SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_109941570.1 NCBI__GCF_003173335.1:WP_109941570.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9NQR4 Omega-amidase NIT2; Nitrilase homolog 2; EC 3.5.1.3 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
30% identity, 89% coverage: 28:255/256 of query aligns to 30:268/276 of Q9NQR4

query
sites
Q9NQR4
E
 
E
A
 
A
V
 
A
E
 
T
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
K
F
 
I
L
 
V
V
 
S
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Q
 
C
I
 
F
L
 
N
T
 
S
G
 
P
W
 
Y
D
 
G
P
 
A
K
 
K
N
 
Y
N
 
F
S
 
P
E
 
E
V
 
Y
T
 
A
T
 
E
E
 
K
-
 
I
D
 
P
G
 
G
E
 
E
E
 
S
I
 
T
S
 
Q
A
 
K
L
 
L
K
 
S
D
 
E
I
 
V
A
 
A
Q
 
K
D
 
E
Y
 
C
S
 
S
I
 
I
G
 
Y
I
 
L
L
 
I
G
 
G
-
 
G
S
 
S
F
 
I
R
 
P
E
 
E
K
 
E
N
 
D
T
 
A
D
 
G
H
 
K
P
 
L
F
 
Y
N
 
N
T
 
T
S
 
C
I
 
A
A
 
V
I
 
F
G
 
G
P
 
P
D
 
D
G
 
G
K
 
T
T
 
L
L
 
L
A
 
A
S
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
S
x
D
-
x
I
-
x
D
-
x
V
P
|
P
A
x
G
G
x
K
-
x
I
-
x
T
-
x
F
-
x
Q
E
|
E
D
 
S
R
 
K
Y
 
T
F
 
L
S
 
S
P
 
P
G
 
G
N
 
D
S
 
S
L
 
F
G
 
S
I
 
T
F
 
F
S
 
D
F
 
T
N
 
P
S
 
Y
C
 
C
T
 
R
I
 
V
G
 
G
I
 
L
A
 
G
I
 
I
C
|
C
Y
 
Y
D
 
D
L
 
M
R
 
R
F
 
F
A
 
A
P
 
E
L
 
L
F
 
A
H
 
Q
A
 
I
Y
 
Y
R
 
A
D
 
Q
A
 
R
G
 
G
V
 
C
N
 
Q
L
 
L
M
 
L
L
 
V
V
 
Y
P
 
P
S
 
G
A
 
A
W
 
F
-
 
N
-
 
L
-
 
T
-
 
T
-
 
G
P
 
P
A
 
A
S
 
-
R
 
-
L
 
-
K
 
-
H
 
H
F
 
W
H
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
Q
T
 
R
S
 
S
R
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
D
F
 
N
Q
 
Q
M
 
V
F
 
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
T
V
 
A
N
 
S
T
 
P
V
 
A
G
 
R
Q
 
D
T
 
D
P
 
K
V
 
A
D
 
S
F
 
Y
Y
 
V
N
 
A
-
 
W
G
 
G
G
 
H
S
 
S
C
 
T
I
 
V
A
 
V
G
 
N
P
 
P
D
 
W
G
 
G
S
 
E
I
x
V
R
 
L
A
 
A
Q
 
K
G
 
A
T
 
G
D
 
T
L
 
E
E
 
E
E
 
A
L
 
I
I
 
V
F
 
Y
Y
 
S
D
 
D
M
 
I
P
 
D
I
 
L
E
 
K
E
 
K
A
 
L
E
 
A
T
 
E
L
 
I
R
 
R
I
 
Q
S
 
Q
F
 
I
P
 
P
F
 
V
H
 
F
K
 
R
D
 
Q
V
 
K
R
 
R
N
 
S
D
 
D
F
 
L

Q9UYV8 Nitrilase; PaNit; EC 3.5.5.1 from Pyrococcus abyssi (strain GE5 / Orsay) (see paper)
27% identity, 88% coverage: 3:227/256 of query aligns to 4:228/262 of Q9UYV8

query
sites
Q9UYV8
L
 
V
S
 
A
L
 
Y
A
 
V
Q
 
Q
I
 
M
T
 
N
P
 
P
C
 
Q
W
 
I
N
 
L
D
 
E
P
 
P
T
 
D
K
 
K
T
 
N
L
 
Y
K
 
S
K
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
L
A
 
I
A
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
K
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
I
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
W
 
Y
D
 
N
P
 
F
K
 
E
N
 
T
N
 
R
S
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
T
 
K
T
 
I
E
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
E
 
T
I
 
T
S
 
T
A
 
F
L
 
L
K
 
M
D
 
D
I
 
V
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
T
S
 
G
I
 
V
G
 
Y
I
 
I
L
 
V
G
 
A
S
 
G
F
 
T
R
 
A
E
 
E
K
 
K
N
 
D
T
 
G
D
 
D
H
 
V
P
 
L
F
 
Y
N
 
N
T
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
R
G
 
G
K
 
-
T
 
F
L
 
I
A
 
G
S
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
S
 
Y
P
 
R
A
 
-
G
 
-
E
 
E
D
 
K
R
 
F
Y
 
F
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
R
I
 
V
F
 
F
S
 
D
F
 
L
N
 
G
S
 
F
C
 
M
T
 
K
I
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
L
 
W
R
 
F
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
S
F
 
A
H
 
R
A
 
T
Y
 
L
R
 
A
D
 
L
A
 
K
G
 
G
V
 
A
N
 
D
L
 
V
M
 
I
L
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
A
W
 
H
P
 
P
A
 
A
S
 
N
R
 
L
L
 
V
K
 
M
H
 
P
F
 
Y
H
 
A
L
 
P
F
 
R
T
 
A
T
 
M
S
 
P
-
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
E
F
 
N
Q
 
K
M
 
V
F
 
Y
V
 
T
A
 
V
S
 
T
V
 
A
N
 
D
T
 
R
V
 
V
G
 
G
Q
 
E
T
 
E
P
 
R
V
 
G
D
 
L
F
 
K
Y
 
F
N
 
I
G
 
G
G
 
K
S
 
S
C
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
I
 
V
R
 
L
A
 
S
Q
 
M
G
 
A
T
 
S
D
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E

3klcB Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
27% identity, 88% coverage: 3:227/256 of query aligns to 3:227/261 of 3klcB

query
sites
3klcB
L
 
V
S
 
A
L
 
Y
A
 
V
Q
 
Q
I
 
M
T
 
N
P
 
P
C
 
Q
W
 
I
N
 
L
D
 
E
P
 
P
T
 
D
K
 
K
T
 
N
L
 
Y
K
 
S
K
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
L
A
 
I
A
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
K
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
W
 
Y
D
 
N
P
 
F
K
 
E
N
 
T
N
 
R
S
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
T
 
K
T
 
I
E
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
E
 
T
I
 
T
S
 
T
A
 
F
L
 
L
K
 
M
D
 
D
I
 
V
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
T
S
 
G
I
 
V
G
 
Y
I
 
I
L
 
V
G
 
A
S
 
G
F
 
T
R
 
A
E
 
E
K
 
K
N
 
D
T
 
G
D
 
D
H
 
V
P
 
L
F
 
Y
N
|
N
T
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
R
G
 
G
K
 
-
T
x
F
L
 
I
A
 
G
S
x
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
S
 
Y
P
 
R
A
 
-
G
 
-
E
|
E
D
 
K
R
 
F
Y
 
F
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
R
I
 
V
F
 
F
S
 
D
F
 
L
N
 
G
S
 
F
C
 
M
T
 
K
I
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
L
 
W
R
 
F
F
 
F
A
 
P
P
x
E
L
 
S
F
 
A
H
 
R
A
 
T
Y
 
L
R
 
A
D
 
L
A
 
K
G
 
G
V
 
A
N
 
D
L
 
V
M
 
I
L
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
A
W
 
H
P
 
P
A
 
A
S
x
N
R
x
L
L
 
V
K
x
M
H
 
P
F
 
Y
H
 
A
L
 
P
F
 
R
T
 
A
T
 
M
S
 
P
-
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
E
F
 
N
Q
 
K
M
 
V
F
 
Y
V
 
T
A
 
V
S
 
T
V
 
A
N
 
D
T
 
R
V
 
V
G
 
G
Q
 
E
T
 
E
P
 
R
V
 
G
D
 
L
F
 
K
Y
 
F
N
 
I
G
 
G
G
 
K
S
 
S
C
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
I
 
V
R
 
L
A
 
S
Q
 
M
G
 
A
T
 
S
D
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E

Sites not aligning to the query:

3klcA Crystal structure of hyperthermophilic nitrilase (see paper)
27% identity, 88% coverage: 3:227/256 of query aligns to 3:227/261 of 3klcA

query
sites
3klcA
L
 
V
S
 
A
L
 
Y
A
 
V
Q
 
Q
I
 
M
T
 
N
P
 
P
C
 
Q
W
 
I
N
 
L
D
x
E
P
 
P
T
x
D
K
|
K
T
 
N
L
 
Y
K
 
S
K
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
L
A
 
I
A
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
K
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
W
 
Y
D
 
N
P
 
F
K
 
E
N
 
T
N
 
R
S
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
E
-
 
I
-
 
A
-
 
Q
T
 
K
T
 
I
E
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
E
 
T
I
 
T
S
 
T
A
 
F
L
 
L
K
 
M
D
 
D
I
 
V
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
T
S
 
G
I
 
V
G
 
Y
I
 
I
L
 
V
G
 
A
S
 
G
F
 
T
R
 
A
E
 
E
K
 
K
N
 
D
T
 
G
D
 
D
H
 
V
P
 
L
F
 
Y
N
|
N
T
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
V
G
|
G
P
|
P
D
x
R
G
 
G
K
 
-
T
x
F
L
x
I
A
x
G
S
x
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
F
 
F
S
 
Y
P
 
R
A
 
-
G
 
-
E
|
E
D
 
K
R
 
F
Y
 
F
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
R
I
 
V
F
 
F
S
 
D
F
 
L
N
 
G
S
 
F
C
 
M
T
 
K
I
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
M
I
 
I
C
|
C
Y
 
F
D
 
D
L
 
W
R
 
F
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
S
F
 
A
H
 
R
A
 
T
Y
 
L
R
 
A
D
 
L
A
 
K
G
 
G
V
 
A
N
 
D
L
 
V
M
 
I
L
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
A
W
 
H
P
 
P
A
 
A
S
x
N
R
x
L
L
 
V
K
x
M
H
 
P
F
 
Y
H
 
A
L
 
P
F
 
R
T
 
A
T
 
M
S
 
P
-
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
E
F
 
N
Q
 
K
M
 
V
F
 
Y
V
 
T
A
 
V
S
 
T
V
 
A
N
 
D
T
 
R
V
 
V
G
 
G
Q
 
E
T
 
E
P
 
R
V
 
G
D
 
L
F
 
K
Y
 
F
N
 
I
G
 
G
G
 
K
S
 
S
C
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
I
 
V
R
 
L
A
 
S
Q
 
M
G
 
A
T
 
S
D
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E

4iztA The e41q mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 showing covalent addition of the acetamide moiety of fluoroacetamide at the active site cysteine
27% identity, 91% coverage: 1:234/256 of query aligns to 10:246/263 of 4iztA

query
sites
4iztA
M
 
M
I
 
R
L
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
Q
I
 
H
T
 
T
P
 
A
C
 
R
W
 
P
N
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
K
 
H
T
 
N
L
 
L
K
 
D
K
 
L
M
 
I
E
 
D
K
 
D
Y
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
S
E
 
E
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
 
Q
Q
 
L
I
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
W
 
Y
D
 
V
P
 
P
K
 
S
N
 
Q
-
 
I
N
 
C
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
T
 
S
T
 
A
E
 
E
D
 
Q
G
 
V
E
 
D
E
 
A
I
 
A
-
 
R
S
 
S
A
 
R
L
 
L
K
 
R
D
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
R
S
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
W
S
 
S
F
 
L
R
 
P
E
 
G
K
 
P
N
 
E
T
 
G
D
 
P
H
 
E
P
 
Q
F
 
R
N
 
G
T
 
I
S
 
T
I
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
A
P
 
D
D
 
E
-
 
H
G
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
I
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
S
 
G
P
 
P
A
 
E
G
 
-
E
 
E
D
 
K
R
 
A
Y
 
A
F
 
F
S
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
E
S
 
Q
-
 
P
L
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
S
 
S
F
 
W
N
 
G
S
 
G
C
 
R
T
 
Q
I
 
L
G
 
S
I
 
L
A
 
L
I
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
L
 
V
R
x
E
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
M
F
 
V
H
 
R
A
 
A
Y
 
A
R
 
A
D
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
M
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
T
A
|
A
W
x
L
P
 
A
A
 
G
S
 
D
R
 
E
L
 
T
K
 
S
H
 
V
F
 
P
H
 
G
L
 
I
F
 
L
T
 
L
T
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
F
 
N
Q
 
G
M
 
I
F
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
Y
V
 
A
N
 
N
T
 
H
V
 
C
G
 
G
Q
 
P
T
 
E
P
 
G
V
 
G
D
 
L
F
 
V
Y
 
F
N
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
P
R
 
L
A
 
G
Q
 
E
G
 
L
T
 
G
D
 
V
L
 
E
E
 
P
E
 
G
L
 
L
I
 
L
F
 
V
Y
 
V
D
 
D
M
 
L
P
 
P

4izuA The e41q mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 showing the result of michael addition of acrylamide at the active site cysteine
27% identity, 96% coverage: 1:245/256 of query aligns to 2:249/254 of 4izuA

query
sites
4izuA
M
 
M
I
 
R
L
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
Q
I
 
H
T
 
T
P
 
A
C
 
R
W
 
P
N
 
L
D
 
D
P
 
P
T
x
Q
K
 
H
T
 
N
L
 
L
K
 
D
K
 
L
M
 
I
E
 
D
K
 
D
Y
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
S
E
 
E
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
x
Q
Q
 
L
I
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
W
x
Y
D
 
V
P
 
P
K
 
S
N
 
Q
-
 
I
N
x
C
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
T
 
S
T
 
A
E
 
E
D
 
Q
G
 
V
E
 
D
E
 
A
I
x
A
-
 
R
S
 
S
A
x
R
L
 
L
K
 
R
D
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
R
S
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
W
S
 
S
F
 
L
R
 
P
E
 
G
K
 
P
N
 
E
T
 
G
D
x
P
H
x
E
P
 
Q
F
 
R
N
 
G
T
 
I
S
 
T
I
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
A
P
 
D
D
 
E
-
 
H
G
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
K
|
K
I
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
S
 
G
P
 
P
A
 
E
G
 
-
E
 
E
D
 
K
R
 
A
Y
 
A
F
 
F
S
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
E
S
 
Q
-
 
P
L
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
S
 
S
F
 
W
N
 
G
S
 
G
C
 
R
T
 
Q
I
 
L
G
 
S
I
 
L
A
 
L
I
 
V
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
R
 
E
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
M
F
 
V
H
 
R
A
 
A
Y
 
A
R
 
A
D
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
M
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
T
A
 
A
W
 
L
P
 
A
A
 
G
S
 
D
R
 
E
L
 
T
K
 
S
H
 
V
F
 
P
H
 
G
L
 
I
F
 
L
T
 
L
T
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
F
 
N
Q
 
G
M
 
I
F
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
Y
V
 
A
N
 
N
T
 
H
V
 
C
G
 
G
Q
 
P
T
 
E
P
 
G
V
 
G
D
 
L
F
 
V
Y
 
F
N
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
P
R
 
L
A
 
G
Q
 
E
G
 
L
T
 
G
D
 
V
L
 
E
E
 
P
E
 
G
L
 
L
I
 
L
F
 
V
Y
 
V
D
 
D
M
 
L
P
 
P
I
 
A
E
 
D
E
 
Y
A
 
L
E
 
Q
T
 
D
L
 
R
R
 
R
I
 
A
S
 
E
F
 
L

5nycA A c145a mutant of nesterenkonia an1 amidase bound to propionitrile
27% identity, 96% coverage: 1:245/256 of query aligns to 9:256/261 of 5nycA

query
sites
5nycA
M
 
M
I
 
R
L
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
Q
I
 
H
T
 
T
P
 
A
C
 
R
W
 
P
N
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
K
 
H
T
 
N
L
 
L
K
 
D
K
 
L
M
 
I
E
 
D
K
 
D
Y
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
S
E
 
E
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
I
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
W
 
Y
D
 
V
P
 
P
K
 
S
N
 
Q
-
 
I
N
 
C
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
T
 
S
T
 
A
E
 
E
D
 
Q
G
 
V
E
 
D
E
 
A
I
x
A
-
 
R
S
 
S
A
x
R
L
 
L
K
 
R
D
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
R
S
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
W
S
 
S
F
 
L
R
 
P
E
 
G
K
 
P
N
 
E
T
 
G
D
 
P
H
 
E
P
 
Q
F
 
R
N
 
G
T
 
I
S
 
T
I
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
A
P
 
D
D
 
E
-
 
H
G
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
I
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
S
 
G
P
 
P
A
 
E
G
 
-
E
 
E
D
 
K
R
 
A
Y
 
A
F
 
F
S
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
E
S
 
Q
-
 
P
L
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
S
 
S
F
 
W
N
 
G
S
 
G
C
 
R
T
 
Q
I
 
L
G
 
S
I
 
L
A
 
L
I
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
R
x
E
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
M
F
 
V
H
 
R
A
 
A
Y
 
A
R
 
A
D
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
M
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
T
A
|
A
W
x
L
P
 
A
A
 
G
S
 
D
R
 
E
L
 
T
K
 
S
H
 
V
F
 
P
H
 
G
L
 
I
F
 
L
T
 
L
T
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
F
 
N
Q
 
G
M
 
I
F
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
Y
V
 
A
N
 
N
T
 
H
V
 
C
G
 
G
Q
 
P
T
 
E
P
 
G
V
 
G
D
 
L
F
 
V
Y
 
F
N
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
P
R
 
L
A
 
G
Q
 
E
G
 
L
T
 
G
D
 
V
L
 
E
E
 
P
E
 
G
L
 
L
I
 
L
F
 
V
Y
 
V
D
 
D
M
 
L
P
 
P
I
 
A
E
 
D
E
 
Y
A
 
L
E
 
Q
T
 
D
L
 
R
R
 
R
I
 
A
S
 
E
F
 
L

5nybA A c145a mutant of nesterenkonia an1 amidase bound to adipamide
27% identity, 91% coverage: 1:234/256 of query aligns to 9:245/262 of 5nybA

query
sites
5nybA
M
 
M
I
 
R
L
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
Q
I
 
H
T
 
T
P
 
A
C
 
R
W
 
P
N
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
K
 
H
T
 
N
L
 
L
K
 
D
K
 
L
M
 
I
E
 
D
K
 
D
Y
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
S
E
 
E
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
W
 
Y
D
 
V
P
 
P
K
 
S
N
 
Q
-
 
I
N
 
C
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
T
 
S
T
 
A
E
 
E
D
 
Q
G
 
V
E
 
D
E
 
A
I
 
A
-
 
R
S
 
S
A
 
R
L
 
L
K
 
R
D
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
R
S
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
W
S
 
S
F
 
L
R
 
P
E
 
G
K
 
P
N
 
E
T
 
G
D
 
P
H
 
E
P
 
Q
F
 
R
N
 
G
T
 
I
S
 
T
I
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
A
P
 
D
D
 
E
-
 
H
G
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
K
|
K
I
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
S
 
G
P
 
P
A
 
E
G
 
-
E
|
E
D
 
K
R
 
A
Y
 
A
F
 
F
S
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
E
S
 
Q
-
 
P
L
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
S
 
S
F
 
W
N
 
G
S
 
G
C
 
R
T
 
Q
I
 
L
G
 
S
I
 
L
A
 
L
I
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
R
x
E
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
M
F
 
V
H
 
R
A
 
A
Y
 
A
R
 
A
D
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
M
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
T
A
|
A
W
 
L
P
 
A
A
 
G
S
 
D
R
 
E
L
 
T
K
 
S
H
 
V
F
 
P
H
 
G
L
 
I
F
 
L
T
 
L
T
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
F
 
N
Q
 
G
M
 
I
F
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
Y
V
 
A
N
 
N
T
 
H
V
 
C
G
 
G
Q
 
P
T
 
E
P
 
G
V
 
G
D
 
L
F
 
V
Y
 
F
N
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
P
R
 
L
A
 
G
Q
 
E
G
 
L
T
 
G
D
 
V
L
 
E
E
 
P
E
 
G
L
 
L
I
 
L
F
 
V
Y
 
V
D
 
D
M
 
L
P
 
P

5ny7A A c145a mutant of nesterenkonia an1 amidase bound to nicotinamide
27% identity, 91% coverage: 1:234/256 of query aligns to 9:245/262 of 5ny7A

query
sites
5ny7A
M
 
M
I
 
R
L
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
Q
I
 
H
T
 
T
P
 
A
C
 
R
W
 
P
N
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
K
 
H
T
 
N
L
 
L
K
 
D
K
 
L
M
 
I
E
 
D
K
 
D
Y
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
S
E
 
E
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
I
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
W
 
Y
D
 
V
P
 
P
K
 
S
N
 
Q
-
 
I
N
 
C
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
T
 
S
T
 
A
E
 
E
D
 
Q
G
 
V
E
 
D
E
 
A
I
 
A
-
x
R
S
 
S
A
 
R
L
 
L
K
 
R
D
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
R
S
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
W
S
 
S
F
 
L
R
 
P
E
 
G
K
x
P
N
 
E
T
 
G
D
 
P
H
 
E
P
 
Q
F
 
R
N
 
G
T
 
I
S
x
T
I
 
A
A
x
E
I
 
L
G
 
A
P
 
D
D
 
E
-
 
H
G
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
A
S
|
S
Y
 
Y
Q
 
Q
K
|
K
I
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
S
 
G
P
 
P
A
 
E
G
 
-
E
 
E
D
 
K
R
 
A
Y
 
A
F
 
F
S
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
E
S
 
Q
-
 
P
L
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
S
 
S
F
 
W
N
 
G
S
 
G
C
 
R
T
 
Q
I
 
L
G
 
S
I
 
L
A
 
L
I
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
R
x
E
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
M
F
 
V
H
 
R
A
 
A
Y
 
A
R
 
A
D
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
M
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
T
A
|
A
W
x
L
P
 
A
A
 
G
S
 
D
R
 
E
L
 
T
K
 
S
H
 
V
F
 
P
H
 
G
L
 
I
F
 
L
T
 
L
T
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
F
 
N
Q
 
G
M
 
I
F
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
Y
V
 
A
N
 
N
T
 
H
V
 
C
G
 
G
Q
 
P
T
 
E
P
 
G
V
 
G
D
 
L
F
 
V
Y
 
F
N
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
P
R
 
L
A
 
G
Q
 
E
G
 
L
T
 
G
D
 
V
L
 
E
E
 
P
E
 
G
L
 
L
I
 
L
F
 
V
Y
 
V
D
 
D
M
 
L
P
 
P

Sites not aligning to the query:

4izsA The c145a mutant of the amidase from nesterenkonia sp. An1 in complex with butyramide
27% identity, 96% coverage: 1:245/256 of query aligns to 9:256/261 of 4izsA

query
sites
4izsA
M
 
M
I
 
R
L
 
I
S
 
A
L
 
L
A
 
M
Q
 
Q
I
 
H
T
 
T
P
 
A
C
 
R
W
 
P
N
 
L
D
 
D
P
 
P
T
 
Q
K
 
H
T
 
N
L
 
L
K
 
D
K
 
L
M
 
I
E
 
D
K
 
D
Y
 
A
A
 
A
A
 
A
E
 
R
A
 
A
V
 
S
E
 
E
G
 
Q
D
 
G
A
 
A
T
 
Q
F
 
L
L
 
L
V
 
L
F
 
T
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
F
L
 
G
T
 
F
G
 
G
W
 
Y
D
 
V
P
 
P
K
 
S
N
 
Q
-
 
I
N
 
C
S
 
A
E
 
Q
V
 
V
T
 
S
T
 
A
E
 
E
D
 
Q
G
 
V
E
 
D
E
 
A
I
 
A
-
 
R
S
 
S
A
 
R
L
 
L
K
 
R
D
 
G
I
 
I
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
R
S
 
G
I
 
I
G
 
A
I
 
L
L
 
V
G
 
W
S
 
S
F
 
L
R
 
P
E
 
G
K
 
P
N
 
E
T
 
G
D
 
P
H
 
E
P
 
Q
F
 
R
N
 
G
T
 
I
S
 
T
I
 
A
A
 
E
I
 
L
G
 
A
P
 
D
D
 
E
-
 
H
G
 
G
K
 
E
T
 
V
L
 
L
A
 
A
S
 
S
Y
 
Y
Q
 
Q
K
|
K
I
 
V
H
 
Q
L
 
L
F
x
Y
S
 
G
P
 
P
A
 
E
G
 
-
E
|
E
D
 
K
R
 
A
Y
 
A
F
 
F
S
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
E
S
 
Q
-
 
P
L
 
P
G
 
P
I
 
V
F
 
L
S
 
S
F
 
W
N
 
G
S
 
G
C
 
R
T
 
Q
I
 
L
G
 
S
I
 
L
A
 
L
I
 
V
C
x
A
Y
|
Y
D
 
D
L
 
V
R
x
E
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
M
F
 
V
H
 
R
A
 
A
Y
 
A
R
 
A
D
 
A
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
Q
L
 
L
M
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
T
A
|
A
W
 
L
P
 
A
A
 
G
S
 
D
R
 
E
L
 
T
K
 
S
H
 
V
F
 
P
H
 
G
L
 
I
F
 
L
T
 
L
T
 
P
S
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
E
F
 
N
Q
 
G
M
 
I
F
 
T
V
 
L
A
 
A
S
 
Y
V
 
A
N
 
N
T
 
H
V
 
C
G
 
G
Q
 
P
T
 
E
P
 
G
V
 
G
D
 
L
F
 
V
Y
 
F
N
 
D
G
 
G
G
 
G
S
 
S
C
 
V
I
 
V
A
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
A
G
 
G
S
 
Q
I
 
P
R
 
L
A
 
G
Q
 
E
G
 
L
T
 
G
D
 
V
L
 
E
E
 
P
E
 
G
L
 
L
I
 
L
F
 
V
Y
 
V
D
 
D
M
 
L
P
 
P
I
 
A
E
 
D
E
 
Y
A
 
L
E
 
Q
T
 
D
L
 
R
R
 
R
I
 
A
S
 
E
F
 
L

Q94JV5 Deaminated glutathione amidase, chloroplastic/cytosolic; dGSH amidase; Nitrilase-like protein 2; Protein nitrilase 1 homolog; AtNit1; Protein Nit1 homolog; EC 3.5.1.128 from Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) (see paper)
26% identity, 96% coverage: 3:249/256 of query aligns to 39:300/307 of Q94JV5

query
sites
Q94JV5
L
 
V
S
 
A
L
 
A
A
 
A
Q
 
Q
I
 
M
T
 
T
P
 
S
C
 
V
W
 
-
N
 
N
D
 
D
P
 
L
T
 
M
K
 
T
T
 
N
L
 
F
K
 
A
K
 
T
M
 
C
E
 
S
K
 
R
Y
 
L
A
 
V
A
 
Q
E
 
E
A
 
A
V
 
A
E
 
L
G
 
A
D
 
G
A
 
A
T
 
K
F
 
L
L
 
I
V
 
C
F
 
F
P
 
P
E
 
E
Q
 
N
I
 
F
L
 
S
T
 
F
G
 
V
W
 
G
D
 
D
P
 
K
K
 
E
N
 
G
N
 
E
S
 
S
E
 
V
V
 
K
T
 
I
T
 
A
E
 
E
-
 
P
-
 
L
D
 
D
G
 
G
E
 
P
E
 
V
I
 
M
S
 
E
A
 
R
L
 
Y
K
 
C
D
 
S
I
 
L
A
 
A
Q
 
R
D
 
D
Y
 
S
S
 
N
I
 
I
G
 
W
I
 
L
-
 
S
L
 
L
G
 
G
S
 
G
F
 
F
R
 
Q
E
 
E
K
 
R
N
 
F
T
 
D
D
 
D
-
 
T
H
 
H
P
 
L
F
 
C
N
 
N
T
 
T
S
 
H
I
 
V
A
 
V
I
 
I
G
 
D
P
 
D
D
 
A
G
 
G
K
 
M
T
 
I
L
 
R
A
 
D
S
 
T
Y
 
Y
Q
 
Q
K
 
K
I
 
M
H
 
H
L
 
L
F
 
F
S
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
V
P
 
P
A
 
G
G
 
G
-
 
S
-
 
S
-
 
Y
-
 
K
E
 
E
D
 
S
R
 
S
Y
 
F
F
 
T
S
 
V
P
 
P
G
 
G
N
 
T
S
 
K
L
 
I
G
 
V
I
 
S
F
 
V
S
 
D
F
 
S
N
 
P
S
 
V
C
 
G
T
 
R
I
 
L
G
 
G
I
 
L
A
 
T
I
 
V
C
 
C
Y
 
Y
D
 
D
L
 
L
R
 
R
F
 
F
A
 
P
P
 
K
L
 
I
F
 
Y
H
 
Q
A
 
Q
Y
 
L
R
 
R
-
 
F
D
 
E
A
 
Q
G
 
K
V
 
A
N
 
Q
L
 
V
M
 
L
L
 
L
V
 
V
P
 
P
S
 
S
A
 
A
W
 
F
-
 
T
P
 
K
A
 
V
S
 
T
R
 
G
L
 
E
K
 
A
H
 
H
F
 
W
H
 
E
L
 
I
F
 
L
T
 
L
T
 
R
S
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
I
E
 
E
F
 
T
Q
 
Q
M
 
C
F
 
Y
V
 
V
A
 
I
S
 
A
V
 
A
N
 
A
T
 
Q
V
 
A
G
 
G
Q
 
K
T
 
H
P
 
N
V
 
E
D
 
K
F
 
R
Y
 
E
N
 
S
-
 
Y
G
 
G
G
 
D
S
 
T
C
 
L
I
 
I
A
 
I
G
 
D
P
 
P
D
 
W
G
 
G
S
 
T
I
 
V
R
 
V
A
 
G
Q
 
R
G
 
L
T
 
P
D
 
D
L
 
R
E
 
V
E
 
S
-
 
T
-
 
G
L
 
I
I
 
V
F
 
V
Y
 
A
D
 
D
M
 
I
P
 
D
I
 
F
E
 
S
E
 
L
A
 
I
E
 
D
T
 
S
L
 
V
R
 
R
I
 
T
S
 
K
F
 
M
P
 
P
F
 
I
H
 
D
K
 
K

Sites not aligning to the query:

7ovgA The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound acetamide (see paper)
26% identity, 87% coverage: 7:229/256 of query aligns to 9:231/263 of 7ovgA

query
sites
7ovgA
Q
 
Q
I
 
M
T
 
E
P
 
P
C
 
K
W
 
I
N
 
L
D
 
E
P
 
L
T
 
D
K
 
K
T
 
N
L
 
Y
K
 
S
K
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
L
A
 
I
A
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
K
G
 
E
D
 
G
A
 
A
T
 
K
F
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
W
 
Y
D
 
N
P
 
F
K
 
E
N
 
S
N
 
R
S
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
T
 
Q
T
 
I
E
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
E
 
T
I
 
T
S
 
T
A
 
F
L
 
L
K
 
M
D
 
E
I
 
L
A
 
A
Q
 
R
D
 
E
Y
 
L
S
 
G
I
 
L
G
 
Y
I
 
I
L
 
V
G
 
A
S
 
G
F
 
T
R
 
A
E
 
E
K
 
K
N
 
S
T
 
G
D
 
N
H
 
Y
P
 
L
F
 
Y
N
 
N
T
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
R
G
 
G
K
 
-
T
 
Y
L
 
I
A
 
G
S
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
S
 
Y
P
 
R
A
 
-
G
 
-
E
 
E
D
 
K
R
 
V
Y
 
F
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
K
I
 
V
F
 
F
S
 
D
F
 
I
N
 
G
S
 
F
C
 
A
T
 
K
I
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
M
I
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
L
 
W
R
 
F
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
S
F
 
A
H
 
R
A
 
T
Y
 
L
R
 
A
D
 
L
A
 
K
G
 
G
V
 
A
N
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
A
W
 
H
P
 
P
A
 
A
S
x
N
R
 
L
L
 
V
K
 
M
H
 
P
F
 
Y
H
 
A
L
 
P
F
 
R
T
 
A
T
 
M
S
 
P
-
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
E
F
 
N
Q
 
R
M
 
V
F
 
Y
V
 
T
A
 
I
S
 
T
V
 
A
N
 
D
T
 
R
V
 
V
G
 
G
Q
 
E
T
 
E
P
 
R
V
 
G
D
 
L
F
 
K
Y
 
F
N
 
I
G
 
G
G
 
K
S
 
S
C
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
I
 
V
R
 
L
A
 
S
Q
 
I
G
 
A
T
 
S
D
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E
L
 
E
I
 
I

6ypaB The c146a variant of an amidase from pyrococcus horikoshii with bound glutaramide
26% identity, 87% coverage: 7:229/256 of query aligns to 15:237/269 of 6ypaB

query
sites
6ypaB
Q
 
Q
I
 
M
T
 
E
P
 
P
C
 
K
W
 
I
N
 
L
D
 
E
P
 
L
T
 
D
K
 
K
T
 
N
L
 
Y
K
 
S
K
 
K
M
 
A
E
 
E
K
 
K
Y
 
L
A
 
I
A
 
K
E
 
E
A
 
A
V
 
S
E
 
K
G
 
E
D
 
G
A
 
A
T
 
K
F
 
L
L
 
V
V
 
V
F
 
L
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
F
L
 
D
T
 
T
G
 
G
W
 
Y
D
 
N
P
 
F
K
 
E
N
 
S
N
 
R
S
 
E
E
 
E
V
 
V
-
 
F
-
 
D
-
 
V
-
 
A
-
 
Q
T
 
Q
T
 
I
E
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
E
 
T
I
 
T
S
 
T
A
 
F
L
 
L
K
 
M
D
 
E
I
 
L
A
 
A
Q
 
R
D
 
E
Y
 
L
S
 
G
I
 
L
G
 
Y
I
 
I
L
 
V
G
 
A
S
 
G
F
 
T
R
 
A
E
 
E
K
 
K
N
 
S
T
 
G
D
 
N
H
 
Y
P
 
L
F
 
Y
N
 
N
T
 
S
S
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
V
G
 
G
P
 
P
D
 
R
G
 
G
K
 
-
T
 
Y
L
 
I
A
 
G
S
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
F
|
F
S
 
Y
P
 
R
A
 
-
G
 
-
E
|
E
D
 
K
R
 
V
Y
 
F
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
K
I
 
V
F
 
F
S
 
D
F
 
I
N
 
G
S
 
F
C
 
A
T
 
K
I
 
V
G
 
G
I
 
V
A
 
M
I
 
I
C
x
A
Y
x
F
D
 
D
L
x
W
R
 
F
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
S
F
 
A
H
 
R
A
 
T
Y
 
L
R
 
A
D
 
L
A
 
K
G
 
G
V
 
A
N
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
-
V
 
-
P
 
-
S
 
-
A
 
A
W
 
H
P
 
P
A
 
A
S
x
N
R
x
L
L
x
V
K
x
M
H
 
P
F
 
Y
H
 
A
L
 
P
F
 
R
T
 
A
T
 
M
S
 
P
-
 
I
R
 
R
A
 
A
A
 
L
E
 
E
F
 
N
Q
 
R
M
 
V
F
 
Y
V
 
T
A
 
I
S
 
T
V
 
A
N
 
D
T
 
R
V
 
V
G
 
G
Q
 
E
T
 
E
P
 
R
V
 
G
D
 
L
F
 
K
Y
 
F
N
 
I
G
 
G
G
 
K
S
 
S
C
 
L
I
 
I
A
 
A
G
 
S
P
 
P
D
 
K
G
 
A
S
 
E
I
 
V
R
 
L
A
 
S
Q
 
I
G
 
A
T
 
S
D
 
E
L
 
T
E
 
E
E
 
E
L
 
E
I
 
I

Q44185 N-carbamoyl-D-amino acid hydrolase; D-N-alpha-carbamilase; EC 3.5.1.77 from Rhizobium radiobacter (Agrobacterium tumefaciens) (Agrobacterium radiobacter) (see paper)
27% identity, 95% coverage: 1:242/256 of query aligns to 5:283/304 of Q44185

query
sites
Q44185
M
 
M
I
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
G
Q
 
Q
I
 
Q
T
 
G
P
 
P
C
 
I
W
 
A
N
 
R
D
 
A
P
 
E
T
 
T
K
 
R
-
 
E
-
 
Q
T
 
V
L
 
V
K
 
G
K
 
R
M
 
L
E
 
L
K
 
D
Y
 
M
A
 
L
A
 
T
E
 
N
A
 
A
V
 
A
E
 
S
G
 
R
D
 
G
A
 
V
T
 
N
F
 
F
L
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
I
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
W
 
F
D
 
F
P
 
P
K
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
-
 
T
N
 
D
N
 
E
S
 
A
E
 
E
V
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
E
T
 
T
T
 
E
E
 
M
D
 
P
G
 
G
E
 
P
E
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
P
L
 
L
K
 
F
D
 
E
I
 
T
A
 
A
Q
 
A
D
 
E
Y
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
F
-
 
N
L
 
L
G
 
G
S
 
Y
F
 
A
R
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
V
E
 
E
K
 
G
N
 
G
T
 
V
D
 
K
H
 
R
P
 
R
F
 
F
N
 
N
T
 
T
S
 
S
I
 
I
A
 
L
I
 
V
G
 
D
P
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
I
L
 
V
A
 
G
S
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
 
K
I
 
I
H
|
H
L
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
F
 
Y
S
 
R
P
 
P
A
 
F
G
 
Q
-
x
H
-
 
L
E
 
E
D
 
K
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
P
I
 
V
F
 
Y
S
 
D
F
 
V
N
 
D
S
 
A
C
 
A
T
 
K
I
 
M
G
 
G
I
 
M
A
 
F
I
 
I
C
 
C
Y
 
N
D
 
D
L
 
R
R
 
R
F
 
W
A
 
P
P
 
E
L
 
T
F
 
W
H
 
R
A
 
V
Y
 
M
R
 
G
D
 
L
A
 
K
G
 
G
V
 
A
N
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
 
N
V
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
H
W
 
N
P
 
P
A
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
H
S
 
D
R
 
H
L
 
L
K
 
T
H
 
S
F
 
F
H
|
H
L
 
H
F
 
L
T
 
L
T
 
S
S
 
M
R
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
S
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
N
-
 
G
M
 
A
F
 
W
V
 
S
A
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
T
 
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
P
 
E
V
 
G
D
 
C
F
 
M
Y
 
L
N
 
L
G
 
G
G
 
H
S
 
S
C
 
C
I
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
I
R
 
V
A
 
A
Q
 
L
G
 
T
T
 
T
D
 
T
L
 
L
E
 
E
-
 
D
E
 
E
L
 
V
I
 
I
F
 
T
Y
 
A
D
 
A
M
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
D
E
 
R
A
 
C
E
 
R
T
 
E
L
 
L
R
 
R

8hpcC Crystal structure of c171a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-hydroxyphenylglycine
27% identity, 95% coverage: 1:242/256 of query aligns to 4:282/303 of 8hpcC

query
sites
8hpcC
M
 
M
I
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
G
Q
 
Q
I
 
Q
T
 
G
P
 
P
C
 
I
W
 
A
N
 
R
D
 
A
P
 
E
T
 
T
K
 
R
-
 
E
-
 
Q
T
 
V
L
 
V
K
 
V
K
 
R
M
 
L
E
 
L
K
 
D
Y
 
M
A
 
L
A
 
T
E
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
S
G
 
R
D
 
G
A
 
A
T
 
N
F
 
F
L
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
W
 
F
D
 
F
P
 
P
K
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
-
 
T
N
 
D
N
 
E
S
 
A
E
 
E
V
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
E
T
 
T
T
 
E
E
 
M
D
 
P
G
 
G
E
 
P
E
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
P
L
 
L
K
 
F
D
 
E
I
 
K
A
 
A
Q
 
A
D
 
E
Y
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
F
-
 
N
L
 
L
G
 
G
S
 
Y
F
 
A
R
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
V
E
 
E
K
 
G
N
 
G
T
 
V
D
 
K
H
 
R
P
 
R
F
 
F
N
 
N
T
 
T
S
 
S
I
 
I
A
 
L
I
 
V
G
 
D
P
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
I
L
 
V
A
 
G
S
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
-
x
P
-
 
G
-
 
H
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
F
 
Y
S
 
R
P
 
P
A
 
F
G
 
Q
-
x
H
-
 
L
E
|
E
D
 
K
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
P
I
 
V
F
 
Y
S
 
D
F
 
V
N
 
D
S
 
A
C
 
A
T
 
K
I
 
M
G
 
G
I
 
M
A
 
F
I
 
I
C
x
A
Y
x
N
D
 
D
L
 
R
R
|
R
F
 
W
A
 
P
P
 
E
L
 
A
F
 
W
H
 
R
A
 
V
Y
 
M
R
 
G
D
 
L
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
x
N
V
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
H
W
x
N
P
 
P
A
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
H
S
 
D
R
 
H
L
 
L
K
 
T
H
 
S
F
 
F
H
 
H
L
 
H
F
 
L
T
 
L
T
 
S
S
 
M
R
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
S
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
N
-
 
G
M
 
A
F
 
W
V
 
S
A
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
T
 
K
V
 
V
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
P
 
E
V
 
N
D
 
C
F
 
M
Y
 
L
N
 
L
G
 
G
G
 
H
S
 
S
C
 
C
I
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
I
R
 
V
A
 
A
Q
 
L
G
 
T
T
 
T
D
 
T
L
 
L
E
 
E
-
 
D
E
 
E
L
 
V
I
 
I
F
 
T
Y
 
A
D
 
A
M
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
D
E
 
R
A
 
C
E
 
R
T
 
E
L
 
L
R
 
R

1uf8A Crystal structure of c171a/v236a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-phenylalanine
27% identity, 95% coverage: 1:242/256 of query aligns to 4:282/303 of 1uf8A

query
sites
1uf8A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
G
Q
 
Q
I
 
Q
T
 
G
P
 
P
C
 
I
W
 
A
N
 
R
D
 
A
P
 
E
T
 
T
K
 
R
-
 
E
-
 
Q
T
 
V
L
 
V
K
 
V
K
 
R
M
 
L
E
 
L
K
 
D
Y
 
M
A
 
L
A
 
T
E
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
S
G
 
R
D
 
G
A
 
A
T
 
N
F
 
F
L
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
W
 
F
D
 
F
P
 
P
K
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
-
 
T
N
 
D
N
 
E
S
 
A
E
 
E
V
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
E
T
 
T
T
 
E
E
 
M
D
 
P
G
 
G
E
 
P
E
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
P
L
 
L
K
 
F
D
 
E
I
 
K
A
 
A
Q
 
A
D
 
E
Y
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
F
-
 
N
L
 
L
G
 
G
S
 
Y
F
 
A
R
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
V
E
 
E
K
 
G
N
 
G
T
 
V
D
 
K
H
 
R
P
 
R
F
 
F
N
|
N
T
 
T
S
 
S
I
 
I
A
 
L
I
 
V
G
 
D
P
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
I
L
 
V
A
 
G
S
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
-
 
P
-
 
G
-
 
H
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
F
 
Y
S
 
R
P
 
P
A
 
F
G
 
Q
-
x
H
-
 
L
E
|
E
D
 
K
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
P
I
 
V
F
 
Y
S
 
D
F
 
V
N
 
D
S
 
A
C
 
A
T
 
K
I
 
M
G
 
G
I
 
M
A
 
F
I
 
I
C
x
A
Y
x
N
D
 
D
L
x
R
R
|
R
F
 
W
A
 
P
P
 
E
L
 
A
F
 
W
H
 
R
A
 
V
Y
 
M
R
 
G
D
 
L
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
x
N
V
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
H
W
 
N
P
 
P
A
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
H
S
 
D
R
 
H
L
 
L
K
 
T
H
 
S
F
 
F
H
 
H
L
 
H
F
 
L
T
 
L
T
 
S
S
 
M
R
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
S
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
N
-
 
G
M
 
A
F
 
W
V
 
S
A
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
T
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
P
 
E
V
 
N
D
 
C
F
 
M
Y
 
L
N
 
L
G
 
G
G
 
H
S
 
S
C
 
C
I
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
I
R
 
V
A
 
A
Q
 
L
G
 
T
T
 
T
D
 
T
L
 
L
E
 
E
-
 
D
E
 
E
L
 
V
I
 
I
F
 
T
Y
 
A
D
 
A
M
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
D
E
 
R
A
 
C
E
 
R
T
 
E
L
 
L
R
 
R

1uf7A Crystal structure of c171a/v236a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-valine
27% identity, 95% coverage: 1:242/256 of query aligns to 4:282/303 of 1uf7A

query
sites
1uf7A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
G
Q
 
Q
I
 
Q
T
 
G
P
 
P
C
 
I
W
 
A
N
 
R
D
 
A
P
 
E
T
 
T
K
 
R
-
 
E
-
 
Q
T
 
V
L
 
V
K
 
V
K
 
R
M
 
L
E
 
L
K
 
D
Y
 
M
A
 
L
A
 
T
E
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
S
G
 
R
D
 
G
A
 
A
T
 
N
F
 
F
L
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
W
 
F
D
 
F
P
 
P
K
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
-
 
T
N
 
D
N
 
E
S
 
A
E
 
E
V
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
E
T
 
T
T
 
E
E
 
M
D
 
P
G
 
G
E
 
P
E
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
P
L
 
L
K
 
F
D
 
E
I
 
K
A
 
A
Q
 
A
D
 
E
Y
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
F
-
 
N
L
 
L
G
 
G
S
 
Y
F
 
A
R
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
V
E
 
E
K
 
G
N
 
G
T
 
V
D
 
K
H
 
R
P
 
R
F
 
F
N
|
N
T
 
T
S
 
S
I
 
I
A
 
L
I
 
V
G
 
D
P
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
I
L
 
V
A
 
G
S
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
-
x
P
-
 
G
-
 
H
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
F
 
Y
S
 
R
P
 
P
A
 
F
G
 
Q
-
 
H
-
 
L
E
|
E
D
 
K
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
P
I
 
V
F
 
Y
S
 
D
F
 
V
N
 
D
S
 
A
C
 
A
T
 
K
I
 
M
G
 
G
I
 
M
A
 
F
I
 
I
C
x
A
Y
x
N
D
 
D
L
 
R
R
|
R
F
 
W
A
 
P
P
 
E
L
 
A
F
 
W
H
 
R
A
 
V
Y
 
M
R
 
G
D
 
L
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
x
N
V
 
T
P
 
P
S
 
T
A
 
H
W
 
N
P
 
P
A
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
H
S
 
D
R
 
H
L
 
L
K
 
T
H
 
S
F
 
F
H
 
H
L
 
H
F
 
L
T
 
L
T
 
S
S
 
M
R
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
S
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
N
-
 
G
M
 
A
F
 
W
V
 
S
A
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
T
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
P
 
E
V
 
N
D
 
C
F
 
M
Y
 
L
N
 
L
G
 
G
G
 
H
S
 
S
C
 
C
I
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
I
R
 
V
A
 
A
Q
 
L
G
 
T
T
 
T
D
 
T
L
 
L
E
 
E
-
 
D
E
 
E
L
 
V
I
 
I
F
 
T
Y
 
A
D
 
A
M
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
D
E
 
R
A
 
C
E
 
R
T
 
E
L
 
L
R
 
R

1uf5A Crystal structure of c171a/v236a mutant of n-carbamyl-d-amino acid amidohydrolase complexed with n-carbamyl-d-methionine
27% identity, 95% coverage: 1:242/256 of query aligns to 4:282/303 of 1uf5A

query
sites
1uf5A
M
 
M
I
 
I
L
 
L
S
 
A
L
 
V
A
 
G
Q
 
Q
I
 
Q
T
 
G
P
 
P
C
 
I
W
 
A
N
 
R
D
 
A
P
 
E
T
 
T
K
 
R
-
 
E
-
 
Q
T
 
V
L
 
V
K
 
V
K
 
R
M
 
L
E
 
L
K
 
D
Y
 
M
A
 
L
A
 
T
E
 
K
A
 
A
V
 
A
E
 
S
G
 
R
D
 
G
A
 
A
T
 
N
F
 
F
L
 
I
V
 
V
F
 
F
P
 
P
E
|
E
Q
 
L
I
 
A
L
 
L
T
 
T
G
 
T
W
 
F
D
 
F
P
 
P
K
 
R
-
 
W
-
 
H
-
 
F
-
 
T
N
 
D
N
 
E
S
 
A
E
 
E
V
 
L
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
Y
-
 
E
T
 
T
T
 
E
E
 
M
D
 
P
G
 
G
E
 
P
E
 
V
I
 
V
S
 
R
A
 
P
L
 
L
K
 
F
D
 
E
I
 
K
A
 
A
Q
 
A
D
 
E
Y
 
L
S
 
G
I
 
I
G
 
G
I
 
F
-
 
N
L
 
L
G
 
G
S
 
Y
F
 
A
R
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
V
E
 
E
K
 
G
N
 
G
T
 
V
D
 
K
H
 
R
P
 
R
F
 
F
N
|
N
T
 
T
S
 
S
I
 
I
A
 
L
I
 
V
G
 
D
P
 
K
D
 
S
G
 
G
K
 
K
T
 
I
L
 
V
A
 
G
S
 
K
Y
 
Y
Q
 
R
K
|
K
I
 
I
H
 
H
L
 
L
-
x
P
-
 
G
-
 
H
-
 
K
-
 
E
-
 
Y
-
 
E
-
 
A
F
 
Y
S
 
R
P
 
P
A
 
F
G
 
Q
-
 
H
-
 
L
E
|
E
D
 
K
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
S
 
E
P
 
P
G
 
G
N
 
D
-
 
L
S
 
G
L
 
F
G
 
P
I
 
V
F
 
Y
S
 
D
F
 
V
N
 
D
S
 
A
C
 
A
T
 
K
I
 
M
G
 
G
I
 
M
A
 
F
I
 
I
C
x
A
Y
x
N
D
 
D
L
 
R
R
|
R
F
 
W
A
 
P
P
 
E
L
 
A
F
 
W
H
 
R
A
 
V
Y
 
M
R
 
G
D
 
L
A
 
R
G
 
G
V
 
A
N
 
E
L
 
I
M
 
I
L
 
C
-
 
G
-
 
G
-
 
Y
-
x
N
V
x
T
P
 
P
S
 
T
A
 
H
W
 
N
P
 
P
A
 
P
-
 
V
-
 
P
-
 
Q
-
 
H
S
 
D
R
 
H
L
 
L
K
 
T
H
 
S
F
 
F
H
 
H
L
 
H
F
 
L
T
 
L
T
 
S
S
 
M
R
 
Q
A
 
A
A
 
G
E
 
S
F
 
Y
Q
 
Q
-
 
N
-
 
G
M
 
A
F
 
W
V
 
S
A
 
A
S
 
A
V
 
A
N
 
G
T
 
K
V
 
A
G
 
G
Q
 
M
T
 
E
P
 
E
V
 
N
D
 
C
F
 
M
Y
 
L
N
 
L
G
 
G
G
 
H
S
 
S
C
 
C
I
 
I
A
 
V
G
 
A
P
 
P
D
 
T
G
 
G
S
 
E
I
 
I
R
 
V
A
 
A
Q
 
L
G
 
T
T
 
T
D
 
T
L
 
L
E
 
E
-
 
D
E
 
E
L
 
V
I
 
I
F
 
T
Y
 
A
D
 
A
M
 
V
P
 
D
I
 
L
E
 
D
E
 
R
A
 
C
E
 
R
T
 
E
L
 
L
R
 
R

5khaA Structure of glutamine-dependent NAD+ synthetase from acinetobacter baumannii in complex with adenosine diphosphate (adp)
22% identity, 89% coverage: 3:230/256 of query aligns to 5:236/526 of 5khaA

query
sites
5khaA
L
 
V
S
 
A
L
 
L
A
 
A
Q
 
Q
I
 
F
T
 
S
P
 
P
C
 
H
W
 
I
N
 
G
D
 
N
P
 
I
T
 
D
K
 
S
T
 
N
L
 
T
K
 
Q
K
 
K
M
 
M
E
 
I
K
 
E
Y
 
Q
A
 
A
A
 
N
E
 
Q
A
 
A
V
 
K
E
 
K
G
 
Q
D
 
D
A
 
A
T
 
D
F
 
L
L
 
I
V
 
I
F
 
F
P
 
P
E
 
E
Q
 
L
I
 
S
L
 
V
T
 
I
G
 
G
W
 
Y
D
 
P
P
 
A
K
 
E
-
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
L
-
 
R
-
 
P
N
 
N
N
 
L
S
 
N
E
 
K
V
 
R
T
 
M
T
 
Q
E
 
K
D
 
A
G
 
F
E
 
A
E
 
Q
I
 
L
S
 
S
A
 
E
L
 
V
K
 
K
D
 
D
I
 
I
A
 
-
Q
 
-
D
 
-
Y
 
-
S
 
-
I
 
V
G
 
M
I
 
V
L
 
F
G
 
G
S
 
F
F
 
V
R
 
N
E
 
Q
K
 
T
N
 
E
T
 
D
D
 
G
H
 
Q
P
 
R
F
 
Y
N
 
N
T
 
S
S
 
A
I
 
-
A
 
A
I
 
V
G
 
M
P
 
K
D
 
D
G
 
G
K
 
Q
T
 
V
L
 
L
A
 
G
S
 
V
Y
 
F
Q
 
N
K
 
K
I
 
H
H
 
N
L
 
L
-
 
P
-
 
N
F
 
Y
S
 
G
P
 
V
A
 
F
G
 
D
E
 
E
D
 
K
R
 
R
Y
 
Y
F
 
F
S
 
Q
P
 
K
G
 
G
N
 
H
S
 
Q
L
 
H
G
 
L
I
 
V
F
 
F
S
 
E
F
 
Y
N
 
L
S
 
G
C
 
H
T
 
K
I
 
F
G
 
G
I
 
V
A
 
L
I
 
I
C
 
C
Y
 
E
D
 
D
L
 
I
R
 
W
F
 
S
A
 
I
P
 
N
L
 
T
F
 
V
H
 
K
A
 
Q
Y
 
L
R
 
S
D
 
Q
A
 
L
G
 
N
V
 
V
N
 
D
L
 
T
M
 
V
L
 
L
V
 
V
P
 
L
S
 
N
A
 
S
W
 
S
P
 
P
-
 
Y
-
 
E
A
 
V
S
 
G
R
 
K
L
 
P
K
 
Q
H
 
H
F
 
R
H
 
K
L
 
Q
F
 
T
T
 
L
T
 
S
S
 
E
R
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
Q
F
 
L
Q
 
H
M
 
L
F
 
N
V
 
I
A
 
V
S
 
Y
V
 
V
N
 
N
T
 
Q
V
 
V
G
 
G
Q
 
G
T
 
Q
P
 
D
V
 
D
D
 
L
F
 
I
Y
 
F
N
 
D
G
 
G
G
 
T
S
 
S
C
 
F
I
 
V
A
 
S
G
 
N
P
 
Q
D
 
N
G
 
G
S
 
E
I
 
I
R
 
A
A
 
L
Q
 
Q
G
 
A
T
 
P
D
 
S
L
 
F
E
 
K
E
 
E
L
 
D
I
 
L
F
 
Y

Sites not aligning to the query:

4hg5A Structural insights into yeast nit2: wild-type yeast nit2 in complex with oxaloacetate (see paper)
26% identity, 95% coverage: 14:255/256 of query aligns to 15:302/304 of 4hg5A

query
sites
4hg5A
D
 
D
P
 
L
T
 
T
K
 
K
T
 
N
L
 
L
K
 
K
K
 
V
M
 
V
E
 
K
K
 
E
Y
 
L
A
 
I
A
 
S
E
 
E
A
 
A
V
 
I
E
 
Q
G
 
K
D
 
K
A
 
A
T
 
D
F
 
V
L
 
V
V
 
F
F
 
L
P
 
P
E
 
E
Q
 
A
I
 
S
-
 
D
L
 
Y
T
 
L
G
 
S
W
 
Q
D
 
N
P
 
P
K
 
L
N
 
H
N
 
S
S
 
R
E
 
Y
V
 
L
T
 
A
T
 
Q
E
 
K
D
 
S
G
 
P
E
 
K
E
 
F
I
 
I
-
 
R
-
 
Q
-
 
L
-
 
Q
S
 
S
A
 
S
L
 
I
K
 
T
D
 
D
I
 
L
A
 
V
Q
 
R
D
 
D
-
 
N
-
 
S
-
 
R
-
 
N
-
 
I
-
 
D
Y
 
V
S
 
S
I
 
I
G
 
G
I
 
V
L
 
H
G
 
L
S
 
P
F
 
P
R
 
S
E
 
E
K
 
Q
N
 
D
-
 
L
-
 
L
-
 
E
-
 
G
T
 
N
D
 
D
H
 
R
P
 
V
F
 
R
N
|
N
T
 
V
S
 
L
I
 
L
A
 
Y
I
 
I
G
 
D
P
 
H
D
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
I
L
 
L
A
 
Q
S
 
E
Y
 
Y
Q
 
Q
K
|
K
I
 
L
H
 
H
L
 
L
F
|
F
S
 
D
-
 
V
-
 
D
-
 
V
P
 
P
A
 
N
G
 
G
-
 
P
-
 
I
-
 
L
-
 
K
E
|
E
D
 
S
R
 
K
Y
 
S
F
 
V
S
 
Q
P
 
P
G
 
G
N
 
K
S
 
A
L
 
I
-
 
P
G
 
D
I
 
I
F
 
I
S
 
E
F
 
S
N
 
P
S
 
L
C
 
G
T
 
K
I
 
L
G
 
G
I
 
S
A
 
A
I
 
I
C
|
C
Y
|
Y
D
 
D
L
 
I
R
|
R
F
 
F
A
 
P
P
 
E
L
 
F
F
 
S
H
 
L
A
 
K
Y
 
L
R
 
R
D
 
S
A
 
M
G
 
G
V
 
A
N
 
E
L
 
I
M
 
L
L
 
C
V
 
F
P
 
P
S
 
S
A
 
A
W
x
F
P
x
T
A
 
I
S
 
K
R
x
T
L
 
G
K
 
E
-
 
A
H
 
H
F
 
W
H
 
E
L
 
L
F
 
L
T
 
G
T
 
R
S
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
V
E
 
D
F
 
T
Q
 
Q
M
 
C
F
 
Y
V
 
V
A
 
L
S
 
M
V
 
P
N
 
G
T
 
Q
V
 
V
G
 
G
-
 
M
-
 
H
-
 
D
-
 
L
-
 
S
-
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
W
-
 
E
-
 
K
Q
 
Q
T
 
S
P
 
H
V
 
M
D
 
S
F
 
A
Y
 
L
N
 
E
-
 
K
-
 
S
-
 
S
-
 
R
-
 
R
-
 
E
-
 
S
-
 
W
G
 
G
G
 
H
S
 
S
C
 
M
I
 
V
A
 
I
G
 
D
P
 
P
D
 
W
G
 
G
S
 
K
I
 
I
R
 
I
A
 
A
Q
 
H
G
 
A
-
 
D
-
 
P
-
 
S
T
 
T
D
 
V
L
 
G
E
 
P
E
 
Q
L
 
L
I
 
I
F
 
L
Y
 
A
D
 
D
M
 
L
P
 
D
I
 
R
E
 
E
E
 
L
A
 
L
E
 
Q
T
 
E
L
 
I
R
 
R
I
 
N
S
 
K
F
 
M
P
 
P
F
 
L
H
 
W
K
 
N
D
 
Q
V
 
R
R
 
R
N
 
D
D
 
D
F
 
L

Query Sequence

>WP_109941570.1 NCBI__GCF_003173335.1:WP_109941570.1
MILSLAQITPCWNDPTKTLKKMEKYAAEAVEGDATFLVFPEQILTGWDPKNNSEVTTEDG
EEISALKDIAQDYSIGILGSFREKNTDHPFNTSIAIGPDGKTLASYQKIHLFSPAGEDRY
FSPGNSLGIFSFNSCTIGIAICYDLRFAPLFHAYRDAGVNLMLVPSAWPASRLKHFHLFT
TSRAAEFQMFVASVNTVGQTPVDFYNGGSCIAGPDGSIRAQGTDLEELIFYDMPIEEAET
LRISFPFHKDVRNDFL

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory