
 
P
R
 
L
I
 
V
R
 
E
R
 
K
V
 
Q
L
 
I
E
 
S
A
 
A
K
x
L
A
 
A
Q
 
E
A
 
K
N
 
N
G
 
G
-
 
V
-
 
D
R
 
Q
S
 
E
F
 
T
A
 
A
E
 
A
Q
 
R
E
 
E
A
 
L
E
 
L
A
 
S
L
 
E
R
 
K
P
 
Q
V
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
C
 
-
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
A
 
G
N
 
G
M
 
T
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
F
 
A
G
 
A
A
 
A
T
 
Q
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
39% identity, 95% coverage: 10:249/253 of query aligns to 8:236/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
V
 
V
A
 
L
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
 
A
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
I
A
 
A
D
 
Q
G
 
A
F
 
F
A
 
A
S
 
R
C
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
L
V
 
V
F
 
A
L
 
L
C
 
C
D
|
D
V
x
L
D
x
R
-
 
P
-
 
E
-
 
G
Q
 
K
E
 
E
A
 
V
L
 
A
A
 
E
A
 
A
C
 
I
P
 
G
Y
 
G
P
 
A
S
 
F
M
 
F
V
 
Q
A
x
V
D
|
D
M
x
L
E
 
E
S
 
D
V
 
E
E
 
R
G
 
E
C
 
R
E
 
V
G
 
R
F
 
F
V
 
V
D
 
E
E
 
E
A
 
A
V
 
A
A
 
Y
R
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
I
|
I
A
 
A
G
 
A
P
 
P
T
 
G
A
 
S
R
 
A
V
 
L
E
 
T
D
 
V
V
 
R
T
 
L
P
 
P
E
 
E
A
 
-
L
 
W
S
 
R
R
 
R
T
 
V
L
 
L
K
 
E
I
 
V
D
 
N
L
 
L
E
 
T
A
 
A
M
 
P
F
 
M
H
 
H
C
 
L
A
 
S
R
 
A
R
 
L
A
 
A
V
 
A
P
 
R
A
 
E
L
 
M
R
 
R
A
 
K
A
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
L
x
V
S
 
A
S
|
S
A
 
V
A
 
Q
G
 
G
R
 
L
F
 
F
G
 
A
F
 
E
P
 
Q
L
 
E
R
x
N
S
 
A
P
 
A
Y
|
Y
A
 
N
A
 
A
A
 
S
K
|
K
W
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
V
G
 
N
F
 
L
T
 
T
K
 
R
S
 
S
L
 
L
A
 
A
I
 
L
E
 
D
L
 
L
G
 
A
P
 
P
E
 
L
G
 
R
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
A
V
x
I
A
 
A
G
x
T
D
 
E
R
 
-
I
 
-
R
 
-
R
x
A
V
|
V
L
 
L
E
 
E
A
 
A
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
F
 
I
A
 
A
E
 
R
Q
 
R
E
 
D
A
 
W
E
 
E
A
 
D
L
 
L
R
 
H
P
 
-
V
 
-
S
 
A
L
 
L
R
 
R
C
 
R
Y
 
L
V
 
G
T
 
K
P
 
P
Q
 
E
D
 
E
I
 
V
A
 
A
N
 
E
M
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
E
F
 
K
G
 
A
A
 
S
T
 
F
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
S
 
I
L
 
L
S
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
G
M
 
M

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
34% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 2:255/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
K
V
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
x
T
G
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
T
G
 
E
F
 
L
A
 
A
S
 
K
C
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
F
 
V
L
 
I
C
 
N
D
 
G
V
x
F
D
 
G
Q
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
K
A
 
F
A
 
G
C
 
V
P
 
K
Y
 
A
P
 
Y
S
 
Y
M
 
L
V
 
N
A
 
A
D
|
D
M
x
L
E
 
S
S
 
D
V
 
A
E
 
Q
G
 
A
C
 
T
E
 
R
G
 
D
F
 
F
V
 
I
D
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
F
T
 
P
P
 
V
E
 
D
A
 
K
L
 
W
S
 
N
R
 
A
T
 
I
L
 
I
K
 
A
I
x
L
D
x
N
L
 
L
E
 
S
A
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
H
C
 
G
A
 
T
R
 
A
R
 
A
A
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
I
L
 
M
R
 
Q
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
A
S
|
S
A
 
A
A
x
H
G
 
G
R
 
L
F
 
V
G
 
A
F
 
S
P
 
V
L
 
N
R
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
A
P
 
G
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
W
V
|
V
A
 
R
G
x
T
D
 
P
R
x
L
I
x
V
R
 
E
R
 
K
V
x
Q
L
 
I
E
 
E
A
 
A
K
x
I
A
 
S
Q
 
Q
A
 
Q
N
 
K
G
 
G
R
 
I
S
 
D
F
 
I
-
 
E
-
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
R
E
 
E
A
 
L
E
 
L
A
 
A
L
 
E
R
 
K
P
 
Q
V
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
C
 
-
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
A
 
G
N
 
G
M
 
A
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
A
F
 
A
G
 
A
A
 
D
T
 
Q
I
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
34% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 2:255/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
K
V
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
x
T
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
T
G
 
E
F
 
L
A
 
A
S
 
K
C
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
F
 
V
L
 
I
C
 
N
D
 
G
V
x
F
D
 
G
Q
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
K
A
 
F
A
 
G
C
 
V
P
 
K
Y
 
A
P
 
Y
S
 
Y
M
 
L
V
 
N
A
|
A
D
|
D
M
x
L
E
 
S
S
 
D
V
 
A
E
 
Q
G
 
A
C
 
T
E
 
R
G
 
D
F
 
F
V
 
I
D
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
F
T
 
P
P
 
V
E
 
D
A
 
K
L
 
W
S
 
N
R
 
A
T
 
I
L
 
I
K
 
A
I
x
L
D
x
N
L
 
L
E
 
S
A
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
H
C
 
G
A
 
T
R
 
A
R
 
A
A
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
I
L
 
M
R
 
Q
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
|
S
A
 
A
A
x
H
G
 
G
R
 
L
F
 
V
G
 
A
F
 
S
P
 
V
L
 
N
R
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
A
P
 
G
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
W
V
|
V
A
 
R
G
x
T
D
 
P
R
x
L
I
x
V
R
 
E
R
 
K
V
x
Q
L
 
I
E
 
E
A
 
A
K
x
I
A
 
S
Q
 
Q
A
 
Q
N
 
K
G
 
G
R
 
I
S
 
D
F
 
I
-
 
E
-
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
R
E
 
E
A
 
L
E
 
L
A
 
A
L
 
E
R
 
K
P
 
Q
V
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
C
 
-
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
A
 
G
N
 
G
M
 
A
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
A
F
 
A
G
 
A
A
 
D
T
 
Q
I
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
34% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 2:255/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
K
V
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
x
T
G
 
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
T
G
 
E
F
 
L
A
 
A
S
 
K
C
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
F
 
V
L
 
I
C
 
N
D
 
G
V
x
F
D
 
G
Q
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
K
A
 
F
A
 
G
C
 
V
P
 
K
Y
 
A
P
 
Y
S
 
Y
M
 
L
V
 
N
A
 
A
D
|
D
M
x
L
E
 
S
S
 
D
V
 
A
E
 
Q
G
 
A
C
 
T
E
 
R
G
 
D
F
 
F
V
 
I
D
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
F
T
 
P
P
 
V
E
 
D
A
 
K
L
 
W
S
 
N
R
 
A
T
 
I
L
 
I
K
 
A
I
x
L
D
x
N
L
 
L
E
 
S
A
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
H
C
 
G
A
 
T
R
 
A
R
 
A
A
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
I
L
 
M
R
 
Q
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
|
S
A
 
A
A
x
H
G
 
G
R
 
L
F
 
V
G
 
A
F
 
S
P
 
V
L
 
N
R
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
A
P
 
G
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
 
P
G
|
G
L
x
W
V
|
V
A
 
R
G
x
T
D
 
P
R
x
L
I
x
V
R
 
E
R
 
K
V
x
Q
L
 
I
E
 
E
A
 
A
K
x
I
A
 
S
Q
 
Q
A
 
Q
N
 
K
G
 
G
R
 
I
S
 
D
F
 
I
-
 
E
-
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
R
E
 
E
A
 
L
E
 
L
A
 
A
L
 
E
R
 
K
P
 
Q
V
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
C
 
-
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
A
 
G
N
 
G
M
 
A
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
A
F
 
A
G
 
A
A
 
D
T
 
Q
I
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
34% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 2:255/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
K
V
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
 
T
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
A
M
 
M
A
 
A
D
 
T
G
 
E
F
 
L
A
 
A
S
 
K
C
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
V
F
 
V
L
 
I
C
 
N
D
 
G
V
x
F
D
 
G
Q
 
Q
-
 
P
-
 
E
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
R
-
 
S
-
 
T
-
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
K
A
 
F
A
 
G
C
 
V
P
 
K
Y
 
A
P
 
Y
S
 
Y
M
 
L
V
 
N
A
 
A
D
|
D
M
x
L
E
 
S
S
 
D
V
 
A
E
 
Q
G
 
A
C
 
T
E
 
R
G
 
D
F
 
F
V
 
I
D
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
A
A
 
E
R
 
A
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
x
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
F
T
 
P
P
 
V
E
 
D
A
 
K
L
 
W
S
 
N
R
 
A
T
 
I
L
 
I
K
 
A
I
x
L
D
x
N
L
 
L
E
 
S
A
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
H
C
 
G
A
 
T
R
 
A
R
 
A
A
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
I
L
 
M
R
 
Q
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
A
S
|
S
A
 
A
A
x
H
G
 
G
R
 
L
F
 
V
G
 
A
F
 
S
P
 
V
L
 
N
R
x
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
N
G
 
A
P
 
G
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
W
V
|
V
A
 
R
G
x
T
D
 
P
R
x
L
I
x
V
R
 
E
R
 
K
V
x
Q
L
 
I
E
 
E
A
 
A
K
x
I
A
 
S
Q
 
Q
A
 
Q
N
 
K
G
 
G
R
 
I
S
 
D
F
 
I
-
 
E
-
 
A
A
 
A
E
 
A
Q
 
R
E
 
E
A
 
L
E
 
L
A
 
A
L
 
E
R
 
K
P
 
Q
V
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
Q
C
 
-
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
A
 
G
N
 
G
M
 
A
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
S
S
 
S
P
 
A
F
 
A
G
 
A
A
 
D
T
 
Q
I
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
L
D
 
D
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:251/253 of query aligns to 2:239/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
R
 
K
L
 
L
D
 
E
G
 
G
L
 
K
R
 
V
V
 
A
A
 
V
I
 
I
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
 
A
G
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
Q
A
 
A
M
 
I
A
 
A
D
 
L
G
 
A
F
 
Y
A
 
A
S
 
E
C
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
F
 
I
L
 
A
C
 
G
D
|
D
V
x
L
D
 
G
Q
 
D
E
 
L
A
 
T
L
 
Y
A
 
S
A
 
H
C
 
P
P
 
N
Y
 
V
P
 
E
S
 
G
M
 
M
V
 
Y
A
x
L
D
x
N
M
x
V
E
 
T
S
 
D
V
 
V
E
 
T
G
 
G
C
 
V
E
 
E
G
 
K
F
 
F
V
 
Y
D
 
Q
E
 
S
A
 
V
V
 
I
A
 
D
R
 
K
L
 
Y
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
A
 
T
G
 
-
P
 
K
T
 
D
A
 
A
R
 
M
V
 
T
E
 
R
D
 
K
V
 
M
T
 
T
P
 
E
E
 
A
A
 
Q
L
 
W
S
 
D
R
 
A
T
 
V
L
 
I
K
 
D
I
 
V
D
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
N
C
 
L
A
 
T
R
 
R
R
 
L
A
 
V
V
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
R
 
Q
A
 
T
A
 
N
G
 
G
G
 
Y
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
S
S
|
S
A
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
V
F
 
F
G
 
G
F
 
N
P
 
I
L
 
G
R
 
Q
S
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
|
K
W
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
M
S
 
T
L
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
F
G
 
A
P
 
L
E
 
K
G
 
G
-
 
A
-
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
A
P
|
P
G
|
G
L
 
Y
V
x
I
A
 
M
G
x
T
D
 
D
R
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
I
L
 
L
E
 
K
A
 
T
K
 
V
A
 
P
Q
 
Q
A
 
D
N
 
L
G
 
L
R
 
D
S
 
K
F
 
F
A
 
A
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
A
L
 
L
R
 
-
P
 
-
V
 
T
S
 
M
L
 
L
R
 
N
C
 
R
Y
 
L
V
 
G
T
 
Q
P
 
P
Q
 
E
D
 
E
I
 
I
A
 
A
N
 
K
M
 
V
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
F
 
D
G
 
A
A
 
S
T
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
I
S
 
N
V
 
V
D
 
N
G
 
G
D
 
G
M
 
M
Q
 
R
V
 
L

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
33% identity, 97% coverage: 5:249/253 of query aligns to 3:245/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
L
 
L
D
 
Q
G
 
G
L
 
K
R
 
V
V
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
x
S
G
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
M
 
I
A
 
A
D
 
I
G
 
N
F
 
L
A
 
A
S
 
K
C
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
I
F
 
F
L
 
F
C
x
N
-
x
Y
-
x
N
-
x
G
-
x
S
-
 
P
D
 
E
V
 
A
D
 
A
Q
 
E
E
 
E
-
 
T
-
 
A
-
 
K
-
 
L
-
 
V
A
 
A
L
 
E
A
 
H
A
 
G
C
 
V
P
 
E
Y
 
V
P
 
E
S
 
A
M
 
M
V
 
K
A
 
A
D
x
N
M
x
V
E
 
A
S
 
I
V
 
A
E
 
E
G
 
D
C
 
V
E
 
D
G
 
A
F
 
F
V
 
F
D
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
I
A
 
E
R
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
|
I
A
 
T
G
 
R
P
 
D
T
 
N
A
 
L
R
 
L
V
 
M
E
 
R
D
 
-
V
 
M
T
 
K
P
 
E
E
 
D
A
 
E
L
 
W
S
 
D
R
 
D
T
 
V
L
 
I
K
 
N
I
|
I
D
 
N
L
 
L
E
 
K
A
 
G
M
 
T
F
 
F
H
 
L
C
 
C
A
 
T
R
 
K
R
 
A
A
 
V
V
 
S
P
 
R
A
 
T
L
 
M
R
 
M
A
 
K
A
 
Q
G
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
M
S
 
A
S
|
S
A
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
F
 
I
G
 
G
F
 
N
P
 
A
L
 
G
R
x
Q
S
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
W
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
T
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
E
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
A
P
|
P
G
 
G
L
 
F
V
x
I
A
 
T
G
x
T
D
 
D
R
 
M
I
 
T
R
 
D
R
 
K
V
 
L
L
 
D
E
 
E
A
 
K
K
 
T
A
 
K
Q
 
E
A
 
A
N
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
F
 
-
A
 
-
E
 
-
Q
 
-
E
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
M
L
 
L
R
 
A
P
 
Q
V
 
I
S
 
P
L
 
L
R
 
G
C
 
A
Y
 
Y
V
 
G
T
 
T
P
 
T
Q
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
M
 
A
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
F
 
A
G
 
S
A
 
K
T
 
Y
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
S
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
G
M
 
M

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
33% identity, 96% coverage: 4:247/253 of query aligns to 4:240/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
D
 
Q
G
 
D
L
 
K
R
 
V
V
 
A
A
 
I
I
 
I
T
 
T
A
x
G
G
 
A
A
 
A
G
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
M
 
A
A
 
A
D
 
R
G
 
V
F
 
F
A
 
M
S
 
K
C
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
F
 
V
L
 
I
C
 
A
D
|
D
V
x
F
D
 
N
Q
 
E
-
 
A
-
 
A
-
 
G
-
 
K
E
 
E
A
 
A
L
 
V
A
 
E
A
 
A
C
 
N
P
 
P
Y
 
G
P
 
V
S
 
V
M
 
F
V
 
I
-
 
R
A
x
V
D
|
D
M
x
V
E
 
S
S
 
D
V
 
R
E
 
E
G
 
S
C
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
L
V
 
V
D
 
E
E
 
N
A
 
V
V
 
A
A
 
E
R
 
R
L
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
A
 
T
G
 
-
P
 
R
T
x
D
A
 
S
R
 
M
V
 
L
E
 
S
D
x
K
V
 
M
T
 
T
P
 
V
E
 
D
A
 
Q
L
 
F
S
 
Q
R
 
Q
T
 
V
L
 
I
K
 
N
I
 
V
D
x
N
L
 
L
E
 
T
A
 
G
M
 
V
F
 
F
H
 
H
C
 
C
A
 
T
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
V
 
L
P
 
P
A
 
Y
L
 
M
R
 
A
A
 
E
A
 
Q
G
 
G
G
 
K
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
T
S
 
S
S
|
S
A
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
F
 
Y
G
 
G
F
x
N
P
x
V
L
 
G
R
x
Q
S
 
T
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
I
G
 
G
F
 
M
T
 
T
K
 
K
S
 
T
L
 
W
A
 
A
I
 
K
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
R
E
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
A
P
|
P
G
 
G
L
x
F
V
x
T
A
 
E
G
x
T
D
 
A
R
x
M
I
 
V
R
 
A
R
 
E
V
 
V
L
 
P
E
 
E
A
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
K
S
 
V
F
 
I
A
 
E
E
x
K
Q
 
M
E
 
K
A
 
A
E
 
Q
A
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
-
V
 
V
S
 
P
L
 
M
R
 
G
C
 
R
Y
 
L
V
 
G
T
 
K
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
I
A
 
A
N
 
N
M
 
A
A
 
Y
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
H
F
 
E
G
 
S
A
 
D
T
 
Y
I
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
H
S
 
V
L
 
L
S
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G

7krmC Putative fabg bound to nadh from acinetobacter baumannii
34% identity, 96% coverage: 9:251/253 of query aligns to 6:243/244 of 7krmC

query
sites
7krmC
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
T
 
I
A
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
A
-
x
S
-
 
E
-
 
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
M
 
T
A
 
A
D
 
E
G
 
I
F
 
F
A
 
A
S
 
Q
C
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
F
 
I
L
 
I
C
 
V
D
|
D
V
x
L
D
 
D
-
 
L
-
 
A
-
 
Q
-
 
S
Q
 
Q
E
 
N
A
 
A
L
 
A
A
 
K
A
 
A
C
 
L
P
 
G
-
 
E
-
 
G
Y
 
H
P
 
M
S
 
G
M
 
L
V
 
A
A
|
A
D
x
N
M
x
V
E
 
A
S
 
N
V
 
E
E
 
E
G
 
Q
C
 
V
E
 
K
G
 
A
F
 
A
V
 
V
D
 
E
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
Q
R
 
H
L
 
Y
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
A
 
T
G
 
Q
P
 
P
T
 
I
A
 
-
R
 
K
V
 
T
E
 
L
D
 
D
V
 
I
T
 
Q
P
 
R
E
 
S
A
 
D
L
 
Y
S
 
D
R
 
R
T
 
V
L
 
L
K
 
D
I
x
V
D
 
S
L
 
L
E
 
R
A
 
G
M
 
T
F
 
L
H
 
I
C
 
M
A
 
S
R
 
Q
R
 
A
A
 
V
V
 
I
P
 
P
A
 
S
L
 
M
R
 
K
A
 
A
A
 
N
G
 
G
G
 
G
G
 
G
S
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
C
L
 
L
S
 
S
S
|
S
A
 
V
A
 
S
-
 
A
-
 
Q
-
 
R
-
 
G
-
 
G
G
 
G
R
 
I
F
 
F
G
 
G
F
 
G
P
 
P
L
 
-
R
 
-
S
 
-
P
 
H
Y
|
Y
A
 
S
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
A
G
 
G
V
 
V
I
 
L
G
 
G
F
 
L
T
 
A
K
 
K
S
 
A
L
 
M
A
 
A
I
 
R
E
 
E
L
 
F
G
 
G
P
 
G
E
 
D
G
 
Q
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
S
I
 
L
L
 
T
P
 
P
G
 
G
L
 
L
V
x
I
A
 
Q
G
x
T
D
 
D
R
 
M
I
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
-
S
 
-
F
 
N
A
 
D
E
 
D
Q
 
R
E
 
R
A
 
H
E
 
D
A
 
I
L
 
L
R
 
A
P
 
G
V
 
I
S
 
P
L
 
L
R
 
G
C
 
R
Y
 
L
V
 
G
T
 
K
P
 
A
Q
 
Q
D
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
N
M
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
F
 
L
G
 
S
A
 
A
T
 
Y
I
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
V
S
 
T
L
 
L
S
 
D
V
 
V
D
 
N
G
 
G
D
 
G
M
 
M
Q
 
L
V
 
I

1x1tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas fragi complexed with NAD+ (see paper)
34% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 2:231/236 of 1x1tA

query
sites
1x1tA
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
V
V
 
A
A
 
V
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
x
T
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
M
 
I
A
 
A
D
 
T
G
 
A
F
 
L
A
 
A
S
 
A
C
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
I
F
 
V
L
 
L
C
 
N
D
x
G
V
x
F
D
 
G
Q
 
D
E
 
A
A
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
E
-
 
K
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
A
C
 
Q
P
 
H
Y
 
G
P
 
V
S
 
K
M
 
V
V
 
L
-
 
Y
-
 
D
-
 
G
A
 
A
D
|
D
M
x
L
E
 
S
S
 
K
V
 
G
E
 
E
G
 
A
C
 
V
E
 
R
G
 
G
F
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
R
R
 
Q
L
 
M
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
T
A
 
A
R
 
L
V
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
F
T
 
P
P
 
T
E
 
E
A
 
K
L
 
W
S
 
D
R
 
A
T
 
I
L
 
L
K
 
A
I
x
L
D
x
N
L
 
L
E
 
S
A
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
H
C
 
G
A
 
T
R
 
A
R
 
A
A
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
M
R
 
K
A
 
K
A
 
Q
G
 
G
G
 
F
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
I
S
 
A
S
|
S
A
 
A
A
x
H
G
 
G
R
 
L
F
 
V
G
 
A
F
 
S
P
 
A
L
 
N
R
 
K
S
 
S
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
F
T
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
T
A
 
A
I
 
L
E
 
E
L
 
T
G
 
A
P
 
G
E
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
G
 
G
L
x
W
V
|
V
A
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
-
R
 
-
R
 
-
V
 
-
L
 
-
E
 
-
A
 
-
K
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
N
 
-
G
 
-
R
 
R
S
x
T
F
 
L
A
 
L
E
 
S
Q
 
E
E
 
K
A
 
Q
E
 
P
A
 
S
L
 
L
R
 
Q
P
 
-
V
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
C
 
-
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
Q
I
 
L
A
 
G
N
 
G
M
 
T
A
 
A
L
 
V
Y
 
F
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
D
F
 
A
G
 
A
A
 
A
T
 
Q
I
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
S
 
T
L
 
V
S
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2q2qD Structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from pseudomonas putida (see paper)
31% identity, 96% coverage: 5:247/253 of query aligns to 2:250/255 of 2q2qD

query
sites
2q2qD
L
 
L
D
 
K
G
 
G
L
 
K
R
 
T
V
 
A
A
 
L
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
S
A
x
T
G
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
G
M
 
I
A
 
A
D
 
Q
G
 
V
F
 
L
A
 
A
S
 
R
C
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
I
F
 
V
L
 
L
-
 
N
-
 
G
-
x
F
-
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
L
C
 
A
D
 
E
V
 
I
D
 
A
Q
 
R
E
 
H
A
 
G
L
 
V
A
 
K
A
 
A
C
 
V
P
 
H
Y
 
H
P
 
P
S
 
A
M
x
D
V
x
L
A
 
S
D
 
D
M
 
V
E
 
A
S
 
Q
V
 
I
E
 
E
G
 
A
C
 
L
E
 
F
G
 
A
F
 
L
V
 
A
D
 
E
E
 
R
A
 
-
V
 
-
A
 
-
R
 
E
L
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
 
Q
G
 
-
P
 
H
T
 
V
A
 
A
R
 
P
V
 
V
E
 
E
D
 
Q
V
 
F
T
 
P
P
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
W
S
 
D
R
 
K
T
 
I
L
 
I
K
 
A
I
x
L
D
 
N
L
 
L
E
 
S
A
 
A
M
 
V
F
 
F
H
 
H
C
 
G
A
 
T
R
 
R
R
 
L
A
 
A
V
 
L
P
 
P
A
 
G
L
 
M
R
 
R
A
 
A
A
 
R
G
 
N
G
 
W
G
 
G
S
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
x
I
S
 
A
S
|
S
A
 
V
A
 
H
G
 
G
R
 
L
F
 
V
G
 
G
F
 
S
P
 
T
L
 
G
R
 
K
S
 
A
P
 
A
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
A
K
|
K
W
 
H
G
 
G
V
 
V
I
 
V
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
K
S
 
V
L
 
V
A
 
G
I
 
L
E
 
E
L
 
T
G
 
A
P
 
T
E
 
S
G
 
N
I
 
V
R
 
T
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
L
 
C
P
|
P
G
|
G
L
x
W
V
|
V
A
 
L
G
x
T
D
 
P
R
x
L
I
x
V
R
 
Q
R
 
K
V
 
Q
L
 
I
E
 
D
A
 
D
K
x
R
A
 
A
Q
 
A
A
 
N
N
 
G
G
 
G
R
 
D
S
 
P
F
 
L
-
 
Q
A
 
A
E
 
Q
Q
 
H
E
 
D
A
 
L
E
 
L
A
 
A
L
 
E
R
 
K
P
 
Q
V
 
P
S
 
S
L
 
L
R
 
-
C
 
A
Y
 
F
V
 
V
T
 
T
P
 
P
Q
 
E
D
 
H
I
 
L
A
 
G
N
 
E
M
 
L
A
 
V
L
 
L
Y
 
F
L
 
L
C
 
C
S
 
S
P
 
E
F
 
A
G
 
G
A
 
S
T
 
Q
I
 
V
S
 
R
G
 
G
Q
 
A
S
 
A
L
 
W
S
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
34% identity, 95% coverage: 9:249/253 of query aligns to 3:253/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
 
L
T
 
V
A
 
T
G
|
G
A
 
A
G
 
G
-
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
M
 
I
A
 
A
-
 
L
-
 
R
-
 
L
-
 
V
-
 
K
D
 
D
G
 
G
F
 
F
A
 
A
-
 
V
-
 
A
-
 
I
-
 
A
-
x
D
-
x
Y
-
 
N
S
 
D
C
 
A
G
 
T
A
 
A
K
 
K
V
 
A
F
 
V
L
 
A
C
 
S
D
 
E
V
 
I
D
 
N
Q
 
Q
E
 
A
A
 
G
L
 
G
A
 
H
A
 
A
C
 
V
P
 
A
Y
 
V
P
 
K
S
x
V
M
x
D
V
|
V
A
 
S
D
 
D
M
x
R
E
x
D
S
 
Q
V
 
V
E
x
F
G
 
A
C
 
A
E
 
-
G
 
-
F
 
-
V
 
V
D
 
E
E
 
Q
A
 
A
V
 
R
A
 
K
R
 
T
L
 
L
G
 
G
G
 
G
L
 
F
D
 
D
V
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
V
A
 
A
G
 
-
P
 
P
T
 
S
A
 
T
R
 
P
V
 
I
E
 
E
D
 
S
V
 
I
T
 
T
P
 
P
E
 
E
A
 
I
L
 
V
S
 
D
R
 
K
T
 
V
L
 
Y
K
 
N
I
|
I
D
 
N
L
 
V
E
 
K
A
 
G
M
 
V
F
 
I
H
 
W
C
 
G
A
 
I
R
 
Q
R
 
A
A
 
A
V
 
V
P
x
E
A
 
A
L
 
F
R
 
K
A
 
K
A
 
E
G
 
G
-
 
H
G
 
G
G
 
G
S
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
L
 
A
S
 
C
S
|
S
A
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
F
 
V
G
 
G
F
 
N
P
 
P
L
 
E
R
 
L
S
 
A
P
 
V
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
S
K
|
K
W
 
F
G
 
A
V
 
V
I
 
R
G
 
G
F
 
L
T
 
T
K
 
Q
S
 
T
L
 
A
A
 
A
I
 
R
E
 
D
L
 
L
G
 
A
P
 
P
E
 
L
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
L
 
C
P
|
P
G
 
G
L
 
I
V
|
V
A
 
K
G
x
T
D
 
P
R
x
M
I
 
W
R
 
A
R
 
E
V
 
I
L
 
D
E
 
R
A
 
Q
K
x
V
A
 
S
Q
 
E
A
 
A
N
 
A
G
 
G
R
 
K
S
 
P
F
 
L
A
 
G
E
 
Y
Q
 
G
E
 
T
A
 
A
E
 
E
A
 
F
L
 
A
R
 
K
P
 
R
V
 
I
S
 
T
L
 
L
R
 
G
C
 
R
Y
 
L
V
 
S
T
 
E
P
 
P
Q
 
E
D
 
D
I
 
V
A
 
A
N
 
A
M
 
C
A
 
V
L
 
S
Y
 
Y
L
 
L
C
 
A
S
 
S
P
 
P
F
 
D
G
 
S
A
 
D
T
 
Y
I
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
S
 
S
L
 
L
S
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
D
 
G
M
 
M

6ci9D Rmm microcompartment-associated aminopropanol dehydrogenase NADP + aminoacetone holo-structure (see paper)
33% identity, 100% coverage: 1:252/253 of query aligns to 3:251/259 of 6ci9D

query
sites
6ci9D
M
 
M
T
 
F
V
 
T
R
 
S
L
 
L
D
 
E
G
 
G
L
 
R
R
 
S
V
 
A
A
 
I
I
 
V
T
 
T
A
x
G
G
 
G
A
x
S
G
 
K
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
G
M
 
I
A
 
A
D
 
E
G
 
T
F
 
F
A
 
A
S
 
N
C
 
A
G
 
G
A
 
V
K
 
D
V
 
V
F
 
V
L
 
I
C
 
T
D
x
G
V
x
R
D
x
N
Q
 
Q
E
 
D
A
 
D
L
 
L
A
 
D
A
 
R
C
 
T
-
 
V
-
 
A
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
G
-
 
T
-
 
R
-
 
G
P
 
K
Y
 
V
P
 
T
S
 
A
M
 
V
V
 
R
A
 
A
D
|
D
M
x
V
E
 
T
S
 
D
V
 
P
E
 
E
G
 
D
C
 
A
E
 
R
G
 
R
F
 
T
V
 
V
D
 
A
E
 
E
A
 
T
V
 
V
A
 
S
R
 
R
L
 
H
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
V
V
 
C
N
 
A
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
A
x
F
G
 
-
P
 
P
T
 
S
A
 
G
R
 
R
V
 
L
E
 
E
D
 
D
V
 
L
T
 
T
P
 
P
E
 
D
A
 
D
L
 
I
S
 
E
R
 
Q
T
 
V
L
 
L
K
 
G
I
 
V
D
 
N
L
 
F
E
 
K
A
 
G
M
 
T
F
 
V
H
 
Y
C
 
I
A
 
V
R
 
Q
R
 
A
A
 
A
V
 
L
P
 
Q
A
 
A
L
 
L
R
 
T
A
 
A
A
 
S
G
 
G
G
 
H
G
 
G
S
 
R
I
 
V
V
 
V
N
 
V
L
x
T
S
 
S
S
|
S
A
 
I
A
x
T
G
 
G
R
 
P
F
 
I
-
 
T
G
 
G
F
 
Y
P
 
P
L
 
G
R
x
W
S
 
S
P
 
H
Y
|
Y
A
 
G
A
 
A
A
 
S
K
|
K
W
 
A
G
 
A
V
 
Q
I
 
L
G
 
G
F
 
F
T
 
L
K
 
R
S
 
T
L
 
A
A
 
A
I
 
M
E
 
E
L
 
L
G
 
A
P
 
P
E
 
K
G
 
K
I
 
I
R
 
T
V
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
L
P
|
P
G
|
G
L
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
R
 
-
I
 
-
R
 
-
R
x
N
V
x
I
L
 
M
E
x
T
A
 
E
K
x
G
A
x
L
Q
 
D
A
 
E
N
 
M
G
 
G
R
 
Q
S
 
D
F
 
Y
A
 
L
E
 
D
Q
 
Q
E
 
M
A
 
A
E
 
S
A
 
A
L
 
I
R
 
P
P
 
A
V
 
G
S
 
R
L
 
L
R
 
G
C
 
S
Y
 
V
V
 
A
T
 
-
P
 
-
Q
 
-
D
 
D
I
 
I
A
 
G
N
 
N
M
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
F
L
 
F
C
 
A
S
 
T
P
 
D
F
 
E
G
 
A
A
 
A
T
 
Y
I
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
S
 
T
L
 
L
S
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
D
 
G
M
 
-
Q
 
Q
V
 
V
L
 
L

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
34% identity, 95% coverage: 9:249/253 of query aligns to 3:253/256 of Q48436

query
sites
Q48436
R
 
K
V
 
V
A
 
A
I
x
L
T
x
V
A
x
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
-
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
R
x
K
A
|
A
M
x
I
A
|
A
-
x
L
-
x
R
-
x
L
-
x
V
-
x
K
D
|
D
G
|
G
F
|
F
A
|
A
-
x
V
-
x