SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_110806556.1 NCBI__GCF_003217355.1:WP_110806556.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

2dtxA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with d-mannose (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:242/243 of query aligns to 2:251/255 of 2dtxA

query
sites
2dtxA
M
 
F
S
 
S
R
 
D
F
 
L
A
 
R
G
 
D
K
 
K
T
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
R
 
S
S
 
M
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
F
A
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
D
F
 
L
T
 
S
A
 
I
Q
 
H
R
 
D
G
 
P
P
 
G
D
 
E
P
 
A
D
 
K
F
 
Y
E
 
D
A
 
H
I
 
I
E
 
E
A
 
C
D
 
D
I
 
V
T
 
T
D
 
N
T
 
P
D
 
D
C
 
Q
P
 
V
A
 
K
R
 
A
V
 
S
V
 
I
S
 
D
T
 
H
V
 
I
L
 
F
A
 
K
R
 
E
A
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
M
 
E
Q
 
S
E
 
Y
A
 
G
G
 
K
V
 
I
E
 
E
A
 
S
M
 
M
R
 
S
L
 
M
E
 
G
D
 
E
W
 
W
D
 
R
R
 
R
T
 
I
L
 
I
R
 
D
M
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
F
A
 
G
P
 
Y
F
 
Y
L
 
Y
L
 
A
I
 
S
K
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
M
R
 
I
Q
 
R
A
 
S
R
 
R
G
 
D
-
 
P
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
G
 
S
S
|
S
I
x
V
E
x
Q
G
 
A
L
 
S
G
 
I
S
 
I
N
 
T
P
 
K
L
 
N
H
 
A
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
T
S
|
S
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
V
H
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
L
D
 
D
H
 
Y
G
 
A
T
 
P
E
 
L
V
 
L
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
x
A
W
x
T
I
 
I
D
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
L
-
 
V
-
 
R
N
 
K
E
 
A
A
 
A
F
 
E
V
 
L
N
 
E
A
 
V
M
 
G
P
 
S
D
 
D
P
 
P
V
 
M
A
 
R
F
 
I
R
 
E
A
 
K
N
 
K
I
 
I
-
 
S
-
 
E
-
 
W
G
 
G
R
 
H
I
 
E
H
 
H
P
 
P
V
 
M
G
 
Q
R
 
R
T
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
A
V
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
S
F
 
F
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
W
 
L
T
 
Y
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
M
 
S
A
 
I
K
 
R
L
 
A
P
 
P
L
 
I

2dteA Structure of thermoplasma acidophilum aldohexose dehydrogenase (aldt) in complex with nadh (see paper)
35% identity, 100% coverage: 1:242/243 of query aligns to 2:251/255 of 2dteA

query
sites
2dteA
M
 
F
S
 
S
R
 
D
F
 
L
A
 
R
G
 
D
K
 
K
T
 
V
A
 
V
L
 
I
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
R
x
S
S
x
M
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
E
R
 
R
L
 
F
A
 
V
A
 
D
E
 
E
G
 
G
A
 
S
R
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
D
F
 
L
T
x
S
A
x
I
Q
 
H
R
 
D
G
 
P
P
 
G
D
 
E
P
 
A
D
 
K
F
 
Y
E
 
D
A
 
H
I
 
I
E
 
E
A
x
C
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
N
T
 
P
D
 
D
C
 
Q
P
 
V
A
 
K
R
 
A
V
 
S
V
 
I
S
 
D
T
 
H
V
 
I
L
 
F
A
 
K
R
 
E
A
 
Y
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
S
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
M
 
E
Q
 
S
E
 
Y
A
 
G
G
 
K
V
 
I
E
 
E
A
 
S
M
 
M
R
 
S
L
 
M
E
 
G
D
 
E
W
 
W
D
 
R
R
 
R
T
 
I
L
 
I
R
 
D
M
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
F
A
 
G
P
 
Y
F
 
Y
L
 
Y
L
 
A
I
 
S
K
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
I
P
 
P
A
 
Y
L
 
M
R
 
I
Q
 
R
A
 
S
R
 
R
G
 
D
-
 
P
A
 
S
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
G
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
Q
G
 
A
L
 
S
G
 
I
S
 
I
N
 
T
P
 
K
L
 
N
H
 
A
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
V
A
 
T
S
|
S
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
V
H
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
V
 
I
A
 
A
V
 
L
D
 
D
H
 
Y
G
 
A
T
 
P
E
 
L
V
 
L
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
x
A
W
x
T
I
|
I
D
 
D
T
|
T
E
x
P
L
|
L
-
x
V
-
 
R
N
 
K
E
 
A
A
 
A
F
 
E
V
 
L
N
 
E
A
 
V
M
 
G
P
 
S
D
 
D
P
 
P
V
 
M
A
 
R
F
 
I
R
 
E
A
 
K
N
 
K
I
 
I
-
 
S
-
 
E
-
 
W
G
 
G
R
 
H
I
 
E
H
 
H
P
 
P
V
 
M
G
 
Q
R
 
R
T
 
I
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
Q
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
S
L
 
A
V
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
R
E
 
E
A
 
A
G
 
S
F
 
F
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
V
 
C
W
 
L
T
 
Y
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
L
M
 
S
A
 
I
K
 
R
L
 
A
P
 
P
L
 
I

5itvA Crystal structure of bacillus subtilis bacc dihydroanticapsin 7- dehydrogenase in complex with nadh (see paper)
37% identity, 98% coverage: 3:239/243 of query aligns to 4:255/255 of 5itvA

query
sites
5itvA
R
 
N
F
 
L
A
 
T
G
 
D
K
 
K
T
 
T
A
 
V
L
 
L
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
R
 
A
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
Y
A
 
A
I
 
A
A
 
V
R
 
Q
R
 
A
L
 
F
A
 
L
A
 
G
E
 
Q
G
 
Q
A
 
A
R
 
N
V
 
V
F
 
V
T
 
V
A
 
A
Q
x
D
-
x
I
-
 
D
-
 
E
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
M
-
 
V
R
 
R
G
 
K
P
 
E
D
 
N
P
 
N
D
 
D
-
 
R
F
 
L
E
 
H
A
 
F
I
 
V
E
 
Q
A
x
T
D
 
D
I
|
I
T
 
T
D
 
D
T
 
E
D
 
A
C
 
A
P
 
C
A
 
Q
R
 
H
V
 
A
V
 
V
S
 
E
T
 
S
V
 
A
L
 
V
A
 
H
R
 
T
A
 
F
G
 
G
G
 
G
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
V
 
I
M
 
E
Q
 
I
E
 
V
A
 
A
G
 
P
V
 
I
E
 
H
A
 
E
M
 
M
R
 
E
L
 
L
E
 
S
D
 
D
W
 
W
D
 
N
R
 
K
T
 
V
L
 
L
R
 
Q
M
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
G
P
 
M
F
 
F
L
 
L
L
 
M
I
 
S
K
 
K
A
 
H
A
 
A
L
 
L
P
 
K
A
 
H
L
 
M
R
 
L
Q
 
A
A
 
A
-
 
G
R
 
K
G
 
G
A
 
N
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
G
 
C
S
|
S
I
 
V
E
 
G
G
 
G
L
 
L
G
 
V
S
 
A
N
 
W
P
 
P
L
 
D
H
 
I
A
 
P
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
V
H
 
L
G
 
Q
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
V
 
M
A
 
A
V
 
V
D
 
D
H
 
Y
G
 
A
T
 
K
-
 
H
E
 
Q
V
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
C
V
 
V
A
 
C
P
|
P
G
|
G
W
x
I
I
|
I
D
 
D
T
 
T
E
 
P
L
 
L
N
 
N
E
 
E
-
 
K
A
 
S
F
 
F
V
 
L
-
 
E
N
 
N
A
 
N
M
 
E
P
 
G
D
 
T
P
 
L
V
 
E
A
 
E
F
 
I
R
 
K
A
 
K
N
 
E
I
 
K
G
 
A
R
 
K
I
 
V
H
 
N
P
 
P
V
 
L
G
 
L
R
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
V
V
 
M
A
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
L
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
V
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
S
V
 
A
W
 
I
T
 
T
L
 
A
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
M
 
T
A
 
A
K
 
Q

5vt6A Crystal structure of acetoacetyl-coa reductase from burkholderia pseudomallei 1710b complexed with NADP
38% identity, 94% coverage: 7:235/243 of query aligns to 2:241/245 of 5vt6A

query
sites
5vt6A
K
 
R
T
 
V
A
 
A
L
 
F
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
R
 
M
S
x
G
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Q
 
A
A
 
A
I
 
I
A
 
S
R
 
R
R
 
R
L
 
L
A
 
H
A
 
D
E
 
A
G
 
G
A
 
M
R
 
A
V
 
V
-
 
A
-
 
V
-
 
S
-
x
H
-
x
S
-
 
E
-
 
R
-
x
N
-
 
D
-
 
H
-
 
V
-
 
S
-
 
T
-
 
W
F
 
L
T
 
M
A
 
H
Q
 
E
R
 
R
G
 
D
P
 
A
D
 
G
P
 
R
D
 
D
F
 
F
E
 
K
A
 
A
I
 
Y
E
 
A
A
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
A
D
 
D
T
 
F
D
 
E
C
 
S
P
 
C
A
 
E
R
 
R
V
 
C
V
 
A
S
 
E
T
 
K
V
 
V
L
 
L
A
 
A
R
 
D
A
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
M
 
T
Q
 
R
E
 
D
A
 
A
G
 
T
V
 
F
E
 
M
A
 
K
M
 
M
R
 
T
L
 
K
E
 
G
D
|
D
W
 
W
D
 
D
R
 
A
T
 
V
L
 
M
R
 
R
M
 
T
N
 
D
L
 
L
T
 
D
A
 
A
P
 
M
F
 
F
L
 
N
L
 
V
I
 
T
K
 
K
A
 
Q
A
 
F
L
 
I
P
 
A
A
 
G
L
 
M
R
 
V
Q
 
E
A
 
R
R
 
R
-
 
F
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
|
I
G
 
G
S
|
S
I
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
S
G
 
R
S
 
G
N
 
A
P
 
F
L
 
G
H
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
I
H
 
H
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
K
A
 
T
V
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
E
H
 
T
G
 
A
T
 
K
E
 
R
-
 
G
V
 
I
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
 
G
W
x
Y
I
x
L
D
 
A
T
|
T
E
 
-
L
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
A
F
 
M
V
 
V
N
 
E
A
 
A
M
 
V
P
 
P
D
 
Q
P
 
D
V
 
V
A
 
-
F
 
L
R
 
E
A
 
A
N
 
K
I
 
I
G
 
L
R
 
P
I
 
Q
H
 
I
P
 
P
V
 
V
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
D
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
V
 
I
A
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
C
S
 
S
E
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
G
F
 
F
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
D
W
 
L
T
 
A
L
 
I
D
 
N
G
 
G
G
 
G

4bmsF Short chain alcohol dehydrogenase from ralstonia sp. Dsm 6428 in complex with NADPH
36% identity, 97% coverage: 1:235/243 of query aligns to 1:245/249 of 4bmsF

query
sites
4bmsF
M
 
M
S
 
Y
R
 
R
F
 
L
A
 
L
G
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
R
x
N
S
|
S
G
 
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
T
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
F
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
F
 
F
T
 
I
A
 
V
Q
 
G
R
|
R
G
x
R
P
 
R
D
 
K
P
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
R
D
 
N
F
 
V
E
 
T
A
 
A
I
 
V
E
 
K
A
|
A
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
K
T
 
L
D
 
E
C
 
D
P
 
L
A
 
D
R
 
R
V
 
L
V
 
Y
S
 
A
T
 
I
V
 
V
L
 
R
A
 
E
R
 
Q
A
 
R
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
V
 
A
M
 
I
Q
 
E
E
 
Q
A
 
K
G
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
I
R
 
T
L
 
P
E
 
E
D
 
H
W
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
T
L
 
F
R
 
D
M
x
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
A
 
G
P
 
L
F
 
I
L
 
F
L
 
T
I
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
A
 
G
R
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
V
V
 
I
N
 
L
I
 
T
G
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
L
S
 
G
N
 
L
P
 
Q
L
 
A
H
|
H
A
 
D
A
 
T
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
L
 
V
H
 
R
G
 
S
L
 
L
T
 
A
R
 
R
A
 
T
V
 
W
A
 
T
V
 
T
D
 
E
-
 
L
H
 
K
G
 
G
T
 
R
E
 
S
V
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
 
P
G
|
G
W
 
A
I
|
I
D
 
D
T
|
T
E
 
P
L
x
I
N
 
I
E
 
E
A
 
N
F
 
Q
V
 
V
N
 
S
A
 
T
M
x
Q
P
 
E
D
 
E
P
 
A
V
 
D
A
 
E
F
 
L
R
 
R
A
 
A
N
 
K
I
 
F
G
 
A
R
 
A
I
 
A
H
 
T
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
D
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
E
W
 
L
T
 
F
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4nbtA Crystal structure of fabg from acholeplasma laidlawii (see paper)
35% identity, 96% coverage: 2:235/243 of query aligns to 1:236/239 of 4nbtA

query
sites
4nbtA
S
 
K
R
 
K
F
 
L
A
 
E
G
 
G
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
R
 
A
S
x
K
G
|
G
I
x
L
G
 
G
Q
 
Q
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
A
L
 
Y
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
F
 
I
T
 
A
A
 
G
Q
x
D
R
x
L
G
 
G
-
 
D
-
 
L
-
 
T
-
 
Y
P
 
S
D
 
H
P
 
P
D
 
N
F
 
V
E
 
E
A
 
G
I
 
M
E
 
Y
A
x
L
D
x
N
I
x
V
T
 
T
D
 
D
T
 
V
D
 
T
C
 
G
P
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
F
V
 
Y
S
 
Q
T
 
S
V
 
V
L
 
I
A
 
D
R
 
K
A
 
Y
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
I
M
 
T
Q
 
K
E
 
D
A
 
A
G
 
M
V
 
T
E
 
R
A
 
K
M
 
M
R
 
T
L
 
E
E
 
A
D
 
Q
W
 
W
D
 
D
R
 
A
T
 
V
L
 
I
R
 
D
M
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
K
A
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
N
L
 
L
I
 
T
K
 
R
A
 
L
A
 
V
L
 
G
P
 
P
A
 
Q
L
 
M
R
 
Q
-
 
T
Q
 
N
A
 
G
R
 
Y
G
 
G
A
 
S
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
|
I
G
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
V
G
 
G
L
 
V
G
 
F
S
 
G
N
 
N
P
 
I
L
 
G
H
 
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
M
A
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
K
D
 
E
-
 
F
-
 
A
-
 
L
H
 
K
G
 
G
T
 
A
E
 
N
V
 
V
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
Y
I
|
I
D
 
M
T
|
T
E
 
D
L
 
I
N
 
L
E
 
K
A
 
T
F
 
V
V
 
P
N
 
Q
A
 
D
M
 
L
P
 
L
D
 
D
P
 
K
V
 
F
A
 
A
F
 
-
R
 
-
A
 
-
N
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
A
I
 
L
H
 
T
P
 
M
V
 
L
G
 
N
R
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
Q
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
K
L
 
V
V
 
A
A
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
W
 
I
T
 
N
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

7xqmB Indel-mutant short chain dehydrogenase bound to sah (see paper)
42% identity, 99% coverage: 1:240/243 of query aligns to 1:246/253 of 7xqmB

query
sites
7xqmB
M
 
M
S
 
G
R
 
L
F
 
F
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
R
 
-
S
 
-
G
 
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
-
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
V
 
V
F
 
A
T
 
L
A
 
C
Q
x
D
R
x
L
G
x
R
P
 
P
D
 
E
P
 
G
D
 
K
-
 
E
-
 
V
F
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
F
E
 
Q
A
x
V
D
 
D
I
x
L
T
 
E
D
 
D
T
 
E
D
 
R
C
 
E
P
 
R
A
 
V
R
 
R
V
 
F
V
 
V
S
 
E
T
 
E
V
 
A
L
 
A
A
 
Y
R
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
V
 
I
M
 
A
Q
 
A
E
 
P
A
 
G
G
 
S
V
 
A
E
 
L
A
 
T
M
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
P
D
 
E
W
 
W
D
 
R
R
 
R
T
 
V
L
 
L
R
 
E
M
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
A
P
 
P
F
 
M
L
 
H
L
 
L
I
 
S
K
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
A
P
 
R
A
 
E
L
 
M
R
 
R
Q
 
K
A
 
V
R
 
G
G
 
G
-
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
V
G
 
A
S
 
S
I
 
V
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
F
S
 
A
N
 
E
P
 
Q
L
 
E
H
 
N
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
 
K
A
 
G
G
 
G
L
 
L
H
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
D
H
 
L
G
 
A
-
 
P
T
 
L
E
 
R
V
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
A
I
 
I
D
 
A
T
 
T
E
 
E
L
 
A
N
 
V
E
 
L
A
 
E
F
 
A
V
 
I
N
 
A
A
 
L
M
 
S
P
 
P
D
 
D
P
 
P
V
 
E
A
 
R
F
 
T
R
 
R
A
 
R
N
 
D
I
 
W
G
 
E
R
 
D
I
 
L
H
 
H
P
 
A
V
 
L
G
 
R
R
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
A
V
 
V
A
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
S
F
 
F
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
I
W
 
L
T
 
P
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
M
 
T
A
 
A
K
 
S
L
 
F

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
37% identity, 95% coverage: 7:238/243 of query aligns to 6:247/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
A
R
 
G
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
V
A
 
A
R
 
H
R
 
S
L
 
Y
A
 
A
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
F
 
I
T
 
V
A
 
S
Q
x
D
R
x
I
G
 
N
P
 
E
D
 
D
P
 
H
D
 
G
F
 
N
E
 
K
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
-
D
 
D
I
 
I
T
 
K
-
 
A
-
 
Q
-
 
G
-
 
G
-
 
E
-
 
A
-
 
S
-
 
F
-
 
V
-
 
K
-
x
A
D
|
D
T
|
T
D
 
S
C
 
N
P
 
P
A
 
E
R
 
E
V
 
V
-
 
E
-
 
A
-
 
L
V
 
V
S
 
K
T
 
R
V
 
T
L
 
V
A
 
E
R
 
I
A
 
Y
G
 
G
G
 
R
L
 
L
D
 
D
V
 
I
L
 
A
V
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
V
 
I
M
 
G
Q
 
G
E
 
E
A
 
Q
G
 
A
V
 
L
E
 
A
A
 
G
-
 
D
M
 
Y
R
 
G
L
 
L
E
 
D
D
 
S
W
 
W
D
 
R
R
 
K
T
 
V
L
 
L
R
 
S
M
 
I
N
 
N
L
 
L
T
 
D
A
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
Y
L
 
G
I
 
C
K
 
K
A
 
Y
A
 
E
L
 
L
P
 
E
A
 
Q
L
 
M
-
 
E
R
 
K
Q
 
N
A
 
G
R
 
G
G
 
G
A
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
M
G
 
A
S
|
S
I
 
I
E
 
H
G
 
G
L
 
I
G
 
V
S
 
A
N
 
A
P
 
P
L
 
L
H
 
S
A
 
S
A
 
A
Y
|
Y
C
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
A
 
H
G
 
A
L
 
V
H
 
V
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
N
V
 
I
A
 
G
V
 
A
D
 
E
H
 
Y
G
 
G
T
 
Q
E
 
K
-
 
N
V
 
I
R
 
R
C
 
C
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
W
x
Y
I
|
I
D
 
E
T
 
T
E
 
P
L
|
L
N
 
L
E
 
E
A
 
S
F
 
L
V
 
T
N
 
K
A
 
E
M
 
M
P
 
K
D
 
E
P
 
A
V
 
L
A
 
I
F
 
S
R
 
K
A
 
-
N
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
H
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
S
S
 
S
E
 
E
E
 
K
A
 
S
G
 
S
F
 
F
V
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
G
V
 
Y
W
 
Y
T
 
L
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
Y
M
 
T
A
 
A

6ihhA Crystal structure of rasadh f12 from ralstonia.Sp in complex with NADPH and a6o
36% identity, 97% coverage: 1:235/243 of query aligns to 1:245/249 of 6ihhA

query
sites
6ihhA
M
 
M
S
 
Y
R
 
R
F
 
L
A
 
L
G
 
N
K
 
K
T
 
T
A
 
A
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
G
R
x
N
S
|
S
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
A
I
 
T
A
 
A
R
 
K
R
 
R
L
 
F
A
 
V
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
Y
V
 
V
F
 
F
T
 
I
A
 
V
Q
 
G
R
|
R
G
x
R
P
 
R
D
 
K
P
 
E
-
 
L
-
 
E
-
 
Q
-
 
A
-
 
A
-
 
A
-
 
E
-
 
I
-
 
G
-
 
R
D
 
N
F
 
V
E
 
T
A
 
A
I
 
V
E
 
K
A
 
A
D
|
D
I
x
V
T
 
T
D
 
K
T
 
L
D
 
E
C
 
D
P
 
L
A
 
D
R
 
R
V
 
L
V
 
Y
S
 
A
T
 
I
V
 
V
L
 
R
A
 
E
R
 
Q
A
 
R
G
 
G
G
 
S
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
F
N
 
A
N
|
N
A
x
S
G
|
G
V
 
A
M
 
V
Q
 
E
E
 
Q
A
 
K
G
 
T
V
 
L
E
 
E
A
 
E
M
 
I
R
 
T
L
 
P
E
 
E
D
 
H
W
 
Y
D
 
D
R
 
R
T
 
T
L
 
F
R
 
D
M
x
V
N
 
N
L
 
V
T
 
R
A
 
G
P
 
L
F
 
I
L
 
F
L
 
T
I
 
V
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
L
L
 
L
R
 
R
Q
 
D
A
 
G
R
 
-
G
 
G
A
 
S
I
 
V
V
 
I
N
 
L
I
x
T
G
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
A
G
 
G
L
 
V
G
 
L
S
 
G
N
 
L
P
 
Q
L
 
A
H
|
H
A
 
D
A
 
T
Y
|
Y
C
 
S
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
A
L
 
V
H
 
R
G
 
S
L
 
L
T
 
A
R
 
R
A
 
T
V
 
W
A
 
T
V
 
T
D
 
E
-
 
L
H
 
K
G
 
G
T
 
R
E
 
S
V
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
W
x
A
I
|
I
D
 
D
T
|
T
E
 
P
L
x
S
N
x
L
E
 
E
A
 
N
F
 
N
V
 
V
N
 
S
A
 
T
M
 
Q
P
 
E
D
 
E
P
 
A
V
 
D
A
 
E
F
 
L
R
 
R
A
 
A
N
 
K
I
 
A
G
 
A
R
 
A
I
 
A
H
 
T
P
 
P
V
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
V
G
 
G
R
 
R
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
L
A
 
A
A
 
A
L
 
A
V
 
V
A
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
D
A
 
S
G
 
S
F
 
Y
V
 
V
S
 
A
G
 
G
Q
 
I
V
 
E
W
 
L
T
 
F
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

Sites not aligning to the query:

2d1yA Crystal structure of tt0321 from thermus thermophilus hb8 (see paper)
42% identity, 98% coverage: 4:240/243 of query aligns to 3:240/240 of 2d1yA

query
sites
2d1yA
F
 
F
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
G
A
 
V
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
R
 
A
S
x
R
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
Q
R
 
A
L
 
F
A
 
A
A
 
R
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
L
V
 
V
F
 
A
T
 
L
A
 
C
Q
x
D
R
x
L
G
x
R
P
 
P
D
 
E
P
 
G
D
 
K
-
 
E
-
 
V
F
 
A
E
 
E
A
 
A
I
 
I
-
 
G
-
 
G
-
 
A
-
 
F
-
 
F
E
 
Q
A
x
V
D
|
D
I
x
L
T
 
E
D
 
D
T
 
E
D
 
R
C
 
E
P
 
R
A
 
V
R
 
R
V
 
F
V
 
V
S
 
E
T
 
E
V
 
A
L
 
A
A
 
Y
R
 
A
A
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
x
A
V
x
I
M
 
A
Q
 
A
E
 
P
A
 
G
G
 
S
V
 
A
E
 
L
A
 
T
M
 
V
R
 
R
L
 
L
E
 
P
D
 
E
W
 
W
D
 
R
R
 
R
T
 
V
L
 
L
R
 
E
M
 
V
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
A
P
 
P
F
 
M
L
 
H
L
 
L
I
 
S
K
 
A
A
 
L
A
 
A
L
 
A
P
 
R
A
 
E
L
 
M
R
 
R
Q
 
K
A
 
V
-
 
G
R
 
G
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
V
G
 
A
S
|
S
I
 
V
E
 
Q
G
 
G
L
 
L
G
 
F
S
 
A
N
 
E
P
 
Q
L
 
E
H
x
N
A
 
A
A
 
A
Y
|
Y
C
 
N
A
 
A
S
 
S
K
|
K
A
 
G
G
 
G
L
 
L
H
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
S
V
 
L
A
 
A
V
 
L
D
 
D
H
 
L
G
 
A
-
 
P
T
 
L
E
 
R
V
 
I
R
 
R
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
|
G
W
 
A
I
|
I
D
 
A
T
|
T
E
 
E
L
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
V
 
-
N
 
-
A
|
A
M
x
V
P
 
L
D
 
E
P
 
A
V
 
I
A
 
A
F
 
-
R
 
R
A
 
R
N
 
D
I
 
W
G
 
E
R
 
D
I
 
L
H
 
H
P
 
A
V
 
L
G
 
R
R
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
E
L
 
A
V
 
V
A
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
E
E
 
K
A
 
A
G
 
S
F
 
F
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
I
W
 
L
T
 
P
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
M
M
 
T
A
 
A
K
 
S
L
 
F

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
35% identity, 98% coverage: 1:237/243 of query aligns to 2:243/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
M
S
 
S
R
 
R
F
 
L
A
 
Q
G
 
D
K
 
K
T
 
V
A
 
A
L
 
I
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
R
 
A
S
x
N
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
L
A
 
E
I
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
V
L
 
F
A
 
M
A
 
K
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
K
V
 
V
F
 
V
T
 
I
A
 
A
Q
x
D
R
x
F
G
 
N
P
 
E
D
 
A
P
 
A
D
 
G
F
 
K
E
 
E
A
 
A
I
 
V
E
 
E
A
 
A
-
 
N
-
 
P
-
 
G
-
 
V
-
 
V
-
 
F
-
 
I
-
 
R
-
x
V
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
T
 
R
D
 
E
C
 
S
P
 
V
A
 
H
R
 
R
V
 
L
V
 
V
S
 
E
T
 
N
V
 
V
L
 
A
A
 
E
R
 
R
A
 
F
G
 
G
G
 
K
L
 
I
D
 
D
V
 
I
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
M
 
T
Q
 
R
E
x
D
A
 
S
G
 
M
V
 
L
E
 
S
A
x
K
M
 
M
R
 
T
L
 
V
E
 
D
D
 
Q
W
 
F
D
 
Q
R
 
Q
T
 
V
L
 
I
R
 
N
M
 
V
N
|
N
L
 
L
T
 
T
A
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
H
L
 
C
I
 
T
K
 
Q
A
 
A
A
 
V
L
 
L
P
 
P
A
 
Y
L
 
M
-
 
A
R
 
E
Q
 
Q
A
 
G
R
 
K
G
 
G
A
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
x
T
G
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
T
G
 
G
L
 
T
G
 
Y
S
 
G
N
|
N
P
x
V
L
 
G
H
x
Q
A
 
T
A
 
N
Y
|
Y
C
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
I
G
 
G
L
 
M
T
 
T
R
 
K
A
 
T
V
 
W
A
 
A
V
 
K
D
 
E
H
 
L
G
 
A
T
 
R
E
 
K
-
 
G
V
 
I
R
 
N
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
W
x
F
I
x
T
D
 
E
T
|
T
E
 
-
L
 
-
N
 
-
E
 
-
A
 
A
F
x
M
V
 
V
N
 
A
A
 
E
M
 
V
P
 
P
D
 
E
P
 
K
V
 
V
-
 
I
-
 
E
A
x
K
F
 
M
R
 
K
A
 
A
N
 
Q
I
 
V
G
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
P
 
P
V
 
M
G
 
G
R
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
A
V
 
Y
A
 
L
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
H
E
 
E
A
 
S
G
 
D
F
 
Y
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
H
V
 
V
W
 
L
T
 
H
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
I
M
 
M

P14697 Acetoacetyl-CoA reductase; EC 1.1.1.36 from Cupriavidus necator (strain ATCC 17699 / DSM 428 / KCTC 22496 / NCIMB 10442 / H16 / Stanier 337) (Ralstonia eutropha) (see 2 papers)
37% identity, 94% coverage: 7:235/243 of query aligns to 4:242/246 of P14697

query
sites
P14697
K
 
R
T
 
I
A
 
A
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
G
R
 
M
S
x
G
G
|
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
C
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
R
V
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
C
-
x
G
-
 
P
-
 
N
-
 
S
-
 
P
-
x
R
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
W
F
 
L
T
 
E
A
x
Q
Q
 
Q
R
 
K
G
 
A
P
 
L
D
 
G
P
 
F
D
 
D
F
 
F
E
 
I
A
 
A
I
 
S
E
 
E
A
x
G
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
D
T
 
W
D
 
D
C
 
S
P
 
T
A
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
F
S
 
D
T
 
K
V
 
V
L
 
K
A
 
S
R
 
E
A
 
V
G
 
G
G
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
x
I
M
x
T
Q
 
R
E
x
D
A
 
V
G
 
V
V
 
F
E
 
R
A
x
K
M
 
M
R
 
T
L
 
R
E
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
A
T
 
V
L
 
I
R
 
D
M
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
T
A
 
S
P
 
L
F
 
F
L
 
N
L
 
V
I
 
T
K
 
K
A
 
Q
A
 
V
L
 
I
P
 
D
A
 
G
L
 
M
-
 
A
R
 
D
Q
 
R
A
 
G
R
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
G
 
S
S
 
S
I
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
Q
G
 
K
S
 
G
N
x
Q
P
x
F
L
 
G
H
x
Q
A
 
T
A
 
N
Y
 
Y
C
 
S
A
 
T
S
 
A
K
 
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
H
 
H
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
M
A
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
Q
D
 
E
H
 
V
G
 
A
T
|
T
E
 
K
-
 
G
V
 
V
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
W
x
Y
I
|
I
D
 
A
T
 
T
E
 
D
L
 
M
N
 
V
E
 
K
A
 
A
F
 
I
V
x
R
N
 
Q
A
 
D
M
 
V
P
 
L
D
 
D
P
 
K
V
 
I
A
 
V
F
 
-
R
 
-
A
 
A
N
 
T
I
 
I
G
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
P
 
P
V
 
V
G
 
K
R
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
I
V
 
C
A
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
S
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
D
W
 
F
T
 
S
L
 
L
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3vzsB Crystal structure of phab from ralstonia eutropha in complex with acetoacetyl-coa and NADP (see paper)
37% identity, 94% coverage: 7:235/243 of query aligns to 7:245/249 of 3vzsB

query
sites
3vzsB
K
 
R
T
 
I
A
 
A
L
 
Y
V
 
V
T
 
T
G
|
G
G
 
G
R
 
M
S
 
G
G
 
G
I
|
I
G
 
G
Q
 
T
A
 
A
I
 
I
A
 
C
R
 
Q
R
 
R
L
 
L
A
 
A
A
 
K
E
 
D
G
 
G
A
 
F
R
 
R
V
 
V
-
 
V
-
 
A
-
 
G
-
 
C
-
x
G
-
 
P
-
 
N
-
 
S
-
 
P
-
x
R
-
 
R
-
 
E
-
 
K
-
 
W
F
 
L
T
 
E
A
 
Q
Q
 
Q
R
 
K
G
 
A
P
 
L
D
 
G
P
 
F
D
 
D
F
 
F
E
 
I
A
 
A
I
 
S
E
 
E
A
x
G
D
x
N
I
x
V
T
 
A
D
 
D
T
 
W
D
 
D
C
 
S
P
 
T
A
 
K
R
 
T
V
 
A
V
 
F
S
 
D
T
 
K
V
 
V
L
 
K
A
 
S
R
 
E
A
 
V
G
 
G
G
 
E
L
 
V
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
I
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
V
x
I
M
x
T
Q
 
R
E
x
D
A
 
V
G
 
V
V
 
F
E
 
R
A
 
K
M
 
M
R
 
T
L
 
R
E
 
A
D
 
D
W
 
W
D
 
D
R
 
A
T
 
V
L
 
I
R
 
D
M
 
T
N
|
N
L
 
L
T
 
T
A
 
S
P
 
L
F
 
F
L
 
N
L
 
V
I
 
T
K
 
K
A
 
Q
A
 
V
L
 
I
P
 
D
A
 
G
L
 
M
-
 
A
R
 
D
Q
 
R
A
 
G
R
 
W
G
 
G
A
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
I
G
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
N
G
 
G
L
 
Q
G
 
K
S
 
G
N
x
Q
P
x
F
L
 
G
H
x
Q
A
 
T
A
 
N
Y
|
Y
C
 
S
A
 
T
S
 
A
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
L
H
 
H
G
 
G
L
 
F
T
 
T
R
 
M
A
 
A
V
 
L
A
 
A
V
 
Q
D
 
E
H
 
V
G
 
A
T
 
T
E
 
K
-
 
G
V
 
V
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
T
V
 
V
A
 
S
P
|
P
G
|
G
W
x
Y
I
|
I
D
 
A
T
 
T
E
 
D
L
x
M
N
x
V
E
 
K
A
 
A
F
 
I
V
x
R
N
 
Q
A
 
D
M
 
V
P
 
L
D
 
D
P
 
K
V
 
I
A
 
V
F
 
-
R
 
-
A
 
A
N
 
T
I
 
I
G
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
P
 
P
V
 
V
G
 
K
R
 
R
T
 
L
G
 
G
R
 
L
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
A
 
S
L
 
I
V
 
C
A
 
A
W
 
W
L
 
L
A
 
S
S
 
S
E
 
E
E
 
E
A
 
S
G
 
G
F
 
F
V
 
S
S
 
T
G
 
G
Q
 
A
V
 
D
W
 
F
T
 
S
L
 
L
D
 
N
G
 
G
G
 
G

3osuA Crystal structure of the 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase, fabg, from staphylococcus aureus
35% identity, 94% coverage: 7:235/243 of query aligns to 5:243/246 of 3osuA

query
sites
3osuA
K
 
K
T
 
S
A
 
A
L
 
L
V
 
V
T
 
T
G
 
G
G
 
A
R
 
S
S
 
R
G
|
G
I
 
I
G
 
G
Q
 
R
A
 
S
I
 
I
A
 
A
R
 
L
R
 
Q
L
 
L
A
 
A
A
 
E
E
 
E
G
 
G
A
 
Y
R
 
N
V
 
V
F
 
A
T
 
V
A
 
N
Q
 
Y
R
 
A
G
 
G
P
 
S
D
 
K
P
 
E
D
 
K
F
 
A
E
 
E
A
 
A
-
 
V
-
 
V
-
 
E
-
 
E
-
 
I
-
 
K
-
 
A
-
 
K
-
 
G
-
 
V
-
 
D
-
 
S
-
 
F
-
 
A
I
 
I
E
 
Q
A
 
A
D
 
N
I
 
V
T
 
A
D
 
D
T
 
A
D
 
D
C
 
E
P
 
V
A
 
K
R
 
A
V
 
M
V
 
I
S
 
K
T
 
E
V
 
V
L
 
V
A
 
S
R
 
Q
A
 
F
G
 
G
G
 
S
L
 
L
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
V
 
I
M
 
T
Q
 
R
E
 
D
A
 
N
G
 
L
V
 
L
E
 
M
A
 
R
M
 
M
R
 
K
L
 
E
E
 
Q
D
 
E
W
 
W
D
 
D
R
 
D
T
 
V
L
 
I
R
 
D
M
 
T
N
 
N
L
 
L
T
 
K
A
 
G
P
 
V
F
 
F
L
 
N
L
 
C
I
 
I
K
 
Q
A
 
K
A
 
A
L
 
T
P
 
P
A
 
Q
-
 
M
L
 
L
R
 
R
Q
 
Q
A
 
R
R
 
S
G
 
G
A
 
A
I
 
I
V
 
I
N
 
N
I
 
L
G
 
S
S
|
S
I
 
V
E
 
V
G
 
G
L
 
A
G
 
V
S
 
G
N
 
N
P
 
P
L
 
G
H
x
Q
A
 
A
A
 
N
Y
|
Y
C
 
V
A
 
A
S
 
T
K
|
K
A
 
A
G
 
G
L
 
V
H
 
I
G
 
G
L
 
L
T
 
T
R
 
K
A
 
S
V
 
A
A
 
A
V
 
R
D
 
E
H
 
L
G
 
A
T
 
S
E
 
R
-
 
G
V
 
I
R
 
T
C
 
V
N
 
N
A
 
A
V
 
V
A
 
A
P
 
P
G
 
G
W
 
F
I
 
I
D
 
V
T
 
S
E
 
D
L
 
M
N
 
T
E
 
D
A
 
A
F
 
L
V
 
S
N
 
D
A
 
E
M
 
L
P
 
K
D
 
E
P
 
Q
V
 
M
A
 
L
F
 
T
R
 
Q
A
 
I
N
 
-
I
 
-
G
 
-
R
 
-
I
 
-
H
 
-
P
 
P
V
 
L
G
 
A
R
 
R
T
 
F
G
 
G
R
 
Q
P
 
D
E
 
T
E
 
D
V
 
I
A
 
A
A
 
N
L
 
T
V
 
V
A
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
K
A
 
A
G
 
K
F
 
Y
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
V
 
T
W
 
I
T
 
H
L
 
V
D
 
N
G
 
G
G
 
G

6vspB Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase mutant q247a (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 4:250/252 of 6vspB

query
sites
6vspB
R
 
R
F
 
F
A
 
D
G
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
R
 
G
S
x
N
G
|
G
I
 
M
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
F
 
V
T
 
L
A
 
A
Q
x
D
R
x
W
G
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
P
 
P
D
 
K
P
 
G
D
 
R
F
 
A
E
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
H
A
x
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
T
 
H
D
 
V
C
 
A
P
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
M
V
 
M
S
 
N
T
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
E
R
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
|
G
V
 
V
M
 
H
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
G
 
S
V
 
V
E
 
L
A
 
E
M
 
T
R
 
S
L
 
I
E
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
T
 
I
L
 
A
R
 
G
M
 
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
A
 
G
P
 
V
F
 
V
L
 
F
L
 
C
I
 
S
K
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
L
R
 
L
Q
 
K
A
 
T
R
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
 
T
G
 
A
S
|
S
I
 
V
E
 
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
N
 
D
P
 
W
L
 
G
H
 
A
A
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
 
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
H
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
M
A
 
A
V
 
L
D
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
G
E
 
D
-
 
G
V
 
V
R
 
R
C
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
 
S
W
 
L
I
 
V
D
 
K
T
 
T
E
 
N
L
 
M
N
 
T
E
 
N
A
 
G
F
 
W
V
 
-
N
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
P
V
 
Q
A
 
E
F
 
I
R
 
R
A
 
D
N
 
K
I
 
F
G
 
N
R
 
E
I
 
R
H
 
I
P
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
M
A
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
S
F
 
F
V
 
I
S
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
W
 
I
T
 
P
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
A
M
 
T
A
 
A
K
 
S
L
 
D
P
 
G
L
 
A
P
 
P

6xewA Structure of serratia marcescens 2,3-butanediol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 2:248/251 of 6xewA

query
sites
6xewA
R
 
R
F
 
F
A
 
D
G
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
|
G
G
 
A
R
 
G
S
x
N
G
|
G
I
x
M
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
F
 
V
T
 
L
A
 
A
Q
x
D
R
x
W
G
x
A
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
P
 
P
D
 
K
P
 
G
D
 
R
F
 
A
E
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
H
A
x
I
D
|
D
I
x
V
T
 
S
D
 
D
T
 
H
D
 
V
C
 
A
P
 
V
A
 
E
R
 
K
V
 
M
V
 
M
S
 
N
T
 
E
V
 
V
L
 
A
A
 
E
R
 
K
A
 
L
G
 
G
G
 
R
L
 
I
D
 
D
V
 
V
L
 
L
V
 
L
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
V
 
V
M
 
H
Q
 
V
E
 
A
A
 
G
G
 
S
V
 
V
E
 
L
A
 
E
M
 
T
R
 
S
L
 
I
E
 
D
D
 
D
W
 
W
D
 
R
R
 
R
T
 
I
L
 
A
R
 
G
M
x
V
N
 
D
L
 
I
T
 
D
A
 
G
P
 
V
F
 
V
L
 
F
L
 
C
I
 
S
K
 
K
A
 
F
A
 
A
L
 
L
P
 
P
A
 
H
L
 
L
R
 
L
Q
 
K
A
 
T
R
 
K
G
 
G
A
 
C
I
 
I
V
 
V
N
 
N
I
x
T
G
 
A
S
|
S
I
 
V
E
x
S
G
 
G
L
 
L
G
 
G
S
 
G
N
 
D
P
 
W
L
 
G
H
 
A
A
 
A
A
 
Y
Y
|
Y
C
 
C
A
 
A
S
 
A
K
|
K
A
 
G
G
 
A
L
 
V
H
 
V
G
 
N
L
 
L
T
 
T
R
 
R
A
 
A
V
 
M
A
 
A
V
 
L
D
 
D
H
 
H
G
 
G
T
 
G
E
 
D
-
 
G
V
 
V
R
 
R
C
 
I
N
 
N
A
 
S
V
 
V
A
 
C
P
 
P
G
x
S
W
x
L
I
x
V
D
 
K
T
|
T
E
x
N
L
x
M
N
x
T
E
 
N
A
 
G
F
 
W
V
 
-
N
 
-
A
 
-
M
 
-
P
 
-
D
 
-
P
 
P
V
 
Q
A
 
E
F
 
I
R
 
R
A
 
D
N
 
K
I
 
F
G
 
N
R
 
E
I
 
R
H
 
I
P
 
A
V
 
L
G
 
G
R
 
R
T
 
A
G
 
A
R
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
V
V
 
M
A
 
A
W
 
F
L
 
L
A
 
A
S
 
S
E
 
D
E
 
D
A
 
A
G
 
S
F
 
F
V
 
I
S
 
N
G
 
G
Q
 
A
V
 
N
W
 
I
T
 
P
L
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
R
 
A
M
 
T
A
 
A
K
 
S
L
 
D
P
 
G
L
 
Q
P
 
P

H9XP47 Meso-2,3-butanediol dehydrogenase; BDH; meso-2,3-BDH; (R,S)-butane-2,3-diol dehydrogenase; NAD(H)-dependent meso-2,3-BDH; SmBdh; EC 1.1.1.- from Serratia marcescens (see paper)
35% identity, 99% coverage: 3:243/243 of query aligns to 2:248/251 of H9XP47

query
sites
H9XP47
R
 
R
F
 
F
A
 
D
G
 
N
K
 
K
T
 
V
A
 
V
L
 
V
V
 
I
T
 
T
G
 
G
G
 
A
R
 
G
S
x
N
G
 
G
I
x
M
G
 
G
Q
 
E
A
 
A
I
 
A
A
 
A
R
 
R
R
 
R
L
 
F
A
 
S
A
 
A
E
 
E
G
 
G
A
 
A
R
 
I
V
 
V
F
 
V
T
 
L
A
 
A
Q
x
D
R
 
W
G
 
A
-
 
K
-
 
E
-
 
A
-
 
V
-
 
D
-
 
K
-
 
V
-
 
A
-
 
A
-
 
S
-
 
L
P
 
P
D
 
K
P
 
G
D
 
R
F
 
A
E
 
M
A
 
A
I
 
V
E
 
H
A
 
I
D
|
D
I
x
V
T