SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_090663522.1 NCBI__GCF_900101615.1:WP_090663522.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6g4fA Crystal structure of the omega transaminase from pseudomonas jessenii in complex with pmp (see paper)
50% identity, 96% coverage: 4:447/461 of query aligns to 1:443/451 of 6g4fA

query
sites
6g4fA
N
 
S
S
 
S
L
 
L
H
 
P
A
 
E
A
 
K
D
 
D
L
 
I
A
 
Q
H
 
Y
L
 
Q
V
 
L
H
 
H
Q
 
P
Q
x
Y
T
 
T
D
 
N
L
 
A
G
 
R
A
 
L
H
 
H
E
 
Q
Q
 
E
E
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
L
L
 
I
I
 
I
A
 
E
S
 
R
G
 
G
N
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
V
 
V
T
 
Y
D
 
D
T
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
E
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
S
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
S
E
 
N
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
F
L
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
H
 
H
T
 
L
F
 
F
F
 
S
Q
 
H
K
 
K
G
 
S
H
 
H
E
 
R
P
 
P
S
 
S
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
A
 
E
I
 
M
A
 
A
P
 
P
E
 
V
G
 
P
L
 
M
G
 
S
H
 
K
V
 
V
L
 
F
F
 
F
Q
 
T
C
 
N
S
|
S
G
|
G
S
|
S
E
 
E
A
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
A
 
V
I
 
V
K
 
K
L
 
M
I
 
V
W
 
W
Y
 
Y
Y
 
L
N
 
N
N
 
N
I
 
A
R
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Q
 
A
K
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
F
I
 
I
G
 
S
R
 
R
V
 
V
R
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
N
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
G
M
 
N
Q
 
Q
A
 
R
D
 
G
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
-
D
 
P
R
 
G
F
 
F
F
 
L
H
 
H
I
 
V
S
 
G
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
H
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
G
 
A
Q
 
L
E
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
H
F
 
F
S
 
A
A
 
D
R
 
R
M
 
L
A
 
A
E
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
L
 
K
I
 
I
E
 
L
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
F
 
I
A
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
L
Q
 
M
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
P
R
 
R
G
 
T
Y
 
Y
F
 
W
D
 
E
L
 
K
I
 
I
Q
 
Q
P
 
K
I
 
V
L
 
C
K
 
R
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
V
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
L
 
M
W
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
Q
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
M
 
I
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
M
 
I
L
 
M
V
 
V
C
 
L
A
 
S
K
|
K
Q
 
Q
L
 
L
T
 
S
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
I
S
 
N
D
 
A
P
 
P
I
 
V
H
 
F
A
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
A
A
 
D
G
 
Q
S
 
S
R
 
Q
K
 
A
H
 
L
G
 
G
S
 
A
F
 
L
G
 
G
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
Y
 
G
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
A
C
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
N
L
 
L
A
 
K
I
 
I
Y
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
E
D
 
S
I
 
L
L
 
V
G
 
E
H
 
H
V
 
A
R
 
A
A
 
Q
V
 
M
S
 
G
P
 
Q
A
 
L
F
 
L
L
 
R
E
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
A
 
H
L
 
F
R
 
I
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
C
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
D
K
 
R
A
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
P
 
Q
P
 
A
A
 
L
A
 
G
K
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
R
L
 
Y
V
 
M
Q
 
A
E
 
G
R
 
R
C
 
A
Q
 
Q
A
 
E
A
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
I
V
 
T
R
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
V
T
 
N
A
 
E
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
R
 
G
E
 
M
M
 
I
C
 
V
G
 
E
R
 
R
F
 
F
K
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
D
 
D

6g4eA Crystal structure of the omega transaminase from pseudomonas jessenii in complex with plp and 6-aminohexanoate (6-aca) (see paper)
50% identity, 96% coverage: 4:447/461 of query aligns to 1:443/451 of 6g4eA

query
sites
6g4eA
N
 
S
S
 
S
L
 
L
H
 
P
A
 
E
A
 
K
D
 
D
L
 
I
A
 
Q
H
 
Y
L
 
Q
V
 
L
H
 
H
Q
 
P
Q
x
Y
T
 
T
D
 
N
L
 
A
G
 
R
A
 
L
H
 
H
E
 
Q
Q
 
E
E
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
L
L
 
I
I
 
I
A
 
E
S
 
R
G
 
G
N
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
V
 
V
T
 
Y
D
 
D
T
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
E
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
S
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
S
E
 
N
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
F
L
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
H
 
H
T
 
L
F
 
F
F
 
S
Q
 
H
K
 
K
G
 
S
H
 
H
E
 
R
P
 
P
S
 
S
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
A
 
E
I
 
M
A
 
A
P
 
P
E
 
V
G
 
P
L
 
M
G
 
S
H
 
K
V
 
V
L
 
F
F
 
F
Q
 
T
C
 
N
S
|
S
G
|
G
S
|
S
E
 
E
A
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
A
 
V
I
 
V
K
 
K
L
 
M
I
 
V
W
 
W
Y
 
Y
Y
 
L
N
 
N
N
 
N
I
 
A
R
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Q
 
A
K
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
F
I
 
I
G
 
S
R
 
R
V
 
V
R
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
N
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
G
M
 
N
Q
 
Q
A
 
R
D
 
G
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
-
D
 
P
R
 
G
F
 
F
F
 
L
H
 
H
I
 
V
S
 
G
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
H
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
G
 
A
Q
 
L
E
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
H
F
 
F
S
 
A
A
 
D
R
 
R
M
 
L
A
 
A
E
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
L
 
K
I
 
I
E
 
L
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
F
 
I
A
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
L
Q
 
M
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
P
R
 
R
G
 
T
Y
 
Y
F
 
W
D
 
E
L
 
K
I
 
I
Q
 
Q
P
 
K
I
 
V
L
 
C
K
 
R
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
V
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
L
 
M
W
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
Q
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
M
 
I
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
M
 
I
L
 
M
V
 
V
C
 
L
A
 
S
K
|
K
Q
 
Q
L
 
L
T
 
S
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
I
S
 
N
D
 
A
P
 
P
I
 
V
H
 
F
A
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
A
A
 
D
G
 
Q
S
 
S
R
 
Q
K
 
A
H
 
L
G
 
G
S
 
A
F
 
L
G
 
G
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
Y
 
G
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
A
C
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
N
L
 
L
A
 
K
I
 
I
Y
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
E
D
 
S
I
 
L
L
 
V
G
 
E
H
 
H
V
 
A
R
 
A
A
 
Q
V
 
M
S
 
G
P
 
Q
A
 
L
F
 
L
L
 
R
E
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
A
 
H
L
 
F
R
 
I
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
C
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
D
K
 
R
A
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
P
 
Q
P
 
A
A
 
L
A
 
G
K
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
R
L
 
Y
V
 
M
Q
 
A
E
 
G
R
 
R
C
 
A
Q
 
Q
A
 
E
A
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
I
V
 
T
R
|
R
A
 
A
I
x
M
G
 
G
D
 
D
R
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
V
T
 
N
A
 
E
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
R
 
G
E
 
M
M
 
I
C
 
V
G
 
E
R
 
R
F
 
F
K
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
D
 
D

6g4dB Crystal structure of the omega transaminase from pseudomonas jessenii in complex with plp (see paper)
50% identity, 96% coverage: 4:447/461 of query aligns to 1:443/453 of 6g4dB

query
sites
6g4dB
N
 
S
S
 
S
L
 
L
H
 
P
A
 
E
A
 
K
D
 
D
L
 
I
A
 
Q
H
 
Y
L
 
Q
V
 
L
H
 
H
Q
 
P
Q
x
Y
T
 
T
D
 
N
L
 
A
G
 
R
A
 
L
H
 
H
E
 
Q
Q
 
E
E
 
L
G
 
G
A
 
P
I
 
L
L
 
I
I
 
I
A
 
E
S
 
R
G
 
G
N
 
E
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
V
 
V
T
 
Y
D
 
D
T
 
D
E
 
Q
G
 
G
R
 
K
E
 
G
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
S
A
 
A
S
 
A
L
 
L
G
 
G
F
 
F
S
 
S
E
 
N
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
I
E
 
K
A
 
A
A
 
A
Y
 
E
K
 
Q
Q
 
Q
M
 
F
L
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
H
 
H
T
 
L
F
 
F
F
 
S
Q
 
H
K
 
K
G
 
S
H
 
H
E
 
R
P
 
P
S
 
S
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
I
A
 
E
I
 
M
A
 
A
P
 
P
E
 
V
G
 
P
L
 
M
G
 
S
H
 
K
V
 
V
L
 
F
F
 
F
Q
 
T
C
 
N
S
|
S
G
|
G
S
|
S
E
 
E
A
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
A
 
V
I
 
V
K
 
K
L
 
M
I
 
V
W
 
W
Y
 
Y
Y
 
L
N
 
N
N
 
N
I
 
A
R
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Q
 
A
K
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
F
I
 
I
G
 
S
R
 
R
V
 
V
R
 
N
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
N
 
I
T
 
T
V
 
V
A
 
A
T
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
G
M
 
N
Q
 
Q
A
 
R
D
 
G
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
-
D
 
P
R
 
G
F
 
F
F
 
L
H
 
H
I
 
V
S
 
G
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
H
Y
 
Y
R
 
R
F
 
F
G
 
A
Q
 
L
E
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
H
F
 
F
S
 
A
A
 
D
R
 
R
M
 
L
A
 
A
E
 
V
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
L
 
K
I
 
I
E
 
L
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
F
 
I
A
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
L
Q
 
M
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
V
P
 
P
P
 
P
R
 
R
G
 
T
Y
 
Y
F
 
W
D
 
E
L
 
K
I
 
I
Q
 
Q
P
 
K
I
 
V
L
 
C
K
 
R
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
V
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
Q
L
 
M
W
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
Q
T
 
T
Y
 
F
G
 
G
M
 
I
R
 
Q
P
 
P
D
 
D
M
 
I
L
 
M
V
 
V
C
 
L
A
 
S
K
|
K
Q
 
Q
L
 
L
T
 
S
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
P
 
P
L
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
I
S
 
N
D
 
A
P
 
P
I
 
V
H
 
F
A
 
E
A
 
G
L
 
I
M
 
A
A
 
D
G
 
Q
S
 
S
R
 
Q
K
 
A
H
 
L
G
 
G
S
 
A
F
 
L
G
 
G
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
Y
 
G
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
A
C
 
T
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
N
L
 
L
A
 
K
I
 
I
Y
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
E
D
 
S
I
 
L
L
 
V
G
 
E
H
 
H
V
 
A
R
 
A
A
 
Q
V
 
M
S
 
G
P
 
Q
A
 
L
F
 
L
L
 
R
E
 
S
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
A
 
H
L
 
F
R
 
I
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
C
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
A
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
D
K
 
R
A
 
V
T
 
S
K
 
K
A
 
A
P
 
P
F
 
Y
P
 
Q
P
 
A
A
 
L
A
 
G
K
 
T
V
 
L
G
 
G
L
 
R
L
 
Y
V
 
M
Q
 
A
E
 
G
R
 
R
C
 
A
Q
 
Q
A
 
E
A
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
I
V
 
T
R
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
A
I
 
V
A
 
A
F
 
F
T
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
V
T
 
N
A
 
E
E
 
Q
E
 
E
I
 
V
R
 
G
E
 
M
M
 
I
C
 
V
G
 
E
R
 
R
F
 
F
K
 
A
A
 
R
G
 
A
L
 
L
D
 
D

5ghgB Transaminase w58l with smba
50% identity, 98% coverage: 3:453/461 of query aligns to 1:431/433 of 5ghgB

query
sites
5ghgB
P
 
P
N
 
N
S
 
S
L
 
L
H
 
E
A
 
A
A
 
R
D
 
D
L
 
I
A
 
R
H
 
Y
L
 
H
V
 
L
H
 
H
Q
 
S
Q
x
Y
T
 
T
D
 
D
L
 
A
G
 
V
A
 
R
H
 
L
E
 
E
Q
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
P
I
 
L
L
 
V
I
 
I
A
 
E
S
 
R
G
 
G
N
 
D
G
 
G
V
 
I
R
 
Y
V
 
V
T
 
E
D
 
D
T
 
V
E
 
S
G
 
G
R
 
K
E
 
R
Y
 
Y
I
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
M
A
 
S
G
 
G
L
 
L
W
 
L
C
 
S
A
 
V
S
 
G
L
 
V
G
 
G
F
 
F
S
 
S
E
 
E
R
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
A
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
A
K
 
R
Q
 
Q
M
 
M
L
 
K
A
 
K
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
H
 
H
T
 
T
F
 
F
F
 
-
Q
 
-
K
 
-
G
 
-
H
 
H
E
 
G
P
 
P
S
 
V
V
 
I
R
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
S
I
 
M
A
 
A
P
 
P
E
 
V
G
 
P
L
 
M
G
 
S
H
 
K
V
 
A
L
 
Y
F
 
F
Q
 
T
C
 
N
S
|
S
G
|
G
S
|
S
E
 
E
A
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
A
 
V
I
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
I
W
 
W
Y
 
Y
Y
 
R
N
 
S
N
 
N
I
 
A
R
 
L
G
 
G
K
 
E
P
 
P
Q
 
E
K
 
R
K
 
K
K
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
R
V
 
K
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
N
 
V
T
 
T
V
 
I
A
 
A
T
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
N
M
 
N
Q
 
H
A
 
R
D
 
S
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
-
D
 
D
R
 
R
F
 
I
F
 
L
H
 
H
I
 
T
S
 
G
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
F
Y
 
Y
R
 
R
F
 
E
G
 
G
Q
 
Q
E
 
A
G
 
G
E
 
E
T
 
S
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
S
 
A
A
 
T
R
 
R
M
 
L
A
 
A
E
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
I
 
I
E
 
I
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
H
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
F
 
I
A
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
V
T
 
V
P
 
P
P
 
P
R
 
K
G
 
T
Y
 
Y
F
 
W
D
 
E
L
 
K
I
 
V
Q
 
Q
P
 
A
I
 
V
L
 
L
K
 
K
R
 
R
H
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
L
W
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
Q
T
 
T
Y
 
F
G
 
D
M
 
M
R
 
K
P
 
P
D
 
D
M
 
I
L
 
L
V
 
V
C
 
M
A
 
S
K
|
K
Q
 
Q
L
 
L
T
 
S
A
 
S
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
L
P
 
P
L
 
I
S
 
S
A
 
A
L
 
F
L
 
L
I
 
I
S
 
N
D
 
E
P
 
R
I
 
V
H
 
Y
A
 
A
A
 
P
L
 
I
M
 
A
A
 
S
G
 
-
S
 
-
R
 
-
K
 
-
H
 
-
G
 
-
S
 
-
F
 
-
G
 
-
H
 
-
G
 
-
F
 
-
T
 
-
Y
 
-
G
 
-
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
A
C
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
N
L
 
L
A
 
A
I
 
I
Y
 
I
E
 
E
E
 
E
R
 
R
D
 
D
I
 
L
L
 
V
G
 
A
H
 
N
V
 
A
R
 
R
A
 
D
V
 
R
S
 
G
P
 
T
A
 
Y
F
 
M
L
 
Q
E
 
K
G
 
R
L
 
L
E
 
R
A
 
E
L
 
L
R
 
Q
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
V
E
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
T
D
 
D
K
 
K
A
 
Q
T
 
A
K
 
K
A
 
T
P
 
G
F
 
L
P
 
E
P
 
P
A
 
T
A
 
G
K
 
A
V
 
L
G
 
G
L
 
A
L
 
K
V
 
A
Q
 
N
E
 
A
R
 
V
C
 
L
Q
 
Q
A
 
E
A
 
R
G
 
G
L
 
V
I
 
I
V
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
M
G
 
G
D
 
D
R
 
T
I
 
L
A
|
A
F
 
F
T
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
N
A
 
D
E
 
Q
E
 
Q
I
 
V
R
 
D
E
 
T
M
 
M
C
 
V
G
 
S
R
 
A
F
 
L
K
 
E
A
 
A
G
 
T
L
 
L
D
 
N
A
 
D
A
 
V
W
 
Q
A
 
A
E
 
S
L
 
L

D6R3B6 Vanillin aminotransferase; Putative aminotransferase; pAMT; EC 2.6.1.119 from Capsicum frutescens (Cayenne pepper) (Tabasco pepper) (see paper)
47% identity, 89% coverage: 30:438/461 of query aligns to 28:436/459 of D6R3B6

query
sites
D6R3B6
I
 
L
L
 
V
I
 
I
A
 
E
S
 
K
G
 
S
N
 
K
G
 
G
V
 
S
R
 
Y
V
 
V
T
 
Y
D
 
D
T
 
I
E
 
N
G
 
G
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
I
 
L
E
 
D
A
 
T
M
 
L
A
 
S
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
C
A
 
A
S
 
T
L
 
L
G
 
G
F
 
G
S
 
S
E
 
E
R
 
T
R
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
N
K
 
K
Q
 
Q
M
 
L
L
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
H
 
H
T
 
S
F
 
F
F
 
W
Q
 
N
K
 
R
G
 
T
H
 
T
E
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
L
R
 
D
L
 
L
A
 
A
-
 
K
E
 
E
K
 
L
L
 
L
A
 
N
A
 
M
I
 
F
A
 
T
P
 
A
E
 
N
G
 
K
L
 
M
G
 
A
H
 
K
V
 
V
L
 
F
F
 
F
Q
 
T
C
 
N
S
 
S
G
 
G
S
 
S
E
 
E
A
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
A
 
Q
I
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
W
 
W
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
N
 
N
I
 
A
R
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
A
R
 
R
V
 
A
R
 
K
G
 
A
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
N
 
S
T
 
T
V
 
Y
A
 
I
T
x
S
A
|
A
S
x
G
L
|
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
P
M
 
M
Q
 
H
A
 
Q
D
 
K
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
-
G
 
P
D
 
P
R
 
F
F
 
V
F
 
L
H
 
H
I
 
T
S
 
E
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
Y
Y
 
W
R
 
A
F
 
Y
G
 
H
Q
 
L
E
 
P
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
F
 
F
S
 
S
A
 
T
R
 
R
M
 
L
A
 
A
E
 
N
E
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
L
I
 
I
E
 
L
R
 
N
E
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
F
F
 
I
A
 
A
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
L
G
 
G
G
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
L
P
 
P
P
 
P
R
 
A
G
 
T
Y
 
Y
F
 
F
D
 
D
L
 
K
I
 
V
Q
 
Q
P
 
A
I
 
I
L
 
L
K
 
R
R
 
K
H
 
H
D
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
F
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
V
C
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
M
W
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
D
T
 
K
Y
 
Y
G
 
N
M
 
I
R
 
K
P
 
P
D
 
D
M
 
L
L
 
V
V
 
S
C
 
V
A
 
A
K
 
K
Q
 
A
L
 
L
T
 
S
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
Q
 
M
P
 
P
L
 
I
S
 
A
A
 
A
L
 
V
L
 
L
I
 
V
S
 
S
D
 
Q
P
 
K
I
 
I
H
 
S
A
 
S
A
 
V
L
 
I
M
 
L
A
 
S
G
 
E
S
 
S
R
 
N
K
 
K
H
 
I
G
 
G
S
 
A
F
 
F
G
 
C
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
L
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
K
I
 
I
Y
 
Y
E
 
K
E
 
E
R
 
R
D
 
N
I
 
I
L
 
T
G
 
E
H
 
V
V
 
V
R
 
N
A
 
K
V
 
I
S
 
S
P
 
Q
A
 
K
F
 
F
L
 
Q
E
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
K
A
 
A
L
 
F
R
 
A
D
 
D
H
 
S
P
 
P
L
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
E
V
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
A
A
 
L
G
 
S
V
 
T
E
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
D
D
 
N
K
 
K
A
 
S
T
 
P
K
 
N
A
 
D
P
 
P
F
 
F
P
 
P
P
 
Y
A
 
E
A
 
W
K
 
A
V
 
V
G
 
G
L
 
T
L
 
Y
V
 
F
Q
 
G
E
 
A
R
 
Q
C
 
C
Q
 
A
A
 
K
A
 
Y
G
 
G
L
 
M
I
 
L
V
 
V
R
 
S
A
 
S
I
 
T
G
 
G
D
 
D
R
 
H
I
 
V
A
 
N
F
 
M
T
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
F
I
 
T
I
 
L
T
 
S
A
 
L
E
 
E
E
 
E
I
 
L
R
 
D
E
 
E
M
 
L

Q94CE5 Gamma-aminobutyrate transaminase POP2, mitochondrial; AtGABA-T; Gamma-aminobutyric acid aminotransferase 1; Protein HEXENAL RESPONSE 1; Protein POLLEN-PISTIL INCOMPATIBILITY 2; AtPOP2; EC 2.6.1.96 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see 2 papers)
45% identity, 91% coverage: 30:449/461 of query aligns to 71:491/504 of Q94CE5

query
sites
Q94CE5
I
 
L
L
 
V
I
 
I
A
 
A
S
 
K
G
 
S
N
 
E
G
 
G
V
 
S
R
 
Y
V
 
V
T
 
Y
D
 
D
T
 
D
E
 
T
G
 
G
R
 
K
E
 
K
Y
 
Y
I
 
L
E
 
D
A
 
S
M
 
L
A
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
|
C
A
 
T
S
 
A
L
 
L
G
 
G
F
x
G
S
 
N
E
 
E
R
 
P
R
 
R
L
 
L
A
 
V
E
 
S
A
 
A
A
 
A
Y
 
V
K
 
E
Q
 
Q
M
 
L
L
 
N
A
 
T
L
 
L
P
 
P
Y
 
F
Y
 
Y
H
 
H
T
 
S
F
 
F
F
 
W
Q
 
N
K
 
R
G
 
T
H
 
T
E
 
K
P
 
P
S
 
S
V
 
L
R
 
D
L
 
L
A
 
A
E
 
K
K
 
V
L
 
L
A
 
L
A
 
E
I
 
M
-
 
F
A
 
T
P
 
A
E
 
N
G
 
K
L
 
M
G
 
A
H
 
K
V
 
A
L
 
F
F
 
F
Q
 
T
C
 
S
S
 
G
G
 
G
S
 
S
E
 
D
A
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
A
 
Q
I
 
V
K
 
K
L
 
L
I
 
V
W
 
W
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
N
 
N
I
 
A
R
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
Q
 
E
K
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
F
I
 
I
G
 
A
R
 
R
V
 
K
R
 
K
G
 
S
Y
 
Y
H
 
H
G
 
G
N
 
S
T
 
T
V
 
L
A
 
I
T
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
P
M
 
L
Q
 
H
A
 
Q
D
 
N
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
-
G
 
A
D
 
P
R
 
F
F
 
V
F
 
L
H
 
H
I
 
T
S
 
D
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
Y
Y
 
W
R
 
R
F
 
F
G
 
H
Q
 
L
E
 
P
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
E
F
 
F
S
 
S
A
 
T
R
 
R
M
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
N
L
 
L
E
 
E
A
 
D
L
 
L
I
 
I
E
 
I
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
E
T
 
T
I
 
I
A
 
G
A
 
A
L
 
F
F
 
I
A
 
A
E
 
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
G
 
G
G
 
A
G
|
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
P
P
 
P
P
 
P
R
 
A
G
 
T
Y
 
Y
F
 
F
D
 
E
L
 
K
I
 
V
Q
 
Q
P
 
A
I
 
V
L
 
V
K
 
K
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
F
V
 
I
A
 
A
D
 
D
E
 
E
V
 
V
I
 
I
C
 
C
G
 
A
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
N
 
T
L
 
M
W
 
F
G
|
G
S
 
C
E
 
D
T
 
K
Y
 
Y
G
 
N
M
 
I
R
 
K
P
 
P
D
 
D
M
 
L
L
 
V
V
 
T
C
 
L
A
 
A
K
 
K
Q
 
A
L
 
L
T
 
S
A
 
S
S
 
A
Y
 
Y
Q
 
M
P
 
P
L
 
I
S
 
G
A
 
A
L
 
I
L
 
L
I
 
M
S
 
S
D
 
Q
P
 
E
I
 
V
H
 
A
A
 
D
A
 
V
L
 
I
M
 
N
A
 
S
G
 
H
S
 
S
R
 
S
K
 
K
H
 
L
G
 
G
S
 
V
F
 
F
G
 
S
H
 
H
G
 
G
F
 
F
T
 
T
Y
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
S
C
 
C
A
 
A
V
 
V
G
 
A
L
 
I
E
 
E
T
 
A
L
 
L
A
 
K
I
 
I
Y
 
Y
E
 
K
E
 
E
R
 
R
D
 
N
I
 
I
L
 
P
G
 
E
H
 
Y
V
 
V
R
 
A
A
 
K
V
 
V
S
 
A
P
 
P
A
 
R
F
 
F
L
 
Q
E
 
D
G
 
G
L
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
F
R
 
A
D
 
S
-
 
G
H
 
S
P
 
P
L
 
I
V
 
I
G
 
G
D
 
E
V
 
T
R
 
R
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
L
I
 
I
A
 
L
G
 
G
V
 
T
E
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
D
D
 
N
K
 
K
A
 
S
T
 
P
K
 
N
A
 
E
P
 
P
F
 
F
P
 
P
P
 
P
A
 
E
A
 
W
K
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
A
L
 
F
V
 
F
Q
 
G
E
 
A
R
 
E
C
 
C
Q
 
Q
A
 
K
A
 
H
G
 
G
L
 
M
I
 
L
V
 
V
R
 
R
A
 
V
I
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
G
I
 
I
A
 
L
F
 
M
T
 
S
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
I
I
 
I
T
 
S
A
 
P
E
 
E
E
 
E
I
 
I
R
 
D
E
 
E
M
 
L
C
 
I
G
 
S
R
 
I
F
 
Y
K
 
G
A
 
K
G
 
A
L
 
L
D
 
K
A
 
A
A
 
T

5kr6B Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
46% identity, 98% coverage: 4:453/461 of query aligns to 7:460/460 of 5kr6B

query
sites
5kr6B
N
 
D
S
 
D
L
 
L
H
 
L
A
 
E
A
 
M
D
 
D
L
 
R
A
 
A
H
 
H
L
 
F
V
 
F
H
 
H
Q
 
P
Q
 
S
T
 
T
D
 
H
L
 
L
G
 
R
A
 
D
H
 
H
-
 
A
-
 
S
-
 
G
E
 
E
Q
 
L
E
 
P
G
 
G
A
 
R
I
 
I
L
 
-
I
 
I
A
 
T
S
 
G
G
 
G
N
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
T
 
Q
D
 
D
T
 
S
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
E
 
D
A
 
A
M
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
C
 
C
A
 
V
S
 
N
L
 
V
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
E
 
R
R
 
T
R
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
K
 
E
Q
 
Q
M
 
A
L
 
K
A
 
E
L
 
L
P
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
H
 
H
T
 
T
F
 
Y
F
 
V
Q
 
G
K
 
H
G
 
S
H
 
N
E
 
E
P
 
P
S
 
I
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
E
K
 
R
L
 
I
A
 
I
-
 
R
A
 
E
I
 
W
A
 
A
P
 
P
E
 
A
G
 
G
L
 
M
G
 
S
H
 
K
V
 
V
L
 
Y
F
 
Y
Q
 
G
C
 
M
S
|
S
G
|
G
S
|
S
E
 
D
A
 
A
N
 
N
D
 
E
A
 
T
A
 
Q
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
V
W
 
W
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
N
 
N
I
 
V
R
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
R
V
 
Q
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
N
 
S
T
 
G
V
 
I
A
 
M
T
 
T
A
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
A
M
 
F
Q
 
H
A
 
N
D
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
-
D
 
E
R
 
P
F
 
I
F
 
R
H
 
H
I
 
T
S
 
T
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
Y
Y
 
Y
R
 
R
F
 
-
G
 
A
Q
 
P
E
 
A
G
 
G
E
 
M
T
 
S
E
 
E
E
 
A
Q
 
E
F
 
F
S
 
S
A
 
R
R
 
H
M
 
C
A
 
A
E
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
M
I
 
I
E
 
L
R
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
P
D
 
D
T
 
T
I
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
F
F
 
I
A
 
G
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
G
 
G
G
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
I
I
 
V
T
 
P
P
 
P
P
 
P
R
 
E
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
D
 
E
L
 
A
I
 
I
Q
 
Q
P
 
A
I
 
V
L
 
L
K
 
N
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
C
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
S
L
 
M
W
 
F
G
 
G
S
 
S
E
 
H
T
 
H
Y
 
Y
G
 
G
M
 
M
R
 
K
P
 
P
D
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
T
C
 
V
A
 
A
K
|
K
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
S
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
G
L
 
V
L
 
I
I
 
V
S
 
G
D
 
E
P
 
K
I
 
V
H
 
W
A
 
K
A
 
V
L
 
L
M
 
E
A
 
Q
G
 
G
S
 
S
R
 
D
K
 
Q
H
 
Y
G
 
G
S
 
P
F
 
I
G
 
G
H
 
H
G
 
G
F
 
W
T
 
T
Y
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
I
A
 
C
C
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
A
T
 
N
L
 
L
A
 
D
I
 
I
Y
 
I
E
 
E
E
 
R
R
 
E
D
 
N
I
 
L
L
 
T
G
 
G
H
 
N
V
 
A
R
 
A
A
 
D
V
 
T
S
 
G
P
 
A
A
 
Y
F
 
F
L
 
Q
E
 
Q
G
 
R
L
 
M
-
 
R
E
 
E
A
 
T
L
 
F
R
 
G
D
 
D
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
M
A
 
A
G
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
V
A
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
D
T
 
K
K
 
R
A
 
T
P
 
R
F
 
F
P
 
D
P
 
P
A
 
S
A
 
L
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
P
L
 
R
V
 
V
Q
 
S
E
 
A
R
 
A
C
 
C
Q
 
L
A
 
E
A
 
D
G
 
G
L
 
M
I
 
I
V
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
M
-
 
P
-
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
I
I
 
L
A
 
G
F
 
F
T
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
I
T
 
T
A
 
R
E
 
A
E
 
E
I
 
V
R
 
D
E
 
E
M
 
I
C
 
V
G
 
D
R
 
I
F
 
A
K
 
K
A
 
Q
G
 
A
L
 
V
D
 
D
A
 
A
A
 
V
W
 
A
A
 
D
E
 
E
L
 
L

5kr5A Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
47% identity, 95% coverage: 10:447/461 of query aligns to 9:450/455 of 5kr5A

query
sites
5kr5A
D
 
D
L
 
R
A
 
A
H
 
H
L
 
F
V
 
M
H
 
H
Q
 
P
Q
 
S
T
 
T
D
 
H
L
 
A
G
 
Y
A
 
D
H
 
H
E
 
-
Q
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
T
S
 
G
G
 
G
N
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
T
 
E
D
 
D
T
 
H
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
E
 
D
A
 
A
M
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
C
 
C
A
 
V
S
 
N
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
E
 
R
R
x
E
R
 
E
L
 
V
A
 
A
E
x
D
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
K
 
E
Q
 
Q
M
 
A
L
 
K
A
 
Q
L
 
L
P
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
H
 
H
T
 
T
F
 
Y
F
 
V
Q
 
G
K
 
H
G
 
S
H
 
N
E
 
D
P
 
P
S
 
V
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
S
K
 
R
L
 
I
A
 
I
A
 
E
-
 
D
I
 
W
A
 
A
P
 
P
E
 
A
G
 
G
L
 
M
G
 
K
H
 
K
V
 
V
L
 
F
F
 
Y
Q
 
G
C
 
M
S
|
S
G
|
G
S
|
S
E
 
D
A
 
A
N
 
N
D
 
E
A
 
T
A
 
Q
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
V
W
 
W
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
N
 
N
I
 
V
R
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
Q
 
N
K
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
A
R
 
R
V
 
E
R
 
R
G
 
S
Y
|
Y
H
|
H
G
|
G
N
 
S
T
 
G
V
 
I
A
 
V
T
 
T
A
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
S
M
 
F
Q
 
H
A
 
Q
D
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
-
D
 
D
R
 
R
F
 
V
F
 
K
H
 
H
I
 
T
S
 
V
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
N
F
 
-
G
 
A
Q
 
P
E
 
P
G
 
G
E
 
M
T
 
S
E
 
E
E
 
A
Q
 
Q
F
 
F
S
 
V
A
 
A
R
 
Y
M
 
C
A
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
F
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
G
 
G
G
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
I
I
 
V
T
 
P
P
 
P
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
D
 
E
L
 
A
I
 
I
Q
 
Q
P
 
A
I
 
V
L
 
L
K
 
R
R
 
K
H
 
H
D
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
C
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
N
 
S
L
 
K
W
 
T
G
 
G
S
 
S
E
 
E
T
 
H
Y
 
Y
G
 
G
M
 
I
R
 
K
P
 
P
D
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
T
C
 
V
A
 
A
K
|
K
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
S
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
A
L
 
V
L
 
I
I
 
V
S
 
S
D
 
E
P
 
K
I
 
V
H
 
W
A
 
D
A
 
V
L
 
I
M
 
E
A
 
K
G
 
G
S
 
S
R
 
R
K
 
E
H
 
H
G
 
G
S
 
V
F
 
M
G
 
G
H
 
H
G
 
G
F
x
W
T
|
T
Y
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
C
C
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
A
T
 
N
L
 
L
A
 
D
I
 
I
Y
 
L
E
 
E
E
 
R
R
 
E
D
 
N
I
 
L
L
 
T
G
 
G
H
 
N
V
 
A
R
 
A
A
 
D
V
 
V
S
 
G
P
 
A
A
 
Y
F
 
L
L
 
Q
E
 
Q
G
 
R
L
 
L
-
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
G
D
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
A
G
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
M
A
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
G
T
 
A
K
 
R
A
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
L
K
 
K
V
 
V
G
 
S
L
 
Q
L
 
K
V
 
V
Q
 
A
E
 
A
R
 
A
C
 
A
Q
 
L
A
 
E
A
x
D
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
A
 
A
I
 
L
-
 
P
-
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
I
I
 
L
A
 
G
F
 
F
T
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
T
T
 
T
A
 
R
E
 
A
E
 
E
I
 
V
R
 
D
E
 
E
M
 
I
C
 
V
G
 
A
R
 
I
F
 
A
K
 
K
A
x
E
G
 
A
L
 
F
D
 
D

5kr3A Directed evolution of transaminases by ancestral reconstruction. Using old proteins for new chemistries
45% identity, 96% coverage: 4:447/461 of query aligns to 6:451/458 of 5kr3A

query
sites
5kr3A
N
 
D
S
 
Q
L
 
L
H
 
F
A
 
E
A
 
M
D
 
D
L
 
R
A
 
A
H
 
H
L
 
F
V
 
M
H
 
H
Q
 
P
Q
 
S
T
 
T
D
 
H
L
 
A
G
 
H
A
 
D
H
 
H
E
 
-
Q
 
A
E
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
R
L
 
I
I
 
I
A
 
T
S
 
G
G
 
G
N
 
K
G
 
G
V
 
I
R
 
R
V
 
I
T
 
E
D
 
D
T
 
H
E
 
E
G
 
G
R
 
R
E
 
E
Y
 
Y
I
 
I
E
 
D
A
 
A
M
 
F
A
 
A
G
 
G
L
 
L
W
 
Y
C
 
C
A
 
V
S
 
N
L
 
I
G
 
G
F
 
Y
S
 
G
E
 
R
R
 
T
R
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
D
A
 
A
A
 
I
Y
 
Y
K
 
E
Q
 
Q
M
 
A
L
 
K
A
 
Q
L
 
L
P
 
A
Y
 
Y
Y
 
Y
H
 
H
T
 
T
F
 
Y
F
 
V
Q
 
G
K
 
H
G
 
S
H
 
T
E
 
D
P
 
A
S
 
I
V
 
I
R
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
S
K
 
R
L
 
I
A
 
I
-
 
R
A
 
D
I
 
W
A
 
A
P
 
P
E
 
A
G
 
G
L
 
M
G
 
K
H
 
K
V
 
V
L
 
Y
F
 
Y
Q
 
G
C
 
M
S
|
S
G
|
G
S
|
S
E
 
D
A
 
A
N
 
N
D
 
E
A
 
T
A
 
Q
I
 
I
K
 
K
L
 
L
I
 
V
W
 
W
Y
 
Y
Y
 
Y
N
 
N
N
 
N
I
 
V
R
 
L
G
 
G
K
 
R
P
 
P
Q
 
N
K
 
K
K
 
K
K
 
K
L
 
I
I
 
I
G
 
S
R
 
R
V
 
E
R
 
R
G
 
G
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
N
 
S
T
 
G
V
 
I
A
 
V
T
 
T
A
 
G
S
 
S
L
 
L
S
 
T
G
 
G
Q
 
L
P
 
P
H
 
S
M
 
F
Q
 
H
A
 
Q
D
 
H
F
 
F
D
 
D
L
 
L
P
 
P
L
 
I
G
 
-
D
 
D
R
 
R
F
 
V
F
 
K
H
 
H
I
 
T
S
 
V
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
W
Y
 
Y
R
 
R
F
 
A
G
 
P
Q
 
M
E
 
-
G
 
-
E
 
-
T
 
S
E
 
E
E
 
A
Q
 
Q
F
 
F
S
 
V
A
 
A
R
 
Y
M
 
C
A
 
V
E
 
E
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
K
L
 
L
I
 
I
E
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
A
L
 
F
F
 
I
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
G
 
G
G
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
I
I
 
I
T
 
P
P
 
P
P
 
P
R
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
F
 
W
D
 
E
L
 
A
I
 
I
Q
 
Q
P
 
A
I
 
V
L
 
L
K
 
R
R
 
K
H
 
H
D
 
D
I
 
I
L
 
L
L
 
L
V
 
I
A
 
A
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
 
V
C
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
N
 
S
L
 
K
W
 
M
G
 
G
S
 
S
E
 
Q
T
 
H
Y
 
Y
G
 
G
M
 
I
R
 
K
P
 
P
D
 
D
M
 
L
L
 
I
V
 
T
C
 
V
A
 
A
K
|
K
Q
 
G
L
 
L
T
 
T
A
 
S
S
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
P
 
P
L
 
L
S
 
S
A
 
G
L
 
V
L
 
I
I
 
V
S
 
G
D
 
E
P
 
K
I
 
V
H
 
W
A
 
D
A
 
V
L
 
I
M
 
E
A
 
K
G
 
G
S
 
S
R
 
Q
K
 
E
H
 
H
G
 
G
S
 
P
F
 
M
G
 
G
H
 
H
G
 
G
F
 
W
T
 
T
Y
 
Y
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
I
A
 
C
C
 
A
A
 
A
V
 
A
G
 
A
L
 
L
E
 
A
T
 
N
L
 
L
A
 
D
I
 
I
Y
 
L
E
 
E
E
 
R
R
 
E
D
 
N
I
 
L
L
 
T
G
 
G
H
 
N
V
 
A
R
 
A
A
 
D
V
 
V
S
 
G
P
 
A
A
 
Y
F
 
L
L
 
Q
E
 
Q
G
 
R
L
 
L
-
 
H
E
 
E
A
 
A
L
 
F
R
 
G
D
 
A
H
 
H
P
 
P
L
 
L
V
 
V
G
 
G
D
 
E
V
 
V
R
 
R
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
M
I
 
L
A
 
A
G
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
F
V
 
M
A
 
A
D
 
D
K
 
K
A
 
D
T
 
A
K
 
R
A
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
D
P
 
P
A
 
A
A
 
L
K
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
P
L
 
K
V
 
V
Q
 
S
E
 
A
R
 
A
C
 
A
Q
 
L
A
 
E
A
 
D
G
 
G
L
 
M
I
 
I
V
 
A
R
 
R
A
 
A
I
 
M
-
 
P
-
 
H
G
 
G
D
 
D
R
 
I
I
 
L
A
 
G
F
 
F
T
 
A
P
 
P
P
 
P
L
 
L
I
 
V
I
 
T
T
 
T
A
 
R
E
 
A
E
 
E
I
 
V
R
 
D
E
 
E
M
 
I
C
 
V
G
 
G
R
 
I
F
 
A
K
 
K
A
 
Q
G
 
A
L
 
V
D
 
D

4e3qA Pmp-bound form of aminotransferase crystal structure from vibrio fluvialis (see paper)
41% identity, 98% coverage: 2:453/461 of query aligns to 2:451/452 of 4e3qA

query
sites
4e3qA
R
 
K
P
 
P
N
 
Q
S
 
S
L
 
W
H
 
E
A
 
A
A
 
R
D
 
A
L
 
E
A
 
T
H
 
Y
L
 
S
V
 
L
H
 
Y
Q
 
G
Q
x
F
T
 
T
D
 
D
L
 
M
G
 
P
A
 
S
H
 
L
E
 
H
Q
 
Q
E
 
R
G
 
G
A
 
T
I
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
T
S
 
H
G
 
G
N
 
E
G
 
G
V
 
P
R
 
Y
V
 
I
T
 
V
D
 
D
T
 
V
E
 
N
G
 
G
R
 
R
E
 
R
Y
 
Y
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
N
A
 
S
G
 
G
L
 
L
W
 
W
C
 
N
A
 
M
S
 
V
L
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
D
E
 
H
R
 
K
R
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
D
A
 
A
A
 
A
Y
 
K
K
 
A
Q
 
Q
M
 
Y
L
 
E
A
 
R
L
 
F
P
 
P
Y
 
G
Y
 
Y
H
 
H
T
 
A
F
 
F
F
 
F
Q
 
G
K
 
R
G
 
M
H
 
S
E
 
D
P
 
Q
S
 
T
V
 
V
R
 
M
L
 
L
A
 
S
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
I
 
V
A
 
S
P
 
P
E
 
F
G
 
D
L
 
S
G
 
G
H
 
R
V
 
V
L
 
F
F
 
Y
Q
 
T
C
 
N
S
|
S
G
|
G
S
|
S
E
 
E
A
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
A
 
M
I
 
V
K
 
K
L
 
M
I
 
L
W
 
W
Y
 
F
Y
 
L
N
 
H
N
 
A
I
 
A
R
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
K
 
R
K
 
K
L
 
I
I
 
L
G
 
T
R
 
R
V
 
W
R
 
N
G
 
A
Y
|
Y
H
|
H
G
 
G
N
 
V
T
 
T
V
 
A
A
 
V
T
 
S
A
 
A
S
 
S
L
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
K
P
 
P
H
 
Y
M
 
-
Q
 
N
A
 
S
D
 
V
F
 
F
D
 
G
L
 
L
P
 
P
L
 
L
G
 
P
D
 
G
R
 
-
F
 
F
F
 
V
H
 
H
I
 
L
S
 
T
N
 
C
P
 
P
N
 
H
Y
 
Y
Y
 
W
R
 
R
F
 
Y
G
 
G
Q
 
E
E
 
E
G
 
G
E
 
E
T
 
T
E
 
E
E
 
E
Q
 
Q
F
 
F
S
 
V
A
 
A
R
 
R
M
 
L
A
 
A
E
 
R
E
 
E
L
 
L
E
 
E
A
 
E
L
 
T
I
 
I
E
 
Q
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
T
 
T
I
 
I
A
 
A
A
 
G
L
 
F
F
 
F
A
 
A
E
|
E
P
 
P
V
 
V
Q
 
M
G
 
G
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
T
 
P
P
 
P
P
 
A
R
 
K
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
D
 
Q
L
 
A
I
 
I
Q
 
L
P
 
P
I
 
I
L
 
L
K
 
R
R
 
K
H
 
Y
D
 
D
I
 
I
L
 
P
L
 
V
V
 
I
A
 
S
D
|
D
E
 
E
V
|
V
I
|
I
C
 
C
G
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
T
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
T
W
 
W
G
 
G
S
 
C
E
 
V
T
 
T
Y
 
Y
G
 
D
M
 
F
R
 
T
P
 
P
D
 
D
M
 
A
L
 
I
V
 
I
C
 
S
A
 
S
K
|
K
Q
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
A
S
 
G
Y
 
F
Q
 
F
P
 
P
L
 
M
S
 
G
A
 
A
L
 
V
L
 
I
I
 
L
S
 
G
D
 
P
P
 
E
I
 
L
H
 
S
A
 
K
A
 
R
L
 
L
M
 
E
A
 
T
G
 
A
S
 
I
R
 
E
K
 
A
H
 
I
G
 
E
S
 
E
F
 
F
G
 
P
H
 
H
G
 
G
F
|
F
T
|
T
Y
 
A
G
 
S
G
 
G
H
 
H
P
 
P
V
 
V
A
 
G
C
 
C
A
 
A
V
 
I
G
 
A
L
 
L
E
 
K
T
 
A
L
 
I
A
 
D
I
 
V
Y
 
V
E
 
M
E
 
N
R
 
E
D
 
G
I
 
L
L
 
A
G
 
E
H
 
N
V
 
V
R
 
R
A
 
R
V
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
R
F
 
F
L
 
E
E
 
E
G
 
R
L
 
L
E
 
K
A
 
H
L
 
I
R
 
A
D
 
E
H
 
R
P
 
P
L
 
N
V
 
I
G
 
G
D
 
E
V
 
Y
R
 
R
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
F
I
 
M
A
 
W
G
 
A
V
 
L
E
 
E
L
 
A
V
 
V
A
 
K
D
 
D
K
 
K
A
 
A
T
 
S
K
 
K
A
 
T
P
 
P
F
 
F
P
 
D
P
 
G
A
 
N
A
 
L
K
 
S
V
 
V
G
 
S
L
 
E
L
 
R
V
 
I
Q
 
A
E
 
N
R
 
T
C
 
C
Q
 
T
A
 
D
A
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
C
R
 
R
A
 
P
I
 
L
G
 
G
D
 
Q
R
 
S
I
 
V
A
x
V
F
 
L
T
 
C
P
 
P
P
 
P
L
 
F
I
 
I
I
 
L
T
 
T
A
 
E
E
 
A
E
 
Q
I
 
M
R
 
D
E
 
E
M
 
M
C
 
F
G
 
D
R
 
K
F
 
L
K
 
E
A
 
K
G
 
A
L
 
L
D
 
D
A
 
K
A
 
V
W
 
F
A
 
A
E
 
E
L
 
V

4grxC Structure of an omega-aminotransferase from paracoccus denitrificans (see paper)
42% identity, 94% coverage: 19:453/461 of query aligns to 16:448/449 of 4grxC

query
sites
4grxC
T
 
T
D
 
D
L
 
M
G
 
P
A
 
S
H
 
V
E
 
H
Q
 
Q
E
 
R
G
 
G
A
 
T
I
 
V
L
 
V
I
 
V
A
 
T
S
 
H
G
 
G
N
 
E
G
 
G
V
 
P
R
 
Y
V
 
I
T
 
V
D
 
D
T
 
V
E
 
H
G
 
G
R
 
R
E
 
R
Y
 
Y
I
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
N
A
 
S
G
 
G
L
|
L
W
 
W
C
 
N
A
 
M
S
 
V
L
 
A
G
 
G
F
 
F
S
 
D
E
 
H
R
 
K
R
 
G
L
 
L
A
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
A
Y
 
K
K
 
A
Q
 
Q
M
 
Y
L
 
D
A
 
R
L
 
F
P
 
P
Y
 
G
Y
 
Y
H
 
H
T
 
A
F
 
F
F
 
F
Q
 
G
K
 
R
G
 
M
H
 
S
E
 
D
P
 
Q
S
 
T
V
 
V
R
 
M
L
 
L
A
 
S
E
 
E
K
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
I
 
V
A
 
S
P
 
P
E
 
F
G
 
D
L
 
N
G
 
G
H
 
R
V
 
V
L
 
F
F
 
Y
Q
 
T
C
 
N
S
 
S
G
 
G
S
 
S
E
 
E
A
 
A
N
 
N
D
 
D
A
 
T
A
 
M
I
 
V
K
 
K
L
 
M
I
 
L
W
 
W
Y
 
F
Y
 
L
N
 
H
N
 
A
I
 
A
R
 
E
G
 
G
K
 
K
P
 
P
Q
 
Q
K
 
K
K
 
R
K
 
K
L
 
I
I
 
L
G
 
T
R
 
R
V
 
W
R
 
N
G
 
A