SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_104485039.1 NCBI__GCF_002936955.1:WP_104485039.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P23533 Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase; Phosphotransferase system, enzyme I; EC 2.7.3.9 from Staphylococcus carnosus (strain TM300) (see paper)
39% identity, 58% coverage: 399:946/949 of query aligns to 5:565/573 of P23533

query
sites
P23533
V
 
I
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
D
G
 
G
I
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
A
P
 
K
V
 
A
F
 
Y
-
 
L
-
 
L
V
 
V
D
 
E
A
 
P
P
 
D
L
 
L
R
 
S
F
 
F
D
 
D
Y
 
-
P
 
N
Q
 
E
Q
 
S
A
 
V
G
 
T
D
 
D
T
 
T
Q
 
D
A
 
A
E
 
E
Q
 
V
Q
 
A
K
 
K
L
 
F
S
 
N
A
 
G
A
 
A
I
 
L
E
 
N
Q
 
K
A
 
S
S
 
K
A
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
K
T
 
I
L
 
R
R
 
N
R
 
N
L
 
A
S
 
E
D
 
K
T
 
Q
Q
 
L
A
 
G
R
 
A
D
 
D
-
 
K
-
 
A
-
 
A
M
 
I
M
 
F
S
 
D
M
 
A
H
 
H
R
 
L
E
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
P
S
 
E
L
 
L
T
 
I
Q
 
Q
G
 
P
V
 
I
S
 
E
C
 
D
R
 
K
I
 
I
K
 
K
Q
 
N
G
 
E
Q
 
S
S
 
V
A
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
W
 
A
W
 
L
S
 
T
E
 
D
I
 
V
D
 
S
S
 
N
A
 
Q
A
 
F
D
 
I
R
 
T
Q
 
I
A
 
F
A
 
E
S
 
S
S
 
M
D
 
D
-
 
N
A
 
E
L
 
Y
L
 
M
A
 
A
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
V
G
 
S
R
 
K
R
 
R
V
 
V
M
 
L
A
 
A
I
 
H
L
 
I
C
 
L
H
 
G
S
 
V
R
 
E
M
 
L
T
 
P
P
 
N
P
 
P
P
 
S
-
 
I
-
 
V
E
 
D
H
 
E
P
 
S
Y
 
V
L
 
V
W
 
I
L
 
I
A
 
G
Q
 
N
D
 
D
I
 
L
G
 
T
P
 
P
S
 
S
Q
 
D
L
 
T
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
D
 
N
P
 
K
S
 
E
R
 
Y
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
L
 
F
V
 
V
T
 
T
V
 
N
G
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
R
S
 
T
S
 
S
H
 
H
S
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
M
A
 
S
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
G
A
 
T
G
 
K
G
 
S
A
 
I
V
 
T
M
 
E
A
 
E
L
 
V
P
 
E
S
 
A
G
 
G
T
 
D
E
 
T
A
 
I
I
 
V
L
 
V
N
 
D
G
 
G
D
 
M
D
 
T
G
 
G
T
 
D
L
 
V
W
 
L
V
 
I
A
 
N
P
 
P
E
 
S
A
 
D
A
 
E
M
 
V
L
 
I
E
 
-
Q
 
-
A
 
A
R
 
E
V
 
Y
R
 
Q
Q
 
E
Q
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
N
E
 
F
-
 
F
Q
 
K
A
 
D
E
 
K
Q
 
Q
D
 
E
W
 
L
M
 
Q
R
 
K
R
 
L
H
 
R
D
 
D
A
 
A
-
 
E
A
 
S
I
 
V
T
 
T
L
 
A
D
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
H
I
 
V
G
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
I
A
 
G
D
 
T
T
 
P
G
 
N
Q
 
D
A
 
L
R
 
P
E
 
G
V
 
V
M
 
I
E
 
E
V
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
|
R
T
 
T
E
 
E
F
 
F
V
 
L
F
 
Y
M
 
M
A
 
G
R
 
R
H
 
D
S
 
Q
E
 
M
P
 
P
D
 
T
L
 
E
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
A
 
E
F
 
A
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
A
A
 
V
F
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
M
D
 
K
G
 
G
R
 
K
P
 
R
L
 
V
V
 
V
A
 
V
R
|
R
T
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
W
 
L
P
 
D
V
 
L
P
 
P
K
 
E
E
 
E
D
 
M
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
Y
R
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
L
C
 
C
M
 
L
Q
 
D
K
 
Q
P
 
P
E
 
E
L
 
I
L
 
F
K
 
R
T
 
P
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
R
A
 
A
A
 
S
G
 
V
D
 
F
R
 
G
P
 
K
L
 
L
R
 
N
I
 
I
M
 
M
F
 
F
P
 
P
M
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
T
W
 
I
S
 
Q
E
 
E
W
 
F
R
 
R
W
 
D
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
F
 
L
D
 
E
K
 
E
I
 
E
Q
 
R
S
 
A
E
 
N
V
 
L
Q
 
K
-
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
E
-
 
V
A
 
A
T
 
D
D
 
D
V
 
I
Q
 
E
V
 
L
G
 
G
I
 
I
M
 
M
V
 
V
E
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
T
A
 
A
L
 
A
N
 
L
A
 
A
A
 
D
V
 
I
F
 
F
A
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
F
F
 
F
S
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
T
N
|
N
D
|
D
L
 
L
T
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
L
 
M
A
 
A
M
 
A
D
 
D
R
|
R
G
 
M
N
 
S
G
 
E
G
 
R
L
 
V
A
 
S
R
 
Y
L
 
L
S
 
Y
D
 
Q
G
 
P
L
 
Y
N
 
N
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
V
V
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
S
H
 
H
A
 
A
K
 
E
G
 
G
K
 
K
W
 
W
V
 
T
G
 
G
V
 
M
C
 
C
G
 
G
E
 
E
L
 
M
A
 
A
S
 
G
D
 
D
P
 
Q
V
 
T
A
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
F
S
 
S
V
 
M
S
 
S
L
 
A
K
 
T
R
 
S
V
 
I
T
 
L
L
 
K
V
 
A
K
 
R
A
 
R
Q
 
L
V
 
I
R
 
R
E
 
S
W
 
L
S
 
N
L
 
E
S
 
S
S
 
E
C
 
M
R
 
K
K
 
E
L
 
L
A
 
S
E
 
E
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
Q
 
Q
A
 
C
V
 
A
D
 
T
A
 
S
P
 
E
A
 
E
V
 
V
R
 
V
Q
 
D
L
 
L

2wqdA Crystal structure of enzyme i of the phosphoenolpyruvate:sugar phosphotransferase system in the dephosphorylated state (see paper)
38% identity, 58% coverage: 398:949/949 of query aligns to 3:568/570 of 2wqdA

query
sites
2wqdA
L
 
L
V
 
I
R
 
K
G
 
G
V
 
I
A
 
A
A
 
A
S
 
S
P
x
D
G
 
G
I
 
V
A
 
A
I
 
I
G
 
A
P
 
K
V
 
A
F
 
Y
-
 
L
-
 
L
V
 
V
D
 
E
A
 
P
P
 
D
L
 
L
R
 
T
F
 
F
D
 
D
Y
 
K
P
 
N
Q
 
E
Q
 
K
A
 
V
G
 
T
D
 
D
T
 
V
Q
 
E
A
 
G
E
 
E
Q
 
V
Q
 
A
K
 
K
L
 
F
S
 
N
A
 
S
A
 
A
I
 
I
E
 
E
Q
 
A
A
 
S
S
 
K
A
 
V
E
 
E
L
 
L
S
 
T
A
 
K
T
 
-
L
 
I
R
 
R
R
 
N
L
 
N
S
 
A
D
 
E
T
 
V
Q
 
Q
-
 
L
-
 
G
-
 
A
-
 
D
A
 
K
R
 
A
D
 
A
M
 
I
M
 
F
S
 
D
M
 
A
H
 
H
R
 
L
E
 
L
L
 
V
L
 
L
A
 
D
D
 
D
S
 
P
S
 
E
L
 
L
T
 
I
Q
 
Q
G
 
P
V
 
I
S
 
Q
C
 
D
R
 
K
I
 
I
K
 
K
Q
 
N
G
 
E
Q
 
N
S
 
A
A
 
N
A
 
A
A
 
A
A
 
T
W
 
A
W
x
L
S
 
T
E
 
D
I
 
V
D
 
T
S
 
T
A
 
Q
A
 
F
D
 
V
R
 
T
Q
 
I
A
 
F
A
 
E
S
 
S
S
 
M
D
 
D
-
 
N
A
 
E
L
 
Y
L
 
M
A
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
I
R
 
R
D
 
D
I
 
V
G
 
S
R
 
K
R
 
R
V
 
V
M
 
L
A
 
S
I
 
H
L
 
I
C
 
L
H
 
G
S
 
V
R
 
E
M
 
L
T
 
P
P
 
N
P
 
P
P
 
S
-
 
M
-
 
I
E
 
D
H
 
E
P
 
S
Y
 
V
L
 
V
W
 
I
L
 
V
A
 
G
Q
 
N
D
 
D
I
 
L
G
 
T
P
 
P
S
 
S
Q
 
D
L
 
T
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
D
 
N
P
 
K
S
 
E
R
 
F
V
 
V
L
 
Q
G
 
G
L
 
F
V
 
A
T
 
T
V
 
N
G
 
I
G
 
G
G
 
G
A
 
R
S
 
T
S
 
S
H
x
A
S
 
S
A
 
A
I
 
I
L
 
M
A
 
S
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
E
I
 
I
P
 
P
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
G
A
 
T
G
 
K
G
 
S
A
 
I
V
 
T
M
 
Q
A
 
E
L
 
V
P
 
K
S
 
Q
G
 
G
T
 
D
E
 
M
A
 
I
I
 
I
L
 
V
N
 
D
G
 
G
D
 
L
D
 
N
G
 
G
T
 
D
L
 
V
W
 
I
V
 
V
A
 
N
P
 
P
E
 
T
A
 
E
A
 
D
M
 
-
L
 
-
E
 
E
Q
 
L
A
 
I
R
 
A
V
 
Y
R
 
Q
Q
 
D
Q
 
K
R
 
R
E
 
E
R
 
R
E
 
Y
Q
 
F
A
 
A
E
 
D
Q
 
K
D
 
K
W
 
E
M
 
L
R
 
Q
R
 
K
-
 
L
H
 
R
D
 
D
A
 
A
-
 
D
A
 
T
I
 
V
T
 
T
L
 
V
D
 
D
G
 
G
H
 
V
R
 
H
I
 
A
G
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
I
A
 
G
D
 
T
T
 
P
G
 
N
Q
 
D
A
 
L
R
 
P
E
 
G
V
 
V
M
 
I
E
 
E
V
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
R
T
 
T
E
 
E
F
 
F
V
 
L
F
 
Y
M
 
M
A
 
G
R
 
R
H
 
D
S
 
Q
E
 
M
P
 
P
D
 
T
L
 
E
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
A
 
E
F
 
A
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
E
A
 
V
F
 
L
D
 
E
A
 
A
L
 
M
D
 
G
G
 
G
R
 
K
P
 
R
L
 
V
V
 
V
A
 
V
R
 
R
T
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
L
 
L
P
 
S
Y
 
Y
W
 
L
P
 
N
V
 
L
P
 
P
K
 
E
E
 
E
D
 
M
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
Y
R
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
L
C
 
S
M
 
L
Q
 
A
K
 
Q
P
 
Q
E
 
D
L
 
I
L
 
F
K
 
R
T
 
P
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
L
M
 
R
A
 
A
A
 
S
G
 
V
D
 
Y
R
 
G
P
 
K
L
 
L
R
 
N
I
 
I
M
 
M
F
 
F
P
 
P
M
 
M
V
 
V
A
 
A
D
 
T
W
 
I
S
 
N
E
 
E
W
 
F
R
 
R
W
 
E
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
I
F
 
L
D
 
L
K
 
E
I
 
E
Q
 
K
S
 
E
E
 
N
V
 
L
Q
 
K
-
 
N
-
 
E
-
 
G
-
 
H
-
 
D
-
 
I
A
 
S
T
 
D
D
 
D
V
 
I
Q
 
E
V
 
L
G
 
G
I
 
I
M
 
M
V
 
V
E
|
E
V
 
I
P
 
P
S
 
A
V
 
T
A
 
A
L
 
A
N
 
L
A
 
A
A
 
D
V
 
V
F
 
F
A
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
F
F
 
F
S
|
S
I
 
I
G
 
G
T
 
T
N
 
N
D
|
D
L
 
L
T
 
I
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
A
D
 
D
R
 
R
G
 
M
N
 
S
G
 
E
G
 
R
L
 
V
A
 
S
R
x
Y
L
 
L
S
 
Y
D
x
Q
G
 
P
L
 
Y
N
 
N
P
 
P
A
 
S
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
V
K
 
K
M
 
Q
V
 
V
V
 
I
D
 
E
A
 
A
A
 
S
H
 
H
A
 
K
K
 
E
G
 
G
K
 
K
W
 
W
V
 
T
G
 
G
V
 
M
C
|
C
G
 
G
E
 
E
L
 
M
A
 
A
S
 
G
D
 
D
P
 
E
V
 
T
A
 
A
L
 
I
P
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
D
E
|
E
L
 
F
S
 
S
V
 
M
S
 
S
L
 
A
K
 
T
R
 
S
V
 
I
T
 
L
L
 
K
V
 
A
K
 
R
A
 
R
Q
 
Q
V
 
I
R
 
N
E
 
G
W
 
L
S
 
S
L
 
K
S
 
N
S
 
E
C
 
M
R
 
T
K
 
E
L
 
L
A
 
A
E
 
N
Q
 
R
A
 
A
L
 
V
Q
 
D
A
 
C
V
 
A
D
 
T
A
 
Q
P
 
E
A
 
E
V
 
V
R
 
I
Q
 
E
L
 
L
Y
 
V
N
 
N
N
 
N

P08839 Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase; Phosphotransferase system, enzyme I; EC 2.7.3.9 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
39% identity, 57% coverage: 398:935/949 of query aligns to 1:553/575 of P08839

query
sites
P08839
L
 
M
V
 
I
R
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
L
A
 
A
S
 
S
P
 
P
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
A
F
 
L
V
 
L
-
 
L
-
 
K
D
 
E
A
 
D
P
 
E
L
 
I
R
 
V
F
 
I
D
 
D
Y
 
R
P
 
K
Q
 
K
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
D
 
D
-
 
Q
T
 
V
Q
 
D
A
 
Q
E
 
E
Q
 
V
Q
 
E
K
 
R
L
 
F
S
 
L
A
 
S
A
 
G
I
 
R
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
E
A
 
T
T
 
I
L
 
K
R
 
T
R
 
K
L
 
A
S
 
G
D
 
E
T
 
T
-
 
F
-
 
G
-
 
E
Q
 
E
A
 
K
R
 
E
D
 
A
M
 
I
M
 
F
S
 
E
M
 
G
H
 
H
R
 
I
E
 
M
L
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
E
S
 
E
L
 
L
T
 
E
Q
 
Q
G
 
E
V
 
I
S
 
I
C
 
A
R
 
L
I
 
I
K
 
K
-
 
D
Q
 
K
G
 
H
Q
 
M
S
 
T
A
 
A
A
 
D
A
 
A
A
 
A
W
 
A
W
 
H
S
 
E
E
 
V
I
 
I
D
 
E
S
 
G
A
 
Q
A
 
A
D
 
S
R
 
A
Q
 
L
A
 
E
A
 
E
S
 
L
S
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
Y
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
D
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
R
V
 
L
M
 
L
A
 
R
I
 
N
L
 
I
C
 
L
H
 
G
S
 
L
R
 
K
M
 
I
T
 
I
-
 
D
-
 
L
P
 
S
P
 
A
P
 
I
E
 
Q
H
 
D
P
 
E
Y
 
V
L
 
I
W
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
A
D
 
D
I
 
L
G
 
T
P
 
P
S
 
S
Q
 
E
L
 
T
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
D
 
N
P
 
L
S
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
F
V
 
I
T
 
T
V
 
D
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
R
S
 
T
S
 
S
H
|
H
S
 
T
A
 
S
I
 
I
L
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
E
I
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
V
V
 
T
M
 
S
A
 
Q
L
 
V
P
 
K
S
 
N
G
 
D
T
 
D
E
 
Y
A
 
L
I
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
A
D
 
V
D
 
N
G
 
N
T
 
Q
L
 
V
W
 
Y
V
 
V
A
 
N
P
 
P
E
 
T
A
 
N
A
 
E
M
 
V
L
 
I
E
 
D
Q
 
K
A
 
M
R
 
R
-
 
A
V
 
V
R
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
R
 
V
E
 
A
R
 
S
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
L
D
 
A
W
 
K
M
 
L
R
 
K
R
 
D
H
 
L
D
 
-
A
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
Q
I
 
V
G
 
E
V
 
V
A
 
C
A
 
A
N
 
N
L
 
I
A
 
G
D
 
T
T
 
V
G
 
R
Q
 
D
A
 
V
R
 
E
E
 
G
V
 
A
M
 
E
E
 
R
V
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
R
T
 
T
E
 
E
F
 
F
V
 
L
F
 
F
M
 
M
A
 
D
R
 
R
H
 
D
S
 
A
E
 
L
P
 
P
D
 
T
L
 
E
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
F
 
A
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
A
A
 
V
F
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
C
D
 
G
G
 
S
R
 
Q
P
 
A
L
 
V
V
 
I
A
 
V
R
|
R
T
 
T
L
 
M
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
W
 
M
P
 
N
V
 
F
P
 
P
K
 
K
E
 
E
D
 
E
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
W
R
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
I
C
 
A
M
 
M
Q
 
D
K
 
R
P
 
R
E
 
E
L
 
I
L
 
L
K
 
R
T
 
D
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
L
M
 
R
A
 
A
A
 
S
G
 
A
D
 
F
R
 
G
P
 
K
L
 
L
R
 
R
I
 
I
M
 
M
F
 
F
P
 
P
M
 
M
V
 
I
A
 
I
D
 
S
W
 
V
S
 
E
E
 
E
W
 
V
R
 
R
W
 
A
A
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
E
F
 
I
D
 
E
-
 
I
-
 
Y
-
 
K
-
 
Q
K
 
E
I
 
L
Q
 
R
S
 
D
E
 
E
V
 
G
Q
 
K
A
 
A
T
 
F
D
 
D
-
 
E
-
 
S
V
 
I
Q
 
E
V
 
I
G
 
G
I
 
V
M
 
M
V
 
V
E
|
E
V
 
T
P
 
P
S
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
T
N
 
I
A
 
A
A
 
R
V
 
H
F
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
F
F
 
F
S
 
S
I
 
I
G
 
G
T
 
T
N
|
N
D
|
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
V
D
 
D
R
 
R
G
 
G
N
 
N
G
 
D
G
 
M
L
 
I
A
 
S
R
 
H
L
 
L
S
 
Y
D
 
Q
G
 
P
L
 
M
N
 
S
P
 
P
A
 
S
V
 
V
L
 
L
R
 
N
L
 
L
I
 
I
K
 
K
M
 
Q
V
 
V
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
S
H
 
H
A
 
A
K
 
E
G
 
G
K
 
K
W
 
W
V
 
T
G
 
G
V
 
M
C
|
C
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
D
P
 
E
V
 
R
A
 
A
L
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
G
V
 
L
D
 
D
E
 
E
L
 
F
S
 
S
V
 
M
S
 
S
L
 
A
K
 
I
R
 
S
V
 
I
T
 
P
L
 
R
V
 
I
K
 
K
A
 
K
Q
 
I
V
 
I
R
 
R
E
 
N
W
 
T
S
 
N
L
 
F
S
 
E
S
 
D
C
 
A
R
 
K
K
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L

2hwgA Structure of phosphorylated enzyme i of the phosphoenolpyruvate:sugar phosphotransferase system (see paper)
39% identity, 57% coverage: 399:935/949 of query aligns to 1:552/572 of 2hwgA

query
sites
2hwgA
V
 
I
R
 
S
G
 
G
V
 
I
A
 
L
A
 
A
S
 
S
P
|
P
G
 
G
I
 
I
A
 
A
I
 
F
G
 
G
P
 
K
V
 
A
F
 
L
V
 
L
-
 
L
-
 
K
D
 
E
A
 
D
P
 
E
L
 
I
R
 
V
F
 
I
D
 
D
Y
 
R
P
 
K
Q
 
K
Q
 
I
A
 
S
G
 
A
D
 
D
-
 
Q
T
 
V
Q
 
D
A
 
Q
E
 
E
Q
 
V
Q
 
E
K
 
R
L
 
F
S
 
L
A
 
S
A
 
G
I
 
R
E
 
A
Q
 
K
A
 
A
S
 
S
A
 
A
E
 
Q
L
 
L
S
 
E
A
 
T
T
 
I
L
 
K
R
 
T
R
 
K
L
 
A
S
 
G
D
 
E
T
 
T
-
 
F
-
 
G
-
 
E
Q
 
E
A
 
K
R
 
E
D
 
A
M
 
I
M
 
F
S
 
E
M
 
G
H
 
H
R
 
I
E
 
M
L
 
L
L
 
L
A
 
E
D
 
D
S
 
E
S
 
E
L
 
L
T
 
E
Q
 
Q
G
 
E
V
 
I
S
 
I
C
 
A
R
 
L
I
 
I
K
 
K
-
 
D
Q
 
K
G
 
H
Q
 
M
S
 
T
A
 
A
A
 
D
A
 
A
A
 
A
W
x
A
W
 
H
S
 
E
E
 
V
I
 
I
D
 
E
S
 
G
A
 
Q
A
 
A
D
 
S
R
 
A
Q
 
L
A
 
E
A
 
E
S
 
L
S
 
D
D
 
D
A
 
E
L
 
Y
L
 
L
A
 
K
E
 
E
R
 
R
A
 
A
A
 
A
D
 
D
I
 
V
R
 
R
D
 
D
I
 
I
G
 
G
R
 
K
R
 
R
V
 
L
M
 
L
A
 
R
I
 
N
L
 
I
C
 
L
H
 
G
S
 
L
R
 
K
M
 
I
T
 
I
-
 
D
-
 
L
P
 
S
P
 
A
P
 
I
E
 
Q
H
 
D
P
 
E
Y
 
V
L
 
I
W
 
L
L
 
V
A
 
A
Q
 
A
D
 
D
I
 
L
G
 
T
P
 
P
S
 
S
Q
 
E
L
 
T
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
D
 
N
P
 
L
S
 
K
R
 
K
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
F
V
 
I
T
 
T
V
 
D
G
 
A
G
 
G
G
 
G
A
 
R
S
 
T
S
 
S
H
|
H
S
 
T
A
 
S
I
 
I
L
 
M
A
 
A
R
 
R
S
 
S
L
 
L
G
 
E
I
 
L
P
 
P
A
 
A
L
 
I
V
 
V
A
 
G
A
 
T
G
 
G
G
 
S
A
 
V
V
 
T
M
 
S
A
 
Q
L
 
V
P
 
K
S
 
N
G
 
D
T
 
D
E
 
Y
A
 
L
I
 
I
L
 
L
N
 
D
G
 
A
D
 
V
D
 
N
G
 
N
T
 
Q
L
 
V
W
 
Y
V
 
V
A
 
N
P
 
P
E
 
T
A
 
N
A
 
E
M
 
V
L
 
I
E
 
D
Q
 
K
A
 
M
R
 
R
-
 
A
V
 
V
R
 
Q
Q
 
E
Q
 
Q
R
 
V
E
 
A
R
 
S
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
E
 
E
Q
 
L
D
 
A
W
 
K
M
 
L
R
 
K
R
 
D
H
 
L
D
 
-
A
 
P
A
 
A
I
 
I
T
 
T
L
 
L
D
 
D
G
 
G
H
 
H
R
 
Q
I
 
V
G
 
E
V
 
V
A
 
C
A
 
A
N
 
N
L
 
I
A
 
G
D
 
T
T
 
V
G
 
R
Q
 
D
A
 
V
R
 
E
E
 
G
V
 
A
M
 
E
E
 
R
V
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
Y
R
 
R
T
 
T
E
 
E
F
 
F
V
 
L
F
 
F
M
 
M
A
 
D
R
 
R
H
 
D
S
 
A
E
 
L
P
 
P
D
 
T
L
 
E
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
A
 
A
F
 
A
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
A
A
 
V
F
 
A
D
 
E
A
 
A
L
 
C
D
 
G
G
 
S
R
 
Q
P
 
A
L
 
V
V
 
I
A
 
V
R
|
R
T
 
T
L
 
M
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
W
 
M
P
 
N
V
 
F
P
 
P
K
 
K
E
 
E
D
 
E
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
W
R
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
I
C
 
A
M
 
M
Q
 
D
K
 
R
P
 
R
E
 
E
L
 
I
L
 
L
K
 
R
T
 
D
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
L
M
 
R
A
 
A
A
 
S
G
 
A
D
 
F
R
 
G
P
 
K
L
 
L
R
 
R
I
 
I
M
 
M
F
 
F
P
 
P
M
 
M
V
 
I
A
 
I
D
 
S
W
 
V
S
 
E
E
 
E
W
 
V
R
 
R
W
 
A
A
 
L
K
 
R
A
 
K
L
 
E
F
 
I
D
 
E
-
 
I
-
 
Y
-
 
K
-
 
Q
K
 
E
I
 
L
Q
 
R
S
 
D
E
 
E
V
 
G
Q
 
K
A
 
A
T
 
F
D
 
D
-
 
E
-
 
S
V
 
I
Q
 
E
V
 
I
G
 
G
I
 
V
M
|
M
V
 
V
E
|
E
V
 
T
P
 
P
S
 
A
V
 
A
A
 
A
L
 
T
N
 
I
A
 
A
A
 
R
V
 
H
F
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
F
F
 
F
S
|
S
I
 
I
G
|
G
T
 
T
N
|
N
D
|
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
V
D
 
D
R
 
R
G
 
G
N
 
N
G
 
D
G
 
M
L
 
I
A
 
S
R
 
H
L
 
L
S
 
Y
D
 
Q
G
 
P
L
 
M
N
 
S
P
 
P
A
 
S
V
 
V
L
 
L
R
 
N
L
 
L
I
 
I
K
 
K
M
 
Q
V
 
V
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
S
H
 
H
A
 
A
K
 
E
G
 
G
K
 
K
W
 
W
V
 
T
G
 
G
V
 
M
C
|
C
G
 
G
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
G
D
 
D
P
 
E
V
 
R
A
 
A
L
 
T
P
 
L
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
M
G
 
G
V
 
L
D
 
D
E
|
E
L
 
F
S
 
S
V
 
M
S
 
S
L
 
A
K
 
I
R
 
S
V
 
I
T
 
P
L
 
R
V
 
I
K
 
K
A
 
K
Q
 
I
V
 
I
R
 
R
E
 
N
W
 
T
S
 
N
L
 
F
S
 
E
S
 
D
C
 
A
R
 
K
K
 
V
L
 
L
A
 
A
E
 
E
Q
 
Q
A
 
A
L
 
L

2xz7A Crystal structure of the phosphoenolpyruvate-binding domain of enzyme i in complex with phosphoenolpyruvate from the thermoanaerobacter tengcongensis pep-sugar phosphotransferase system (pts) (see paper)
45% identity, 32% coverage: 651:949/949 of query aligns to 15:319/324 of 2xz7A

query
sites
2xz7A
T
 
T
L
 
P
D
 
D
G
 
G
H
 
K
R
 
K
I
 
V
G
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
I
A
 
G
D
 
T
T
 
P
G
 
K
Q
 
D
A
 
V
R
 
A
E
 
S
V
 
A
M
 
L
E
 
A
V
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
F
R
|
R
T
 
T
E
 
E
F
 
F
V
 
L
F
 
Y
M
 
M
A
 
D
R
 
R
H
 
N
S
 
S
E
 
L
P
 
P
D
 
S
L
 
E
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
A
 
E
F
 
A
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
E
A
 
V
F
 
V
D
 
E
A
 
K
L
 
M
D
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
V
V
 
T
A
 
I
R
|
R
T
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
W
 
L
P
 
D
V
 
M
P
 
P
K
 
K
E
 
E
D
 
M
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
Y
R
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
L
C
 
C
M
 
L
Q
 
D
K
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
I
L
 
F
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
L
M
 
R
A
 
A
A
 
S
G
 
A
D
 
Y
R
 
G
P
 
N
L
 
V
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
F
 
Y
P
 
P
M
 
M
V
 
I
A
 
S
D
 
S
W
 
V
S
 
E
E
 
E
W
 
V
R
 
R
W
 
K
A
 
A
K
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
L
D
 
E
K
 
E
I
 
V
Q
 
K
S
 
A
E
 
E
V
 
L
Q
 
D
A
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
T
 
K
D
 
E
V
 
I
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
I
M
 
M
V
 
V
E
|
E
V
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
A
A
 
A
L
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
I
F
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
F
F
 
F
S
|
S
I
 
I
G
|
G
T
 
T
N
|
N
D
|
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
V
D
 
D
R
|
R
G
 
M
N
 
N
G
 
E
G
 
H
L
 
V
A
 
K
R
 
E
L
 
Y
S
 
Y
D
 
Q
G
 
P
L
 
F
N
 
H
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
V
K
 
K
M
 
M
V
 
V
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
K
K
 
E
G
 
G
K
 
K
W
 
F
V
 
A
G
 
A
V
 
M
C
|
C
G
 
G
E
 
E
L
 
M
A
 
A
S
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
L
A
 
A
L
 
A
P
 
V
L
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
D
E
|
E
L
 
F
S
 
S
V
 
M
S
 
S
L
 
A
K
 
T
R
 
S
V
 
I
T
 
P
L
 
E
V
 
I
K
 
K
A
 
N
Q
 
I
V
 
I
R
 
R
E
 
N
W
 
V
S
 
E
L
 
Y
S
 
E
S
 
K
C
 
A
R
 
K
K
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
A
 
M
V
 
S
D
 
E
A
 
A
P
 
R
A
 
E
V
 
I
R
 
E
Q
 
K
L
 
M
Y
 
M
N
 
K
N
 
D

2xz9A Crystal structure from the phosphoenolpyruvate-binding domain of enzyme i in complex with pyruvate from the thermoanaerobacter tengcongensis pep-sugar phosphotransferase system (pts) (see paper)
45% identity, 32% coverage: 651:949/949 of query aligns to 8:312/317 of 2xz9A

query
sites
2xz9A
T
 
T
L
 
P
D
 
D
G
 
G
H
 
K
R
 
K
I
 
V
G
 
M
V
 
L
A
 
A
A
 
A
N
 
N
L
 
I
A
 
G
D
 
T
T
 
P
G
 
K
Q
 
D
A
 
V
R
 
A
E
 
S
V
 
A
M
 
L
E
 
A
V
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
F
R
 
R
T
 
T
E
 
E
F
 
F
V
 
L
F
 
Y
M
 
M
A
 
D
R
 
R
H
 
N
S
 
S
E
 
L
P
 
P
D
 
S
L
 
E
D
 
E
E
 
E
Q
 
Q
L
 
F
A
 
E
F
 
A
Y
 
Y
R
 
K
Q
 
E
A
 
V
F
 
V
D
 
E
A
 
K
L
 
M
D
 
G
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
V
V
 
T
A
 
I
R
 
R
T
 
T
L
 
L
D
 
D
V
 
I
G
 
G
G
 
G
D
 
D
K
 
K
P
 
E
L
 
L
P
 
P
Y
 
Y
W
 
L
P
 
D
V
 
M
P
 
P
K
 
K
E
 
E
D
 
M
N
 
N
P
 
P
F
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
Y
R
 
R
G
 
A
I
 
I
R
 
R
L
 
L
C
 
C
M
 
L
Q
 
D
K
 
R
P
 
P
E
 
D
L
 
I
L
 
F
K
 
K
T
 
T
Q
 
Q
L
 
L
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
L
M
 
R
A
 
A
A
 
S
G
 
A
D
 
Y
R
 
G
P
 
N
L
 
V
R
 
Q
I
 
I
M
 
M
F
 
Y
P
 
P
M
 
M
V
 
I
A
 
S
D
 
S
W
 
V
S
 
E
E
 
E
W
 
V
R
 
R
W
 
K
A
 
A
K
 
N
A
 
S
L
 
I
F
 
L
D
 
E
K
 
E
I
 
V
Q
 
K
S
 
A
E
 
E
V
 
L
Q
 
D
A
 
R
-
 
E
-
 
G
-
 
V
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
T
 
K
D
 
E
V
 
I
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
I
M
|
M
V
 
V
E
|
E
V
 
I
P
 
P
S
 
S
V
 
A
A
 
A
L
 
V
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
I
F
 
L
A
 
A
E
 
K
E
 
E
V
 
V
D
 
D
F
 
F
F
 
F
S
|
S
I
 
I
G
|
G
T
 
T
N
|
N
D
|
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
Y
 
Y
T
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
V
D
 
D
R
 
R
G
 
M
N
 
N
G
 
E
G
 
H
L
 
V
A
 
K
R
 
E
L
 
Y
S
 
Y
D
 
Q
G
 
P
L
 
F
N
 
H
P
 
P
A
 
A
V
 
I
L
 
L
R
 
R
L
 
L
I
 
V
K
 
K
M
 
M
V
 
V
V
 
I
D
 
D
A
 
A
A
 
A
H
 
H
A
 
K
K
 
E
G
 
G
K
 
K
W
 
F
V
 
A
G
 
A
V
 
M
C
|
C
G
 
G
E
 
E
L
 
M
A
 
A
S
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
L
A
 
A
L
 
A
P
 
V
L
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
G
L
 
L
G
 
G
V
 
L
D
 
D
E
|
E
L
 
F
S
 
S
V
 
M
S
 
S
L
 
A
K
 
T
R
 
S
V
 
I
T
 
P
L
 
E
V
 
I
K
 
K
A
 
N
Q
 
I
V
 
I
R
 
R
E
 
N
W
 
V
S
 
E
L
 
Y
S
 
E
S
 
K
C
 
A
R
 
K
K
 
E
L
 
I
A
 
A
E
 
E
Q
 
K
A
 
A
L
 
L
Q
 
N
A
 
M
V
 
S
D
 
E
A
 
A
P
 
R
A
 
E
V
 
I
R
 
E
Q
 
K
L
 
M
Y
 
M
N
 
K
N
 
D

P22983 Pyruvate, phosphate dikinase; Pyruvate, orthophosphate dikinase; EC 2.7.9.1 from Clostridium symbiosum (Bacteroides symbiosus) (see 4 papers)
27% identity, 37% coverage: 566:914/949 of query aligns to 444:861/874 of P22983

query
sites
P22983
G
 
G
L
 
I
V
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
M
S
 
T
S
 
S
H
|
H
S
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
G
L
 
M
G
 
G
I
 
T
P
 
C
A
 
C
L
 
V
V
 
S
A
 
G
A
 
C
G
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
I
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
H
-
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
E
G
 
G
A
 
D
V
 
Y
M
 
I
A
 
S
L
 
L
P
 
D
S
 
G
G
 
S
T
 
T
E
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
Y
N
 
K
G
 
G
D
 
D
D
 
I
G
 
E
T
 
T
L
 
-
W
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
Q
Q
 
E
A
 
A
R
 
S
V
 
V
R
 
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
I
Q
 
M
A
 
V
E
 
W
Q
 
A
D
 
D
W
 
K
M
 
F
R
 
R
R
 
-
H
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
T
I
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
R
A
 
T
N
 
N
L
 
A
A
 
D
D
 
T
T
 
P
G
 
E
Q
 
D
A
 
T
R
 
L
E
 
N
V
 
A
M
 
V
E
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
C
R
|
R
T
 
T
E
 
E
F
 
H
V
 
M
F
 
F
M
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
M
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
S
A
 
V
R
 
E
H
 
A
S
 
R
E
 
E
P
 
E
D
 
A
L
 
L
D
 
N
E
 
E
Q
 
L
L
 
I
A
 
P
F
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
D
Y
 
F
R
 
K
Q
 
A
A
 
M
F
 
Y
D
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
M
V
 
T
A
 
V
R
|
R
T
 
Y
L
 
L
D
 
D
V
 
P
G
 
P
G
 
L
D
 
H
K
 
E
P
 
F
L
 
V
P
 
P
Y
 
H
W
 
T
P
 
E
V
 
E
P
 
E
K
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
M
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
H
E
 
E
D
 
F
N
 
N
P
 
P
F
 
M
L
 
M
G
 
G
V
 
H
R
 
R
G
 
G
I
 
C
R
 
R
L
 
L
C
 
A
M
 
V
Q
 
T
K
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
I
L
 
A
K
 
K
T
 
M
Q
 
Q
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
M
M
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
G
G
 
I
D
 
D
R
 
I
P
 
V
L
 
P
R
 
E
I
 
I
M
 
M
F
 
I
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
E
W
 
K
S
 
K
E
 
E
W
 
L
R
 
K
W
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
D
L
 
V
F
 
V
D
 
V
K
 
E
I
 
V
Q
 
A
S
 
E
E
 
Q
V
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
E
Q
 
K
A
 
G
T
 
S
D
 
D
V
 
M
Q
 
Q
-
 
Y
-
 
H
V
 
I
G
 
G
I
 
T
M
 
M
V
 
I
E
|
E
V
 
I
P
 
P
S
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
A
D
 
E
F
 
F
F
 
F
S
 
S
I
 
F
G
|
G
T
|
T
N
|
N
D
|
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
Y
 
M
T
 
T
L
 
F
A
 
G
M
 
F
D
 
S
R
 
R
G
 
D
N
 
D
G
 
A
G
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
Y
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
S
-
 
D
-
 
P
L
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
D
D
 
-
G
 
-
L
 
-
N
 
Q
P
 
T
A
 
G
V
 
V
L
 
G
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
K
 
E
M
 
M
V
 
A
V
 
V
D
 
K
A
 
K
A
 
G
H
 
R
A
 
Q
K
 
T
-
 
R
-
 
P
G
 
G
K
 
L
W
 
K
V
 
C
G
 
G
V
 
I
C
|
C
G
 
G
E
 
E
L
 
H
A
 
G
S
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
S
A
 
S
L
 
V
P
 
E
L
 
F
L
 
C
L
 
H
G
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
N
E
 
Y
L
 
V
S
 
S
V
 
C
S
 
S
L
 
P
K
 
F
R
 
R
V
 
V
T
 
P
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1kc7A Pyruvate phosphate dikinase with bound mg-phosphonopyruvate (see paper)
27% identity, 37% coverage: 566:914/949 of query aligns to 443:860/872 of 1kc7A

query
sites
1kc7A
G
 
G
L
 
I
V
 
L
T
 
T
V
 
V
G
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
M
S
 
T
S
 
S
H
|
H
S
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
G
L
 
M
G
 
G
I
 
T
P
 
C
A
 
C
L
 
V
V
 
S
A
 
G
A
 
C
G
 
G
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
I
-
 
N
-
 
E
-
 
E
-
 
A
-
 
K
-
 
T
-
 
F
-
 
E
-
 
L
-
 
G
-
 
G
-
 
H
-
 
T
-
 
F
-
 
A
-
 
E
G
 
G
A
 
D
V
 
Y
M
 
I
A
 
S
L
 
L
P
 
D
S
 
G
G
 
S
T
 
T
E
 
G
A
 
K
I
 
I
L
 
Y
N
 
K
G
 
G
D
 
D
D
 
I
G
 
E
T
 
T
L
 
-
W
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
-
E
 
-
A
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
E
 
Q
Q
 
E
A
 
A
R
 
S
V
 
V
R
 
S
Q
 
G
Q
 
S
R
 
F
E
 
E
R
 
R
E
 
I
Q
 
M
A
 
V
E
 
W
Q
 
A
D
 
D
W
 
K
M
 
F
R
 
R
R
 
-
H
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
I
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
R
 
T
I
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
R
A
 
T
N
 
N
L
 
A
A
 
D
D
 
T
T
 
P
G
 
E
Q
 
D
A
 
T
R
 
L
E
 
N
V
 
A
M
 
V
E
 
K
V
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
E
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
C
R
|
R
T
 
T
E
 
E
F
 
H
V
 
M
F
 
F
M
 
F
-
 
E
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
I
-
 
M
-
 
K
-
 
I
-
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
I
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
S
A
 
V
R
 
E
H
 
A
S
 
R
E
 
E
P
 
E
D
 
A
L
 
L
D
 
N
E
 
E
Q
 
L
L
 
I
A
 
P
F
 
F
-
 
Q
-
 
K
-
 
G
-
 
D
Y
 
F
R
 
K
Q
 
A
A
 
M
F
 
Y
D
 
K
A
 
A
L
 
L
D
 
E
G
 
G
R
 
R
P
 
P
L
 
M
V
 
T
A
 
V
R
|
R
T
 
Y
L
 
L
D
 
D
V
 
P
G
 
P
G
 
L
D
 
H
K
 
E
P
 
F
L
 
V
P
 
P
Y
 
H
W
 
T
P
 
E
V
 
E
P
 
E
K
 
Q
-
 
A
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
K
-
 
N
-
 
M
-
 
G
-
 
L
-
 
T
-
 
L
-
 
A
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
V
-
 
D
-
 
E
-
 
L
-
 
H
E
 
E
D
 
F
N
 
N
P
 
P
F
 
M
L
 
M
G
 
G
V
 
H
R
 
R
G
 
G
I
 
C
R
 
R
L
 
L
C
 
A
M
 
V
Q
 
T
K
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
I
L
 
A
K
 
K
T
 
M
Q
 
Q
L
 
T
R
 
R
A
 
A
L
 
V
L
 
M
M
 
E
A
 
A
A
 
A
-
 
I
-
 
E
-
 
V
-
 
K
-
 
E
-
 
E
-
 
T
-
 
G
G
 
I
D
 
D
R
 
I
P
 
V
L
 
P
R
 
E
I
 
I
M
 
M
F
 
I
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
E
W
 
K
S
 
K
E
 
E
W
 
L
R
 
K
W
 
F
A
 
V
K
 
K
A
 
D
L
 
V
F
 
V
D
 
V
K
 
E
I
 
V
Q
 
A
S
 
E
E
 
Q
V
 
V
-
 
K
-
 
K
-
 
E
Q
 
K
A
 
G
T
 
S
D
 
D
V
 
M
Q
 
Q
-
 
Y
-
 
H
V
 
I
G
 
G
I
 
T
M
 
M
V
 
I
E
|
E
V
 
I
P
 
P
S
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
T
A
 
A
A
 
D
V
 
A
F
 
I
A
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
A
D
 
E
F
 
F
F
 
F
S
|
S
I
 
F
G
|
G
T
|
T
N
|
N
D
|
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
Y
 
M
T
 
T
L
 
F
A
 
G
M
 
F
D
 
S
R
 
R
G
 
D
N
 
D
G
 
A
G
 
G
-
 
K
-
 
F
-
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
Y
-
 
Y
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
I
-
 
Y
-
 
E
-
 
S
-
 
D
-
 
P
L
 
F
A
 
A
R
 
R
L
 
L
S
 
D
D
 
-
G
 
-
L
 
-
N
 
Q
P
 
T
A
 
G
V
 
V
L
 
G
R
 
Q
L
 
L
I
 
V
K
 
E
M
 
M
V
 
A
V
 
V
D
 
K
A
 
K
A
 
G
H
 
R
A
 
Q
K
 
T
-
 
R
-
 
P
G
 
G
K
 
L
W
 
K
V
 
C
G
 
G
V
 
I
C
|
C
G
 
G
E
 
E
L
 
H
A
 
G
S
 
G
D
 
D
P
 
P
V
 
S
A
 
S
L
 
V
P
 
E
L
 
F
L
 
C
L
 
H
G
 
K
L
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
N
E
x
Y
L
 
V
S
 
S
V
 
C
S
 
S
L
 
P
K
 
F
R
 
R
V
 
V
T
 
P
L
 
I

Sites not aligning to the query:

5lu4A C4-type pyruvate phosphate dikinase: conformational intermediate of central domain in the swiveling mechanism (see paper)
29% identity, 37% coverage: 566:916/949 of query aligns to 445:844/850 of 5lu4A

query
sites
5lu4A
G
 
G
L
 
I
V
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
M
S
 
T
S
 
S
H
|
H
S
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
G
L
 
W
G
 
G
I
 
K
P
 
C
A
 
C
L
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
C
-
 
A
-
 
D
V
 
I
A
 
R
A
 
V
G
 
N
G
 
D
A
 
D
V
 
M
M
 
K
A
 
I
L
 
F
P
 
T
S
 
I
G
 
G
T
 
D
E
 
R
A
 
V
I
 
I
L
 
K
N
 
E
G
 
G
D
 
D
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
W
 
W
V
 
L
A
 
S
P
 
L
E
 
N
A
 
G
A
 
T
M
 
T
L
 
G
E
 
E
Q
 
V
A
 
I
R
 
L
V
 
G
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
L
R
 
L
E
 
A
R
 
P
E
 
P
Q
 
A
A
 
M
E
 
S
Q
 
N
D
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
I
W
 
F
M
 
M
R
 
S
R
 
W
H
 
A
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
I
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
A
A
 
D
D
 
T
T
 
P
G
 
N
Q
 
D
A
 
A
R
 
L
E
 
T
V
 
A
M
 
R
E
 
N
V
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
C
R
 
R
T
 
T
E
 
E
F
 
H
V
 
M
F
 
F
M
 
F
A
 
A
R
 
S
H
 
D
S
 
E
E
 
R
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
V
-
 
T
P
 
P
D
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
L
Q
 
L
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
Y
 
Q
R
 
R
Q
 
S
A
 
D
F
 
F
D
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
F
-
 
R
A
 
A
L
 
M
D
 
D
G
 
G
R
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
T
A
 
I
R
 
R
T
 
L
L
 
L
D
|
D
V
 
P
G
 
P
G
 
L
D
 
H
K
 
E
P
 
F
L
 
L
P
 
I
Y
 
Y
W
 
S
P
 
K
V
 
I
P
 
E
K
 
N
-
 
L
-
 
S
E
 
E
D
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
C
R
 
R
L
 
L
C
 
G
M
 
I
Q
 
S
K
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
T
K
 
E
T
 
M
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
F
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
V
D
 
S
R
 
M
P
 
T
L
 
N
R
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
E
I
 
I
M
 
M
F
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
T
W
 
P
S
 
Q
E
 
E
W
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
Q
K
 
I
A
 
S
L
 
V
F
 
I
D
 
R
K
 
G
I
 
V
Q
 
A
S
 
A
E
 
N
V
 
V
Q
 
F
A
 
A
T
 
E
-
 
M
-
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
L
D
 
E
V
 
Y
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
T
M
 
M
V
 
I
E
|
E
V
 
I
P
 
P
S
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
I
A
 
A
A
 
E
V
 
E
F
 
I
A
 
G
E
 
K
E
 
E
V
 
A
D
 
D
F
 
F
F
 
F
S
|
S
I
 
F
G
|
G
T
 
T
N
|
N
D
|
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
Y
 
M
T
 
T
L
 
F
A
 
G
M
 
Y
D
 
S
R
 
R
G
 
D
N
 
D
G
 
V
G
 
G
L
 
K
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
A
 
I
R
 
Y
L
 
L
S
 
A
D
 
Q
G
 
G
L
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
D
N
 
Q
P
 
K
A
 
G
V
 
V
L
 
G
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
K
M
 
M
V
 
A
V
 
T
D
 
E
A
 
K
A
 
G
H
 
R
A
 
A
K
 
A
G
 
N
K
 
P
-
 
S
-
 
L
W
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
I
C
|
C
G
 
G
E
 
E
L
 
H
A
 
G
S
 
G
D
 
E
P
 
P
V
 
S
A
 
S
L
 
V
P
 
A
L
 
F
L
 
F
L
 
D
G
 
G
L
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
E
x
Y
L
 
V
S
 
S
V
 
C
S
 
S
L
 
P
K
 
F
R
 
R
V
 
V
T
 
P
L
 
I
V
 
A
K
 
R

Sites not aligning to the query:

5jvjB C4-type pyruvate phosphate dikinase: different conformational states of the nucleotide binding domain in the dimer (see paper)
28% identity, 37% coverage: 566:916/949 of query aligns to 372:789/797 of 5jvjB

query
sites
5jvjB
G
 
G
L
 
I
V
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
M
S
 
T
S
 
S
H
|
H
S
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
G
L
 
W
G
 
G
I
 
K
P
 
C
A
 
C
L
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
C
-
 
A
-
 
D
V
 
I
A
 
R
A
 
V
G
 
N
G
 
D
A
 
D
V
 
M
M
 
K
A
 
I
L
 
F
P
 
T
S
 
I
G
 
G
T
 
D
E
 
R
A
 
V
I
 
I
L
 
K
N
 
E
G
 
G
D
 
D
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
W
 
W
V
 
L
A
 
S
P
 
L
E
 
N
A
 
G
A
 
T
M
 
T
L
 
G
E
 
E
Q
 
V
A
 
I
R
 
L
V
 
G
R
 
K
Q
 
Q
Q
 
L
R
 
L
E
 
A
R
 
P
E
 
P
Q
 
A
A
 
M
E
 
S
Q
 
N
D
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
I
W
 
F
M
 
M
R
 
S
R
 
W
H
 
A
D
 
D
A
 
Q
A
 
A
I
 
-
T
 
-
L
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
R
R
 
R
I
 
L
G
 
K
V
 
V
A
 
M
A
 
A
N
 
N
L
 
A
A
 
D
D
 
T
T
 
P
G
 
N
Q
 
D
A
 
A
R
 
L
E
 
T
V
 
A
M
 
R
E
 
N
V
 
N
G
 
G
A
 
A
E
 
Q
G
 
G
V
 
I
G
 
G
L
 
L
L
 
C
R
|
R
T
 
T
E
 
E
F
 
H
V
 
M
F
 
F
M
 
F
A
 
A
R
 
S
H
 
D
S
 
E
E
 
R
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
V
-
 
R
-
 
K
-
 
M
-
 
I
-
 
M
-
 
A
-
 
V
-
 
T
P
 
P
D
 
E
-
 
Q
-
 
R
-
 
K
-
 
V
-
 
A
L
 
L
D
 
D
E
 
L
Q
 
L
L
 
L
A
 
P
F
 
Y
Y
 
Q
R
 
R
Q
 
S
A
 
D
F
 
F
D
 
E
-
 
G
-
 
I
-
 
F
-
 
R
A
 
A
L
 
M
D
 
D
G
 
G
R
 
L
P
 
P
L
 
V
V
 
T
A
 
I
R
|
R
T
 
L
L
 
L
D
 
D
V
 
P
G
 
P
G
 
L
D
 
H
K
 
E
P
 
F
L
 
L
P
 
P
-
 
D
-
 
L
-
 
E
-
 
H
-
 
I
-
 
V
-
 
N
-
 
E
-
 
L
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
M
-
 
S
-
 
A
-
 
D
-
 
E
-
 
I
Y
 
Y
W
 
S
P
 
K
V
 
I
P
 
E
K
 
N
-
 
L
-
 
S
E
 
E
D
 
V
N
 
N
P
 
P
F
 
M
L
 
L
G
 
G
V
 
F
R
 
R
G
 
G
I
 
C
R
 
R
L
 
L
C
 
G
M
 
I
Q
 
S
K
 
Y
P
 
P
E
 
E
L
 
L
L
 
T
K
 
E
T
 
M
Q
 
Q
L
 
V
R
 
R
A
 
A
L
 
I
L
 
F
M
 
Q
A
 
A
A
 
A
G
 
V
D
 
S
R
 
M
P
 
T
L
 
N
R
 
Q
-
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
V
-
 
I
-
 
P
-
 
E
I
 
I
M
 
M
F
 
V
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
G
D
 
T
W
 
P
S
 
Q
E
 
E
W
 
L
R
 
R
W
 
H
A
 
Q
K
 
I
A
 
S
L
 
V
F
 
I
D
 
R
K
 
G
I
 
V
Q
 
A
S
 
A
E
 
N
V
 
V
Q
 
F
A
 
A
T
 
E
-
 
M
-
 
G
-
 
V
-
 
T
-
 
L
D
 
E
V
 
Y
Q
 
K
V
 
V
G
 
G
I
 
T
M
 
M
V
 
I
E
|
E
V
 
I
P
 
P
S
 
R
V
 
A
A
 
A
L
 
L
N
 
I
A
 
A
A
 
E
V
 
E
F
 
I
A
 
G
E
 
K
E
 
E
V
 
A
D
 
D
F
 
F
F
 
F
S
|
S
I
 
F
G
|
G
T
 
T
N
|
N
D
|
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
Y
 
M
T
 
T
L
 
F
A
 
G
M
 
Y
D
 
S
R
 
R
G
 
D
N
 
D
G
 
V
G
 
G
L
 
K
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
A
 
I
R
 
Y
L
 
L
S
 
A
D
 
Q
G
 
G
L
 
I
-
 
L
-
 
Q
-
 
H
-
 
D
-
 
P
-
 
F
-
 
E
-
 
V
-
 
I
-
 
D
N
 
Q
P
 
K
A
 
G
V
 
V
L
 
G
R
 
Q
L
 
L
I
 
I
K
 
K
M
 
M
V
 
A
V
 
T
D
 
E
A
 
K
A
 
G
H
 
R
A
 
A
K
 
A
G
 
N
K
 
P
-
 
S
-
 
L
W
 
K
V
 
V
G
 
G
V
 
I
C
|
C
G
 
G
E
 
E
L
 
H
A
 
G
S
 
G
D
 
E
P
 
P
V
 
S
A
 
S
L
 
V
P
 
A
L
 
F
L
 
F
L
 
D
G
 
G
L
 
V
G
 
G
V
 
L
D
 
D
E
x
Y
L
 
V
S
 
S
V
 
C
S
 
S
L
 
P
K
 
F
R
 
R
V
 
V
T
 
P
L
 
I
V
 
A
K
 
R

Sites not aligning to the query:

Q39735 Pyruvate, phosphate dikinase, chloroplastic; Cold-sensitive pyruvate, orthophosphate dikinase; Pyruvate, orthophosphate dikinase; EC 2.7.9.1 from Flaveria bidentis (Coastal plain yellowtops) (Ethulia bidentis) (see 2 papers)
28% identity, 37% coverage: 566:916/949 of query aligns to 524:945/953 of Q39735

query
sites
Q39735
G
 
G
L
 
I
V
 
L
T
 
T
V
 
A
G
 
R
G
 
G
G
 
G
A
 
M
S
 
T
S
 
S
H
 
H
S
 
A
A
 
A
I
 
V
L
 
V
A
 
A
R
 
R
S
 
G
L
 
W
G
 
G
I
 
K
P
 
C
A
 
C
L
 
V
-
 
S
-
 
G
-
 
C
-
 
A
-
 
D
V
 
I
A
 
R
A
 
V
G
 
N
G
 
D
A
 
D
V
 
M
M
 
K
A
 
I
L
 
F
P
 
T
S
 
I
G
 
G
T
 
D
E
 
R
A
 
V
I
 
I
L
 
K
N
 
E
G
 
G
D
 
D
D
 
-
G
 
-
T
 
-
L
 
-
W
 
W
V
 
L
A
 
S
P
 
L
E
 
N
A
 
G
A
 
T
M
 
T
L
 
G
E
 
E
Q
 
V
A
 
I
R
 
L
V
 
G
R