SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_090663116.1 NCBI__GCF_900101615.1:WP_090663116.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7zlaB Cryo-em structure of holo-pdxr from bacillus clausii bound to its target DNA in the half-closed conformation (see paper)
34% identity, 94% coverage: 10:450/470 of query aligns to 2:437/458 of 7zlaB

query
sites
7zlaB
I
 
L
D
 
N
R
|
R
A
 
D
S
 
L
P
 
P
E
 
T
P
|
P
V
x
L
L
x
Y
R
 
E
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
L
 
A
A
 
H
L
 
I
R
 
K
R
 
T
A
 
E
I
 
I
L
 
T
S
 
E
G
 
G
A
 
R
I
 
I
P
 
G
A
 
Y
G
 
G
G
 
T
R
 
K
L
 
L
P
 
P
P
x
S
T
x
K
R
|
R
A
x
K
L
 
L
A
 
A
A
 
D
R
 
S
L
 
L
G
 
K
I
 
L
A
 
S
R
x
Q
N
|
N
S
x
T
V
 
V
V
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
I
 
V
E
 
E
G
 
V
R
 
I
V
 
P
G
x
R
A
 
K
G
 
G
S
 
F
Y
 
Y
V
 
V
A
 
Q
G
 
A
D
 
-
L
 
-
P
 
Y
E
 
E
P
 
D
L
 
L
E
 
E
-
 
Y
L
 
I
P
 
R
P
 
A
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
P
 
P
A
 
G
P
 
D
A
 
A
P
 
L
V
 
A
V
 
T
P
 
K
H
 
Q
A
 
D
G
 
T
L
 
I
-
 
R
Y
 
Y
G
 
N
A
 
F
A
 
H
P
 
P
F
 
T
N
 
H
T
 
I
G
 
D
R
 
T
C
 
T
T
 
S
L
 
F
D
 
-
D
 
-
R
 
-
T
 
P
L
 
F
Q
 
E
V
 
Q
W
 
W
R
 
R
G
 
K
L
 
Y
T
 
F
A
 
K
R
 
Q
R
 
T
L
 
M
Q
 
C
R
 
K
P
 
E
D
 
N
P
 
H
A
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
L
Y
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
H
R
 
Q
G
 
G
S
 
E
A
 
A
A
 
S
L
 
F
R
 
R
G
 
R
A
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
H
A
 
H
A
 
S
R
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
N
C
 
C
E
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
E
Q
 
-
A
 
T
I
 
L
D
 
L
L
 
Q
V
 
Q
L
 
L
R
 
F
V
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
G
P
 
E
G
 
S
D
 
K
A
 
V
A
 
Y
W
 
G
M
 
I
E
 
E
D
 
D
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
A
 
L
V
 
M
R
 
R
A
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
H
A
 
Y
G
 
P
A
 
N
R
 
D
I
 
Y
V
 
V
P
 
P
V
 
F
P
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
E
Q
 
E
G
 
G
M
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
D
S
 
S
G
 
I
I
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
P
 
V
E
 
D
A
 
-
R
 
-
L
 
V
A
 
V
Y
 
Y
V
 
T
T
 
T
P
 
P
S
 
S
S
 
R
Q
 
H
Y
 
F
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
S
V
 
V
L
 
L
S
 
S
M
 
I
A
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
K
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
H
W
 
W
A
 
A
R
 
E
-
 
A
R
 
H
A
 
E
G
 
N
A
 
R
W
 
Y
V
 
I
L
 
I
E
 
E
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
F
 
F
R
 
R
Y
 
Y
A
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
T
L
 
I
A
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
H
G
 
N
R
 
K
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
T
 
A
F
 
F
S
 
S
K
 
K
V
 
S
L
 
L
F
 
I
P
 
P
G
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
I
G
 
S
Y
 
Y
A
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
A
A
 
P
L
 
L
L
 
A
E
 
H
G
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
Y
T
 
K
R
 
N
L
 
K
L
 
F
S
 
S
D
 
Y
W
 
Y
H
 
H
P
 
S
A
 
T
A
 
V
-
 
S
-
 
R
L
 
I
Q
 
D
E
 
Q
G
 
Q
V
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
A
F
 
F
I
 
M
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
H
 
D
F
 
F
A
 
E
Q
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
N
R
 
R
M
 
M
R
 
R
Q
 
K
H
 
I
Y
 
Y
R
 
R
G
 
R
T
 
K
R
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
R
H
 
Y
L
 
-
P
 
E
G
 
D
R
 
K
L
 
L
E
 
L
V
 
I
E
 
I
V
 
G
P
 
E
D
 
R
Q
 
S
G
 
G
M
 
L
K
 
H
L
 
I
L
 
V
A
 
L
R
 
V
L
 
V
R
 
K
P
 
N
G
 
G
L
 
M
L
 
D
D
 
E
T
 
Q
A
 
T
V
 
L
A
 
V
A
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
A
R
 
A
G
 
K
I
 
A
I
 
K
A
 
V
R
 
Y
P
 
P
V
 
L
S
 
S
P
 
A
M
 
Y
F
 
S
L
 
L
A
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
I
A
 
H
P
 
P
P
 
P
V
 
-
Q
 
-
A
 
Q
L
 
I
M
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F

7zn5B Cryo-em structure of holo-pdxr from bacillus clausii bound to its target DNA in the closed conformation, c2 symmetry. (see paper)
33% identity, 93% coverage: 12:450/470 of query aligns to 1:414/435 of 7zn5B

query
sites
7zn5B
R
 
R
A
 
D
S
 
L
P
 
P
E
 
T
P
|
P
V
 
L
L
 
Y
R
 
E
Q
 
Q
V
 
L
Y
 
Y
L
 
A
A
 
H
L
 
I
R
 
K
R
 
T
A
 
E
I
 
I
L
 
T
S
 
E
G
 
G
A
 
R
I
 
I
P
 
G
A
 
Y
G
 
G
G
 
T
R
 
K
L
 
L
P
 
P
P
x
S
T
 
K
R
|
R
A
x
K
L
 
L
A
 
A
A
 
D
R
 
S
L
 
L
G
 
K
I
 
L
A
x
S
R
x
Q
N
|
N
S
 
T
V
 
V
V
x
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
Y
E
 
E
Q
 
Q
L
 
L
L
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
F
 
Y
I
 
V
E
 
E
G
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
A
 
-
G
 
-
S
 
-
Y
 
-
V
 
-
A
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
-
P
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
P
 
-
P
 
-
P
 
-
A
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
-
V
 
V
V
 
I
P
 
P
H
x
R
A
x
K
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
G
 
V
A
 
Q
A
 
A
P
 
-
F
 
Y
N
 
E
T
 
T
G
 
I
R
 
R
C
 
Y
T
 
N
L
 
F
D
 
H
-
 
P
-
 
T
-
 
H
-
 
I
D
 
D
R
 
T
T
 
T
-
 
S
-
 
F
-
 
P
L
 
F
Q
 
E
V
 
Q
W
 
W
R
 
R
G
 
K
L
 
Y
T
 
F
A
 
K
R
 
Q
R
 
T
L
 
M
Q
 
C
R
 
K
P
 
E
D
 
N
P
 
H
A
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
L
Y
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
H
R
 
Q
G
 
G
S
 
E
A
 
A
A
 
S
L
 
F
R
 
R
G
 
R
A
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
H
A
 
H
A
 
S
R
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
N
C
 
C
E
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
E
Q
 
-
A
 
T
I
 
L
D
 
L
L
 
Q
V
 
Q
L
 
L
R
 
F
V
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
G
P
 
E
G
 
S
D
 
K
A
 
V
A
 
Y
W
 
G
M
 
I
E
 
E
D
 
D
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
A
 
L
V
 
M
R
 
R
A
 
K
A
 
L
L
 
L
E
 
S
A
 
H
A
 
Y
G
 
P
A
 
N
R
 
D
I
 
Y
V
 
V
P
 
P
V
 
F
P
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
E
Q
 
E
G
 
G
M
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
D
S
 
S
G
 
I
I
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
P
 
V
E
 
D
A
 
-
R
 
-
L
 
V
A
 
V
Y
 
Y
V
 
T
T
 
T
P
 
P
S
 
S
S
 
R
Q
 
H
Y
 
F
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
S
V
 
V
L
 
L
S
 
S
M
 
I
A
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
K
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
H
W
 
W
A
 
A
R
 
E
-
 
A
R
 
H
A
 
E
G
 
N
A
 
R
W
 
Y
V
 
I
L
 
I
E
 
E
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
F
 
F
R
 
R
Y
 
Y
A
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
T
L
 
I
A
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
H
G
 
N
R
 
K
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
T
 
A
F
 
F
S
 
S
K
 
K
V
 
S
L
 
L
F
 
I
P
 
P
G
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
I
G
 
S
Y
 
Y
A
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
A
A
 
P
L
 
L
L
 
A
E
 
H
G
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
Y
T
 
K
R
 
N
L
 
K
L
 
F
S
 
S
D
 
Y
W
 
Y
H
 
H
P
 
S
A
 
T
A
 
V
-
 
S
-
 
R
L
 
I
Q
 
D
E
 
Q
G
 
Q
V
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
A
F
 
F
I
 
M
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
H
 
D
F
 
F
A
 
E
Q
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
N
R
 
R
M
 
M
R
 
R
Q
 
K
H
 
I
Y
 
Y
R
|
R
G
 
R
T
 
K
R
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
R
H
 
Y
L
 
-
P
 
E
G
 
D
R
 
K
L
 
L
E
 
L
V
 
I
E
 
I
V
 
G
P
 
E
D
 
R
Q
 
S
G
 
G
M
 
L
K
 
H
L
 
I
L
 
V
A
 
L
R
 
V
L
 
V
R
 
K
P
 
N
G
 
G
L
 
M
L
 
D
D
 
E
T
 
Q
A
 
T
V
 
L
A
 
V
A
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
A
R
 
A
G
 
K
I
 
A
I
 
K
A
 
V
R
 
Y
P
 
P
V
 
L
S
 
S
P
 
A
M
 
Y
F
 
S
L
 
L
A
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
I
A
 
H
P
 
P
P
 
P
V
 
-
Q
 
-
A
 
Q
L
 
I
M
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F

5t4kA Plp and gaba trigger gabr-mediated transcription regulation in bacillus subsidies via external aldimine formation (see paper)
32% identity, 66% coverage: 114:424/470 of query aligns to 6:313/360 of 5t4kA

query
sites
5t4kA
F
 
F
N
 
S
T
x
H
G
x
M
R
 
S
C
 
S
T
 
D
L
 
T
D
 
D
D
 
H
R
 
F
T
 
P
L
 
I
Q
 
K
V
 
S
W
 
W
R
 
F
G
 
R
L
 
C
T
 
E
A
 
Q
R
 
K
R
 
A
L
 
A
Q
 
S
R
 
R
P
 
S
D
 
Y
P
 
A
A
 
T
L
 
L
L
 
G
G
 
D
Y
 
M
A
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
S
 
I
A
 
Y
A
 
E
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
R
Y
 
L
L
 
I
R
 
S
A
 
L
A
 
T
R
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
C
E
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
M
V
 
I
V
 
I
T
 
G
A
 
A
G
 
G
A
x
T
Q
 
Q
Q
 
V
A
 
L
I
 
M
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
L
 
T
R
 
E
V
 
L
L
 
L
L
 
-
R
 
-
P
 
P
G
 
K
D
 
E
A
 
A
A
 
V
W
 
Y
-
 
A
M
 
M
E
 
E
D
 
E
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
P
 
R
A
 
R
V
 
M
R
 
Y
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
K
R
 
Q
I
 
V
V
 
K
P
 
T
V
 
I
P
 
M
V
 
L
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
G
M
 
M
D
 
S
V
 
I
G
 
A
S
 
E
G
 
I
I
 
T
A
 
R
A
 
Q
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
A
 
V
R
 
L
L
 
V
A
 
T
Y
 
-
V
 
-
T
 
T
P
 
P
S
 
S
S
 
H
Q
 
Q
Y
x
F
P
 
P
L
 
S
G
 
G
V
 
T
V
 
I
L
 
M
S
 
P
M
 
V
A
 
S
R
 
R
R
 
R
L
 
I
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
N
W
 
W
A
 
A
R
 
A
R
 
E
A
 
E
G
 
P
A
 
A
-
 
R
W
 
Y
V
 
I
L
 
I
E
 
E
D
|
D
D
 
D
Y
|
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
F
 
F
R
 
T
Y
 
Y
A
 
D
G
 
V
R
 
E
P
 
S
L
 
I
A
 
P
S
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
L
D
 
D
E
 
R
A
 
F
G
 
Q
R
 
N
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
 
K
V
 
S
L
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
L
R
|
R
L
 
I
G
 
S
Y
 
Y
A
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
R
G
 
A
V
 
Y
L
 
-
S
 
K
T
 
Q
R
 
R
L
 
G
L
 
Y
S
 
D
D
 
L
W
 
Q
H
 
T
P
 
C
A
 
S
A
 
S
L
 
L
Q
 
T
E
 
Q
G
 
L
V
 
T
V
 
L
T
 
Q
D
 
E
F
 
F
I
 
I
E
 
E
E
 
S
G
 
G
H
 
E
F
 
Y
A
 
Q
Q
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
K
R
 
K
M
 
M
R
 
K
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
R
 
K
G
 
E
T
 
K
R
 
R
D
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
A
H
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
R
 
E
L
 
V
E
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
G
P
 
A
D
 
N
Q
 
A
G
 
G
M
 
L
K
 
H
L
 
F
L
 
V
A
 
T
R
 
E
L
 
F
R
 
D
P
 
T
G
 
R
L
 
R
L
 
T
D
 
E
T
 
Q
A
 
D
V
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
H
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5t4jB Plp and gaba trigger gabr-mediated transcription regulation in bacillus subsidies via external aldimine formation (see paper)
32% identity, 66% coverage: 114:424/470 of query aligns to 6:313/360 of 5t4jB

query
sites
5t4jB
F
 
F
N
 
S
T
x
H
G
x
M
R
 
S
C
 
S
T
 
D
L
 
T
D
 
D
D
 
H
R
 
F
T
 
P
L
 
I
Q
 
K
V
 
S
W
 
W
R
 
F
G
 
R
L
 
C
T
 
E
A
 
Q
R
 
K
R
 
A
L
 
A
Q
 
S
R
 
R
P
 
S
D
 
Y
P
 
A
A
 
T
L
 
L
L
 
G
G
 
D
Y
 
M
A
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
S
 
I
A
 
Y
A
 
E
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
R
Y
 
L
L
 
I
R
 
S
A
 
L
A
 
T
R
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
C
E
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
M
V
 
I
V
 
I
T
 
G
A
 
A
G
 
G
A
x
T
Q
 
Q
Q
 
V
A
 
L
I
 
M
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
L
 
T
R
 
E
V
 
L
L
 
L
L
 
-
R
 
-
P
 
P
G
 
K
D
 
E
A
 
A
A
 
V
W
 
Y
-
 
A
M
 
M
E
 
E
D
 
E
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
P
 
R
A
 
R
V
 
M
R
 
Y
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
K
R
 
Q
I
 
V
V
 
K
P
 
T
V
 
I
P
 
M
V
 
L
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
G
M
 
M
D
 
S
V
 
I
G
 
A
S
 
E
G
 
I
I
 
T
A
 
R
A
 
Q
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
A
 
V
R
 
L
L
 
V
A
 
T
Y
 
-
V
 
-
T
 
T
P
 
P
S
 
S
S
 
H
Q
 
Q
Y
x
F
P
 
P
L
 
S
G
 
G
V
 
T
V
 
I
L
 
M
S
 
P
M
 
V
A
 
S
R
 
R
R
 
R
L
 
I
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
N
W
 
W
A
 
A
R
 
A
R
 
E
A
 
E
G
 
P
A
 
A
-
 
R
W
 
Y
V
 
I
L
 
I
E
 
E
D
|
D
D
 
D
Y
|
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
F
 
F
R
 
T
Y
 
Y
A
 
D
G
 
V
R
 
E
P
 
S
L
 
I
A
 
P
S
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
L
D
 
D
E
 
R
A
 
F
G
 
Q
R
 
N
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
 
K
V
 
S
L
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
L
R
|
R
L
 
I
G
x
S
Y
 
Y
A
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
R
G
 
A
V
 
Y
L
 
-
S
 
K
T
 
Q
R
 
R
L
 
G
L
 
Y
S
 
D
D
 
L
W
 
Q
H
 
T
P
 
C
A
 
S
A
 
S
L
 
L
Q
 
T
E
 
Q
G
 
L
V
 
T
V
 
L
T
 
Q
D
 
E
F
 
F
I
 
I
E
 
E
E
 
S
G
 
G
H
 
E
F
 
Y
A
 
Q
Q
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
K
R
 
K
M
 
M
R
 
K
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
R
 
K
G
 
E
T
 
K
R
 
R
D
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
A
H
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
R
 
E
L
 
V
E
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
G
P
 
A
D
 
N
Q
 
A
G
 
G
M
 
L
K
 
H
L
 
F
L
 
V
A
 
T
R
 
E
L
 
F
R
 
D
P
 
T
G
 
R
L
 
R
L
 
T
D
 
E
T
 
Q
A
 
D
V
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
H
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

6uxzB (S)-4-amino-5-phenoxypentanoate as a selective agonist of the transcription factor gabr (see paper)
32% identity, 66% coverage: 114:424/470 of query aligns to 5:312/358 of 6uxzB

query
sites
6uxzB
F
 
F
N
 
S
T
x
H
G
x
M
R
 
S
C
 
S
T
 
D
L
 
T
D
 
D
D
 
H
R
 
F
T
 
P
L
 
I
Q
 
K
V
 
S
W
 
W
R
 
F
G
 
R
L
 
C
T
 
E
A
 
Q
R
 
K
R
 
A
L
 
A
Q
 
S
R
 
R
P
 
S
D
 
Y
P
 
A
A
 
T
L
 
L
L
 
G
G
 
D
Y
 
M
A
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
S
 
I
A
 
Y
A
 
E
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
R
Y
 
L
L
 
I
R
 
S
A
 
L
A
 
T
R
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
C
E
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
M
V
 
I
V
 
I
T
 
G
A
 
A
G
|
G
A
x
T
Q
 
Q
Q
 
V
A
 
L
I
 
M
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
L
 
T
R
 
E
V
 
L
L
 
L
L
 
-
R
 
-
P
 
P
G
 
K
D
 
E
A
 
A
A
 
V
W
 
Y
-
 
A
M
 
M
E
 
E
D
 
E
P
 
P
G
 
G
Y
|
Y
P
 
R
A
x
R
V
 
M
R
 
Y
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
K
R
 
Q
I
 
V
V
 
K
P
 
T
V
 
I
P
 
M
V
 
L
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
G
M
 
M
D
 
S
V
 
I
G
 
A
S
 
E
G
 
I
I
 
T
A
 
R
A
 
Q
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
A
 
V
R
 
L
L
 
V
A
 
T
Y
 
-
V
 
-
T
 
T
P
 
P
S
 
S
S
 
H
Q
 
Q
Y
x
F
P
 
P
L
 
S
G
 
G
V
 
T
V
 
I
L
 
M
S
 
P
M
 
V
A
 
S
R
 
R
R
 
R
L
 
I
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
N
W
 
W
A
 
A
R
 
N
R
 
E
A
 
E
-
 
P
G
 
R
A
 
R
W
 
Y
V
 
I
L
 
I
E
 
E
D
|
D
D
 
D
Y
|
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
F
 
F
R
 
T
Y
 
Y
A
 
D
G
 
V
R
 
E
P
 
S
L
 
I
A
 
P
S
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
L
D
 
D
E
 
R
A
 
F
G
 
Q
R
 
N
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
V
 
S
L
 
L
F
 
L
P
|
P
G
 
G
L
 
L
R
|
R
L
 
I
G
 
S
Y
 
Y
A
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
R
G
 
A
V
 
Y
L
 
-
S
 
K
T
 
Q
R
 
R
L
 
G
L
 
Y
S
 
D
D
 
L
W
 
Q
H
 
T
P
 
C
A
 
S
A
 
S
L
 
L
Q
 
T
E
 
Q
G
 
L
V
 
T
V
 
L
T
 
Q
D
 
E
F
 
F
I
 
I
E
 
E
E
 
S
G
 
G
H
 
E
F
 
Y
A
 
Q
Q
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
K
R
 
K
M
 
M
R
 
K
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
R
 
K
G
 
E
T
 
K
R
 
R
D
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
A
H
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
R
 
E
L
 
V
E
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
G
P
 
A
D
 
N
Q
 
A
G
 
G
M
 
L
K
 
H
L
 
F
L
 
V
A
 
T
R
 
E
L
 
F
R
 
D
P
 
T
G
 
R
L
 
R
L
 
T
D
 
E
T
 
Q
A
 
D
V
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
H
A
 
A
A
 
A

Sites not aligning to the query:

5x03B Crystal structure of thE C-terminal domain of bacillus subtilis gabr reveals a closed conformation by the binding of gamma-aminobutyric acid, inducing the transcriptional activation (see paper)
32% identity, 66% coverage: 114:424/470 of query aligns to 5:312/365 of 5x03B

query
sites
5x03B
F
 
F
N
 
S
T
 
H
G
 
M
R
 
S
C
 
S
T
 
D
L
 
T
D
 
D
D
 
H
R
 
F
T
 
P
L
 
I
Q
 
K
V
 
S
W
 
W
R
 
F
G
 
R
L
 
C
T
 
E
A
 
Q
R
 
K
R
 
A
L
 
A
Q
 
S
R
 
R
P
 
S
D
 
Y
P
 
R
A
 
T
L
 
L
L
 
G
G
 
D
Y
 
M
A
 
S
D
 
H
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
S
 
I
A
 
Y
A
 
E
L
 
V
R
 
R
G
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
R
Y
 
L
L
 
I
R
 
S
A
 
L
A
 
T
R
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
K
C
 
C
E
 
R
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
M
V
 
I
V
 
I
T
 
G
A
 
A
G
|
G
A
x
T
Q
 
Q
Q
 
V
A
 
L
I
 
M
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
L
 
T
R
 
E
V
 
L
L
 
L
L
 
-
R
 
-
P
 
P
G
 
K
D
 
E
A
 
A
A
 
V
W
 
Y
-
 
A
M
 
M
E
 
E
D
 
E
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
P
 
R
A
 
R
V
 
M
R
 
Y
A
 
Q
A
 
L
L
 
L
E
 
K
A
 
N
A
 
A
G
 
G
A
 
K
R
 
Q
I
 
V
V
 
K
P
 
T
V
 
I
P
 
M
V
 
L
D
 
D
G
 
E
Q
 
K
G
 
G
M
 
M
D
 
S
V
 
I
G
 
A
S
 
E
G
 
I
I
 
T
A
 
R
A
 
Q
A
 
Q
P
 
P
E
 
D
A
 
V
R
 
L
L
 
V
A
 
T
Y
 
-
V
 
-
T
 
T
P
 
P
S
 
S
S
 
H
Q
 
Q
Y
x
F
P
 
P
L
 
S
G
 
G
V
 
T
V
 
I
L
 
M
S
 
P
M
 
V
A
 
S
R
 
R
R
 
R
L
 
I
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
N
W
 
W
A
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
E
-
 
P
R
 
R
R
 
R
A
 
-
G
 
-
A
 
-
W
 
Y
V
 
I
L
 
I
E
 
E
D
|
D
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
F
 
F
R
 
T
Y
 
Y
A
 
D
G
 
V
R
 
D
P
 
S
L
 
I
A
 
P
S
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
L
D
 
D
E
 
R
A
 
F
G
 
Q
R
 
N
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
M
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
V
 
S
L
 
L
F
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
L
R
|
R
L
 
I
G
 
S
Y
 
Y
A
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
P
A
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
R
G
 
A
V
 
Y
L
 
-
S
 
K
T
 
Q
R
 
R
L
 
G
L
 
Y
S
 
D
D
 
L
W
 
Q
H
 
T
P
 
C
A
 
S
A
 
S
L
 
L
Q
 
T
E
 
Q
G
 
L
V
 
T
V
 
L
T
 
Q
D
 
E
F
 
F
I
 
I
E
 
E
E
 
S
G
 
G
H
 
E
F
 
Y
A
 
Q
Q
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
K
R
 
K
M
 
M
R
 
K
Q
 
Q
H
 
H
Y
 
Y
R
 
K
G
 
E
T
 
K
R
 
R
D
 
E
A
 
R
L
 
L
V
 
I
A
 
T
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
A
H
 
E
L
 
F
P
 
S
G
 
G
R
 
E
L
 
V
E
 
T
V
 
V
E
 
K
V
 
G
P
 
A
D
 
N
Q
 
A
G
 
G
M
 
L
K
 
H
L
 
F
L
 
V
A
 
T
R
 
E
L
 
F
R
 
D
P
 
T
G
 
R
L
 
R
L
 
T
D
 
E
T
 
Q
A
 
D
V
 
I
A
 
L
A
 
S
A
 
H
A
 
A
A
 
A

7pq9AAA PLP-dependent aminotransferase family protein (see paper)
34% identity, 69% coverage: 126:450/470 of query aligns to 19:341/367 of 7pq9AAA

