SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_092053756.1 NCBI__GCF_900111775.1:WP_092053756.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P30750 Methionine import ATP-binding protein MetN; EC 7.4.2.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
37% identity, 87% coverage: 4:216/245 of query aligns to 1:220/343 of P30750

query
sites
P30750
L
 
M
Y
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
N
I
 
I
E
 
T
-
 
K
-
 
V
H
 
F
H
 
H
R
 
Q
E
 
G
G
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
N
R
 
N
L
 
V
E
 
S
L
 
L
-
 
H
L
 
V
P
 
P
-
 
A
G
 
G
R
 
Q
F
 
I
Y
 
Y
A
 
G
L
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
H
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
S
L
 
V
R
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
L
P
 
T
G
 
T
-
 
L
S
 
S
N
 
E
R
 
S
H
 
E
L
 
L
Y
 
T
R
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
I
 
I
T
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
F
Q
 
Q
A
 
H
V
 
F
F
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
-
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
F
D
 
G
N
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
N
L
 
T
S
 
P
R
 
K
R
 
D
E
 
E
R
 
V
N
 
K
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
T
W
 
E
A
 
L
L
 
L
Q
 
S
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
D
F
 
K
G
 
H
E
 
D
R
 
S
R
 
Y
A
 
P
N
 
S
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
S
K
 
N
P
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
|
E
P
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
A
S
 
T
A
 
T
A
 
R
A
 
S
F
 
I
E
 
L
G
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
K
G
 
D
L
 
I
-
 
N
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
I
V
 
L
M
 
L
A
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
R
 
M
A
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
K
R
 
R
L
 
I
G
 
C
A
 
D
E
 
C
E
 
V
I
 
A
R
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3tuzC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 semet soak crystal form (see paper)
37% identity, 87% coverage: 4:216/245 of query aligns to 2:221/344 of 3tuzC

query
sites
3tuzC
L
 
M
Y
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
N
I
 
I
E
 
T
-
 
K
-
 
V
H
x
F
H
 
H
R
x
Q
E
 
G
G
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
N
R
 
N
L
 
V
E
 
S
L
 
L
-
 
H
L
 
V
P
 
P
-
 
A
G
 
G
R
 
Q
F
 
I
Y
 
Y
A
 
G
L
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
H
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
S
L
 
V
R
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
L
P
 
T
G
 
T
-
 
L
S
 
S
N
 
E
R
 
S
H
 
E
L
 
L
Y
 
T
R
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
I
 
I
T
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
F
Q
 
Q
A
 
H
V
 
F
F
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
-
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
F
D
 
G
N
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
N
L
 
T
S
 
P
R
 
K
R
 
D
E
 
E
R
 
V
N
 
K
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
T
W
 
E
A
 
L
L
 
L
Q
 
S
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
D
F
 
K
G
 
H
E
 
D
R
 
S
R
 
Y
A
 
P
N
 
S
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
S
K
 
N
P
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
A
S
 
T
A
 
T
A
 
R
A
 
S
F
 
I
E
 
L
G
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
K
G
 
D
L
 
I
-
 
N
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
I
V
 
L
M
 
L
A
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
R
 
M
A
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
K
R
 
R
L
 
I
G
 
C
A
 
D
E
 
C
E
 
V
I
 
A
R
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
L
 
I

Sites not aligning to the query:

3tuiC Inward facing conformations of the metni methionine abc transporter: cy5 native crystal form (see paper)
37% identity, 87% coverage: 4:216/245 of query aligns to 2:221/344 of 3tuiC

query
sites
3tuiC
L
 
M
Y
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
N
I
 
I
E
 
T
-
 
K
-
 
V
H
x
F
H
 
H
R
 
Q
E
 
G
G
 
T
R
 
R
T
 
T
V
 
I
L
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
N
R
 
N
L
 
V
E
 
S
L
 
L
-
 
H
L
 
V
P
 
P
-
 
A
G
 
G
R
 
Q
F
 
I
Y
 
Y
A
 
G
L
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
H
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
S
L
 
V
R
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
L
P
 
T
G
 
T
-
 
L
S
 
S
N
 
E
R
 
S
H
 
E
L
 
L
Y
 
T
R
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
I
 
I
T
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
F
Q
 
Q
A
 
H
V
 
F
F
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
-
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
F
D
 
G
N
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
N
L
 
T
S
 
P
R
 
K
R
 
D
E
 
E
R
 
V
N
 
K
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
T
W
 
E
A
 
L
L
 
L
Q
 
S
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
D
F
 
K
G
 
H
E
 
D
R
 
S
R
 
Y
A
 
P
N
 
S
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
S
K
 
N
P
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
A
S
 
T
A
 
T
A
 
R
A
 
S
F
 
I
E
 
L
G
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
K
G
 
D
L
 
I
-
 
N
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
I
V
 
L
M
 
L
A
 
I
S
 
T
H
 
H
D
 
E
R
 
M
A
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
K
R
 
R
L
 
I
G
 
C
A
 
D
E
 
C
E
 
V
I
 
A
R
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
L
 
I

6cvlD Crystal structure of the escherichia coli atpgs-bound metni methionine abc transporter in complex with its metq binding protein (see paper)
37% identity, 87% coverage: 4:216/245 of query aligns to 2:221/344 of 6cvlD

query
sites
6cvlD
L
 
M
Y
 
I
E
 
K
L
 
L
S
 
S
D
 
N
I
 
I
E
 
T
-
 
K
-
 
V
H
x
F
H
 
H
R
x
Q
E
 
G
G
 
T
R
 
R
T
 
T
V
x
I
L
 
Q
A
 
A
I
 
L
D
 
N
R
 
N
L
 
V
E
 
S
L
 
L
-
 
H
L
 
V
P
 
P
-
 
A
G
 
G
R
 
Q
F
 
I
Y
 
Y
A
 
G
L
 
V
T
 
I
G
 
G
A
 
A
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
I
H
 
R
L
 
C
L
 
V
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
S
L
 
V
R
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
Q
 
Q
S
 
E
L
 
L
P
 
T
G
 
T
-
 
L
S
 
S
N
 
E
R
 
S
H
 
E
L
 
L
Y
 
T
R
 
K
L
 
A
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
I
 
I
T
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
F
Q
 
Q
A
 
H
V
 
F
F
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
S
-
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
F
D
 
G
N
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
E
L
 
L
R
 
D
G
 
N
L
 
T
S
 
P
R
 
K
R
 
D
E
 
E
R
 
V
N
 
K
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
T
W
 
E
A
 
L
L
 
L
Q
 
S
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
D
F
 
K
G
 
H
E
 
D
R
 
S
R
 
Y
A
 
P
N
 
S
R
x
N
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
E
x
Q
S
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
S
K
 
N
P
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
C
D
 
D
E
 
Q
P
 
A
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
A
S
 
T
A
 
T
A
 
R
A
 
S
F
 
I
E
 
L
G
 
E
L
 
L
L
 
L
A
 
K
G
 
D
L
 
I
-
 
N
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
L
S
 
T
L
 
I
V
 
L
M
 
L
A
 
I
S
 
T
H
|
H
D
 
E
R
 
M
A
 
D
L
 
V
V
 
V
Q
 
K
R
 
R
L
 
I
G
 
C
A
 
D
E
 
C
E
 
V
I
 
A
R
 
V
L
 
I
A
 
S
E
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
L
L
 
I

P0A9R7 Cell division ATP-binding protein FtsE from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
38% identity, 82% coverage: 16:217/245 of query aligns to 14:217/222 of P0A9R7

query
sites
P0A9R7
G
 
G
R
 
R
T
 
Q
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
I
 
G
D
 
V
R
 
T
L
 
F
E
 
H
L
 
M
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
E
F
 
M
Y
 
A
A
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
H
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
H
 
K
L
 
L
L
 
I
A
x
C
L
 
G
L
 
I
D
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
S
R
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
I
R
 
W
I
 
F
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
S
 
D
L
 
I
P
 
T
G
 
R
-
 
L
S
 
K
N
 
N
R
 
R
H
 
E
L
 
V
Y
 
P
R
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
I
 
I
T
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
F
Q
 
Q
A
 
D
V
 
H
F
 
H
L
 
L
L
 
L
S
 
M
G
 
D
-
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
I
G
 
P
L
 
L
K
 
I
L
 
I
R
 
A
G
 
G
L
 
A
S
 
S
R
 
G
R
 
D
E
 
D
R
 
I
N
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
D
 
D
F
 
K
G
 
A
E
 
K
R
 
N
R
 
F
A
 
P
N
 
I
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
N
K
 
K
P
 
P
R
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
D
S
 
A
S
 
L
A
 
S
A
 
E
A
 
G
F
 
I
E
 
L
G
 
R
L
 
L
L
 
F
A
 
E
G
 
E
L
 
F
R
 
N
D
 
R
Q
 
V
G
 
G
L
 
V
S
 
T
L
 
V
V
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
I
Q
 
S
R
 
R
L
 
R
G
 
S
A
 
Y
E
 
R
E
 
M
I
 
L
R
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
D
G
 
G
R
 
H
I
 
L
L
 
H
G
 
G

8w6iD Cryo-em structure of escherichia coli str k12 ftsex complex with atp- gamma-s in peptidisc
38% identity, 82% coverage: 16:217/245 of query aligns to 14:217/219 of 8w6iD

query
sites
8w6iD
G
 
G
R
 
R
T
 
Q
V
 
A
L
 
L
A
 
Q
I
 
G
D
 
V
R
 
T
L
 
F
E
 
H
L
 
M
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
E
F
 
M
Y
 
A
A
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
H
N
x
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
C
L
 
G
L
 
I
D
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
S
R
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
I
R
 
W
I
 
F
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
S
 
D
L
 
I
P
 
T
G
 
R
-
 
L
S
 
K
N
 
N
R
 
R
H
 
E
L
 
V
Y
 
P
R
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
I
 
I
T
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
F
Q
|
Q
A
 
D
V
 
H
F
 
H
L
 
L
L
 
L
S
 
M
G
 
D
-
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
I
G
 
P
L
 
L
K
 
I
L
 
I
R
 
A
G
 
G
L
 
A
S
 
S
R
 
G
R
 
D
E
 
D
R
 
I
N
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
D
 
D
F
x
K
G
 
A
E
 
K
R
 
N
R
 
F
A
 
P
N
 
I
R
x
Q
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
E
|
E
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
N
K
 
K
P
 
P
R
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
D
S
 
A
S
 
L
A
 
S
A
 
E
A
 
G
F
 
I
E
 
L
G
 
R
L
 
L
L
 
F
A
 
E
G
 
E
L
 
F
R
 
N
D
 
R
Q
 
V
G
 
G
L
 
V
S
 
T
L
 
V
V
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
T
H
|
H
D
 
D
R
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
I
Q
 
S
R
 
R
L
 
R
G
 
S
A
 
Y
E
 
R
E
 
M
I
 
L
R
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
D
G
 
G
R
 
H
I
 
L
L
 
H
G
 
G

Sites not aligning to the query:

4ymuJ Crystal structure of an amino acid abc transporter complex with arginines and atps (see paper)
31% identity, 80% coverage: 25:219/245 of query aligns to 22:220/240 of 4ymuJ

query
sites
4ymuJ
L
 
L
E
 
K
L
 
V
L
 
N
P
 
K
G
 
G
R
 
E
F
 
V
Y
 
V
A
 
V
L
 
I
T
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
R
L
 
C
L
 
I
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
E
P
 
P
S
 
T
R
 
K
G
 
G
E
 
E
L
 
V
R
 
F
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
V
S
 
K
L
 
I
P
 
N
G
 
N
S
 
G
N
 
K
R
 
V
H
 
N
L
 
I
Y
 
N
R
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
Q
E
 
K
I
 
V
T
 
G
L
 
M
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
H
V
 
F
F
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
G
 
H
S
 
L
V
 
T
A
 
A
-
 
I
D
 
E
N
 
N
L
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
-
 
P
L
 
V
K
 
K
L
 
V
R
 
K
G
 
K
L
 
M
S
 
N
R
 
K
R
 
K
E
 
E
R
 
A
N
 
E
R
 
E
R
 
L
A
 
A
L
 
V
W
 
D
A
 
L
L
 
L
Q
 
A
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
D
 
D
F
 
K
G
 
K
E
 
D
R
 
Q
R
 
Y
A
 
P
N
 
I
R
 
K
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
K
R
 
Q
R
 
R
V
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
K
 
Q
P
 
P
R
 
E
V
 
V
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
E
S
 
M
A
 
V
A
 
K
A
 
E
F
 
V
E
 
L
G
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
K
G
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
L
 
M
S
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
A
 
V
S
 
T
H
|
H
D
 
E
R
 
M
A
 
G
L
 
F
V
 
A
Q
 
R
R
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
D
E
 
R
E
 
V
I
 
I
R
 
F
L
 
M
A
 
D
E
 
D
G
 
G
R
 
V
I
 
I
L
 
V
-
 
E
-
 
E
G
 
G
R
 
T
P
 
P

Sites not aligning to the query:

8hd0A Cell divisome spg hydrolysis machinery ftsex-envc
38% identity, 82% coverage: 16:217/245 of query aligns to 14:217/218 of 8hd0A

query
sites
8hd0A
G
 
G
R
|
R
T
 
Q
V
x
A
L
 
L
A
 
Q
I
 
G
D
 
V
R
 
T
L
 
F
E
 
H
L
 
M
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
E
F
 
M
Y
 
A
A
 
F
L
 
L
T
 
T
G
 
G
A
 
H
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
C
L
 
G
L
 
I
D
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
S
R
 
A
G
 
G
E
 
K
L
 
I
R
 
W
I
 
F
D
 
S
G
 
G
Q
 
H
S
 
D
L
 
I
P
 
T
G
 
R
-
 
L
S
 
K
N
 
N
R
 
R
H
 
E
L
 
V
Y
 
P
R
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
I
 
I
T
 
G
L
 
M
V
 
I
H
 
F
Q
 
Q
A
 
D
V
 
H
F
 
H
L
 
L
L
 
L
S
 
M
G
 
D
-
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
I
G
 
P
L
 
L
K
 
I
L
 
I
R
 
A
G
 
G
L
 
A
S
 
S
R
 
G
R
 
D
E
 
D
R
 
I
N
 
R
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
S
W
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
L
D
 
D
F
 
K
G
 
A
E
 
K
R
 
N
R
 
F
A
 
P
N
 
I
R
 
Q
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
E
 
E
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
V
A
 
V
L
 
N
K
 
K
P
 
P
R
 
A
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
D
S
 
A
S
 
L
A
 
S
A
 
E
A
 
G
F
 
I
E
 
L
G
 
R
L
 
L
L
 
F
A
 
E
G
 
E
L
 
F
R
 
N
D
 
R
Q
 
V
G
 
G
L
 
V
S
 
T
L
 
V
V
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
I
A
 
N
L
 
L
V
 
I
Q
 
S
R
 
R
L
 
R
G
 
S
A
 
Y
E
 
R
E
 
M
I
 
L
R
 
T
L
 
L
A
 
S
E
 
D
G
 
G
R
 
H
I
 
L
L
 
H
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3c4jA Abc protein artp in complex with atp-gamma-s
32% identity, 85% coverage: 12:219/245 of query aligns to 25:222/242 of 3c4jA

query
sites
3c4jA
H
 
H
H
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
E
T
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
V
I
 
I
D
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
H
 
R
L
 
C
L
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
D
P
 
F
S
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
I
S
 
N
L
 
L
P
 
K
G
 
A
S
 
K
N
 
D
R
 
T
H
 
N
L
 
L
Y
 
N
R
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
E
 
E
I
 
V
T
 
G
L
 
M
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
R
V
 
F
F
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
G
 
H
-
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
K
L
 
V
R
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
R
 
R
R
 
E
E
 
K
R
 
A
N
 
E
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
W
 
E
A
 
L
L
 
L
Q
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
D
 
D
F
 
K
G
 
A
E
 
H
R
 
A
R
 
Y
A
 
P
N
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
K
 
E
P
 
P
R
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
E
S
 
M
A
 
V
A
 
G
A
 
E
F
 
V
E
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
M
A
 
K
G
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
L
 
M
S
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
A
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
R
 
M
A
 
G
L
 
F
V
 
A
Q
 
R
R
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
D
E
 
R
E
 
V
I
 
L
R
 
F
L
 
M
A
 
D
E
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

3c41J Abc protein artp in complex with amp-pnp/mg2+
32% identity, 85% coverage: 12:219/245 of query aligns to 25:222/242 of 3c41J

query
sites
3c41J
H
 
H
H
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
E
T
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
V
I
 
I
D
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
H
 
R
L
 
C
L
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
D
P
 
F
S
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
I
S
 
N
L
 
L
P
 
K
G
 
A
S
 
K
N
 
D
R
 
T
H
 
N
L
 
L
Y
 
N
R
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
E
 
E
I
 
V
T
 
G
L
 
M
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
R
V
 
F
F
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
G
 
H
-
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
K
L
 
V
R
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
R
 
R
R
 
E
E
 
K
R
 
A
N
 
E
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
W
 
E
A
 
L
L
 
L
Q
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
D
 
D
F
 
K
G
 
A
E
 
H
R
 
A
R
 
Y
A
 
P
N
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
K
 
E
P
 
P
R
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
E
S
 
M
A
 
V
A
 
G
A
 
E
F
 
V
E
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
M
A
 
K
G
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
L
 
M
S
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
A
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
R
 
M
A
 
G
L
 
F
V
 
A
Q
 
R
R
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
D
E
 
R
E
 
V
I
 
L
R
 
F
L
 
M
A
 
D
E
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2olkA Abc protein artp in complex with adp-beta-s
32% identity, 85% coverage: 12:219/245 of query aligns to 25:222/242 of 2olkA

query
sites
2olkA
H
 
H
H
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
E
T
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
V
I
 
I
D
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
H
 
R
L
 
C
L
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
D
P
 
F
S
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
I
S
 
N
L
 
L
P
 
K
G
 
A
S
 
K
N
 
D
R
 
T
H
 
N
L
 
L
Y
 
N
R
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
E
 
E
I
 
V
T
 
G
L
 
M
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
R
V
 
F
F
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
G
 
H
-
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
K
L
 
V
R
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
R
 
R
R
 
E
E
 
K
R
 
A
N
 
E
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
W
 
E
A
 
L
L
 
L
Q
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
D
 
D
F
 
K
G
 
A
E
 
H
R
 
A
R
 
Y
A
 
P
N
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
K
 
E
P
 
P
R
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
E
S
 
M
A
 
V
A
 
G
A
 
E
F
 
V
E
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
M
A
 
K
G
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
L
 
M
S
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
A
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
R
 
M
A
 
G
L
 
F
V
 
A
Q
 
R
R
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
D
E
 
R
E
 
V
I
 
L
R
 
F
L
 
M
A
 
D
E
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2oljA Abc protein artp in complex with adp/mg2+
32% identity, 85% coverage: 12:219/245 of query aligns to 25:222/242 of 2oljA

query
sites
2oljA
H
 
H
H
 
I
R
 
R
E
 
E
G
 
G
R
 
E
T
 
V
V
 
V
L
 
V
A
 
V
I
 
I
D
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
G
 
-
R
 
-
F
 
-
Y
 
-
A
 
-
L
 
-
T
 
-
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
L
H
 
R
L
 
C
L
 
L
A
 
N
L
 
L
L
 
L
D
 
E
R
 
D
P
 
F
S
 
D
R
 
E
G
 
G
E
 
E
L
 
I
R
 
I
I
 
I
D
 
D
G
 
G
Q
 
I
S
 
N
L
 
L
P
 
K
G
 
A
S
 
K
N
 
D
R
 
T
H
 
N
L
 
L
Y
 
N
R
 
K
L
 
V
R
 
R
R
 
E
E
 
E
I
 
V
T
 
G
L
 
M
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
R
V
 
F
F
 
N
L
 
L
L
 
F
S
 
P
G
 
H
-
 
M
S
 
T
V
 
V
A
 
L
D
 
N
N
 
N
L
 
I
A
 
T
F
 
L
G
 
A
-
 
P
L
 
M
K
 
K
L
 
V
R
 
R
G
 
K
L
 
W
S
 
P
R
 
R
R
 
E
E
 
K
R
 
A
N
 
E
R
 
A
R
 
K
A
 
A
L
 
M
W
 
E
A
 
L
L
 
L
Q
 
D
T
 
K
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
D
 
D
F
 
K
G
 
A
E
 
H
R
 
A
R
 
Y
A
 
P
N
 
D
R
 
S
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
A
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
M
K
 
E
P
 
P
R
 
K
V
 
I
L
 
M
L
 
L
L
 
F
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
E
S
 
M
A
 
V
A
 
G
A
 
E
F
 
V
E
 
L
G
 
S
L
 
V
L
 
M
A
 
K
G
 
Q
L
 
L
R
 
A
D
 
N
Q
 
E
G
 
G
L
 
M
S
 
T
L
 
M
V
 
V
M
 
V
A
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
E
R
 
M
A
 
G
L
 
F
V
 
A
Q
 
R
R
 
E
L
 
V
G
 
G
A
 
D
E
 
R
E
 
V
I
 
L
R
 
F
L
 
M
A
 
D
E
 
G
G
 
G
R
 
Y
I
 
I
L
 
I
-
 
E
-
 
E
G
 
G
R
 
K
P
 
P

Sites not aligning to the query:

2pclA Crystal structure of abc transporter with complex (aq_297) from aquifex aeolicus vf5
35% identity, 82% coverage: 16:217/245 of query aligns to 15:218/223 of 2pclA

query
sites
2pclA
G
 
G
R
 
Y
T
 
E
V
 
I
L
 
L
A
 
K
I
 
G
D
 
I
R
 
S
L
 
L
E
 
S
L
 
V
L
 
K
P
 
K
G
 
G
R
 
E
F
 
F
Y
 
V
A
 
S
L
 
I
T
 
I
G
 
G
A
 
A
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
L
H
 
Y
L
 
I
L
 
L
A
 
G
L
 
L
L
 
L
D
 
D
R
 
A
P
 
P
S
 
T
R
 
E
G
 
G
E
 
K
L
 
V
R
 
F
I
 
L
D
 
E
G
 
G
Q
 
K
S
 
E
L
 
V
P
 
D
G
 
Y
S
 
T
N
 
N
-
 
E
R
 
K
H
 
E
L
 
L
Y
 
S
R
 
L
L
 
L
R
 
R
-
 
N
R
 
R
E
 
K
I
 
L
T
 
G
L
 
F
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
F
V
 
H
F
 
Y
L
 
L
L
 
I
S
 
P
G
 
E
S
 
L
V
 
T
A
 
A
-
 
L
D
 
E
N
 
N
L
 
V
A
 
I
F
 
V
G
 
P
L
 
M
K
 
L
L
 
K
R
 
M
G
 
G
L
 
K
S
 
P
R
 
K
R
 
K
E
 
E
R
 
A
N
 
K
R
 
E
R
 
R
A
 
G
L
 
E
W
 
Y
A
 
L
L
 
L
Q
 
S
T
 
E
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
D
 
D
F
 
K
G
 
L
E
 
S
R
 
R
R
 
K
A
 
P
N
 
Y
R
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
N
K
 
E
P
 
P
R
 
I
V
 
L
L
 
L
L
 
F
L
 
A
D
 
D
E
|
E
P
|
P
T
|
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
S
S
 
A
S
 
N
A
 
T
A
 
K
A
 
R
F
 
V
E
 
M
G
 
D
L
 
I
L
 
F
A
 
L
G
 
K
L
 
I
R
 
N
D
 
E
Q
 
G
G
 
G
L
 
T
S
 
S
L
 
I
V
 
V
M
 
M
A
 
V
S
x
T
H
 
H
D
 
E
R
 
R
A
 
E
L
 
L
V
 
A
Q
 
E
R
 
-
L
 
L
G
 
T
A
 
H
E
 
R
E
 
T
I
 
L
R
 
E
L
 
M
A
 
K
E
 
D
G
 
G
R
 
K
I
 
V
L
 
V
G
 
G

8i6rB Cryo-em structure of pseudomonas aeruginosa ftse(e163q)x/envc complex with atp in peptidisc (see paper)
38% identity, 76% coverage: 30:216/245 of query aligns to 28:216/222 of 8i6rB

query
sites
8i6rB
G
 
G
R
 
E
F
 
I
Y
 
L
A
 
F
L
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
H
N
x
S
G
 
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
L
L
 
L
H
 
R
L
 
L
L
 
I
A
 
L
L
 
A
L
 
M
D
 
E
R
 
R
P
 
P
S
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
K
L
 
L
R
 
L
I
 
L
D
 
G
G
 
G
Q
 
Q
S
 
D
L
 
L
P
 
G
G
 
R
-
 
I
S
 
T
N
 
T
R
 
A
H
 
Q
L
 
I
Y
 
P
R
 
F
L
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
Q
I
 
I
T
 
G
L
 
V
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
N
V
 
H
F
 
Q
L
 
L
L
 
L
S
 
T
G
 
D
-
 
R
S
 
T
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
L
G
 
P
L
 
L
K
 
Q
L
 
I
R
 
L
G
 
G
L
 
M
S
 
P
R
 
K
R
 
P
E
 
E
R
 
I
N
 
A
R
 
K
R
 
R
A
 
V
L
 
A
W
 
S
A
 
A
L
 
L
Q
 
E
T
 
R
V
 
V
G
 
N
L
 
L
G
 
K
D
 
E
F
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
A
R
 
L
A
 
P
N
 
S
R
x
D
L
 
L
S
|
S
G
x
T
G
|
G
E
x
Q
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
G
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
L
 
H
K
 
Q
P
 
P
R
 
A
V
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
Q
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
R
S
 
L
A
 
A
A
 
S
A
 
E
F
 
I
E
 
M
G
 
G
L
 
V
L
 
F
A
 
E
G
 
D
L
 
I
R
 
N
D
 
R
Q
 
L
G
 
G
L
 
T
S
 
T
L
 
V
V
 
L
M
 
I
A
 
A
S
 
S
H
 
H
D
 
D
R
 
L
A
 
A
L
 
L
V
 
I
Q
 
A
R
 
R
L
 
M
G
 
R
A
 
H
E
 
R
E
 
M
I
 
L
R
 
T
L
 
L
A
 
Q
E
 
R
G
 
G
R
 
R
I
 
I
L
 
I

Sites not aligning to the query:

P75831 Macrolide export ATP-binding/permease protein MacB; EC 7.6.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
36% identity, 90% coverage: 1:221/245 of query aligns to 1:227/648 of P75831

query
sites
P75831
M
 
M
T
 
T
P
 
P
L
 
L
Y
 
L
E
 
E
L
 
L
S
 
K
D
 
D
I
 
I
E
 
R
H
 
R
H
 
S
R
 
Y
-
 
P
-
 
A
-
 
G
-
 
D
E
 
E
G
 
Q
R
 
V
T
 
E
V
 
V
L
 
L
A
 
K
I
 
G
D
 
I
R
 
S
L
 
L
E
 
D
L
 
I
L
 
Y
P
 
A
G
 
G
R
 
E
F
 
M
Y
 
V
A
 
A
L
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
A
N
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
L
L
 
M
H
 
N
L
 
I
L
 
L
A
 
G
L
 
C
L
 
L
D
 
D
R
 
K
P
 
A
S
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
T
L
 
Y
R
 
R
I
 
V
D
 
A
G
 
G
Q
 
Q
S
 
D
L
 
V
P
 
A
G
 
T
S
 
L
N
 
D
R
 
A
H
 
D
-
 
A
L
 
L
Y
 
A
R
 
Q
L
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
E
-
 
H
I
 
F
T
 
G
L
 
F
V
 
I
H
 
F
Q
 
Q
A
 
R
V
 
Y
F
 
H
L
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
H
S
 
L
V
 
T
A
 
A
D
 
E
-
 
Q
N
 
N
L
 
V
A
 
E
F
 
V
G
 
P
L
 
A
K
 
V
L
 
Y
R
 
A
G
 
G
L
 
L
S
 
E
R
 
R
R
 
K
E
 
Q
R
 
R
N
 
L
R
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
Q
W
 
E
A
 
L
L
 
L
Q
 
Q
T
 
R
V
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
E
D
 
D
F
 
R
G
 
T
E
 
E
R
 
Y
R
 
Y
A
 
P
N
 
A
R
 
Q
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
S
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
M
L
 
N
K
 
G
P
 
G
R
 
Q
V
 
V
L
 
I
L
 
L
L
 
A
D
|
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
S
S
 
H
S
 
S
A
 
G
A
 
E
A
 
E
F
 
V
E
 
M
G
 
A
L
 
I
L
 
L
A
 
H
G
 
Q
L
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
R
G
 
G
L
 
H
S
 
T
L
 
V
V
 
I
M
 
I
A
 
V
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
P
A
 
Q
L
 
V
V
 
A
Q
 
A
R
 
Q
L
 
-
G
 
A
A
 
E
E
 
R
E
 
V
I
 
I
R
 
E
L
 
I
A
 
R
E
 
D
G
 
G
R
 
E
I
 
I
L
 
V
G
 
R
R
 
N
P
 
P
L
 
P
A
 
A

6z4wA Ftse structure from streptococcus pneumoniae in complex with adp (space group p 1) (see paper)
33% identity, 87% coverage: 4:216/245 of query aligns to 3:218/230 of 6z4wA

query
sites
6z4wA
L
 
I
Y
 
I
E
 
E
L
 
M
S
 
R
D
 
D
I
 
V
-
 
V
E
 
K
H
 
K
H
x
Y
R
 
D
E
 
N
G
 
G
R
x
T
T
 
T
V
x
A
L
 
L
A
 
R
I
 
G
D
 
V
R
 
S
L
 
V
E
 
S
L
 
V
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
E
F
 
F
Y
 
A
A
 
Y
L
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
H
 
R
L
 
S
L
 
L
A
 
Y
L
 
R
L
 
E
D
 
V
R
 
K
P
 
I
S
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
S
L
 
L
R
 
S
I
 
V
D
 
A
G
 
G
Q
 
F
S
 
N
L
 
L
P
 
V
G
 
K
-
 
I
S
 
K
N
 
K
R
 
K
H
 
D
L
 
V
Y
 
P
R
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
S
I
 
V
T
 
G
L
 
V
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
D
V
 
Y
F
 
K
L
 
L
L
 
L
-
 
P
S
 
K
G
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
A
L
 
M
K
 
E
L
 
V
R
 
I
G
 
G
L
 
E
S
 
N
R
 
R
R
 
R
E
 
N
R
 
I
N
 
K
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
M
W
 
E
A
 
V
L
 
L
Q
 
D
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
D
 
H
F
 
K
G
 
V
E
 
R
R
 
S
R
 
F
A
 
P
N
 
N
R
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
L
 
N
K
 
N
P
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
D
S
 
N
A
 
S
A
 
W
A
 
E
F
 
I
E
 
M
G
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
R
L
 
I
R
 
N
D
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
T
S
 
T
L
 
I
V
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
N
R
 
S
A
 
Q
L
 
I
V
 
V
Q
 
N
R
 
T
L
 
L
G
 
R
A
 
H
E
 
R
E
 
V
I
 
I
R
 
A
L
 
I
A
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
L
 
V

A0A0H2ZM82 Cell division ATP-binding protein FtsE from Streptococcus pneumoniae serotype 2 (strain D39 / NCTC 7466) (see paper)
33% identity, 87% coverage: 4:216/245 of query aligns to 3:218/230 of A0A0H2ZM82

query
sites
A0A0H2ZM82
L
 
I
Y
 
I
E
 
E
L
 
M
S
 
R
D
 
D
I
 
V
-
 
V
E
 
K
H
 
K
H
 
Y
R
 
D
E
 
N
G
 
G
R
 
T
T
 
T
V
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
G
D
 
V
R
 
S
L
 
V
E
 
S
L
 
V
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
E
F
 
F
Y
 
A
A
 
Y
L
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
|
K
S
 
S
T
 
T
L
 
F
L
 
I
H
 
R
L
 
S
L
 
L
A
 
Y
L
 
R
L
 
E
D
 
V
R
 
K
P
 
I
S
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
S
L
 
L
R
 
S
I
 
V
D
 
A
G
 
G
Q
 
F
S
 
N
L
 
L
P
 
V
G
 
K
-
 
I
S
 
K
N
 
K
R
 
K
H
 
D
L
 
V
Y
 
P
R
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
S
I
 
V
T
 
G
L
 
V
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
D
V
 
Y
F
 
K
L
 
L
L
 
L
-
 
P
S
 
K
G
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
A
L
 
M
K
 
E
L
 
V
R
 
I
G
 
G
L
 
E
S
 
N
R
 
R
R
 
R
E
 
N
R
 
I
N
 
K
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
M
W
 
E
A
 
V
L
 
L
Q
 
D
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
D
 
H
F
 
K
G
 
V
E
 
R
R
 
S
R
 
F
A
 
P
N
 
N
R
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
L
 
N
K
 
N
P
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
A
D
|
D
E
|
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
D
S
 
N
A
 
S
A
 
W
A
 
E
F
 
I
E
 
M
G
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
R
L
 
I
R
 
N
D
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
T
S
 
T
L
 
I
V
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
N
R
 
S
A
 
Q
L
 
I
V
 
V
Q
 
N
R
 
T
L
 
L
G
 
R
A
 
H
E
 
R
E
 
V
I
 
I
R
 
A
L
 
I
A
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
L
 
V

6z67B Ftse structure of streptococcus pneumoniae in complex with amppnp at 2.4 a resolution (see paper)
33% identity, 87% coverage: 4:216/245 of query aligns to 3:218/229 of 6z67B

query
sites
6z67B
L
 
I
Y
 
I
E
 
E
L
 
M
S
 
R
D
 
D
I
 
V
-
 
V
E
 
K
H
 
K
H
x
Y
R
 
D
E
 
N
G
|
G
R
 
T
T
 
T
V
x
A
L
 
L
A
 
R
I
 
G
D
 
V
R
 
S
L
 
V
E
 
S
L
 
V
L
 
Q
P
 
P
G
 
G
R
 
E
F
 
F
Y
 
A
A
 
Y
L
 
I
T
 
V
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
L
 
F
L
 
I
H
 
R
L
 
S
L
 
L
A
 
Y
L
 
R
L
 
E
D
 
V
R
 
K
P
 
I
S
 
D
R
 
K
G
 
G
E
 
S
L
 
L
R
 
S
I
 
V
D
 
A
G
 
G
Q
 
F
S
 
N
L
 
L
P
 
V
G
 
K
-
 
I
S
 
K
N
 
K
R
 
K
H
 
D
L
 
V
Y
 
P
R
 
L
L
 
L
R
 
R
R
 
R
E
 
S
I
 
V
T
 
G
L
 
V
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
D
V
 
Y
F
 
K
L
 
L
L
 
L
-
 
P
S
 
K
G
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
E
N
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
Y
G
 
A
L
 
M
K
 
E
L
 
V
R
 
I
G
 
G
L
 
E
S
 
N
R
 
R
R
 
R
E
 
N
R
 
I
N
 
K
R
 
R
R
 
R
A
 
V
L
 
M
W
 
E
A
 
V
L
 
L
Q
 
D
T
 
L
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
K
D
 
H
F
 
K
G
 
V
E
 
R
R
 
S
R
 
F
A
 
P
N
 
N
R
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
I
A
 
V
L
 
N
K
 
N
P
 
P
R
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
I
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
D
S
 
N
A
 
S
A
 
W
A
 
E
F
 
I
E
 
M
G
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
R
L
 
I
R
 
N
D
 
L
Q
 
Q
G
 
G
L
 
T
S
 
T
L
 
I
V
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
N
R
 
S
A
 
Q
L
 
I
V
 
V
Q
 
N
R
 
T
L
 
L
G
 
R
A
 
H
E
 
R
E
 
V
I
 
I
R
 
A
L
 
I
A
 
E
E
 
N
G
 
G
R
 
R
I
 
V
L
 
V

8igqA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis adp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
35% identity, 84% coverage: 11:216/245 of query aligns to 11:218/227 of 8igqA

query
sites
8igqA
E
 
Q
H
x
Y
H
 
K
R
 
S
E
 
S
G
 
A
R
 
R
T
 
P
V
 
A
L
 
L
A
 
D
I
 
D
D
 
I
R
 
N
L
 
V
E
 
K
L
 
I
L
 
D
P
 
K
G
 
G
R
 
E
F
 
F
Y
 
V
A
 
F
L
 
L
T
 
I
G
 
G
A
 
P
N
 
S
G
|
G
A
x
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
H
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
E
R
 
T
P
 
P
S
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
D
L
 
V
R
 
R
I
 
V
D
 
S
G
 
K
Q
 
F
S
 
H
L
 
V
P
 
N
G
 
K
-
 
L
S
 
R
N
 
G
R
 
R
H
 
H
L
 
V
Y
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
E
 
V
I
 
I
T
 
G
L
 
C
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
D
V
 
F
F
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
-
 
Q
G
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
V
R
 
I
G
 
G
L
 
K
S
 
R
R
 
T
R
 
D
E
 
A
R
 
I
N
 
N
R
 
R
R
 
V
A
 
V
L
 
P
W
 
E
A
 
V
L
 
L
Q
 
E
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
S
D
 
G
F
 
K
G
 
A
E
 
N
R
 
R
R
 
L
A
 
P
N
 
D
R
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
L
 
N
K
 
R
P
 
P
R
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
E
S
 
T
A
 
S
A
 
R
A
 
D
F
 
I
E
 
M
G
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
R
L
 
I
R
 
N
D
 
R
Q
 
T
G
 
G
L
 
T
S
 
T
L
 
V
V
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
H
A
 
H
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
R
 
S
L
 
M
G
 
R
A
 
Q
E
 
R
E
 
V
I
 
V
R
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
L
 
V

8iddA Cryo-em structure of mycobacterium tuberculosis atp bound ftsex/ripc complex in peptidisc (see paper)
35% identity, 84% coverage: 11:216/245 of query aligns to 11:218/225 of 8iddA

query
sites
8iddA
E
 
Q
H
x
Y
H
 
K
R
 
S
E
 
S
G
 
A
R
 
R
T
 
P
V
 
A
L
 
L
A
 
D
I
 
D
D
 
I
R
 
N
L
 
V
E
 
K
L
 
I
L
 
D
P
 
K
G
 
G
R
 
E
F
 
F
Y
 
V
A
 
F
L
 
L
T
 
I
G
 
G
A
 
P
N
x
S
G
 
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
L
 
F
L
 
M
H
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
L
L
 
A
L
 
A
D
 
E
R
 
T
P
 
P
S
 
T
R
 
S
G
 
G
E
 
D
L
 
V
R
 
R
I
 
V
D
 
S
G
 
K
Q
 
F
S
 
H
L
 
V
P
 
N
G
 
K
-
 
L
S
 
R
N
 
G
R
 
R
H
 
H
L
 
V
Y
 
P
R
 
K
L
 
L
R
 
R
R
 
Q
E
 
V
I
 
I
T
 
G
L
 
C
V
 
V
H
 
F
Q
 
Q
A
 
D
V
 
F
F
 
R
L
 
L
L
 
L
S
 
Q
-
 
Q
G
 
K
S
 
T
V
 
V
A
 
Y
D
 
D
N
 
N
L
 
V
A
 
A
F
 
F
G
 
A
L
 
L
K
 
E
L
 
V
R
 
I
G
 
G
L
 
K
S
 
R
R
 
T
R
 
D
E
 
A
R
 
I
N
 
N
R
 
R
R
 
V
A
 
V
L
 
P
W
 
E
A
 
V
L
 
L
Q
 
E
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
L
G
 
S
D
 
G
F
 
K
G
 
A
E
 
N
R
 
R
R
 
L
A
 
P
N
 
D
R
 
E
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
E
 
E
S
 
Q
R
 
Q
R
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
F
A
 
V
L
 
N
K
 
R
P
 
P
R
 
L
V
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
A
D
 
D
E
 
E
P
 
P
T
 
T
T
 
G
G
 
N
L
 
L
D
 
D
E
 
P
S
 
E
S
 
T
A
 
S
A
 
R
A
 
D
F
 
I
E
 
M
G
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
G
 
R
L
 
I
R
 
N
D
 
R
Q
 
T
G
 
G
L
 
T
S
 
T
L
 
V
V
 
L
M
 
M
A
 
A
S
 
T
H
 
H
D
 
D
R
 
H
A
 
H
L
 
I
V
 
V
Q
 
D
R
 
S
L
 
M
G
 
R
A
 
Q
E
 
R
E
 
V
I
 
V
R
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
L
G
 
G
R
 
R
I
 
L
L
 
V

Query Sequence

>WP_092053756.1 NCBI__GCF_900111775.1:WP_092053756.1
MTPLYELSDIEHHREGRTVLAIDRLELLPGRFYALTGANGAGKSTLLHLLALLDRPSRGE
LRIDGQSLPGSNRHLYRLRREITLVHQAVFLLSGSVADNLAFGLKLRGLSRRERNRRALW
ALQTVGLGDFGERRANRLSGGESRRVALARALALKPRVLLLDEPTTGLDESSAAAFEGLL
AGLRDQGLSLVMASHDRALVQRLGAEEIRLAEGRILGRPLAGSTQHRLAVAGSSLCLNPS
KMPER

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory