SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_091521197.1 NCBI__GCF_900115115.1:WP_091521197.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P07821 Iron(3+)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; Ferric hydroxamate uptake protein C; Ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC; Iron(III)-hydroxamate import ATP-binding protein FhuC; EC 7.2.2.16 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
28% identity, 97% coverage: 4:253/257 of query aligns to 14:261/265 of P07821

query
sites
P07821
I
 
L
H
 
R
D
 
N
L
 
I
S
 
S
F
 
F
Q
 
R
I
 
V
K
 
P
D
 
G
R
 
R
F
 
T
L
 
L
L
 
L
K
 
H
D
 
P
I
 
L
N
 
S
L
 
L
E
 
T
I
 
F
N
 
P
K
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
V
I
 
T
A
 
G
I
 
L
V
 
I
G
 
G
P
 
H
N
 
N
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
F
 
L
L
 
L
S
 
K
C
 
M
V
 
L
A
 
G
N
 
R
E
 
H
I
 
Q
P
 
P
Y
 
P
Q
 
S
T
 
E
K
 
G
H
 
E
F
 
I
S
 
L
F
 
L
K
 
D
D
 
A
K
 
Q
D
 
P
V
 
L
K
 
E
S
 
S
Y
 
W
K
 
S
R
 
S
S
 
K
E
 
A
I
 
F
P
 
A
L
 
R
H
 
K
R
 
V
A
 
A
K
 
Y
F
 
L
S
 
P
Q
 
Q
H
 
Q
Q
 
L
S
 
P
N
 
P
E
 
A
I
 
E
N
 
G
L
 
M
K
 
T
N
 
V
E
 
R
E
 
E
I
 
L
V
 
V
L
 
A
M
 
I
G
 
G
R
 
R
Y
 
Y
P
 
P
Y
 
W
F
 
H
K
 
G
T
 
A
E
 
L
A
 
G
-
 
R
-
 
F
D
 
G
L
 
A
S
 
A
D
 
D
L
 
R
E
 
E
I
 
K
V
 
V
E
 
E
K
 
E
W
 
A
M
 
I
A
 
S
K
 
L
T
 
V
E
 
G
T
 
L
S
 
K
H
 
P
L
 
L
T
 
A
D
 
H
R
 
R
E
 
L
Y
 
V
E
 
D
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
A
H
 
W
L
 
I
A
 
A
R
 
M
V
 
L
F
 
V
A
 
A
Q
 
Q
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
-
E
 
D
N
 
S
K
 
R
L
 
C
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
|
D
E
|
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
I
A
 
A
H
 
H
Q
 
Q
F
 
V
K
 
D
T
 
V
L
 
L
H
 
S
L
 
L
I
 
V
K
 
H
E
 
R
F
 
L
T
 
S
N
 
Q
Q
 
E
N
 
R
N
 
G
-
 
L
S
 
T
A
 
V
L
 
I
V
 
A
V
 
V
L
 
L
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
I
 
M
A
 
A
S
 
A
Q
 
R
F
 
Y
A
 
C
D
 
D
R
 
Y
L
 
L
I
 
V
L
 
A
M
 
L
N
 
R
K
 
G
S
 
G
S
 
E
I
 
M
E
 
I
M
 
A
F
 
Q
D
 
G
E
 
T
P
 
P
K
 
A
K
 
E
V
 
I
L
 
M
T
 
R
Q
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
L
S
 
E
R
 
M
V
 
I
Y
 
Y
Q
 
G
Y
 
I
P
 
P
C
 
M
I
 
G
I
 
I
T
 
L
P
 
P
H
 
H
P
 
P
E
 
A
N
 
G
Q
 
A
Q
 
A
P
 
P
I
 
V

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
28% identity, 92% coverage: 1:237/257 of query aligns to 3:242/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
M
 
M
I
 
I
K
 
D
I
 
V
H
 
H
D
 
Q
L
 
L
S
 
K
F
 
K
Q
 
S
I
x
F
K
 
G
D
 
S
R
 
L
F
 
E
L
x
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
N
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
S
 
R
C
 
C
V
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
D
A
 
E
N
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
I
Y
 
I
Q
 
D
T
 
G
K
 
I
H
 
N
F
 
L
S
 
K
F
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
T
D
 
N
V
 
L
K
 
N
S
 
K
Y
 
V
K
 
-
R
 
R
S
 
E
E
 
E
I
 
V
P
 
G
L
 
M
H
 
V
R
 
F
A
 
Q
K
 
R
F
 
F
S
 
N
Q
 
L
H
 
F
Q
 
P
S
 
H
N
 
M
E
 
T
I
 
V
N
 
-
L
 
L
K
 
N
N
 
N
E
 
I
E
 
T
I
 
L
V
 
A
L
 
P
M
 
M
G
 
K
R
 
V
Y
 
R
P
 
K
Y
 
W
F
 
P
K
 
R
T
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
E
L
 
A
S
 
K
D
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
L
V
 
L
E
 
D
K
 
K
W
 
V
M
 
G
A
 
L
K
 
K
T
 
D
E
 
K
T
 
A
S
 
H
H
 
A
L
 
Y
T
 
P
D
 
D
R
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
M
E
 
E
N
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
E
H
 
M
Q
 
V
F
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
H
 
S
L
 
V
I
 
M
K
 
K
E
 
Q
F
 
L
T
 
A
N
 
N
Q
 
E
N
 
G
N
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
I
 
F
A
 
A
S
 
R
Q
 
E
F
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
F
M
 
M
N
 
D
K
 
G
S
 
G
S
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
E
E
 
D
M
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
R
P
 
P
K
 
Q
K
 
H
V
 
E
L
 
R
T
 
T
Q
 
K
E
 
A
R
 
F
I
 
L
S
 
S
R
 
K
V
 
V
Y
 
F

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
28% identity, 92% coverage: 1:237/257 of query aligns to 3:242/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
M
 
M
I
 
I
K
 
D
I
 
V
H
 
H
D
 
Q
L
 
L
S
 
K
F
 
K
Q
 
S
I
x
F
K
 
G
D
 
S
R
 
L
F
 
E
L
x
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
N
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
S
 
R
C
 
C
V
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
D
A
 
E
N
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
I
Y
 
I
Q
 
D
T
 
G
K
 
I
H
 
N
F
 
L
S
 
K
F
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
T
D
 
N
V
 
L
K
 
N
S
 
K
Y
 
V
K
 
-
R
 
R
S
 
E
E
 
E
I
 
V
P
 
G
L
 
M
H
 
V
R
 
F
A
 
Q
K
 
R
F
 
F
S
 
N
Q
 
L
H
 
F
Q
 
P
S
 
H
N
 
M
E
 
T
I
 
V
N
 
-
L
 
L
K
 
N
N
 
N
E
 
I
E
 
T
I
 
L
V
 
A
L
 
P
M
 
M
G
 
K
R
 
V
Y
 
R
P
 
K
Y
 
W
F
 
P
K
 
R
T
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
E
L
 
A
S
 
K
D
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
L
V
 
L
E
 
D
K
 
K
W
 
V
M
 
G
A
 
L
K
 
K
T
 
D
E
 
K
T
 
A
S
 
H
H
 
A
L
 
Y
T
 
P
D
 
D
R
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
M
E
 
E
N
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
E
H
 
M
Q
 
V
F
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
H
 
S
L
 
V
I
 
M
K
 
K
E
 
Q
F
 
L
T
 
A
N
 
N
Q
 
E
N
 
G
N
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
I
 
F
A
 
A
S
 
R
Q
 
E
F
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
F
M
 
M
N
 
D
K
 
G
S
 
G
S
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
E
E
 
D
M
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
R
P
 
P
K
 
Q
K
 
H
V
 
E
L
 
R
T
 
T
Q
 
K
E
 
A
R
 
F
I
 
L
S
 
S
R
 
K
V
 
V
Y
 
F

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
28% identity, 92% coverage: 1:237/257 of query aligns to 3:242/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
M
 
M
I
 
I
K
 
D
I
 
V
H
 
H
D
 
Q
L
 
L
S
 
K
F
 
K
Q
 
S
I
x
F
K
 
G
D
 
S
R
 
L
F
 
E
L
x
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
N
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
S
 
R
C
 
C
V
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
D
A
 
E
N
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
I
Y
 
I
Q
 
D
T
 
G
K
 
I
H
 
N
F
 
L
S
 
K
F
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
T
D
 
N
V
 
L
K
 
N
S
 
K
Y
 
V
K
 
-
R
 
R
S
 
E
E
 
E
I
 
V
P
 
G
L
 
M
H
 
V
R
 
F
A
 
Q
K
 
R
F
 
F
S
 
N
Q
 
L
H
 
F
Q
 
P
S
 
H
N
 
M
E
 
T
I
 
V
N
 
-
L
 
L
K
 
N
N
 
N
E
 
I
E
 
T
I
 
L
V
 
A
L
 
P
M
 
M
G
 
K
R
 
V
Y
 
R
P
 
K
Y
 
W
F
 
P
K
 
R
T
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
E
L
 
A
S
 
K
D
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
L
V
 
L
E
 
D
K
 
K
W
 
V
M
 
G
A
 
L
K
 
K
T
 
D
E
 
K
T
 
A
S
 
H
H
 
A
L
 
Y
T
 
P
D
 
D
R
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
M
E
 
E
N
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
E
H
 
M
Q
 
V
F
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
H
 
S
L
 
V
I
 
M
K
 
K
E
 
Q
F
 
L
T
 
A
N
 
N
Q
 
E
N
 
G
N
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
I
 
F
A
 
A
S
 
R
Q
 
E
F
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
F
M
 
M
N
 
D
K
 
G
S
 
G
S
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
E
E
 
D
M
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
R
P
 
P
K
 
Q
K
 
H
V
 
E
L
 
R
T
 
T
Q
 
K
E
 
A
R
 
F
I
 
L
S
 
S
R
 
K
V
 
V
Y
 
F

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
28% identity, 92% coverage: 1:237/257 of query aligns to 3:242/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
M
 
M
I
 
I
K
 
D
I
 
V
H
 
H
D
 
Q
L
 
L
S
 
K
F
 
K
Q
 
S
I
x
F
K
 
G
D
 
S
R
 
L
F
 
E
L
x
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
I
 
I
N
 
N
L
 
V
E
 
H
I
 
I
N
 
R
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
V
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
F
L
 
L
S
 
R
C
 
C
V
 
L
-
 
N
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
D
-
 
F
-
 
D
A
 
E
N
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
I
Y
 
I
Q
 
D
T
 
G
K
 
I
H
 
N
F
 
L
S
 
K
F
 
A
K
 
K
D
 
D
K
 
T
D
 
N
V
 
L
K
 
N
S
 
K
Y
 
V
K
 
-
R
 
R
S
 
E
E
 
E
I
 
V
P
 
G
L
 
M
H
 
V
R
 
F
A
 
Q
K
 
R
F
 
F
S
 
N
Q
 
L
H
 
F
Q
 
P
S
 
H
N
 
M
E
 
T
I
 
V
N
 
-
L
 
L
K
 
N
N
 
N
E
 
I
E
 
T
I
 
L
V
 
A
L
 
P
M
 
M
G
 
K
R
 
V
Y
 
R
P
 
K
Y
 
W
F
 
P
K
 
R
T
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
E
L
 
A
S
 
K
D
 
A
L
 
M
E
 
E
I
 
L
V
 
L
E
 
D
K
 
K
W
 
V
M
 
G
A
 
L
K
 
K
T
 
D
E
 
K
T
 
A
S
 
H
H
 
A
L
 
Y
T
 
P
D
 
D
R
 
-
E
 
-
Y
 
-
E
 
-
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
M
E
 
E
N
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
E
H
 
M
Q
 
V
F
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
H
 
S
L
 
V
I
 
M
K
 
K
E
 
Q
F
 
L
T
 
A
N
 
N
Q
 
E
N
 
G
N
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
I
 
F
A
 
A
S
 
R
Q
 
E
F
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
L
L
 
F
M
 
M
N
 
D
K
 
G
S
 
G
S
 
Y
I
 
I
-
 
I
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
K
-
 
P
-
 
E
E
 
D
M
 
L
F
 
F
D
 
D
E
 
R
P
 
P
K
 
Q
K
 
H
V
 
E
L
 
R
T
 
T
Q
 
K
E
 
A
R
 
F
I
 
L
S
 
S
R
 
K
V
 
V
Y
 
F

1l7vC Bacterial abc transporter involved in b12 uptake (see paper)
30% identity, 86% coverage: 17:237/257 of query aligns to 15:229/231 of 1l7vC

query
sites
1l7vC
L
 
L
K
 
G
D
 
P
I
 
L
N
 
S
L
 
G
E
 
E
I
 
V
N
 
R
K
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
L
A
 
H
I
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
L
S
 
A
C
 
R
V
 
M
A
 
A
N
 
G
E
 
-
I
 
M
P
 
T
Y
 
S
Q
 
G
T
 
K
K
 
G
H
 
S
F
 
I
S
 
Q
F
 
F
K
 
A
D
 
G
K
 
Q
D
 
P
V
 
L
K
 
E
S
 
A
Y
 
W
K
 
S
R
 
A
S
 
T
E
 
K
I
 
L
P
 
A
L
 
L
H
 
H
R
 
R
A
 
A
K
 
Y
F
 
L
S
 
S
Q
 
Q
H
 
Q
Q
 
Q
S
 
T
N
 
P
E
 
P
I
 
F
N
 
A
L
 
T
K
 
P
N
 
V
E
 
W
E
 
H
I
 
Y
V
 
L
L
 
T
M
 
L
G
 
H
R
 
Q
Y
 
H
P
 
D
Y
 
K
F
 
T
K
 
R
T
 
T
E
 
E
A
 
L
D
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
L
E
 
N
I
 
D
V
 
V
E
 
A
K
 
G
W
 
A
M
 
L
A
 
A
K
 
L
T
 
D
E
 
D
T
 
K
S
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
L
D
 
G
R
 
R
E
 
S
Y
 
T
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
W
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
A
V
 
V
F
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
-
 
T
-
 
P
E
 
Q
N
 
A
N
 
N
V
 
P
E
 
A
N
 
G
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
M
N
 
N
N
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
F
 
S
K
 
A
T
 
L
L
 
D
H
 
K
L
 
I
I
 
L
K
 
S
E
 
A
F
 
L
T
 
C
N
 
Q
Q
 
Q
N
 
G
N
 
L
S
 
A
A
 
I
L
 
V
V
 
M
V
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
N
I
 
H
A
 
T
S
 
L
Q
 
R
F
 
H
A
 
A
D
 
H
R
 
R
L
 
A
I
 
W
L
 
L
M
 
L
N
 
K
K
 
G
S
 
G
S
 
K
I
 
M
E
 
L
M
 
A
F
 
S
D
 
G
E
 
R
P
 
R
K
 
E
K
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
P
E
 
P
R
 
N
I
 
L
S
 
A
R
 
Q
V
 
A
Y
 
Y

4fi3C Structure of vitamin b12 transporter btucd-f in a nucleotide-bound state (see paper)
30% identity, 86% coverage: 17:237/257 of query aligns to 15:229/248 of 4fi3C

query
sites
4fi3C
L
 
L
K
 
G
D
 
P
I
 
L
N
 
S
L
 
G
E
 
E
I
 
V
N
 
R
K
 
A
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
L
A
 
H
I
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
L
S
 
A
C
 
R
V
 
M
A
 
A
N
 
G
E
 
-
I
 
M
P
 
T
Y
 
S
Q
 
G
T
 
K
K
 
G
H
 
S
F
 
I
S
 
Q
F
 
F
K
 
A
D
 
G
K
 
Q
D
 
P
V
 
L
K
 
E
S
 
A
Y
 
W
K
 
S
R
 
A
S
 
T
E
 
K
I
 
L
P
 
A
L
 
L
H
 
H
R
 
R
A
 
A
K
 
Y
F
 
L
S
 
S
Q
|
Q
H
 
Q
Q
 
Q
S
 
T
N
 
P
E
 
P
I
 
F
N
 
A
L
 
T
K
 
P
N
 
V
E
 
W
E
 
H
I
 
Y
V
 
L
L
 
T
M
 
L
G
 
H
R
 
Q
Y
 
H
P
 
D
Y
 
K
F
 
T
K
 
R
T
 
T
E
 
E
A
 
L
D
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
L
E
 
N
I
 
D
V
 
V
E
 
A
K
 
G
W
 
A
M
 
L
A
 
A
K
 
L
T
 
D
E
 
D
T
 
K
S
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
L
D
 
G
R
|
R
E
 
S
Y
 
T
E
 
N
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
|
E
K
 
W
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
R
L
 
L
A
 
A
R
 
A
V
 
V
F
 
V
A
 
L
Q
 
Q
L
 
I
-
 
T
-
 
P
E
 
Q
N
 
A
N
 
N
V
 
P
E
 
A
N
 
G
K
 
Q
L
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
x
Q
P
 
P
L
 
M
N
 
C
N
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
A
H
 
Q
Q
 
Q
F
 
S
K
 
A
T
 
L
L
 
D
H
 
K
L
 
I
I
 
L
K
 
S
E
 
A
F
 
L
T
 
S
N
 
Q
Q
 
Q
N
 
G
N
 
L
S
 
A
A
 
I
L
 
V
V
 
M
V
 
S
L
 
S
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
N
I
 
H
A
 
T
S
 
L
Q
 
R
F
 
H
A
 
A
D
 
H
R
 
R
L
 
A
I
 
W
L
 
L
M
 
L
N
 
K
K
 
G
S
 
G
S
 
K
I
 
M
E
 
L
M
 
A
F
 
S
D
 
G
E
 
R
P
 
R
K
 
E
K
 
E
V
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
P
E
 
P
R
 
N
I
 
L
S
 
A
R
 
Q
V
 
A
Y
 
Y

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
27% identity, 93% coverage: 1:239/257 of query aligns to 1:235/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
M
 
M
I
 
I
K
 
F
I
 
V
H
 
N
D
 
D
L
 
V
S
 
Y
F
 
K
Q
 
N
I
x
F
K
 
G
D
 
S
R
 
L
F
 
E
L
x
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
I
 
V
N
 
T
L
 
L
E
 
K
I
 
V
N
 
N
K
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
V
A
 
V
I
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
L
S
 
R
C
 
C
V
 
I
A
 
-
N
 
N
E
 
L
I
 
L
P
 
E
Y
 
E
Q
 
P
T
 
T
K
 
K
H
 
G
F
 
E
S
 
V
F
 
F
K
 
I
D
 
D
K
 
G
D
 
V
V
 
K
K
 
I
S
 
N
Y
 
N
K
 
G
R
 
K
S
 
V
E
 
N
I
 
I
P
 
N
L
 
K
H
 
V
R
 
R
A
 
Q
K
 
K
F
 
V
S
 
G
-
 
M
-
 
V
-
 
F
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
-
S
 
-
N
 
-
E
 
-
I
 
F
N
 
N
L
 
L
K
 
-
N
 
-
E
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
F
P
 
P
Y
 
H
F
 
L
K
 
T
T
 
A
E
 
I
A
 
E
D
 
N
L
 
I
S
 
T
D
 
L
L
 
A
E
 
P
I
 
V
V
 
K
E
 
V
K
 
K
W
 
K
M
 
M
A
 
N
K
 
K
T
 
K
E
 
E
T
 
A
S
 
E
H
 
E
L
 
L
T
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
K
D
 
D
R
 
Q
E
 
Y
Y
 
P
E
 
I
Q
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
M
E
 
Q
N
 
P
K
 
E
L
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
E
H
 
M
Q
 
V
F
 
K
K
 
E
T
 
V
L
 
L
H
 
N
L
 
V
I
 
M
K
 
K
E
 
Q
F
 
L
T
 
A
N
 
N
Q
 
E
N
 
G
N
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
T
H
|
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
I
 
F
A
 
A
S
 
R
Q
 
E
F
 
V
A
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
I
L
 
F
M
 
M
N
 
D
K
 
D
S
 
G
S
 
V
I
 
I
E
 
V
M
 
E
F
 
E
D
 
G
E
 
T
P
 
P
K
 
E
K
 
E
V
 
I
L
 
F
T
 
Y
Q
 
R
E
 
A
R
 
K
I
 
N
S
 
E
R
 
R
V
 
T
Y
 
R
Q
 
E
Y
 
F

4u00A Crystal structure of ttha1159 in complex with adp (see paper)
28% identity, 92% coverage: 1:236/257 of query aligns to 2:239/241 of 4u00A

query
sites
4u00A
M
 
I
I
 
I
K
 
R
I
 
I
H
 
R
D
 
N
L
 
L
S
 
H
F
 
K
Q
 
W
I
x
F
K
 
G
D
 
P
R
 
L
F
 
H
L
x
V
L
 
L
K
 
K
D
 
G
I
 
I
N
 
H
L
 
L
E
 
E
I
 
V
N
 
A
K
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
K
I
 
L
A
 
V
I
 
I
V
 
I
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
L
L
 
I
S
 
R
C
 
T
V
 
I
A
 
N
N
 
R
E
 
L
I
 
E
P
 
D
Y
 
F
Q
 
Q
-
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
V
-
 
V
T
 
V
K
 
D
H
 
G
F
 
L
S
 
S
F
 
V
K
 
K
D
 
D
K
 
D
D
 
R
V
 
A
K
 
L
S
 
R
Y
 
E
K
 
I
R
 
R
S
 
R
E
 
E
I
 
V
P
 
G
L
 
M
H
 
V
R
 
F
A
 
Q
K
 
Q
F
 
F
S
 
N
Q
 
L
H
 
F
Q
 
P
S
 
H
N
 
M
E
 
T
I
 
V
N
 
-
L
 
L
K
 
E
N
 
N
E
 
V
E
 
T
I
 
L
V
 
A
L
 
P
M
 
M
G
 
R
R
 
V
Y
 
R
P
 
R
Y
 
W
F
 
P
K
 
R
T
 
E
E
 
K
A
 
A
D
 
E
L
 
K
S
 
K
D
 
A
L
 
L
E
 
E
I
 
L
V
 
L
E
 
E
K
 
R
W
 
V
M
 
G
A
 
I
K
 
L
T
 
D
E
 
Q
T
 
A
S
 
-
H
 
-
L
 
-
T
 
-
D
 
-
R
 
R
E
 
K
Y
 
Y
-
 
P
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
M
E
 
E
N
 
P
K
 
K
L
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
S
N
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
P
A
 
E
H
 
M
Q
 
V
F
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
H
 
D
L
 
V
I
 
M
K
 
R
E
 
D
F
 
L
T
 
A
N
 
Q
Q
 
G
N
 
G
N
 
M
S
 
T
A
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
E
L
 
M
N
 
G
I
 
F
A
 
A
S
 
R
Q
 
E
F
 
V
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
V
I
 
V
L
 
F
M
 
M
N
 
D
K
 
G
S
 
G
S
 
Q
I
 
I
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
P
-
 
E
E
 
E
M
 
I
F
 
F
D
 
T
E
 
R
P
 
P
K
 
K
K
 
E
V
 
E
L
 
R
T
 
T
Q
 
R
E
 
S
R
 
F
I
 
L
S
 
Q
R
 
R
V
 
V

7z18I E. Coli c-p lyase bound to a phnk abc dimer and atp (see paper)
27% identity, 86% coverage: 18:238/257 of query aligns to 20:249/250 of 7z18I

query
sites
7z18I
K
 
S
D
 
D
I
 
V
N
 
S
L
 
F
E
 
D
I
 
L
N
 
W
K
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
L
A
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
E
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
F
 
L
L
 
L
S
 
K
C
 
S
V
 
I
A
 
S
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
Q
N
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
T
 
N
K
 
R
H
 
S
-
 
L
F
 
Y
S
 
A
F
 
M
K
 
S
D
 
E
K
 
A
D
 
D
V
 
R
K
 
R
S
 
R
Y
 
L
K
 
L
R
 
R
S
 
T
E
 
E
I
 
W
P
 
G
L
 
V
-
 
V
-
 
H
-
x
Q
H
 
H
R
 
P
A
 
L
K
 
D
F
 
G
S
 
L
Q
 
R
H
 
R
Q
 
Q
S
 
V
N
 
S
E
 
A
I
 
G
N
 
G
L
 
N
K
 
I
N
 
G
E
 
E
E
 
R
I
 
L
V
 
M
L
 
A
M
 
T
G
 
G
R
 
A
Y
 
R
P
 
H
Y
 
Y
F
 
G
K
 
D
T
 
I
E
 
R
A
 
A
D
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
T
V
 
A
E
 
Q
K
 
K
W
 
W
M
 
L
A
 
E
K
 
E
T
 
V
E
 
E
T
 
I
-
 
P
S
 
A
H
 
N
L
x
R
T
 
I
D
 
D
R
 
D
E
 
L
Y
 
P
E
 
T
Q
x
T
L
 
F
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
N
F
 
L
A
 
V
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
T
E
 
H
N
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
F
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
G
N
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
S
H
 
V
Q
 
Q
F
 
A
K
 
R
T
 
L
L
 
L
H
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
R
E
 
G
F
 
L
T
 
V
N
 
V
Q
 
E
N
 
L
N
 
N
S
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
V
-
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
L
N
 
G
I
 
V
A
 
A
S
 
R
Q
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
I
 
L
L
 
V
M
 
M
N
 
K
K
 
Q
S
 
G
S
 
Q
I
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
D
E
 
R
M
 
V
F
 
L
D
 
D
E
 
D
P
 
P
K
 
H
K
 
H
V
 
P
L
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
L
R
 
L
I
 
V
S
 
S
R
 
S
V
 
V
Y
 
L
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

7z15I E. Coli c-p lyase bound to a phnk/phnl dual abc dimer and adp + pi (see paper)
27% identity, 86% coverage: 18:238/257 of query aligns to 20:249/253 of 7z15I

query
sites
7z15I
K
 
S
D
 
D
I
 
V
N
 
S
L
 
F
E
 
D
I
 
L
N
 
W
K
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
L
A
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
E
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
F
 
L
L
 
L
S
 
K
C
 
S
V
 
I
A
 
S
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
Q
N
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
T
 
N
K
 
R
H
 
S
-
 
L
F
 
Y
S
 
A
F
 
M
K
 
S
D
 
E
K
 
A
D
 
D
V
 
R
K
 
R
S
 
R
Y
 
L
K
 
L
R
 
R
S
 
T
E
 
E
I
 
W
P
 
G
L
 
V
-
 
V
-
 
H
-
x
Q
H
 
H
R
 
P
A
 
L
K
 
D
F
 
G
S
 
L
Q
 
R
H
 
R
Q
 
Q
S
 
V
N
 
S
E
 
A
I
 
G
N
 
G
L
 
N
K
 
I
N
 
G
E
 
E
E
 
R
I
 
L
V
 
M
L
 
A
M
 
T
G
 
G
R
 
A
Y
 
R
P
 
H
Y
 
Y
F
 
G
K
 
D
T
 
I
E
 
R
A
 
A
D
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
T
V
 
A
E
 
Q
K
 
K
W
 
W
M
 
L
A
 
E
K
 
E
T
 
V
E
 
E
T
 
I
-
 
P
S
 
A
H
 
N
L
x
R
T
 
I
D
 
D
R
 
D
E
 
L
Y
 
P
E
 
T
Q
x
T
L
 
F
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
N
F
 
L
A
 
V
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
T
E
 
H
N
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
F
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
G
N
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
S
H
 
V
Q
 
Q
F
 
A
K
 
R
T
 
L
L
 
L
H
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
R
E
 
G
F
 
L
T
 
V
N
 
V
Q
 
E
N
 
L
N
 
N
S
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
V
-
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
L
N
 
G
I
 
V
A
 
A
S
 
R
Q
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
I
 
L
L
 
V
M
 
M
N
 
K
K
 
Q
S
 
G
S
 
Q
I
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
D
E
 
R
M
 
V
F
 
L
D
 
D
E
 
D
P
 
P
K
 
H
K
 
H
V
 
P
L
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
L
R
 
L
I
 
V
S
 
S
R
 
S
V
 
V
Y
 
L
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

7z16I E. Coli c-p lyase bound to phnk/phnl dual abc dimer with amppnp and phnk e171q mutation (see paper)
27% identity, 86% coverage: 18:238/257 of query aligns to 20:249/250 of 7z16I

query
sites
7z16I
K
 
S
D
 
D
I
 
V
N
 
S
L
 
F
E
 
D
I
 
L
N
 
W
K
 
P
G
 
G
E
 
E
L
 
V
I
 
L
A
 
G
I
 
I
V
 
V
G
 
G
P
 
E
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
F
 
L
L
 
L
S
 
K
C
 
S
V
 
I
A
 
S
-
 
A
-
 
R
-
 
L
-
 
T
-
 
P
-
 
Q
-
 
Q
N
 
G
E
 
E
I
 
I
P
 
H
Y
 
Y
Q
 
E
T
 
N
K
 
R
H
 
S
-
 
L
F
 
Y
S
 
A
F
 
M
K
 
S
D
 
E
K
 
A
D
 
D
V
 
R
K
 
R
S
 
R
Y
 
L
K
 
L
R
 
R
S
 
T
E
 
E
I
 
W
P
 
G
L
 
V
-
 
V
-
 
H
-
 
Q
H
 
H
R
 
P
A
 
L
K
 
D
F
 
G
S
 
L
Q
 
R
H
 
R
Q
 
Q
S
 
V
N
 
S
E
 
A
I
 
G
N
 
G
L
 
N
K
 
I
N
 
G
E
 
E
E
 
R
I
 
L
V
 
M
L
 
A
M
 
T
G
 
G
R
 
A
Y
 
R
P
 
H
Y
 
Y
F
 
G
K
 
D
T
 
I
E
 
R
A
 
A
D
 
-
L
 
-
S
 
-
D
 
-
L
 
-
E
 
-
I
 
T
V
 
A
E
 
Q
K
 
K
W
 
W
M
 
L
A
 
E
K
 
E
T
 
V
E
 
E
T
 
I
-
 
P
S
 
A
H
 
N
L
x
R
T
 
I
D
 
D
R
 
D
E
 
L
Y
 
P
E
 
T
Q
x
T
L
 
F
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
M
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
H
 
Q
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
N
F
 
L
A
 
V
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
T
E
 
H
N
 
P
K
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
F
L
 
M
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
T
N
 
G
N
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
A
 
S
H
 
V
Q
 
Q
F
 
A
K
 
R
T
 
L
L
 
L
H
 
D
L
 
L
I
 
L
K
 
R
E
 
G
F
 
L
T
 
V
N
 
V
Q
 
E
N
 
L
N
 
N
S
 
L
A
 
A
L
 
V
V
 
V
V
 
I
L
 
V
-
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
L
N
 
G
I
 
V
A
 
A
S
 
R
Q
 
L
F
 
L
A
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
L
I
 
L
L
 
V
M
 
M
N
 
K
K
 
Q
S
 
G
S
 
Q
I
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
S
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
D
E
 
R
M
 
V
F
 
L
D
 
D
E
 
D
P
 
P
K
 
H
K
 
H
V
 
P
L
 
Y
T
 
T
Q
 
Q
E
 
L
R
 
L
I
 
V
S
 
S
R
 
S
V
 
V
Y
 
L
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

1f3oA Crystal structure of mj0796 atp-binding cassette (see paper)
30% identity, 80% coverage: 15:219/257 of query aligns to 19:224/232 of 1f3oA

query
sites
1f3oA
F
 
Y
L
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
I
N
 
K
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
F
I
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
M
G
 
G
P
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
M
L
 
L
S
 
N
C
 
I
V
 
I
A
 
G
N
 
C
-
 
L
E
 
D
I
 
K
P
 
P
Y
 
T
Q
 
E
T
 
G
K
 
E
H
 
V
F
 
Y
-
 
I
-
 
D
S
 
N
F
 
I
K
 
K
D
 
T
K
 
N
D
 
D
V
 
L
K
 
D
S
 
D
Y
 
D
K
 
E
R
 
L
S
 
T
E
 
K
I
 
I
P
 
R
L
 
R
H
 
D
R
 
K
A
 
I
K
 
G
F
 
F
S
 
V
Q
 
F
H
 
Q
Q
 
Q
S
 
F
N
 
N
E
 
L
I
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
T
N
 
A
L
 
L
K
 
E
N
 
N
E
 
V
E
 
E
I
 
L
V
 
P
L
 
L
M
 
I
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
F
 
F
K
 
K
T
 
Y
E
 
R
A
 
G
D
 
A
L
 
M
S
 
S
D
 
G
L
 
E
E
 
E
I
 
R
V
 
R
E
 
K
K
 
R
W
 
A
M
 
L
A
 
E
K
 
C
T
 
L
E
 
K
T
 
M
S
 
A
H
 
E
L
 
L
T
 
E
D
 
E
R
 
R
-
 
F
-
 
A
-
 
N
-
 
H
E
 
K
Y
 
P
E
 
N
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
N
N
 
N
V
 
-
E
 
-
N
 
P
K
 
P
L
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
T
N
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
S
A
 
K
H
 
T
Q
 
G
F
 
E
K
 
K
T
 
I
L
 
M
H
 
Q
L
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
K
F
 
L
T
 
N
N
 
E
Q
 
E
N
 
D
N
 
G
S
 
K
A
 
T
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
-
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
A
S
 
-
Q
 
R
F
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
Y
M
 
L
N
 
K
K
 
D
S
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1l2tA Dimeric structure of mj0796, a bacterial abc transporter cassette (see paper)
29% identity, 80% coverage: 15:219/257 of query aligns to 19:224/230 of 1l2tA

query
sites
1l2tA
F
 
Y
L
 
A
L
 
L
K
 
K
D
 
N
I
 
V
N
 
N
L
 
L
E
 
N
I
 
I
N
 
K
K
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
F
I
 
V
A
 
S
I
 
I
V
 
M
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
F
 
M
L
 
L
S
 
N
C
 
I
V
 
I
A
 
G
N
 
C
-
 
L
E
 
D
I
 
K
P
 
P
Y
 
T
Q
 
E
T
 
G
K
 
E
H
 
V
F
 
Y
-
 
I
-
 
D
S
 
N
F
 
I
K
 
K
D
 
T
K
 
N
D
 
D
V
 
L
K
 
D
S
 
D
Y
 
D
K
 
E
R
 
L
S
 
T
E
 
K
I
 
I
P
 
R
L
 
R
H
 
D
R
 
K
A
 
I
K
 
G
F
 
F
S
 
V
Q
 
F
H
 
Q
Q
 
Q
S
 
F
N
 
N
E
 
L
I
 
I
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
T
N
 
A
L
 
L
K
 
E
N
 
N
E
 
V
E
 
E
I
 
L
V
 
P
L
 
L
M
 
I
G
 
-
R
 
-
Y
 
-
P
 
-
Y
 
-
F
 
F
K
 
K
T
 
Y
E
 
R
A
 
G
D
 
A
L
 
M
S
 
S
D
 
G
L
 
E
E
 
E
I
 
R
V
 
R
E
 
K
K
 
R
W
 
A
M
 
L
A
 
E
K
 
C
T
 
L
E
 
K
T
 
M
S
 
A
H
 
E
L
 
L
T
 
E
D
 
E
R
 
R
-
x
F
-
 
A
-
 
N
-
 
H
E
 
K
Y
 
P
E
 
N
Q
|
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
x
Q
K
 
Q
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
N
N
 
N
V
 
-
E
 
-
N
 
P
K
 
P
L
 
I
L
 
I
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
L
 
T
N
 
G
N
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
S
A
 
K
H
 
T
Q
 
G
F
 
E
K
 
K
T
 
I
L
 
M
H
 
Q
L
 
L
I
 
L
K
 
K
E
 
K
F
 
L
T
 
N
N
 
E
Q
 
E
N
 
D
N
 
G
S
 
K
A
 
T
L
 
V
V
 
V
V
 
V
L
 
V
-
 
T
H
|
H
D
 
D
L
 
I
N
 
N
I
 
V
A
 
A
S
 
-
Q
 
R
F
 
F
A
 
G
D
 
E
R
 
R
L
 
I
I
 
I
L
 
Y
M
 
L
N
 
K
K
 
D
S
 
G
S
 
E
I
 
V
E
 
E

Sites not aligning to the query:

1vciA Crystal structure of the atp-binding cassette of multisugar transporter from pyrococcus horikoshii ot3 complexed with atp (see paper)
28% identity, 88% coverage: 2:227/257 of query aligns to 7:216/353 of 1vciA

query
sites
1vciA
I
 
V
K
 
K
I
 
L
H
 
E
D
 
N
L
 
L
S
 
T
F
 
K
Q
 
R
I
x
F
K
 
G
D
 
N
R
x
F
F
 
T
L
 
A
L
 
V
K
 
N
D
 
K
I
 
L
N
 
N
L
 
L
E
 
T
I
 
I
N
 
K
K
 
D
G
 
G
E
 
E
L
 
F
I
 
L
A
 
V
I
 
L
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
C
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
F
 
T
L
 
L
S
 
R
C
 
M
V
 
I
A
 
A
N
 
G
-
 
L
E
 
E
I
 
E
P
 
P
Y
 
T
Q
 
E
T
 
G
K
 
R
H
 
I
F
 
Y
S
 
-
F
 
F
K
 
G
D
 
D
K
 
R
D
 
D
V
 
V
K
 
-
S
 
-
Y
 
-
K
 
-
R
 
-
S
 
T
E
 
Y
I
 
L
P
 
P
L
 
P
H
 
K
R
 
D
A
 
R
K
 
N
F
 
I
S
 
S
-
 
M
-
 
V
-
 
F
Q
 
Q
H
 
H
Q
 
M
S
 
T
N
 
V
E
 
Y
I
 
E
N
 
N
L
 
I
K
 
A
N
 
-
E
 
-
E
 
-
I
 
-
V
 
-
L
 
-
M
 
-
G
 
-
R
 
-
Y
 
F
P
 
P
Y
 
L
F
 
K
K
 
K
T
 
F
E
 
P
A
 
K
D
 
D
L
 
E
S
 
I
D
 
D
L
 
K
E
 
R
I
 
V
V
 
-
E
 
-
K
 
R
W
 
W
M
 
A
A
 
A
K
 
E
-
 
L
T
 
L
E
 
Q
T
 
I
S
 
E
H
 
E
L
 
L
T
 
L
D
 
N
R
 
R
E
 
Y
Y
 
P
E
 
A
Q
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
K
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
H
 
A
L
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
I
A
 
V
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
V
E
 
E
N
 
P
K
 
D
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
M
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
L
N
 
S
N
 
N
L
 
L
D
 
D
V
 
A
A
 
K
H
 
L
Q
 
R
F
 
V
K
 
A
T
 
M
L
 
R
H
 
A
L
 
E
I
 
I
K
 
K
E
 
K
F
 
L
T
 
Q
N
 
Q
Q
 
K
-
 
L
N
 
K
N
 
V
S
 
T
A
 
T
L
 
I
V
 
Y
V
 
V
L
 
T
H
 
H
D
 
D
L
 
Q
N
 
V
I
 
E
A
 
A
S
 
M
Q
 
T
F
 
M
A
 
G
D
 
D
R
 
R
L
 
I
I
 
A
L
 
V
M
 
M
N
 
N
K
 
R
S
 
G
S
 
Q
I
 
L
E
 
L
M
 
Q
F
 
I
D
 
G
E
 
S
P
 
P
K
 
T
K
 
E
V
 
V

6b8bA E. Coli lptb in complex with adp and a novobiocin derivative (see paper)
25% identity, 90% coverage: 6:237/257 of query aligns to 7:233/233 of 6b8bA

query
sites
6b8bA
D
 
N
L
 
L
S
 
A
F
 
K
Q
 
A
I
x
Y
K
 
K
D
 
G
R
|
R
F
 
R
L
x
V
L
 
V
K
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
I
 
V
N
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
L
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
F
 
T
L
 
F
S
 
Y
C
 
M
V
 
V
A
 
V
N
 
G
E
 
I
I
 
V
P
 
P
Y
 
R
Q
 
D
T
 
A
K
 
-
H
 
-
F
 
-
S
 
-
F
 
-
K
 
G
D
 
N
K
 
I
D
 
I
V
 
I
K
 
D
S
 
D
Y
 
D
K
 
D
R
 
I
S
 
S
E
 
L
I
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
H
-
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
F
 
R
S
 
G
-
 
I
Q
 
G
H
 
Y
Q
 
L
S
 
P
N
 
Q
E
 
E
I
 
A
N
 
S
L
 
I
K
x
F
N
x
R
E
x
R
E
 
L
I
 
S
V
 
V
L
 
Y
M
 
D
G
 
N
R
 
L
Y
 
M
P
 
A
Y
 
V
F
 
L
K
 
Q
T
 
I
E
 
R
A
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
A
L
 
E
E
 
Q
I
 
R
V
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
E
W
 
L
M
 
M
A
 
E
K
 
E
T
 
F
E
 
H
T
 
I
S
 
E
H
 
H
L
 
L
T
 
R
D
 
D
R
 
S
E
 
M
Y
 
G
E
 
Q
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
R
R
 
R
L
 
V
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
A
E
 
N
N
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
F
N
 
A
N
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
P
A
 
I
H
 
S
Q
 
V
F
 
I
K
 
D
T
 
I
L
 
K
H
 
R
L
 
I
I
 
I
K
 
E
E
 
H
F
 
L
T
 
R
N
 
D
Q
 
S
N
 
G
N
 
L
S
 
G
A
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
I
 
E
A
 
T
S
 
L
Q
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
I
 
Y
L
 
I
M
 
V
N
 
S
K
 
Q
S
 
G
S
 
H
I
 
L
E
 
I
M
 
A
F
 
H
D
 
G
E
 
T
P
 
P
K
 
T
K
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
Q
 
D
E
 
E
R
 
H
I
 
V
S
 
K
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y

6mhzA Vanadate trapped cryo-em structure of e.Coli lptb2fg transporter (see paper)
25% identity, 90% coverage: 6:237/257 of query aligns to 7:233/235 of 6mhzA

query
sites
6mhzA
D
 
N
L
 
L
S
 
A
F
 
K
Q
 
A
I
x
Y
K
 
K
D
 
G
R
 
R
F
 
R
L
 
V
L
 
V
K
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
I
 
V
N
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
L
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
F
 
T
L
 
F
S
 
Y
C
 
M
V
 
V
A
 
V
N
 
G
E
 
I
I
 
V
P
 
P
Y
 
R
Q
 
D
T
 
A
K
 
-
H
 
-
F
 
-
S
 
-
F
 
-
K
 
G
D
 
N
K
 
I
D
 
I
V
 
I
K
 
D
S
 
D
Y
 
D
K
 
D
R
 
I
S
 
S
E
 
L
I
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
H
-
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
F
 
R
S
 
G
-
 
I
Q
 
G
H
 
Y
Q
 
L
S
 
P
N
x
Q
E
 
E
I
 
A
N
 
S
L
 
I
K
 
F
N
 
R
E
 
R
E
 
L
I
 
S
V
 
V
L
 
Y
M
 
D
G
 
N
R
 
L
Y
 
M
P
 
A
Y
 
V
F
 
L
K
 
Q
T
 
I
E
 
R
A
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
A
L
 
E
E
 
Q
I
 
R
V
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
E
W
 
L
M
 
M
A
 
E
K
 
E
T
 
F
E
 
H
T
 
I
S
 
E
H
 
H
L
 
L
T
 
R
D
 
D
R
 
S
E
 
M
Y
 
G
E
 
Q
Q
x
S
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
R
R
 
R
L
 
V
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
A
E
 
N
N
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
|
E
P
 
P
L
 
F
N
 
A
N
x
G
L
 
V
D
 
D
V
 
P
A
 
I
H
 
S
Q
 
V
F
 
I
K
 
D
T
 
I
L
 
K
H
 
R
L
 
I
I
 
I
K
 
E
E
 
H
F
 
L
T
 
R
N
 
D
Q
 
S
N
 
G
N
 
L
S
 
G
A
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
T
L
 
D
H
|
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
I
 
E
A
 
T
S
 
L
Q
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
I
 
Y
L
 
I
M
 
V
N
 
S
K
 
Q
S
 
G
S
 
H
I
 
L
E
 
I
M
 
A
F
 
H
D
 
G
E
 
T
P
 
P
K
 
T
K
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
Q
 
D
E
 
E
R
 
H
I
 
V
S
 
K
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y

6s8nB Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with lipopolysaccharide (see paper)
25% identity, 90% coverage: 6:237/257 of query aligns to 7:233/238 of 6s8nB

query
sites
6s8nB
D
 
N
L
 
L
S
 
A
F
 
K
Q
 
A
I
 
Y
K
 
K
D
 
G
R
 
R
F
 
R
L
 
V
L
 
V
K
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
I
 
V
N
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
L
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
 
N
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
T
F
 
T
L
 
F
S
 
Y
C
 
M
V
 
V
A
 
V
N
 
G
E
 
I
I
 
V
P
 
P
Y
 
R
Q
 
D
T
 
A
K
 
-
H
 
-
F
 
-
S
 
-
F
 
-
K
 
G
D
 
N
K
 
I
D
 
I
V
 
I
K
 
D
S
 
D
Y
 
D
K
 
D
R
 
I
S
 
S
E
 
L
I
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
H
-
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
F
 
R
S
 
G
-
 
I
Q
 
G
H
 
Y
Q
 
L
S
 
P
N
 
Q
E
 
E
I
 
A
N
 
S
L
 
I
K
 
F
N
x
R
E
 
R
E
 
L
I
 
S
V
 
V
L
 
Y
M
 
D
G
 
N
R
 
L
Y
 
M
P
 
A
Y
 
V
F
 
L
K
 
Q
T
 
I
E
 
R
A
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
A
L
 
E
E
 
Q
I
 
R
V
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
E
W
 
L
M
 
M
A
 
E
K
 
E
T
 
F
E
 
H
T
 
I
S
 
E
H
 
H
L
 
L
T
 
R
D
 
D
R
 
S
E
x
M
Y
x
G
E
x
Q
Q
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
K
 
R
Q
 
R
R
 
R
L
 
V
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
A
E
 
N
N
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
P
 
P
L
 
F
N
 
A
N
 
G
L
 
V
D
 
D
V
 
P
A
 
I
H
 
S
Q
 
V
F
 
I
K
 
D
T
 
I
L
 
K
H
 
R
L
 
I
I
 
I
K
 
E
E
 
H
F
 
L
T
 
R
N
 
D
Q
 
S
N
 
G
N
 
L
S
 
G
A
 
V
L
 
L
V
 
I
V
 
T
L
 
D
H
 
H
D
 
N
L
 
V
N
 
R
I
 
E
A
 
T
S
 
L
Q
 
A
F
 
V
A
 
C
D
 
E
R
 
R
L
 
A
I
 
Y
L
 
I
M
 
V
N
 
S
K
 
Q
S
 
G
S
 
H
I
 
L
E
 
I
M
 
A
F
 
H
D
 
G
E
 
T
P
 
P
K
 
T
K
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
Q
Q
 
D
E
 
E
R
 
H
I
 
V
S
 
K
R
 
R
V
 
V
Y
 
Y

6s8gA Cryo-em structure of lptb2fgc in complex with amp-pnp (see paper)
25% identity, 90% coverage: 6:237/257 of query aligns to 7:233/238 of 6s8gA

query
sites
6s8gA
D
 
N
L
 
L
S
 
A
F
 
K
Q
 
A
I
x
Y
K
 
K
D
 
G
R
|
R
F
 
R
L
 
V
L
 
V
K
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
S
L
 
L
E
 
T
I
 
V
N
 
N
K
 
S
G
 
G
E
 
E
L
 
I
I
 
V
A
 
G
I
 
L
V
 
L
G
 
G
P
 
P
N
|
N
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
F
 
T
L
 
F
S
 
Y
C
 
M
V
 
V
A
 
V
N
 
G
E
 
I
I
 
V
P
 
P
Y
 
R
Q
 
D
T
 
A
K
 
-
H
 
-
F
 
-
S
 
-
F
 
-
K
 
G
D
 
N
K
 
I
D
 
I
V
 
I
K
 
D
S
 
D
Y
 
D
K
 
D
R
 
I
S
 
S
E
 
L
I
 
L
P
 
P
L
 
L
H
 
H
-
 
A
R
 
R
A
 
A
K
 
R
F
 
R
S
 
G
-
 
I
Q
 
G
H
 
Y
Q
 
L
S
 
P
N
x
Q
E
 
E
I
 
A
N
 
S
L
 
I
K
 
F
N
 
R
E
 
R
E
 
L
I
 
S
V
 
V
L
 
Y
M
 
D
G
 
N
R
 
L
Y
 
M
P
 
A
Y
 
V
F
 
L
K
 
Q
T
 
I
E
 
R
A
 
D
D
 
D
L
 
L
S
 
S
D
 
A
L
 
E
E
 
Q
I
 
R
V
 
E
E
 
D
K
 
R
-
 
A
-
 
N
-
 
E
W
 
L
M
 
M
A
 
E
K
 
E
T
 
F
E
 
H
T
 
I
S
 
E
H
 
H
L
 
L
T
 
R
D
 
D
R
 
S
E
 
M
Y
 
G
E
 
Q
Q
x
S
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
|
E
K
 
R
Q
 
R
R
 
R
L
 
V
H
 
E
L
 
I
A
 
A
R
 
R
V
 
A
F
 
L
A
 
A
Q
 
-
L
 
-
E
 
-
N
 
-
N
 
-
V
 
A
E
 
N
N
 
P
K
 
K
L
 
F
L
 
I
L
 
L
L