SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_090664325.1 NCBI__GCF_900101615.1:WP_090664325.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
41% identity, 100% coverage: 1:250/251 of query aligns to 3:254/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
M
 
M
R
 
N
L
 
L
K
 
T
D
 
D
R
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
A
 
Q
R
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
I
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
D
T
 
E
V
 
A
V
 
Q
R
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
M
Q
 
V
P
 
R
T
 
K
H
 
E
E
 
N
W
 
N
L
 
D
G
 
R
I
 
L
E
 
H
H
 
F
V
 
V
Q
 
Q
T
|
T
D
 
D
V
x
I
S
 
T
V
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
A
C
 
C
E
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
H
R
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
D
x
N
A
 
A
A
x
G
I
 
I
T
 
E
L
 
I
G
 
V
K
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
H
D
 
E
C
 
M
S
 
E
R
 
L
E
 
S
E
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
C
 
M
F
 
F
L
 
L
M
 
M
S
 
S
R
 
K
A
 
H
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
C
S
|
S
Q
 
V
H
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
W
P
 
P
G
 
D
D
 
I
I
 
P
A
 
A
Y
|
Y
G
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
L
Y
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
S
V
 
M
A
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
K
Q
 
H
G
 
Q
I
 
I
V
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
K
x
I
I
|
I
L
 
D
T
 
T
G
 
P
K
 
L
T
 
N
G
 
E
R
 
K
A
 
S
I
 
F
-
 
L
-
 
E
-
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
G
D
 
T
P
 
L
A
 
E
M
 
E
I
 
I
A
 
K
Y
 
K
S
 
E
E
 
K
A
 
A
R
 
K
-
 
V
T
 
N
P
 
P
W
 
L
P
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
V
A
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
L
A
 
S
M
 
S
Y
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
S
N
 
A
L
 
I
M
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
M
 
T
A
 
A

5itvD Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
41% identity, 100% coverage: 1:250/251 of query aligns to 3:226/227 of 5itvD

query
sites
5itvD
M
 
M
R
 
N
L
 
L
K
 
T
D
 
D
R
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
A
 
Q
R
 
A
F
 
F
V
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
I
 
N
V
 
V
V
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
V
x
I
T
 
D
T
 
E
V
 
A
V
 
Q
R
 
G
E
 
E
G
 
A
G
 
M
Q
 
V
P
 
R
T
 
K
H
 
E
E
 
N
W
 
N
L
 
D
G
 
R
I
 
L
E
 
H
H
 
F
V
 
V
Q
 
Q
T
|
T
D
|
D
V
x
I
S
 
T
V
 
D
E
 
E
A
 
A
E
 
A
C
 
C
E
 
Q
A
 
H
A
 
A
V
 
V
A
 
E
R
 
S
V
 
A
V
 
V
A
 
H
R
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
D
x
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
E
L
 
I
G
 
V
K
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
H
D
 
E
C
 
M
S
 
E
R
 
L
E
 
S
E
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
Q
V
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
C
 
M
F
 
F
L
 
L
M
 
M
S
 
S
R
 
K
A
 
H
A
 
A
V
 
L
R
 
K
A
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
A
Q
 
A
A
 
G
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
C
S
|
S
Q
 
V
H
 
G
G
 
G
M
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
W
P
 
P
G
 
D
D
 
I
I
 
P
A
 
A
Y
|
Y
G
 
N
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
V
A
 
L
Y
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
S
V
 
M
A
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
K
Q
 
H
G
 
Q
I
 
I
V
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
K
 
I
I
|
I
L
 
D
T
 
T
G
 
-
K
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
M
 
-
I
 
-
A
 
-
Y
 
-
S
 
-
E
 
-
A
 
-
R
 
-
T
 
-
P
 
-
W
 
-
P
 
L
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
V
A
 
M
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
L
A
 
S
M
 
S
Y
 
Y
V
 
M
T
 
T
G
 
G
E
 
S
N
 
A
L
 
I
M
 
T
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
Y
M
 
T
A
 
A

3ay6B Crystal structure of bacillus megaterium glucose dehydrogenase 4 a258f mutant in complex with nadh and d-glucose (see paper)
37% identity, 99% coverage: 3:251/251 of query aligns to 11:259/267 of 3ay6B

query
sites
3ay6B
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
S
S
x
T
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
A
 
V
R
 
R
F
 
F
V
 
G
A
 
Q
E
 
E
G
 
E
A
 
A
I
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
N
-
 
Y
-
x
Y
-
 
N
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
L
D
 
D
V
 
A
T
 
K
T
 
K
V
 
E
V
 
V
R
 
E
E
 
E
-
 
A
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
P
 
A
T
 
I
H
 
I
E
 
-
W
 
-
L
 
-
G
 
-
I
 
-
E
 
-
H
 
-
V
 
V
Q
 
Q
T
 
G
D
|
D
V
|
V
S
 
T
V
 
K
E
 
E
A
 
E
E
 
D
C
 
V
E
 
V
A
 
N
A
 
L
V
 
V
A
 
Q
R
 
T
V
 
A
V
 
I
A
 
K
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
M
V
 
I
N
 
N
D
x
N
A
|
A
A
x
G
I
x
V
T
x
E
L
 
N
G
 
P
K
 
V
P
 
P
L
 
S
L
 
H
D
 
E
C
 
L
S
 
S
R
 
L
E
 
D
E
 
N
W
 
W
D
 
N
R
 
K
V
 
V
L
 
I
A
 
D
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
C
 
A
F
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
S
R
 
R
A
 
E
A
 
A
V
 
I
R
 
K
A
 
Y
M
 
F
L
 
V
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
E
G
 
N
E
 
D
V
 
I
R
 
K
G
 
G
R
 
N
I
 
V
V
 
I
N
 
N
I
x
M
S
 
S
S
|
S
Q
 
V
H
|
H
G
 
E
M
 
M
V
 
I
A
 
P
S
x
W
P
 
P
G
 
L
D
 
F
I
 
V
A
 
H
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
V
 
M
A
 
K
Y
 
L
L
 
M
T
 
T
R
 
E
Q
 
T
V
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
E
Y
 
Y
A
 
A
A
 
P
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
N
V
 
I
A
 
G
P
|
P
G
|
G
K
 
A
I
x
M
L
 
N
T
|
T
G
x
P
K
x
I
T
x
N
G
 
A
R
 
E
A
x
K
I
 
F
-
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
M
 
Q
I
 
R
A
 
A
Y
 
D
S
 
V
E
 
E
A
 
S
R
 
M
T
 
I
P
 
P
W
 
M
P
 
G
R
 
Y
L
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
V
A
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
S
D
 
Q
A
 
A
M
 
S
Y
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
I
N
 
T
L
 
L
M
 
F
V
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
M
 
T
A
 
K
Y
 
Y

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
37% identity, 99% coverage: 1:249/251 of query aligns to 1:246/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
R
 
T
L
 
L
K
 
Q
D
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
D
I
 
I
A
 
A
A
 
I
R
 
N
F
 
L
V
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
N
V
 
I
V
 
F
I
 
F
-
x
N
-
x
Y
-
x
N
-
x
G
-
x
S
-
 
P
-
 
E
-
 
A
-
 
A
A
 
E
D
 
E
V
 
T
T
 
A
T
 
K
V
 
L
V
 
V
R
 
A
E
 
E
G
 
H
G
 
G
Q
 
-
P
 
-
T
 
-
H
 
-
E
 
-
W
 
-
L
 
V
G
 
E
I
 
V
E
 
E
H
 
A
V
 
M
Q
 
K
T
 
A
D
x
N
V
|
V
S
 
A
V
 
I
E
 
A
A
 
E
E
 
D
C
 
V
E
 
D
A
 
A
A
 
F
V
 
F
A
 
K
R
 
Q
V
 
A
V
 
I
A
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
x
N
A
|
A
A
 
G
I
|
I
T
 
T
L
 
R
G
 
D
K
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
R
C
 
M
S
 
K
R
 
E
E
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
I
A
 
N
V
x
I
N
 
N
L
 
L
T
 
K
G
 
G
C
 
T
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
T
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
S
R
 
R
A
 
T
M
 
M
L
 
M
A
 
K
Q
 
Q
A
 
R
P
 
A
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
M
S
 
A
S
|
S
Q
 
V
H
 
V
G
 
G
M
 
L
V
 
I
A
 
G
S
 
N
P
 
A
G
 
G
D
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
G
 
V
T
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
Y
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
T
V
 
T
A
 
A
V
 
R
D
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
P
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
K
 
F
I
|
I
L
 
T
T
|
T
G
 
D
K
 
M
T
 
T
G
 
D
R
 
K
A
 
-
I
 
L
D
 
D
P
 
E
A
 
K
M
 
T
I
 
K
A
 
E
Y
 
A
S
 
M
E
 
L
A
 
A
R
 
Q
T
 
I
P
 
P
W
 
L
P
 
G
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
T
P
 
T
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
S
M
 
K
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
N
 
T
L
 
L
M
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
M
M
 
V

2cfcA Structural basis for stereo selectivity in the (r)- and (s)- hydroxypropylethane thiosulfonate dehydrogenases (see paper)
43% identity, 98% coverage: 6:250/251 of query aligns to 3:249/250 of 2cfcA

query
sites
2cfcA
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
F
V
 
L
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
I
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
A
A
 
L
D
|
D
V
x
L
T
 
S
T
 
A
V
 
E
V
 
T
R
 
L
E
 
E
G
 
E
G
 
T
Q
 
A
P
 
R
T
 
T
H
 
H
E
 
-
W
 
W
L
 
H
G
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
K
I
 
V
E
 
L
H
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
V
 
D
E
 
E
A
 
G
E
 
D
C
 
V
E
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
T
V
 
M
A
 
E
R
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
A
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
x
N
A
|
A
A
x
G
I
 
I
T
 
T
L
 
G
G
 
N
K
 
S
P
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
V
L
 
L
L
 
H
D
 
T
C
 
T
S
 
P
R
 
V
E
 
E
E
 
Q
W
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
G
 
G
C
 
I
F
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
V
V
 
L
R
 
P
A
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
L
Q
 
Q
A
 
G
P
 
A
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
V
H
 
A
G
 
S
M
 
L
V
 
V
A
 
A
S
x
F
P
 
P
G
 
G
D
x
R
I
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
T
T
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
K
x
M
I
|
I
L
 
E
T
|
T
G
x
P
K
x
M
T
|
T
G
 
Q
R
x
W
A
x
R
I
 
L
D
 
D
-
 
Q
P
 
P
A
 
E
M
 
L
I
 
R
A
 
D
Y
 
Q
S
 
V
E
 
L
A
 
A
R
 
R
T
 
I
P
 
P
W
 
Q
P
 
K
R
 
E
L
 
I
G
 
G
R
 
T
P
 
A
E
 
A
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
A
M
 
T
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
E
 
A
N
 
A
L
 
L
M
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
M
 
T
A
 
A

Q56840 2-(R)-hydroxypropyl-CoM dehydrogenase; R-HPCDH; 2-[(R)-2-hydroxypropylthio]ethanesulfonate dehydrogenase; Aliphatic epoxide carboxylation component III; Epoxide carboxylase component III; RHPCDH1; EC 1.1.1.268 from Xanthobacter autotrophicus (strain ATCC BAA-1158 / Py2) (see 4 papers)
43% identity, 98% coverage: 6:250/251 of query aligns to 3:249/250 of Q56840

query
sites
Q56840
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
|
S
G
|
G
I
x
N
G
 
G
R
 
L
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
T
R
 
R
F
 
F
V
 
L
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
D
I
 
R
V
 
V
V
 
A
I
 
A
A
 
L
D
|
D
V
 
L
T
 
S
T
 
A
V
 
E
V
 
T
R
 
L
E
 
E
G
 
E
G
 
T
Q
 
A
P
 
R
T
 
T
H
 
H
E
 
-
W
 
W
L
 
H
G
 
A
-
 
Y
-
 
A
-
 
D
-
 
K
I
 
V
E
 
L
H
 
R
V
 
V
Q
 
R
T
 
A
D
|
D
V
|
V
S
 
A
V
 
D
E
 
E
A
 
G
E
 
D
C
 
V
E
 
N
A
 
A
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
A
V
 
T
V
 
M
A
 
E
R
 
Q
H
 
F
G
 
G
R
 
A
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
x
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
G
G
 
N
K
 
S
P
 
E
-
 
A
-
 
G
-
 
V
L
 
L
L
 
H
D
 
T
C
 
T
S
 
P
R
 
V
E
 
E
E
 
Q
W
 
F
D
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
M
A
 
A
V
 
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
G
 
G
C
 
I
F
 
F
L
 
L
M
 
G
S
 
C
R
 
R
A
 
A
A
 
V
V
 
L
R
 
P
A
 
H
M
 
M
L
 
L
A
 
L
Q
 
Q
A
 
G
P
 
A
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
V
H
 
A
G
 
S
M
 
L
V
 
V
A
 
A
S
 
F
P
 
P
G
 
G
D
x
R
I
 
S
A
 
A
Y
|
Y
G
 
T
T
 
T
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
A
V
 
V
A
 
L
Y
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
S
V
 
V
A
 
A
V
 
V
D
 
D
Y
 
Y
A
 
A
A
 
G
Q
 
S
G
 
G
I
 
I
V
x
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
G
K
 
M
I
|
I
L
x
E
T
|
T
G
x
P
K
x
M
T
 
T
G
 
Q
R
x
W
A
x
R
I
 
L
D
 
D
-
 
Q
P
 
P
A
 
E
M
 
L
I
x
R
A
 
D
Y
 
Q
S
 
V
E
 
L
A
 
A
R
|
R
T
 
I
P
 
P
W
 
Q
P
 
K
R
 
E
L
 
I
G
 
G
R
 
T
P
 
A
E
 
A
D
 
Q
V
 
V
A
 
A
G
 
D
A
 
A
A
 
V
L
 
M
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
E
D
 
D
A
 
A
M
 
T
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
E
 
A
N
 
A
L
 
L
M
 
V
V
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
A
W
 
Y
M
 
T
A
 
A

Sites not aligning to the query:

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 99% coverage: 2:249/251 of query aligns to 4:243/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
A
 
E
I
 
A
A
 
A
A
 
R
R
 
V
F
 
F
V
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
D
|
D
V
x
F
T
 
N
T
 
E
V
 
A
V
 
A
R
 
-
E
 
-
G
 
G
G
 
K
Q
 
E
P
 
A
T
 
V
H
 
E
E
 
A
W
 
N
L
 
P
G
 
G
I
 
V
E
 
V
H
 
F
V
 
I
Q
 
R
T
x
V
D
|
D
V
|
V
S
 
S
V
 
D
E
 
R
A
 
E
E
 
S
C
 
V
E
 
H
A
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
E
R
 
N
V
 
V
V
 
A
A
 
E
R
 
R
H
 
F
G
 
G
R
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
D
x
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
T
L
 
R
G
x
D
K
 
S
P
 
M
L
 
L
L
 
S
D
x
K
C
 
M
S
 
T
R
 
V
E
 
D
E
 
Q
W
 
F
D
 
Q
R
 
Q
V
 
V
L
 
I
A
 
N
V
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
G
 
G
C
 
V
F
 
F
L
 
H
M
 
C
S
 
T
R
 
Q
A
 
A
A
 
V
V
 
L
R
 
P
A
 
Y
M
 
M
L
 
A
A
 
E
Q
 
Q
A
 
G
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
S
 
S
S
|
S
Q
 
V
H
 
T
G
 
G
M
 
T
V
 
Y
A
 
G
S
x
N
P
x
V
G
 
G
D
x
Q
I
 
T
A
 
N
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
Y
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
Q
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
K
D
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
K
G
 
G
I
 
I
V
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
K
x
F
I
x
T
L
 
E
T
|
T
G
 
A
K
x
M
T
 
V
G
 
A
R
 
E
A
 
-
I
 
V
D
 
P
P
 
E
A
 
K
M
 
V
I
 
I
A
 
E
Y
x
K
S
 
M
E
 
K
A
 
A
R
 
Q
T
 
V
P
 
P
W
 
M
P
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
M
 
D
Y
 
Y
V
 
V
T
 
N
G
 
G
E
 
H
N
 
V
L
 
L
M
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
W
 
I
M
 
M

6t77A Crystal structure of klebsiella pneumoniae fabg(NADPH-dependent) NADP- complex at 1.75 a resolution (see paper)
38% identity, 99% coverage: 1:248/251 of query aligns to 1:241/244 of 6t77A

query
sites
6t77A
M
 
M
R
 
S
L
 
F
K
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
T
F
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
G
T
 
T
T
 
A
V
x
T
V
 
S
R
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
P
 
A
T
 
I
H
 
S
E
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
-
 
N
-
 
G
E
 
K
H
 
G
V
 
L
Q
 
M
T
x
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
V
 
D
E
 
P
A
 
A
E
 
S
C
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
R
 
N
V
 
V
V
 
R
A
 
A
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
 
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
T
L
 
R
G
 
D
K
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
R
C
 
M
S
 
K
R
 
D
E
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
L
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
M
R
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
M
A
 
K
Q
 
K
A
 
R
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
Q
 
V
H
 
V
G
 
G
M
 
T
V
 
M
A
 
G
S
 
N
P
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
Y
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
R
D
 
E
Y
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
F
I
 
I
L
 
E
T
 
T
G
 
D
K
 
M
T
 
T
G
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
T
P
 
D
A
 
E
M
 
Q
I
 
R
A
 
A
Y
 
G
S
 
T
E
 
L
A
 
A
R
 
A
T
 
V
P
 
P
W
 
A
P
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
T
P
 
P
E
 
N
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
N
 
T
L
 
L
M
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
M

4dmmB 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from synechococcus elongatus pcc 7942 in complex with NADP
43% identity, 98% coverage: 3:247/251 of query aligns to 3:236/240 of 4dmmB

query
sites
4dmmB
L
 
L
K
 
T
D
 
D
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
L
R
 
E
F
 
L
V
 
A
A
 
A
E
 
A
G
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
V
 
A
I
 
V
A
 
N
D
 
Y
V
x
A
T
x
S
T
x
S
V
 
A
-
 
G
-
 
A
-
 
A
V
 
D
R
 
E
E
 
V
G
 
V
G
 
A
Q
 
A
P
 
I
T
 
A
H
 
A
E
 
A
W
 
G
L
 
G
G
 
E
I
 
A
E
 
F
H
 
A
V
 
V
Q
 
K
T
x
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
V
 
Q
E
 
E
A
 
S
E
 
E
C
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
L
V
 
F
A
 
A
R
 
A
V
 
V
V
 
I
A
 
E
R
 
R
H
 
W
G
 
G
R
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
x
N
A
|
A
A
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
R
G
 
D
K
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
R
C
 
M
S
 
K
R
 
R
E
 
D
E
 
D
W
 
W
D
 
Q
R
 
S
V
 
V
L
 
L
A
 
D
V
x
L
N
 
N
L
 
L
T
 
G
G
 
G
C
 
V
F
 
F
L
 
L
M
 
C
S
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
A
V
 
A
R
 
K
A
 
I
M
 
M
L
 
L
A
 
K
Q
 
Q
A
 
R
P
 
S
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
S
 
A
S
|
S
Q
 
V
H
 
V
G
 
G
M
 
E
V
 
M
A
 
G
S
 
N
P
 
P
G
 
G
D
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
G
 
S
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
Y
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
Q
 
T
V
 
V
A
 
A
V
 
K
D
 
E
Y
 
L
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
K
 
F
I
|
I
L
 
A
T
|
T
G
 
D
K
 
-
T
 
-
G
 
-
R
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
-
P
 
-
A
 
-
M
|
M
I
 
T
A
 
S
Y
 
L
S
 
L
E
 
E
A
 
V
R
 
-
T
 
I
P
 
P
W
 
L
P
 
G
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
R
 
E
P
 
A
E
 
A
D
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
G
A
 
V
A
 
V
L
 
R
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
A
D
 
D
D
 
P
-
 
A
A
 
A
M
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
N
 
V
L
 
I
M
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P0AEK2 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
37% identity, 99% coverage: 1:248/251 of query aligns to 1:241/244 of P0AEK2

query
sites
P0AEK2
M
 
M
R
 
N
L
 
F
K
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
x
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
T
F
 
L
V
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
G
T
 
T
T
 
A
V
x
T
V
 
S
R
 
E
E
 
N
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
P
 
A
T
 
I
H
 
S
E
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
-
 
N
-
 
G
E
 
K
H
 
G
V
 
L
Q
 
M
T
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
V
 
D
E
 
P
A
 
A
E
 
S
C
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
R
 
K
V
 
I
V
 
R
A
 
A
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
x
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
R
G
 
D
K
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
R
C
 
M
S
 
K
R
 
D
E
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
L
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
M
R
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
M
A
 
K
Q
 
K
A
 
R
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
Q
 
V
H
 
V
G
 
G
M
 
T
V
 
M
A
 
G
S
 
N
P
 
G
G
 
G
D
 
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
G
x
A
T
x
A
S
x
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
Y
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
R
D
 
E
Y
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
F
I
|
I
L
 
E
T
 
T
G
 
D
K
 
M
T
 
T
G
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
S
P
 
D
A
 
D
M
 
Q
I
 
R
A
 
A
Y
 
G
S
 
I
E
 
L
A
 
A
R
 
Q
T
 
V
P
 
P
W
 
A
P
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
|
E
N
 
T
L
 
L
M
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
M

1q7bA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase from e. Coli in complex with NADP+ (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 1:240/243 of 1q7bA

query
sites
1q7bA
R
 
N
L
 
F
K
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
T
F
 
L
V
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
G
T
 
T
T
 
A
V
x
T
V
 
S
R
 
E
E
 
N
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
P
 
A
T
 
I
H
 
S
E
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
-
 
N
-
 
G
E
 
K
H
 
G
V
 
L
Q
 
M
T
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
V
 
D
E
 
P
A
 
A
E
 
S
C
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
R
 
K
V
 
I
V
 
R
A
 
A
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
x
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
T
 
T
L
 
R
G
 
D
K
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
R
C
 
M
S
 
K
R
 
D
E
 
E
E
|
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
L
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
M
R
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
M
A
 
K
Q
 
K
A
 
R
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
Q
 
V
H
 
V
G
 
G
M
 
T
V
 
M
A
 
G
S
 
N
P
 
G
G
 
G
D
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
Y
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
R
D
 
E
Y
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
K
 
F
I
|
I
L
 
E
T
 
T
G
 
D
K
 
M
T
 
T
G
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
S
P
 
D
A
 
D
M
 
Q
I
 
R
A
 
A
Y
 
G
S
 
I
E
 
L
A
 
A
R
 
Q
T
 
V
P
 
P
W
 
A
P
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
|
E
N
x
T
L
 
L
M
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:248/251 of query aligns to 4:244/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
R
 
N
L
 
L
K
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
R
 
K
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
L
F
 
L
V
 
A
A
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
G
T
 
T
T
 
A
V
x
T
V
 
S
R
 
E
E
 
S
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
P
 
A
T
 
I
H
 
S
E
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
D
-
 
N
-
 
G
E
 
K
H
 
G
V
 
M
Q
 
A
T
 
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
V
 
N
E
 
P
A
 
E
E
 
S
C
 
I
E
 
E
A
 
A
A
 
V
V
 
L
A
 
K
R
 
A
V
 
I
V
 
T
A
 
D
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
x
N
A
|
A
A
 
G
I
|
I
T
 
T
L
 
R
G
 
D
K
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
R
C
 
M
S
 
K
R
 
E
E
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
S
R
 
D
V
 
I
L
 
M
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
G
 
S
C
 
I
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
L
R
 
R
A
 
G
M
 
M
L
 
M
A
 
K
Q
 
K
A
 
R
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
V
S
 
G
S
|
S
Q
 
V
H
 
V
G
 
G
M
 
T
V
 
M
A
 
G
S
 
N
P
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
A
A
 
N
Y
|
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
V
A
 
I
Y
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
Q
 
S
V
 
M
A
 
A
V
 
R
D
 
E
Y
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
V
V
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
K
 
F
I
|
I
L
 
E
T
|
T
G
 
D
K
x
M
T
 
T
G
 
-
R
 
K
A
 
A
I
 
L
D
 
N
P
 
D
A
 
E
M
 
Q
I
 
R
A
 
T
Y
 
A
S
 
T
E
 
L
A
 
A
R
 
Q
T
 
V
P
 
P
W
 
A
P
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
P
D
 
E
A
 
A
M
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
N
 
T
L
 
L
M
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
M

Q5P5I4 (S)-1-Phenylethanol dehydrogenase; EC 1.1.1.311 from Aromatoleum aromaticum (strain EbN1) (Azoarcus sp. (strain EbN1)) (see 2 papers)
38% identity, 98% coverage: 2:247/251 of query aligns to 4:245/249 of Q5P5I4

query
sites
Q5P5I4
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
K
V
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
R
F
 
F
V
 
A
A
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
D
V
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
V
 
L
T
 
V
T
 
P
V
 
A
V
 
P
R
 
E
E
 
A
G
 
E
G
 
A
Q
 
A
P
 
I
T
 
R
H
 
N
E
 
L
W
 
G
L
 
R
G
 
R
I
 
V
E
 
L
H
 
T
V
 
V
Q
 
K
T
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
S
V
 
Q
E
 
P
A
 
G
E
 
D
C
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
F
V
 
G
A
 
K
R
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
S
R
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
x
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
x
Y
L
 
P
G
 
L
K
 
I
P
 
P
L
 
F
L
 
D
D
 
E
C
 
L
S
 
T
R
 
F
E
 
E
E
 
Q
W
 
W
D
 
K
R
 
K
V
 
T
L
 
F
A
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
D
G
 
S
C
 
G
F
 
F
L
 
L
M
 
M
S
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
F
V
 
V
R
 
P
A
 
G
M
 
M
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
K
G
 
R
E
 
N
V
 
G
R
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
T
S
 
S
Q
 
T
H
 
T
G
 
Y
M
 
W
V
 
L
A
 
K
S
 
I
P
 
E
G
 
A
D
 
Y
I
 
T
A
 
H
Y
 
Y
G
 
I
T
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
V
 
N
A
 
I
Y
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
R
Q
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
S
D
 
D
Y
 
L
A
 
G
A
 
K
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
V
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
K
x
L
I
x
V
L
 
R
T
 
T
G
 
A
K
x
T
T
 
T
G
 
E
R
 
A
A
 
S
I
 
A
D
 
L
P
 
S
A
 
A
M
 
M
I
 
F
-
 
D
A
 
V
Y
 
L
S
 
P
E
 
N
A
 
M
R
 
L
T
 
Q
P
 
A
W
 
I
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
Q
R
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
D
V
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
M
 
S
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
N
 
T
L
 
L
M
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2ewmB Crystal structure of the (s)-specific 1-phenylethanol dehydrogenase of the denitrifying bacterium strain ebn1 (see paper)
38% identity, 98% coverage: 2:247/251 of query aligns to 2:243/247 of 2ewmB

query
sites
2ewmB
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
D
R
 
K
V
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
R
F
 
F
V
 
A
A
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
D
V
 
I
V
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
V
x
L
T
 
V
T
 
P
V
 
A
V
 
P
R
 
E
E
 
A
G
 
E
G
 
A
Q
 
A
P
 
I
T
 
R
H
 
N
E
 
L
W
 
G
L
 
R
G
 
R
I
 
V
E
 
L
H
 
T
V
 
V
Q
 
K
T
x
C
D
|
D
V
|
V
S
 
S
V
 
Q
E
 
P
A
 
G
E
 
D
C
 
V
E
 
E
A
 
A
A
 
F
V
 
G
A
 
K
R
 
Q
V
 
V
V
 
I
A
 
S
R
 
T
H
 
F
G
 
G
R
 
R
L
 
C
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
x
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
Y
L
 
P
G
 
L
K
 
I
P
 
P
L
 
F
L
 
D
D
 
E
C
 
L
S
 
T
R
 
F
E
 
E
E
 
Q
W
 
W
D
 
K
R
 
K
V
 
T
L
 
F
A
 
E
V
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
D
G
 
S
C
 
G
F
 
F
L
 
L
M
 
M
S
 
A
R
 
K
A
 
A
A
 
F
V
 
V
R
 
P
A
 
G
M
 
M
L
 
-
A
 
-
Q
 
-
A
 
-
P
 
-
R
 
K
G
 
R
E
 
N
V
 
G
R
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
S
 
T
S
|
S
Q
 
T
H
 
T
G
 
Y
M
 
W
V
 
L
A
 
K
S
 
I
P
 
E
G
 
A
D
x
Y
I
 
T
A
 
H
Y
|
Y
G
 
I
T
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
A
V
 
N
A
 
I
Y
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
R
Q
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
S
D
 
D
Y
 
L
A
 
G
A
 
K
Q
 
D
G
 
G
I
 
I
V
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
K
x
L
I
x
V
L
 
R
T
 
T
G
 
A
K
x
T
T
 
T
G
 
E
R
 
A
A
 
S
I
 
A
D
 
L
P
 
S
A
 
A
M
 
M
I
 
F
-
 
D
A
 
V
Y
 
L
S
 
P
E
 
N
A
 
M
R
 
L
T
 
Q
P
 
A
W
 
I
P
 
P
R
 
R
L
 
L
G
 
Q
R
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
D
V
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
M
 
S
Y
 
F
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
Q
N
 
T
L
 
L
M
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

P0A2C9 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG; 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase; Beta-ketoacyl-ACP reductase; EC 1.1.1.100 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
37% identity, 99% coverage: 1:248/251 of query aligns to 1:241/244 of P0A2C9

query
sites
P0A2C9
M
 
M
R
 
S
L
 
F
K
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
A
 
S
S
 
R
G
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
T
F
 
L
V
 
V
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
G
T
 
T
T
 
A
V
 
T
V
 
S
R
 
E
E
 
N
G
 
G
G
 
A
Q
 
K
P
 
N
T
 
I
H
 
S
E
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
-
 
N
-
 
G
E
 
K
H
 
G
V
 
L
Q
 
M
T
 
L
D
 
N
V
 
V
S
 
T
V
 
D
E
 
P
A
 
A
E
 
S
C
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
R
 
N
V
 
I
V
 
R
A
 
A
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
 
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
T
 
T
L
 
R
G
 
D
K
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
R
C
 
M
S
 
K
R
 
D
E
 
D
E
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
L
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
M
R
 
R
A
 
A
M
|
M
L
 
M
A
 
K
Q
 
K
A
 
R
P
 
C
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
-
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
 
S
Q
 
V
H
 
V
G
 
G
M
 
T
V
 
M
A
 
G
S
 
N
P
 
A
G
 
G
D
 
Q
I
 
A
A
 
N
Y
 
Y
G
 
A
T
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
Y
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
R
D
 
E
Y
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
F
I
 
I
L
 
E
T
 
T
G
 
D
K
 
M
T
 
T
G
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
S
P
 
D
A
 
D
M
 
Q
I
 
R
A
 
A
Y
 
G
S
 
I
E
 
L
A
 
A
R
 
Q
T
 
V
P
 
P
W
 
A
P
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
S
A
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
|
A
S
|
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
S
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
N
 
T
L
 
L
M
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
M

1q7cA The structure of betaketoacyl-[acp] reductase y151f mutant in complex with NADPH fragment (see paper)
37% identity, 98% coverage: 2:248/251 of query aligns to 1:240/243 of 1q7cA

query
sites
1q7cA
R
 
N
L
 
F
K
 
E
D
 
G
R
 
K
V
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
x
S
S
x
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
E
R
 
T
F
 
L
V
 
A
A
 
A
E
 
R
G
 
G
A
 
A
I
 
K
V
 
V
V
 
I
I
 
-
A
 
-
D
 
-
V
 
G
T
 
T
T
x
A
V
x
T
V
 
S
R
 
E
E
 
N
G
 
G
G
 
A
Q
 
Q
P
 
A
T
 
I
H
 
S
E
 
D
W
 
Y
L
 
L
G
 
G
I
 
A
-
 
N
-
 
G
E
 
K
H
 
G
V
 
L
Q
 
M
T
x
L
D
x
N
V
|
V
S
 
T
V
 
D
E
 
P
A
 
A
E
 
S
C
 
I
E
 
E
A
 
S
A
 
V
V
 
L
A
 
E
R
 
K
V
 
I
V
 
R
A
 
A
R
 
E
H
 
F
G
 
G
R
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
D
 
N
A
 
A
A
x
G
I
|
I
T
 
T
L
 
R
G
 
D
K
 
N
P
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
R
C
 
M
S
 
K
R
 
D
E
 
E
E
 
E
W
 
W
D
 
N
R
 
D
V
 
I
L
 
I
A
 
E
V
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
S
G
 
S
C
 
V
F
 
F
L
 
R
M
 
L
S
 
S
R
 
K
A
 
A
A
 
V
V
 
M
R
 
R
A
 
A
M
 
M
L
 
M
A
 
K
Q
 
K
A
 
R
P
 
-
R
 
-
G
 
-
E
 
-
V
 
-
R
 
H
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
T
I
 
I
S
 
G
S
|
S
Q
 
V
H
 
V
G
 
G
M
 
T
V
 
M
A
 
G
S
 
N
P
 
G
G
 
G
D
x
Q
I
 
A
A
 
N
Y
x
F
G
 
A
T
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
V
 
L
A
 
I
Y
 
G
L
 
F
T
 
S
R
 
K
Q
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
R
D
 
E
Y
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
R
G
 
G
I
 
I
V
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
V
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
K
 
F
I
 
I
L
 
E
T
 
T
G
 
D
K
 
M
T
 
T
G
 
-
R
 
R
A
 
A
I
 
L
D
 
S
P
 
D
A
 
D
M
 
Q
I
 
R
A
 
A
Y
 
G
S
 
I
E
 
L
A
 
A
R
 
Q
T
 
V
P
 
P
W
 
A
P
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
G
P
 
A
E
 
Q
D
 
E
V
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
A
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
M
 
A
Y
 
Y
V
 
I
T
 
T
G
 
G
E
 
E
N
 
T
L
 
L
M
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
W
 
M

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
43% identity, 96% coverage: 9:250/251 of query aligns to 9:238/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
A
 
Q
R
 
A
F
 
F
V
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
I
 
L
V
 
V
V
 
A
I
 
L
A
 
C
D
|
D
V
x
L