SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_110806731.1 NCBI__GCF_003217355.1:WP_110806731.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

P60752 ATP-dependent lipid A-core flippase; Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA; Lipid flippase; EC 7.5.2.6 from Escherichia coli (strain K12) (see 7 papers)
33% identity, 95% coverage: 28:590/592 of query aligns to 10:580/582 of P60752

query
sites
P60752
W
 
W
R
 
Q
D
 
T
Y
 
F
L
 
-
R
 
R
Q
 
R
Q
 
L
W
 
W
P
 
P
L
 
T
M
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
G
L
 
V
L
 
A
L
 
L
M
 
I
V
 
L
E
 
N
G
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
D
G
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
L
W
 
S
M
 
L
I
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
D
V
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
K
G
 
T
Q
 
D
T
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
L
I
 
V
W
 
W
V
 
M
G
 
P
G
 
L
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
I
I
 
L
R
 
R
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
Y
A
 
V
S
 
S
K
 
S
T
 
Y
L
x
C
L
 
I
T
 
S
S
 
W
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
G
 
K
S
 
V
S
 
V
T
 
M
A
 
T
M
 
M
Q
 
R
I
 
R
D
 
R
I
 
L
V
 
F
R
 
G
H
 
H
I
 
M
L
 
M
R
 
G
L
 
M
D
 
P
Q
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
N
 
Q
P
 
S
P
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
Y
D
 
D
T
 
S
Q
 
E
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
G
 
S
V
 
S
W
 
S
S
 
S
V
 
G
F
 
A
V
 
L
S
 
I
G
 
T
A
 
V
G
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
I
V
 
M
A
 
M
L
 
F
A
 
Y
I
 
Y
D
 
S
W
 
W
R
 
Q
W
 
L
T
 
S
L
 
I
A
 
I
A
 
L
L
 
I
I
 
V
G
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
V
-
 
S
I
 
I
A
 
A
P
 
I
T
 
R
A
 
V
M
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
R
Y
 
F
I
 
-
R
 
R
R
 
N
K
 
I
T
 
S
K
 
K
Q
 
N
M
 
M
R
 
Q
D
 
N
E
 
T
S
 
M
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
A
 
T
T
 
T
R
 
S
L
 
A
D
x
E
E
 
Q
V
 
M
F
 
L
H
x
K
G
 
G
I
 
H
A
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
L
L
 
I
Y
 
F
Q
 
G
M
 
G
E
 
Q
E
 
E
Y
 
V
Q
 
E
L
 
T
G
 
K
R
 
R
F
 
F
T
 
D
G
 
K
L
 
V
V
 
S
H
 
N
R
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
L
A
 
Q
M
 
G
V
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
V
F
 
S
S
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
V
 
S
P
 
D
A
 
P
L
 
I
I
 
I
D
 
Q
V
 
L
M
 
I
T
 
A
G
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
L
F
 
A
A
 
F
V
 
V
L
 
L
M
 
Y
M
 
A
A
|
A
S
 
S
P
 
F
E
 
P
I
 
S
T
 
V
S
 
M
G
 
D
E
 
S
R
 
L
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
T
F
 
I
M
 
T
S
 
V
F
 
V
F
 
F
T
 
S
A
 
S
M
 
M
T
 
I
L
 
A
T
 
L
F
 
M
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
R
 
K
R
 
S
L
 
L
G
 
T
G
 
N
L
 
V
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
S
 
R
A
 
G
R
 
M
A
 
A
S
 
A
L
x
C
E
 
Q
R
 
T
L
 
L
Y
 
F
E
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
-
A
 
S
P
 
E
G
 
Q
V
 
E
F
 
K
A
 
D
P
 
E
A
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
V
A
 
I
R
 
E
P
 
R
A
 
A
S
 
T
T
 
G
L
 
D
I
 
V
R
 
E
F
 
F
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
G
 
T
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
G
 
P
Q
 
G
K
 
R
-
 
D
-
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
N
L
 
I
S
 
N
F
 
L
S
 
K
A
 
I
E
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
I
 
I
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
S
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
M
G
 
D
G
 
G
V
 
H
P
 
D
I
 
L
T
 
R
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
P
 
L
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
Q
F
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
Q
D
 
N
A
 
V
A
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
N
E
 
D
T
 
T
I
 
V
R
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
-
 
T
Q
 
E
D
 
Q
V
 
Y
T
 
S
P
 
R
E
 
E
V
 
Q
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
R
 
M
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
N
A
 
K
M
 
M
P
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
V
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
|
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
|
L
D
|
D
T
 
T
A
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
R
K
 
A
V
 
I
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
E
E
 
D
G
 
G
Q
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
 
Q
L
 
L
C
 
H
R
 
K
M
 
M
Q
 
Q
L
 
F

8dmmA Structure of the vanadate-trapped msba bound to kdl (see paper)
33% identity, 95% coverage: 28:590/592 of query aligns to 6:576/576 of 8dmmA

query
sites
8dmmA
W
 
W
R
 
Q
D
 
T
Y
 
F
L
 
-
R
 
R
Q
 
R
Q
 
L
W
 
W
P
 
P
L
 
T
M
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
I
V
|
V
A
 
A
M
 
G
L
 
V
L
 
A
L
 
L
M
 
I
V
 
L
E
 
N
G
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
D
G
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
L
W
 
S
M
 
L
I
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
D
V
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
K
G
 
T
Q
 
D
T
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
L
I
 
V
W
 
W
V
 
M
G
 
P
G
 
L
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
I
I
 
L
R
 
R
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
x
Y
A
 
V
S
 
S
K
 
S
T
x
Y
L
 
C
L
 
I
T
 
S
S
 
W
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
G
 
K
S
 
V
S
 
V
T
 
M
A
 
T
M
 
M
Q
 
R
I
 
R
D
 
R
I
 
L
V
 
F
R
 
G
H
 
H
I
 
M
L
 
M
R
 
G
L
 
M
D
 
P
Q
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
N
 
Q
P
 
S
P
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
Y
D
 
D
T
 
S
Q
 
E
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
G
 
S
V
 
S
W
 
S
S
 
S
V
 
G
F
 
A
V
 
L
S
 
I
G
 
T
A
 
V
G
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
I
V
 
M
A
 
M
L
 
F
A
 
Y
I
 
Y
D
 
S
W
 
W
R
 
Q
W
 
L
T
 
S
L
 
I
A
 
I
A
 
L
L
 
I
I
 
V
G
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
V
-
 
S
I
 
I
A
 
A
P
 
I
T
 
R
A
 
V
M
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
|
R
Y
 
F
I
 
-
R
 
R
R
 
N
K
 
I
T
 
S
K
 
K
Q
 
N
M
 
M
R
 
Q
D
 
N
E
 
T
S
 
M
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
A
 
T
T
 
T
R
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
V
 
M
F
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
H
A
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
L
L
 
I
Y
 
F
Q
 
G
M
 
G
E
 
Q
E
 
E
Y
 
V
Q
 
E
L
 
T
G
 
K
R
 
R
F
 
F
T
 
D
G
 
K
L
 
V
V
 
S
H
 
N
R
 
R
I
 
M
R
|
R
R
 
L
A
 
Q
M
 
G
V
 
M
K
|
K
M
 
M
S
 
V
F
 
S
S
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
|
I
V
 
S
P
 
D
A
 
P
L
x
I
I
 
I
D
 
Q
V
 
L
M
 
I
T
 
A
G
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
L
F
 
A
A
 
F
V
 
V
L
 
L
M
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
P
I
 
S
T
 
V
S
 
M
G
 
D
E
 
S
R
 
L
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
T
F
 
I
M
 
T
S
 
V
F
 
V
F
 
F
T
 
S
A
 
S
M
 
M
T
 
I
L
 
A
T
 
L
F
 
M
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
R
 
K
R
 
S
L
 
L
G
 
T
G
 
N
L
 
V
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
S
 
R
A
 
G
R
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
C
E
 
Q
R
 
T
L
 
L
Y
 
F
E
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
-
A
 
S
P
 
E
G
 
Q
V
 
E
F
 
K
A
 
D
P
 
E
A
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
V
A
 
I
R
 
E
P
 
R
A
 
A
S
 
T
T
 
G
L
 
D
I
 
V
R
 
E
F
 
F
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
G
 
T
L
 
F
S
 
T
Y
|
Y
G
 
P
Q
 
G
K
x
R
-
 
D
-
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
N
L
 
I
S
 
N
F
 
L
S
 
K
A
 
I
E
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
I
 
I
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
S
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
M
G
 
D
G
 
G
V
 
H
P
 
D
I
 
L
T
 
R
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
P
 
L
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
Q
F
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
|
Q
D
 
N
A
 
V
A
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
N
E
 
D
T
 
T
I
 
V
R
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
-
 
T
Q
 
E
D
 
Q
V
 
Y
T
 
S
P
 
R
E
 
E
V
 
Q
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
R
 
M
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
N
A
 
K
M
 
M
P
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
V
A
x
L
L
 
L
S
|
S
G
|
G
G
|
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
R
K
 
A
V
 
I
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
E
E
 
D
G
 
G
Q
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
 
Q
L
 
L
C
 
H
R
 
K
M
 
M
Q
 
Q
L
 
F

7mewA E. Coli msba in complex with g247 (see paper)
33% identity, 95% coverage: 28:589/592 of query aligns to 3:572/572 of 7mewA

query
sites
7mewA
W
 
W
R
 
Q
D
 
T
Y
 
F
L
 
-
R
 
R
Q
 
R
Q
 
L
W
 
W
P
 
P
L
 
T
M
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
G
L
 
V
L
 
A
L
 
L
M
 
I
V
 
L
E
 
N
G
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
D
G
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
L
W
 
S
M
 
L
I
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
D
V
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
K
G
 
T
Q
 
D
T
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
L
I
 
V
W
 
W
V
 
M
G
 
P
G
 
L
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
I
I
 
L
R
 
R
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
Y
A
 
V
S
 
S
K
 
S
T
 
Y
L
 
C
L
 
I
T
 
S
S
 
W
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
G
 
K
S
 
V
S
 
V
T
 
M
A
 
T
M
 
M
Q
 
R
I
 
R
D
 
R
I
 
L
V
 
F
R
 
G
H
 
H
I
 
M
L
 
M
R
 
G
L
 
M
D
 
P
Q
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
N
 
Q
P
 
S
P
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
Y
D
 
D
T
 
S
Q
 
E
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
G
 
S
V
 
S
W
 
S
S
 
S
V
 
G
F
 
A
V
 
L
S
 
I
G
 
T
A
 
V
G
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
G
L
 
L
F
|
F
V
 
I
V
 
M
A
 
M
L
 
F
A
 
Y
I
 
Y
D
 
S
W
 
W
R
 
Q
W
 
L
T
 
S
L
 
I
A
 
I
A
x
L
L
 
I
I
 
V
G
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
x
V
-
 
S
I
 
I
A
 
A
P
 
I
T
 
R
A
 
V
M
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
R
Y
 
F
I
 
-
R
 
R
R
 
N
K
 
I
T
 
S
K
 
K
Q
 
N
M
 
M
R
 
Q
D
 
N
E
 
T
S
 
M
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
A
 
T
T
 
T
R
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
V
 
M
F
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
H
A
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
L
L
 
I
Y
 
F
Q
 
G
M
 
G
E
 
Q
E
 
E
Y
 
V
Q
 
E
L
 
T
G
 
K
R
 
R
F
 
F
T
 
D
G
 
K
L
 
V
V
 
S
H
 
N
R
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
L
A
 
Q
M
 
G
V
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
V
F
 
S
S
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
V
 
S
P
 
D
A
 
P
L
 
I
I
|
I
D
 
Q
V
 
L
M
 
I
T
x
A
G
 
S
L
 
L
G
 
A
F
x
L
F
 
A
A
 
F
V
 
V
L
 
L
M
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
P
I
 
S
T
 
V
S
 
M
G
 
D
E
 
S
R
 
L
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
T
F
 
I
M
 
T
S
 
V
F
 
V
F
 
F
T
 
S
A
 
S
M
 
M
T
 
I
L
 
A
T
 
L
F
x
M
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
R
x
K
R
 
S
L
 
L
G
 
T
G
 
N
L
 
V
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
S
 
R
A
 
G
R
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
C
E
 
Q
R
 
T
L
 
L
Y
 
F
E
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
-
A
 
S
P
 
E
G
 
Q
V
 
E
F
 
K
A
 
D
P
 
E
A
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
V
A
 
I
R
 
E
P
 
R
A
 
A
S
 
T
T
 
G
L
 
D
I
 
V
R
 
E
F
 
F
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
G
 
T
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
G
 
P
Q
 
G
K
 
R
-
 
D
-
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
N
L
 
I
S
 
N
F
 
L
S
 
K
A
 
I
E
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
I
 
I
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
S
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
M
G
 
D
G
 
G
V
 
H
P
 
D
I
 
L
T
 
R
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
P
 
L
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
Q
F
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
Q
D
 
N
A
 
V
A
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
N
E
 
D
T
 
T
I
 
V
R
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
-
 
T
Q
 
E
D
 
Q
V
 
Y
T
 
S
P
 
R
E
 
E
V
 
Q
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
R
 
M
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
N
A
 
K
M
 
M
P
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
V
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
R
K
 
A
V
 
I
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
E
E
 
D
G
 
G
Q
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
 
Q
L
 
L
C
 
H
R
 
K
M
 
M
Q
 
Q

6bppA E. Coli msba in complex with lps and inhibitor g092 (see paper)
33% identity, 95% coverage: 28:589/592 of query aligns to 7:576/576 of 6bppA

query
sites
6bppA
W
 
W
R
 
Q
D
 
T
Y
 
F
L
 
-
R
 
R
Q
 
R
Q
 
L
W
 
W
P
 
P
L
 
T
M
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
G
L
 
V
L
 
A
L
 
L
M
 
I
V
 
L
E
 
N
G
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
D
G
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
L
W
 
S
M
 
L
I
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
D
V
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
K
G
 
T
Q
 
D
T
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
L
I
 
V
W
 
W
V
 
M
G
 
P
G
 
L
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
I
I
 
L
R
 
R
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
Y
A
 
V
S
 
S
K
 
S
T
 
Y
L
 
C
L
 
I
T
 
S
S
 
W
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
G
 
K
S
 
V
S
 
V
T
 
M
A
 
T
M
 
M
Q
 
R
I
 
R
D
 
R
I
 
L
V
 
F
R
 
G
H
 
H
I
 
M
L
 
M
R
 
G
L
 
M
D
 
P
Q
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
N
 
Q
P
 
S
P
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
Y
D
 
D
T
 
S
Q
 
E
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
G
 
S
V
 
S
W
 
S
S
 
S
V
 
G
F
 
A
V
 
L
S
 
I
G
 
T
A
 
V
G
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
I
V
 
M
A
 
M
L
 
F
A
 
Y
I
 
Y
D
 
S
W
 
W
R
 
Q
W
 
L
T
 
S
L
 
I
A
 
I
A
x
L
L
 
I
I
 
V
G
 
L
A
|
A
P
 
P
L
 
I
L
x
V
-
x
S
I
 
I
A
 
A
P
x
I
T
 
R
A
 
V
M
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
R
Y
 
F
I
 
-
R
 
R
R
 
N
K
 
I
T
 
S
K
 
K
Q
 
N
M
 
M
R
 
Q
D
 
N
E
 
T
S
 
M
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
A
 
T
T
 
T
R
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
V
 
M
F
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
H
A
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
L
L
 
I
Y
 
F
Q
 
G
M
 
G
E
 
Q
E
 
E
Y
 
V
Q
 
E
L
 
T
G
 
K
R
 
R
F
 
F
T
 
D
G
 
K
L
 
V
V
 
S
H
 
N
R
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
L
A
 
Q
M
 
G
V
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
V
F
 
S
S
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
V
 
S
P
 
D
A
 
P
L
 
I
I
 
I
D
 
Q
V
 
L
M
 
I
T
x
A
G
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
L
F
 
A
A
 
F
V
 
V
L
 
L
M
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
P
I
 
S
T
 
V
S
 
M
G
 
D
E
 
S
R
 
L
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
T
F
 
I
M
 
T
S
 
V
F
 
V
F
 
F
T
 
S
A
 
S
M
|
M
T
 
I
L
 
A
T
x
L
F
x
M
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
R
x
K
R
 
S
L
 
L
G
 
T
G
 
N
L
 
V
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
S
 
R
A
 
G
R
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
C
E
 
Q
R
 
T
L
 
L
Y
 
F
E
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
-
A
 
S
P
 
E
G
 
Q
V
 
E
F
 
K
A
 
D
P
 
E
A
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
V
A
 
I
R
 
E
P
 
R
A
 
A
S
 
T
T
 
G
L
 
D
I
 
V
R
 
E
F
 
F
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
G
 
T
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
G
 
P
Q
 
G
K
 
R
-
 
D
-
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
N
L
 
I
S
 
N
F
 
L
S
 
K
A
 
I
E
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
I
 
I
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
S
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
M
G
 
D
G
 
G
V
 
H
P
 
D
I
 
L
T
 
R
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
P
 
L
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
Q
F
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
Q
D
 
N
A
 
V
A
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
N
E
 
D
T
 
T
I
 
V
R
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
-
 
T
Q
 
E
D
 
Q
V
 
Y
T
 
S
P
 
R
E
 
E
V
 
Q
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
R
 
M
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
N
A
 
K
M
 
M
P
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
V
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
R
K
 
A
V
 
I
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
E
E
 
D
G
 
G
Q
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
 
Q
L
 
L
C
 
H
R
 
K
M
 
M
Q
 
Q

6bplA E. Coli msba in complex with lps and inhibitor g907 (see paper)
33% identity, 95% coverage: 28:589/592 of query aligns to 7:576/576 of 6bplA

query
sites
6bplA
W
 
W
R
 
Q
D
 
T
Y
 
F
L
 
-
R
 
R
Q
 
R
Q
 
L
W
 
W
P
 
P
L
 
T
M
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
G
L
 
V
L
 
A
L
 
L
M
 
I
V
 
L
E
 
N
G
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
D
G
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
L
W
 
S
M
 
L
I
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
D
V
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
K
G
 
T
Q
 
D
T
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
L
I
 
V
W
 
W
V
 
M
G
 
P
G
 
L
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
I
I
 
L
R
 
R
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
Y
A
 
V
S
 
S
K
 
S
T
 
Y
L
 
C
L
 
I
T
 
S
S
 
W
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
G
 
K
S
 
V
S
 
V
T
 
M
A
 
T
M
 
M
Q
 
R
I
 
R
D
 
R
I
 
L
V
 
F
R
 
G
H
 
H
I
 
M
L
 
M
R
 
G
L
 
M
D
 
P
Q
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
N
 
Q
P
 
S
P
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
Y
D
 
D
T
 
S
Q
 
E
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
G
 
S
V
 
S
W
 
S
S
 
S
V
 
G
F
 
A
V
 
L
S
 
I
G
 
T
A
 
V
G
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
G
L
 
L
F
|
F
V
 
I
V
 
M
A
 
M
L
 
F
A
 
Y
I
 
Y
D
 
S
W
 
W
R
 
Q
W
 
L
T
 
S
L
 
I
A
 
I
A
x
L
L
 
I
I
 
V
G
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
x
V
-
x
S
I
 
I
A
 
A
P
x
I
T
 
R
A
 
V
M
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
R
Y
 
F
I
 
-
R
 
R
R
 
N
K
 
I
T
 
S
K
 
K
Q
 
N
M
 
M
R
 
Q
D
 
N
E
 
T
S
 
M
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
A
 
T
T
 
T
R
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
V
 
M
F
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
H
A
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
L
L
 
I
Y
 
F
Q
 
G
M
 
G
E
 
Q
E
 
E
Y
 
V
Q
 
E
L
 
T
G
 
K
R
 
R
F
 
F
T
 
D
G
 
K
L
 
V
V
 
S
H
 
N
R
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
L
A
 
Q
M
 
G
V
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
V
F
 
S
S
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
V
 
S
P
 
D
A
 
P
L
 
I
I
 
I
D
 
Q
V
 
L
M
 
I
T
x
A
G
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
L
F
 
A
A
 
F
V
 
V
L
 
L
M
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
P
I
 
S
T
 
V
S
 
M
G
 
D
E
 
S
R
 
L
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
T
F
 
I
M
 
T
S
 
V
F
 
V
F
 
F
T
 
S
A
 
S
M
|
M
T
 
I
L
 
A
T
x
L
F
x
M
Q
 
R
P
 
P
L
|
L
R
x
K
R
 
S
L
 
L
G
 
T
G
 
N
L
 
V
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
S
 
R
A
 
G
R
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
C
E
 
Q
R
 
T
L
 
L
Y
 
F
E
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
-
A
 
S
P
 
E
G
 
Q
V
 
E
F
 
K
A
 
D
P
 
E
A
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
V
A
 
I
R
 
E
P
 
R
A
 
A
S
 
T
T
 
G
L
 
D
I
 
V
R
 
E
F
 
F
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
G
 
T
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
G
 
P
Q
 
G
K
 
R
-
 
D
-
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
N
L
 
I
S
 
N
F
 
L
S
 
K
A
 
I
E
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
I
 
I
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
S
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
M
G
 
D
G
 
G
V
 
H
P
 
D
I
 
L
T
 
R
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
P
 
L
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
Q
F
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
Q
D
 
N
A
 
V
A
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
N
E
 
D
T
 
T
I
 
V
R
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
-
 
T
Q
 
E
D
 
Q
V
 
Y
T
 
S
P
 
R
E
 
E
V
 
Q
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
R
 
M
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
N
A
 
K
M
 
M
P
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
V
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
R
K
 
A
V
 
I
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
E
E
 
D
G
 
G
Q
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
 
Q
L
 
L
C
 
H
R
 
K
M
 
M
Q
 
Q

7bcwA Structure of msba in salipro with adp vanadate (see paper)
33% identity, 95% coverage: 28:589/592 of query aligns to 5:574/574 of 7bcwA

query
sites
7bcwA
W
 
W
R
 
Q
D
 
T
Y
 
F
L
 
-
R
 
R
Q
 
R
Q
 
L
W
 
W
P
 
P
L
 
T
M
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
G
L
 
V
L
 
A
L
 
L
M
 
I
V
 
L
E
 
N
G
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
D
G
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
L
W
 
S
M
 
L
I
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
D
V
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
K
G
 
T
Q
 
D
T
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
L
I
 
V
W
 
W
V
 
M
G
 
P
G
 
L
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
I
I
 
L
R
 
R
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
Y
A
 
V
S
 
S
K
 
S
T
 
Y
L
 
C
L
 
I
T
 
S
S
 
W
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
G
 
K
S
 
V
S
 
V
T
 
M
A
 
T
M
 
M
Q
 
R
I
 
R
D
 
R
I
 
L
V
 
F
R
 
G
H
 
H
I
 
M
L
 
M
R
 
G
L
 
M
D
 
P
Q
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
N
 
Q
P
 
S
P
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
Y
D
 
D
T
 
S
Q
 
E
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
G
 
S
V
 
S
W
 
S
S
 
S
V
 
G
F
 
A
V
 
L
S
 
I
G
 
T
A
 
V
G
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
I
V
 
M
A
 
M
L
 
F
A
 
Y
I
 
Y
D
 
S
W
 
W
R
 
Q
W
 
L
T
 
S
L
 
I
A
 
I
A
 
L
L
 
I
I
 
V
G
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
V
-
 
S
I
 
I
A
 
A
P
 
I
T
 
R
A
 
V
M
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
R
Y
 
F
I
 
-
R
 
R
R
 
N
K
 
I
T
 
S
K
 
K
Q
 
N
M
 
M
R
 
Q
D
 
N
E
 
T
S
 
M
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
A
 
T
T
 
T
R
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
V
 
M
F
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
H
A
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
L
L
 
I
Y
 
F
Q
 
G
M
 
G
E
 
Q
E
 
E
Y
 
V
Q
 
E
L
 
T
G
 
K
R
 
R
F
 
F
T
 
D
G
 
K
L
 
V
V
 
S
H
 
N
R
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
L
A
 
Q
M
 
G
V
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
V
F
 
S
S
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
V
 
S
P
 
D
A
 
P
L
 
I
I
 
I
D
 
Q
V
 
L
M
 
I
T
 
A
G
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
L
F
 
A
A
 
F
V
 
V
L
 
L
M
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
P
I
 
S
T
 
V
S
 
M
G
 
D
E
 
S
R
 
L
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
T
F
 
I
M
 
T
S
 
V
F
 
V
F
 
F
T
 
S
A
 
S
M
 
M
T
 
I
L
 
A
T
 
L
F
 
M
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
R
 
K
R
 
S
L
 
L
G
 
T
G
 
N
L
 
V
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
S
 
R
A
 
G
R
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
C
E
 
Q
R
 
T
L
 
L
Y
 
F
E
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
-
A
 
S
P
 
E
G
 
Q
V
 
E
F
 
K
A
 
D
P
 
E
A
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
V
A
 
I
R
 
E
P
 
R
A
 
A
S
 
T
T
 
G
L
 
D
I
 
V
R
 
E
F
 
F
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
G
 
T
L
 
F
S
 
T
Y
|
Y
G
 
P
Q
 
G
K
 
R
-
 
D
-
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
N
L
 
I
S
 
N
F
 
L
S
 
K
A
 
I
E
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
|
S
G
|
G
A
x
S
G
 
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
I
 
I
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
S
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
M
G
 
D
G
 
G
V
 
H
P
 
D
I
 
L
T
 
R
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
P
 
L
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
Q
F
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
|
Q
D
 
N
A
 
V
A
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
N
E
 
D
T
 
T
I
 
V
R
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
-
 
T
Q
 
E
D
 
Q
V
 
Y
T
 
S
P
 
R
E
 
E
V
 
Q
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
R
 
M
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
N
A
 
K
M
 
M
P
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
V
A
x
L
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
 
G
Q
|
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
|
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
R
K
 
A
V
 
I
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
E
E
 
D
G
 
G
Q
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
 
Q
L
 
L
C
 
H
R
 
K
M
 
M
Q
 
Q

7ph3A Amp-pnp bound nanodisc reconstituted msba with nanobodies, spin- labeled at position a60c (see paper)
33% identity, 95% coverage: 28:589/592 of query aligns to 8:577/577 of 7ph3A

query
sites
7ph3A
W
 
W
R
 
Q
D
 
T
Y
 
F
L
 
-
R
 
R
Q
 
R
Q
 
L
W
 
W
P
 
P
L
 
T
M
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
G
L
 
V
L
 
A
L
 
L
M
 
I
V
 
L
E
 
N
G
 
A
S
 
A
T
 
S
L
 
D
G
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
L
W
 
S
M
 
L
I
 
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
D
V
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
K
G
 
T
Q
 
D
T
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
L
I
 
V
W
 
W
V
 
M
G
 
P
G
 
L
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
I
I
 
L
R
 
R
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
Y
A
 
V
S
 
S
K
 
S
T
 
Y
L
 
C
L
 
I
T
 
S
S
 
W
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
G
 
K
S
 
V
S
 
V
T
 
M
A
 
T
M
 
M
Q
 
R
I
 
R
D
 
R
I
 
L
V
 
F
R
 
G
H
 
H
I
 
M
L
 
M
R
 
G
L
 
M
D
 
P
Q
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
N
 
Q
P
 
S
P
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
Y
D
 
D
T
 
S
Q
 
E
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
G
 
S
V
 
S
W
 
S
S
 
S
V
 
G
F
 
A
V
 
L
S
 
I
G
 
T
A
 
V
G
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
I
V
 
M
A
 
M
L
 
F
A
 
Y
I
 
Y
D
 
S
W
 
W
R
 
Q
W
 
L
T
 
S
L
 
I
A
 
I
A
 
L
L
 
I
I
 
V
G
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
V
-
 
S
I
 
I
A
 
A
P
 
I
T
 
R
A
 
V
M
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
R
Y
 
F
I
 
-
R
 
R
R
 
N
K
 
I
T
 
S
K
 
K
Q
 
N
M
 
M
R
 
Q
D
 
N
E
 
T
S
 
M
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
A
 
T
T
 
T
R
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
V
 
M
F
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
H
A
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
L
L
 
I
Y
 
F
Q
 
G
M
 
G
E
 
Q
E
 
E
Y
 
V
Q
 
E
L
 
T
G
 
K
R
 
R
F
 
F
T
 
D
G
 
K
L
 
V
V
 
S
H
 
N
R
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
L
A
 
Q
M
 
G
V
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
V
F
 
S
S
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
V
 
S
P
 
D
A
 
P
L
 
I
I
 
I
D
 
Q
V
 
L
M
 
I
T
 
A
G
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
L
F
 
A
A
 
F
V
 
V
L
 
L
M
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
P
I
 
S
T
 
V
S
 
M
G
 
D
E
 
S
R
 
L
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
T
F
 
I
M
 
T
S
 
V
F
 
V
F
 
F
T
 
S
A
 
S
M
 
M
T
 
I
L
 
A
T
 
L
F
 
M
Q
 
R
P
 
P
L
 
L
R
 
K
R
 
S
L
 
L
G
 
T
G
 
N
L
 
V
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
S
 
R
A
 
G
R
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
C
E
 
Q
R
 
T
L
 
L
Y
 
F
E
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
-
A
 
S
P
 
E
G
 
Q
V
 
E
F
 
K
A
 
D
P
 
E
A
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
V
A
 
I
R
 
E
P
 
R
A
 
A
S
 
T
T
 
G
L
 
D
I
 
V
R
 
E
F
 
F
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
G
 
T
L
 
F
S
 
T
Y
|
Y
G
 
P
Q
 
G
K
 
R
-
 
D
-
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
N
L
 
I
S
 
N
F
 
L
S
 
K
A
 
I
E
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
|
S
G
|
G
A
 
S
G
|
G
K
|
K
S
|
S
S
x
T
I
 
I
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
S
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
M
G
 
D
G
 
G
V
 
H
P
 
D
I
 
L
T
 
R
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
P
 
L
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
Q
F
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
|
Q
D
 
N
A
 
V
A
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
N
E
 
D
T
 
T
I
 
V
R
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
-
 
T
Q
 
E
D
 
Q
V
 
Y
T
 
S
P
 
R
E
 
E
V
 
Q
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
R
 
M
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
N
A
 
K
M
 
M
P
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
V
A
x
L
L
 
L
S
|
S
G
 
G
G
|
G
Q
|
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
R
K
 
A
V
 
I
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
|
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
E
E
 
D
G
 
G
Q
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
V
Y
 
Y
A
 
A
N
 
Q
L
 
L
C
 
H
R
 
K
M
 
M
Q
 
Q

7ph2A Nanodisc reconstituted msba in complex with nanobodies, spin-labeled at position a60c (see paper)
33% identity, 94% coverage: 32:590/592 of query aligns to 2:569/569 of 7ph2A

query
sites
7ph2A
L
 
F
R
 
R
Q
 
R
Q
 
L
W
 
W
P
 
P
L
 
T
M
 
I
A
 
A
-
 
P
-
 
F
-
 
K
-
 
A
-
 
G
-
 
L
-
 
I
V
 
V
A
 
A
M
 
G
L
 
V
L
 
A
L
 
L
M
 
I
V
 
L
E
 
N
G
 
A
S
 
A
T
 
S
L
x
D
G
 
T
L
 
F
L
 
M
S
 
L
W
 
S
M
 
L
I
x
L
E
 
K
P
 
P
L
 
L
F
 
L
D
 
D
R
 
D
V
 
G
F
 
F
A
 
G
Q
 
K
G
 
T
Q
 
D
T
 
R
G
 
S
A
 
V
V
 
L
I
 
V
W
 
W
V
 
M
G
 
P
G
 
L
A
 
V
I
 
V
F
 
I
G
 
G
L
 
L
F
 
M
L
 
I
I
 
L
R
 
R
A
 
G
I
 
I
T
 
T
S
 
S
V
 
Y
A
 
V
S
 
S
K
 
S
T
 
Y
L
 
C
L
 
I
T
 
S
S
 
W
V
 
V
A
 
S
Q
 
G
G
 
K
S
 
V
S
 
V
T
 
M
A
 
T
M
 
M
Q
 
R
I
 
R
D
 
R
I
 
L
V
 
F
R
 
G
H
 
H
I
 
M
L
 
M
R
 
G
L
 
M
D
 
P
Q
 
V
S
 
S
F
 
F
F
 
F
Q
 
D
A
 
K
N
 
Q
P
 
S
P
 
T
G
 
G
A
 
T
L
 
L
I
 
L
D
 
S
R
 
R
V
 
I
Q
 
T
G
 
Y
D
 
D
T
 
S
Q
 
E
A
 
Q
V
 
V
Q
 
A
G
 
S
V
 
S
W
 
S
S
 
S
V
 
G
F
 
A
V
 
L
S
 
I
G
 
T
A
 
V
G
 
V
R
 
R
D
 
E
A
 
G
V
 
A
S
 
S
L
 
I
V
 
I
S
 
G
L
 
L
F
 
F
V
 
I
V
 
M
A
 
M
L
 
F
A
 
Y
I
 
Y
D
 
S
W
 
W
R
 
Q
W
 
L
T
 
S
L
 
I
A
 
I
A
 
L
L
 
I
I
 
V
G
 
L
A
 
A
P
 
P
L
 
I
L
 
V
-
 
S
I
 
I
A
 
A
P
 
I
T
 
R
A
 
V
M
 
V
A
 
S
Q
 
K
R
 
R
Y
 
F
I
 
-
R
 
R
R
 
N
K
 
I
T
 
S
K
 
K
Q
 
N
M
 
M
R
 
Q
D
 
N
E
 
T
S
 
M
G
 
G
Q
 
Q
R
 
V
A
 
T
T
 
T
R
 
S
L
 
A
D
 
E
E
 
Q
V
 
M
F
 
L
H
 
K
G
 
G
I
 
H
A
 
K
A
 
E
V
 
V
K
 
L
L
 
I
Y
 
F
Q
 
G
M
 
G
E
 
Q
E
 
E
Y
 
V
Q
 
E
L
 
T
G
 
K
R
 
R
F
 
F
T
 
D
G
 
K
L
 
V
V
 
S
H
 
N
R
 
R
I
 
M
R
 
R
R
 
L
A
 
Q
M
 
G
V
 
M
K
 
K
M
 
M
S
 
V
F
 
S
S
 
A
Q
 
S
S
 
S
I
 
I
V
 
S
P
 
D
A
 
P
L
 
I
I
 
I
D
 
Q
V
 
L
M
 
I
T
 
A
G
 
S
L
 
L
G
 
A
F
 
L
F
 
A
A
 
F
V
 
V
L
 
L
M
 
Y
M
 
A
A
 
A
S
 
S
P
 
F
E
 
P
I
 
S
T
 
V
S
 
M
G
 
D
E
 
S
R
 
L
S
 
T
V
 
A
G
 
G
E
 
T
F
 
I
M
 
T
S
 
V
F
 
V
F
|
F
T
 
S
A
 
S
M
 
M
T
 
I
L
x
A
T
 
L
F
 
M
Q
x
R
P
 
P
L
 
L
R
 
K
R
 
S
L
 
L
G
 
T
G
 
N
L
 
V
A
 
N
G
 
A
T
 
Q
W
 
F
Q
 
Q
S
 
R
A
 
G
R
 
M
A
 
A
S
 
A
L
 
C
E
 
Q
R
 
T
L
 
L
Y
 
F
E
 
T
V
 
I
L
 
L
D
 
D
I
 
-
A
 
S
P
 
E
G
 
Q
V
 
E
F
 
K
A
 
D
P
 
E
A
 
G
A
 
K
P
 
R
A
 
V
A
 
I
R
 
E
P
 
R
A
 
A
S
 
T
T
 
G
L
 
D
I
 
V
R
 
E
F
 
F
E
 
R
Q
 
N
V
 
V
G
 
T
L
 
F
S
 
T
Y
 
Y
G
 
P
Q
 
G
K
 
R
-
 
D
-
 
V
P
 
P
V
 
A
L
 
L
R
 
R
G
 
N
L
 
I
S
 
N
F
 
L
S
 
K
A
 
I
E
 
P
A
 
A
G
 
G
K
 
K
T
 
T
T
 
V
A
 
A
L
 
L
V
 
V
G
 
G
P
 
R
S
 
S
G
 
G
A
 
S
G
 
G
K
 
K
S
 
S
S
 
T
I
 
I
F
 
A
N
 
S
L
 
L
L
 
I
T
 
T
R
 
R
L
 
F
V
 
Y
E
 
D
A
 
I
Q
 
D
S
 
E
G
 
G
A
 
E
I
 
I
T
 
L
L
 
M
G
 
D
G
 
G
V
 
H
P
 
D
I
 
L
T
 
R
A
 
E
L
 
Y
D
 
T
P
 
L
A
 
A
V
 
S
L
 
L
R
 
R
S
 
N
L
 
Q
F
 
V
A
 
A
M
 
L
V
 
V
T
 
S
Q
 
Q
D
 
N
A
 
V
A
 
H
L
 
L
F
 
F
D
 
N
E
 
D
T
 
T
I
 
V
R
 
A
E
 
N
N
 
N
I
 
I
L
 
A
L
 
Y
G
 
A
R
 
R
-
 
T
Q
 
E
D
 
Q
V
 
Y
T
 
S
P
 
R
E
 
E
V
 
Q
L
 
I
A
 
E
R
 
E
A
 
A
I
 
A
E
 
R
V
 
M
A
 
A
H
 
Y
V
 
A
R
 
M
E
 
D
F
 
F
V
 
I
E
 
N
A
 
K
M
 
M
P
 
D
L
 
N
G
 
G
L
 
L
D
 
D
T
 
T
P
 
V
A
 
I
G
 
G
P
 
E
R
 
N
G
 
G
S
 
V
A
 
L
L
 
L
S
 
S
G
 
G
G
 
G
Q
 
Q
R
 
R
Q
 
Q
R
 
R
V
 
I
A
 
A
I
 
I
A
 
A
R
 
R
A
 
A
V
 
L
L
 
L
R
 
R
D
 
D
A
 
S
P
 
P
I
 
I
L
 
L
L
 
I
L
 
L
D
 
D
E
 
E
A
 
A
T
 
T
S
 
S
A
 
A
L
 
L
D
 
D
T
 
T
A
 
E
S
 
S
E
 
E
A
 
R
K
 
A
V
 
I
A
 
Q
E
 
A
A
 
A
L
 
L
T
 
D
E
 
E
L
 
L
S
 
Q
Q
 
K
G
 
N
R
 
R
T
 
T
T
 
S
L
 
L
V
 
V
I
 
I
A
 
A
H
 
H
R
 
R
L
 
L
S
 
S
T
 
T
V
 
I
R
 
E
N
 
K
A
 
A
D
 
D
K
 
E
I
 
I
V
 
V
V
 
V
I
 
V
V
 
E
E
 
D
G
 
G
Q
 
V
V
 
I
V
 
V
E
 
E
E
 
R
G
 
G
S
 
T
H
 
H
D
 
N
D
 
D
L
 
L
L
 
L
A
 
E
R
 
H
G
 
R
G
 
G
A
 
V
Y