query
sites
7pq9AAA
L
 
F
Q
 
E
V
 
Q
W
 
W
R
 
R
G
 
K
L
 
Y
T
 
F
A
 
K
R
 
Q
R
 
T
L
 
M
Q
 
C
R
 
K
P
 
E
D
 
N
P
 
H
A
 
R
L
 
L
L
 
L
G
 
L
Y
 
N
A
 
G
D
 
D
P
 
H
R
 
Q
G
 
G
S
 
E
A
 
A
A
 
S
L
 
F
R
 
R
G
 
R
A
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
Y
Y
 
Y
L
 
L
R
 
H
A
 
H
A
 
S
R
 
R
A
 
G
V
 
V
R
 
N
C
 
C
E
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
Q
V
 
V
V
 
V
V
 
V
T
 
G
A
 
A
G
 
G
A
 
V
Q
 
E
Q
 
-
A
 
T
I
 
L
D
 
L
L
 
Q
V
 
Q
L
 
L
R
 
F
V
 
L
L
 
L
L
 
L
R
 
G
P
 
E
G
 
S
D
 
K
A
 
V
A
 
Y
W
 
G
M
 
I
E
 
E
D
 
D
P
 
P
G
 
G
Y
 
Y
P
 
Q
A
 
L
V
 
M
R
 
R
A
 
K
A
 
L
L
|
L
E
x
S
A
 
H
A
x
Y
G
 
P
A
x
N
R
 
D
I
 
Y
V
 
V
P
 
P
V
 
F
P
 
Q
V
 
V
D
 
D
G
 
E
Q
 
E
G
 
G
M
 
I
D
 
D
V
 
V
G
 
D
S
 
S
G
 
I
I
 
V
A
 
R
A
 
T
A
 
A
P
 
V
E
 
D
A
 
-
R
 
-
L
 
V
A
 
V
Y
 
Y
V
 
T
T
 
T
P
 
P
S
 
S
S
 
R
Q
 
H
Y
 
F
P
 
P
L
 
Y
G
 
G
V
 
S
V
 
V
L
 
L
S
 
S
M
 
I
A
 
N
R
 
R
R
 
R
L
 
K
E
 
Q
L
 
L
L
 
L
A
 
H
W
 
W
A
 
A
R
 
E
-
 
A
R
 
H
A
 
E
G
 
N
A
 
R
W
 
Y
V
 
I
L
 
I
E
 
E
D
 
D
D
 
D
Y
 
Y
D
 
D
S
 
S
E
 
E
F
 
F
R
 
R
Y
 
Y
A
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
T
L
 
I
A
 
P
S
 
S
L
 
L
Q
 
Q
G
 
S
V
 
M
D
 
D
E
 
V
A
 
H
G
 
N
R
 
K
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
T
 
A
F
 
F
S
 
S
K
 
K
V
 
S
L
 
L
F
 
I
P
 
P
G
 
S
L
 
V
R
 
R
L
 
I
G
 
S
Y
 
Y
A
 
M
V
 
V
L
 
L
P
 
P
P
 
A
A
 
P
L
 
L
L
 
A
E
 
H
G
 
-
V
 
-
L
 
L
S
 
Y
T
 
K
R
 
N
L
 
K
L
 
F
S
 
S
D
 
Y
W
 
Y
H
 
H
P
 
S
A
x
T
A
x
V
-
 
S
-
 
R
L
 
I
Q
 
D
E
 
Q
G
 
Q
V
 
V
V
 
L
T
 
T
D
 
A
F
 
F
I
 
M
E
 
K
E
 
Q
G
 
G
H
 
D
F
 
F
A
 
E
Q
 
K
H
 
H
L
 
L
R
 
N
R
 
R
M
 
M
R
 
R
Q
 
K
H
 
I
Y
 
Y
R
 
R
G
 
R
T
 
K
R
 
L
D
 
E
A
 
K
L
 
V
V
 
L
A
 
S
A
 
L
L
 
L
R
 
K
E
 
R
H
 
Y
L
 
-
P
 
E
G
 
D
R
 
K
L
 
L
E
 
L
V
 
I
E
 
I
V
 
G
P
 
E
D
 
R
Q
 
S
G
 
G
M
 
L
K
 
H
L
 
I
L
 
V
A
 
L
R
 
V
L
 
V
R
 
K
P
 
N
G
 
G
L
 
M
L
 
D
D
 
E
T
 
Q
A
 
T
V
 
L
A
 
V
A
 
E
A
 
K
A
 
A
A
 
L
R
 
A
R
 
A
G
 
K
I
 
A
I
 
K
A
 
V
R
 
Y
P
 
P
V
 
L
S
 
S
P
 
A
M
 
Y
F
 
S
L
 
L
A
 
E
-
 
R
-
 
A
-
 
I
A
 
H
P
 
P
P
 
P
V
 
-
Q
 
-
A
 
Q
L
 
I
M
 
V
L
 
L
G
 
G
F
 
F

2zc0A Crystal structure of an archaeal alanine:glyoxylate aminotransferase (see paper)
32% identity, 68% coverage: 131:451/470 of query aligns to 55:383/405 of 2zc0A

query
sites
2zc0A
G
 
G
L
 
E
T
 
I
A
 
A
R
 
K
R
 
E
L
 
V
Q
 
L
R
 
E
P
 
K
D
 
E
P
 
P
A
 
K
L
 
S
L
 
V
G
 
M
Y
 
Y
A
 
T
D
 
P
P
 
A
R
 
N
G
 
G
S
 
I
A
 
P
A
 
E
L
 
L
R
 
R
G
 
E
A
 
E
V
 
L
A
 
A
R
 
A
Y
 
F
L
 
L
R
 
K
A
 
K
A
 
Y
R
 
D
A
 
H
V
 
L
R
 
E
C
 
V
E
 
S
P
 
P
E
 
E
Q
 
N
V
 
I
V
 
V
V
 
I
T
 
T
A
 
I
G
|
G
A
x
G
Q
x
T
Q
 
G
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
L
L
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
L
L
 
I
R
 
D
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
V
A
 
V
W
 
I
M
 
T
E
 
E
D
 
N
P
 
P
G
 
S
Y
|
Y
P
 
I
A
 
N
V
 
T
R
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
F
E
 
E
A
 
Q
A
 
L
G
 
G
A
 
A
R
 
K
I
 
I
V
 
E
P
 
G
V
 
V
P
 
P
V
 
V
D
 
D
G
 
N
Q
 
D
G
 
G
M
 
M
-
 
R
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
E
D
 
K
V
 
I
G
 
K
S
 
E
G
 
L
I
 
K
A
 
A
A
 
K
A
 
G
P
 
Q
E
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
L
A
 
I
Y
 
Y
V
 
T
T
 
I
P
 
P
S
 
T
S
 
G
Q
 
Q
Y
x
N
P
 
P
L
 
M
G
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
M
S
 
S
M
 
M
A
 
E
R
 
R
R
 
R
L
 
K
E
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
E
W
 
I
A
 
A
R
 
S
R
 
K
A
 
Y
G
 
D
A
 
L
W
 
L
V
 
I
L
 
I
E
 
E
D
|
D
D
 
T
Y
x
A
D
x
Y
S
 
N
E
 
F
F
 
M
R
 
R
Y
 
Y
A
 
E
G
 
G
R
 
G
P
 
D
L
 
I
A
 
V
S
 
P
L
 
L
Q
 
K
G
 
A
V
 
L
D
 
D
E
 
N
A
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
Y
 
V
V
 
A
G
 
G
T
|
T
F
 
L
S
|
S
K
|
K
V
 
V
L
 
L
F
 
G
P
 
T
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
W
A
 
I
V
 
I
L
 
A
P
 
E
P
 
G
A
 
E
L
 
I
L
 
L
E
 
K
G
 
K
V
 
V
L
 
L
S
 
M
T
 
Q
R
 
K
L
 
Q
L
 
P
S
 
I
D
 
D
W
 
F
H
 
C
P
 
A
A
 
P
A
 
A
L
 
I
Q
 
S
E
 
Q
G
 
Y
V
 
I
V
 
A
T
 
L
D
 
E
F
 
Y
I
 
L
E
 
K
E
 
R
G
 
G
H
 
Y
F
 
F
A
 
E
Q
 
K
-
 
Y
H
 
H
L
 
L
R
 
E
R
 
G
M
 
A
R
 
L
Q
 
L
H
 
G
Y
 
Y
R
 
K
G
 
E
T
 
K
R
 
R
D
 
D
A
 
I
L
 
M
V
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
N
H
 
H
L
 
L
P
 
P
G
 
N
R
 
A
L
 
-
E
 
E
V
 
F
E
 
T
V
 
K
P
 
P
D
 
I
Q
 
A
G
 
G
M
 
M
K
 
F
L
 
V
L
 
M
A
 
F
R
 
F
L
 
L
R
 
P
P
 
E
G
 
G
L
 
A
L
 
D
D
 
G
T
 
I
A
 
S
V
 
F
A
 
A
A
 
N
A
 
E
-
 
L
A
 
M
A
 
E
R
 
R
R
 
E
G
 
G
I
 
V
I
 
V
A
 
V
R
 
V
P
 
P
V
 
G
S
 
K
P
 
P
M
 
F
F
 
Y
L
 
T
A
 
D
A
 
E
P
 
S
P
 
G
V
 
K
Q
 
N
A
 
A
L
 
I
M
 
R
L
 
L
G
 
N
F
 
F
S
 
S

1wstA Crystal structure of multiple substrate aminotransferase (msat) from thermococcus profundus
30% identity, 69% coverage: 145:466/470 of query aligns to 65:393/403 of 1wstA

query
sites
1wstA
L
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
D
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
F
A
 
T
A
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
L
A
 
A
V
 
L
A
 
A
R
 
R
Y
 
W
L
 
M
R
 
E
A
 
K
A
 
R
R
 
Y
A
 
D
V
 
I
R
 
P
C
 
M
E
 
S
P
 
K
E
 
V
Q
 
E
V
 
I
V
 
M
V
 
T
T
 
V
A
 
A
G
|
G
A
x
S
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
I
L
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
P
A
 
I
W
 
V
M
 
V
E
 
E
D
 
A
P
 
P
G
 
T
Y
|
Y
P
 
L
A
 
A
V
 
A
R
 
I
A
 
Q
A
 
A
L
 
F
E
 
K
A
 
Y
A
 
Y
G
 
D
A
 
P
R
 
E
I
 
F
V
 
I
P
 
S
V
 
I
P
 
P
V
 
L
D
 
D
G
 
D
Q
 
K
G
 
G
M
 
M
D
 
R
V
 
V
G
 
D
S
 
L
G
 
L
I
 
E
A
 
E
A
 
K
A
 
L
P
 
E
E
 
E
A
 
L
R
 
R
-
 
K
-
 
Q
-
 
G
-
 
K
-
 
R
-
 
V
-
 
K
L
 
I
A
 
V
Y
 
Y
V
 
T
T
x
V
P
 
S
S
 
T
S
 
F
Q
 
Q
Y
x
N
P
 
P
L
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
M
S
 
S
M
 
V
A
 
D
R
 
R
R
 
R
L
 
K
E
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
N
R
 
E
A
 
Y
G
 
D
A
 
F
W
 
L
V
 
I
L
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
G
Y
x
P
D
x
Y
S
 
S
E
 
E
F
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
R
 
E
P
 
P
L
 
T
A
 
P
S
 
P
L
 
I
Q
 
K
G
 
H
V
 
F
D
 
D
E
 
D
A
 
Y
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
V
 
I
L
 
L
F
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
W
A
 
V
V
 
A
L
 
A
P
 
H
P
 
P
A
 
H
L
 
L
L
 
I
E
 
R
G
 
K
V
 
M
L
 
E
S
 
I
T
 
A
R
 
K
L
 
Q
L
 
S
S
 
I
D
 
D
W
 
L
H
 
C
P
 
T
A
 
N
A
 
T
L
 
F
Q
 
G
E
 
Q
G
 
A
V
 
I
V
 
A
T
 
W
D
 
K
F
 
Y
I
 
V
E
 
E
E
 
N
G
 
G
H
 
Y
F
 
L
A
 
D
Q
 
E
H
 
H
L
 
I
R
 
P
R
 
K
M
 
I
R
 
I
Q
 
E
H
 
F
Y
 
Y
R
 
K
G
 
P
T
 
R
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
M
V
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
E
H
 
Y
L
 
M
P
 
P
G
 
E
R
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
W
E
 
T
V
 
K
P
 
P
D
 
E
Q
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
F
L
 
V
L
 
R
A
 
V
R
 
T
L
 
L
R
 
P
P
 
E
G
 
G
L
 
I
L
 
D
D
 
T
T
 
K
A
 
L
V
 
M
A
 
M
A
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
V
R
 
A
R
 
K
G
 
G
I
 
V
I
 
A
A
 
Y
R
 
V
P
 
P
V
 
G
S
 
E
P
 
A
M
 
F
F
 
F
L
 
V
A
 
H
A
 
R
P
 
D
P
 
K
V
 
K
Q
 
N
A
 
T
L
 
M
M
 
R
L
 
L
G
 
N
F
 
F
S
 
T
G
 
Y
H
 
V
E
 
P
P
 
E
G
 
E
A
 
T
L
 
I
R
 
R
W
 
E
A
 
G
A
 
V
R
 
R
E
 
R
L
 
L
A
 
A

3wx9A Crystal structure of pyrococcus horikoshii kynurenine aminotransferase in complex with pmp, gla, 4ad, 2og, glu and kya
27% identity, 72% coverage: 127:466/470 of query aligns to 50:395/404 of 3wx9A

query
sites
3wx9A
Q
 
E
V
 
I
W
 
I
R
 
R
G
 
D
L
 
I
T
 
L
A
 
V
R
 
E
R
 
I
L
 
M
Q
 
E
R
 
K
P
 
Y
D
 
A
P
 
D
A
 
K
L
 
A
L
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
D
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
F
A
 
T
A
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
M
R
 
K
Y
 
W
L
 
L
R
 
-
A
 
G
A
 
K
R
 
R
A
 
Y
V
 
G
R
 
I
C
 
S
E
 
Q
P
 
D
E
 
N
Q
 
D
V
 
I
V
 
M
V
 
I
T
 
T
A
 
S
G
|
G
A
x
S
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
I
L
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
I
A
 
V
W
 
V
M
 
V
E
 
E
D
 
A
P
 
P
G
 
T
Y
|
Y
P
x
L
A
 
A
V
 
A
R
 
L
A
 
Q
A
 
A
L
 
F
E
 
N
A
 
F
A
 
Y
G
 
E
A
 
P
R
 
Q
I
 
Y
V
 
I
P
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
L
D
 
D
G
 
D
Q
 
E
G
 
G
M
 
M
D
 
K
V
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
L
G
 
K
S
 
E
G
 
L
I
 
K
A
 
S
A
 
Q
A
 
G
P
 
K
E
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
V
A
 
V
Y
 
Y
V
 
T
T
 
V
P
 
P
S
 
T
S
 
F
Q
 
Q
Y
x
N
P
 
P
L
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
M
S
 
N
M
 
E
A
 
D
R
 
R
R
 
R
L
 
K
E
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
S
R
 
E
A
 
Y
G
 
D
A
 
F
W
 
I
V
 
V
L
 
V
E
 
E
D
|
D
D
|
D
Y
x
P
D
x
Y
S
x
G
E
|
E
F
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
R
 
N
P
 
P
L
 
E
A
 
K
S
 
K
L
 
I
Q
 
K
G
 
A
V
 
L
D
 
D
E
 
N
A
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
G
|
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
V
x
I
L
 
L
F
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
W
A
 
M
V
 
V
L
 
G
P
 
D
P
 
P
A
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
R
G
 
K
V
 
M
L
 
E
S
 
I
T
 
A
R
 
K
L
 
Q
L
 
S
S
 
T
D
 
D
W
 
L
H
 
C
P
 
T
A
 
N
A
 
V
L
 
F
Q
 
G
E
 
Q
G
 
V
V
 
V
V
 
A
T
 
W
D
 
R
F
 
Y
I
 
V
E
 
D
E
 
G
G
 
G
H
 
Y
F
 
L
A
 
E
Q
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
P
R
 
E
M
 
I
R
 
R
Q
 
K
H
 
F
Y
 
Y
R
 
K
G
 
P
T
 
R
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
M
V
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
E
H
 
F
L
 
M
P
 
P
G
 
E
R
 
G
L
 
V
E
 
K
V
 
W
E
 
T
V
 
K
P
 
P
D
 
E
Q
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
F
L
 
I
L
 
W
A
 
V
R
 
T
L
 
L
R
 
P
P
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
D
D
 
S
T
 
K
A
 
K
V
 
M
A
 
L
A
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
I
R
 
K
R
 
K
G
 
G
I
 
V
I
 
A
A
 
Y
R
x
V
P
 
P
V
 
G
S
 
E
P
x
A
M
 
F
F
 
Y
L
 
A
A
 
H
A
x
R
P
 
D
P
 
V
V
 
K
Q
 
N
A
 
T
L
 
M
M
x
R
L
 
L
G
 
N
F
 
F
S
 
T
G
 
Y
H
 
V
E
 
D
P
 
E
G
 
D
A
 
K
L
 
I
R
 
M
W
 
E
A
 
G
A
 
I
R
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3av7A Crystal structure of pyrococcus horikoshii kynurenine aminotransferase in complex with pmp, kyn as substrates and kya as products
27% identity, 72% coverage: 127:466/470 of query aligns to 50:395/404 of 3av7A

query
sites
3av7A
Q
 
E
V
 
I
W
 
I
R
 
R
G
 
D
L
 
I
T
 
L
A
 
V
R
 
E
R
 
I
L
 
M
Q
 
E
R
 
K
P
 
Y
D
 
A
P
 
D
A
 
K
L
 
A
L
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
D
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
F
A
 
T
A
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
M
R
 
K
Y
 
W
L
 
L
R
 
-
A
 
G
A
 
K
R
 
R
A
 
Y
V
 
G
R
 
I
C
 
S
E
 
Q
P
 
D
E
 
N
Q
 
D
V
 
I
V
 
M
V
 
I
T
 
T
A
 
S
G
|
G
A
x
S
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
I
L
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
I
A
 
V
W
 
V
M
 
V
E
 
E
D
 
A
P
 
P
G
 
T
Y
|
Y
P
x
L
A
|
A
V
 
A
R
 
L
A
x
Q
A
 
A
L
 
F
E
 
N
A
 
F
A
 
Y
G
 
E
A
 
P
R
 
Q
I
 
Y
V
 
I
P
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
L
D
 
D
G
 
D
Q
 
E
G
 
G
M
 
M
D
 
K
V
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
L
G
 
K
S
 
E
G
 
L
I
 
K
A
 
S
A
 
Q
A
 
G
P
 
K
E
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
V
A
 
V
Y
 
Y
V
 
T
T
x
V
P
 
P
S
 
T
S
 
F
Q
 
Q
Y
x
N
P
 
P
L
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
M
S
 
N
M
 
E
A
 
D
R
 
R
R
 
R
L
 
K
E
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
S
R
 
E
A
 
Y
G
 
D
A
 
F
W
 
I
V
 
V
L
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
Y
x
P
D
x
Y
S
 
G
E
 
E
F
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
R
 
N
P
 
P
L
 
E
A
 
K
S
 
K
L
 
I
Q
 
K
G
 
A
V
 
L
D
 
D
E
 
N
A
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
V
 
I
L
 
L
F
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
W
A
 
M
V
 
V
L
 
G
P
 
D
P
 
P
A
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
R
G
 
K
V
 
M
L
 
E
S
 
I
T
 
A
R
 
K
L
 
Q
L
 
S
S
 
T
D
 
D
W
 
L
H
 
C
P
 
T
A
 
N
A
 
V
L
 
F
Q
 
G
E
 
Q
G
 
V
V
 
V
V
 
A
T
 
W
D
 
R
F
 
Y
I
 
V
E
 
D
E
 
G
G
 
G
H
 
Y
F
 
L
A
 
E
Q
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
P
R
 
E
M
 
I
R
 
R
Q
 
K
H
 
F
Y
 
Y
R
 
K
G
 
P
T
 
R
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
M
V
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
E
H
 
F
L
 
M
P
 
P
G
 
E
R
 
G
L
 
V
E
 
K
V
 
W
E
 
T
V
 
K
P
 
P
D
 
E
Q
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
F
L
 
I
L
 
W
A
 
V
R
 
T
L
 
L
R
 
P
P
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
D
D
 
S
T
 
K
A
 
K
V
 
M
A
 
L
A
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
I
R
 
K
R
 
K
G
 
G
I
 
V
I
 
A
A
 
Y
R
 
V
P
 
P
V
 
G
S
 
E
P
x
A
M
 
F
F
 
Y
L
 
A
A
 
H
A
x
R
P
 
D
P
 
V
V
 
K
Q
 
N
A
 
T
L
 
M
M
x
R
L
 
L
G
 
N
F
 
F
S
 
T
G
 
Y
H
 
V
E
 
D
P
 
E
G
 
D
A
 
K
L
 
I
R
 
M
W
 
E
A
 
G
A
 
I
R
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3aowC Crystal structure of pyrococcus horikoshii kynurenine aminotransferase in complex with akg
27% identity, 72% coverage: 127:466/470 of query aligns to 50:395/404 of 3aowC

query
sites
3aowC
Q
 
E
V
 
I
W
 
I
R
 
R
G
 
D
L
 
I
T
 
L
A
 
V
R
 
E
R
 
I
L
 
M
Q
 
E
R
 
K
P
 
Y
D
 
A
P
 
D
A
 
K
L
 
A
L
 
L
G
 
Q
Y
|
Y
A
 
G
D
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
F
A
 
T
A
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
M
R
 
K
Y
 
W
L
 
L
R
 
-
A
 
G
A
 
K
R
 
R
A
 
Y
V
 
G
R
 
I
C
 
S
E
 
Q
P
 
D
E
 
N
Q
 
D
V
 
I
V
 
M
V
 
I
T
 
T
A
 
S
G
|
G
A
x
S
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
I
L
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
I
A
 
V
W
 
V
M
 
V
E
 
E
D
 
A
P
 
P
G
 
T
Y
|
Y
P
 
L
A
 
A
V
 
A
R
 
L
A
 
Q
A
 
A
L
 
F
E
 
N
A
 
F
A
 
Y
G
 
E
A
 
P
R
 
Q
I
 
Y
V
 
I
P
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
L
D
 
D
G
 
D
Q
 
E
G
 
G
M
 
M
D
 
K
V
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
L
G
 
K
S
 
E
G
 
L
I
 
K
A
 
S
A
 
Q
A
 
G
P
 
K
E
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
V
A
 
V
Y
 
Y
V
 
T
T
x
V
P
 
P
S
 
T
S
 
F
Q
 
Q
Y
x
N
P
 
P
L
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
M
S
 
N
M
 
E
A
 
D
R
 
R
R
 
R
L
 
K
E
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
S
R
 
E
A
 
Y
G
 
D
A
 
F
W
 
I
V
 
V
L
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
Y
x
P
D
x
Y
S
 
G
E
 
E
F
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
R
 
N
P
 
P
L
 
E
A
 
K
S
 
K
L
 
I
Q
 
K
G
 
A
V
 
L
D
 
D
E
 
N
A
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
V
 
I
L
 
L
F
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
W
A
 
M
V
 
V
L
 
G
P
 
D
P
 
P
A
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
R
G
 
K
V
 
M
L
 
E
S
 
I
T
 
A
R
 
K
L
 
Q
L
 
S
S
 
T
D
 
D
W
x
L
H
 
C
P
 
T
A
 
N
A
 
V
L
 
F
Q
 
G
E
 
Q
G
 
V
V
 
V
V
 
A
T
 
W
D
 
R
F
 
Y
I
 
V
E
 
D
E
 
G
G
 
G
H
 
Y
F
 
L
A
 
E
Q
 
K
H
 
H
L
 
I
R
 
P
R
 
E
M
 
I
R
 
R
Q
 
K
H
 
F
Y
 
Y
R
 
K
G
 
P
T
 
R
R
 
R
D
 
D
A
 
A
L
 
M
V
 
L
A
 
E
A
 
A
L
 
L
R
 
E
E
 
E
H
 
F
L
 
M
P
 
P
G
 
E
R
 
G
L
 
V
E
 
K
V
 
W
E
 
T
V
 
K
P
 
P
D
 
E
Q
 
G
G
 
G
M
 
M
K
 
F
L
 
I
L
 
W
A
 
V
R
 
T
L
 
L
R
 
P
P
 
D
G
 
G
L
 
I
L
 
D
D
 
S
T
 
K
A
 
K
V
 
M
A
 
L
A
 
E
A
 
R
A
 
A
A
 
I
R
 
K
R
 
K
G
 
G
I
 
V
I
 
A
A
 
Y
R
 
V
P
 
P
V
 
G
S
 
E
P
 
A
M
 
F
F
 
Y
L
 
A
A
 
H
A
 
R
P
 
D
P
 
V
V
 
K
Q
 
N
A
 
T
L
 
M
M
 
R
L
 
L
G
 
N
F
 
F
S
 
T
G
 
Y
H
 
V
E
 
D
P
 
E
G
 
D
A
 
K
L
 
I
R
 
M
W
 
E
A
 
G
A
 
I
R
 
K
E
 
R
L
 
L
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3aovA Crystal structure of pyrococcus horikoshii kynurenine aminotransferase in complex with plp
27% identity, 72% coverage: 127:466/470 of query aligns to 50:395/404 of 3aovA

query
sites
3aovA
Q
 
E
V
 
I
W
 
I
R
 
R
G
 
D
L
 
I
T
 
L
A
 
V
R
 
E
R
 
I
L
 
M
Q
 
E
R
 
K
P
 
Y
D
 
A
P
 
D
A
 
K
L
 
A
L
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
A
 
G
D
 
T
P
 
T
R
 
K
G
 
G
S
 
F
A
 
T
A
 
P
L
 
L
R
 
R
G
 
E
A
 
T
V
 
L
A
 
M
R
 
K
Y
 
W
L
 
L
R
 
-
A
 
G
A
 
K
R
 
R
A
 
Y
V
 
G
R
 
I
C
 
S
E
 
Q
P
 
D
E
 
N
Q
 
D
V
 
I
V
 
M
V
 
I
T
 
T
A
 
S
G
|
G
A
x
S
Q
|
Q
Q
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
D
L
 
L
V
 
I
L
 
G
R
 
R
V
 
V
L
 
F
L
 
L
R
 
N
P
 
P
G
 
G
D
 
D
A
 
I
A
 
V
W
 
V
M
 
V
E
 
E
D
 
A
P
 
P
G
 
T
Y
|
Y
P
 
L
A
 
A
V
 
A
R
 
L
A
 
Q
A
 
A
L
 
F
E
 
N
A
 
F
A
 
Y
G
 
E
A
 
P
R
 
Q
I
 
Y
V
 
I
P
 
Q
V
 
I
P
 
P
V
 
L
D
 
D
G
 
D
Q
 
E
G
 
G
M
 
M
D
 
K
V
 
V
-
 
E
-
 
I
-
 
L
-
 
E
-
 
E
-
 
K
-
 
L
G
 
K
S
 
E
G
 
L
I
 
K
A
 
S
A
 
Q
A
 
G
P
 
K
E
 
K
A
 
V
R
 
K
L
 
V
A
 
V
Y
 
Y
V
 
T
T
x
V
P
 
P
S
 
T
S
 
F
Q
 
Q
Y
x
N
P
 
P
L
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
T
L
 
M
S
 
N
M
 
E
A
 
D
R
 
R
R
 
R
L
 
K
E
 
Y
L
 
L
L
 
L
A
 
E
W
 
L
A
 
A
R
 
S
R
 
E
A
 
Y
G
 
D
A
 
F
W
 
I
V
 
V
L
 
V
E
 
E
D
|
D
D
 
D
Y
x
P
D
x
Y
S
 
G
E
 
E
F
 
L
R
 
R
Y
 
Y
A
 
S
G
 
G
R
 
N
P
 
P
L
 
E
A
 
K
S
 
K
L
 
I
Q
 
K
G
 
A
V
 
L
D
 
D
E
 
N
A
 
E
G
 
G
R
 
R
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
V
 
L
G
 
G
T
|
T
F
 
F
S
|
S
K
|
K
V
 
I
L
 
L
F
 
A
P
 
P
G
 
G
L
 
F
R
|
R
L
 
I
G
 
G
Y
 
W
A
 
M
V
 
V
L
 
G
P
 
D
P
 
P
A
 
G
L
 
I
L
 
I
E
 
R
G
 
K
V
 
M
L
 
E
S
 
I
T
 
A
R
 
K