SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_108358865.1 NCBI__GCF_003063475.1:WP_108358865.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q5HH38 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Staphylococcus aureus (strain COL) (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 11:271/273 of Q5HH38

query
sites
Q5HH38
Q
 
E
F
 
Y
E
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
K
Y
 
Y
E
 
E
N
 
F
R
 
Y
N
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
E
K
 
V
M
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
T
G
 
P
T
 
K
T
 
T
C
 
V
D
 
A
E
 
E
I
 
M
I
 
I
K
 
D
A
 
A
L
 
F
N
 
S
K
 
R
A
 
A
G
 
R
Y
 
D
D
 
D
R
 
Q
S
 
N
V
 
V
G
 
S
A
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
S
 
K
A
 
K
H
 
R
-
 
G
D
 
H
G
 
G
N
 
G
Y
 
Y
D
 
V
G
 
G
R
 
E
G
 
D
T
 
Q
I
 
I
G
 
P
-
 
R
L
 
L
P
 
N
M
 
V
E
 
L
E
 
D
L
 
L
H
 
Q
T
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
I
V
 
I
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
K
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
N
V
 
V
L
 
L
C
 
N
T
 
V
I
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
 
D
P
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
H
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
N
G
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
E
Q
 
K
L
 
V
D
 
E
A
 
D
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
Q
W
 
W
G
 
C
E
 
K
E
 
E
I
 
I
C
 
M
E
 
K
R
 
H
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
F
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
M
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
D
H
 
G
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
Q
L
 
M
G
 
A
M
 
G
Y
 
D
A
 
A
L
 
T
K
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
 
Y
D
 
T
T
 
T
E
 
D
E
 
E
S
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
K
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
D
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
D
K
 
Q
Y
 
F
A
 
P
K
 
K

2uzfA Crystal structure of staphylococcus aureus 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coa synthase (menb) in complex with acetoacetyl coa (see paper)
49% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 6:258/260 of 2uzfA

query
sites
2uzfA
Q
 
E
F
 
Y
E
 
D
D
 
E
I
 
I
L
 
K
Y
 
Y
E
 
E
N
 
F
R
 
Y
N
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
V
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
E
K
x
V
M
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
T
G
 
P
T
 
K
T
 
T
C
 
V
D
 
A
E
 
E
I
 
M
I
 
I
K
 
D
A
 
A
L
 
F
N
 
S
K
 
R
A
 
A
G
 
R
Y
 
D
D
 
D
R
 
Q
S
 
N
V
 
V
G
 
S
A
 
V
I
 
I
V
 
V
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
L
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
 
Q
S
 
K
A
 
G
H
 
E
D
 
D
G
 
Q
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
I
I
 
P
G
x
R
L
 
L
P
 
N
M
 
V
E
x
L
E
 
D
L
 
L
H
 
Q
T
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
I
V
 
I
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
K
G
 
G
F
x
Y
A
 
A
I
 
V
G
 
G
G
|
G
G
 
G
N
 
N
V
|
V
L
 
L
C
 
N
T
 
V
I
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
x
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
|
D
P
x
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
G
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
H
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
N
G
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
L
A
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
E
Q
 
K
L
 
V
D
 
E
A
 
D
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
Q
W
 
W
G
 
C
E
 
K
E
 
E
I
 
I
C
 
M
E
 
K
R
 
H
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
F
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
M
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
T
A
 
D
H
 
G
Q
 
L
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
Q
L
 
M
G
x
A
M
 
G
Y
 
D
A
 
A
L
 
T
K
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
|
Y
D
 
T
T
 
T
E
 
D
E
 
E
S
 
A
R
 
K
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
K
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
D
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
D
K
 
Q
Y
 
F
A
 
P
K
 
K

3t88A Crystal structure of escherichia coli menb in complex with substrate analogue, osb-ncoa (see paper)
48% identity, 99% coverage: 3:260/260 of query aligns to 18:279/281 of 3t88A

query
sites
3t88A
F
 
F
E
 
E
D
 
D
I
 
I
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
-
 
K
N
 
S
R
 
T
N
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
x
Q
K
x
V
M
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
L
T
 
T
C
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
M
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
A
K
 
D
A
 
A
G
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
D
S
 
N
V
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
S
x
K
A
 
V
-
x
R
-
 
G
-
 
D
H
 
Y
D
 
G
G
 
G
N
x
Y
Y
 
K
D
 
D
G
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
V
I
 
H
G
x
H
L
 
L
P
 
N
M
x
V
E
x
L
E
 
D
L
 
F
H
 
Q
T
 
R
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
T
V
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
x
Y
A
 
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
|
V
L
 
L
C
 
H
T
 
M
I
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
x
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
x
V
G
 
G
S
|
S
V
x
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
W
G
 
G
T
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Y
 
F
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
D
G
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
R
W
 
W
G
 
C
E
 
R
E
 
E
I
 
M
C
 
L
E
 
Q
R
 
N
S
 
S
P
 
P
T
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
x
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
x
T
K
 
M
L
 
L
Y
 
F
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
N
A
 
A
L
x
F
K
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
K
K
 
R

4i42A E.Coli. 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl coenzyme a synthase (ecmenb) in complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-coa (see paper)
48% identity, 99% coverage: 3:260/260 of query aligns to 22:283/285 of 4i42A

query
sites
4i42A
F
 
F
E
 
E
D
 
D
I
 
I
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
-
 
K
N
 
S
R
 
T
N
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
Q
K
x
V
M
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
L
T
 
T
C
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
M
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
A
K
 
D
A
 
A
G
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
D
S
 
N
V
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
S
x
K
A
 
V
-
x
R
-
 
G
-
 
D
H
 
Y
D
 
G
G
 
G
N
x
Y
Y
 
K
D
 
D
G
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
V
I
 
H
G
x
H
L
 
L
P
 
N
M
x
V
E
x
L
E
 
D
L
 
F
H
 
Q
T
 
R
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
T
V
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
x
Y
A
 
S
I
 
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
|
V
L
 
L
C
 
H
T
 
M
I
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
x
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
W
G
 
G
T
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Y
 
F
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
D
G
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
R
W
 
W
G
 
C
E
 
R
E
 
E
I
 
M
C
 
L
E
 
Q
R
 
N
S
 
S
P
 
P
T
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
x
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
x
T
K
 
M
L
 
L
Y
 
F
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
N
A
 
A
L
x
F
K
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
K
K
 
R

P0ABU0 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Escherichia coli (strain K12) (see 4 papers)
48% identity, 99% coverage: 3:260/260 of query aligns to 22:283/285 of P0ABU0

query
sites
P0ABU0
F
 
F
E
 
E
D
 
D
I
 
I
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
-
 
K
N
 
S
R
 
T
N
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
Q
K
 
V
M
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
L
T
 
T
C
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
M
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
A
K
 
D
A
 
A
G
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
D
S
 
N
V
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
S
x
K
A
 
V
-
x
R
-
 
G
-
 
D
H
 
Y
D
 
G
G
 
G
N
x
Y
Y
 
K
D
 
D
G
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
V
I
 
H
G
 
H
L
 
L
P
 
N
M
 
V
E
 
L
E
 
D
L
 
F
H
 
Q
T
 
R
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
T
V
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
x
Y
A
x
S
I
|
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
 
V
L
 
L
C
 
H
T
 
M
I
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
V
x
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
 
D
P
 
G
G
 
G
Y
 
W
G
 
G
T
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
Y
 
F
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
D
G
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
R
W
 
W
G
 
C
E
 
R
E
 
E
I
 
M
C
 
L
E
 
Q
R
 
N
S
 
S
P
 
P
T
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
 
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
 
T
K
 
M
L
 
L
Y
 
F
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
x
R
N
 
N
A
 
A
L
x
F
K
 
N
E
 
Q
K
|
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
K
K
 
R

Q8GYN9 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase, peroxisomal; DHNS; Enoyl-CoA hydratase/isomerase D; ECHID; Naphthoate synthase; EC 4.1.3.36 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
48% identity, 100% coverage: 2:260/260 of query aligns to 73:335/337 of Q8GYN9

query
sites
Q8GYN9
Q
 
E
F
 
F
E
 
V
D
 
D
I
 
I
L
 
I
Y
 
Y
E
 
E
N
 
K
-
 
A
-
 
L
R
 
D
N
 
E
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
E
K
 
R
M
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
Q
T
 
T
C
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
L
I
 
M
K
 
R
A
 
A
L
 
F
N
 
N
K
 
D
A
 
A
G
 
R
Y
 
D
D
 
D
R
 
S
S
 
S
V
 
V
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
K
G
 
G
D
 
T
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
 
S
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
S
 
A
-
 
L
-
 
R
A
 
T
H
 
Q
D
 
D
G
 
G
N
 
Y
Y
 
A
D
 
D
G
 
P
R
 
N
G
 
D
T
 
V
I
 
G
G
 
R
L
 
L
P
 
N
M
 
V
E
 
L
E
 
D
L
 
L
H
 
Q
T
 
V
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
R
V
 
L
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
I
 
V
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
H
V
 
I
L
 
L
C
 
H
T
 
M
I
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
G
 
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
F
D
 
D
P
 
A
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
S
F
 
I
L
 
M
A
 
S
R
 
R
V
 
L
V
 
V
G
 
G
E
 
P
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
M
W
 
W
Y
 
F
L
 
M
N
 
T
R
 
R
R
 
F
Y
 
Y
T
 
T
G
 
A
A
 
S
E
 
E
A
 
A
V
 
E
A
 
K
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
I
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
E
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
K
W
 
W
G
 
C
E
 
R
E
 
E
I
 
I
C
 
L
E
 
R
R
 
N
S
 
S
P
 
P
T
 
T
A
 
A
L
 
I
A
 
R
I
 
V
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
V
T
 
D
A
 
D
H
 
G
Q
 
H
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
G
M
 
G
Y
 
D
A
 
A
L
 
T
K
 
L
L
 
L
Y
 
F
Y
 
Y
D
 
G
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
A
R
 
T
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
T
A
 
A
L
 
Y
K
 
M
E
 
H
K
 
R
R
 
R
K
 
P
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
H
K
 
R

Sites not aligning to the query:

4elxA Structure of apo e.Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coa synthases with cl (see paper)
48% identity, 99% coverage: 3:260/260 of query aligns to 19:266/268 of 4elxA

query
sites
4elxA
F
 
F
E
 
E
D
 
D
I
 
I
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
-
 
K
N
 
S
R
 
T
N
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
Q
K
 
V
M
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
L
T
 
T
C
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
M
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
A
K
 
D
A
 
A
G
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
D
S
 
N
V
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
Q
 
Q
S
 
K
A
 
H
H
|
H
D
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
N
M
 
V
E
x
L
E
 
D
L
 
F
H
 
Q
T
 
R
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
T
V
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
S
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
|
V
L
 
L
C
 
H
T
 
M
I
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
W
G
 
G
T
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
Y
 
F
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
D
G
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
R
W
 
W
G
 
C
E
 
R
E
 
E
I
 
M
C
 
L
E
 
Q
R
 
N
S
 
S
P
 
P
T
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
x
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
 
T
K
 
M
L
 
L
Y
 
F
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
K
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
K
K
 
R

4elwA Structure of e. Coli. 1,4-dihydroxy-2- naphthoyl coenzyme a synthases (menb) in complex with nitrate (see paper)
48% identity, 99% coverage: 3:260/260 of query aligns to 19:265/267 of 4elwA

query
sites
4elwA
F
 
F
E
 
E
D
 
D
I
 
I
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
-
 
K
N
 
S
R
 
T
N
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
Q
K
 
V
M
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
L
T
 
T
C
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
M
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
A
K
 
D
A
 
A
G
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
D
S
 
N
V
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
Q
 
Q
S
 
K
A
 
H
H
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
N
M
 
V
E
x
L
E
 
D
L
 
F
H
 
Q
T
 
R
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
T
V
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
S
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
|
V
L
 
L
C
 
H
T
 
M
I
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
x
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
x
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
W
G
 
G
T
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
Y
 
F
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
D
G
 
A
A
 
K
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
R
W
 
W
G
 
C
E
 
R
E
 
E
I
 
M
C
 
L
E
 
Q
R
 
N
S
 
S
P
 
P
T
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
x
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
 
T
K
 
M
L
 
L
Y
 
F
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
K
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
K
K
 
R

Q7CQ56 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase; DHNA-CoA synthase; EC 4.1.3.36 from Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
47% identity, 99% coverage: 3:260/260 of query aligns to 22:283/285 of Q7CQ56

query
sites
Q7CQ56
F
 
Y
E
 
T
D
 
D
I
 
I
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
-
 
K
N
 
S
R
 
T
N
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
Q
K
 
V
M
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
L
T
 
T
C
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
M
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
A
K
 
D
A
 
A
G
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
D
S
 
N
V
 
V
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
 
A
G
 
G
G
 
G
D
 
D
Q
 
Q
S
 
K
A
 
V
-
 
R
-
 
G
-
 
D
H
 
Y
D
 
G
G
 
G
N
 
Y
Y
 
Q
D
 
D
G
 
D
R
 
S
G
 
G
T
 
V
I
 
H
G
 
H
L
 
L
P
 
N
M
 
V
E
 
L
E
 
D
L
 
F
H
 
Q
T
 
R
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
T
V
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
S
I
 
I
G
 
G
G
 
G
G
 
G
N
 
H
V
 
V
L
 
L
C
 
H
T
 
M
I
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
E
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
V
x
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
 
S
V
 
F
D
 
D
P
 
G
G
 
G
Y
 
W
G
 
G
T
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Y
 
F
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
D
G
 
A
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
R
W
 
W
G
 
C
E
 
R
E
 
E
I
 
M
C
 
L
E
 
Q
R
 
N
S
 
S
P
 
P
T
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
 
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
 
T
K
 
M
L
 
L
Y
 
F
Y
 
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
K
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
K
K
 
R

4i52A Scmenb im complex with 1-hydroxy-2-naphthoyl-coa (see paper)
49% identity, 99% coverage: 2:258/260 of query aligns to 8:271/275 of 4i52A

query
sites
4i52A
Q
 
H
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Y
N
 
K
R
 
A
N
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
x
H
K
|
K
M
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
Q
T
 
T
C
 
V
D
 
F
E
 
E
I
 
L
I
 
Y
K
 
D
A
 
A
L
 
F
N
 
C
K
 
N
A
 
A
G
 
R
Y
 
E
D
 
D
R
 
N
S
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
P
R
 
H
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
Y
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
S
 
S
A
 
V
H
x
R
-
 
G
D
 
E
G
 
G
N
 
G
Y
|
Y
-
 
I
D
 
D
G
 
D
R
 
Q
G
 
G
T
 
T
I
 
P
G
x
R
L
|
L
P
 
N
M
x
V
E
x
L
E
 
D
L
 
L
H
 
Q
T
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
S
V
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
L
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
x
Y
A
 
A
I
|
I
G
 
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
|
V
L
 
L
C
 
H
T
 
L
I
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
 
Q
V
x
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
x
V
G
 
G
S
|
S
V
x
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
F
G
 
G
T
 
S
A
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
W
Y
 
Y
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
S
G
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
E
A
 
R
M
 
M
G
 
G
L
 
M
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
V
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
E
E
 
E
V
 
G
Q
 
I
K
 
Q
W
 
W
G
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
I
C
 
L
E
 
S
R
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
x
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
 
T
K
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
K
N
 
Q
A
 
A
L
 
F
K
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
Q
Y
 
Y

4i4zA Synechocystis sp. Pcc 6803 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-coenzyme a synthase (menb) in complex with salicylyl-coa (see paper)
49% identity, 99% coverage: 2:258/260 of query aligns to 8:271/275 of 4i4zA

query
sites
4i4zA
Q
 
H
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Y
N
 
K
R
 
A
N
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
x
H
K
|
K
M
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
Q
T
 
T
C
 
V
D
 
F
E
 
E
I
 
L
I
 
Y
K
 
D
A
 
A
L
 
F
N
 
C
K
 
N
A
 
A
G
 
R
Y
 
E
D
 
D
R
 
N
S
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
P
R
 
H
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
Y
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
|
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
S
 
S
A
 
V
H
x
R
-
 
G
D
 
E
G
 
G
N
 
G
Y
|
Y
-
 
I
D
 
D
G
 
D
R
 
Q
G
 
G
T
 
T
I
 
P
G
x
R
L
 
L
P
 
N
M
x
V
E
x
L
E
 
D
L
 
L
H
 
Q
T
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
S
V
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
L
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
|
V
L
 
L
C
 
H
T
 
L
I
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
V
x
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
x
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
F
G
 
G
T
 
S
A
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
Y
 
Y
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
S
G
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
E
A
 
R
M
 
M
G
 
G
L
 
M
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
V
D
 
D
Q
 
R
L
 
L
D
 
E
A
 
E
E
 
E
V
 
G
Q
 
I
K
 
Q
W
 
W
G
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
I
C
 
L
E
 
S
R
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
x
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
 
T
K
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
K
N
 
Q
A
 
A
L
x
F
K
 
L
E
 
E
K
|
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
Q
Y
 
Y

3h02A 2.15 angstrom resolution crystal structure of naphthoate synthase from salmonella typhimurium.
47% identity, 99% coverage: 3:260/260 of query aligns to 18:264/266 of 3h02A

query
sites
3h02A
F
 
Y
E
 
T
D
 
D
I
 
I
L
 
R
Y
 
Y
E
 
E
-
 
K
N
 
S
R
 
T
N
 
D
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
T
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
Q
K
 
V
M
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
L
T
 
T
C
 
V
D
 
K
E
 
E
I
 
M
I
 
I
K
 
Q
A
 
A
L
 
L
N
 
A
K
 
D
A
 
A
G
 
R
Y
 
Y
D
 
D
R
 
D
S
 
N
V
 
V
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
I
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
E
G
 
G
D
 
D
R
 
K
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
 
A
G
 
G
G
|
G
D
 
D
Q
 
Q
S
 
H
A
x
H
H
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
N
M
 
V
E
x
L
E
 
D
L
 
F
H
 
Q
T
 
R
A
 
Q
I
 
I
R
 
R
D
 
T
V
 
C
P
 
P
K
 
K
P
 
P
V
 
V
I
 
V
A
 
A
R
 
M
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
S
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
|
V
L
 
L
C
 
H
T
 
M
I
 
M
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
E
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
V
 
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
W
G
 
G
T
 
A
A
 
S
F
 
Y
L
 
M
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
Y
 
F
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
D
G
 
A
A
 
Q
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
A
 
D
M
 
M
G
 
G
L
 
L
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
L
D
 
A
Q
 
D
L
 
L
D
 
E
A
 
K
E
 
E
V
 
T
Q
 
V
K
 
R
W
 
W
G
 
C
E
 
R
E
 
E
I
 
M
C
 
L
E
 
Q
R
 
N
S
 
S
P
 
P
T
 
M
A
 
A
L
 
L
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
L
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
x
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
 
T
K
 
M
L
 
L
Y
 
F
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
Q
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
N
A
 
A
L
 
F
K
 
N
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
Q
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
K
Y
 
F
A
 
K
K
 
R

4emlA Synechocystis sp. Pcc 6803 1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-coenzyme a synthase (menb) in complex with bicarbonate (see paper)
48% identity, 99% coverage: 2:258/260 of query aligns to 8:257/261 of 4emlA

query
sites
4emlA
Q
 
H
F
 
Y
E
 
D
D
 
D
I
 
I
L
 
L
Y
 
Y
E
 
Y
N
 
K
R
 
A
N
 
G
G
 
G
V
 
I
A
 
A
W
 
K
I
 
I
T
 
V
I
 
I
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
H
K
 
K
M
 
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
Q
T
 
T
C
 
V
D
 
F
E
 
E
I
 
L
I
 
Y
K
 
D
A
 
A
L
 
F
N
 
C
K
 
N
A
 
A
G
 
R
Y
 
E
D
 
D
R
 
N
S
 
R
V
 
I
G
 
G
A
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
A
G
 
G
D
 
P
R
 
H
-
 
S
-
 
D
-
 
G
-
 
K
-
 
Y
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
 
S
G
 
G
G
|
G
D
 
D
Q
 
Q
S
 
S
A
x
R
H
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
P
 
N
M
 
V
E
x
L
E
 
D
L
 
L
H
 
Q
T
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
S
V
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
A
R
 
L
V
 
V
Q
 
A
G
 
G
F
 
Y
A
 
A
I
 
I
G
|
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
|
V
L
 
L
C
 
H
T
 
L
I
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
I
C
 
A
S
 
A
D
 
D
K
 
N
A
 
A
V
 
I
F
 
F
G
 
G
Q
|
Q
V
 
T
G
|
G
P
 
P
K
 
K
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
F
G
 
G
T
 
S
A
 
S
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
I
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
K
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
|
W
Y
 
Y
L
 
L
N
 
C
R
 
R
R
 
Q
Y
 
Y
T
 
S
G
 
A
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
E
A
 
R
M
 
M
G
 
G
L
 
M
A
 
V
N
 
N
V
 
T
C
 
V
V
 
V
P
 
P
H
 
V
D
|
D
Q
x
R
L
 
L
D
x
E
A
x
E
E
 
E
V
 
G
Q
 
I
K
 
Q
W
 
W
G
 
A
E
 
K
E
 
E
I
 
I
C
 
L
E
 
S
R
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
R
I
 
C
A
 
L
K
 
K
R
 
A
S
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
A
D
 
D
T
 
C
A
 
D
H
 
G
Q
 
Q
S
 
A
G
 
G
I
 
L
A
 
Q
G
 
E
L
 
L
G
x
A
M
 
G
Y
 
N
A
 
A
L
 
T
K
 
L
L
 
L
Y
 
Y
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
E
E
 
E
S
 
G
R
 
S
E
 
E
G
 
G
V
 
K
N
 
Q
A
 
A
L
 
F
K
 
L
E
 
E
K
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
E
 
D
F
 
F
R
 
S
K
 
Q
Y
 
Y

1q51B Crystal structure of mycobacterium tuberculosis menb in complex with acetoacetyl-coenzyme a, a key enzyme in vitamin k2 biosynthesis (see paper)
37% identity, 98% coverage: 5:260/260 of query aligns to 19:278/280 of 1q51B

query
sites
1q51B
D
 
D
I
 
I
L
 
T
Y
 
Y
E
 
H
N
 
R
R
 
H
-
 
V
-
 
D
N
 
D
G
 
A
V
 
T
A
 
V
W
 
R
I
 
V
T
 
A
I
 
F
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
E
K
x
V
M
x
R
N
 
N
A
|
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
H
T
 
T
C
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
L
I
 
Y
K
 
R
A
 
V
L
 
L
N
 
D
K
 
H
A
 
A
G
 
R
Y
 
M
D
 
S
R
 
P
S
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
N
G
 
G
D
 
P
R
 
S
-
 
P
-
 
K
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
W
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
 
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
S
 
T
A
 
V
H
 
-
D
 
D
G
 
V
N
 
A
Y
 
R
D
 
A
G
 
G
R
 
R
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
P
x
H
M
 
I
E
 
L
E
 
E
L
 
V
H
 
Q
T
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
F
V
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
C
R
 
L
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
F
x
W
A
 
A
I
 
A
G
|
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
x
S
L
 
L
C
 
H
T
 
V
I
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
L
C
 
A
S
 
S
-
 
R
D
 
E
K
 
Y
A
 
A
V
 
R
F
 
F
G
 
K
Q
 
Q
V
x
T
G
x
D
P
 
A
K
 
D
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
F
Y
 
F
L
 
L
N
 
G
R
 
R
R
 
T
Y
 
Y
T
 
T
G
 
A
A
 
E
E
 
Q
A
 
M
V
 
H
A
 
Q
M
 
M
G
 
G
L
 
A
A
 
V
N
 
N
V
 
A
C
 
V
V
 
A
P
 
E
H
 
H
D
 
A
Q
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
T
E
 
V
V
 
G
Q
 
L
K
 
Q
W
 
W
G
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
I
C
 
N
E
 
A
R
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
Q
A
 
A
L
 
Q
A
 
R
I
 
M
A
 
L
K
 
K
R
 
F
S
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
L
H
 
L
Q
 
D
S
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
G
 
Q
M
 
L
Y
 
F
-
x
A
-
 
G
-
 
E
A
 
A
L
 
T
K
 
R
L
 
L
Y
 
A
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
D
E
 
E
S
 
A
R
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
L
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
E
 
D
F
 
W
R
 
S
K
 
P
Y
 
F
A
 
P
K
 
R

1q51A Crystal structure of mycobacterium tuberculosis menb in complex with acetoacetyl-coenzyme a, a key enzyme in vitamin k2 biosynthesis (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:260/260 of query aligns to 19:269/271 of 1q51A

query
sites
1q51A
D
 
D
I
 
I
L
 
T
Y
 
Y
E
 
H
N
 
R
R
 
H
-
 
V
-
 
D
N
 
D
G
 
A
V
 
T
A
 
V
W
 
R
I
 
V
T
 
A
I
 
F
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
E
K
x
V
M
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
H
T
 
T
C
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
L
I
 
Y
K
 
R
A
 
V
L
 
L
N
 
D
K
 
H
A
 
A
G
 
R
Y
 
M
D
 
S
R
 
P
S
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
N
G
 
G
D
 
P
R
 
S
-
 
P
-
x
K
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
W
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
 
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
S
 
-
A
 
-
H
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
L
P
x
H
M
 
I
E
 
L
E
 
E
L
 
V
H
 
Q
T
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
F
V
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
C
R
 
L
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
F
x
W
A
 
A
I
 
A
G
|
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
x
S
L
 
L
C
 
H
T
 
V
I
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
L
C
 
A
S
 
S
-
 
R
D
 
E
K
 
Y
A
 
A
V
 
R
F
 
F
G
 
K
Q
 
Q
V
x
T
G
x
D
P
 
A
K
 
D
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
 
R
V
 
Q
V
 
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
F
Y
 
F
L
 
L
N
 
G
R
 
R
R
 
T
Y
 
Y
T
 
T
G
 
A
A
 
E
E
 
Q
A
 
M
V
 
H
A
 
Q
M
 
M
G
 
G
L
 
A
A
 
V
N
 
N
V
 
A
C
 
V
V
 
A
P
 
E
H
 
H
D
 
A
Q
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
T
E
 
V
V
 
G
Q
 
L
K
 
Q
W
 
W
G
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
I
C
 
N
E
 
A
R
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
Q
A
 
A
L
 
Q
A
 
R
I
 
M
A
 
L
K
 
K
R
 
F
S
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
L
H
 
L
Q
 
D
S
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
G
 
Q
M
 
L
Y
 
F
-
x
A
-
 
G
-
 
E
A
 
A
L
 
T
K
 
R
L
 
L
Y
 
A
Y
|
Y
D
 
M
T
 
T
E
 
D
E
 
E
S
 
A
R
 
V
E
 
E
G
 
G
V
 
R
N
 
D
A
 
A
L
 
F
K
 
L
E
 
Q
K
 
K
R
 
R
K
 
P
P
 
P
E
 
D
F
 
W
R
 
S
K
 
P
Y
 
F
A
 
P
K
 
R

1rjnB The crystal structure of menb (rv0548c) from mycobacterium tuberculosis in complex with the coa portion of naphthoyl coa (see paper)
36% identity, 98% coverage: 5:260/260 of query aligns to 23:273/275 of 1rjnB

query
sites
1rjnB
D
 
D
I
 
I
L
 
T
Y
 
Y
E
 
H
N
 
R
R
 
H
-
 
V
-
 
D
N
 
D
G
 
A
V
 
T
A
 
V
W
 
R
I
 
V
T
 
A
I
 
F
N
 
N
R
 
R
A
 
P
D
 
E
K
x
V
M
x
R
N
 
N
A
 
A
F
 
F
R
 
R
G
 
P
T
 
H
T
 
T
C
 
V
D
 
D
E
 
E
I
 
L
I
 
Y
K
 
R
A
 
V
L
 
L
N
 
D
K
 
H
A
 
A
G
 
R
Y
 
M
D
 
S
R
 
P
S
 
D
V
 
V
G
 
G
A
 
V
I
 
V
V
 
L
L
 
L
A
 
T
G
 
G
A
 
N
G
 
G
D
 
P
R
 
S
-
 
P
-
x
K
-
 
D
-
 
G
-
 
G
-
 
W
A
 
A
F
 
F
C
 
C
T
x
S
G
 
G
G
|
G
D
|
D
Q
|
Q
S
 
R
A
x
H
H
 
-
D
 
-
G
 
-
N
 
-
Y
 
-
D
 
-
G
 
-
R
 
-
G
 
-
T
 
-
I
 
-
G
 
-
L
 
-
P
 
-
M
 
I
E
 
L
E
 
E
L
 
V
H
 
Q
T
 
R
A
 
L
I
 
I
R
 
R
D
 
F
V
 
M
P
 
P
K
 
K
P
 
V
V
 
V
I
 
I
A
 
C
R
 
L
V
 
V
Q
 
N
G
 
G
F
x
W
A
 
A
I
 
A
G
 
G
G
|
G
G
 
G
N
 
H
V
x
S
L
 
L
C
 
H
T
 
V
I
 
V
C
 
C
D
 
D
L
 
L
T
 
T
I
 
L
C
 
A
S
 
S
-
 
R
D
 
E
K
 
Y
A
 
A
V
 
R
F
 
F
G
 
K
Q
 
Q
V
 
T
G
x
D
P
 
A
K
 
D
M
 
V
G
 
G
S
|
S
V
 
F
D
|
D
P
x
G
G
 
G
Y
 
Y
G
 
G
T
 
S
A
 
A
F
 
Y
L
 
L
A
 
A
R
|
R
V
x
Q
V
|
V
G
 
G
E
 
Q
K
 
K
K
 
F
A
 
A
R
 
R
E
 
E
I
 
I
W
 
F
Y
 
F
L
 
L
N
 
G
R
 
R
R
 
T
Y
 
Y
T
 
T
G
 
A
A
 
E
E
 
Q
A
 
M
V
 
H
A
 
Q
M
|
M
G
 
G
L
 
A
A
 
V
N
 
N
V
 
A
C
 
V
V
 
A
P
 
E
H
 
H
D
 
A
Q
 
E
L
 
L
D
 
E
A
 
T
E
 
V
V
 
G
Q
 
L
K
 
Q
W
 
W
G
 
A
E
 
A
E
 
E
I
 
I
C
 
N
E
 
A
R
 
K
S
 
S
P
 
P
T
 
Q
A
 
A
L
 
Q
A
 
R
I
 
M
A
 
L
K
 
K
R
 
F
S
 
A
F
 
F
N
 
N
A
 
-
D
 
-
T
 
-
A
 
L
H
 
L
Q
 
D
S
 
D
G
 
G
I
 
L
A
 
V
G
 
G
L
 
Q
G
 
Q
M
 
L
Y
 
F
-
x
A
-
 
G
-
 
E
A
 
A