SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_106711729.1 NCBI__GCF_003010955.1:WP_106711729.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

7o4tD Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme with coenzyme a bound at the hydratase, thiolase active sites and possible additional binding site (coa(ech/had)) (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 4:403/403 of 7o4tD

query
sites
7o4tD
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
|
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
 
F
M
 
V
P
 
P
Q
|
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
|
R
P
 
P
T
 
D
T
|
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
|
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
|
F
V
 
E
M
 
G
P
 
L
G
 
A
E
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
x
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
|
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
V
 
V

O53871 Putative acyltransferase Rv0859; EC 2.3.1.- from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 4:403/403 of O53871

query
sites
O53871
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
 
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
x
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
E
M
 
G
P
 
L
G
 
A
E
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
V
 
V

8oqoC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-49 (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 3:398/398 of 8oqoC

query
sites
8oqoC
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
 
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
|
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
E
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
|
V
E
|
E
T
x
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
V
 
V

8pf8C Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-72 (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 3:402/402 of 8pf8C

query
sites
8pf8C
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
x
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
|
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
E
M
 
G
P
 
L
G
 
A
E
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
V
 
V

8oqsC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-83 (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 3:402/402 of 8oqsC

query
sites
8oqsC
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
|
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
|
F
M
x
V
P
 
P
Q
|
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
E
M
 
G
P
 
L
G
 
A
E
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
|
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
|
G
A
x
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
V
 
V

8oqpC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-76 (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 3:402/402 of 8oqpC

query
sites
8oqpC
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
x
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
 
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
x
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
E
M
 
G
P
 
L
G
 
A
E
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
x
T
P
 
P
R
|
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
|
R
R
|
R
D
 
N
L
 
A
N
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
V
 
V

4b3iC Crystal structure of mycobacterium tuberculosis fatty acid beta- oxidation complex with coenzymea bound at the hydratase active sites (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 3:402/402 of 4b3iC

query
sites
4b3iC
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
 
F
C
|
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
 
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
E
M
 
G
P
 
L
G
 
A
E
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
x
H
E
x
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
|
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
|
C
I
 
I
G
|
G
A
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
V
 
V

8opyD Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-b-dnq (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 4:401/401 of 8opyD

query
sites
8opyD
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
 
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
L
M
 
-
P
 
-
G
 
A
E
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
|
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
x
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
|
E
R
 
R
V
 
V

8oqmD Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-10 (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 4:399/399 of 8oqmD

query
sites
8oqmD
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
 
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
A
M
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
x
A
N
x
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
|
R
V
 
V

8oqlC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with fragment-m-1 (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 3:397/397 of 8oqlC

query
sites
8oqlC
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
x
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
x
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
x
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
 
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
F
V
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
-
E
 
-
M
 
E
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
x
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
x
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
 
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
A
 
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
V
 
V

8opuC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with sulfamethoxazole (fragment-b-e1) (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 3:399/399 of 8opuC

query
sites
8opuC
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
|
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
|
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
 
D
G
 
V
Y
 
M
F
|
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
L
V
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
A
E
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
 
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I
 
S
G
 
G
S
 
A
D
 
D
P
 
P
A
 
V
L
 
I
M
|
M
L
 
L
T
 
T
G
 
G
P
 
P
V
 
T
D
 
P
V
 
A
T
 
T
E
 
R
K
 
K
L
 
V
L
 
L
K
 
D
R
 
R
A
 
A
K
 
G
M
 
L
K
 
T
I
 
V
S
 
D
D
 
D
I
 
I
D
 
D
L
 
L
F
 
F
E
 
E
L
 
L
N
 
N
E
 
E
A
 
A
F
 
F
A
 
A
A
 
S
V
 
V
V
 
V
L
 
L
R
 
K
Y
 
F
M
 
Q
Q
 
K
A
 
D
F
 
L
D
 
N
I
 
I
P
 
P
R
 
D
D
 
E
K
 
K
I
 
L
N
 
N
V
 
V
N
 
N
G
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
A
 
A
M
 
M
G
 
G
H
 
H
P
 
P
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
T
G
 
G
A
 
A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
G
 
G
T
 
T
V
 
M
L
 
V
D
 
D
E
 
E
L
 
L
E
 
E
R
 
R
R
 
R
D
 
N
L
 
A
N
 
R
V
 
R
A
 
A
L
 
L
V
 
I
T
 
T
L
 
L
C
 
C
I
 
I
G
 
G
A
x
G
G
 
G
M
 
M
G
 
G
T
 
V
A
 
A
T
 
T
I
 
I
I
 
I
E
 
E
R
 
R
V
 
V

8opxC Structure of mycobacterium tuberculosis beta-oxidation trifunctional enzyme in complex with trehalose (fragment-b-tre) (see paper)
59% identity, 100% coverage: 3:402/402 of query aligns to 3:398/398 of 8opxC

query
sites
8opxC
E
 
E
A
 
A
Y
 
F
I
 
I
Y
 
Y
D
 
E
H
 
A
V
 
I
R
 
R
T
 
T
P
 
P
R
 
R
G
 
G
R
 
K
G
 
-
K
 
Q
K
 
K
D
 
N
G
 
G
S
 
S
L
 
L
H
 
H
E
 
E
V
 
V
P
 
K
A
 
P
V
 
L
R
 
S
L
 
L
G
 
V
A
 
V
H
 
G
V
 
L
L
 
I
E
 
D
A
 
E
L
 
L
R
 
R
D
 
K
R
 
R
N
 
H
-
 
P
G
 
D
L
 
L
D
 
D
T
 
E
G
 
N
L
 
L
V
 
I
D
 
S
D
 
D
I
 
V
I
 
I
Y
 
L
G
 
G
C
 
C
V
 
V
D
 
S
P
 
P
V
 
V
G
 
G
E
 
D
A
 
Q
G
 
G
A
 
G
V
 
D
I
 
I
P
 
A
R
 
R
S
 
A
S
 
A
A
 
V
F
 
L
E
 
A
A
 
S
G
 
G
Y
 
M
D
 
P
F
 
V
K
 
T
A
 
S
P
 
G
G
 
G
M
 
V
Q
 
Q
I
 
L
S
 
N
R
 
R
F
 
F
C
 
C
A
 
A
S
 
S
G
 
G
L
 
L
D
 
E
A
 
A
V
 
V
N
 
N
F
 
T
A
 
A
A
 
A
A
 
Q
K
 
K
I
 
V
V
 
R
Q
 
S
G
 
G
A
 
W
D
 
D
D
 
D
I
 
L
V
 
V
I
 
L
A
 
A
G
 
G
G
 
G
V
 
V
E
 
E
S
 
S
M
 
M
S
 
S
R
 
R
V
 
V
G
 
P
M
 
M
G
 
G
M
 
S
S
 
D
G
 
G
G
 
G
A
 
A
W
 
M
Y
 
G
M
 
L
D
 
D
P
 
P
S
 
A
V
 
T
G
 
N
L
 
Y
P
x
D
G
 
V
Y
x
M
F
 
F
M
 
V
P
 
P
Q
 
Q
G
 
S
V
 
I
S
 
G
A
 
A
D
 
D
L
 
L
I
 
I
A
 
A
T
 
T
K
 
I
Y
 
E
G
 
G
F
 
F
S
 
S
R
 
R
D
 
E
D
 
D
V
 
V
D
 
D
A
 
A
Y
 
Y
A
 
A
V
 
L
E
 
R
S
 
S
Q
 
Q
K
 
Q
R
 
K
A
 
A
G
 
A
E
 
E
A
 
A
W
 
W
K
 
S
K
 
G
G
 
G
Y
 
Y
F
 
F
K
 
A
N
 
K
S
 
S
V
 
V
L
 
V
E
 
P
I
 
V
K
 
R
D
 
D
Q
 
Q
N
 
N
G
 
G
L
 
L
T
 
L
I
 
I
L
 
L
D
 
D
H
 
H
D
 
D
E
 
E
H
 
H
M
 
M
R
 
R
P
 
P
T
 
D
T
 
T
D
 
T
M
 
K
Q
 
E
A
 
G
L
 
L
A
 
A
S
 
K
L
 
L
N
 
K
P
 
P
S
 
A
F
 
-
V
 
-
M
 
-
P
 
-
G
 
A
E
 
A
M
 
L
G
 
G
G
 
G
F
 
F
N
 
D
A
 
D
V
 
V
G
 
A
I
 
L
Q
 
Q
A
x
K
H
 
Y
P
 
H
E
 
W
V
 
V
E
 
E
T
 
K
I
 
I
N
 
N
H
 
H
V
 
V
H
 
H
H
 
T
A
 
G
G
 
G
N
 
N
S
 
S
S
 
S
G
 
G
I
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
 
L
V
 
V
L
 
M
L
 
I
G
 
G
S
 
S
K
 
A
S
 
A
A
 
A
G
 
G
K
 
K
A
 
L
I
 
Q
G
 
G
T
 
L
K
 
T
P
 
P
R
 
R
A
 
A
R
 
R
I
 
I
R
 
V
A
 
A
F
 
T
A
 
A
N
 
T
I