SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_104485040.1 NCBI__GCF_002936955.1:WP_104485040.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2jgvB Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase in complex with adp (see paper)
30% identity, 98% coverage: 3:309/314 of query aligns to 6:314/314 of 2jgvB

query
sites
2jgvB
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
I
T
 
S
V
 
Y
S
 
P
L
 
L
K
 
T
P
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
L
G
 
D
A
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
R
A
 
V
N
 
Q
H
 
E
G
 
V
H
 
S
L
 
K
G
 
T
A
 
A
A
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
L
 
V
G
 
G
H
 
E
R
 
P
P
 
V
R
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
G
N
 
E
N
 
L
D
 
G
A
 
Q
S
 
F
F
 
I
R
 
A
A
 
K
M
 
K
F
 
L
E
 
D
R
 
H
Y
 
A
G
 
D
I
 
I
E
 
K
D
 
H
D
 
A
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
L
 
I
A
 
K
G
 
G
D
 
E
T
 
T
R
 
R
V
 
N
N
 
C
V
 
I
K
 
A
I
 
I
S
 
L
E
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
Q
R
 
Q
V
 
-
T
 
T
D
 
E
I
 
I
N
 
L
L
 
E
P
 
Q
G
 
G
L
 
P
Q
 
E
V
 
I
E
 
D
K
 
N
S
 
Q
D
 
E
W
 
A
N
 
A
R
 
G
L
 
F
L
 
I
A
 
K
R
 
H
L
 
F
E
 
E
S
 
Q
L
 
L
E
 
L
R
 
E
H
 
K
F
 
V
D
 
E
T
 
A
L
 
V
V
 
A
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
K
G
 
G
V
 
L
Y
 
N
P
 
Q
K
 
D
Q
 
Y
L
 
Y
E
 
A
G
 
Q
L
 
I
I
 
I
D
 
E
M
 
R
W
 
C
R
 
Q
E
 
N
R
 
K
G
 
G
K
 
V
L
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
Q
V
 
T
G
 
V
I
 
L
K
 
E
G
 
N
-
 
P
-
 
Y
F
 
K
P
 
P
A
 
T
L
 
V
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
N
I
 
I
D
 
S
E
 
E
L
 
L
V
 
Y
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
G
 
N
R
 
Q
P
 
P
I
 
L
R
 
D
D
 
E
E
 
S
A
 
L
D
 
E
-
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
Q
C
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
Q
L
 
P
Q
 
L
Q
 
F
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
H
 
W
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
|
S
N
 
L
G
 
G
A
|
A
E
 
Q
G
 
G
V
 
A
H
 
F
W
 
A
F
 
K
S
 
H
P
 
N
R
 
H
G
 
T
A
 
F
W
 
Y
K
 
R
A
 
V
R
 
N
V
 
I
P
 
P
K
 
T
V
x
I
K
 
S
V
 
V
V
 
L
S
 
N
T
x
P
V
 
V
G
|
G
A
x
S
G
|
G
D
|
D
S
 
S
L
 
T
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
I
L
 
L
E
 
N
G
 
H
R
 
E
D
 
N
E
 
D
A
 
H
F
 
D
T
 
L
L
 
L
R
 
K
R
 
K
A
 
A
V
x
N
A
 
T
L
 
L
S
x
G
I
x
M
M
 
L
A
 
N
V
 
A
T
 
Q
Q
 
E
V
 
A
G
 
Q
V
 
T
G
 
G
I
 
Y
S
 
V
N
 
N
K
 
L
Q
 
N
Q
 
N
L
 
Y
N
 
D
D
 
D
Y
 
L
Q
 
F
D
 
N
A
 
Q
I
 
I
E
 
E
I
 
V
T
 
L
Q
 
E
L
 
V

2jg1A Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase with cofactor and substrate (see paper)
30% identity, 98% coverage: 3:309/314 of query aligns to 10:318/318 of 2jg1A

query
sites
2jg1A
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
I
T
 
S
V
 
Y
S
 
P
L
 
L
K
 
T
P
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
L
G
 
D
A
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
R
A
 
V
N
 
Q
H
 
E
G
 
V
H
 
S
L
 
K
G
 
T
A
 
A
A
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
L
 
V
G
 
G
H
 
E
R
 
P
P
 
V
R
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
G
N
 
E
N
 
L
D
 
G
A
 
Q
S
 
F
F
 
I
R
 
A
A
 
K
M
 
K
F
 
L
E
 
D
R
 
H
Y
 
A
G
 
D
I
 
I
E
 
K
D
 
H
D
 
A
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
L
 
I
A
 
K
G
 
G
D
 
E
T
 
T
R
 
R
V
 
N
N
 
C
V
 
I
K
 
A
I
 
I
S
 
L
E
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
Q
R
 
Q
V
 
-
T
 
T
D
 
E
I
 
I
N
 
L
L
 
E
P
 
Q
G
 
G
L
 
P
Q
 
E
V
 
I
E
 
D
K
 
N
S
 
Q
D
 
E
W
 
A
N
 
A
R
 
G
L
 
F
L
 
I
A
 
K
R
 
H
L
 
F
E
 
E
S
 
Q
L
 
M
E
 
M
R
 
E
H
 
K
F
 
V
D
 
E
T
 
A
L
 
V
V
 
A
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
K
G
 
G
V
 
L
Y
 
N
P
 
Q
K
 
D
Q
 
Y
L
 
Y
E
 
A
G
 
Q
L
 
I
I
 
I
D
 
E
M
 
R
W
 
C
R
 
Q
E
 
N
R
 
K
G
 
G
K
 
V
L
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
Q
V
 
T
G
 
V
I
 
L
K
 
E
G
 
N
-
 
P
-
 
Y
F
 
K
P
 
P
A
 
T
L
 
V
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
|
N
I
 
I
D
 
S
E
 
E
L
 
L
V
 
Y
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
G
 
N
R
 
Q
P
 
P
I
 
L
R
 
D
D
 
E
E
 
S
A
 
L
D
 
E
-
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
Q
C
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
Q
L
 
P
Q
 
L
Q
 
F
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
H
 
W
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
|
S
N
 
L
G
|
G
A
 
A
E
 
Q
G
|
G
V
 
A
H
 
F
W
 
A
F
 
K
S
 
H
P
 
N
R
 
H
G
 
T
A
 
F
W
 
Y
K
 
R
A
 
V
R
 
N
V
 
I
P
 
P
K
 
T
V
x
I
K
 
S
V
|
V
V
 
L
S
 
N
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
x
S
G
|
G
D
|
D
S
 
S
L
x
T
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
I
L
 
L
E
 
N
G
 
H
R
 
E
D
 
N
E
 
D
A
 
H
F
 
D
T
 
L
L
 
L
R
 
K
R
 
K
A
 
A
V
x
N
A
 
T
L
 
L
S
x
G
I
x
M
M
 
L
A
 
N
V
 
A
T
 
Q
Q
 
E
V
 
A
G
 
Q
V
 
T
G
 
G
I
 
Y
S
 
V
N
 
N
K
 
L
Q
 
N
Q
 
N
L
 
Y
N
 
D
D
 
D
Y
 
L
Q
 
F
D
 
N
A
 
Q
I
 
I
E
 
E
I
 
V
T
 
L
Q
 
E
L
 
V

2jg1C Structure of staphylococcus aureus d-tagatose-6-phosphate kinase with cofactor and substrate (see paper)
30% identity, 98% coverage: 3:309/314 of query aligns to 7:315/315 of 2jg1C

query
sites
2jg1C
I
 
I
L
 
L
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
S
L
 
V
D
|
D
L
 
I
T
 
S
V
 
Y
S
 
P
L
 
L
K
 
T
P
 
A
L
 
L
N
 
K
T
 
L
G
 
D
A
 
D
V
 
V
N
 
N
L
 
R
A
 
V
N
 
Q
H
 
E
G
 
V
H
 
S
L
 
K
G
 
T
A
 
A
A
 
G
G
|
G
K
|
K
G
 
G
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
L
A
 
A
D
 
Q
L
 
V
G
 
G
H
 
E
R
 
P
P
 
V
R
 
L
A
 
A
T
 
S
G
 
G
F
 
F
L
 
I
G
 
G
L
 
G
N
 
E
N
 
L
D
 
G
A
 
Q
S
 
F
F
 
I
R
 
A
A
 
K
M
 
K
F
 
L
E
 
D
R
 
H
Y
 
A
G
 
D
I
 
I
E
 
K
D
 
H
D
 
A
F
 
F
V
 
Y
R
 
N
L
 
I
A
 
K
G
 
G
D
 
E
T
 
T
R
|
R
V
 
N
N
x
C
V
 
I
K
 
A
I
 
I
S
 
L
E
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
Q
R
 
Q
V
 
-
T
 
T
D
 
E
I
 
I
N
x
L
L
 
E
P
 
Q
G
 
G
L
 
P
Q
 
E
V
 
I
E
 
D
K
 
N
S
 
Q
D
 
E
W
 
A
N
 
A
R
 
G
L
 
F
L
 
I
A
 
K
R
 
H
L
 
F
E
 
E
S
 
Q
L
 
M
E
 
M
R
 
E
H
 
K
F
 
V
D
 
E
T
 
A
L
 
V
V
 
A
V
 
I
A
 
S
G
|
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
P
 
K
G
 
G
V
 
L
Y
 
N
P
 
Q
K
 
D
Q
 
Y
L
 
Y
E
 
A
G
 
Q
L
 
I
I
 
I
D
 
E
M
 
R
W
 
C
R
 
Q
E
 
N
R
 
K
G
 
G
K
 
V
L
 
P
V
 
V
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
C
S
 
S
G
 
G
E
 
A
T
 
T
L
 
L
R
 
Q
V
 
T
G
 
V
I
 
L
K
 
E
G
 
N
-
 
P
-
 
Y
F
 
K
P
 
P
A
 
T
L
 
V
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
N
I
 
I
D
 
S
E
 
E
L
 
L
V
 
Y
D
 
Q
L
 
L
V
 
L
G
 
N
R
 
Q
P
 
P
I
 
L
R
 
D
D
 
E
E
 
S
A
 
L
D
 
E
-
 
S
L
 
L
A
 
K
D
 
Q
C
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
Q
L
 
P
Q
 
L
Q
 
F
Q
 
E
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
H
 
W
I
 
I
V
 
I
V
 
V
S
|
S
N
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
Q
G
|
G
V
 
A
H
 
F
W
 
A
F
 
K
S
 
H
P
 
N
R
 
H
G
 
T
A
 
F
W
 
Y
K
 
R
A
 
V
R
 
N
V
x
I
P
 
P
K
 
T
V
x
I
K
 
S
V
|
V
V
 
L
S
 
N
T
 
P
V
|
V
G
|
G
A
x
S
G
|
G
D
|
D
S
 
S
L
x
T
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
I
C
 
T
A
 
S
G
 
A
L
 
I
L
 
L
E
 
N
G
 
H
R
 
E
D
 
N
E
 
D
A
 
H
F
 
D
T
 
L
L
 
L
R
 
K
R
 
K
A
 
A
V
x
N
A
 
T
L
 
L
S
x
G
I
x
M
M
 
L
A
 
N
V
 
A
T
 
Q
Q
 
E
V
 
A
G
 
Q
V
 
T
G
 
G
I
 
Y
S
 
V
N
 
N
K
 
L
Q
 
N
Q
 
N
L
 
Y
N
 
D
D
 
D
Y
 
L
Q
 
F
D
 
N
A
 
Q
I
 
I
E
 
E
I
 
V
T
 
L
Q
 
E
L
 
V

2f02A Crystal structure of lacc from enterococcus faecalis in complex with atp
31% identity, 88% coverage: 3:278/314 of query aligns to 3:281/319 of 2f02A

query
sites
2f02A
I
 
I
L
 
V
T
 
T
L
 
V
T
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
S
L
 
I
D
 
D
L
 
I
T
 
S
V
 
Y
S
 
L
L
 
L
K
 
D
P
 
H
L
 
L
N
 
K
T
 
L
G
 
D
A
 
T
V
 
V
N
 
N
L
 
R
A
 
T
N
 
S
H
 
Q
G
 
V
H
 
T
L
 
K
G
 
T
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
L
N
 
N
V
 
V
A
 
T
R
 
R
V
 
V
L
 
I
A
 
H
D
 
D
L
 
L
G
 
G
H
 
G
R
 
D
P
 
V
R
 
I
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
G
N
 
F
N
 
H
D
 
G
A
 
A
S
 
F
F
 
I
R
 
A
A
 
N
M
 
E
F
 
L
E
 
K
R
 
K
Y
 
A
G
 
N
I
 
I
E
 
P
D
 
Q
D
 
A
F
 
F
V
 
T
R
 
S
L
 
I
A
 
K
G
 
E
D
 
E
T
 
T
R
 
R
V
 
D
N
 
S
V
 
I
K
 
A
I
 
I
S
 
L
E
 
H
E
 
E
G
 
G
G
 
N
R
 
Q
V
 
-
T
 
T
D
 
E
I
 
I
N
 
L
L
 
E
P
 
A
G
 
G
L
 
P
Q
 
T
V
 
V
E
 
S
K
 
P
S
 
E
D
 
E
W
 
I
N
 
S
R
 
N
L
 
F
L
 
L
A
 
E
R
 
N
L
 
F
E
 
D
S
 
Q
L
 
L
E
 
I
R
 
K
H
 
Q
F
 
A
D
 
E
T
 
I
L
 
V
V
 
T
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
A
P
 
K
G
 
G
V
 
L
Y
 
P
P
 
S
K
 
D
Q
 
F
L
 
Y
E
 
Q
G
 
E
L
 
L
I
 
V
D
 
Q
M
 
K
W
 
A
R
 
H
E
 
A
R
 
Q
G
 
E
K
 
V
L
 
K
V
 
V
L
 
L
L
 
L
D
 
D
A
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
D
T
 
S
L
 
L
R
 
R
V
 
Q
G
 
V
I
 
L
K
 
Q
G
 
G
-
 
P
-
 
W
F
 
K
P
 
P
A
 
Y
L
 
L
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
|
N
I
 
L
D
 
E
E
 
E
L
 
L
V
 
E
D
 
G
L
 
L
V
 
L
G
 
G
R
 
Q
P
 
D
I
 
F
R
 
-
D
 
S
E
 
E
A
 
N
D
 
P
L
 
L
A
 
A
D
 
A
C
 
V
A
 
Q
R
 
T
E
 
A
L
 
L
Q
 
T
Q
 
K
-
 
P
-
 
M
-
 
F
Q
 
A
G
 
G
I
 
I
Q
 
E
H
 
W
I
 
I
V
 
V
V
 
I
S
|
S
N
 
L
G
|
G
A
 
K
E
 
D
G
 
G
V
 
A
H
 
I
W
 
A
F
 
K
S
 
H
P
 
H
R
 
D
G
 
Q
A
 
F
W
 
Y
K
 
R
A
 
V
R
 
K
V
x
I
P
 
P
K
 
T
V
x
I
K
 
Q
V
 
A
V
 
K
S
 
N
T
 
P
V
 
V
G
|
G
A
x
S
G
|
G
D
 
D
S
 
A
L
x
T
V
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
Y
G
 
G
L
 
L
L
 
A
E
 
K
G
 
D
R
 
A
D
 
P
E
 
A
A
 
A
F
 
E
T
 
L
L
 
L
R
 
K
R
 
W
A
 
G
V
x
M
A
 
A

Sites not aligning to the query:

2ajrA Crystal structure of possible 1-phosphofructokinase (ec 2.7.1.56) (tm0828) from thermotoga maritima at 2.46 a resolution
30% identity, 84% coverage: 3:265/314 of query aligns to 3:274/320 of 2ajrA

query
sites
2ajrA
I
 
V
L
 
L
T
 
T
L
 
V
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
R
T
 
E
V
 
I
S
 
F
L
 
I
K
 
E
P
 
D
L
 
F
N
 
Q
T
 
V
G
 
N
A
 
R
-
 
L
-
 
Y
-
 
R
V
 
I
N
 
N
L
 
D
A
 
L
N
 
S
H
 
K
G
 
T
H
 
Q
L
 
M
G
 
S
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
S
R
 
I
V
 
A
L
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
L
G
 
G
H
 
V
R
 
P
P
 
S
R
 
V
A
 
A
T
 
T
G
 
G
F
 
F
L
 
V
G
 
G
L
 
G
N
 
Y
N
 
M
D
 
G
A
 
K
S
 
I
F
 
L
R
 
V
A
 
E
M
 
E
F
 
L
E
 
R
R
 
K
Y
 
I
G
 
S
-
 
K
-
 
L
I
 
I
E
 
T
D
 
T
D
 
N
F
 
F
V
 
V
R
 
Y
L
 
V
A
 
E
G
 
G
D
 
E
T
 
T
R
 
R
V
 
E
N
 
N
V
 
I
K
 
E
I
 
I
S
 
I
E
 
D
E
 
E
G
 
K
G
 
N
R
 
K
-
 
T
V
 
I
T
 
T
D
 
A
I
 
I
N
 
N
L
 
F
P
 
P
G
 
G
L
 
P
Q
 
D
V
 
V
E
 
T
K
 
D
S
 
M
D
 
D
W
 
V
N
 
N
R
 
H
L
 
F
L
 
L
A
 
R
R
 
R
L
 
Y
E
 
K
S
 
M
L
 
T
E
 
L
R
 
S
H
 
K
F
 
V
D
 
D
T
 
C
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
I
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
N
P
 
E
K
 
G
Q
 
I
L
 
C
E
 
N
G
 
E
L
 
L
I
 
V
D
 
R
M
 
L
W
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
R
G
 
G
K
 
V
L
 
F
V
 
V
L
 
F
L
 
V
D
 
E
A
 
Q
S
 
T
G
 
P
E
 
R
T
 
L
L
 
L
R
 
E
V
 
R
G
 
I
I
 
Y
K
 
E
G
 
G
-
 
P
-
 
E
F
 
F
P
 
P
A
 
N
L
 
V
I
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
D
I
 
L
D
 
R
-
 
G
E
 
N
L
 
H
V
 
A
D
 
S
L
 
F
V
 
L
G
 
G
R
 
V
P
 
D
I
 
L
R
 
K
D
 
T
E
 
F
A
 
D
D
 
D
L
 
Y
A
 
V
D
 
K
C
 
L
A
 
A
R
 
E
E
 
K
L
 
L
Q
 
A
Q
 
E
Q
 
K
G
 
S
I
 
-
Q
 
Q
H
 
V
I
 
S
V
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
Y
G
 
E
A
 
V
E
 
K
G
 
N
V
 
D
H
 
I
W
 
V
F
 
A
S
 
T
P
 
R
R
 
E
G
 
G
A
 
V
W
 
W
K
 
L
A
 
I
R
 
R
V
 
S
P
 
K
-
 
E
K
 
E
V
 
I
K
 
D
V
 
T
V
 
S
S
x
H
T
 
L
V
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
L
 
Y
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
M
C
 
V
A
 
Y
G
 
Y
L
 
F
L
 
I
E
 
K

Sites not aligning to the query:

3ie7A The crystal structure of phosphofructokinase (lin2199) from listeria innocua in complex with atp at 1.6a
28% identity, 98% coverage: 3:310/314 of query aligns to 3:309/309 of 3ie7A

query
sites
3ie7A
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
D
 
D
L
 
R
T
 
L
V
 
L
S
 
F
L
 
I
K
 
R
-
 
G
P
 
E
L
 
L
N
 
E
T
 
K
G
 
R
A
 
K
V
 
T
N
 
N
L
 
R
A
 
V
N
 
I
H
 
K
G
 
T
H
 
E
L
 
F
G
 
D
A
 
C
A
 
G
G
 
G
K
 
K
G
 
G
I
 
L
N
 
H
V
 
V
A
 
S
R
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
F
G
 
G
H
 
I
R
 
K
P
 
N
R
 
E
A
 
A
T
 
L
G
 
G
F
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
S
N
 
D
N
 
N
D
 
L
A
 
D
S
 
K
F
 
L
R
 
Y
A
 
A
M
 
I
F
 
L
E
 
K
R
 
E
Y
 
K
G
 
H
I
 
I
E
 
N
D
 
H
D
 
D
F
 
F
V
 
L
R
 
V
L
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
T
T
 
S
-
 
T
-
 
R
R
 
E
V
 
C
N
 
F
V
 
V
K
 
V
I
 
L
S
 
S
E
 
D
E
 
D
G
 
T
G
 
N
R
 
G
V
 
S
T
 
T
D
 
M
I
 
I
N
 
P
L
 
E
P
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
T
V
 
V
E
 
S
K
 
Q
S
 
T
D
 
N
W
 
K
N
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
Q
L
 
I
E
 
A
S
 
K
L
 
K
E
 
V
R
 
K
H
 
K
F
 
E
D
 
D
T
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
 
G
S
 
S
L
 
P
P
 
P
P
 
P
G
 
H
V
 
Y
Y
 
T
P
 
L
K
 
S
Q
 
D
L
 
F
E
 
K
G
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
R
M
 
T
W
 
V
R
 
K
E
 
A
R
 
T
G
 
G
K
 
A
L
 
F
V
 
L
L
 
G
L
 
C
D
 
D
A
 
N
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
Y
L
 
L
R
 
N
V
 
L
G
 
A
I
 
V
K
 
E
G
 
M
F
 
G
P
 
V
A
 
D
L
 
F
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
|
N
I
 
E
D
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
D
R
 
E
P
 
K
I
 
T
R
 
N
D
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
S
L
 
L
A
 
E
D
 
E
C
 
N
A
 
I
R
 
R
E
 
T
L
 
L
Q
 
A
Q
 
E
Q
 
K
G
 
-
I
 
I
Q
 
P
H
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
 
V
S
|
S
N
 
L
G
|
G
A
|
A
E
 
K
G
|
G
V
 
S
H
 
I
W
 
C
F
 
A
S
 
H
P
 
N
R
 
G
G
 
K
A
 
L
W
 
Y
K
 
Q
A
 
V
R
 
I
V
 
P
P
 
P
K
 
K
V
|
V
K
 
Q
V
 
E
V
 
R
S
 
N
T
 
D
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
V
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
A
L
 
F
C
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
A
E
 
M
G
 
N
R
 
M
D
 
P
E
 
I
A
 
T
F
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
K
R
 
V
A
 
A
V
 
T
A
 
G
L
 
C
S
|
S
I
 
A
M
 
S
A
 
K
V
|
V
T
 
M
Q
 
Q
V
 
Q
G
 
D
V
 
S
G
 
S
I
 
S
S
 
F
N
 
D
K
 
L
Q
 
E
Q
 
A
L
 
A
N
 
G
D
 
K
Y
 
L
Q
 
K
D
 
N
A
 
Q
I
 
V
E
 
S
I
 
I
T
 
I
Q
 
Q
L
 
L
E
 
E

3uqeA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 mutant y23d from escherichia coli
30% identity, 88% coverage: 3:278/314 of query aligns to 4:281/307 of 3uqeA

query
sites
3uqeA
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
L
 
S
T
 
A
V
 
T
S
 
I
L
 
T
K
 
P
P
 
Q
L
 
I
N
 
D
T
 
P
G
 
E
A
 
G
V
 
K
N
 
L
L
 
R
A
 
C
N
 
T
H
 
A
G
 
P
H
 
V
L
 
F
G
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
R
 
S
P
 
A
R
 
T
A
 
A
T
 
I
G
 
F
F
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
G
N
 
A
N
 
T
D
 
G
A
 
E
S
 
H
F
 
L
R
 
V
A
 
S
M
 
L
F
 
L
E
 
A
R
 
D
Y
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
P
D
 
V
D
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
D
D
 
W
T
 
T
R
 
R
V
 
Q
N
 
N
V
 
L
K
 
H
I
 
V
S
 
H
-
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
N
 
V
L
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
A
Q
 
A
V
 
L
E
 
N
K
 
E
S
 
D
D
 
E
W
 
F
N
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
E
A
 
E
R
 
Q
L
 
V
E
 
L
S
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
S
H
 
G
F
 
A
D
 
-
T
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
K
P
 
L
K
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
T
G
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
S
M
 
A
W
 
A
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
G
 
G
K
 
I
L
 
R
V
 
C
L
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
L
R
 
S
V
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
-
 
I
G
 
G
F
 
N
P
 
I
A
 
E
L
 
L
I
 
V
K
|
K
P
 
P
N
|
N
I
 
Q
D
x
K
E
 
E
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
N
R
 
R
P
 
E
I
 
L
R
 
T
D
 
Q
E
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
R
D
 
K
C
 
A
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
Q
 
V
Q
 
N
Q
 
S
G
 
G
-
 
K
I
 
A
Q
 
K
H
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
N
 
L
G
|
G
A
x
P
E
 
Q
G
|
G
V
 
A
H
 
L
W
 
G
F
 
V
S
 
D
P
 
S
R
 
E
G
 
N
A
 
C
W
 
I
K
 
Q
A
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
K
 
P
V
 
V
K
 
K
V
x
S
V
 
Q
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
L
x
M
V
 
V
A
 
G
G
 
A
L
 
M
C
 
T
A
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
S
E
 
L
A
 
E
F
 
E
T
 
M
L
 
V
R
 
R
R
 
F
A
 
G
V
|
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3uqdB Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with substrates and products (see paper)
31% identity, 88% coverage: 3:278/314 of query aligns to 4:281/309 of 3uqdB

query
sites
3uqdB
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
|
D
-
 
S
L
 
A
T
 
T
V
 
I
S
 
T
L
 
P
K
 
Q
P
 
I
L
x
Y
N
 
P
T
 
E
G
 
G
A
x
K
V
 
L
N
x
R
L
 
-
A
 
C
N
 
T
H
 
A
G
 
P
H
 
V
L
 
F
G
 
E
A
 
P
A
 
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
R
 
S
P
 
A
R
 
T
A
 
A
T
 
I
G
 
F
F
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
G
N
 
A
N
 
T
D
 
G
A
 
E
S
 
H
F
 
L
R
 
V
A
 
S
M
 
L
F
 
L
E
 
A
R
 
D
Y
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
P
D
 
V
D
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
D
D
 
W
T
 
T
R
|
R
V
 
Q
N
 
N
V
 
L
K
 
H
I
 
V
S
 
H
-
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
x
R
I
 
F
N
 
V
L
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
A
Q
 
A
V
 
L
E
 
N
K
 
E
S
 
D
D
 
E
W
 
F
N
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
E
A
 
E
R
 
Q
L
 
V
E
 
L
S
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
S
H
 
G
F
 
A
D
 
-
T
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
K
P
 
L
K
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
T
G
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
S
M
 
A
W
 
A
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
G
 
G
K
 
I
L
 
R
V
 
C
L
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
L
R
 
S
V
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
-
 
I
G
 
G
F
 
N
P
 
I
A
 
E
L
 
L
I
 
V
K
|
K
P
 
P
N
|
N
I
 
Q
D
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
N
R
 
R
P
 
E
I
 
L
R
 
T
D
 
Q
E
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
R
D
 
K
C
 
A
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
Q
 
V
Q
 
N
Q
 
S
G
 
G
-
 
K
I
 
A
Q
 
K
H
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
N
 
L
G
|
G
A
x
P
E
 
Q
G
|
G
V
 
A
H
 
L
W
 
G
F
 
V
S
 
D
P
 
S
R
 
E
G
 
N
A
 
C
W
 
I
K
 
Q
A
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
K
 
P
V
 
V
K
 
K
V
x
S
V
 
Q
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
L
x
M
V
 
V
A
 
G
G
 
A
L
 
M
C
 
T
A
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
S
E
 
L
A
 
E
F
 
E
T
 
M
L
 
V
R
 
R
R
 
F
A
 
G
V
|
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3uqdA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with substrates and products (see paper)
31% identity, 88% coverage: 3:278/314 of query aligns to 4:281/309 of 3uqdA

query
sites
3uqdA
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
|
D
-
 
S
L
 
A
T
 
T
V
 
I
S
 
T
L
 
P
K
 
Q
P
 
I
L
 
Y
N
 
P
T
 
E
G
 
G
A
x
K
V
 
L
N
x
R
L
 
-
A
 
C
N
 
T
H
 
A
G
 
P
H
 
V
L
 
F
G
 
E
A
 
P
A
x
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
R
 
S
P
 
A
R
 
T
A
 
A
T
 
I
G
 
F
F
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
G
N
 
A
N
 
T
D
 
G
A
 
E
S
 
H
F
 
L
R
 
V
A
 
S
M
 
L
F
 
L
E
 
A
R
 
D
Y
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
P
D
 
V
D
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
D
D
 
W
T
 
T
R
|
R
V
 
Q
N
 
N
V
 
L
K
 
H
I
 
V
S
 
H
-
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
N
 
V
L
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
A
Q
 
A
V
 
L
E
 
N
K
 
E
S
 
D
D
 
E
W
 
F
N
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
E
A
 
E
R
 
Q
L
 
V
E
 
L
S
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
S
H
 
G
F
 
A
D
 
-
T
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
K
P
 
L
K
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
T
G
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
S
M
 
A
W
 
A
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
G
 
G
K
 
I
L
 
R
V
 
C
L
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
L
R
 
S
V
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
-
 
I
G
 
G
F
 
N
P
 
I
A
 
E
L
 
L
I
 
V
K
|
K
P
 
P
N
 
N
I
 
Q
D
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
N
R
 
R
P
 
E
I
 
L
R
 
T
D
 
Q
E
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
R
D
 
K
C
 
A
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
Q
 
V
Q
 
N
Q
 
S
G
 
G
-
 
K
I
 
A
Q
 
K
H
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
N
 
L
G
|
G
A
x
P
E
 
Q
G
|
G
V
 
A
H
 
L
W
 
G
F
 
V
S
 
D
P
 
S
R
 
E
G
 
N
A
 
C
W
 
I
K
 
Q
A
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
K
 
P
V
 
V
K
 
K
V
 
S
V
 
Q
S
 
S
T
|
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
L
x
M
V
 
V
A
 
G
G
 
A
L
 
M
C
 
T
A
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
S
E
 
L
A
 
E
F
 
E
T
 
M
L
 
V
R
 
R
R
 
F
A
 
G
V
|
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3n1cA Crystal structure of the phosphofructokinase-2 from escherichia coli in complex with fructose-6-phosphate (see paper)
31% identity, 88% coverage: 3:278/314 of query aligns to 4:281/309 of 3n1cA

query
sites
3n1cA
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
|
D
-
 
S
L
 
A
T
 
T
V
 
I
S
 
T
L
 
P
K
 
Q
P
 
I
L
 
Y
N
 
P
T
 
E
G
 
G
A
x
K
V
 
L
N
x
R
L
 
-
A
 
C
N
 
T
H
 
A
G
 
P
H
 
V
L
 
F
G
 
E
A
 
P
A
 
G
G
|
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
|
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
R
 
S
P
 
A
R
 
T
A
 
A
T
 
I
G
 
F
F
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
G
N
 
A
N
 
T
D
 
G
A
 
E
S
 
H
F
 
L
R
 
V
A
 
S
M
 
L
F
 
L
E
 
A
R
 
D
Y
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
P
D
 
V
D
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
D
D
 
W
T
 
T
R
|
R
V
 
Q
N
 
N
V
 
L
K
 
H
I
 
V
S
 
H
-
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
N
 
V
L
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
A
Q
 
A
V
 
L
E
 
N
K
 
E
S
 
D
D
 
E
W
 
F
N
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
E
A
 
E
R
 
Q
L
 
V
E
 
L
S
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
S
H
 
G
F
 
A
D
 
-
T
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
S
G
|
G
S
|
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
K
P
 
L
K
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
T
G
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
S
M
 
A
W
 
A
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
G
 
G
K
 
I
L
 
R
V
 
C
L
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
L
R
 
S
V
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
-
 
I
G
 
G
F
 
N
P
 
I
A
 
E
L
 
L
I
 
V
K
 
K
P
 
P
N
 
N
I
 
Q
D
 
K
E
 
E
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
N
R
 
R
P
 
E
I
 
L
R
 
T
D
 
Q
E
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
R
D
 
K
C
 
A
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
Q
 
V
Q
 
N
Q
 
S
G
 
G
-
 
K
I
 
A
Q
 
K
H
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
L
G
 
G
A
 
P
E
 
Q
G
 
G
V
 
A
H
 
L
W
 
G
F
 
V
S
 
D
P
 
S
R
 
E
G
 
N
A
 
C
W
 
I
K
 
Q
A
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
K
 
P
V
 
V
K
 
K
V
 
S
V
 
Q
S
 
S
T
 
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
L
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
A
L
 
M
C
 
T
A
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
S
E
 
L
A
 
E
F
 
E
T
 
M
L
 
V
R
 
R
R
 
F
A
 
G
V
 
V
A
 
A

P06999 ATP-dependent 6-phosphofructokinase isozyme 2; ATP-PFK 2; Phosphofructokinase 2; 6-phosphofructokinase isozyme II; Phosphohexokinase 2; EC 2.7.1.11 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
31% identity, 88% coverage: 3:278/314 of query aligns to 4:281/309 of P06999

query
sites
P06999
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
-
 
S
L
 
A
T
 
T
V
 
I
S
 
T
L
 
P
K
 
Q
P
 
I
L
 
Y
N
 
P
T
 
E
G
 
G
A
x
K
V
 
L
N
 
R
L
 
-
A
 
C
N
 
T
H
 
A
G
 
P
H
 
V
L
 
F
G
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
R
 
S
P
 
A
R
 
T
A
 
A
T
 
I
G
 
F
F
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
G
N
 
A
N
 
T
D
 
G
A
 
E
S
 
H
F
 
L
R
 
V
A
 
S
M
 
L
F
 
L
E
 
A
R
 
D
Y
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
P
D
 
V
D
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
D
D
 
W
T
 
T
R
 
R
V
 
Q
N
 
N
V
 
L
K
 
H
I
 
V
S
 
H
-
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
N
 
V
L
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
A
Q
 
A
V
 
L
E
 
N
K
 
E
S
 
D
D
 
E
W
 
F
N
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
E
A
 
E
R
 
Q
L
 
V
E
 
L
S
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
S
H
 
G
F
 
A
D
 
-
T
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
K
P
 
L
K
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
T
G
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
S
M
 
A
W
 
A
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
G
 
G
K
 
I
L
 
R
V
 
C
L
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
L
R
 
S
V
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
-
 
I
G
 
G
F
 
N
P
 
I
A
 
E
L
 
L
I
 
V
K
|
K
P
|
P
N
|
N
I
x
Q
D
x
K
E
|
E
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
N
R
 
R
P
 
E
I
 
L
R
 
T
D
 
Q
E
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
R
D
 
K
C
 
A
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
Q
 
V
Q
 
N
Q
 
S
G
 
G
-
 
K
I
 
A
Q
 
K
H
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
N
x
L
G
|
G
A
x
P
E
x
Q
G
|
G
V
 
A
H
 
L
W
 
G
F
 
V
S
 
D
P
 
S
R
 
E
G
 
N
A
 
C
W
 
I
K
 
Q
A
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
K
 
P
V
 
V
K
 
K
V
x
S
V
 
Q
S
|
S
T
 
T
V
|
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
S
L
 
M
V
 
V
A
 
G
G
 
A
L
 
M
C
 
T
A
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
S
E
 
L
A
 
E
F
 
E
T
 
M
L
 
V
R
 
R
R
 
F
A
 
G
V
|
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3cqdA Structure of the tetrameric inhibited form of phosphofructokinase-2 from escherichia coli (see paper)
31% identity, 88% coverage: 3:278/314 of query aligns to 4:281/304 of 3cqdA

query
sites
3cqdA
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
L
N
 
A
P
 
P
A
 
S
L
 
L
D
 
D
-
 
S
L
 
A
T
 
T
V
 
I
S
 
T
L
 
P
K
 
Q
P
 
I
L
x
Y
N
 
P
T
 
E
G
|
G
A
x
K
V
 
L
N
 
R
L
 
-
A
 
C
N
 
T
H
 
A
G
 
P
H
 
V
L
 
F
G
 
E
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
A
L
 
I
A
 
A
D
 
H
L
 
L
G
 
G
H
 
G
R
 
S
P
 
A
R
 
T
A
 
A
T
 
I
G
 
F
F
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
G
N
 
A
N
 
T
D
 
G
A
 
E
S
 
H
F
 
L
R
 
V
A
 
S
M
 
L
F
 
L
E
 
A
R
 
D
Y
 
E
G
 
N
I
 
V
E
 
P
D
 
V
D
 
A
F
 
T
V
 
V
R
 
E
L
 
A
A
 
K
G
 
D
D
 
W
T
 
T
R
 
R
V
 
Q
N
 
N
V
 
L
K
 
H
I
 
V
S
 
H
-
 
V
E
 
E
E
 
A
G
 
S
G
 
G
R
 
E
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
N
 
V
L
 
M
P
 
P
G
 
G
L
 
A
Q
 
A
V
 
L
E
 
N
K
 
E
S
 
D
D
 
E
W
 
F
N
 
R
R
 
Q
L
 
L
L
 
E
A
 
E
R
 
Q
L
 
V
E
 
L
S
 
E
L
 
I
E
 
E
R
 
S
H
 
G
F
 
A
D
 
-
T
 
I
L
 
L
V
 
V
V
 
I
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
K
P
 
L
K
 
E
Q
 
K
L
 
L
E
 
T
G
 
Q
L
 
L
I
 
I
D
 
S
M
 
A
W
 
A
R
 
Q
E
 
K
R
 
Q
G
 
G
K
 
I
L
 
R
V
 
C
L
 
I
L
 
V
D
 
D
A
 
S
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
A
L
 
L
R
 
S
V
 
A
G
 
A
I
 
L
K
 
A
-
 
I
G
 
G
F
 
N
P
 
I
A
 
E
L
 
L
I
 
V
K
|
K
P
 
P
N
|
N
I
 
Q
D
x
K
E
 
E
L
 
L
V
 
S
D
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
N
R
 
R
P
 
E
I
 
L
R
 
T
D
 
Q
E
 
P
A
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
R
D
 
K
C
 
A
A
 
A
R
 
Q
E
 
E
L
 
I
Q
 
V
Q
 
N
Q
 
S
G
 
G
-
 
K
I
 
A
Q
 
K
H
 
R
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
|
S
N
 
L
G
|
G
A
x
P
E
 
Q
G
|
G
V
 
A
H
 
L
W
 
G
F
 
V
S
 
D
P
 
S
R
 
E
G
 
N
A
 
C
W
 
I
K
 
Q
A
 
V
R
 
V
V
 
P
P
 
P
K
 
P
V
 
V
K
 
K
V
x
S
V
 
Q
S
 
S
T
|
T
V
 
V
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
L
x
M
V
 
V
A
 
G
G
 
A
L
 
M
C
 
T
A
 
L
G
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
E
G
 
N
R
 
A
D
 
S
E
 
L
A
 
E
F
 
E
T
 
M
L
 
V
R
 
R
R
 
F
A
 
G
V
|
V
A
 
A

Sites not aligning to the query:

3julA Crystal structure of listeria innocua d-tagatose-6-phosphate kinase bound with substrate
28% identity, 90% coverage: 3:286/314 of query aligns to 3:278/298 of 3julA

query
sites
3julA
I
 
I
L
 
Y
T
 
T
L
 
I
T
 
T
L
 
L
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
I
D
|
D
L
 
R
T
 
L
V
 
L
S
 
F
L
 
I
K
 
R
-
 
G
P
 
E
L
 
L
N
 
E
T
 
K
G
 
R
A
 
K
V
 
T
N
 
N
L
 
R
A
 
V
N
 
I
H
 
K
G
 
T
H
 
E
L
 
F
G
 
D
A
 
C
A
 
G
G
 
G
K
|
K
G
 
G
I
 
L
N
x
H
V
 
V
A
 
S
R
 
G
V
 
V
L
 
L
A
 
S
D
 
K
L
 
F
G
 
G
H
 
I
R
 
K
P
 
N
R
 
E
A
 
A
T
 
L
G
 
G
F
 
I
L
 
A
G
 
G
L
 
S
N
 
D
N
 
N
D
 
L
A
 
D
S
 
K
F
 
L
R
 
Y
A
 
A
M
 
I
F
 
L
E
 
K
R
 
E
Y
 
K
G
 
H
I
 
I
E
 
N
D
 
H
D
 
D
F
 
F
V
 
L
R
 
V
L
 
E
A
 
A
G
 
G
D
 
T
T
 
S
-
 
T
-
x
R
R
 
E
V
 
C
N
 
F
V
 
V
K
 
V
I
 
L
S
 
S
E
 
D
E
 
D
G
 
T
G
 
N
R
 
G
V
 
S
T
 
T
D
x
M
I
 
I
N
 
P
L
 
E
P
 
A
G
 
G
L
 
F
Q
 
T
V
 
V
E
 
S
K
 
Q
S
 
T
D
 
N
W
 
K
N
 
D
R
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
Q
L
 
I
E
 
A
S
 
K
L
 
K
E
 
V
R
 
K
H
 
K
F
 
E
D
 
D
T
 
M
L
 
V
V
 
V
V
 
I
A
 
A
G
|
G
S
 
S
L
 
P
P
 
P
P
 
P
G
 
H
V
 
Y
Y
 
T
P
 
L
K
 
S
Q
 
D
L
 
F
E
 
K
G
 
E
L
 
L
I
 
L
D
 
R
M
 
T
W
 
V
R
 
K
E
 
A
R
 
T
G
 
G
K
 
A
L
 
F
V
 
L
L
 
G
L
 
C
D
 
D
A
 
N
S
 
S
G
 
G
E
 
E
T
 
Y
L
 
L
R
 
N
V
 
L
G
 
A
I
 
V
K
 
E
G
 
M
F
 
G
P
 
V
A
 
D
L
 
F
I
 
I
K
 
K
P
 
P
N
 
N
I
 
E
D
 
D
E
 
E
L
 
V
V
 
I
D
 
A
L
 
I
V
 
L
G
 
D
R
 
E
P
 
K
I
 
T
R
 
N
D
 
-
E
 
-
A
 
-
D
 
S
L
 
L
A
 
E
D
 
E
C
 
N
A
 
I
R
 
R
E
 
T
L
 
L
Q
 
A
Q
 
E
Q
 
K
G
 
-
I
 
I
Q
 
P
H
 
Y
I
 
L
V
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
-
G
 
-
V
 
-
H
 
-
W
 
-
F
 
-
S
 
-
P
 
-
R
 
K
G
 
G
A
 
S
W
 
I
K
 
C
A
 
A
R
 
H
V
 
N
P
 
G
K
 
K
V
 
L
-
 
Y
K
 
Q
V
 
V
V
 
I
S
 
P
T
 
P
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
V
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
A
L
 
F
C
 
I
A
 
A
G
 
G
L
 
L
L
 
A
E
 
M
G
 
N
R
 
M
D
 
P
E
 
I
A
 
T
F
 
E
T
 
T
L
 
L
R
 
K
R
 
V
A
 
A
V
 
T
A
 
G
L
 
C
S
 
S
I
 
A
M
 
S
A
 
K
V
 
V
T
 
M
Q
 
Q

P9WID3 ATP-dependent 6-phosphofructokinase isozyme 2; ATP-PFK 2; Phosphofructokinase 2; Phosphofructokinase B; Phosphohexokinase 2; Tagatose-6-phosphate kinase; EC 2.7.1.11; EC 2.7.1.144 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
27% identity, 99% coverage: 3:314/314 of query aligns to 14:322/339 of P9WID3

query
sites
P9WID3
I
 
I
L
 
I
T
 
T
L
 
L
T
 
T
L
 
M
N
 
N
P
 
P
A
 
A
L
 
L
D
 
D
L
 
I
T
 
T
V
 
T
S
 
S
L
 
V
K
 
D
P
 
V
L
 
V
N
 
R
T
 
P
G
 
T
A
 
E
V
 
K
N
 
M
L
 
R
A
 
C
N
 
G
H
 
A
G
 
P
H
 
R
L
 
Y
G
 
D
A
 
P
A
 
G
G
 
G
K
 
G
G
 
G
I
 
I
N
 
N
V
 
V
A
 
A
R
 
R
V
 
I
L
 
V
A
 
H
D
 
V
L
 
L
G
 
G
H
 
G
R
 
C
P
 
S
R
 
T
A
 
A
T
 
L
G
 
F
F
 
P
L
 
A
G
 
G
L
 
G
N
 
S
N
 
T
D
 
G
A
 
S
S
 
L
F
 
L
R
 
M
A
 
A
M
 
L
F
 
L
E
 
G
R
 
D
Y
 
A
G
 
G
I
 
V
E
 
P
D
 
F
D
 
R
F
 
V
V
 
I
R
 
P
L
 
I
A
 
A
G
 
A
D
 
S
T
 
T
R
 
R
V
 
E
N
 
S
V
 
F
K
 
T
I
 
V
S
 
N
E
 
E
E
 
S
-
 
R
G
 
T
G
 
A
R
 
K
V
 
Q
T
 
Y
D
 
R
I
 
F
N
 
V
L
 
L
P
 
P
G
 
G
L
 
P
Q
 
S
V
 
L
E
 
T
K
 
V
S
 
A
D
 
E
W
 
Q
N
 
E
R
 
Q
L
 
C
L
 
L
A
 
D
R
 
E
L
 
L
E
 
R
S
 
G
L
 
A
E
 
A
R
 
A
H
 
S
F
 
A
D
 
A
T
 
F
L
 
V
V
 
V
V
 
A
A
 
S
G
 
G
S
 
S
L
 
L
P
 
P
P
 
P
G
 
G
V
 
V
Y
 
A
P
 
A
K
 
D
Q
 
Y
L
 
Y
E
 
Q
G
 
R
L
 
V
I
 
A
D
 
D
M
 
I
W
 
C
R
 
R
E
 
R
R
 
S
G
 
S
K
 
T
L
 
P
V
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
A
 
T
S
 
S
G
 
G
E
 
G
T
 
G
L
 
L
R
 
Q
V
 
H
G
 
I
I
 
S
K
 
S
G
 
G
F
 
V
P
 
-
A
 
F
L
 
L
I
 
L
K
 
K
P
 
A
N
 
S
I
 
V
D
 
R
E
 
E
L
 
L
V
 
R
D
 
E
L
 
C
V
 
V
G
 
G
R
 
S
P
 
E
I
 
L
R
 
L
D
 
T
E
 
E
A
 
P
D
 
E
L
 
Q
A
 
L
D
 
A
C
 
A
A
 
A
R
 
H
E
 
E
L
 
L
Q
 
I
Q
 
D
Q
 
R
G
 
G
-
 
R
I
 
A
Q
 
E
H
 
V
I
 
V
V
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
L
G
 
G
A
 
S
E
 
Q
G
 
G
V
 
A
H
 
L
W
 
L
F
 
A
S
 
T
P
 
R
R
 
H
G
 
A
A
 
S
W
 
H
K
 
R
A
 
F
R
 
S
V
 
S
P
 
I
K
 
P
V
 
M
K
 
T
V
 
A
V
 
V
S
 
S
T
 
G
V
 
V
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
L
 
M
V
 
V
A
 
A
G
 
A
L
 
I
C
 
T
A
 
V
G
 
G
L
 
L
L
 
S
E
 
R
G
 
G
R
 
W
D
 
S
E
 
L
A
 
I
F
x
K
T
 
S
L
 
V
R
 
R
R
 
L
A
 
G
V
 
N
A
 
A
L
 
A
S
 
G
I
 
A
M
 
A
A
 
M
V
 
L
T
 
L
Q
 
T
V
 
P
G
 
G
V
 
T
G
 
A
I
 
A
S
 
C
N
 
N
K
 
R
Q
 
-
Q
 
-
L
 
-
N
 
D
D
 
D
Y
 
V
Q
 
E
D
 
R
A
 
F
I
 
F
E
 
E
I
 
L
T
 
A
Q
 
A
L
 
-
E
 
E
P
 
P
S
 
T
K
 
E
V
 
V

3in1A Crystal structure of a putative ribokinase in complex with adp from e.Coli
28% identity, 85% coverage: 34:301/314 of query aligns to 36:312/312 of 3in1A

query
sites
3in1A
L
 
M
G
 
T
A
 
T
A
 
G
G
 
G
K
 
D
G
 
A
I
 
I
N
 
N
V
 
E
A
 
A
R
 
T
V
 
I
L
 
I
A
 
S
D
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
H
R
 
R
P
 
T
R
 
A
A
 
L
T
 
M
G
 
S
F
 
R
L
 
I
G
 
G
L
 
K
N
 
D
N
 
A
D
 
A
A
 
G
S
 
Q
F
 
F
-
 
I
-
 
L
-
 
D
R
 
H
A
 
C
M
 
R
F
 
K
E
 
E
R
 
N
Y
 
I
G
 
D
I
 
I
E
 
Q
D
 
S
D
 
L
F
 
K
V
 
Q
R
 
D
L
 
V
A
 
S
G
 
I
D
 
D
T
 
T
R
 
S
V
 
I
N
 
N
V
 
V
K
 
G
-
 
L
I
 
V
S
 
T
E
 
E
E
 
D
G
 
G
G
 
E
R
|
R
V
 
T
T
 
F
D
 
V
I
 
T
N
 
N
L
 
R
P
 
N
G
 
G
-
 
S
-
 
L
-
 
W
-
 
K
L
 
L
Q
 
N
V
 
I
E
 
D
K
 
D
S
 
V
D
 
D
W
 
F
N
 
A
R
 
R
L
 
F
-
 
S
L
 
Q
A
 
A
R
 
K
L
 
L
E
 
L
S
 
S
L
 
L
E
 
A
R
 
S
H
 
I
F
 
F
D
 
N
T
 
S
L
 
P
V
 
L
V
 
L
A
 
D
G
 
G
S
 
K
L
 
A
P
 
L
P
 
T
G
 
E
V
 
I
Y
 
F
P
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
K
-
 
A
K
 
R
Q
 
Q
L
 
M
E
 
I
G
 
I
L
 
C
I
 
A
D
 
D
M
 
M
W
 
I
R
 
K
E
 
P
R
 
R
G
 
L
K
 
N
L
 
E
V
 
T
L
 
L
L
 
D
D
 
D
A
 
I
S
 
C
G
 
-
E
 
E
T
 
A
L
 
L
R
 
-
V
 
-
G
 
-
I
 
-
K
 
-
G
 
S
F
 
Y
P
 
V
A
 
D
L
 
Y
I
 
L
K
 
F
P
 
P
N
|
N
I
 
F
D
 
A
E
 
E
L
 
A
V
 
K
D
 
L
L
 
L
V
 
T
G
 
G
R
 
K
P
 
E
I
 
T
R
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
-
D
 
-
L
 
I
A
 
A
D
 
D
C
 
C
A
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
F
Q
 
L
Q
 
A
Q
 
C
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
H
 
T
I
 
V
V
 
V
V
 
I
S
x
K
N
 
T
G
|
G
A
 
K
E
 
D
G
|
G
V
 
-
H
 
-
W
 
C
F
 
F
S
 
I
P
 
K
R
 
R
G
 
G
A
 
D
W
 
M
K
 
T
A
 
M
R
 
K
V
 
V
P
 
P
K
x
A
V
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
I
K
 
T
V
 
A
V
 
I
S
 
D
T
|
T
V
 
I
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
N
L
 
F
V
 
A
A
 
S
G
 
G
L
 
F
C
 
I
A
 
A
G
 
A
L
 
L
L
 
L
E
 
E
G
 
G
R
 
K
D
 
N
E
 
L
A
 
R
F
 
E
T
 
C
L
 
A
R
 
R
R
 
F
A
 
A
V
x
N
A
 
A
L
 
T
S
x
A
I
 
A
M
 
I
A
 
S
V
 
V
T
 
L
Q
 
S
V
 
V
G
 
G
-
 
A
-
 
T
V
 
T
G
 
G
I
 
V
S
 
K
N
 
N
K
 
R
-
 
K
-
 
L
-
 
V
-
 
E
Q
 
Q
Q
 
L
L
 
L
N
 
E
D
 
E
Y
 
Y
Q
 
E

3kzhA Crystal structure of a putative sugar kinase from clostridium perfringens
24% identity, 86% coverage: 17:286/314 of query aligns to 23:287/316 of 3kzhA

query
sites
3kzhA
S
 
S
L
 
Y
K
 
R
P
 
P
L
 
Y
N
 
N
T
 
S
G
 
T
A
 
P
V
 
-
N
 
-
L
 
-
A
 
-
N
 
-
H
 
-
G
 
G
H
 
H
L
 
V
G
 
K
A
 
I
A
 
S
G
 
F
K
 
G
G
 
G
I
 
V
-
 
C
-
 
R
N
 
N
V
 
I
A
 
A
R
 
E
V
 
N
L
 
M
A
 
A
D
 
R
L
 
V
G
 
G
H
 
V
R
 
N
P
 
T
R
 
N
A
 
F
T
 
M
G
 
S
F
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
-
N
 
-
N
 
N
D
 
D
A
 
E
S
 
H
F
 
G
R
 
K
A
 
S
M
 
I
F
 
V
E
 
E
R
 
H
-
 
S
-
 
K
-
 
K
-
 
I
-
 
G
Y
 
Y
G
 
H
I
 
M
E
 
D
D
 
D
D
 
S
F
 
M
V
 
V
R
 
I
L
 
E
A
 
G
G
 
G
D
 
S
T
 
T
R
 
P
V
 
T
N
 
Y
V
 
L
K
 
A
I
 
I
S
 
L
E
 
D
E
 
E
G
 
N
G
 
G
R
 
E
V
 
M
T
 
V
D
 
S
I
 
A
N
 
I
L
 
A
P
 
D
G
 
M
L
 
K
Q
 
S
V
 
I
E
 
G
K
 
A
S
 
M
D
 
N
W
 
T
N
 
D
R
 
F
L
 
I
L
 
D
A
 
S
R
 
K
L
 
R
E
 
E
S
 
I
L
 
F
E
 
E
R
 
N
H
 
A
F
 
E
D
 
Y
T
 
T
L
 
V
V
 
L
V
 
D
A
 
S
G
 
D
S
 
N
L
 
-
P
 
-
P
 
-
G
 
-
V
 
-
Y
 
-
P
 
P
K
 
E
Q
 
I
L
 
M
E
 
E
G
 
Y
L
 
L
I
 
L
D
 
K
M
 
N
W
 
F
R
 
K
E
 
D
R
 
K
G
 
T
K
 
N
L
 
F
V
 
I
L
 
L
L
x
D
D
 
P
A
x
V
S
 
S
G
 
A
E
 
E
T
 
K
-
 
A
-
 
S
-
 
W
L
 
V
R
 
K
V
 
H
G
 
L
I
 
I
K
 
K
G
 
D
F
 
F
P
 
H
A
 
T
L
 
-
I
 
I
K
|
K
P
 
P
N
 
N
I
 
R
D
 
H
E
|
E
L
 
A
V
 
E
D
 
I
L
 
L
V
 
A
G
 
G
R
 
F
P
 
P
I
 
I
R
 
T
D
 
D
E
 
T
A
 
D
D
 
D
L
 
L
A
 
I
D
 
K
C
 
A
A
 
S
R
 
N
E
 
Y
L
 
F
Q
 
L
Q
 
G
Q
 
L
G
 
G
I
 
I
Q
 
K
H
 
K
I
 
V
V
 
F
V
 
I
S
 
S
N
 
L
G
 
D
A
 
A
E
 
D
G
 
G
V
 
I
H
 
F
W
 
Y
F
 
N
S
 
D
P
 
G
R
 
V
G
 
S
A
 
C
W
 
G
K
 
K
A
 
I
R
 
K
V
 
A
P
 
T
K
 
E
V
 
V
K
 
D
V
 
V
V
 
K
S
 
N
T
 
V
V
 
T
G
|
G
A
|
A
G
|
G
D
|
D
S
 
S
L
 
F
V
 
V
A
 
A
G
 
G
L
 
L
C
 
G
A
 
Y
G
 
G
L
 
Y
L
 
M
E
 
N
G
 
K
R
 
M
D
 
P
E
 
I
A
 
E
F
 
D
T
 
I
L
 
V
R
 
K
R
 
F
A
 
A
V
 
M
A
 
T
L
 
M
S
 
S
I
 
N
M
 
I
A
 
T
V
 
I
T
 
S
Q
 
H

7vteA Uridine bound structure of pseudouridine kinase (puki) from escherichia coli strain b (see paper)
34% identity, 33% coverage: 182:285/314 of query aligns to 177:281/302 of 7vteA

query
sites
7vteA
I
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
N
I
 
R
D
 
L
E
 
E
L
 
A
V
 
E
D
 
T
L
 
L
V
 
S
G
 
G
R
 
I
P
 
A
I
 
L
R
 
S
D
 
G
E
 
R
A
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
A
D
 
K
C
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
W
L
 
F
Q
 
H
Q
 
Q
Q
 
H
G
 
G
I
 
L
Q
 
N
H
 
R
I
 
L
V
 
V
V
 
L
S
 
S
N
 
M
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
V
H
 
Y
W
 
Y
F
 
S
S
 
D
P
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
E
-
 
N
A
 
G
W
 
W
K
 
S
A
 
A
R
 
P
V
 
I
P
 
-
K
 
K
V
 
T
K
 
N
V
 
V
V
 
I
S
 
N
T
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
L
 
M
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
S
G
 
C
L
 
W
L
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
M
D
 
P
E
 
F
A
 
A
F
 
E
T
 
S
L
 
V
R
 
R
R
 
F
A
 
A
V
 
Q
A
 
G
L
 
C
S
 
S
I
 
S
M
 
M
A
 
A
V
 
L
T
 
S

Sites not aligning to the query:

7w93A Crystal structure of e.Coli pseudouridine kinase psuk complexed with n1-methyl-pseudouridine (see paper)
34% identity, 33% coverage: 182:285/314 of query aligns to 183:287/307 of 7w93A

query
sites
7w93A
I
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
N
I
 
R
D
 
L
E
 
E
L
 
A
V
 
E
D
 
T
L
 
L
V
 
S
G
 
G
R
 
I
P
 
A
I
 
L
R
 
S
D
 
G
E
 
R
A
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
A
D
 
K
C
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
W
L
 
F
Q
 
H
Q
 
Q
Q
 
H
G
 
G
I
 
L
Q
 
N
H
 
R
I
 
L
V
 
V
V
 
L
S
 
S
N
 
M
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
V
H
 
Y
W
 
Y
F
 
S
S
 
D
P
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
E
-
 
N
A
 
G
W
 
W
K
 
S
A
 
A
R
 
P
V
 
I
P
 
-
K
 
K
V
 
T
K
 
N
V
 
V
V
 
I
S
 
N
T
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
L
 
M
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
S
G
 
C
L
 
W
L
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
M
D
 
P
E
 
F
A
 
A
F
 
E
T
 
S
L
 
V
R
 
R
R
 
F
A
 
A
V
 
Q
A
 
G
L
 
C
S
 
S
I
 
S
M
 
M
A
 
A
V
 
L
T
 
S

Sites not aligning to the query:

7vtfA Cytidine bound structure of pseudouridine kinase (puki) from escherichia coli strain b (see paper)
34% identity, 33% coverage: 182:285/314 of query aligns to 177:281/301 of 7vtfA

query
sites
7vtfA
I
 
L
K
 
K
P
 
P
N
 
N
I
 
R
D
 
L
E
 
E
L
 
A
V
 
E
D
 
T
L
 
L
V
 
S
G
 
G
R
 
I
P
 
A
I
 
L
R
 
S
D
 
G
E
 
R
A
 
D
D
 
D
L
 
V
A
 
A
D
 
K
C
 
V
A
 
A
R
 
A
E
 
W
L
 
F
Q
 
H
Q
 
Q
Q
 
H
G
 
G
I
 
L
Q
 
N
H
 
R
I
 
L
V
 
V
V
 
L
S
 
S
N
 
M
G
 
G
A
 
G
E
 
D
G
 
G
V
 
V
H
 
Y
W
 
Y
F
 
S
S
 
D
P
 
I
R
 
R
G
 
G
-
 
E
-
 
N
A
 
G
W
 
W
K
 
S
A
 
A
R
 
P
V
 
I
P
 
-
K
 
K
V
 
T
K
 
N
V
 
V
V
 
I
S
 
N
T
 
V
V
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
S
 
A
L
 
M
V
 
M
A
 
A
G
 
G
L
 
L
C
 
A
A
 
S
G
 
C
L
 
W
L
 
V
E
 
D
G
 
G
R
 
M
D
 
P
E
 
F
A
 
A
F
 
E
T
 
S
L
 
V
R
 
R
R
 
F
A
 
A
V
 
Q
A
 
G
L
 
C
S
 
S
I
 
S
M
 
M
A
 
A
V
 
L
T
 
S

Sites not aligning to the query:

Q8ZKR2 Aminoimidazole riboside kinase; AIRs kinase; EC 2.7.1.223 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (see paper)
28% identity, 86% coverage: 38:308/314 of query aligns to 31:314/319 of Q8ZKR2

query
sites
Q8ZKR2
G
|
G
K
 
A
G
 
S
I
 
A
N
 
N
V
 
V
A
 
G
R
 
V
V
 
C
L
 
V
A
 
A
D
 
R
L
 
L
G
 
G
H
 
G
R
 
E
P
 
C
R
 
G
A
 
F
T
 
I
G
 
G
F
 
C
L
 
L
G
 
G
L
 
D
N
 
D
N
 
D
D
 
A
A
 
G
S
 
R
F
 
F
-
 
L
R
 
R
A
 
Q
M
 
V
F
 
F
E
 
Q
R
 
D
Y
 
N
G
 
G
I
 
V
E
 
D
D
 
V
D
 
T
F
 
F
V
 
L
R
 
R
L
 
L
A
 
D
G
 
A
D
 
D
T
 
L
R
 
T
-
 
S
-
 
A
-
 
V
V
 
L
N
 
I
V
 
V
K
 
N
I
 
L
S
 
T
E
 
A
E
 
D
G
 
G
G
 
E
R
 
R
-
 
S
V
 
F
T
 
T
D
x
Y
I
 
L
N
 
V
L
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
A
Q
 
D
V
 
T
E
 
Y
K
 
V
S
 
S
D
 
P
W
 
Q
N
 
D
R
 
-
L
 
-
L
 
L
A
 
P
R
 
P
L
 
F
E
 
R
S
 
Q
L
 
Y
E
 
E
R
 
W
H
 
F
F
 
Y
D
 
F
T
 
S
L
 
S
V
 
I
V
 
G
A
 
L
G
 
T
S
 
D
L
 
R
P
 
P
P
 
-
G
 
-
V
 
A
Y
 
R
P
 
E
K
 
A
Q
 
C
L
 
L
E
 
E
G
 
G
L
 
A
I
 
R
D
 
R
M
 
M
W
 
-
R
 
R
E
 
E
R
 
A
G
 
G
K
 
G
L
 
Y
V
 
V
L
 
L
L
 
F
D
 
D
A
 
V
S
 
N
G
 
-
E
 
-
T
 
-
L
 
L
R
|
R
V
 
S
G
 
K
I
 
M
K
 
W
G
 
G
-
 
N
-
 
T
-
 
D
-
 
E
F
 
I
P
 
P
A
 
E
L
 
L
I
 
I
-
 
A
-
 
R
-
 
S
-
x
A
-
x
A
-
 
L
-
x
A
-
 
S
-
 
I
-
 
C
K
 
K
P
 
V
N
 
S
I
 
A
D
 
D
E
 
E
L
 
L
V
 
C
D
 
Q
L
 
L
V
 
S
G
 
G
R
 
-
P
 
-
I
 
-
R
 
-
D
 
-
E
 
A
A
 
S
D
 
H
L
 
W
A
 
Q
D
 
D
C
 
A
A
 
R
R
 
Y
E
 
Y
L
 
L
Q
 
R
Q
 
D
Q
 
L
G
|
G
I
 
C
Q
 
D
H
 
T
I
 
T
V
 
I
V
 
I
S
 
S
N
 
L
G
 
G
A
 
A
E
 
D
G
 
G
V
 
A
H
 
L
W
 
L
F
 
I
S
 
T
P
 
A
R
 
E
G
 
G
A
 
E
W
 
F
K
 
H
A
 
F
R
 
P
V
 
A
P
 
P
K
 
R
V
 
V
K
 
D
V
 
V
V
 
V
S
x
D
T
 
T
V
x
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
|
D
S
 
A
L
 
F
V
 
V
A
 
G
G
 
G
L
 
L
C
 
L
A
 
F
G
 
T
L
 
L
L
 
S
E
 
R
G
 
A
R
 
N
-
 
C
-
 
W
D
 
D
E
 
H
A
 
A
F
 
L
-
 
L
-
 
A
-
 
E
T
 
A
L
 
I
R
 
S
R
 
N
A
 
A
V
 
N
A
 
A
L
 
C
S
 
G
I
 
A
M
 
M
A
|
A
V
 
V
T
 
T
Q
x
A
V
 
K
G
|
G
-
 
A
-
 
M
V
 
T
G
 
A
I
 
L
S
 
P
N
 
F
K
 
P
Q
 
D
Q
 
Q
L
 
L
N
 
N
D
 
T
Y
 
F
Q
 
L
D
 
S
A
 
S
I
 
H
E
 
S
I
 
L
T
 
A
Q
 
Q

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_104485040.1 NCBI__GCF_002936955.1:WP_104485040.1
MSILTLTLNPALDLTVSLKPLNTGAVNLANHGHLGAAGKGINVARVLADLGHRPRATGFL
GLNNDASFRAMFERYGIEDDFVRLAGDTRVNVKISEEGGRVTDINLPGLQVEKSDWNRLL
ARLESLERHFDTLVVAGSLPPGVYPKQLEGLIDMWRERGKLVLLDASGETLRVGIKGFPA
LIKPNIDELVDLVGRPIRDEADLADCARELQQQGIQHIVVSNGAEGVHWFSPRGAWKARV
PKVKVVSTVGAGDSLVAGLCAGLLEGRDEAFTLRRAVALSIMAVTQVGVGISNKQQLNDY
QDAIEITQLEPSKV

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory