SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_109970219.1 NCBI__GCF_003173355.1:WP_109970219.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

6wj9B Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-glcnac (see paper)
40% identity, 98% coverage: 2:305/310 of query aligns to 2:306/308 of 6wj9B

query
sites
6wj9B
K
 
E
R
 
R
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
S
 
V
R
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
G
 
G
D
 
Y
S
 
A
V
 
V
V
 
R
I
 
V
F
 
L
D
|
D
S
x
D
L
 
L
D
x
S
S
x
T
G
|
G
N
 
K
L
 
V
A
 
G
N
 
N
I
 
L
T
 
P
D
 
-
L
 
-
Q
 
M
K
 
G
N
 
D
P
 
A
H
 
G
L
 
L
E
 
E
F
 
L
I
 
L
E
 
V
D
 
G
T
x
D
I
x
A
L
 
A
N
 
D
K
 
A
T
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
A
S
 
D
I
 
A
C
 
V
S
 
Q
H
 
G
I
 
C
D
 
D
G
 
A
I
 
V
F
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
V
V
 
A
S
 
S
V
|
V
Q
 
Q
R
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
V
L
 
A
N
 
T
H
 
H
S
 
Q
I
x
S
N
 
N
V
 
F
D
 
I
G
 
A
M
 
T
F
 
L
N
 
R
V
 
L
L
 
C
E
 
E
S
 
A
A
 
M
R
 
T
K
 
A
E
 
A
K
 
G
V
 
I
P
 
R
K
 
R
I
 
V
V
 
V
F
 
F
A
|
A
S
 
S
S
x
A
A
|
A
A
|
A
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
-
 
N
A
 
G
Y
 
E
V
 
G
P
 
T
P
 
P
H
 
I
K
 
A
E
 
E
S
 
D
F
 
T
P
 
P
P
 
K
I
 
S
P
 
P
L
 
L
S
 
T
P
 
P
Y
x
F
A
 
A
V
 
A
G
 
D
K
|
K
N
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
S
 
D
V
 
F
Y
 
Y
S
 
R
S
 
R
L
 
Q
Y
 
H
G
 
G
I
 
L
G
 
E
C
 
P
V
 
V
C
 
I
L
 
L
R
 
R
F
|
F
F
|
F
N
|
N
V
x
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
G
|
G
V
|
V
I
 
I
S
 
S
K
 
I
F
|
F
L
 
S
E
 
E
A
 
R
V
 
A
T
 
K
Q
 
A
E
 
G
K
 
R
N
 
P
I
 
I
I
x
T
I
x
L
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
G
Q
 
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
I
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
Q
 
K
A
 
I
L
 
L
L
 
V
L
 
Q
S
 
G
M
 
L
D
 
E
K
 
S
D
 
P
V
 
A
N
 
P
G
 
A
-
 
A
-
 
D
V
 
A
F
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
T
 
L
G
 
G
F
 
G
T
 
V
S
 
T
S
 
T
I
x
L
N
 
N
Q
 
D
L
 
L
A
 
I
C
 
G
N
 
A
I
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
S
 
S
N
 
G
R
 
K
K
 
P
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
S
H
 
H
M
 
G
E
 
A
A
 
T
R
|
R
G
 
S
G
 
G
E
x
D
V
 
I
R
 
R
H
 
H
S
 
S
C
 
K
A
 
A
D
 
D
I
 
N
T
 
R
Q
 
R
A
 
L
Q
 
R
E
 
E
K
 
R
L
 
F
G
 
D
Y
 
L
Y
 
G
P
 
T
G
 
P
Y
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
E
E
 
R
T
 
L
Y
 
Y
Q
 
R

6wjaA Udp-glcnac c4-epimerase mutant s121a/y146f from pseudomonas protegens in complex with udp-galnac (see paper)
40% identity, 98% coverage: 2:305/310 of query aligns to 1:305/307 of 6wjaA

query
sites
6wjaA
K
 
E
R
 
R
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
S
 
V
R
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
K
G
 
G
D
 
Y
S
 
A
V
 
V
V
 
R
I
 
V
F
 
L
D
|
D
S
x
D
L
 
L
D
x
S
S
x
T
G
|
G
N
 
K
L
 
V
A
 
G
N
 
N
I
 
L
T
 
P
D
 
-
L
 
-
Q
 
M
K
 
G
N
 
D
P
 
A
H
 
G
L
 
L
E
 
E
F
 
L
I
 
L
E
 
V
D
 
G
T
 
D
I
x
A
L
 
A
N
 
D
K
 
A
T
 
A
R
 
L
L
 
L
L
 
A
S
 
D
I
 
A
C
 
V
S
 
Q
H
 
G
I
 
C
D
 
D
G
 
A
I
 
V
F
 
V
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
V
V
 
A
S
 
S
V
|
V
Q
 
Q
R
 
A
S
 
S
I
 
V
D
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
V
L
 
A
N
 
T
H
 
H
S
 
Q
I
x
S
N
 
N
V
 
F
D
 
I
G
 
A
M
 
T
F
 
L
N
 
R
V
 
L
L
 
C
E
 
E
S
 
A
A
 
M
R
 
T
K
 
A
E
 
A
K
 
G
V
 
I
P
 
R
K
 
R
I
 
V
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
 
S
S
x
A
A
|
A
A
|
A
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
N
-
 
N
A
 
G
Y
 
E
V
 
G
P
 
T
P
 
P
H
 
I
K
 
A
E
 
E
S
 
D
F
 
T
P
 
P
P
 
K
I
 
S
P
 
P
L
 
L
S
 
T
P
 
P
Y
x
F
A
 
A
V
 
A
G
 
D
K
|
K
N
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
E
M
 
Y
Y
 
Y
S
 
L
S
 
D
V
 
F
Y
 
Y
S
 
R
S
 
R
L
 
Q
Y
 
H
G
 
G
I
 
L
G
 
E
C
 
P
V
 
V
C
 
I
L
 
L
R
 
R
F
|
F
F
|
F
N
|
N
V
x
I
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
S
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
S
G
|
G
V
|
V
I
 
I
S
 
S
K
 
I
F
|
F
L
 
S
E
 
E
A
 
R
V
 
A
T
 
K
Q
 
A
E
 
G
K
 
R
N
 
P
I
 
I
I
x
T
I
 
L
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
G
Q
 
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
I
 
A
D
 
D
V
 
L
V
 
V
Q
 
K
A
 
I
L
 
L
L
 
V
L
 
Q
S
 
G
M
 
L
D
 
E
K
 
S
D
 
P
V
 
A
N
 
P
G
 
A
-
 
A
-
 
D
V
 
A
F
 
T
N
 
N
V
 
V
G
 
G
T
 
L
G
 
G
F
 
G
T
 
V
S
 
T
S
 
T
I
x
L
N
 
N
Q
 
D
L
 
L
A
 
I
C
 
G
N
 
A
I
 
L
I
 
Q
Q
 
Q
L
 
I
S
 
S
N
 
G
R
 
K
K
 
P
V
 
L
E
 
Q
V
 
V
I
 
S
H
 
H
M
 
G
E
 
A
A
 
T
R
|
R
G
 
S
G
 
G
E
x
D
V
 
I
R
 
R
H
 
H
S
 
S
C
 
K
A
 
A
D
 
D
I
 
N
T
 
R
Q
 
R
A
 
L
Q
 
R
E
 
E
K
 
R
L
 
F
G
 
D
Y
 
L
Y
 
G
P
 
T
G
 
P
Y
 
S
S
 
S
L
 
L
E
 
A
R
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
E
E
 
R
T
 
L
Y
 
Y
Q
 
R

4zrnA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (tm0509) with udp-glucose from hyperthermophilic eubacterium thermotoga maritima (see paper)
41% identity, 99% coverage: 5:310/310 of query aligns to 4:307/309 of 4zrnA

query
sites
4zrnA
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
V
S
 
V
R
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
I
A
 
E
R
 
N
G
 
G
D
 
Y
S
 
G
V
 
V
V
 
I
I
 
V
F
 
V
D
|
D
S
x
N
L
 
L
D
x
S
S
|
S
G
|
G
N
 
K
L
 
V
A
 
E
N
 
N
I
 
L
T
 
-
D
 
-
L
 
-
Q
 
-
K
 
-
N
 
N
P
 
R
H
 
N
L
 
A
E
 
L
F
 
F
I
 
Y
E
 
E
D
 
Q
T
x
S
I
|
I
L
 
E
N
 
D
K
 
E
T
 
E
R
 
M
L
 
M
L
 
E
S
 
R
I
 
I
C
 
F
S
 
S
-
 
L
-
 
H
H
 
R
I
 
P
D
 
E
G
 
Y
I
 
V
F
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
Q
V
 
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
A
R
 
I
S
 
S
I
 
V
D
 
R
D
 
E
P
 
P
E
 
A
L
 
R
N
 
D
H
 
A
S
 
K
I
x
T
N
 
N
V
 
I
D
 
I
G
 
G
M
 
S
F
 
L
N
 
V
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
K
A
 
S
R
 
I
K
 
K
E
 
Y
K
 
G
V
 
V
P
 
K
K
 
K
I
 
F
V
 
I
F
 
F
A
x
S
S
|
S
S
x
T
A
 
G
-
x
G
A
|
A
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
-
 
E
N
 
N
A
 
V
Y
 
K
V
 
V
P
 
F
P
 
P
H
 
T
K
 
P
E
 
E
S
 
T
F
 
E
P
 
I
P
 
P
I
 
H
P
 
P
L
 
I
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
G
V
 
I
G
 
A
K
|
K
N
 
Y
L
 
S
S
 
T
E
 
E
M
 
M
Y
 
Y
S
 
L
S
 
E
V
 
F
Y
 
F
S
 
A
S
 
R
L
 
E
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
K
C
 
Y
V
 
T
C
 
V
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
A
N
|
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
Y
S
 
G
P
 
E
Y
 
-
S
 
A
G
|
G
V
|
V
I
 
V
S
 
A
K
 
I
F
 
F
L
 
T
E
 
E
A
 
R
V
 
M
T
 
L
Q
 
R
E
 
G
K
 
E
N
 
E
I
 
V
I
x
H
I
 
I
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
x
Y
T
 
V
R
|
R
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
I
 
D
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
R
A
 
A
L
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
A
M
 
M
D
 
E
K
 
K
D
 
G
V
 
D
N
 
N
G
 
E
V
 
V
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
F
 
R
T
 
G
S
 
T
S
 
T
I
x
V
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
F
C
 
K
N
 
L
I
 
L
I
 
K
Q
 
E
L
 
I
S
 
T
N
 
G
R
 
Y
K
 
D
V
 
K
E
 
E
V
 
P
I
 
V
H
 
Y
M
 
K
E
 
P
A
 
P
R
|
R
G
 
K
G
 
G
E
x
D
V
 
V
R
 
R
H
 
K
S
 
S
C
 
I
A
 
L
D
 
D
I
 
Y
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
Q
 
K
E
 
E
K
 
K
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
Y
 
E
P
 
P
G
 
K
Y
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
K
E
 
L
T
 
T
Y
 
V
Q
 
E
W
 
Y
W
 
F
K
 
R
G
 
K
T
 
T

6dntA Udp-n-acetylglucosamine 4-epimerase from methanobrevibacter ruminantium m1 in complex with udp-n-acetylmuramic acid (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:307/310 of query aligns to 4:306/310 of 6dntA

query
sites
6dntA
K
 
K
R
 
N
Y
 
V
L
 
V
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
L
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
I
S
 
V
R
 
D
A
 
A
L
 
L
L
 
I
A
 
-
R
 
D
G
 
D
D
 
N
S
 
K
V
 
V
V
 
T
I
 
I
F
 
I
D
|
D
S
x
N
L
|
L
D
x
S
S
|
S
G
|
G
N
 
K
L
 
M
A
 
E
N
 
N
I
 
L
T
 
N
D
 
N
L
 
-
Q
 
P
K
 
N
N
 
H
P
 
E
H
 
N
L
 
L
E
 
T
F
 
I
I
 
I
E
 
K
D
 
E
T
x
D
I
x
L
L
 
M
N
 
D
K
 
-
T
 
A
R
 
D
L
 
L
L
 
E
S
 
K
I
 
I
C
 
L
S
 
K
H
 
D
I
 
K
D
 
D
G
 
Y
I
 
V
F
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
L
V
x
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
P
R
 
G
S
 
S
I
 
V
D
 
A
D
 
E
P
 
P
E
 
L
L
 
R
N
 
Y
H
 
N
S
 
Q
I
 
N
N
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
A
M
 
S
F
 
L
N
 
K
V
 
L
L
 
F
E
 
I
S
 
A
A
 
C
R
 
K
K
 
N
E
 
N
K
 
N
V
 
I
P
 
K
K
 
K
I
 
V
V
 
I
F
 
F
A
x
S
S
|
S
S
|
S
A
x
S
A
|
A
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
A
 
N
Y
 
P
V
 
N
P
 
M
P
 
P
H
 
L
K
 
K
E
 
E
S
 
S
F
 
E
P
 
N
P
 
F
I
 
L
P
 
P
L
 
C
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
G
 
Q
K
|
K
N
 
A
L
 
S
S
 
C
E
 
E
M
 
L
Y
 
Y
S
 
L
S
 
K
V
 
S
Y
 
F
S
 
H
S
 
E
L
 
S
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
D
C
 
Y
V
 
V
C
 
A
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
|
F
N
|
N
V
|
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
E
S
 
N
S
 
S
P
 
P
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
K
|
K
F
 
F
L
 
I
E
 
S
A
 
A
V
 
I
T
 
L
Q
 
N
E
 
G
K
 
E
N
 
S
I
 
P
I
x
V
I
|
I
F
x
Y
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
|
E
Q
|
Q
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
I
Y
 
Y
V
 
V
I
 
K
D
 
E
V
 
I
V
 
A
Q
 
K
A
 
A
L
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
S
M
 
A
D
 
E
K
 
S
D
 
D
V
 
Y
N
 
N
G
 
G
V
 
V
F
 
I
N
 
N
V
 
V
G
 
A
T
 
L
G
 
G
F
 
K
T
 
S
S
 
M
S
 
T
I
|
I
N
 
N
Q
 
R
L
 
L
A
 
F
C
 
E
N
 
I
I
 
I
I
 
S
Q
 
D
L
 
V
S
 
L
N
 
E
R
 
S
K
 
D
V
 
I
E
 
D
V
 
V
I
 
K
H
 
Y
M
 
L
E
 
D
A
 
E
R
|
R
G
 
P
G
 
G
E
x
D
V
 
I
R
 
K
H
|
H
S
 
S
C
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
S
Q
 
N
A
 
L
Q
 
-
E
 
D
K
 
K
L
 
I
G
 
S
Y
 
F
Y
 
K
P
 
P
G
 
D
Y
 
E
-
 
D
S
 
K
L
 
F
E
 
E
R
 
E
G
 
Q
L
 
L
F
 
R
E
 
E
T
 
T
Y
 
V
Q
 
K
W
 
W
W
 
F

1sb9A Crystal structure of pseudomonas aeruginosa udp-n-acetylglucosamine 4- epimerase complexed with udp-glucose (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:307/310 of query aligns to 16:335/340 of 1sb9A

query
sites
1sb9A
K
 
K
R
 
V
Y
 
W
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
L
R
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
D
D
 
Q
S
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
G
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
x
F
D
 
A
S
x
T
G
|
G
N
 
H
L
 
Q
A
 
R
N
 
N
I
 
L
T
 
D
D
 
E
L
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
E
Q
 
K
K
 
Q
N
 
W
P
 
S
H
 
N
L
 
F
E
 
K
F
 
F
I
 
I
E
 
Q
D
 
G
T
x
D
I
|
I
L
 
R
N
 
N
K
 
L
T
 
D
R
 
D
L
 
C
L
 
N
S
 
N
I
 
A
C
 
C
S
 
A
H
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
Y
I
 
V
F
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
 
A
A
|
A
L
 
L
V
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
D
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
I
L
 
T
N
 
S
H
 
N
S
 
A
I
x
T
N
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
G
M
 
F
F
 
L
N
 
N
V
 
M
L
 
L
E
 
I
S
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
D
E
 
A
K
 
K
V
 
V
P
 
Q
K
 
S
I
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
A
 
H
Y
 
P
V
 
G
P
 
L
P
 
P
H
 
K
K
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
T
P
 
I
P
 
G
I
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
Y
L
 
V
S
 
N
E
 
E
M
 
L
Y
 
Y
S
 
A
S
 
D
V
 
V
Y
 
F
S
 
S
S
 
R
L
 
C
Y
 
Y
G
 
G
I
 
F
G
 
S
C
 
T
V
 
I
C
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
V
|
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
K
 
K
F
x
W
L
 
T
E
 
S
A
 
S
V
 
M
T
 
I
Q
 
Q
E
 
G
K
 
D
N
 
D
I
 
V
I
x
Y
I
|
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
 
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
I
 
E
D
 
N
V
 
T
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
A
M
 
A
D
 
T
K
 
A
D
 
G
V
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
R
N
 
N
G
 
Q
V
 
V
F
 
Y
N
 
N
V
 
I
G
 
A
T
 
V
G
 
G
F
 
G
T
 
R
S
 
T
S
 
S
I
x
L
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
F
C
 
F
N
 
A
I
 
L
I
 
R
Q
 
D
-
 
G
L
 
L
S
 
A
N
 
E
R
 
N
K
 
G
V
 
V
-
 
S
-
 
Y
-
 
H
-
 
R
E
 
E
V
 
P
I
 
V
H
 
Y
M
 
R
E
 
D
A
 
F
R
|
R
G
 
E
G
 
G
E
x
D
V
 
V
R
 
R
H
 
H
S
 
S
C
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
S
Q
 
K
A
 
A
Q
 
A
E
 
K
K
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
A
P
 
P
G
 
K
Y
 
Y
S
 
D
L
 
V
E
 
S
R
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
A
E
 
L
T
 
A
Y
 
M
Q
 
P
W
 
W
W
 
Y

1sb8A Crystal structure of pseudomonas aeruginosa udp-n-acetylglucosamine 4- epimerase complexed with udp-n-acetylgalactosamine (see paper)
38% identity, 99% coverage: 2:307/310 of query aligns to 17:336/341 of 1sb8A

query
sites
1sb8A
K
 
K
R
 
V
Y
 
W
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
L
R
 
E
A
 
T
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
D
D
 
Q
S
 
K
V
 
V
V
 
V
I
 
G
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
x
F
D
 
A
S
x
T
G
|
G
N
 
H
L
 
Q
A
 
R
N
 
N
I
 
L
T
 
D
D
 
E
L
 
V
-
 
R
-
 
S
-
 
L
-
 
V
-
 
S
-
 
E
Q
 
K
K
 
Q
N
 
W
P
 
S
H
 
N
L
 
F
E
 
K
F
 
F
I
 
I
E
 
Q
D
 
G
T
x
D
I
|
I
L
 
R
N
 
N
K
 
L
T
 
D
R
 
D
L
 
C
L
 
N
S
 
N
I
 
A
C
 
C
S
 
A
H
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
Y
I
 
V
F
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
 
A
A
|
A
L
 
L
V
 
G
S
|
S
V
 
V
Q
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
D
 
N
D
 
D
P
 
P
E
 
I
L
 
T
N
 
S
H
 
N
S
 
A
I
x
T
N
 
N
V
 
I
D
 
D
G
 
G
M
 
F
F
 
L
N
 
N
V
 
M
L
 
L
E
 
I
S
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
D
E
 
A
K
 
K
V
 
V
P
 
Q
K
 
S
I
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
A
 
H
Y
 
P
V
 
G
P
 
L
P
 
P
H
 
K
K
 
V
E
 
E
S
 
D
F
 
T
P
 
I
P
 
G
I
 
K
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
Y
L
 
V
S
 
N
E
 
E
M
 
L
Y
 
Y
S
 
A
S
 
D
V
 
V
Y
 
F
S
 
S
S
 
R
L
 
C
Y
 
Y
G
 
G
I
 
F
G
 
S
C
 
T
V
 
I
C
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
V
|
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
K
 
K
F
x
W
L
 
T
E
 
S
A
 
S
V
 
M
T
 
I
Q
 
Q
E
 
G
K
 
D
N
 
D
I
 
V
I
x
Y
I
|
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
I
 
E
D
 
N
V
 
T
V
 
V
Q
 
Q
A
 
A
L
 
N
L
 
L
L
 
L
S
 
A
M
 
A
D
 
T
K
 
A
D
 
G
V
 
L
-
 
D
-
 
A
-
 
R
N
 
N
G
 
Q
V
 
V
F
 
Y
N
 
N
V
 
I
G
 
A
T
 
V
G
 
G
F
 
G
T
 
R
S
 
T
S
 
S
I
x
L
N
 
N
Q
 
Q
L
 
L
A
 
F
C
 
F
N
 
A
I
 
L
I
 
R
Q
 
D
-
 
G
L
 
L
S
 
A
N
 
E
R
 
N
K
 
G
V
 
V
-
 
S
-
 
Y
-
 
H
-
 
R
E
 
E
V
 
P
I
 
V
H
 
Y
M
 
R
E
 
D
A
 
F
R
|
R
G
 
E
G
 
G
E
x
D
V
 
V
R
 
R
H
 
H
S
|
S
C
 
L
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
S
Q
 
K
A
 
A
Q
 
A
E
 
K
K
 
L
L
 
L
G
 
G
Y
 
Y
Y
 
A
P
 
P
G
 
K
Y
 
Y
S
 
D
L
 
V
E
 
S
R
 
A
G
 
G
L
 
V
F
 
A
E
 
L
T
 
A
Y
 
M
Q
 
P
W
 
W
W
 
Y

3ruhA Alternative analogs as viable substrates of udp-hexose 4-epimerases
36% identity, 99% coverage: 2:307/310 of query aligns to 17:331/336 of 3ruhA

query
sites
3ruhA
K
 
K
R
 
T
Y
 
W
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
L
R
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
N
D
 
Q
S
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
G
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
 
F
D
x
S
S
x
T
G
|
G
N
 
H
L
 
Q
A
 
Y
N
 
N
I
 
L
T
 
D
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
K
 
T
N
 
L
P
 
V
H
 
S
L
 
T
E
 
E
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
C
F
 
F
I
 
I
E
 
E
D
 
G
T
x
D
I
|
I
L
 
R
N
 
D
K
 
L
T
 
T
R
 
T
L
 
C
L
 
E
S
 
Q
I
 
V
C
 
M
S
 
K
H
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
H
I
 
V
F
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
L
V
x
G
S
|
S
V
 
V
Q
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
D
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
I
L
 
T
N
 
T
H
 
N
S
 
A
I
x
T
N
 
N
V
 
I
D
 
T
G
 
G
M
 
F
F
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
H
S
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
N
E
 
A
K
 
Q
V
 
V
P
 
Q
K
 
S
I
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
A
 
H
Y
 
P
V
 
A
P
 
L
P
 
P
H
 
K
K
 
V
E
 
E
S
 
E
F
 
N
P
 
I
P
 
G
I
 
N
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
Y
L
 
V
S
 
N
E
 
E
M
 
I
Y
 
Y
S
 
A
S
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
S
 
A
S
 
R
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
I
 
F
G
 
K
C
 
T
V
 
I
C
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
V
|
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
K
|
K
F
x
W
L
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
L
Q
 
K
E
 
G
K
 
D
N
 
D
I
 
V
I
x
Y
I
|
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
I
 
D
D
 
N
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
A
 
M
L
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
S
M
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
K
D
 
D
K
 
S
D
 
A
V
 
K
N
 
D
G
 
N
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
A
T
 
V
G
 
G
F
 
D
T
 
R
S
 
T
S
 
T
I
x
L
N
 
N
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
C
 
G
N
 
Y
I
 
I
I
 
Y
Q
 
D
L
 
E
S
 
L
N
 
N
R
 
L
K
 
I
V
 
H
E
 
H
V
 
I
I
 
K
H
 
Y
M
 
R
E
 
E
A
 
F
R
|
R
G
 
S
G
 
G
E
x
D
V
|
V
R
 
R
H
 
H
S
|
S
C
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
Q
 
I
E
 
D
K
 
L
L
 
L
G
 
K
Y
 
Y
Y
 
R
P
 
P
G
 
N
Y
 
I
S
 
K
L
 
I
E
 
R
R
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
R
E
 
L
T
 
S
Y
 
M
Q
 
P
W
 
W
W
 
Y

3rufA Alternative analogs as viable substrates of udp-hexose 4-epimerases
36% identity, 99% coverage: 2:307/310 of query aligns to 17:331/336 of 3rufA

query
sites
3rufA
K
 
K
R
 
T
Y
 
W
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
L
R
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
N
D
 
Q
S
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
G
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
 
F
D
x
S
S
x
T
G
|
G
N
 
H
L
 
Q
A
 
Y
N
 
N
I
 
L
T
 
D
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
K
 
T
N
 
L
P
 
V
H
 
S
L
 
T
E
 
E
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
C
F
 
F
I
 
I
E
 
E
D
 
G
T
x
D
I
|
I
L
 
R
N
 
D
K
 
L
T
 
T
R
 
T
L
 
C
L
 
E
S
 
Q
I
 
V
C
 
M
S
 
K
H
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
H
I
 
V
F
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
L
V
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
D
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
I
L
 
T
N
 
T
H
 
N
S
 
A
I
x
T
N
 
N
V
 
I
D
 
T
G
 
G
M
 
F
F
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
H
S
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
N
E
 
A
K
 
Q
V
 
V
P
 
Q
K
 
S
I
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
 
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
A
 
H
Y
 
P
V
 
A
P
 
L
P
 
P
H
 
K
K
 
V
E
 
E
S
 
E
F
 
N
P
 
I
P
 
G
I
 
N
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
Y
L
 
V
S
 
N
E
 
E
M
 
I
Y
 
Y
S
 
A
S
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
S
 
A
S
 
R
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
I
 
F
G
 
K
C
 
T
V
 
I
C
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
V
|
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
x
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
K
|
K
F
x
W
L
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
L
Q
 
K
E
 
G
K
 
D
N
 
D
I
 
V
I
x
Y
I
|
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
I
 
D
D
 
N
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
A
 
M
L
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
S
M
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
K
D
 
D
K
 
S
D
 
A
V
 
K
N
 
D
G
 
N
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
A
T
 
V
G
 
G
F
 
D
T
 
R
S
 
T
S
 
T
I
x
L
N
 
N
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
C
 
G
N
 
Y
I
 
I
I
 
Y
Q
 
D
L
 
E
S
 
L
N
 
N
R
 
L
K
 
I
V
 
H
E
 
H
V
 
I
I
 
K
H
 
Y
M
 
R
E
 
E
A
 
F
R
|
R
G
 
S
G
 
G
E
x
D
V
 
V
R
 
R
H
 
H
S
 
S
C
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
Q
 
I
E
 
D
K
 
L
L
 
L
G
 
K
Y
 
Y
Y
 
R
P
 
P
G
 
N
Y
 
I
S
 
K
L
 
I
E
 
R
R
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
R
E
 
L
T
 
S
Y
 
M
Q
 
P
W
 
W
W
 
Y

3lu1A Crystal structure analysis of wbgu: a udp-galnac 4-epimerase (see paper)
36% identity, 99% coverage: 2:307/310 of query aligns to 17:331/336 of 3lu1A

query
sites
3lu1A
K
 
K
R
 
T
Y
 
W
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
V
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
L
R
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
N
D
 
Q
S
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
G
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
 
F
D
x
S
S
x
T
G
|
G
N
 
H
L
 
Q
A
 
Y
N
 
N
I
 
L
T
 
D
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
K
 
T
N
 
L
P
 
V
H
 
S
L
 
T
E
 
E
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
C
F
 
F
I
 
I
E
 
E
D
 
G
T
x
D
I
|
I
L
 
R
N
 
D
K
 
L
T
 
T
R
 
T
L
 
C
L
 
E
S
 
Q
I
 
V
C
 
M
S
 
K
H
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
H
I
 
V
F
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
L
V
 
G
S
|
S
V
 
V
Q
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
D
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
I
L
 
T
N
 
T
H
 
N
S
 
A
I
 
T
N
 
N
V
 
I
D
 
T
G
 
G
M
 
F
F
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
H
S
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
N
E
 
A
K
 
Q
V
 
V
P
x
Q
K
 
S
I
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
|
A
S
x
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
A
 
H
Y
 
P
V
 
A
P
 
L
P
 
P
H
 
K
K
 
V
E
 
E
S
 
E
F
 
N
P
 
I
P
 
G
I
 
N
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
Y
L
 
V
S
 
N
E
 
E
M
 
I
Y
 
Y
S
 
A
S
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
S
 
A
S
 
R
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
I
 
F
G
x
K
C
 
T
V
 
I
C
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
|
N
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
V
|
V
I
 
I
S
 
P
K
 
K
F
x
W
L
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
L
Q
 
K
E
 
G
K
 
D
N
 
D
I
 
V
I
x
Y
I
|
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
 
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
I
 
D
D
 
N
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
A
 
M
L
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
S
M
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
K
D
 
D
K
 
S
D
 
A
V
 
K
N
 
D
G
 
N
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
A
T
 
V
G
 
G
F
 
D
T
 
R
S
 
T
S
 
T
I
x
L
N
 
N
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
C
 
G
N
 
Y
I
 
I
I
 
Y
Q
 
D
L
 
E
S
 
L
N
 
N
R
 
L
K
 
I
V
 
H
E
 
H
V
 
I
I
 
K
H
 
Y
M
 
R
E
 
E
A
 
F
R
|
R
G
 
S
G
 
G
E
x
D
V
 
V
R
 
R
H
 
H
S
 
S
C
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
Q
 
I
E
 
D
K
 
L
L
 
L
G
 
K
Y
 
Y
Y
 
R
P
 
P
G
 
N
Y
 
I
S
 
K
L
 
I
E
 
R
R
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
R
E
 
L
T
 
S
Y
 
M
Q
 
P
W
 
W
W
 
Y

Q7BJX9 UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase; UDP-GalNAc 4-epimerase; EC 5.1.3.7 from Plesiomonas shigelloides (Aeromonas shigelloides) (see 2 papers)
36% identity, 99% coverage: 2:307/310 of query aligns to 20:339/345 of Q7BJX9

query
sites
Q7BJX9
K
 
K
R
 
T
Y
 
W
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
x
V
A
|
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
L
R
 
E
A
 
K
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
L
G
 
N
D
 
Q
S
 
V
V
 
V
V
 
I
I
 
G
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
x
F
D
x
S
S
x
T
G
|
G
N
 
H
L
 
Q
A
 
Y
N
 
N
I
 
L
T
 
D
D
 
E
L
 
V
Q
 
K
K
 
T
N
 
L
P
 
V
H
 
S
L
 
T
E
 
E
-
 
Q
-
 
W
-
 
S
-
 
R
-
 
F
-
 
C
F
 
F
I
 
I
E
 
E
D
 
G
T
x
D
I
|
I
L
 
R
N
 
D
K
 
L
T
 
T
R
 
T
L
 
C
L
 
E
S
 
Q
I
 
V
C
 
M
S
 
K
H
 
G
I
 
V
D
 
D
G
 
H
I
 
V
F
 
L
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
L
V
 
G
S
 
S
V
 
V
Q
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
I
D
 
V
D
 
D
P
 
P
E
 
I
L
 
T
N
 
T
H
 
N
S
 
A
I
x
T
N
 
N
V
 
I
D
 
T
G
 
G
M
 
F
F
 
L
N
 
N
V
 
I
L
 
L
E
 
H
S
 
A
A
 
A
R
 
K
K
 
N
E
 
A
K
 
Q
V
 
V
P
 
Q
K
 
S
I
 
F
V
 
T
F
 
Y
A
 
A
S
 
A
S
|
S
A
x
S
A
x
S
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
N
 
D
A
 
H
Y
 
P
V
 
A
P
 
L
P
 
P
H
 
K
K
 
V
E
 
E
S
 
E
F
 
N
P
 
I
P
 
G
I
 
N
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
Y
L
 
V
S
 
N
E
 
E
M
 
I
Y
 
Y
S
 
A
S
 
Q
V
 
V
Y
 
Y
S
 
A
S
 
R
L
 
T
Y
 
Y
G
 
G
I
 
F
G
 
K
C
 
T
V
 
I
C
 
G
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
|
F
N
|
N
V
|
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
R
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
N
S
 
G
P
 
A
Y
 
Y
S
 
A
G
 
A
V
|
V
I
|
I
S
x
P
K
|
K
F
 
W
L
 
T
E
 
A
A
 
A
V
 
M
T
 
L
Q
 
K
E
 
G
K
 
D
N
 
D
I
 
V
I
x
Y
I
|
I
F
x
N
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
 
T
T
x
S
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
C
Y
 
Y
V
 
I
I
 
D
D
 
N
V
 
V
V
 
I
Q
 
Q
A
 
M
L
 
N
L
 
I
L
 
L
S
 
S
M
 
A
-
 
L
-
 
A
-
 
K
D
 
D
K
 
S
D
 
A
V
 
K
N
 
D
G
 
N
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
A
T
 
V
G
 
G
F
 
D
T
x
R
S
 
T
S
 
T
I
 
L
N
 
N
Q
 
E
L
 
L
A
 
S
C
 
G
N
 
Y
I
 
I
I
 
Y
Q
 
D
L
 
E
S
 
L
N
 
N
-
 
L
-
 
I
-
 
H
-
 
H
-
 
I
R
 
D
K
 
K
V
 
L
E
 
S
V
 
I
I
 
K
H
 
Y
M
 
R
E
 
E
A
 
F
R
|
R
G
x
S
G
|
G
E
x
D
V
 
V
R
|
R
H
|
H
S
|
S
C
 
Q
A
 
A
D
 
D
I
 
V
T
 
T
Q
 
K
A
 
A
Q
 
I
E
 
D
K
 
L
L
 
L
G
 
K
Y
 
Y
Y
 
R
P
 
P
G
 
N
Y
 
I
S
 
K
L
 
I
E
 
R
R
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
R
E
 
L
T
 
S
Y
 
M
Q
 
P
W
 
W
W
 
Y

7ystA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chain b from mycobacterium tuberculosis
36% identity, 99% coverage: 3:308/310 of query aligns to 2:309/312 of 7ystA

query
sites
7ystA
R
 
R
Y
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
L
 
L
S
 
V
R
 
D
A
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
G
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
 
F
D
 
A
S
x
T
G
|
G
N
 
R
L
 
A
A
 
T
N
 
N
I
 
L
T
 
E
D
 
H
L
 
L
Q
 
A
K
 
D
N
 
N
P
 
S
H
 
A
L
 
H
E
 
V
F
 
F
I
 
V
E
 
E
D
 
A
T
x
D
I
|
I
L
 
V
N
 
T
K
 
A
T
 
D
R
 
L
L
 
H
L
 
A
S
 
I
I
 
L
C
 
E
S
 
Q
H
 
H
-
 
R
I
 
P
D
 
E
G
 
V
I
 
V
F
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
Q
V
x
I
S
 
D
V
 
V
Q
x
R
R
 
R
S
 
S
I
 
V
D
 
A
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
N
 
D
H
 
A
S
 
A
I
x
V
N
 
N
V
 
V
D
 
I
G
 
G
M
 
T
F
 
V
N
 
R
V
 
L
L
 
A
E
 
E
S
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
T
K
 
G
V
 
V
P
 
R
K
 
K
I
 
I
V
 
V
F
 
H
A
x
T
S
 
S
S
|
S
A
 
G
-
x
G
A
 
S
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
T
A
 
P
Y
 
P
V
 
E
P
 
Y
P
 
P
H
 
T
K
 
P
E
 
E
S
 
T
F
 
A
P
 
P
P
 
T
I
 
D
P
 
P
L
 
A
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
G
 
G
K
|
K
N
 
V
L
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
I
Y
 
Y
S
 
L
S
 
N
V
 
T
Y
 
F
S
 
R
S
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
D
C
 
C
V
 
S
C
 
H
L
 
I
R
 
A
F
x
P
F
x
A
N
|
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
H
S
 
G
P
 
-
Y
 
E
S
x
A
G
|
G
V
|
V
I
 
V
S
 
A
K
 
I
F
|
F
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
L
Q
 
S
E
 
G
K
 
K
N
 
P
I
 
T
I
x
R
I
x
V
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
 
N
T
 
T
R
|
R
D
 
-
F
 
D
V
 
Y
Y
 
V
V
 
F
I
 
V
D
 
D
V
 
D
V
 
V
Q
 
V
A
 
D
L
 
A
L
 
F
L
 
V
S
 
R
M
 
V
D
 
S
K
 
A
D
 
D
V
 
V
N
 
G
G
 
G
-
 
G
-
 
L
V
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
F
 
K
T
 
E
S
 
T
S
 
S
I
x
D
N
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
H
C
 
S
N
 
A
I
 
V
I
 
A
Q
 
A
L
 
A
S
 
V
N
 
G
R
 
G
K
 
P
V
 
D
E
 
D
V
 
P
I
 
E
H
 
F
M
 
H
E
 
P
A
 
P
R
|
R
G
 
L
G
 
G
E
 
D
V
 
L
R
 
K
H
 
R
S
 
S
C
 
C
A
 
L
D
 
D
I
 
I
T
 
G
Q
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
R
K
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
Y
 
R
P
 
P
G
 
Q
Y
 
I
S
 
E
L
 
L
E
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
F
 
R
E
 
R
T
 
T
Y
 
V
Q
 
E
W
 
Y
W
 
F
K
 
R

7ys9A Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) in complex with both udp-glucose and udp-galactose in chaina from mycobacterium tuberculosis
36% identity, 99% coverage: 3:308/310 of query aligns to 2:309/310 of 7ys9A

query
sites
7ys9A
R
 
R
Y
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
L
 
L
S
 
V
R
 
D
A
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
G
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
 
F
D
x
A
S
x
T
G
|
G
N
 
R
L
 
A
A
 
T
N
 
N
I
 
L
T
 
E
D
 
H
L
 
L
Q
 
A
K
 
D
N
 
N
P
 
S
H
 
A
L
 
H
E
 
V
F
 
F
I
 
V
E
 
E
D
 
A
T
x
D
I
|
I
L
 
V
N
 
T
K
 
A
T
 
D
R
 
L
L
 
H
L
 
A
S
 
I
I
 
L
C
 
E
S
 
Q
H
 
H
-
 
R
I
 
P
D
 
E
G
 
V
I
 
V
F
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
Q
V
x
I
S
 
D
V
 
V
Q
x
R
R
 
R
S
 
S
I
 
V
D
 
A
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
N
 
D
H
 
A
S
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
I
G
 
G
M
 
T
F
 
V
N
 
R
V
 
L
L
 
A
E
 
E
S
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
T
K
 
G
V
 
V
P
 
R
K
 
K
I
 
I
V
 
V
F
 
H
A
x
T
S
 
S
S
|
S
A
 
G
-
x
G
A
 
S
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
T
A
 
P
Y
 
P
V
 
E
P
 
Y
P
 
P
H
 
T
K
 
P
E
 
E
S
 
T
F
 
A
P
 
P
P
 
T
I
 
D
P
 
P
L
 
A
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
G
 
G
K
|
K
N
 
V
L
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
I
Y
 
Y
S
 
L
S
 
N
V
 
T
Y
 
F
S
 
R
S
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
D
C
 
C
V
 
S
C
 
H
L
 
I
R
 
A
F
x
P
F
x
A
N
|
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
H
S
 
G
P
 
-
Y
 
E
S
x
A
G
|
G
V
|
V
I
 
V
S
 
A
K
 
I
F
|
F
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
L
Q
 
S
E
 
G
K
 
K
N
 
P
I
 
T
I
x
R
I
 
V
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
x
N
T
 
T
R
|
R
D
 
-
F
 
D
V
 
Y
Y
 
V
V
 
F
I
 
V
D
 
D
V
 
D
V
 
V
Q
 
V
A
 
D
L
 
A
L
 
F
L
 
V
S
 
R
M
 
V
D
 
S
K
 
A
D
 
D
V
 
V
N
 
G
G
 
G
-
 
G
-
 
L
V
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
F
 
K
T
 
E
S
 
T
S
 
S
I
x
D
N
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
H
C
 
S
N
 
A
I
 
V
I
 
A
Q
 
A
L
 
A
S
 
V
N
 
G
R
 
G
K
 
P
V
 
D
E
 
D
V
 
P
I
 
E
H
 
F
M
 
H
E
 
P
A
 
P
R
|
R
G
 
L
G
 
G
E
 
D
V
 
L
R
 
K
H
 
R
S
 
S
C
 
C
A
 
L
D
 
D
I
 
I
T
 
G
Q
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
R
K
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
Y
 
R
P
 
P
G
 
Q
Y
 
I
S
 
E
L
 
L
E
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
F
 
R
E
 
R
T
 
T
Y
 
V
Q
 
E
W
 
Y
W
 
F
K
 
R

7ysmA Crystal structure of udp-glucose 4-epimerase (rv3634c) co-crystallized with udp-n-acetylglucosamine from mycobacterium tuberculosis
36% identity, 99% coverage: 3:308/310 of query aligns to 2:309/311 of 7ysmA

query
sites
7ysmA
R
 
R
Y
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
T
L
 
L
S
 
V
R
 
D
A
 
R
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
D
G
 
G
D
 
H
S
 
S
V
 
V
V
 
V
I
 
G
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
 
F
D
 
A
S
x
T
G
|
G
N
 
R
L
 
A
A
 
T
N
 
N
I
 
L
T
 
E
D
 
H
L
 
L
Q
 
A
K
 
D
N
 
N
P
 
S
H
 
A
L
 
H
E
 
V
F
 
F
I
 
V
E
 
E
D
 
A
T
x
D
I
|
I
L
 
V
N
 
T
K
 
A
T
 
D
R
 
L
L
 
H
L
 
A
S
 
I
I
 
L
C
 
E
S
 
Q
H
 
H
-
 
R
I
 
P
D
 
E
G
 
V
I
 
V
F
 
F
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
Q
V
x
I
S
 
D
V
 
V
Q
x
R
R
 
R
S
 
S
I
 
V
D
 
A
D
 
D
P
 
P
E
 
Q
L
 
F
N
 
D
H
 
A
S
 
A
I
 
V
N
 
N
V
 
V
D
 
I
G
 
G
M
 
T
F
 
V
N
 
R
V
 
L
L
 
A
E
 
E
S
 
A
A
 
A
R
 
R
K
 
Q
E
 
T
K
 
G
V
 
V
P
 
R
K
 
K
I
 
I
V
 
V
F
 
H
A
x
T
S
 
S
S
|
S
A
 
G
-
x
G
A
x
S
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
T
A
 
P
Y
 
P
V
 
E
P
 
Y
P
 
P
H
 
T
K
 
P
E
 
E
S
 
T
F
 
A
P
 
P
P
 
T
I
 
D
P
 
P
L
 
A
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
G
 
G
K
|
K
N
 
V
L
 
A
S
 
G
E
 
E
M
 
I
Y
 
Y
S
 
L
S
 
N
V
 
T
Y
 
F
S
 
R
S
 
H
L
 
L
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
D
C
 
C
V
 
S
C
 
H
L
 
I
R
 
A
F
x
P
F
x
A
N
|
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
 
H
S
 
G
P
 
-
Y
 
E
S
 
A
G
|
G
V
|
V
I
 
V
S
 
A
K
 
I
F
|
F
L
 
A
E
 
Q
A
 
A
V
 
L
T
 
L
Q
 
S
E
 
G
K
 
K
N
 
P
I
 
T
I
x
R
I
x
V
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
x
N
T
 
T
R
|
R
D
 
-
F
 
D
V
 
Y
Y
 
V
V
 
F
I
 
V
D
 
D
V
 
D
V
 
V
Q
 
V
A
 
D
L
 
A
L
 
F
L
 
V
S
 
R
M
 
V
D
 
S
K
 
A
D
 
D
V
 
V
N
 
G
G
 
G
-
 
G
-
 
L
V
 
R
F
 
F
N
 
N
V
 
I
G
 
G
T
 
T
G
 
G
F
 
K
T
 
E
S
 
T
S
 
S
I
x
D
N
 
R
Q
 
Q
L
 
L
A
 
H
C
 
S
N
 
A
I
 
V
I
 
A
Q
 
A
L
 
A
S
 
V
N
 
G
R
 
G
K
 
P
V
 
D
E
 
D
V
 
P
I
 
E
H
 
F
M
 
H
E
 
P
A
 
P
R
|
R
G
 
L
G
 
G
E
 
D
V
 
L
R
 
K
H
 
R
S
 
S
C
 
C
A
 
L
D
 
D
I
 
I
T
 
G
Q
 
L
A
 
A
Q
 
E
E
 
R
K
 
V
L
 
L
G
 
G
Y
 
W
Y
 
R
P
 
P
G
 
Q
Y
 
I
S
 
E
L
 
L
E
 
A
R
 
D
G
 
G
L
 
V
F
 
R
E
 
R
T
 
T
Y
 
V
Q
 
E
W
 
Y
W
 
F
K
 
R

3vpsA Structure of a novel NAD dependent-ndp-hexosamine 5,6-dehydratase, tuna, involved in tunicamycin biosynthesis
34% identity, 99% coverage: 3:308/310 of query aligns to 3:297/303 of 3vpsA

query
sites
3vpsA
R
 
R
Y
 
I
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
G
H
 
H
L
 
L
S
 
A
R
 
R
A
 
A
L
 
L
L
 
V
A
 
A
R
 
S
G
 
G
D
 
E
S
 
E
V
 
V
V
 
T
I
 
V
F
 
L
D
|
D
S
x
D
L
 
L
D
x
R
S
x
V
G
 
P
N
 
P
L
 
M
-
 
I
-
 
P
-
 
P
A
 
E
N
 
G
I
 
T
T
 
G
D
 
K
L
 
F
Q
 
L
K
 
E
N
 
K
P
|
P
H
x
V
L
 
L
E
 
E
F
 
-
I
 
L
E
 
E
D
 
E
T
 
R
I
 
D
L
 
L
N
 
S
K
 
D
T
 
V
R
 
R
L
 
L
L
 
-
S
 
-
I
 
-
C
 
-
S
 
-
H
 
-
I
 
-
D
 
-
G
 
-
I
 
V
F
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
x
S
L
 
H
V
x
K
S
 
S
V
 
V
Q
 
P
R
 
R
S
 
S
I
 
F
D
 
K
D
 
Q
P
 
P
E
 
-
L
 
L
N
 
D
H
 
Y
S
 
L
I
 
D
N
 
N
V
 
V
D
 
D
G
 
S
M
 
G
F
 
R
N
 
H
V
 
L
L
 
L
E
 
A
S
 
L
A
 
C
R
 
T
K
 
S
E
 
V
K
 
G
V
 
V
P
 
P
K
 
K
I
 
V
V
 
V
F
 
V
A
 
G
S
 
S
S
x
T
A
x
C
A
x
E
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
Q
A
 
A
Y
 
D
V
 
T
P
 
L
P
 
P
H
 
T
K
 
P
E
 
E
S
 
D
F
 
S
P
 
P
P
 
L
I
 
S
P
 
P
L
 
R
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
G
 
S
K
|
K
N
 
V
L
 
G
S
 
L
E
 
E
M
 
M
Y
 
V
S
 
A
S
 
G
V
 
A
Y
 
H
-
 
Q
-
 
R
-
 
A
S
 
S
S
 
V
L
 
A
Y
 
P
G
 
E
I
 
V
G
 
G
C
 
I
V
 
V
C
 
-
L
 
-
R
 
R
F
|
F
F
 
F
N
|
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
G
Q
 
E
D
 
R
P
 
P
S
x
D
S
x
A
P
 
-
Y
 
-
S
 
-
G
 
-
V
x
L
I
 
V
S
 
P
K
x
R
F
 
L
L
 
C
E
 
A
A
 
N
V
 
L
T
 
L
Q
 
T
E
 
R
K
 
N
N
 
E
I
 
L
I
x
P
I
x
V
F
x
E
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
E
Q
|
Q
T
 
R
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
T
Y
 
Y
V
 
I
I
 
T
D
 
D
V
 
V
V
 
V
Q
 
D
A
 
K
L
 
L
L
 
V
L
 
A
S
 
L
M
 
A
D
 
N
K
 
R
D
 
P
V
 
L
N
 
P
G
 
S
V
 
V
F
 
V
N
 
N
V
 
F
G
 
G
T
 
S
G
 
G
F
 
Q
T
 
S
S
 
L
S
 
S
I
x
V
N
 
N
Q
 
D
L
 
V
A
 
-
C
 
I
N
 
R
I
 
I
I
 
L
Q
 
Q
L
 
A
S
 
T
N
 
S
R
 
P
K
 
A
V
 
A
E
 
E
V
 
V
I
 
A
H
 
R
M
 
K
E
 
Q
A
 
P
R
|
R
G
 
P
G
 
N
E
|
E
V
 
I
R
 
T
H
 
E
S
 
F
C
 
R
A
 
A
D
 
D
I
 
T
T
 
A
Q
 
L
A
 
Q
Q
 
T
E
 
R
K
 
Q
L
 
I
G
 
G
Y
 
E
Y
 
R
P
 
S
-
 
G
G
 
G
Y
 
I
S
 
G
L
 
I
E
 
E
R
 
E
G
 
G
L
 
I
F
 
R
E
 
L
T
 
T
Y
 
L
Q
 
E
W
 
W
W
 
W
K
 
Q

6zllA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-galacturonic acid and NAD (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:308/310 of query aligns to 2:311/321 of 6zllA

query
sites
6zllA
R
 
K
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
S
 
C
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
N
G
 
S
D
 
A
-
 
Y
S
 
H
V
 
V
V
 
V
I
 
G
F
 
I
D
|
D
-
x
H
-
x
F
-
x
I
-
 
G
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
A
S
 
T
L
 
L
D
x
K
S
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
I
T
 
Q
D
 
S
L
 
L
Q
 
E
K
 
L
N
 
N
P
 
S
H
 
R
L
 
F
E
 
Q
F
 
F
I
 
I
E
 
R
D
 
E
T
x
D
I
|
I
L
 
L
N
 
N
K
 
-
T
 
T
R
 
D
L
 
L
L
 
S
S
 
K
I
 
L
C
 
L
S
 
Q
H
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
V
I
 
V
F
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
I
V
x
P
S
 
G
V
|
V
Q
x
R
R
 
T
S
 
S
I
 
W
D
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
F
D
 
Q
P
 
P
E
 
Y
L
 
V
N
 
T
H
 
N
S
 
N
I
 
I
N
 
M
V
 
V
D
 
T
G
 
Q
M
 
-
F
 
-
N
 
Q
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
A
 
C
R
 
K
K
 
H
E
 
I
K
 
K
V
 
L
P
 
D
K
 
K
I
 
F
V
 
I
F
 
H
A
x
I
S
 
S
S
x
T
A
x
S
A
x
S
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
A
 
K
Y
 
-
V
 
S
P
 
G
P
 
A
H
 
V
K
 
S
E
 
E
S
 
D
F
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
G
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
L
L
 
S
S
 
G
E
 
E
M
 
H
Y
 
L
S
 
C
S
 
H
V
 
V
Y
 
Y
S
 
H
S
 
K
L
 
N
Y
 
F
G
 
H
I
 
I
G
 
P
C
 
I
V
 
V
C
 
I
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
x
R
P
 
P
S
 
D
S
x
M
P
x
A
Y
 
F
S
 
H
G
x
R
V
 
L
I
 
I
S
 
K
K
 
Q
F
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
E
 
D
K
 
K
N
 
P
I
 
L
I
x
T
I
 
I
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
|
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
T
Y
 
Y
V
 
I
I
 
D
D
 
D
V
 
C
V
 
I
Q
 
R
A
 
G
L
 
T
L
 
V
L
 
A
S
 
A
M
 
L
D
 
E
K
 
T
D
 
K
V
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
G
G
 
E
V
 
V
F
 
I
N
 
N
V
 
I
G
 
G
T
 
G
G
 
K
F
 
E
T
 
Q
S
 
A
S
 
S
I
|
I
N
 
L
Q
 
D
L
 
I
A
 
I
C
 
S
N
 
M
I
 
L
I
 
E
Q
 
K
L
 
I
S
 
S
N
 
G
R
 
K
K
 
S
V
 
A
E
 
T
V
 
K
I
 
N
H
 
F
M
 
L
E
 
K
A
 
S
R
 
V
G
 
P
G
 
G
E
|
E
V
 
P
R
 
K
H
 
Q
S
 
T
C
 
W
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
S
Q
 
K
A
 
A
Q
 
S
E
 
T
K
 
L
L
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
Y
 
S
P
 
P
G
 
T
Y
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
S
R
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
E
E
 
A
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
D
W
 
Y
W
 
I
K
 
K

6zldA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp-glucuronic acid and NAD (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:308/310 of query aligns to 2:311/314 of 6zldA

query
sites
6zldA
R
 
K
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
S
 
C
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
N
G
 
S
D
 
A
-
 
Y
S
 
H
V
 
V
V
 
V
I
 
G
F
 
I
D
|
D
-
x
H
-
x
F
-
x
I
-
 
G
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
A
S
 
T
L
 
L
D
x
K
S
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
I
T
 
Q
D
 
S
L
 
L
Q
 
E
K
 
L
N
 
N
P
 
S
H
 
R
L
 
F
E
 
Q
F
 
F
I
 
I
E
 
R
D
 
E
T
x
D
I
|
I
L
 
L
N
 
N
K
 
-
T
 
T
R
 
D
L
 
L
L
 
S
S
 
K
I
 
L
C
 
L
S
 
Q
H
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
V
I
 
V
F
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
I
V
x
P
S
 
G
V
 
V
Q
x
R
R
 
T
S
 
S
I
 
W
D
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
F
D
 
Q
P
 
P
E
 
Y
L
 
V
N
 
T
H
 
N
S
 
N
I
 
I
N
 
M
V
 
V
D
 
T
G
 
Q
M
 
-
F
 
-
N
 
Q
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
A
 
C
R
 
K
K
 
H
E
 
I
K
 
K
V
 
L
P
 
D
K
 
K
I
 
F
V
 
I
F
 
H
A
x
I
S
 
S
S
x
T
A
x
S
A
x
S
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
A
 
K
Y
 
-
V
 
S
P
 
G
P
 
A
H
 
V
K
 
S
E
 
E
S
 
D
F
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
G
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
L
L
 
S
S
 
G
E
 
E
M
 
H
Y
 
L
S
 
C
S
 
H
V
 
V
Y
 
Y
S
 
H
S
 
K
L
 
N
Y
 
F
G
 
H
I
 
I
G
 
P
C
 
I
V
 
V
C
 
I
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
|
F
N
x
T
V
 
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
x
R
P
 
P
S
 
D
S
x
M
P
x
A
Y
 
F
S
 
H
G
x
R
V
 
L
I
 
I
S
 
K
K
 
Q
F
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
E
 
D
K
 
K
N
 
P
I
 
L
I
x
T
I
 
I
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
|
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
T
Y
 
Y
V
 
I
I
 
D
D
 
D
V
 
C
V
 
I
Q
 
R
A
 
G
L
 
T
L
 
V
L
 
A
S
 
A
M
 
L
D
 
E
K
 
T
D
 
K
V
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
G
G
 
E
V
 
V
F
 
I
N
 
N
V
 
I
G
 
G
T
 
G
G
 
K
F
 
E
T
 
Q
S
 
A
S
 
S
I
|
I
N
 
L
Q
 
D
L
 
I
A
 
I
C
 
S
N
 
M
I
 
L
I
 
E
Q
 
K
L
 
I
S
 
S
N
 
G
R
 
K
K
 
S
V
 
A
E
 
T
V
 
K
I
 
N
H
 
F
M
 
L
E
 
K
A
 
S
R
 
V
G
 
P
G
 
G
E
|
E
V
 
P
R
 
K
H
 
Q
S
 
T
C
 
W
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
S
Q
 
K
A
 
A
Q
 
S
E
 
T
K
 
L
L
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
Y
 
S
P
 
P
G
 
T
Y
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
S
R
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
E
E
 
A
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
D
W
 
Y
W
 
I
K
 
K

6zl6A Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase from bacillus cereus in complex with udp and NAD (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:308/310 of query aligns to 2:311/314 of 6zl6A

query
sites
6zl6A
R
 
K
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
S
 
C
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
N
G
 
S
D
 
A
-
 
Y
S
 
H
V
 
V
V
 
V
I
 
G
F
 
I
D
|
D
-
x
H
-
x
F
-
x
I
-
 
G
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
A
S
 
T
L
 
L
D
x
K
S
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
I
T
 
Q
D
 
S
L
 
L
Q
 
E
K
 
L
N
 
N
P
 
S
H
 
R
L
 
F
E
 
Q
F
 
F
I
 
I
E
 
R
D
 
E
T
x
D
I
|
I
L
 
L
N
 
N
K
 
-
T
 
T
R
 
D
L
 
L
L
 
S
S
 
K
I
 
L
C
 
L
S
 
Q
H
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
V
I
 
V
F
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
I
V
 
P
S
 
G
V
 
V
Q
 
R
R
 
T
S
 
S
I
 
W
D
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
F
D
 
Q
P
 
P
E
 
Y
L
 
V
N
 
T
H
 
N
S
 
N
I
 
I
N
 
M
V
 
V
D
 
T
G
 
Q
M
 
-
F
 
-
N
 
Q
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
A
 
C
R
 
K
K
 
H
E
 
I
K
 
K
V
 
L
P
 
D
K
 
K
I
 
F
V
 
I
F
 
H
A
x
I
S
 
S
S
x
T
A
x
S
A
x
S
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
A
 
K
Y
 
-
V
 
S
P
 
G
P
 
A
H
 
V
K
 
S
E
 
E
S
 
D
F
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
G
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
L
L
 
S
S
 
G
E
 
E
M
 
H
Y
 
L
S
 
C
S
 
H
V
 
V
Y
 
Y
S
 
H
S
 
K
L
 
N
Y
 
F
G
 
H
I
 
I
G
 
P
C
 
I
V
 
V
C
 
I
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
 
F
N
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
x
R
P
 
P
S
 
D
S
x
M
P
x
A
Y
 
F
S
 
H
G
x
R
V
 
L
I
 
I
S
 
K
K
 
Q
F
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
E
 
D
K
 
K
N
 
P
I
 
L
I
x
T
I
 
I
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
|
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
T
Y
 
Y
V
 
I
I
 
D
D
 
D
V
 
C
V
 
I
Q
 
R
A
 
G
L
 
T
L
 
V
L
 
A
S
 
A
M
 
L
D
 
E
K
 
T
D
 
K
V
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
G
G
 
E
V
 
V
F
 
I
N
 
N
V
 
I
G
 
G
T
 
G
G
 
K
F
 
E
T
 
Q
S
 
A
S
 
S
I
|
I
N
 
L
Q
 
D
L
 
I
A
 
I
C
 
S
N
 
M
I
 
L
I
 
E
Q
 
K
L
 
I
S
 
S
N
 
G
R
 
K
K
 
S
V
 
A
E
 
T
V
 
K
I
 
N
H
 
F
M
 
L
E
 
K
A
 
S
R
 
V
G
 
P
G
 
G
E
|
E
V
 
P
R
 
K
H
 
Q
S
 
T
C
 
W
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
S
Q
 
K
A
 
A
Q
 
S
E
 
T
K
 
L
L
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
Y
 
S
P
 
P
G
 
T
Y
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
S
R
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
E
E
 
A
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
D
W
 
Y
W
 
I
K
 
K

2p5uA Crystal structure of thermus thermophilus hb8 udp-glucose 4-epimerase complex with NAD
34% identity, 99% coverage: 3:310/310 of query aligns to 2:310/311 of 2p5uA

query
sites
2p5uA
R
 
R
Y
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
I
S
 
V
R
 
E
A
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
A
R
 
R
G
 
G
D
 
L
S
 
E
V
 
V
V
 
A
I
 
V
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
|
L
D
x
A
S
x
T
G
|
G
N
 
K
L
 
R
A
 
E
N
 
N
I
 
V
T
 
P
D
 
K
L
 
G
Q
 
V
K
 
P
N
 
F
P
 
F
H
 
R
L
 
V
E
x
D
F
x
L
I
 
R
E
 
D
D
 
K
T
 
E
I
 
G
L
 
V
N
 
E
K
 
R
T
 
A
R
 
F
L
 
R
L
 
E
S
 
F
I
 
R
C
 
P
S
 
T
H
 
H
I
 
V
D
 
S
G
 
-
I
 
-
F
 
-
H
 
H
L
x
Q
A
|
A
A
|
A
L
 
Q
V
x
A
S
 
S
V
 
V
Q
 
K
R
 
V
S
 
S
I
 
V
D
 
E
D
 
D
P
 
P
E
 
V
L
 
L
N
 
D
H
 
F
S
 
E
I
 
V
N
 
N
V
 
L
D
 
L
G
 
G
M
 
G
F
 
L
N
 
N
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
A
 
C
R
 
R
K
 
Q
E
 
Y
K
 
G
V
 
V
P
 
E
K
 
K
I
 
L
V
 
V
F
 
F
A
 
A
S
|
S
S
x
T
A
 
G
-
x
G
A
|
A
L
 
I
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
A
 
-
Y
 
-
V
 
V
P
 
P
P
 
E
-
 
G
-
 
E
-
 
R
H
 
A
K
 
E
E
 
E
S
 
T
F
 
W
P
 
P
P
 
P
I
 
R
P
 
P
L
 
K
S
 
S
P
 
P
Y
|
Y
A
 
A
V
 
A
G
 
S
K
|
K
N
 
A
L
 
A
S
 
F
E
 
E
M
 
H
Y
 
Y
S
 
L
S
 
S
V
 
V
Y
 
Y
S
 
G
S
 
Q
L
 
S
Y
 
Y
G
 
G
I
 
L
G
 
K
C
 
W
V
 
V
C
 
S
L
 
L
R
 
R
F
 
Y
F
 
G
N
 
N
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
 
D
P
 
P
S
x
H
S
 
G
P
 
-
Y
 
E
S
 
A
G
|
G
V
 
V
I
 
V
S
 
A
K
 
I
F
 
F
L
 
A
E
 
E
A
 
R
V
 
V
T
 
L
Q
 
K
E
 
G
K
 
L
N
 
P
I
 
V
I
 
T
I
 
L
F
 
Y
-
 
A
-
 
R
-
 
K
-
 
T
-
 
P
G
 
G
D
 
D
G
 
E
E
 
G
Q
 
C
T
 
V
R
 
R
D
 
D
F
 
Y
V
 
V
Y
 
Y
V
 
V
I
 
G
D
 
D
V
 
V
V
 
A
Q
 
E
A
 
A
L
 
H
L
 
A
L
 
L
S
 
A
M
 
L
D
 
-
K
 
F
D
 
S
V
 
L
N
 
E
G
 
G
V
 
I
F
 
Y
N
 
N
V
 
V
G
 
G
T
 
T
G
 
G
F
 
E
T
 
G
S
 
H
S
 
T
I
 
T
N
 
R
Q
 
E
L
 
V
A
 
L
C
 
M
N
 
A
I
 
V
I
 
A
Q
 
E
L
 
A
S
 
A
N
 
G
R
 
K
K
 
A
V
 
P
E
 
E
V
 
V
I
 
Q
H
 
P
M
 
A
E
 
P
A
 
P
R
 
R
G
 
P
G
 
G
E
 
D
V
 
L
R
 
E
H
 
R
S
 
S
C
 
V
A
 
L
D
 
S
I
 
P
T
 
L
Q
 
K
A
 
L
Q
 
M
E
 
A
K
 
H
L
 
-
G
 
G
Y
 
W
Y
 
R
P
 
P
G
 
K
Y
 
V
S
 
G
L
 
F
E
 
Q
R
 
E
G
 
G
L
 
I
F
 
R
E
 
L
T
 
T
Y
 
V
Q
 
D
W
 
H
W
 
F
K
 
R
G
 
G
T
 
A

6zljA Crystal structure of udp-glucuronic acid 4-epimerase y149f mutant from bacillus cereus in complex with udp-4-deoxy-4-fluoro-glucuronic acid and NAD (see paper)
34% identity, 99% coverage: 3:308/310 of query aligns to 2:311/314 of 6zljA

query
sites
6zljA
R
 
K
Y
 
I
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
A
 
A
G
|
G
F
|
F
I
|
I
G
 
G
S
 
S
H
 
H
L
 
L
S
 
C
R
 
Q
A
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
K
R
 
N
G
 
S
D
 
A
-
 
Y
S
 
H
V
 
V
V
 
V
I
 
G
F
 
I
D
|
D
-
x
H
-
x
F
-
x
I
-
 
G
-
 
P
-
 
T
-
 
P
-
 
A
S
 
T
L
 
L
D
x
K
S
 
T
G
 
G
N
 
N
L
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
I
T
 
Q
D
 
S
L
 
L
Q
 
E
K
 
L
N
 
N
P
 
S
H
 
R
L
 
F
E
 
Q
F
 
F
I
 
I
E
 
R
D
 
E
T
x
D
I
|
I
L
 
L
N
 
N
K
 
-
T
 
T
R
 
D
L
 
L
L
 
S
S
 
K
I
 
L
C
 
L
S
 
Q
H
 
D
I
 
I
D
 
D
G
 
V
I
 
V
F
 
Y
H
 
H
L
|
L
A
|
A
A
|
A
L
 
I
V
x
P
S
 
G
V
 
V
Q
x
R
R
 
T
S
 
S
I
 
W
D
 
G
-
 
K
-
 
D
-
 
F
D
 
Q
P
 
P
E
 
Y
L
 
V
N
 
T
H
 
N
S
 
N
I
 
I
N
 
M
V
 
V
D
 
T
G
 
Q
M
 
-
F
 
-
N
 
Q
V
 
L
L
 
L
E
 
E
S
 
A
A
 
C
R
 
K
K
 
H
E
 
I
K
 
K
V
 
L
P
 
D
K
 
K
I
 
F
V
 
I
F
 
H
A
x
I
S
 
S
S
x
T
A
x
S
A
x
S
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
E
A
 
K
Y
 
S
V
 
-
P
 
G
P
 
A
H
 
V
K
 
S
E
 
E
S
 
D
F
 
L
P
 
L
P
 
P
I
 
I
P
 
P
L
 
L
S
 
S
P
 
P
Y
x
F
A
 
G
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
L
L
 
S
S
 
G
E
 
E
M
 
H
Y
 
L
S
 
C
S
 
H
V
 
V
Y
 
Y
S
 
H
S
 
K
L
 
N
Y
 
F
G
 
H
I
 
I
G
 
P
C
 
I
V
 
V
C
 
I
L
 
L
R
 
R
F
x
Y
F
|
F
N
x
T
V
|
V
Y
 
Y
G
 
G
P
 
P
Y
 
R
Q
 
Q
D
x
R
P
 
P
S
 
D
S
x
M
P
x
A
Y
 
F
S
 
H
G
x
R
V
 
L
I
 
I
S
 
K
K
 
Q
F
 
M
L
 
L
E
 
E
A
 
-
V
 
-
T
 
-
Q
 
-
E
 
D
K
 
K
N
 
P
I
 
L
I
x
T
I
 
I
F
|
F
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
T
Q
|
Q
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
F
V
 
T
Y
 
Y
V
 
I
I
 
D
D
 
D
V
 
C
V
 
I
Q
 
R
A
 
G
L
 
T
L
 
V
L
 
A
S
 
A
M
 
L
D
 
E
K
 
T
D
 
K
V
 
K
N
 
N
-
 
I
-
 
I
-
 
G
G
 
E
V
 
V
F
 
I
N
 
N
V
 
I
G
 
G
T
 
G
G
 
K
F
 
E
T
 
Q
S
 
A
S
 
S
I
|
I
N
 
L
Q
 
D
L
 
I
A
 
I
C
 
S
N
 
M
I
 
L
I
 
E
Q
 
K
L
 
I
S
 
S
N
 
G
R
 
K
K
 
S
V
 
A
E
 
T
V
 
K
I
 
N
H
 
F
M
 
L
E
 
K
A
 
S
R
 
V
G
 
P
G
 
G
E
|
E
V
 
P
R
 
K
H
 
Q
S
 
T
C
 
W
A
 
A
D
 
D
I
 
I
T
 
S
Q
 
K
A
 
A
Q
 
S
E
 
T
K
 
L
L
 
L
G
 
Q
Y
 
Y
Y
 
S
P
 
P
G
 
T
Y
 
V
S
 
S
L
 
L
E
 
S
R
 
D
G
 
G
L
 
L
F
 
E
E
 
A
T
 
E
Y
 
Y
Q
 
D
W
 
Y
W
 
I
K
 
K

6pmhA Structure of epimerase mth375 from the thermophilic pseudomurein- containing methanogen methanothermobacter thermautotrophicus
33% identity, 97% coverage: 5:306/310 of query aligns to 13:316/330 of 6pmhA

query
sites
6pmhA
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
A
 
A
G
|
G
F
 
C
I
 
V
G
 
G
S
 
S
H
 
N
L
 
L
S
 
T
R
 
G
A
 
N
L
 
L
L
 
A
A
 
K
R
 
A
G
 
G
D
 
A
S
 
N
V
 
V
V
 
I
I
 
I
F
 
L
D
|
D
S
x
N
L
 
L
D
x
S
S
|
S
G
x
S
N
 
Y
L
 
E
A
 
W
N
 
N
I
 
I
T
 
P
D
 
E
L
 
Y
Q
 
E
K
 
-
N
 
-
P
 
-
H
 
N
L
 
I
E
 
E
F
 
F
I
 
V
E
 
K
D
 
G
T
x
D
I
|
I
L
 
L
N
 
D
K
 
D
T
 
E
R
 
V
L
 
L
L
 
K
S
 
R
I
 
V
C
 
F
S
 
K
H
 
E
I
 
R
-
 
P
D
 
D
G
 
Y
I
 
V
F
 
F
H
 
H
L
 
L
A
|
A
A
 
A
L
 
H
V
x
F
S
 
A
V
 
N
Q
 
Q
R
 
N
S
 
S
I
 
V
D
 
D
D
 
N
P
 
P
E
 
E
L
 
K
N
 
D
H
 
L
S
 
L
I
 
V
N
 
N
V
 
G
D
 
L
G
 
G
M
 
I
F
 
L
N
 
K
V
 
V
L
 
L
E
 
E
S
 
Y
A
 
A
R
 
Q
K
 
L
E
 
V
K
 
G
V
 
V
P
 
E
K
 
R
I
 
F
V
 
V
F
 
Y
A
 
S
S
 
S
S
|
S
A
 
G
-
x
C
A
x
G
L
 
V
Y
 
Y
G
 
G
N
 
L
A
 
D
Y
 
S
V
 
K
P
 
I
P
 
P
H
 
F
K
 
E
E
 
E
S
 
H
F
 
D
P
 
I
P
 
S
I
 
I
P
 
S
L
 
L
-
 
H
S
 
T
P
 
P
Y
|
Y
A
 
Q
V
 
V
G
 
T
K
|
K
N
 
L
L
 
L
S
 
G
E
 
E
M
 
L
Y
 
Y
S
 
T
S
 
N
V
 
Y
Y
 
F
S
 
H
S
 
N
L
 
L
Y
 
Y
G
 
E
I
 
M
G
 
P
C
 
I
V
 
V
C
 
N
L
 
A
R
 
R
F
 
F
F
 
F
N
|
N
V
 
V
Y
 
F
G
 
G
P
 
P
Y
 
G
Q
 
E
D
 
V
P
 
P
S
 
G
S
 
K
P
 
-
Y
 
Y
S
x
R
G
x
N
V
|
V
I
 
I
S
 
P
K
 
N
F
|
F
L
 
F
E
 
Y
A
 
W
V
 
A
T
 
M
Q
 
N
E
 
Q
K
 
Q
N
 
P
I
 
L
I
x
P
I
|
I
F
x
T
G
 
G
D
 
D
G
 
G
E
 
S
Q
 
E
T
 
T
R
|
R
D
 
D
F
 
W
V
 
T
Y
 
F
V
 
V
I
 
E
D
 
D
V
 
I
V
 
V
Q
 
R
A
 
G
L
 
L
L
 
M
-
 
A
L
 
M
S
 
G
M
 
V
D
 
R
K
 
R
D
 
E
V
 
A
N
 
I
G
 
G
-
 
E
V
 
A
F
 
I
N
 
N
V
 
L
G
 
G
T
 
S
G
 
G
F
 
T
T
 
E
S
 
H
S
 
Q
I
x
V
N
 
I
Q
 
E
L
 
M
A
 
A
C
 
G
N
 
I
I
 
I
I
 
N
Q
 
E
L
 
L
S
 
T
N
 
E
R
 
N
K
 
P
V
 
A
E
 
G
V
 
V
I
 
V
H
 
Y
M
 
R
E
 
P
A
 
R
R
|
R
G
 
D
G
 
W
E
 
D
V
 
A
R
 
K
H
 
T
S
 
R
-
 
L
C
 
L
A
 
S
D
 
S
I
 
I
T
 
D
Q
 
K
A
 
A
Q
 
R
E
 
R
K
 
L
L
 
L
G
 
D
Y
 
Y
Y
 
E
P
 
P
G
 
Q
Y
 
V
S
 
S
L
 
F
E
 
R
R
 
E
G
 
G
L
 
L
F
 
E
E
 
R
T
 
T
Y
 
H
Q
 
R
W
 
W

Query Sequence

>WP_109970219.1 NCBI__GCF_003173355.1:WP_109970219.1
MKRYLVTGGAGFIGSHLSRALLARGDSVVIFDSLDSGNLANITDLQKNPHLEFIEDTILN
KTRLLSICSHIDGIFHLAALVSVQRSIDDPELNHSINVDGMFNVLESARKEKVPKIVFAS
SAALYGNAYVPPHKESFPPIPLSPYAVGKNLSEMYSSVYSSLYGIGCVCLRFFNVYGPYQ
DPSSPYSGVISKFLEAVTQEKNIIIFGDGEQTRDFVYVIDVVQALLLSMDKDVNGVFNVG
TGFTSSINQLACNIIQLSNRKVEVIHMEARGGEVRHSCADITQAQEKLGYYPGYSLERGL
FETYQWWKGT

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory