SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_094508027.1 NCBI__GCF_002252445.1:WP_094508027.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6pejA Structure of sorbitol dehydrogenase from sinorhizobium meliloti 1021 bound to sorbitol
64% identity, 100% coverage: 2:256/256 of query aligns to 3:257/257 of 6pejA

query
sites
6pejA
R
 
R
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
S
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
R
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
L
 
R
G
 
A
F
 
F
A
 
A
E
 
E
A
 
A
Y
 
Y
A
 
V
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
T
V
 
V
I
 
A
I
 
I
A
 
A
D
 
D
I
 
I
N
 
D
I
 
I
E
 
E
R
 
R
A
 
A
E
 
R
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
R
 
A
G
 
E
L
 
I
G
 
G
S
 
P
A
 
A
V
 
A
K
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
 
Q
L
 
M
D
 
D
V
 
V
T
 
T
N
 
R
L
 
Q
A
 
D
D
 
S
I
 
I
E
 
D
K
 
A
I
 
A
V
 
I
G
 
A
E
 
A
I
 
T
D
 
V
K
 
E
D
 
H
Y
 
A
G
 
G
G
 
G
I
 
L
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
A
I
 
L
F
 
F
D
 
D
M
 
L
A
 
A
P
 
P
I
 
I
N
 
V
A
 
E
I
 
I
T
 
T
E
 
R
D
 
E
S
 
S
Y
 
Y
D
 
E
R
 
K
V
 
L
L
 
F
G
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
A
G
 
G
P
 
T
L
 
L
F
 
F
M
 
T
M
 
L
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
A
N
 
R
V
 
Q
M
 
M
I
 
I
E
 
A
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
|
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
R
R
 
R
G
 
G
E
|
E
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
A
L
 
I
Y
|
Y
C
 
C
L
 
A
S
 
T
K
 
K
A
 
A
A
 
A
I
 
V
I
 
I
S
 
S
A
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
S
A
 
A
A
 
G
L
 
L
A
 
D
L
 
L
V
 
I
K
 
K
H
 
H
N
 
R
I
 
I
Q
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
V
 
V
V
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
H
|
H
W
|
W
D
 
D
V
 
G
V
 
V
D
 
D
A
 
A
N
 
L
F
|
F
A
 
A
K
 
R
W
 
Y
E
 
E
G
 
N
L
 
R
K
 
P
P
 
R
G
 
G
E
 
E
K
 
K
K
 
K
A
 
R
A
 
L
V
 
V
A
 
G
K
 
E
S
 
A
V
 
V
P
 
P
F
 
F
G
 
G
R
 
R
F
 
M
A
 
G
T
 
T
P
 
A
E
 
E
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
M
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
A
E
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
L
 
V
A
 
S
Q
 
Q
T
 
T
F
 
Y
G
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
N
W
 
W
M
 
M
A
 
S

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
39% identity, 99% coverage: 2:255/256 of query aligns to 4:244/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
L
 
L
K
 
Q
D
 
D
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
E
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
V
Y
 
F
A
 
M
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
F
N
 
N
I
 
E
E
 
A
R
 
A
A
 
G
E
 
K
E
 
E
A
 
A
A
 
V
R
 
E
G
 
A
L
 
-
G
 
N
S
 
P
A
 
G
V
 
V
K
 
V
A
 
F
V
 
I
K
 
R
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
D
L
 
R
A
 
E
D
 
S
I
 
V
E
 
H
K
 
R
I
 
L
V
 
V
G
 
E
E
 
N
I
 
V
D
 
A
K
 
E
D
 
R
Y
 
F
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
F
 
T
D
 
R
M
x
D
A
 
S
P
 
M
I
 
L
N
 
S
A
x
K
I
 
M
T
 
T
E
 
V
D
 
D
S
 
Q
Y
 
F
D
 
Q
R
 
Q
V
 
V
L
 
I
G
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
H
M
 
C
M
 
T
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
S
 
L
N
 
P
V
 
Y
M
 
M
I
 
A
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
T
A
 
S
S
|
S
Q
 
V
A
 
T
G
 
G
R
 
T
R
 
Y
G
 
G
E
x
N
A
x
V
L
 
G
V
x
Q
T
 
T
L
 
N
Y
|
Y
C
 
A
L
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
I
 
I
S
 
G
A
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
W
A
 
A
L
 
K
A
 
E
L
 
L
V
 
A
K
 
R
H
 
K
N
 
G
I
 
I
Q
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
x
F
V
x
T
D
 
-
G
 
-
E
 
E
H
x
T
W
 
A
D
x
M
V
 
V
V
 
A
D
 
E
A
 
V
N
 
P
F
 
E
A
 
K
K
 
V
W
 
I
E
 
E
G
x
K
L
 
M
K
 
K
P
 
A
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
M
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
T
 
K
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
I
 
A
A
 
Y
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
H
E
 
E
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
V
L
 
N
A
 
G
Q
 
H
T
 
V
F
 
L
G
 
H
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
I
W
 
M
M
 
M

Q48436 Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; Acetoin(diacetyl) reductase; AR; Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; EC 1.1.1.304 from Klebsiella pneumoniae (see paper)
38% identity, 96% coverage: 6:252/256 of query aligns to 3:252/256 of Q48436

query
sites
Q48436
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
|
L
I
x
V
T
|
T
G
|
G
A
|
A
A
x
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
|
G
L
x
K
G
x
A
F
x
I
A
|
A
E
x
L
A
x
R
Y
x
L
A
x
V
R
x
K
E
x
D
G
|
G
A
x
F
K
x
A
V
|
V
I
x
A
I
|
I
A
|
A
D
|
D
I
 
Y
N
 
N
I
 
D
E
 
A
R
 
T
A
 
A
E
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
S
G
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
S
 
G
A
 
R
V
 
A
K
 
M
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
 
V
D
|
D
V
 
V
T
 
S
N
 
D
L
 
R
A
 
D
D
 
Q
I
 
V
E
 
F
K
 
A
I
 
A
V
 
V
G
 
E
E
 
Q
I
 
A
D
 
R
K
 
K
D
 
T
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
A
 
G
I
 
V
F
 
A
D
 
P
M
 
S
A
 
T
P
 
P
I
 
I
N
 
E
A
 
S
I
 
I
T
 
T
E
 
P
D
 
E
S
 
I
Y
 
V
D
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
Y
G
 
N
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
K
G
 
G
P
 
V
L
 
I
F
 
W
M
 
G
M
 
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
V
N
 
E
V
 
A
M
 
F
I
 
K
E
 
K
R
 
E
G
 
G
R
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
 
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
T
 
A
L
 
V
Y
 
Y
C
 
S
L
 
S
S
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
R
S
 
G
A
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
D
L
 
L
V
 
A
K
 
P
H
 
L
N
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
I
V
 
V
D
 
K
G
 
T
E
 
P
H
 
M
W
 
W
D
 
A
V
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
N
 
Q
F
 
V
A
 
S
K
 
E
W
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
K
K
 
P
P
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
A
 
A
A
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
K
S
 
R
V
 
I
P
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
S
T
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
I
 
C
A
 
V
I
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
E
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
L
G
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1gegE Cryatal structure analysis of meso-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
38% identity, 96% coverage: 6:252/256 of query aligns to 3:252/256 of 1gegE

query
sites
1gegE
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
G
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
R
Y
 
L
A
 
V
R
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
K
 
A
V
 
V
I
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
N
 
N
I
 
D
E
 
A
R
 
T
A
 
A
E
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
S
G
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
S
 
G
A
 
H
V
 
A
K
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
D
L
x
R
A
x
D
D
 
Q
I
 
V
E
x
F
K
 
A
I
 
A
V
 
V
G
 
E
E
 
Q
I
 
A
D
 
R
K
 
K
D
 
T
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
 
V
F
 
A
D
 
P
M
 
S
A
 
T
P
 
P
I
 
I
N
 
E
A
 
S
I
 
I
T
 
T
E
 
P
D
 
E
S
 
I
Y
 
V
D
 
D
R
 
K
V
 
V
L
 
Y
G
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
V
K
 
K
G
 
G
P
 
V
L
 
I
F
 
W
M
 
G
M
 
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
V
N
x
E
V
 
A
M
 
F
I
 
K
E
 
K
R
 
E
G
 
G
R
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
C
S
|
S
Q
 
Q
A
 
A
G
 
G
R
 
H
R
 
V
G
 
G
E
 
N
A
 
P
L
 
E
V
 
L
T
 
A
L
 
V
Y
|
Y
C
 
S
L
 
S
S
 
S
K
|
K
A
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
R
S
 
G
A
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
D
L
 
L
V
 
A
K
 
P
H
 
L
N
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
K
G
x
T
E
 
P
H
x
M
W
 
W
D
 
A
V
 
E
V
 
I
D
 
D
A
 
R
N
 
Q
F
x
V
A
 
S
K
 
E
W
 
A
E
 
A
G
 
G
L
 
K
K
 
P
P
 
L
G
 
G
E
 
Y
K
 
G
K
 
T
A
 
A
A
 
E
V
 
F
A
 
A
K
 
K
S
 
R
V
 
I
P
 
T
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
S
T
 
E
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
A
I
 
C
A
 
V
I
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
E
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
L
G
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
39% identity, 100% coverage: 1:255/256 of query aligns to 1:247/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
M
 
M
R
 
T
L
 
L
K
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
D
F
 
I
A
 
A
E
 
I
A
 
N
Y
 
L
A
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
N
V
 
I
I
 
F
I
 
F
A
x
N
-
x
Y
D
x
N
I
x
G
N
x
S
I
 
P
E
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
T
A
 
A
R
 
K
G
 
L
L
 
V
-
 
A
-
 
E
-
 
H
G
 
G
S
 
V
A
 
E
V
 
V
K
 
E
A
 
A
V
 
M
K
 
K
L
 
A
D
x
N
V
|
V
T
 
A
N
 
I
L
 
A
A
 
E
D
 
D
I
 
V
E
 
D
K
 
A
I
 
F
V
 
F
G
 
K
E
 
Q
I
 
A
D
 
I
K
 
E
D
 
R
Y
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
|
I
F
 
T
D
 
R
M
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
N
 
M
A
 
R
I
 
M
T
 
K
E
 
E
D
 
D
S
 
E
Y
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
I
G
 
N
I
|
I
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
T
L
 
F
F
 
L
M
 
C
M
 
T
K
 
K
A
 
A
V
 
V
S
 
S
N
 
R
V
 
T
M
 
M
I
 
M
E
 
K
R
 
Q
G
 
-
R
 
R
G
 
A
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
M
A
 
A
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
L
R
 
I
G
 
G
E
 
N
A
 
A
L
 
G
V
x
Q
T
 
A
L
 
N
Y
|
Y
C
 
V
L
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
I
 
I
S
 
G
A
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
T
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
L
V
 
A
K
 
P
H
 
R
N
 
G
I
 
I
Q
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
T
G
x
T
E
 
D
H
 
M
W
 
T
D
 
D
V
 
K
V
 
L
D
 
D
A
 
E
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
W
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
K
K
 
T
K
 
K
A
 
E
A
 
A
V
 
M
A
 
L
K
 
A
S
 
Q
V
 
I
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
A
F
 
Y
A
 
G
T
 
T
P
 
T
E
 
E
D
 
D
L
 
I
T
 
A
G
 
N
I
 
A
A
 
V
I
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
A
S
 
S
D
 
K
Y
 
Y
I
 
I
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
F
 
L
G
 
S
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
V
M
 
M

4za2D Crystal structure of pectobacterium carotovorum 2-keto-3-deoxy-d- gluconate dehydrogenase complexed with NAD+ (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:256/256 of query aligns to 8:246/247 of 4za2D

query
sites
4za2D
L
 
L
K
 
Q
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
C
A
x
D
R
 
T
G
 
G
I
x
L
G
 
G
L
 
Q
G
 
G
F
 
M
A
 
A
E
 
I
A
 
G
Y
 
L
A
 
A
R
 
Q
E
 
A
G
 
G
A
 
C
K
 
D
V
 
I
I
 
V
I
 
G
A
 
V
D
 
N
I
|
I
N
 
-
I
 
V
E
 
E
R
 
P
A
 
K
E
 
D
-
 
T
-
 
I
E
 
E
A
 
K
A
 
V
R
 
T
G
 
A
L
 
L
G
 
G
S
 
R
A
 
R
V
 
F
K
 
L
A
 
S
V
 
L
K
 
T
L
 
A
D
|
D
V
x
M
T
 
S
N
 
N
L
 
V
A
 
S
D
 
G
I
 
H
E
 
A
K
 
E
I
 
L
V
 
V
G
 
E
E
 
K
I
 
A
D
 
V
K
 
A
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
H
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
 
I
F
 
I
D
 
R
M
 
R
A
 
E
P
 
D
I
 
A
N
 
I
A
 
E
I
 
F
T
 
S
E
 
E
D
 
K
S
 
N
Y
 
W
D
 
D
R
 
D
V
 
V
L
 
M
G
 
N
I
x
L
N
 
N
L
 
I
K
 
K
G
 
S
P
 
V
L
 
F
F
 
F
M
 
M
M
 
S
K
 
Q
A
 
T
V
 
V
S
 
A
N
 
R
V
 
Q
M
 
F
I
 
I
E
 
K
R
 
Q
G
 
G
R
 
K
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
 
A
S
|
S
Q
 
M
A
 
L
G
 
S
R
 
F
R
 
Q
G
 
G
E
 
G
A
 
I
L
 
R
V
 
V
T
 
P
L
 
S
Y
|
Y
C
 
T
L
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
S
A
 
A
I
 
V
I
 
M
S
 
G
A
 
V
T
 
T
Q
 
R
S
 
L
A
 
M
A
 
A
L
 
N
A
 
E
L
 
W
V
 
A
K
 
K
H
 
H
N
 
G
I
 
I
Q
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
|
G
V
 
Y
V
x
M
D
 
A
G
x
T
E
 
N
H
x
N
W
 
-
D
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
W
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
T
G
 
Q
E
 
E
K
 
R
K
 
S
A
 
K
A
 
E
V
 
I
A
 
L
K
 
D
S
 
R
V
 
I
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
W
A
 
G
T
 
L
P
 
P
E
 
Q
D
 
D
L
 
L
T
 
M
G
 
G
I
 
P
A
 
S
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
S
E
 
A
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
I
L
 
N
A
 
G
Q
 
Y
T
 
T
F
 
I
G
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
-
W
 
W
M
 
L
A
 
A

C1DMX5 L-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD(P)(+)); RhaDH; AvLRA1; EC 1.1.1.378 from Azotobacter vinelandii (strain DJ / ATCC BAA-1303) (see paper)
36% identity, 100% coverage: 1:255/256 of query aligns to 1:253/256 of C1DMX5

query
sites
C1DMX5
M
 
M
R
 
L
L
 
L
K
 
I
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
G
D
 
H
I
x
S
N
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
A
I
 
L
E
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
F
L
 
G
G
 
G
S
 
T
A
 
A
V
 
I
K
 
-
A
 
A
V
 
V
K
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
N
 
D
L
 
L
A
 
D
D
 
S
I
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
 
A
I
 
A
D
 
V
K
 
E
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
F
 
C
D
 
P
M
x
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
N
 
L
A
 
D
I
 
M
T
 
P
E
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
D
 
L
R
 
K
V
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
P
 
A
L
 
Y
F
 
F
M
 
T
M
 
V
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
A
N
 
R
V
 
R
M
 
M
I
 
K
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
 
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
x
Q
T
 
T
L
 
H
Y
|
Y
C
 
T
L
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
L
I
 
L
S
 
S
A
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
G
K
 
P
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
x
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
V
 
A
V
 
T
D
 
D
A
x
I
N
|
N
F
 
-
A
 
-
K
 
-
W
 
K
E
 
E
G
x
D
L
 
L
K
 
S
P
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
A
 
E
A
 
R
V
 
M
A
 
T
K
 
S
S
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
F
 
L
G
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V

5u9pB Crystal structure of a gluconate 5-dehydrogenase from burkholderia cenocepacia j2315 in complex with NADP and tartrate
37% identity, 98% coverage: 1:252/256 of query aligns to 12:256/261 of 5u9pB

query
sites
5u9pB
M
 
F
R
 
R
L
 
L
K
 
D
D
 
G
K
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
G
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
L
G
 
T
F
 
L
A
 
A
E
 
R
A
 
G
Y
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
A
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
I
I
 
V
I
 
I
A
 
N
D
 
D
I
x
R
N
 
N
I
 
E
E
 
E
R
 
K
A
 
A
E
 
A
E
 
T
A
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
R
L
 
F
-
 
R
-
 
D
-
 
E
G
 
G
S
 
F
A
 
A
V
 
A
K
 
D
A
 
H
V
 
A
K
 
V
L
 
F
D
|
D
V
|
V
T
 
A
N
 
E
L
 
H
A
 
A
D
 
Q
I
 
V
E
 
R
K
 
A
I
 
A
V
 
I
G
 
D
E
 
E
I
 
F
D
 
E
K
 
A
D
 
R
Y
 
V
G
 
G
G
 
A
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
 
I
F
 
Q
D
 
R
M
 
R
A
 
A
P
 
P
I
 
L
N
 
D
A
 
A
I
 
F
T
 
E
E
 
P
D
 
D
S
 
D
Y
 
W
D
 
H
R
 
A
V
 
L
L
 
M
G
 
R
I
 
V
N
 
N
L
 
L
K
 
D
G
 
G
P
 
V
L
 
F
F
 
N
M
 
V
M
 
A
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
S
 
A
N
 
R
V
 
H
M
 
M
I
 
I
E
 
A
R
 
R
G
 
G
R
 
H
G
 
-
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
 
C
S
|
S
Q
 
V
A
 
Q
G
 
S
R
 
E
R
 
L
G
 
A
E
 
R
A
 
P
L
 
T
V
 
I
T
 
A
L
 
P
Y
|
Y
C
 
A
L
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
R
S
 
M
A
 
L
T
 
T
Q
 
K
S
 
G
A
 
M
A
 
C
L
 
A
A
 
D
L
 
W
V
 
A
K
 
R
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
Q
 
Q
V
 
A
N
 
N
A
 
G
I
 
L
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
Y
V
x
F
D
 
E
G
x
T
E
 
E
-
x
L
-
x
N
H
 
R
W
 
A
D
 
L
V
 
V
V
 
D
D
 
D
A
 
A
N
 
A
F
 
F
A
 
S
K
 
D
W
 
W
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
V
 
L
A
 
C
K
 
K
S
 
R
V
 
T
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
W
A
 
G
T
 
Q
P
 
V
E
 
D
D
 
E
L
 
L
T
 
C
G
 
G
I
 
A
A
 
A
I
 
I
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
A
E
 
A
S
 
S
D
 
D
Y
 
F
I
 
V
L
 
N
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
F
 
L
G
 
F
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Q9ZNN8 L-2,3-butanediol dehydrogenase; L-BDH; (S,S)-butanediol dehydrogenase; Diacetyl reductase [(S)-acetoin forming]; EC 1.1.1.76; EC 1.1.1.304 from Corynebacterium glutamicum (Brevibacterium saccharolyticum) (see paper)
37% identity, 96% coverage: 6:252/256 of query aligns to 3:254/258 of Q9ZNN8

query
sites
Q9ZNN8
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
G
F
 
I
A
 
S
E
 
E
A
 
K
Y
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
K
 
D
V
 
I
I
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
L
-
 
P
-
 
Q
N
x
Q
I
 
E
E
 
E
R
 
Q
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
I
R
 
K
G
 
L
L
 
I
G
 
E
S
 
A
A
 
A
V
 
D
K
 
Q
A
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
F
V
 
V
K
 
G
L
 
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
N
 
D
L
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
F
E
 
D
K
 
S
I
 
A
V
 
I
G
 
D
E
 
E
I
 
A
D
 
A
K
 
E
D
 
K
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
F
 
A
D
 
Q
M
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
N
 
L
A
 
E
I
 
V
T
 
T
E
 
E
D
 
E
S
 
D
Y
 
L
D
 
K
R
 
Q
V
 
I
L
 
Y
G
 
S
I
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
F
G
 
S
P
 
V
L
 
F
F
 
F
M
 
G
M
 
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
S
N
 
R
V
 
K
M
 
F
I
 
D
E
 
E
R
 
L
G
 
G
R
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
 
S
Q
x
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
x
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
T
 
S
L
 
A
Y
|
Y
C
 
S
L
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
R
S
 
G
A
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
L
 
L
V
 
A
K
 
P
H
 
K
N
 
G
I
 
H
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
x
I
V
|
V
D
x
G
G
x
T
E
 
G
H
 
M
W
 
W
D
 
E
V
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
E
F
 
L
A
 
S
K
 
K
W
 
I
E
 
N
G
 
G
L
 
K
K
 
P
P
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
A
 
K
A
 
E
V
 
Y
A
 
S
K
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
P
A
 
S
T
 
V
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
E
E
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
I
 
V
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
F
 
M
G
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7do7A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NAD and l-rhamnose bound-form) (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 3:253/256 of 7do7A

query
sites
7do7A
L
 
L
K
 
I
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
G
D
 
H
I
x
S
N
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
A
I
 
L
E
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
F
L
 
G
G
 
G
S
 
T
A
 
A
V
 
I
K
 
-
A
 
A
V
 
V
K
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
N
 
D
L
 
L
A
 
D
D
 
S
I
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
 
A
I
 
A
D
 
V
K
 
E
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
F
 
C
D
 
P
M
x
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
N
 
L
A
 
D
I
 
M
T
 
P
E
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
D
 
L
R
 
K
V
 
T
L
 
V
G
 
G
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
P
 
A
L
 
Y
F
 
F
M
 
T
M
 
V
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
A
N
 
R
V
 
R
M
 
M
I
 
K
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
x
S
S
|
S
Q
 
I
A
x
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
x
Q
T
 
T
L
 
H
Y
|
Y
C
 
T
L
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
L
I
 
L
S
 
S
A
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
G
K
 
P
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
V
 
A
V
x
T
D
 
D
A
x
I
N
|
N
F
 
-
A
 
-
K
 
-
W
 
K
E
 
E
G
 
D
L
 
L
K
 
S
P
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
A
 
E
A
 
R
V
 
M
A
 
T
K
 
S
S
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
x
D
E
x
M
S
 
A
D
x
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
F
 
L
G
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V

7b81A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1-dehydrogenase (NAD bound-form) (see paper)
36% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 3:253/256 of 7b81A

query
sites
7b81A
L
 
L
K
 
I
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
G
D
 
H
I
 
S
N
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
A
I
 
L
E
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
F
L
 
G
G
 
G
S
 
T
A
 
A
V
 
I
K
 
-
A
 
A
V
 
V
K
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
N
 
D
L
 
L
A
 
D
D
 
S
I
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
 
A
I
 
A
D
 
V
K
 
E
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
F
 
C
D
 
P
M
 
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
N
 
L
A
 
D
I
 
M
T
 
P
E
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
D
 
L
R
 
K
V
 
T
L
 
V
G
 
G
I
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
P
 
A
L
 
Y
F
 
F
M
 
T
M
 
V
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
A
N
 
R
V
 
R
M
 
M
I
 
K
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
x
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
T
 
T
L
 
H
Y
|
Y
C
 
T
L
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
L
I
 
L
S
 
S
A
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
G
K
 
P
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
-
D
 
-
V
 
A
V
x
T
D
 
D
A
x
I
N
 
N
F
 
-
A
 
-
K
 
-
W
 
K
E
 
E
G
 
D
L
 
L
K
 
S
P
 
D
G
 
L
E
 
E
K
 
K
K
 
R
A
 
E
A
 
R
V
 
M
A
 
T
K
 
S
S
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
F
 
L
G
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V

3a28C Crystal structure of l-2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
37% identity, 96% coverage: 6:252/256 of query aligns to 2:253/257 of 3a28C

query
sites
3a28C
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
M
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
G
F
 
I
A
 
S
E
 
E
A
 
K
Y
 
L
A
 
A
R
 
A
E
 
D
G
 
G
A
 
F
K
 
D
V
 
I
I
 
A
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
x
L
-
 
P
-
 
Q
N
x
Q
I
 
E
E
 
E
R
 
Q
A
 
A
E
 
A
E
 
E
A
 
T
A
 
I
R
 
K
G
 
L
L
 
I
G
 
E
S
 
A
A
 
A
V
 
D
K
 
Q
A
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
F
V
 
V
K
 
G
L
|
L
D
|
D
V
|
V
T
 
T
N
 
D
L
 
K
A
 
A
D
 
N
I
 
F
E
 
D
K
 
S
I
 
A
V
 
I
G
 
D
E
 
E
I
 
A
D
 
A
K
 
E
D
 
K
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
F
 
A
D
 
Q
M
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
N
 
L
A
 
E
I
 
V
T
 
T
E
 
E
D
 
E
S
 
D
Y
 
L
D
 
K
R
 
Q
V
 
I
L
 
Y
G
 
S
I
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
F
G
 
S
P
 
V
L
 
F
F
 
F
M
 
G
M
 
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
S
N
 
R
V
 
K
M
 
F
I
 
D
E
 
E
R
 
L
G
 
G
R
 
V
G
 
K
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
T
 
S
L
 
A
Y
|
Y
C
 
S
L
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
R
S
 
G
A
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
A
A
 
A
A
 
A
L
 
Q
A
 
E
L
 
L
V
 
A
K
 
P
H
 
K
N
 
G
I
 
H
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
Y
A
 
A
P
|
P
G
 
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
V
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
E
F
x
L
A
 
S
K
 
K
W
 
I
E
 
N
G
 
G
L
 
K
K
 
P
P
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
A
 
K
A
 
E
V
 
Y
A
 
S
K
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
P
A
 
S
T
 
V
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
E
E
 
N
S
 
S
D
 
N
Y
 
Y
I
 
V
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
V
F
 
M
G
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

3wyeA Crystal structure of chimeric engineered (2s,3s)-butanediol dehydrogenase complexed with NAD+
36% identity, 96% coverage: 6:252/256 of query aligns to 2:251/255 of 3wyeA

query
sites
3wyeA
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
G
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
L
A
 
R
Y
 
L
A
 
V
R
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
K
 
A
V
 
V
I
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
Y
N
 
N
I
 
D
E
 
A
R
 
T
A
 
A
E
 
K
E
 
A
A
 
V
A
 
A
R
 
S
G
 
E
L
 
I
-
 
N
-
 
Q
-
 
A
G
 
G
S
 
G
A
 
H
V
 
A
K
 
V
A
 
A
V
 
V
K
 
K
L
x
V
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
D
L
 
R
A
 
D
D
 
Q
I
 
V
E
 
F
K
 
A
I
 
A
V
 
V
G
 
E
E
 
Q
I
 
A
D
 
R
K
 
K
D
 
T
Y
 
L
G
 
G
G
 
G
I
 
F
D
 
D
I
 
V
L
 
I
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
 
I
F
 
A
D
 
Q
M
 
I
A
 
K
P
 
P
I
 
L
N
 
L
A
 
E
I
 
V
T
 
T
E
 
E
D
 
E
S
 
D
Y
 
L
D
 
K
R
 
Q
V
 
I
L
 
Y
G
 
S
I
 
V
N
 
N
L
 
V
K
 
F
G
 
S
P
 
V
L
 
F
F
 
F
M
 
G
M
 
I
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
V
N
 
E
V
 
A
M
 
F
I
 
K
E
 
K
R
 
E
G
 
G
R
 
H
G
 
G
G
 
G
K
 
K
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
A
A
 
A
S
|
S
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
R
 
I
R
 
Q
G
 
G
E
 
F
A
 
P
L
 
I
V
 
L
T
 
S
L
 
A
Y
|
Y
C
 
S
L
 
T
S
 
T
K
|
K
A
 
F
A
 
A
I
 
V
I
 
R
S
 
G
A
 
L
T
 
T
Q
 
Q
S
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
R
A
 
D
L
 
L
V
 
A
K
 
P
H
 
L
N
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
G
I
 
Y
A
 
C
P
|
P
G
|
G
V
 
I
V
|
V
D
 
G
G
x
T
E
 
G
H
x
M
W
|
W
D
 
E
V
 
Q
V
 
I
D
 
D
A
 
A
N
 
E
F
x
L
A
 
S
K
 
K
W
 
I
E
 
N
G
 
G
L
 
K
K
 
P
P
 
I
G
 
G
E
 
E
K
 
N
K
 
F
A
 
K
A
 
E
V
 
Y
A
 
S
K
 
S
S
 
S
V
 
I
P
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
P
A
 
S
T
 
V
P
 
P
E
 
E
D
 
D
L
 
V
T
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
V
I
 
S
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
E
 
D
S
 
S
D
 
D
Y
 
Y
I
 
M
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
S
F
 
L
G
 
L
V
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4i08A Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (fabg) from vibrio cholerae in complex with NADPH (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:255/256 of query aligns to 4:242/243 of 4i08A

query
sites
4i08A
M
 
M
R
 
N
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
G
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
L
Y
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
G
A
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
I
 
E
E
 
S
R
 
G
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
R
 
D
G
 
Y
L
 
L
G
 
G
S
 
D
A
 
N
V
 
G
K
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
A
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
N
 
N
L
 
P
A
 
E
D
 
S
I
 
I
E
 
E
K
 
A
I
 
V
V
 
L
G
 
K
E
 
A
I
 
I
D
 
T
K
 
D
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
 
I
F
 
T
D
 
R
M
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
N
 
M
A
 
R
I
 
M
T
 
K
E
 
E
D
 
E
S
 
E
Y
 
W
D
 
S
R
 
D
V
 
I
L
 
M
G
 
E
I
 
T
N
|
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
P
 
I
L
 
F
F
 
R
M
 
L
M
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
S
 
L
N
 
R
V
 
G
M
 
M
I
 
M
E
 
K
R
 
K
G
 
-
R
 
R
G
 
Q
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
V
A
x
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
R
 
M
G
 
G
E
 
N
A
 
A
L
 
G
V
x
Q
T
 
A
L
 
N
Y
|
Y
C
 
A
L
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
I
 
I
S
 
G
A
 
F
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
M
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
V
V
 
A
K
 
S
H
 
R
N
 
G
I
 
V
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
V
 
I
D
 
E
G
x
T
E
 
D
H
 
M
W
 
N
D
 
D
V
 
-
V
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
W
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
Q
K
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
T
A
 
L
K
 
A
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
T
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
L
 
I
T
 
A
G
 
S
I
 
A
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
E
 
E
S
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
I
L
 
T
A
 
G
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
G
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
Y
M
 
M

3op4A Crystal structure of putative 3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase from vibrio cholerae o1 biovar eltor str. N16961 in complex with NADP+ (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:255/256 of query aligns to 4:246/247 of 3op4A

query
sites
3op4A
M
 
M
R
 
N
L
 
L
K
 
E
D
 
G
K
 
K
V
 
V
A
 
A
L
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
 
G
I
|
I
G
 
G
L
 
K
G
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
L
Y
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
A
K
 
K
V
 
V
I
 
I
I
 
G
A
 
T
D
 
A
I
x
T
N
 
S
I
 
E
E
 
S
R
 
G
A
 
A
E
 
Q
E
 
A
A
 
I
A
 
S
R
 
D
G
 
Y
L
 
L
G
 
G
S
 
D
A
 
N
V
 
G
K
 
K
A
 
G
V
 
M
K
 
A
L
 
L
D
x
N
V
|
V
T
 
T
N
 
N
L
 
P
A
 
E
D
 
S
I
 
I
E
 
E
K
 
A
I
 
V
V
 
L
G
 
K
E
 
A
I
 
I
D
 
T
K
 
D
D
 
E
Y
 
F
G
 
G
G
 
G
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
 
G
I
|
I
F
 
T
D
 
R
M
 
D
A
 
N
P
 
L
I
 
L
N
 
M
A
 
R
I
 
M
T
 
K
E
 
E
D
 
E
S
 
E
Y
 
W
D
 
S
R
 
D
V
 
I
L
 
M
G
 
E
I
 
T
N
 
N
L
 
L
K
 
T
G
 
S
P
 
I
L
 
F
F
 
R
M
 
L
M
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
V
S
 
L
N
 
R
V
 
G
M
 
M
I
 
M
E
 
K
R
 
K
G
 
-
R
 
R
G
 
Q
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
V
A
 
G
S
|
S
Q
 
V
A
 
V
G
 
G
R
 
T
R
 
M
G
 
G
E
 
N
A
 
A
L
 
G
V
 
Q
T
 
A
L
 
N
Y
|
Y
C
 
A
L
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
I
 
I
S
 
G
A
 
F
T
 
T
Q
 
K
S
 
S
A
 
M
A
 
A
L
 
R
A
 
E
L
 
V
V
 
A
K
 
S
H
 
R
N
 
G
I
 
V
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
V
 
F
V
x
I
D
 
E
G
x
T
E
 
D
H
x
M
W
 
T
D
 
K
V
 
A
V
 
L
D
 
N
A
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
W
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
D
E
 
E
K
 
Q
K
 
R
A
 
T
A
 
A
V
 
T
A
 
L
K
 
A
S
 
Q
V
 
V
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
T
 
D
P
 
P
E
 
R
D
 
E
L
 
I
T
 
A
G
 
S
I
 
A
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
P
E
 
E
S
 
A
D
 
A
Y
 
Y
I
 
I
L
 
T
A
 
G
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
G
 
H
V
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G
N
 
M
W
 
Y
M
 
M

Q5P5I4 (S)-1-Phenylethanol dehydrogenase; EC 1.1.1.311 from Aromatoleum aromaticum (strain DSM 19018 / LMG 30748 / EbN1) (Azoarcus sp. (strain EbN1)) (see 2 papers)
39% identity, 98% coverage: 2:252/256 of query aligns to 4:245/249 of Q5P5I4

query
sites
Q5P5I4
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
G
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
-
 
L
I
 
V
N
 
P
I
 
A
E
 
P
R
 
E
A
 
A
E
 
E
E
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
R
G
 
N
L
 
L
G
 
G
S
 
R
A
 
R
V
 
V
K
 
L
A
 
T
V
 
V
K
 
K
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
Q
L
 
P
A
 
G
D
 
D
I
 
V
E
 
E
K
 
A
I
 
F
V
 
G
G
 
K
E
 
Q
I
 
V
D
 
I
K
 
S
D
 
T
Y
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
F
x
Y
D
 
P
M
 
L
A
 
I
P
 
P
I
 
F
N
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
T
E
 
F
D
 
E
S
 
Q
Y
 
W
D
 
K
R
 
K
V
 
T
L
 
F
G
 
E
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
S
P
 
G
L
 
F
F
 
L
M
 
M
M
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
F
S
 
V
N
 
P
V
 
G
M
 
M
I
 
-
E
 
K
R
 
R
G
 
N
R
 
G
G
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
T
S
 
S
Q
 
T
A
 
T
G
 
Y
R
 
W
R
 
L
G
 
K
E
 
I
A
 
E
L
 
A
V
 
Y
T
 
T
L
 
H
Y
 
Y
C
 
I
L
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
I
 
N
I
 
I
S
 
G
A
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
G
K
 
K
H
 
D
N
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
V
x
L
V
|
V
D
 
R
G
 
T
E
 
A
H
x
T
W
 
T
D
 
E
V
 
-
V
 
A
D
 
S
A
 
A
N
 
L
F
 
S
A
 
A
K
 
M
W
 
F
E
 
D
G
 
V
L
 
L
K
 
P
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
N
V
 
M
A
 
L
K
 
Q
S
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
-
G
 
-
R
 
R
F
 
L
A
 
Q
T
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
A
A
 
A
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
D
S
 
A
D
 
S
Y
 
F
I
 
I
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
F
 
L
G
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2ewmB Crystal structure of the (s)-specific 1-phenylethanol dehydrogenase of the denitrifying bacterium strain ebn1 (see paper)
39% identity, 98% coverage: 2:252/256 of query aligns to 2:243/247 of 2ewmB

query
sites
2ewmB
R
 
R
L
 
L
K
 
K
D
 
D
K
 
K
V
 
L
A
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
A
R
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
V
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
D
V
 
I
I
 
A
I
 
I
A
 
A
D
|
D
-
x
L
I
 
V
N
 
P
I
 
A
E
 
P
R
 
E
A
 
A
E
 
E
E
 
A
A
 
A
A
 
I
R
 
R
G
 
N
L
 
L
G
 
G
S
 
R
A
 
R
V
 
V
K
 
L
A
 
T
V
 
V
K
 
K
L
x
C
D
|
D
V
|
V
T
 
S
N
 
Q
L
 
P
A
 
G
D
 
D
I
 
V
E
 
E
K
 
A
I
 
F
V
 
G
G
 
K
E
 
Q
I
 
V
D
 
I
K
 
S
D
 
T
Y
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
C
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
 
G
I
 
I
F
 
Y
D
 
P
M
 
L
A
 
I
P
 
P
I
 
F
N
 
D
A
 
E
I
 
L
T
 
T
E
 
F
D
 
E
S
 
Q
Y
 
W
D
 
K
R
 
K
V
 
T
L
 
F
G
 
E
I
 
I
N
 
N
L
 
V
K
 
D
G
 
S
P
 
G
L
 
F
F
 
L
M
 
M
M
 
A
K
 
K
A
 
A
V
 
F
S
 
V
N
 
P
V
 
G
M
 
M
I
 
-
E
 
K
R
 
R
G
 
N
R
 
G
G
 
W
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
L
A
 
T
S
|
S
Q
 
T
A
 
T
G
 
Y
R
 
W
R
 
L
G
 
K
E
 
I
A
 
E
L
 
A
V
x
Y
T
 
T
L
 
H
Y
|
Y
C
 
I
L
 
S
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
A
I
 
N
I
 
I
S
 
G
A
 
F
T
 
T
Q
 
R
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
S
A
 
D
L
 
L
V
 
G
K
 
K
H
 
D
N
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
x
S
V
x
L
V
|
V
D
 
R
G
 
T
E
 
A
H
x
T
W
 
T
D
 
E
V
 
-
V
 
A
D
 
S
A
 
A
N
 
L
F
 
S
A
 
A
K
 
M
W
 
F
E
 
D
G
 
V
L
 
L
K
 
P
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
N
V
 
M
A
 
L
K
 
Q
S
 
A
V
 
I
P
 
P
F
 
-
G
 
-
R
 
R
F
 
L
A
 
Q
T
 
V
P
 
P
E
 
L
D
 
D
L
 
L
T
 
T
G
 
G
I
 
A
A
 
A
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
D
S
 
A
D
 
S
Y
 
F
I
 
I
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
F
 
L
G
 
A
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

7do6A Crystal structure of azotobacter vinelandii l-rhamnose 1- dehydrogenase(NADP bound-form) (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:255/256 of query aligns to 3:244/247 of 7do6A

query
sites
7do6A
L
 
L
K
 
I
D
 
D
K
 
K
V
 
T
A
 
V
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
A
F
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
E
Y
 
C
A
 
A
R
 
R
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
V
I
 
I
A
 
G
D
x
H
I
x
S
N
 
G
-
 
S
-
 
D
-
 
E
-
x
G
-
 
R
-
 
A
-
 
G
-
 
A
I
 
L
E
 
S
R
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
A
 
I
A
 
A
R
 
A
G
 
F
L
 
G
G
 
G
S
 
T
A
 
A
V
 
I
K
 
-
A
 
A
V
 
V
K
 
G
L
 
A
D
|
D
V
x
A
T
 
A
N
 
D
L
 
L
A
 
D
D
 
S
I
 
G
E
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
G
 
A
E
 
A
I
 
A
D
 
V
K
 
E
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
S
I
 
V
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
A
x
G
I
|
I
F
 
C
D
 
P
M
 
F
A
 
H
P
 
S
I
 
F
N
 
L
A
 
D
I
 
M
T
 
P
E
 
R
D
 
E
S
 
L
Y
 
Y
D
 
L
R
 
K
V
 
T
L
 
V
G
 
G
I
x
T
N
 
N
L
 
L
K
 
N
G
 
G
P
 
A
L
 
Y
F
 
F
M
 
T
M
 
V
K
 
Q
A
 
A
V
 
A
S
 
A
N
 
R
V
 
R
M
 
M
I
 
K
E
 
E
R
 
Q
G
 
G
R
 
R
G
 
G
G
 
G
K
 
A
I
 
I
I
 
I
N
 
A
M
 
V
A
 
S
S
|
S
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
R
 
L
R
 
V
G
 
G
E
 
G
A
 
A
L
 
M
V
 
Q
T
 
T
L
 
H
Y
|
Y
C
 
T
L
 
P
S
 
T
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
L
I
 
L
S
 
S
A
 
L
T
 
M
Q
 
Q
S
 
S
A
 
C
A
 
A
L
 
I
A
 
A
L
 
L
V
 
G
K
 
P
H
 
Y
N
 
G
I
 
I
Q
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
 
P
G
 
G
V
 
T
V
x
I
D
 
-
G
 
-
E
 
-
H
 
-
W
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
-
D
 
-
A
 
-
N
 
-
F
 
-
A
 
-
K
 
-
W
 
-
E
 
-
G
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
E
K
 
K
K
 
R
A
 
E
A
 
R
V
 
M
A
 
T
K
 
S
S
 
R
V
 
V
P
 
P
F
 
L
G
 
G
R
 
R
F
 
L
A
 
G
T
 
E
P
 
P
E
 
D
D
 
D
L
 
L
T
 
A
G
 
G
I
 
P
A
 
I
I
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
M
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
V
L
 
T
A
 
G
Q
 
A
T
 
S
F
 
L
G
 
L
V
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
N
 
L
W
 
F
M
 
V

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
35% identity, 98% coverage: 1:252/256 of query aligns to 1:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
M
 
V
R
 
R
L
 
L
K
 
A
D
 
N
K
 
R
V
 
V
A
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
x
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
R
G
 
I
F
 
Y
A
 
A
E
 
E
A
 
R
Y
 
F
A
 
A
R
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
A
V
 
V
I
 
V
I
 
V
A
 
A
D
|
D
I
 
I
N
 
N
I
 
E
E
 
P
R
 
K
A
 
A
E
 
T
E
 
E
A
 
V
A
 
A
R
 
S
-
 
S
-
 
I
-
 
T
G
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
A
 
R
V
 
A
K
 
I
A
 
A
V
 
A
K
 
A
L
 
V
D
 
D
V
|
V
T
 
S
N
 
D
L
 
V
A
 
E
D
 
S
I
 
V
E
 
N
K
 
R
I
 
M
V
 
V
G
 
D
E
 
S
I
 
A
D
 
V
K
 
E
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
|
A
I
 
I
F
 
F
D
x
S
-
 
T
-
 
L
-
 
K
M
 
M
A
 
K
P
 
P
I
 
F
N
 
E
A
 
E
I
 
I
T
 
S
E
 
G
D
 
D
S
 
E
Y
 
W
D
 
D
R
 
K
V
 
L
L
 
F
G
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
A
K
 
K
G
 
G
P
 
T
L
 
F
F
 
L
M
 
C
M
 
C
K
 
Q
A
 
A
V
 
V
S
 
S
N
 
P
V
 
V
M
 
M
I
 
-
E
 
R
R
 
K
G
 
N
R
 
Q
G
 
Y
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
x
I
A
x
S
S
|
S
Q
 
S
A
 
V
G
 
V
R
 
V
R
 
T
G
 
G
E
 
R
A
 
P
L
 
N
V
 
Y
T
 
A
L
 
H
Y
|
Y
C
 
I
L
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
A
 
A
I
 
V
I
 
W
S
 
A
A
 
L
T
 
T
Q
 
H
S
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
T
A
 
E
L
 
M
V
 
G
K
 
T
H
 
D
N
 
G
I
 
I
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
I
 
V
A
 
S
P
|
P
G
x
H
V
 
G
V
x
I
D
 
I
G
 
T
E
 
E
H
 
-
W
 
-
D
 
-
V
 
-
V
x
I
D
 
P
A
 
R
N
 
E
F
 
T
A
 
I
K
 
S
W
 
E
E
 
E
G
 
G
L
 
W
K
 
R
P
 
R
G
 
N
E
 
L
K
 
E
K
 
E
A
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
K
K
 
-
S
 
-
V
 
-
P
 
-
F
 
-
G
 
-
R
 
R
F
 
K
A
 
G
T
 
D
P
 
A
E
 
S
D
 
D
L
 
L
T
 
V
G
 
G
I
 
I
A
 
L
I
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
E
S
 
S
D
 
K
Y
 
F
I
 
M
L
 
T
A
 
G
Q
 
Q
T
 
T
F
 
V
G
 
A
V
 
L
D
 
D
G
 
A
G
 
G

7tzpG Crystal structure of putataive short-chain dehydrogenase/reductase (fabg) from klebsiella pneumoniae subsp. Pneumoniae ntuh-k2044 in complex with nadh (see paper)
36% identity, 98% coverage: 1:252/256 of query aligns to 4:244/247 of 7tzpG

query
sites
7tzpG
M
 
M
R
 
K
L
 
L
K
 
A
D
 
S
K
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
R
|
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
L
 
F
G
 
G
F
 
I
A
 
A
E
 
Q
A
 
V
Y
 
L
A
 
A
R
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
I
I
 
I
A
 
A
D
|
D
I
x
R
N
 
D
I
 
A
-
 
H
-
 
G
E
 
E
R
 
A
A
 
A
E
 
A
E
 
A
A
 
S
A
 
L
R
 
R
G
 
E
L
 
S
G
 
G
S
 
A
A
 
Q
V
 
A
K
 
L
A
 
F
V
 
I
K
 
S
L
x
C
D
 
N
V
x
I
T
 
A
N
 
E
L
 
K
A
 
T
D
 
Q
I
 
V
E
 
E
K
 
A
I
 
L
V
 
F
G
 
S
E
 
Q
I
 
A
D
 
E
K
 
E
D
 
A
Y
 
F
G
 
G
G
 
P
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
A
x
G
I
|
I
F
 
N
D
 
R
M
 
D
A
 
A
P
 
M
I
 
L
N
 
H
A
 
K
I
 
L
T
 
T
E
 
E
D
 
A
S
 
D
Y
 
W
D
 
D
R
 
T
V
 
V
L
 
I
G
 
D
I
x
V
N
 
N
L
 
L
K
 
K
G
 
G
P
 
T
L
 
F
F
 
L
M
 
C
M
 
M
K
 
Q
A
 
Q
V
 
A
S
 
A
N
 
I
V
 
R
M
 
M
I
 
R
E
 
E
R
 
R
G
 
G
R
 
-
G
 
A
G
 
G
K
 
R
I
 
I
I
 
I
N
 
N
M
 
I
A
 
A
S
 
S
Q
 
-
A
 
A
G
 
S
R
 
W
R
 
L
G
 
G
E
 
N
A
 
V
L
 
G
V
 
Q
T
 
T
L
 
N
Y
|
Y
C
 
S
L
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
A
A
 
G
I
 
V
I
 
V
S
 
G
A
 
M
T
 
T
Q
 
K
S
 
T
A
 
A
A
 
C
L
 
R
A
 
E
L
 
L
V
 
A
K
 
K
H
 
K
N
 
G
I
 
V
Q
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
V
 
F
V
x
I
D
 
D
G
x
T
E
 
D
H
 
M
W
x
T
D
 
R
V
 
G
V
 
V
D
 
P
A
 
E
N
 
N
F
 
V
A
 
-
K
 
-
W
 
W
E
 
Q
G
 
-
L
 
-
K
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
K
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
I
V
 
M
A
 
V
K
 
S
S
 
K
V
 
I
P
 
P
F
 
A
G
 
G
R
 
Y
F
 
A
A
 
G
T
 
E
P
 
A
E
 
K
D
 
D
L
 
V
T
 
G
G
 
E
I
 
C
A
 
V
I
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
S
 
D
E
 
G
S
 
A
D
 
R
Y
 
Y
I
 
I
L
 
N
A
 
G
Q
 
E
T
 
V
F
 
I
G
 
N
V
 
V
D
 
G
G
 
G
G
 
G

Query Sequence

>WP_094508027.1 NCBI__GCF_002252445.1:WP_094508027.1
MRLKDKVALITGAARGIGLGFAEAYAREGAKVIIADINIERAEEAARGLGSAVKAVKLDV
TNLADIEKIVGEIDKDYGGIDILVNNAAIFDMAPINAITEDSYDRVLGINLKGPLFMMKA
VSNVMIERGRGGKIINMASQAGRRGEALVTLYCLSKAAIISATQSAALALVKHNIQVNAI
APGVVDGEHWDVVDANFAKWEGLKPGEKKAAVAKSVPFGRFATPEDLTGIAIFLASSESD
YILAQTFGVDGGNWMA

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory