SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_092482437.1 NCBI__GCF_900115975.1:WP_092482437.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8ipsB Cryo-em structure of heme transporter cyddc from escherichia coli in the inward facing heme loading state (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:570/576 of query aligns to 9:582/588 of 8ipsB

query
sites
8ipsB
M
 
L
D
 
T
K
 
R
R
 
W
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
E
 
Q
A
 
S
G
 
V
A
 
I
V
 
S
R
 
Q
S
 
R
F
 
W
L
 
L
A
 
N
L
 
I
S
 
S
V
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
I
I
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
S
 
W
Y
 
F
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
L
N
 
Q
R
 
H
V
 
M
S
 
I
L
 
M
E
 
E
G
 
N
Q
 
I
S
 
P
L
 
R
S
 
E
G
 
A
V
 
L
W
 
L
P
 
L
W
 
P
L
 
F
Y
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
V
G
 
L
V
 
T
I
 
F
I
 
V
F
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
V
T
 
V
W
 
W
M
 
L
G
 
R
E
 
E
V
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
Y
R
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
Q
 
H
I
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
W
A
 
I
G
 
Q
G
 
G
E
 
K
R
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
W
V
 
A
N
 
T
A
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
Q
I
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
M
D
 
H
A
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
V
F
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
L
 
S
D
 
N
T
 
W
I
 
A
S
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
G
T
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
F
M
 
M
F
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
M
W
 
G
A
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
A
S
 
N
Q
 
R
R
 
R
Q
 
N
W
 
F
E
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
L
S
 
S
A
 
G
H
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
L
 
M
T
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
E
S
 
A
Q
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
S
I
 
I
G
 
R
Q
 
S
I
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
T
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
R
V
 
L
A
 
A
F
|
F
L
 
L
S
 
S
A
x
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
A
 
T
T
 
S
I
 
L
S
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
F
G
 
G
L
 
F
-
 
S
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
D
Y
 
F
A
 
G
H
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
T
-
 
G
I
 
V
P
 
T
F
 
L
E
 
A
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
F
 
L
L
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
D
L
 
L
G
|
G
S
 
T
H
 
F
F
x
Y
H
|
H
A
 
A
G
 
K
L
 
A
M
 
Q
G
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
S
I
 
L
F
 
K
A
 
T
I
 
F
L
 
M
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
A
-
 
H
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
E
C
 
A
H
 
E
L
 
L
S
 
A
H
 
L
D
 
T
P
 
D
S
 
P
F
 
L
Q
 
T
I
 
I
A
 
E
F
 
A
E
 
E
D
 
D
V
 
L
H
 
F
Y
 
I
A
 
T
F
 
S
E
 
P
D
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
-
P
 
-
A
 
T
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
-
 
P
I
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
T
L
 
L
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
V
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
S
A
 
L
A
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
L
L
 
S
Q
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
S
P
 
Y
D
 
-
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
I
 
L
T
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
E
L
 
L
D
 
R
R
 
D
I
 
L
P
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
H
 
H
I
 
L
A
 
S
L
 
W
V
 
V
P
 
G
Q
 
Q
K
 
N
P
 
P
Y
 
Q
F
 
L
F
 
P
Y
 
A
G
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
N
I
 
V
R
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
S
L
 
E
E
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
A
G
 
W
A
 
V
H
 
S
Q
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
P
D
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
Q
G
 
A
I
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
N
N
 
P
A
 
C
P
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
A
V
 
H
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
N
R
 
A
L
 
A
M
 
S
Q
 
L
G
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
M
I
 
V
A
 
T
H
 
H
R
 
Q
L
 
L
N
 
E
T
 
D
V
 
L
H
 
A
R
 
D
A
 
W
D
 
D
R
 
V
I
 
I
I
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
H
 
Y
K
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
S
E
 
V
Q
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
P
Y
 
F
H
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
L
A
 
A

7zdfD If(heme/confined) conformation of cyddc in amp-pnp(cydd) bound state (dataset-4) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:570/576 of query aligns to 7:580/586 of 7zdfD

query
sites
7zdfD
M
 
L
D
 
T
K
 
R
R
 
W
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
E
 
Q
A
 
S
G
 
V
A
 
I
V
 
S
R
 
Q
S
 
R
F
 
W
L
 
L
A
 
N
L
 
I
S
 
S
V
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
I
I
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
S
 
W
Y
 
F
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
L
N
 
Q
R
 
H
V
 
M
S
 
I
L
 
M
E
 
E
G
 
N
Q
 
I
S
 
P
L
 
R
S
 
E
G
 
A
V
 
L
W
 
L
P
 
L
W
 
P
L
 
F
Y
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
V
G
 
L
V
 
T
I
 
F
I
 
V
F
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
V
T
 
V
W
 
W
M
 
L
G
 
R
E
 
E
V
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
Y
R
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
Q
 
H
I
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
W
A
 
I
G
 
Q
G
 
G
E
 
K
R
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
W
V
 
A
N
 
T
A
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
Q
I
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
M
D
 
H
A
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
V
F
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
L
 
S
D
 
N
T
 
W
I
 
A
S
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
G
T
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
F
M
 
M
F
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
M
W
 
G
A
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
A
S
x
N
Q
 
R
R
 
R
Q
 
N
W
x
F
E
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
L
S
 
S
A
 
G
H
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
L
 
M
T
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
E
S
 
A
Q
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
S
I
 
I
G
 
R
Q
 
S
I
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
T
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
R
V
 
L
A
 
A
F
|
F
L
 
L
S
 
S
A
x
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
A
 
T
T
 
S
I
 
L
S
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
F
G
 
G
L
 
F
-
 
S
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
D
Y
 
F
A
 
G
H
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
T
-
 
G
I
 
V
P
 
T
F
 
L
E
 
A
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
F
 
L
L
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
D
L
 
L
G
|
G
S
x
T
H
 
F
F
x
Y
H
|
H
A
 
A
G
 
K
L
 
A
M
 
Q
G
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
S
I
 
L
F
 
K
A
 
T
I
 
F
L
 
M
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
A
-
 
H
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
E
C
 
A
H
 
E
L
 
L
S
 
A
H
 
S
D
 
T
P
 
D
S
 
P
F
 
V
Q
 
T
I
 
I
A
 
E
F
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
L
H
 
F
Y
 
I
A
 
T
F
x
S
E
 
P
D
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
-
P
 
-
A
 
T
L
|
L
Q
 
A
G
 
G
-
 
P
I
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
T
L
 
L
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
V
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
x
S
A
 
L
A
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
L
L
 
S
Q
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
S
P
 
Y
D
 
-
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
I
 
L
T
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
E
L
 
L
D
 
R
R
 
D
I
 
L
P
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
H
 
H
I
 
L
A
 
S
L
 
W
V
 
V
P
 
G
Q
|
Q
K
 
N
P
 
P
Y
 
Q
F
 
L
F
 
P
Y
 
A
G
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
N
I
 
V
R
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
S
L
 
E
E
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
A
G
 
W
A
 
V
H
 
S
Q
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
P
D
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
Q
G
 
A
I
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
N
N
 
P
A
 
C
P
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
A
V
 
H
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
N
R
 
A
L
 
A
M
 
S
Q
 
L
G
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
M
I
 
V
A
 
T
H
 
H
R
 
Q
L
 
L
N
 
E
T
 
D
V
 
L
H
 
A
R
 
D
A
 
W
D
 
D
R
 
V
I
 
I
I
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
H
 
Y
K
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
S
E
 
V
Q
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
P
Y
 
F
H
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
L
A
 
A

7zdcD If(heme/confined) conformation of cyddc in adp(cydd) bound state (dataset-3) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:570/576 of query aligns to 7:580/586 of 7zdcD

query
sites
7zdcD
M
 
L
D
 
T
K
 
R
R
 
W
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
E
 
Q
A
 
S
G
 
V
A
 
I
V
 
S
R
 
Q
S
 
R
F
 
W
L
 
L
A
 
N
L
 
I
S
 
S
V
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
I
I
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
S
 
W
Y
 
F
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
L
N
 
Q
R
 
H
V
 
M
S
 
I
L
 
M
E
 
E
G
 
N
Q
 
I
S
 
P
L
 
R
S
 
E
G
 
A
V
 
L
W
 
L
P
 
L
W
 
P
L
 
F
Y
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
V
G
 
L
V
 
T
I
 
F
I
 
V
F
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
V
T
 
V
W
 
W
M
 
L
G
 
R
E
 
E
V
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
Y
R
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
Q
 
H
I
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
W
A
 
I
G
 
Q
G
 
G
E
 
K
R
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
W
V
 
A
N
 
T
A
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
Q
I
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
M
D
 
H
A
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
V
F
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
L
 
S
D
 
N
T
 
W
I
 
A
S
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
G
T
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
F
M
 
M
F
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
M
W
 
G
A
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
A
S
x
N
Q
 
R
R
 
R
Q
x
N
W
x
F
E
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
L
S
 
S
A
 
G
H
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
L
 
M
T
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
E
S
 
A
Q
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
S
I
 
I
G
 
R
Q
 
S
I
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
T
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
R
V
 
L
A
 
A
F
|
F
L
 
L
S
 
S
A
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
A
 
T
T
 
S
I
 
L
S
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
F
G
 
G
L
 
F
-
 
S
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
D
Y
 
F
A
 
G
H
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
T
-
 
G
I
 
V
P
 
T
F
 
L
E
 
A
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
F
 
L
L
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
D
L
 
L
G
|
G
S
x
T
H
 
F
F
x
Y
H
|
H
A
 
A
G
 
K
L
 
A
M
 
Q
G
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
S
I
 
L
F
 
K
A
 
T
I
 
F
L
 
M
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
A
-
 
H
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
E
C
 
A
H
 
E
L
 
L
S
 
A
H
 
S
D
 
T
P
 
D
S
 
P
F
 
V
Q
 
T
I
 
I
A
 
E
F
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
L
H
 
F
Y
 
I
A
 
T
F
x
S
E
 
P
D
 
E
G
 
G
A
x
K
R
 
-
P
 
-
A
 
T
L
|
L
Q
 
A
G
 
G
-
 
P
I
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
T
L
 
L
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
V
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
x
S
A
 
L
A
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
L
L
 
S
Q
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
S
P
 
Y
D
 
-
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
I
 
L
T
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
E
L
 
L
D
 
R
R
 
D
I
 
L
P
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
H
 
H
I
 
L
A
 
S
L
 
W
V
 
V
P
 
G
Q
|
Q
K
 
N
P
 
P
Y
 
Q
F
 
L
F
 
P
Y
 
A
G
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
N
I
 
V
R
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
S
L
 
E
E
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
A
G
 
W
A
 
V
H
 
S
Q
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
P
D
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
Q
G
 
A
I
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
N
N
 
P
A
 
C
P
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
A
V
 
H
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
N
R
 
A
L
 
A
M
 
S
Q
 
L
G
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
M
I
 
V
A
 
T
H
 
H
R
 
Q
L
 
L
N
 
E
T
 
D
V
 
L
H
 
A
R
 
D
A
 
W
D
 
D
R
 
V
I
 
I
I
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
H
 
Y
K
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
S
E
 
V
Q
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
P
Y
 
F
H
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
L
A
 
A

P29018 Glutathione/L-cysteine transport system ATP-binding/permease protein CydD; EC 7.4.2.- from Escherichia coli (strain K12) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:570/576 of query aligns to 9:582/588 of P29018

query
sites
P29018
M
 
L
D
 
T
K
 
R
R
 
W
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
E
 
Q
A
 
S
G
 
V
A
 
I
V
 
S
R
 
Q
S
 
R
F
 
W
L
 
L
A
 
N
L
 
I
S
 
S
V
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
I
I
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
S
 
W
Y
 
F
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
L
N
 
Q
R
 
H
V
 
M
S
 
I
L
 
M
E
 
E
G
 
N
Q
 
I
S
 
P
L
 
R
S
 
E
G
 
A
V
 
L
W
 
L
P
 
L
W
 
P
L
 
F
Y
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
V
G
 
L
V
 
T
I
 
F
I
 
V
F
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
V
T
 
V
W
 
W
M
 
L
G
 
R
E
 
E
V
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
Y
R
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
Q
 
H
I
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
W
A
 
I
G
 
Q
G
 
G
E
 
K
R
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
W
V
 
A
N
 
T
A
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
Q
I
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
M
D
 
H
A
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
V
F
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
L
 
S
D
 
N
T
 
W
I
 
A
S
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
G
T
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
F
M
 
M
F
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
M
W
 
G
A
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
A
S
 
N
Q
 
R
R
 
R
Q
 
N
W
 
F
E
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
L
S
 
S
A
 
G
H
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
L
Q
x
R
G
 
G
L
 
M
T
 
E
T
 
T
L
 
L
K
x
R
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
E
S
 
A
Q
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
S
I
 
I
G
 
R
Q
 
S
I
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
T
x
R
T
 
T
L
 
M
G
 
E
V
 
V
L
 
L
R
|
R
V
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
A
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
A
 
T
T
 
S
I
 
L
S
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
F
G
 
G
L
 
F
-
 
S
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
D
Y
 
F
A
 
G
H
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
T
-
 
G
I
 
V
P
 
T
F
 
L
E
 
A
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
F
 
L
L
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
D
L
 
L
G
 
G
S
 
T
H
 
F
F
 
Y
H
 
H
A
 
A
G
 
K
L
 
A
M
 
Q
G
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
S
I
 
L
F
 
K
A
 
T
I
 
F
L
 
M
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
A
-
 
H
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
E
C
 
A
H
 
E
L
 
L
S
 
A
H
 
S
D
 
T
P
 
D
S
 
P
F
 
V
Q
 
T
I
 
I
A
 
E
F
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
L
H
 
F
Y
 
I
A
 
T
F
 
S
E
 
P
D
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
-
P
 
-
A
 
T
L
 
L
Q
 
A
G
 
G
-
 
P
I
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
T
L
 
L
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
V
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
S
A
 
L
A
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
L
L
 
S
Q
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
S
P
 
Y
D
 
-
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
I
 
L
T
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
E
L
 
L
D
 
R
R
 
D
I
 
L
P
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
H
 
H
I
 
L
A
 
S
L
 
W
V
 
V
P
 
G
Q
 
Q
K
 
N
P
 
P
Y
 
Q
F
 
L
F
 
P
Y
 
A
G
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
N
I
 
V
R
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
S
L
 
E
E
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
A
G
 
W
A
 
V
H
 
S
Q
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
P
D
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
Q
G
 
A
I
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
N
N
 
P
A
 
C
P
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
A
V
 
H
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
N
R
 
A
L
 
A
M
 
S
Q
 
L
G
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
M
I
 
V
A
 
T
H
 
H
R
 
Q
L
 
L
N
 
E
T
 
D
V
 
L
H
 
A
R
 
D
A
 
W
D
 
D
R
 
V
I
 
I
I
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
H
 
Y
K
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
S
E
 
V
Q
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
P
Y
 
F
H
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
L
A
 
A

7zdeD If(apo/as isolated) conformation of cyddc in amp-pnp(cydd) bound state (dataset-4) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:570/576 of query aligns to 8:581/587 of 7zdeD

query
sites
7zdeD
M
 
L
D
 
T
K
 
R
R
 
W
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
E
 
Q
A
 
S
G
 
V
A
 
I
V
 
S
R
 
Q
S
 
R
F
 
W
L
 
L
A
 
N
L
 
I
S
 
S
V
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
I
I
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
S
 
W
Y
 
F
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
L
N
 
Q
R
 
H
V
 
M
S
 
I
L
 
M
E
 
E
G
 
N
Q
 
I
S
 
P
L
 
R
S
 
E
G
 
A
V
 
L
W
 
L
P
 
L
W
 
P
L
 
F
Y
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
V
G
 
L
V
 
T
I
 
F
I
 
V
F
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
V
T
 
V
W
 
W
M
 
L
G
 
R
E
 
E
V
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
Y
R
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
Q
 
H
I
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
W
A
 
I
G
 
Q
G
 
G
E
 
K
R
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
W
V
 
A
N
 
T
A
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
Q
I
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
M
D
 
H
A
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
V
F
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
L
 
S
D
 
N
T
 
W
I
 
A
S
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
G
T
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
F
M
 
M
F
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
M
W
 
G
A
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
A
S
 
N
Q
 
R
R
 
R
Q
 
N
W
 
F
E
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
L
S
 
S
A
 
G
H
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
L
 
M
T
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
E
S
 
A
Q
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
S
I
 
I
G
 
R
Q
 
S
I
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
T
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
R
V
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
A
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
A
 
T
T
 
S
I
 
L
S
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
F
G
 
G
L
 
F
-
 
S
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
D
Y
 
F
A
 
G
H
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
T
-
 
G
I
 
V
P
 
T
F
 
L
E
 
A
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
F
 
L
L
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
D
L
 
L
G
 
G
S
 
T
H
 
F
F
 
Y
H
 
H
A
 
A
G
 
K
L
 
A
M
 
Q
G
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
S
I
 
L
F
 
K
A
 
T
I
 
F
L
 
M
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
A
-
 
H
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
E
C
 
A
H
 
E
L
 
L
S
 
A
H
 
S
D
 
T
P
 
D
S
 
P
F
 
V
Q
 
T
I
 
I
A
 
E
F
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
L
H
 
F
Y
 
I
A
 
T
F
x
S
E
 
P
D
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
-
P
 
-
A
 
T
L
|
L
Q
 
A
G
 
G
-
 
P
I
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
T
L
 
L
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
V
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
x
S
A
 
L
A
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
L
L
 
S
Q
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
S
P
 
Y
D
 
-
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
I
 
L
T
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
E
L
 
L
D
 
R
R
 
D
I
 
L
P
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
H
 
H
I
 
L
A
 
S
L
 
W
V
 
V
P
 
G
Q
 
Q
K
 
N
P
 
P
Y
 
Q
F
 
L
F
 
P
Y
 
A
G
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
N
I
 
V
R
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
S
L
 
E
E
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
A
G
 
W
A
 
V
H
 
S
Q
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
P
D
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
Q
G
 
A
I
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
N
N
 
P
A
 
C
P
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
A
V
 
H
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
N
R
 
A
L
 
A
M
 
S
Q
 
L
G
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
M
I
 
V
A
 
T
H
 
H
R
 
Q
L
 
L
N
 
E
T
 
D
V
 
L
H
 
A
R
 
D
A
 
W
D
 
D
R
 
V
I
 
I
I
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
H
 
Y
K
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
S
E
 
V
Q
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
P
Y
 
F
H
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
L
A
 
A

7zdaD If(apo/asym) conformation of cyddc in adp+pi(cydc)/atp(cydd) bound state (dataset-2) (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:570/576 of query aligns to 8:581/587 of 7zdaD

query
sites
7zdaD
M
 
L
D
 
T
K
 
R
R
 
W
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
E
 
Q
A
 
S
G
 
V
A
 
I
V
 
S
R
 
Q
S
 
R
F
 
W
L
 
L
A
 
N
L
 
I
S
 
S
V
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
I
I
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
S
 
W
Y
 
F
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
L
N
 
Q
R
 
H
V
 
M
S
 
I
L
 
M
E
 
E
G
 
N
Q
 
I
S
 
P
L
 
R
S
 
E
G
 
A
V
 
L
W
 
L
P
 
L
W
 
P
L
 
F
Y
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
V
G
 
L
V
 
T
I
 
F
I
 
V
F
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
V
T
 
V
W
 
W
M
 
L
G
 
R
E
 
E
V
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
Y
R
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
Q
 
H
I
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
W
A
 
I
G
 
Q
G
 
G
E
 
K
R
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
W
V
 
A
N
 
T
A
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
Q
I
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
M
D
 
H
A
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
V
F
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
L
 
S
D
 
N
T
 
W
I
 
A
S
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
G
T
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
F
M
 
M
F
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
M
W
 
G
A
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
A
S
 
N
Q
 
R
R
 
R
Q
 
N
W
 
F
E
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
L
S
 
S
A
 
G
H
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
L
 
M
T
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
E
S
 
A
Q
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
S
I
 
I
G
 
R
Q
 
S
I
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
T
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
E
V
 
V
L
 
L
R
 
R
V
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
A
 
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
A
 
T
T
 
S
I
 
L
S
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
F
G
 
G
L
 
F
-
 
S
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
D
Y
 
F
A
 
G
H
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
T
-
 
G
I
 
V
P
 
T
F
 
L
E
 
A
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
F
 
L
L
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
D
L
 
L
G
 
G
S
 
T
H
 
F
F
 
Y
H
 
H
A
 
A
G
 
K
L
 
A
M
 
Q
G
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
S
I
 
L
F
 
K
A
 
T
I
 
F
L
 
M
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
A
-
 
H
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
E
C
 
A
H
 
E
L
 
L
S
 
A
H
 
S
D
 
T
P
 
D
S
 
P
F
 
V
Q
 
T
I
 
I
A
 
E
F
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
L
H
 
F
Y
 
I
A
 
T
F
x
S
E
 
P
D
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
-
P
 
-
A
 
T
L
|
L
Q
 
A
G
 
G
-
 
P
I
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
T
L
 
L
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
V
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
x
S
A
 
L
A
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
L
L
 
S
Q
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
S
P
 
Y
D
 
-
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
I
 
L
T
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
E
L
 
L
D
 
R
R
 
D
I
 
L
P
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
H
 
H
I
 
L
A
 
S
L
 
W
V
 
V
P
 
G
Q
|
Q
K
 
N
P
 
P
Y
 
Q
F
 
L
F
 
P
Y
 
A
G
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
N
I
 
V
R
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
S
L
 
E
E
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
A
G
 
W
A
 
V
H
 
S
Q
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
P
D
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
Q
G
 
A
I
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
N
N
 
P
A
 
C
P
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
A
V
 
H
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
N
R
 
A
L
 
A
M
 
S
Q
 
L
G
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
M
I
 
V
A
 
T
H
 
H
R
 
Q
L
 
L
N
 
E
T
 
D
V
 
L
H
 
A
R
 
D
A
 
W
D
 
D
R
 
V
I
 
I
I
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
H
 
Y
K
 
A
E
 
E
L
 
L
I
 
S
E
 
V
Q
 
A
Q
 
G
G
 
G
V
 
P
Y
 
F
H
 
A
R
 
T
L
 
L
I
 
L
A
 
A

7zdbD If(heme/bound) conformation of cyddc in adp+pi(cydc)/atp(cydd) bound state (dataset-2) (see paper)
38% identity, 96% coverage: 2:555/576 of query aligns to 9:567/568 of 7zdbD

query
sites
7zdbD
M
 
L
D
 
T
K
 
R
R
 
W
L
 
L
M
 
K
R
 
Q
E
 
Q
A
 
S
G
 
V
A
 
I
V
 
S
R
 
Q
S
 
R
F
 
W
L
 
L
A
 
N
L
 
I
S
 
S
V
 
R
G
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
F
G
 
V
T
 
S
G
 
G
L
 
I
L
 
L
A
 
I
I
 
I
L
 
A
Q
 
Q
A
 
A
S
 
W
Y
 
F
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
L
N
 
Q
R
 
H
V
 
M
S
 
I
L
 
M
E
 
E
G
 
N
Q
 
I
S
 
P
L
 
R
S
 
E
G
 
A
V
 
L
W
 
L
P
 
L
W
 
P
L
 
F
Y
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
V
G
 
L
V
 
T
I
 
F
I
 
V
F
 
L
R
 
R
A
 
A
G
 
W
L
 
V
T
 
V
W
 
W
M
 
L
G
 
R
E
 
E
V
 
R
V
 
V
A
 
G
H
 
Y
R
 
H
A
 
A
A
 
G
A
 
Q
Q
 
H
I
 
I
K
 
R
H
 
F
A
 
A
L
 
I
R
 
R
Q
 
R
R
 
Q
L
 
V
L
 
L
A
 
D
H
 
R
L
 
L
L
 
Q
A
 
Q
L
 
A
G
 
G
P
 
P
V
 
A
Y
 
W
A
 
I
G
 
Q
G
 
G
E
 
K
R
 
P
T
 
A
G
 
G
E
 
S
L
 
W
V
 
A
N
 
T
A
 
L
L
 
V
V
 
L
E
 
E
G
 
Q
I
 
I
E
 
D
A
 
D
L
 
M
D
 
H
A
 
D
Y
 
Y
F
 
Y
T
 
A
R
 
R
Y
 
Y
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
L
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
A
A
 
V
L
 
S
V
 
V
P
 
P
L
 
L
A
 
L
V
 
I
L
 
V
G
 
V
F
 
A
V
 
I
F
 
F
P
 
P
L
 
S
D
 
N
T
 
W
I
 
A
S
 
A
G
 
A
L
 
L
I
 
I
L
 
L
L
 
L
F
 
G
T
 
T
A
 
A
P
 
P
L
 
L
I
 
I
P
 
P
L
 
L
F
 
F
M
 
M
F
 
A
L
 
L
I
 
V
G
 
G
R
 
M
W
 
G
A
 
A
E
 
A
S
 
D
L
 
A
S
 
N
Q
 
R
R
 
R
Q
 
N
W
 
F
E
 
L
T
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
R
M
 
L
S
 
S
A
 
G
H
 
H
F
 
F
L
 
L
D
 
D
V
 
R
L
 
L
Q
 
R
G
 
G
L
 
M
T
 
E
T
 
T
L
 
L
K
 
R
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
R
S
 
G
K
 
E
S
 
A
Q
 
E
A
 
I
E
 
E
V
 
S
I
 
I
G
 
R
Q
 
S
I
 
A
S
 
S
S
 
E
R
 
D
F
 
F
R
 
R
E
 
Q
T
 
R
T
 
T
L
 
M
G
 
E
V
 
V
L
|
L
R
 
R
V
 
L
A
 
A
F
 
F
L
 
L
S
 
S
A
x
S
L
 
G
V
 
I
L
 
L
E
 
E
F
 
F
L
 
F
A
 
T
T
 
S
I
 
L
S
 
S
T
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
V
A
 
A
V
 
V
T
 
Y
V
 
F
G
 
G
L
 
F
-
 
S
-
 
Y
-
 
L
-
 
G
R
 
E
L
 
L
V
 
D
Y
 
F
A
 
G
H
 
H
-
 
Y
-
 
D
-
 
T
-
 
G
I
 
V
P
 
T
F
 
L
E
 
A
Q
 
A
A
 
G
F
 
F
F
 
L
L
 
A
L
 
L
L
 
I
L
 
L
A
 
A
P
 
P
E
 
E
F
 
F
Y
 
F
L
 
Q
P
 
P
L
 
L
R
 
R
L
 
D
L
 
L
G
 
G
S
 
T
H
 
F
F
 
Y
H
 
H
A
 
A
G
 
K
L
 
A
M
 
Q
G
 
A
V
 
V
S
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
D
R
 
S
I
 
L
F
 
K
A
 
T
I
 
F
L
 
M
E
 
E
T
 
T
P
 
P
L
 
L
-
 
A
-
 
H
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
K
 
-
L
 
-
Q
 
-
G
 
G
E
 
E
C
 
A
H
 
E
L
 
L
S
 
A
H
 
S
D
 
T
P
 
D
S
 
P
F
 
V
Q
 
T
I
 
I
A
 
E
F
 
A
E
 
E
D
 
E
V
 
L
H
 
F
Y
 
I
A
 
T
F
 
S
E
 
P
D
 
E
G
 
G
A
 
K
R
 
-
P
 
-
A
 
T
L
|
L
Q
 
A
G
 
G
-
 
P
I
 
L
S
 
N
F
 
F
E
 
T
L
 
L
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
R
V
 
A
A
 
V
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
S
A
 
L
A
 
L
H
 
N
L
 
A
L
 
L
L
 
S
Q
 
G
F
 
F
M
 
L
A
 
S
P
 
Y
D
 
-
R
 
Q
G
 
G
R
 
S
I
 
L
T
 
R
V
 
I
N
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
E
L
 
L
D
 
R
R
 
D
I
 
L
P
 
S
V
 
P
E
 
E
E
 
S
W
 
W
R
 
R
R
 
K
H
 
H
I
 
L
A
 
S
L
 
W
V
 
V
P
 
G
Q
 
Q
K
 
N
P
 
P
Y
 
Q
F
 
L
F
 
P
Y
 
A
G
 
A
T
 
T
V
 
L
A
 
R
E
 
D
N
 
N
I
 
V
R
 
L
L
 
L
G
 
A
R
 
R
P
 
P
G
 
D
A
 
A
A
 
S
L
 
E
E
 
Q
E
 
E
V
 
L
A
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
L
E
 
D
Q
 
N
A
 
A
G
 
W
A
 
V
H
 
S
Q
 
E
F
 
F
I
 
L
L
 
P
D
 
L
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
V
D
 
D
T
 
T
Q
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
G
 
Q
G
 
A
I
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
S
G
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
Q
 
Q
R
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
V
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
N
N
 
P
A
 
C
P
 
S
L
 
L
L
 
L
I
 
L
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
P
T
 
A
A
 
A
G
 
S
L
 
L
D
 
D
P
 
A
V
 
H
N
 
S
E
 
E
R
 
Q
L
 
R
V
 
V
L
 
M
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
N
R
 
A
L
 
A
M
 
S
Q
 
L
G
 
R
R
 
Q
T
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
M
I
 
V
A
 
T
H
 
H
R
 
Q
L
 
L
N
 
E
T
 
D
V
 
L
H
 
A
R
 
D
A
 
W
D
 
D
R
 
V
I
 
I
I
 
W
V
 
V
L
 
M
E
 
Q
R
 
D
G
 
G
R
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
R
H
 
Y

2onjA Structure of the multidrug abc transporter sav1866 from s. Aureus in complex with amp-pnp (see paper)
32% identity, 87% coverage: 66:568/576 of query aligns to 71:572/578 of 2onjA

query
sites
2onjA
I
 
V
I
 
I
F
 
V
R
 
R
A
 
P
G
 
P
L
 
I
T
 
E
W
 
F
M
 
I
G
 
R
E
 
Q
V
 
Y
V
 
L
A
 
A
H
 
Q
R
 
W
A
 
T
A
 
S
A
 
N
Q
 
K
I
 
I
K
 
L
H
 
Y
A
 
D
L
 
I
R
 
R
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
Y
A
 
N
H
 
H
L
 
L
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
A
V
 
R
Y
 
F
A
 
Y
G
 
A
G
 
N
E
 
N
R
 
Q
T
 
V
G
 
G
E
 
Q
L
 
V
V
 
I
N
 
S
A
 
R
L
 
V
V
 
I
E
 
N
G
 
D
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
L
 
T
D
 
K
A
 
D
Y
 
F
F
 
I
T
 
L
R
 
T
Y
 
G
L
 
L
P
 
M
Q
 
N
L
 
I
A
 
W
L
 
L
A
 
D
A
 
C
L
 
I
V
 
T
P
 
I
L
 
I
A
 
I
V
 
A
L
 
L
G
 
S
F
 
I
V
 
M
F
 
F
P
 
F
L
 
L
D
 
D
T
 
V
I
 
K
S
 
L
G
 
T
L
 
L
I
 
A
L
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
I
A
 
F
P
 
P
L
 
F
I
 
Y
P
 
I
L
 
L
F
 
T
M
 
V
F
 
Y
L
 
V
I
 
F
G
 
F
R
 
G
W
 
R
A
 
L
E
 
R
S
 
K
L
 
L
S
 
T
Q
 
R
R
 
E
Q
 
R
W
 
S
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
E
M
 
V
S
 
Q
A
 
G
H
 
F
F
 
L
L
 
H
D
 
E
V
 
R
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
I
T
 
S
T
 
V
L
 
V
K
 
K
I
 
S
F
 
F
G
 
A
R
 
I
S
 
E
K
 
D
S
 
N
Q
 
E
A
 
A
E
 
K
V
 
N
I
 
F
G
 
D
Q
 
K
I
 
K
S
 
N
S
 
T
R
 
N
F
 
F
R
 
L
E
 
T
T
 
R
T
 
A
L
 
L
G
 
K
V
 
H
L
 
T
R
 
R
V
 
W
A
 
N
F
 
A
L
 
Y
S
 
S
A
 
F
L
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
N
F
 
T
L
 
V
A
 
T
T
 
D
I
 
I
S
 
G
T
 
P
A
 
I
L
 
I
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
G
A
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
L
L
 
A
V
 
A
Y
 
F
A
 
V
H
 
-
I
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
G
F
 
Y
F
 
L
L
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
G
P
 
P
E
 
-
F
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
G
 
V
S
 
A
H
 
S
F
 
F
H
 
T
A
 
T
G
 
L
L
 
T
M
 
Q
G
 
S
V
 
F
S
 
A
A
 
S
A
 
M
G
 
D
R
 
R
I
 
V
F
 
F
A
 
Q
I
 
L
L
 
I
E
 
D
T
 
E
P
 
D
L
 
Y
P
 
D
E
 
I
R
 
K
K
 
N
L
 
G
Q
 
V
G
 
G
E
 
A
C
 
Q
H
 
P
L
 
I
S
 
E
H
 
I
D
 
K
P
 
Q
S
 
G
F
 
-
Q
 
R
I
 
I
A
 
D
F
 
I
E
 
D
D
 
H
V
 
V
H
 
S
Y
 
F
A
 
Q
F
x
Y
E
 
N
D
 
D
G
 
N
A
 
E
R
 
A
P
 
P
A
x
I
L
 
L
Q
 
K
G
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
E
 
S
L
 
I
H
 
E
S
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
V
G
 
G
P
 
M
S
|
S
G
|
G
A
x
G
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
A
 
L
A
 
I
H
 
N
L
 
L
L
 
I
L
 
P
Q
 
R
F
 
F
M
 
Y
A
 
D
P
 
V
D
 
T
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
L
V
 
I
N
 
D
G
 
G
I
 
H
P
 
N
L
 
I
D
 
K
R
 
D
I
 
F
P
 
L
V
 
T
E
 
G
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
N
H
 
Q
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
V
P
 
Q
Q
|
Q
K
 
D
P
 
N
Y
 
I
F
 
L
F
 
F
Y
 
S
G
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
K
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
T
A
 
A
A
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
K
Q
 
M
A
 
A
G
 
N
A
 
A
H
 
H
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
M
D
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
R
G
 
G
I
 
V
R
x
K
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
I
F
 
F
L
 
L
K
 
N
N
 
N
A
 
P
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
|
E
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
L
V
 
E
N
 
S
E
 
E
R
 
S
L
 
I
V
 
I
L
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
K
G
 
D
R
 
R
T
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
I
I
 
V
A
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
T
V
 
I
H
 
T
R
 
H
A
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
 
I
E
 
E
R
 
N
G
 
G
R
 
H
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
T
H
 
H
K
 
R
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
V
 
A
Y
 
Y
H
 
E
R
 
H
L
 
L

2hydA Multidrug abc transporter sav1866 (see paper)
32% identity, 87% coverage: 66:568/576 of query aligns to 71:572/578 of 2hydA

query
sites
2hydA
I
 
V
I
 
I
F
 
V
R
 
R
A
 
P
G
 
P
L
 
I
T
 
E
W
 
F
M
 
I
G
 
R
E
 
Q
V
 
Y
V
 
L
A
 
A
H
 
Q
R
 
W
A
 
T
A
 
S
A
 
N
Q
 
K
I
 
I
K
 
L
H
 
Y
A
 
D
L
 
I
R
 
R
Q
 
K
R
 
K
L
 
L
L
 
Y
A
 
N
H
 
H
L
 
L
L
 
Q
A
 
A
L
 
L
G
 
S
P
 
A
V
 
R
Y
 
F
A
 
Y
G
 
A
G
 
N
E
 
N
R
 
Q
T
 
V
G
 
G
E
 
Q
L
 
V
V
 
I
N
 
S
A
 
R
L
 
V
V
 
I
E
 
N
G
 
D
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
L
 
T
D
 
K
A
 
D
Y
 
F
F
 
I
T
 
L
R
 
T
Y
 
G
L
 
L
P
 
M
Q
 
N
L
 
I
A
 
W
L
 
L
A
 
D
A
 
C
L
 
I
V
 
T
P
 
I
L
 
I
A
 
I
V
 
A
L
 
L
G
 
S
F
 
I
V
 
M
F
 
F
P
 
F
L
 
L
D
 
D
T
 
V
I
 
K
S
 
L
G
 
T
L
 
L
I
 
A
L
 
A
L
 
L
F
 
F
T
 
I
A
 
F
P
 
P
L
 
F
I
 
Y
P
 
I
L
 
L
F
 
T
M
 
V
F
 
Y
L
 
V
I
 
F
G
 
F
R
 
G
W
 
R
A
 
L
E
 
R
S
 
K
L
 
L
S
 
T
Q
 
R
R
 
E
Q
 
R
W
 
S
E
 
Q
T
 
A
L
 
L
S
 
A
R
 
E
M
 
V
S
 
Q
A
 
G
H
 
F
F
 
L
L
 
H
D
 
E
V
 
R
L
 
V
Q
 
Q
G
 
G
L
 
I
T
 
S
T
 
V
L
 
V
K
 
K
I
 
S
F
 
F
G
 
A
R
 
I
S
 
E
K
 
D
S
 
N
Q
 
E
A
 
A
E
 
K
V
 
N
I
 
F
G
 
D
Q
 
K
I
 
K
S
 
N
S
 
T
R
 
N
F
 
F
R
 
L
E
 
T
T
 
R
T
 
A
L
 
L
G
 
K
V
 
H
L
 
T
R
 
R
V
 
W
A
 
N
F
 
A
L
 
Y
S
 
S
A
 
F
L
 
A
V
 
A
L
 
I
E
 
N
F
 
T
L
 
V
A
 
T
T
 
D
I
 
I
S
 
G
T
 
P
A
 
I
L
 
I
V
 
V
-
 
I
-
 
G
-
 
V
-
 
G
-
 
A
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
-
 
I
-
 
S
-
 
G
A
 
S
V
 
I
T
 
T
V
 
V
G
 
G
L
 
T
R
 
L
L
 
A
V
 
A
Y
 
F
A
 
V
H
 
-
I
 
-
P
 
-
F
 
-
E
 
-
Q
 
-
A
 
G
F
 
Y
F
 
L
L
 
E
L
 
L
L
 
L
L
 
F
A
 
G
P
 
P
E
 
-
F
 
-
Y
 
-
L
 
-
P
 
-
L
 
L
R
 
R
L
 
R
L
 
L
G
 
V
S
 
A
H
 
S
F
 
F
H
 
T
A
 
T
G
 
L
L
 
T
M
 
Q
G
 
S
V
 
F
S
 
A
A
 
S
A
 
M
G
 
D
R
 
R
I
 
V
F
 
F
A
 
Q
I
 
L
L
 
I
E
 
D
T
 
E
P
 
D
L
 
Y
P
 
D
E
 
I
R
 
K
K
 
N
L
 
G
Q
 
V
G
 
G
E
 
A
C
 
Q
H
 
P
L
 
I
S
 
E
H
 
I
D
 
K
P
 
Q
S
 
G
F
 
-
Q
 
R
I
 
I
A
 
D
F
 
I
E
 
D
D
 
H
V
 
V
H
 
S
Y
 
F
A
 
Q
F
x
Y
E
 
N
D
 
D
G
 
N
A
 
E
R
 
A
P
 
P
A
x
I
L
 
L
Q
 
K
G
 
D
I
 
I
S
 
N
F
 
L
E
 
S
L
 
I
H
 
E
S
 
K
G
 
G
E
 
E
R
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
V
G
 
G
P
 
M
S
 
S
G
|
G
A
 
G
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
 
T
A
 
L
A
 
I
H
 
N
L
 
L
L
 
I
L
 
P
Q
 
R
F
 
F
M
 
Y
A
 
D
P
 
V
D
 
T
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
L
V
 
I
N
 
D
G
 
G
I
 
H
P
 
N
L
 
I
D
 
K
R
 
D
I
 
F
P
 
L
V
 
T
E
 
G
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
N
H
 
Q
I
 
I
A
 
G
L
 
L
V
 
V
P
 
Q
Q
 
Q
K
 
D
P
 
N
Y
 
I
F
 
L
F
 
F
Y
 
S
G
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
K
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
L
L
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
G
 
T
A
 
A
A
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
V
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
K
Q
 
M
A
 
A
G
 
N
A
 
A
H
 
H
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
M
D
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
Q
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
Q
 
E
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
R
G
 
G
I
 
V
R
x
K
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
K
Q
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
S
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
I
F
 
F
L
 
L
K
 
N
N
 
N
A
 
P
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
L
V
 
E
N
 
S
E
 
E
R
 
S
L
 
I
V
 
I
L
 
Q
E
 
E
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
V
L
 
L
M
 
S
Q
 
K
G
 
D
R
 
R
T
 
T
A
 
T
L
 
L
I
 
I
I
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
T
V
 
I
H
 
T
R
 
H
A
 
A
D
 
D
R
 
K
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
 
I
E
 
E
R
 
N
G
 
G
R
 
H
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
T
G
 
G
R
 
T
H
 
H
K
 
R
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
A
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
V
 
A
Y
 
Y
H
 
E
R
 
H
L
 
L

6qv0B Structure of atp-bound outward-facing tm287/288 in complex with sybody sb_tm35 (see paper)
30% identity, 87% coverage: 72:571/576 of query aligns to 72:568/570 of 6qv0B

query
sites
6qv0B
L
 
L
T
 
F
W
 
W
M
 
L
G
 
Q
E
 
G
V
 
K
V
 
I
A
 
M
H
 
L
R
 
T
A
 
L
A
 
S
A
 
Q
Q
 
D
I
 
V
K
 
V
H
 
F
A
 
R
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
E
H
 
K
L
 
L
L
 
Q
A
 
R
L
 
V
G
 
P
P
 
V
V
 
G
Y
 
F
A
 
F
G
 
D
G
 
R
E
 
T
R
 
P
T
 
H
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
S
A
 
R
L
 
V
V
 
I
E
 
N
G
 
D
I
 
V
E
 
D
A
 
N
L
 
I
D
 
N
A
 
N
Y
 
V
F
 
L
T
 
G
R
 
N
Y
 
S
L
 
I
P
 
I
Q
 
Q
L
 
F
A
 
-
L
 
F
A
 
S
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
T
L
 
L
A
 
A
-
 
G
V
 
A
L
 
V
G
 
I
F
 
M
V
 
M
F
 
F
P
 
R
L
 
V
D
 
N
T
 
V
I
 
I
S
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
V
L
 
T
L
 
L
F
 
S
T
 
I
A
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
T
P
 
V
L
 
L
F
 
I
M
 
T
F
 
Q
L
 
I
I
 
V
G
 
S
R
 
S
W
 
Q
A
 
T
E
 
R
S
 
K
L
 
Y
S
 
F
Q
 
Y
R
 
E
Q
 
N
W
 
Q
E
 
R
T
 
V
L
 
L
S
 
G
R
 
Q
M
 
L
S
 
N
A
 
G
H
 
I
F
 
I
L
 
E
D
 
E
V
 
D
L
 
I
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
V
L
 
I
K
 
K
I
 
L
F
 
F
G
 
T
R
 
R
S
 
E
K
 
E
S
 
K
Q
 
E
A
 
M
E
 
E
V
 
K
I
 
F
G
 
D
Q
 
R
I
 
V
S
 
N
S
 
E
R
 
S
F
 
L
R
 
R
E
 
K
T
 
-
T
 
-
L
 
V
G
 
G
V
 
T
L
 
K
R
 
A
V
 
Q
A
 
I
F
 
F
L
 
S
S
 
G
A
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
P
V
 
L
L
 
M
E
 
N
F
 
M
L
 
V
A
 
N
T
 
N
I
 
L
S
 
G
T
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
S
V
 
G
T
 
F
V
 
G
G
 
G
L
 
W
R
 
L
L
 
A
V
 
L
Y
 
K
A
 
D
H
 
I
I
 
I
P
 
T
F
 
V
E
 
G
Q
 
T
A
 
I
F
 
A
F
 
T
L
 
F
L
 
I
L
 
G
L
 
Y
A
 
S
P
 
R
E
 
Q
F
 
F
Y
 
T
L
 
R
P
 
P
L
 
L
R
 
N
L
 
E
L
 
L
G
 
S
S
 
N
H
 
Q
F
 
F
H
 
N
A
 
M
G
 
I
L
 
Q
M
 
M
G
 
A
V
 
L
S
 
A
A
 
S
A
 
A
G
 
E
R
 
R
I
 
I
F
 
F
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
D
T
 
-
P
 
-
L
 
L
P
 
E
E
 
E
R
 
E
K
 
K
L
 
D
Q
 
D
G
 
P
E
 
D
C
 
A
H
 
V
L
 
E
S
 
L
H
 
R
D
 
E
P
 
V
S
 
R
F
 
G
Q
 
E
I
 
I
A
 
E
F
 
F
E
 
K
D
 
N
V
 
V
H
 
W
Y
 
F
A
 
S
F
x
Y
E
 
-
D
 
D
G
 
K
A
 
K
R
 
K
P
 
P
A
x
V
L
 
L
Q
 
K
G
 
D
I
 
I
S
 
T
F
 
F
E
 
H
L
 
I
H
 
K
S
 
P
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
P
S
x
T
G
 
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
A
 
I
A
 
V
H
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
Q
 
R
F
 
F
M
 
Y
A
 
D
P
 
V
D
 
D
R
 
R
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
L
V
 
V
N
 
D
G
 
G
I
 
I
P
 
D
L
 
I
D
 
R
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
R
E
 
S
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
S
H
 
S
I
 
I
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
L
Q
|
Q
K
 
D
P
 
T
Y
 
I
F
 
L
F
 
F
Y
 
S
G
 
T
T
 
T
V
 
V
A
 
K
E
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
K
L
 
Y
G
 
G
R
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
K
Q
 
L
A
 
T
G
 
H
A
 
S
H
 
D
Q
 
H
F
 
F
I
 
I
L
 
K
D
 
H
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
T
 
T
Q
 
V
V
 
L
G
 
T
E
 
D
G
 
N
G
 
G
I
 
E
R
x
D
L
 
L
S
|
S
G
 
Q
G
|
G
Q
|
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
L
K
 
A
N
 
N
A
 
P
P
 
K
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
N
L
 
V
D
 
D
P
 
T
V
 
K
N
 
T
E
 
E
R
 
K
L
 
S
V
 
I
L
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
M
E
 
W
R
 
K
L
 
L
M
 
M
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
S
L
 
I
I
 
I
I
 
I
A
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
N
 
N
T
 
T
V
 
I
H
 
K
R
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
R
R
 
D
G
 
G
R
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
M
G
 
G
R
 
K
H
 
H
K
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
R
G
 
G
V
 
F
Y
 
Y
H
 
Y
R
 
E
L
 
L
I
 
F
A
 
T
A
 
S

6quzD Structure of atpgs-bound outward-facing tm287/288 in complex with sybody sb_tm35 (see paper)
30% identity, 87% coverage: 72:571/576 of query aligns to 76:572/574 of 6quzD

query
sites
6quzD
L
 
L
T
 
F
W
 
W
M
 
L
G
 
Q
E
 
G
V
 
K
V
 
I
A
 
M
H
 
L
R
 
T
A
 
L
A
 
S
A
 
Q
Q
 
D
I
 
V
K
 
V
H
 
F
A
 
R
L
 
L
R
 
R
Q
 
K
R
 
E
L
 
L
L
 
F
A
 
E
H
 
K
L
 
L
L
 
Q
A
 
R
L
 
V
G
 
P
P
 
V
V
 
G
Y
 
F
A
 
F
G
 
D
G
 
R
E
 
T
R
 
P
T
 
H
G
 
G
E
 
D
L
 
I
V
 
I
N
 
S
A
 
R
L
 
V
V
 
I
E
 
N
G
 
D
I
 
V
E
 
D
A
 
N
L
 
I
D
 
N
A
 
N
Y
 
V
F
 
L
T
 
G
R
 
N
Y
 
S
L
 
I
P
 
I
Q
 
Q
L
 
F
A
 
-
L
 
F
A
 
S
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
T
L
 
L
A
 
A
-
 
G
V
 
A
L
 
V
G
 
I
F
 
M
V
 
M
F
 
F
P
 
R
L
 
V
D
 
N
T
 
V
I
 
I
S
 
L
G
 
S
L
 
L
I
 
V
L
 
T
L
 
L
F
 
S
T
 
I
A
 
V
P
 
P
L
 
L
I
 
T
P
 
V
L
 
L
F
 
I
M
 
T
F
 
Q
L
 
I
I
 
V
G
 
S
R
 
S
W
 
Q
A
 
T
E
 
R
S
 
K
L
 
Y
S
 
F
Q
 
Y
R
 
E
Q
 
N
W
 
Q
E
 
R
T
 
V
L
 
L
S
 
G
R
 
Q
M
 
L
S
 
N
A
 
G
H
 
I
F
 
I
L
 
E
D
 
E
V
 
D
L
 
I
Q
 
S
G
 
G
L
 
L
T
 
T
T
 
V
L
 
I
K
 
K
I
 
L
F
 
F
G
 
T
R
 
R
S
 
E
K
 
E
S
 
K
Q
 
E
A
 
M
E
 
E
V
 
K
I
 
F
G
 
D
Q
 
R
I
 
V
S
 
N
S
 
E
R
 
S
F
 
L
R
 
R
E
 
K
T
 
-
T
 
-
L
 
V
G
 
G
V
 
T
L
 
K
R
 
A
V
 
Q
A
 
I
F
 
F
L
 
S
S
 
G
A
 
V
L
 
L
-
 
P
-
 
P
V
 
L
L
 
M
E
 
N
F
 
M
L
 
V
A
 
N
T
 
N
I
 
L
S
 
G
T
 
F
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
S
V
 
G
T
 
F
V
 
G
G
 
G
L
 
W
R
 
L
L
 
A
V
 
L
Y
 
K
A
 
D
H
 
I
I
 
I
P
 
T
F
 
V
E
 
G
Q
 
T
A
 
I
F
 
A
F
 
T
L
 
F
L
 
I
L
 
G
L
 
Y
A
 
S
P
 
R
E
 
Q
F
 
F
Y
 
T
L
 
R
P
 
P
L
 
L
R
 
N
L
 
E
L
 
L
G
 
S
S
 
N
H
 
Q
F
 
F
H
 
N
A
 
M
G
 
I
L
 
Q
M
 
M
G
 
A
V
 
L
S
 
A
A
 
S
A
 
A
G
 
E
R
 
R
I
 
I
F
 
F
A
 
E
I
 
I
L
 
L
E
 
D
T
 
-
P
 
-
L
 
L
P
 
E
E
 
E
R
 
E
K
 
K
L
 
D
Q
 
D
G
 
P
E
 
D
C
 
A
H
 
V
L
 
E
S
 
L
H
 
R
D
 
E
P
 
V
S
 
R
F
 
G
Q
 
E
I
 
I
A
 
E
F
 
F
E
 
K
D
 
N
V
 
V
H
 
W
Y
 
F
A
 
S
F
x
Y
E
 
-
D
 
D
G
 
K
A
 
K
R
 
K
P
 
P
A
x
V
L
 
L
Q
 
K
G
 
D
I
 
I
S
 
T
F
 
F
E
 
H
L
 
I
H
 
K
S
 
P
G
 
G
E
 
Q
R
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
T
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
|
T
A
 
I
A
 
V
H
 
N
L
 
L
L
 
L
L
 
M
Q
 
R
F
 
F
M
 
Y
A
 
D
P
 
V
D
 
D
R
 
R
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
L
V
 
V
N
 
D
G
 
G
I
 
I
P
 
D
L
 
I
D
 
R
R
 
K
I
 
I
P
 
K
V
 
R
E
 
S
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
S
H
 
S
I
 
I
A
 
G
L
 
I
V
 
V
P
 
L
Q
|
Q
K
 
D
P
 
T
Y
 
I
F
 
L
F
 
F
Y
 
S
G
 
T
T
 
T
V
 
V
A
 
K
E
 
E
N
 
N
I
 
L
R
 
K
L
 
Y
G
 
G
R
 
N
P
 
P
G
 
G
A
 
A
A
 
T
L
 
D
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
K
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
K
Q
 
L
A
 
T
G
 
H
A
 
S
H
 
D
Q
 
H
F
 
F
I
 
I
L
 
K
D
 
H
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
Y
 
Y
D
 
E
T
 
T
Q
 
V
V
 
L
G
 
T
E
 
D
G
 
N
G
 
G
I
 
E
R
x
D
L
|
L
S
|
S
G
 
Q
G
|
G
Q
|
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
I
A
 
T
R
 
R
A
 
A
F
 
F
L
 
L
K
 
A
N
 
N
A
 
P
P
 
K
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
A
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
N
L
 
V
D
 
D
P
 
T
V
 
K
N
 
T
E
 
E
R
 
K
L
 
S
V
 
I
L
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
M
E
 
W
R
 
K
L
 
L
M
 
M
Q
 
E
G
 
G
R
 
K
T
 
T
A
 
S
L
 
I
I
 
I
I
 
I
A
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
N
 
N
T
 
T
V
 
I
H
 
K
R
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
L
I
 
I
I
 
I
V
 
V
L
 
L
E
 
R
R
 
D
G
 
G
R
 
E
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
M
G
 
G
R
 
K
H
 
H
K
 
D
E
 
E
L
 
L
I
 
I
E
 
Q
Q
 
K
Q
 
R
G
 
G
V
 
F
Y
 
Y
H
 
Y
R
 
E
L
 
L
I
 
F
A
 
T
A
 
S

8vsiA Mechanistic insights revealed by ybtpq in the occluded state (see paper)
32% identity, 89% coverage: 56:568/576 of query aligns to 53:563/571 of 8vsiA

query
sites
8vsiA
W
 
W
P
 
P
W
 
-
L
 
L
Y
 
G
P
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
C
I
 
V
I
 
V
F
 
L
R
 
T
A
 
F
G
 
V
L
 
L
T
 
R
W
 
L
M
 
Q
G
 
A
E
 
F
V
 
N
V
 
T
A
 
S
H
 
H
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
F
Q
 
H
I
 
L
K
 
E
H
 
N
A
 
I
L
 
L
R
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
A
A
 
R
H
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
G
 
P
P
 
P
V
 
G
Y
 
V
A
 
L
G
 
Q
G
 
Q
E
 
M
R
 
G
T
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
V
 
A
N
 
K
A
 
V
L
 
M
V
 
L
E
 
D
G
 
D
I
 
V
E
 
K
A
 
S
L
 
L
D
 
H
A
 
I
Y
 
F
F
 
V
T
 
A
R
 
D
Y
 
S
L
 
T
P
 
P
Q
 
L
L
 
Y
A
 
A
L
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
I
V
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
L
 
I
G
 
V
F
 
I
V
 
L
F
 
F
P
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
W
I
 
R
S
 
L
G
 
A
L
 
I
I
 
A
L
 
T
L
 
L
F
 
G
T
 
V
A
 
L
P
 
A
L
 
F
I
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
V
M
 
L
F
 
V
L
 
L
I
 
A
G
 
R
R
 
Q
W
 
R
A
 
S
E
 
E
S
 
N
L
 
M
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Y
W
 
H
E
 
K
T
 
A
L
 
R
S
 
E
R
 
Q
M
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
A
F
 
V
L
 
I
D
 
E
V
 
F
L
 
V
Q
 
Q
G
 
A
L
 
M
T
 
P
T
 
V
L
 
V
K
 
R
I
 
T
F
 
F
G
 
D
R
 
S
S
 
G
K
 
S
S
 
T
Q
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
R
-
 
Y
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
L
A
 
E
E
 
E
V
 
W
I
 
V
G
 
D
Q
 
V
I
 
L
S
 
K
S
 
T
R
 
W
F
 
Y
R
 
R
E
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
K
V
 
A
A
 
G
F
 
F
L
 
S
S
 
A
A
 
R
L
 
F
V
 
S
L
 
F
E
 
S
F
 
I
L
 
L
A
 
N
T
 
P
I
 
L
S
 
P
T
 
T
A
 
L
L
 
F
V
 
V
A
 
L
V
 
I
T
 
W
V
 
S
G
 
G
L
 
Y
R
 
G
L
 
L
V
 
L
-
 
H
Y
 
Y
A
 
G
H
 
S
I
 
F
P
 
D
F
 
F
E
 
I
Q
 
A
A
 
W
F
 
V
F
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
G
P
 
S
-
 
G
-
 
M
-
 
A
E
 
E
F
 
A
Y
 
V
L
 
M
P
 
P
L
 
M
R
 
M
L
 
M
L
 
L
G
 
N
S
 
N
H
 
L
F
 
V
H
 
A
A
 
Q
G
 
T
L
 
R
M
 
L
G
 
S
V
 
I
S
 
Q
A
 
R
A
 
I
G
 
Y
R
 
Q
I
 
V
F
 
L
A
 
A
I
 
M
L
 
P
E
 
E
T
 
L
P
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
R
 
S
K
 
D
L
 
Q
Q
 
Q
G
 
P
E
 
Q
C
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
E
F
 
A
Q
 
S
I
 
I
A
 
T
F
 
F
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
H
 
S
Y
 
F
A
 
H
F
x
Y
E
 
P
D
 
Q
G
 
A
A
 
R
R
 
T
-
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
E
I
 
V
S
 
S
F
 
F
E
 
H
L
 
V
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
P
S
|
S
G
|
G
A
|
A
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
A
 
V
A
 
A
H
x
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
F
 
Y
M
 
A
A
 
D
P
 
P
D
 
D
R
 
K
G
 
G
R
 
H
I
 
I
T
 
R
V
 
I
N
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
L
D
 
R
R
 
D
I
 
M
P
 
Q
V
 
T
E
 
D
E
 
T
W
 
L
R
 
M
R
 
K
H
 
Q
I
 
L
A
 
S
L
 
F
V
 
V
P
 
F
Q
|
Q
K
 
D
P
 
N
Y
 
F
F
 
L
F
 
F
Y
 
A
G
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
A
P
 
P
G
 
D
A
 
T
A
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Q
 
V
A
 
A
G
 
Q
A
 
A
H
 
H
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
S
D
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
T
 
T
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
R
G
 
G
I
x
V
R
x
F
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
T
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
Q
N
 
D
A
 
R
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
x
F
L
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
E
N
 
N
E
 
E
R
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
A
L
 
A
M
 
M
Q
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
M
I
 
V
A
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
M
V
 
V
H
 
T
R
 
Q
A
 
A
D
 
D
R
 
V
I
 
I
I
 
L
V
 
L
L
 
F
E
 
S
R
 
D
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
A
 
R
E
 
E
T
 
M
G
 
G
R
 
N
H
 
H
K
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
L
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
G
G
 
G
V
 
L
Y
 
Y
H
 
Q
R
 
R
L
 
L

6p6jA Structure of ybtpq importer with substrate ybt-fe bound (see paper)
32% identity, 89% coverage: 56:568/576 of query aligns to 49:559/571 of 6p6jA

query
sites
6p6jA
W
 
W
P
 
P
W
 
-
L
 
L
Y
 
G
P
 
G
L
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
C
I
 
V
I
 
V
F
 
L
R
 
T
A
 
F
G
 
V
L
 
L
T
 
R
W
 
L
M
 
Q
G
 
A
E
 
F
V
 
N
V
 
T
A
 
S
H
 
H
R
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
F
Q
 
H
I
 
L
K
 
E
H
 
N
A
 
I
L
 
L
R
 
R
Q
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
A
A
 
R
H
 
K
L
 
A
L
 
L
A
 
Q
L
 
L
G
 
P
P
 
P
V
 
G
Y
 
V
A
 
L
G
 
Q
G
 
Q
E
 
M
R
 
G
T
 
S
G
 
G
E
 
S
L
 
V
V
 
A
N
 
K
A
 
V
L
 
M
V
 
L
E
 
D
G
 
D
I
 
V
E
 
K
A
 
S
L
 
L
D
 
H
A
 
I
Y
 
F
F
 
V
T
 
A
R
 
D
Y
 
S
L
 
T
P
 
P
Q
 
L
L
 
Y
A
 
A
L
 
R
A
 
A
A
 
I
L
 
I
V
 
M
P
 
P
L
 
L
A
 
A
V
 
T
L
 
I
G
 
V
F
 
I
V
 
L
F
 
F
P
 
W
L
 
L
D
 
D
T
 
W
I
 
R
S
 
L
G
 
A
L
 
I
I
 
A
L
 
T
L
 
L
F
 
G
T
 
V
A
 
L
P
 
A
L
 
F
I
 
G
P
 
S
L
 
V
F
 
V
M
x
L
F
 
V
L
 
L
I
 
A
G
 
R
R
 
Q
W
 
R
A
 
S
E
 
E
S
 
N
L
 
M
S
 
A
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Y
W
 
H
E
 
K
T
 
A
L
 
R
S
 
E
R
 
Q
M
 
V
S
 
S
A
 
A
H
 
A
F
 
V
L
 
I
D
 
E
V
 
F
L
 
V
Q
 
Q
G
 
A
L
 
M
T
 
P
T
 
V
L
 
V
K
 
R
I
 
T
F
 
F
G
 
D
R
 
S
S
 
G
K
 
S
S
 
T
Q
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
R
-
 
Y
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
-
 
L
A
 
E
E
 
E
V
 
W
I
 
V
G
 
D
Q
 
V
I
 
L
S
 
K
S
 
T
R
x
W
F
x
Y
R
 
R
E
 
-
T
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
R
 
K
V
x
A
A
 
G
F
 
F
L
 
S
S
x
A
A
 
R
L
 
F
V
 
S
L
x
F
E
 
S
F
 
I
L
 
L
A
 
N
T
 
P
I
 
L
S
 
P
T
 
T
A
 
L
L
 
F
V
 
V
A
 
L
V
 
I
T
 
W
V
 
S
G
 
G
L
 
Y
R
 
G
L
 
L
V
 
L
-
 
H
Y
 
Y
A
 
G
H
 
S
I
 
F
P
 
D
F
 
F
E
 
I
Q
 
A
A
 
W
F
 
V
F
 
A
L
 
V
L
 
L
L
 
L
L
 
L
A
 
G
P
 
S
-
 
G
-
 
M
-
 
A
E
 
E
F
 
A
Y
 
V
L
 
M
P
 
P
L
 
M
R
 
M
L
 
M
L
 
L
G
 
N
S
x
N
H
 
L
F
 
V
H
 
A
A
 
Q
G
 
T
L
 
R
M
 
L
G
 
S
V
 
I
S
 
Q
A
 
R
A
 
I
G
 
Y
R
 
Q
I
 
V
F
 
L
A
 
A
I
 
M
L
 
P
E
 
E
T
 
L
P
 
S
L
 
L
P
 
P
E
 
Q
R
 
S
K
 
D
L
 
Q
Q
 
Q
G
 
P
E
 
Q
C
 
-
H
 
-
L
 
-
S
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
-
S
 
E
F
 
A
Q
 
S
I
 
I
A
 
T
F
 
F
E
 
E
D
 
Q
V
 
V
H
 
S
Y
 
F
A
 
H
F
 
Y
E
 
P
D
 
Q
G
 
A
A
 
R
R
 
T
-
 
G
P
 
A
A
 
A
L
 
L
Q
 
Q
G
 
E
I
 
V
S
 
S
F
 
F
E
 
H
L
 
V
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
Q
R
 
I
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
P
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
A
 
V
A
 
A
H
 
R
L
 
L
L
 
L
L
 
L
Q
 
R
F
 
Y
M
 
A
A
 
D
P
 
P
D
 
D
R
 
K
G
 
G
R
 
H
I
 
I
T
 
R
V
 
I
N
 
G
G
 
G
I
 
V
P
 
D
L
 
L
D
 
R
R
 
D
I
 
M
P
 
Q
V
 
T
E
 
D
E
 
T
W
 
L
R
 
M
R
 
K
H
 
Q
I
 
L
A
 
S
L
 
F
V
 
V
P
 
F
Q
 
Q
K
 
D
P
 
N
Y
 
F
F
 
L
F
 
F
Y
 
A
G
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
R
 
R
L
 
L
G
 
G
R
 
A
P
 
P
G
 
D
A
 
T
A
 
P
L
 
L
E
 
E
E
 
A
V
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Q
 
V
A
 
A
G
 
Q
A
 
A
H
 
H
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
S
D
 
A
L
 
L
P
 
P
Q
 
E
G
 
G
Y
 
Y
D
 
N
T
 
T
Q
 
R
V
 
V
G
 
G
E
 
E
G
 
R
G
 
G
I
 
V
R
 
F
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
T
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
Q
N
 
D
A
 
R
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
V
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
A
G
 
F
L
 
A
D
 
D
P
 
P
V
 
E
N
 
N
E
 
E
R
 
A
L
 
A
V
 
L
L
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
E
 
A
R
 
A
L
 
A
M
 
M
Q
 
R
G
 
G
R
 
R
T
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
M
I
 
V
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
M
V
 
V
H
 
T
R
 
Q
A
 
A
D
 
D
R
 
V
I
 
I
I
 
L
V
 
L
L
 
F
E
 
S
R
 
D
G
 
G
R
 
Q
V
 
L
A
 
R
E
 
E
T
 
M
G
 
G
R
 
N
H
 
H
K
 
T
E
 
Q
L
 
L
I
 
L
E
 
A
Q
 
Q
Q
 
G
G
 
G
V
 
L
Y
 
Y
H
 
Q
R
 
R
L
 
L

9csiA Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA (see paper)
32% identity, 89% coverage: 57:568/576 of query aligns to 59:567/569 of 9csiA

query
sites
9csiA
P
 
D
W
 
W
L
 
F
Y
 
P
P
 
L
L
 
L
L
x
I
G
 
I
V
 
L
I
 
L
I
 
V
F
 
F
R
 
F
A
x
R
G
 
G
L
 
L
-
 
G
T
 
L
W
 
F
M
 
M
G
 
G
E
 
G
V
 
Y
V
 
Y
A
 
T
H
 
A
R
 
V
A
 
I
A
 
S
A
 
R
Q
 
S
I
 
L
K
 
V
H
 
F
A
 
S
L
 
I
R
 
R
Q
 
Q
R
 
E
L
 
V
L
 
Y
A
 
A
H
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
R
L
 
L
G
 
P
P
 
A
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
Y
G
 
L
G
 
D
E
 
N
R
 
S
T
 
S
G
 
G
E
 
H
L
 
I
V
 
T
N
 
A
A
 
K
L
 
I
V
 
M
E
 
Y
G
 
N
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
D
 
T
A
 
A
Y
 
A
F
 
S
T
 
S
R
 
E
Y
 
S
L
 
L
P
 
K
Q
 
T
L
 
I
A
 
V
L
 
R
A
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
I
P
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
V
 
L
F
 
F
P
 
Y
L
 
T
D
 
N
T
 
W
I
 
R
S
 
L
G
 
T
L
 
I
I
 
C
L
 
I
L
 
M
F
 
V
T
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
I
P
 
G
L
 
I
F
 
L
M
 
V
F
 
R
L
 
K
I
 
A
G
 
S
R
 
K
W
 
R
A
 
M
E
 
R
S
 
K
L
 
L
S
 
S
Q
 
M
R
 
Q
Q
 
V
W
 
Q
E
 
D
T
 
T
L
 
M
S
 
G
R
 
D
M
 
V
S
 
N
A
 
H
H
 
V
F
 
V
L
 
Q
D
 
E
V
 
S
L
 
I
Q
 
N
G
 
G
L
 
N
T
 
A
T
 
V
L
 
V
K
 
K
I
 
S
F
 
F
G
 
A
R
 
G
S
 
E
K
 
E
S
 
S
Q
 
E
A
 
Q
E
 
E
V
 
R
I
 
F
G
 
Y
Q
 
K
I
 
S
S
 
S
S
 
E
R
 
E
F
 
N
R
 
L
E
 
K
T
 
R
T
 
G
L
 
L
G
 
K
V
 
M
L
 
V
R
 
I
V
 
V
A
 
Q
F
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
S
L
 
P
V
 
V
L
 
V
E
 
Q
F
 
V
L
 
V
A
x
M
T
 
A
I
 
C
S
 
A
T
x
M
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
-
V
 
V
T
 
W
V
 
L
G
 
A
L
 
L
R
 
R
-
 
P
L
 
Q
V
 
I
Y
 
L
A
 
G
H
 
N
I
 
T
P
 
T
F
 
A
E
 
G
Q
 
E
A
 
F
F
 
V
F
 
A
L
 
Y
L
 
I
L
x
T
L
 
A
A
|
A
P
x
G
E
 
L
F
 
L
Y
 
S
L
 
K
P
 
P
L
 
V
R
 
K
L
 
N
L
 
L
G
 
T
S
 
D
H
 
V
F
 
N
H
 
E
A
 
K
G
 
L
L
 
Q
M
 
R
G
 
G
V
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
H
R
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
E
I
 
L
L
 
L
E
 
D
T
 
-
P
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
E
R
 
E
K
 
Q
L
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
C
 
L
H
 
K
L
 
-
S
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
-
 
G
-
 
A
I
 
I
A
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
H
V
 
V
H
 
V
Y
 
L
A
 
N
F
x
Y
E
 
A
D
|
D
G
 
G
A
x
T
R
 
Q
P
 
-
A
 
A
L
 
I
Q
 
K
G
 
D
I
 
F
S
 
S
F
 
L
E
 
D
L
 
I
H
 
R
S
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
|
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
x
S
A
 
L
A
 
V
H
 
N
L
 
M
L
 
L
L
 
V
Q
 
R
F
 
F
M
 
Q
A
 
E
P
 
V
D
 
S
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
Y
V
 
L
N
 
D
G
 
D
I
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
R
R
 
D
I
 
I
P
 
E
V
 
L
E
 
S
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
T
H
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
V
P
 
N
Q
|
Q
K
 
Q
P
 
V
Y
 
V
F
 
L
F
 
F
Y
 
N
G
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
R
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
Q
-
 
L
P
 
H
G
 
N
A
 
A
A
 
S
L
 
D
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
Y
A
 
A
H
 
H
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
M
D
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
Q
 
V
V
 
L
G
 
G
E
 
A
G
 
Q
G
 
G
I
 
L
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
N
V
 
E
N
 
S
E
 
E
R
 
H
L
 
F
V
 
I
L
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
E
 
D
R
 
E
L
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
D
R
 
R
T
 
T
A
 
T
L
 
I
I
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
T
V
 
I
H
 
E
R
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
 
M
E
 
D
R
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
T
H
 
H
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
A
Q
 
K
Q
 
H
G
 
G
V
 
A
Y
 
Y
H
 
Y
R
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7metA A. Baumannii msba in complex with tbt1 decoupler (see paper)
32% identity, 89% coverage: 57:568/576 of query aligns to 53:561/564 of 7metA

query
sites
7metA
P
 
D
W
 
W
L
 
F
Y
 
P
P
 
L
L
 
L
L
 
I
G
 
I
V
 
L
I
 
L
I
 
V
F
 
F
R
 
F
A
 
R
G
 
G
L
 
L
-
 
G
T
 
L
W
 
F
M
 
M
G
 
G
E
 
G
V
 
Y
V
 
Y
A
 
T
H
 
A
R
 
V
A
 
I
A
 
S
A
 
R
Q
 
S
I
 
L
K
 
V
H
 
F
A
 
S
L
 
I
R
 
R
Q
 
Q
R
 
E
L
 
V
L
 
Y
A
 
A
H
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
R
L
 
L
G
 
P
P
 
A
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
Y
G
 
L
G
 
D
E
 
N
R
 
S
T
 
S
G
 
G
E
 
H
L
 
I
V
 
T
N
 
A
A
 
K
L
 
I
V
 
M
E
 
Y
G
 
N
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
D
 
T
A
 
A
Y
 
A
F
 
S
T
 
S
R
 
E
Y
 
S
L
 
L
P
 
K
Q
 
T
L
 
I
A
 
V
L
 
R
A
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
I
P
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
V
 
L
F
 
F
P
 
Y
L
 
T
D
 
N
T
 
W
I
 
R
S
 
L
G
 
T
L
 
I
I
 
C
L
 
I
L
 
M
F
 
V
T
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
I
I
 
I
P
 
G
L
 
I
F
 
L
M
 
V
F
 
R
L
 
K
I
 
A
G
 
S
R
 
K
W
 
R
A
 
M
E
 
R
S
 
K
L
 
L
S
 
S
Q
 
M
R
 
Q
Q
 
V
W
 
Q
E
 
D
T
 
T
L
 
M
S
 
G
R
 
D
M
 
V
S
 
N
A
 
H
H
 
V
F
 
V
L
 
Q
D
 
E
V
 
S
L
 
I
Q
 
N
G
 
G
L
 
N
T
 
A
T
 
V
L
 
V
K
 
K
I
 
S
F
 
F
G
 
A
R
 
G
S
 
E
K
 
E
S
 
S
Q
 
E
A
 
Q
E
 
E
V
 
R
I
 
F
G
 
Y
Q
 
K
I
 
S
S
 
S
S
 
E
R
 
E
F
 
N
R
 
L
E
 
K
T
 
R
T
 
G
L
 
L
G
 
K
V
 
M
L
 
V
R
 
I
V
 
V
A
 
Q
F
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
S
L
 
P
V
 
V
L
 
V
E
 
Q
F
 
V
L
 
V
A
x
M
T
 
A
I
 
C
S
 
A
T
 
M
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
-
V
 
V
T
 
W
V
 
L
G
 
A
L
 
L
R
 
R
-
 
P
L
 
Q
V
 
I
Y
 
L
A
 
G
H
 
N
I
 
T
P
 
T
F
 
A
E
 
G
Q
 
E
A
 
F
F
 
V
F
 
A
L
 
Y
L
 
I
L
 
T
L
 
A
A
|
A
P
x
G
E
 
L
F
 
L
Y
x
S
L
x
K
P
 
P
L
x
V
R
 
K
L
 
N
L
 
L
G
 
T
S
 
D
H
 
V
F
 
N
H
 
E
A
 
K
G
 
L
L
 
Q
M
 
R
G
 
G
V
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
H
R
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
E
I
 
L
L
 
L
E
 
D
T
 
-
P
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
E
R
 
E
K
 
Q
L
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
C
 
L
H
 
K
L
 
-
S
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
-
 
G
-
 
A
I
 
I
A
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
H
V
 
V
H
 
V
Y
 
L
A
 
N
F
 
Y
E
 
A
D
 
D
G
 
G
A
 
T
R
 
Q
P
 
-
A
 
A
L
 
I
Q
 
K
G
 
D
I
 
F
S
 
S
F
 
L
E
 
D
L
 
I
H
 
R
S
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
A
G
 
G
K
 
K
S
 
T
T
 
S
A
 
L
A
 
V
H
 
N
L
 
M
L
 
L
L
 
V
Q
 
R
F
 
F
M
 
Q
A
 
E
P
 
V
D
 
S
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
Y
V
 
L
N
 
D
G
 
D
I
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
R
R
 
D
I
 
I
P
 
E
V
 
L
E
 
S
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
T
H
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
V
P
 
N
Q
 
Q
K
 
Q
P
 
V
Y
 
V
F
 
L
F
 
F
Y
 
N
G
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
R
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
Q
-
 
L
P
 
H
G
 
N
A
 
A
A
 
S
L
 
D
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
Y
A
 
A
H
 
H
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
M
D
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
Q
 
V
V
 
L
G
 
G
E
 
A
G
 
Q
G
 
G
I
 
L
R
 
N
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
N
V
 
E
N
 
S
E
 
E
R
 
H
L
 
F
V
 
I
L
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
E
 
D
R
 
E
L
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
D
R
 
R
T
 
T
A
 
T
L
 
I
I
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
T
V
 
I
H
 
E
R
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
 
M
E
 
D
R
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
T
H
 
H
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
A
Q
 
K
Q
 
H
G
 
G
V
 
A
Y
 
Y
H
 
Y
R
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

8gk7A Msba bound to cerastecin c (see paper)
32% identity, 89% coverage: 57:568/576 of query aligns to 54:562/564 of 8gk7A

query
sites
8gk7A
P
 
D
W
 
W
L
 
F
Y
 
P
P
 
L
L
 
L
L
x
I
G
 
I
V
 
L
I
 
L
I
 
V
F
 
F
R
 
F
A
x
R
G
 
G
L
 
L
-
 
G
T
 
L
W
 
F
M
 
M
G
 
G
E
 
G
V
 
Y
V
 
Y
A
 
T
H
 
A
R
 
V
A
 
I
A
 
S
A
 
R
Q
 
S
I
 
L
K
 
V
H
 
F
A
 
S
L
 
I
R
 
R
Q
 
Q
R
 
E
L
 
V
L
 
Y
A
 
A
H
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
R
L
 
L
G
 
P
P
 
A
V
 
Q
Y
 
Y
A
 
Y
G
 
L
G
 
D
E
 
N
R
 
S
T
 
S
G
 
G
E
 
H
L
 
I
V
 
T
N
 
A
A
 
K
L
 
I
V
 
M
E
 
Y
G
 
N
I
 
V
E
 
E
A
 
Q
L
 
L
D
 
T
A
 
A
Y
 
A
F
 
S
T
 
S
R
 
E
Y
 
S
L
 
L
P
 
K
Q
 
T
L
 
I
A
 
V
L
 
R
A
 
D
A
 
G
L
 
M
V
 
I
P
 
T
L
 
L
A
 
G
V
 
L
L
 
L
G
 
G
F
 
Y
V
 
L
F
 
F
P
 
Y
L
 
T
D
 
N
T
 
W
I
 
R
S
 
L
G
 
T
L
 
I
I
 
C
L
 
I
L
 
M
F
 
V
T
 
F
A
 
L
P
 
P
L
 
V
I
 
I
P
 
G
L
 
I
F
 
L
M
 
V
F
 
R
L
 
K
I
 
A
G
 
S
R
 
K
W
 
R
A
 
M
E
 
R
S
 
K
L
 
L
S
 
S
Q
 
M
R
 
Q
Q
 
V
W
 
Q
E
 
D
T
 
T
L
 
M
S
 
G
R
 
D
M
 
V
S
 
N
A
 
H
H
 
V
F
 
V
L
 
Q
D
 
E
V
 
S
L
 
I
Q
 
N
G
 
G
L
 
N
T
 
A
T
 
V
L
 
V
K
 
K
I
 
S
F
 
F
G
 
A
R
 
G
S
 
E
K
 
E
S
 
S
Q
 
E
A
 
Q
E
 
E
V
 
R
I
 
F
G
 
Y
Q
 
K
I
 
S
S
 
S
S
 
E
R
 
E
F
 
N
R
 
L
E
 
K
T
 
R
T
 
G
L
 
L
G
 
K
V
 
M
L
 
V
R
 
I
V
 
V
A
 
Q
F
 
N
L
 
L
S
 
N
A
 
S
L
 
P
V
 
V
L
 
V
E
 
Q
F
 
V
L
 
V
A
x
M
T
 
A
I
 
C
S
 
A
T
x
M
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
-
V
 
V
T
 
W
V
 
L
G
 
A
L
 
L
R
 
R
-
 
P
L
 
Q
V
 
I
Y
 
L
A
 
G
H
 
N
I
 
T
P
 
T
F
 
A
E
 
G
Q
 
E
A
 
F
F
 
V
F
 
A
L
 
Y
L
x
I
L
x
T
L
 
A
A
|
A
P
x
G
E
 
L
F
 
L
Y
x
S
L
 
K
P
 
P
L
 
V
R
 
K
L
 
N
L
 
L
G
 
T
S
 
D
H
 
V
F
 
N
H
 
E
A
 
K
G
 
L
L
 
Q
M
 
R
G
 
G
V
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
H
R
 
S
I
 
V
F
 
F
A
 
E
I
 
L
L
 
L
E
 
D
T
 
-
P
 
-
L
 
L
P
 
P
E
 
E
R
 
E
K
 
Q
L
 
N
Q
 
S
G
 
G
E
 
E
C
 
L
H
 
K
L
 
-
S
 
-
H
 
-
D
 
-
P
 
P
S
 
Q
F
 
L
Q
 
Q
-
 
G
-
 
A
I
 
I
A
 
R
F
 
F
E
 
D
D
 
H
V
 
V
H
 
V
Y
 
L
A
 
N
F
x
Y
E
 
A
D
 
D
G
 
G
A
x
T
R
 
Q
P
 
-
A
 
A
L
 
I
Q
 
K
G
 
D
I
 
F
S
 
S
F
 
L
E
 
D
L
 
I
H
 
R
S
 
P
G
 
G
E
 
E
R
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
|
S
G
|
G
A
 
A
G
|
G
K
|
K
S
x
T
T
 
S
A
 
L
A
 
V
H
 
N
L
 
M
L
 
L
L
 
V
Q
 
R
F
 
F
M
 
Q
A
 
E
P
 
V
D
 
S
R
 
S
G
 
G
R
 
Q
I
 
I
T
 
Y
V
 
L
N
 
D
G
 
D
I
 
L
P
 
P
L
 
I
D
 
R
R
 
D
I
 
I
P
 
E
V
 
L
E
 
S
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
T
H
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
M
V
 
V
P
 
N
Q
 
Q
K
 
Q
P
 
V
Y
 
V
F
 
L
F
 
F
Y
 
N
G
 
R
T
 
T
V
 
V
A
 
R
E
 
E
N
 
N
I
 
I
R
 
A
L
 
Y
G
 
G
R
 
Q
-
 
L
P
 
H
G
 
N
A
 
A
A
 
S
L
 
D
E
 
E
E
 
D
V
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
K
Q
 
A
A
 
A
G
 
Y
A
 
A
H
 
H
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
M
D
 
N
L
 
L
P
 
P
Q
 
N
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
T
 
T
Q
 
V
V
 
L
G
 
G
E
 
A
G
 
Q
G
 
G
I
 
L
R
x
N
L
|
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
I
L
 
L
K
 
K
N
 
N
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
N
V
 
E
N
 
S
E
 
E
R
 
H
L
 
F
V
 
I
L
 
Q
E
 
Q
A
 
A
L
 
F
E
 
D
R
 
E
L
 
A
M
 
M
Q
 
Q
G
 
D
R
 
R
T
 
T
A
 
T
L
 
I
I
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
T
V
 
I
H
 
E
R
 
N
A
 
A
D
 
D
R
 
R
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
 
M
E
 
D
R
 
R
G
 
G
R
 
Q
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
Q
G
 
G
R
 
T
H
 
H
K
 
Q
E
 
E
L
 
L
I
 
L
E
 
A
Q
 
K
Q
 
H
G
 
G
V
 
A
Y
 
Y
H
 
Y
R
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

6bppA E. Coli msba in complex with lps and inhibitor g092 (see paper)
29% identity, 90% coverage: 49:568/576 of query aligns to 54:572/576 of 6bppA

query
sites
6bppA
G
 
G
Q
 
K
S
 
T
L
 
D
S
 
R
G
 
S
V
 
V
W
 
L
P
 
V
W
 
W
L
 
M
Y
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
V
-
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
L
I
 
M
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
G
G
 
I
L
 
T
T
 
S
W
 
Y
M
 
V
G
 
S
E
 
S
V
 
Y
V
 
C
A
 
I
H
 
S
R
 
W
A
 
V
A
 
S
A
 
G
Q
 
K
I
 
V
K
 
V
H
 
M
A
 
T
L
 
M
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
F
A
 
G
H
 
H
L
 
M
L
 
M
A
 
G
L
 
M
G
 
P
P
 
V
V
 
S
Y
 
F
A
 
F
G
 
D
G
 
K
E
 
Q
R
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
T
L
 
L
V
 
L
N
 
S
A
 
R
L
 
I
V
 
T
E
 
Y
G
 
D
I
 
S
E
 
E
A
 
Q
L
 
V
D
 
A
A
 
S
Y
 
S
F
 
S
T
 
S
R
 
G
Y
 
A
L
 
L
P
 
I
Q
 
T
L
 
V
A
 
V
L
 
R
-
 
E
-
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
I
V
 
I
P
 
G
L
 
L
A
 
F
V
 
I
L
 
M
G
 
M
F
 
F
V
 
Y
F
 
Y
P
 
S
L
 
W
D
 
Q
T
 
L
I
 
-
S
 
-
G
 
S
L
 
I
I
 
I
L
|
L
L
 
I
F
 
V
T
 
L
A
|
A
P
 
P
L
 
I
I
x
V
P
x
S
L
 
I
F
 
A
M
x
I
F
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
S
R
 
K
W
 
R
A
 
F
E
 
R
S
 
N
L
 
I
S
 
S
Q
 
K
R
 
N
Q
 
M
W
 
Q
E
 
N
T
 
T
L
 
M
S
 
G
R
 
Q
M
 
V
S
 
T
A
 
T
H
 
S
F
 
A
L
 
E
D
 
Q
V
 
M
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
L
 
H
T
 
K
T
 
E
L
 
V
K
 
L
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
G
S
 
Q
K
 
E
S
 
V
Q
 
E
A
 
T
E
 
K
V
 
R
I
 
F
G
 
D
Q
 
K
I
 
V
S
 
S
S
 
N
R
 
R
F
 
M
R
 
R
E
 
L
T
 
Q
T
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
M
L
 
V
R
 
S
V
 
A
A
 
S
F
 
S
L
 
I
S
 
S
A
 
D
L
 
P
V
 
I
L
 
I
E
 
Q
F
 
L
L
 
I
A
|
A
T
 
S
I
 
L
S
 
A
T
 
L
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
L
V
 
Y
T
 
A
V
 
A
G
 
S
L
 
F
R
 
P
L
 
S
V
 
V
Y
 
M
A
 
D
H
 
S
I
 
L
P
 
T
F
 
A
E
 
G
Q
 
T
A
 
I
F
 
T
F
 
V
L
 
V
L
 
F
L
 
S
L
 
S
A
x
M
P
 
I
E
 
A
F
x
L
Y
x
M
L
 
R
P
 
P
L
 
L
R
x
K
L
 
S
L
 
L
G
 
T
S
 
N
H
 
V
F
 
N
H
 
A
A
 
Q
G
 
F
L
 
Q
M
 
R
G
 
G
V
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
C
G
 
Q
R
 
T
I
 
L
F
 
F
A
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
D
T
 
S
P
 
E
L
 
-
P
 
-
E
 
Q
R
 
E
K
 
K
L
 
D
Q
 
E
G
 
G
E
 
K
C
 
-
H
 
R
L
 
V
S
 
I
H
 
E
D
 
R
P
 
A
S
 
T
F
 
G
Q
 
D
I
 
V
A
 
E
F
 
F
E
 
R
D
 
N
V
 
V
H
 
T
Y
 
F
A
 
T
F
 
Y
E
 
P
D
 
G
G
 
R
A
 
D
R
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
G
 
N
I
 
I
S
 
N
F
 
L
E
 
K
L
 
I
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
K
R
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
A
 
I
A
 
A
H
 
S
L
 
L
L
 
I
L
 
T
Q
 
R
F
 
F
M
 
Y
A
 
D
P
 
I
D
 
D
R
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
G
I
 
H
P
 
D
L
 
L
D
 
R
R
 
E
I
 
Y
P
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
N
H
 
Q
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
S
Q
 
Q
K
 
N
P
 
V
Y
 
H
F
 
L
F
 
F
Y
 
N
G
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
R
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
P
 
T
G
 
E
A
 
Q
-
 
Y
A
 
S
L
 
R
E
 
E
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Q
 
M
A
 
A
G
 
Y
A
 
A
H
 
M
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
N
D
 
K
L
 
M
P
 
D
Q
 
N
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
R
N
 
D
A
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
V
 
E
N
 
S
E
 
E
R
 
R
L
 
A
V
 
I
L
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
E
L
 
L
M
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
A
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
T
V
 
I
H
 
E
R
 
K
A
 
A
D
 
D
R
 
E
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
 
V
E
 
E
R
 
D
G
 
G
R
 
V
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
R
G
 
G
R
 
T
H
 
H
K
 
N
E
 
D
L
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
H
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
H
 
A
R
 
Q
L
 
L

6bplA E. Coli msba in complex with lps and inhibitor g907 (see paper)
29% identity, 90% coverage: 49:568/576 of query aligns to 54:572/576 of 6bplA

query
sites
6bplA
G
 
G
Q
 
K
S
 
T
L
 
D
S
 
R
G
 
S
V
 
V
W
 
L
P
 
V
W
 
W
L
 
M
Y
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
V
-
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
L
I
 
M
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
G
G
 
I
L
 
T
T
 
S
W
 
Y
M
 
V
G
 
S
E
 
S
V
 
Y
V
 
C
A
 
I
H
 
S
R
 
W
A
 
V
A
 
S
A
 
G
Q
 
K
I
 
V
K
 
V
H
 
M
A
 
T
L
 
M
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
F
A
 
G
H
 
H
L
 
M
L
 
M
A
 
G
L
 
M
G
 
P
P
 
V
V
 
S
Y
 
F
A
 
F
G
 
D
G
 
K
E
 
Q
R
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
T
L
 
L
V
 
L
N
 
S
A
 
R
L
 
I
V
 
T
E
 
Y
G
 
D
I
 
S
E
 
E
A
 
Q
L
 
V
D
 
A
A
 
S
Y
 
S
F
 
S
T
 
S
R
 
G
Y
 
A
L
 
L
P
 
I
Q
 
T
L
 
V
A
 
V
L
 
R
-
 
E
-
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
I
V
 
I
P
 
G
L
 
L
A
x
F
V
 
I
L
 
M
G
 
M
F
 
F
V
 
Y
F
 
Y
P
 
S
L
 
W
D
 
Q
T
 
L
I
 
-
S
 
-
G
 
S
L
 
I
I
 
I
L
|
L
L
 
I
F
 
V
T
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
I
x
V
P
x
S
L
 
I
F
 
A
M
x
I
F
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
S
R
 
K
W
 
R
A
 
F
E
 
R
S
 
N
L
 
I
S
 
S
Q
 
K
R
 
N
Q
 
M
W
 
Q
E
 
N
T
 
T
L
 
M
S
 
G
R
 
Q
M
 
V
S
 
T
A
 
T
H
 
S
F
 
A
L
 
E
D
 
Q
V
 
M
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
L
 
H
T
 
K
T
 
E
L
 
V
K
 
L
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
G
S
 
Q
K
 
E
S
 
V
Q
 
E
A
 
T
E
 
K
V
 
R
I
 
F
G
 
D
Q
 
K
I
 
V
S
 
S
S
 
N
R
 
R
F
 
M
R
 
R
E
 
L
T
 
Q
T
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
M
L
 
V
R
 
S
V
 
A
A
 
S
F
 
S
L
 
I
S
 
S
A
 
D
L
 
P
V
 
I
L
 
I
E
 
Q
F
 
L
L
 
I
A
|
A
T
 
S
I
 
L
S
 
A
T
 
L
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
L
V
 
Y
T
 
A
V
 
A
G
 
S
L
 
F
R
 
P
L
 
S
V
 
V
Y
 
M
A
 
D
H
 
S
I
 
L
P
 
T
F
 
A
E
 
G
Q
 
T
A
 
I
F
 
T
F
 
V
L
 
V
L
 
F
L
 
S
L
 
S
A
x
M
P
 
I
E
 
A
F
x
L
Y
x
M
L
 
R
P
 
P
L
|
L
R
x
K
L
 
S
L
 
L
G
 
T
S
 
N
H
 
V
F
 
N
H
 
A
A
 
Q
G
 
F
L
 
Q
M
 
R
G
 
G
V
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
C
G
 
Q
R
 
T
I
 
L
F
 
F
A
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
D
T
 
S
P
 
E
L
 
-
P
 
-
E
 
Q
R
 
E
K
 
K
L
 
D
Q
 
E
G
 
G
E
 
K
C
 
-
H
 
R
L
 
V
S
 
I
H
 
E
D
 
R
P
 
A
S
 
T
F
 
G
Q
 
D
I
 
V
A
 
E
F
 
F
E
 
R
D
 
N
V
 
V
H
 
T
Y
 
F
A
 
T
F
 
Y
E
 
P
D
 
G
G
 
R
A
 
D
R
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
G
 
N
I
 
I
S
 
N
F
 
L
E
 
K
L
 
I
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
K
R
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
A
 
I
A
 
A
H
 
S
L
 
L
L
 
I
L
 
T
Q
 
R
F
 
F
M
 
Y
A
 
D
P
 
I
D
 
D
R
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
G
I
 
H
P
 
D
L
 
L
D
 
R
R
 
E
I
 
Y
P
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
N
H
 
Q
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
S
Q
 
Q
K
 
N
P
 
V
Y
 
H
F
 
L
F
 
F
Y
 
N
G
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
R
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
P
 
T
G
 
E
A
 
Q
-
 
Y
A
 
S
L
 
R
E
 
E
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Q
 
M
A
 
A
G
 
Y
A
 
A
H
 
M
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
N
D
 
K
L
 
M
P
 
D
Q
 
N
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
R
N
 
D
A
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
V
 
E
N
 
S
E
 
E
R
 
R
L
 
A
V
 
I
L
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
E
L
 
L
M
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
A
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
T
V
 
I
H
 
E
R
 
K
A
 
A
D
 
D
R
 
E
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
 
V
E
 
E
R
 
D
G
 
G
R
 
V
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
R
G
 
G
R
 
T
H
 
H
K
 
N
E
 
D
L
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
H
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
H
 
A
R
 
Q
L
 
L

7ph2A Nanodisc reconstituted msba in complex with nanobodies, spin-labeled at position a60c (see paper)
29% identity, 90% coverage: 49:568/576 of query aligns to 46:564/569 of 7ph2A

query
sites
7ph2A
G
 
G
Q
 
K
S
 
T
L
 
D
S
 
R
G
 
S
V
 
V
W
 
L
P
 
V
W
 
W
L
 
M
Y
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
V
-
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
L
I
 
M
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
G
G
 
I
L
 
T
T
 
S
W
 
Y
M
 
V
G
 
S
E
 
S
V
 
Y
V
 
C
A
 
I
H
 
S
R
 
W
A
 
V
A
 
S
A
 
G
Q
 
K
I
 
V
K
 
V
H
 
M
A
 
T
L
 
M
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
F
A
 
G
H
 
H
L
 
M
L
 
M
A
 
G
L
 
M
G
 
P
P
 
V
V
 
S
Y
 
F
A
 
F
G
 
D
G
 
K
E
 
Q
R
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
T
L
 
L
V
 
L
N
 
S
A
 
R
L
 
I
V
 
T
E
 
Y
G
 
D
I
 
S
E
 
E
A
 
Q
L
 
V
D
 
A
A
 
S
Y
 
S
F
 
S
T
 
S
R
 
G
Y
 
A
L
 
L
P
 
I
Q
 
T
L
 
V
A
 
V
L
 
R
-
 
E
-
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
I
V
 
I
P
 
G
L
 
L
A
 
F
V
 
I
L
 
M
G
 
M
F
 
F
V
 
Y
F
 
Y
P
 
S
L
 
W
D
 
Q
T
 
L
I
 
-
S
 
-
G
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
L
L
 
I
F
 
V
T
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
I
 
V
P
 
S
L
 
I
F
 
A
M
 
I
F
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
S
R
 
K
W
 
R
A
 
F
E
 
R
S
 
N
L
 
I
S
 
S
Q
 
K
R
 
N
Q
 
M
W
 
Q
E
 
N
T
 
T
L
 
M
S
 
G
R
 
Q
M
 
V
S
 
T
A
 
T
H
 
S
F
 
A
L
 
E
D
 
Q
V
 
M
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
L
 
H
T
 
K
T
 
E
L
 
V
K
 
L
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
G
S
 
Q
K
 
E
S
 
V
Q
 
E
A
 
T
E
 
K
V
 
R
I
 
F
G
 
D
Q
 
K
I
 
V
S
 
S
S
 
N
R
 
R
F
 
M
R
 
R
E
 
L
T
 
Q
T
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
M
L
 
V
R
 
S
V
 
A
A
 
S
F
 
S
L
 
I
S
 
S
A
 
D
L
 
P
V
 
I
L
 
I
E
 
Q
F
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
L
S
 
A
T
 
L
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
L
V
 
Y
T
 
A
V
 
A
G
 
S
L
 
F
R
 
P
L
 
S
V
 
V
Y
 
M
A
 
D
H
 
S
I
 
L
P
 
T
F
 
A
E
 
G
Q
 
T
A
 
I
F
 
T
F
 
V
L
 
V
L
x
F
L
 
S
L
 
S
A
 
M
P
 
I
E
x
A
F
 
L
Y
 
M
L
x
R
P
 
P
L
 
L
R
 
K
L
 
S
L
 
L
G
 
T
S
 
N
H
 
V
F
 
N
H
 
A
A
 
Q
G
 
F
L
 
Q
M
 
R
G
 
G
V
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
C
G
 
Q
R
 
T
I
 
L
F
 
F
A
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
D
T
 
S
P
 
E
L
 
-
P
 
-
E
 
Q
R
 
E
K
 
K
L
 
D
Q
 
E
G
 
G
E
 
K
C
 
-
H
 
R
L
 
V
S
 
I
H
 
E
D
 
R
P
 
A
S
 
T
F
 
G
Q
 
D
I
 
V
A
 
E
F
 
F
E
 
R
D
 
N
V
 
V
H
 
T
Y
 
F
A
 
T
F
 
Y
E
 
P
D
 
G
G
 
R
A
 
D
R
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
G
 
N
I
 
I
S
 
N
F
 
L
E
 
K
L
 
I
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
K
R
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
T
 
T
A
 
I
A
 
A
H
 
S
L
 
L
L
 
I
L
 
T
Q
 
R
F
 
F
M
 
Y
A
 
D
P
 
I
D
 
D
R
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
G
I
 
H
P
 
D
L
 
L
D
 
R
R
 
E
I
 
Y
P
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
N
H
 
Q
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
S
Q
 
Q
K
 
N
P
 
V
Y
 
H
F
 
L
F
 
F
Y
 
N
G
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
R
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
P
 
T
G
 
E
A
 
Q
-
 
Y
A
 
S
L
 
R
E
 
E
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Q
 
M
A
 
A
G
 
Y
A
 
A
H
 
M
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
N
D
 
K
L
 
M
P
 
D
Q
 
N
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
N
G
 
G
I
 
V
R
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
R
N
 
D
A
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
V
 
E
N
 
S
E
 
E
R
 
R
L
 
A
V
 
I
L
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
E
L
 
L
M
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
A
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
T
V
 
I
H
 
E
R
 
K
A
 
A
D
 
D
R
 
E
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
 
V
E
 
E
R
 
D
G
 
G
R
 
V
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
R
G
 
G
R
 
T
H
 
H
K
 
N
E
 
D
L
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
H
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
H
 
A
R
 
Q
L
 
L

Sites not aligning to the query:

7ph3A Amp-pnp bound nanodisc reconstituted msba with nanobodies, spin- labeled at position a60c (see paper)
29% identity, 90% coverage: 49:568/576 of query aligns to 55:573/577 of 7ph3A

query
sites
7ph3A
G
 
G
Q
 
K
S
 
T
L
 
D
S
 
R
G
 
S
V
 
V
W
 
L
P
 
V
W
 
W
L
 
M
Y
 
-
P
 
P
L
 
L
-
 
V
-
 
V
L
 
I
G
 
G
V
 
L
I
 
M
I
 
I
F
 
L
R
 
R
A
 
G
G
 
I
L
 
T
T
 
S
W
 
Y
M
 
V
G
 
S
E
 
S
V
 
Y
V
 
C
A
 
I
H
 
S
R
 
W
A
 
V
A
 
S
A
 
G
Q
 
K
I
 
V
K
 
V
H
 
M
A
 
T
L
 
M
R
 
R
Q
 
R
R
 
R
L
 
L
L
 
F
A
 
G
H
 
H
L
 
M
L
 
M
A
 
G
L
 
M
G
 
P
P
 
V
V
 
S
Y
 
F
A
 
F
G
 
D
G
 
K
E
 
Q
R
 
S
T
 
T
G
 
G
E
 
T
L
 
L
V
 
L
N
 
S
A
 
R
L
 
I
V
 
T
E
 
Y
G
 
D
I
 
S
E
 
E
A
 
Q
L
 
V
D
 
A
A
 
S
Y
 
S
F
 
S
T
 
S
R
 
G
Y
 
A
L
 
L
P
 
I
Q
 
T
L
 
V
A
 
V
L
 
R
-
 
E
-
 
G
A
 
A
A
 
S
L
 
I
V
 
I
P
 
G
L
 
L
A
 
F
V
 
I
L
 
M
G
 
M
F
 
F
V
 
Y
F
 
Y
P
 
S
L
 
W
D
 
Q
T
 
L
I
 
-
S
 
-
G
 
S
L
 
I
I
 
I
L
 
L
L
 
I
F
 
V
T
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
I
 
V
P
 
S
L
 
I
F
 
A
M
 
I
F
 
R
L
 
V
I
 
V
G
 
S
R
 
K
W
 
R
A
 
F
E
 
R
S
 
N
L
 
I
S
 
S
Q
 
K
R
 
N
Q
 
M
W
 
Q
E
 
N
T
 
T
L
 
M
S
 
G
R
 
Q
M
 
V
S
 
T
A
 
T
H
 
S
F
 
A
L
 
E
D
 
Q
V
 
M
L
 
L
Q
 
K
G
 
G
L
 
H
T
 
K
T
 
E
L
 
V
K
 
L
I
 
I
F
 
F
G
 
G
R
 
G
S
 
Q
K
 
E
S
 
V
Q
 
E
A
 
T
E
 
K
V
 
R
I
 
F
G
 
D
Q
 
K
I
 
V
S
 
S
S
 
N
R
 
R
F
 
M
R
 
R
E
 
L
T
 
Q
T
 
G
L
 
M
G
 
K
V
 
M
L
 
V
R
 
S
V
 
A
A
 
S
F
 
S
L
 
I
S
 
S
A
 
D
L
 
P
V
 
I
L
 
I
E
 
Q
F
 
L
L
 
I
A
 
A
T
 
S
I
 
L
S
 
A
T
 
L
A
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
L
V
 
Y
T
 
A
V
 
A
G
 
S
L
 
F
R
 
P
L
 
S
V
 
V
Y
 
M
A
 
D
H
 
S
I
 
L
P
 
T
F
 
A
E
 
G
Q
 
T
A
 
I
F
 
T
F
 
V
L
 
V
L
 
F
L
 
S
L
 
S
A
 
M
P
 
I
E
 
A
F
 
L
Y
 
M
L
 
R
P
 
P
L
 
L
R
 
K
L
 
S
L
 
L
G
 
T
S
 
N
H
 
V
F
 
N
H
 
A
A
 
Q
G
 
F
L
 
Q
M
 
R
G
 
G
V
 
M
S
 
A
A
 
A
A
 
C
G
 
Q
R
 
T
I
 
L
F
 
F
A
 
T
I
 
I
L
 
L
E
 
D
T
 
S
P
 
E
L
 
-
P
 
-
E
 
Q
R
 
E
K
 
K
L
 
D
Q
 
E
G
 
G
E
 
K
C
 
-
H
 
R
L
 
V
S
 
I
H
 
E
D
 
R
P
 
A
S
 
T
F
 
G
Q
 
D
I
 
V
A
 
E
F
 
F
E
 
R
D
 
N
V
 
V
H
 
T
Y
 
F
A
 
T
F
x
Y
E
 
P
D
 
G
G
 
R
A
 
D
R
 
V
P
 
P
A
 
A
L
 
L
Q
 
R
G
 
N
I
 
I
S
 
N
F
 
L
E
 
K
L
 
I
H
 
P
S
 
A
G
 
G
E
 
K
R
 
T
V
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
T
|
T
A
 
I
A
 
A
H
 
S
L
 
L
L
 
I
L
 
T
Q
 
R
F
 
F
M
 
Y
A
 
D
P
 
I
D
 
D
R
 
E
G
 
G
R
 
E
I
 
I
T
 
L
V
 
M
N
 
D
G
 
G
I
 
H
P
 
D
L
 
L
D
 
R
R
 
E
I
 
Y
P
 
T
V
 
L
E
 
A
E
 
S
W
 
L
R
 
R
R
 
N
H
 
Q
I
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
P
 
S
Q
|
Q
K
 
N
P
 
V
Y
 
H
F
 
L
F
 
F
Y
 
N
G
 
D
T
 
T
V
 
V
A
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
R
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
P
 
T
G
 
E
A
 
Q
-
 
Y
A
 
S
L
 
R
E
 
E
E
 
Q
V
 
I
A
 
E
A
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
R
Q
 
M
A
 
A
G
 
Y
A
 
A
H
 
M
Q
 
D
F
 
F
I
 
I
L
 
N
D
 
K
L
 
M
P
 
D
Q
 
N
G
 
G
Y
 
L
D
 
D
T
 
T
Q
 
V
V
 
I
G
 
G
E
 
E
G
 
N
G
 
G
I
 
V
R
x
L
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
A
 
R
Q
 
Q
R
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
F
 
L
L
 
L
K
 
R
N
 
D
A
 
S
P
 
P
L
 
I
L
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
L
D
 
D
P
 
T
V
 
E
N
 
S
E
 
E
R
 
R
L
 
A
V
 
I
L
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
R
 
E
L
 
L
M
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
A
 
S
L
 
L
I
 
V
I
 
I
A
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
N
 
S
T
 
T
V
 
I
H
 
E
R
 
K
A
 
A
D
 
D
R
 
E
I
 
I
I
 
V
V
 
V
L
 
V
E
 
E
R
 
D
G
 
G
R
 
V
V
 
I
A
 
V
E
 
E
T
 
R
G
 
G
R
 
T
H
 
H
K
 
N
E
 
D
L
 
L
I
 
L
E
 
E
Q
 
H
Q
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
Y
H
 
A
R
 
Q
L
 
L

Query Sequence

>WP_092482437.1 NCBI__GCF_900115975.1:WP_092482437.1
MMDKRLMREAGAVRSFLALSVGLGLGTGLLAILQASYLARVVNRVSLEGQSLSGVWPWLY
PLLGVIIFRAGLTWMGEVVAHRAAAQIKHALRQRLLAHLLALGPVYAGGERTGELVNALV
EGIEALDAYFTRYLPQLALAALVPLAVLGFVFPLDTISGLILLFTAPLIPLFMFLIGRWA
ESLSQRQWETLSRMSAHFLDVLQGLTTLKIFGRSKSQAEVIGQISSRFRETTLGVLRVAF
LSALVLEFLATISTALVAVTVGLRLVYAHIPFEQAFFLLLLAPEFYLPLRLLGSHFHAGL
MGVSAAGRIFAILETPLPERKLQGECHLSHDPSFQIAFEDVHYAFEDGARPALQGISFEL
HSGERVALVGPSGAGKSTAAHLLLQFMAPDRGRITVNGIPLDRIPVEEWRRHIALVPQKP
YFFYGTVAENIRLGRPGAALEEVAAAAEQAGAHQFILDLPQGYDTQVGEGGIRLSGGQAQ
RLAVARAFLKNAPLLILDEATAGLDPVNERLVLEALERLMQGRTALIIAHRLNTVHRADR
IIVLERGRVAETGRHKELIEQQGVYHRLIAAFGGAG

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory