SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_106709892.1 NCBI__GCF_003010955.1:WP_106709892.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

5bshA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with l-proline (see paper)
30% identity, 94% coverage: 12:260/266 of query aligns to 15:272/272 of 5bshA

query
sites
5bshA
G
 
G
A
 
A
G
 
G
W
 
K
L
 
M
G
 
A
S
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
A
V
 
V
H
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
S
P
 
P
R
 
S
D
 
R
L
 
I
T
 
K
C
 
T
S
 
A
Y
 
I
R
 
H
S
 
S
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
R
R
 
R
M
 
T
P
 
A
E
 
F
N
 
E
T
 
S
I
 
I
G
 
G
C
 
I
A
 
T
W
 
V
T
 
L
S
 
S
D
 
S
N
 
N
G
 
D
E
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
S
 
D
S
 
S
N
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
V
L
 
F
S
 
S
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
Q
D
 
L
W
 
L
M
 
K
S
 
D
V
 
V
N
 
V
A
 
L
D
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
A
 
T
G
 
K
G
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
V
 
M
A
 
K
D
 
D
I
 
L
K
 
Q
E
 
E
R
 
W
F
 
A
G
 
G
T
 
H
V
 
E
R
 
R
V
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
V
L
 
M
P
 
P
N
 
N
A
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
T
I
 
V
G
 
G
F
 
E
S
 
A
Y
 
A
T
 
S
P
 
V
Y
 
M
F
 
S
M
 
L
Q
 
G
-
 
G
H
 
A
P
 
A
Q
 
T
Q
 
E
G
 
E
D
 
D
L
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
R
 
G
S
 
S
C
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
D
 
-
A
 
W
V
 
K
A
 
A
E
 
D
E
 
D
S
 
K
H
 
Y
I
 
F
D
 
D
Y
 
A
F
 
I
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
D
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
S
A
 
L
A
 
A
E
 
S
Q
 
Q
V
 
T
I
 
V
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
S
L
 
M
Q
 
A
E
 
T
A
 
Q
H
 
S
G
 
G
V
 
K
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
D
F
x
V
V
 
T
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
|
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
H
A
 
E
M
 
L
R
 
E
Q
 
K
M
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
M
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
K
K
 
R
A
 
S
Q
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
S

5bsgA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NADP+ (see paper)
30% identity, 94% coverage: 12:260/266 of query aligns to 15:272/272 of 5bsgA

query
sites
5bsgA
G
|
G
A
 
A
G
|
G
W
x
K
L
x
M
G
 
A
S
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
A
V
 
V
H
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
S
P
 
P
R
 
S
D
 
R
L
 
I
T
 
K
C
 
T
S
 
A
Y
 
I
R
x
H
S
|
S
-
x
N
-
 
P
-
 
A
-
 
R
R
 
R
M
 
T
P
 
A
E
 
F
N
 
E
T
 
S
I
 
I
G
 
G
C
 
I
A
 
T
W
 
V
T
 
L
S
 
S
D
 
S
N
|
N
G
 
D
E
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
S
 
D
S
 
S
N
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
V
L
 
F
S
|
S
V
|
V
R
x
K
P
 
P
N
 
Q
D
x
L
W
 
L
M
 
K
S
 
D
V
|
V
N
 
V
A
 
L
D
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
A
 
T
G
 
K
G
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
S
V
|
V
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
V
 
M
A
 
K
D
 
D
I
 
L
K
 
Q
E
 
E
R
 
W
F
 
A
G
 
G
T
 
H
V
 
E
R
 
R
V
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
V
L
 
M
P
|
P
N
 
N
A
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
T
I
 
V
G
 
G
F
 
E
S
 
A
Y
 
A
T
 
S
P
 
V
Y
 
M
F
 
S
M
 
L
Q
 
G
-
 
G
H
 
A
P
 
A
Q
 
T
Q
 
E
G
 
E
D
 
D
L
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
R
 
G
S
 
S
C
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
D
 
-
A
 
W
V
 
K
A
 
A
E
 
D
E
 
D
S
 
K
H
 
Y
I
 
F
D
 
D
Y
 
A
F
 
I
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
D
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
S
A
 
L
A
 
A
E
 
S
Q
 
Q
V
 
T
I
 
V
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
S
L
 
M
Q
 
A
E
 
T
A
 
Q
H
 
S
G
 
G
V
 
K
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
D
F
 
V
V
 
T
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
H
A
 
E
M
 
L
R
 
E
Q
 
K
M
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
M
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
K
K
 
R
A
 
S
Q
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
S

5bsfA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) in complex with NAD+ (see paper)
30% identity, 94% coverage: 12:260/266 of query aligns to 15:272/272 of 5bsfA

query
sites
5bsfA
G
|
G
A
 
A
G
|
G
W
x
K
L
x
M
G
 
A
S
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
A
V
 
V
H
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
S
P
 
P
R
 
S
D
 
R
L
 
I
T
 
K
C
 
T
S
 
A
Y
 
I
R
x
H
S
 
S
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
R
R
 
R
M
 
T
P
 
A
E
 
F
N
 
E
T
 
S
I
 
I
G
 
G
C
 
I
A
 
T
W
 
V
T
 
L
S
 
S
D
 
S
N
|
N
G
 
D
E
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
S
 
D
S
 
S
N
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
V
L
 
F
S
|
S
V
|
V
R
x
K
P
 
P
N
 
Q
D
x
L
W
 
L
M
 
K
S
 
D
V
|
V
N
 
V
A
 
L
D
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
A
 
T
G
 
K
G
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
S
V
|
V
M
 
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
V
 
M
A
 
K
D
 
D
I
 
L
K
 
Q
E
 
E
R
 
W
F
 
A
G
 
G
T
 
H
V
 
E
R
 
R
V
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
V
L
 
M
P
|
P
N
 
N
A
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
T
I
 
V
G
 
G
F
 
E
S
 
A
Y
 
A
T
 
S
P
 
V
Y
 
M
F
 
S
M
 
L
Q
 
G
-
 
G
H
 
A
P
 
A
Q
 
T
Q
 
E
G
 
E
D
 
D
L
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
R
 
G
S
 
S
C
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
D
 
-
A
 
W
V
 
K
A
 
A
E
 
D
E
 
D
S
 
K
H
 
Y
I
 
F
D
 
D
Y
 
A
F
 
I
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
D
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
S
A
 
L
A
 
A
E
 
S
Q
 
Q
V
 
T
I
 
V
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
S
L
 
M
Q
 
A
E
 
T
A
 
Q
H
 
S
G
 
G
V
 
K
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
D
F
 
V
V
 
T
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
H
A
 
E
M
 
L
R
 
E
Q
 
K
M
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
M
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
K
K
 
R
A
 
S
Q
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
S

5bseA Crystal structure of medicago truncatula (delta)1-pyrroline-5- carboxylate reductase (mtp5cr) (see paper)
30% identity, 94% coverage: 12:260/266 of query aligns to 15:272/272 of 5bseA

query
sites
5bseA
G
 
G
A
 
A
G
 
G
W
 
K
L
 
M
G
 
A
S
 
E
A
 
S
I
 
I
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
A
V
 
V
H
 
R
S
 
S
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
S
P
 
P
R
 
S
D
 
R
L
 
I
T
 
K
C
 
T
S
 
A
Y
 
I
R
 
H
S
 
S
-
 
N
-
 
P
-
 
A
-
 
R
R
 
R
M
 
T
P
 
A
E
 
F
N
 
E
T
 
S
I
 
I
G
 
G
C
 
I
A
 
T
W
 
V
T
 
L
S
 
S
D
 
S
N
 
N
G
 
D
E
 
D
L
 
V
V
 
V
D
 
R
S
 
D
S
 
S
N
 
N
V
 
V
I
 
V
I
 
V
L
 
F
S
 
S
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
Q
D
 
L
W
 
L
M
 
K
S
 
D
V
 
V
N
 
V
A
 
L
D
 
K
-
 
L
-
 
K
-
 
P
-
 
L
-
 
L
A
 
T
G
 
K
G
 
D
K
 
K
L
 
L
V
 
L
V
 
V
S
 
S
V
 
V
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
K
V
 
M
A
 
K
D
 
D
I
 
L
K
 
Q
E
 
E
R
 
W
F
 
A
G
 
G
T
 
H
V
 
E
R
 
R
V
 
F
A
 
I
R
 
R
A
 
V
L
 
M
P
 
P
N
 
N
A
 
T
A
 
A
A
 
A
E
 
T
I
 
V
G
 
G
F
 
E
S
 
A
Y
 
A
T
 
S
P
 
V
Y
 
M
F
 
S
M
 
L
Q
 
G
-
 
G
H
 
A
P
 
A
Q
 
T
Q
 
E
G
 
E
D
 
D
L
 
A
E
 
N
I
 
L
V
 
I
G
 
S
A
 
Q
I
 
L
F
 
F
R
 
G
S
 
S
C
 
I
G
 
G
E
 
K
V
 
I
D
 
-
A
 
W
V
 
K
A
 
A
E
 
D
E
 
D
S
 
K
H
 
Y
I
 
F
D
 
D
Y
 
A
F
 
I
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
A
A
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
A
R
 
A
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
D
I
 
L
A
 
A
R
 
L
R
 
S
A
 
L
A
 
A
E
 
S
Q
 
Q
V
 
T
I
 
V
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
S
L
 
M
Q
 
A
E
 
T
A
 
Q
H
 
S
G
 
G
V
 
K
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
D
F
 
V
V
 
T
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
V
I
 
H
A
 
E
M
 
L
R
 
E
Q
 
K
M
 
A
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
G
V
 
I
V
 
L
G
 
M
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
V
A
 
A
A
 
A
C
 
A
R
 
K
K
 
R
A
 
S
Q
 
Q
A
 
E
L
 
L
S
 
S

2ahrE Crystal structures of 1-pyrroline-5-carboxylate reductase from human pathogen streptococcus pyogenes (see paper)
25% identity, 97% coverage: 2:259/266 of query aligns to 1:259/259 of 2ahrE

query
sites
2ahrE
T
 
S
N
 
N
V
 
A
G
 
M
R
 
K
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
V
G
|
G
W
x
K
L
x
M
G
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
I
K
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
K
H
 
Q
S
 
T
G
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
P
R
 
H
D
 
E
L
 
L
T
 
I
C
 
I
S
 
S
-
x
G
-
x
S
-
 
S
-
 
L
Y
 
E
R
|
R
S
 
S
R
 
K
M
 
E
P
 
I
E
 
A
N
 
E
T
 
Q
I
 
L
G
 
A
C
 
L
A
 
P
W
 
Y
T
 
A
S
 
M
D
 
S
N
x
H
G
 
Q
E
 
D
L
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
Q
S
 
V
N
 
D
V
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
G
V
x
I
R
 
K
P
|
P
N
 
Q
D
x
L
W
 
F
M
 
E
S
 
T
V
 
V
N
 
L
A
 
K
D
 
P
A
 
L
G
 
H
G
 
F
K
 
K
L
 
Q
-
 
P
V
 
I
V
 
I
S
 
S
V
x
M
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
I
P
 
S
V
 
L
A
 
Q
D
 
R
I
 
L
K
 
A
E
 
T
R
 
F
F
 
V
G
 
G
T
 
Q
-
 
D
V
 
L
R
 
P
V
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
I
L
x
M
P
|
P
N
 
N
A
 
M
A
 
N
A
 
A
E
 
Q
I
 
I
G
 
L
F
 
Q
S
 
S
Y
 
S
T
 
T
P
 
A
Y
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
A
F
 
L
M
 
V
Q
 
S
H
 
Q
P
 
E
Q
 
L
Q
 
Q
G
 
A
D
 
R
L
 
V
E
 
R
I
 
D
V
 
L
G
 
T
A
 
D
I
 
S
F
 
F
R
 
G
S
 
S
C
 
T
G
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
S
E
 
E
S
 
K
H
 
D
I
 
F
D
 
D
Y
 
T
F
 
F
T
 
T
A
 
A
M
 
L
S
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
S
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
F
A
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
K
D
 
A
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
K
G
 
A
I
 
K
A
 
A
R
 
L
R
 
E
A
 
I
A
 
V
E
 
T
Q
 
Q
V
 
T
I
 
V
I
 
L
G
 
A
A
 
S
G
 
A
R
 
S
L
 
N
Q
 
L
E
 
K
A
 
T
H
 
S
G
 
S
V
 
Q
S
 
S
P
 
P
A
 
H
A
 
D
A
 
F
V
 
I
K
 
D
S
 
A
F
 
I
V
 
C
D
 
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
M
A
 
E
M
 
L
R
 
E
Q
 
R
M
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
T
S
 
A
V
 
T
V
 
V
G
 
S
A
 
S
G
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
K
A
 
T
C
 
I
R
 
D
K
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L

2ag8A NADP complex of pyrroline-5-carboxylate reductase from neisseria meningitidis (see paper)
29% identity, 94% coverage: 12:260/266 of query aligns to 7:259/263 of 2ag8A

query
sites
2ag8A
G
|
G
A
 
G
G
|
G
W
x
N
L
x
M
G
 
A
S
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
A
K
 
G
A
 
G
L
 
L
V
 
V
H
 
K
S
 
Q
G
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
R
-
 
I
T
 
Y
V
 
I
A
|
A
P
x
N
R
|
R
D
x
G
L
 
-
T
 
-
C
 
A
S
 
E
Y
x
K
R
 
R
S
 
E
R
 
R
M
 
L
P
 
-
E
 
E
N
 
K
T
 
E
I
 
L
G
 
G
C
 
V
A
 
E
W
 
T
T
 
S
S
 
A
D
 
T
N
 
L
G
 
P
E
 
E
L
 
L
V
 
-
D
 
H
S
 
S
S
 
D
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
I
L
 
L
S
x
A
V
|
V
R
x
K
P
 
P
N
 
Q
D
 
D
W
 
M
M
 
E
S
 
A
V
x
A
-
 
C
-
 
K
N
 
N
A
 
I
D
 
R
A
 
T
G
 
N
G
 
G
K
 
A
L
 
L
V
 
V
V
 
L
S
 
S
V
|
V
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
L
P
 
S
V
 
V
A
 
G
D
 
T
I
 
L
K
 
S
E
 
R
R
 
Y
F
 
L
G
 
G
-
 
G
T
 
T
V
 
R
R
 
R
V
 
I
A
 
V
R
 
R
A
 
V
L
x
M
P
|
P
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
G
E
 
K
I
 
I
G
 
G
F
 
L
S
 
G
Y
 
V
T
 
S
P
 
G
Y
 
M
F
 
Y
M
 
A
Q
 
E
-
 
A
H
 
E
P
 
V
Q
 
S
Q
 
E
G
 
T
D
 
D
L
 
R
E
 
R
I
 
I
V
 
A
G
 
D
A
 
R
I
 
I
F
 
M
R
 
K
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
L
V
 
T
D
 
V
A
 
W
V
 
L
A
 
D
E
 
D
E
 
E
S
 
E
H
 
K
I
 
M
D
 
H
Y
 
G
F
 
I
T
 
T
A
 
G
M
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
V
A
 
F
L
 
Y
L
 
L
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
Q
M
 
N
D
 
A
A
 
A
I
 
I
E
 
R
R
 
Q
G
 
G
I
 
F
P
 
D
A
 
M
G
 
A
I
 
E
A
 
A
R
 
R
R
 
A
A
 
L
A
 
S
E
 
L
Q
 
A
V
 
T
I
 
F
I
 
K
G
 
G
A
 
A
G
 
V
R
 
A
L
 
L
Q
 
A
E
 
E
A
 
Q
H
 
T
G
 
G
V
 
E
S
 
D
P
 
F
A
 
E
A
 
K
A
 
L
V
 
Q
K
 
K
S
 
N
F
 
V
V
 
T
D
 
S
Y
 
K
K
 
G
G
 
G
T
 
T
T
 
T
A
 
H
A
 
E
G
 
A
I
 
V
I
 
E
A
 
A
M
 
F
R
 
R
Q
 
R
M
 
H
G
 
R
F
 
V
A
 
A
S
 
E
V
 
A
V
 
I
G
 
S
A
 
E
G
 
G
L
 
V
D
 
C
A
 
A
A
 
C
C
 
V
R
 
R
K
 
R
A
 
S
Q
 
Q
A
 
E
L
 
M
S
 
E

Sites not aligning to the query:

2amfA Crystal structure of 1-pyrroline-5-carboxylate reductase from human pathogen streptococcus pyogenes (see paper)
25% identity, 95% coverage: 6:259/266 of query aligns to 3:257/257 of 2amfA

query
sites
2amfA
R
 
K
V
 
I
G
 
G
I
 
I
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
V
G
 
G
W
 
K
L
x
M
G
 
A
S
 
S
A
 
A
I
 
I
A
 
I
K
 
K
A
 
G
L
 
L
V
 
K
H
 
Q
S
 
T
G
 
-
T
 
-
V
 
-
A
 
-
P
 
P
R
 
H
D
 
E
L
 
L
T
 
I
C
 
I
S
 
S
-
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
L
Y
 
E
R
 
R
S
 
S
R
 
K
M
 
E
P
 
I
E
 
A
N
 
E
T
 
Q
I
 
L
G
 
A
C
 
L
A
 
P
W
 
Y
T
 
A
S
 
M
D
 
S
N
 
H
G
 
Q
E
 
D
L
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
Q
S
 
V
N
 
D
V
 
L
I
 
V
I
 
I
L
 
L
S
 
G
V
 
I
R
 
K
P
 
P
N
 
Q
D
 
L
W
 
F
M
 
E
S
 
T
V
 
V
N
 
L
A
 
K
D
 
P
A
 
L
G
 
H
G
 
F
K
 
K
L
 
Q
-
 
P
V
 
I
V
 
I
S
 
S
V
 
M
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
S
V
 
L
A
 
Q
D
 
R
I
 
L
K
 
A
E
 
T
R
 
F
F
 
V
G
 
G
T
 
Q
-
 
D
V
 
L
R
 
P
V
 
L
A
 
L
R
 
R
A
 
I
L
x
M
P
|
P
N
 
N
A
 
M
A
 
N
A
 
A
E
 
Q
I
 
I
G
 
L
F
 
Q
S
 
S
Y
 
S
T
 
T
P
 
A
Y
 
L
-
 
T
-
 
G
-
 
N
-
 
A
F
 
L
M
 
V
Q
 
S
H
 
Q
P
 
E
Q
 
L
Q
 
Q
G
 
A
D
 
R
L
 
V
E
 
R
I
 
D
V
 
L
G
 
T
A
 
D
I
 
S
F
 
F
R
 
G
S
 
S
C
 
T
G
 
F
E
 
D
V
 
I
D
 
-
A
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
S
E
 
E
S
 
K
H
 
D
I
 
F
D
 
D
Y
 
T
F
 
F
T
 
T
A
 
A
M
 
L
S
 
A
G
 
G
S
 
S
G
 
S
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
I
A
 
Y
L
 
L
L
 
F
A
 
I
E
 
E
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
K
D
 
A
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
N
G
 
G
I
 
I
P
 
P
A
 
K
G
 
A
I
 
K
A
 
A
R
 
L
R
 
E
A
 
I
A
 
V
E
 
T
Q
 
Q
V
 
T
I
 
V
I
 
L
G
 
A
A
 
S
G
 
A
R
 
S
L
 
N
Q
 
L
E
 
K
A
 
T
H
 
S
G
 
S
V
 
Q
S
 
S
P
 
P
A
 
H
A
 
D
A
 
F
V
 
I
K
 
D
S
 
A
F
 
I
V
 
C
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
|
G
T
|
T
T
|
T
A
 
I
A
 
A
G
 
G
I
 
L
I
 
M
A
 
E
M
 
L
R
 
E
Q
 
R
M
 
L
G
 
G
F
 
L
A
 
T
S
 
A
V
 
T
V
 
V
G
 
S
A
 
S
G
 
A
L
 
I
D
 
D
A
 
K
A
 
T
C
 
I
R
 
D
K
 
K
A
 
A
Q
 
K
A
 
S
L
 
L

6xp1A Structure of human pycr1 complexed with l-thiazolidine-2-carboxylate (see paper)
25% identity, 94% coverage: 10:259/266 of query aligns to 3:261/266 of 6xp1A

query
sites
6xp1A
I
 
V
G
 
G
G
 
F
A
 
I
G
 
G
W
 
Q
L
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
 
M
P
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
 
V
V
 
S
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

6xp2A Structure of human pycr1 complexed with l-thiazolidine-4-carboxylate (see paper)
25% identity, 94% coverage: 10:259/266 of query aligns to 3:261/267 of 6xp2A

query
sites
6xp2A
I
 
V
G
 
G
G
 
F
A
 
I
G
 
G
W
 
Q
L
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
 
M
P
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
x
V
V
 
S
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

6xp0A Structure of human pycr1 complexed with n-formyl l-proline (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 5:267/272 of 6xp0A

query
sites
6xp0A
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
A
G
 
G
W
 
Q
L
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
 
M
P
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
x
V
V
 
S
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

2graA Crystal structure of human pyrroline-5-carboxylate reductase complexed with NADP (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 5:270/277 of 2graA

query
sites
2graA
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
A
G
 
G
W
 
Q
L
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
 
M
P
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
x
R
F
x
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
x
S
S
|
S
C
 
V
G
|
G
E
x
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
x
L
A
x
H
H
x
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
 
V
V
 
S
D
 
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

2gr9A Crystal structure of p5cr complexed with nadh (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 5:270/277 of 2gr9A

query
sites
2gr9A
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
A
G
 
G
W
 
Q
L
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
 
M
P
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
x
R
F
x
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
x
S
S
 
S
C
 
V
G
|
G
E
x
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
x
L
A
x
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
 
V
V
 
S
D
 
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

8tcuA Structure of pycr1 complexed with 2-chloro-5-(2-oxoimidazolidin-1-yl) benzoic acid (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 10:275/279 of 8tcuA

query
sites
8tcuA
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
A
G
 
G
W
 
Q
L
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
x
A
V
|
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
x
M
P
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
 
V
V
 
S
D
 
S
Y
 
P
K
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

8tcvB Structure of pycr1 complexed with 4-bromobenzene-1,3-dicarboxylic acid (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 9:274/279 of 8tcvB

query
sites
8tcvB
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
A
G
 
G
W
 
Q
L
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
 
M
P
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
 
V
V
 
S
D
 
S
Y
 
P
K
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

6xp3A Structure of human pycr1 complexed with cyclopentanecarboxylic acid (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 6:271/276 of 6xp3A

query
sites
6xp3A
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
A
G
 
G
W
 
Q
L
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
 
M
P
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
|
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
 
V
V
 
S
D
 
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

5uauA Structure of human pycr-1 complexed with proline (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 3:268/274 of 5uauA

query
sites
5uauA
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
A
G
 
G
W
 
Q
L
 
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
 
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
 
M
P
 
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
x
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
|
E
E
|
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
 
V
V
 
S
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

8td6B Structure of pycr1 complexed with nadh and 2-(methylthio)acetic acid (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 9:274/281 of 8td6B

query
sites
8td6B
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
-
A
|
A
G
|
G
W
x
Q
L
|
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
 
S
-
x
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
|
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
x
A
V
|
V
R
x
K
P
 
P
N
 
H
D
x
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
x
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
x
M
P
x
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
|
G
S
|
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
 
V
V
 
S
D
 
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

8td3A Structure of pycr1 complexed with nadh and (s)-tetrahydro-2h-pyran-2- carboxylic acid (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 9:274/281 of 8td3A

query
sites
8td3A
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
-
A
|
A
G
|
G
W
x
Q
L
|
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
x
S
-
x
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
|
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
x
A
V
|
V
R
x
K
P
 
P
N
 
H
D
x
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
x
M
P
x
T
N
 
N
A
x
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
|
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
x
V
V
 
S
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

8tcyA Structure of pycr1 complexed with 7-fluoro-2-oxo-1,2,3,4- tetrahydroquinoline-6-carboxylic acid (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 10:275/281 of 8tcyA

query
sites
8tcyA
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
 
G
G
 
-
A
 
A
G
 
G
W
 
Q
L
|
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
 
S
-
 
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
 
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
 
A
V
 
V
R
 
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
 
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
M
 
A
A
 
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
x
M
P
x
T
N
 
N
A
 
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
 
V
V
 
S
D
 
S
Y
 
P
K
 
G
G
 
G
T
 
A
T
 
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

8tdcA Structure of pycr1 complexed with nadh and 1,3-dithiane-2-carboxylic acid (see paper)
26% identity, 95% coverage: 7:259/266 of query aligns to 4:269/276 of 8tdcA

query
sites
8tdcA
V
 
V
G
 
G
I
 
F
I
 
I
G
|
G
G
 
-
A
|
A
G
|
G
W
x
Q
L
|
L
G
 
A
S
 
F
A
 
A
I
 
L
A
 
A
K
 
K
A
 
G
L
 
F
V
 
T
H
 
A
S
 
A
G
 
G
T
 
V
V
 
L
A
 
A
P
 
A
R
 
H
D
 
K
L
 
I
T
 
M
C
 
A
S
 
S
-
x
S
-
x
P
-
 
D
-
 
M
-
 
D
Y
 
L
R
 
A
S
 
T
R
 
V
M
 
S
P
 
A
E
 
L
N
 
R
T
 
K
I
 
M
G
 
G
C
 
V
A
 
K
W
 
L
T
 
T
S
 
P
D
 
H
N
|
N
G
 
K
E
 
E
L
 
T
V
 
V
D
 
Q
S
 
H
S
 
S
N
 
D
V
 
V
I
 
L
I
 
F
L
 
L
S
x
A
V
|
V
R
x
K
P
 
P
N
 
H
D
 
I
W
 
I
M
 
P
S
 
F
V
x
I
N
 
L
A
 
D
D
 
E
A
 
I
G
 
G
G
 
A
-
 
D
-
 
I
-
 
E
-
 
D
-
 
R
K
 
H
L
 
I
V
 
V
V
 
V
S
 
S
V
x
C
M
x
A
A
|
A
G
 
G
V
 
V
P
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
S
I
 
I
K
 
E
E
 
K
R
 
K
F
 
L
G
 
S
T
 
A
V
 
F
R
 
R
-
 
P
-
 
A
-
 
P
-
 
R
V
 
V
A
 
I
R
 
R
A
 
C
L
x
M
P
x
T
N
 
N
A
x
T
A
 
P
A
 
V
E
 
V
I
 
V
G
 
R
F
 
E
S
 
G
Y
 
A
T
 
T
P
 
V
Y
 
Y
F
 
A
M
 
T
-
 
G
Q
 
T
H
 
H
P
 
A
Q
 
Q
Q
 
V
G
 
E
D
 
D
L
 
G
E
 
R
I
 
L
V
 
M
G
 
E
A
 
Q
I
 
L
F
 
L
R
 
S
S
 
S
C
 
V
G
 
G
E
 
F
V
 
C
D
 
T
A
 
E
V
 
V
A
 
-
E
 
E
E
 
E
S
 
D
H
 
L
I
 
I
D
 
D
Y
 
A
F
 
V
T
 
T
A
 
G
M
 
L
S
 
S
G
 
G
S
 
S
G
 
G
A
 
P
A
 
A
F
 
Y
P
 
A
A
 
F
L
 
T
L
 
A
A
 
L
E
 
D
A
 
A
M
 
L
M
 
A
M
 
D
D
 
G
A
 
G
I
 
V
E
 
K
R
 
M
G
 
G
I
 
L
P
 
P
A
 
R
G
 
R
I
 
L
A
 
A
R
 
V
R
 
R
A
 
L
A
 
G
E
 
A
Q
 
Q
V
 
A
I
 
L
I
 
L
G
 
G
A
 
A
G
 
A
R
 
K
L
 
M
Q
 
L
E
 
L
A
 
H
H
 
S
G
 
E
V
 
Q
S
 
H
P
 
P
A
 
G
A
 
Q
A
 
L
V
 
K
K
 
D
S
 
N
F
x
V
V
 
S
D
x
S
Y
 
P
K
 
G
G
|
G
T
x
A
T
|
T
A
 
I
A
 
H
G
 
A
I
 
L
I
 
H
A
 
V
M
 
L
R
 
E
Q
 
S
M
 
G
G
 
G
F
 
F
A
 
R
S
 
S
V
 
L
V
 
L
G
 
I
A
 
N
G
 
A
L
 
V
D
 
E
A
 
A
A
 
S
C
 
C
R
 
I
K
 
R
A
 
T
Q
 
R
A
 
E
L
 
L

Query Sequence

>WP_106709892.1 NCBI__GCF_003010955.1:WP_106709892.1
MTNVGRVGIIGGAGWLGSAIAKALVHSGTVAPRDLTCSYRSRMPENTIGCAWTSDNGELV
DSSNVIILSVRPNDWMSVNADAGGKLVVSVMAGVPVADIKERFGTVRVARALPNAAAEIG
FSYTPYFMQHPQQGDLEIVGAIFRSCGEVDAVAEESHIDYFTAMSGSGAAFPALLAEAMM
MDAIERGIPAGIARRAAEQVIIGAGRLQEAHGVSPAAAVKSFVDYKGTTAAGIIAMRQMG
FASVVGAGLDAACRKAQALSIRPEED

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory