SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_106710555.1 NCBI__GCF_003010955.1:WP_106710555.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 16 hits to proteins with known functional sites (download)

3e49A Crystal structure of a prokaryotic domain of unknown function (duf849) with a tim barrel fold (bxe_c0966) from burkholderia xenovorans lb400 at 1.75 a resolution
34% identity, 97% coverage: 6:297/301 of query aligns to 1:299/307 of 3e49A

query
sites
3e49A
N
 
S
R
 
R
E
 
K
V
 
V
F
 
I
I
 
I
T
 
T
C
 
C
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
I
D
 
H
T
 
T
T
 
P
G
 
S
R
 
M
S
 
S
D
 
P
K
 
Y
V
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
T
P
 
P
R
 
D
Q
 
E
I
 
V
A
 
A
D
 
Q
E
 
A
C
 
S
I
 
I
A
 
G
A
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
I
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
R
T
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
P
S
 
T
R
 
Q
D
 
D
V
 
P
A
 
A
L
 
A
Y
 
F
A
 
A
E
 
E
V
 
F
V
 
L
E
 
P
H
 
R
I
 
I
K
 
K
A
 
-
S
 
S
G
 
N
V
 
T
D
 
D
M
 
A
V
 
V
L
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
T
G
 
G
M
 
G
G
 
S
G
 
P
D
 
H
L
 
M
T
 
T
L
 
V
G
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
R
H
 
P
V
 
A
A
 
T
K
 
H
L
 
Y
R
 
M
P
 
P
E
 
E
I
 
L
C
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
N
C
 
M
G
 
G
T
 
S
M
 
M
N
 
N
F
 
F
G
 
G
-
 
L
-
 
Y
-
 
P
-
 
M
-
 
L
-
 
E
-
 
R
-
 
F
-
 
K
-
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
H
-
 
G
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
E
-
 
H
-
 
L
-
 
E
-
 
R
E
 
S
G
 
R
D
 
D
Y
 
L
V
 
V
M
 
F
T
 
K
N
 
N
T
 
T
P
 
F
A
 
A
M
 
D
L
 
I
K
 
E
A
 
F
M
 
I
A
 
L
A
 
K
Q
 
T
I
 
C
K
 
G
A
 
G
L
 
N
G
 
G
V
 
T
R
 
R
P
 
F
E
 
E
V
 
F
E
 
E
I
 
C
F
 
Y
D
 
D
T
 
T
G
 
S
H
 
H
L
 
L
L
 
Y
L
 
N
A
 
L
K
 
A
W
 
H
L
 
F
Y
 
V
D
 
D
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
A
E
 
T
D
 
P
P
 
P
V
 
F
M
 
F
V
 
V
Q
 
Q
L
 
T
C
 
V
M
 
F
G
 
G
I
 
L
P
 
L
W
 
G
G
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
P
A
 
H
P
 
P
D
 
E
D
 
D
I
 
L
N
 
A
T
 
H
L
 
M
L
 
R
A
 
R
L
 
T
T
 
A
N
 
D
N
 
R
L
 
L
-
 
F
P
 
G
S
 
A
N
 
D
W
 
Y
T
 
V
F
 
W
S
 
S
A
 
I
F
 
L
S
 
G
I
 
A
G
 
G
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
M
 
I
P
 
P
Y
 
L
A
 
A
A
 
S
M
 
I
A
 
G
M
 
A
L
 
A
A
 
Q
G
 
G
G
 
A
N
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
|
E
D
 
D
T
 
S
I
 
L
W
 
W
L
 
I
D
 
A
K
 
P
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
A
-
 
E
T
 
T
N
 
N
G
 
A
P
 
A
L
 
Q
V
 
V
E
 
R
R
 
K
A
 
I
V
 
R
K
 
Q
V
 
V
A
 
I
E
 
E
G
 
G
M
 
L
G
 
S
A
 
L
R
 
E
I
 
V
L
 
A
G
 
S
P
 
P
N
 
A
E
 
E
V
 
A
R
 
R
E
 
T
R
 
M
M
 
L
K
 
G
L
 
L

3lotD Crystal structure of protein of unknown function (np_070038.1) from archaeoglobus fulgidus at 1.89 a resolution
34% identity, 96% coverage: 9:297/301 of query aligns to 7:305/313 of 3lotD

query
sites
3lotD
V
 
V
F
 
I
I
 
V
T
 
T
C
 
C
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
I
D
 
H
T
 
T
T
 
P
G
 
S
R
 
M
S
 
S
D
 
P
K
 
Y
V
 
L
P
 
P
V
 
V
T
 
T
P
 
P
R
 
D
Q
 
Q
I
 
I
A
 
V
D
 
E
E
 
E
C
 
A
I
 
V
A
 
K
A
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
I
 
M
A
 
V
H
|
H
I
 
I
H
|
H
V
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
K
T
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
P
S
 
T
R
 
T
D
 
D
V
 
V
A
 
E
L
 
V
Y
 
F
A
 
R
E
 
Y
V
 
I
V
 
C
E
 
R
H
 
E
I
 
I
K
 
K
A
 
K
S
 
Q
G
 
S
V
 
-
D
 
D
M
 
V
V
 
V
L
 
I
N
 
N
L
 
V
T
 
T
A
 
T
G
 
G
M
 
G
G
 
G
G
 
G
D
 
T
L
 
L
T
 
G
L
 
I
G
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
P
A
 
V
T
 
E
E
 
E
R
 
R
L
 
A
E
 
K
H
 
V
V
 
V
A
 
P
K
 
A
L
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
I
C
 
A
T
 
T
L
 
F
D
 
N
C
 
M
G
 
G
T
 
S
M
 
M
N
 
N
F
 
F
G
 
A
-
 
I
-
 
H
-
 
P
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
K
-
 
Y
-
 
K
-
 
E
-
 
F
-
 
K
-
 
Y
-
 
D
-
 
W
-
 
E
-
 
P
-
 
E
-
 
Y
-
 
L
-
 
E
-
 
M
E
 
T
G
 
R
D
 
D
Y
 
I
V
 
V
M
 
F
T
 
R
N
 
N
T
 
T
P
 
F
A
 
K
M
 
D
L
 
L
K
 
E
A
 
A
M
 
L
A
 
S
A
 
R
Q
 
I
I
 
F
K
 
K
A
 
E
L
 
N
G
 
D
V
 
T
R
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
L
E
 
E
I
 
C
F
 
Y
D
 
D
T
 
I
G
 
G
H
 
Q
L
 
I
L
 
Y
L
 
N
A
 
T
K
 
A
W
 
F
L
 
M
Y
 
F
D
 
H
Q
 
E
K
 
G
L
 
Y
L
 
L
E
 
E
D
 
P
P
 
P
V
 
L
M
 
R
V
 
L
Q
 
Q
L
 
F
C
 
I
M
 
H
G
 
G
I
 
I
P
 
L
W
 
G
G
 
G
-
 
I
-
 
G
-
 
T
A
 
A
P
 
V
D
 
E
D
 
D
I
 
V
N
 
L
T
 
F
L
 
M
L
 
K
A
 
Q
L
 
T
T
 
A
N
 
D
N
 
R
L
 
L
-
 
I
-
 
G
P
 
R
S
 
E
N
 
N
W
 
Y
T
 
T
F
 
W
S
 
S
A
 
L
F
 
V
S
 
G
I
 
A
G
 
G
R
 
R
N
 
F
Q
 
Q
M
 
M
P
 
P
Y
 
L
A
 
G
A
 
T
M
 
L
A
 
A
M
 
V
L
 
I
A
 
M
G
 
G
G
 
G
N
 
D
I
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
|
E
D
 
D
T
 
S
I
 
L
W
 
Y
L
 
I
D
 
E
K
 
R
G
 
G
V
 
K
L
 
L
A
 
A
-
 
K
T
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
E
L
 
Q
V
 
V
E
 
E
R
 
K
A
 
M
V
 
V
K
 
R
V
 
I
A
 
V
E
 
K
G
 
E
M
 
L
G
 
G
A
 
K
R
 
R
I
 
P
L
 
A
G
 
T
P
 
P
N
 
D
E
 
E
V
 
V
R
 
R
E
 
E
R
 
I
M
 
L
K
 
G
L
 
L

3e02A Crystal structure of a duf849 family protein (bxe_c0271) from burkholderia xenovorans lb400 at 1.90 a resolution
32% identity, 98% coverage: 6:300/301 of query aligns to 4:304/310 of 3e02A

query
sites
3e02A
N
 
S
R
 
K
E
 
K
V
 
I
F
 
I
I
 
I
T
 
T
C
 
C
A
 
A
V
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
I
D
 
H
T
 
T
T
 
P
G
 
T
R
 
M
S
 
S
D
 
P
K
 
Y
V
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
E
Q
 
E
I
 
I
A
 
V
D
 
K
E
 
E
C
 
G
I
 
V
A
 
A
A
 
A
A
 
A
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
M
A
 
L
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
A
R
 
R
D
 
D
P
 
P
K
 
L
T
 
N
G
 
G
K
 
R
G
 
P
S
 
S
R
 
Q
D
 
D
V
 
P
A
 
D
L
 
L
Y
 
F
A
 
M
E
 
R
V
 
F
V
 
L
E
 
P
H
 
Q
I
 
L
K
 
K
A
 
E
S
 
R
G
 
-
V
 
T
D
 
D
M
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
L
 
I
T
 
T
A
 
T
G
 
G
M
 
G
G
 
G
G
 
L
D
 
G
L
 
M
T
 
S
L
 
L
G
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
D
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
A
H
 
P
V
 
A
A
 
R
K
 
A
L
 
A
R
 
R
P
 
P
E
 
E
I
 
V
C
 
A
T
 
S
L
 
M
D
 
N
C
 
M
G
 
G
T
 
S
M
 
L
N
 
N
F
 
F
-
 
N
-
 
I
-
 
S
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
K
-
 
F
-
 
D
-
 
T
-
 
F
-
 
K
-
 
F
-
 
D
-
 
W
-
 
E
-
 
R
-
 
P
-
 
Y
-
 
L
-
 
A
G
 
G
E
 
T
G
 
R
D
 
D
Y
 
F
V
 
I
M
 
L
T
 
S
N
 
N
T
 
T
P
 
F
A
 
S
M
 
Q
L
 
I
K
 
E
A
 
R
M
 
G
A
 
M
A
 
T
Q
 
E
I
 
L
K
 
G
A
 
A
L
 
S
G
 
G
V
 
T
R
 
R
P
 
F
E
 
E
V
 
F
E
 
E
I
 
C
F
 
Y
D
 
D
T
 
V
G
 
G
H
 
H
L
 
L
L
 
Y
L
 
N
A
 
L
K
 
A
W
 
H
L
 
F
Y
 
V
D
 
D
Q
 
R
K
 
K
L
 
L
L
 
V
E
 
E
D
 
P
P
 
P
V
 
F
M
 
F
V
 
L
Q
 
Q
L
 
C
C
 
V
M
 
F
G
 
G
I
 
I
P
 
L
W
 
G
G
 
G
A
 
I
P
 
G
D
 
A
D
 
D
I
 
P
N
 
E
T
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
H
L
 
M
T
 
R
N
 
T
N
 
I
-
 
A
-
 
D
-
 
R
-
 
L
L
 
F
P
 
G
S
 
Q
N
 
D
W
 
Y
T
 
Y
F
 
L
S
 
S
A
 
V
F
 
L
S
 
A
I
 
A
G
 
G
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
M
 
M
P
 
P
Y
 
F
A
 
V
A
 
T
M
 
M
A
 
S
M
 
A
L
 
I
A
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
N
I
 
V
R
 
R
V
 
V
G
 
G
L
 
L
E
|
E
D
 
D
T
 
S
I
 
L
W
 
Y
L
 
S
D
 
G
K
 
K
G
 
G
V
 
Q
L
 
L
A
 
A
T
 
T
-
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
E
L
 
Q
V
 
V
E
 
R
R
 
K
A
 
I
V
 
R
K
 
R
V
 
I
A
 
I
E
 
E
G
 
E
M
 
L
G
 
S
A
 
L
R
 
D
I
 
I
L
 
A
G
 
T
P
 
P
N
 
D
E
 
E
V
 
A
R
 
R
E
 
A
R
 
M
M
 
L
K
 
K
L
 
-
T
 
T
K
 
K
G
 
G

B0VHH0 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme; EC 2.3.1.247 from Cloacimonas acidaminovorans (strain Evry) (see paper)
30% identity, 97% coverage: 9:299/301 of query aligns to 4:276/276 of B0VHH0

query
sites
B0VHH0
V
 
L
F
 
I
I
 
L
T
 
T
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
x
E
D
 
T
T
 
T
T
 
R
G
 
A
R
 
D
S
 
Q
D
 
P
K
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
E
Q
 
E
I
 
Q
A
 
A
D
 
K
E
 
E
C
 
A
I
 
K
A
 
A
A
 
C
A
 
F
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
I
 
V
A
 
I
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
I
R
 
R
D
 
E
P
 
-
K
 
D
T
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
P
S
 
S
R
 
Q
D
 
R
V
 
L
A
 
D
L
 
R
Y
 
F
A
 
Q
E
 
E
V
 
A
V
 
I
E
 
S
H
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
E
S
 
V
G
 
V
V
 
P
D
 
E
M
 
I
V
 
I
L
 
I
N
 
Q
L
 
I
T
x
S
A
 
T
G
 
G
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
G
|
G
S
 
A
V
 
V
E
 
G
Q
 
E
P
 
S
M
 
F
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
D
E
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
A
H
 
P
V
 
L
A
 
A
K
 
-
L
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
C
 
A
T
|
T
L
 
L
D
x
N
C
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
M
 
F
T
 
I
N
 
N
T
 
H
P
 
P
A
 
A
M
 
D
L
 
I
K
 
I
A
 
R
M
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
I
 
F
K
 
K
A
 
Q
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
R
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
|
E
I
 
V
F
 
Y
D
 
E
T
 
S
G
 
G
H
 
M
L
 
V
-
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
R
W
 
L
L
 
I
Y
 
K
D
 
K
Q
 
G
K
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
Q
D
 
N
P
 
P
V
 
L
M
 
H
V
 
I
Q
 
Q
L
 
F
C
 
V
M
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
P
W
 
G
G
 
G
A
 
M
P
 
S
D
 
G
D
 
K
I
 
P
N
 
K
T
 
N
L
 
L
L
 
M
A
 
Y
L
 
M
T
 
M
N
 
E
N
 
H
L
 
L
P
 
K
S
 
E
N
 
E
W
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
A
T
 
T
F
 
W
S
 
A
A
 
V
F
 
A
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
W
Q
 
H
M
 
I
P
 
P
Y
 
T
A
 
S
A
 
L
M
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
I
R
|
R
V
 
C
G
 
G
L
 
F
E
|
E
D
|
D
T
 
N
I
 
I
W
 
F
L
 
Y
D
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
A
-
 
E
T
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
Q
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
L
V
 
A
K
 
R
V
 
I
A
 
A
E
 
K
G
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
R
R
 
P
I
 
L
L
 
A
G
 
T
P
 
P
N
 
E
E
 
Q
V
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
I
M
 
L
K
 
A
L
 
L
T
 
N
K
 
K

2y7dD Crystal structure of the 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme (kce) from candidatus cloacamonas acidaminovorans (orthorombic form) (see paper)
30% identity, 96% coverage: 9:297/301 of query aligns to 7:277/278 of 2y7dD

query
sites
2y7dD
V
 
L
F
 
I
I
 
L
T
 
T
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
E
D
 
T
T
 
T
T
 
R
G
 
A
R
 
D
S
 
Q
D
 
P
K
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
E
Q
 
E
I
 
Q
A
 
A
D
 
K
E
 
E
C
 
A
I
 
K
A
 
A
A
 
C
A
 
F
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
I
 
V
A
 
I
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
I
R
 
R
D
 
E
P
 
-
K
 
D
T
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
P
S
 
S
R
 
Q
D
 
R
V
 
L
A
 
D
L
 
R
Y
 
F
A
 
Q
E
 
E
V
 
A
V
 
I
E
 
S
H
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
E
S
 
V
G
 
V
V
 
P
D
 
E
M
 
I
V
 
I
L
 
I
N
 
Q
L
 
I
T
 
S
A
 
T
G
 
G
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
S
 
A
V
 
V
E
 
G
Q
 
E
P
 
S
M
 
F
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
D
E
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
A
H
 
P
V
 
L
A
 
A
K
 
-
L
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
C
 
A
T
 
T
L
 
L
D
 
N
C
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
M
 
F
T
 
I
N
 
N
T
 
H
P
 
P
A
 
A
M
 
D
L
 
I
K
 
I
A
 
R
M
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
I
 
F
K
 
K
A
 
Q
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
R
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
E
I
 
V
F
 
Y
D
 
E
T
 
S
G
 
G
H
 
M
L
 
V
-
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
R
W
 
L
L
 
I
Y
 
K
D
 
K
Q
 
G
K
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
Q
D
 
N
P
 
P
V
 
L
M
 
H
V
 
I
Q
 
Q
L
 
F
C
 
V
M
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
P
W
 
G
G
 
G
A
 
M
P
 
S
D
 
G
D
 
K
I
 
P
N
 
K
T
 
N
L
 
L
L
 
M
A
 
Y
L
 
M
T
 
M
N
 
E
N
 
H
L
 
L
P
 
K
S
 
E
N
 
E
W
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
A
T
 
T
F
 
W
S
 
A
A
 
V
F
 
A
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
W
Q
 
H
M
 
I
P
 
P
Y
 
T
A
 
S
A
 
L
M
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
I
R
 
R
V
 
C
G
 
G
L
 
F
E
|
E
D
 
D
T
 
N
I
 
I
W
 
F
L
 
Y
D
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
A
-
 
E
T
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
Q
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
L
V
 
A
K
 
R
V
 
I
A
 
A
E
 
K
G
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
R
R
 
P
I
 
L
L
 
A
G
 
T
P
 
P
N
 
E
E
 
Q
V
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
I
M
 
L
K
 
A
L
 
L

2y7fD Crystal structure of the 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme (kce) from c. Cloacamonas acidaminovorans in complex with the substrate 3- keto-5-aminohexanoate (see paper)
30% identity, 96% coverage: 9:297/301 of query aligns to 6:276/277 of 2y7fD

query
sites
2y7fD
V
 
L
F
 
I
I
 
L
T
 
T
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
x
E
D
 
T
T
 
T
T
 
R
G
 
A
R
 
D
S
 
Q
D
 
P
K
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
E
Q
 
E
I
 
Q
A
 
A
D
 
K
E
 
E
C
 
A
I
 
K
A
 
A
A
 
C
A
 
F
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
I
 
V
A
 
I
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
I
R
 
R
D
 
E
P
 
-
K
 
D
T
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
P
S
 
S
R
 
Q
D
 
R
V
 
L
A
x
D
L
 
R
Y
 
F
A
 
Q
E
|
E
V
 
A
V
 
I
E
 
S
H
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
E
S
 
V
G
 
V
V
 
P
D
 
E
M
 
I
V
 
I
L
 
I
N
 
Q
L
 
I
T
x
S
A
 
T
G
|
G
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
G
|
G
S
 
A
V
 
V
E
 
G
Q
 
E
P
 
S
M
 
F
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
D
E
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
A
H
 
P
V
 
L
A
 
A
K
 
-
L
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
C
 
A
T
|
T
L
 
L
D
 
N
C
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
L
N
 
N
F
|
F
G
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
M
x
F
T
 
I
N
 
N
T
 
H
P
 
P
A
 
A
M
 
D
L
 
I
K
 
I
A
 
R
M
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
I
 
F
K
 
K
A
 
Q
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
R
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
E
I
 
V
F
 
Y
D
 
E
T
 
S
G
 
G
H
 
M
L
 
V
-
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
R
W
 
L
L
 
I
Y
 
K
D
 
K
Q
 
G
K
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
Q
D
 
N
P
 
P
V
 
L
M
 
H
V
 
I
Q
 
Q
L
 
F
C
 
V
M
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
P
W
 
G
G
 
G
A
 
M
P
 
S
D
 
G
D
 
K
I
 
P
N
 
K
T
 
N
L
 
L
L
 
M
A
 
Y
L
 
M
T
 
M
N
 
E
N
 
H
L
 
L
P
 
K
S
 
E
N
 
E
W
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
A
T
 
T
F
 
W
S
 
A
A
 
V
F
 
A
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
W
Q
 
H
M
 
I
P
 
P
Y
 
T
A
 
S
A
 
L
M
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
I
R
 
R
V
 
C
G
 
G
L
 
F
E
|
E
D
 
D
T
 
N
I
 
I
W
 
F
L
 
Y
D
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
A
-
 
E
T
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
Q
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
L
V
 
A
K
 
R
V
 
I
A
 
A
E
 
K
G
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
R
R
 
P
I
 
L
L
 
A
G
 
T
P
 
P
N
 
E
E
 
Q
V
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
I
M
 
L
K
 
A
L
 
L

2y7fA Crystal structure of the 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme (kce) from c. Cloacamonas acidaminovorans in complex with the substrate 3- keto-5-aminohexanoate (see paper)
30% identity, 96% coverage: 9:297/301 of query aligns to 6:276/277 of 2y7fA

query
sites
2y7fA
V
 
L
F
 
I
I
 
L
T
 
T
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
x
E
D
 
T
T
 
T
T
 
R
G
 
A
R
 
D
S
 
Q
D
 
P
K
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
E
Q
 
E
I
 
Q
A
 
A
D
 
K
E
 
E
C
 
A
I
 
K
A
 
A
A
 
C
A
 
F
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
I
 
V
A
 
I
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
I
R
 
R
D
 
E
P
 
-
K
 
D
T
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
P
S
 
S
R
 
Q
D
 
R
V
 
L
A
 
D
L
 
R
Y
 
F
A
 
Q
E
 
E
V
 
A
V
 
I
E
 
S
H
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
E
S
 
V
G
 
V
V
 
P
D
 
E
M
 
I
V
 
I
L
 
I
N
 
Q
L
 
I
T
x
S
A
 
T
G
|
G
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
G
|
G
S
 
A
V
 
V
E
 
G
Q
 
E
P
 
S
M
 
F
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
D
E
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
A
H
 
P
V
 
L
A
 
A
K
 
-
L
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
C
 
A
T
|
T
L
 
L
D
x
N
C
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
L
N
 
N
F
|
F
G
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
M
x
F
T
 
I
N
 
N
T
 
H
P
 
P
A
 
A
M
 
D
L
 
I
K
 
I
A
 
R
M
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
I
 
F
K
 
K
A
 
Q
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
R
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
E
I
 
V
F
 
Y
D
 
E
T
 
S
G
 
G
H
 
M
L
 
V
-
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
R
W
 
L
L
 
I
Y
 
K
D
 
K
Q
 
G
K
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
Q
D
 
N
P
 
P
V
 
L
M
 
H
V
 
I
Q
 
Q
L
 
F
C
 
V
M
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
P
W
 
G
G
 
G
A
 
M
P
 
S
D
 
G
D
 
K
I
 
P
N
 
K
T
 
N
L
 
L
L
 
M
A
 
Y
L
 
M
T
 
M
N
 
E
N
 
H
L
 
L
P
 
K
S
 
E
N
 
E
W
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
A
T
 
T
F
 
W
S
 
A
A
 
V
F
 
A
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
W
Q
 
H
M
 
I
P
 
P
Y
 
T
A
 
S
A
 
L
M
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
I
R
 
R
V
 
C
G
 
G
L
 
F
E
|
E
D
 
D
T
 
N
I
 
I
W
 
F
L
 
Y
D
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
A
-
 
E
T
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
Q
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
L
V
 
A
K
 
R
V
 
I
A
 
A
E
 
K
G
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
R
R
 
P
I
 
L
L
 
A
G
 
T
P
 
P
N
 
E
E
 
Q
V
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
I
M
 
L
K
 
A
L
 
L

2y7gA Crystal structure of the 3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme (kce) from c. Cloacamonas acidaminovorans in complex with the product acetoacetate (see paper)
30% identity, 96% coverage: 9:297/301 of query aligns to 5:275/276 of 2y7gA

query
sites
2y7gA
V
 
L
F
 
I
I
 
L
T
 
T
C
 
A
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
E
D
 
T
T
 
T
T
 
R
G
 
A
R
 
D
S
 
Q
D
 
P
K
 
N
V
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
E
Q
 
E
I
 
Q
A
 
A
D
 
K
E
 
E
C
 
A
I
 
K
A
 
A
A
 
C
A
 
F
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
R
I
 
V
A
 
I
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
I
R
 
R
D
 
E
P
 
-
K
 
D
T
 
D
G
 
G
K
 
R
G
 
P
S
 
S
R
 
Q
D
 
R
V
 
L
A
 
D
L
 
R
Y
 
F
A
 
Q
E
 
E
V
 
A
V
 
I
E
 
S
H
 
A
I
 
I
K
 
R
A
 
E
S
 
V
G
 
V
V
 
P
D
 
E
M
 
I
V
 
I
L
 
I
N
 
Q
L
 
I
T
x
S
A
 
T
G
|
G
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
G
S
 
A
V
 
V
E
 
G
Q
 
E
P
 
S
M
 
F
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
D
E
 
K
R
 
R
L
 
L
E
 
A
H
 
P
V
 
L
A
 
A
K
 
-
L
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
E
I
 
M
C
 
A
T
|
T
L
 
L
D
x
N
C
 
A
G
 
G
T
 
T
M
 
L
N
 
N
F
 
F
G
 
-
E
 
-
G
 
G
D
 
D
Y
 
D
V
 
I
M
 
F
T
 
I
N
 
N
T
 
H
P
 
P
A
 
A
M
 
D
L
 
I
K
 
I
A
 
R
M
 
L
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
I
 
F
K
 
K
A
 
Q
L
 
Y
G
 
N
V
 
V
R
 
V
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
E
I
 
V
F
 
Y
D
 
E
T
 
S
G
 
G
H
 
M
L
 
V
-
 
D
L
 
A
L
 
V
A
 
A
K
 
R
W
 
L
L
 
I
Y
 
K
D
 
K
Q
 
G
K
 
I
L
 
I
L
 
T
E
 
Q
D
 
N
P
 
P
V
 
L
M
 
H
V
 
I
Q
 
Q
L
 
F
C
 
V
M
 
L
G
 
G
I
 
V
P
 
P
W
 
G
G
 
G
A
 
M
P
 
S
D
 
G
D
 
K
I
 
P
N
 
K
T
 
N
L
 
L
L
 
M
A
 
Y
L
 
M
T
 
M
N
 
E
N
 
H
L
 
L
P
 
K
S
 
E
N
 
E
W
 
I
-
 
P
-
 
T
-
 
A
T
 
T
F
 
W
S
 
A
A
 
V
F
 
A
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
W
Q
 
H
M
 
I
P
 
P
Y
 
T
A
 
S
A
 
L
M
 
I
A
 
A
M
 
M
L
 
V
A
 
T
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
I
R
|
R
V
 
C
G
 
G
L
 
F
E
|
E
D
 
D
T
 
N
I
 
I
W
 
F
L
 
Y
D
 
H
K
 
K
G
 
G
V
 
V
L
 
I
A
 
A
-
 
E
T
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
Q
L
 
L
V
 
V
E
 
A
R
 
R
A
 
L
V
 
A
K
 
R
V
 
I
A
 
A
E
 
K
G
 
E
M
 
I
G
 
G
A
 
R
R
 
P
I
 
L
L
 
A
G
 
T
P
 
P
N
 
E
E
 
Q
V
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
I
M
 
L
K
 
A
L
 
L

3chvA Crystal structure of a prokaryotic domain of unknown function (duf849) member (spoa0042) from silicibacter pomeroyi dss-3 at 1.45 a resolution
29% identity, 97% coverage: 6:297/301 of query aligns to 2:273/279 of 3chvA

query
sites
3chvA
N
 
N
R
 
K
E
 
P
V
 
C
F
 
I
I
 
I
T
 
C
C
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
V
D
 
P
T
 
T
T
 
K
G
 
A
R
 
D
S
 
N
D
 
P
K
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
V
R
 
S
Q
 
E
I
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
S
C
 
T
I
 
Q
A
 
E
A
 
A
A
 
F
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
A
H
|
H
I
 
C
H
|
H
V
 
V
R
 
R
D
 
N
P
 
-
K
 
D
T
 
D
G
 
G
K
 
T
G
 
P
S
 
S
R
 
S
D
 
D
V
 
P
A
 
D
L
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
R
V
 
L
V
 
T
E
 
E
H
 
G
I
 
L
K
x
H
A
 
T
S
 
H
G
 
C
V
 
P
D
 
G
M
 
M
V
 
I
L
 
V
N
 
Q
L
 
F
T
 
S
A
 
T
G
 
G
M
 
-
G
 
-
G
 
G
D
 
R
L
 
S
T
 
G
L
 
A
G
 
G
S
 
Q
V
 
A
E
 
R
Q
 
G
P
 
G
M
 
M
P
 
L
P
 
P
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
D
I
 
M
C
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
S
C
 
V
G
 
G
T
 
S
M
 
N
N
 
N
F
 
F
G
 
P
E
 
S
G
 
-
D
 
-
Y
 
R
V
 
V
M
 
Y
T
 
E
N
 
N
T
 
P
P
 
P
A
 
D
M
 
L
L
 
V
K
 
D
A
 
W
M
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
I
 
M
K
 
R
A
 
S
L
 
Y
G
 
R
V
 
V
R
 
T
P
 
P
E
 
E
V
 
I
E
 
E
I
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
S
H
 
H
L
 
I
L
 
L
L
 
R
A
 
A
K
 
I
W
 
D
L
 
M
Y
 
H
D
 
G
Q
 
R
K
 
G
L
 
L
L
 
L
E
 
Y
D
 
G
P
 
K
V
 
L
M
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
L
 
F
C
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
K
W
 
N
G
 
A
A
 
M
P
 
P
D
 
A
D
 
D
-
 
R
-
 
E
-
 
V
I
 
F
N
 
D
T
 
F
L
 
Y
L
 
V
A
 
R
L
 
M
T
 
M
N
 
R
N
 
T
L
 
R
P
 
A
S
 
P
N
 
Q
W
 
A
T
 
E
F
 
W
S
 
C
A
 
A
F
 
A
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
A
N
 
N
Q
 
Q
M
 
L
P
 
T
Y
 
V
A
 
N
A
 
E
M
 
W
A
 
A
M
 
I
L
 
A
A
 
A
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
T
R
 
R
V
 
T
G
 
G
L
 
L
E
|
E
D
 
D
T
 
N
I
 
I
W
 
R
L
 
L
D
 
D
K
 
R
G
 
Q
V
 
T
L
 
L
A
 
A
-
 
P
T
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
R
R
 
R
A
 
S
V
 
V
K
 
E
V
 
L
A
 
C
E
 
D
G
 
K
M
 
Y
G
 
Q
A
 
R
R
 
P
I
 
V
L
 
A
G
 
S
P
 
W
N
 
Q
E
 
Q
V
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
I
M
 
L
K
 
G
L
 
L

Sites not aligning to the query:

3no5E Crystal structure of a pfam duf849 domain containing protein (reut_a1631) from ralstonia eutropha jmp134 at 1.90 a resolution
29% identity, 97% coverage: 6:297/301 of query aligns to 3:274/275 of 3no5E

query
sites
3no5E
N
 
N
R
 
K
E
 
P
V
 
C
F
 
I
I
 
I
T
 
S
C
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
L
D
 
P
T
 
R
T
 
K
G
 
K
R
 
D
S
 
N
D
 
P
K
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
V
R
 
S
Q
 
E
I
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
S
C
 
T
I
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
F
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
T
I
 
L
A
 
V
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
V
R
 
R
-
 
N
D
 
D
P
 
D
K
 
E
T
 
T
G
 
P
K
 
T
G
 
S
S
 
N
R
 
P
D
 
D
V
 
-
A
 
-
L
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
L
V
 
V
V
 
L
E
 
E
H
 
G
I
 
I
K
 
R
A
 
K
S
 
H
G
 
A
V
 
P
D
 
G
M
 
M
V
 
I
L
 
T
N
 
Q
L
 
V
T
 
S
A
 
T
G
 
G
M
 
-
G
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
G
M
 
R
A
 
S
G
 
G
A
 
A
T
 
G
E
 
N
R
 
E
L
 
R
E
 
G
H
 
A
V
 
M
A
 
L
K
 
S
L
 
L
R
 
R
P
 
P
E
 
D
I
 
M
C
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
A
C
 
T
G
 
G
T
 
S
M
 
V
N
 
N
F
 
F
G
 
P
E
 
T
G
 
R
D
 
V
Y
 
Y
V
 
-
M
 
-
T
 
D
N
 
N
T
 
P
P
 
P
A
 
E
M
 
L
L
 
V
K
 
D
A
 
W
M
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
M
K
 
K
A
 
T
L
 
Y
G
 
G
V
 
I
R
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
E
I
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
S
H
 
M
L
 
I
L
 
F
L
 
Q
A
 
A
K
 
A
W
 
A
L
 
M
Y
 
Q
D
 
A
Q
 
A
K
 
G
L
 
A
L
 
I
E
 
V
D
 
G
P
 
P
V
 
L
M
 
H
V
 
I
Q
 
Q
L
 
F
C
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
I
P
 
K
W
 
N
G
 
A
A
 
M
P
 
P
D
 
V
D
 
D
I
 
R
N
 
E
T
 
V
L
 
L
-
 
E
-
 
F
-
 
Y
L
 
V
A
 
Q
L
 
T
T
 
L
N
 
K
N
 
R
L
 
L
P
 
S
S
 
P
N
 
D
W
 
A
T
 
T
F
 
W
S
 
T
A
 
G
F
 
A
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
R
N
 
H
Q
 
Q
M
 
L
P
 
T
Y
 
M
A
 
A
A
 
R
M
 
W
A
 
S
M
 
L
L
 
E
A
 
L
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
C
R
 
R
V
 
T
G
 
G
L
 
L
E
|
E
D
 
D
T
 
N
I
 
V
W
 
R
L
 
L
D
 
D
K
 
K
G
 
N
V
 
T
L
 
L
A
 
A
-
 
P
T
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
V
V
 
A
K
 
E
V
 
L
A
 
C
E
 
E
G
 
E
M
 
Y
G
 
G
A
 
R
R
 
P
I
 
V
L
 
A
G
 
T
P
 
A
N
 
A
E
 
Q
V
 
A
R
 
R
E
 
E
R
 
I
M
 
M
K
 
S
L
 
L

3fa5A Crystal structure of a duf849 family protein (pden_3495) from paracoccus denitrificans pd1222 at 1.90 a resolution
29% identity, 91% coverage: 7:279/301 of query aligns to 2:255/276 of 3fa5A

query
sites
3fa5A
R
 
K
E
 
P
V
 
C
F
 
I
I
 
I
T
 
C
C
 
V
A
 
A
V
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
S
G
 
L
D
 
P
T
 
T
T
 
K
G
 
E
R
 
N
S
 
N
D
 
P
K
 
A
V
 
V
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
L
R
 
A
Q
 
E
I
 
Q
A
 
V
D
 
E
E
 
S
C
 
T
I
 
H
A
 
E
A
 
A
A
 
F
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
I
 
I
A
 
A
H
|
H
I
 
C
H
|
H
V
 
V
R
 
R
D
 
D
P
 
D
K
 
E
T
 
-
G
 
G
K
 
R
G
 
P
S
 
T
R
 
S
D
 
D
V
 
P
A
 
D
L
 
R
Y
 
F
A
 
A
E
 
A
V
 
L
V
 
K
E
 
E
H
 
G
I
 
L
K
 
E
A
 
R
S
 
H
G
 
C
V
 
P
D
 
G
M
 
M
V
 
I
L
 
V
N
 
Q
L
 
L
T
 
S
A
 
T
G
 
G
M
 
-
G
 
-
G
 
G
D
 
R
L
 
S
T
 
G
L
 
A
G
 
G
S
 
Q
V
 
A
E
 
R
Q
 
G
P
 
A
M
 
M
P
 
L
P
 
P
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
-
A
 
-
T
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
L
R
 
C
P
 
P
E
 
D
I
 
M
C
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
S
C
 
V
G
 
G
T
 
S
M
 
N
N
 
N
F
 
F
G
 
P
E
 
T
G
 
-
D
 
-
Y
 
R
V
 
V
M
 
Y
T
 
E
N
 
N
T
 
P
P
 
P
A
 
D
M
 
L
L
 
V
K
 
D
A
 
W
M
 
L
A
 
A
A
 
A
Q
 
E
I
 
M
K
 
L
A
 
K
L
 
Y
G
 
D
V
 
I
R
 
K
P
 
P
E
 
E
V
 
I
E
 
E
I
 
A
F
 
F
D
 
D
T
 
L
G
 
S
H
 
H
L
 
I
L
 
L
L
 
Q
A
 
A
K
 
K
W
 
R
L
 
M
Y
 
A
D
 
G
Q
 
D
K
 
G
L
 
R
L
 
L
E
 
A
D
 
G
P
 
T
V
 
P
M
 
Y
V
 
V
Q
 
Q
L
 
F
C
 
V
M
 
M
G
 
G
I
 
V
P
 
R
W
 
N
G
 
A
A
 
M
P
 
P
D
 
A
D
 
D
I
 
R
N
 
D
T
 
V
L
 
F
L
 
D
A
 
Y
L
 
Y
T
 
I
N
 
H
N
 
T
L
 
V
P
 
R
-
 
R
-
 
L
-
 
F
-
 
G
S
 
E
N
 
D
W
 
A
T
 
P
F
 
W
S
 
C
A
 
A
F
 
A
S
 
G
I
 
I
G
 
G
R
 
P
N
 
S
Q
 
Q
M
 
I
P
 
V
Y
 
L
A
 
N
A
 
E
M
 
W
A
 
A
M
 
I
L
 
S
A
 
S
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
A
R
 
R
V
 
T
G
 
G
L
 
L
E
|
E
D
 
D
T
 
N
I
 
V
W
 
R
L
 
L
D
 
D
K
 
R
G
 
D
V
 
R
L
 
L
A
 
A
-
 
P
T
 
S
N
 
N
G
 
A
P
 
A
L
 
L
V
 
V
E
 
G
R
 
R
A
 
A
V
 
V
K
 
E
V
 
L
A
 
C
E
 
E

5zmuD Crystal structure of a cis-epoxysuccinate hydrolase producing d(-)- tartaric acids (see paper)
28% identity, 89% coverage: 27:293/301 of query aligns to 21:283/287 of 5zmuD

query
sites
5zmuD
K
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
W
T
 
T
P
 
P
R
 
K
Q
 
E
I
 
I
A
 
G
D
 
E
E
 
A
C
 
A
I
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
R
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
I
 
I
A
 
V
H
|
H
I
 
F
H
|
H
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
P
 
-
K
 
A
T
 
D
G
 
G
K
 
S
G
 
P
S
 
S
R
 
H
D
 
D
V
 
Y
A
 
E
L
 
T
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
V
 
S
V
 
I
E
 
R
H
 
E
I
 
I
K
 
R
A
 
A
S
 
R
G
 
S
V
 
-
D
 
D
M
 
V
V
 
L
L
 
V
N
 
H
L
 
P
T
 
T
A
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
G
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
G
A
 
R
T
 
E
E
 
S
R
 
R
L
 
L
E
 
A
H
 
H
V
 
I
A
 
E
K
 
R
-
 
L
-
 
C
-
 
L
-
 
D
-
 
P
-
 
A
L
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
D
I
 
F
C
 
A
T
 
P
L
 
V
D
 
D
C
 
L
G
 
G
T
 
S
M
 
T
N
 
N
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
R
F
 
Y
G
 
E
E
 
T
G
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
V
M
 
Y
T
 
L
N
 
N
T
 
N
P
 
I
A
 
D
M
 
T
L
 
L
K
 
Q
A
 
H
M
 
F
A
 
S
A
 
K
Q
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
P
 
P
E
 
A
V
 
F
E
 
I
I
 
A
F
 
W
D
 
T
T
 
V
G
 
P
H
 
F
L
 
T
L
 
R
L
 
T
A
 
L
K
 
D
W
 
A
L
 
F
Y
 
M
D
 
D
Q
 
M
K
 
G
L
 
L
L
 
V
E
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
A
M
 
Y
V
 
L
Q
 
L
L
 
F
C
 
E
M
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
C
G
 
G
I
 
I
P
 
R
W
 
G
G
 
G
A
 
H
P
 
P
D
 
G
D
 
T
I
 
I
N
 
R
T
 
G
L
 
L
L
 
R
A
 
A
L
 
H
T
 
T
N
 
D
N
 
F
L
 
L
P
 
P
S
 
P
-
 
G
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
N
 
Q
W
 
W
T
 
T
F
 
V
S
 
C
A
 
N
F
 
-
S
 
K
I
 
I
G
 
G
R
 
-
N
 
N
Q
 
L
M
 
F
P
 
G
Y
 
P
A
 
A
A
 
A
M
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
E
A
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
V
R
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
G
D
 
D
T
 
Y
I
 
L
W
 
Y
L
 
P
D
 
E
K
 
L
G
 
G
V
 
T
L
 
-
A
 
P
T
 
T
N
 
N
G
 
G
P
 
E
L
 
V
V
 
V
E
 
Q
R
 
T
A
 
V
V
 
A
K
 
N
V
 
M
A
 
A
E
 
R
G
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
R
R
 
E
I
 
I
L
 
A
G
 
T
P
 
P
N
 
A
E
 
E
V
 
T
R
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

5zmyA Crystal structure of a cis-epoxysuccinate hydrolase producing d(-)- tartaric acids (see paper)
28% identity, 89% coverage: 27:293/301 of query aligns to 21:276/280 of 5zmyA

query
sites
5zmyA
K
 
H
V
 
V
P
 
P
V
 
W
T
 
T
P
 
P
R
 
K
Q
 
E
I
 
I
A
 
G
D
 
E
E
 
A
C
 
A
I
 
A
A
 
Q
A
 
A
A
 
R
N
 
E
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
S
I
 
I
A
 
V
H
|
H
I
 
F
H
|
H
V
 
A
R
 
R
D
 
Q
P
 
-
K
 
A
T
 
D
G
 
G
K
 
S
G
 
P
S
 
S
R
 
H
D
 
D
V
 
Y
A
 
E
L
 
T
Y
 
Y
A
 
A
E
 
E
V
 
S
V
 
I
E
 
R
H
 
E
I
 
I
K
 
R
A
 
A
S
 
R
G
 
S
V
 
-
D
 
D
M
 
V
V
 
L
L
 
V
N
 
H
L
 
P
T
|
T
A
 
L
G
 
G
M
 
L
G
 
-
G
 
-
D
 
-
L
 
-
T
 
-
L
 
-
G
 
-
S
 
-
V
 
-
E
 
-
Q
 
-
P
 
-
M
 
-
P
 
-
P
 
-
S
 
-
P
 
-
N
 
-
G
 
-
T
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
G
 
A
A
 
H
T
 
I
E
 
E
R
 
R
L
 
L
E
 
C
H
 
L
V
 
D
A
 
P
K
 
A
L
 
L
R
 
K
P
 
P
E
 
D
I
 
F
C
 
A
T
x
P
L
 
V
D
 
A
C
 
L
G
 
G
T
 
S
M
 
T
N
 
N
-
 
I
-
 
D
-
 
R
-
 
Y
-
 
D
-
 
D
-
 
V
-
 
E
-
 
K
-
 
R
F
 
Y
G
 
E
E
 
T
G
 
G
D
 
D
Y
 
R
V
 
V
M
 
Y
T
 
L
N
 
N
T
 
N
P
 
I
A
 
D
M
 
T
L
 
L
K
 
Q
A
 
H
M
 
F
A
 
S
A
 
K
Q
 
R
I
 
L
K
 
R
A
 
E
L
 
L
G
 
G
V
 
V
R
 
K
P
 
P
E
 
A
V
 
F
E
 
I
I
 
A
F
 
W
D
 
T
T
 
V
G
 
P
H
 
F
L
 
T
L
 
R
L
 
T
A
 
L
K
 
D
W
 
A
L
 
F
Y
 
M
D
 
D
Q
 
M
K
 
G
L
 
L
L
 
V
E
 
D
D
 
D
P
 
P
V
 
A
M
 
Y
V
 
L
Q
 
L
L
 
F
C
x
E
M
 
L
-
 
T
-
 
D
-
 
C
G
 
G
I
 
I
P
 
R
W
 
G
G
 
G
A
 
H
P
 
P
D
 
G
D
 
T
I
 
I
N
 
R
T
 
G
L
 
L
L
 
R
A
 
A
L
 
H
T
 
T
N
 
D
N
 
F
L
 
L
P
 
P
S
 
P
-
 
G
-
 
R
-
 
Q
-
 
I
N
 
Q
W
 
W
T
 
T
F
 
V
S
 
C
A
 
N
F
 
-
S
x
K
I
 
I
G
 
G
R
 
-
N
 
N
Q
 
L
M
 
F
P
 
G
Y
 
P
A
 
A
A
 
A
M
 
A
A
 
A
M
 
I
L
 
E
A
 
E
G
 
G
G
 
G
N
 
H
I
 
V
R
 
A
V
 
I
G
 
G
L
 
L
E
 
G
D
 
D
T
 
Y
I
 
L
W
 
Y
L
 
P
D
 
E
K
 
L
G
 
G
V
 
T
L
 
-
A
 
P
T
 
T
N
 
N
G
 
G
P
 
E
L
 
V
V
 
V
E
 
Q
R
 
T
A
 
V
V
 
A
K
 
N
V
 
M
A
 
A
E
 
R
G
 
A
M
 
M
G
 
G
A
 
R
R
 
E
I
 
I
L
 
A
G
 
T
P
 
P
N
 
A
E
 
E
V
 
T
R
 
K
E
 
E

Sites not aligning to the query:

4nnaA Apo structure of obca (see paper)
28% identity, 64% coverage: 10:202/301 of query aligns to 154:352/498 of 4nnaA

query
sites
4nnaA
F
 
W
I
 
I
T
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
A
T
 
G
G
 
Y
A
 
W
G
 
Q
D
 
A
T
 
G
T
 
K
G
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
P
K
 
Y
V
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
D
 
E
E
 
E
C
 
T
I
 
I
A
 
R
A
 
S
A
 
M
N
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
V
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
L
K
 
S
-
 
D
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
T
T
 
V
G
 
G
K
 
S
G
 
Q
S
 
R
R
 
N
D
 
Q
V
 
I
A
 
V
L
 
L
-
 
D
-
 
D
Y
 
Y
A
 
D
E
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
P
H
 
M
I
 
V
K
 
K
A
 
K
S
 
R
G
 
E
V
 
P
D
 
A
M
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
L
 
L
T
 
S
A
 
T
G
 
S
M
 
V
G
 
R
G
 
G
D
 
D
L
 
R
T
 
H
L
 
-
G
 
G
S
 
A
V
 
R
E
 
S
Q
 
K
P
 
L
M
 
R
P
 
R
P
 
A
S
 
H
P
 
L
N
 
K
G
 
F
T
 
Y
D
 
D
M
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
S
T
 
A
E
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
I
 
V
C
 
A
T
 
S
L
 
L
D
 
S
C
 
P
G
 
A
T
 
A
M
 
V
N
 
V
F
 
F
-
 
Q
G
 
G
E
 
G
G
 
G
D
 
G
Y
 
Y
V
 
-
M
 
-
T
 
D
N
 
N
T
 
A
P
 
P
A
 
D
M
 
F
L
 
L
K
 
D
A
 
A
M
 
Q
A
 
F
A
 
D
Q
 
H
I
 
F
K
 
E
A
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
 
R
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
E
I
 
V
F
 
F
D
 
N
T
 
H
G
 
A
H
 
I
L
 
V
L
 
D
L
 
N
A
 
A
K
 
T
W
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
R
Q
 
D
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
R
-
 
T
-
 
G
D
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
L
V
 
F
Q
 
M
L
 
L
C
 
V
M
 
A
G
 
G
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4nncA Ternary complex of obca with c4-coa adduct and oxalate (see paper)
28% identity, 64% coverage: 10:202/301 of query aligns to 141:339/483 of 4nncA

query
sites
4nncA
F
 
W
I
 
I
T
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
A
T
 
G
G
 
Y
A
 
W
G
 
Q
D
 
A
T
 
G
T
x
K
G
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
P
K
 
Y
V
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
D
 
E
E
 
E
C
 
T
I
 
I
A
 
R
A
 
S
A
 
M
N
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
V
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
L
K
 
S
-
 
D
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
T
T
 
V
G
 
G
K
 
S
G
 
Q
S
 
R
R
 
N
D
 
Q
V
 
I
A
 
V
L
 
L
-
 
D
-
 
D
Y
 
Y
A
 
D
E
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
P
H
 
M
I
 
V
K
 
K
A
 
K
S
 
R
G
 
E
V
 
P
D
 
A
M
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
L
 
L
T
x
S
A
 
T
G
x
S
M
 
V
G
x
R
G
 
G
D
 
D
L
 
R
T
 
H
L
 
-
G
 
G
S
 
A
V
 
R
E
 
S
Q
 
K
P
 
L
M
 
R
P
 
R
P
 
A
S
 
H
P
 
L
N
 
K
G
 
F
T
 
Y
D
 
D
M
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
S
T
 
A
E
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
I
 
V
C
 
A
T
x
S
L
 
L
D
 
S
C
 
P
G
 
A
T
 
A
M
 
V
N
 
V
F
 
F
-
 
Q
G
 
G
E
 
G
G
 
G
D
 
G
Y
|
Y
V
 
-
M
 
-
T
 
D
N
 
N
T
 
A
P
 
P
A
 
D
M
 
F
L
 
L
K
 
D
A
 
A
M
 
Q
A
 
F
A
 
D
Q
 
H
I
 
F
K
 
E
A
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
 
R
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
|
E
I
 
V
F
|
F
D
 
N
T
 
H
G
 
A
H
 
I
L
 
V
L
 
D
L
 
N
A
 
A
K
 
T
W
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
R
Q
 
D
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
R
-
 
T
-
 
G
D
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
L
V
 
F
Q
 
M
L
 
L
C
 
V
M
 
A
G
 
G
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4nnbA Binary complex of obca with oxaloacetate (see paper)
28% identity, 64% coverage: 10:202/301 of query aligns to 140:338/484 of 4nnbA

query
sites
4nnbA
F
 
W
I
 
I
T
 
A
C
 
C
A
 
A
V
 
A
T
 
G
G
 
Y
A
 
W
G
 
Q
D
 
A
T
 
G
T
 
K
G
 
A
R
 
R
S
 
S
D
 
P
K
 
Y
V
 
L
P
 
P
V
 
I
T
 
T
P
 
P
R
 
E
Q
 
A
I
 
I
A
 
T
D
 
E
E
 
E
C
 
T
I
 
I
A
 
R
A
 
S
A
 
M
N
 
R
A
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
I
 
V
A
 
V
H
|
H
I
 
L
H
|
H
V
 
T
R
 
R
D
 
D
P
 
L
K
 
S
-
 
D
-
 
R
-
 
R
-
 
R
-
 
I
-
 
E
-
 
I
-
 
P
-
 
G
-
 
L
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
T
T
 
V
G
 
G
K
 
S
G
 
Q
S
 
R
R
 
N
D
 
Q
V
 
I
A
 
V
L
 
L
-
 
D
-
 
D
Y
 
Y
A
 
D
E
 
A
V
 
I
V
 
V
E
 
P
H
 
M
I
 
V
K
 
K
A
 
K
S
 
R
G
 
E
V
 
P
D
 
A
M
 
A
V
 
I
L
 
L
N
 
N
L
 
L
T
x
S
A
 
T
G
x
S
M
 
V
G
x
R
G
 
G
D
 
D
L
 
R
T
 
H
L
 
-
G
 
G
S
 
A
V
 
R
E
 
S
Q
 
K
P
 
L
M
 
R
P
 
R
P
 
A
S
 
H
P
 
L
N
 
K
G
 
F
T
 
Y
D
 
D
M
 
D
A
 
V
G
 
G
A
 
S
T
 
A
E
 
-
R
 
-
L
 
-
E
 
-
H
 
-
V
 
-
A
 
-
K
 
-
L
 
-
R
 
-
P
 
P
E
 
E
I
 
V
C
 
A
T
x
S
L
 
L
D
 
S
C
 
P
G
 
A
T
 
A
M
 
V
N
 
V
F
 
F
-
 
Q
G
 
G
E
 
G
G
 
G
D
 
G
Y
|
Y
V
 
-
M
 
-
T
 
D
N
 
N
T
 
A
P
 
P
A
 
D
M
 
F
L
 
L
K
 
D
A
 
A
M
 
Q
A
 
F
A
 
D
Q
 
H
I
 
F
K
 
E
A
 
R
L
 
V
G
 
G
V
 
T
R
 
R
P
 
P
E
 
E
V
 
V
E
 
E
I
 
V
F
 
F
D
 
N
T
 
H
G
 
A
H
 
I
L
 
V
L
 
D
L
 
N
A
 
A
K
 
T
W
 
S
L
 
L
Y
 
Y
D
 
R
Q
 
D
K
 
R
L
 
L
L
 
L
E
 
R
-
 
T
-
 
G
D
 
K
P
 
P
V
 
V
M
 
L
V
 
F
Q
 
M
L
 
L
C
 
V
M
 
A
G
 
G
I
 
V

Sites not aligning to the query:

Query Sequence

>WP_106710555.1 NCBI__GCF_003010955.1:WP_106710555.1
MGLTPNREVFITCAVTGAGDTTGRSDKVPVTPRQIADECIAAANAGAAIAHIHVRDPKTG
KGSRDVALYAEVVEHIKASGVDMVLNLTAGMGGDLTLGSVEQPMPPSPNGTDMAGATERL
EHVAKLRPEICTLDCGTMNFGEGDYVMTNTPAMLKAMAAQIKALGVRPEVEIFDTGHLLL
AKWLYDQKLLEDPVMVQLCMGIPWGAPDDINTLLALTNNLPSNWTFSAFSIGRNQMPYAA
MAMLAGGNIRVGLEDTIWLDKGVLATNGPLVERAVKVAEGMGARILGPNEVRERMKLTKG
W

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory