SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_110207473.1 NCBI__GCF_003194585.1:WP_110207473.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2x75A Staphylococcus aureus adenylosuccinate lyase (see paper)
30% identity, 88% coverage: 15:366/400 of query aligns to 4:349/427 of 2x75A

query
sites
2x75A
W
x
Y
G
 
S
T
 
R
P
 
E
E
 
E
V
 
M
R
 
S
E
 
N
V
 
I
F
 
W
D
 
T
E
 
D
S
 
Q
A
 
N
R
 
R
V
 
Y
Q
 
E
G
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
E
V
 
V
L
 
E
V
 
I
A
 
L
L
 
A
A
 
C
R
 
E
A
 
A
Q
 
W
A
 
S
A
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
H
I
 
I
P
 
P
L
 
K
S
 
A
S
 
D
A
 
V
E
 
Q
A
 
K
I
 
I
A
 
R
E
 
Q
A
 
N
A
 
A
K
 
K
V
 
V
D
 
N
R
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
V
D
 
E
Q
 
R
V
 
A
G
 
Q
V
 
E
A
 
I
T
 
E
R
 
Q
E
 
E
T
 
T
G
 
R
H
|
H
S
 
D
T
 
V
L
 
V
G
 
A
L
 
F
I
 
T
R
 
R
E
 
Q
L
 
V
Q
 
S
P
 
E
L
 
T
L
 
L
P
 
G
E
 
E
S
 
E
A
 
-
R
 
R
E
 
K
H
 
W
L
 
V
Y
 
H
F
 
Y
K
 
G
T
 
L
T
 
T
V
 
S
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
F
A
 
V
V
 
I
R
 
K
T
 
Q
V
 
A
G
 
N
G
 
D
I
 
I
V
 
I
W
 
E
R
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
E
A
 
R
I
 
F
E
 
I
A
 
D
R
 
V
L
 
L
L
 
A
E
 
E
L
 
K
S
 
A
A
 
K
Q
 
N
H
 
Y
R
 
K
D
 
Y
T
 
T
L
 
L
M
 
M
C
 
M
G
 
G
R
 
R
T
|
T
H
|
H
G
 
G
Q
 
V
P
 
H
G
 
A
A
 
E
P
 
P
I
 
T
T
 
T
F
 
F
G
 
G
W
 
V
K
 
K
V
 
M
A
 
A
S
 
L
W
 
W
A
 
Y
D
 
T
E
 
E
V
 
M
R
 
Q
R
 
R
H
 
N
L
 
L
D
 
Q
R
 
R
L
 
F
R
 
K
E
 
Q
G
 
V
S
 
R
D
 
E
R
 
E
W
 
I
L
 
E
T
 
V
V
 
G
Q
 
K
L
 
M
G
 
S
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
F
V
 
A
D
 
N
A
 
I
G
 
P
P
 
P
S
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
V
 
I
R
 
E
A
 
S
R
 
Y
F
 
V
A
 
C
A
 
K
E
 
H
L
 
L
G
 
G
L
 
I
N
 
G
E
 
T
P
 
A
R
 
P
I
 
V
S
 
S
W
 
T
L
 
Q
S
 
T
-
 
L
S
 
Q
R
 
R
D
 
D
R
 
R
P
 
H
A
 
A
E
 
Y
F
 
Y
G
 
I
H
 
A
L
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
L
I
 
I
C
 
A
G
 
T
T
 
S
L
 
L
A
 
E
R
 
K
I
 
F
G
 
A
G
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
R
E
 
N
L
 
L
Q
 
Q
R
 
K
P
 
T
E
 
E
I
 
T
G
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
E
E
 
E
P
 
A
R
 
F
P
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
Q
V
 
K
G
 
G
S
|
S
I
x
S
T
 
A
M
 
M
H
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
I
G
 
G
S
 
S
E
|
E
H
x
N
L
 
I
D
 
T
T
 
G
L
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
V
A
 
I
R
 
R
S
 
G
S
 
Y
S
 
I
G
 
T
V
 
T
L
 
A
S
 
Y
E
 
E
S
 
N
V
 
V
V
 
P
S
 
L
Q
 
W
H
 
H
E
 
E
R
 
R
D
 
D
G
 
I
R
 
S
A
 
H
W
 
S
K
 
S
A
 
A
E
 
E
W
 
R
V
 
I
A
 
M
L
 
L
P
 
P
E
 
D
V
 
V
C
 
T
L
 
I
L
 
A
T
 
L
G
 
D
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
N
L
 
R
T
 
F
R
 
T
R
 
N
L
 
I
V
 
V
D
 
D
G
 
R
L
 
L
E
 
T
I
 
V
D
 
F
E
 
E
D
 
D
R
 
N
M
 
M
T
 
R
A
 
N
N
 
N
L
 
I
R
 
D
T
 
K
H
 
T
L
 
F
G
 
G

Sites not aligning to the query:

P12047 Adenylosuccinate lyase; ASL; Adenylosuccinase; ASase; Glutamyl--tRNA ligase regulatory factor; EC 4.3.2.2 from Bacillus subtilis (strain 168) (see paper)
29% identity, 88% coverage: 15:366/400 of query aligns to 5:350/431 of P12047

query
sites
P12047
W
 
Y
G
 
S
T
 
R
P
 
P
E
 
E
V
 
M
R
 
S
E
 
A
V
 
I
F
 
W
D
 
T
E
 
D
S
 
E
A
 
N
R
 
R
V
 
F
Q
 
Q
G
 
A
W
 
W
L
 
L
D
 
E
V
 
V
L
 
E
V
 
I
A
 
L
L
 
A
A
 
C
R
 
E
A
 
A
Q
 
W
A
 
A
A
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
V
I
 
I
P
 
P
L
 
K
S
 
E
S
 
D
A
 
V
E
 
K
A
 
V
I
 
M
A
 
R
E
 
E
A
 
N
A
 
A
K
 
S
V
 
-
D
 
-
R
 
-
L
 
F
D
 
D
L
 
I
D
 
N
Q
 
R
V
 
I
G
 
L
V
 
E
A
 
I
T
 
E
R
 
K
E
 
D
T
 
T
G
 
R
H
 
H
S
 
D
T
 
V
L
 
V
G
 
A
L
 
F
I
 
T
R
 
R
E
 
A
L
 
V
Q
 
S
P
 
E
L
 
S
L
 
L
P
 
G
E
 
E
S
 
E
A
 
-
R
 
R
E
 
K
H
 
W
L
 
V
Y
x
H
F
 
Y
K
 
G
T
 
L
T
 
T
V
 
S
Q
 
T
D
 
D
V
 
V
T
 
V
D
 
D
T
 
T
W
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
Y
A
 
L
V
 
L
R
 
K
T
 
Q
V
 
A
G
 
N
G
 
D
I
 
I
V
 
L
W
 
L
R
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
E
A
 
R
I
 
F
E
 
V
A
 
D
R
 
I
L
 
I
L
 
K
E
 
E
L
 
K
S
 
A
A
 
K
Q
 
E
H
 
H
R
 
K
D
 
Y
T
 
T
L
 
V
M
 
M
C
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
T
H
|
H
G
 
G
Q
 
V
P
 
H
G
 
A
A
 
E
P
 
P
I
 
T
T
 
T
F
 
F
G
 
G
W
 
L
K
 
K
V
 
L
A
 
A
S
 
L
W
 
W
A
 
H
D
 
E
E
 
E
V
 
M
R
 
K
R
 
R
H
 
N
L
 
L
D
 
E
R
 
R
L
 
F
R
 
K
E
 
Q
G
 
A
S
 
K
D
 
A
R
 
G
W
 
I
L
 
E
T
 
V
V
 
G
Q
 
K
L
 
I
G
 
S
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
T
L
 
Y
V
 
A
D
 
N
A
 
I
G
 
D
P
 
P
S
 
F
A
 
-
L
 
-
E
 
-
V
 
V
R
 
E
A
 
Q
R
 
Y
F
 
V
A
 
C
A
 
E
E
 
K
L
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
K
E
 
A
P
 
A
R
 
P
I
 
I
S
 
S
W
 
T
L
x
Q
S
 
T
-
 
L
S
 
Q
R
 
R
D
 
D
R
 
R
P
 
H
A
 
A
E
 
D
F
 
Y
G
 
M
H
 
A
L
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
L
I
 
I
C
 
A
G
 
T
T
 
S
L
 
I
A
 
E
R
 
K
I
 
F
G
 
A
G
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
R
E
 
G
L
 
L
Q
 
Q
R
 
K
P
 
S
E
 
E
I
 
T
G
 
R
E
 
E
L
 
V
A
 
E
E
 
E
P
 
F
R
 
F
P
 
A
A
 
K
G
 
G
V
 
Q
V
 
K
G
 
G
S
 
S
I
 
S
T
 
A
M
 
M
H
 
P
H
 
H
K
 
K
R
 
R
N
|
N
P
 
P
E
 
I
G
 
G
S
 
S
E
 
E
H
 
N
L
 
M
D
 
T
T
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
V
A
 
I
R
 
R
S
 
G
S
 
Y
S
 
M
G
 
M
V
 
T
L
 
A
S
 
Y
E
 
E
S
 
N
V
 
V
V
 
P
S
 
L
Q
 
W
H
 
H
E
 
E
R
|
R
D
 
D
G
 
I
R
 
S
A
 
H
W
 
S
K
 
S
A
 
A
E
 
E
W
 
R
V
 
I
A
 
I
L
 
L
P
 
P
E
 
D
V
 
A
C
 
T
L
 
I
L
 
A
T
 
L
G
 
N
S
 
Y
A
 
M
L
 
L
S
 
N
L
 
R
T
 
F
R
 
S
R
 
N
L
 
I
V
 
V
D
 
K
G
 
N
L
 
L
E
 
T
I
 
V
D
 
F
E
 
P
D
 
E
R
 
N
M
 
M
T
 
K
A
 
R
N
 
N
L
 
M
R
 
D
T
 
R
H
 
T
L
 
L
G
 
G

A0A0K2JL82 Nitrosuccinate lyase; EC 4.3.99.5 from Streptomyces cremeus (see paper)
38% identity, 87% coverage: 16:361/400 of query aligns to 29:385/476 of A0A0K2JL82

query
sites
A0A0K2JL82
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
-
V
 
V
R
 
E
E
 
A
V
 
L
F
 
V
D
 
C
E
 
D
S
 
S
A
 
A
R
 
W
V
 
L
Q
 
Q
G
 
A
W
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
A
L
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
R
S
 
T
G
 
G
L
 
F
I
 
L
P
 
P
L
 
A
S
 
A
S
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
L
Q
 
A
V
 
V
G
 
A
V
 
R
A
 
G
T
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
T
G
 
A
H
x
N
S
 
P
T
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
A
L
 
L
Q
 
T
P
 
A
L
 
A
L
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
D
P
 
D
E
 
P
S
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
E
H
 
Y
L
 
V
Y
 
H
F
 
R
K
 
G
T
 
S
T
 
T
V
 
S
Q
 
Q
D
|
D
V
 
V
T
 
L
D
 
D
T
 
T
W
 
G
T
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
V
V
 
A
R
 
R
T
x
R
V
 
A
G
 
L
G
x
R
I
 
L
V
 
I
W
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
L
R
 
D
A
 
R
I
 
A
E
 
A
A
 
D
R
 
A
L
 
L
L
 
A
E
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
A
Q
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
T
 
T
L
 
P
M
 
M
C
 
A
G
 
G
R
 
R
T
 
T
H
 
L
G
 
A
Q
 
L
P
 
H
G
 
A
A
 
V
P
 
P
I
 
T
T
 
T
F
 
F
G
 
G
W
 
L
K
 
K
V
 
A
A
 
A
S
 
G
W
 
W
A
 
L
D
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
S
E
 
E
V
 
A
R
 
A
R
 
G
H
 
R
L
 
V
D
 
A
R
 
R
L
 
L
R
|
R
E
 
D
G
 
G
S
 
-
D
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
T
 
P
V
 
F
Q
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
A
L
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
-
 
A
-
 
G
-
 
Y
-
 
F
-
 
G
-
 
D
-
 
R
V
 
T
D
 
D
A
 
R
G
 
G
-
 
D
P
 
P
S
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
L
V
 
D
R
 
R
A
 
L
-
 
L
-
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
A
E
 
R
P
 
P
R
 
V
I
 
L
S
 
P
W
 
W
L
x
H
S
 
V
S
 
L
R
 
R
D
 
T
R
 
P
P
 
V
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
A
H
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
F
I
 
T
C
 
A
G
 
G
T
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
K
I
 
I
G
 
A
G
 
V
E
 
D
V
 
V
Y
 
Q
E
 
S
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
P
 
T
E
 
E
I
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
A
P
 
V
A
 
E
G
 
G
V
 
R
V
 
G
G
 
A
S
|
S
I
 
S
T
 
A
M
 
M
H
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
R
N
|
N
P
 
P
E
 
V
G
 
L
S
 
S
E
 
T
H
 
L
L
 
I
D
 
R
T
 
S
L
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
Q
A
 
V
R
 
P
S
 
A
S
 
L
S
 
A
G
 
T
V
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
Q
S
 
C
V
 
L
V
 
V
S
 
S
Q
 
E
H
 
D
E
 
E
R
|
R
D
 
S
G
 
A
R
 
G
A
 
A
W
 
W
K
 
H
A
 
A
E
 
E
W
 
W
V
 
Q
A
 
P
L
 
L
P
 
R
E
 
E
V
 
C
C
 
L
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
A
L
 
A
S
 
R
L
 
T
T
 
A
R
 
V
R
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
V
D
 
D
E
 
A
D
 
A
R
 
R
M
 
M
T
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
L

5xnzA Crystal structure of cred complex with fumarate (see paper)
38% identity, 87% coverage: 16:361/400 of query aligns to 15:354/439 of 5xnzA

query
sites
5xnzA
G
 
G
T
 
T
P
 
P
E
 
-
V
 
V
R
 
E
E
 
A
V
 
L
F
 
V
D
 
C
E
 
D
S
 
S
A
 
A
R
 
W
V
 
L
Q
 
Q
G
 
A
W
 
M
L
 
L
D
 
D
V
 
A
L
 
E
V
 
A
A
 
A
L
 
L
A
 
T
R
 
R
A
 
A
Q
 
Q
A
 
A
A
 
R
S
 
T
G
 
G
L
 
F
I
 
L
P
 
P
L
 
A
S
 
A
S
 
A
A
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
A
 
T
E
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
R
V
 
A
D
 
D
R
 
R
L
 
I
D
 
D
L
 
L
D
 
L
Q
 
A
V
 
V
G
 
A
V
 
R
A
 
G
T
 
A
R
 
R
E
 
E
T
 
T
G
 
A
H
x
N
S
 
P
T
 
V
L
 
V
G
 
G
L
 
L
I
 
V
R
 
A
E
 
A
L
 
L
Q
 
T
P
 
A
L
 
A
L
 
V
-
 
R
-
 
R
-
 
D
P
 
D
E
 
P
S
 
A
A
 
A
R
 
A
E
 
E
H
 
Y
L
 
V
Y
 
H
F
 
R
K
 
G
T
 
S
T
 
T
V
 
S
Q
 
Q
D
 
D
V
 
V
T
 
L
D
 
D
T
 
T
W
 
G
T
 
A
A
 
M
L
 
L
A
 
V
V
 
A
R
 
R
T
x
R
V
 
A
G
 
L
G
x
R
I
 
L
V
 
I
W
 
G
R
 
D
D
 
D
L
 
L
R
 
D
A
 
R
I
 
A
E
 
A
A
 
D
R
 
A
L
 
L
L
 
A
E
 
A
L
 
L
S
 
A
A
 
A
Q
 
D
H
 
H
R
 
R
D
 
D
T
 
T
L
 
P
M
 
M
C
 
A
G
 
G
R
 
R
T
|
T
H
x
L
G
 
A
Q
 
L
P
 
H
G
 
A
A
 
V
P
 
P
I
 
T
T
 
T
F
 
F
G
 
G
W
 
L
K
 
K
V
 
A
A
 
A
S
 
G
W
 
W
A
 
L
D
 
E
-
 
L
-
 
V
-
 
S
E
 
E
V
 
A
R
 
A
R
 
G
H
 
R
L
 
V
D
 
A
R
 
R
L
 
L
R
|
R
E
 
D
G
 
G
S
 
-
D
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
L
T
 
P
V
 
F
Q
 
S
L
 
L
G
 
G
G
 
G
G
 
A
L
 
A
G
 
G
T
 
T
L
 
L
V
 
A
D
 
G
A
 
Y
-
 
F
G
 
D
P
 
P
S
 
A
A
 
V
L
 
L
E
 
L
V
 
D
R
 
R
A
 
L
-
 
L
-
 
D
R
 
A
F
 
Y
A
 
A
A
 
A
E
 
E
L
 
T
G
 
G
L
 
L
N
 
A
E
 
R
P
 
P
R
 
V
I
 
L
S
 
P
W
 
W
L
 
H
S
 
V
S
 
L
R
 
R
D
 
T
R
 
P
P
 
V
A
 
A
E
 
D
F
 
L
G
 
A
H
 
A
L
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
F
I
 
T
C
 
A
G
 
G
T
 
A
L
 
L
A
 
G
R
 
K
I
 
I
G
 
A
G
 
V
E
 
D
V
 
V
Y
 
Q
E
 
S
L
 
L
Q
 
A
R
 
R
P
 
T
E
 
E
I
 
V
G
 
A
E
 
E
L
 
V
A
 
A
E
 
E
P
 
P
R
 
A
P
 
P
A
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
T
 
-
M
 
-
H
 
-
H
 
H
K
|
K
R
 
R
N
|
N
P
 
P
E
 
V
G
 
L
S
 
S
E
x
T
H
 
L
L
 
I
D
 
R
T
 
S
L
 
A
A
 
A
R
 
L
L
 
Q
A
 
V
R
 
P
S
 
A
S
 
L
S
 
A
G
 
T
V
 
G
L
 
L
S
 
T
E
 
Q
S
 
C
V
 
L
V
 
V
S
 
S
Q
 
E
H
 
D
E
 
E
R
 
R
D
 
S
G
 
A
R
 
G
A
 
A
W
 
W
K
 
H
A
 
A
E
 
E
W
 
W
V
 
Q
A
 
P
L
 
L
P
 
R
E
 
E
V
 
C
C
 
L
L
 
R
L
 
L
T
 
T
G
 
G
S
 
G
A
 
A
L
 
A
S
 
R
L
 
T
T
 
A
R
 
V
R
 
E
L
 
L
V
 
A
D
 
A
G
 
G
L
 
L
E
 
E
I
 
V
D
 
D
E
 
A
D
 
A
R
 
R
M
 
M
T
 
R
A
 
A
N
 
N
L
 
L

Q9X0I0 Adenylosuccinate lyase; ASL; Adenylosuccinase; ASase; EC 4.3.2.2 from Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8) (see paper)
29% identity, 86% coverage: 20:361/400 of query aligns to 10:345/431 of Q9X0I0

query
sites
Q9X0I0
V
 
M
R
 
K
E
 
D
V
 
L
F
 
W
D
 
T
E
 
E
S
 
E
A
 
A
R
 
K
V
 
Y
Q
 
R
G
 
R
W
 
W
L
 
L
D
 
E
V
 
V
L
 
E
V
 
L
A
 
A
L
 
V
A
 
T
R
 
R
A
 
A
Q
 
Y
A
 
E
A
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
M
I
 
I
P
 
P
L
 
K
S
 
G
S
 
V
A
 
T
E
 
E
A
 
R
I
 
I
A
 
R
E
 
N
A
 
N
A
 
A
K
 
K
V
 
I
D
 
D
R
 
-
L
 
-
D
 
-
L
 
V
D
 
E
Q
 
L
V
 
F
G
 
K
V
 
K
A
 
I
T
 
E
R
 
E
E
 
K
T
 
T
G
 
N
H
 
H
S
 
D
T
 
V
L
 
V
G
 
A
L
 
F
I
 
V
R
 
E
E
 
G
L
 
I
Q
 
G
P
 
S
L
 
M
L
 
I
P
 
G
E
 
E
S
 
D
A
 
S
R
 
R
E
 
-
H
 
F
L
 
F
Y
 
H
F
 
Y
K
 
G
T
 
L
T
 
T
V
 
S
Q
 
S
D
 
D
V
 
V
T
 
L
D
 
D
T
 
T
W
 
A
T
 
N
A
 
S
L
 
L
A
 
A
V
 
L
R
 
V
T
 
E
V
 
A
G
 
G
G
 
K
I
 
I
V
 
L
W
 
L
R
 
E
D
 
S
L
 
L
R
 
K
A
 
E
I
 
F
E
 
C
A
 
D
R
 
V
L
 
L
L
 
W
E
 
E
L
 
V
S
 
A
A
 
N
Q
 
R
H
 
Y
R
 
K
D
 
H
T
 
T
L
 
P
M
 
T
C
 
I
G
 
G
R
 
R
T
 
T
H
|
H
G
 
G
Q
 
V
P
 
H
G
 
A
A
 
E
P
 
P
I
 
T
T
 
S
F
 
F
G
 
G
W
 
L
K
 
K
V
 
V
A
 
L
S
 
G
W
 
W
A
 
Y
D
 
S
E
 
E
V
 
M
R
 
K
R
 
R
H
 
N
L
 
V
D
 
Q
R
 
R
L
 
L
R
 
E
E
 
R
G
 
A
S
 
I
D
 
E
R
 
E
W
 
V
L
 
S
T
 
Y
V
 
G
Q
 
K
L
 
I
G
 
S
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
N
L
 
Y
V
 
A
D
 
N
A
 
V
G
 
P
P
 
P
S
 
-
A
 
-
L
 
-
E
 
E
V
 
V
R
 
E
A
 
E
R
 
K
F
 
A
A
 
L
A
 
S
E
 
Y
L
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
K
-
 
P
E
 
E
P
 
P
R
 
V
I
 
S
S
 
T
W
 
Q
L
 
V
S
 
V
S
 
P
R
 
R
D
 
D
R
 
R
P
 
H
A
 
A
E
 
F
F
 
Y
G
 
L
H
 
S
L
 
T
L
 
L
A
 
A
M
 
I
I
 
V
C
 
A
G
 
A
T
 
G
L
 
I
A
 
E
R
 
R
I
 
I
G
 
A
G
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
R
E
 
H
L
 
L
Q
 
Q
R
 
R
P
 
T
E
 
E
I
 
V
G
 
L
E
 
E
L
 
V
A
 
E
E
 
E
P
 
P
R
 
F
P
 
R
A
 
K
G
 
G
V
 
Q
V
 
R
G
 
G
S
 
S
I
 
S
T
 
A
M
 
M
H
 
P
H
 
H
K
 
K
R
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
I
G
 
T
S
 
C
E
 
E
H
 
R
L
 
L
D
 
T
T
 
G
L
 
L
A
 
S
R
 
R
L
 
M
A
 
M
R
 
R
S
 
A
S
 
Y
S
 
V
G
 
D
V
 
P
L
 
S
S
 
L
E
 
E
S
 
N
V
 
I
V
 
A
S
 
L
Q
 
W
H
 
H
E
 
E
R
 
R
D
 
D
G
 
I
R
 
S
A
 
H
W
 
S
K
 
S
A
 
V
E
 
E
W
 
R
V
 
Y
A
 
V
L
 
F
P
 
P
E
 
D
V
 
A
C
 
T
L
 
Q
L
 
T
T
 
L
G
 
Y
S
 
Y
A
 
M
L
 
I
S
 
V
L
 
T
T
 
A
R
 
T
R
 
N
L
 
V
V
 
V
D
 
R
G
 
N
L
 
M
E
 
K
I
 
V
D
 
N
E
 
E
D
 
E
R
 
R
M
 
M
T
 
K
A
 
K
N
 
N
L
 
I

5hw2A Crystal structure of adenylosuccinate lyase from francisella tularensis complexed with fumaric acid
24% identity, 87% coverage: 15:363/400 of query aligns to 5:335/419 of 5hw2A

query
sites
5hw2A
W
 
Y
G
 
D
T
 
V
P
 
A
E
 
E
V
 
I
R
 
S
E
 
K
V
 
I
F
 
W
D
 
A
E
 
D
S
 
E
A
 
N
R
 
K
V
 
Y
Q
 
A
G
 
K
W
 
M
L
 
L
D
 
E
V
 
V
L
 
E
V
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
L
R
 
E
A
 
A
Q
 
-
A
 
L
A
 
E
S
 
D
G
 
R
L
 
M
I
 
V
P
 
P
L
 
K
S
 
G
S
 
T
A
 
A
E
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
R
E
 
A
A
 
R
A
 
A
K
 
Q
V
 
I
D
 
R
R
 
P
L
 
E
D
 
R
L
 
V
D
 
D
Q
 
E
V
 
I
G
 
E
V
 
K
A
 
V
T
 
T
R
 
K
E
 
-
T
 
-
G
 
-
H
|
H
S
 
D
T
 
I
L
 
I
G
 
A
L
 
F
I
 
C
R
 
T
E
 
S
L
 
I
Q
 
A
P
 
E
L
 
Q
L
 
F
P
 
T
E
 
A
S
 
E
A
 
T
R
 
G
E
 
K
H
 
F
L
 
F
Y
x
H
F
 
F
K
 
G
T
 
V
T
|
T
V
x
S
Q
 
S
D
 
D
V
 
I
T
 
I
D
 
D
T
 
S
W
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
D
V
 
S
G
 
M
G
 
S
I
 
Y
V
 
V
W
 
I
R
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
C
A
 
D
R
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
T
L
 
K
S
 
A
A
 
E
Q
 
E
H
 
T
R
 
K
D
 
E
T
 
I
L
 
I
M
 
T
C
 
M
G
 
G
R
 
R
T
x
S
H
|
H
G
 
G
Q
 
M
P
 
F
G
 
A
A
 
E
P
 
P
I
 
M
T
 
S
F
 
F
G
 
G
W
 
Q
K
 
K
V
 
F
A
 
L
S
 
G
W
 
A
A
 
Y
D
 
V
E
 
E
V
 
F
R
 
K
R
 
R
H
 
R
L
 
L
D
 
K
R
 
D
L
 
L
R
 
K
E
 
D
G
 
F
S
 
Q
D
 
K
R
 
D
W
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
Q
 
Q
L
 
F
G
 
S
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
N
L
 
Y
V
 
C
D
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
I
S
 
L
A
 
T
L
 
T
E
 
E
V
 
D
R
 
E
A
 
K
R
 
K
F
 
A
A
 
A
A
 
D
E
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
P
E
 
V
P
 
E
R
 
E
I
 
V
S
 
S
-
 
T
W
 
Q
L
 
V
S
 
I
S
 
P
R
 
R
D
 
D
R
 
R
P
 
I
A
 
A
E
 
K
F
 
L
G
 
I
H
 
S
L
 
I
L
 
H
A
 
G
M
 
L
I
 
I
C
 
A
G
 
S
T
 
A
L
 
I
A
 
E
R
 
R
I
 
L
G
 
A
G
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
R
E
 
H
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
P
 
S
E
 
D
I
 
V
G
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
Y
E
 
E
P
 
G
R
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
T
 
-
M
 
-
H
 
-
H
 
F
K
|
K
R
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
I
G
 
S
S
 
T
E
|
E
H
 
N
L
 
L
D
 
T
T
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
L
R
 
R
S
 
S
S
 
H
S
 
V
G
 
S
V
 
I
L
 
A
S
 
L
E
 
E
S
 
N
V
 
C
V
 
V
S
 
L
Q
 
W
H
 
H
E
 
E
R
 
R
D
 
D
G
 
I
R
 
S
A
 
H
W
 
S
K
 
S
A
 
A
E
 
E
W
 
R
V
 
F
A
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
 
D
V
 
N
C
 
F
L
 
G
L
 
I
T
 
M
G
 
V
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
R
L
 
R
T
 
M
R
 
K
R
 
N
L
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
N
L
 
L
E
 
V
I
 
V
D
 
Q
E
 
R
D
 
D
R
 
I
M
 
I
T
 
E
A
 
D
N
 
R
L
 
V
R
 
R
T
 
S

4eeiB Crystal structure of adenylosuccinate lyase from francisella tularensis complexed with amp and succinate
24% identity, 87% coverage: 15:363/400 of query aligns to 5:335/423 of 4eeiB

query
sites
4eeiB
W
 
Y
G
 
D
T
 
V
P
 
A
E
 
E
V
 
I
R
 
S
E
 
K
V
 
I
F
 
W
D
 
A
E
 
D
S
 
E
A
 
N
R
 
K
V
 
Y
Q
 
A
G
 
K
W
 
M
L
 
L
D
 
E
V
 
V
L
 
E
V
 
L
A
 
A
L
 
I
A
 
L
R
 
E
A
 
A
Q
 
-
A
 
L
A
 
E
S
 
D
G
 
R
L
 
M
I
 
V
P
 
P
L
 
K
S
 
G
S
 
T
A
 
A
E
 
A
A
 
E
I
 
I
A
 
R
E
 
A
A
 
R
A
 
A
K
 
Q
V
 
I
D
 
R
R
 
P
L
 
E
D
 
R
L
 
V
D
 
D
Q
 
E
V
 
I
G
 
E
V
 
K
A
 
V
T
 
T
R
x
K
E
 
-
T
 
-
G
 
-
H
|
H
S
x
D
T
 
I
L
 
I
G
 
A
L
 
F
I
 
C
R
 
T
E
 
S
L
 
I
Q
 
A
P
 
E
L
 
Q
L
 
F
P
 
T
E
 
A
S
 
E
A
 
T
R
 
G
E
 
K
H
 
F
L
 
F
Y
 
H
F
 
F
K
 
G
T
 
V
T
 
T
V
 
S
Q
 
S
D
 
D
V
 
I
T
 
I
D
 
D
T
 
S
W
 
A
T
 
L
A
 
S
L
 
L
A
 
Q
V
 
I
R
 
R
T
 
D
V
 
S
G
 
M
G
 
S
I
 
Y
V
 
V
W
 
I
R
 
K
D
 
D
L
 
L
R
 
E
A
 
A
I
 
L
E
 
C
A
 
D
R
 
S
L
 
L
L
 
L
E
 
T
L
 
K
S
 
A
A
 
E
Q
 
E
H
 
T
R
 
K
D
 
E
T
 
I
L
 
I
M
 
T
C
 
M
G
 
G
R
 
R
T
x
S
H
|
H
G
 
G
Q
 
M
P
 
F
G
 
A
A
 
E
P
 
P
I
 
M
T
 
S
F
 
F
G
 
G
W
 
Q
K
 
K
V
 
F
A
 
L
S
 
G
W
 
A
A
 
Y
D
 
V
E
 
E
V
 
F
R
 
K
R
 
R
H
 
R
L
 
L
D
 
K
R
 
D
L
 
L
R
 
K
E
 
D
G
 
F
S
 
Q
D
 
K
R
 
D
W
 
G
L
 
L
T
 
T
V
 
V
Q
 
Q
L
 
F
G
 
S
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
N
L
 
Y
V
 
C
D
 
-
A
 
-
G
 
-
P
 
I
S
 
L
A
 
T
L
 
T
E
 
E
V
 
D
R
 
E
A
 
K
R
 
K
F
 
A
A
 
A
A
 
D
E
 
I
L
 
L
G
 
G
L
 
L
N
 
P
E
 
V
P
 
E
R
 
E
I
 
V
S
 
S
-
 
T
W
x
Q
L
 
V
S
 
I
S
 
P
R
 
R
D
 
D
R
 
R
P
 
I
A
 
A
E
 
K
F
 
L
G
 
I
H
 
S
L
 
I
L
 
H
A
 
G
M
 
L
I
 
I
C
 
A
G
 
S
T
 
A
L
 
I
A
 
E
R
 
R
I
 
L
G
 
A
G
 
V
E
 
E
V
 
I
Y
 
R
E
 
H
L
 
L
Q
 
H
R
 
R
P
 
S
E
 
D
I
 
V
G
 
F
E
 
E
L
 
V
A
 
Y
E
 
E
P
 
G
R
 
-
P
 
-
A
 
-
G
 
-
V
 
-
V
 
-
G
 
-
S
 
-
I
 
-
T
 
-
M
 
-
H
 
-
H
 
F
K
|
K
R
 
K
N
 
N
P
 
P
E
 
I
G
 
S
S
 
T
E
|
E
H
 
N
L
 
L
D
 
T
T
 
G
L
 
M
A
 
A
R
 
R
L
 
M
A
 
L
R
 
R
S
 
S
S
 
H
S
 
V
G
 
S
V
 
I
L
 
A
S
 
L
E
 
E
S
 
N
V
 
C
V
 
V
S
 
L
Q
 
W
H
 
H
E
 
E
R
|
R
D
 
D
G
x
I
R
 
S
A
 
H
W
x
S
K
 
S
A
 
A
E
 
E
W
x
R
V
 
F
A
 
Y
L
 
L
P
 
P
E
 
D
V
 
N
C
 
F
L
 
G
L
 
I
T
 
M
G
 
V
S
 
Y
A
 
A
L
 
L
S
 
R
L
 
R
T
 
M
R
 
K
R
 
N
L
 
T
V
 
I
D
 
D
G
 
N
L
 
L
E
 
V
I
 
V
D
 
Q
E
 
R
D
 
D
R
 
I
M
 
I
T
 
E
A
 
D
N
 
R
L
 
V
R
 
R
T
 
S

3gzhA Crystal structure of phosphate-bound adenylosuccinate lyase from e. Coli (see paper)
27% identity, 68% coverage: 20:291/400 of query aligns to 36:324/469 of 3gzhA

query
sites
3gzhA
V
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
I
F
 
F
D
 
S
E
 
E
S
 
Y
A
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
G
 
V
W
 
E
L
 
V
D
 
R
V
 
W
L
 
L
V
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
-
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
I
G
 
K
L
 
E
I
 
V
P
 
P
L
 
A
S
 
F
S
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
D
A
 
A
E
 
I
A
 
V
A
 
A
K
 
N
V
 
F
D
 
S
R
 
E
L
 
E
D
 
D
L
 
A
D
 
A
Q
 
R
V
 
I
G
 
K
V
 
T
A
 
I
T
 
E
R
 
R
E
 
T
T
 
T
G
 
N
H
|
H
S
 
D
T
 
V
L
 
K
G
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
L
 
F
I
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
K
Q
 
V
P
 
A
L
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
H
S
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
E
H
 
F
L
 
I
Y
 
H
F
 
F
K
 
A
T
 
C
T
|
T
V
x
S
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
N
D
 
N
T
 
L
W
 
S
T
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
M
V
 
L
R
 
K
T
 
T
V
 
A
G
 
R
G
 
D
I
 
E
V
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
W
 
W
R
 
R
D
 
Q
L
 
L
R
 
-
A
 
-
I
 
I
E
 
D
A
 
G
R
 
-
L
 
I
L
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
A
A
 
V
Q
 
Q
H
 
Y
R
 
R
D
 
D
T
 
I
L
 
P
M
 
L
C
 
L
G
 
S
R
 
R
T
|
T
H
|
H
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
G
 
A
A
 
T
P
 
P
I
 
S
T
 
T
F
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
E
V
 
M
A
 
A
S
 
N
W
 
V
A
 
A
D
 
Y
E
 
R
V
 
M
R
 
E
R
 
R
H
 
Q
L
 
Y
D
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
G
 
V
S
 
E
D
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
I
T
 
L
V
 
G
Q
 
K
L
 
I
G
 
N
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
N
L
 
Y
-
 
N
-
 
A
-
 
H
V
 
I
D
 
A
A
 
A
G
 
Y
P
 
P
S
 
E
A
 
V
-
 
D
-
 
W
L
 
H
E
 
Q
V
 
F
R
 
S
A
 
E
R
 
E
F
 
F
A
 
V
A
 
T
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
N
 
Q
-
 
W
E
 
N
P
 
P
R
 
Y
I
 
T
S
 
T
W
 
Q
L
 
I
S
 
E
S
 
P
R
 
H
D
 
D
R
 
Y
P
 
I
A
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
F
H
 
D
L
 
C
L
 
V
A
 
A
M
 
R
I
 
F
C
 
N
G
 
T
T
 
I
L
 
L
A
 
I
R
 
D
I
 
F
G
 
D
G
 
R
E
 
D
V
 
V
Y
 
W
E
 
-
L
 
-
Q
 
G
R
 
Y
P
 
I
E
 
A
I
 
L
G
 
N
E
 
H
L
 
F
A
 
K
E
 
Q
P
 
K
R
 
T
P
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
x
S
T
 
T
M
 
M
H
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
V
N
 
N
P
 
P
-
 
I
-
 
D
-
 
F
E
|
E
G
 
N
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

P0AB89 Adenylosuccinate lyase; ASL; Adenylosuccinase; ASase; EC 4.3.2.2 from Escherichia coli (strain K12) (see 2 papers)
27% identity, 68% coverage: 20:291/400 of query aligns to 23:311/456 of P0AB89

query
sites
P0AB89
V
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
I
F
 
F
D
 
S
E
 
E
S
 
Y
A
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
G
 
V
W
 
E
L
 
V
D
 
R
V
 
W
L
 
L
V
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
-
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
I
G
 
K
L
 
E
I
 
V
P
 
P
L
 
A
S
 
F
S
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
D
A
 
A
E
 
I
A
 
V
A
 
A
K
 
S
V
 
F
D
 
S
R
 
E
L
 
E
D
 
D
L
 
A
D
 
A
Q
 
R
V
 
I
G
 
K
V
 
T
A
 
I
T
 
E
R
 
R
E
 
T
T
 
T
G
x
N
H
|
H
S
x
D
T
 
V
L
x
K
G
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
L
 
F
I
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
K
Q
 
V
P
 
A
L
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
H
S
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
E
H
 
F
L
 
I
Y
 
H
F
 
F
K
 
A
T
 
C
T
|
T
V
x
S
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
N
D
 
N
T
 
L
W
 
S
T
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
M
V
 
L
R
 
K
T
 
T
V
 
A
G
 
R
G
 
D
I
 
E
V
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
W
 
W
R
 
R
D
 
Q
L
 
L
R
 
-
A
 
-
I
 
I
E
 
D
A
 
G
R
 
-
L
 
I
L
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
A
A
 
V
Q
 
Q
H
 
Y
R
 
R
D
 
D
T
 
I
L
 
P
M
 
L
C
 
L
G
 
S
R
 
R
T
 
T
H
|
H
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
G
 
A
A
 
T
P
 
P
I
 
S
T
 
T
F
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
E
V
 
M
A
 
A
S
 
N
W
 
V
A
 
A
D
 
Y
E
 
R
V
 
M
R
 
E
R
 
R
H
 
Q
L
 
Y
D
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
G
 
V
S
 
E
D
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
I
T
 
L
V
 
G
Q
 
K
L
 
I
G
 
N
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
N
L
 
Y
-
 
N
-
 
A
-
 
H
V
 
I
D
 
A
A
 
A
G
 
Y
P
 
P
S
 
E
A
 
V
-
 
D
-
 
W
L
 
H
E
 
Q
V
 
F
R
 
S
A
 
E
R
 
E
F
 
F
A
 
V
A
 
T
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
N
 
Q
-
 
W
E
 
N
P
 
P
R
 
Y
I
 
T
S
 
T
W
x
Q
L
 
I
S
 
E
S
 
P
R
 
H
D
 
D
R
 
Y
P
 
I
A
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
F
H
 
D
L
 
C
L
 
V
A
 
A
M
 
R
I
 
F
C
 
N
G
 
T
T
 
I
L
 
L
A
 
I
R
 
D
I
 
F
G
 
D
G
 
R
E
 
D
V
 
V
Y
 
W
E
 
-
L
 
-
Q
 
G
R
 
Y
P
 
I
E
 
A
I
 
L
G
 
N
E
 
H
L
 
F
A
 
K
E
 
Q
P
 
K
R
 
T
P
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
I
G
 
G
S
|
S
I
x
S
T
 
T
M
 
M
H
 
P
H
 
H
K
|
K
R
x
V
N
|
N
P
 
P
-
 
I
-
 
D
-
 
F
E
 
E
G
x
N
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2ptqA Crystal structure of escherichia coli adenylosuccinate lyase mutant h171n with bound amp and fumarate (see paper)
27% identity, 68% coverage: 20:291/400 of query aligns to 23:311/459 of 2ptqA

query
sites
2ptqA
V
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
I
F
 
F
D
 
S
E
 
E
S
 
Y
A
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
G
 
V
W
 
E
L
 
V
D
 
R
V
 
W
L
 
L
V
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
-
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
I
G
 
K
L
 
E
I
 
V
P
 
P
L
 
A
S
 
F
S
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
D
A
 
A
E
 
I
A
 
V
A
 
A
K
 
S
V
 
F
D
 
S
R
 
E
L
 
E
D
 
D
L
 
A
D
 
A
Q
 
R
V
 
I
G
 
K
V
 
T
A
 
I
T
 
E
R
 
R
E
 
T
T
 
T
G
x
N
H
|
H
S
 
D
T
 
V
L
 
K
G
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
L
 
F
I
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
K
Q
 
V
P
 
A
L
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
H
S
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
E
H
 
F
L
 
I
Y
 
H
F
 
F
K
 
A
T
 
C
T
|
T
V
x
S
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
N
D
 
N
T
 
L
W
 
S
T
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
M
V
 
L
R
 
K
T
 
T
V
 
A
G
 
R
G
 
D
I
 
E
V
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
W
 
W
R
 
R
D
 
Q
L
 
L
R
 
-
A
 
-
I
 
I
E
 
D
A
 
G
R
 
-
L
 
L
L
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
A
A
 
V
Q
 
Q
H
 
Y
R
 
R
D
 
D
T
 
I
L
 
P
M
 
L
C
 
L
G
 
S
R
 
R
T
|
T
H
x
N
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
G
 
A
A
 
T
P
 
P
I
 
S
T
 
T
F
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
E
V
 
M
A
 
A
S
 
N
W
 
V
A
 
A
D
 
Y
E
 
R
V
 
M
R
 
E
R
 
R
H
 
Q
L
 
Y
D
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
G
 
V
S
 
E
D
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
I
T
 
L
V
 
G
Q
 
K
L
 
I
G
 
N
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
N
L
 
Y
-
 
N
-
 
A
-
 
H
V
 
I
D
 
A
A
 
A
G
 
Y
P
 
P
S
 
E
A
 
V
-
 
D
-
 
W
L
 
H
E
 
Q
V
 
F
R
 
S
A
 
E
R
 
E
F
 
F
A
 
V
A
 
T
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
N
 
Q
-
 
W
E
 
N
P
 
P
R
 
Y
I
 
T
S
 
T
W
x
Q
L
 
I
S
 
E
S
 
P
R
 
H
D
 
D
R
 
Y
P
 
I
A
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
F
H
 
D
L
 
C
L
 
V
A
 
A
M
 
R
I
 
F
C
 
N
G
 
T
T
 
I
L
 
L
A
 
I
R
 
D
I
 
F
G
 
D
G
 
R
E
 
D
V
 
V
Y
 
W
E
 
-
L
 
-
Q
 
G
R
 
Y
P
 
I
E
 
A
I
 
L
G
 
N
E
 
H
L
 
F
A
 
K
E
 
Q
P
 
K
R
 
T
P
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
I
G
 
G
S
|
S
I
x
S
T
 
T
M
|
M
H
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
V
N
|
N
P
 
P
-
 
I
-
 
D
-
 
F
E
|
E
G
x
N
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

2ptrA Crystal structure of escherichia coli adenylosuccinate lyase mutant h171a with bound adenylosuccinate substrate (see paper)
27% identity, 68% coverage: 20:291/400 of query aligns to 23:311/454 of 2ptrA

query
sites
2ptrA
V
 
L
R
 
R
E
 
G
V
 
I
F
 
F
D
 
S
E
 
E
S
 
Y
A
 
G
-
 
L
-
 
L
-
 
K
-
 
F
R
 
R
V
 
V
Q
 
Q
G
 
V
W
 
E
L
 
V
D
 
R
V
 
W
L
 
L
V
 
Q
A
 
K
L
 
L
A
 
A
R
 
-
A
 
A
Q
 
H
A
 
A
A
 
A
S
 
I
G
 
K
L
 
E
I
 
V
P
 
P
L
 
A
S
 
F
S
 
A
A
 
A
E
 
D
A
 
A
I
 
I
-
 
G
-
 
Y
-
 
L
-
 
D
A
 
A
E
 
I
A
 
V
A
 
A
K
 
S
V
 
F
D
 
S
R
 
E
L
 
E
D
 
D
L
 
A
D
 
A
Q
 
R
V
 
I
G
 
K
V
 
T
A
 
I
T
 
E
R
 
R
E
 
T
T
 
T
G
 
N
H
|
H
S
x
D
T
 
V
L
 
K
G
 
A
-
 
V
-
 
E
-
 
Y
L
 
F
I
 
L
R
 
K
E
 
E
L
 
K
Q
 
V
P
 
A
L
 
E
L
 
I
P
 
P
E
 
E
-
 
L
-
 
H
S
 
A
A
 
V
R
 
S
E
 
E
H
 
F
L
 
I
Y
 
H
F
 
F
K
 
A
T
 
C
T
|
T
V
x
S
Q
 
E
D
 
D
V
 
I
T
 
N
D
 
N
T
 
L
W
 
S
T
 
H
A
 
A
L
 
L
A
 
M
V
 
L
R
 
K
T
 
T
V
 
A
G
 
R
G
 
D
I
 
E
V
 
V
-
 
I
-
 
L
-
 
P
-
 
Y
W
 
W
R
 
R
D
 
Q
L
 
L
R
 
-
A
 
-
I
 
I
E
 
D
A
 
G
R
 
-
L
 
L
L
 
K
E
 
D
L
 
L
S
 
A
A
 
V
Q
 
Q
H
 
Y
R
 
R
D
 
D
T
 
I
L
 
P
M
 
L
C
 
L
G
 
S
R
 
R
T
|
T
H
x
A
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
G
 
A
A
 
T
P
 
P
I
 
S
T
 
T
F
 
I
G
 
G
W
 
K
K
 
E
V
 
M
A
 
A
S
 
N
W
 
V
A
 
A
D
 
Y
E
 
R
V
 
M
R
 
E
R
 
R
H
 
Q
L
 
Y
D
 
R
R
 
Q
L
 
L
R
 
N
E
 
Q
G
 
V
S
 
E
D
 
-
R
 
-
W
 
-
L
 
I
T
 
L
V
 
G
Q
 
K
L
 
I
G
 
N
G
 
G
G
 
A
L
 
V
G
 
G
T
 
N
L
 
Y
-
 
N
-
 
A
-
 
H
V
 
I
D
 
A
A
 
A
G
 
Y
P
 
P
S
 
E
A
 
V
-
 
D
-
 
W
L
 
H
E
 
Q
V
 
F
R
 
S
A
 
E
R
 
E
F
 
F
A
 
V
A
 
T
E
 
S
L
 
L
G
 
G
L
 
I
N
 
Q
-
 
W
E
 
N
P
 
P
R
 
Y
I
 
T
S
 
T
W
x
Q
L
 
I
S
 
E
S
 
P
R
 
H
D
 
D
R
 
Y
P
 
I
A
 
A
E
 
E
F
 
L
G
 
F
H
 
D
L
 
C
L
 
V
A
 
A
M
 
R
I
 
F
C
 
N
G
 
T
T
 
I
L
 
L
A
 
I
R
 
D
I
 
F
G
 
D
G
 
R
E
 
D
V
 
V
Y
 
W
E
 
-
L
 
-
Q
 
G
R
 
Y
P
 
I
E
 
A
I
 
L
G
 
N
E
 
H
L
 
F
A
 
K
E
 
Q
P
 
K
R
 
T
P
 
I
A
 
A
G
 
G
V
 
E
V
 
I
G
 
G
S
|
S
I
x
S
T
 
T
M
|
M
H
 
P
H
 
H
K
|
K
R
 
V
N
|
N
P
 
P
-
 
I
-
 
D
-
 
F
E
|
E
G
x
N
S
 
S
E
 
E

Sites not aligning to the query:

G4VQX9 Adenylosuccinate lyase; ADSL; Adenylosuccinase; SmADSL; EC 4.3.2.2 from Schistosoma mansoni (Blood fluke) (see paper)
22% identity, 88% coverage: 15:365/400 of query aligns to 15:372/480 of G4VQX9

query
sites
G4VQX9
W
x
Y
G
 
A
T
 
S
P
 
R
E
 
E
V
 
M
R
 
V
E
 
C
V
 
N
F
 
F
D
 
G
E
 
E
S
 
K
A
 
R
R
 
K
V
 
V
Q
 
I
G
 
L
W
 
W
L
 
R
D
 
Q
V
 
L
L
 
W
V
 
I
A
 
W
L
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
T
Q
 
Q
A
 
K
A
 
E
S
 
L
G
 
G
L
 
F
I
 
-
P
 
D
L
 
I
S
 
T
S
 
D
A
 
E
E
 
Q
A
 
I
I
 
N
A
 
E
E
 
M
A
 
K
A
 
S
K
 
Q
V
 
R
D
 
D
R
 
S
L
 
V
D
 
D
L
 
F
D
 
G
Q
 
T
V
 
A
G
 
A
V
 
A
A
 
E
T
 
E
R
 
K
E
 
A
T
 
R
G
x
R
H
|
H
S
x
D
T
 
V
L
 
M
G
 
A
L
 
H
I
 
V
R
 
Y
E
 
T
L
 
F
Q
 
A
P
 
L
L
 
A
L
 
C
P
 
P
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
-
E
 
P
H
 
I
L
 
I
Y
 
H
F
 
L
K
 
G
T
 
A
T
 
T
V
 
S
Q
 
C
D
 
F
V
 
V
T
 
G
D
 
D
T
 
N
W
 
A
T
 
D
A
 
L
L
 
I
A
 
M
V
 
L
R
 
K
T
 
D
V
 
G
G
 
L
G
 
N
I
 
I
V
 
L
W
 
L
R
 
P
D
 
K
L
 
V
R
 
A
A
 
R
I
 
C
E
 
I
A
 
D
R
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
K
L
 
K
S
 
A
A
 
M
Q
 
L
H
 
H
R
 
K
D
 
S
T
 
L
L
 
I
M
 
C
C
 
L
G
 
A
R
 
R
T
 
T
H
 
H
G
 
L
Q
 
Q
P
 
P
G
 
A
A
 
Q
P
 
P
I
 
T
T
 
T
F
 
M
G
 
G
W
 
R
K
 
R
V
 
I
A
 
C
S
 
M
W
 
W
A
 
I
D
 
Q
E
 
D
V
 
L
R
 
L
R
 
L
H
 
D
L
 
L
D
 
E
R
 
N
L
 
L
R
 
E
E
 
R
G
 
L
S
 
K
D
 
N
R
 
H
W
 
-
L
 
-
T
 
T
V
 
I
Q
 
R
L
 
F
G
 
R
G
 
G
G
 
A
L
 
K
G
 
G
T
 
A
L
 
V
V
 
G
D
 
T
A
 
Q
G
 
A
P
 
S
S
 
F
A
 
M
L
 
D
E
 
L
V
 
F
R
 
Q
A
 
G
R
 
D
F
 
H
A
 
Q
A
 
K
E
 
V
L
 
I
G
 
K
L
 
L
N
 
D
E
 
E
P
 
I
-
 
L
-
 
T
-
 
K
-
 
K
-
 
S
-
 
G
-
 
F
R
 
Q
I
 
R
S
 
S
W
 
W
L
 
C
S
 
V
S
 
T
-
 
G
-
x
Q
-
 
T
-
 
Y
-
 
P
R
 
R
D
 
K
R
 
V
P
 
D
A
 
I
E
 
E
F
 
I
G
 
T
H
 
N
L
 
A
L
 
L
A
 
S
M
 
N
I
 
I
C
 
G
G
 
A
T
 
T
L
 
V
A
 
H
R
 
K
I
 
I
G
 
C
G
 
T
E
 
D
V
 
I
Y
 
R
E
 
L
L
 
L
Q
 
S
R
 
-
P
 
-
E
 
S
I
 
F
G
 
H
E
 
E
L
 
V
A
 
E
E
 
E
P
 
P
R
 
F
P
 
E
A
 
T
G
 
K
V
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
 
S
I
 
S
T
 
A
M
 
M
H
 
P
H
 
Y
K
 
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
I
G
 
R
S
 
S
E
 
E
H
x
R
L
 
A
D
 
C
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
Y
L
 
L
A
 
M
R
 
H
S
 
I
S
 
S
S
 
T
G
 
S
V
 
M
L
 
V
S
 
S
E
 
T
S
 
V
V
 
S
V
 
V
S
 
Q
Q
 
W
H
 
L
E
 
E
R
 
R
D
 
S
G
 
L
R
 
D
A
 
D
W
x
S
K
 
A
A
 
I
E
 
R
W
x
R
V
 
I
A
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
V
 
A
C
 
F
L
 
L
L
 
A
T
 
A
G
 
D
S
 
A
A
 
C
L
 
L
S
 
T
L
 
L
T
 
L
R
 
Q
R
 
N
L
 
I
V
 
A
D
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
I
I
 
V
D
 
Y
E
 
P
D
 
M
R
 
V
M
 
M
T
 
E
A
 
A
N
 
N
L
 
L
R
 
N
T
 
S
H
 
E
L
 
L

Sites not aligning to the query:

5nx9D Crystal structure of neanderthal adenylosuccinate lyase (adsl) in complex with its products amp and fumarate (see paper)
21% identity, 85% coverage: 15:352/400 of query aligns to 14:357/477 of 5nx9D

query
sites
5nx9D
W
x
Y
G
 
A
T
 
S
P
 
P
E
 
E
V
 
M
R
 
C
E
 
F
V
 
V
F
 
F
D
 
S
E
 
D
S
 
R
A
 
Y
R
 
K
V
 
F
Q
 
R
G
 
T
W
 
W
L
 
R
D
 
Q
V
 
L
L
 
W
V
 
L
A
 
W
L
 
L
A
 
A
R
 
E
A
 
A
Q
 
E
A
 
Q
A
 
T
S
 
L
G
 
G
L
 
L
I
 
-
P
 
P
L
 
I
S
 
T
S
 
D
A
 
E
E
 
Q
A
 
I
I
 
Q
A
 
E
E
 
M
A
 
K
A
 
S
K
 
N
V
 
L
D
 
E
R
 
N
L
 
I
D
 
D
L
 
F
D
 
K
Q
 
M
V
 
A
G
 
A
V
 
E
A
 
E
T
 
E
R
 
K
E
 
R
T
 
L
G
x
R
H
|
H
S
x
D
T
 
V
L
 
M
G
 
A
L
 
H
I
 
V
R
 
H
E
 
T
L
 
F
Q
 
G
P
 
H
L
 
C
L
 
C
P
 
P
E
 
K
S
 
A
A
 
A
R
 
-
E
 
G
H
 
I
L
 
I
Y
 
H
F
 
L
K
 
G
T
 
A
T
 
T
V
x
S
Q
 
C
D
 
Y
V
 
V
T
 
G
D
 
D
T
 
N
W
 
T
T
 
D
A
 
L
L
 
I
A
 
I
V
 
L
R
 
R
T
 
N
V
 
A
G
 
L
G
 
D
I
 
L
V
 
L
W
 
L
R
 
P
D
 
K
L
 
L
R
 
A
A
 
R
I
 
V
E
 
I
A
 
S
R
 
R
L
 
L
L
 
A
E
 
D
L
 
F
S
 
A
A
 
K
Q
 
E
H
 
R
R
 
A
D
 
S
T
 
L
L
 
P
M
 
T
C
 
L
G
 
G
R
 
F
T
|
T
H
|
H
G
 
F
Q
 
Q
P
 
P
G
 
A
A
 
Q
P
 
L
I
 
T
T
 
T
F
 
V
G
 
G
W
 
K
K
 
R
V
 
C
A
 
C
S
 
L
W
 
W
A
 
I
D
 
Q
E
 
D
V
 
L
R
 
C
R
 
M
H
 
D
L
 
L
D
 
Q
R
 
N
L
 
L
R
 
K
E
 
R
G
 
V
S
 
R
D
 
D
R
 
D
W
 
L
L
 
R
T
 
F
V
 
R
Q
 
G
L
 
V
G
 
K
G
 
G
G
 
T
L
 
T
G
 
G
T
 
T
-
 
Q
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
L
-
 
Q
L
 
L
V
 
F
D
 
E
A
 
G
G
 
D
P
 
D
S
 
H
A
 
K
L
 
V
E
 
E
V
 
Q
R
 
L
A
 
D
R
 
K
F
 
M
A
 
V
A
 
T
E
 
E
-
 
K
L
 
A
G
 
G
L
 
F
N
 
K
E
 
R
P
 
A
R
 
F
I
 
I
-
 
I
-
 
T
S
 
G
W
x
Q
L
 
T
S
 
Y
S
 
T
R
 
R
D
 
K
R
 
V
P
 
D
A
 
I
E
 
E
F
 
V
G
 
L
H
 
S
L
 
V
L
 
L
A
 
A
M
 
S
I
 
L
C
 
G
G
 
A
T
 
S
L
 
V
A
 
H
R
 
K
I
 
I
G
 
C
G
 
T
E
 
D
V
 
I
Y
 
R
E
 
L
L
 
L
Q
 
-
R
 
-
P
 
A
E
 
N
I
 
L
G
 
K
E
 
E
L
 
M
A
 
E
E
 
E
P
 
P
R
 
F
P
 
E
A
 
K
G
 
Q
V
 
Q
V
 
I
G
 
G
S
|
S
I
x
S
T
 
A
M
 
M
H
 
P
H
 
Y
K
|
K
R
 
R
N
 
N
P
 
P
E
 
M
G
 
R
S
 
S
E
|
E
H
x
R
L
 
C
D
 
C
T
 
S
L
 
L
A
 
A
R
 
R
-
 
H
L
 
L
A
 
M
R
 
T
S
 
L
S
 
V
S
 
M
G
 
D
V
 
P
L
 
L
S
 
Q
E
 
T
S
 
A
V
 
S
V
 
V
S
 
Q
Q
 
W
H
 
F
E
 
E
R
 
R
D
 
T
G
x
L
R
 
D
A
 
D
W
x
S
K
x
A
A
 
N
E
 
R
W
x
R
V
 
I
A
 
C
L
 
L
P
 
A
E
 
E
V
 
A
C
 
F
L
 
L
L
 
T
T
 
A
G
 
D
S
 
T
A
 
I
L
 
L
S
 
N
L
 
T
T
 
L
R
 
Q
R
 
N
L
 
I
V
 
S
D
 
E
G
 
G
L
 
L
E
 
V
I
 
V

Sites not aligning to the query:

4efcA Crystal structure of adenylosuccinate lyase from trypanosoma brucei, tb427tmp.160.5560
26% identity, 67% coverage: 52:318/400 of query aligns to 81:340/452 of 4efcA

query
sites
4efcA
L
 
V
S
 
S
S
 
S
A
 
A
E
 
E
A
 
E
I
 
I
A
 
K
E
 
R
A
 
L
A
 
E
K
 
R
V
 
V
D
 
T
R
x
N
L
x
H
D
|
D
L
 
I
D
 
K
Q
 
A
V
 
V
G
 
E
V
 
Y
A
 
F
T
 
I
R
 
K
E
 
E
T
 
R
G
 
-
H
 
M
S
 
D
T
 
T
L
 
C
G
 
G
L
 
L
I
 
-
R
 
-
E
 
-
L
 
-
Q
 
-
P
 
-
L
 
-
L
 
-
P
 
-
E
 
S
S
 
H
A
 
V
R
 
T
E
 
E
H
 
F
L
 
V
Y
 
H
F
 
F
K
 
G
T
 
L
T
 
T
V
x
S
Q
|
Q
D
 
D
V
 
I
T
 
N
D
 
N
T
 
T
W
 
A
T
 
I
A
 
P
L
 
M
A
 
M
V
 
I
R
 
R
T
 
-
V
 
-
G
 
D
G
 
A
I
 
I
V
 
V
W
 
T
R
 
L
D
 
Y
L
 
L
R
 
P
A
 
A
I
 
L
E
 
D
A
 
G
R
 
I
L
 
I
L
 
G
E
 
S
L
 
L
S
 
T
A
 
S
Q
 
K
H
 
L
R
 
V
D
 
D
-
 
W
-
 
D
T
 
V
L
 
P
M
 
M
C
 
L
G
 
A
R
 
R
T
|
T
H
|
H
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
G
 
A
A
 
S
P
 
P
I
 
T
T
 
N
F
 
L
G
 
A
W