SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_106714899.1 NCBI__GCF_003010935.1:WP_106714899.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

3ijpB Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
59% identity, 97% coverage: 9:276/277 of query aligns to 1:267/267 of 3ijpB

query
sites
3ijpB
P
 
S
M
 
M
K
 
R
L
 
L
A
 
T
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
N
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
E
L
 
L
I
 
I
R
 
T
I
 
A
I
|
I
H
x
Q
S
 
R
T
x
R
P
 
K
G
 
D
A
x
V
M
x
E
L
 
L
S
 
C
G
 
A
A
 
V
I
 
L
E
 
V
R
 
R
V
 
K
G
 
G
S
 
S
P
 
S
H
 
F
I
 
V
G
 
D
S
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
S
G
 
D
K
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
R
I
 
I
S
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
P
L
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
S
G
 
N
V
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
L
D
 
D
F
 
F
T
 
S
T
 
Q
P
 
P
A
 
Q
A
 
A
S
 
S
V
 
V
E
 
L
F
 
Y
A
 
A
G
 
N
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
T
 
K
G
 
S
I
 
L
V
 
I
H
 
H
V
 
I
V
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
C
 
F
D
 
S
S
 
K
T
 
T
D
 
E
D
 
E
A
 
A
K
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
D
A
 
F
A
 
A
R
 
K
H
 
Y
A
 
T
V
 
T
V
 
I
I
 
V
K
 
K
S
 
S
G
 
G
N
 
N
M
 
M
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
D
A
 
-
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
M
 
M
H
|
H
H
 
H
K
 
A
H
 
N
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
N
I
 
I
G
 
M
L
 
L
G
 
K
Q
 
N
H
 
V
S
 
S
V
 
V
R
 
N
V
 
G
R
 
R
D
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
K
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
C
L
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
D
H
 
H
S
 
S
V
 
I
I
 
T
L
 
F
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
I
 
I
T
 
V
L
 
L
S
 
S
H
 
H
H
 
I
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
F
 
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
A
R
 
K
G
 
N
R
 
H
K
 
E
P
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
S
M
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
N

3ijpA Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase from bartonella henselae at 2.0a resolution (see paper)
59% identity, 96% coverage: 9:275/277 of query aligns to 1:266/266 of 3ijpA

query
sites
3ijpA
P
 
S
M
 
M
K
 
R
L
 
L
A
 
T
V
 
V
V
 
V
G
|
G
A
 
A
A
x
N
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
E
L
 
L
I
 
I
R
 
T
I
 
A
I
|
I
H
x
Q
S
 
R
T
x
R
P
 
K
G
 
D
A
x
V
M
 
E
L
 
L
S
 
C
G
 
A
A
 
V
I
 
L
E
 
V
R
|
R
V
 
K
G
 
G
S
 
S
P
 
S
H
 
F
I
 
V
G
 
D
S
 
K
D
 
D
A
 
A
G
 
S
V
 
I
L
 
L
A
 
I
G
 
G
V
 
S
G
 
D
K
 
F
L
 
L
G
 
G
V
 
V
P
 
R
I
 
I
S
 
T
D
 
D
D
 
D
A
 
P
L
 
E
A
 
S
A
 
A
F
 
F
A
 
S
G
 
N
V
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
I
L
 
L
D
 
D
F
|
F
T
x
S
T
x
Q
P
 
P
A
 
Q
A
|
A
S
 
S
V
 
V
E
 
L
F
 
Y
A
 
A
G
 
N
L
 
Y
A
 
A
A
 
A
Q
 
Q
T
 
K
G
 
S
I
 
L
V
 
I
H
 
H
V
 
I
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
S
S
 
K
T
 
T
D
 
E
D
 
E
A
 
A
K
 
Q
I
 
I
A
 
A
L
 
D
A
 
F
A
 
A
R
 
K
H
 
Y
A
 
T
V
 
T
V
 
I
I
 
V
K
 
K
S
 
S
G
|
G
N
|
N
M
|
M
S
 
S
L
 
L
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
L
A
 
A
V
 
N
L
 
L
V
 
V
K
 
K
Q
 
R
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
A
L
 
L
G
 
D
A
 
-
D
 
D
D
 
D
F
 
F
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
Y
E
 
E
M
 
M
H
|
H
H
 
H
K
 
A
H
 
N
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
S
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
L
L
 
L
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
E
G
 
G
R
 
R
N
 
N
I
 
I
G
 
M
L
 
L
G
 
K
Q
 
N
H
 
V
S
 
S
V
 
V
R
 
N
V
 
G
R
 
R
D
 
S
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
K
R
 
R
E
 
E
A
 
K
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
C
L
 
S
R
 
R
G
 
G
G
 
G
S
 
T
V
 
V
V
 
I
G
 
G
D
 
D
H
 
H
S
 
S
V
 
I
I
 
T
L
 
F
A
 
A
G
 
G
Q
 
E
G
 
N
E
 
E
R
 
R
I
 
I
T
 
V
L
 
L
S
 
S
H
 
H
H
 
I
A
 
A
E
 
Q
D
 
E
R
 
R
S
 
S
I
 
I
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
A
R
 
K
G
 
N
R
 
H
K
 
E
P
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
S
M
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

4ywjA Crystal structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase (htpa reductase) from pseudomonas aeruginosa
47% identity, 96% coverage: 11:275/277 of query aligns to 3:267/268 of 4ywjA

query
sites
4ywjA
K
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
K
T
 
N
L
 
L
I
 
I
R
 
E
I
 
A
I
 
V
H
 
Q
S
 
Q
T
 
T
P
 
G
G
 
G
A
 
A
M
 
A
-
 
G
L
 
L
S
 
T
G
 
A
A
 
A
I
 
V
E
x
D
R
|
R
V
 
P
G
 
D
S
 
S
P
 
T
H
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
A
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
L
G
 
G
K
 
R
L
 
I
G
 
G
V
 
V
P
 
P
I
 
L
S
 
S
D
 
G
D
 
D
A
 
L
L
 
G
A
 
K
A
 
V
F
 
C
A
 
E
G
 
E
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
L
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
H
P
 
P
A
 
S
A
x
V
S
 
T
V
 
L
E
 
K
F
 
N
A
 
I
G
 
E
L
 
Q
A
 
C
A
 
R
Q
 
K
T
 
A
G
 
R
I
 
R
V
 
A
H
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
S
S
 
A
T
 
D
D
 
E
D
 
K
A
 
L
K
 
L
I
 
L
A
 
A
L
 
E
A
 
A
A
 
A
R
 
K
H
 
D
A
 
I
V
 
P
V
 
I
I
 
V
K
 
F
S
 
A
G
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
C
A
 
L
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
D
Q
 
T
A
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
V
L
 
L
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
E
F
 
V
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
R
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
V
A
 
V
A
 
A
E
 
Q
G
 
A
R
 
L
N
 
G
I
 
R
G
 
D
L
 
L
G
 
Q
Q
 
E
H
 
V
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
G
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
Q
T
 
T
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
A
A
 
R
G
 
E
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
V
V
 
V
G
 
G
D
 
D
H
 
H
S
 
T
V
 
V
I
 
L
L
 
F
A
 
A
G
 
A
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
|
R
S
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
R
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
A
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
L
R
 
E
G
 
G
R
 
K
K
 
E
P
 
N
G
 
G
L
 
L
Y
 
Y
T
 
D
M
 
M
L
 
Q
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

5tejB Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
44% identity, 96% coverage: 10:276/277 of query aligns to 2:267/269 of 5tejB

query
sites
5tejB
M
 
V
K
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
N
L
 
L
I
 
V
R
 
K
I
 
A
I
 
A
H
 
H
S
 
H
T
 
N
P
 
P
G
 
V
A
 
A
M
 
K
L
 
V
S
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
S
E
|
E
R
|
R
V
 
P
G
 
E
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
F
G
 
D
V
 
V
P
 
V
I
 
V
S
 
C
D
 
D
D
 
D
A
 
L
L
 
A
A
 
K
A
 
Q
F
 
I
A
 
D
G
 
Q
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
I
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
A
P
 
P
A
 
A
A
x
S
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
 
N
A
 
L
G
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
Q
Q
 
Q
T
 
Y
G
 
G
I
 
K
V
 
S
H
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
T
S
 
E
T
 
E
D
 
Q
D
 
R
A
 
E
K
 
Q
I
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
H
 
Q
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
V
K
 
M
S
 
A
G
x
P
N
|
N
M
x
Y
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
F
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
C
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
V
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
|
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
G
G
 
A
R
 
M
N
 
G
I
 
N
G
 
K
L
 
L
G
 
S
Q
 
D
H
 
V
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
T
A
 
K
G
 
D
T
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
T
D
 
D
R
 
R
S
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
G
 
L
R
 
H
G
 
E
R
 
K
K
 
P
P
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
L
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
N

5tejA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,5 furan dicarboxylic and nadh (see paper)
44% identity, 96% coverage: 10:276/277 of query aligns to 2:267/269 of 5tejA

query
sites
5tejA
M
 
V
K
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
N
L
 
L
I
 
V
R
 
K
I
 
A
I
 
A
H
 
H
S
 
H
T
 
N
P
 
P
G
 
V
A
 
A
M
 
K
L
 
V
S
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
S
E
|
E
R
|
R
V
 
P
G
 
E
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
F
G
 
D
V
 
V
P
 
V
I
 
V
S
 
C
D
 
D
D
 
D
A
 
L
L
 
A
A
 
K
A
 
Q
F
 
I
A
 
D
G
 
Q
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
I
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
A
P
 
P
A
 
A
A
x
S
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
 
N
A
 
L
G
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
Q
Q
 
Q
T
 
Y
G
 
G
I
 
K
V
 
S
H
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
T
S
 
E
T
 
E
D
 
Q
D
 
R
A
 
E
K
 
Q
I
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
H
 
Q
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
V
K
 
M
S
 
A
G
x
P
N
 
N
M
 
Y
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
F
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
C
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
V
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
G
G
 
A
R
 
M
N
 
G
I
 
N
G
 
K
L
 
L
G
 
S
Q
 
D
H
 
V
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
T
A
 
K
G
 
D
T
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
T
D
 
D
R
 
R
S
 
M
I
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
G
 
L
R
 
H
G
 
E
R
 
K
K
 
P
P
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
L
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L
D
 
N

5temA Structure of 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase from vibrio vulnificus with 2,6 pyridine dicarboxylic and nadh (see paper)
44% identity, 96% coverage: 10:275/277 of query aligns to 2:266/266 of 5temA

query
sites
5temA
M
 
V
K
 
R
L
 
I
A
 
A
V
 
V
V
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
A
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
N
L
 
L
I
 
V
R
 
K
I
 
A
I
 
A
H
 
H
S
 
H
T
 
N
P
 
P
G
 
V
A
 
A
M
 
K
L
 
V
S
 
A
G
 
A
A
 
G
I
 
S
E
|
E
R
|
R
V
 
P
G
 
E
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
V
G
 
G
S
 
V
D
 
D
A
 
L
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
C
G
 
G
V
 
E
G
 
G
K
 
K
L
 
F
G
 
D
V
 
V
P
 
V
I
 
V
S
 
C
D
 
D
D
 
D
A
 
L
L
 
A
A
 
K
A
 
Q
F
 
I
A
 
D
G
 
Q
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
I
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
A
P
 
P
A
 
A
A
x
S
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
 
N
A
 
L
G
 
A
L
 
L
A
 
C
A
 
Q
Q
 
Q
T
 
Y
G
 
G
I
 
K
V
 
S
H
 
I
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
T
S
 
E
T
 
E
D
 
Q
D
 
R
A
 
E
K
 
Q
I
 
I
A
 
D
L
 
L
A
 
V
A
 
A
R
 
Q
H
 
Q
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
V
K
 
M
S
 
A
G
x
P
N
|
N
M
x
Y
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
L
L
 
V
A
 
F
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
C
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
V
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
|
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
L
 
G
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
G
G
 
A
R
 
M
N
 
G
I
 
N
G
 
K
L
 
L
G
 
S
Q
 
D
H
 
V
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
A
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
I
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
T
A
 
K
G
 
D
T
 
E
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
I
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
V
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
T
D
 
D
R
 
R
S
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
V
W
 
W
G
 
L
R
 
H
G
 
E
R
 
K
K
 
P
P
 
A
G
 
G
L
 
F
Y
 
Y
T
 
T
M
 
M
L
 
T
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
G
L
 
L

1drvA Escherichia coli dhpr/acnadh complex (see paper)
44% identity, 97% coverage: 10:277/277 of query aligns to 3:269/270 of 1drvA

query
sites
1drvA
M
 
I
K
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
I
 
A
I
 
A
H
 
L
S
 
A
T
 
L
P
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
A
A
 
A
I
 
L
E
|
E
R
 
R
V
 
E
G
 
G
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
V
S
 
Q
D
 
S
D
 
S
A
 
L
L
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
K
A
 
D
G
 
D
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
F
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
x
G
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
 
H
A
 
L
G
 
A
L
 
F
A
 
C
A
 
R
Q
 
Q
T
 
H
G
 
G
I
 
K
V
 
G
H
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
E
T
 
A
D
 
G
D
 
K
A
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
H
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
V
K
 
F
S
 
A
G
x
A
N
 
N
M
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
A
R
 
L
N
 
D
I
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
K
Q
 
D
H
 
C
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
V
A
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
|
R
S
 
M
I
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
L
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
D
 
N
T
 
N

1druA Escherichia coli dhpr/nadh complex (see paper)
44% identity, 97% coverage: 10:277/277 of query aligns to 3:269/270 of 1druA

query
sites
1druA
M
 
I
K
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
I
 
A
I
 
A
H
 
L
S
 
A
T
 
L
P
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
A
A
 
A
I
 
L
E
|
E
R
|
R
V
 
E
G
 
G
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
V
S
 
Q
D
 
S
D
 
S
A
 
L
L
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
K
A
 
D
G
 
D
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
F
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
x
G
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
 
H
A
 
L
G
 
A
L
 
F
A
 
C
A
 
R
Q
 
Q
T
 
H
G
 
G
I
 
K
V
 
G
H
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
E
T
 
A
D
 
G
D
 
K
A
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
H
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
V
K
 
F
S
 
A
G
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
A
R
 
L
N
 
D
I
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
K
Q
 
D
H
 
C
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
V
A
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
 
R
S
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
L
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
D
 
N
T
 
N

1arzA Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
44% identity, 97% coverage: 10:277/277 of query aligns to 3:269/270 of 1arzA

query
sites
1arzA
M
 
I
K
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
G
G
 
G
R
 
R
M
 
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
I
 
A
I
 
A
H
 
L
S
 
A
T
 
L
P
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
E
R
 
R
V
 
E
G
 
G
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
V
S
 
Q
D
 
S
D
 
S
A
 
L
L
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
K
A
 
D
G
 
D
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
F
L
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
T
T
 
R
P
 
P
A
 
E
A
 
G
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
 
H
A
 
L
G
 
A
L
 
F
A
 
C
A
 
R
Q
 
Q
T
 
H
G
 
G
I
 
K
V
 
G
H
 
M
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
E
T
 
A
D
 
G
D
 
K
A
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
H
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
V
K
 
F
S
 
A
G
 
A
N
 
N
M
 
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
|
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
A
R
 
L
N
 
D
I
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
K
Q
 
D
H
 
C
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
V
A
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
 
R
S
 
M
I
 
T
F
 
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
L
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
D
 
N
T
 
N

1arzB Escherichia coli dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pyridine dicarboxylate (see paper)
44% identity, 97% coverage: 10:277/277 of query aligns to 2:268/269 of 1arzB

query
sites
1arzB
M
 
I
K
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
A
x
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
I
 
A
I
 
A
H
 
L
S
 
A
T
 
L
P
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
A
A
 
A
I
 
L
E
|
E
R
 
R
V
 
E
G
 
G
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
V
S
 
Q
D
 
S
D
 
S
A
 
L
L
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
K
A
 
D
G
 
D
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
F
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
x
G
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
x
H
A
 
L
G
 
A
L
 
F
A
 
C
A
 
R
Q
 
Q
T
 
H
G
 
G
I
 
K
V
 
G
H
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
E
T
 
A
D
 
G
D
 
K
A
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
H
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
V
K
 
F
S
 
A
G
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
|
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
A
R
 
L
N
 
D
I
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
K
Q
 
D
H
 
C
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
V
A
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
 
R
S
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
L
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
D
 
N
T
 
N

P04036 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Escherichia coli (strain K12) (see 3 papers)
44% identity, 97% coverage: 10:277/277 of query aligns to 6:272/273 of P04036

query
sites
P04036
M
 
I
K
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
I
 
A
I
 
A
H
 
L
S
 
A
T
 
L
P
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
A
A
 
A
I
 
L
E
|
E
R
|
R
V
 
E
G
 
G
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
V
S
 
Q
D
 
S
D
 
S
A
 
L
L
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
K
A
 
D
G
 
D
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
F
L
 
I
D
 
D
F
 
F
T
|
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
 
G
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
 
H
A
 
L
G
 
A
L
 
F
A
 
C
A
 
R
Q
 
Q
T
 
H
G
 
G
I
 
K
V
 
G
H
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
E
T
 
A
D
 
G
D
 
K
A
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
H
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
V
K
 
F
S
x
A
G
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
A
R
 
L
N
 
D
I
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
K
Q
 
D
H
 
C
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
V
A
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
|
R
S
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
L
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
D
 
N
T
 
N

1drwA Escherichia coli dhpr/nhdh complex (see paper)
44% identity, 97% coverage: 10:277/277 of query aligns to 5:271/272 of 1drwA

query
sites
1drwA
M
 
I
K
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
I
 
A
I
 
A
H
 
L
S
 
A
T
 
L
P
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
A
A
 
A
I
 
L
E
|
E
R
|
R
V
 
E
G
 
G
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
V
S
 
Q
D
 
S
D
 
S
A
 
L
L
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
K
A
 
D
G
 
D
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
F
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
 
G
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
 
H
A
 
L
G
 
A
L
 
F
A
 
C
A
 
R
Q
 
Q
T
 
H
G
 
G
I
 
K
V
 
G
H
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
E
T
 
A
D
 
G
D
 
K
A
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
H
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
V
K
 
F
S
 
A
G
x
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
A
R
 
L
N
 
D
I
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
K
Q
 
D
H
 
C
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
V
A
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
 
R
S
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
L
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
D
 
N
T
 
N

1dihA Three-dimensional structure of e. Coli dihydrodipicolinate reductase (see paper)
44% identity, 97% coverage: 10:277/277 of query aligns to 5:271/272 of 1dihA

query
sites
1dihA
M
 
I
K
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
A
G
|
G
A
 
A
A
 
G
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
R
T
 
Q
L
 
L
I
 
I
R
 
Q
I
 
A
I
 
A
H
 
L
S
 
A
T
 
L
P
 
E
G
 
G
A
 
V
M
 
Q
L
 
L
S
 
G
G
 
A
A
 
A
I
 
L
E
 
E
R
|
R
V
 
E
G
 
G
S
 
S
P
 
S
H
 
L
I
 
L
G
 
G
S
 
S
D
 
D
A
 
A
G
 
G
V
 
E
L
 
L
A
 
A
G
 
G
V
 
A
G
 
G
K
 
K
L
 
T
G
 
G
V
 
V
P
 
T
I
 
V
S
 
Q
D
 
S
D
 
S
A
 
L
L
 
D
A
 
A
A
 
V
F
 
K
A
 
D
G
 
D
V
 
F
E
 
D
G
 
V
V
 
F
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
x
R
P
 
P
A
 
E
A
x
G
S
 
T
V
 
L
E
 
N
F
 
H
A
 
L
G
 
A
L
 
F
A
 
C
A
 
R
Q
 
Q
T
 
H
G
 
G
I
 
K
V
 
G
H
 
M
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
E
T
 
A
D
 
G
D
 
K
A
 
Q
K
 
A
I
 
I
A
 
R
L
 
D
A
 
A
A
 
A
R
 
A
H
 
D
A
 
I
V
 
A
V
 
I
I
 
V
K
 
F
S
 
A
G
 
A
N
|
N
M
x
F
S
 
S
L
 
V
G
 
G
V
 
V
N
 
N
L
 
V
L
 
M
A
 
L
V
 
K
L
 
L
V
 
L
K
 
E
Q
 
K
A
 
A
A
 
A
K
 
K
A
 
V
L
 
M
G
 
G
A
 
-
D
 
D
D
 
Y
F
 
T
D
 
D
V
 
I
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
A
H
|
H
H
 
H
K
 
R
H
 
H
K
|
K
V
 
V
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
L
L
 
A
L
 
M
G
 
G
E
 
E
A
 
A
A
 
I
A
 
A
E
 
H
G
 
A
R
 
L
N
 
D
I
 
K
G
 
D
L
 
L
G
 
K
Q
 
D
H
 
C
S
 
A
V
 
V
R
 
Y
V
 
S
R
 
R
D
 
E
G
 
G
H
 
H
T
 
T
G
 
G
A
 
E
R
 
R
E
 
V
A
 
P
G
 
G
T
 
T
I
 
I
G
 
G
F
 
F
A
 
A
S
 
T
L
 
V
R
 
R
G
 
A
G
 
G
S
 
D
V
 
I
V
 
V
G
 
G
D
 
E
H
 
H
S
 
T
V
 
A
I
 
M
L
 
F
A
 
A
G
 
D
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
R
I
 
L
T
 
E
L
 
I
S
 
T
H
 
H
H
 
K
A
 
A
E
 
S
D
 
S
R
|
R
S
 
M
I
 
T
F
|
F
A
 
A
R
 
N
G
 
G
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
S
A
 
A
L
 
L
W
 
W
G
 
L
R
 
S
G
 
G
R
 
K
K
 
E
P
 
S
G
 
G
L
 
L
Y
 
F
T
 
D
M
 
M
L
 
R
D
 
D
V
 
V
L
 
L
G
 
D
L
 
L
D
 
N
T
 
N

Q9X1K8 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase; HTPA reductase; EC 1.17.1.8 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
31% identity, 95% coverage: 10:273/277 of query aligns to 1:212/216 of Q9X1K8

query
sites
Q9X1K8
M
 
M
K
 
K
L
 
Y
A
 
G
V
 
I
V
 
V
G
 
G
A
 
Y
A
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
E
L
 
-
I
 
I
R
 
Q
I
 
K
I
 
V
H
 
F
S
 
S
T
 
E
P
 
K
G
 
G
A
 
H
M
 
E
L
 
L
S
 
V
G
 
L
A
 
K
I
 
V
E
 
D
R
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
V
A
 
N
G
 
G
V
 
V
G
 
E
K
 
E
L
 
L
G
 
D
V
 
S
P
 
P
I
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
D
G
 
V
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
 
F
T
 
S
T
 
S
P
 
P
A
 
E
A
 
A
S
 
L
V
 
P
E
 
K
F
 
T
A
 
V
G
 
D
L
 
L
A
 
C
A
 
K
Q
 
K
T
 
Y
G
 
R
I
 
A
V
 
G
H
 
L
V
 
V
V
 
L
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
A
C
 
L
D
 
K
S
 
E
T
 
E
D
 
H
D
 
L
A
 
Q
K
 
M
I
 
L
A
 
R
L
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
K
H
 
E
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
V
K
 
Q
S
x
A
G
x
Y
N
|
N
M
x
F
S
 
S
L
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
K
V
 
R
L
 
F
V
 
L
K
 
S
Q
 
E
A
 
L
A
 
V
K
 
K
A
 
V
L
 
L
G
 
-
A
 
-
D
 
E
D
 
D
F
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
L
 
V
E
 
E
M
 
T
H
 
H
H
 
H
K
 
R
H
 
F
K
|
K
V
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
-
E
 
-
A
 
E
A
 
S
A
 
A
E
 
L
G
 
G
R
 
K
N
 
S
I
 
V
G
 
P
L
 
I
G
 
-
Q
 
-
H
 
H
S
 
S
V
 
L
R
 
R
V
 
V
R
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
F
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
-
R
 
-
G
 
-
G
 
G
S
 
G
V
 
V
V
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
S
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
F
A
 
G
G
 
N
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
I
T
 
E
L
 
I
S
 
K
H
 
H
H
 
R
A
 
A
E
 
I
D
 
S
R
 
R
S
 
T
I
 
V
F
 
F
A
 
A
R
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
E
W
 
F
G
 
L
R
 
V
G
 
G
R
 
K
K
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
T
 
S
M
 
F
L
 
E
D
 
E
V
 
V
L
 
I

1vm6B Crystal structure of dihydrodipicolinate reductase (tm1520) from thermotoga maritima at 2.27 a resolution
31% identity, 95% coverage: 10:273/277 of query aligns to 6:217/218 of 1vm6B

query
sites
1vm6B
M
 
M
K
 
K
L
 
Y
A
 
G
V
 
I
V
 
V
G
|
G
A
 
Y
A
x
S
G
|
G
R
|
R
M
|
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
E
L
 
I
I
 
Q
R
 
K
I
 
V
I
 
F
H
 
-
S
 
S
T
 
E
P
 
K
G
 
G
A
 
H
M
 
E
L
 
L
S
 
V
G
 
L
A
 
K
I
 
V
E
x
D
R
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
x
V
A
 
N
G
 
G
V
 
V
G
 
E
K
 
E
L
 
L
G
 
D
V
 
S
P
 
P
I
 
-
S
 
-
D
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
-
A
 
-
A
 
-
F
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
E
 
D
G
 
V
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
x
S
T
x
S
P
 
P
A
x
E
A
|
A
S
 
L
V
 
P
E
 
K
F
 
T
A
 
V
G
 
D
L
 
L
A
 
C
A
 
K
Q
 
K
T
 
Y
G
 
R
I
 
A
V
 
G
H
 
L
V
 
V
V
 
L
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
A
C
 
L
D
 
K
S
 
E
T
 
E
D
 
H
D
 
L
A
 
Q
K
 
M
I
 
L
A
 
R
L
 
E
A
 
L
A
 
S
R
 
K
H
 
E
A
 
V
V
 
P
V
 
V
I
 
V
K
 
Q
S
 
A
G
x
Y
N
|
N
M
x
F
S
 
S
L
 
I
G
 
G
V
 
I
N
 
N
L
 
V
L
 
L
A
 
K
V
 
R
L
 
F
V
 
L
K
 
S
Q
 
E
A
 
L
A
 
V
K
 
K
A
 
V
L
 
L
G
 
-
A
 
-
D
 
E
D
 
D
F
 
W
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
L
 
V
E
 
E
M
 
T
H
|
H
H
 
H
K
 
R
H
 
F
K
|
K
V
 
K
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
 
G
T
 
T
A
 
A
L
 
I
L
 
L
L
 
L
G
 
E
E
 
S
A
 
A
A
 
-
A
 
-
E
 
-
G
 
-
R
 
-
N
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
G
 
G
Q
 
K
H
 
-
S
 
-
V
 
-
R
 
-
V
 
-
R
 
-
D
 
-
G
 
-
H
 
-
T
 
-
G
 
-
A
 
-
R
 
-
E
 
-
A
 
-
G
 
-
T
 
S
I
 
V
G
 
P
F
 
I
A
 
H
S
 
S
L
 
L
R
 
R
G
 
V
G
 
G
S
 
G
V
 
V
V
 
P
G
 
G
D
 
D
H
 
H
S
 
V
V
 
V
I
 
V
L
 
F
A
 
G
G
 
N
Q
 
I
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
I
T
 
E
L
 
I
S
 
K
H
 
H
H
 
R
A
 
A
E
 
I
D
 
S
R
 
R
S
 
T
I
 
V
F
|
F
A
 
A
R
 
I
G
 
G
A
 
A
V
 
L
K
 
K
A
 
A
A
 
A
L
 
E
W
 
F
G
 
L
R
 
V
G
 
G
R
 
K
K
 
D
P
 
P
G
 
G
L
 
M
Y
 
Y
T
 
S
M
 
F
L
 
E
D
 
E
V
 
V
L
 
I

5eesA Crystal structure of dapb in complex with NADP+ from corynebacterium glutamicum (see paper)
30% identity, 96% coverage: 10:275/277 of query aligns to 2:247/247 of 5eesA

query
sites
5eesA
M
 
I
K
 
K
L
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
G
|
G
A
 
A
A
 
K
G
|
G
R
|
R
M
x
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
I
I
 
V
R
 
A
I
 
A
I
 
V
H
 
N
S
 
E
T
 
S
P
 
-
G
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
S
 
D
D
 
D
A
 
L
G
 
E
V
 
L
L
 
V
A
 
A
G
 
E
V
 
I
G
|
G
K
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
I
x
V
S
 
D
D
 
D
D
 
D
-
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
L
A
 
V
F
 
D
A
 
N
G
 
G
V
 
A
E
 
E
G
 
V
V
 
V
L
 
V
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
T
P
 
P
A
 
N
A
 
A
S
 
V
V
 
M
E
 
G
F
 
N
A
 
L
G
 
E
L
 
F
A
 
C
A
 
I
Q
 
N
T
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
S
H
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
D
T
 
A
-
 
R
-
 
L
D
 
E
D
 
Q
A
 
V
K
 
R
I
 
D
A
 
W
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
K
H
 
D
A
 
N
V
 
V
-
 
G
V
 
V
I
 
L
K
 
I
S
 
A
G
x
P
N
|
N
M
x
F
S
 
A
L
 
I
G
 
S
V
 
A
N
 
V
L
 
L
L
 
T
A
 
M
V
 
V
L
 
F
V
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
F
L
 
F
G
 
E
A
 
S
D
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
A
E
 
E
I
 
V
L
 
I
E
 
E
M
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
P
H
 
N
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
 
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
L
 
H
L
 
T
G
 
A
E
 
Q
A
 
G
A
 
I
A
 
A
E
 
A
G
 
A
R
 
R
-
 
K
N
 
E
I
 
A
G
 
G
L
 
M
G
 
D
Q
 
A
H
 
Q
S
 
P
V
 
D
R
 
A
V
 
T
R
 
E
D
 
Q
G
 
A
H
 
L
T
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
G
A
 
A
G
 
S
T
 
V
I
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
P
-
 
V
-
 
H
S
 
A
L
 
V
R
 
R
G
 
M
G
 
S
S
 
G
V
 
M
V
 
V
G
 
A
D
 
H
H
 
E
S
 
Q
V
 
V
I
 
I
L
 
F
A
 
G
G
 
T
Q
 
Q
G
 
G
E
 
Q
R
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
I
S
 
K
H
 
Q
H
 
D
A
 
S
E
 
Y
D
 
D
R
 
R
S
 
N
I
 
S
F
|
F
A
 
A
R
 
P
G
 
G
A
 
-
V
 
V
K
 
L
A
 
V
A
 
G
L
 
V
W
 
R
G
 
N
R
 
I
G
 
A
R
 
Q
K
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
T
 
V
M
 
G
L
 
L
D
 
E
-
 
H
V
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L

5eerA Crystal structure of dapb from corynebacterium glutamicum (see paper)
30% identity, 96% coverage: 10:275/277 of query aligns to 2:247/247 of 5eerA

query
sites
5eerA
M
 
I
K
 
K
L
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
G
 
G
A
 
A
A
 
K
G
 
G
R
 
R
M
 
V
G
 
G
Q
 
Q
T
 
T
L
 
I
I
 
V
R
 
A
I
 
A
I
 
V
H
 
N
S
 
E
T
 
S
P
 
-
G
 
-
A
 
-
M
 
-
L
 
-
S
 
-
G
 
-
A
 
-
I
 
-
E
 
-
R
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
S
 
D
D
 
D
A
 
L
G
 
E
V
 
L
L
 
V
A
 
A
G
 
E
V
 
I
G
 
G
K
 
-
L
 
-
G
 
-
V
 
-
P
 
-
I
 
V
S
 
D
D
 
D
D
 
D
-
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
L
A
 
V
F
 
D
A
 
N
G
 
G
V
 
A
E
 
E
G
 
V
V
 
V
L
 
V
D
 
D
F
 
F
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
N
A
 
A
S
 
V
V
 
M
E
 
G
F
 
N
A
 
L
G
 
E
L
 
F
A
 
C
A
 
I
Q
 
N
T
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
S
H
 
A
V
 
V
V
 
V
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
C
 
F
D
 
D
S
 
D
T
 
A
-
 
R
-
 
L
D
 
E
D
 
Q
A
 
V
K
 
R
I
 
D
A
 
W
L
 
L
A
 
E
A
 
G
R
 
K
H
 
D
A
 
N
V
 
V
-
 
G
V
 
V
I
 
L
K
 
I
S
 
A
G
 
P
N
 
N
M
 
F
S
 
A
L
 
I
G
 
S
V
 
A
N
 
V
L
 
L
L
 
T
A
 
M
V
 
V
L
 
F
V
 
S
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
F
L
 
F
G
 
E
A
 
S
D
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
A
E
 
E
I
 
V
L
 
I
E
 
E
M
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
P
H
 
N
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
I
L
 
H
L
 
T
G
 
A
E
 
Q
A
 
G
A
 
I
A
 
A
E
 
A
G
 
A
R
 
R
-
 
K
N
 
E
I
 
A
G
 
G
L
 
M
G
 
D
Q
 
A
H
 
Q
S
 
P
V
 
D
R
 
A
V
 
T
R
 
E
D
 
Q
G
 
A
H
 
L
T
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
R
E
 
G
A
 
A
G
 
S
T
 
V
I
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
P
-
 
V
-
 
H
S
 
A
L
 
V
R
 
R
G
 
M
G
 
S
S
 
G
V
 
M
V
 
V
G
 
A
D
 
H
H
 
E
S
 
Q
V
 
V
I
 
I
L
 
F
A
 
G
G
 
T
Q
 
Q
G
 
G
E
 
Q
R
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
I
S
 
K
H
 
Q
H
 
D
A
 
S
E
 
Y
D
 
D
R
 
R
S
 
N
I
 
S
F
 
F
A
 
A
R
 
P
G
 
G
A
 
-
V
 
V
K
 
L
A
 
V
A
 
G
L
 
V
W
 
R
G
 
N
R
 
I
G
 
A
R
 
Q
K
 
H
P
 
P
G
 
G
L
 
L
Y
 
V
T
 
V
M
 
G
L
 
L
D
 
E
-
 
H
V
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L

5z2fA NADPH/pda bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
27% identity, 87% coverage: 10:251/277 of query aligns to 3:243/265 of 5z2fA

query
sites
5z2fA
M
 
I
K
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
G
G
 
G
A
 
P
A
x
R
G
|
G
R
x
K
M
|
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
E
L
 
A
I
 
V
R
 
H
I
 
T
I
 
V
H
 
M
S
 
N
T
 
N
P
 
E
G
 
N
A
 
M
M
 
E
L
 
L
S
 
V
G
 
A
A
 
V
I
 
L
E
x
D
R
x
H
V
x
K
G
 
D
S
 
I
P
 
G
H
 
D
I
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
E
A
 
S
G
 
P
V
 
N
L
 
F
A
 
P
G
 
A
V
 
S
G
 
Y
K
 
E
L
 
V
G
 
P
V
 
V
P
 
F
I
 
L
S
 
N
D
 
L
D
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
I
A
 
V
F
 
T
A
 
I
G
 
K
V
 
P
E
 
D
G
 
V
V
 
F
L
 
L
D
 
D
F
x
L
T
|
T
T
 
T
P
 
P
A
 
H
A
 
Q
S
 
V
V
 
F
E
 
E
F
 
H
A
 
T
G
 
M
L
 
L
A
 
C
A
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
N
I
 
V
V
 
R
H
 
P
V
 
V
V
 
I
G
|
G
T
|
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
-
 
T
-
 
D
D
 
E
S
 
Q
T
 
L
D
 
Q
D
 
Q
A
 
C
K
 
T
I
 
I
A
 
L
L
 
A
A
 
E
A
 
V
R
 
N
H
 
K
A
 
L
V
 
G
V
 
C
I
 
I
K
 
V
S
 
A
G
x
P
N
|
N
M
x
F
S
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
M
K
 
M
Q
 
K
A
 
F
A
 
A
K
 
S
A
 
L
L
 
A
G
 
A
A
 
A
D
 
Y
D
 
F
F
 
P
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
M
H
|
H
H
|
H
K
 
D
H
 
Q
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
Y
L
 
K
L
 
T
G
 
A
E
 
Q
A
 
M
A
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
V
R
 
R
N
 
P
I
 
S
G
 
H
L
 
K
G
 
Q
Q
 
G
H
 
H
S
 
P
V
 
-
R
 
N
V
 
E
R
 
K
D
 
E
G
 
T
H
 
L
T
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
G
A
 
A
G
 
S
T
 
Y
-
 
D
-
 
G
I
 
I
G
 
P
F
 
I
A
 
H
S
 
S
L
 
V
R
 
R
G
 
L
G
 
P
S
 
G
V
 
L
V
 
I
G
x
A
D
 
H
H
 
Q
S
 
Q
V
 
I
I
 
L
L
 
F
A
 
G
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
L
I
 
F
T
 
T
L
 
L
S
 
R
H
 
H
H
 
D
A
 
S
E
 
Y
D
 
N
R
 
R
S
 
Q
I
 
S
F
 
F
A
 
M
R
 
S
G
 
G

5z2eA Dipicolinate bound dihydrodipicolinate reductase from paenisporosarcina sp. Tg-14 (see paper)
27% identity, 87% coverage: 10:251/277 of query aligns to 3:243/265 of 5z2eA

query
sites
5z2eA
M
 
I
K
 
R
L
 
V
A
 
A
V
 
I
V
 
G
G
 
G
A
 
P
A
 
R
G
 
G
R
 
K
M
 
M
G
 
G
Q
 
Q
T
 
E
L
 
A
I
 
V
R
 
H
I
 
T
I
 
V
H
 
M
S
 
N
T
 
N
P
 
E
G
 
N
A
 
M
M
 
E
L
 
L
S
 
V
G
 
A
A
 
V
I
 
L
E
 
D
R
 
H
V
 
K
G
 
D
S
 
I
P
 
G
H
 
D
I
 
L
G
 
L
S
 
S
D
 
E
A
 
S
G
 
P
V
 
N
L
 
F
A
 
P
G
 
A
V
 
S
G
 
Y
K
 
E
L
 
V
G
 
P
V
 
V
P
 
F
I
 
L
S
 
N
D
 
L
D
 
E
A
 
S
L
 
L
A
 
I
A
 
V
F
 
T
A
 
I
G
 
K
V
 
P
E
 
D
G
 
V
V
 
F
L
 
L
D
 
D
F
 
L
T
 
T
T
 
T
P
 
P
A
 
H
A
 
Q
S
 
V
V
 
F
E
 
E
F
 
H
A
 
T
G
 
M
L
 
L
A
 
C
A
 
L
Q
 
Q
T
 
N
G
 
N
I
 
V
V
 
R
H
 
P
V
 
V
V
 
I
G
 
G
T
 
T
T
 
T
G
 
G
C
 
F
-
 
T
-
 
D
D
 
E
S
 
Q
T
 
L
D
 
Q
D
 
Q
A
 
C
K
 
T
I
 
I
A
 
L
L
 
A
A
 
E
A
 
V
R
 
N
H
 
K
A
 
L
V
 
G
V
 
C
I
 
I
K
 
V
S
 
A
G
 
P
N
 
N
M
 
F
S
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
-
N
 
-
L
 
-
L
 
-
A
 
A
V
 
V
L
 
L
V
 
M
K
 
M
Q
 
K
A
 
F
A
 
A
K
 
S
A
 
L
L
 
A
G
 
A
A
 
A
D
 
Y
D
 
F
F
 
P
D
 
D
V
 
V
E
 
E
I
 
I
L
 
I
E
 
E
M
 
M
H
|
H
H
|
H
K
 
D
H
 
Q
K
|
K
V
 
L
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
Y
L
 
K
L
 
T
G
 
A
E
 
Q
A
 
M
A
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
V
R
 
R
N
 
P
I
 
S
G
 
H
L
 
K
G
 
Q
Q
 
G
H
 
H
S
 
P
V
 
-
R
 
N
V
 
E
R
 
K
D
 
E
G
 
T
H
 
L
T
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
G
A
 
A
G
 
S
T
 
Y
-
 
D
-
 
G
I
 
I
G
 
P
F
 
I
A
 
H
S
 
S
L
 
V
R
 
R
G
 
L
G
 
P
S
 
G
V
 
L
V
 
I
G
 
A
D
 
H
H
 
Q
S
 
Q
V
 
I
I
 
L
L
 
F
A
 
G
G
 
G
Q
 
E
G
 
G
E
 
Q
R
 
L
I
 
F
T
 
T
L
 
L
S
 
R
H
 
H
H
 
D
A
 
S
E
 
Y
D
 
N
R
 
R
S
 
Q
I
 
S
F
 
F
A
 
M
R
 
S
G
 
G

1p9lA Structure of m. Tuberculosis dihydrodipicolinate reductase in complex with nadh and 2,6 pdc (see paper)
29% identity, 95% coverage: 10:273/277 of query aligns to 1:241/245 of 1p9lA

query
sites
1p9lA
M
 
M
K
 
R
L
 
V
A
 
G
V
 
V
V
 
L
G
|
G
A
 
A
A
 
K
G
|
G
R
x
K
M
x
V
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
L
 
M
I
 
V
R
 
R
I
 
A
I
 
V
H
 
A
S
 
A
T
 
A
P
 
D
G
 
D
A
 
L
M
 
T
L
 
L
S
 
S
G
 
A
A
 
E
I
 
L
E
x
D
R
x
A
V
 
-
G
 
-
S
 
-
P
 
-
H
 
-
I
 
-
G
 
-
S
 
-
D
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
L
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
K
 
-
L
 
-
G
 
G
V
 
D
P
 
P
I
 
L
S
 
S
D
 
-
D
 
-
A
 
-
L
 
L
A
 
L
A
 
T
F
 
D
A
 
G
G
 
N
V
 
T
E
 
E
G
 
V
V
 
V
L
 
I
D
 
D
F
|
F
T
|
T
T
 
H
P
 
P
A
 
D
A
x
V
S
 
V
V
 
M
E
 
G
F
 
N
A
 
L
G
 
E
L
 
F
A
 
L
A
 
I
Q
 
D
T
 
N
G
 
G
I
 
I
V
 
H
H
 
A
V
 
V
V
 
V
G
|
G
T
 
T
T
|
T
G
 
G
C
 
F
D
 
T
S
 
A
T
 
E
D
 
R
D
 
F
A
 
Q
K
 
Q
I
 
V
A
 
E
-
 
S
-
 
W
-
 
L
L
 
V
A
 
A
A
 
K
R
 
P
H
 
N
A
 
T
V
 
S
V
 
V
I
 
L
K
 
I
S
 
A
G
x
P
N
|
N
M
x
F
S
 
A
L
 
I
G
 
G
V
 
A
N
 
V
L
 
L
L
 
S
A
 
M
V
 
H
L
 
F
V
 
A
K
 
K
Q
 
Q
A
 
A
A
 
A
K
 
R
A
 
F
L
 
F
G
 
D
A
 
S
D
 
-
D
 
-
F
 
-
D
 
-
V
 
A
E
 
E
I
 
V
L
 
I
E
 
E
M
 
L
H
|
H
H
|
H
K
 
P
H
 
H
K
|
K
V
 
A
D
 
D
A
 
A
P
 
P
S
|
S
G
|
G
T
|
T
A
 
A
L
 
A
L
 
R
L
 
T
G
 
A
E
 
K
A
 
L
A
 
I
A
 
A
E
 
E
G
 
A
R
 
R
N
 
K
I
 
-
G
 
G
L
 
L
G
 
P
Q
 
P
H
 
N
S
 
P
V
 
D
R
 
A
V
 
T
R
 
S
D
 
T
G
 
S
H
 
L
T
 
P
G
 
G
A
 
A
R
 
R
E
 
G
A
 
A
G
 
D
T
 
V
I
 
D
G
 
G
F
 
I
A
 
P
-
 
V
-
 
H
S
 
A
L
 
V
R
 
R
G
 
L
G
 
A
S
 
G
V
 
L
V
 
V
G
x
A
D
 
H
H
 
Q
S
 
E
V
 
V
I
 
L
L
 
F
A
 
G
G
 
T
Q
 
E
G
 
G
E
 
E
R
 
T
I
 
L
T
 
T
L
 
I
S
 
R
H
 
H
H
 
D
A
 
S
E
 
L
D
 
D
R
 
R
S
 
T
I
 
S
F
|
F
A
 
V
R
 
P
G
 
G
A
 
-
V
 
V
K
 
L
A
 
L
A
 
A
L
 
V
W
 
R
G
 
R
R
 
I
G
 
A
R
 
E
K
 
R
P
 
P
G
 
G
L
 
L
Y
 
T
T
 
V
M
 
G
L
 
L
D
 
E
V
 
P
L
 
L

Query Sequence

>WP_106714899.1 NCBI__GCF_003010935.1:WP_106714899.1
MSDVEQPTPMKLAVVGAAGRMGQTLIRIIHSTPGAMLSGAIERVGSPHIGSDAGVLAGVG
KLGVPISDDALAAFAGVEGVLDFTTPAASVEFAGLAAQTGIVHVVGTTGCDSTDDAKIAL
AARHAVVIKSGNMSLGVNLLAVLVKQAAKALGADDFDVEILEMHHKHKVDAPSGTALLLG
EAAAEGRNIGLGQHSVRVRDGHTGAREAGTIGFASLRGGSVVGDHSVILAGQGERITLSH
HAEDRSIFARGAVKAALWGRGRKPGLYTMLDVLGLDT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory