SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_091525222.1 NCBI__GCF_900115115.1:WP_091525222.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3dtgA Structural analysis of mycobacterial branched chain aminotransferase- implications for inhibitor design
39% identity, 93% coverage: 26:356/356 of query aligns to 23:362/363 of 3dtgA

query
sites
3dtgA
N
 
N
V
 
P
K
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
Y
F
 
Y
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
V
V
 
S
C
 
I
E
 
D
Y
 
Y
K
 
T
N
 
V
G
 
D
E
 
E
-
 
G
W
 
W
G
 
H
T
 
N
L
 
A
E
 
Q
I
 
V
K
 
I
P
 
P
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
I
V
 
V
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
A
 
E
I
 
I
F
|
F
E
 
E
G
 
G
M
 
L
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
E
 
W
E
 
A
N
 
D
N
 
G
D
 
S
I
 
I
W
 
V
M
 
S
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
E
Q
 
A
N
 
N
F
 
A
E
 
A
R
|
R
F
 
L
N
 
Q
K
 
S
S
 
S
A
 
A
I
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
I
P
 
P
A
 
E
I
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
E
R
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
E
G
 
S
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
A
V
 
V
E
 
D
K
 
E
E
 
K
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
P
G
 
A
L
 
G
G
 
G
-
 
E
N
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
M
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
G
A
 
V
S
 
R
P
 
P
S
 
S
N
 
N
E
 
E
F
 
Y
L
 
R
F
 
Y
C
 
L
I
 
L
L
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
A
K
 
G
S
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
A
 
K
G
 
G
K
 
G
I
 
I
K
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
S
V
 
V
Q
 
W
I
 
L
A
 
S
D
 
H
Y
 
E
Y
 
Y
S
 
V
R
|
R
A
 
A
A
 
S
N
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
Q
 
S
F
 
L
Y
 
L
P
 
A
T
 
Q
K
 
A
L
 
Q
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
M
G
 
G
F
 
C
N
 
D
Q
 
Q
V
 
V
I
 
V
W
 
W
T
 
L
D
 
D
S
 
A
-
 
I
N
 
E
H
 
R
T
 
R
H
 
Y
L
 
V
E
 
E
E
|
E
A
 
M
G
 
G
T
x
G
M
 
M
N
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
F
R
 
V
I
 
F
N
 
G
D
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
E
T
 
L
S
 
S
D
 
G
R
 
S
I
 
L
L
|
L
D
 
P
G
 
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
K
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
T
S
 
D
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
A
I
 
V
K
 
E
I
 
E
E
 
R
S
 
K
V
 
I
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
T
 
E
I
 
W
L
 
Q
N
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
G
N
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
I
K
 
T
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
A
A
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
 
T
Q
 
P
I
 
V
E
 
S
G
 
H
F
 
V
S
 
K
Y
 
H
K
 
H
D
 
D
Q
 
G
Y
 
E
Y
 
F
Q
 
T
L
 
I
P
 
A
E
 
D
M
 
G
A
 
Q
D
 
P
E
 
G
E
 
E
S
 
-
Y
 
I
A
 
T
L
 
M
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
D
A
 
T
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
K
 
G
L
 
T
A
 
F
D
 
A
D
 
D
P
 
T
F
 
H
N
 
G
W
 
W
T
 
M
V
 
A
K
 
R
I
 
L

3dtfA Structural analysis of mycobacterial branched chain aminotransferase- implications for inhibitor design (see paper)
39% identity, 93% coverage: 26:356/356 of query aligns to 23:362/363 of 3dtfA

query
sites
3dtfA
N
 
N
V
 
P
K
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
Y
F
 
Y
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
V
V
 
S
C
 
I
E
 
D
Y
 
Y
K
 
T
N
 
V
G
 
D
E
 
E
-
 
G
W
 
W
G
 
H
T
 
N
L
 
A
E
 
Q
I
 
V
K
 
I
P
 
P
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
I
V
 
V
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
A
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
L
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
E
 
W
E
 
A
N
 
D
N
 
G
D
 
S
I
 
I
W
 
V
M
 
S
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
E
Q
 
A
N
 
N
F
 
A
E
 
A
R
|
R
F
 
L
N
 
Q
K
 
S
S
 
S
A
 
A
I
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
I
P
 
P
A
 
E
I
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
E
R
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
E
G
 
