SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_097070321.1 NCBI__GCF_900217815.1:WP_097070321.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3pm9A Crystal structure of a putative dehydrogenase (rpa1076) from rhodopseudomonas palustris cga009 at 2.57 a resolution
42% identity, 100% coverage: 2:462/463 of query aligns to 5:465/465 of 3pm9A

query
sites
3pm9A
D
 
E
L
 
L
I
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
F
A
 
T
E
 
A
I
 
I
L
 
V
G
 
G
P
 
D
D
 
K
H
 
H
V
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
D
A
 
P
-
 
L
D
 
E
A
 
L
A
 
E
R
 
A
F
 
Y
G
 
I
R
 
T
E
 
E
W
 
E
T
 
R
G
 
N
H
 
L
Y
 
Y
R
 
R
W
 
G
T
 
H
P
 
S
L
 
P
A
 
L
V
 
V
V
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
G
H
 
S
T
 
T
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
V
A
 
A
V
 
I
L
 
C
R
 
K
L
 
L
A
 
A
H
 
N
L
 
E
T
 
A
G
 
R
T
 
V
K
 
A
V
 
L
V
 
V
P
|
P
V
x
Q
A
x
G
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
|
G
L
|
L
N
 
V
G
 
G
G
|
G
-
x
Q
T
 
T
Y
 
P
A
 
H
E
 
N
G
 
G
A
 
E
L
 
V
M
 
V
L
 
I
S
 
S
L
|
L
A
 
K
R
 
R
L
 
M
N
 
D
K
 
K
V
 
I
R
 
R
E
 
E
I
 
I
N
 
D
V
 
T
Q
 
S
A
 
S
R
 
N
T
 
T
V
 
I
V
 
T
A
 
V
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
A
V
 
I
L
 
L
E
 
Q
T
 
R
L
 
V
H
 
Q
D
 
E
L
 
K
A
 
A
G
 
A
G
 
E
H
 
V
G
 
D
L
 
R
A
 
L
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
S
F
x
L
G
|
G
S
x
A
K
 
Q
G
 
G
S
 
S
A
x
C
M
x
T
V
 
I
G
|
G
G
|
G
F
 
N
L
 
L
S
|
S
T
|
T
N
 
N
A
|
A
G
|
G
G
 
G
S
 
T
N
 
A
V
 
A
V
 
L
R
 
A
Y
 
Y
G
 
G
S
x
L
A
 
A
R
 
R
A
 
D
L
 
M
C
 
A
L
 
L
G
 
G
L
 
V
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
R
I
 
V
W
 
M
H
 
N
G
 
L
L
 
L
T
 
S
G
 
K
L
 
L
H
 
K
K
 
K
D
 
D
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
R
D
 
D
L
 
L
V
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
|
I
I
|
I
T
 
T
A
 
A
A
 
A
V
 
T
L
 
L
R
 
K
L
 
L
T
 
F
P
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
R
A
 
A
Y
 
V
A
 
E
T
 
T
A
 
A
L
 
F
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
 
Q
T
 
S
L
 
P
A
 
D
D
 
D
A
 
A
L
 
L
A
 
K
L
 
L
L
 
L
N
 
G
A
 
I
I
 
A
Q
 
Q
A
 
G
A
 
E
T
 
A
G
 
A
G
 
G
A
 
N
V
 
L
E
 
T
A
 
S
F
 
F
E
 
E
F
 
L
M
 
I
P
 
A
E
 
E
R
 
T
Y
 
P
M
 
L
D
 
D
-
 
F
-
 
S
-
 
V
R
 
R
L
 
H
A
 
A
S
 
N
A
 
N
R
 
R
P
 
D
G
 
P
L
 
L
A
 
E
C
 
A
P
 
R
F
 
Y
P
 
-
P
 
-
A
 
-
P
 
P
V
 
W
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
L
A
 
S
S
 
S
T
 
-
T
 
-
P
 
P
T
 
R
D
 
D
T
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
D
 
D
P
 
A
V
 
R
S
 
A
R
 
A
L
 
L
E
 
E
A
 
S
L
 
I
L
 
L
G
 
E
A
 
R
A
 
G
L
 
F
A
 
E
A
 
D
G
 
G
R
 
I
I
 
V
Q
 
V
D
 
D
A
 
A
V
 
A
I
 
I
A
 
A
Q
 
N
S
 
S
T
 
V
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
Q
S
 
Q
K
 
A
L
 
F
W
 
W
E
 
K
M
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
E
A
 
I
A
 
S
E
 
P
I
 
A
T
 
Q
F
 
K
T
 
P
T
 
E
P
 
G
D
 
G
I
 
S
V
 
I
D
 
K
C
 
H
D
 
D
I
 
I
A
 
S
L
 
V
P
 
P
L
 
V
D
 
A
R
 
A
L
 
V
E
 
P
T
 
Q
F
 
F
L
 
I
V
 
E
R
 
Q
M
 
A
T
 
N
P
 
A
R
 
A
L
 
V
A
 
V
A
 
A
L
 
L
D
 
I
P
 
P
E
 
G
A
 
A
E
 
R
E
 
P
L
 
V
V
 
P
I
 
F
G
 
G
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
I
H
 
H
Y
 
Y
T
 
N
-
 
V
A
 
S
Y
 
Q
P
 
P
S
 
V
R
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
K
A
 
A
L
 
E
G
 
F
A
 
L
A
 
A
-
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
D
I
 
V
R
 
S
A
 
Q
A
 
V
V
 
V
T
 
F
E
 
E
E
 
V
A
 
V
V
 
L
A
 
R
L
 
L
G
 
G
G
 
G
S
 
S
F
 
I
S
 
S
A
 
A
E
|
E
H
 
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
V
S
 
M
K
 
K
R
 
R
A
 
D
T
 
E
M
 
L
A
 
A
A
 
E
H
 
V
K
 
K
D
 
D
P
 
K
V
 
T
A
 
A
L
 
I
E
 
E
M
 
L
M
 
M
A
 
R
A
 
S
I
 
I
K
 
K
T
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
H
G
 
G
I
 
I
L
 
M
N
 
N
P
 
P
G
 
G
K
 
K
V
 
V
L
 
V

6lpnB Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in apo form (see paper)
38% identity, 94% coverage: 28:463/463 of query aligns to 39:466/467 of 6lpnB

query
sites
6lpnB
E
 
D
W
|
W
T
 
L
G
 
R
H
 
T
Y
 
L
R
 
R
W
 
G
T
 
C
P
 
S
L
 
K
A
 
V
V
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
R
H
 
T
T
 
S
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
H
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
H
A
 
C
H
 
H
L
 
E
T
 
R
G
 
N
T
 
L
K
 
A
V
 
V
V
 
N
P
|
P
V
 
Q
A
x
G
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
|
G
L
x
M
N
 
V
G
 
G
G
|
G
T
x
S
Y
 
V
-
 
P
A
 
V
E
 
F
G
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
L
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
M
N
 
N
K
 
R
V
 
V
R
 
L
E
 
S
I
 
F
N
 
H
V
 
S
Q
 
V
A
 
S
R
 
G
T
 
I
V
 
L
V
 
V
A
 
C
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
E
L
 
L
H
 
S
D
 
R
L
 
Y
A
 
V
G
 
E
G
 
E
H
 
R
G
 
D
L
 
F
A
 
I
F
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
D
F
x
L
G
 
G
S
x
A
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
x
C
M
x
H
V
 
I
G
 
G
G
|
G
F
x
N
L
 
V
S
x
A
T
|
T
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
L
N
 
R
V
 
F
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
A
 
G
L
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
T
I
 
V
W
 
L
H
 
D
G
 
C
L
 
L
T
 
T
G
 
S
L
 
L
H
 
R
K
 
K
D
 
D
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
K
D
 
Q
L
 
L
V
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
S
E
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
|
I
I
|
I
T
 
T
A
 
T
A
 
V
V
 
S
L
 
I
R
 
L
L
 
C
T
 
P
P
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
R
A
 
A
Y
 
V
A
 
N
T
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
G
L
 
C
E
 
P
T
 
G
L
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
T
L
 
F
N
 
S
A
 
T
I
 
C
Q
 
K
A
 
G
A
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
I
V
 
L
E
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
F
 
F
M
 
M
P
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
M
 
M
D
 
-
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
S
 
G
A
 
R
R
 
H
P
 
L
G
 
H
L
 
L
A
 
A
C
 
S
P
 
P
F
 
V
P
 
Q
P
 
E
A
 
S
P
 
P
V
 
F
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
T
A
 
S
S
 
G
T
 
S
T
 
N
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
G
D
 
H
P
 
D
V
 
A
S
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
G
A
 
H
L
 
F
L
 
L
G
 
E
A
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
G
R
 
L
I
 
V
Q
 
T
D
 
D
A
 
G
V
 
T
I
 
M
A
 
A
Q
 
T
S
 
D
T
 
Q
A
 
R
Q
 
K
R
 
V
S
 
K
K
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
A
M
 
L
R
 
R
E
 
E
S
 
R
A
 
I
A
 
T
E
 
E
I
 
A
T
 
L
F
 
S
T
 
R
T
 
D
P
 
G
D
 
Y
I
 
V
V
 
Y
D
 
K
C
 
Y
D
 
D
I
 
L
A
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
Y
T
 
D
F
 
I
L
 
V
V
 
T
R
 
D
M
 
L
T
 
R
P
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
H
A
 
A
E
 
K
E
 
H
L
 
V
V
 
V
-
 
G
I
 
Y
G
 
G
H
 
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
L
H
 
H
Y
 
L
T
 
N
A
 
V
Y
 
T
P
 
A
S
 
E
R
 
A
S
 
F
D
 
S
P
 
P
A
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
E
A
 
P
A
 
H
V
 
V
T
 
Y
E
 
E
E
 
W
A
 
T
V
 
A
A
 
G
L
 
Q
G
 
Q
G
 
G
S
 
S
F
 
V
S
 
S
A
 
A
E
|
E
H
 
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
F
S
 
R
K
 
K
R
 
R
A
 
D
T
 
V
M
 
L
A
 
G
A
 
Y
H
 
S
K
 
K
D
 
P
P
 
P
V
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
L
M
 
M
A
 
Q
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
T
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
|
N
P
 
P
G
 
Y
K
 
K
V
 
T
L
 
L
P
 
P

6lpxA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with 2-oxoglutarate (2-og) (see paper)
38% identity, 94% coverage: 28:463/463 of query aligns to 38:465/466 of 6lpxA

query
sites
6lpxA
E
 
D
W
|
W
T
 
L
G
 
R
H
 
T
Y
 
L
R
 
R
W
 
G
T
 
C
P
 
S
L
 
K
A
 
V
V
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
R
H
 
T
T
 
S
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
H
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
H
A
 
C
H
 
H
L
 
E
T
 
R
G
 
N
T
 
L
K
 
A
V
 
V
V
 
N
P
|
P
V
x
Q
A
x
G
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
|
G
L
x
M
N
 
V
G
 
G
G
|
G
T
x
S
Y
 
V
-
 
P
A
 
V
E
 
F
G
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
L
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
M
N
 
N
K
 
R
V
 
V
R
 
L
E
 
S
I
 
F
N
 
H
V
 
S
Q
 
V
A
 
S
R
 
G
T
 
I
V
 
L
V
 
V
A
 
C
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
E
L
 
L
H
 
S
D
 
R
L
 
Y
A
 
V
G
 
E
G
 
E
H
 
R
G
 
D
L
 
F
A
 
I
F
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
D
F
x
L
G
|
G
S
x
A
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
x
C
M
 
H
V
 
I
G
 
G
G
|
G
F
x
N
L
 
V
S
x
A
T
|
T
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
|
G
S
 
L
N
 
R
V
 
F
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
A
 
G
L
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
T
I
 
V
W
 
L
H
 
D
G
 
C
L
 
L
T
 
T
G
 
S
L
 
L
H
 
R
K
 
K
D
 
D
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
K
D
 
Q
L
 
L
V
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
S
E
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
A
 
T
A
 
V
V
 
S
L
 
I
R
 
L
L
 
C
T
 
P
P
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
R
A
 
A
Y
 
V
A
 
N
T
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
G
L
 
C
E
 
P
T
 
G
L
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
T
L
 
F
N
 
S
A
 
T
I
 
C
Q
 
K
A
 
G
A
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
I
V
 
L
E
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
F
 
F
M
 
M
P
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
M
 
M
D
 
-
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
S
 
G
A
 
R
R
 
H
P
 
L
G
 
H
L
 
L
A
 
A
C
 
S
P
 
P
F
 
V
P
 
Q
P
 
E
A
 
S
P
 
P
V
 
F
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
T
A
 
S
S
 
G
T
 
S
T
 
N
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
G
D
 
H
P
 
D
V
 
A
S
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
G
A
 
H
L
 
F
L
 
L
G
 
E
A
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
G
R
 
L
I
 
V
Q
 
T
D
 
D
A
 
G
V
 
T
I
 
M
A
 
A
Q
 
T
S
 
D
T
 
Q
A
 
R
Q
 
K
R
 
V
S
 
K
K
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
A
M
 
L
R
|
R
E
 
E
S
 
R
A
 
I
A
x
T
E
 
E
I
 
A
T
 
L
F
 
S
T
 
R
T
 
D
P
 
G
D
 
Y
I
 
V
V
 
Y
D
x
K
C
 
Y
D
 
D
I
 
L
A
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
Y
T
 
D
F
 
I
L
 
V
V
 
T
R
 
D
M
 
L
T
 
R
P
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
H
A
 
A
E
 
K
E
 
H
L
 
V
V
 
V
-
 
G
I
x
Y
G
 
G
H
|
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
L
H
|
H
Y
 
L
T
 
N
A
 
V
Y
 
T
P
 
A
S
 
E
R
 
A
S
 
F
D
 
S
P
 
P
A
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
E
A
 
P
A
 
H
V
 
V
T
 
Y
E
 
E
E
 
W
A
 
T
V
 
A
A
 
G
L
 
Q
G
 
Q
G
 
G
S
 
S
F
 
V
S
 
S
A
 
A
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
F
S
 
R
K
 
K
R
 
R
A
 
D
T
 
V
M
 
L
A
 
G
A
 
Y
H
 
S
K
 
K
D
 
P
P
 
P
V
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
L
M
 
M
A
 
Q
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
T
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
|
N
P
 
P
G
 
Y
K
 
K
V
 
T
L
 
L
P
 
P

6lpuA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with l-2-hydroxyglutarate (l-2-hg) (see paper)
38% identity, 94% coverage: 28:463/463 of query aligns to 38:465/466 of 6lpuA

query
sites
6lpuA
E
 
D
W
|
W
T
 
L
G
 
R
H
 
T
Y
 
L
R
 
R
W
 
G
T
 
C
P
 
S
L
 
K
A
 
V
V
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
R
H
 
T
T
 
S
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
H
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
H
A
 
C
H
 
H
L
 
E
T
 
R
G
 
N
T
 
L
K
 
A
V
 
V
V
 
N
P
|
P
V
 
Q
A
x
G
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
|
G
L
 
M
N
 
V
G
 
G
G
|
G
T
x
S
Y
 
V
-
 
P
A
 
V
E
 
F
G
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
L
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
M
N
 
N
K
 
R
V
 
V
R
 
L
E
 
S
I
 
F
N
 
H
V
 
S
Q
 
V
A
 
S
R
 
G
T
 
I
V
 
L
V
 
V
A
 
C
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
E
L
 
L
H
 
S
D
 
R
L
 
Y
A
 
V
G
 
E
G
 
E
H
 
R
G
 
D
L
 
F
A
 
I
F
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
D
F
x
L
G
|
G
S
x
A
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
x
C
M
x
H
V
 
I
G
|
G
G
|
G
F
x
N
L
 
V
S
x
A
T
|
T
N
 
N
A
|
A
G
 
G
G
 
G
S
 
L
N
 
R
V
 
F
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
A
 
G
L
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
T
I
 
V
W
 
L
H
 
D
G
 
C
L
 
L
T
 
T
G
 
S
L
 
L
H
 
R
K
 
K
D
 
D
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
K
D
 
Q
L
 
L
V
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
|
I
I
|
I
T
 
T
A
 
T
A
 
V
V
 
S
L
 
I
R
 
L
L
 
C
T
 
P
P
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
R
A
 
A
Y
 
V
A
 
N
T
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
G
L
 
C
E
 
P
T
 
G
L
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
T
L
 
F
N
 
S
A
 
T
I
 
C
Q
 
K
A
 
G
A
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
I
V
 
L
E
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
F
 
F
M
 
M
P
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
M
 
M
D
 
-
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
S
 
G
A
 
R
R
 
H
P
 
L
G
 
H
L
 
L
A
 
A
C
 
S
P
 
P
F
 
V
P
 
Q
P
 
E
A
 
S
P
 
P
V
 
F
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
T
A
 
S
S
 
G
T
 
S
T
 
N
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
G
D
 
H
P
 
D
V
 
A
S
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
G
A
 
H
L
 
F
L
 
L
G
 
E
A
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
G
R
 
L
I
 
V
Q
 
T
D
 
D
A
 
G
V
 
T
I
 
M
A
 
A
Q
 
T
S
 
D
T
 
Q
A
 
R
Q
 
K
R
 
V
S
 
K
K
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
A
M
 
L
R
|
R
E
 
E
S
 
R
A
 
I
A
x
T
E
 
E
I
 
A
T
 
L
F
 
S
T
 
R
T
 
D
P
 
G
D
 
Y
I
 
V
V
 
Y
D
x
K
C
 
Y
D
 
D
I
 
L
A
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
Y
T
 
D
F
 
I
L
 
V
V
 
T
R
 
D
M
 
L
T
 
R
P
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
H
A
 
A
E
 
K
E
 
H
L
 
V
V
 
V
-
 
G
I
x
Y
G
 
G
H
|
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
L
H
|
H
Y
 
L
T
 
N
A
 
V
Y
 
T
P
 
A
S
 
E
R
 
A
S
 
F
D
 
S
P
 
P
A
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
E
A
 
P
A
 
H
V
 
V
T
 
Y
E
 
E
E
 
W
A
 
T
V
 
A
A
 
G
L
 
Q
G
 
Q
G
 
G
S
 
S
F
 
V
S
 
S
A
 
A
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
F
S
 
R
K
 
K
R
 
R
A
 
D
T
 
V
M
 
L
A
 
G
A
 
Y
H
 
S
K
 
K
D
 
P
P
 
P
V
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
L
M
 
M
A
 
Q
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
T
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
|
N
P
 
P
G
 
Y
K
 
K
V
 
T
L
 
L
P
 
P

6lpqA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with d-malate (d-mal) (see paper)
38% identity, 94% coverage: 28:463/463 of query aligns to 38:465/466 of 6lpqA

query
sites
6lpqA
E
 
D
W
|
W
T
 
L
G
 
R
H
 
T
Y
 
L
R
 
R
W
 
G
T
 
C
P
 
S
L
 
K
A
 
V
V
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
R
H
 
T
T
 
S
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
H
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
H
A
 
C
H
 
H
L
 
E
T
 
R
G
 
N
T
 
L
K
 
A
V
 
V
V
 
N
P
|
P
V
 
Q
A
x
G
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
|
G
L
x
M
N
 
V
G
 
G
G
|
G
T
x
S
Y
 
V
-
 
P
A
 
V
E
 
F
G
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
L
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
M
N
 
N
K
 
R
V
 
V
R
 
L
E
 
S
I
 
F
N
 
H
V
 
S
Q
 
V
A
 
S
R
 
G
T
 
I
V
 
L
V
 
V
A
 
C
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
E
L
 
L
H
 
S
D
 
R
L
 
Y
A
 
V
G
 
E
G
 
E
H
 
R
G
 
D
L
 
F
A
 
I
F
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
D
F
x
L
G
|
G
S
x
A
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
x
C
M
x
H
V
 
I
G
 
G
G
|
G
F
x
N
L
 
V
S
x
A
T
|
T
N
 
N
A
|
A
G
 
G
G
|
G
S
 
L
N
 
R
V
 
F
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
A
 
G
L
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
T
I
 
V
W
 
L
H
 
D
G
 
C
L
 
L
T
 
T
G
 
S
L
 
L
H
 
R
K
 
K
D
 
D
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
K
D
 
Q
L
 
L
V
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
S
E
|
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
|
I
I
|
I
T
 
T
A
 
T
A
 
V
V
 
S
L
 
I
R
 
L
L
 
C
T
 
P
P
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
R
A
 
A
Y
 
V
A
 
N
T
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
G
L
 
C
E
 
P
T
 
G
L
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
T
L
 
F
N
 
S
A
 
T
I
 
C
Q
 
K
A
 
G
A
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
I
V
 
L
E
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
F
 
F
M
 
M
P
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
M
 
M
D
 
-
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
S
 
G
A
 
R
R
 
H
P
 
L
G
 
H
L
 
L
A
 
A
C
 
S
P
 
P
F
 
V
P
 
Q
P
 
E
A
 
S
P
 
P
V
 
F
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
T
A
 
S
S
 
G
T
 
S
T
 
N
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
G
D
 
H
P
 
D
V
 
A
S
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
G
A
 
H
L
 
F
L
 
L
G
 
E
A
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
G
R
 
L
I
 
V
Q
 
T
D
 
D
A
 
G
V
 
T
I
 
M
A
 
A
Q
 
T
S
 
D
T
 
Q
A
 
R
Q
 
K
R
 
V
S
 
K
K
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
A
M
 
L
R
|
R
E
 
E
S
 
R
A
 
I
A
x
T
E
 
E
I
 
A
T
 
L
F
 
S
T
 
R
T
 
D
P
 
G
D
 
Y
I
 
V
V
 
Y
D
x
K
C
 
Y
D
 
D
I
 
L
A
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
Y
T
 
D
F
 
I
L
 
V
V
 
T
R
 
D
M
 
L
T
 
R
P
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
H
A
 
A
E
 
K
E
 
H
L
 
V
V
 
V
-
 
G
I
x
Y
G
 
G
H
|
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
L
H
|
H
Y
 
L
T
 
N
A
 
V
Y
 
T
P
 
A
S
 
E
R
 
A
S
 
F
D
 
S
P
 
P
A
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
E
A
 
P
A
 
H
V
 
V
T
 
Y
E
 
E
E
 
W
A
 
T
V
 
A
A
 
G
L
 
Q
G
 
Q
G
 
G
S
 
S
F
 
V
S
 
S
A
 
A
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
F
S
 
R
K
 
K
R
 
R
A
 
D
T
 
V
M
 
L
A
 
G
A
 
Y
H
 
S
K
 
K
D
 
P
P
 
P
V
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
L
M
 
M
A
 
Q
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
T
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
|
N
P
 
P
G
 
Y
K
 
K
V
 
T
L
 
L
P
 
P

6lppA Crystal structure of human d-2-hydroxyglutarate dehydrogenase in complex with d-2-hydroxyglutarate (d-2-hg) (see paper)
38% identity, 94% coverage: 28:463/463 of query aligns to 38:465/466 of 6lppA

query
sites
6lppA
E
 
D
W
|
W
T
 
L
G
 
R
H
 
T
Y
 
L
R
 
R
W
 
G
T
 
C
P
 
S
L
 
K
A
 
V
V
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
R
H
 
T
T
 
S
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
H
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
H
A
 
C
H
 
H
L
 
E
T
 
R
G
 
N
T
 
L
K
 
A
V
 
V
V
 
N
P
|
P
V
 
Q
A
x
G
G
|
G
N
|
N
T
|
T
G
|
G
L
x
M
N
 
V
G
 
G
G
|
G
T
x
S
Y
 
V
-
 
P
A
 
V
E
 
F
G
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
L
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
R
L
 
M
N
 
N
K
 
R
V
 
V
R
 
L
E
 
S
I
 
F
N
 
H
V
 
S
Q
 
V
A
 
S
R
 
G
T
 
I
V
 
L
V
 
V
A
 
C
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
C
V
 
V
L
 
L
E
 
E
T
 
E
L
 
L
H
 
S
D
 
R
L
 
Y
A
 
V
G
 
E
G
 
E
H
 
R
G
 
D
L
 
F
A
 
I
F
 
M
P
 
P
L
 
L
T
 
D
F
x
L
G
|
G
S
x
A
K
 
K
G
 
G
S
 
S
A
x
C
M
 
H
V
 
I
G
 
G
G
|
G
F
x
N
L
 
V
S
x
A
T
|
T
N
 
N
A
|
A
G
 
G
G
|
G
S
 
L
N
 
R
V
 
F
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
A
 
G
L
 
T
C
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
D
G
 
G
R
 
T
I
 
V
W
 
L
H
 
D
G
 
C
L
 
L
T
 
T
G
 
S
L
 
L
H
 
R
K
 
K
D
 
D
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
K
D
 
Q
L
 
L
V
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
S
E
 
E
G
|
G
T
 
T
L
 
L
G
 
G
I
 
I
I
|
I
T
 
T
A
 
T
A
 
V
V
 
S
L
 
I
R
 
L
L
 
C
T
 
P
P
 
P
A
 
K
P
 
P
T
 
R
A
 
A
Y
 
V
A
 
N
T
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
L
G
 
G
L
 
C
E
 
P
T
 
G
L
 
F
A
 
A
D
 
E
A
 
V
L
 
L
A
 
Q
L
 
T
L
 
F
N
 
S
A
 
T
I
 
C
Q
 
K
A
 
G
A
 
M
T
 
L
G
 
G
G
 
E
A
 
I
V
 
L
E
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
F
 
F
M
 
M
P
 
D
E
 
A
R
 
V
Y
 
C
M
 
M
D
 
-
R
 
Q
L
 
L
A
 
V
S
 
G
A
 
R
R
 
H
P
 
L
G
 
H
L
 
L
A
 
A
C
 
S
P
 
P
F
 
V
P
 
Q
P
 
E
A
 
S
P
 
P
V
 
F
N
 
Y
L
 
V
L
 
L
V
 
I
E
 
E
I
 
T
A
 
S
S
 
G
T
 
S
T
 
N
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
A
 
A
I
 
G
D
 
H
P
 
D
V
 
A
S
 
E
R
 
K
L
 
L
E
 
G
A
 
H
L
 
F
L
 
L
G
 
E
A
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
G
A
 
S
G
 
G
R
 
L
I
 
V
Q
 
T
D
 
D
A
 
G
V
 
T
I
 
M
A
 
A
Q
 
T
S
 
D
T
 
Q
A
 
R
Q
 
K
R
 
V
S
 
K
K
 
M
L
 
L
W
 
W
E
 
A
M
 
L
R
|
R
E
 
E
S
 
R
A
 
I
A
x
T
E
 
E
I
 
A
T
 
L
F
 
S
T
 
R
T
 
D
P
 
G
D
 
Y
I
 
V
V
 
Y
D
x
K
C
 
Y
D
 
D
I
 
L
A
 
S
L
 
L
P
 
P
L
 
V
D
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
Y
T
 
D
F
 
I
L
 
V
V
 
T
R
 
D
M
 
L
T
 
R
P
 
A
R
 
R
L
 
L
A
 
G
A
 
-
L
 
-
D
 
-
P
 
P
E
 
H
A
 
A
E
 
K
E
 
H
L
 
V
V
 
V
-
 
G
I
x
Y
G
 
G
H
|
H
L
 
L
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
L
H
|
H
Y
 
L
T
x
N
A
 
V
Y
 
T
P
 
A
S
 
E
R
 
A
S
 
F
D
 
S
P
 
P
A
 
S
L
 
L
G
 
L
A
 
A
A
 
A
I
 
L
R
 
E
A
 
P
A
 
H
V
 
V
T
 
Y
E
 
E
E
 
W
A
 
T
V
 
A
A
 
G
L
 
Q
G
 
Q
G
 
G
S
 
S
F
 
V
S
 
S
A
 
A
E
|
E
H
|
H
G
 
G
V
 
V
G
 
G
I
 
F
S
 
R
K
 
K
R
 
R
A
 
D
T
 
V
M
 
L
A
 
G
A
 
Y
H
 
S
K
 
K
D
 
P
P
 
P
V
 
G
A
 
A
L
 
L
E
 
Q
M
 
L
M
 
M
A
 
Q
A
 
Q
I
 
L
K
 
K
T
 
A
A
 
L
L
 
L
D
 
D
P
 
P
K
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
Y
K
 
K
V
 
T
L
 
L
P
 
P

Q8N465 D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial; EC 1.1.99.39 from Homo sapiens (Human) (see 7 papers)
38% identity, 94% coverage: 28:463/463 of query aligns to 91:518/521 of Q8N465

query
sites
Q8N465
E
 
D
W
 
W
T
 
L
G
 
R
H
 
T
Y
 
L
R
 
R
W
 
G
T
 
C
P
 
S
L
 
K
A
 
V
V
 
L
V
 
L
R
 
R
P
 
P
A
 
R
H
 
T
T
x
S
A
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
S
A
 
H
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
H
A
 
C
H
 
H
L
 
E
T
 
R
G
 
N
T
 
L
K
 
A
V
 
V
V
x
N
P
 
P
V
 
Q
A
 
G
G
|
G
N
 
N
T
 
T
G
 
G
L
 
M
N
 
V
G
 
G
G
 
G
T
 
S
Y
 
V
-
 
P
A
 
V
E
 
F
G
 
D
A
 
E
L
 
I
M
x
I
L
 
L
S
 
S
L
 
T
A
 
A
R
 
R
L
x
M
N
 
N
K
 
R
V
 
V
R
 
L
E
 
S
I
 
F
N
 
H
V
 
S
Q
 
V
A
 
S
R
 
G
T
 
I
V
 
L
V
 
V
A
 
C
E
x
Q
A
|
A
G
|
G
V
x
C
V
|
V
L
|
L
E
|
E
T
x
E
L
|
L
H
x
S
D
x
R
L
x
Y
A
x
V
G
x
E
G
x
E
H
x
R
G
x
D
L
x
F
A
x
I
F
x
M
P
|
P
L
|
L
T
x
D
F
x
L
G
|
G
S
x
A
K
|
K
G
|
G
S
|
S
A
x
C
M
x
H
V
x
I
G
|
G
G
|
G
F
x
N
L
x
V
S
x
A
T
|
T
N
|
N
A
|
A
G
|
G
G
|
G
S
x
L
N
x
R
V
x
F
V
x
L
R
|
R
Y
|
Y
G
|
G
S
|
S
A
x
L
R
x
H
A
x
G
L
x
T
C
x
V
L
|
L
G
|
G
L
|
L
E
|
E
V
|
V
V
|
V
L
|
L
A
|
A
D
|
D
G
|
G
R
x
T
I
x
V
W
x
L
H
x
D
G
x
C
L
|
L
T
|
T
G
x
S
L
|
L
H
x
R
K
|
K
D
|
D
N
|
N
T
|
T
G
|
G
Y
|
Y
D
|
D
L
|
L
R
x
K
D
x
Q
L
|
L
V
x
F
I
|
I
G
|
G
A
x
S
E
|
E
G
|
G
T
|
T
L
|
L
G
|
G
I
|
I
I
|
I
T
|
T
A
x
T
A
x
V
V
x
S
L
x
I
R
x
L
L
x
C
T
x
P
P
|
P
A
x
K
P
|
P
T
x
R
A
|
A
Y
x
V
A
x
N
T
x
V
A
|
A
L
x
F
V
x
L
G
|
G
L
x
C
E
x
P
T
x
G
L
x
F
A
|
A
D
x
E
A
x
V
L
|
L
A
x
Q
L
x
T
L
x
F
N
x
S
A
x
T
I
x
C
Q
x
K
A
x
G
A
x
M
T
x
L
G
|
G
G
x
E
A
x
I
V
x
L
E
x
S
A
|
A
F
|
F
E
|
E
F
|
F
M
|
M
P
x
D
E
x
A
R
x
V
Y
x
C
M
|
M
D
 
-
R
x
Q
L
|
L
A
x
V
S
x
G
A
x
R
R
x
H
P
x
L
G
x
H
L
|
L
A
|
A
C
x
S
P
|
P
F
x
V
P
x
Q
P
x
E
A
x
S
P
|
P
V
x
F
N
x
Y
L
x
V
L
|
L
V
x
I
E
|
E
I
x
T
A
x
S
S
x
G
T
x
S
T
x
N
P
 
-
T
 
-
D
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
A
|
A
I
x
G
D
x
H
P
x
D
V
x
A
S
x
E
R
x
K
L
|
L
E
x
G
A
x
H
L
x
F
L
|
L
G
x
E
A
x
H
A
|
A
L
|
L
A
x
G
A
x
S
G
|
G
R
x
L
I
x
V
Q
x
T
D
|
D
A
x
G
V
x
T
I
x
M
A
|
A
Q
x
T
S
x
D
T
x
Q
A
x
R
Q
x
K
R
x
V
S
x
K
K
x
M
L
|
L
W
|
W
E
x
A
M
x
L
R
|
R
E
|
E
S
x
R
A
x
I
A
x
T
E
|
E
I
x
A
T
x
L
F
x
S
T
x
R
T
x
D
P
x
G
D
x
Y
I
x
V
V
x
Y
D
x
K
C
x
Y
D
|
D
I
x
L
A
x
S
L
|
L
P
|
P
L
x
V
D
x
E
R
|
R
L
|
L
E
x
Y
T
x
D
F
x
I
L
x
V
V
x
T
R
x
D
M
x
L
T
x
R
P
x
A
R
|
R
L
|
L
A
x
G
A
 
-
L
 
-
D
 
-
P
|
P
E
x
H
A
|
A
E
x
K
E
x
H
L
x
V
V
|
V
-
x
G
I
x
Y
G
|
G
H
|
H
L
|
L
G
|
G
D
|
D
G
|
G
N
|
N
L
|
L
H
|
H
Y
x
L
T
x
N
A
x
V
Y
x
T
P
x
A
S
x
E
R
x
A
S
x
F
D
x
S
P
|
P
A
x
S
L
|
L
G
x
L
A
|
A
A
|
A
I
x
L
R
x
E
A
x
P
A
x
H
V
|
V
T
x
Y
E
|
E
E
x
W
A
x
T
V
x
A
A
x
G
L
x
Q
G
x
Q
G
|
G
S
|
S
F
x
V
S
|
S
A
|
A
E
|
E
H
|
H
G
|
G
V
|
V
G
|
G
I
x
F
S
x
R
K
|
K
R
|
R
A
x
D
T
x
V
M
x
L
A
x
G
A
x
Y
H
x
S
K
|
K
D
x
P
P
|
P
V
x
G
A
|
A
L
|
L
E
x
Q
M
x
L
M
|
M
A
x
Q
A
x
Q
I
x
L
K
|
K
T
x
A
A
x
L
L
|
L
D
|
D
P
|
P
K
|
K
G
|
G
I
|
I
L
|
L
N
|
N
P
|
P
G
x
Y
K
|
K
V
x
T
L
|
L
P
|
P

Sites not aligning to the query:

P39976 D-2-hydroxyglutarate--pyruvate transhydrogenase DLD3; D-2HG--pyruvate transhydrogenase DLD3; (R)-2-hydroxyglutarate--pyruvate transhydrogenase; D-lactate dehydrogenase [cytochrome] 3; D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase; D-LCR; EC 1.1.99.40; EC 1.1.2.4 from Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (Baker's yeast) (see paper)
30% identity, 99% coverage: 4:462/463 of query aligns to 32:496/496 of P39976

query
sites
P39976
I
 
L
A
 
A
K
 
Y
L
 
F
A
 
R
E
 
S
I
 
I
L
 
L
G
 
S
P
 
N
D
 
D
H
 
E
V
 
I
L
 
L
T
 
N
G
 
S
A
 
Q
-
 
A
-
 
P
-
 
E
D
 
E
A
 
L
A
 
A
R
 
S
F
 
F
G
 
N
R
 
Q
E
 
D
W
 
W
T
 
M
G
 
K
H
 
K
Y
 
Y
R
 
R
W
 
G
T
 
Q
P
 
S
L
 
N
A
 
L
V
 
I
V
 
L
R
 
L
P
 
P
A
 
N
H
 
S
T
 
T
A
 
D
E
 
K
V
 
V
A
 
S
A
 
K
V
 
I
L
 
M
R
 
K
L
 
Y
A
 
C
H
 
N
L
 
D
T
 
K
G
 
K
T
 
L
K
 
A
V
 
V
V
 
V
P
 
P
V
 
Q
A
 
G
G
 
G
N
 
N
T
 
T
G
 
D
L
 
L
N
 
V
G
 
G
G
 
A
T
 
S
Y
 
V
-
 
P
A
 
V
E
 
F
G
 
D
A
 
E
L
 
I
M
 
V
L
 
L
S
 
S
L
 
L
A
 
R
R
 
N
L
 
M
N
 
N
K
 
K
V
 
V
R
 
R
E
 
D
I
 
F
N
 
D
V
 
P
Q
 
V
A
 
S
R
 
G
T
 
T
V
 
F
V
 
K
A
 
C
E
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
V
V
 
V
L
 
M
E
 
R
T
 
D
L
 
A
H
 
H
D
 
Q
L
 
F
A
 
L
G
 
H
G
 
D
H
 
H
G
 
D
L
 
H
A
 
I
F
 
F
P
 
P
L
 
L
T
 
D
F
 
L
G
 
P
S
 
S
K
 
R
G
 
N
S
 
N
A
 
C
M
 
Q
V
 
V
G
 
G
G
 
G
F
 
V
L
 
V
S
 
S
T
 
T
N
 
N
A
 
A
G
 
G
G
 
G
S
 
L
N
 
N
V
 
F
V
 
L
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
S
 
S
A
 
L
R
 
H
A
 
G
L
 
N
C
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
E
 
E
V
 
V
V
 
V
L
 
L
A
 
P
D
 
N
G
 
G
R
 
E
I
 
I
W
 
I
H
 
S
G
 
N
L
 
I
T
 
N
G
 
A
L
 
L
H
 
R
K
 
K
D
 
D
N
 
N
T
 
T
G
 
G
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
K
D
 
Q
L
 
L
V
 
F
I
 
I
G
 
G
A
 
A
E
 
E
G
 
G
T
 
T
L
 
I
G
 
G
I
 
V
I
 
V
T
 
T
A
 
G
A
 
V
V
 
S
L
 
I
R
 
V
L
 
A
T
 
A
P
 
A
A
 
K
P
 
P
T
 
K
A
 
A
Y
 
L
A
 
N
T
 
A
A
 
V
L
 
F
V
 
F
G
 
G
L
 
I
E
 
E
T
 
N
L
 
F
A
 
D
D
 
T
A
 
V
L
 
Q
A
 
K
L
 
L
L
 
F
N
 
V
A
 
K
I
 
A
Q
 
K
A
 
S
A
 
E
T
 
L
G
 
S
G
 
E
A
 
I
V
 
L
E
 
S
A
 
A
F
 
F
E
 
E
F
 
F
M
 
M
P
 
D
E
 
R
R
 
G
Y
 
S
M
 
I
D
 
E
R
 
C
L
 
T
A
 
I
S
 
E
A
 
Y
R
 
L
P
 
K
G
 
D
L
 
L
A
 
-
C
 
-
P
 
P
F
 
F
P
 
P
P
 
L
A
 
E
P
 
N
V
 
Q
N
 
H
L
 
N
L
 
F
V
 
Y
E
 
V
I
 
L
A
 
I
S
 
E
T
 
T
T
 
S
P
 
G
T
 
S
D
 
N
T
 
K
G
 
R
A
 
H
A
 
D
I
 
D
D
 
E
P
 
-
V
 
-
S
 
-
R
 
K
L
 
L
E
 
T
A
 
A
L
 
F
L
 
L
G
 
K
A
 
D
A
 
T
L
 
T
A
 
D
A
 
S
G
 
K
R
 
L
I
 
I
Q
 
S
D
 
E
A
 
G
V
 
M
I
 
M
A
 
A
Q
 
K
S
 
D
T
 
K
A
 
A
Q
 
D
R
 
F
S
 
D
K
 
R
L
 
L
W
 
W
E
 
T
M
 
W
R
 
R
E
 
K
S
 
S
A
 
V
A
 
P
E
 
T
I
 
A
T
 
C
F
 
N
T
 
S
T
 
Y
P
 
G
D
 
G
I
 
M
V
 
Y
D
 
K
C
 
Y
D
 
D
I
 
M
A
 
S
L
 
L
P
 
Q
L
 
L
D
 
K
R
 
D
L
 
L
E
 
Y
T
 
S
F
 
V
L
 
S
V
 
A
R
 
A
M
 
V
T
 
T
P
 
E
R
 
R
L
 
L
A
 
N
A
 
A
L
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
I
-
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
P
D
 
K
P
 
P
E
 
V
A
 
V
E
 
K
E
 
S
L
 
C
V
 
G
I
 
Y
G
 
G
H
 
H
L
 
V
G
 
G
D
 
D
G
 
G
N
 
N
L
 
I
H
 
H
Y
 
L
T
 
N
A
 
I
Y
 
A
P
 
V
S
 
R
R
 
E
S
 
F
D
 
T
P
 
K
A
 
Q
L
 
I
G
 
E
A
 
D
A
 
L
I
 
L
R
 
E
A
 
P
A
 
F
V
 
V
T
 
Y
E
 
E
E
 
Y
A
 
I
V
 
A
A
 
S
L
 
K
G
 
K
G
 
G
S
 
S
F
 
I
S
 
S
A
 
A
E
 
E
H
 
H
G
 
G
V
 
I
G
 
G
I
 
F
S
 
H
K
 
K
R
 
K
A
 
G
T
 
K
M
 
L
A
 
H
A
 
Y
H
 
T
K
 
R
D
 
S
P
 
D
V
 
I
A
 
E
L
 
I
E
 
R
M
 
F
M
 
M
A
 
K
A
 
D
I
 
I
K
 
K
T
 
N
A
 
H
L
 
Y
D
 
D
P
 
P
K
 
N
G
 
G
I
 
I
L
 
L
N
 
N
P
 
P
G
 
Y
K
 
K
V
 
Y
L
 
I

Sites not aligning to the query:

8jdzA Crystal structure of mldhd in complex with 2-keto-3-methylvaleric acid (see paper)
33% identity, 100% coverage: 1:462/463 of query aligns to 3:454/454 of 8jdzA

query
sites
8jdzA
M
 
Q
D
 
D
L
 
F
I
 
V
A
 
E
K
 
A
L
 
L
A
 
K
E
 
A
I
 
V
L
 
V
G
 
G
P
 
S
D
 
P
H
 
H
V
 
V
L
 
S
T
 
T
G
 
-
A
 
A
D
 
S
A
 
A
A
 
V
R
 
R
-
 
E
-
 
Q
F
 
H
G
 
G
R
 
H
E
 
D
W
x
E
T
 
S
G
 
M
H
 
H
Y
 
R
R
 
C
W
 
Q
T
 
P
P
 
P
L
 
D
A
 
A
V
 
V
V
 
V
R
 
W
P
 
P
A
 
Q
H
 
N
T
 
V
A
 
D
E
 
Q
V
 
V
A
 
S
A
 
R
V
 
V
L
 
A
R
 
S
L
 
L
A
 
C
H
 
Y
L
 
N
T
 
Q
G
 
G
T
 
V
K
 
P
V
 
I
V
 
I
P
|
P
V
 
F
A
x
G
G
x
T
N
x
G
T
|
T
G
|
G
L
 
V
N
 
E
G
 
G
G
|
G
T
x
V
Y
 
C
A
 
A
-
 
V
E
 
Q
G
 
G
A
 
G
L
 
V