SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_092484432.1 NCBI__GCF_900115975.1:WP_092484432.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6plfA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
41% identity, 93% coverage: 15:305/314 of query aligns to 17:305/305 of 6plfA

query
sites
6plfA
E
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
L
 
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
|
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V
K
 
D
V
 
M
F
 
V
Q
 
K
G
 
G

O43175 D-3-phosphoglycerate dehydrogenase; 3-PGDH; 2-oxoglutarate reductase; Malate dehydrogenase; EC 1.1.1.95; EC 1.1.1.399; EC 1.1.1.37 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
41% identity, 95% coverage: 15:312/314 of query aligns to 21:316/533 of O43175

query
sites
O43175
E
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
|
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
|
D
P
 
P
F
 
I
L
 
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
 
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
|
D
V
|
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
x
L
A
x
G
G
x
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V
K
 
D
V
 
M
F
 
V
Q
 
K
G
 
G
Q
 
K
Q
 
S
S
 
L
S
 
T
C
 
G
V
 
V
V
 
V

Sites not aligning to the query:

6plgA Crystal structure of human phgdh complexed with compound 15 (see paper)
41% identity, 92% coverage: 15:304/314 of query aligns to 16:303/303 of 6plgA

query
sites
6plgA
E
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
L
G
|
G
E
x
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
x
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
L
 
L
N
x
L
K
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V
K
 
D
V
 
M
F
 
V
Q
 
K

7dkmA Phgdh covalently linked to oridonin (see paper)
41% identity, 92% coverage: 15:304/314 of query aligns to 17:304/306 of 7dkmA

query
sites
7dkmA
E
x
K
I
|
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
x
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
x
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
|
G
I
 
L
G
 
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
 
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
 
S
T
|
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
x
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
x
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V
K
 
D
V
 
M
F
 
V
Q
 
K

Sites not aligning to the query:

6rj5A Crystal structure of phgdh in complex with compound 39 (see paper)
41% identity, 92% coverage: 15:302/314 of query aligns to 16:301/301 of 6rj5A

query
sites
6rj5A
E
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
x
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
L
x
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V
K
 
D
V
 
M

7ewhA Crystal structure of human phgdh in complex with homoharringtonine (see paper)
41% identity, 92% coverage: 15:302/314 of query aligns to 16:301/302 of 7ewhA

query
sites
7ewhA
E
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
x
L
G
|
G
I
x
L
G
|
G
E
x
R
I
|
I
G
|
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
 
Y
D
|
D
P
 
P
F
 
I
L
 
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V
K
 
D
V
 
M

6rihA Crystal structure of phgdh in complex with compound 9 (see paper)
41% identity, 92% coverage: 15:302/314 of query aligns to 16:301/302 of 6rihA

query
sites
6rihA
E
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
L
G
|
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
x
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V
K
 
D
V
 
M

6rj2A Crystal structure of phgdh in complex with compound 40 (see paper)
41% identity, 92% coverage: 15:302/314 of query aligns to 13:298/299 of 6rj2A

query
sites
6rj2A
E
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
L
G
|
G
E
 
R
I
|
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
x
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
 
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
 
C
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V
K
 
D
V
 
M

6rj3A Crystal structure of phgdh in complex with compound 15 (see paper)
42% identity, 90% coverage: 15:296/314 of query aligns to 15:294/297 of 6rj3A

query
sites
6rj3A
E
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
x
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
x
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
 
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A

6cwaA Crystal structure phgdh in complex with nadh and 3-phosphoglycerate at 1.77 a resolution (see paper)
42% identity, 91% coverage: 15:300/314 of query aligns to 15:298/299 of 6cwaA

query
sites
6cwaA
E
 
K
I
 
I
L
 
L
S
 
Q
E
 
D
M
 
G
G
 
G
E
 
L
V
 
Q
I
 
V
Y
 
V
D
 
E
P
 
K
E
 
Q
L
 
N
W
 
L
R
 
S
K
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
L
P
 
I
D
 
A
I
 
E
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
A
T
 
D
L
 
V
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
|
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
x
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
x
I
L
 
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
|
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
 
S
T
|
T
R
 
T
H
 
G
L
 
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
x
C
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
x
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V

1wwkA Crystal structure of phosphoglycerate dehydrogenase from pyrococcus horikoshii ot3
44% identity, 97% coverage: 1:305/314 of query aligns to 1:304/304 of 1wwkA

query
sites
1wwkA
M
 
M
K
 
K
T
 
V
V
 
L
I
 
V
T
 
A
E
 
A
L
 
P
N
 
L
W
 
H
K
 
E
Q
 
K
G
 
A
N
 
I
E
 
Q
I
 
V
L
 
L
S
 
K
E
 
D
M
 
A
G
 
G
-
 
L
E
 
E
V
 
V
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
P
 
-
E
 
E
L
 
Y
W
 
P
R
 
D
K
 
E
K
 
D
E
 
R
L
 
L
P
 
V
D
 
E
I
 
L
I
 
V
H
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
E
A
 
A
L
 
I
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
K
T
 
P
K
 
K
V
 
V
S
 
T
R
 
R
T
 
R
L
 
V
L
 
I
D
 
E
S
 
S
A
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
V
I
 
I
G
 
A
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
K
D
 
E
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
E
V
 
V
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
R
 
P
N
 
A
A
 
A
N
x
S
A
 
S
I
 
R
S
 
S
V
|
V
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
A
F
 
V
A
 
G
V
 
L
M
 
M
L
 
F
T
 
S
F
 
V
A
 
A
R
 
R
H
 
K
P
 
I
V
 
A
E
 
F
A
 
A
T
 
D
T
 
R
D
 
K
V
 
M
K
 
R
R
 
E
G
 
G
N
 
V
W
 
W
N
 
A
R
 
K
K
 
K
L
 
E
F
 
A
T
 
M
G
 
G
S
 
I
E
 
E
L
 
L
Y
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
I
G
|
G
I
x
F
G
|
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
Y
R
 
Q
L
 
V
A
 
A
A
 
K
R
 
I
A
 
A
K
 
N
A
 
A
F
 
L
G
 
G
M
 
M
H
 
N
L
 
I
L
 
L
G
 
L
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
Y
L
 
-
P
 
-
P
 
P
Y
 
N
E
 
E
I
 
E
A
 
R
I
 
A
A
 
K
D
 
E
F
 
V
G
 
N
V
 
G
E
 
K
Q
 
F
A
 
V
N
 
D
L
 
L
E
 
E
G
 
T
V
 
L
I
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
V
I
 
V
S
 
T
L
 
I
H
 
H
V
|
V
P
|
P
L
 
L
N
 
V
K
 
E
A
 
S
T
|
T
R
 
Y
H
 
H
L
 
L
I
 
I
N
 
N
K
 
E
Q
 
E
T
 
R
L
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
M
K
 
K
S
 
K
T
 
T
A
 
A
Y
 
I
I
 
L
I
 
I
N
 
N
S
x
T
A
x
S
R
|
R
G
 
G
G
 
P
V
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
Q
 
N
A
 
A
L
 
L
Y
 
V
E
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
K
N
 
E
K
 
G
K
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
E
 
E
Q
 
E
E
|
E
P
 
P
-
 
L
P
 
P
T
 
K
N
 
D
S
 
H
P
 
P
L
 
L
L
 
T
K
 
K
L
 
F
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
V
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
E
K
 
R
T
 
A
S
 
G
V
 
V
L
 
E
V
 
V
A
 
A
R
 
E
E
 
K
V
 
V
I
 
V
K
 
K
V
 
I
F
 
L
Q
 
K
G
 
G

6plfB Crystal structure of human phgdh complexed with compound 1 (see paper)
42% identity, 84% coverage: 39:302/314 of query aligns to 35:292/292 of 6plfB

query
sites
6plfB
I
 
L
H
 
Q
D
 
D
A
 
C
E
 
E
A
 
G
L
 
L
I
 
I
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
A
K
 
D
V
 
V
S
 
-
R
 
-
T
 
-
L
 
-
L
 
I
D
 
N
S
 
A
A
 
A
P
 
E
K
 
K
L
 
L
R
 
Q
V
 
V
I
 
V
G
 
G
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
T
G
 
G
L
 
V
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
L
Q
 
E
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
K
G
 
G
I
 
I
S
 
L
V
 
V
V
 
M
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
N
A
 
G
N
 
N
A
 
S
I
 
L
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
L
V
 
T
F
 
C
A
 
G
V
 
M
M
 
I
L
 
M
T
 
C
F
 
L
A
 
A
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
Q
A
 
A
T
 
T
T
 
A
D
 
S
V
 
M
K
 
K
R
 
D
G
 
G
N
 
K
W
 
W
N
 
E
R
 
R
K
 
K
L
 
K
F
 
F
T
 
M
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
L
Y
 
N
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
L
G
 
G
L
 
I
I
 
L
G
 
G
I
 
L
G
 
G
E
x
R
I
 
I
G
 
G
T
 
R
R
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
T
R
 
R
A
 
M
K
 
Q
A
 
S
F
 
F
G
 
G
M
 
M
H
 
K
L
 
T
L
 
I
G
 
G
Y
|
Y
D
|
D
P
|
P
F
 
I
L
x
I
P
 
S
P
 
P
Y
 
-
E
 
E
I
 
V
A
 
S
I
 
-
A
 
A
D
 
S
F
 
F
G
 
G
V
 
V
E
 
Q
Q
 
Q
A
 
L
N
 
P
L
|
L
E
 
E
G
 
E
V
 
I
I
 
W
R
 
P
R
 
L
A
 
C
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
T
L
 
V
H
 
H
V
x
T
P
|
P
L
 
L
N
 
L
K
 
P
A
x
S
T
 
T
R
 
T
H
 
G
L
|
L
I
 
L
N
 
N
K
 
D
Q
 
N
T
 
T
L
 
F
E
 
A
L
 
Q
V
 
C
K
 
K
S
 
K
T
 
G
A
 
V
Y
 
R
I
 
V
I
 
V
N
 
N
S
 
C
A
 
A
R
 
R
G
 
G
G
 
G
V
 
I
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
G
A
 
A
L
 
L
Y
 
L
E
 
R
A
 
A
L
 
L
S
 
Q
N
 
S
K
 
G
K
 
Q
I
 
C
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
F
E
 
T
Q
 
E
E
 
E
P
 
P
P
 
P
T
 
R
N
 
D
S
 
R
P
 
A
L
 
L
L
 
V
K
 
D
L
 
H
D
 
E
N
 
N
V
 
V
I
 
I
L
 
S
T
 
C
P
 
P
H
 
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
S
K
 
R
T
 
C
S
 
G
V
 
E
L
 
E
V
 
I
A
 
A
R
 
V
E
 
Q
V
 
F
I
 
V
K
 
D
V
 
M

5aovA Ternary crystal structure of pyrococcus furiosus glyoxylate hydroxypyruvate reductase in presence of glyoxylate (see paper)
39% identity, 89% coverage: 32:312/314 of query aligns to 36:321/334 of 5aovA

query
sites
5aovA
K
 
R
K
 
E
E
 
K
L
 
L
P
 
L
D
 
E
I
 
K
I
 
V
H
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
T
R
x
M
N
x
L
Q
 
S
T
 
E
K
 
R
V
 
I
S
 
D
R
 
Q
T
 
E
L
 
V
L
 
F
D
 
E
S
 
N
A
 
A
P
 
P
K
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
I
I
 
V
G
 
A
R
 
N
L
x
Y
G
x
A
V
|
V
G
|
G
L
 
Y
D
 
D
N
 
N
I
 
I
D
 
D
L
 
V
Q
 
E
A
 
E
T
 
A
K
 
T
D
 
R
K
 
R
G
 
G
I
 
I
S
 
Y
V
 
V
V
 
T
Y
 
N
A
 
T
R
 
P
N
 
D
A
 
V
N
x
L
A
 
T
I
 
N
S
 
A
V
x
T
V
 
A
E
 
D
Y
 
H
V
 
A
F
 
F
A
 
A
V
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
A
F
 
T
A
 
A
R
 
R
H
 
H
P
 
V
V
 
V
E
 
K
A
 
G
T
 
D
T
 
K
D
 
F
V
 
V
K
 
R
R
 
S
G
 
G
N
 
E
W
 
W
N
 
K
R
 
R
K
 
K
-
 
G
-
 
I
-
 
A
-
 
W
-
 
H
-
 
P
-
 
K
L
 
W
F
 
F
T
 
L
G
 
G
S
 
Y
E
 
E
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
I
G
 
G
L
 
I
I
 
V
G
 
G
I
x
F
G
|
G
E
x
R
I
|
I
G
 
G
T
 
Q
R
 
A
L
 
I
A
 
A
A
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
K
A
 
G
F
 
F
G
 
N
M
 
M
H
 
R
L
 
I
L
 
L
G
 
Y
Y
 
Y
D
x
S
P
x
R
F
 
T
L
 
R
P
 
K
P
 
S
Y
 
Q
E
 
-
I
 
-
A
 
A
I
 
E
A
 
K
D
 
E
F
 
L
G
 
G
V
 
A
E
 
E
Q
 
Y
A
 
R
N
 
P
L
 
L
E
 
E
G
 
E
V
 
V
I
 
L
R
 
K
R
 
E
A
 
S
D
 
D
F
 
F
I
 
V
S
 
I
L
 
L
H
x
A
V
|
V
P
|
P
L
 
L
N
 
T
K
 
K
A
 
E
T
|
T
R
 
M
H
 
Y
L
 
M
I
 
I
N
 
N
K
 
E
Q
 
E
T
 
R
L
 
L
E
 
K
L
 
L
V
 
M
K
 
K
S
 
P
T
 
T
A
 
A
Y
 
I
I
 
L
I
 
V
N
 
N
S
x
I
A
|
A
R
|
R
G
 
G
G
 
K
V
 
V
I
 
V
D
 
D
E
 
T
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
Y
 
I
E
 
K
A
 
A
L
 
L
S
 
K
N
 
E
K
 
G
K
 
W
I
 
I
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
E
 
E
Q
 
E
E
|
E
P
 
P
P
 
Y
T
 
Y
N
 
N
S
 
E
P
 
E
L
 
L
L
 
F
K
 
S
L
 
L
D
 
D
N
 
N
V
 
V
I
 
V
L
 
L
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
I
A
x
G
G
 
S
L
 
A
T
 
T
E
 
F
E
 
E
A
 
A
Q
 
R
V
 
E
K
 
A
T
 
M
S
 
A
V
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
A
R
 
R
E
 
N
V
 
L
I
 
I
K
 
A
V
 
F
F
 
K
Q
 
R
G
 
G
Q
 
E
Q
 
I
S
 
P
S
 
P
C
 
T
V
 
L
V
 
V

3dc2A Crystal structure of serine bound d-3-phosphoglycerate dehydrogenase from mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 85% coverage: 39:306/314 of query aligns to 39:304/526 of 3dc2A

query
sites
3dc2A
I
 
V
H
 
P
D
 
E
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
T
V
 
V
S
 
D
R
 
A
T
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
A
S
 
A
A
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
I
I
 
V
G
 
A
R
 
R
L
 
A
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
D
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
A
K
 
R
G
 
G
I
 
V
S
 
L
V
 
V
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
R
 
P
N
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
I
 
H
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
A
F
 
L
A
 
A
V
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
A
F
 
A
A
 
S
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
A
A
 
A
T
 
D
T
 
A
D
 
S
V
 
L
K
 
R
R
 
E
G
 
H
N
 
T
W
 
W
N
 
K
R
 
R
K
 
S
L
 
S
F
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
I
Y
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
I
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
Q
R
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
I
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
H
 
Y
L
 
V
L
 
V
G
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
L
 
V
P
 
S
P
 
P
Y
 
A
E
 
R
I
 
-
A
 
-
I
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
Q
 
L
A
 
L
N
 
S
L
 
L
E
 
D
G
 
D
V
 
L
I
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
N
 
T
K
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
L
 
L
I
 
I
N
 
D
K
 
K
Q
 
E
T
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
K
V
 
T
K
 
K
S
 
P
T
 
G
A
 
V
Y
 
I
I
 
I
I
 
V
N
 
N
S
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
S
 
T
N
 
G
K
 
G
K
 
H
I
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
E
 
A
Q
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
C
T
 
T
N
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
K
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
I
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
 
G
G
 
A
L
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
 
Q
V
 
D
K
 
R
T
 
A
S
 
G
V
 
T
L
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
E
E
 
S
V
 
V
I
 
R
K
 
L
V
 
A
F
 
L
Q
 
A
G
 
G
Q
 
E

Sites not aligning to the query:

3ddnB Crystal structure of hydroxypyruvic acid phosphate bound d-3- phosphoglycerate dehydrogenase in mycobacterium tuberculosis (see paper)
40% identity, 85% coverage: 39:306/314 of query aligns to 40:305/525 of 3ddnB

query
sites
3ddnB
I
 
V
H
 
P
D
 
E
A
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
L
V
 
V
R
 
R
N
 
S
Q
 
A
T
 
T
K
 
T
V
 
V
S
 
D
R
 
A
T
 
E
L
 
V
L
 
L
D
 
A
S
 
A
A
 
A
P
 
P
K
 
K
L
 
L
R
 
K
V
 
I
I
 
V
G
 
A
R
|
R
L
 
A
G
 
G
V
|
V
G
 
G
L
 
L
D
 
D
N
 
N
I
 
V
D
 
D
L
 
V
Q
 
D
A
 
A
T
 
A
K
 
T
D
 
A
K
 
R
G
 
G
I
 
V
S
 
L
V
 
V
V
 
V
Y
 
N
A
 
A
R
 
P
N
 
T
A
 
S
N
|
N
A
 
I
I
 
H
S
 
S
V
 
A
V
 
A
E
 
E
Y
 
H
V
 
A
F
 
L
A
 
A
V
 
L
M
 
L
L
 
L
T
 
A
F
 
A
A
 
S
R
 
R
H
 
Q
P
 
I
V
 
P
E
 
A
A
 
A
T
 
D
T
 
A
D
 
S
V
 
L
K
 
R
R
 
E
G
 
H
N
 
T
W
 
W
N
 
K
R
 
R
K
 
S
L
 
S
F
 
F
T
 
S
G
 
G
S
 
T
E
 
E
L
 
I
Y
 
F
G
 
G
K
 
K
T
 
T
L
 
V
G
 
G
L
 
V
I
 
V
G
 
G
I
 
L
G
 
G
E
 
R
I
 
I
G
 
G
T
 
Q
R
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
Q
R
 
R
A
 
I
K
 
A
A
 
A
F
 
F
G
 
G
M
 
A
H
 
Y
L
 
V
L
 
V
G
 
A
Y
 
Y
D
 
D
P
 
P
F
 
Y
L
 
V
P
 
S
P
 
P
Y
 
A
E
 
R
I
 
-
A
 
-
I
 
A
A
 
A
D
 
Q
F
 
L
G
 
G
V
 
I
E
 
E
Q
 
L
A
 
L
N
 
S
L
 
L
E
 
D
G
 
D
V
 
L
I
 
L
R
 
A
R
 
R
A
 
A
D
 
D
F
 
F
I
 
I
S
 
S
L
 
V
H
 
H
V
 
L
P
 
P
L
 
K
N
 
T
K
 
P
A
 
E
T
 
T
R
 
A
H
 
G
L
 
L
I
 
I
N
 
D
K
 
K
Q
 
E
T
 
A
L
 
L
E
 
A
L
 
K
V
 
T
K
 
K
S
 
P
T
 
G
A
 
V
Y
 
I
I
 
I
I
 
V
N
 
N
S
 
A
A
 
A
R
|
R
G
 
G
G
 
G
V
 
L
I
 
V
D
 
D
E
 
E
Q
 
A
A
 
A
L
 
L
Y
 
A
E
 
D
A
 
A
L
 
I
S
 
T
N
 
G
K
 
G
K
 
H
I
 
V
A
 
R
G
 
A
A
 
A
A
 
G
L
 
L
D
|
D
V
 
V
L
 
F
E
 
A
Q
 
T
E
|
E
P
 
P
P
 
C
T
 
T
N
 
D
S
 
S
P
 
P
L
 
L
L
 
F
K
 
E
L
 
L
D
 
A
N
 
Q
V
 
V
I
 
V
L
 
V
T
 
T
P
 
P
H
|
H
I
 
L
A
 
G
G
x
A
L
 
S
T
 
T
E
 
A
E
 
E
A
 
A
Q
|
Q
V
 
D
K
 
R
T
 
A
S
 
G
V
 
T
L
 
D
V
 
V
A
 
A
R
 
E
E
 
S
V
 
V
I
 
R
K
 
L
V
 
A
F
 
L
Q
 
A
G
 
G
Q
 
E

6biiA Crystal structure of pyrococcus yayanosii glyoxylate hydroxypyruvate reductase in complex with NADP and malonate (re-refinement of 5aow) (see paper)
39% identity, 87% coverage: 39:312/314 of query aligns to 42:320/332 of 6biiA

query
sites
6biiA
I
 
V
H
 
K
D
 
D
A
 
V
E
 
D
A
 
A
L
 
L
I
 
V
V
 
T
R
 
M
N
 
L
Q
 
S
T
 
E
K
 
K
V
 
I
S
 
D
R
 
R
T
 
E
L
 
V
L
 
F
D
 
D
S
 
A
A
 
A
P
 
P
K
 
R
L
 
L
R
 
R
V
 
I
I
 
V
G
 
A
R
 
N
L
 
Y
G
 
A
V
|