SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_110208130.1 NCBI__GCF_003194585.1:WP_110208130.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 8 hits to proteins with known functional sites (download)

2eb5A Crystal structure of hpcg complexed with oxalate (see paper)
33% identity, 94% coverage: 16:265/267 of query aligns to 11:258/259 of 2eb5A

query
sites
2eb5A
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
D
Q
 
Q
A
 
A
I
 
E
E
 
K
T
 
Q
H
 
R
T
 
E
P
 
Q
C
 
I
A
 
R
P
 
A
V
 
I
R
 
S
D
 
L
Q
 
D
I
 
Y
G
 
P
E
 
E
N
 
I
D
 
T
V
 
I
A
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
V
 
V
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
L
 
W
I
 
V
A
 
R
A
 
L
R
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
R
V
 
T
V
 
L
V
 
K
G
 
G
R
 
H
K
|
K
I
 
I
G
|
G
A
x
L
T
 
T
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
E
 
A
Q
 
S
L
 
S
G
 
Q
V
 
I
D
 
S
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
D
D
 
D
M
 
M
E
 
F
Y
 
F
R
 
H
E
 
D
D
 
G
Q
 
S
V
 
D
V
 
I
P
 
P
M
 
T
S
 
D
R
 
R
L
 
F
L
 
I
Q
 
V
P
 
P
K
 
R
V
 
I
E
|
E
A
 
V
E
|
E
V
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
L
 
L
G
 
A
E
 
K
D
 
P
L
 
L
A
 
R
D
 
G
G
 
P
P
 
N
L
 
C
D
 
T
V
 
L
A
 
F
Q
 
D
V
 
V
R
 
Y
G
 
N
A
 
A
I
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
V
V
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
I
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
C
E
 
H
N
 
-
W
 
-
N
 
N
I
 
I
S
 
K
F
 
V
G
 
F
D
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
A
S
 
N
G
 
A
L
 
G
Y
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
R
R
 
P
R
 
I
T
 
K
L
 
P
A
 
D
E
 
E
F
 
L
E
 
D
P
 
L
V
 
R
E
 
W
V
 
I
E
 
S
M
 
A
S
 
L
M
 
M
T
 
Y
I
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
V
E
 
I
V
 
E
S
 
E
T
 
T
G
 
G
N
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
C
 
V
L
 
L
G
 
N
D
 
H
P
 
P
L
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
V
S
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
R
 
N
Y
 
K
A
 
L
R
 
A
D
 
P
F
 
Y
G
 
D
V
 
V
P
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
L
 
I
L
 
L
S
 
G
G
|
G
A
x
S
L
 
F
G
 
T
P
 
R
M
 
P
R
 
V
P
 
P
V
 
A
E
 
R
P
 
K
G
 
G
Q
 
D
V
 
T
V
 
F
T
 
H
A
 
V
H
 
D
I
 
Y
S
 
G
S
 
N
L
 
M
G
 
G
T
 
S
A
 
I
T
 
S
A
 
C
T
 
R
F
 
F

2eb6A Crystal structure of hpcg complexed with mg ion (see paper)
32% identity, 94% coverage: 16:265/267 of query aligns to 11:266/267 of 2eb6A

query
sites
2eb6A
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
D
Q
 
Q
A
 
A
I
 
E
E
 
K
T
 
Q
H
 
R
T
 
E
P
 
Q
C
 
I
A
 
R
P
 
A
V
 
I
R
 
S
D
 
L
Q
 
D
I
 
Y
G
 
P
E
 
E
N
 
I
D
 
T
V
 
I
A
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
V
 
V
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
L
 
W
I
 
V
A
 
R
A
 
L
R
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
R
V
 
T
V
 
L
V
 
K
G
 
G
R
 
H
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
L
T
 
T
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
E
 
A
Q
 
S
L
 
S
G
 
Q
V
 
I
D
 
S
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
D
D
 
D
M
 
M
E
 
F
Y
 
F
R
 
H
E
 
D
D
 
G
Q
 
S
V
 
D
V
 
I
P
 
P
M
 
T
S
 
D
R
 
R
L
 
F
L
 
I
Q
 
V
P
 
P
K
 
R
V
 
I
E
|
E
A
 
V
E
|
E
V
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
L
 
L
G
 
A
E
 
K
D
 
P
L
 
L
A
 
R
D
 
G
G
 
P
P
 
N
L
 
C
D
 
T
V
 
L
A
 
F
Q
 
D
V
 
V
R
 
Y
G
 
N
A
 
A
I
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
V
V
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
I
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
C
E
 
H
N
 
N
W
 
I
N
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
Q
-
 
R
-
 
P
I
 
R
S
 
K
F
 
V
G
 
F
D
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
A
S
 
N
G
 
A
L
 
G
Y
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
R
R
 
P
R
 
I
T
 
K
L
 
P
A
 
D
E
 
E
F
 
L
E
 
D
P
 
L
V
 
R
E
 
W
V
 
I
E
 
S
M
 
A
S
 
L
M
 
M
T
 
Y
I
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
V
E
 
I
V
 
E
S
 
E
T
 
T
G
 
G
N
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
C
 
V
L
 
L
G
 
N
D
 
H
P
 
P
L
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
V
S
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
R
 
N
Y
 
K
A
 
L
R
 
A
D
 
P
F
 
Y
G
 
D
V
 
V
P
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
L
 
I
L
 
L
S
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
F
G
 
T
P
 
R
M
 
P
R
 
V
P
 
P
V
 
A
E
 
R
P
 
K
G
 
G
Q
 
D
V
 
T
V
 
F
T
 
H
A
 
V
H
 
D
I
 
Y
S
 
G
S
 
N
L
 
M
G
 
G
T
 
S
A
 
I
T
 
S
A
 
C
T
 
R
F
 
F

P42270 2-oxo-hept-4-ene-1,7-dioate hydratase; OHED hydratase; EC 4.2.1.163 from Escherichia coli (see paper)
32% identity, 94% coverage: 16:265/267 of query aligns to 11:266/267 of P42270

query
sites
P42270
A
 
A
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
I
 
D
Q
 
Q
A
 
A
I
 
E
E
 
K
T
 
Q
H
 
R
T
 
E
P
 
Q
C
 
I
A
 
R
P
 
A
V
 
I
R
 
S
D
 
L
Q
 
D
I
 
Y
G
 
P
E
 
E
N
 
I
D
 
T
V
 
I
A
 
E
A
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
A
V
 
V
Q
 
Q
E
 
R
Q
 
E
L
 
W
I
 
V
A
 
R
A
 
L
R
 
K
I
 
I
A
 
A
A
 
E
G
 
G
A
 
R
V
 
T
V
 
L
V
 
K
G
 
G
R
 
H
K
 
K
I
 
I
G
 
G
A
 
L
T
 
T
S
 
S
K
 
K
A
 
A
V
 
M
Q
 
Q
E
 
A
Q
 
S
L
 
S
G
 
Q
V
 
I
D
 
S
Q
 
E
P
 
P
D
 
D
F
 
Y
G
 
G
V
 
A
L
 
L
L
 
L
A
 
D
D
 
D
M
 
M
E
 
F
Y
 
F
R
 
H
E
 
D
D
 
G
Q
 
S
V
 
D
V
 
I
P
 
P
M
 
T
S
 
D
R
 
R
L
 
F
L
 
I
Q
 
V
P
 
P
K
 
R
V
 
I
E
|
E
A
 
V
E
|
E
V
 
L
A
 
A
F
 
F
V
 
V
L
 
L
G
 
A
E
 
K
D
 
P
L
 
L
A
 
R
D
 
G
G
 
P
P
 
N
L
 
C
D
 
T
V
 
L
A
 
F
Q
 
D
V
 
V
R
 
Y
G
 
N
A
 
A
I
 
T
D
 
D
Y
 
Y
A
 
V
V
 
I
A
 
P
A
 
A
L
 
L
E
|
E
I
 
L
V
 
I
D
 
D
S
 
A
R
 
R
I
 
C
E
 
H
N
 
N
W
 
I
N
 
D
-
 
P
-
 
E
-
 
T
-
 
Q
-
 
R
-
 
P
I
 
R
S
 
K
F
 
V
G
 
F
D
 
D
T
 
T
V
 
I
A
 
S
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
A
S
 
N
G
 
A
L
 
G
Y
 
V
V
 
I
L
 
L
G
 
G
S
 
G
Q
 
R
R
 
P
R
 
I
T
 
K
L
 
P
A
 
D
E
 
E
F
 
L
E
 
D
P
 
L
V
 
R
E
 
W
V
 
I
E
 
S
M
 
A
S
 
L
M
 
M
T
 
Y
I
 
R
D
 
N
G
 
G
V
 
V
E
 
I
V
 
E
S
 
E
T
 
T
G
 
G
N
 
V
G
 
A
A
 
A
A
 
G
C
 
V
L
 
L
G
 
N
D
 
H
P
 
P
L
 
A
N
 
N
A
 
G
V
 
V
S
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
A
R
 
N
Y
 
K
A
 
L
R
 
A
D
 
P
F
 
Y
G
 
D
V
 
V
P
 
Q
L
 
L
R
 
E
A
 
A
G
 
G
Q
 
Q
V
 
I
L
 
I
L
 
L
S
 
G
G
 
G
A
 
S
L
 
F
G
 
T
P
 
R
M
 
P
R
 
V
P
 
P
V
 
A
E
 
R
P
 
K
G
 
G
Q
 
D
V
 
T
V
 
F
T
 
H
A
 
V
H
 
D
I
 
Y
S
 
G
S
 
N
L
 
M
G
 
G
T
 
S
A
 
I
T
 
S
A
 
C
T
 
R
F
 
F

5d2kA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium and 2-oxoadipate (see paper)
35% identity, 88% coverage: 32:265/267 of query aligns to 29:262/263 of 5d2kA

query
sites
5d2kA
V
 
V
R
 
T
D
 
N
Q
 
D
I
 
F
G
 
P
E
 
E
N
 
M
D
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
D
V
 
V
Q
 
Q
E
 
W
Q
 
E
L
 
I
I
 
R
A
 
R
A
 
R
R
 
K
I
 
E
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
N
V
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
A
x
L
T
 
T
S
 
S
K
 
W
A
 
A
V
x
K
Q
 
M
E
 
A
Q
 
Q
L
x
M
G
 
G
V
 
V
D
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
V
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
D
 
Y
M
 
F
E
 
S
Y
 
V
R
 
P
E
 
D
D
 
G
Q
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
D
M
 
C
S
 
S
R
 
K
L
 
L
L
 
I
Q
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
I
E
|
E
A
 
A
E
|
E
V
 
I
A
 
S
F
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
K
E
 
A
D
 
P
L
 
L
A
 
H
D
 
G
G
 
P
P
 
G
L
 
C
D
 
H
V
 
L
A
 
G
Q
 
D
V
 
V
R
 
I
G
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
A
 
V
V
 
I
A
 
P
A
 
T
L
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
W
 
F
N
 
K
I
x
F
S
 
D
F
 
P
G
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
|
A
S
|
S
S
 
S
G
 
T
L
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
S
 
G
Q
 
R
R
 
M
R
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
E
E
 
E
F
 
V
E
 
D
P
 
L
V
 
R
E
 
T
V
 
L
E
 
G
M
 
V
S
 
V
M
 
M
T
 
E
I
 
K
D
 
N
G
 
G
V
 
E
E
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
C
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
H
P
 
P
L
 
L
N
 
S
A
 
S
V
 
V
S
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
N
Y
 
L
A
 
L
R
 
A
D
 
E
F
 
R
G
 
G
V
 
E
P
 
H
L
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
F
L
 
I
L
 
M
S
 
T
G
|
G
A
x
G
L
 
I
G
 
T
P
 
A
M
 
A
R
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
D
V
 
N
V
 
I
T
 
T
A
 
V
H
 
R
I
 
Y
S
 
Q
S
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
S
A
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
R
F
 
F

5d2jA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium and adipate (see paper)
35% identity, 88% coverage: 32:265/267 of query aligns to 29:262/263 of 5d2jA

query
sites
5d2jA
V
 
V
R
 
T
D
 
N
Q
 
D
I
 
F
G
 
P
E
 
E
N
 
M
D
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
D
V
 
V
Q
 
Q
E
 
W
Q
 
E
L
 
I
I
 
R
A
 
R
A
 
R
R
 
K
I
 
E
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
N
V
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
A
 
L
T
 
T
S
 
S
K
 
W
A
 
A
V
 
K
Q
 
M
E
 
A
Q
 
Q
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
V
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
D
 
Y
M
 
F
E
 
S
Y
 
V
R
 
P
E
 
D
D
 
G
Q
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
D
M
 
C
S
 
S
R
 
K
L
 
L
L
 
I
Q
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
I
E
|
E
A
 
A
E
|
E
V
 
I
A
 
S
F
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
K
E
 
A
D
 
P
L
 
L
A
 
H
D
 
G
G
 
P
P
 
G
L
 
C
D
 
H
V
 
L
A
 
G
Q
 
D
V
 
V
R
 
I
G
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
A
 
V
V
 
I
A
 
P
A
 
T
L
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
W
 
F
N
 
K
I
 
F
S
 
D
F
 
P
G
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
|
S
S
 
S
G
 
T
L
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
S
 
G
Q
 
R
R
 
M
R
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
E
E
 
E
F
 
V
E
 
D
P
 
L
V
 
R
E
 
T
V
 
L
E
 
G
M
 
V
S
 
V
M
 
M
T
 
E
I
 
K
D
 
N
G
 
G
V
 
E
E
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
C
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
H
P
 
P
L
 
L
N
 
S
A
 
S
V
 
V
S
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
N
Y
 
L
A
 
L
R
 
A
D
 
E
F
 
R
G
 
G
V
 
E
P
 
H
L
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
F
L
 
I
L
 
M
S
 
T
G
 
G
A
 
G
L
 
I
G
 
T
P
 
A
M
 
A
R
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
D
V
 
N
V
 
I
T
 
T
A
 
V
H
 
R
I
 
Y
S
 
Q
S
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
S
A
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
R
F
 
F

5d2iA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with calcium and acetate (see paper)
35% identity, 88% coverage: 32:265/267 of query aligns to 29:262/263 of 5d2iA

query
sites
5d2iA
V
 
V
R
 
T
D
 
N
Q
 
D
I
 
F
G
 
P
E
 
E
N
 
M
D
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
D
V
 
V
Q
 
Q
E
 
W
Q
 
E
L
 
I
I
 
R
A
 
R
A
 
R
R
 
K
I
 
E
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
N
V
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
A
 
L
T
 
T
S
 
S
K
 
W
A
 
A
V
 
K
Q
 
M
E
 
A
Q
 
Q
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
V
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
D
 
Y
M
 
F
E
 
S
Y
 
V
R
 
P
E
x
D
D
 
G
Q
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
D
M
 
C
S
 
S
R
 
K
L
 
L
L
 
I
Q
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
I
E
|
E
A
 
A
E
|
E
V
 
I
A
 
S
F
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
K
E
 
A
D
 
P
L
 
L
A
 
H
D
 
G
G
 
P
P
 
G
L
 
C
D
 
H
V
 
L
A
 
G
Q
 
D
V
 
V
R
 
I
G
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
A
 
V
V
 
I
A
 
P
A
 
T
L
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
W
 
F
N
 
K
I
 
F
S
 
D
F
 
P
G
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
T
L
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
S
 
G
Q
 
R
R
 
M
R
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
E
E
 
E
F
 
V
E
 
D
P
 
L
V
 
R
E
 
T
V
 
L
E
 
G
M
 
V
S
 
V
M
 
M
T
 
E
I
 
K
D
 
N
G
 
G
V
 
E
E
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
C
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
H
P
 
P
L
 
L
N
 
S
A
 
S
V
 
V
S
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
N
Y
 
L
A
 
L
R
 
A
D
 
E
F
 
R
G
 
G
V
 
E
P
 
H
L
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
F
L
 
I
L
 
M
S
 
T
G
 
G
A
 
G
L
 
I
G
 
T
P
 
A
M
 
A
R
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
D
V
 
N
V
 
I
T
 
T
A
 
V
H
 
R
I
 
Y
S
 
Q
S
 
G
L
 
L
G
 
G
T
x
S
A
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
R
F
 
F

5d2hA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium and alpha-ketoglutarate (see paper)
35% identity, 88% coverage: 32:265/267 of query aligns to 29:262/263 of 5d2hA

query
sites
5d2hA
V
 
V
R
 
T
D
 
N
Q
 
D
I
 
F
G
 
P
E
 
E
N
 
M
D
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
D
V
 
V
Q
 
Q
E
 
W
Q
 
E
L
 
I
I
 
R
A
 
R
A
 
R
R
 
K
I
 
E
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
N
V
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
L
K
|
K
I
 
M
G
|
G
A
x
L
T
 
T
S
 
S
K
 
W
A
 
A
V
x
K
Q
 
M
E
 
A
Q
 
Q
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
V
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
D
 
Y
M
 
F
E
 
S
Y
 
V
R
 
P
E
 
D
D
 
G
Q
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
D
M
 
C
S
 
S
R
 
K
L
 
L
L
 
I
Q
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
I
E
|
E
A
 
A
E
|
E
V
 
I
A
 
S
F
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
K
E
 
A
D
 
P
L
 
L
A
 
H
D
 
G
G
 
P
P
 
G
L
 
C
D
 
H
V
 
L
A
 
G
Q
 
D
V
 
V
R
 
I
G
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
A
 
V
V
 
I
A
 
P
A
 
T
L
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
W
 
F
N
 
K
I
 
F
S
 
D
F
 
P
G
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
|
A
S
 
S
S
 
S
G
 
T
L
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
S
 
G
Q
 
R
R
 
M
R
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
E
E
 
E
F
 
V
E
 
D
P
 
L
V
 
R
E
 
T
V
 
L
E
 
G
M
 
V
S
 
V
M
 
M
T
 
E
I
 
K
D
 
N
G
 
G
V
 
E
E
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
C
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
H
P
 
P
L
 
L
N
 
S
A
 
S
V
 
V
S
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
N
Y
 
L
A
 
L
R
 
A
D
 
E
F
 
R
G
 
G
V
 
E
P
 
H
L
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
F
L
 
I
L
 
M
S
 
T
G
 
G
A
 
G
L
 
I
G
 
T
P
 
A
M
 
A
R
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
D
V
 
N
V
 
I
T
 
T
A
 
V
H
 
R
I
 
Y
S
 
Q
S
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
S
A
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
R
F
 
F

5d2gA 4-oxalocrotonate decarboxylase from pseudomonas putida g7 - complexed with magnesium (see paper)
35% identity, 88% coverage: 32:265/267 of query aligns to 29:262/263 of 5d2gA

query
sites
5d2gA
V
 
V
R
 
T
D
 
N
Q
 
D
I
 
F
G
 
P
E
 
E
N
 
M
D
 
T
V
 
F
A
 
A
A
 
D
A
 
A
Y
 
Y
Q
 
D
V
 
V
Q
 
Q
E
 
W
Q
 
E
L
 
I
I
 
R
A
 
R
A
 
R
R
 
K
I
 
E
A
 
A
A
 
R
G
 
G
A
 
N
V
 
K
V
 
I
V
 
V
G
 
G
R
 
L
K
 
K
I
 
M
G
 
G
A
 
L
T
 
T
S
 
S
K
 
W
A
 
A
V
 
K
Q
 
M
E
 
A
Q
 
Q
L
 
M
G
 
G
V
 
V
D
 
E
Q
 
T
P
 
P
D
 
I
F
 
Y
G
 
G
V
 
F
L
 
L
L
 
A
A
 
D
D
 
Y
M
 
F
E
 
S
Y
 
V
R
 
P
E
 
D
D
 
G
Q
 
G
V
 
V
V
 
V
P
 
D
M
 
C
S
 
S
R
 
K
L
 
L
L
 
I
Q
 
H
P
 
P
K
 
K
V
 
I
E
|
E
A
 
A
E
|
E
V
 
I
A
 
S
F
 
V
V
 
V
L
 
T
G
 
K
E
 
A
D
 
P
L
 
L
A
 
H
D
 
G
G
 
P
P
 
G
L
 
C
D
 
H
V
 
L
A
 
G
Q
 
D
V
 
V
R
 
I
G
 
A
A
 
A
I
 
I
D
 
D
Y
 
Y
A
 
V
V
 
I
A
 
P
A
 
T
L
 
V
E
|
E
I
 
V
V
 
I
D
 
D
S
 
S
R
 
R
I
 
Y
E
 
E
N
 
N
W
 
F
N
 
K
I
 
F
S
 
D
F
 
P
G
 
I
D
 
S
T
 
V
V
 
V
A
 
A
D
 
D
N
 
N
A
 
A
S
 
S
S
 
S
G
 
T
L
 
R
Y
 
F
V
 
I
L
 
T
G
 
G
S
 
G
Q
 
R
R
 
M
R
 
A
T
 
S
L
 
L
A
 
E
E
 
E
F
 
V
E
 
D
P
 
L
V
 
R
E
 
T
V
 
L
E
 
G
M
 
V
S
 
V
M
 
M
T
 
E
I
 
K
D
 
N
G
 
G
V
 
E
E
 
V
V
 
V
S
 
E
T
 
L
G
 
G
N
 
A
G
 
G
A
 
A
A
 
A
C
 
V
L
 
L
G
 
G
D
 
H
P
 
P
L
 
L
N
 
S
A
 
S
V
 
V
S
 
A
W
 
M
L
 
L
A
 
A
R
 
N
Y
 
L
A
 
L
R
 
A
D
 
E
F
 
R
G
 
G
V
 
E
P
 
H
L
 
I
R
 
P
A
 
A
G
 
G
Q
 
T
V
 
F
L
 
I
L
 
M
S
 
T
G
 
G
A
 
G
L
 
I
G
 
T
P
 
A
M
 
A
R
 
V
P
 
P
V
 
V
E
 
A
P
 
P
G
 
G
Q
 
D
V
 
N
V
 
I
T
 
T
A
 
V
H
 
R
I
 
Y
S
 
Q
S
 
G
L
 
L
G
 
G
T
 
S
A
 
V
T
 
S
A
 
A
T
 
R
F
 
F

Query Sequence

>WP_110208130.1 NCBI__GCF_003194585.1:WP_110208130.1
MTTQPAASPEAIDTAARRLIQAIETHTPCAPVRDQIGENDVAAAYQVQEQLIAARIAAGA
VVVGRKIGATSKAVQEQLGVDQPDFGVLLADMEYREDQVVPMSRLLQPKVEAEVAFVLGE
DLADGPLDVAQVRGAIDYAVAALEIVDSRIENWNISFGDTVADNASSGLYVLGSQRRTLA
EFEPVEVEMSMTIDGVEVSTGNGAACLGDPLNAVSWLARYARDFGVPLRAGQVLLSGALG
PMRPVEPGQVVTAHISSLGTATATFSS

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory