SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_092057244.1 NCBI__GCF_900111775.1:WP_092057244.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 19 hits to proteins with known functional sites (download)

3oa4A Crystal structure of hypothetical protein bh1468 from bacillus halodurans c-125
48% identity, 95% coverage: 5:131/133 of query aligns to 5:131/138 of 3oa4A

query
sites
3oa4A
I
 
L
N
 
D
H
|
H
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
T
S
 
S
L
 
I
E
 
K
T
 
D
A
 
V
L
 
L
P
 
P
F
 
F
Y
 
Y
R
 
V
D
 
G
V
 
S
L
 
L
G
 
K
M
 
L
P
 
K
F
 
L
E
 
L
G
 
G
T
 
M
E
 
E
E
 
D
V
 
L
A
 
P
E
 
S
Q
 
Q
K
 
G
V
 
V
R
 
K
V
x
I
A
 
A
F
 
F
I
 
L
G
 
E
V
 
I
G
 
G
E
 
E
S
 
S
R
 
K
I
 
I
E
|
E
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
L
S
 
S
P
 
E
D
 
E
S
 
S
P
 
P
V
 
I
A
 
A
K
 
K
F
 
F
L
 
I
E
 
Q
K
 
K
N
 
R
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
I
H
 
H
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
I
Q
 
G
V
 
V
D
 
K
D
 
S
I
 
I
V
 
E
E
 
E
T
 
R
L
 
I
S
 
Q
R
 
E
L
 
V
K
 
K
A
 
E
S
 
N
G
 
G
V
 
V
R
 
Q
L
 
M
I
 
I
D
 
N
E
 
D
S
 
E
P
 
P
R
 
V
H
 
P
G
 
G
A
 
A
H
 
R
H
 
G
S
 
A
L
 
Q
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
R
A
 
S
T
 
A
G
 
R
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
Y
E
|
E
I
 
F
C
 
C
Q
 
E

Q96PE7 Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial; DL-methylmalonyl-CoA racemase; EC 5.1.99.1 from Homo sapiens (Human) (see paper)
42% identity, 95% coverage: 5:131/133 of query aligns to 48:175/176 of Q96PE7

query
sites
Q96PE7
I
 
L
N
 
N
H
|
H
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
P
S
 
D
L
 
L
E
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
A
P
 
A
F
 
F
Y
 
Y
R
 
K
D
 
N
V
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
A
P
 
Q
F
 
V
E
 
S
G
 
E
T
 
A
E
 
V
E
 
P
V
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
H
K
 
G
V
 
V
R
 
S
V
 
V
A
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
N
V
 
L
G
 
G
E
 
N
S
 
T
R
 
K
I
 
M
E
 
E
L
 
L
L
 
L
E
 
H
P
 
P
T
 
L
S
 
G
P
x
R
D
 
D
S
 
S
P
 
P
V
 
I
A
 
A
K
 
G
F
 
F
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
N
 
N
-
 
K
G
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
M
H
 
H
H
|
H
I
 
I
A
 
C
Y
 
I
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
D
 
N
I
 
I
V
 
N
E
 
A
T
 
A
L
 
V
S
 
M
R
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
K
S
 
K
G
 
K
V
 
I
R
 
R
L
 
S
I
 
L
D
 
S
E
 
E
S
 
E
P
 
V
R
 
K
H
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
H
H
 
G
S
 
K
L
 
P
I
 
V
A
 
I
F
 
F
L
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
K
A
 
D
T
 
C
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
V
E
|
E
I
 
L
C
 
E
Q
 
Q

6wf6A Streptomyces coelicolor methylmalonyl-coa epimerase (see paper)
45% identity, 94% coverage: 5:129/133 of query aligns to 5:135/141 of 6wf6A

query
sites
6wf6A
I
 
I
N
 
D
H
|
H
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
C
K
 
H
S
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
A
A
 
T
L
 
V
P
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
V
 
T
L
 
Y
G
 
G
M
 
F
P
 
E
F
 
V
E
 
F
G
 
H
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
N
A
 
E
E
 
E
Q
 
Q
K
 
G
V
 
V
R
 
R
V
x
E
A
 
A
F
 
M
I
 
L
G
 
K
V
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
G
G
 
G
E
 
A
S
 
S
R
 
Y
I
 
L
E
x
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
R
P
 
E
D
 
D
S
 
S
P
 
A
V
 
V
A
 
G
K
 
K
F
 
W
L
 
L
E
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
H
 
H
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
Q
 
G
V
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
D
E
 
A
T
 
D
L
 
A
S
 
A
R
 
D
L
 
I
K
 
R
A
 
D
S
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
 
L
D
 
Y
E
 
D
S
 
E
P
 
P
R
 
R
H
 
R
G
 
G
A
 
S
H
 
M
H
 
G
S
 
S
L
 
R
I
 
I
A
 
T
F
 
F
L
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
K
A
 
D
T
 
C
G
 
H
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
T
E
|
E
I
 
L

6wfhA Streptomyces coelicolor methylmalonyl-coa epimerase substrate complex (see paper)
45% identity, 94% coverage: 5:129/133 of query aligns to 5:135/139 of 6wfhA

query
sites
6wfhA
I
 
I
N
 
D
H
|
H
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
C
K
 
H
S
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
A
A
 
T
L
 
V
P
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
V
 
T
L
 
Y
G
 
G
M
 
F
P
 
E
F
 
V
E
 
F
G
 
H
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
N
A
 
E
E
 
E
Q
|
Q
K
 
G
V
 
V
R
 
R
V
x
E
A
 
A
F
 
M
I
 
L
G
 
K
V
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
G
G
 
G
E
 
A
S
 
S
R
 
Y
I
 
L
E
x
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
R
P
 
E
D
 
D
S
 
S
P
x
A
V
 
V
A
 
G
K
|
K
F
x
W
L
 
L
E
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
H
|
H
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
Q
 
G
V
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
D
E
 
A
T
 
D
L
 
A
S
 
A
R
 
D
L
 
I
K
 
R
A
 
D
S
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
x
L
D
 
Y
E
 
D
S
 
E
P
 
P
R
 
R
H
 
R
G
|
G
A
x
S
H
 
M
H
 
G
S
 
S
L
 
R
I
 
I
A
 
T
F
|
F
L
 
L
H
 
H
P
|
P
K
|
K
A
 
D
T
 
C
G
 
H
G
 
G
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
|
E
I
 
L

6xbqA Streptomyces coelicolor methylmalonyl-coa epimerase in complex with carboxy-carba(dethia)-coa
45% identity, 94% coverage: 5:129/133 of query aligns to 5:135/144 of 6xbqA

query
sites
6xbqA
I
 
I
N
 
D
H
|
H
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
C
K
 
H
S
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
A
A
 
T
L
 
V
P
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
V
 
T
L
 
Y
G
 
G
M
 
F
P
 
E
F
 
V
E
 
F
G
 
H
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
N
A
 
E
E
 
E
Q
|
Q
K
 
G
V
 
V
R
 
R
V
x
E
A
 
A
F
 
M
I
 
L
G
 
K
V
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
G
G
 
G
E
 
A
S
 
S
R
 
Y
I
 
L
E
x
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
R
P
 
E
D
 
D
S
 
S
P
x
A
V
 
V
A
 
G
K
|
K
F
x
W
L
 
L
E
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
H
|
H
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
Q
 
G
V
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
D
E
 
A
T
 
D
L
 
A
S
 
A
R
 
D
L
 
I
K
 
R
A
 
D
S
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
x
L
D
 
Y
E
 
D
S
 
E
P
 
P
R
 
R
H
 
R
G
 
G
A
 
S
H
 
M
H
 
G
S
 
S
L
 
R
I
 
I
A
 
T
F
|
F
L
 
L
H
 
H
P
|
P
K
|
K
A
 
D
T
 
C
G
 
H
G
 
G
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
|
E
I
 
L

6wfiA Methylmalonyl-coa epimerase in complex with 2-nitronate-propionyl-coa (see paper)
45% identity, 94% coverage: 5:129/133 of query aligns to 5:135/144 of 6wfiA

query
sites
6wfiA
I
 
I
N
 
D
H
|
H
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
C
K
 
H
S
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
A
A
 
T
L
 
V
P
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
V
 
T
L
 
Y
G
 
G
M
 
F
P
 
E
F
 
V
E
 
F
G
 
H
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
N
A
 
E
E
 
E
Q
|
Q
K
 
G
V
 
V
R
 
R
V
x
E
A
 
A
F
 
M
I
 
L
G
 
K
V
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
G
G
 
G
E
 
A
S
 
S
R
 
Y
I
 
L
E
x
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
R
P
 
E
D
 
D
S
 
S
P
x
A
V
 
V
A
 
G
K
|
K
F
x
W
L
 
L
E
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
H
|
H
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
Q
 
G
V
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
D
E
 
A
T
 
D
L
 
A
S
 
A
R
 
D
L
 
I
K
 
R
A
 
D
S
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
x
L
D
 
Y
E
 
D
S
 
E
P
 
P
R
 
R
H
 
R
G
|
G
A
x
S
H
 
M
H
 
G
S
 
S
L
 
R
I
|
I
A
 
T
F
|
F
L
 
L
H
 
H
P
|
P
K
 
K
A
 
D
T
 
C
G
 
H
G
 
G
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
|
E
I
 
L

6wf7A Methylmalonyl-coa epimerase in complex with methylmalonyl-coa and nh4+ (see paper)
45% identity, 94% coverage: 5:129/133 of query aligns to 5:135/144 of 6wf7A

query
sites
6wf7A
I
 
I
N
 
D
H
|
H
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
C
K
 
H
S
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
A
A
 
T
L
 
V
P
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
V
 
T
L
 
Y
G
 
G
M
 
F
P
 
E
F
 
V
E
 
F
G
 
H
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
N
A
 
E
E
 
E
Q
|
Q
K
 
G
V
 
V
R
 
R
V
x
E
A
 
A
F
 
M
I
 
L
G
 
K
V
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
G
G
 
G
E
 
A
S
 
S
R
 
Y
I
 
L
E
x
Q
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
R
P
 
E
D
 
D
S
 
S
P
x
A
V
 
V
A
 
G
K
 
K
F
x
W
L
 
L
E
 
A
K
 
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
H
|
H
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
Q
 
G
V
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
D
E
 
A
T
 
D
L
 
A
S
 
A
R
 
D
L
 
I
K
 
R
A
 
D
S
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
x
L
D
 
Y
E
 
D
S
 
E
P
 
P
R
 
R
H
 
R
G
|
G
A
x
S
H
 
M
H
 
G
S
 
S
L
 
R
I
|
I
A
 
T
F
|
F
L
 
L
H
 
H
P
|
P
K
|
K
A
 
D
T
 
C
G
 
H
G
 
G
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
|
E
I
 
L

6xbtA Streptomyces coelicolor methylmalonyl-coa epimerase (q60a) in complex with 2-nitronate-propionyl-coa
45% identity, 94% coverage: 5:129/133 of query aligns to 5:135/140 of 6xbtA

query
sites
6xbtA
I
 
I
N
 
D
H
|
H
I
 
I
G
 
G
I
 
I
A
 
A
V
 
C
K
 
H
S
 
D
L
 
L
E
 
D
T
 
A
A
 
T
L
 
V
P
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
A
V
 
T
L
 
Y
G
 
G
M
 
F
P
 
E
F
 
V
E
 
F
G
 
H
T
 
T
E
 
E
E
 
V
V
 
N
A
 
E
E
 
E
Q
|
Q
K
 
G
V
 
V
R
 
R
V
x
E
A
 
A
F
 
M
I
 
L
G
 
K
V
 
I
-
 
N
-
 
D
-
 
T
-
 
S
-
 
D
-
 
G
G
 
G
E
 
A
S
 
S
R
 
Y
I
 
L
E
x
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
R
P
 
E
D
 
D
S
 
S
P
x
A
V
 
V
A
 
G
K
|
K
F
x
W
L
 
L
E
 
A
K
|
K
N
 
N
G
 
G
E
 
E
G
 
G
V
 
V
H
|
H
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
Q
 
G
V
 
T
D
 
A
D
 
D
I
 
V
V
 
D
E
 
A
T
 
D
L
 
A
S
 
A
R
 
D
L
 
I
K
 
R
A
 
D
S
 
K
G
 
G
V
 
V
R
 
R
L
 
V
I
x
L
D
 
Y
E
 
D
S
 
E
P
 
P
R
 
R
H
 
R
G
|
G
A
x
S
H
 
M
H
 
G
S
 
S
L
 
R
I
 
I
A
 
T
F
|
F
L
 
L
H
 
H
P
|
P
K
|
K
A
 
D
T
 
C
G
 
H
G
 
G
V
 
V
L
|
L
T
 
T
E
|
E
I
 
L

6qh4C Crystal structure of human methylmalonyl-coa epimerase (mcee) p.Arg143cys variant
41% identity, 98% coverage: 1:131/133 of query aligns to 8:137/138 of 6qh4C

query
sites
6qh4C
M
 
M
T
 
L
K
 
G
L
 
R
I
 
L
N
 
N
H
|
H
I
 
V
G
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
V
K
 
P
S
 
D
L
 
L
E
 
E
T
 
K
A
 
A
L
 
A
P
 
A
F
 
F
Y
 
Y
R
 
K
D
 
N
V
 
I
L
 
L
G
 
G
M
 
A
P
 
Q
F
 
V
E
 
S
G
 
E
T
 
A
E
 
V
E
 
P
V
 
L
A
 
P
E
 
E
Q
 
H
K
 
G
V
 
V
R
 
S
V
|
V
A
 
V
F
 
F
I
 
V
G
 
N
V
 
L
G
 
G
E
 
N
S
 
T
R
 
K
I
 
M
E
|
E
L
 
L
L
 
L
E
 
H
P
 
P
T
 
L
S
 
G
P
 
L
D
 
D
S
 
S
P
 
P
V
 
I
A
 
A
K
 
G
F
 
F
L
 
L
E
 
Q
K
 
K
N
 
N
-
 
K
G
 
A
E
 
G
G
 
G
V
 
M
H
 
H
H
|
H
I
 
I
A
 
C
Y
 
I
Q
 
E
V
 
V
D
 
D
D
 
N
I
 
I
V
 
N
E
 
A
T
 
A
L
 
V
S
 
M
R
 
D
L
 
L
K
 
K
A
 
K
S
 
K
G
 
-
V
 
-
R
 
K
L
 
I
I
 
C
D
 
S
E
 
L
S
 
S
P
 
V
R
 
K
H
 
I
G
 
G
A
 
A
H
 
H
H
 
G
S
 
K
L
 
P
I
 
V
A
 
I
F
 
F
L
 
L
H
 
H
P
 
P
K
 
K
A
 
D
T
 
C
G
 
G
G
 
G
V
 
V
L
 
L
T
 
V
E
|
E
I
 
L
C
 
E
Q
 
Q

2qh0A Crystal structure of a glyoxalase from clostridium acetobutylicum
33% identity, 89% coverage: 5:123/133 of query aligns to 4:122/129 of 2qh0A

query
sites
2qh0A
I
 
V
N
 
H
H
|
H
I
 
I
G
 
G
I
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
 
K
S
 
N
L
 
I
E
 
D
T
 
S
A
 
A
L
 
L
P
 
K
F
 
K
Y
 
F
R
 
K
D
 
R
V
 
-
L
 
L
G
 
G
M
 
Y
P
 
-
F
 
V
E
 
E
G
 
E
T
 
S
E
 
E
E
 
V
V
 
V
A
 
R
E
 
D
Q
 
E
-
 
V
-
 
R
K
 
K
V
 
V
R
 
Y
V
 
I
A
 
Q
F
 
F
I
 
V
G
 
I
V
 
N
G
 
G
E
 
G
S
 
Y
R
 
R
I
 
V
E
|
E
L
 
L
L
 
V
E
 
A
P
 
P
T
 
D
S
 
G
P
 
E
D
 
D
S
 
S
P
 
P
V
 
I
A
 
N
K
 
K
F
 
T
L
 
I
E
 
K
K
 
K
N
 
-
G
 
G
E
 
S
G
 
T
V
 
P
H
 
Y
H
|
H
I
 
I
A
 
C
Y
 
Y
Q
 
E
V
 
V
D
 
E
D
 
D
I
 
I
V
 
Q
E
 
K
T
 
S
L
 
I
S
 
E
R
 
E
L
 
M
K
 
S
A
 
Q
S
 
I
G
 
G
V
 
Y
R
 
T
L
 
L
I
 
F
D
 
K
E
 
K
S
 
A
P
 
E
R
 
I
H
 
A
G
 
P
A
 
A
-
 
I
H
 
D
H
 
N
S
 
R
L
 
K
I
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
F
P
 
S
K
 
T
A
 
D
T
 
I
G
 
G

Sites not aligning to the query:

3zgjB S221m v223f y359a mutant of 4-hydroxymandelate synthase from streptomyces coelicolor (see paper)
32% identity, 83% coverage: 4:114/133 of query aligns to 158:274/343 of 3zgjB

query
sites
3zgjB
L
 
L
I
 
L
N
 
D
H
|
H
I
 
V
G
 
A
I
 
V
A
 
C
V
 
L
K
 
E
S
 
S
-
 
G
-
 
T
L
 
L
E
 
R
T
 
S
A
 
T
L
 
A
P
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
E
D
 
A
V
 
A
L
 
F
G
 
D
M
 
M
P
 
P
F
 
Y
E
 
Y
G
 
S
T
 
S
E
 
E
-
 
Y
-
 
I
E
 
E
V
 
V
A
 
G
E
 
E
Q
 
Q
K
 
A
V
 
M
R
 
D
V
 
M
A
 
I
F
 
F
I
 
V
-
 
R
-
 
N
G
 
A
V
 
G
G
 
G
E
 
G
S
 
I
R
 
T
I
 
F
E
x
T
L
 
L
L
x
I
E
 
E
P
 
P
T
 
D
S
 
D
P
 
T
D
 
R
S
 
V
P
 
P
-
 
G
-
 
Q
V
 
I
A
 
D
K
 
Q
F
 
F
L
 
L
E
 
S
K
 
A
-
 
H
N
 
D
G
 
G
E
 
P
G
 
G
V
 
V
H
 
Q
H
|
H
I
 
L
A
 
A
Y
 
F
Q
 
L
V
 
V
D
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
V
E
 
G
T
 
S
L
 
V
S
 
R
R
 
S
L
 
L
K
 
G
A
 
D
S
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
A
L
 
F
I
 
L
D
 
-
E
 
R
S
 
T
P
 
P
R
 
-
H
 
-
G
 
G
A
 
A
H
 
Y
H
 
Y
S
 
D
L
 
L
I
 
L

Sites not aligning to the query:

4mttA Ni- and zn-bound gloa2 at low resolution (see paper)
31% identity, 97% coverage: 5:133/133 of query aligns to 3:127/128 of 4mttA

query
sites
4mttA
I
 
I
N
 
L
H
|
H
I
 
S
G
 
M
I
 
L
A
 
R
V
 
V
K
 
A
S
 
D
L
 
L
E
 
E
T
 
A
A
 
A
L
 
L
P
 
E
F
 
F
Y
 
Y
R
 
T
D
 
R
V
 
A
L
 
L
G
 
D
M
 
M
P
 
R
F
 
L
E
 
L
G
 
R
T
 
R
E
 
R
E
 
D
V
 
Y
A
 
P
E
 
E
Q
 
G
K
 
R
V
 
F
R
 
T
V
 
L
A
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
G
V
 
Y
G
 
Q
E
 
D
S
 
E
R
 
R
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
A
I
 
L
E
|
E
L
 
L
L
 
T
E
 
H
P
 
N
T
 
W
S
 
D
P
 
R
D
 
D
S
 
G
P
 
Y
V
 
T
A
 
-
K
 
-
F
 
-
L
 
-
E
 
-
K
 
-
N
 
Q
G
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
Y
H
 
G
H
|
H
I
 
L
A
 
A
Y
 
I
Q
 
E
V
 
V
D
 
E
D
 
D
I
 
A
V
 
A
E
 
V
T
 
T
L
 
C
S
 
A
R
 
R
L
 
A
K
 
R
A
 
A
S
 
L
G
 
G
V
 
Y
R
 
R
L
 
V
I
 
T
D
 
R
E
 
E
S
 
A
P
 
G
-
 
L
-
 
M
R
 
Q
H
 
H
G
 
G
A
 
-
H
 
-
H
 
R
S
 
S
L
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
L
H
 
E
P
 
D
K
 
P
A
 
-
T
 
-
G
 
D
G
 
G
V
 
Y
L
 
K
T
 
V
E
|
E
I
 
L
C
 
I
Q
 
Q
P
 
K
G
 
G

1fa6A Crystal structure of the co(ii)-bound glyoxalase i of escherichia coli (see paper)
29% identity, 83% coverage: 7:117/133 of query aligns to 5:113/128 of 1fa6A

query
sites
1fa6A
H
|
H
I
 
T
G
 
M
I
 
L
A
 
R
V
 
V
K
 
G
S
 
D
L
 
L
E
 
Q
T
 
R
A
 
S
L
 
I
P
 
D
F
 
F
Y
 
Y
R
 
T
D
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
K
F
 
L
E
 
L
G
 
R
T
 
T
E
 
S
E
 
E
V
 
N
A
 
P
E
 
E
Q
 
Y
K
 
K
V
 
Y
R
 
S
V
 
L
A
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
G
V
 
Y
G
 
G
E
 
P
S
 
E
R
 
T
I
 
E
E
 
E
L
 
A
L
 
V
E
 
I
P
x
E
T
 
L
S
 
T
P
 
Y
D
 
N
S
 
W
P
 
G
V
 
V
A
 
D
K
 
K
F
 
Y
L
 
-
E
 
-
K
 
E
N
 
L
G
 
G
E
 
T
G
 
A
V
 
Y
H
 
G
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
L
Q
 
S
V
 
V
D
 
D
D
 
N
I
 
A
V
 
A
E
 
E
T
 
A
L
 
C
S
 
E
R
 
K
L
 
I
K
 
R
A
 
Q
S
 
N
G
 
G
V
 
G
R
 
N
L
 
V
I
 
T
D
 
R
E
 
E
S
 
A
P
 
G
R
 
P
H
 
V
G
 
K
A
 
G
H
 
G
H
 
T
S
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
V

Sites not aligning to the query:

1fa5A Crystal structure of the zn(ii)-bound glyoxalase i of escherichia coli (see paper)
29% identity, 83% coverage: 7:117/133 of query aligns to 5:113/128 of 1fa5A

query
sites
1fa5A
H
|
H
I
 
T
G
 
M
I
 
L
A
 
R
V
 
V
K
 
G
S
 
D
L
 
L
E
 
Q
T
 
R
A
 
S
L
 
I
P
 
D
F
 
F
Y
 
Y
R
 
T
D
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
K
F
 
L
E
 
L
G
 
R
T
 
T
E
 
S
E
 
E
V
 
N
A
 
P
E
 
E
Q
 
Y
K
 
K
V
 
Y
R
 
S
V
 
L
A
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
G
V
 
Y
G
 
G
E
 
P
S
 
E
R
 
T
I
 
E
E
 
E
L
 
A
L
 
V
E
 
I
P
x
E
T
 
L
S
 
T
P
 
Y
D
 
N
S
 
W
P
 
G
V
 
V
A
 
D
K
 
K
F
 
Y
L
 
-
E
 
-
K
 
E
N
 
L
G
 
G
E
 
T
G
 
A
V
 
Y
H
 
G
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
L
Q
 
S
V
 
V
D
 
D
D
 
N
I
 
A
V
 
A
E
 
E
T
 
A
L
 
C
S
 
E
R
 
K
L
 
I
K
 
R
A
 
Q
S
 
N
G
 
G
V
 
G
R
 
N
L
 
V
I
 
T
D
 
R
E
 
E
S
 
A
P
 
G
R
 
P
H
 
V
G
 
K
A
 
G
H
 
G
H
 
T
S
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
V

Sites not aligning to the query:

P0AC81 Lactoylglutathione lyase; Aldoketomutase; Glyoxalase I; Glx I; Ketone-aldehyde mutase; Methylglyoxalase; S-D-lactoylglutathione methylglyoxal lyase; EC 4.4.1.5 from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
29% identity, 83% coverage: 7:117/133 of query aligns to 5:113/135 of P0AC81

query
sites
P0AC81
H
|
H
I
 
T
G
 
M
I
 
L
A
 
R
V
 
V
K
 
G
S
 
D
L
 
L
E
 
Q
T
 
R
A
 
S
L
 
I
P
 
D
F
 
F
Y
 
Y
R
 
T
D
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
M
P
 
K
F
 
L
E
 
L
G
 
R
T
 
T
E
 
S
E
 
E
V
 
N
A
 
P
E
 
E
Q
 
Y
K
 
K
V
 
Y
R
 
S
V
 
L
A
 
A
F
 
F
I
 
V
G
 
G
V
 
Y
G
 
G
E
 
P
S
 
E
R
 
T
I
 
E
E
 
E
L
 
A
L
 
V
E
 
I
P
x
E
T
 
L
S
 
T
P
 
Y
D
 
N
S
 
W
P
 
G
V
 
V
A
 
D
K
 
K
F
 
Y
L
 
-
E
 
-
K
 
E
N
 
L
G
 
G
E
 
T
G
 
A
V
 
Y
H
 
G
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
L
Q
 
S
V
 
V
D
 
D
D
 
N
I
 
A
V
 
A
E
 
E
T
 
A
L
 
C
S
 
E
R
 
K
L
 
I
K
 
R
A
 
Q
S
 
N
G
 
G
V
 
G
R
 
N
L
 
V
I
 
T
D
 
R
E
 
E
S
 
A
P
 
G
R
 
P
H
 
V
G
 
K
A
 
G
H
 
G
H
 
T
S
 
T
L
 
V
I
 
I
A
 
A
F
 
F
L
 
V

Sites not aligning to the query:

7yvvA Acmp1, r-4-hydroxymandelate synthase
30% identity, 73% coverage: 5:101/133 of query aligns to 147:252/335 of 7yvvA

query
sites
7yvvA
I
 
I
N
 
D
H
|
H
I
 
F
G
 
A
I
 
V
A
 
C
V
 
V
K
 
E
S
 
H
-
 
G
-
 
H
L
 
L
E
 
D
T
 
A
A
 
T
L
 
V
P
 
D
F
 
F
Y
 
Y
R
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
M
 
F
P
 
E
F
 
L
E
 
I
G
 
F
T
 
A
E
 
E
E
 
T
V
 
I
A
 
A
-
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
Q
E
 
A
Q
 
M
K
 
T
V
 
T
R
 
K
V
 
V
A
 
V
F
 
Q
I
 
S
G
 
K
V
 
S
G
 
G
E
 
S
S
 
V
R
 
T
I
 
F
E
 
T
L
 
L
L
 
I
E
 
E
P
 
P
T
 
D
S
 
T
P
 
S
D
 
K
S
 
D
P
 
P
-
 
G
-
 
H
V
 
I
A
 
D
K
 
D
F
 
F
L
 
L
E
 
K
K
 
D
N
 
H
G
 
G
-
 
G
E
 
A
G
 
G
V
 
V
H
 
Q
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
Q
 
T
V
 
S
D
 
N
D
 
G
I
 
I
V
 
I
E
 
E
T
 
A
L
 
V
S
 
D
R
 
V
L
 
L
K
 
R
A
 
D
S
 
R
G
 
G
V
 
V
R
 
E
L
 
F
I
 
M

Sites not aligning to the query:

5hmqD Xylose isomerase-like tim barrel/4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase fusion protein
31% identity, 74% coverage: 5:102/133 of query aligns to 441:542/624 of 5hmqD

query
sites
5hmqD
I
 
I
N
 
D
H
|
H
I
 
M
G
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
L
-
 
P
-
 
A
K
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
D
T
 
S
A
 
W
L
 
V
P
 
L
F
 
F
Y
 
Y
R
 
K
D
 
S
V
 
L
L
 
F
G
 
D
M
 
-
P
 
-
F
 
F
E
 
A
G
 
A
T
 
D
E
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
L
Q
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
V
K
 
K
V
 
S
R
 
R
V
 
A
A
 
L
F
 
R
I
 
S
G
 
Q
V
 
C
G
 
G
E
 
T
S
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
P
L
 
L
L
 
N
E
 
I
P
 
S
T
 
E
S
 
N
P
 
R
D
 
N
S
 
T
P
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
H
F
 
A
L
 
L
E
 
S
K
 
S
-
 
Y
N
 
R
G
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
H
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
Q
 
D
V
 
C
D
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
F
E
 
R
T
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
R
L
 
A
K
 
K
A
 
L
S
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
P
L
 
L
I
 
L
D
 
E

Sites not aligning to the query:

2r5vA Hydroxymandelate synthase crystal structure (see paper)
27% identity, 79% coverage: 5:109/133 of query aligns to 5:107/346 of 2r5vA

query
sites
2r5vA
I
 
I
N
 
D
H
 
Y
I
 
V
G
 
E
I
 
M
A
 
Y
V
 
V
K
 
E
S
 
N
L
 
L
E
 
E
T
 
V
A
 
A
L
 
A
P
 
F
F
 
S
Y
 
W
R
 
V
D
 
D
V
 
K
L
 
Y
G
 
A
M
 
F
P
 
A
F
 
V
E
 
A
G
 
G
T
 
T
E
 
S
E
 
R
V
 
S
A
 
A
E
 
D
Q
 
H
K
 
-
V
 
-
R
 
R
V
 
S
A
 
I
F
 
A
I
 
L
G
 
R
V
 
Q
G
 
G
E
 
Q
S
 
V
R
 
T
I
 
L
E
 
V
L
 
L
L
 
T
E
 
E
P
 
P
T
 
T
S
 
S
P
 
D
D
 
R
S
 
H
P
 
P
V
 
A
A
 
A
K
 
A
F
 
Y
L
 
L
E
 
Q
K
 
T
N
 
H
G
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
V
H
 
A
H
 
D
I
 
I
A
 
A
Y
 
M
Q
 
A
V
 
T
D
 
S
D
 
D
I
 
V
V
 
A
E
 
A
T
 
A
L
 
Y
S
 
E
R
 
A
L
 
A
K
 
V
A
 
R
S
 
A
G
 
G
V
 
A
R
 
E
L
 
A
I
 
V
D
 
R
E
 
A
S
 
P
P
 
G
R
 
Q
H
 
H
G
 
S
A
 
A

Sites not aligning to the query:

Q88JU3 3-dehydroshikimate dehydratase; DSD; EC 4.2.1.118 from Pseudomonas putida (strain ATCC 47054 / DSM 6125 / CFBP 8728 / NCIMB 11950 / KT2440) (see paper)
30% identity, 74% coverage: 5:102/133 of query aligns to 441:545/635 of Q88JU3

query
sites
Q88JU3
I
 
I
N
 
D
H
|
H
I
 
M
G
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
L
-
 
P
-
 
A
K
 
E
S
 
S
L
 
L
E
 
D
T
 
S
A
 
W
L
 
V
P
 
L
F
 
F
Y
 
Y
R
 
K
D
 
S
V
 
L
L
 
F
G
 
D
M
 
-
P
 
-
F
 
F
E
 
A
G
 
A
T
 
D
E
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
V
E
 
L
Q
 
P
-
 
D
-
 
P
-
 
Y
-
 
G
-
 
L
-
 
V
K
 
K
V
 
S
R
 
R
V
 
A
A
 
L
F
 
R
I
 
S
G
 
Q
V
 
C
G
 
G
E
 
T
S
 
L
R
 
R
I
 
L
E
 
P
L
 
L
L
 
N
E
 
I
P
 
S
T
 
E
S
 
N
P
 
R
D
 
N
S
 
T
P
 
A
V
 
I
A
 
A
K
 
H
F
 
A
L
 
L
E
 
S
K
 
S
-
 
Y
N
 
R
G
 
G
E
 
S
G
 
G
V
 
V
H
 
H
H
|
H
I
 
I
A
 
A
Y
 
F
Q
 
D
V
 
C
D
 
D
D
 
D
I
 
I
V
 
F
E
 
R
T
 
E
L
 
V
S
 
A
R
 
R
L
 
A
K
 
K
A
 
L
S
 
A
G
 
G
V
 
V
R
 
P
L
 
L
I
 
L
D
 
E

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_092057244.1 NCBI__GCF_900111775.1:WP_092057244.1
MTKLINHIGIAVKSLETALPFYRDVLGMPFEGTEEVAEQKVRVAFIGVGESRIELLEPTS
PDSPVAKFLEKNGEGVHHIAYQVDDIVETLSRLKASGVRLIDESPRHGAHHSLIAFLHPK
ATGGVLTEICQPG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory