SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_104484773.1 NCBI__GCF_002936955.1:WP_104484773.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

8cxaA Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase from mycobacterium smegmatis with bound NAD
36% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 2:247/251 of 8cxaA

query
sites
8cxaA
R
 
R
F
 
L
S
 
A
N
 
N
K
 
R
V
 
V
M
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
|
Q
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
R
 
I
V
 
Y
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
V
V
 
A
D
|
D
L
 
I
A
 
N
D
 
E
-
 
P
H
 
K
V
 
A
F
 
T
E
 
E
L
 
V
A
 
A
A
 
S
E
 
S
F
 
I
N
 
T
Q
 
S
Q
 
L
G
 
G
V
 
G
E
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
V
 
A
K
 
A
A
 
V
N
 
D
L
x
V
E
 
S
T
 
D
W
 
V
D
 
E
G
 
S
A
 
V
D
 
N
S
 
R
V
 
M
M
 
V
T
 
D
Q
 
S
A
 
A
A
 
V
E
 
E
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
T
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
-
 
A
-
x
A
V
 
I
G
 
F
G
x
S
T
 
T
I
 
L
W
 
K
A
 
M
Q
 
K
P
 
P
Y
 
F
E
 
E
H
 
E
Y
 
I
S
 
S
P
 
G
E
 
D
Q
 
E
I
 
W
E
 
D
K
 
K
E
 
L
V
 
F
Q
 
A
R
 
V
S
 
N
L
 
A
F
 
K
P
 
G
T
 
T
L
 
F
W
 
L
C
 
C
C
 
C
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
P
H
 
V
L
 
M
L
 
R
K
 
K
R
 
N
E
 
Q
G
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
S
|
S
S
|
S
-
 
S
-
 
V
V
 
V
A
 
V
T
 
T
R
 
G
G
 
R
L
 
P
M
 
N
R
 
Y
V
 
A
P
 
H
Y
|
Y
A
 
I
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
N
 
W
A
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
T
E
 
E
Y
 
M
A
 
G
E
 
T
H
 
D
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
T
T
 
V
A
 
S
P
|
P
G
x
H
G
 
G
-
x
I
-
 
I
T
 
T
E
 
E
A
x
I
P
 
P
P
 
R
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
E
S
 
T
E
 
I
R
 
S
E
 
E
Q
 
E
Q
 
G
W
 
W
Y
 
R
Q
 
R
T
 
N
L
 
L
V
 
E
D
 
E
Q
 
Q
T
 
A
K
 
-
A
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
L
H
 
K
R
 
R
Y
 
K
G
 
G
T
 
D
L
 
A
D
 
S
E
 
D
Q
 
L
A
 
V
G
 
G
A
 
I
I
 
L
L
 
L
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
S
S
 
K
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
I
 
T
L
 
V
P
 
A
V
 
L
A
 
D
G
 
A
G
 
G

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
33% identity, 97% coverage: 5:256/259 of query aligns to 5:250/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
F
 
L
S
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
M
 
V
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
R
 
A
V
 
I
A
 
A
E
 
K
R
 
K
A
 
F
A
 
A
E
 
L
E
 
N
G
 
D
A
 
S
R
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
A
V
 
V
D
x
E
L
|
L
A
 
L
-
 
E
D
 
D
H
x
R
V
 
L
F
 
N
E
 
Q
L
 
I
A
 
V
A
 
Q
E
 
E
F
 
L
N
 
R
Q
 
G
Q
 
M
G
 
G
V
 
K
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
G
V
 
V
K
 
K
A
|
A
N
x
D
L
x
V
E
 
S
T
 
K
W
 
K
D
 
K
G
 
D
A
 
V
D
 
E
S
 
E
V
 
F
M
 
V
T
 
R
Q
 
R
A
 
T
A
 
F
E
 
E
H
 
T
F
 
Y
G
 
S
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
C
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
|
G
G
x
I
T
 
M
I
 
D
W
 
G
A
 
V
Q
 
T
P
 
P
Y
 
V
E
 
A
H
 
E
Y
 
V
S
 
S
P
 
D
E
 
E
Q
 
L
I
 
W
E
 
E
K
 
R
E
 
V
V
 
L
Q
 
A
R
 
V
S
 
N
L
 
L
F
 
Y
P
 
S
T
 
A
L
 
F
W
 
Y
C
 
S
C
 
S
R
 
R
A
 
A
V
 
V
L
 
I
P
 
P
H
 
I
L
 
M
L
 
L
K
 
K
R
 
Q
E
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
V
 
I
A
 
A
-
 
G
-
 
I
T
 
R
R
 
G
G
 
G
L
 
F
M
 
A
R
 
G
V
 
A
P
 
P
Y
|
Y
A
 
T
A
 
V
A
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
V
 
L
N
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
S
L
 
I
A
 
A
F
 
A
E
 
H
Y
 
Y
A
 
G
E
 
D
H
 
Q
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
A
N
 
V
A
 
A
T
 
V
A
 
L
P
|
P
G
 
G
G
 
T
T
x
V
E
 
K
A
x
T
P
x
N
P
x
I
R
 
G
L
 
L
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
G
Q
 
S
S
 
S
E
 
K
R
 
P
E
x
S
Q
 
E
Q
 
L
W
 
G
Y
 
M
Q
 
R
T
 
T
L
 
L
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
T
 
T
K
 
K
A
 
L
T
 
M
S
 
S
L
 
L
M
 
S
H
 
S
R
 
R
Y
 
L
G
 
A
T
 
E
L
 
P
D
 
E
E
 
D
Q
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
V
I
 
I
L
 
V
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
D
I
 
A
L
 
V
P
 
V
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

4jroC Crystal structure of 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein]reductase (fabg) from listeria monocytogenes in complex with NADP+
36% identity, 96% coverage: 8:256/259 of query aligns to 6:244/247 of 4jroC

query
sites
4jroC
K
 
K
V
 
V
M
 
A
V
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
R
 
D
V
 
I
A
 
A
E
 
I
R
 
N
A
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
N
L
 
I
V
 
F
L
 
F
V
x
N
-
x
Y
-
x
N
-
x
G
-
x
S
-
 
P
D
 
E
L
 
A
A
 
A
D
 
E
H
 
E
V
 
T
F
 
A
E
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
A
E
 
E
F
 
-
N
 
-
Q
 
-
Q
 
H
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
V
I
 
E
A
 
A
V
 
M
K
 
K
A
 
A
N
|
N
L
x
V
E
 
A
T
 
I
W
 
A
D
 
E
G
 
D
A
 
V
D
 
D
S
 
A
V
 
F
M
 
F
T
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
I
E
 
E
H
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
 
G
G
x
I
T
 
T
I
 
-
W
 
R
A
 
D
Q
 
N
P
 
L
Y
 
L
E
 
M
H
 
R
Y
 
M
S
 
K
P
 
E
E
 
D
Q
 
E
I
 
W
E
 
D
K
 
D
E
 
V
V
 
I
Q
 
N
R
x
I
S
 
N
L
 
L
F
 
K
P
 
G
T
 
T
L
 
F
W
 
L
C
 
C
C
 
T
R
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
H
 
T
L
 
M
L
 
M
K
 
K
R
 
Q
E
 
R
G
 
A
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
M
S
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
V
T
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
L
M
 
I
-
 
G
-
 
N
-
 
A
-
 
G
R
x
Q
V
 
A
P
 
N
Y
|
Y
A
 
V
A
 
A
A
 
S
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
I
A
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
K
A
 
T
L
 
T
A
 
A
F
 
R
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
E
 
P
H
 
R
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
-
 
F
-
x
I
G
 
T
T
|
T
E
 
D
A
 
M
P
 
T
P
 
D
R
 
K
L
 
L
T
 
D
P
 
E
R
 
K
N
 
T
T
 
K
E
 
E
A
 
A
Q
 
M
S
 
L
E
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
-
W
 
-
Y
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
-
D
 
-
Q
 
-
T
 
-
K
 
-
A
 
A
T
 
Q
S
 
I
L
 
P
M
 
L
H
 
G
R
 
A
Y
 
Y
G
 
G
T
 
T
L
 
T
D
 
E
E
 
D
Q
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
A
A
 
S
S
 
K
Y
 
Y
I
 
I
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
I
 
T
L
 
L
P
 
S
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
35% identity, 97% coverage: 5:256/259 of query aligns to 2:241/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
F
 
I
S
 
Q
N
 
N
K
 
R
V
 
V
M
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
Q
 
S
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
V
 
T
A
 
A
E
 
L
R
 
R
A
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
D
|
D
L
x
I
-
 
D
A
 
A
D
 
E
H
 
K
V
 
V
F
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
E
F
 
F
N
 
S
Q
 
A
Q
 
R
G
 
G
V
 
H
E
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
G
V
 
A
K
 
V
A
 
A
N
 
D
L
x
I
E
 
G
T
 
N
W
 
K
D
 
A
G
 
A
A
 
V
D
 
D
S
 
G
V
 
M
M
 
V
T
 
K
Q
 
Q
A
 
T
A
 
I
E
 
D
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
|
G
G
 
-
T
 
M
I
 
E
W
 
R
A
 
A
Q
 
G
P
 
A
Y
 
L
E
 
R
H
 
K
Y
 
L
S
 
S
P
 
E
E
 
A
Q
 
D
I
 
W
E
 
D
K
 
V
E
 
T
V
 
I
Q
 
N
R
 
V
S
 
N
L
 
L
F
 
K
P
 
G
T
 
T
L
 
F
W
 
L
C
 
C
C
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
H
 
H
L
 
M
L
 
V
K
 
E
R
 
N
E
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
I
S
 
A
S
|
S
V
 
R
A
 
A
-
 
W
T
 
L
R
 
G
G
 
G
L
 
A
M
 
G
R
 
Q
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
E
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
T
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
L
T
x
I
E
 
H
A
 
T
P
 
P
P
 
M
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
W
E
 
D
A
 
E
Q
 
L
S
 
P
E
 
E
R
 
K
E
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
F
Y
 
L
Q
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
S
D
 
R
Q
 
Q
T
 
P
K
 
T
A
 
G
T
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
-
H
 
-
R
 
K
Y
 
L
G
 
G
T
 
E
L
 
P
D
 
D
E
 
D
Q
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
T
I
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
I
 
V
L
 
L
P
 
Y
V
 
V
A
 
C
G
 
G
G
 
G

Q9KJF1 (2S)-[(R)-hydroxy(phenyl)methyl]succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; (S,R)-2-(alpha-hydroxybenzyl)succinyl-CoA dehydrogenase subunit BbsD; EC 1.1.1.429 from Thauera aromatica (see 2 papers)
35% identity, 97% coverage: 5:256/259 of query aligns to 3:242/248 of Q9KJF1

query
sites
Q9KJF1
F
 
I
S
 
Q
N
 
N
K
 
R
V
 
V
M
 
A
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
A
Q
x
S
G
 
G
I
 
M
G
 
G
R
 
K
R
 
Q
V
 
T
A
 
A
E
 
L
R
 
R
A
 
F
A
 
A
E
 
E
E
 
Q
G
 
G
A
 
A
R
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
D
|
D
L
 
I
-
 
D
A
 
A
D
 
E
H
 
K
V
 
V
F
 
R
E
 
A
L
 
T
A
 
V
A
 
D
E
 
E
F
 
F
N
 
S
Q
 
A
Q
 
R
G
 
G
V
 
H
E
 
R
A
 
V
I
 
L
A
 
G
V
 
A
K
 
V
A
 
A
N
x
D
L
x
I
E
 
G
T
 
N
W
 
K
D
 
A
G
 
A
A
 
V
D
 
D
S
 
G
V
 
M
M
 
V
T
 
K
Q
 
Q
A
 
T
A
 
I
E
 
D
H
 
A
F
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
 
G
G
 
-
T
 
M
I
 
E
W
 
R
A
 
A
Q
 
G
P
 
A
Y
 
L
E
 
R
H
 
K
Y
 
L
S
 
S
P
 
E
E
 
A
Q
 
D
I
 
W
E
 
D
K
 
V
E
 
T
V
 
I
Q
 
N
R
 
V
S
 
N
L
 
L
F
 
K
P
 
G
T
 
T
L
 
F
W
 
L
C
 
C
C
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
H
P
 
G
H
 
H
L
 
M
L
 
V
K
 
E
R
 
N
E
 
K
G
 
H
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
S
 
A
S
 
S
V
 
R
A
 
A
-
 
W
T
 
L
R
 
G
G
 
G
L
 
A
M
 
G
R
 
Q
V
 
T
P
 
P
Y
|
Y
A
 
S
A
 
S
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
M
T
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
L
A
 
A
F
 
I
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
E
 
R
H
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
T
V
 
V
N
 
N
A
 
C
T
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
L
T
 
I
E
 
H
A
 
T
P
 
P
P
 
M
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
W
E
 
D
A
 
E
Q
 
L
S
 
P
E
 
E
R
 
K
E
 
D
Q
 
Q
Q
 
Q
W
 
F
Y
 
L
Q
 
-
T
 
-
L
 
L
V
 
S
D
 
R
Q
 
Q
T
 
P
K
 
T
A
 
G
T
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
-
H
 
-
R
 
K
Y
 
L
G
 
G
T
 
E
L
 
P
D
 
D
E
 
D
Q
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
T
I
 
L
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
D
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
F
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
Q
I
 
V
L
 
L
P
 
Y
V
 
V
A
 
C
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

1zemA Crystal structure of NAD+-bound xylitol dehydrogenase (see paper)
32% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 2:260/260 of 1zemA

query
sites
1zemA
R
 
K
F
 
F
S
 
N
N
 
G
K
 
K
V
 
V
M
 
C
V
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
G
G
x
N
I
|
I
G
 
G
R
 
L
R
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
L
R
 
R
A
 
L
A
 
A
E
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
T
R
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
L
D
|
D
L
x
M
A
 
N
D
 
R
H
 
E
V
 
A
F
 
L
E
 
E
L
 
K
A
 
A
-
 
E
A
 
A
E
 
S
F
 
V
N
 
R
Q
 
E
Q
 
K
G
 
G
V
 
V
E
 
E
A
 
A
I
 
R
A
 
S
V
 
Y
K
 
V
A
 
C
N
x
D
L
x
V
E
 
T
T
 
S
W
 
E
D
 
E
G
 
A
A
 
V
D
 
I
S
 
G
V
 
T
M
 
V
T
 
D
Q
 
S
A
 
V
A
 
V
E
 
R
H
 
D
F
 
F
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
F
L
 
L
V
 
F
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
G
 
Y
T
 
Q
I
 
G
W
 
A
A
 
F
Q
 
A
P
 
P
Y
 
V
E
 
Q
H
 
D
Y
 
Y
S
 
P
P
 
S
E
 
D
Q
 
D
I
 
F
E
 
A
K
 
R
E
 
V
V
 
L
Q
 
T
R
 
I
S
 
N
L
 
V
F
 
T
P
 
G
T
 
A
L
 
F
W
 
H
C
 
V
C
 
L
R
 
K
A
 
A
V
 
V
L
 
S
P
 
R
H
 
Q
L
 
M
L
 
I
K
 
T
R
 
Q
E
 
N
G
 
Y
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
V
 
M
A
 
A
T
 
-
R
 
-
G
 
G
L
 
V
M
 
K
R
 
G
V
 
P
P
 
P
-
 
N
-
 
M
-
 
A
-
 
A
Y
|
Y
A
 
G
A
 
T
A
 
S
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
I
N
 
I
A
 
A
L
 
L
T
 
T
V
 
E
A
 
T
L
 
A
A
 
A
F
 
L
E
 
D
Y
 
L
A
 
A
E
 
P
H
 
Y
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
S
P
|
P
G
 
G
G
 
-
T
 
Y
E
x
M
A
 
G
P
 
P
P
 
G
R
 
F
L
 
M
T
 
W
P
 
E
R
 
R
N
 
Q
T
 
V
E
 
E
A
 
L
Q
 
Q
S
 
A
E
 
K
R
 
V
E
 
G
Q
 
S
Q
 
Q
W
 
Y
Y
 
F
Q
 
S
T
 
T
-
x
D
-
 
P
-
 
K
-
 
V
L
 
V
V
 
A
D
 
Q
Q
 
Q
T
 
M
K
 
I
A
 
G
T
 
S
S
 
V
L
 
P
M
 
M
H
 
R
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
D
L
 
I
D
 
N
E
 
E
Q
 
I
A
 
P
G
 
G
A
 
V
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
G
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
S
Y
 
F
I
 
M
T
 
T
G
 
G
T
 
V
I
 
N
L
 
L
P
 
P
V
 
I
A
 
A
G
 
G
G
 
G

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 10:262/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
R
 
R
F
 
F
S
 
T
N
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
V
V
x
L
I
|
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
G
Q
x
S
G
|
G
I
x
L
G
|
G
R
|
R
R
x
A
V
x
T
A
|
A
E
x
V
R
|
R
A
x
L
A
|
A
E
x
A
E
|
E
G
|
G
A
|
A
R
x
K
L
|
L
V
x
S
L
|
L
V
 
V
D
 
D
L
 
V
A
 
S
D
 
S
H
 
E
V
 
G
F
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
K
L
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
L
F
 
E
N
 
T
Q
 
A
Q
 
P
G
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
T
V
 
T
K
 
V
A
 
A
N
 
D
L
 
V
E
 
S
T
 
D
W
 
E
D
 
A
G
 
Q
A
 
V
D
 
E
S
 
A
V
 
Y
M
 
V
T
 
T
Q
 
A
A
 
T
A
 
T
E
 
E
H
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
 
N
V
 
A
G
 
G
G
 
I
T
x
E
I
 
G
W
 
K
A
 
Q
Q
 
N
P
 
P
Y
 
T
E
 
E
H
 
S
Y
 
F
S
 
T
P
 
A
E
 
A
Q
 
E
I
 
F
E
 
D
K
 
K
E
 
V
V
 
V
Q
 
S
R
 
I
S
 
N
L
 
L
F
 
R
P
 
G
T
 
V
L
 
F
W
 
L
C
 
G
C
 
L
R
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
K
H
 
I
L
 
M
L
 
R
K
 
E
R
 
Q
E
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
T
S
 
A
S
 
S
V
 
V
-
 
G
A
 
G
T
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
I
-
 
G
M
 
N
R
 
Q
V
 
S
P
 
G
Y
 
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
N
L
 
S
A
 
A
F
 
V
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
E
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
G
 
A
T
 
I
E
 
W
A
 
T
P
 
P
-
 
M
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
M
P
 
K
R
 
Q
L
 
L
T
 
D
P
 
P
R
 
E
N
 
N
T
 
P
E
 
R
A
 
K
Q
 
A
S
 
A
E
 
E
R
 
E
E
 
F
Q
 
I
Q
 
Q
W
 
-
Y
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
N
Q
 
P
T
 
S
K
 
K
A
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
-
H
 
-
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
E
L
 
A
D
 
P
E
 
E
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
I
A
 
D
G
 
G
G
 
G

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 1:253/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
R
 
R
F
 
F
S
 
T
N
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
V
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
Q
x
S
G
|
G
I
x
L
G
 
G
R
 
R
R
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
A
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
L
V
 
S
L
 
L
V
 
V
D
|
D
L
x
V
A
 
S
D
 
S
H
 
E
V
 
G
F
 
L
E
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
K
L
 
A
A
 
A
A
 
V
E
 
L
F
 
E
N
 
T
Q
 
A
Q
 
P
G
 
D
V
 
A
E
 
E
A
 
V
I
 
L
A
 
T
V
 
T
K
 
V
A
|
A
N
x
D
L
x
V
E
 
S
T
 
D
W
 
E
D
 
A
G
 
Q
A
 
V
D
 
E
S
 
A
V
 
Y
M
 
V
T
 
T
Q
 
A
A
 
T
A
 
T
E
 
E
H
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
G
L
 
F
V
 
F
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
|
G
G
x
I
T
 
E
I
 
G
W
 
K
A
 
Q
Q
 
N
P
 
P
Y
 
T
E
 
E
H
 
S
Y
 
F
S
 
T
P
 
A
E
 
A
Q
 
E
I
 
F
E
 
D
K
 
K
E
 
V
V
 
V
Q
 
S
R
 
I
S
 
N
L
 
L
F
 
R
P
 
G
T
 
V
L
 
F
W
 
L
C
 
G
C
 
L
R
 
E
A
 
K
V
 
V
L
 
L
P
 
K
H
 
I
L
 
M
L
 
R
K
 
E
R
 
Q
E
 
G
G
 
S
G
 
G
A
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
V
 
V
-
 
G
A
 
G
T
 
I
R
 
R
G
 
G
L
 
I
-
 
G
M
 
N
R
x
Q
V
 
S
P
 
G
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
H
G
 
G
V
 
V
N
 
V
A
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
N
L
 
S
A
 
A
F
 
V
E
 
E
Y
 
Y
A
 
G
E
 
R
H
 
Y
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
A
T
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
G
 
A
T
 
I
E
 
W
A
x
T
P
|
P
-
x
M
-
 
V
-
 
E
-
 
N
-
 
S
-
 
M
P
 
K
R
 
Q
L
 
L
T
 
D
P
 
P
R
 
E
N
 
N
T
 
P
E
 
R
A
 
K
Q
 
A
S
 
A
E
 
E
R
 
E
E
 
F
Q
 
I
Q
 
Q
W
 
-
Y
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
V
D
 
N
Q
 
P
T
 
S
K
 
K
A
 
-
T
 
-
S
 
-
L
 
-
M
 
-
H
 
-
R
 
R
Y
 
Y
G
 
G
T
 
E
L
 
A
D
 
P
E
 
E
Q
 
I
A
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
V
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
L
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
A
T
 
T
I
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
I
A
 
D
G
 
G
G
 
G

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 2:240/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
F
 
F
S
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
M
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
E
R
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
R
A
 
F
A
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
A
D
|
D
L
x
W
A
|
A
D
 
K
H
 
E
V
 
A
F
 
V
E
 
D
L
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
A
F
 
S
N
 
L
Q
 
P
Q
 
K
G
 
G
V
 
-
E
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
V
K
 
H
A
x
I
N
x
D
L
x
V
E
 
S
T
 
D
W
 
H
D
 
V
G
 
A
A
 
V
D
 
E
S
 
K
V
 
M
M
 
M
T
 
N
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
G
 
V
T
 
H
I
 
V
W
 
A
A
 
G
Q
 
S
P
 
V
Y
 
L
E
 
E
H
 
-
Y
 
T
S
 
S
P
 
I
E
 
D
Q
 
D
I
 
W
E
 
R
K
 
R
E
 
I
V
 
A
Q
 
G
R
x
V
S
 
D
L
 
I
F
 
D
P
 
G
T
 
V
L
 
V
W
 
F
C
 
C
C
 
S
R
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
T
E
 
K
G
 
-
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
V
 
V
A
x
S
T
 
G
R
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
D
L
 
W
M
 
G
R
 
A
V
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
N
 
V
A
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
A
F
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
E
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
T
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
x
S
E
x
L
A
x
V
Q
 
K
S
x
T
E
x
N
R
x
M
E
x
T
Q
 
N
Q
 
G
W
 
W
Y
 
P
Q
 
Q
T
 
E
L
 
I
V
 
R
D
 
D
Q
 
K
T
 
F
K
 
N
A
 
E
T
 
R
S
 
I
L
 
A
M
 
L
H
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
A
T
 
E
L
 
P
D
 
E
E
 
E
Q
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 4:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
R
 
R
F
 
L
S
 
Q
N
 
D
K
 
K
V
 
V
M
 
A
V
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
Q
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
L
R
 
E
V
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
V
A
 
F
A
 
M
E
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
L
x
F
A
 
N
D
 
E
H
 
A
V
 
A
F
 
G
E
 
K
L
 
E
A
 
A
A
 
V
E
 
E
F
 
A
N
 
N
Q
 
P
Q
 
-
G
 
G
V
 
V
E
 
-
A
 
-
I
 
V
A
 
F
V
 
I
K
 
R
A
x
V
N
x
D
L
x
V
E
 
S
T
 
D
W
 
R
D
 
E
G
 
S
A
 
V
D
 
H
S
 
R
V
 
L
M
 
V
T
 
E
Q
 
N
A
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
K
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
G
x
I
T
 
T
I
 
-
W
 
R
A
x
D
Q
 
S
P
 
M
Y
 
L
E
 
S
H
x
K
Y
 
M
S
 
T
P
 
V
E
 
D
Q
 
Q
I
 
F
E
 
Q
K
 
Q
E
 
V
V
 
I
Q
 
N
R
 
V
S
x
N
L
 
L
F
 
T
P
 
G
T
 
V
L
 
F
W
 
H
C
 
C
C
 
T
R
 
Q
A
 
A
V
 
V
L
 
L
P
 
P
H
 
Y
L
 
M
L
 
A
K
 
E
R
 
Q
E
 
G
G
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
S
 
S
S
|
S
V
 
V
-
 
T
A
 
G
T
 
T
R
 
Y
G
 
G
-
x
N
L
x
V
M
 
G
R
x
Q
V
 
T
P
 
N
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
A
G
 
G
V
 
V
N
 
I
A
 
G
L
 
M
T
 
T
V
 
K
A
 
T
L
 
W
A
 
A
F
 
K
E
 
E
Y
 
L
A
 
A
E
 
R
H
 
K
G
 
G
I
 
I
R
 
N
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
G
x
F
T
|
T
E
 
E
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
|
T
E
 
A
A
x
M
Q
 
V
S
 
A
E
 
E
R
 
V
E
 
P
Q
 
E
Q
 
K
W
 
-
Y
 
-
Q
 
-
T
 
-
L
 
V
V
 
I
D
 
E
Q
x
K
T
 
M
K
 
K
A
 
A
T
 
Q
S
 
V
L
 
P
M
 
M
H
 
G
R
 
R
Y
 
L
G
 
G
T
 
K
L
 
P
D
 
E
E
 
D
Q
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
Y
L
 
L
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
H
D
 
E
A
 
S
S
 
D
Y
 
Y
I
 
V
T
 
N
G
 
G
T
 
H
I
 
V
L
 
L
P
 
H
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 2:240/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
R
 
R
F
 
F
S
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
M
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
R
 
E
R
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
R
A
 
F
A
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
A
D
|
D
L
 
W
A
 
A
D
 
K
H
 
E
V
 
A
F
 
V
E
 
D
L
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
A
F
 
S
N
 
L
Q
 
P
Q
 
K
G
 
G
V
 
-
E
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
V
K
 
H
A
 
I
N
x
D
L
x
V
E
 
S
T
 
D
W
 
H
D
 
V
G
 
A
A
 
V
D
 
E
S
 
K
V
 
M
M
 
M
T
 
N
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
V
 
A
G
 
G
G
 
V
T
 
H
I
 
V
W
 
A
A
 
G
Q
 
S
P
 
V
Y
 
L
E
 
E
H
 
-
Y
 
T
S
 
S
P
 
I
E
 
D
Q
 
D
I
 
W
E
 
R
K
 
R
E
 
I
V
 
A
Q
 
G
R
 
V
S
 
D
L
 
I
F
 
D
P
 
G
T
 
V
L
 
V
W
 
F
C
 
C
C
 
S
R
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
T
E
 
K
G
 
-
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
T
S
 
A
S
|
S
V
|
V
A
x
S
T
 
G
R
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
D
L
 
W
M
 
G
R
 
A
V
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
N
 
V
A
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
A
F
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
E
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
T
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
S
E
 
L
A
x
V
Q
 
K
S
x
T
E
 
N
R
 
M
E
 
T
Q
 
N
Q
 
G
W
 
W
Y
 
P
Q
 
Q
T
 
E
L
 
I
V
x
R
D
|
D
Q
x
K
T
 
F
K
 
N
A
 
E
T
 
R
S
 
I
L
 
A
M
 
L
H
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
A
T
 
E
L
 
P
D
 
E
E
 
E
Q
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

6vspA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 2:240/251 of 6vspA

query
sites
6vspA
R
 
R
F
 
F
S
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
M
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
R
 
E
R
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
R
A
 
F
A
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
A
D
|
D
L
x
W
A
|
A
D
 
K
H
 
E
V
 
A
F
 
V
E
 
D
L
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
A
F
 
S
N
 
L
Q
 
P
Q
 
K
G
 
G
V
 
-
E
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
V
K
 
H
A
x
I
N
x
D
L
x
V
E
 
S
T
 
D
W
 
H
D
 
V
G
 
A
A
 
V
D
 
E
S
 
K
V
 
M
M
 
M
T
 
N
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
G
x
V
T
 
H
I
 
V
W
 
A
A
 
G
Q
 
S
P
 
V
Y
 
L
E
 
E
H
 
-
Y
 
T
S
 
S
P
 
I
E
 
D
Q
 
D
I
 
W
E
 
R
K
 
R
E
 
I
V
 
A
Q
 
G
R
x
V
S
 
D
L
 
I
F
 
D
P
 
G
T
 
V
L
 
V
W
 
F
C
 
C
C
 
S
R
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
T
E
 
K
G
 
-
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
S
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
S
T
 
G
R
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
D
L
 
W
M
 
G
R
 
A
V
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
N
 
V
A
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
A
F
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
E
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
T
 
V
A
 
C
P
|
P
G
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
x
S
E
x
L
A
x
V
Q
 
K
S
x
T
E
x
N
R
x
M
E
x
T
Q
 
N
Q
 
G
W
 
W
Y
 
P
Q
 
Q
T
 
E
L
 
I
V
 
R
D
 
D
Q
 
K
T
 
F
K
 
N
A
 
E
T
 
R
S
 
I
L
 
A
M
 
L
H
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
A
T
 
E
L
 
P
D
 
E
E
 
E
Q
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 4:242/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
R
 
R
F
 
F
S
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
M
 
V
V
 
V
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
Q
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
R
 
E
R
 
A
V
 
A
A
 
A
E
 
R
R
 
R
A
 
F
A
 
S
E
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
A
D
|
D
L
x
W
A
 
A
D
 
K
H
 
E
V
 
A
F
 
V
E
 
D
L
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
A
F
 
S
N
 
L
Q
 
P
Q
 
K
G
 
G
V
 
-
E
 
R
A
 
A
I
 
M
A
 
A
V
 
V
K
 
H
A
x
I
N
x
D
L
x
V
E
 
S
T
 
D
W
 
H
D
 
V
G
 
A
A
 
V
D
 
E
S
 
K
V
 
M
M
 
M
T
 
N
Q
 
E
A
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
K
F
 
L
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
 
N
V
 
A
G
|
G
G
 
V
T
 
H
I
 
V
W
 
A
A
 
G
Q
 
S
P
 
V
Y
 
L
E
 
E
H
 
-
Y
 
T
S
 
S
P
 
I
E
 
D
Q
 
D
I
 
W
E
 
R
K
 
R
E
 
I
V
 
A
Q
 
G
R
 
V
S
 
D
L
 
I
F
 
D
P
 
G
T
 
V
L
 
V
W
 
F
C
 
C
C
 
S
R
 
K
A
 
F
V
 
A
L
 
L
P
 
P
H
 
H
L
 
L
L
 
L
K
 
K
R
 
T
E
 
K
G
 
-
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
T
S
 
A
S
|
S
V
 
V
A
 
S
T
 
G
R
 
L
G
 
G
-
 
G
-
 
D
L
 
W
M
 
G
R
 
A
V
 
A
P
 
Y
Y
|
Y
A
 
C
A
 
A
A
 
A
K
 
K
G
 
G
G
 
A
V
 
V
N
 
V
A
 
N
L
 
L
T
 
T
V
 
R
A
 
A
L
 
M
A
 
A
F
 
L
E
 
D
Y
 
H
A
 
G
E
 
G
H
 
D
G
 
G
I
 
V
R
 
R
V
 
I
N
 
N
A
 
S
T
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
-
G
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
S
E
 
L
A
 
V
Q
 
K
S
 
T
E
 
N
R
 
M
E
 
T
Q
 
N
Q
 
G
W
 
W
Y
 
P
Q
 
Q
T
 
E
L
 
I
V
 
R
D
 
D
Q
 
K
T
 
F
K
 
N
A
 
E
T
 
R
S
 
I
L
 
A
M
 
L
H
 
G
R
 
R
Y
 
A
G
 
A
T
 
E
L
 
P
D
 
E
E
 
E
Q
 
V
A
 
A
G
 
A
A
 
V
I
 
M
L
 
A
F
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
A
S
 
S
Y
 
F
I
 
I
T
 
N
G
 
G
T
 
A
I
 
N
L
 
I
P
 
P
V
 
V
A
 
D
G
 
G
G
 
G

8bcjB Crystal structure of short-chain dehydrogenase pa3128 from pseudomonas aeruginosa pao1 in complex with NADP+
36% identity, 96% coverage: 8:256/259 of query aligns to 5:249/250 of 8bcjB

query
sites
8bcjB
K
 
N
V
 
V
M
 
M
V
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
x
S
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
A
R
 
A
V
 
T
A
 
A
E
 
L
R
 
L
A
 
A
A
 
A
E
 
E
E
 
R
G
 
G
A
 
Y
R
 
A
L
 
V
V
 
V
L
 
L
V
 
N
D
 
Y
L
|
L
A
x
R
D
x
N
H
 
R
-
 
E
-
 
A
V
 
A
F
 
E
E
 
A
L
 
L
A
 
R
A
 
Q
E
 
R
F
 
I
N
 
E
Q
 
R
Q
 
Q
G
 
G
V
 
G
E
 
E
A
 
A
I
 
L
A
 
A
V
 
V
K
 
A
A
|
A
N
x
D
L
x
V
E
 
A
T
 
E
W
 
E
D
 
G
G
 
D
A
 
V
D
 
E
S
 
R
V
 
L
M
 
F
T
 
A
Q
 
S
A
 
I
A
 
D
E
 
E
H
 
R
F
 
F
G
 
G
G
 
R
I
 
L
D
 
D
I
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
A
G
|
G
G
 
M
T
 
L
I
 
E
W
 
A
A
 
Q
Q
 
T
P
 
R
Y
 
L
E
 
E
H
 
N
Y
 
I
S
 
D
P
 
A
E
 
A
Q
 
R
I
 
L
E
 
H
K
 
R
E
 
V
V
 
F
Q
 
A
R
x
T
S
 
N
L
 
V
F
 
T
P
 
G
T
 
S
L
 
F
W
 
L
C
 
C
C
 
A
R
 
R
A
 
E
V
 
A
L
 
V
P
 
K
H
 
R
L
 
L
L
 
S
K
 
T
R
 
R
-
 
H
-
 
G
-
 
G
E
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
|
V
S
 
S
S
|
S
V
 
M
A
 
A
T
 
S
R
 
R
G
 
-
L
 
-
M
 
L
R
 
G
V
 
S
P
 
P
-
 
N
-
 
E
-
 
Y
-
 
I
-
 
D
Y
|
Y
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
|
K
G
 
G
G
 
A
V
 
I
N
 
D
A
 
S
L
 
M
T
 
T
V
 
I
A
 
G
L
 
L
A
 
A
F
 
R
E
 
E
Y
 
V
A
 
A
E
 
A
H
 
E
G
 
G
I
 
I
R
 
R
V
 
V
N
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
R
P
|
P
G
|
G
G
 
L
T
x
I
E
 
D
A
 
-
P
 
-
P
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
|
T
E
 
E
A
x
I
Q
x
H
S
 
A
E
 
S
R
 
G
E
 
G
Q
 
E
Q
 
P
W
 
G
Y
 
R
Q
 
-
T
 
-
L
 
-
V
 
I
D
 
E
Q
 
R
T
 
L
K
 
K
A
 
G
T
 
G
S
 
I
L
 
P
M
 
L
H
 
G
R
 
R
Y
 
G
G
 
G
T
 
T
L
 
A
D
 
E
E
 
E
Q
 
V
A
 
A
G
 
R
A
 
A
I
 
I
L
 
L
F
 
W
L
 
L
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
E
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
I
 
S
T
 
T
G
 
G
T
 
T
I
 
F
L
 
I
P
 
D
V
 
V
A
 
S
G
 
G
G
 
G

5epoA The three-dimensional structure of clostridium absonum 7alpha- hydroxysteroid dehydrogenase (see paper)
34% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 2:247/261 of 5epoA

query
sites
5epoA
R
 
R
F
 
L
S
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
V
M
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
x
S
A
 
S
A
x
T
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
R
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
E
R
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
L
V
 
V
D
 
Y
L
 
L
A
 
A
D
 
A
H
x
R
V
 
S
F
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
V
-
 
I
A
 
A
E
 
D
F
 
I
N
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
V
 
G
E
 
V
A
 
A
I
 
K
A
 
F
V
 
V
K
 
Y
A
x
F
N
|
N
L
 
A
E
 
R
T
 
E
W
 
E
D
 
E
G
 
T
A
 
Y
D
 
T
S
 
S
V
 
M
M
 
V
T
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
A
F
 
E
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
V
x
Y
G
|
G
G
 
G
T
|
T
-
 
N
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
N
I
 
L
W
 
T
A
 
A
Q
 
G
P
 
D
Y
 
T
E
 
D
H
 
E
Y
 
F
S
 
F
P
 
-
E
 
R
Q
 
I
I
 
L
E
 
K
K
 
D
E
 
N
V
 
V
Q
 
Q
R
 
S
S
 
V
L
 
Y
F
 
L
P
 
P
T
 
-
L
 
-
W
 
-
C
 
-
C
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
I
P
 
P
H
 
H
L
 
M
L
 
E
K
 
K
R
 
V
E
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
S
 
S
S
x
T
V
 
I
A
x
G
T
 
S
R
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
L
x
I
M
 
S
R
|
R
V
 
I
P
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
V
A
 
S
K
|
K
G
 
S
G
 
A
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
Q
A
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
L
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
H
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
T
 
V
A
 
L
P
|
P
G
|
G
-
 
L
-
x
I
G
 
G
T
|
T
E
x
R
A
|
A
P
x
A
P
 
-
R
 
-
L
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
N
 
-
T
 
-
E
 
-
A
 
-
Q
 
-
S
 
-
E
 
-
R
 
-
E
 
-
Q
 
-
Q
 
-
W
 
-
Y
 
L
Q
 
E
T
x
N
L
x
M
V
 
T
D
 
D
Q
 
E
T
x
F
K
 
R
A
 
D
T
 
S
S
 
F
L
 
L
M
 
G
H
 
H
-
 
V
-
 
P
-
 
L
-
 
N
R
 
R
Y
 
V
G
 
G
T
 
R
L
 
P
D
 
E
E
 
D
Q
 
I
A
 
A
G
 
N
A
 
A
I
 
V
L
 
L
F
 
Y
L
 
Y
A
 
A
S
 
S
D
 
D
D
 
D
A
 
S
S
 
G
Y
 
Y
I
 
V
T
 
T
G
 
G
T
 
M
I
 
I
L
 
H
P
 
E
V
 
V
A
 
A
G
 
G
G
 
G

G9FRD7 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; 7alpha-HSDH; NADP-dependent 7alpha-hydroxysteroid dehydrogenase; EC 1.1.1.- from Clostridium sardiniense (Clostridium absonum) (see 2 papers)
34% identity, 98% coverage: 4:256/259 of query aligns to 3:248/262 of G9FRD7

query
sites
G9FRD7
R
 
R
F
 
L
S
 
E
N
 
G
K
 
K
V
 
V
M
 
A
V
 
I
I
 
V
T
 
T
G
x
S
A
x
S
A
x
T
Q
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
R
 
R
R
 
A
V
 
S
A
 
A
E
 
E
R
 
A
A
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
L
V
 
V
D
 
Y
L
 
L
A
 
A
D
 
A
H
x
R
V
 
S
F
 
E
E
 
E
L
 
L
A
 
A
-
 
N
-
 
E
-
 
V
-
 
I
A
 
A
E
 
D
F
 
I
N
 
K
Q
 
K
Q
 
Q
G
 
G
V
 
G
E
 
V
A
 
A
I
 
K
A
 
F
V
 
V
K
 
Y
A
 
F
N
|
N
L
x
A
E
 
R
T
 
E
W
 
E
D
 
E
G
 
T
A
 
Y
D
 
T
S
 
S
V
 
M
M
 
V
T
 
E
Q
 
K
A
 
V
A
 
A
E
 
E
H
 
A
F
 
E
G
 
G
G
 
R
I
 
I
D
 
D
I
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
V
 
Y
G
 
G
G
 
G
T
 
T
-
 
N
-
 
V
-
 
N
-
 
L
-
 
D
-
 
K
-
 
N
I
 
L
W
 
T
A
 
A
Q
 
G
P
 
D
Y
 
T
E
 
D
H
 
E
Y
 
F
S
 
F
P
 
-
E
 
R
Q
 
I
I
 
L
E
 
K
K
 
D
E
 
N
V
 
V
Q
 
Q
R
 
S
S
 
V
L
 
Y
F
 
L
P
 
P
T
 
-
L
 
-
W
 
-
C
 
-
C
 
A
R
 
K
A
 
A
V
 
A
L
 
I
P
 
P
H
 
H
L
 
M
L
 
E
K
 
K
R
 
V
E
 
G
G
 
G
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
 
I
S
 
S
S
x
T
V
 
I
A
 
G
T
 
S
R
 
V
-
 
V
-
 
P
G
 
D
L
 
I
M
 
S
R
 
R
V
 
I
P
 
A
Y
|
Y
A
 
C
A
 
V
A
 
S
K
|
K
G
 
S
G
 
A
V
 
I
N
 
N
A
 
S
L
 
L
T
 
T
V
 
Q
A
 
N
L
 
I
A
 
A
F
 
L
E
 
Q
Y
 
Y
A
 
A
E
 
R
H
 
K
G
 
N
I
 
I
R
 
R
V
 
C
N
 
N
A
 
A
T
 
V