S
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
A
V
 
V
E
 
D
K
 
E
E
 
K
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
P
G
 
A
L
 
G
G
 
G
-
 
E
N
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
M
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
G
A
 
V
S
 
R
P
 
P
S
 
S
N
 
N
E
 
E
F
 
Y
L
 
R
F
 
Y
C
 
L
I
 
L
L
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
A
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
K
G
 
G
K
 
G
I
 
I
K
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
S
V
 
V
Q
 
W
I
 
L
A
 
S
D
 
H
Y
 
E
Y
 
Y
S
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
S
N
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
S
 
A
A
 
A
Q
 
S
F
 
L
Y
 
L
P
 
A
T
 
Q
K
 
A
L
 
Q
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
M
G
 
G
F
 
C
N
 
D
Q
 
Q
V
 
V
I
 
V
W
 
W
T
 
L
D
 
D
S
 
A
-
 
I
N
 
E
H
 
R
T
 
R
H
 
Y
L
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
M
G
 
G
T
 
G
M
 
M
N
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
F
R
 
V
I
 
F
N
 
G
D
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
E
T
 
L
S
 
S
D
 
G
R
 
S
I
 
L
L
 
L
D
 
P
G
 
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
K
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
T
S
 
D
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
A
I
 
V
K
 
E
I
 
E
E
 
R
S
 
K
V
 
I
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
T
 
E
I
 
W
L
 
Q
N
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
G
N
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
I
K
 
T
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
A
A
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
 
T
Q
 
P
I
 
V
E
 
S
G
 
H
F
 
V
S
 
K
Y
 
H
K
 
H
D
 
D
Q
 
G
Y
 
E
Y
 
F
Q
 
T
L
 
I
P
 
A
E
 
D
M
 
G
A
 
Q
D
 
P
E
 
G
E
 
E
S
 
-
Y
 
I
A
 
T
L
 
M
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
D
A
 
T
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
K
 
G
L
 
T
A
 
F
D
 
A
D
 
D
P
 
T
F
 
H
N
 
G
W
 
W
T
 
M
V
 
A
K
 
R
I
 
L

A0R066 Branched-chain-amino-acid aminotransferase; BCAT; EC 2.6.1.42 from Mycolicibacterium smegmatis (strain ATCC 700084 / mc(2)155) (Mycobacterium smegmatis) (see 2 papers)
39% identity, 93% coverage: 26:356/356 of query aligns to 28:367/368 of A0R066

query
sites
A0R066
N
 
N
V
 
P
K
 
G
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
Y
F
 
Y
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
V
V
 
S
C
 
I
E
 
D
Y
 
Y
K
 
T
N
 
V
G
 
D
E
 
E
-
 
G
W
 
W
G
 
H
T
 
N
L
 
A
E
 
Q
I
 
V
K
 
I
P
 
P
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
Q
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
I
V
 
V
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
G
Q
 
Q
A
 
E
I
 
I
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
L
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
E
 
W
E
 
A
N
 
D
N
 
G
D
 
S
I
 
I
W
 
V
M
 
S
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
E
Q
 
A
N
 
N
F
 
A
E
 
A
R
|
R
F
 
L
N
 
Q
K
 
S
S
 
S
A
 
A
I
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
I
P
 
P
A
 
E
I
 
L
D
 
P
E
 
E
T
 
E
R
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
E
G
 
S
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
A
V
 
V
E
 
D
K
 
E
E
 
K
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
P
G
 
A
L
 
G
G
 
G
-
 
E
N
 
E
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
M
 
V
I
 
I
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
G
A
 
V
S
 
R
P
 
P
S
 
S
N
 
N
E
 
E
F
 
Y
L
 
R
F
 
Y
C
 
L
I
 
L
L
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
A
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
K
G
 
G
K
 
G
I
 
I
K
 
K
-
 
P
-
 
V
-
 
S
V
 
V
Q
 
W
I
 
L
A
 
S
D
 
H
Y
 
E
Y
 
Y
S
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
S
N
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
Q
 
S
F
 
L
Y
 
L
P
 
A
T
 
Q
K
 
A
L
 
Q
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
M
G
 
G
F
 
C
N
 
D
Q
 
Q
V
 
V
I
 
V
W
 
W
T
 
L
D
 
D
S
 
A
-
 
I
N
 
E
H
 
R
T
 
R
H
 
Y
L
 
V
E
 
E
E
 
E
A
 
M
G
 
G
T
 
G
M
 
M
N
 
N
V
 
L
F
 
F
F
 
F
R
 
V
I
 
F
N
 
G
D
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
E
T
 
L
S
 
S
D
 
G
R
 
S
I
 
L
L
 
L
D
 
P
G
 
G
V
 
I
T
 
T
R
 
R
K
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
T
S
 
D
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
A
I
 
V
K
 
E
I
 
E
E
 
R
S
 
K
V
 
I
Q
 
D
V
 
V
D
 
D
T
 
E
I
 
W
L
 
Q
N
x
K
A
 
K
A
 
A
K
 
G
N
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
I
K
 
T
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
A
A
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
 
T
Q
 
P
I
 
V
E
 
S
G
 
H
F
 
V
S
 
K
Y
 
H
K
 
H
D
 
D
Q
 
G
Y
 
E
Y
 
F
Q
 
T
L
 
I
P
 
A
E
 
D
M
 
G
A
 
Q
D
 
P
E
 
G
E
 
E
S
 
-
Y
 
I
A
 
T
L
 
M
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
D
A
 
T
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
K
 
G
L
 
T
A
 
F
D
 
A
D
 
D
P
 
T
F
 
H
N
 
G
W
 
W
T
 
M
V
 
A
K
 
R
I
 
L

3ht5A Crystal structure of ilve a branched chain amino acid transaminase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
36% identity, 91% coverage: 34:356/356 of query aligns to 3:334/335 of 3ht5A

query
sites
3ht5A
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
V
V
 
S
C
 
I
E
 
D
Y
 
Y
K
 
A
N
 
E
G
 
G
E
 
R
-
 
G
W
 
W
G
 
H
T
 
N
L
 
A
E
 
R
I
 
V
K
 
I
P
 
P
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
E
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
I
V
 
V
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
A
Q
 
Q
A
 
E
I
 
V
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
L
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
E
 
W
E
 
A
N
 
D
N
 
G
D
 
S
I
 
I
W
 
V
M
 
S
F
 
F
R
 
R
P
 
A
D
 
D
Q
 
A
N
 
N
F
 
A
E
 
A
R
|
R
F
 
L
N
 
R
K
 
S
S
 
S
A
 
A
I
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
I
P
 
P
A
 
E
I
 
L
D
 
P
E
 
D
T
 
A
R
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
E
G
 
S
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
A
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
A
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
G
G
 
A
L
 
G
G
 
G
-
 
E
N
 
E
S
 
A
L
 
L
Y
 
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
M
 
I
I
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
G
A
 
V
S
 
R
P
 
P
S
 
A
N
 
T
E
 
Q
F
 
Y
L
 
R
F
 
Y
C
 
L
I
 
L
L
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
A
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
K
G
 
G
K
 
G
I
 
I
-
 
A
-
 
P
-
 
V
K
 
S
V
 
V
Q
 
W
I
 
V
A
 
S
D
 
T
Y
 
E
Y
 
Y
S
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
N
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
Q
 
S
F
 
L
Y
 
L
P
 
A
T
 
Q
K
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
C
N
 
D
Q
 
Q
V
 
V
I
 
V
W
 
W
T
 
L
D
 
D
S
 
A
-
 
V
N
 
E
H
 
R
T
 
R
H
 
Y
L
 
I
E
 
E
E
|
E
A
 
M
G
 
G
T
x
G
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
F
R
 
V
I
 
L
N
 
G
D
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
E
T
 
L
S
 
S
D
 
G
R
 
S
I
 
L
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
K
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
I
S
 
D
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
A
I
 
V
K
 
E
I
 
E
E
 
R
S
 
R
V
 
I
Q
 
D
V
 
I
D
 
D
T
 
E
I
 
W
L
 
Q
N
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
A
N
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
I
K
 
T
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
A
A
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
 
T
Q
 
P
I
 
V
E
 
A
G
 
R
F
 
V
S
 
R
Y
 
H
K
 
G
D
 
A
Q
 
S
Y
 
E
Y
 
F
Q
 
R
L
 
I
P
 
A
E
 
D
M
 
G
A
 
Q
D
 
P
E
 
G
E
 
E
S
 
-
Y
 
V
A
 
T
L
 
M
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
D
A
 
T
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
K
 
G
L
 
T
A
 
F
D
 
A
D
 
D
P
 
T
F
 
H
N
 
G
W
 
W
T
 
M
V
 
A
K
 
R
I
 
L

5u3fA Structure of mycobacterium tuberculosis ilve, a branched-chain amino acid transaminase, in complex with d-cycloserine derivative (see paper)
36% identity, 91% coverage: 34:356/356 of query aligns to 2:325/326 of 5u3fA

query
sites
5u3fA
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
V
V
 
S
C
 
I
E
 
D
Y
 
Y
K
 
A
N
 
E
G
 
G
E
 
R
-
 
G
W
 
W
G
 
H
T
 
N
L
 
A
E
 
R
I
 
V
K
 
I
P
 
P
Y
 
Y
A
 
G
P
 
P
I
 
I
T
 
E
L
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
S
A
 
A
R
 
I
V
 
V
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
A
Q
 
Q
A
 
E
I
 
V
F
 
F
E
 
E
G
|
G
M
 
L
K
 
K
A
 
A
Y
 
Y
K
 
R
E
 
W
E
 
A
N
 
D
N
 
G
D
 
S
I
 
I
W
 
V
M
 
S
F
 
F
R
 
R
P
 
A
D
 
D
Q
 
A
N
 
N
F
 
A
E
 
A
R
|
R
F
 
L
N
 
R
K
 
S
S
 
S
A
 
A
I
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
A
M
 
I
P
 
P
A
 
E
I
 
L
D
 
P
E
 
D
T
 
A
R
 
V
F
 
F
I
 
I
G
 
E
G
 
S
L
 
L
K
 
R
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
A
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
A
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
G
G
 
A
L
 
G
G
 
G
-
 
E
N
 
E
S
 
A
L
 
L
Y
|
Y
I
 
L
R
 
R
P
 
P
F
 
F
M
 
I
I
 
F
A
 
A
T
 
T
E
 
E
S
 
P
G
 
G
V
 
L
I
 
G
A
 
V
S
 
R
P
 
P
S
 
A
N
 
T
E
 
Q
F
 
Y
L
 
R
F
 
Y
C
 
L
I
 
L
L
 
I
L
 
A
S
 
S
P
 
P
A
 
A
K
 
A
S
 
-
Y
 
-
Y
 
-
A
 
-
G
 
-
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
V
Q
 
W
I
 
V
A
 
S
D
 
T
Y
 
E
Y
 
Y
S
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
N
 
P
G
 
G
G
 
G
I
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
A
K
|
K
A
 
F
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
A
A
 
A
Q
 
S
F
 
L
Y
 
L
P
 
A
T
 
Q
K
 
A
L
 
E
A
 
A
Q
 
A
E
 
E
A
 
N
G
 
G
F
 
C
N
 
D
Q
 
Q
V
 
V
I
 
V
W
 
W
T
 
L
D
 
D
S
 
A
-
 
V
N
 
E
H
 
R
T
 
R
H
 
Y
L
 
I
E
 
E
E
|
E
A
 
M
G
 
G
T
x
G
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
F
R
 
V
I
 
L
N
 
G
D
 
S
-
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
A
T
 
R
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
E
T
 
L
S
 
S
D
 
G
R
 
S
I
 
L
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
x
I
T
|
T
R
 
R
K
 
D
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
Q
L
 
L
G
 
A
E
 
I
S
 
D
L
 
A
G
 
G
Y
 
F
D
 
A
I
 
V
K
 
E
I
 
E
E
 
R
S
 
R
V
 
I
Q
 
D
V
 
I
D
 
D
T
 
E
I
 
W
L
 
Q
N
 
K
A
 
K
A
 
A
K
 
A
N
 
A
G
 
G
T
 
E
L
 
I
K
 
T
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
A
A
 
C
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
A
V
 
V
V
 
I
N
 
T
Q
 
P
I
 
V
E
 
A
G
 
R
F
 
V
S
 
R
Y
 
H
K
 
G
D
 
A
Q
 
S
Y
 
E
Y
 
F
Q
 
R
L
 
I
P
 
A
E
 
D
M
 
G
A
 
Q
D
 
P
E
 
G
E
 
E
S
 
-
Y
 
V
A
 
T
L
 
M
Q
 
A
L
 
L
K
 
R
N
 
D
A
 
T
L
 
L
T
 
T
K
 
G
L
 
I
Q
 
Q
N
 
R
K
 
G
L
 
T
A
 
F
D
 
A
D
 
D
P
 
T
F
 
H
N
 
G
W
 
W
T
 
M
V
 
A
K
 
R
I
 
L

5bwvA X-ray crystal structure at 1.86a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a pyrazolopyrimidinone compound and an internal aldimine linked plp cofactor. (see paper)
33% identity, 88% coverage: 29:342/356 of query aligns to 24:343/355 of 5bwvA

query
sites
5bwvA
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
|
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
 
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
|
Y
Y
 
S
A
 
V
G
 
T
K
 
P
I
x
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
|
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
x
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
x
C
V
 
Q
V
 
V
N
x
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

2hdkB Crystal structure of cys315ala-cys318ala mutant of human mitochondrial branched chain aminotransferase (see paper)
33% identity, 89% coverage: 25:342/356 of query aligns to 24:351/363 of 2hdkB

query
sites
2hdkB
E
 
E
N
 
P
V
 
L
K
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
I
 
G
A
 
V
S
 
S
P
 
Q
S
 
P
N
 
R
E
 
R
F
 
A
L
 
L
F
 
L
C
 
F
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
 
M
N
 
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
A
V
 
Q
V
 
V
N
 
A
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

5i5sA X-ray crystal structure at 2.06a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a benzisoxazole compound and an internal aldimine linked plp cofactor. (see paper)
33% identity, 89% coverage: 25:342/356 of query aligns to 22:349/361 of 5i5sA

query
sites
5i5sA
E
 
E
N
 
P
V
 
L
K
 
V
F
|
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
 
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
|
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

5bwtA X-ray crystal structure at 2.20a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a pyrazolopyrimidinone fragment and an internal aldimine linked plp. (see paper)
33% identity, 89% coverage: 25:342/356 of query aligns to 24:348/360 of 5bwtA

query
sites
5bwtA
E
 
E
N
 
P
V
 
L
K
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
 
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
V
K
 
T
I
 
P
K
 
V
V
 
S
Q
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
D
-
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
x
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

O15382 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial; BCAT(m); Placental protein 18; PP18; EC 2.6.1.42 from Homo sapiens (Human) (see 6 papers)
33% identity, 89% coverage: 25:342/356 of query aligns to 53:380/392 of O15382

query
sites
O15382
E
 
E
N
 
P
V
 
L
K
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
 
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
|
Y
I
 
V
R
|
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
 
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
x
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
 
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
 
T
M
 
M
N
 
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
 
L
D
 
P
G
 
G
V
 
V
T
 
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
A
x
C
V
 
Q
V
 
V
N
x
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

5i5yA X-ray crystal structure at 1.81a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with an aryl acetate compound and an internal aldimine linked plp cofactor. (see paper)
33% identity, 89% coverage: 25:342/356 of query aligns to 24:351/363 of 5i5yA

query
sites
5i5yA
E
 
E
N
 
P
V
 
L
K
 
V
F
|
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
|
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
|
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
|
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
x
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
|
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
 
M
N
 
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

5i5uA X-ray crystal structure at 2.40a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a tetrahydronaphthalenyl compound and an internal aldimine linked plp cofactor. (see paper)
33% identity, 89% coverage: 25:342/356 of query aligns to 24:351/363 of 5i5uA

query
sites
5i5uA
E
 
E
N
 
P
V
 
L
K
 
V
F
|
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
|
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
x
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
|
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
 
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

2a1hA X-ray crystal structure of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with gabapentin (see paper)
33% identity, 89% coverage: 25:342/356 of query aligns to 24:351/363 of 2a1hA

query
sites
2a1hA
E
 
E
N
 
P
V
 
L
K
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
|
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
|
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
I
 
G
A
x
V
S
 
S
P
 
Q
S
 
P
N
 
R
E
 
R
F
 
A
L
 
L
F
 
L
C
 
F
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
|
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

5i5xA X-ray crystal structure at 1.65a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a thiazole compound and pmp cofactor. (see paper)
34% identity, 88% coverage: 29:342/356 of query aligns to 25:346/358 of 5i5xA

query
sites
5i5xA
F
|
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
|
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
|
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
 
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
x
V
K
 
G
S
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
A
 
G
G
 
S
K
 
V
I
 
T
K
 
P
V
 
V
Q
 
S
-
 
L
I
 
L
A
 
A
D
 
D
-
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
|
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

1ktaA Human branched chain amino acid aminotransferase : three dimensional structure of the enzyme in its pyridoxamine phosphate form. (see paper)
33% identity, 89% coverage: 25:342/356 of query aligns to 26:353/365 of 1ktaA

query
sites
1ktaA
E
 
E
N
 
P
V
 
L
K
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
I
 
G
A
 
V
S
 
S
P
 
Q
S
 
P
N
 
R
E
 
R
F
 
A
L
 
L
F
 
L
C
 
F
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
|
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

1ekfA Crystallographic structure of human branched chain amino acid aminotransferase (mitochondrial) complexed with pyridoxal-5'- phosphate at 1.95 angstroms (orthorhombic form) (see paper)
33% identity, 89% coverage: 25:342/356 of query aligns to 26:353/365 of 1ekfA

query
sites
1ekfA
E
 
E
N
 
P
V
 
L
K
 
V
F
 
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
I
 
G
A
 
V
S
 
S
P
 
Q
S
 
P
N
 
R
E
 
R
F
 
A
L
 
L
F
 
L
C
 
F
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
 
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
|
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
 
G
T
|
T
A
 
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

5cr5A X-ray crystal structure at 1.61a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a biphenyl pyrrolidine ether compound and an internal aldimine linked plp cofactor. (see paper)
33% identity, 88% coverage: 29:342/356 of query aligns to 23:346/358 of 5cr5A

query
sites
5cr5A
F
|
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
 
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
x
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
|
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
x
V
G
|
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
x
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

5i5tA X-ray crystal structure at 2.31a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a tetrahydroquinoline compound and an internal aldimine linked plp cofactor. (see paper)
33% identity, 88% coverage: 29:342/356 of query aligns to 26:349/361 of 5i5tA

query
sites
5i5tA
F
|
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
 
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
|
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

5i60A X-ray crystal structure at 2.12a resolution of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a biarl amide compound and an internal aldimine linked plp cofactor. (see paper)
33% identity, 88% coverage: 29:342/356 of query aligns to 24:347/359 of 5i60A

query
sites
5i60A
F
|
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
 
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
|
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
 
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
x
G
S
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
|
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
 
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
 
V
G
 
G
T
|
T
M
|
M
N
 
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
 
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

5hneA X-ray crystal structure of human mitochondrial branched chain aminotransferase (bcatm) complexed with a 2-aryl benzimidazole compound and an internal aldimine linked plp cofactor (see paper)
33% identity, 88% coverage: 29:342/356 of query aligns to 24:347/359 of 5hneA

query
sites
5hneA
F
|
F
G
 
G
E
 
K
K
 
T
F
 
F
T
 
T
D
 
D
H
 
H
M
 
M
L
 
L
V
 
M
C
 
V
E
 
E
Y
 
W
K
 
N
N
 
D
G
 
K
E
 
G
W
 
W
G
 
G
T
 
Q
L
 
P
E
 
R
I
 
I
K
 
Q
P
 
P
Y
 
F
A
 
Q
P
 
N
I
 
L
T
 
T
L
 
L
D
 
H
P
 
P
S
 
A
A
 
S
R
 
S
V
 
S
F
 
L
H
 
H
Y
 
Y
G
 
S
Q
 
L
A
 
Q
I
 
L
F
|
F
E
 
E
G
 
G
M
 
M
K
|
K
A
 
A
Y
 
F
K
 
K
E
 
G
E
 
K
N
 
D
N
 
Q
D
 
Q
I
 
V
W
 
R
M
 
L
F
 
F
R
 
R
P
 
P
D
 
W
Q
 
L
N
 
N
F
 
M
E
 
D
R
|
R
F
 
M
N
 
L
K
 
R
S
 
S
A
 
A
I
 
M
R
 
R
L
 
L
A
 
C
M
 
L
P
 
P
A
 
S
I
 
F
D
 
D
E
 
K
T
 
L
R
 
E
F
 
L
I
 
L
G
 
E
G
 
C
L
 
I
K
 
R
E
 
R
L
 
L
I
 
I
K
 
E
V
 
V
E
 
D
K
 
K
E
 
D
W
 
W
V
 
V
R
 
P
K
 
D
G
 
A
L
 
A
G
 
G
N
 
T
S
 
S
L
 
L
Y
 
Y
I
 
V
R
 
R
P
 
P
F
 
V
M
 
L
I
 
I
A
 
G
T
 
N
E
 
E
S
 
P
G
 
S
V
 
L
-
 
G
I
 
V
A
 
S
S
 
Q
P
 
P
S
 
T
N
 
R
E
 
A
F
 
L
L
 
L
F
 
F
C
 
-
I
 
V
L
 
I
L
 
L
S
 
C
P
 
P
A
 
V
K
 
G
S
 
A
Y
|
Y
Y
 
F
A
 
P
G
 
G
-
 
G
-
 
S
-
 
V
-
 
T
K
 
P
I
 
V
K
 
S
V
 
L
Q
 
L
I
 
A
A
 
D
D
 
P
Y
 
A
Y
 
F
S
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
W
N
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
V
G
 
G
A
 
N
A
 
Y
K
|
K
A
 
L
A
 
G
G
 
G
N
 
N
Y
|
Y
S
 
G
A
 
P
Q
 
T
F
 
V
Y
 
L
P
 
V
T
 
Q
K
 
Q
L
 
E
A
 
A
Q
 
L
E
 
K
A
 
R
G
 
G
F
 
C
N
 
E
Q
|
Q
V
 
V
I
 
L
W
 
W
T
 
L
D
 
Y
S
 
G
N
 
P
H
 
D
T
 
H
H
 
Q
L
 
L
E
 
T
E
|
E
A
x
V
G
|
G
T
|
T
M
|
M
N
|
N
V
 
I
F
 
F
F
 
V
R
 
Y
I
 
W
N
 
T
D
 
H
-
 
E
-
 
D
-
 
G
-
 
V
-
 
L
T
 
E
L
 
L
F
 
V
T
 
T
A
 
P
P
 
P
T
 
L
S
 
N
D
 
G
R
 
V
I
 
I
L
|
L
D
 
P
G
|
G
V
|
V
T
x
V
R
 
R
K
 
Q
S
 
S
L
 
L
I
 
L
Q
 
D
L
 
M
G
 
A
E
 
Q
S
 
T
L
 
W
G
 
G
-
 
E
Y
 
F
D
 
R
I
 
V
K
 
V
I
 
E
E
 
R
S
 
T
V
 
I
Q
 
T
V
 
M
D
 
K
T
 
Q
I
 
L
L
 
L
N
 
R
A
 
A
A
 
L
K
 
E
N
 
E
G
 
G
T
 
R
L
 
V
K
 
R
E
 
E
I
 
V
F
 
F
G
 
G
A
 
S
G
|
G
T
|
T
A
|
A
A
 
C
V
 
Q
V
 
V
N
x
C
Q
 
P
I
 
V
E
 
H
G
 
R
F
 
I
S
 
L
Y
 
Y
K
 
K
D
 
D
Q
 
R
Y
 
N
Y
 
L
Q
 
H
L
 
I
P
 
P
E
 
T
M
 
M
A
 
E
D
 
N
E
 
G
E
 
P
S
 
E
Y
 
L
A
 
I
L
 
L
Q
 
R
L
 
F
K
 
Q
N
 
K
A
 
E
L
 
L
T
 
K
K
 
E
L
 
I
Q
 
Q

Query Sequence

>WP_091525222.1 NCBI__GCF_900115115.1:WP_091525222.1
MDSNILNNLKLTKVAASKIDTFDFENVKFGEKFTDHMLVCEYKNGEWGTLEIKPYAPITL
DPSARVFHYGQAIFEGMKAYKEENNDIWMFRPDQNFERFNKSAIRLAMPAIDETRFIGGL
KELIKVEKEWVRKGLGNSLYIRPFMIATESGVIASPSNEFLFCILLSPAKSYYAGKIKVQ
IADYYSRAANGGIGAAKAAGNYSAQFYPTKLAQEAGFNQVIWTDSNHTHLEEAGTMNVFF
RINDTLFTAPTSDRILDGVTRKSLIQLGESLGYDIKIESVQVDTILNAAKNGTLKEIFGA
GTAAVVNQIEGFSYKDQYYQLPEMADEESYALQLKNALTKLQNKLADDPFNWTVKI

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory