SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_091375961.1 NCBI__GCF_900105165.1:WP_091375961.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q15493 Regucalcin; RC; Gluconolactonase; GNL; Senescence marker protein 30; SMP-30; EC 3.1.1.17 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
31% identity, 94% coverage: 6:282/295 of query aligns to 4:284/299 of Q15493

query
sites
Q15493
I
 
I
T
 
K
A
 
I
D
 
E
L
 
C
I
 
V
F
 
L
D
 
P
A
 
E
K
 
N
A
 
C
Q
 
R
L
 
C
G
 
G
E
|
E
G
 
S
A
 
P
I
 
V
W
 
W
N
 
E
H
 
E
M
 
V
E
 
S
S
 
N
K
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
P
G
 
A
R
 
K
L
 
K
F
 
V
N
 
C
V
 
R
F
 
W
D
 
D
P
 
S
V
 
F
T
 
T
N
 
K
Q
 
Q
N
 
V
R
 
Q
T
 
R
Y
 
V
N
 
T
T
 
M
L
 
D
K
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
T
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
L
T
 
R
N
 
Q
N
 
S
G
 
G
Q
 
G
V
 
Y
L
 
V
V
 
A
A
 
T
L
 
I
E
 
G
D
 
T
G
 
K
I
 
F
A
 
C
T
 
A
I
 
L
E
 
N
L
 
W
T
 
K
D
 
E
-
 
Q
-
 
S
G
 
A
T
 
V
I
 
V
T
 
L
Y
 
A
K
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
N
D
 
D
I
 
-
H
 
-
L
 
-
M
 
K
H
 
K
N
 
N
K
 
N
R
 
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
C
 
V
D
 
D
H
 
P
E
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
A
M
 
E
S
 
E
G
 
T
V
 
A
R
 
P
E
 
A
V
 
V
S
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
L
 
L
Y
 
Y
C
 
S
I
 
L
S
 
F
E
 
P
N
 
D
F
 
H
A
 
H
M
 
V
E
 
K
E
 
K
K
 
Y
V
 
F
S
 
D
G
 
Q
V
 
V
S
 
D
I
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
D
W
 
W
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
M
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
L
T
 
S
G
 
Y
Q
 
S
V
 
V
V
 
D
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
R
 
L
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
A
 
S
N
 
N
K
 
R
K
 
R
V
 
S
I
 
V
I
 
Y
T
 
K
I
 
L
P
 
E
E
 
K
E
 
E
Q
 
E
G
 
Q
Y
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
 
C
I
 
I
D
 
D
N
 
A
E
 
E
G
 
G
M
 
K
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
L
 
C
W
 
Y
D
 
N
G
 
G
F
 
G
C
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
F
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
K
M
 
R
I
 
L
H
 
Q
K
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
L
P
 
P
A
 
V
P
 
D
K
 
K
V
 
T
S
 
T
S
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
K
N
 
N
L
 
Y
D
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
D
E
 
G
M
 
M
T
 
D
E
 
P
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
L
L
 
R
Y
 
Q
P
 
P
L
 
E
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I

4gncA Human smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
31% identity, 94% coverage: 6:282/295 of query aligns to 3:283/298 of 4gncA

query
sites
4gncA
I
 
I
T
 
K
A
 
I
D
 
E
L
 
C
I
 
V
F
 
L
D
 
P
A
 
E
K
 
N
A
 
C
Q
 
R
L
 
C
G
 
G
E
|
E
G
 
S
A
 
P
I
 
V
W
 
W
N
 
E
H
 
E
M
 
V
E
 
S
S
 
N
K
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
P
G
 
A
R
 
K
L
 
K
F
 
V
N
 
C
V
 
R
F
 
W
D
 
D
P
 
S
V
 
F
T
 
T
N
 
K
Q
 
Q
N
 
V
R
 
Q
T
 
R
Y
 
V
N
 
T
T
 
M
L
 
D
K
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
T
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
L
T
 
R
N
 
Q
N
 
S
G
 
G
Q
 
G
V
 
Y
L
 
V
V
 
A
A
 
T
L
 
I
E
 
G
D
 
T
G
 
K
I
 
F
A
 
C
T
 
A
I
 
L
E
 
N
L
 
W
T
 
K
D
 
E
-
 
Q
-
 
S
G
 
A
T
 
V
I
 
V
T
 
L
Y
 
A
K
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
N
D
 
D
I
 
-
H
 
-
L
 
-
M
 
K
H
 
K
N
 
N
K
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
|
D
G
 
G
K
 
K
C
 
V
D
 
D
H
 
P
E
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
A
M
 
E
S
 
E
G
 
T
V
 
A
R
 
P
E
 
A
V
 
V
S
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
L
 
L
Y
 
Y
C
 
S
I
 
L
S
 
F
E
 
P
N
 
D
F
 
H
A
 
H
M
 
V
E
 
K
E
 
K
K
 
Y
V
 
F
S
 
D
G
 
Q
V
 
V
S
 
D
I
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
D
W
 
W
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
M
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
L
T
 
S
G
 
Y
Q
 
S
V
 
V
V
 
D
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
R
 
L
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
A
 
S
N
 
N
K
 
R
K
 
R
V
 
S
I
 
V
I
 
Y
T
 
K
I
 
L
P
 
E
E
 
K
E
 
E
Q
 
E
G
 
Q
Y
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
 
C
I
 
I
D
 
D
N
 
A
E
 
E
G
 
G
M
 
K
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
L
 
C
W
 
Y
D
 
N
G
 
G
F
 
G
C
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
F
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
K
M
 
R
I
 
L
H
 
Q
K
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
L
P
 
P
A
 
V
P
 
D
K
 
K
V
 
T
S
x
T
S
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
K
N
|
N
L
x
Y
D
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
D
E
 
G
M
 
M
T
 
D
E
 
P
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
L
L
 
R
Y
 
Q
P
 
P
L
 
E
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I

Sites not aligning to the query:

3g4hA Crystal structure of human senescence marker protein-30 (zinc bound) (see paper)
31% identity, 94% coverage: 6:282/295 of query aligns to 2:282/297 of 3g4hA

query
sites
3g4hA
I
 
I
T
 
K
A
 
I
D
 
E
L
 
C
I
 
V
F
 
L
D
 
P
A
 
E
K
 
N
A
 
C
Q
 
R
L
 
C
G
 
G
E
|
E
G
 
S
A
 
P
I
 
V
W
 
W
N
 
E
H
 
E
M
 
V
E
 
S
S
 
N
K
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
P
G
 
A
R
 
K
L
 
K
F
 
V
N
 
C
V
 
R
F
 
W
D
 
D
P
 
S
V
 
F
T
 
T
N
 
K
Q
 
Q
N
 
V
R
 
Q
T
 
R
Y
 
V
N
 
T
T
 
M
L
 
D
K
 
A
R
 
P
I
 
V
G
 
S
T
 
S
V
 
V
V
 
A
P
 
L
T
 
R
N
 
Q
N
 
S
G
 
G
Q
 
G
V
 
Y
L
 
V
V
 
A
A
 
T
L
 
I
E
 
G
D
 
T
G
 
K
I
 
F
A
 
C
T
 
A
I
 
L
E
 
N
L
 
W
T
 
K
D
 
E
-
 
Q
-
 
S
G
 
A
T
 
V
I
 
V
T
 
L
Y
 
A
K
 
T
I
 
V
D
 
D
T
 
N
D
 
D
I
 
-
H
 
-
L
 
-
M
 
K
H
 
K
N
 
N
K
 
N
R
 
R
F
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
C
 
V
D
 
D
H
 
P
E
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
A
M
 
E
S
 
E
G
 
T
V
 
A
R
 
P
E
 
A
V
 
V
S
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
A
L
 
L
Y
 
Y
C
 
S
I
 
L
S
 
F
E
 
P
N
 
D
F
 
H
A
 
H
M
 
V
E
 
K
E
 
K
K
 
Y
V
 
F
S
 
D
G
 
Q
V
 
V
S
 
D
I
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
D
W
 
W
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
M
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
L
T
 
S
G
 
Y
Q
 
S
V
 
V
V
 
D
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
R
 
L
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
A
 
S
N
 
N
K
 
R
K
 
R
V
 
S
I
 
V
I
 
Y
T
 
K
I
 
L
P
 
E
E
 
K
E
 
E
Q
 
E
G
 
Q
Y
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
 
C
I
 
I
D
 
D
N
 
A
E
 
E
G
 
G
M
 
K
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
L
 
C
W
 
Y
D
 
N
G
 
G
F
 
G
C
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
F
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
V
T
 
T
G
 
G
E
 
K
M
 
R
I
 
L
H
 
Q
K
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
L
P
 
P
A
 
V
P
 
D
K
 
K
V
 
T
S
 
T
S
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
K
N
 
N
L
 
Y
D
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
D
E
 
G
M
 
M
T
 
D
E
 
P
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
L
L
 
R
Y
 
Q
P
 
P
L
 
E
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I

7pldB Caulobacter crescentus xylonolactonase with (r)-4-hydroxy-2- pyrrolidone (see paper)
35% identity, 96% coverage: 11:292/295 of query aligns to 8:284/289 of 7pldB

query
sites
7pldB
I
 
V
F
 
W
D
 
D
A
 
L
K
 
K
A
 
A
Q
 
T
L
|
L
G
 
G
E
|
E
G
 
G
A
 
P
I
 
I
W
 
W
N
 
H
H
 
-
M
 
-
E
 
G
S
 
D
K
 
T
L
 
L
Y
 
W
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
|
I
E
 
K
G
 
Q
R
 
R
L
 
K
F
 
I
N
 
H
V
 
N
F
 
Y
D
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
N
 
G
Q
 
E
N
 
R
R
 
F
T
 
S
Y
 
F
N
 
D
T
 
A
L
 
P
K
 
D
R
 
Q
I
 
V
G
 
T
T
 
F
V
 
L
V
 
A
P
 
P
T
 
I
N
 
V
N
 
G
G
x
A
Q
 
T
-
x
G
V
x
F
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
H
T
 
R
I
 
F
E
 
H
L
x
P
T
 
A
D
 
T
G
 
G
T
 
F
I
 
S
T
 
L
Y
 
L
K
 
L
I
 
E
D
 
V
T
 
E
D
 
D
I
 
A
H
 
A
L
 
L
M
 
-
H
 
-
N
 
N
K
 
N
R
|
R
F
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
K
 
T
C
 
V
D
 
D
H
 
A
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
L
W
 
W
V
 
F
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
H
M
 
D
S
 
G
G
x
E
V
 
E
R
 
N
E
 
N
V
 
S
S
 
G
E
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
R
I
 
M
S
 
D
E
 
L
N
 
T
F
 
-
A
 
G
M
 
V
E
 
A
E
 
R
K
 
M
V
x
D
S
 
R
G
 
D
V
 
I
S
 
C
I
 
I
S
 
T
N
|
N
G
 
G
I
 
P
A
 
C
W
 
V
N
 
S
A
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
T
M
 
F
Y
 
Y
Y
 
H
I
 
T
D
 
D
T
 
T
P
 
L
T
 
E
G
 
K
Q
 
T
V
 
I
V
 
Y
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
L
D
 
-
R
 
A
Q
 
E
T
 
D
G
 
G
A
 
L
I
 
L
A
 
S
N
 
N
K
|
K
K
 
R
V
 
V
I
 
F
I
 
V
T
 
Q
I
 
F
P
 
A
-
 
L
E
 
G
E
 
D
Q
 
D
G
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
S
T
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
Y
L
 
L
W
 
W
I
 
T
A
 
A
L
 
L
W
|
W
D
 
G
G
 
G
F
 
F
C
 
G
V
 
A
A
 
V
R
 
R
F
 
F
D
 
S
P
 
P
Q
 
Q
T
 
-
G
 
G
E
 
D
M
 
A
I
 
V
H
 
T
K
 
R
V
 
I
A
 
E
V
 
L
P
 
P
A
 
A
P
 
P
K
 
N
V
 
V
S
 
T
S
 
K
C
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
P
N
 
D
L
 
L
D
 
K
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
I
 
F
T
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
K
E
 
G
M
 
L
T
 
S
E
 
D
E
 
E
E
 
T
L
 
L
E
 
A
L
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
V
 
V
K
 
P
T
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
A
G
 
G
M
 
Q
P
 
P
A
 
Q
H
 
H

7plbB Caulobacter crescentus xylonolactonase with d-xylose (see paper)
35% identity, 96% coverage: 11:292/295 of query aligns to 8:284/289 of 7plbB

query
sites
7plbB
I
 
V
F
 
W
D
 
D
A
 
L
K
 
K
A
 
A
Q
 
T
L
|
L
G
 
G
E
|
E
G
 
G
A
 
P
I
 
I
W
 
W
N
 
H
H
 
-
M
 
-
E
 
G
S
 
D
K
 
T
L
 
L
Y
 
W
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
K
G
 
Q
R
 
R
L
 
K
F
 
I
N
 
H
V
 
N
F
 
Y
D
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
N
 
G
Q
 
E
N
 
R
R
 
F
T
 
S
Y
 
F
N
 
D
T
 
A
L
 
P
K
 
D
R
 
Q
I
 
V
G
 
T
T
 
F
V
 
L
V
 
A
P
 
P
T
 
I
N
 
V
N
 
G
G
x
A
Q
 
T
-
x
G
V
x
F
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
H
T
 
R
I
 
F
E
 
H
L
x
P
T
 
A
D
 
T
G
 
G
T
 
F
I
 
S
T
 
L
Y
 
L
K
 
L
I
x
E
D
x
V
T
 
E
D
|
D
I
 
A
H
 
A
L
 
L
M
 
-
H
 
-
N
 
N
K
 
N
R
|
R
F
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
A
K
 
T
C
 
V
D
 
D
H
 
A
E
 
Q
G
 
G
R
|
R
F
 
L
W
 
W
V
 
F
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
H
M
 
D
S
 
G
G
 
E
V
 
E
R
 
N
E
 
N
V
 
S
S
 
G
E
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
R
I
 
M
S
x
D
E
 
L
N
 
T
F
 
-
A
 
G
M
 
V
E
 
A
E
 
R
K
 
M
V
 
D
S
 
R
G
 
D
V
 
I
S
 
C
I
 
I
S
 
T
N
|
N
G
 
G
I
 
P
A
 
C
W
 
V
N
 
S
A
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
T
M
 
F
Y
 
Y
Y
 
H
I
 
T
D
 
D
T
 
T
P
 
L
T
 
E
G
 
K
Q
 
T
V
 
I
V
 
Y
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
L
D
 
-
R
 
A
Q
 
E
T
x
D
G
 
G
A
 
L
I
 
L
A
 
S
N
 
N
K
 
K
K
 
R
V
 
V
I
 
F
I
 
V
T
 
Q
I
 
F
P
 
A
-
 
L
E
 
G
E
 
D
Q
 
D
G
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
S
T
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
Y
L
 
L
W
 
W
I
 
T
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
G
G
 
G
F
 
F
C
 
G
V
 
A
A
 
V
R
 
R
F
 
F
D
 
S
P
 
P
Q
 
Q
T
 
-
G
 
G
E
 
D
M
 
A
I
 
V
H
 
T
K
 
R
V
 
I
A
 
E
V
 
L
P
 
P
A
 
A
P
 
P
K
 
N
V
 
V
S
 
T
S
 
K
C
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
P
N
 
D
L
 
L
D
 
K
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
I
 
F
T
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
K
E
 
G
M
 
L
T
 
S
E
 
D
E
 
E
E
 
T
L
 
L
E
 
A
L
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
V
 
V
K
 
P
T
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
A
G
 
G
M
 
Q
P
 
P
A
 
Q
H
 
H

Q9A9Z1 D-xylonolactone lactonase; Xylono-1,5-lactonase; EC 3.1.1.110 from Caulobacter vibrioides (strain ATCC 19089 / CIP 103742 / CB 15) (Caulobacter crescentus) (see paper)
35% identity, 96% coverage: 11:292/295 of query aligns to 8:284/289 of Q9A9Z1

query
sites
Q9A9Z1
I
 
V
F
 
W
D
 
D
A
 
L
K
 
K
A
 
A
Q
 
T
L
 
L
G
 
G
E
|
E
G
 
G
A
 
P
I
 
I
W
 
W
N
 
H
H
 
-
M
 
-
E
 
G
S
 
D
K
 
T
L
 
L
Y
 
W
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
K
G
 
Q
R
 
R
L
 
K
F
 
I
N
 
H
V
 
N
F
 
Y
D
 
H
P
 
P
V
 
A
T
 
T
N
 
G
Q
 
E
N
 
R
R
 
F
T
 
S
Y
 
F
N
 
D
T
 
A
L
 
P
K
 
D
R
 
Q
I
 
V
G
 
T
T
 
F
V
 
L
V
 
A
P
 
P
T
 
I
N
 
V
N
 
G
G
 
A
Q
 
T
-
 
G
V
 
F
L
 
V
V
 
V
A
 
G
L
 
L
E
 
K
D
 
T
G
 
G
I
 
I
A
 
H
T
 
R
I
 
F
E
 
H
L
 
P
T
 
A
D
 
T
G
 
G
T
 
F
I
 
S
T
 
L
Y
 
L
K
 
L
I
 
E
D
 
V
T
 
E
D
 
D
I
 
A
H
 
A
L
 
L
M
 
-
H
 
-
N
 
N
K
 
N
R
 
R
F
 
P
N
 
N
D
 
D
G
 
A
K
 
T
C
 
V
D
 
D
H
 
A
E
 
Q
G
 
G
R
 
R
F
 
L
W
 
W
V
 
F
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
H
M
 
D
S
 
G
G
 
E
V
 
E
R
 
N
E
 
N
V
 
S
S
 
G
E
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
R
I
 
M
S
 
D
E
 
L
N
 
T
F
 
-
A
 
G
M
 
V
E
 
A
E
 
R
K
 
M
V
 
D
S
 
R
G
 
D
V
 
I
S
 
C
I
 
I
S
 
T
N
|
N
G
 
G
I
 
P
A
 
C
W
 
V
N
 
S
A
 
P
D
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
T
M
 
F
Y
 
Y
Y
 
H
I
 
T
D
 
D
T
 
T
P
 
L
T
 
E
G
 
K
Q
 
T
V
 
I
V
 
Y
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
L
D
 
-
R
 
A
Q
 
E
T
 
D
G
 
G
A
 
L
I
 
L
A
 
S
N
 
N
K
 
K
K
 
R
V
 
V
I
 
F
I
 
V
T
 
Q
I
 
F
P
 
A
-
 
L
E
 
G
E
 
D
Q
 
D
G
 
V
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
S
T
 
V
I
 
V
D
 
D
N
 
S
E
 
E
G
 
G
M
 
Y
L
 
L
W
 
W
I
 
T
A
 
A
L
 
L
W
 
W
D
 
G
G
 
G
F
 
F
C
 
G
V
 
A
A
 
V
R
 
R
F
 
F
D
 
S
P
 
P
Q
 
Q
T
 
-
G
 
G
E
 
D
M
 
A
I
 
V
H
 
T
K
 
R
V
 
I
A
 
E
V
 
L
P
 
P
A
 
A
P
 
P
K
 
N
V
 
V
S
 
T
S
 
K
C
 
P
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
P
N
 
D
L
 
L
D
 
K
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
I
 
F
T
 
T
T
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
K
E
 
G
M
 
L
T
 
S
E
 
D
E
 
E
E
 
T
L
 
L
E
 
A
L
 
Q
Y
 
Y
P
 
P
L
 
L
S
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
F
 
F
A
 
A
V
 
V
K
 
P
T
 
V
D
 
D
A
 
V
K
 
A
G
 
G
M
 
Q
P
 
P
A
 
Q
H
 
H

4gnaA Mouse smp30/gnl-xylitol complex (see paper)
31% identity, 94% coverage: 6:282/295 of query aligns to 2:282/297 of 4gnaA

query
sites
4gnaA
I
 
I
T
 
K
A
 
V
D
 
E
L
 
C
I
 
V
F
 
L
D
 
R
A
 
E
K
 
N
A
 
Y
Q
 
R
L
 
C
G
 
G
E
|
E
G
 
S
A
 
P
I
 
V
W
 
W
N
 
E
H
 
E
M
 
A
E
 
S
S
 
Q
K
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
P
G
 
S
R
 
K
L
 
I
F
 
I
N
 
C
V
 
R
F
 
W
D
 
D
P
 
T
V
 
V
T
 
S
N
 
N
Q
 
Q
N
 
-
R
 
-
T
 
-
Y
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
V
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
T
 
V
V
 
D
V
 
A
P
 
P
T
 
V
N
 
S
N
 
S
G
 
-
Q
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
R
A
 
Q
L
 
L
E
 
G
D
 
G
G
 
Y
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
G
L
 
T
T
 
K
D
 
F
G
 
C
T
 
A
I
 
L
T
 
N
Y
 
W
K
 
E
I
 
N
D
 
Q
T
 
S
D
 
V
I
 
F
H
 
V
L
 
L
M
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
K
H
 
K
N
 
N
K
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
C
 
V
D
 
D
H
 
P
E
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
A
M
 
E
S
x
E
G
 
T
V
 
A
R
 
P
E
 
A
V
 
V
S
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
S
I
 
L
S
 
F
E
 
P
N
 
D
F
 
H
A
 
S
M
 
V
E
 
K
E
 
K
K
 
Y
V
 
F
S
 
D
G
 
Q
V
 
V
S
 
D
I
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
D
W
 
W
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
M
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
L
T
 
S
G
 
Y
Q
 
T
V
 
V
V
 
D
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
R
 
L
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
A
 
S
N
 
N
K
 
R
K
 
R
V
 
I
I
 
V
I
 
Y
T
 
K
I
 
M
P
 
E
E
 
K
E
 
D
Q
 
E
G
 
Q
Y
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
 
C
I
 
I
D
 
D
N
 
A
E
 
E
G
 
G
M
 
K
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
L
 
C
W
x
Y
D
 
N
G
 
G
F
 
G
C
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
F
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
K
M
 
R
I
 
L
H
 
Q
K
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
L
P
 
P
A
 
V
P
 
D
K
 
K
V
 
T
S
 
T
S
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
K
N
 
D
L
 
Y
D
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
D
E
 
G
M
 
L
T
 
N
E
 
A
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
L
L
 
R
Y
 
Q
P
 
P
L
 
D
S
 
A
G
 
G
G
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I

4gn9A Mouse smp30/gnl-glucose complex (see paper)
31% identity, 94% coverage: 6:282/295 of query aligns to 2:282/297 of 4gn9A

query
sites
4gn9A
I
 
I
T
 
K
A
 
V
D
 
E
L
 
C
I
 
V
F
 
L
D
 
R
A
 
E
K
 
N
A
 
Y
Q
 
R
L
 
C
G
 
G
E
|
E
G
 
S
A
 
P
I
 
V
W
 
W
N
 
E
H
 
E
M
 
A
E
 
S
S
 
Q
K
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
P
G
 
S
R
 
K
L
 
I
F
 
I
N
 
C
V
 
R
F
 
W
D
 
D
P
 
T
V
 
V
T
 
S
N
 
N
Q
 
Q
N
 
-
R
 
-
T
 
-
Y
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
V
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
T
 
V
V
 
D
V
 
A
P
 
P
T
 
V
N
 
S
N
 
S
G
 
-
Q
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
R
A
 
Q
L
 
L
E
 
G
D
x
G
G
 
Y
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
G
L
 
T
T
 
K
D
 
F
G
 
C
T
 
A
I
 
L
T
 
N
Y
x
W
K
x
E
I
 
N
D
 
Q
T
 
S
D
 
V
I
 
F
H
 
V
L
 
L
M
 
A
-
 
M
-
 
V
-
x
D
-
x
E
-
 
D
-
 
K
H
 
K
N
 
N
K
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
C
 
V
D
 
D
H
 
P
E
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
A
M
 
E
S
x
E
G
 
T
V
 
A
R
 
P
E
 
A
V
 
V
S
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
L
 
L
Y
|
Y
C
 
S
I
 
L
S
 
F
E
 
P
N
 
D
F
 
H
A
 
S
M
 
V
E
 
K
E
x
K
K
 
Y
V
 
F
S
 
D
G
 
Q
V
 
V
S
 
D
I
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
D
W
 
W
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
M
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
T
x
S
P
 
L
T
 
S
G
 
Y
Q
 
T
V
 
V
V
 
D
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
R
 
L
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
A
 
S
N
 
N
K
 
R
K
 
R
V
 
I
I
 
V
I
 
Y
T
 
K
I
 
M
P
 
E
E
 
K
E
 
D
Q
 
E
G
 
Q
Y
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
 
C
I
 
I
D
 
D
N
 
A
E
 
E
G
 
G
M
 
K
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
L
 
C
W
x
Y
D
 
N
G
 
G
F
 
G
C
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
F
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
K
M
 
R
I
 
L
H
 
Q
K
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
L
P
 
P
A
 
V
P
 
D
K
 
K
V
 
T
S
 
T
S
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
K
N
 
D
L
 
Y
D
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
D
E
 
G
M
 
L
T
 
N
E
 
A
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
L
L
 
R
Y
 
Q
P
 
P
L
 
D
S
 
A
G
 
G
G
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I

4gn8A Mouse smp30/gnl-1,5-ag complex (see paper)
31% identity, 94% coverage: 6:282/295 of query aligns to 2:282/297 of 4gn8A

query
sites
4gn8A
I
 
I
T
 
K
A
 
V
D
 
E
L
 
C
I
 
V
F
 
L
D
 
R
A
 
E
K
 
N
A
 
Y
Q
 
R
L
 
C
G
 
G
E
|
E
G
 
S
A
 
P
I
 
V
W
 
W
N
 
E
H
 
E
M
 
A
E
 
S
S
 
Q
K
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
P
G
 
S
R
 
K
L
 
I
F
 
I
N
 
C
V
 
R
F
 
W
D
 
D
P
 
T
V
 
V
T
 
S
N
 
N
Q
 
Q
N
 
-
R
 
-
T
 
-
Y
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
V
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
T
 
V
V
 
D
V
 
A
P
 
P
T
 
V
N
 
S
N
 
S
G
 
-
Q
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
R
A
x
Q
L
 
L
E
 
G
D
 
G
G
 
Y
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
G
L
 
T
T
 
K
D
 
F
G
 
C
T
 
A
I
 
L
T
 
N
Y
 
W
K
 
E
I
 
N
D
 
Q
T
 
S
D
 
V
I
 
F
H
 
V
L
 
L
M
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
K
H
 
K
N
 
N
K
 
N
R
|
R
F
 
F
N
|
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
C
 
V
D
 
D
H
 
P
E
x
A
G
|
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
A
M
 
E
S
x
E
G
 
T
V
 
A
R
x
P
E
 
A
V
 
V
S
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
S
I
 
L
S
 
F
E
 
P
N
 
D
F
 
H
A
 
S
M
 
V
E
 
K
E
 
K
K
 
Y
V
 
F
S
 
D
G
 
Q
V
 
V
S
 
D
I
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
D
W
 
W
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
M
 
F
Y
|
Y
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
L
T
 
S
G
 
Y
Q
 
T
V
 
V
V
 
D
Q
x
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
Y
D
|
D
R
 
L
Q
|
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
A
 
S
N
 
N
K
 
R
K
x
R
V
 
I
I
x
V
I
 
Y
T
 
K
I
 
M
P
 
E
E
 
K
E
 
D
Q
 
E
G
 
Q
Y
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
 
C
I
 
I
D
 
D
N
 
A
E
 
E
G
 
G
M
 
K
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
L
 
C
W
x
Y
D
 
N
G
 
G
F
 
G
C
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
F
 
L
D
 
D
P
|
P
Q
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
K
M
 
R
I
 
L
H
 
Q
K
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
L
P
 
P
A
 
V
P
 
D
K
 
K
V
 
T
S
 
T
S
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
K
N
 
D
L
 
Y
D
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
D
E
 
G
M
 
L
T
 
N
E
 
A
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
L
L
 
R
Y
 
Q
P
 
P
L
 
D
S
 
A
G
 
G
G
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I

Sites not aligning to the query:

4gn7A Mouse smp30/gnl (see paper)
31% identity, 94% coverage: 6:282/295 of query aligns to 2:282/297 of 4gn7A

query
sites
4gn7A
I
 
I
T
 
K
A
 
V
D
 
E
L
 
C
I
 
V
F
 
L
D
 
R
A
 
E
K
 
N
A
 
Y
Q
 
R
L
 
C
G
 
G
E
|
E
G
 
S
A
 
P
I
 
V
W
 
W
N
 
E
H
 
E
M
 
A
E
 
S
S
 
Q
K
 
S
L
 
L
Y
 
L
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
I
E
 
P
G
 
S
R
 
K
L
 
I
F
 
I
N
 
C
V
 
R
F
 
W
D
 
D
P
 
T
V
 
V
T
 
S
N
 
N
Q
 
Q
N
 
-
R
 
-
T
 
-
Y
 
-
N
 
-
T
 
-
L
 
V
K
 
Q
R
 
R
I
 
V
G
 
A
T
 
V
V
 
D
V
 
A
P
 
P
T
 
V
N
 
S
N
 
S
G
 
-
Q
 
V
V
 
A
L
 
L
V
 
R
A
 
Q
L
 
L
E
 
G
D
 
G
G
 
Y
I
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
E
 
G
L
 
T
T
 
K
D
 
F
G
 
C
T
 
A
I
 
L
T
 
N
Y
 
W
K
 
E
I
 
N
D
 
Q
T
 
S
D
 
V
I
 
F
H
 
V
L
 
L
M
 
A
-
 
M
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
D
-
 
K
H
 
K
N
 
N
K
 
N
R
 
R
F
 
F
N
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
C
 
V
D
 
D
H
 
P
E
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
Y
W
 
F
V
 
A
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
A
M
 
E
S
 
E
G
 
T
V
 
A
R
 
P
E
 
A
V
 
V
S
 
L
E
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
Q
-
 
G
-
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
S
I
 
L
S
 
F
E
 
P
N
 
D
F
 
H
A
 
S
M
 
V
E
 
K
E
 
K
K
 
Y
V
 
F
S
 
D
G
 
Q
V
 
V
S
 
D
I
 
I
S
 
S
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
D
W
 
W
N
 
S
A
 
L
D
 
D
G
 
H
S
 
K
L
 
I
M
 
F
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
L
T
 
S
G
 
Y
Q
 
T
V
 
V
V
 
D
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
R
 
L
Q
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
Q
I
 
I
A
 
S
N
 
N
K
 
R
K
 
R
V
 
I
I
 
V
I
 
Y
T
 
K
I
 
M
P
 
E
E
 
K
E
 
D
Q
 
E
G
 
Q
Y
 
I
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
 
C
I
 
I
D
 
D
N
 
A
E
 
E
G
 
G
M
 
K
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
L
 
C
W
 
Y
D
 
N
G
 
G
F
 
G
C
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
F
 
L
D
 
D
P
 
P
Q
 
E
T
 
T
G
 
G
E
 
K
M
 
R
I
 
L
H
 
Q
K
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
L
P
 
P
A
 
V
P
 
D
K
 
K
V
 
T
S
 
T
S
 
S
C
 
C
A
 
C
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
K
N
 
D
L
 
Y
D
 
S
T
 
E
L
 
M
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
T
 
C
A
 
A
R
 
R
A
 
D
E
 
G
M
 
L
T
 
N
E
 
A
E
 
E
E
 
G
L
 
L
E
 
L
L
 
R
Y
 
Q
P
 
P
L
 
D
S
 
A
G
 
G
G
 
N
V
 
I
F
 
F
A
 
K
V
 
I

5gx1A Luciferin-regenerating enzyme collected with serial synchrotron rotational crystallography with accumulated dose of 1.1 mgy (1st measurement) (see paper)
32% identity, 91% coverage: 14:282/295 of query aligns to 11:292/307 of 5gx1A

query
sites
5gx1A
A
 
G
K
 
K
A
 
Y
Q
 
T
L
 
V
G
 
G
E
|
E
G
 
G
A
 
P
I
 
H
W
 
W
N
 
D
H
 
H
M
 
E
E
 
T
S
 
Q
K
 
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
T
E
 
V
G
 
E
R
 
K
L
 
T
F
 
F
N
 
H
V
 
K
F
 
Y
D
 
V
P
 
P
V
 
S
T
 
Q
N
 
K
Q
 
K
N
 
Y
R
 
T
T
 
F
Y
x
C
N
 
K
T
 
V
L
 
D
K
 
K
R
 
L
I
 
V
G
 
S
T
 
F
V
 
I
V
 
I
P
 
P
T
 
L
-
 
A
-
 
G
N
 
S
N
 
P
G
 
G
Q
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
A
 
S
L
 
L
E
 
E
D
 
R
G
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
I
-
x
L
-
 
T
-
x
W
-
 
D
-
 
G
I
 
V
E
 
S
L
 
A
T
 
A
D
 
P
G
 
T
T
 
S
I
 
I
T
 
E
Y
 
A
K
 
I
I
 
V
D
 
N
T
 
V
D
 
E
I
 
P
H
 
H
L
 
I
M
 
K
H
 
N
N
 
N
K
 
-
R
 
R
F
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
C
 
A
D
 
D
H
 
P
E
 
L
G
 
G
R
 
N
F
 
L
W
 
W
V
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
A
M
 
I
S
 
D
G
 
A
V
 
G
R
 
L
E
 
P
V
 
I
S
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
G
E
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
H
I
 
L
S
 
G
E
 
A
N
 
D
F
 
K
A
 
K
M
 
V
E
 
K
E
 
M
K
 
H
V
 
E
S
 
S
G
 
N
V
 
I
S
 
A
I
 
I
S
 
A
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
A
W
 
W
N
 
S
A
 
N
D
 
D
G
 
L
S
 
K
L
 
K
M
 
M
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
G
T
 
K
G
 
R
Q
 
R
V
 
V
V
 
D
Q
 
E
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
R
 
A
Q
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
I
 
I
A
 
S
N
 
N
K
 
Q
K
 
R
V
 
P
I
 
L
I
 
F
T
 
T
I
 
F
P
 
E
E
 
K
E
 
H
Q
 
E
-
 
V
-
 
P
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
Q
T
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
N
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
L
 
V
W
 
F
D
 
Q
G
 
G
F
 
Q
C
 
R
V
 
I
A
 
I
R
 
K
F
 
I
D
 
S
P
 
T
Q
 
Q
T
 
Q
G
 
P
E
 
E
-
 
V
M
 
L
I
 
L
H
 
D
K
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
I
P
 
P
A
 
D
P
 
P
K
 
Q
V
 
V
S
 
T
S
 
S
C
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
P
N
 
N
L
 
L
D
 
D
T
 
E
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
L
E
 
Q
M
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
S
E
 
S
L
 
F
E
 
D
L
 
K
Y
 
S
P
 
L
L
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
H
V
 
V
F
 
Y
A
 
R
V
 
V

5d9bA Luciferin-regenerating enzyme solved by siras using xfel (refined against native data) (see paper)
32% identity, 91% coverage: 14:282/295 of query aligns to 11:292/307 of 5d9bA

query
sites
5d9bA
A
 
G
K
 
K
A
 
Y
Q
 
T
L
 
V
G
 
G
E
|
E
G
 
G
A
 
P
I
 
H
W
 
W
N
 
D
H
 
H
M
 
E
E
 
T
S
 
Q
K
 
T
L
 
L
Y
 
Y
W
 
F
V
 
V
D
 
D
I
 
T
E
 
V
G
 
E
R
 
K
L
 
T
F
 
F
N
 
H
V
 
K
F
 
Y
D
 
V
P
 
P
V
 
S
T
 
Q
N
 
K
Q
 
K
N
 
Y
R
 
T
T
 
F
Y
 
C
N
 
K
T
 
V
L
 
D
K
 
K
R
 
L
I
 
V
G
 
S
T
 
F
V
 
I
V
 
I
P
 
P
T
 
L
-
 
A
-
 
G
N
 
S
N
 
P
G
 
G
Q
 
R
V
 
F
L
 
V
V
 
V
A
 
S
L
 
L
E
 
E
D
 
R
G
 
E
I
 
I
A
 
A
T
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
W
-
 
D
-
 
G
I
 
V
E
 
S
L
 
A
T
 
A
D
 
P
G
 
T
T
 
S
I
 
I
T
 
E
Y
 
A
K
 
I
I
 
V
D
 
N
T
 
V
D
 
E
I
 
P
H
 
H
L
 
I
M
 
K
H
 
N
N
 
N
K
 
-
R
 
R
F
 
L
N
 
N
D
 
D
G
 
G
K
 
K
C
 
A
D
 
D
H
 
P
E
 
L
G
 
G
R
 
N
F
 
L
W
 
W
V
 
T
G
 
G
T
 
T
H
 
M
S
 
A
M
 
I
S
 
D
G
 
A
V
 
G
R
 
L
E
 
P
V
 
I
S
 
G
-
 
P
-
 
V
-
 
T
-
 
G
E
 
S
L
 
L
Y
 
Y
C
 
H
I
 
L
S
 
G
E
 
A
N
 
D
F
 
K
A
 
K
M
 
V
E
 
K
E
 
M
K
 
H
V
 
E
S
 
S
G
 
N
V
 
I
S
 
A
I
 
I
S
 
A
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
A
W
 
W
N
 
S
A
 
N
D
 
D
G
 
L
S
 
K
L
 
K
M
 
M
Y
 
Y
Y
 
Y
I
 
I
D
 
D
T
 
S
P
 
G
T
 
K
G
 
R
Q
 
R
V
 
V
V
 
D
Q
 
E
Y
 
Y
D
 
D
F
 
Y
D
 
D
R
 
A
Q
 
S
T
 
T
G
 
L
A
 
S
I
 
I
A
 
S
N
 
N
K
 
Q
K
 
R
V
 
P
I
 
L
I
 
F
T
 
T
I
 
F
P
 
E
E
 
K
E
 
H
Q
 
E
-
 
V
-
 
P
G
 
G
Y
 
Y
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
Q
T
 
T
I
 
I
D
 
D
N
 
E
E
 
E
G
 
G
M
 
N
L
 
L
W
 
W
I
 
V
A
 
A
L
 
V
W
 
F
D
 
Q
G
 
G
F
 
Q
C
 
R
V
 
I
A
 
I
R
 
K
F
 
I
D
 
S
P
 
T
Q
 
Q
T
 
Q
G
 
P
E
 
E
-
 
V
M
 
L
I
 
L
H
 
D
K
 
T
V
 
V
A
 
K
V
 
I
P
 
P
A
 
D
P
 
P
K
 
Q
V
 
V
S
 
T
S
 
S
C
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
G
D
 
P
N
 
N
L
 
L
D
 
D
T
 
E
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
T
 
S
A
 
A
R
 
G
A
 
L
E
 
Q
M
 
L
T
 
D
E
 
D
E
 
S
E
 
S
L
 
F
E
 
D
L
 
K
Y
 
S
P
 
L
L
 
V
S
 
N
G
 
G
G
 
H
V
 
V
F
 
Y
A
 
R
V
 
V

3dr2A Structural and functional analyses of xc5397 from xanthomonas campestris: a gluconolactonase important in glucose secondary metabolic pathways (see paper)
25% identity, 79% coverage: 15:248/295 of query aligns to 40:278/299 of 3dr2A

query
sites
3dr2A
K
 
Q
A
 
A
Q
 
T
L
 
W
G
 
S
E
|
E
G
 
G
A
 
P
I
 
A
W
 
W
N
 
W
H
 
E
M
 
A
E
 
Q
S
 
R
K
 
T
L
 
L
Y
 
V
W
 
W
V
 
S
D
 
D
I
 
L
E
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
R
F
 
V
N
 
L
V
 
G
F
 
W
D
 
-
P
 
-
V
 
-
T
 
-
N
 
-
Q
 
-
N
 
-
R
 
R
T
 
E
Y
 
D
N
 
G
T
 
T
L
 
V
K
 
D
R
 
V
I
 
L
G
 
L
T
 
D
V
 
A
V
 
T
P
 
A
T
 
F
N
 
T
N
 
N
G
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
A
-
 
Q
Q
 
Q
V
 
R
L
 
L
V
 
V
A
 
H
L
 
C
E
 
E
D
 
H
G
 
G
I
 
R
A
 
R
T
 
A
I
 
I
E
 
T
L
 
R
T
 
S
D
 
D
G
 
A
T
 
-
I
 
-
T
 
-
Y
 
-
K
 
-
I
 
-
D
 
D
T
 
G
D
 
Q
I
 
A
H
 
H
L
 
L
M
 
L
-
 
V
-
 
G
-
 
R
-
 
Y
H
 
A
N
 
G
K
 
K
R
 
R
F
 
L
N
 
N
-
 
S
-
 
P
-
x
N
D
 
D
G
 
L
K
 
I
C
 
V
D
 
A
H
 
R
E
 
D
G
 
G
R
 
A
F
 
I
W
 
W
V
 
F
G
 
-
T
 
T
H
 
D
S
 
P
M
 
P
S
 
F
G
 
G
V
 
L
R
 
R
E
 
K
V
 
P
S
 
S
E
 
Q
-
 
G
-
 
C
-
 
P
-
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
H
-
 
H
-
 
S
L
 
V
Y
 
Y
C
 
R
I
 
L
S
 
P
E
 
P
N
 
D
F
 
G
A
 
S
M
 
P
E
 
L
E
 
Q
K
 
R
V
 
M
S
 
A
G
 
D
V
 
L
S
 
D
I
 
H
S
 
P
N
|
N
G
 
G
I
 
L
A
 
A
W
 
F
N
 
S
A
 
P
D
 
D
G
 
E
S
 
Q
L
 
T
M
 
L
Y
 
Y
Y
 
V
I
 
S
D
 
Q
T
 
T
P
 
P
T
 
E
G
 
G
Q
 
S
V
 
V
V
 
E
Q
 
I
Y
 
T
D
 
A
F
 
F
D
 
A
R
 
W
Q
 
R
T
 
D
G
 
G
A
 
A
I
 
L
A
 
H
N
 
D
K
 
R
K
 
R
V
 
H
I
 
F
I
 
A
T
 
S
I
 
V
P
 
P
E
 
D
E
 
-
Q
 
-
G
 
G
Y
 
L
P
 
P
D
|
D
G
 
G
M
 
F
T
 
C
I
 
V
D
 
D
N
 
R
E
 
G
G
 
G
M
 
W
L
 
L
W
 
W
I
 
S
A
 
S
L
 
S
W
 
G
D
 
T
G
 
G
F
 
V
C
 
C
V
 
V
A
 
-
R
 
-
F
 
F
D
 
D
P
 
-
Q
 
S
T
 
D
G
 
G
E
 
Q
M
 
L
I
 
L
H
 
G
K
 
H
V
 
I
A
 
P
V
 
T
P
 
P
A
 
G
P
 
-
K
 
T
V
 
A
S
 
S
S
 
N
C
 
C
A
 
T
F
 
F

3o4pA Dfpase at 0.85 angstrom resolution (h atoms included) (see paper)
27% identity, 64% coverage: 70:259/295 of query aligns to 84:285/314 of 3o4pA

query
sites
3o4pA
Q
 
Q
V
 
L
L
 
F
V
 
V
A
 
A
-
 
D
L
 
M
E
 
R
D
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
L
T
 
V
I
 
V
E
 
Q
L
 
-
T
 
T
D
 
D
G
 
G
T
 
T
I
 
F
T
 
E
Y
 
E
K
 
I
I
 
A
D
 
K
T
 
K
D
 
D
I
 
S
H
 
E
L
 
G
M
 
R
H
 
R
N
 
M
K
 
Q
R
 
G
F
 
C
N
|
N
D
 
D
G
 
C
K
 
A
C
 
F
D
 
D
H
 
Y
E
 
E
G
 
G
R
 
N
F
 
L
W
 
W
V
 
I
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
P
G
 
A
T
 
D
H
 
Y
S
 
T
M
 
R
S
 
S
G
 
M
V
 
Q
R
 
E
E
x
K
V
 
F
S
 
G
E
 
S
L
 
I
Y
 
Y
C
 
C
I
 
F
S
 
T
E
 
T
N
 
D
F
 
G
A
 
Q
M
 
M
E
 
I
E
 
Q
K
 
V
V
 
D
S
 
T
G
x
A
V
x
F
S
 
Q
I
 
F
S
 
P
N
|
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
N
 
R
-
 
H
-
 
M
A
 
N
D
 
D
G
 
G
S
 
R
L
 
P
M
 
Y
Y
 
Q
Y
 
L
I
 
I
-
 
V
-
 
A
D
x
E
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
K
Q
 
K
V
 
L
V
 
W
Q
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
I
D
 
-
R
 
K
Q
 
G
T
 
P
G
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
E
N
 
N
K
|
K
K
 
K
V
 
V
I
 
W
I
 
G
T
 
H
I
 
I
P
 
P
-
 
G
E
 
T
E
 
H
Q
 
E
G
 
G
Y
 
G
P
 
A
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
x
D
I
 
F
D
 
D
N
 
E
E
 
D
G
 
N
M
 
N
L
 
L
W
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
N
W
|
W
D
 
G
G
 
S
F
 
S
C
 
H
V
 
I
A
 
E
R
 
V
F
 
F
D
 
G
P
 
P
Q
 
D
T
 
G
G
 
G
E
 
Q
M
 
P
I
 
K
H
 
M
K
 
R
V
 
I
A
 
R
V
 
C
P
 
P
A
 
F
P
 
E
K
|
K
V
 
P
S
 
S
S
 
N
C
x
L
A
x
H
F
 
F
G
 
-
G
 
K
D
 
P
N
 
Q
L
 
T
D
 
K
T
 
T
L
 
I
Y
 
F
I
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

Q7SIG4 Diisopropyl-fluorophosphatase; DFPase; EC 3.8.2.2 from Loligo vulgaris (Common European squid) (see 4 papers)
27% identity, 64% coverage: 70:259/295 of query aligns to 84:285/314 of Q7SIG4

query
sites
Q7SIG4
Q
 
Q
V
 
L
L
 
F
V
 
V
A
 
A
-
 
D
L
 
M
E
 
R
D
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
L
T
 
V
I
 
V
E
 
Q
L
 
-
T
 
T
D
 
D
G
 
G
T
 
T
I
 
F
T
 
E
Y
 
E
K
 
I
I
 
A
D
 
K
T
 
K
D
 
D
I
 
S
H
 
E
L
 
G
M
 
R
H
 
R
N
 
M
K
 
Q
R
 
G
F
 
C
N
|
N
D
|
D
G
 
C
K
 
A
C
 
F
D
 
D
H
 
Y
E
 
E
G
 
G
R
 
N
F
 
L
W
 
W
V
 
I
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
P
G
 
A
T
 
D
H
x
Y
S
 
T
M
x
R
S
 
S
G
x
M
V
 
Q
R
 
E
E
 
K
V
 
F
S
 
G
E
 
S
L
 
I
Y
 
Y
C
 
C
I
 
F
S
 
T
E
 
T
N
 
D
F
 
G
A
 
Q
M
 
M
E
 
I
E
 
Q
K
 
V
V
 
D
S
 
T
G
 
A
V
 
F
S
 
Q
I
x
F
S
 
P
N
|
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
N
 
R
-
x
H
-
 
M
A
 
N
D
 
D
G
 
G
S
 
R
L
 
P
M
 
Y
Y
 
Q
Y
 
L
I
 
I
-
 
V
-
 
A
D
 
E
T
|
T
P
 
P
T
 
T
G
 
K
Q
 
K
V
 
L
V
 
W
Q
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
I
D
 
-
R
 
K
Q
 
G
T
 
P
G
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
E
N
 
N
K
 
K
K
 
K
V
 
V
I
 
W
I
 
G
T
x
H
I
 
I
P
 
P
-
 
G
E
 
T
E
x
H
Q
 
E
G
 
G
Y
 
G
P
 
A
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
x
D
I
 
F
D
 
D
N
 
E
E
 
D
G
x
N
M
 
N
L
 
L
W
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
N
W
|
W
D
 
G
G
 
S
F
 
S
C
x
H
V
 
I
A
 
E
R
 
V
F
 
F
D
 
G
P
 
P
Q
 
D
T
 
G
G
 
G
E
 
Q
M
 
P
I
 
K
H
 
M
K
 
R
V
 
I
A
 
R
V
 
C
P
 
P
A
 
F
P
 
E
K
 
K
V
 
P
S
|
S
S
x
N
C
x
L
A
x
H
F
 
F
G
 
-
G
 
K
D
 
P
N
 
Q
L
 
T
D
 
K
T
 
T
L
 
I
Y
 
F
I
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

2gvvA Structure of diisopropyl fluorophosphatase (dfpase) in complex with dicyclopentylphosphoroamidate (dcppa) (see paper)
27% identity, 64% coverage: 70:259/295 of query aligns to 82:283/309 of 2gvvA

query
sites
2gvvA
Q
 
Q
V
 
L
L
 
F
V
 
V
A
 
A
-
 
D
L
 
M
E
 
R
D
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
L
T
 
V
I
 
V
E
 
Q
L
 
-
T
 
T
D
 
D
G
 
G
T
 
T
I
 
F
T
 
E
Y
 
E
K
 
I
I
 
A
D
 
K
T
 
K
D
 
D
I
 
S
H
 
E
L
 
G
M
 
R
H
 
R
N
 
M
K
 
Q
R
 
G
F
 
C
N
|
N
D
 
D
G
 
C
K
 
A
C
 
F
D
 
D
H
 
Y
E
 
E
G
 
G
R
 
N
F
 
L
W
 
W
V
 
I
-
 
T
-
 
A
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
A
-
 
P
G
 
A
T
 
D
H
 
Y
S
 
T
M
 
R
S
 
S
G
 
M
V
 
Q
R
 
E
E
 
K
V
 
F
S
 
G
E
 
S
L
 
I
Y
 
Y
C
 
C
I
 
F
S
 
T
E
 
T
N
 
D
F
 
G
A
 
Q
M
 
M
E
 
I
E
 
Q
K
 
V
V
 
D
S
 
T
G
 
A
V
 
F
S
 
Q
I
 
F
S
 
P
N
|
N
G
 
G
I
 
I
A
 
A
W
 
V
N
 
R
-
 
H
-
 
M
A
 
N
D
 
D
G
 
G
S
 
R
L
 
P
M
 
Y
Y
 
Q
Y
 
L
I
 
I
-
 
V
-
 
A
D
 
E
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
K
Q
 
K
V
 
L
V
 
W
Q
 
S
Y
 
Y
D
 
D
F
 
I
D
 
-
R
 
K
Q
 
G
T
 
P
G
 
A
A
 
K
I
 
I
A
 
E
N
 
N
K
 
K
K
 
K
V
 
V
I
 
W
I
 
G
T
 
H
I
 
I
P
 
P
-
 
G
E
 
T
E
 
H
Q
 
E
G
 
G
Y
 
G
P
 
A
D
|
D
G
 
G
M
 
M
T
x
D
I
 
F
D
 
D
N
 
E
E
 
D
G
 
N
M
 
N
L
 
L
W
 
L
I
 
V
A
 
A
L
 
N
W
|
W
D
 
G
G
 
S
F
 
S
C
 
H
V
 
I
A
 
E
R
 
V
F
 
F
D
 
G
P
 
P
Q
 
D
T
 
G
G
 
G
E
 
Q
M
 
P
I
 
K
H
 
M
K
 
R
V
 
I
A
 
R
V
 
C
P
 
P
A
 
F
P
 
E
K
 
K
V
 
P
S
 
S
S
 
N
C
x
L
A
x
H
F
 
F
G
 
-
G
 
K
D
 
P
N
 
Q
L
 
T
D
 
K
T
 
T
L
 
I
Y
 
F
I
 
V
T
 
T

Sites not aligning to the query:

8dk0A Crystal structure of rpa3624, a beta-propeller lactonase from rhodopseudomonas palustris, with active-site bound (s)gamma- valerolactone (see paper)
26% identity, 55% coverage: 103:265/295 of query aligns to 112:276/293 of 8dk0A

query
sites
8dk0A
K
 
K
R
 
G
F
 
P
N
|
N
D
 
D
G
 
L
K
 
V
C
 
F
D
 
D
H
 
K
E
 
H
G
 
G
R
 
G
F
 
L
W
 
W
V
 
F
G
 
T
T
 
D
H
 
L
S
 
G
M
 
K
S
 
R
G
 
R
V
 
A
R
 
R
E
 
D
-
 
M
-
 
D
V
 
V
S
 
G
E
 
A
L
 
A
Y
 
Y
C
 
Y
I
 
I
S
 
K
E
 
P
N
 
G
F
 
M
A
 
T
-
 
E
M
 
I
E
 
T
E
 
E
K
 
Q
V
 
V
S
 
F
G
 
G
V
 
T
S
 
L
I
 
P
S
 
L
N
|
N
G
 
G
I
 
I
A
 
G
W
 
L
N
 
S
A
 
P
D
 
D
G
 
E
S
 
A
L
 
T
M
 
M
Y
 
Y
Y
 
A
I
 
A
D
 
E
T
 
T
P
 
P
T
 
T
G
 
G
Q
 
R
V
 
L
V
 
W
Q
 
A
Y
 
F
D
 
D
F
 
L
D
 
S
R
 
G
Q
 
P
T
 
G
G
 
E
A
 
V
I
 
K
A
 
P
N
 
K
K
 
G
K
 
K
V
 
P
I
 
I
I
 
C
T
 
G
I
 
L
P
 
G
E
 
G
E
 
Y
Q
 
Q
G
 
M
Y
 
F
P
 
-
D
|
D
G
x
S
M
 
L
T
 
A
I
 
V
D
 
E
N
 
A
E
 
S
G
 
G
M
 
N
L
 
V
W
 
C
I
 
V
A
 
A
L
 
T
W
 
L
D
 
V
G
 
S
F
 
G
C
 
C
V
 
I
A
 
S
R
 
V
F
 
I
D
 
A
P
 
P
Q
 
D
T
 
-
G
 
G
E
 
T
M
 
L
I
 
V
H
 
E
K
 
Q
V
 
V
A