SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_104486719.1 NCBI__GCF_002936955.1:WP_104486719.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 17 hits to proteins with known functional sites (download)

4ga6A Crystal structure of amp phosphorylasE C-terminal deletion mutant in complex with substrates (see paper)
43% identity, 83% coverage: 67:485/502 of query aligns to 58:480/493 of 4ga6A

query
sites
4ga6A
H
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
I
S
 
S
N
 
R
I
 
D
A
 
V
W
 
L
Q
 
D
R
 
L
M
 
H
A
 
N
L
 
F
K
 
S
G
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
V
 
V
Q
 
S
I
 
V
S
 
I
H
 
P
A
 
A
P
 
G
L
 
T
L
 
P
H
 
E
S
 
S
M
 
V
S
 
R
A
 
Y
V
 
I
R
 
K
K
 
K
K
 
K
I
 
M
Y
 
H
G
 
G
H
 
E
T
 
K
L
 
L
S
 
R
S
 
K
R
 
V
E
 
E
I
 
I
H
 
E
D
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
V
A
 
D
H
 
R
R
 
K
Y
 
L
S
 
R
D
 
D
M
 
I
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
S
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
A
-
 
L
G
 
E
V
 
I
D
 
N
C
 
G
L
 
L
N
 
D
T
 
M
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
D
R
 
M
L
 
L
T
 
D
W
 
I
P
 
D
D
 
R
T
 
K
P
 
P
L
 
I
L
 
M
V
 
-
D
|
D
K
x
V
H
|
H
C
x
S
I
|
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
N
R
 
K
T
 
T
T
 
N
P
 
I
I
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
P
I
 
I
A
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
T
M
 
I
P
 
P
K
 
K
T
 
T
S
 
S
S
|
S
R
 
R
A
|
A
I
|
I
T
|
T
S
|
S
P
 
A
S
 
A
G
 
G
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
V
M
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
F
T
 
A
T
 
D
V
 
V
R
 
S
L
 
F
S
 
S
L
 
L
E
 
D
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
Q
 
R
T
 
I
V
 
V
R
 
E
K
 
K
V
 
V
N
 
G
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
V
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
D
 
D
M
 
I
L
 
T
I
 
I
R
 
K
I
x
A
E
 
E
H
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
S
I
 
I
D
|
D
G
 
P
V
 
T
G
 
G
Q
 
L
L
x
M
V
 
L
A
 
A
S
|
S
V
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
Y
A
 
A
A
 
M
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
H
 
Y
A
 
V
L
 
L
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
T
G
 
G
P
 
K
T
 
G
A
 
V
K
|
K
V
 
V
R
 
E
S
 
T
Q
 
V
H
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
H
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
R
L
 
D
F
 
F
D
 
I
T
 
E
V
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
N
 
Y
M
 
V
R
 
E
C
 
V
L
 
A
I
 
I
T
 
T
D
 
Y
G
 
G
A
 
G
E
 
Q
A
 
P
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
G
 
T
I
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
Q
 
R
D
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
A
L
 
L
N
 
M
N
 
T
E
 
-
P
 
G
E
 
K
A
 
G
P
 
P
A
 
G
D
 
S
L
 
L
R
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
T
F
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
N
 
I
L
 
L
L
 
L
N
 
E
L
 
M
A
 
G
G
 
G
G
 
V
A
 
A
S
 
P
L
 
A
E
 
G
V
 
T
A
 
G
Q
 
K
A
 
K
R
 
M
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
E
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
E
Q
 
K
F
 
M
K
 
K
Q
 
E
I
 
I
C
 
I
D
 
E
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
I
-
 
K
M
 
P
K
 
E
Q
 
E
I
 
I
P
 
P
Q
 
I
A
 
G
T
 
D
H
 
K
Q
 
T
L
 
Y
E
 
T
L
 
F
G
 
T
A
 
A
R
 
A
H
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
Y
L
 
V
L
 
T
A
 
A
M
 
I
D
 
D
N
 
N
R
 
R
R
 
A
L
 
I
S
 
T
R
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
I
 
E
S
 
D
P
 
K
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
E
L
 
L
H
 
Y
I
 
V
K
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
K
Q
 
E
H
 
G
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
F
T
 
T
L
 
I
Y
 
H
A
 
A
D
 
E
S
 
H
R
 
E
G
 
A
E
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
Q
A
 
A

Q5JCX3 AMP phosphorylase; AMPpase; Nucleoside monophosphate phosphorylase; NMP phosphorylase; EC 2.4.2.57 from Thermococcus kodakarensis (strain ATCC BAA-918 / JCM 12380 / KOD1) (Pyrococcus kodakaraensis (strain KOD1)) (see paper)
43% identity, 83% coverage: 67:485/502 of query aligns to 58:480/503 of Q5JCX3

query
sites
Q5JCX3
H
 
E
I
 
V
G
 
G
F
 
I
S
 
S
N
 
R
I
 
D
A
 
V
W
 
L
Q
 
D
R
 
L
M
 
H
A
 
N
L
 
F
K
 
S
G
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
V
 
V
Q
 
S
I
 
V
S
 
I
H
 
P
A
 
A
P
 
G
L
 
T
L
 
P
H
 
E
S
 
S
M
 
V
S
 
R
A
 
Y
V
 
I
R
 
K
K
 
K
K
 
K
I
 
M
Y
 
H
G
 
G
H
 
E
T
 
K
L
 
L
S
 
R
S
 
K
R
 
V
E
 
E
I
 
I
H
 
E
D
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
V
A
 
D
H
 
R
R
 
K
Y
 
L
S
 
R
D
 
D
M
 
I
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
S
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
A
-
 
L
G
 
E
V
 
I
D
 
N
C
 
G
L
 
L
N
 
D
T
 
M
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
D
R
 
M
L
 
L
T
 
D
W
 
I
P
 
D
D
 
R
T
 
K
P
 
P
L
 
I
L
 
M
V
 
-
D
 
D
K
 
V
H
 
H
C
 
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
N
R
 
K
T
 
T
T
 
N
P
 
I
I
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
P
I
 
I
A
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
T
M
 
I
P
 
P
K
 
K
T
 
T
S
 
S
S
|
S
R
|
R
A
|
A
I
|
I
T
|
T
S
|
S
P
 
A
S
 
A
G
 
G
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
V
M
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
F
T
 
A
T
 
D
V
 
V
R
 
S
L
 
F
S
 
S
L
 
L
E
 
D
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
Q
 
R
T
 
I
V
 
V
R
 
E
K
 
K
V
 
V
N
 
G
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
V
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
D
M
 
I
L
 
T
I
 
I
R
 
K
I
 
A
E
 
E
H
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
S
I
 
I
D
|
D
G
 
P
V
 
T
G
 
G
Q
 
L
L
 
M
V
 
L
A
 
A
S
|
S
V
 
I
L
 
M
S
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
Y
A
 
A
A
 
M
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
H
 
Y
A
 
V
L
 
L
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
T
G
 
G
P
 
K
T
 
G
A
 
V
K
|
K
V
 
V
R
 
E
S
 
T
Q
 
V
H
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
H
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
R
L
 
D
F
 
F
D
 
I
T
 
E
V
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
N
 
Y
M
 
V
R
 
E
C
 
V
L
 
A
I
 
I
T
 
T
D
 
Y
G
 
G
A
 
G
E
 
Q
A
 
P
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
G
 
T
I
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
Q
 
R
D
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
A
L
 
L
N
 
M
N
 
T
E
 
-
P
 
G
E
 
K
A
 
G
P
 
P
A
 
G
D
 
S
L
 
L
R
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
T
F
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
N
 
I
L
 
L
L
 
L
N
 
E
L
 
M
A
 
G
G
 
G
G
 
V
A
 
A
S
 
P
L
 
A
E
 
G
V
 
T
A
 
G
Q
 
K
A
 
K
R
 
M
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
E
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
E
Q
 
K
F
 
M
K
 
K
Q
 
E
I
 
I
C
 
I
D
 
E
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
I
-
 
K
M
 
P
K
 
E
Q
 
E
I
 
I
P
 
P
Q
 
I
A
 
G
T
 
D
H
 
K
Q
 
T
L
 
Y
E
 
T
L
 
F
G
 
T
A
 
A
R
 
A
H
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
Y
L
 
V
L
 
T
A
 
A
M
 
I
D
 
D
N
 
N
R
 
R
R
 
A
L
 
I
S
 
T
R
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
I
 
E
S
 
D
P
 
K
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
E
L
 
L
H
 
Y
I
 
V
K
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
K
Q
 
E
H
 
G
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
F
T
 
T
L
 
I
Y
 
H
A
 
A
D
 
E
S
 
H
R
 
E
G
 
A
E
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
Q
A
 
A

4ga4A Crystal structure of amp phosphorylase n-terminal deletion mutant (see paper)
44% identity, 78% coverage: 95:485/502 of query aligns to 2:396/418 of 4ga4A

query
sites
4ga4A
H
 
E
S
 
S
M
 
V
S
 
R
A
 
Y
V
 
I
R
 
K
K
 
K
K
 
K
I
 
M
Y
 
H
G
 
G
H
 
E
T
 
K
L
 
L
S
 
R
S
 
K
R
 
V
E
 
E
I
 
I
H
 
E
D
 
A
I
 
I
V
 
V
A
 
R
D
 
D
I
 
I
A
 
V
A
 
D
H
 
R
R
 
K
Y
 
L
S
 
R
D
 
D
M
 
I
Q
 
E
I
 
I
A
 
S
S
 
S
F
 
F
I
 
V
T
 
T
A
 
A
-
 
L
G
 
E
V
 
I
D
 
N
C
 
G
L
 
L
N
 
D
T
 
M
Q
 
D
E
 
E
I
 
I
I
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
I
A
 
A
M
 
M
V
 
A
A
 
E
S
 
T
G
 
G
K
 
D
R
 
M
L
 
L
T
 
D
W
 
I
P
 
D
D
 
R
T
 
K
P
 
P
L
 
I
L
 
M
V
 
-
D
|
D
K
x
V
H
|
H
C
x
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
N
R
 
K
T
 
T
T
x
N
P
 
I
I
 
L
V
 
V
V
 
V
A
 
P
I
 
I
A
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
A
G
 
G
L
 
L
V
 
T
M
 
I
P
 
P
K
 
K
T
 
T
S
 
S
S
 
S
R
 
R
A
 
A
I
 
I
T
 
T
S
 
S
P
 
A
S
 
A
G
 
G
T
|
T
A
 
A
D
 
D
T
 
V
M
 
V
E
 
E
V
 
V
L
 
F
T
 
A
T
 
D
V
 
V
R
 
S
L
 
F
S
 
S
L
 
L
E
 
D
Q
 
E
I
 
I
Q
 
K
Q
 
R
T
 
I
V
 
V
R
 
E
K
 
K
V
 
V
N
 
G
A
 
A
C
 
C
L
 
L
A
 
V
W
 
W
G
 
G
G
 
G
A
 
A
V
 
L
N
 
N
L
 
L
S
 
A
P
 
P
A
 
A
D
|
D
D
 
D
M
 
I
L
 
T
I
 
I
R
 
K
I
x
A
E
 
E
H
 
R
A
 
A
L
 
L
D
 
S
I
 
I
D
 
D
G
 
P
V
 
T
G
 
G
Q
 
L
L
 
M
V
 
L
A
 
A
S
|
S
V
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
Y
A
 
A
A
 
M
G
 
G
S
 
S
T
 
Q
H
 
Y
A
 
V
L
 
L
I
 
I
D
 
D
I
 
I
P
 
P
V
 
T
G
 
G
P
 
K
T
 
G
A
 
V
K
 
K
V
 
V
R
 
E
S
 
T
Q
 
V
H
 
E
E
 
E
A
 
A
R
 
R
H
 
S
L
 
L
A
 
A
G
 
R
L
 
D
F
 
F
D
 
I
T
 
E
V
 
L
G
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
L
G
 
G
L
 
Q
N
 
Y
M
 
V
R
 
E
C
 
V
L
 
A
I
 
I
T
 
T
D
 
Y
G
 
G
A
 
G
E
 
Q
A
 
P
I
 
I
G
 
G
Y
 
H
G
 
T
I
 
V
G
 
G
P
 
P
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
A
Q
 
R
D
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
S
V
 
A
L
 
L
N
 
M
N
 
T
E
 
-
P
 
G
E
 
K
A
 
G
P
 
P
A
 
G
D
 
S
L
 
L
R
 
I
E
 
E
R
 
K
A
 
A
L
 
T
F
 
G
L
 
L
A
 
A
A
 
G
N
 
I
L
 
L
L
 
L
N
 
E
L
 
M
A
 
G
G
 
G
G
 
V
A
 
A
S
 
P
L
 
A
E
 
G
V
 
T
A
 
G
Q
 
K
A
 
K
R
 
M
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
L
 
I
L
 
L
A
 
E
S
 
S
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
W
 
W
E
 
E
Q
 
K
F
 
M
K
 
K
Q
 
E
I
 
I
C
 
I
D
 
E
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
-
 
D
-
 
P
-
 
N
-
 
I
-
 
K
M
 
P
K
 
E
Q
 
E
I
 
I
P
 
P
Q
 
I
A
 
G
T
 
D
H
 
K
Q
 
T
L
 
Y
E
 
T
L
 
F
G
 
T
A
 
A
R
 
A
H
 
T
S
 
S
G
 
G
T
 
Y
L
 
V
L
 
T
A
 
A
M
 
I
D
 
D
N
 
N
R
 
R
R
 
A
L
 
I
S
 
T
R
 
A
L
 
I
A
 
A
K
 
R
L
 
A
A
 
A
G
 
G
A
 
A
P
 
P
I
 
E
S
 
D
P
 
K
A
 
G
A
 
A
G
 
G
L
 
I
R
 
E
L
 
L
H
 
Y
I
 
V
K
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
E
A
 
K
L
 
V
A
 
K
Q
 
E
H
 
G
Q
 
D
P
 
P
L
 
L
L
 
F
T
 
T
L
 
I
Y
 
H
A
 
A
D
 
E
S
 
H
R
 
E
G
 
A
E
 
R
L
 
L
D
 
D
Y
 
Q
A
 
A

7m7kB Crystal structure of uridine bound to geobacillus thermoglucosidasius pyrimidine nucleoside phosphorylase pynp
30% identity, 77% coverage: 95:479/502 of query aligns to 1:401/432 of 7m7kB

