SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_110805778.1 NCBI__GCF_003217355.1:WP_110805778.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P05414 Glycolate oxidase; GAO; GOX; Short chain alpha-hydroxy acid oxidase; EC 1.1.3.15 from Spinacia oleracea (Spinach) (see 4 papers)
37% identity, 96% coverage: 4:376/387 of query aligns to 3:354/369 of P05414

query
sites
P05414
I
 
I
T
 
T
C
 
N
I
 
V
D
 
N
D
 
E
L
 
Y
K
 
E
A
 
A
L
 
I
H
 
A
R
 
K
K
 
Q
R
 
K
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
 
Y
E
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
T
 
D
E
 
Q
Q
 
W
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
E
N
 
N
T
 
R
T
 
N
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
I
R
 
L
L
 
F
R
 
R
Q
 
P
K
 
R
V
 
I
A
 
L
V
 
I
D
 
D
M
 
V
S
 
T
G
 
N
R
 
I
S
 
D
T
 
M
A
 
T
S
 
T
T
 
T
M
 
I
A
 
L
G
 
G
Q
 
F
P
 
K
V
 
I
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
M
L
 
I
A
 
A
P
|
P
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
K
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
K
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
A
F
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
I
F
 
M
T
 
T
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
T
S
 
G
P
 
P
D
 
G
P
 
I
F
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
L
|
L
Y
|
Y
V
 
V
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
N
F
 
V
V
 
V
D
 
A
A
 
Q
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
E
K
 
R
A
 
A
R
 
G
C
 
F
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
T
|
T
L
 
V
D
 
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
H
 
E
K
 
A
D
 
D
L
 
I
K
 
K
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
V
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
F
F
 
E
G
 
G
N
 
I
I
 
D
V
 
L
G
 
G
H
 
K
A
 
M
K
 
D
G
 
K
V
 
A
G
 
N
D
 
D
A
 
S
A
 
G
S
 
-
L
 
L
M
 
S
S
 
S
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
G
Q
 
Q
F
 
I
D
 
D
P
 
R
C
 
S
L
 
L
D
 
S
W
 
W
T
 
K
K
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
W
I
 
L
R
 
Q
D
 
T
Q
 
I
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
V
L
 
I
D
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
V
D
 
Q
F
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
A
A
 
G
I
 
I
I
 
I
V
 
V
S
|
S
N
 
N
H
 
H
G
 
G
G
 
A
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
Y
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
M
M
 
A
L
 
L
P
 
E
E
 
E
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
K
 
R
T
 
I
E
 
P
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
x
V
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
A
G
 
G
T
 
V
M
 
F
I
 
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
V
V
 
V
H
 
F
G
 
S
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
E
G
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
K
K
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
V
 
M
M
 
M
R
 
R
K
 
D
E
 
E
L
 
F
D
 
E
I
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
R
R
 
S
V
 
L
Q
 
K
D
 
E
L
 
I
G
 
S
R
 
R
D
 
S
N
 
H
L
 
I

Sites not aligning to the query:

1al7A Three-dimensional structures of glycolate oxidase with bound active- site inhibitors (see paper)
37% identity, 96% coverage: 4:376/387 of query aligns to 3:345/350 of 1al7A

query
sites
1al7A
I
 
I
T
 
T
C
 
N
I
 
V
D
 
N
D
 
E
L
 
Y
K
 
E
A
 
A
L
 
I
H
 
A
R
 
K
K
 
Q
R
 
K
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
T
 
D
E
 
Q
Q
 
W
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
E
N
 
N
T
 
R
T
 
N
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
I
R
 
L
L
 
F
R
 
R
Q
 
P
K
 
R
V
 
I
A
 
L
V
 
I
D
 
D
M
 
V
S
 
T
G
 
N
R
 
I
S
 
D
T
 
M
A
 
T
S
 
T
T
 
T
M
 
I
A
 
L
G
 
G
Q
 
F
P
 
K
V
 
I
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
M
L
 
I
A
 
A
P
|
P
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
K
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
K
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
A
F
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
I
F
 
M
T
 
T
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
T
S
 
G
P
 
P
D
 
G
P
 
I
F
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
N
F
 
V
V
 
V
D
 
A
A
 
Q
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
E
K
 
R
A
 
A
R
 
G
C
 
F
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
T
|
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
R
|
R
H
 
E
K
 
A
D
 
D
L
 
I
K
 
K
N
 
N
G
 
R
L
x
F
T
 
V
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
F
F
 
E
G
 
G
N
 
I
I
 
D
V
 
L
G
 
G
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
M
 
S
S
 
S
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
G
Q
 
Q
F
x
I
D
 
D
P
 
R
C
 
S
L
 
L
D
 
S
W
 
W
T
 
K
K
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
W
I
 
L
R
 
Q
D
 
T
Q
 
I
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
V
L
 
I
D
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
V
D
 
Q
F
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
A
A
 
G
I
 
I
I
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
Y
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
M
M
 
A
L
 
L
P
 
E
E
 
E
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
K
 
R
T
 
I
E
 
P
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
I
 
V
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
A
G
 
G
T
 
V
M
 
F
I
 
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
V
V
 
V
H
 
F
G
 
S
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
E
G
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
K
K
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
V
 
M
M
 
M
R
 
R
K
 
D
E
 
E
L
 
F
D
 
E
I
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
R
R
 
S
V
 
L
Q
 
K
D
 
E
L
 
I
G
 
S
R
 
R
D
 
S
N
 
H
L
 
I

5zbmB Structure of glycolate oxidase containing fmn from nicotiana benthamiana (see paper)
36% identity, 97% coverage: 4:377/387 of query aligns to 2:349/353 of 5zbmB

query
sites
5zbmB
I
 
V
T
 
T
C
 
N
I
 
V
D
 
M
D
 
E
L
 
Y
K
 
E
A
 
A
L
 
I
H
 
A
R
 
K
K
 
K
R
 
K
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
F
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
T
 
D
E
 
Q
Q
 
W
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
E
N
 
N
T
 
R
T
 
N
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
I
R
 
L
L
 
F
R
 
R
Q
 
P
K
 
R
V
 
I
A
 
L
V
 
I
D
 
D
M
 
V
S
 
S
G
 
K
R
 
I
S
 
D
T
 
M
A
 
S
S
 
T
T
 
T
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
F
P
 
K
V
 
I
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
M
L
 
I
A
 
A
P
|
P
V
x
T
G
 
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
K
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
K
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
A
F
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
I
F
 
M
T
 
T
L
 
L
S
 
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
T
S
 
G
P
 
P
D
 
G
P
 
I
F
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
N
F
 
V
V
 
V
D
 
A
A
 
Q
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
E
K
 
R
A
 
A
R
 
G
C
 
F
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
T
|
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
R
L
 
L
G
 
G
Q
 
R
R
 
R
H
 
E
K
 
A
D
 
D
L
 
I
K
 
K
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
V
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
E
A
 
G
K
 
L
G
 
D
V
 
L
G
 
G
D
 
K
A
 
D
A
 
S
S
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
S
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
G
Q
 
Q
F
 
I
D
 
D
P
 
R
C
 
T
L
 
L
D
 
S
W
 
W
T
 
K
K
 
D
I
 
V
A
 
Q
R
 
W
I
 
L
R
 
Q
D
 
T
Q
 
I
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
V
L
 
L
D
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
V
D
 
Q
F
 
A
G
 
G
A
 
A
D
 
A
A
 
G
I
 
I
I
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
Y
A
 
V
L
 
P
S
 
S
S
 
T
I
 
I
R
 
M
M
 
A
L
 
L
P
 
E
E
 
E
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
K
 
R
T
 
I
E
 
P
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
I
 
V
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
S
G
 
G
T
 
I
M
 
F
I
 
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
V
V
 
V
H
 
F
G
 
S
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
E
G
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
I
T
 
K
K
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
V
 
M
M
 
L
R
 
R
K
 
D
E
 
E
L
 
F
D
 
E
I
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
R
R
 
S
V
 
L
Q
 
N
D
 
E
L
 
I
G
 
T
R
 
R
D
 
N
N
 
H
L
 
I
L
 
V

6bfgA Crystal structure of monotopic membrane protein (s)-mandelate dehydrogenase (see paper)
38% identity, 96% coverage: 7:376/387 of query aligns to 6:370/373 of 6bfgA

query
sites
6bfgA
I
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
K
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
R
R
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
 
L
E
 
E
S
 
G
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
T
 
D
E
 
E
Q
 
Y
T
 
G
F
 
V
R
 
K
E
 
H
N
 
N
T
 
R
T
 
D
D
 
V
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
W
R
 
R
L
 
F
R
 
K
Q
 
P
K
 
K
V
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
D
M
 
V
S
 
S
G
 
R
R
 
R
S
 
S
T
 
L
A
 
Q
S
 
A
T
 
E
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
R
V
 
Q
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
L
A
 
L
L
 
I
A
 
G
P
|
P
V
x
T
G
|
G
L
 
L
L
 
N
G
 
G
M
 
A
Q
 
L
R
 
W
A
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
L
K
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
F
T
 
V
L
 
L
S
 
S
T
 
T
M
 
A
S
 
S
I
 
N
C
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
S
 
C
P
 
D
D
 
G
P
 
D
F
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
M
 
I
R
 
H
D
 
R
E
 
E
D
 
-
F
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
G
I
 
M
I
 
V
E
 
L
R
 
K
A
 
A
K
 
L
K
 
H
A
 
T
R
 
G
C
 
Y
S
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
 
T
D
|
D
L
 
V
Q
 
A
I
 
V
L
 
N
G
 
G
Q
 
Y
R
 
R
H
 
E
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
H
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
I
P
 
P
P
 
M
K
 
S
L
 
Y
T
 
S
P
 
A
A
 
K
N
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
D
M
 
G
A
 
C
T
 
L
K
 
H
L
 
P
T
 
R
W
 
W
G
 
S
R
 
L
E
 
D
M
 
F
L
 
V
A
 
R
T
 
H
P
 
G
R
 
M
R
 
P
F
 
Q
F
 
L
G
 
A
N
 
N
I
 
F
V
 
V
-
 
S
G
 
S
H
 
Q
A
 
T
K
 
S
G
 
S
V
 
L
G
 
E
D
 
M
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
L
 
L
M
 
M
S
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
S
E
 
R
Q
 
Q
F
 
M
D
 
D
P
 
A
C
 
S
L
 
F
D
 
N
W
 
W
T
 
E
K
 
A
I
 
L
A
 
R
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
L
W
 
W
G
 
P
G
 
H
K
 
K
F
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
R
A
 
C
A
 
I
D
 
A
F
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
C
A
 
A
L
 
I
S
 
S
S
 
P
I
 
M
R
 
E
M
 
V
L
 
L
P
 
A
E
 
Q
I
 
S
V
 
V
Q
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
-
K
 
-
T
 
K
E
 
P
V
 
V
W
 
L
L
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
I
 
F
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
G
 
A
T
 
V
M
 
L
I
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
Y
 
T
V
 
L
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
T
G
 
G
V
 
V
T
 
D
K
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
T
V
 
L
M
 
L
R
 
K
K
 
A
E
 
D
L
 
I
D
 
D
I
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
Q
C
 
I
G
 
G
E
 
C
K
 
P
R
 
D
V
 
I
Q
 
T
D
 
S
L
 
L
G
 
S
R
 
P
D
 
D
N
 
Y
L
 
L

P20932 (S)-mandelate dehydrogenase; MDH; L(+)-mandelate dehydrogenase; EC 1.1.99.31 from Pseudomonas putida (Arthrobacter siderocapsulatus) (see 3 papers)
38% identity, 96% coverage: 7:376/387 of query aligns to 8:372/393 of P20932

query
sites
P20932
I
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
K
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
R
R
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
 
Y
C
 
L
E
 
E
S
 
G
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
T
 
D
E
 
E
Q
 
Y
T
 
G
F
 
V
R
 
K
E
 
H
N
 
N
T
 
R
T
 
D
D
 
V
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
W
R
 
R
L
 
F
R
 
K
Q
 
P
K
 
K
V
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
D
M
 
V
S
 
S
G
 
R
R
 
R
S
 
S
T
 
L
A
 
Q
S
 
A
T
 
E
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
R
V
 
Q
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
L
A
 
L
L
 
I
A
 
G
P
|
P
V
x
T
G
|
G
L
 
L
L
 
N
G
 
G
M
 
A
Q
 
L
R
 
W
A
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
L
K
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
F
T
 
V
L
 
L
S
|
S
T
 
T
M
 
A
S
 
S
I
 
N
C
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
S
 
C
P
 
D
D
 
G
P
 
D
F
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
 
Y
V
 
V
M
 
I
R
 
H
D
 
R
E
 
E
D
 
-
F
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
G
I
 
M
I
 
V
E
 
L
R
 
K
A
 
A
K
 
L
K
 
H
A
 
T
R
 
G
C
 
Y
S
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
 
T
D
 
D
L
 
V
Q
 
A
I
 
V
L
 
N
G
 
G
Q
 
Y
R
 
R
H
 
E
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
H
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
I
P
 
P
P
 
M
K
 
S
L
 
Y
T
 
S
P
 
A
A
 
K
N
 
V
L
 
V
I
 
L
D
 
D
M
 
G
A
 
C
T
 
L
K
 
H
L
 
P
T
 
R
W
 
W
G
 
S
R
 
L
E
 
D
M
 
F
L
 
V
A
 
R
T
 
H
P
 
G
R
 
M
R
 
P
F
 
Q
F
 
L
G
 
A
N
 
N
I
 
F
V
 
V
-
 
S
G
 
S
H
 
Q
A
 
T
K
 
S
G
 
S
V
 
L
G
 
E
D
 
M
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
L
 
L
M
 
M
S
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
S
E
 
R
Q
 
Q
F
 
M
D
 
D
P
 
A
C
 
S
L
 
F
D
 
N
W
 
W
T
 
E
K
 
A
I
 
L
A
 
R
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
L
W
 
W
G
 
P
G
 
H
K
 
K
F
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
R
A
 
C
A
 
I
D
 
A
F
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
 
H
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
C
A
 
A
L
 
I
S
 
S
S
 
P
I
 
M
R
 
E
M
 
V
L
 
L
P
 
A
E
 
Q
I
 
S
V
 
V
Q
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
-
K
 
-
T
 
K
E
 
P
V
 
V
W
 
L
L
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
I
x
F
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
G
 
A
T
 
V
M
 
L
I
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
Y
 
T
V
 
L
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
T
G
 
G
V
 
V
T
 
D
K
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
T
V
 
L
M
 
L
R
 
K
K
 
A
E
 
D
L
 
I
D
 
D
I
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
Q
C
 
I
G
 
G
E
 
C
K
 
P
R
 
D
V
 
I
Q
 
T
D
 
S
L
 
L
G
 
S
R
 
P
D
 
D
N
 
Y
L
 
L

Q8Z0C8 L-lactate oxidase; LOX; Glyoxylate oxidase; No-LOX; EC 1.1.3.-; EC 1.2.3.5 from Nostoc sp. (strain PCC 7120 / SAG 25.82 / UTEX 2576) (see paper)
39% identity, 96% coverage: 1:371/387 of query aligns to 1:358/365 of Q8Z0C8

query
sites
Q8Z0C8
M
 
M
T
 
T
V
 
A
I
 
I
T
 
S
C
 
S
I
 
P
D
 
I
D
 
N
L
 
L
-
 
F
-
 
E
-
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
L
H
 
A
R
 
K
K
 
T
R
 
H
T
 
L
P
 
S
K
 
Q
M
 
M
F
 
A
Y
 
F
D
 
D
Y
 
Y
C
 
Y
E
 
I
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
G
T
 
D
E
 
E
Q
 
I
T
 
T
F
 
L
R
 
Q
E
 
E
N
 
N
T
 
R
T
 
A
D
 
V
F
 
F
A
 
E
Q
 
R
I
 
I
R
 
K
L
 
L
R
 
R
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
V
D
 
D
M
 
V
S
 
S
G
 
Q
R
 
I
S
 
N
T
 
L
A
 
T
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
P
V
 
L
A
 
Q
M
 
L
P
 
P
V
 
L
A
 
L
L
 
I
A
 
A
P
 
P
V
x
M
G
 
A
L
 
F
L
 
Q
G
 
C
M
 
L
Q
 
A
R
 
H
A
 
T
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
M
A
 
A
A
 
A
A
 
A
K
 
S
F
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
V
L
 
L
S
 
S
T
 
T
M
x
L
S
 
S
I
 
T
C
 
K
S
 
S
I
 
L
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
V
-
 
G
-
 
S
-
 
K
-
 
F
S
 
S
P
 
P
D
 
S
P
 
L
F
 
Q
W
 
W
F
 
F
Q
 
Q
L
 
L
Y
 
Y
V
 
I
M
 
H
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
G
F
 
L
V
 
T
D
 
R
A
 
A
I
 
L
I
 
V
E
 
E
R
 
R
A
 
A
K
 
Y
K
 
A
A
 
A
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
L
V
 
C
L
 
L
T
 
T
L
 
V
D
 
D
L
 
A
Q
 
P
I
 
V
L
 
L
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
H
 
E
K
 
R
D
 
D
L
 
R
K
 
R
N
 
N
G
 
E
L
 
F
T
 
V
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
G
L
 
L
T
 
H
P
 
L
A
 
A
N
 
N
L
 
L
I
 
T
D
 
T
M
 
I
A
 
S
T
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
G
N
 
L
I
 
N
V
 
I
G
 
P
H
 
H
A
 
A
K
 
P
G
 
G
V
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
E
A
 
S
S
 
G
L
 
L
M
 
F
S
 
T
W
 
Y
T
x
F
S
 
A
E
 
Q
Q
 
Q
F
 
L
D
 
N
P
 
P
C
 
A
L
 
L
D
 
T
W
 
W
T
 
D
K
 
D
I
 
L
A
 
E
R
 
W
I
 
L
R
 
Q
D
 
S
Q
 
L
W
 
S
G
 
P
G
 
L
K
 
P
F
 
L
I
 
V
L
 
L
K
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
A
A
 
R
A
 
A
A
 
V
D
 
E
F
 
Y
G
 
G
A
 
A
D
 
K
A
 
A
I
 
I
I
 
V
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
 
H
G
 
G
G
 
G
R
 
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
A
L
 
I
S
 
A
S
 
S
I
 
L
R
 
D
M
 
A
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
A
A
 
A
V
 
V
G
 
N
D
 
G
K
 
K
T
 
A
E
 
E
V
 
V
W
 
L
L
 
L
D
 
D
S
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
I
L
 
I
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
I
G
 
G
A
 
A
T
 
Q
G
 
A
T
 
V
M
 
L
I
 
I
G
 
G
R
 
R
A
 
P
Y
 
V
V
 
L
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
V
M
 
G
G
 
G
E
 
Q
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
S
K
 
H
A
 
V
L
 
I
E
 
S
V
 
L
M
 
L
R
 
Q
K
 
K
E
 
E
L
 
L
D
 
N
I
 
V
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
I
G
 
G
E
 
C
K
 
S
R
 
Q
V
 
L
Q
 
Q
D
 
D
L
 
I

6gmcA 1.2 a resolution structure of human hydroxyacid oxidase 1 bound with fmn and 4-carboxy-5-[(4-chlorophenyl)sulfanyl]-1,2,3-thiadiazole
34% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 5:351/360 of 6gmcA

query
sites
6gmcA
I
 
L
T
 
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
x
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
S
D
 
T
M
 
L
A
 
S
T
x
F
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
S
P
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
L
|
L
M
 
A
S
 
A
W
x
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

1huvA Crystal structure of a soluble mutant of the membrane-associated (s)- mandelate dehydrogenase from pseudomonas putida at 2.15a resolution (see paper)
39% identity, 96% coverage: 7:376/387 of query aligns to 5:346/349 of 1huvA

query
sites
1huvA
I
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
K
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
A
R
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
 
L
E
 
E
S
 
G
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
T
 
D
E
 
E
Q
 
Y
T
 
G
F
 
V
R
 
K
E
 
H
N
 
N
T
 
R
T
 
D
D
 
V
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
W
R
 
R
L
 
F
R
 
K
Q
 
P
K
 
K
V
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
D
M
 
V
S
 
S
G
 
R
R
 
R
S
 
S
T
 
L
A
 
Q
S
 
A
T
 
E
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
R
V
 
Q
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
L
A
 
L
L
 
I
A
 
G
P
|
P
V
x
T
G
|
G
L
 
L
L
 
N
G
 
G
M
 
A
Q
 
L
R
 
W
A
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
L
K
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
F
T
 
V
L
 
L
S
|
S
T
 
T
M
 
A
S
 
S
I
 
N
C
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
S
 
C
P
 
D
D
 
G
P
 
D
F
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
M
 
I
R
 
H
D
 
R
E
 
E
D
 
-
F
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
G
I
 
M
I
 
V
E
 
L
R
 
K
A
 
A
K
 
L
K
 
H
A
 
T
R
 
G
C
 
Y
S
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
 
T
D
|
D
L
 
V
Q
 
A
I
 
V
L
 
N
G
 
G
Q
 
Y
R
 
R
H
 
E
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
H
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
F
F
 
E
G
 
G
N
 
I
I
 
D
V
 
L
G
 
G
H
 
K
A
 
M
K
 
D
G
 
E
V
 
M
G
 
-
D
 
-
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
L
 
L
M
 
M
S
 
S
W
 
-
T
 
-
S
 
-
E
 
R
Q
 
Q
F
 
M
D
 
D
P
 
A
C
 
S
L
 
F
D
 
N
W
 
W
T
 
E
K
 
A
I
 
L
A
 
R
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
L
W
 
W
G
 
P
G
 
H
K
 
K
F
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
R
A
 
C
A
 
I
D
 
A
F
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
C
A
 
A
L
 
I
S
 
S
S
 
P
I
 
M
R
 
E
M
 
V
L
 
L
P
 
A
E
 
Q
I
 
S
V
 
V
Q
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
-
K
 
-
T
 
K
E
 
P
V
 
V
W
 
L
L
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
I
 
F
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
G
 
A
T
 
V
M
 
L
I
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
Y
 
T
V
 
L
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
T
G
 
G
V
 
V
T
 
D
K
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
T
V
 
L
M
 
L
R
 
K
K
 
A
E
 
D
L
 
I
D
 
D
I
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
Q
C
 
I
G
 
G
E
 
C
K
 
P
R
 
D
V
 
I
Q
 
T
D
 
S
L
 
L
G
 
S
R
 
P
D
 
D
N
 
Y
L
 
L

2a85A Crystal structure of the g81a mutant of the active chimera of (s)- mandelate dehydrogenase in complex with its substrate 2- hydroxyoctanoate (see paper)
38% identity, 96% coverage: 7:376/387 of query aligns to 5:350/353 of 2a85A

query
sites
2a85A
I
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
K
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
A
R
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
 
L
E
 
E
S
 
G
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
T
 
D
E
 
E
Q
 
Y
T
 
G
F
 
V
R
 
K
E
 
H
N
 
N
T
 
R
T
 
D
D
 
V
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
W
R
 
R
L
 
F
R
 
K
Q
 
P
K
 
K
V
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
D
M
 
V
S
 
S
G
 
R
R
 
R
S
 
S
T
 
L
A
 
Q
S
 
A
T
 
E
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
R
V
 
Q
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
L
A
 
L
L
 
I
A
 
G
P
|
P
V
x
T
G
x
A
L
 
L
L
 
N
G
 
G
M
 
A
Q
 
L
R
 
W
A
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
L
K
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
F
T
 
V
L
 
L
S
|
S
T
 
T
M
 
A
S
 
S
I
 
N
C
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
S
 
C
P
 
D
D
 
G
P
 
D
F
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
M
 
I
R
 
H
D
 
R
E
 
E
D
 
-
F
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
G
I
 
M
I
 
V
E
 
L
R
 
K
A
 
A
K
 
L
K
 
H
A
 
T
R
 
G
C
 
Y
S
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
 
T
D
|
D
L
 
V
Q
 
A
I
 
V
L
x
N
G
|
G
Q
 
Y
R
|
R
H
 
E
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
H
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
F
-
 
E
-
 
G
I
 
I
D
 
D
M
 
L
A
 
G
T
 
K
K
 
M
L
 
D
T
 
K
W
 
A
G
 
N
R
 
L
E
 
E
M
 
M
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
L
 
L
M
 
M
S
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
S
E
 
R
Q
 
Q
F
 
M
D
 
D
P
 
A
C
 
S
L
 
F
D
 
N
W
 
W
T
 
E
K
 
A
I
 
L
A
 
R
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
L
W
 
W
G
 
P
G
 
H
K
 
K
F
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
R
A
 
C
A
 
I
D
 
A
F
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
C
A
 
A
L
 
I
S
 
S
S
 
P
I
 
M
R
 
E
M
 
V
L
 
L
P
 
A
E
 
Q
I
 
S
V
 
V
Q
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
-
K
 
-
T
 
K
E
 
P
V
 
V
W
 
L
L
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
I
 
F
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
G
 
A
T
 
V
M
 
L
I
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
Y
 
T
V
 
L
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
T
G
 
G
V
 
V
T
 
D
K
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
T
V
 
L
M
 
L
R
 
K
K
 
A
E
 
D
L
 
I
D
 
D
I
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
Q
C
 
I
G
 
G
E
 
C
K
 
P
R
 
D
V
 
I
Q
 
T
D
 
S
L
 
L
G
 
S
R
 
P
D
 
D
N
 
Y
L
 
L

2a7pA Crystal structure of the g81a mutant of the active chimera of (s)- mandelate dehydrogenase in complex with its substrate 3-indolelactate (see paper)
38% identity, 96% coverage: 7:376/387 of query aligns to 5:350/353 of 2a7pA

query
sites
2a7pA
I
 
V
D
 
E
D
 
D
L
 
Y
K
 
R
A
 
K
L
 
L
H
 
A
R
 
Q
K
 
K
R
 
R
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
 
L
E
 
E
S
 
G
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
T
 
D
E
 
E
Q
 
Y
T
 
G
F
 
V
R
 
K
E
 
H
N
 
N
T
 
R
T
 
D
D
 
V
F
 
F
A
 
Q
Q
 
Q
I
 
W
R
 
R
L
 
F
R
 
K
Q
 
P
K
 
K
V
 
R
A
 
L
V
 
V
D
 
D
M
 
V
S
 
S
G
 
R
R
 
R
S
 
S
T
 
L
A
 
Q
S
 
A
T
 
E
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
K
P
 
R
V
 
Q
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
L
A
 
L
L
 
I
A
 
G
P
|
P
V
x
T
G
x
A
L
 
L
L
 
N
G
 
G
M
 
A
Q
 
L
R
 
W
A
 
P
D
 
K
G
 
G
E
 
D
I
 
L
K
 
A
A
 
L
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
T
K
 
K
F
 
A
G
 
G
V
 
I
P
 
P
F
 
F
T
 
V
L
 
L
S
|
S
T
 
T
M
 
A
S
 
S
I
 
N
C
 
M
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
D
V
 
L
A
 
A
A
 
R
Q
 
Q
S
 
C
P
 
D
D
 
G
P
 
D
F
 
L
W
 
W
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
M
 
I
R
 
H
D
 
R
E
 
E
D
 
-
F
 
I
V
 
A
D
 
Q
A
 
G
I
 
M
I
 
V
E
 
L
R
 
K
A
 
A
K
 
L
K
 
H
A
 
T
R
 
G
C
 
Y
S
 
T
A
 
T
L
 
L
V
 
V
L
 
L
T
|
T
L
 
T
D
|
D
L
 
V
Q
 
A
I
 
V
L
 
N
G
 
G
Q
 
Y
R
|
R
H
 
E
K
 
R
D
 
D
L
 
L
K
 
H
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
I
P
 
P
P
 
P
K
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
F
-
 
E
-
 
G
I
 
I
D
 
D
M
 
L
A
 
G
T
 
K
K
 
M
L
 
D
T
 
K
W
 
A
G
 
N
R
 
L
E
 
E
M
 
M
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
Q
A
 
A
S
 
A
L
 
L
M
 
M
S
 
-
W
 
-
T
 
-
S
 
S
E
 
R
Q
 
Q
F
 
M
D
 
D
P
 
A
C
 
S
L
 
F
D
 
N
W
 
W
T
 
E
K
 
A
I
 
L
A
 
R
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
D
Q
 
L
W
 
W
G
 
P
G
 
H
K
 
K
F
 
L
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
L
L
 
L
D
 
S
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
D
A
 
R
A
 
C
A
 
I
D
 
A
F
 
E
G
 
G
A
 
A
D
 
D
A
 
G
I
 
V
I
 
I
V
 
L
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
G
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
C
A
 
A
L
 
I
S
 
S
S
 
P
I
 
M
R
 
E
M
 
V
L
 
L
P
 
A
E
 
Q
I
 
S
V
 
V
Q
 
A
A
 
K
V
 
T
G
 
G
D
 
-
K
 
-
T
 
K
E
 
P
V
 
V
W
 
L
L
 
I
D
|
D
S
|
S
G
|
G
I
 
F
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
S
D
 
D
I
 
I
L
 
V
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
E
G
 
A
T
 
V
M
 
L
I
 
L
G
|
G
R
|
R
A
 
A
Y
 
T
V
 
L
H
 
Y
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
R
G
 
G
E
 
E
A
 
T
G
 
G
V
 
V
T
 
D
K
 
E
A
 
V
L
 
L
E
 
T
V
 
L
M
 
L
R
 
K
K
 
A
E
 
D
L
 
I
D
 
D
I
 
R
S
 
T
M
 
L
A
 
A
L
 
Q
C
 
I
G
 
G
E
 
C
K
 
P
R
 
D
V
 
I
Q
 
T
D
 
S
L
 
L
G
 
S
R
 
P
D
 
D
N
 
Y
L
 
L

Q9UJM8 2-Hydroxyacid oxidase 1; HAOX1; Glycolate oxidase; GO; GOX; Glyoxylate oxidase; EC 1.1.3.15; EC 1.2.3.5 from Homo sapiens (Human) (see 2 papers)
34% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 5:353/370 of Q9UJM8

query
sites
Q9UJM8
I
 
L
T
 
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
 
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
 
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
L
 
V
D
 
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
-
D
 
-
M
 
E
A
 
T
T
 
S
K
 
T
L
 
L
T
 
S
W
 
F
G
 
S
R
 
P
E
 
E
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
E
G
 
N
V
 
F
G
 
G
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
|
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
x
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

5qigA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z1407672867
35% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 2:350/359 of 5qigA

query
sites
5qigA
I
x
L
T
 
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
 
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
 
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
-
D
 
-
M
 
E
A
 
T
T
 
S
K
 
T
L
 
L
T
 
S
W
 
F
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
S
P
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
|
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
|
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
x
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
x
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
x
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

5qifA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z31792168
35% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 2:350/359 of 5qifA

query
sites
5qifA
I
 
L
T
 
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
 
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
 
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
-
D
 
-
M
 
E
A
 
T
T
 
S
K
 
T
L
 
L
T
 
S
W
 
F
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
S
P
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
|
R
D
x
R
Q
 
L
W
 
T
G
x
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

2rdwA Crystal structure of human glycolate oxidase in complex with sulfate (see paper)
35% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 2:350/359 of 2rdwA

query
sites
2rdwA
I
 
L
T
 
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
-
D
 
-
M
 
E
A
 
T
T
 
S
K
 
T
L
 
L
T
 
S
W
 
F
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
S
P
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

2rduA Crystal structure of human glycolate oxidase in complex with glyoxylate (see paper)
35% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 3:351/360 of 2rduA

query
sites
2rduA
I
 
L
T
 
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
-
D
 
-
M
 
E
A
 
T
T
 
S
K
 
T
L
 
L
T
 
S
W
 
F
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
S
P
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

6gmbA Structure of human hydroxyacid oxidase 1 bound with fmn and glycolate
35% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 5:353/362 of 6gmbA

query
sites
6gmbA
I
 
L
T
 
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
-
D
 
-
M
 
E
A
 
T
T
 
S
K
 
T
L
 
L
T
 
S
W
 
F
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
S
P
 
P
R
 
E
R
 
E
F
 
N
F
 
F
G
 
G
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
D
A
 
D
A
 
S
S
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
|
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

1al8A Three-dimensional structure of glycolate oxidase with bound active- site inhibitors (see paper)
35% identity, 96% coverage: 4:376/387 of query aligns to 3:339/344 of 1al8A

query
sites
1al8A
I
 
I
T
 
T
C
 
N
I
 
V
D
 
N
D
 
E
L
 
Y
K
 
E
A
 
A
L
 
I
H
 
A
R
 
K
K
 
Q
R
 
K
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
M
F
 
V
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
A
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
E
T
 
D
E
 
Q
Q
 
W
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
E
N
 
N
T
 
R
T
 
N
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
I
R
 
L
L
 
F
R
 
R
Q
 
P
K
 
R
V
 
I
A
 
L
V
 
I
D
 
D
M
 
V
S
 
T
G
 
N
R
 
I
S
 
D
T
 
M
A
 
T
S
 
T
T
 
T
M
 
I
A
 
L
G
 
G
Q
 
F
P
 
K
V
 
I
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
M
L
 
I
A
 
A
P
|
P
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
K
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
P
D
 
E
G
 
G
E
 
E
I
 
Y
K
 
A
A
 
T
A
 
A
R
 
R
A
 
A
A
 
A
A
 
S
K
 
A
F
 
A
G
 
G
V
 
T
P
 
I
F
 
M
T
 
T
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
V
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
Q
 
T
S
 
G
P
 
P
D
 
G
P
 
I
F
 
R
W
 
F
F
 
F
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
V
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
N
F
 
V
V
 
V
D
 
A
A
 
Q
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
R
A
 
A
K
 
E
K
 
R
A
 
A
R
 
G
C
 
F
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
T
|
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
R
L
 
L
G
 
-
Q
 
-
R
 
-
H
 
-
K
 
-
D
 
-
L
 
I
K
 
K
N
 
N
G
 
R
L
x
F
T
 
V
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
F
L
 
L
T
 
T
P
 
L
A
 
K
N
 
N
L
 
F
-
 
E
-
 
G
I
 
I
D
 
D
M
 
L
A
 
G
T
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
-
S
 
-
L
 
L
M
 
S
S
 
S
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
G
Q
 
Q
F
 
I
D
 
D
P
 
R
C
 
S
L
 
L
D
 
S
W
 
W
T
 
K
K
 
D
I
 
V
A
 
A
R
 
W
I
 
L
R
 
Q
D
 
T
Q
 
I
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
L
L
 
V
K
|
K
G
 
G
I
 
V
L
 
I
D
 
T
A
 
A
E
 
E
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
L
A
 
A
A
 
V
D
 
Q
F
 
H
G
 
G
A
 
A
D
 
A
A
 
G
I
 
I
I
 
I
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
 
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
Y
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
M
M
 
A
L
 
L
P
 
E
E
 
E
I
 
V
V
 
V
Q
 
K
A
 
A
V
 
A
G
 
Q
D
 
G
K
 
R
T
 
I
E
 
P
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
I
 
V
R
|
R
S
 
R
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
F
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
A
G
 
G
T
 
V
M
 
F
I
 
I
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
V
V
 
V
H
 
F
G
 
S
L
 
L
G
 
A
A
 
A
M
 
E
G
 
G
E
 
E
A
 
A
G
 
G
V
 
V
T
 
K
K
 
K
A
 
V
L
 
L
E
 
Q
V
 
M
M
 
M
R
 
R
K
 
D
E
 
E
L
 
F
D
 
E
I
 
L
S
 
T
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
R
R
 
S
V
 
L
Q
 
K
D
 
E
L
 
I
G
 
S
R
 
R
D
 
S
N
 
H
L
 
I

7r4nA Structure of human hydroxyacid oxidase 1 bound with 5-bromo-n-methyl- 1h-indazole-3-carboxamide
34% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 4:343/352 of 7r4nA

query
sites
7r4nA
I
 
L
T
 
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
x
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
|
T
L
 
V
D
 
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
|
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
x
M
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
S
D
 
T
M
 
L
A
 
S
T
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
F
G
 
S
N
 
D
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
-
A
 
S
S
 
G
L
 
L
M
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

5qieA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z2856434894
34% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 2:344/353 of 5qieA

query
sites
5qieA
I
 
L
T
x
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
 
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
 
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
 
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
 
M
A
 
K
N
 
N
L
 
-
I
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
F
F
 
E
G
 
T
N
 
S
I
 
T
V
 
L
G
 
S
H
 
F
A
 
S
K
 
P
G
 
D
V
 
S
G
 
G
D
 
L
A
 
A
A
 
A
S
 
-
L
 
-
M
 
-
S
 
-
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
x
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

5qihA Pandda analysis group deposition of models with modelled events (e.G. Bound ligands) -- crystal structure of hao1 in complex with z2697514548
33% identity, 95% coverage: 4:369/387 of query aligns to 2:335/344 of 5qihA

query
sites
5qihA
I
 
L
T
 
I
C
 
C
I
 
I
D
 
N
D
 
D
L
 
Y
K
 
E
A
 
Q
L
 
H
H
 
A
R
 
K
K
 
S
R
 
V
T
 
L
P
 
P
K
 
K
M
 
S
F
 
I
Y
 
Y
D
 
D
Y
|
Y
C
x
Y
E
 
R
S
 
S
G
 
G
S
 
A
Y
 
N
T
 
D
E
 
E
Q
 
E
T
 
T
F
 
L
R
 
A
E
 
D
N
 
N
T
 
I
T
 
A
D
 
A
F
 
F
A
 
S
Q
 
R
I
 
W
R
 
K
L
 
L
R
 
Y
Q
 
P
K
 
R
V
 
M
A
 
L
V
 
R
D
 
N
M
 
V
S
 
A
G
 
E
R
 
T
S
 
D
T
 
L
A
 
S
S
 
T
T
 
S
M
 
V
A
 
L
G
 
G
Q
 
Q
P
 
R
V
 
V
A
 
S
M
 
M
P
 
P
V
 
I
A
 
C
L
 
V
A
 
G
P
x
A
V
x
T
G
x
A
L
x
M
L
 
Q
G
 
R
M
 
M
Q
 
A
R
 
H
A
 
V
D
 
D
G
 
G
E
 
E
I
 
L
K
 
A
A
 
T
A
 
V
R
 
R
A
 
A
A
 
C
A
 
Q
K
 
S
F
 
L
G
 
G
V
 
T
P
 
G
F
 
M
T
 
M
L
 
L
S
|
S
T
 
S
M
x
W
S
 
A
I
 
T
C
 
S
S
 
S
I
 
I
E
 
E
D
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
Q
 
A
S
 
G
P
 
P
D
 
E
P
 
A
F
 
L
-
 
R
W
 
W
F
 
L
Q
|
Q
L
 
L
Y
|
Y
V
 
I
M
 
Y
R
 
K
D
 
D
E
 
R
D
 
E
F
 
V
V
 
T
D
 
K
A
 
K
I
 
L
I
 
V
E
 
R
R
 
Q
A
 
A
K
 
E
K
 
K
A
 
M
R
 
G
C
 
Y
S
 
K
A
 
A
L
 
I
V
 
F
L
 
V
T
 
T
L
 
V
D
|
D
L
 
T
Q
 
P
I
 
Y
L
 
L
G
 
G
Q
 
N
R
 
R
H
 
L
K
 
D
D
 
D
L
 
V
K
 
R
N
 
N
G
 
R
L
 
F
T
 
K
A
 
L
P
 
P
P
 
P
K
 
Q
L
 
L
T
 
R
P
x
M
A
 
K
N
 
N
L
 
F
I
 
-
D
 
-
M
 
-
A
 
-
T
 
-
K
 
-
L
 
-
T
 
-
W
 
-
G
 
-
R
 
-
E
 
-
M
 
-
L
 
-
A
 
-
T
 
-
P
 
-
R
 
-
R
 
-
F
 
-
F
 
-
G
 
-
N
 
-
I
 
-
V
 
-
G
 
-
H
 
-
A
 
-
K
 
-
G
 
-
V
 
-
G
 
-
D
 
-
A
 
D
A
 
S
S
 
G
L
|
L
M
 
A
S
 
A
W
 
Y
T
 
V
S
 
A
E
 
K
Q
 
A
F
 
I
D
 
D
P
 
P
C
 
S
L
 
I
D
 
S
W
 
W
T
 
E
K
 
D
I
 
I
A
 
K
R
 
W
I
 
L
R
 
R
D
 
R
Q
 
L
W
 
T
G
 
S
G
 
L
K
 
P
F
 
I
I
 
V
L
 
A
K
|
K
G
 
G
I
 
I
L
 
L
D
 
R
A
 
G
E
 
D
D
 
D
A
 
A
R
 
R
A
 
E
A
 
A
A
 
V
D
 
K
F
 
H
G
 
G
A
 
L
D
 
N
A
 
G
I
 
I
I
 
L
V
 
V
S
 
S
N
 
N
H
|
H
G
|
G
G
 
A
R
|
R
Q
 
Q
L
 
L
D
 
D
G
 
G
A
 
V
L
 
P
S
 
A
S
 
T
I
 
I
R
 
D
M
 
V
L
 
L
P
 
P
E
 
E
I
 
I
V
 
V
Q
 
E
A
 
A
V
 
V
G
 
E
D
 
G
K
 
K
T
 
V
E
 
E
V
 
V
W
 
F
L
 
L
D
|
D
S
x
G
G
 
G
I
 
V
R
|
R
S
 
K
G
 
G
Q
 
T
D
 
D
I
 
V
L
 
L
K
 
K
A
 
A
L
 
L
A
 
A
L
 
L
G
 
G
A
 
A
T
 
K
G
 
A
T
 
V
M
 
F
I
 
V
G
|
G
R
|
R
A
 
P
Y
 
I
V
 
V
H
 
W
G
 
G
L
 
L
G
 
A
A
 
F
M
 
Q
G
 
G
E
 
E
A
 
K
G
 
G
V
 
V
T
 
Q
K
 
D
A
 
V
L
 
L
E
 
E
V
 
I
M
 
L
R
 
K
K
 
E
E
 
E
L
 
F
D
 
R
I
 
L
S
 
A
M
 
M
A
 
A
L
 
L
C
 
S
G
 
G
E
 
C
K
 
Q
R
 
N
V
 
V
Q
 
K

Query Sequence

>WP_110805778.1 NCBI__GCF_003217355.1:WP_110805778.1
MTVITCIDDLKALHRKRTPKMFYDYCESGSYTEQTFRENTTDFAQIRLRQKVAVDMSGRS
TASTMAGQPVAMPVALAPVGLLGMQRADGEIKAARAAAKFGVPFTLSTMSICSIEDVAAQ
SPDPFWFQLYVMRDEDFVDAIIERAKKARCSALVLTLDLQILGQRHKDLKNGLTAPPKLT
PANLIDMATKLTWGREMLATPRRFFGNIVGHAKGVGDAASLMSWTSEQFDPCLDWTKIAR
IRDQWGGKFILKGILDAEDARAAADFGADAIIVSNHGGRQLDGALSSIRMLPEIVQAVGD
KTEVWLDSGIRSGQDILKALALGATGTMIGRAYVHGLGAMGEAGVTKALEVMRKELDISM
ALCGEKRVQDLGRDNLLVPEGFFTTYR

Or try a new SitesBLAST search

SitesBLAST's Database

SitesBLAST's database includes (1) SwissProt entries with experimentally-supported functional features; and (2) protein structures with bound ligands, from the BioLip database.

by Morgan Price, Arkin group
Lawrence Berkeley National Laboratory