SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_110205229.1 NCBI__GCF_003194585.1:WP_110205229.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

1iunB Meta-cleavage product hydrolase from pseudomonas fluorescens ip01 (cumd) s103a mutant hexagonal (see paper)
28% identity, 82% coverage: 19:283/323 of query aligns to 18:275/276 of 1iunB

query
sites
1iunB
Y
 
Y
V
 
H
K
 
D
V
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
L
x
S
G
|
G
-
 
P
-
x
G
-
 
V
C
 
S
N
 
A
H
 
Y
S
 
A
T
 
N
W
 
W
A
 
R
P
 
L
V
 
T
I
 
I
E
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
K
R
 
F
H
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
E
 
F
S
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
R
 
E
A
 
N
-
 
Y
D
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
A
 
D
A
 
S
Y
 
W
A
 
V
N
 
D
G
 
H
M
 
I
R
 
I
D
 
G
L
 
I
L
 
M
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
K
A
 
A
T
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
I
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Y
 
L
Q
 
R
F
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
T
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
T
G
 
R
P
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
P
 
E
L
 
G
I
 
L
R
 
N
A
 
A
I
x
V
-
 
W
-
 
G
T
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
S
I
 
I
Q
 
E
P
 
N
L
 
M
L
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
I
P
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
F
A
 
A
A
 
Y
L
 
D
R
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
V
N
 
T
K
 
D
S
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
D
 
Y
L
 
E
D
 
A
E
 
S
I
 
I
A
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
D
 
S
I
x
F
V
 
S
D
 
S
S
 
M
F
 
F
A
 
P
D
 
E
P
 
P
R
 
R
T
 
Q
R
 
R
T
 
W
A
 
-
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
D
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
-
V
 
-
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
S
R
 
S
A
 
D
Y
 
E
L
 
D
V
 
I
E
 
K
G
 
T
L
 
L
P
 
P
-
 
N
-
 
E
I
 
T
C
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
|
D
L
 
Q
V
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
L
R
 
S
H
 
S
A
 
S
N
 
L
I
 
R
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
D
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
x
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
R
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
x
W
P
 
T
H
 
Q
R
 
I
D
 
E
H
 
Q
P
 
T
E
 
D
R
|
R
F
 
F
A
 
N
K
 
R
V
 
L
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
F
-
 
N
-
 
E
A
 
A
S
 
N
T
 
T
P
 
P

2d0dA Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) a129v mutant (see paper)
28% identity, 80% coverage: 19:278/323 of query aligns to 17:267/271 of 2d0dA

query
sites
2d0dA
Y
 
Y
V
 
H
K
 
D
V
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
L
x
S
G
|
G
-
 
P
-
x
G
-
 
V
C
 
S
N
 
A
H
 
Y
S
 
A
T
 
N
W
 
W
A
 
R
P
 
L
V
 
T
I
 
I
E
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
K
R
 
F
H
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
E
 
F
S
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
R
 
E
A
 
N
-
 
Y
D
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
A
 
D
A
 
S
Y
 
W
A
 
V
N
 
D
G
 
H
M
 
I
R
 
I
D
 
G
L
 
I
L
 
M
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
K
A
 
A
T
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
x
N
S
|
S
L
x
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
I
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Y
 
L
Q
 
R
F
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
T
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
x
G
A
 
A
G
 
V
G
 
G
L
 
T
G
 
R
P
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
P
 
E
L
 
G
I
 
L
R
 
N
A
 
A
I
x
V
-
 
W
-
 
G
T
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
S
I
 
I
Q
 
E
P
 
N
L
 
M
L
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
I
P
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
F
A
 
A
A
 
Y
L
 
D
R
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
V
N
 
T
K
 
D
S
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
D
 
Y
L
 
E
D
 
A
E
 
S
I
 
I
A
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
D
 
S
I
x
F
V
 
S
D
 
S
S
 
M
F
 
F
A
 
P
D
 
E
P
 
P
R
 
R
T
 
Q
R
 
R
T
 
W
A
 
-
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
D
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
-
V
 
-
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
S
R
 
S
A
 
D
Y
 
E
L
 
D
V
 
I
E
 
K
G
 
T
L
 
L
P
 
P
-
 
N
-
 
E
I
 
T
C
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
|
D
L
 
Q
V
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
L
R
 
S
H
 
S
A
 
S
N
 
L
I
 
R
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
D
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
R
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
x
W
P
 
T
H
 
Q
R
 
I
D
 
E
H
 
Q
P
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
N
K
 
R
V
 
L
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
F
 
F

1ukaA Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with (s)-2-methylbutyrate (see paper)
28% identity, 81% coverage: 19:279/323 of query aligns to 17:268/271 of 1ukaA

query
sites
1ukaA
Y
 
Y
V
 
H
K
 
D
V
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
L
x
S
G
|
G
-
 
P
-
x
G
-
 
V
C
 
S
N
 
A
H
 
Y
S
 
A
T
 
N
W
 
W
A
 
R
P
 
L
V
 
T
I
 
I
E
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
K
R
 
F
H
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
E
 
F
S
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
R
 
E
A
 
N
-
 
Y
D
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
A
 
D
A
 
S
Y
 
W
A
 
V
N
 
D
G
 
H
M
 
I
R
 
I
D
 
G
L
 
I
L
 
M
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
K
A
 
A
T
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
I
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Y
 
L
Q
 
R
F
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
T
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
T
G
 
R
P
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
P
 
E
L
 
G
I
 
L
R
 
N
A
 
A
I
x
V
-
x
W
-
 
G
T
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
S
I
 
I
Q
 
E
P
 
N
L
 
M
L
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
I
P
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
F
A
 
A
A
 
Y
L
 
D
R
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
V
N
 
T
K
 
D
S
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
D
 
Y
L
 
E
D
 
A
E
 
S
I
 
I
A
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
D
 
S
I
x
F
V
 
S
D
 
S
S
 
M
F
 
F
A
 
P
D
 
E
P
 
P
R
 
R
T
 
Q
R
 
R
T
 
W
A
 
-
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
D
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
-
V
 
-
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
S
R
 
S
A
 
D
Y
 
E
L
 
D
V
 
I
E
 
K
G
 
T
L
 
L
P
 
P
-
 
N
-
 
E
I
 
T
C
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
|
D
L
 
Q
V
|
V
L
 
V
P
 
P
V
 
L
R
 
S
H
 
S
A
 
S
N
 
L
I
 
R
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
D
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
R
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
x
W
P
 
T
H
 
Q
R
 
I
D
 
E
H
 
Q
P
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
N
K
 
R
V
 
L
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
F

1uk9A Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with isovalerate (see paper)
28% identity, 81% coverage: 19:279/323 of query aligns to 17:268/271 of 1uk9A

query
sites
1uk9A
Y
 
Y
V
 
H
K
 
D
V
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
L
x
S
G
|
G
-
 
P
-
x
G
-
 
V
C
 
S
N
 
A
H
 
Y
S
 
A
T
 
N
W
 
W
A
 
R
P
 
L
V
 
T
I
 
I
E
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
K
R
 
F
H
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
E
 
F
S
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
R
 
E
A
 
N
-
 
Y
D
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
A
 
D
A
 
S
Y
 
W
A
 
V
N
 
D
G
 
H
M
 
I
R
 
I
D
 
G
L
 
I
L
 
M
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
K
A
 
A
T
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
I
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Y
 
L
Q
 
R
F
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
T
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
T
G
 
R
P
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
P
 
E
L
 
G
I
 
L
R
 
N
A
 
A
I
x
V
-
x
W
-
 
G
T
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
S
I
 
I
Q
 
E
P
 
N
L
 
M
L
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
I
P
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
F
A
 
A
A
 
Y
L
 
D
R
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
V
N
 
T
K
 
D
S
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
D
 
Y
L
 
E
D
 
A
E
 
S
I
 
I
A
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
D
 
S
I
x
F
V
 
S
D
 
S
S
 
M
F
 
F
A
 
P
D
 
E
P
 
P
R
 
R
T
 
Q
R
 
R
T
 
W
A
 
-
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
D
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
-
V
 
-
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
S
R
 
S
A
 
D
Y
 
E
L
 
D
V
 
I
E
 
K
G
 
T
L
 
L
P
 
P
-
 
N
-
 
E
I
 
T
C
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
|
D
L
 
Q
V
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
L
R
 
S
H
 
S
A
 
S
N
 
L
I
 
R
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
D
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
R
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
x
W
P
 
T
H
 
Q
R
 
I
D
 
E
H
 
Q
P
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
N
K
 
R
V
 
L
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
F

1uk8A Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with n-valerate (see paper)
28% identity, 81% coverage: 19:279/323 of query aligns to 17:268/271 of 1uk8A

query
sites
1uk8A
Y
 
Y
V
 
H
K
 
D
V
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
L
x
S
G
|
G
-
 
P
-
x
G
-
 
V
C
 
S
N
 
A
H
 
Y
S
 
A
T
 
N
W
 
W
A
 
R
P
 
L
V
 
T
I
 
I
E
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
K
R
 
F
H
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
E
 
F
S
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
R
 
E
A
 
N
-
 
Y
D
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
A
 
D
A
 
S
Y
 
W
A
 
V
N
 
D
G
 
H
M
 
I
R
 
I
D
 
G
L
 
I
L
 
M
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
K
A
 
A
T
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
I
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Y
 
L
Q
 
R
F
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
T
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
T
G
 
R
P
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
P
 
E
L
 
G
I
x
L
R
 
N
A
 
A
I
x
V
-
x
W
-
 
G
T
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
S
I
 
I
Q
 
E
P
 
N
L
 
M
L
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
I
P
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
F
A
 
A
A
 
Y
L
 
D
R
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
V
N
 
T
K
 
D
S
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
D
 
Y
L
 
E
D
 
A
E
 
S
I
 
I
A
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
D
 
S
I
x
F
V
 
S
D
 
S
S
 
M
F
 
F
A
 
P
D
 
E
P
 
P
R
 
R
T
 
Q
R
 
R
T
 
W
A
 
-
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
D
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
-
V
 
-
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
S
R
 
S
A
 
D
Y
 
E
L
 
D
V
 
I
E
 
K
G
 
T
L
 
L
P
 
P
-
 
N
-
 
E
I
 
T
C
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
|
D
L
 
Q
V
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
L
R
 
S
H
 
S
A
 
S
N
x
L
I
 
R
A
 
L
A
x
G
A
x
E
L
 
L
V
 
I
P
 
D
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
R
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
x
W
P
 
T
H
 
Q
R
 
I
D
 
E
H
 
Q
P
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
N
K
 
R
V
 
L
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
F

1uk7A Crystal structure of a meta-cleavage product hydrolase (cumd) complexed with n-butyrate (see paper)
28% identity, 81% coverage: 19:279/323 of query aligns to 17:268/271 of 1uk7A

query
sites
1uk7A
Y
 
Y
V
 
H
K
 
D
V
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
L
x
S
G
|
G
-
 
P
-
x
G
-
 
V
C
 
S
N
 
A
H
 
Y
S
 
A
T
 
N
W
 
W
A
 
R
P
 
L
V
 
T
I
 
I
E
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
K
R
 
F
H
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
E
 
F
S
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
R
 
E
A
 
N
-
 
Y
D
 
N
Y
 
Y
S
 
S
I
 
K
A
 
D
A
 
S
Y
 
W
A
 
V
N
 
D
G
 
H
M
 
I
R
 
I
D
 
G
L
 
I
L
 
M
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
K
A
 
A
T
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
I
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Y
 
L
Q
 
R
F
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
T
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
T
G
 
R
P
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
P
 
E
L
 
G
I
x
L
R
 
N
A
 
A
I
x
V
-
 
W
-
 
G
T
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
S
I
 
I
Q
 
E
P
 
N
L
 
M
L
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
I
P
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
F
A
 
A
A
 
Y
L
 
D
R
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
V
N
 
T
K
 
D
S
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
D
 
Y
L
 
E
D
 
A
E
 
S
I
 
I
A
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
D
 
S
I
x
F
V
 
S
D
 
S
S
 
M
F
 
F
A
 
P
D
 
E
P
 
P
R
 
R
T
 
Q
R
 
R
T
 
W
A
 
-
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
D
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
-
V
 
-
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
S
R
 
S
A
 
D
Y
 
E
L
 
D
V
 
I
E
 
K
G
 
T
L
 
L
P
 
P
-
 
N
-
 
E
I
 
T
C
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
|
D
L
 
Q
V
 
V
L
 
V
P
 
P
V
 
L
R
 
S
H
 
S
A
 
S
N
 
L
I
 
R
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
D
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
R
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
x
W
P
 
T
H
 
Q
R
 
I
D
 
E
H
 
Q
P
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
N
K
 
R
V
 
L
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
F

1iupA Meta-cleavage product hydrolase from pseudomonas fluorescens ip01 (cumd) s103a mutant complexed with isobutyrates (see paper)
28% identity, 81% coverage: 19:279/323 of query aligns to 17:268/271 of 1iupA

query
sites
1iupA
Y
 
Y
V
 
H
K
 
D
V
 
V
G
 
G
S
 
E
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
V
L
 
I
L
 
L
I
 
I
H
 
H
G
 
G
L
x
S
G
|
G
-
 
P
-
x
G
-
 
V
C
 
S
N
 
A
H
 
Y
S
x
A
T
x
N
W
 
W
A
 
R
P
 
L
V
 
T
I
 
I
E
 
P
T
 
A
L
 
L
A
 
S
R
 
K
R
 
F
H
 
Y
T
 
R
V
 
V
I
 
I
V
 
A
P
 
P
D
 
D
L
 
M
L
 
V
G
 
G
H
 
F
G
 
G
E
 
F
S
 
T
D
 
D
K
 
R
P
 
P
R
 
E
A
 
N
-
 
Y
D
 
N
Y
|
Y
S
 
S
I
 
K
A
 
D
A
 
S
Y
x
W
A
 
V
N
 
D
G
 
H
M
 
I
R
 
I
D
 
G
L
 
I
L
 
M
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
E
I
 
I
D
 
E
A
 
K
A
 
A
T
 
H
I
 
I
V
 
V
G
 
G
H
x
N
S
x
A
L
x
F
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
L
A
 
A
M
 
I
Q
 
A
F
 
T
A
 
A
Y
 
L
Q
 
R
F
 
Y
P
 
S
E
 
E
R
 
R
T
 
V
E
 
D
R
 
R
L
 
M
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
x
G
A
 
A
G
 
A
G
 
G
L
 
T
G
 
R
P
 
F
E
 
D
V
 
V
T
 
T
P
 
E
L
 
G
I
x
L
R
 
N
A
 
A
I
x
V
-
x
W
-
 
G
T
 
Y
T
 
T
P
 
P
G
 
S
I
 
I
Q
 
E
P
 
N
L
 
M
L
 
R
A
 
N
L
 
L
A
 
L
A
 
D
L
 
I
P
 
-
G
 
-
I
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
-
T
 
F
A
 
A
A
 
Y
L
 
D
R
 
R
G
 
S
L
 
L
A
 
V
N
 
T
K
 
D
S
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
L
R
|
R
D
 
Y
L
 
E
D
 
A
E
 
S
I
 
I
A
 
Q
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
Q
-
 
E
D
 
S
I
x
F
V
 
S
D
 
S
S
x
M
F
 
F
A
 
P
D
 
E
P
 
P
R
 
R
T
 
Q
R
 
R
T
x
W
A
 
-
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
I
D
 
D
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
-
V
 
-
T
 
A
M
 
L
A
 
A
D
 
S
R
 
S
A
 
D
Y
 
E
L
 
D
V
 
I
E
 
K
G
 
T
L
 
L
P
 
P
-
 
N
-
 
E
I
 
T
C
 
L
V
 
I
V
 
I
W
 
H
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
|
D
L
 
Q
V
|
V
L
 
V
P
 
P
V
 
L
R
 
S
H
 
S
A
 
S
N
 
L
I
 
R
A
 
L
A
 
G
A
 
E
L
 
L
V
 
I
P
 
D
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
R
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
x
W
P
 
T
H
 
Q
R
 
I
D
 
E
H
 
Q
P
 
T
E
 
D
R
 
R
F
 
F
A
 
N
K
 
R
V
 
L
V
 
V
Q
 
V
E
 
E
F
 
F
V
 
F

6eb3A Structural and enzymatic characterization of an esterase from a metagenomic library
31% identity, 84% coverage: 9:280/323 of query aligns to 3:261/265 of 6eb3A

query
sites
6eb3A
Y
 
Y
V
 
A
D
 
Q
L
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
 
I
R
 
N
R
 
L
A
 
H
Y
 
Y
V
 
E
K
 
I
V
 
E
G
|
G
S
 
Q
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
M
G
 
G
L
 
L
G
 
G
C
 
A
N
 
P
H
 
A
S
 
A
T
 
A
W
 
W
A
 
D
P
 
P
V
 
I
-
 
F
I
 
V
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
T
R
 
K
R
 
T
H
 
H
T
x
Q
V
 
V
I
 
I
V
 
I
P
 
Y
D
 
D
L
 
N
L
 
R
G
 
G
H
 
T
G
 
G
E
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
R
 
D
A
 
M
D
 
P
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
M
Y
 
F
A
 
A
N
 
S
G
 
D
M
 
A
R
 
V
D
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
I
D
 
P
A
 
R
A
 
A
T
 
H
I
 
V
V
 
F
G
 
G
H
 
V
S
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
I
A
 
A
M
 
Q
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
Y
 
I
Q
 
H
F
 
Y
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
T
 
V
E
 
A
R
 
S
L
 
L
V
 
I
L
 
L
V
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
-
P
 
-
L
 
-
I
 
-
R
 
-
A
 
G
I
 
C
T
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
G
Q
 
K
P
 
H
L
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
V
A
 
P
A
 
A
L
 
P
P
 
P
G
 
E
I
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
S
T
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
A
G
 
G
L
 
L
A
 
T
N
 
P
K
 
E
S
 
E
V
 
-
A
 
-
A
 
A
L
 
I
R
 
R
D
 
E
L
 
G
D
 
W
E
 
K
I
 
L
A
 
S
D
 
-
I
 
F
V
 
S
D
 
E
S
 
E
F
 
F
A
 
I
D
 
H
P
 
T
R
 
H
T
 
K
R
 
A
T
 
E
A
 
L
V
 
E
R
 
A
N
 
H
V
 
I
T
 
P
R
 
R
S
 
L
V
 
L
V
 
A
D
 
Q
W
 
L
G
 
T
G
 
P
Q
 
R
Y
 
F
-
 
A
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
Q
V
 
A
T
 
T
M
 
M
A
 
T
D
 
L
R
 
R
A
 
V
Y
 
F
-
 
K
-
 
Q
L
 
L
V
 
K
E
 
E
-
 
I
G
 
Q
L
 
A
P
 
P
I
 
T
C
 
L
V
 
V
V
 
A
W
 
T
G
 
G
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
M
V
 
L
L
 
I
P
 
P
V
 
A
R
 
V
H
 
N
A
 
S
N
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
L
E
 
A
I
 
I
M
 
F
P
 
E
N
 
S
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
G
P
 
F
H
 
V
R
 
T
D
 
S
H
 
A
P
 
R
E
 
E
R
 
P
F
 
F
A
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
L
Q
 
K
E
 
E
F
 
F
V
 
L
A
 
A

6eb3C Structural and enzymatic characterization of an esterase from a metagenomic library
31% identity, 84% coverage: 9:280/323 of query aligns to 3:258/262 of 6eb3C

query
sites
6eb3C
Y
 
Y
V
 
A
D
 
Q
L
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
 
I
R
 
N
R
 
L
A
 
H
Y
 
Y
V
 
E
K
 
I
V
 
E
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
M
G
 
G
L
|
L
G
 
G
C
 
A
N
 
P
H
 
A
S
 
A
T
 
A
W
 
W
A
 
D
P
 
P
V
 
I
-
 
F
I
 
V
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
T
R
 
K
R
 
T
H
 
H
T
 
Q
V
 
V
I
 
I
V
 
I
P
 
Y
D
 
D
L
 
N
L
 
R
G
 
G
H
 
T
G
 
G
E
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
R
 
D
A
 
M
D
 
P
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
 
A
A
 
M
Y
 
F
A
 
A
N
 
S
G
 
D
M
 
A
R
 
V
D
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
I
D
 
P
A
 
R
A
 
A
T
 
H
I
 
V
V
 
F
G
 
G
H
 
V
S
|
S
L
x
M
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
I
A
 
A
M
 
Q
Q
 
E
F
 
L
A
 
A
Y
 
I
Q
 
H
F
 
Y
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
T
 
V
E
 
A
R
 
S
L
 
L
V
 
I
L
 
L
V
 
G
A
 
C
A
 
T
G
 
T
G
 
P
L
 
G
G
 
G
P
 
K
E
 
H
V
 
A
T
 
V
P
 
P
L
 
A
-
 
P
-
 
P
-
 
E
-
 
S
I
 
L
R
 
K
A
 
A
I
 
L
T
 
T
-
 
P
T
 
E
P
 
E
G
 
A
I
 
I
Q
 
R
P
 
E
L
 
G
L
 
W
A
 
K
L
 
L
A
 
S
A
 
F
L
 
S
P
 
E
G
 
E
I
 
F
R
 
I
H
 
H
L
 
T
G
 
H
T
 
K
A
 
A
A
 
E
L
 
L
R
 
E
G
 
A
L
 
H
A
 
I
N
 
P
K
 
R
S
 
L
V
 
L
A
 
A
A
 
Q
L
 
L
R
 
-
D
 
-
L
 
-
D
 
-
E
 
-
I
 
-
A
 
-
D
 
-
I
 
-
V
 
T
D
 
P
S
 
R
F
 
F
A
 
A
D
 
Y
P
 
E
R
 
R
T
 
H
R
 
F
T
 
Q
A
 
A
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
-
T
 
-
R
 
-
S
 
-
V
 
-
V
 
-
D
 
-
W
 
-
G
 
-
G
 
-
Q
 
-
Y
 
-
V
 
-
T
 
T
M
 
M
A
 
T
D
 
L
R
 
R
A
 
V
Y
 
F
-
 
K
-
 
Q
L
 
L
V
 
K
E
 
E
-
 
I
G
 
Q
L
 
A
P
 
P
I
 
T
C
 
L
V
 
V
V
 
A
W
 
T
G
 
G
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
M
V
 
L
L
 
I
P
 
P
V
 
A
R
 
V
H
 
N
A
 
S
N
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
L
E
 
A
I
 
I
M
 
F
P
 
E
N
 
S
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
G
P
 
F
H
 
V
R
 
T
D
 
S
H
 
A
P
 
R
E
 
E
R
 
P
F
 
F
A
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
L
Q
 
K
E
 
E
F
 
F
V
 
L
A
 
A

6eb3B Structural and enzymatic characterization of an esterase from a metagenomic library
31% identity, 84% coverage: 9:280/323 of query aligns to 3:264/268 of 6eb3B

query
sites
6eb3B
Y
 
Y
V
 
A
D
 
Q
L
 
V
H
 
N
G
 
G
Y
 
I
R
 
N
R
 
L
A
 
H
Y
 
Y
V
 
E
K
 
I
V
 
E
G
 
G
S
 
Q
G
 
G
P
 
Q
A
 
P
L
 
L
L
 
L
L
 
L
I
 
I
H
 
M
G
 
G
L
 
L
G
 
G
C
 
A
N
 
P
H
 
A
S
 
A
T
 
A
W
 
W
A
 
D
P
 
P
V
 
I
-
 
F
I
 
V
E
 
Q
T
 
T
L
 
L
A
 
T
R
 
K
R
 
T
H
 
H
T
 
Q
V
 
V
I
 
I
V
 
I
P
 
Y
D
 
D
L
 
N
L
 
R
G
 
G
H
 
T
G
 
G
E
 
L
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
P
R
 
D
A
 
M
D
 
P
Y
 
Y
S
 
S
I
 
I
A
|
A
A
 
M
Y
 
F
A
 
A
N
 
S
G
 
D
M
 
A
R
 
V
D
 
G
L
 
L
L
 
L
S
 
D
V
 
A
L
 
L
D
 
N
I
 
I
D
 
P
A
 
R
A
 
A
T
 
H
I
 
V
V
 
F
G
 
G
H
 
V
S
 
S
L
 
M
G
 
G
G
 
G
G
 
M
V
 
I
A
 
A
M
 
Q
Q
x
E
F
 
L
A
 
A
Y
 
I
Q
x
H
F
 
Y
P
 
P
E
 
Q
R
 
R
T
 
-
E
 
-
R
 
-
L
 
-
V
 
-
L
 
-
V
 
-
A
 
-
A
 
-
G
 
-
G
 
-
L
 
-
G
 
-
P
 
-
E
 
-
V
 
V
T
 
A
P
 
S
L
 
L
I
 
I
R
 
L
A
 
G
I
 
C
T
 
T
T
 
T
P
 
P
G
 
G
I
 
G
Q
 
K
P
 
H
L
 
-
L
 
-
A
 
A
L
 
V
A
 
P
A
 
A
L
 
P
P
 
P
G
 
E
I
 
-
R
 
-
H
 
-
L
 
-
G
 
S
T
 
L
A
 
K
A
 
A
L
 
L
R
 
E
G
 
G
L
 
R
A
 
A
N
 
G
K
 
L
S
 
T
-
 
P
V
 
E
A
 
E
A
 
A
L
 
I
R
 
R
D
 
E
L
 
G
D
 
W
E
 
K
I
 
L
A
 
S
D
 
-
I
 
F
V
 
S
D
 
E
S
 
E
F
 
F
A
 
I
D
 
H
P
 
T
R
 
H
T
 
K
R
 
A
T
 
E
A
 
L
V
 
E
R
 
A
N
 
H
V
 
I
T
 
P
R
 
R
S
 
L
V
 
L
V
 
A
D
 
Q
W
 
L
G
 
T
G
 
P
Q
 
R
Y
 
F
-
 
A
-
 
Y
-
 
E
-
 
R
-
 
H
-
 
F
-
 
Q
V
 
A
T
 
T
M
 
M
A
x
T
D
 
L
R
|
R
A
 
V
Y
 
F
-
 
K
-
x
Q
L
 
L
V
 
K
E
 
E
-
 
I
G
 
Q
L
 
A
P
 
P
I
 
T
C
 
L
V
 
V
V
 
A
W
 
T
G
 
G
R
 
R
D
 
D
D
 
D
L
 
M
V
 
L
L
 
I
P
 
P
V
 
A
R
 
V
H
 
N
A
 
S
N
 
E
I
 
I
A
 
L
A
 
A
A
 
R
L
 
E
V
 
I
P
 
P
S
 
G
A
 
A
R
 
E
I
 
L
E
 
A
I
 
I
M
 
F
P
 
E
N
 
S
S
 
A
G
 
G
H
 
H
F
 
G
P
 
F
H
 
V
R
 
T
D
 
S
H
 
A
P
 
R
E
 
E
R
 
P
F
 
F
A
 
L
K
 
K
V
 
V
V
 
L
Q
 
K
E
 
E
F
 
F
V
 
L
A
 
A

5w15D Crystal structure of an alpha/beta hydrolase fold protein from burkholderia ambifaria.
27% identity, 80% coverage: 10:269/323 of query aligns to 11:261/270 of 5w15D

query
sites
5w15D
V
 
F
D
 
N
L
 
F
H
 
E
G
 
G
Y
 
H
R
 
R
R
 
I
A
 
A
Y
 
W
V
 
G
K
 
T
V
 
L
G
 
G
S
 
E
G
 
G
P
 
P
A
 
P
L
 
L
L
 
V
L
 
L
I
 
V
H
 
H
G
 
G
L
x
T
G
 
P
C
 
F
N
 
S
H
 
S
S
 
Q
T
 
V
W
 
W
A
 
R
P
 
R
V
 
I
I
 
A
E
 
P
T
 
W
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
R
H
 
H
T
 
R
V
 
V
I
 
F
V
 
F
P
 
Y
D
 
D
L
 
L
L
 
L
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
E
 
Q
S
 
S
D
 
D
K
 
M
P
 
P
R
 
D
A
 
A
D
 
D
Y
 
V
S
 
S
I
 
L
A
 
G
A
 
R
Y
 
Q
A
 
N
N
 
V
G
 
L
M
 
F
R
 
G
D
 
A
L
 
L
L
 
L
S
 
D
V
x
E
L
x
W
D
 
K
I
 
I
D
 
S
A
 
R
A
 
P
T
 
R
I
 
V
V
 
L
G
 
A
H
|
H
S
x
D
L
x
Y
G
 
G
G
 
G
G
 
A
V
 
T
A
 
V
M
 
L
Q
 
R
F
 
A
A
 
H
Y
 
F
Q
 
L
F
 
D
P
 
G
E
 
I
R
 
A
T
 
Y
E
 
S
R
x
D
L
 
L
V
 
T
L
 
L
V
 
V
A
 
N
A
 
P
G
 
V
G
 
A
L
 
I
G
 
A
P
 
P
E
 
Q
V
 
G
T
 
S
P
 
P
L
 
F
I
 
V
R
 
R
A
 
H
I
 
V
T
 
A
T
 
-
P
 
-
G
 
-
I
 
-
Q
 
Q
P
 
H
L
 
E
L
 
A
A
 
A
L
 
F
A
 
T
A
 
G
L
 
L
P
 
P
G
 
A
I
 
Y
R
 
A
H
 
H
L
 
-
G
 
-
T
 
H
A
 
A
A
 
L
L
 
V
R
 
S
G
 
A
L
 
Y
A
 
I
N
 
G
K
 
Q
S
 
A
V
 
V
A
 
A
A
 
Q
L
 
P
R
 
L
D
 
S
L
 
D
D
 
D
E
x
V
I
 
L
A
 
S
D
 
I
I
 
Y
V
 
R
D
 
A
S
 
P
F
 
W
A
 
L
D
 
T
P
 
P
R
 
A
T
 
G
R
 
Q
T
 
A
A
 
A
V
 
-
R
 
-
N
 
-
V
 
F
T
 
Y
R
 
R
S
 
Q
V
 
I
V
 
A
D
 
Q
W
 
M
G
 
R
G
 
Q
Q
 
R
Y
 
Y
V
 
I
T
 
E
M
 
D
A
 
A
D
 
E
R
 
A
A
 
R
Y
 
Y
L
 
A
V
 
P
E
 
P
G
 
D
L
 
F
P
 
P
I
 
V
C
 
R
V
 
I
V
 
V
W
 
W
G
 
G
R
 
E
D
|
D
D
|
D
L
 
R
V
 
W
L
 
I
P
 
P
V
 
L
R
 
E
H
 
Q
A
 
G
N
x
Q
I
 
A
A
 
L
A
 
A
A
 
D
L
 
R
V
 
I
P
 
A
S
 
N
A
 
G
R
 
K
I
 
L
E
 
I
I
x
R
M
 
V
P
 
P
N
 
R
S
 
A
G
 
G
H
|
H
F
x
L
P
 
V
H
 
Q
R
 
E
D
 
D
H
 
A
P
 
P
E
 
E

P9WNH5 4,5:9,10-diseco-3-hydroxy-5,9,17-trioxoandrosta-1(10),2-diene-4-oate hydrolase; 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase; HOPDA hydrolase; Meta-cleavage product hydrolase; MCP hydrolase; EC 3.7.1.17; EC 3.7.1.8 from Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (see paper)
29% identity, 80% coverage: 22:280/323 of query aligns to 33:288/291 of P9WNH5

query
sites
P9WNH5
V
 
V
G
 
G
S
 
N
G
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
L
H
 
H
G
 
G
L
 
G
G
 
G
C
 
P
N
 
G
H
 
A
S
 
A
T
 
S
W
 
W
A
 
T
P
 
N
V
 
F
-
 
S
-
 
R
-
 
N
I
 
I
E
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
H
H
 
F
T
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
A
P
 
V
D
 
D
L
 
Q
L
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
E
 
H
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
R
 
A
A
 
E
D
 
H
Y
 
G
S
 
Q
I
 
F
A
 
N
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
N
 
A
-
 
M
G
 
A
M
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
D
V
 
Q
L
 
L
D
 
G
I
 
L
D
 
G
A
 
R
A
 
V
T
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
N
S
|
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
T
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
F
 
F
A
 
A
Y
 
L
Q
 
D
F
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
T
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
S
P
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
I
P
 
N
L
 
L
I
 
F
R
 
A
A
 
P
I
 
D
T
 
P
T
 
T
P
 
E
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
P
 
R
L
 
L
L
 
S
A
 
K
L
 
F
A
 
S
A
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
T
I
 
R
R
 
E
H
 
N
L
 
L
G
 
-
T
 
E
A
 
A
A
 
F
L
 
L
R
 
R
G
 
V
L
 
M
A
 
V
-
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
T
L
 
P
R
 
E
D
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
Q
I
 
R
A
 
F
D
 
A
I
 
L
V
 
A
D
 
S
S
 
T
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
R
 
E
T
 
S
R
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
M
T
 
G
R
 
K
S
 
S
V
 
F
V
 
A
D
 
G
W
 
A
G
 
D
G
 
F
Q
 
E
Y
 
A
V
 
G
T
 
M
M
 
M
A
 
W
D
 
R
R
 
E
A
 
V
Y
 
Y
L
 
R
V
 
L
E
 
R
G
 
-
L
 
Q
P
 
P
I
 
V
C
 
L
V
 
L
V
 
I
W
 
W
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
R
V
 
V
L
 
N
P
 
P
V
 
L
R
 
D
H
 
G
A
 
A
N
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
T
V
 
I
P
 
P
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
Q
S
 
C
G
 
G
H
 
H
F
 
W
P
 
V
H
 
Q
R
 
V
D
 
E
H
 
K
P
 
F
E
 
D
R
 
E
F
 
F
A
 
N
K
 
K
V
 
L
V
 
T
Q
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
L
A
 
G

7zm4A Crystal structure of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with cyclipostin-like inhibitor cyc31 (see paper)
29% identity, 80% coverage: 22:280/323 of query aligns to 27:282/284 of 7zm4A

query
sites
7zm4A
V
 
V
G
 
G
S
 
N
G
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
L
H
 
H
G
|
G
L
x
G
G
 
G
C
 
P
N
 
G
H
 
A
S
 
A
T
 
S
W
 
W
A
 
T
P
 
N
V
 
F
-
 
S
-
 
R
-
 
N
I
 
I
E
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
H
H
 
F
T
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
A
P
 
V
D
 
D
L
 
Q
L
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
E
 
H
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
R
 
A
A
 
E
D
 
H
Y
 
G
S
 
Q
I
 
F
A
 
N
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
N
 
A
-
 
M
G
 
A
M
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
D
V
 
Q
L
 
L
D
 
G
I
 
L
D
 
G
A
 
R
A
 
V
T
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
T
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
F
 
F
A
 
A
Y
 
L
Q
 
D
F
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
T
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
S
P
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
I
P
 
N
L
 
L
I
 
F
R
 
A
A
 
P
I
 
D
T
 
P
T
 
T
P
 
E
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
P
 
R
L
 
L
L
 
S
A
 
K
L
 
F
A
x
S
A
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
T
I
 
R
R
 
E
H
 
N
L
 
L
G
 
-
T
 
E
A
 
A
A
 
F
L
 
L
R
 
R
G
 
V
L
 
M
A
 
V
-
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
T
L
 
P
R
 
E
D
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
Q
I
 
R
A
 
F
D
 
A
I
 
L
V
 
A
D
 
S
S
 
T
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
R
 
E
T
 
S
R
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
M
T
 
G
R
 
K
S
 
S
V
 
F
V
 
A
D
 
G
W
 
A
G
 
D
G
 
F
Q
 
E
Y
 
A
V
 
G
T
 
M
M
 
M
A
 
W
D
 
R
R
 
E
A
 
V
Y
 
Y
L
 
R
V
 
L
E
 
R
G
 
-
L
 
Q
P
 
P
I
 
V
C
 
L
V
 
L
V
 
I
W
 
W
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
R
V
 
V
L
 
N
P
 
P
V
 
L
R
 
D
H
 
G
A
 
A
N
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
T
V
 
I
P
 
P
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
Q
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
 
W
P
 
V
H
 
Q
R
 
V
D
 
E
H
 
K
P
 
F
E
 
D
R
 
E
F
 
F
A
 
N
K
 
K
V
 
L
V
 
T
Q
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
L
A
 
G

7zm3A Crystal structure of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with cyclipostin-like inhibitor cyc17 (see paper)
29% identity, 80% coverage: 22:280/323 of query aligns to 27:282/284 of 7zm3A

query
sites
7zm3A
V
 
V
G
 
G
S
 
N
G
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
L
H
 
H
G
 
G
L
x
G
G
 
G
C
 
P
N
 
G
H
 
A
S
 
A
T
 
S
W
 
W
A
 
T
P
 
N
V
 
F
-
 
S
-
 
R
-
 
N
I
 
I
E
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
H
H
 
F
T
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
A
P
 
V
D
 
D
L
 
Q
L
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
E
 
H
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
R
 
A
A
 
E
D
 
H
Y
 
G
S
 
Q
I
 
F
A
 
N
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
N
 
A
-
 
M
G
 
A
M
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
D
V
 
Q
L
 
L
D
 
G
I
 
L
D
 
G
A
 
R
A
 
V
T
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
T
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
F
 
F
A
 
A
Y
 
L
Q
 
D
F
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
T
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
S
P
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
I
P
 
N
L
 
L
I
 
F
R
 
A
A
 
P
I
 
D
T
 
P
T
 
T
P
 
E
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
P
 
R
L
 
L
L
 
S
A
 
K
L
 
F
A
 
S
A
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
T
I
 
R
R
 
E
H
 
N
L
 
L
G
 
-
T
 
E
A
 
A
A
 
F
L
 
L
R
 
R
G
 
V
L
 
M
A
 
V
-
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
T
L
 
P
R
 
E
D
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
Q
I
 
R
A
 
F
D
 
A
I
 
L
V
 
A
D
 
S
S
 
T
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
R
 
E
T
 
S
R
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
M
T
 
G
R
 
K
S
 
S
V
 
F
V
 
A
D
 
G
W
 
A
G
 
D
G
 
F
Q
 
E
Y
 
A
V
 
G
T
 
M
M
 
M
A
 
W
D
 
R
R
 
E
A
 
V
Y
 
Y
L
 
R
V
 
L
E
 
R
G
 
-
L
 
Q
P
 
P
I
 
V
C
 
L
V
 
L
V
 
I
W
 
W
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
R
V
 
V
L
 
N
P
 
P
V
 
L
R
 
D
H
 
G
A
 
A
N
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
T
V
 
I
P
 
P
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
Q
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
 
W
P
 
V
H
 
Q
R
 
V
D
 
E
H
 
K
P
 
F
E
 
D
R
 
E
F
 
F
A
 
N
K
 
K
V
 
L
V
 
T
Q
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
L
A
 
G

7zm2A Crystal structure of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with cyclophostin-like inhibitor cyc8b (see paper)
29% identity, 80% coverage: 22:280/323 of query aligns to 27:282/284 of 7zm2A

query
sites
7zm2A
V
 
V
G
 
G
S
 
N
G
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
L
H
 
H
G
 
G
L
x
G
G
 
G
C
 
P
N
 
G
H
 
A
S
 
A
T
 
S
W
 
W
A
 
T
P
 
N
V
 
F
-
 
S
-
 
R
-
 
N
I
 
I
E
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
H
H
 
F
T
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
A
P
 
V
D
 
D
L
 
Q
L
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
E
 
H
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
R
 
A
A
 
E
D
 
H
Y
 
G
S
 
Q
I
 
F
A
 
N
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
N
 
A
-
 
M
G
 
A
M
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
D
V
 
Q
L
 
L
D
 
G
I
 
L
D
 
G
A
 
R
A
 
V
T
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
T
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
F
 
F
A
 
A
Y
 
L
Q
 
D
F
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
T
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
S
P
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
I
P
 
N
L
 
L
I
 
F
R
 
A
A
 
P
I
 
D
T
 
P
T
 
T
P
 
E
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
P
 
R
L
 
L
L
 
S
A
 
K
L
 
F
A
 
S
A
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
T
I
 
R
R
 
E
H
 
N
L
 
L
G
 
-
T
 
E
A
 
A
A
 
F
L
 
L
R
 
R
G
 
V
L
 
M
A
 
V
-
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
T
L
 
P
R
 
E
D
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
Q
I
 
R
A
 
F
D
 
A
I
 
L
V
 
A
D
 
S
S
 
T
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
R
 
E
T
 
S
R
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
M
T
 
G
R
 
K
S
 
S
V
 
F
V
 
A
D
 
G
W
 
A
G
 
D
G
 
F
Q
 
E
Y
 
A
V
 
G
T
 
M
M
 
M
A
 
W
D
 
R
R
 
E
A
 
V
Y
 
Y
L
 
R
V
 
L
E
 
R
G
 
-
L
 
Q
P
 
P
I
 
V
C
 
L
V
 
L
V
 
I
W
 
W
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
R
V
 
V
L
 
N
P
 
P
V
 
L
R
 
D
H
 
G
A
 
A
N
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
T
V
 
I
P
 
P
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
Q
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
 
W
P
 
V
H
 
Q
R
 
V
D
 
E
H
 
K
P
 
F
E
 
D
R
 
E
F
 
F
A
 
N
K
 
K
V
 
L
V
 
T
Q
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
L
A
 
G

7zm1A Crystal structure of hsad from mycobacterium tuberculosis in complex with cyclophostin-like inhibitor cyc7b (see paper)
29% identity, 80% coverage: 22:280/323 of query aligns to 27:282/284 of 7zm1A

query
sites
7zm1A
V
 
V
G
 
G
S
 
N
G
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
L
H
 
H
G
|
G
L
x
G
G
 
G
C
 
P
N
 
G
H
 
A
S
 
A
T
 
S
W
 
W
A
 
T
P
 
N
V
 
F
-
 
S
-
 
R
-
 
N
I
 
I
E
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
H
H
 
F
T
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
A
P
 
V
D
 
D
L
 
Q
L
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
E
 
H
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
R
 
A
A
 
E
D
 
H
Y
 
G
S
 
Q
I
 
F
A
 
N
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
N
 
A
-
 
M
G
 
A
M
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
D
V
 
Q
L
 
L
D
 
G
I
 
L
D
 
G
A
 
R
A
 
V
T
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
H
 
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
T
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
F
 
F
A
 
A
Y
 
L
Q
 
D
F
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
T
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
G
A
 
P
G
|
G
G
 
G
L
 
L
G
 
S
P
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
I
P
 
N
L
 
L
I
 
F
R
 
A
A
 
P
I
 
D
T
 
P
T
 
T
P
 
E
G
 
G
I
 
V
Q
 
K
P
 
R
L
 
L
L
 
S
A
 
K
L
 
F
A
x
S
A
 
V
L
 
A
P
 
P
G
 
T
I
 
R
R
 
E
H
 
N
L
 
L
G
 
-
T
 
E
A
 
A
A
 
F
L
 
L
R
 
R
G
 
V
L
 
M
A
 
V
-
 
Y
N
 
D
K
 
K
S
 
N
V
 
L
A
 
I
A
 
T
L
 
P
R
 
E
D
 
L
L
 
V
D
 
D
E
 
Q
I
 
R
A
 
F
D
 
A
I
 
L
V
 
A
D
 
S
S
 
T
F
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
R
 
E
T
 
S
R
 
L
T
 
T
A
 
A
V
 
T
R
 
R
N
 
A
V
 
M
T
 
G
R
 
K
S
 
S
V
x
F
V
 
A
D
 
G
W
 
A
G
 
D
G
 
F
Q
 
E
Y
 
A
V
 
G
T
 
M
M
 
M
A
 
W
D
 
R
R
 
E
A
 
V
Y
 
Y
L
 
R
V
 
L
E
 
R
G
 
-
L
 
Q
P
 
P
I
 
V
C
 
L
V
 
L
V
 
I
W
 
W
G
 
G
R
 
R
D
 
E
D
 
D
L
 
R
V
 
V
L
 
N
P
 
P
V
 
L
R
 
D
H
 
G
A
 
A
N
 
L
I
 
V
A
 
A
A
 
L
A
 
K
L
 
T
V
 
I
P
 
P
S
 
R
A
 
A
R
 
Q
I
 
L
E
 
H
I
 
V
M
 
F
P
 
G
N
 
Q
S
 
C
G
 
G
H
|
H
F
 
W
P
 
V
H
 
Q
R
 
V
D
 
E
H
 
K
P
 
F
E
 
D
R
 
E
F
 
F
A
 
N
K
 
K
V
 
L
V
 
T
Q
 
I
E
 
E
F
 
F
V
 
L
A
 
G

5jzsB Hsad bound to 3,5-dichloro-4-hydroxybenzoic acid (see paper)
29% identity, 80% coverage: 22:280/323 of query aligns to 27:282/284 of 5jzsB

query
sites
5jzsB
V
 
V
G
 
G
S
 
N
G
 
D
P
 
Q
A
 
T
L
 
V
L
 
V
L
 
L
I
 
L
H
 
H
G
 
G
L
x
G
G
|
G
C
 
P
N
x
G
H
 
A
S
 
A
T
 
S
W
 
W
A
 
T
P
 
N
V
 
F
-
 
S
-
 
R
-
 
N
I
 
I
E
 
A
T
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
R
R
 
H
H
 
F
T
 
H
V
 
V
I
 
L
V
 
A
P
 
V
D
 
D
L
 
Q
L
 
P
G
 
G
H
 
Y
G
 
G
E
 
H
S
 
S
D
 
D
K
 
K
P
 
R
R
 
A
A
 
E
D
 
H
Y
 
G
S
 
Q
I
 
F
A
 
N
A
 
R
Y
 
Y
A
 
A
N
 
A
-
 
M
G
 
A
M
 
L
R
 
K
D
 
G
L
 
L
L
 
F
S
 
D
V
 
Q
L
 
L
D
 
G
I
 
L
D
 
G
A
 
R
A
 
V
T
 
P
I
 
L
V
 
V
G
 
G
H
x
N
S
|
S
L
|
L
G
 
G
G
 
G
G
 
G
V
 
T
A
 
A
M
 
V
Q
 
R
F
 
F
A
 
A
Y
 
L
Q
 
D
F
 
Y
P
 
P
E
 
A
R
 
R
T
 
A
E
 
G
R
 
R
L
 
L
V
 
V
L
 
L
V
 
M
A
 
G
A
 
P
G
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
S
P
 
-
E
 
-
V
 
-
T
 
I
P
 
N
L
 
L
I
 
F
R
 
A
A
 
P
I
 
D
T
 
P
T
 
T
P
 
E
G
|
G
I
x
V
Q
 
K
P
 
R
L
|
L
L
 
S
A
 
K
L
 
F
A
 
S
A
 
V
L
 
A
P
 
P