query
sites
7m7kB
H
 
H
S
 
H
M
 
V
S
 
D
A
 
L
V
 
I
R
 
A
K
 
K
K
 
K
I
 
R
Y
 
D
G
 
G
H
 
Y
T
 
E
L
 
L
S
 
S
S
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
I
H
 
D
D
 
F
I
 
I
V
 
I
A
 
R
D
 
G
I
 
Y
A
 
T
A
 
N
H
 
G
R
 
D
Y
 
I
S
 
P
D
 
D
M
 
Y
Q
 
Q
I
 
M
A
 
S
S
 
A
F
 
F
I
 
A
T
 
M
A
 
A
-
 
V
G
 
F
V
 
F
D
 
R
C
 
G
L
 
M
N
 
T
T
 
E
Q
 
E
E
 
E
I
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
M
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
R
S
 
S
G
 
G
K
 
D
R
 
V
L
 
I
T
 
D
W
 
L
P
 
S
D
 
K
T
 
I
P
 
E
-
 
G
L
 
M
L
 
K
V
 
V
D
 
D
K
 
K
H
 
H
C
 
S
I
x
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
-
G
 
G
N
 
D
R
 
T
T
 
T
T
 
T
P
 
L
I
 
V
V
 
L
V
 
G
A
 
P
I
 
L
A
 
V
S
 
A
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
P
M
 
V
P
 
A
K
 
K
T
 
M
S
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
G
I
 
L
T
 
G
S
 
H
P
 
T
S
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
I
D
 
D
T
 
K
M
 
L
E
 
E
V
 
S
L
 
V
T
 
P
T
 
G
-
 
F
-
 
H
V
 
V
R
 
E
L
 
I
S
 
D
L
 
N
E
 
E
Q
 
Q
I
 
F
Q
 
I
Q
 
E
T
 
L
V
 
V
R
 
N
K
 
K
V
 
-
N
 
N
A
 
K
C
 
I
L
 
A
A
 
I
W
 
I
G
 
G
G
 
Q
A
 
T
V
 
G
N
 
N
L
 
L
S
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
K
M
 
K
L
 
L
I
x
Y
R
 
A
I
 
L
E
x
R
H
 
D
A
 
V
L
 
T
-
 
A
D
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
I
G
 
P
Q
 
L
L
 
I
V
 
A
A
 
S
S
|
S
V
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
A
T
 
D
H
 
A
A
 
I
L
 
V
I
 
L
D
 
D
I
 
V
P
 
K
V
 
T
G
 
G
P
 
A
T
 
G
A
 
A
K
x
F
V
 
M
R
 
K
S
 
D
Q
 
F
H
 
A
E
 
G
A
 
A
R
 
K
H
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
T
L
 
A
F
 
M
D
 
V
T
 
E
V
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
R
N
 
K
M
 
T
R
 
M
C
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
S
D
 
D
G
 
M
A
 
S
E
 
Q
A
 
P
I
 
L
G
 
G
Y
 
Y
G
 
A
I
 
V
G
 
G
P
 
N
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
V
Q
 
K
D
 
E
I
 
A
L
 
I
A
 
D
V
 
T
L
 
L
N
 
K
N
 
G
E
 
-
P
 
-
E
 
K
A
 
G
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
Q
E
 
E
R
 
L
A
 
C
L
 
L
F
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
S
N
 
Y
L
 
M
L
 
V
N
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
K
A
 
A
-
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
E
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
R
 
L
A
 
L
Q
 
E
E
 
A
L
 
S
L
 
I
A
 
R
S
 
E
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
W
 
L
E
 
E
Q
 
T
F
 
F
K
 
K
Q
 
V
I
 
F
C
 
L
D
 
S
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
D
M
 
P
K
 
T
Q
 
K
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
T
 
K
H
 
Y
Q
 
R
L
 
W
E
 
E
L
 
L
G
 
E
A
 
A
R
 
P
H
 
E
S
 
D
G
 
G
T
 
Y
L
 
V
L
 
A
A
 
E
M
 
I
D
 
V
N
 
A
R
 
D
R
 
E
L
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
A
A
 
A
K
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
-
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
E
A
 
A
P
 
T
I
 
I
S
 
D
P
 
L
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
K
K
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
K
Q
 
K
H
 
G
Q
 
E
P
 
S
L
 
L
L
 
V
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
A
 
S
D
 
N
S
 
T
R
 
E

5olnB X-ray structure of the complex pyrimidine-nucleoside phosphorylase from bacillus subtilis at 1.88 a (see paper)
29% identity, 78% coverage: 102:491/502 of query aligns to 10:415/434 of 5olnB

query
sites
5olnB
K
 
K
K
 
K
I
 
Q
Y
 
N
G
 
G
H
 
K
T
 
E
L
 
L
S
 
T
S
 
T
R
 
E
E
 
E
I
 
I
H
 
Q
D
 
F
I
 
F
V
 
V
A
 
N
D
 
G
I
 
Y
A
 
T
A
 
D
H
 
G
R
 
S
Y
 
I
S
 
P
D
 
D
M
 
Y
Q
 
Q
I
 
A
A
 
S
S
 
A
F
 
L
I
 
A
T
 
M
A
 
A
-
 
I
G
 
F
V
 
F
D
 
Q
C
 
D
L
 
M
N
 
S
T
 
D
Q
 
R
E
 
E
I
 
R
I
 
A
A
 
D
L
 
L
T
 
T
Q
 
M
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
N
S
 
S
G
 
G
K
 
E
R
 
T
L
 
I
T
 
D
W
 
L
P
 
S
D
 
A
T
 
I
P
 
E
-
 
G
L
 
I
L
 
K
V
 
V
D
 
D
K
 
K
H
|
H
C
 
S
I
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
-
G
 
G
N
 
D
R
 
T
T
 
T
T
|
T
P
 
L
I
 
V
V
 
L
V
 
A
A
 
P
I
 
L
A
 
V
S
 
A
A
 
A
A
 
L
G
 
D
L
 
V
V
 
P
M
 
V
P
 
A
K
 
K
T
 
M
S
|
S
S
 
G
R
 
R
A
 
G
I
 
L
T
 
G
S
 
H
P
 
T
S
 
G
G
 
G
T
|
T
A
 
I
D
 
D
T
 
K
M
 
L
E
 
E
V
 
A
L
 
I
T
 
M
T
 
G
V
 
F
R
 
H
L
 
V
S
 
E
L
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
D
E
 
E
Q
 
F
I
 
I
Q
 
K
Q
 
L
T
 
V
V
 
N
R
 
R
K
 
D
V
 
K
N
 
V
A
 
A
C
 
V
L
 
I
A
 
G
W
 
Q
G
 
S
G
 
G
A
 
-
V
 
-
N
 
N
L
 
L
S
 
T
P
 
P
A
 
A
D
|
D
D
 
K
M
 
K
L
 
L
I
x
Y
R
 
A
I
 
L
E
x
R
H
 
D
A
 
V
L
 
T
-
 
G
D
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
S
V
 
I
G
 
P
Q
 
L
L
x
I
V
 
A
A
 
S
S
|
S
V
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
A
T
 
D
H
 
A
A
 
I
L
 
V
I
 
L
D
 
D
I
 
V
P
 
K
V
 
T
G
 
G
P
 
A
T
 
G
A
 
A
K
 
F
V
 
M
R
 
K
S
 
T
Q
 
E
H
 
E
E
 
D
A
 
A
R
 
A
H
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
A
F
 
M
D
 
V
T
 
R
V
 
I
G
 
G
K
 
N
A
 
N
L
 
V
G
 
G
L
 
R
N
 
Q
M
 
T
R
 
M
C
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
S
D
 
D
G
 
M
A
 
S
E
 
Q
A
 
P
I
 
L
G
 
G
Y
 
F
G
 
A
I
 
I
G
 
G
P
 
N
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
V
Q
 
K
D
 
E
I
 
A
L
 
I
A
 
D
V
 
T
L
 
L
N
 
K
N
 
G
E
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
G
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
L
R
 
H
E
 
E
R
 
L
A
 
V
L
 
L
F
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
S
N
 
Q
L
 
M
L
 
V
N
 
V
L
 
L
A
 
A
G
 
K
G
 
K
A
 
A
-
 
D
S
 
T
L
 
L
E
 
D
V
 
E
A
 
A
Q
 
R
A
 
A
R
 
K
A
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
V
L
 
M
A
 
K
S
 
N
G
 
G
Q
 
K
A
 
A
W
 
L
E
 
E
Q
 
K
F
 
F
K
 
K
Q
 
D
I
 
F
C
 
L
D
 
K
A
 
N
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
M
 
D
K
 
S
Q
 
S
I
 
I
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
P
-
 
S
-
 
K
-
 
L
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
T
 
A
H
 
Y
Q
 
Q
L
 
I
E
 
D
L
 
V
G
 
P
A
 
A
R
 
K
H
 
E
S
 
A
G
 
G
T
 
V
L
 
V
L
 
S
A
 
E
M
 
I
D
 
V
N
 
A
R
 
D
R
 
E
L
 
I
S
 
G
R
 
V
L
 
A
A
 
A
K
 
M
L
 
L
A
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
D
P
 
E
I
 
I
S
 
D
P
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
I
R
 
M
L
 
L
H
 
R
I
 
K
K
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
D
A
 
K
L
 
V
A
 
E
Q
 
K
H
 
G
Q
 
E
P
 
P
L
 
L
L
 
V
T
 
T
L
 
L
Y
 
Y
A
 
A
D
 
N
S
 
R
R
 
E
G
 
N
E
 
V
L
 
D
D
 
E
Y
 
V
A
 
I
A
 
A
A
 
K
Y
 
V
Y
 
Y
A
 
D
N
 
N

P77836 Pyrimidine-nucleoside phosphorylase; PYNP; Py-NPase; EC 2.4.2.2 from Geobacillus stearothermophilus (Bacillus stearothermophilus) (see paper)
29% identity, 78% coverage: 100:491/502 of query aligns to 7:414/433 of P77836

query
sites
P77836
V
 
I
R
 
E
K
 
K
K
 
K
I
 
R
Y
 
D
G
 
G
H
 
H
T
 
A
L
 
L
S
 
T
S
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
I
H
 
Q
D
 
F
I
 
I
V
 
I
-
 
E
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
K
A
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
D
H
 
Y
R
 
Q
Y
 
M
S
 
S
D
 
A
M
 
L
Q
 
A
I
 
M
A
 
A
S
 
I
F
 
F
I
 
F
T
 
R
A
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
M
N
 
N
T
 
E
Q
 
E
E
 
E
I
 
T
I
 
A
A
 
E
L
 
L
T
 
T
Q
 
M
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
H
S
 
S
G
 
G
K
 
D
R
 
T
L
 
I
T
 
D
W
 
L
P
 
S
D
 
R
T
 
I
P
 
E
-
 
G
L
 
I
L
 
K
V
 
V
D
 
D
K
|
K
H
|
H
C
x
S
I
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
-
G
|
G
N
 
D
R
x
T
T
 
T
T
|
T
P
 
L
I
 
V
V
 
L
V
 
G
A
 
P
I
 
L
A
 
V
S
 
A
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
P
M
 
V
P
 
A
K
|
K
T
x
M
S
|
S
S
 
G
R
 
R
A
 
G
I
 
L
T
 
G
S
 
H
P
 
T
S
 
G
G
 
G
T
|
T
A
 
I
D
 
D
T
 
K
M
 
L
E
 
E
V
 
S
L
 
V
T
 
P
T
 
G
-
 
F
-
 
H
V
 
V
R
 
E
L
 
I
S
 
T
L
 
N
E
 
D
Q
 
E
I
 
F
Q
 
I
Q
 
D
T
 
L
V
 
V
R
 
N
K
 
K
V
 
-
N
 
N
A
 
K
C
 
I
L
 
A
A
 
V
W
 
V
G
 
G
G
 
Q
A
 
S
V
 
G
N
 
N
L
 
L
S
 
T
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
K
M
 
K
L
 
L
I
 
Y
R
 
A
I
 
L
E
x
R
H
 
D
A
 
V
L
 
T
-
 
A
D
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
S
V
 
I
G
 
P
Q
 
L
L
 
I
V
 
A
A
 
S
S
 
S
V
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
A
T
 
D
H
 
A
A
 
I
L
 
V
I
 
L
D
 
D
I
 
V
P
 
K
V
 
T
G
 
G
P
 
V
T
 
G
A
 
A
K
 
F
V
 
M
R
 
K
S
 
D
Q
 
L
H
 
N
E
 
D
A
 
A
R
 
K
H
 
A
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
A
F
 
M
D
 
V
T
 
D
V
 
I
G
 
G
K
 
N
A
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
R
N
 
K
M
 
T
R
 
M
C
 
A
L
 
I
I
 
I
T
 
S
D
 
D
G
 
M
A
 
S
E
 
Q
A
 
P
I
x
L
G
 
G
Y
 
Y
G
x
A
I
 
I
G
 
G
P
 
N
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
V
Q
 
K
D
x
E
I
 
A
L
 
I
A
 
D
V
 
T
L
 
L
N
 
K
N
 
G
E
 
-
P
 
-
E
 
E
A
 
G
P
 
P
A
 
E
D
 
D
L
 
F
R
 
Q
E
 
E
R
 
L
A
 
C
L
 
L
F
 
V
L
 
L
A
 
G
A
 
S
N
 
H
L
 
M
L
 
V
N
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
K
A
 
A
-
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
E
V
 
E
A
 
A
Q
 
R
A
 
H
R
 
M
A
 
L
Q
 
E
E
 
K
L
 
A
L
 
M
A
 
K
S
 
D
G
 
G
Q
 
S
A
 
A
W
 
L
E
 
Q
Q
 
T
F
 
F
K
 
K
Q
 
T
I
 
F
C
 
L
D
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
M
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
D
-
 
P
K
 
S
Q
 
K
I
 
L
P
 
P
Q
 
Q
A
 
A
T
 
K
H
 
Y
Q
 
I
L
 
I
E
 
E
L
 
L
G
 
E
A
 
A
R
 
K
H
 
E
S
 
D
G
 
G
T
 
Y
L
 
V
L
 
S
A
 
E
M
 
I
D
 
V
N
 
A
R
 
D
R
 
A
L
 
V
S
 
G
R
 
T
L
 
A
A
 
A
K
 
M
L
 
W
A
 
L
G
 
G
A
 
A
-
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
T
-
 
K
-
 
E
-
 
S
P
 
T
I
 
I
S
 
D
P
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
L
R
 
V
L
 
L
H
 
R
I
 
K
K
 
K
L
 
V
G
 
G
Q
 
D
A
 
A
L
 
V
A
 
K
Q
 
K
H
 
G
Q
 
E
P
 
S
L
 
L
L
 
V
T
 
T
L
 
I
Y
 
Y
A
 
S
D
 
N
S
 
R
R
 
E
G
 
Q
E
 
V
L
 
D
D
 
D
Y
 
V
A
 
K
A
 
Q
A
 
K
Y
 
L
Y
 
Y
A
 
E
N
 
N

1brwB The crystal structure of pyrimidine nucleoside phosphorylase in a closed conformation (see paper)
29% identity, 76% coverage: 100:483/502 of query aligns to 7:406/433 of 1brwB

query
sites
1brwB
V
 
I
R
 
A
K
 
K
K
 
K
I
 
R
Y
 
D
G
 
G
H
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
T
S
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
I
H
 
E
D
 
W
I
 
I
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
N
A
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
D
H
 
Y
R
 
Q
Y
 
M
S
 
S
D
 
A
M
 
L
Q
 
A
I
 
M
A
 
A
S
 
I
F
 
Y
I
 
F
T
 
R
A
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
M
N
 
T
T
 
E
Q
 
E
E
 
E
I
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
M
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
E
R
 
M
L
 
L
T
 
D
W
 
L
P
 
S
D
 
S
T
 
I
P
 
R
-
 
G
L
 
V
L
 
K
V
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
C
x
S
I
x
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
-
G
|
G
N
 
D
R
 
T
T
 
T
T
|
T
P
 
L
I
 
V
V
 
L
V
 
G
A
 
P
I
 
L
A
 
V
S
 
A
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
P
M
 
V
P
 
A
K
|
K
T
 
M
S
|
S
S
 
G
R
 
R
A
 
G
I
x
L
T
 
G
S
 
H
P
 
T
S
 
G
G
 
G
T
|
T
A
 
I
D
 
D
T
 
K
M
 
L
E
 
E
V
 
S
L
 
V
T
 
P
T
 
G
-
 
F
-
 
H
V
 
V
R
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
K
E
 
D
Q
 
E
I
 
F
Q
 
I
Q
 
R
T
 
L
V
 
V
R
 
N
K
 
E
V
 
-
N
 
N
A
 
G
C
 
I
L
 
A
A
 
I
W
 
I
G
 
G
G
 
Q
A
 
T
V
 
G
N
 
D
L
 
L
S
 
T
P
 
P
A
 
A
D
|
D
D
 
K
M
 
K
L
 
L
I
x
Y
R
 
A
I
 
L
E
x
R
H
 
D
A
 
V
L
 
T
-
 
A
D
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
S
V
 
I
G
 
P
Q
 
L
L
x
I
V
 
A
A
 
S
S
|
S
V
x
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
A
T
 
D
H
 
A
A
 
I
L
 
V
I
 
L
D
 
D
I
 
V
P
 
K
V
 
T
G
 
G
P
 
A
T
 
G
A
 
A
K
 
F
V
 
M
R
 
K
S
 
K
Q
 
L
H
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
H
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
R
L
 
V
F
 
M
D
 
V
T
 
D
V
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
R
N
 
R
M
 
T
R
 
M
C
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
S
D
 
D
G
 
M
A
 
S
E
 
Q
A
 
P
I
x
L
G
 
G
Y
 
Y
G
x
A
I
 
V
G
 
G
P
 
N
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
V
Q
 
K
D
x
E
I
 
A
L
 
I
A
 
E
V
 
T
L
 
L
N
 
K
N
 
G
E
 
-
P
 
-
E
 
N
A
 
G
P
 
P
A
 
H
D
 
D
L
 
L
R
 
T
E
 
E
R
 
L
A
 
C
L
 
L
F
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
S
N
 
H
L
 
M
L
 
V
N
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
K
A
 
A
-
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
D
V
 
E
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
R
 
L
A
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
W
 
I
E
 
A
Q
 
A
F
 
F
K
 
K
Q
 
T
I
 
F
C
 
L
D
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
D
M
 
L
K
 
D
Q
 
K
I
 
L
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
T
 
A
H
 
Y
Q
 
T
L
 
S
E
 
T
L
 
V
G
 
T
A
 
A
R
 
A
H
 
A
S
 
D
G
 
G
T
 
Y
L
 
V
L
 
A
A
 
E
M
 
M
D
 
A
N
 
A
R
 
D
R
 
D
L
 
I
S
 
G
R
 
T
L
 
A
A
 
A
K
 
M
L
 
W
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
V
I
 
I
S
 
D
P
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
I
R
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
K
K
 
K
L
 
I
G
 
G
Q
 
D
A
 
R
L
 
V
A
 
Q
Q
 
K
H
 
G
Q
 
E
P
 
A
L
 
L
L
 
A
T
 
T
L
 
I
Y
 
H
A
 
S
D
 
N
S
 
R
R
 
P
G
 
D
E
 
V
L
 
L
D
 
D

1brwA The crystal structure of pyrimidine nucleoside phosphorylase in a closed conformation (see paper)
29% identity, 76% coverage: 100:483/502 of query aligns to 7:406/433 of 1brwA

query
sites
1brwA
V
 
I
R
 
A
K
 
K
K
 
K
I
 
R
Y
 
D
G
 
G
H
 
K
T
 
A
L
 
L
S
 
T
S
 
K
R
 
E
E
 
E
I
 
I
H
 
E
D
 
W
I
 
I
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
Y
-
 
T
-
 
N
A
 
G
D
 
D
I
 
I
A
 
P
A
 
D
H
 
Y
R
 
Q
Y
 
M
S
 
S
D
 
A
M
 
L
Q
 
A
I
 
M
A
 
A
S
 
I
F
 
Y
I
 
F
T
 
R
A
 
G
G
 
-
V
 
-
D
 
-
C
 
-
L
 
M
N
 
T
T
 
E
Q
 
E
E
 
E
I
 
T
I
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
T
Q
 
M
A
 
A
M
 
M
V
 
V
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
E
R
 
M
L
 
L
T
 
D
W
 
L
P
 
S
D
 
S
T
 
I
P
 
R
-
 
G
L
 
V
L
 
K
V
 
V
D
 
D
K
|
K
H
|
H
C
x
S
I
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
-
G
|
G
N
 
D
R
x
T
T
 
T
T
|
T
P
 
L
I
 
V
V
 
L
V
 
G
A
 
P
I
 
L
A
 
V
S
 
A
A
 
S
A
 
V
G
 
G
L
 
V
V
 
P
M
 
V
P
 
A
K
|
K
T
 
M
S
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
G
I
 
L
T
 
G
S
 
H
P
 
T
S
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
I
D
 
D
T
 
K
M
 
L
E
 
E
V
 
S
L
 
V
T
 
P
T
 
G
-
 
F
-
 
H
V
 
V
R
 
E
L
 
I
S
 
S
L
 
K
E
 
D
Q
 
E
I
 
F
Q
 
I
Q
 
R
T
 
L
V
 
V
R
 
N
K
 
E
V
 
-
N
 
N
A
 
G
C
 
I
L
 
A
A
 
I
W
 
I
G
 
G
G
 
Q
A
 
T
V
 
G
N
 
D
L
 
L
S
 
T
P
 
P
A
 
A
D
|
D
D
 
K
M
 
K
L
 
L
I
 
Y
R
 
A
I
 
L
E
x
R
H
 
D
A
 
V
L
 
T
-
 
A
D
 
T
I
 
V
D
 
N
G
 
S
V
 
I
G
 
P
Q
 
L
L
 
I
V
 
A
A
 
S
S
|
S
V
 
I
L
 
M
S
 
S
K
|
K
K
 
K
L
 
I
A
 
A
A
 
A
G
 
G
S
 
A
T
 
D
H
 
A
A
 
I
L
 
V
I
 
L
D
 
D
I
 
V
P
 
K
V
 
T
G
 
G
P
 
A
T
 
G
A
 
A
K
 
F
V
 
M
R
 
K
S
 
K
Q
 
L
H
 
D
E
 
E
A
 
A
R
 
R
H
 
R
L
 
L
A
 
A
G
 
R
L
 
V
F
 
M
D
 
V
T
 
D
V
 
I
G
 
G
K
 
K
A
 
R
L
 
V
G
 
G
L
 
R
N
 
R
M
 
T
R
 
M
C
 
A
L
 
V
I
 
I
T
 
S
D
 
D
G
 
M
A
 
S
E
 
Q
A
 
P
I
x
L
G
 
G
Y
 
Y
G
x
A
I
 
V
G
 
G
P
 
N
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
V
Q
 
K
D
x
E
I
 
A
L
 
I
A
 
E
V
 
T
L
 
L
N
 
K
N
 
G
E
 
-
P
 
-
E
 
N
A
 
G
P
 
P
A
 
H
D
 
D
L
 
L
R
 
T
E
 
E
R
 
L
A
 
C
L
 
L
F
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
S
N
 
H
L
 
M
L
 
V
N
 
Y
L
 
L
A
 
A
G
 
E
G
 
K
A
 
A
-
 
P
S
 
S
L
 
L
E
 
D
V
 
E
A
 
A
Q
 
R
A
 
R
R
 
L
A
 
L
Q
 
E
E
 
E
L
 
A
L
 
I
A
 
R
S
 
S
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
W
 
I
E
 
A
Q
 
A
F
 
F
K
 
K
Q
 
T
I
 
F
C
 
L
D
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
G
 
G
-
 
D
-
 
A
-
 
S
-
 
V
-
 
V
-
 
D
-
 
D
M
 
L
K
 
D
Q
 
K
I
 
L
P
 
P
Q
 
K
A
 
A
T
 
A
H
 
Y
Q
 
T
L
 
S
E
 
T
L
 
V
G
 
T
A
 
A
R
 
A
H
 
A
S
 
D
G
 
G
T
 
Y
L
 
V
L
 
A
A
 
E
M
 
M
D
 
A
N
 
A
R
 
D
R
 
D
L
 
I
S
 
G
R
 
T
L
 
A
A
 
A
K
 
M
L
 
W
A
 
L
G
 
G
A
 
A
P
 
G
-
 
R
-
 
A
-
 
K
-
 
K
-
 
E
-
 
D
-
 
V
I
 
I
S
 
D
P
 
L
A
 
A
A
 
V
G
 
G
L
 
I
R
 
V
L
 
L
H
 
H
I
 
K
K
 
K
L
 
I
G
 
G
Q
 
D
A
 
R
L
 
V
A
 
Q
Q
 
K
H
 
G
Q
 
E
P
 
A
L
 
L
L
 
A
T
 
T
L
 
I
Y
 
H
A
 
S
D
 
N
S
 
R
R
 
P
G
 
D
E
 
V
L
 
L
D
 
D

2wk6A Structural features of native human thymidine phosphorylase and in complex with 5-iodouracil (see paper)
29% identity, 75% coverage: 100:477/502 of query aligns to 6:409/446 of 2wk6A

query
sites
2wk6A
V
 
I
R
 
R
K
 
M
K
 
K
I
 
R
Y
 
D
G
 
G
H
 
G
T
 
R
L
 
L
S
 
S
S
 
E
R
 
A
E
 
D
I
 
I
H
 
R
D
 
G
I
 
F
V
 
V
A
 
A
D
 
A
I
 
V
A
 
V
A
 
N
H
 
G
R
 
S
Y
 
A
S
 
Q
D
 
G
M
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
S
 
A
F
 
M
I
 
L
T
 
M
A
 
A
-
 
I
G
 
R
V
 
L
D
 
R
C
 
G
L
 
M
N
 
D
T
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
T
I
 
S
A
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
M
 
L
V
 
A
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
R
 
Q
L
 
L
T
 
E
W
 
W
P
 
P
D
 
E
T
 
A
-
 
W
-
 
R
P
 
Q
L
 
Q
L
 
L
V
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
C
x
S
I
x
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
-
G
 
G
N
 
D
R
 
K
T
 
V
T
 
S
P
 
L
I
 
V
V
 
L
V
 
A
A
 
P
I
 
A
A
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
C
G
 
G
L
 
C
V
 
K
M
 
V
P
 
P
K
 
M
T
 
I
S
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
G
I
x
L
T
 
G
S
 
H
P
 
T
S
 
G
G
 
G
T
|
T
A
 
L
D
 
D
T
 
K
M
 
L
E
 
E
V
 
S
L
 
I
T
 
P
T
 
G
V
 
F
R
 
N
L
 
V
-
 
I
-
 
Q
S
 
S
L
 
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
M
Q
 
Q
Q
 
V
T
 
L
V
 
L
R
 
D
K
 
Q
V
 
A
N
 
G
A
 
C
C
 
C
L
 
I
A
 
V
W
 
-
G
 
G
G
 
Q
A
 
S
V
 
E
N
 
Q
L
 
L
S
 
V
P
 
P
A
 
A
D
|
D
D
 
G
M
 
I
L
 
L
I
x
Y
R
 
A
I
 
A
E
x
R
H
 
D
A
 
V
L
 
T
-
 
A
D
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
L
G
 
P
Q
 
L
L
x
I
V
 
T
A
 
A
S
|
S
V
x
I
L
 
L
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
G
 
G
S
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
L
L
 
V
I
 
V
D
 
D
I
 
V
P
 
K
V
 
F
G
 
G
P
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
V
V
 
F
R
 
P
S
 
N
Q
 
Q
H
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
H
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
T
F
 
L
D
 
V
T
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
A
A
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
R
M
 
V
R
 
A
C
 
A
L
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
A
G
 
M
A
 
D
E
 
K
A
 
P
I
 
L
G
 
G
Y
 
R
G
 
C
I
 
V
G
 
G
P
 
H
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
V
Q
 
E
D
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
C
L
 
M
N
 
D
N
 
G
E
 
-
P
 
-
E
 
A
A
 
G
P
 
P
A
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
L
A
 
V
L
 
T
F
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
G
N
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
W
L
 
L
A
 
S
G
 
G
G
 
H
A
 
A
S
 
G
L
 
T
E
 
Q
-
 
A
V
 
Q
A
 
G
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
V
Q
 
A
E
 
A
L
 
A
L
 
L
A
 
D
S
 
D
G
 
G
Q
 
S
A
 
A
W
 
L
E
 
G
Q
 
R
F
 
F
K
 
E
Q
 
R
I
 
M
C
 
L
D
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
G
 
G
M
 
L
K
 
A
Q
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
C
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
R
A
 
A
T
 
R
H
 
E
Q
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
A
S
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
P
L
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
V
N
 
L
R
 
H
R
 
E
L
 
L
S
 
G
R
 
A
L
 
G
A
 
R
K
 
S
L
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
E
P
 
P
I
 
L
S
 
R
P
 
L
A
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
A
R
 
E
L
 
L
H
 
L
I
 
V
K
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
R
Q
 
R
H
 
G
Q
 
T
P
 
P
L
 
W
L
 
L
T
 
R
L
 
V
Y
 
H
A
 
R
D
 
D

2j0fA Structural basis for non-competitive product inhibition in human thymidine phosphorylase: implication for drug design (see paper)
29% identity, 75% coverage: 100:477/502 of query aligns to 7:410/446 of 2j0fA

query
sites
2j0fA
V
 
I
R
 
R
K
 
M
K
 
K
I
 
R
Y
 
D
G
 
G
H
 
G
T
 
R
L
 
L
S
 
S
S
 
E
R
 
A
E
 
D
I
 
I
H
 
R
D
 
G
I
 
F
V
 
V
A
 
A
D
 
A
I
 
V
A
 
V
A
 
N
H
 
G
R
 
S
Y
 
A
S
 
Q
D
 
G
M
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
S
 
A
F
 
M
I
 
L
T
 
M
A
 
A
-
 
I
G
 
R
V
 
L
D
 
R
C
 
G
L
 
M
N
 
D
T
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
T
I
 
S
A
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
M
 
L
V
 
A
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
R
 
Q
L
 
L
T
 
E
W
 
W
P
 
P
D
 
E
T
 
A
-
 
W
-
 
R
P
 
Q
L
 
Q
L
 
L
V
 
V
D
|
D
K
|
K
H
|
H
C
x
S
I
x
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
-
G
 
G
N
 
D
R
 
K
T
 
V
T
 
S
P
 
L
I
 
V
V
 
L
V
 
A
A
 
P
I
 
A
A
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
C
G
 
G
L
 
C
V
 
K
M
 
V
P
 
P
K
 
M
T
 
I
S
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
G
I
x
L
T
 
G
S
 
H
P
 
T
S
 
G
G
 
G
T
|
T
A
 
L
D
 
D
T
 
K
M
 
L
E
 
E
V
 
S
L
 
I
T
 
P
T
 
G
V
 
F
R
 
N
L
 
V
-
 
I
-
 
Q
S
 
S
L
 
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
M
Q
 
Q
Q
 
V
T
 
L
V
 
L
R
 
D
K
 
Q
V
 
A
N
 
G
A
 
C
C
 
C
L
 
I
A
 
V
W
 
-
G
 
G
G
 
Q
A
 
S
V
 
E
N
 
Q
L
 
L
S
 
V
P
 
P
A
 
A
D
|
D
D
 
G
M
 
I
L
 
L
I
x
Y
R
 
A
I
 
A
E
x
R
H
 
D
A
 
V
L
 
T
-
 
A
D
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
L
G
 
P
Q
 
L
L
x
I
V
 
T
A
 
A
S
|
S
V
 
I
L
 
L
S
 
S
K
|
K
K
|
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
G
 
G
S
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
L
L
 
V
I
 
V
D
 
D
I
 
V
P
 
K
V
 
F
G
 
G
P
 
A
T
 
G
A
 
A
K
 
V
V
 
F
R
 
P
S
 
N
Q
 
Q
H
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
H
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
T
F
 
L
D
 
V
T
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
A
A
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
R
M
 
V
R
 
A
C
 
A
L
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
A
G
 
M
A
 
D
E
 
K
A
 
P
I
 
L
G
 
G
Y
 
R
G
 
C
I
 
V
G
 
G
P
 
H
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
V
Q
 
E
D
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
C
L
 
M
N
 
D
N
 
G
E
 
-
P
 
-
E
 
A
A
 
G
P
 
P
A
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
L
A
 
V
L
 
T
F
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
G
N
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
W
L
 
L
A
 
S
G
 
G
G
 
H
A
 
A
S
 
G
L
 
T
E
 
Q
-
 
A
V
 
Q
A
 
G
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
V
Q
 
A
E
 
A
L
 
A
L
 
L
A
 
D
S
 
D
G
 
G
Q
 
S
A
 
A
W
 
L
E
 
G
Q
 
R
F
 
F
K
 
E
Q
 
R
I
 
M
C
 
L
D
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
G
 
G
M
 
L
K
 
A
Q
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
C
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
R
A
 
A
T
 
R
H
 
E
Q
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
A
S
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
P
L
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
V
N
 
L
R
 
H
R
 
E
L
 
L
S
 
G
R
 
A
L
 
G
A
 
R
K
 
S
L
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
E
P
 
P
I
 
L
S
 
R
P
 
L
A
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
A
R
 
E
L
 
L
H
 
L
I
 
V
K
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
R
Q
 
R
H
 
G
Q
 
T
P
 
P
L
 
W
L
 
L
T
 
R
L
 
V
Y
 
H
A
 
R
D
 
D

P19971 Thymidine phosphorylase; TP; Gliostatin; Platelet-derived endothelial cell growth factor; PD-ECGF; TdRPase; EC 2.4.2.4 from Homo sapiens (Human) (see 3 papers)
29% identity, 75% coverage: 100:477/502 of query aligns to 40:443/482 of P19971

query
sites
P19971
V
 
I
R
 
R
K
 
M
K
 
K
I
 
R
Y
 
D
G
 
G
H
 
G
T
 
R
L
 
L
S
 
S
S
 
E
R
 
A
E
 
D
I
 
I
H
 
R
D
 
G
I
 
F
V
 
V
A
 
A
D
 
A
I
 
V
A
 
V
A
 
N
H
 
G
R
 
S
Y
 
A
S
 
Q
D
 
G
M
 
A
Q
 
Q
I
 
I
A
 
G
S
 
A
F
 
M
I
 
L
T
 
M
A
 
A
-
 
I
G
 
R
V
 
L
D
 
R
C
 
G
L
 
M
N
 
D
T
 
L
Q
 
E
E
 
E
I
 
T
I
 
S
A
 
V
L
 
L
T
 
T
Q
 
Q
A
 
A
M
 
L
V
 
A
A
 
Q
S
 
S
G
 
G
K
 
Q
R
 
Q
L
 
L
T
 
E
W
 
W
P
 
P
D
 
E
T
 
A
-
 
W
-
 
R
P
 
Q
L
 
Q
L
 
L
V
 
V
D
 
D
K
 
K
H
 
H
C
 
S
I
 
T
G
 
G
G
 
G
V
 
V
P
 
-
G
 
G
N
 
D
R
 
K
T
 
V
T
 
S
P
 
L
I
 
V
V
 
L
V
 
A
A
 
P
I
 
A
A
 
L
S
 
A
A
 
A
A
 
C
G
 
G
L
 
C
V
 
K
M
 
V
P
 
P
K
 
M
T
 
I
S
 
S
S
 
G
R
 
R
A
 
G
I
 
L
T
 
G
S
 
H
P
 
T
S
 
G
G
 
G
T
 
T
A
 
L
D
 
D
T
 
K
M
 
L
E
 
E
V
 
S
L
 
I
T
 
P
T
 
G
V
 
F
R
 
N
L
 
V
-
 
I
-
 
Q
S
 
S
L
 
P
E
 
E
Q
 
Q
I
 
M
Q
 
Q
Q
 
V
T
 
L
V
 
L
R
 
D
K
 
Q
V
 
A
N
 
G
A
 
C
C
 
C
L
 
I
A
 
V
W
 
-
G
 
G
G
 
Q
A
 
S
V
 
E
N
 
Q
L
 
L
S
 
V
P
 
P
A
 
A
D
 
D
D
 
G
M
 
I
L
 
L
I
x
Y
R
 
A
I
 
A
E
 
R
H
 
D
A
 
V
L
 
T
-
 
A
D
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
S
V
 
L
G
 
P
Q
 
L
L
 
I
V
 
T
A
 
A
S
 
S
V
 
I
L
 
L
S
 
S
K
 
K
K
 
K
L
 
L
A
 
V
A
 
E
G
 
G
S
 
L
T
 
S
H
 
A
A
 
L
L
 
V
I
 
V
D
 
D
I
 
V
P
 
K
V
 
F
G
 
G
P
 
G
T
 
A
A
 
A
K
 
V
V
 
F
R
 
P
S
 
N
Q
 
Q
H
 
E
E
 
Q
A
 
A
R
 
R
H
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
K
L
 
T
F
 
L
D
 
V
T
 
G
V
 
V
G
 
G
K
 
A
A
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
R
M
 
V
R
 
A
C
 
A
L
 
A
I
 
L
T
 
T
D
 
A
G
 
M
A
 
D
E
 
K
A
 
P
I
 
L
G
 
G
Y
 
R
G
 
C
I
 
V
G
 
G
P
 
H
A
 
A
Q
 
L
E
 
E
A
 
V
Q
 
E
D
 
E
I
 
A
L
 
L
A
 
L
V
 
C
L
 
M
N
 
D
N
 
G
E
 
-
P
 
-
E
 
A
A
 
G
P
 
P
A
 
P
D
 
D
L
 
L
R
 
R
E
 
D
R
 
L
A
 
V
L
 
T
F
 
T
L
 
L
A
 
G
A
 
G
N
 
A
L
 
L
L
 
L
N
 
W
L
 
L
A
 
S
G
 
G
G
 
H
A
 
A
S
 
G
L
 
T
E
 
Q
-
 
A
V
 
Q
A
 
G
Q
 
A
A
 
A
R
 
R
A
 
V
Q
 
A
E
 
A
L
 
A
L
 
L
A
 
D
S
 
D
G
 
G
Q
 
S
A
 
A
W
 
L
E
 
G
Q
 
R
F
 
F
K
 
E
Q
 
R
I
 
M
C
 
L
D
 
A
A
 
A
Q
 
Q
G
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
P
G
 
G
M
 
L
K
 
A
Q
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
C
-
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
P
-
 
A
-
 
E
-
 
R
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
I
 
L
P
 
P
Q
 
R
A
 
A
T
 
R
H
 
E
Q
 
Q
L
 
E
E
 
E
L
 
L
G
 
L
A
 
A
R
 
P
H
 
A
S
 
D
G
 
G
T
 
T
L
 
V
-
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
R
-
 
A
-
 
L
-
 
P
L
 
L
A
 
A
M
 
L
D
 
V
N
 
L
R
 
H
R
 
E
L
 
L
S
 
G
R
 
A
L
 
G
A
 
R
K
 
S
L
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
E
P
 
P
I
 
L
S
 
R
P
 
L
A
 
G
A
 
V
G
 
G
L
 
A
R
 
E
L
 
L
H
 
L
I
 
V
K
 
D
L
 
V
G
 
G
Q
 
Q
A
 
R
L
 
L
A
 
R
Q
 
R
H
 
G
Q
 
T
P
 
P
L
 
W
L
 
L
T
 
R
L
 
V
Y
 
H
A
 
R
D
 
D