SitesBLAST – Find functional sites

 

SitesBLAST

Comparing WP_111392228.1 NCBI__GCF_003253485.1:WP_111392228.1 to proteins with known functional sites using BLASTp with E ≤ 0.001.

Or try Sites on a Tree, PaperBLAST, Conserved Domains, or compare to all protein structures

Found 20 (the maximum) hits to proteins with known functional sites (download)

Q9LBG2 Levodione reductase; (6R)-2,2,6-trimethyl-1,4-cyclohexanedione reductase; EC 1.1.1.- from Leifsonia aquatica (Corynebacterium aquaticum) (see paper)
50% identity, 99% coverage: 1:257/260 of query aligns to 11:267/267 of Q9LBG2

query
sites
Q9LBG2
M
 
F
K
 
T
N
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
V
I
x
L
I
|
I
T
|
T
G
|
G
A
x
G
A
x
G
M
x
S
G
|
G
L
|
L
G
|
G
Y
x
R
A
|
A
A
x
T
A
|
A
K
x
V
E
x
R
L
|
L
A
|
A
S
x
A
K
x
E
G
|
G
A
|
A
H
x
K
L
|
L
V
x
S
L
|
L
V
 
V
D
 
D
Y
 
V
N
 
S
Q
 
S
K
 
E
S
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
A
A
 
S
K
 
K
S
 
A
E
 
A
I
 
V
I
 
L
K
 
E
E
 
T
F
 
A
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
K
 
E
I
 
V
I
 
L
T
 
T
V
 
T
I
 
V
A
 
A
D
 
D
V
 
V
S
 
S
K
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
Q
V
 
V
K
 
E
N
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
T
V
 
T
K
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
|
E
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
I
 
T
T
 
E
E
 
S
Y
 
F
D
 
T
V
 
A
D
 
A
V
 
E
F
 
F
K
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
V
D
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
M
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
Y
 
L
G
 
G
M
 
L
R
 
E
Y
 
K
V
 
V
I
 
L
P
 
K
V
 
I
M
 
M
Q
 
R
K
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
S
G
 
G
R
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
V
 
T
A
 
A
S
 
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
G
N
 
N
Q
 
Q
T
 
S
P
 
G
Y
 
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
A
K
 
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
N
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
R
T
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
 
P
G
 
G
A
 
A
I
 
I
L
 
W
T
 
T
P
 
P
M
 
M
V
 
V
A
 
E
E
 
N
A
 
S
F
 
M
K
 
K
Q
 
Q
V
 
L
N
 
D
P
 
P
A
 
E
D
 
N
P
 
P
K
 
R
A
 
K
A
 
A
E
 
A
S
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
I
Q
 
Q
R
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
S
K
 
K
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
K
 
E
P
 
A
E
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
D
D
 
D
N
 
A
G
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
G
 
A
Q
 
T
T
 
V
I
 
V
A
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
S
N
 
A
I
 
A
Y
 
Y

1iy8A Crystal structure of levodione reductase (see paper)
50% identity, 99% coverage: 1:257/260 of query aligns to 2:258/258 of 1iy8A

query
sites
1iy8A
M
 
F
K
 
T
N
 
D
K
 
R
V
 
V
M
 
V
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
G
A
 
G
M
x
S
G
|
G
L
|
L
G
 
G
Y
 
R
A
 
A
A
 
T
A
 
A
K
 
V
E
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
A
K
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
L
 
L
V
 
S
L
 
L
V
 
V
D
|
D
Y
x
V
N
 
S
Q
 
S
K
 
E
S
 
G
L
 
L
E
 
E
D
 
A
A
 
S
K
 
K
S
 
A
E
 
A
I
 
V
I
 
L
K
 
E
E
 
T
F
 
A
P
 
P
Q
 
D
A
 
A
K
 
E
I
 
V
I
 
L
T
 
T
V
 
T
I
 
V
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
D
E
 
E
D
 
A
A
 
Q
V
 
V
K
 
E
N
 
A
Y
 
Y
V
 
V
D
 
T
E
 
A
A
 
T
V
 
T
K
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
G
F
 
F
Y
 
F
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
E
 
E
G
 
G
R
 
K
Q
 
Q
A
 
N
P
 
P
I
 
T
T
 
E
E
 
S
Y
 
F
D
 
T
V
 
A
D
 
A
V
 
E
F
 
F
K
 
D
K
 
K
V
 
V
I
 
V
D
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
M
 
R
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
Y
 
L
G
 
G
M
 
L
R
 
E
Y
 
K
V
 
V
I
 
L
P
 
K
V
 
I
M
 
M
Q
 
R
K
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
S
G
 
G
R
 
M
I
 
V
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
V
 
V
G
 
G
G
 
G
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
I
L
 
G
N
 
N
Q
|
Q
T
 
S
P
 
G
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
N
 
N
A
 
S
A
 
A
L
 
V
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
R
D
 
Y
G
 
G
I
 
I
L
 
R
T
 
I
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
A
P
|
P
G
|
G
A
 
A
I
 
I
L
 
W
T
|
T
P
|
P
M
|
M
V
 
V
A
 
E
E
 
N
A
 
S
F
 
M
K
 
K
Q
 
Q
V
 
L
N
 
D
P
 
P
A
 
E
D
 
N
P
 
P
K
 
R
A
 
K
A
 
A
E
 
A
S
 
E
E
 
E
Y
 
F
A
 
I
Q
 
Q
R
 
V
N
 
N
P
 
P
T
 
S
K
 
K
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
K
 
E
P
 
A
E
 
P
E
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
A
L
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
S
E
 
D
D
 
D
N
 
A
G
 
S
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
G
 
A
Q
 
T
T
 
V
I
 
V
A
 
P
I
 
I
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
Q
S
 
S
N
 
A
I
 
A
Y
 
Y

6zzqA Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and acetoacetate (see paper)
38% identity, 97% coverage: 1:252/260 of query aligns to 4:256/260 of 6zzqA

query
sites
6zzqA
M
 
L
K
 
D
N
 
G
K
 
K
V
 
V
M
 
A
I
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
M
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
E
A
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
K
L
 
F
A
 
A
S
 
Q
K
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
S
D
|
D
Y
x
M
N
 
N
Q
 
A
K
 
E
S
 
K
L
 
C
E
 
Q
D
 
E
A
 
T
K
 
A
S
 
N
E
 
S
I
 
L
I
 
K
K
 
E
E
 
Q
F
 
G
P
 
F
Q
 
D
A
 
A
K
 
-
I
 
-
I
 
L
T
 
S
V
 
A
I
 
P
A
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
K
 
D
E
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
Y
K
 
K
N
 
Q
Y
 
A
V
 
I
D
 
E
E
 
L
A
 
T
V
 
Q
K
 
K
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
I
F
 
L
Y
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
E
x
Q
G
 
-
R
 
H
Q
 
V
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
E
Y
 
F
D
 
P
V
 
T
D
 
A
V
 
V
F
 
F
K
 
Q
K
 
K
V
 
L
I
 
V
D
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
M
 
T
G
 
G
V
 
A
Y
 
F
Y
 
I
G
 
G
M
 
I
R
 
K
Y
 
H
V
 
V
I
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
M
Q
 
K
K
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
G
 
N
G
 
G
I
 
L
R
 
I
G
 
G
V
 
F
L
 
A
N
 
G
Q
x
K
T
 
A
P
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
C
G
 
A
R
 
R
D
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
T
T
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
C
P
 
P
G
 
G
A
x
Y
I
x
V
L
 
D
T
|
T
P
 
P
M
 
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
-
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
L
F
 
A
K
 
K
Q
 
T
V
 
R
N
 
N
P
 
V
A
 
S
D
 
L
P
 
D
K
 
S
A
 
A
A
 
L
E
 
E
S
 
D
E
 
V
Y
 
I
A
 
L
Q
 
A
R
 
M
N
 
V
P
 
P
T
 
Q
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
L
K
 
S
P
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
Y
V
 
A
A
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
S
D
 
K
N
 
A
G
 
G
Y
 
G
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6zzsD Crystal structure of (r)-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from acinetobacter baumannii complexed with NAD+ and 3-oxovalerate (see paper)
38% identity, 97% coverage: 1:252/260 of query aligns to 5:257/261 of 6zzsD

query
sites
6zzsD
M
 
L
K
 
D
N
 
G
K
 
K
V
 
V
M
 
A
I
 
F
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
M
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
E
A
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
K
L
 
F
A
 
A
S
 
Q
K
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
S
D
|
D
Y
x
M
N
 
N
Q
 
A
K
 
E
S
 
K
L
 
C
E
 
Q
D
 
E
A
 
T
K
 
A
S
 
N
E
 
S
I
 
L
I
 
K
K
 
E
E
 
Q
F
 
G
P
 
F
Q
 
D
A
 
A
K
 
-
I
 
-
I
 
L
T
 
S
V
 
A
I
 
P
A
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
K
 
D
E
 
E
D
 
D
A
 
A
V
 
Y
K
 
K
N
 
Q
Y
 
A
V
 
I
D
 
E
E
 
L
A
 
T
V
 
Q
K
 
K
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
T
I
 
V
D
 
D
G
 
I
F
 
L
Y
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
F
E
x
Q
G
 
-
R
 
H
Q
 
V
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
E
Y
 
F
D
 
P
V
 
T
D
 
A
V
 
V
F
 
F
K
 
Q
K
 
K
V
 
L
I
 
V
D
 
Q
I
 
V
N
 
M
L
 
L
M
 
T
G
 
G
V
 
A
Y
 
F
Y
 
I
G
 
G
M
 
I
R
 
K
Y
 
H
V
 
V
I
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
M
Q
 
K
K
 
A
Q
 
Q
Q
 
K
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
M
A
|
A
S
|
S
V
 
I
G
x
N
G
 
G
I
 
L
R
 
I
G
 
G
V
 
F
L
 
A
N
 
G
Q
x
K
T
 
A
P
 
G
Y
|
Y
V
 
N
A
 
S
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
V
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
C
G
 
A
R
 
R
D
 
D
G
 
G
I
 
I
L
 
T
T
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
L
A
 
C
P
|
P
G
|
G
A
 
Y
I
x
V
L
 
D
T
|
T
P
 
P
M
x
L
V
 
V
-
 
R
-
 
G
-
x
Q
-
 
I
A
 
A
E
 
D
A
 
L
F
 
A
K
 
K
Q
 
T
V
 
R
N
 
N
P
 
V
A
 
S
D
 
L
P
 
D
K
 
S
A
 
A
A
 
L
E
 
E
S
 
D
E
 
V
Y
 
I
A
 
L
Q
 
A
R
 
M
N
 
V
P
 
P
T
 
Q
K
 
K
R
 
R
L
 
L
G
 
L
K
 
S
P
 
V
E
 
E
E
 
E
V
 
I
A
 
A
K
 
D
L
 
Y
V
 
A
A
 
I
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
S
D
 
K
N
 
A
G
 
G
Y
 
G
V
 
V
S
 
T
G
 
G
Q
 
Q
T
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
M
D
 
D
G
 
G
G
 
G

6ixmC Crystal structure of the ketone reductase chkred20 from the genome of chryseobacterium sp. Ca49 complexed with NAD (see paper)
39% identity, 97% coverage: 1:252/260 of query aligns to 3:244/248 of 6ixmC

query
sites
6ixmC
M
 
L
K
 
D
N
 
N
K
 
K
V
 
V
M
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
M
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
H
E
 
S
L
 
Y
A
 
A
S
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
L
 
V
V
 
I
L
 
V
V
 
S
D
|
D
Y
x
I
N
 
N
Q
 
E
K
 
D
S
 
H
L
 
G
E
 
N
D
 
K
A
 
A
K
 
V
S
 
E
E
 
D
I
 
I
I
 
K
K
 
A
E
 
Q
F
 
G
P
 
G
Q
 
E
A
 
A
K
 
S
I
 
F
I
 
V
T
 
K
V
 
-
I
 
-
A
|
A
D
|
D
V
x
T
S
 
S
K
 
N
E
 
P
D
 
E
A
 
E
V
 
V
K
 
E
N
 
A
Y
 
L
V
 
V
D
 
K
E
 
R
A
 
T
V
 
V
K
 
E
A
 
I
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
A
Y
 
C
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
 
G
I
 
I
E
 
G
G
 
G
R
 
E
Q
 
Q
A
 
A
P
 
L
I
 
A
T
 
G
E
 
D
Y
 
Y
D
 
G
V
 
L
D
 
D
V
 
S
F
 
W
K
 
R
K
 
K
V
 
V
I
 
L
D
 
S
I
 
I
N
 
N
L
 
L
M
 
D
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
Y
 
Y
G
 
G
M
 
C
R
 
K
Y
 
Y
V
 
E
I
 
L
P
 
E
V
 
Q
M
 
M
Q
 
E
K
 
K
Q
 
N
Q
 
G
F
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
M
A
 
A
S
|
S
V
 
I
G
 
H
G
 
G
I
 
I
R
 
V
G
 
A
V
 
A
L
 
P
N
 
L
Q
 
S
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
N
A
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
D
 
K
G
 
N
I
 
I
L
 
R
T
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
x
A
A
x
Y
I
|
I
L
 
E
T
 
T
P
 
P
M
x
L
V
 
L
A
 
E
E
 
S
A
 
L
F
 
T
K
 
K
Q
 
E
V
 
M
N
 
K
P
 
E
A
 
A
D
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
Y
 
L
A
 
I
Q
 
S
R
 
K
N
 
H
P
 
P
T
 
M
K
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
E
 
E
D
 
K
N
 
S
G
 
S
Y
 
F
V
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
G
T
 
Y
I
 
Y
A
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

5b4tA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and a substrate d-3- hydroxybutyrate (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:254/260 of query aligns to 2:258/260 of 5b4tA

query
sites
5b4tA
M
 
L
K
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
K
M
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
M
 
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
D
 
G
Y
x
F
N
 
G
Q
 
Q
-
 
P
K
 
E
S
 
D
L
 
I
E
 
E
D
 
R
A
 
E
K
 
R
S
 
S
E
 
T
I
 
L
I
 
E
K
 
S
E
 
K
F
 
F
P
 
-
Q
 
G
A
 
V
K
 
K
I
 
A
I
 
Y
T
 
Y
V
 
L
I
 
N
A
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
S
K
 
D
E
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
T
K
 
R
N
 
D
Y
 
F
V
 
I
D
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
L
Y
 
V
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
 
I
E
x
Q
G
 
-
R
 
H
Q
 
T
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
E
Y
 
F
D
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
K
F
 
W
K
 
N
K
 
A
V
 
I
I
 
I
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
V
 
V
Y
 
F
Y
 
H
G
 
G
M
 
T
R
 
A
Y
 
A
V
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
M
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
G
x
H
G
 
G
I
 
L
R
 
V
G
 
A
V
 
S
L
 
V
N
 
N
Q
x
K
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
N
G
 
A
R
 
G
D
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
T
T
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
|
P
G
|
G
A
x
W
I
x
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
M
x
L
V
|
V
A
 
E
-
 
K
-
x
Q
-
 
I
E
 
E
A
 
A
F
x
I
K
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
N
 
K
P
 
G
A
 
I
D
 
D
P
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
R
E
 
E
-
 
L
Y
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
N
 
Q
P
 
P
T
 
S
K
 
L
R
 
Q
L
 
F
G
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
K
 
G
L
 
A
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
E
 
A
D
 
A
N
 
A
G
 
D
Y
 
Q
V
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
I
 
L
A
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
W
S
 
T

3w8dA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase from alcaligenes faecalis complexed with NAD+ and an inhibitor methylmalonate
37% identity, 98% coverage: 1:254/260 of query aligns to 2:258/260 of 3w8dA

query
sites
3w8dA
M
 
L
K
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
K
M
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
M
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
D
 
G
Y
x
F
N
 
G
Q
 
Q
-
 
P
K
 
E
S
 
D
L
 
I
E
 
E
D
 
R
A
 
E
K
 
R
S
 
S
E
 
T
I
 
L
I
 
E
K
 
S
E
 
K
F
 
F
P
 
-
Q
 
G
A
 
V
K
 
K
I
 
A
I
 
Y
T
 
Y
V
 
L
I
 
N
A
|
A
D
|
D
V
x
L
S
 
S
K
 
D
E
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
T
K
 
R
N
 
D
Y
 
F
V
 
I
D
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
L
Y
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
E
x
Q
G
 
-
R
 
H
Q
 
T
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
E
Y
 
F
D
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
K
F
 
W
K
 
N
K
 
A
V
 
I
I
 
I
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
V
 
V
Y
 
F
Y
 
H
G
 
G
M
 
T
R
 
A
Y
 
A
V
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
M
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
G
x
H
G
 
G
I
 
L
R
 
V
G
 
A
V
 
S
L
 
V
N
 
N
Q
x
K
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
N
G
 
A
R
 
G
D
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
T
T
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
|
P
G
|
G
A
x
W
I
x
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
M
x
L
V
|
V
A
 
E
-
 
K
-
x
Q
-
 
I
E
 
E
A
 
A
F
x
I
K
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
N
 
K
P
 
G
A
 
I
D
 
D
P
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
R
E
 
E
-
 
L
Y
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
N
 
Q
P
 
P
T
 
S
K
 
L
R
 
Q
L
 
F
G
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
K
 
G
L
 
A
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
E
 
A
D
 
A
N
 
A
G
 
D
Y
 
Q
V
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
I
 
L
A
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
x
W
S
 
T

3vdrA Crystal structure of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase, prepared in the presence of the substrate d-3-hydroxybutyrate and NAD(+) (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:254/260 of query aligns to 2:258/260 of 3vdrA

query
sites
3vdrA
M
 
L
K
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
K
M
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
x
T
M
 
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
D
 
G
Y
x
F
N
 
G
Q
 
Q
-
 
P
K
 
E
S
 
D
L
 
I
E
 
E
D
 
R
A
 
E
K
 
R
S
 
S
E
 
T
I
 
L
I
 
E
K
 
S
E
 
K
F
 
F
P
 
-
Q
 
G
A
 
V
K
 
K
I
 
A
I
 
Y
T
 
Y
V
 
L
I
 
N
A
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
S
K
 
D
E
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
T
K
 
R
N
 
D
Y
 
F
V
 
I
D
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
L
Y
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
E
x
Q
G
 
-
R
 
H
Q
 
T
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
E
Y
 
F
D
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
K
F
 
W
K
 
N
K
 
A
V
 
I
I
 
I
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
V
 
V
Y
 
F
Y
 
H
G
 
G
M
 
T
R
 
A
Y
 
A
V
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
M
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
G
x
H
G
 
G
I
 
L
R
 
V
G
 
A
V
 
S
L
 
V
N
 
N
Q
x
K
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
N
G
 
A
R
 
G
D
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
T
T
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
|
G
A
x
W
I
x
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
M
x
L
V
|
V
A
 
E
-
 
K
-
x
Q
-
 
I
E
 
E
A
 
A
F
x
I
K
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
N
 
K
P
 
G
A
 
I
D
 
D
P
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
R
E
 
E
-
 
L
Y
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
N
 
Q
P
 
P
T
 
S
K
 
L
R
 
Q
L
 
F
G
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
K
 
G
L
 
A
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
E
 
A
D
 
A
N
 
A
G
 
D
Y
 
Q
V
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
I
 
L
A
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
x
W
S
 
T

3vdqA Crystal structure of alcaligenes faecalis d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase in complex with NAD(+) and acetate (see paper)
37% identity, 98% coverage: 1:254/260 of query aligns to 2:258/260 of 3vdqA

query
sites
3vdqA
M
 
L
K
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
K
M
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
T
M
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
A
 
M
A
 
A
K
 
T
E
 
E
L
 
L
A
 
A
S
 
K
K
 
A
G
 
G
A
 
A
H
 
D
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
N
D
 
G
Y
x
F
N
 
G
Q
 
Q
-
 
P
K
 
E
S
 
D
L
 
I
E
 
E
D
 
R
A
 
E
K
 
R
S
 
S
E
 
T
I
 
L
I
 
E
K
 
S
E
 
K
F
 
F
P
 
-
Q
 
G
A
 
V
K
 
K
I
 
A
I
 
Y
T
 
Y
V
 
L
I
 
N
A
 
A
D
|
D
V
x
L
S
 
S
K
 
D
E
 
A
D
 
Q
A
 
A
V
 
T
K
 
R
N
 
D
Y
 
F
V
 
I
D
 
A
E
 
K
A
 
A
V
 
A
K
 
E
A
 
A
F
 
L
G
 
G
R
 
G
I
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
L
Y
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
E
x
Q
G
 
-
R
 
H
Q
 
T
A
 
A
P
 
P
I
 
I
T
 
E
E
 
E
Y
 
F
D
 
P
V
 
V
D
 
D
V
 
K
F
 
W
K
 
N
K
 
A
V
 
I
I
 
I
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
V
 
V
Y
 
F
Y
 
H
G
 
G
M
 
T
R
 
A
Y
 
A
V
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
I
M
 
M
Q
 
Q
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
W
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
G
x
H
G
 
G
I
 
L
R
 
V
G
 
A
V
 
S
L
 
V
N
 
N
Q
x
K
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
N
G
 
A
R
 
G
D
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
T
T
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
|
P
G
|
G
A
x
W
I
x
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
M
x
L
V
|
V
A
 
E
-
 
K
-
x
Q
-
 
I
E
 
E
A
 
A
F
x
I
K
 
S
Q
 
Q
V
 
Q
N
 
K
P
 
G
A
 
I
D
 
D
P
 
I
K
 
E
A
 
A
A
 
A
E
 
A
S
 
R
E
 
E
-
 
L
Y
 
L
A
 
A
Q
 
E
R
 
K
N
 
Q
P
 
P
T
 
S
K
 
L
R
 
Q
L
 
F
G
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
K
 
G
L
 
A
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
E
 
A
D
 
A
N
 
A
G
 
D
Y
 
Q
V
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
I
 
L
A
 
S
I
 
L
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
W
S
 
T

4nbuB Crystal structure of fabg from bacillus sp (see paper)
40% identity, 97% coverage: 1:252/260 of query aligns to 5:241/244 of 4nbuB

query
sites
4nbuB
M
 
L
K
 
Q
N
 
D
K
 
K
V
 
V
M
 
A
I
 
I
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
A
M
x
N
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
E
A
 
A
A
 
A
K
 
R
E
 
V
L
 
F
A
 
M
S
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
A
D
|
D
Y
x
F
N
 
N
Q
 
-
K
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
E
D
 
A
A
 
A
K
 
G
S
 
K
E
 
E
I
 
A
I
 
V
K
 
E
E
 
A
F
 
N
P
 
P
Q
 
G
A
 
V
K
 
V
I
 
F
I
 
I
T
 
R
V
|
V
I
 
-
A
 
-
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
D
E
 
R
D
 
E
A
 
S
V
 
V
K
 
H
N
 
R
Y
 
L
V
 
V
D
 
E
E
 
N
A
 
V
V
 
A
K
 
E
A
 
R
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
I
F
 
L
Y
 
I
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
|
I
E
 
T
G
 
-
R
 
R
Q
x
D
A
 
S
P
 
M
I
 
L
T
 
S
E
x
K
Y
 
M
D
 
T
V
 
V
D
 
D
V
 
Q
F
 
F
K
 
Q
K
 
Q
V
 
V
I
 
I
D
 
N
I
 
V
N
|
N
L
 
L
M
 
T
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
Y
 
H
G
 
C
M
 
T
R
 
Q
Y
 
A
V
 
V
I
 
L
P
 
P
V
 
Y
M
 
M
Q
 
A
K
 
E
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
K
G
 
G
R
 
K
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
x
T
A
 
S
S
|
S
V
 
V
G
 
T
G
 
G
I
 
T
R
 
Y
G
 
G
V
x
N
L
x
V
N
 
G
Q
|
Q
T
 
T
P
 
N
Y
|
Y
V
 
A
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
A
A
 
G
V
 
V
S
 
I
G
 
G
M
 
M
T
 
T
K
 
K
N
 
T
A
 
W
A
 
A
L
 
K
E
 
E
Y
 
L
G
 
A
R
 
R
D
 
K
G
 
G
I
 
I
L
 
N
T
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
A
P
|
P
G
 
G
A
x
F
I
x
T
L
 
E
T
|
T
P
 
A
M
|
M
V
 
V
A
 
A
E
 
E
A
 
V
F
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
-
N
 
-
P
 
-
A
 
-
D
 
-
P
 
P
K
 
E
A
 
K
A
 
V
E
 
I
S
 
E
E
x
K
Y
 
M
A
 
K
Q
 
A
R
 
Q
N
 
V
P
 
P
T
 
M
K
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
N
L
 
A
V
 
Y
A
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
H
D
 
E
N
 
S
G
 
D
Y
 
Y
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
H
T
 
V
I
 
L
A
 
H
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

2ztlA Closed conformation of d-3-hydroxybutyrate dehydrogenase complexed with NAD+ and l-3-hydroxybutyrate (see paper)
36% identity, 98% coverage: 1:254/260 of query aligns to 2:258/260 of 2ztlA

query
sites
2ztlA
M
 
L
K
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
V
M
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
T
M
 
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
T
E
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
A
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
D
L
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
N
D
 
G
Y
x
F
N
 
G
Q
 
D
K
 
A
S
 
A
-
 
E
L
 
I
E
 
E
D
 
K
A
 
V
K
 
R
S
 
A
E
 
G
I
 
L
I
 
A
K
 
A
E
 
Q
F
 
H
P
 
G
Q
 
-
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
L
T
 
Y
V
 
D
I
 
G
A
 
A
D
 
D
V
x
L
S
 
S
K
 
K
E
 
G
D
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
R
N
 
G
Y
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
I
F
 
L
Y
 
V
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
I
E
x
Q
G
 
-
R
 
H
Q
 
T
A
 
A
P
 
L
I
 
I
T
 
E
E
 
D
Y
 
F
D
 
P
V
 
T
D
 
E
V
 
K
F
 
W
K
 
D
K
 
A
V
 
I
I
 
L
D
 
A
I
x
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
V
 
V
Y
 
F
Y
 
H
G
 
G
M
 
T
R
 
A
Y
 
A
V
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
H
M
 
M
Q
 
K
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
G
x
H
G
 
G
I
 
L
R
 
V
G
 
A
V
 
S
L
 
A
N
 
N
Q
x
K
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
N
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
T
G
 
A
R
 
G
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
T
T
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
|
P
G
 
G
A
x
W
I
x
V
L
 
R
T
|
T
P
 
P
M
 
L
V
|
V
A
 
E
E
 
K
-
x
Q
-
 
I
-
 
S
A
 
A
F
x
L
K
 
A
Q
 
E
V
 
K
N
 
N
P
 
G
A
 
V
D
 
D
P
 
Q
K
 
E
A
 
T
A
 
A
E
 
A
S
 
R
E
 
E
-
 
L
Y
 
L
A
 
S
Q
 
E
R
 
K
N
 
Q
P
 
P
T
 
S
K
 
L
R
 
Q
L
 
F
G
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
K
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
A
N
 
A
G
 
A
Y
 
Q
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
I
 
V
A
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
 
W
S
 
T

1wmbA Crystal structure of NAD dependent d-3-hydroxybutylate dehydrogenase (see paper)
36% identity, 98% coverage: 1:254/260 of query aligns to 2:258/260 of 1wmbA

query
sites
1wmbA
M
 
L
K
 
K
N
 
G
K
 
K
V
 
V
M
 
A
I
 
V
I
 
V
T
 
T
G
 
G
A
 
S
A
 
T
M
 
S
G
|
G
L
 
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
G
A
 
I
A
 
A
K
 
T
E
 
A
L
 
L
A
 
A
S
 
A
K
 
Q
G
 
G
A
 
A
H
 
D
L
 
I
V
 
V
L
 
L
V
 
N
D
 
G
Y
 
F
N
 
G
Q
 
D
K
 
A
S
 
A
-
 
E
L
 
I
E
 
E
D
 
K
A
 
V
K
 
R
S
 
A
E
 
G
I
 
L
I
 
A
K
 
A
E
 
Q
F
 
H
P
 
G
Q
 
-
A
 
V
K
 
K
I
 
V
I
 
L
T
 
Y
V
 
D
I
 
G
A
 
A
D
 
D
V
 
L
S
 
S
K
 
K
E
 
G
D
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
R
N
 
G
Y
 
L
V
 
V
D
 
D
E
 
N
A
 
A
V
 
V
K
 
R
A
 
Q
F
 
M
G
 
G
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
I
F
 
L
Y
 
V
N
 
N
N
 
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
Q
G
 
-
R
 
H
Q
 
T
A
 
A
P
 
L
I
 
I
T
 
E
E
 
D
Y
 
F
D
 
P
V
 
T
D
 
E
V
 
K
F
 
W
K
 
D
K
 
A
V
 
I
I
 
L
D
 
A
I
 
L
N
|
N
L
 
L
M
 
S
G
 
A
V
 
V
Y
 
F
Y
 
H
G
 
G
M
 
T
R
 
A
Y
 
A
V
 
A
I
 
L
P
 
P
V
 
H
M
 
M
Q
 
K
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
I
N
 
N
V
 
I
A
 
A
S
|
S
V
 
A
G
 
H
G
 
G
I
 
L
R
 
V
G
 
A
V
 
S
L
 
A
N
 
N
Q
 
K
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
V
A
 
A
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
F
T
 
T
K
 
K
N
 
V
A
 
T
A
 
A
L
 
L
E
 
E
Y
 
T
G
 
A
R
 
G
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
T
T
 
A
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
C
P
 
P
G
 
G
A
 
W
I
 
V
L
 
R
T
 
T
P
 
P
M
 
L
V
 
V
A
 
E
E
 
K
-
 
Q
-
 
I
-
 
S
A
 
A
F
x
L
K
 
A
Q
 
E
V
 
K
N
 
N
P
 
G
A
 
V
D
 
D
P
 
Q
K
 
E
A
 
T
A
 
A
E
 
A
S
 
R
E
 
E
-
 
L
Y
 
L
A
 
S
Q
 
E
R
 
K
N
 
Q
P
 
P
T
 
S
K
 
L
R
 
Q
L
 
F
G
 
V
K
 
T
P
 
P
E
 
E
E
 
Q
V
 
L
A
 
G
K
 
G
L
 
T
V
 
A
A
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
A
N
 
A
G
 
A
Y
 
Q
V
 
I
S
 
T
G
 
G
Q
 
T
T
 
T
I
 
V
A
 
S
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G
E
x
W
S
 
T

8y83A Crystal structure of a ketoreductase from sphingobacterium siyangense sy1 with co-enzyme
39% identity, 97% coverage: 1:252/260 of query aligns to 4:245/249 of 8y83A

query
sites
8y83A
M
 
L
K
 
A
N
 
D
K
 
K
V
 
V
M
 
A
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
G
M
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
A
 
V
A
 
A
K
 
L
E
 
A
L
 
Y
A
 
G
S
 
K
K
 
E
G
 
G
A
 
A
H
 
K
L
 
V
V
 
V
L
 
I
V
 
S
D
|
D
Y
x
I
N
 
N
Q
 
-
K
 
-
S
 
-
L
 
-
E
 
E
D
 
Q
A
 
A
K
 
G
S
 
N
E
 
E
I
 
T
I
 
V
K
 
K
E
 
Q
F
 
I
P
 
E
Q
 
S
-
 
L
-
 
G
A
 
G
K
 
E
I
 
A
I
 
V
T
 
F
V
 
F
I
 
K
A
|
A
D
|
D
V
x
S
S
 
S
K
 
S
E
 
P
D
 
A
A
 
D
V
 
N
K
 
E
N
 
A
Y
 
L
V
 
V
D
 
G
E
 
Y
A
 
A
V
 
V
K
 
K
A
 
T
F
 
F
G
 
G
R
 
R
I
 
L
D
 
D
G
 
I
F
 
A
Y
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
 
G
I
 
I
E
 
G
G
 
G
R
 
E
Q
 
A
A
 
A
P
 
L
I
 
T
T
 
G
E
 
D
Y
 
Y
D
 
S
V
 
L
D
 
D
V
 
G
F
 
W
K
 
K
K
 
K
V
 
V
I
 
I
D
 
D
I
 
I
N
 
N
L
 
F
M
 
N
G
 
G
V
 
V
Y
 
F
Y
 
Y
G
 
G
M
 
C
R
 
K
Y
 
Y
V
 
Q
I
 
I
P
 
E
V
 
A
M
 
M
Q
 
E
K
 
R
Q
 
N
Q
 
G
F
 
G
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
M
A
 
A
S
 
S
V
 
I
G
 
H
G
 
G
I
 
T
R
 
V
G
 
A
V
 
A
L
 
P
N
 
M
Q
 
S
T
 
S
P
 
A
Y
|
Y
V
 
T
A
 
S
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
A
V
 
V
S
 
V
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
K
N
 
N
A
 
I
A
 
G
L
 
A
E
 
E
Y
 
Y
G
 
G
R
 
Q
D
 
K
G
 
N
I
 
I
L
 
R
T
 
C
N
 
N
A
 
A
I
 
V
A
 
G
P
|
P
G
|
G
A
x
Y
I
|
I
L
 
D
T
 
T
P
 
P
M
x
L
V
 
L
A
 
A
E
 
K
A
 
L
F
 
D
K
 
K
Q
 
E
V
 
H
N
 
I
P
 
N
A
 
A
D
 
-
P
 
-
K
 
-
A
 
-
A
 
-
E
 
-
S
 
-
E
 
-
Y
 
L
A
 
I
Q
 
S
R
 
K
N
 
H
P
 
P
T
 
I
K
 
G
R
 
R
L
 
L
G
 
G
K
 
K
P
 
A
E
 
E
E
 
E
V
 
V
A
 
A
K
 
E
L
 
L
V
 
V
A
 
L
F
 
F
L
 
L
L
 
S
S
 
S
E
 
D
D
 
K
N
 
S
G
 
S
Y
 
F
V
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
G
T
 
Y
I
 
Y
A
 
L
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

4fn4A Short-chain NAD(h)-dependent dehydrogenase/reductase from sulfolobus acidocaldarius (see paper)
36% identity, 97% coverage: 1:252/260 of query aligns to 5:250/254 of 4fn4A

query
sites
4fn4A
M
 
L
K
 
K
N
 
N
K
 
K
V
 
V
M
 
V
I
 
I
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
M
x
S
G
|
G
L
x
I
G
 
G
Y
 
R
A
 
A
A
 
I
A
 
A
K
 
K
E
 
K
L
 
F
A
 
A
S
 
L
K
 
N
G
 
D
A
 
S
H
 
I
L
 
V
V
 
V
L
 
A
V
 
V
D
x
E
Y
x
L
N
 
-
Q
 
-
K
 
-
S
 
-
L
 
L
E
 
E
D
 
D
A
x
R
K
 
L
S
 
N
E
 
Q
I
 
I
I
 
V
K
 
Q
E
 
E
F
 
L
P
 
R
Q
 
G
A
 
M
-
 
G
-
 
K
K
 
E
I
 
V
I
 
L
T
 
G
V
 
V
I
 
K
A
|
A
D
|
D
V
|
V
S
 
S
K
 
K
E
 
K
D
 
K
A
 
D
V
 
V
K
 
E
N
 
E
Y
 
F
V
 
V
D
 
R
E
 
R
A
 
T
V
 
F
K
 
E
A
 
T
F
 
Y
G
 
S
R
 
R
I
 
I
D
 
D
G
 
V
F
 
L
Y
 
C
N
 
N
N
|
N
A
 
A
G
|
G
I
|
I
E
 
M
G
 
D
R
 
G
Q
 
V
A
 
T
P
 
P
I
 
V
T
 
A
E
 
E
Y
 
V
D
 
S
V
 
D
D
 
E
V
 
L
F
 
W
K
 
E
K
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
A
I
 
V
N
 
N
L
 
L
M
 
Y
G
 
S
V
 
A
Y
 
F
Y
 
Y
G
 
S
M
 
S
R
 
R
Y
 
A
V
 
V
I
 
I
P
 
P
V
 
I
M
 
M
Q
 
L
K
 
K
Q
 
Q
Q
 
G
F
 
K
G
 
G
R
 
V
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
V
 
I
G
 
A
G
 
G
I
 
I
R
 
R
G
 
G
V
 
G
L
 
F
N
 
A
Q
 
G
T
 
A
P
 
P
Y
|
Y
V
 
T
A
 
V
S
 
A
K
|
K
H
 
H
A
 
G
V
 
L
S
 
I
G
 
G
M
 
L
T
 
T
K
 
R
N
 
S
A
 
I
A
 
A
L
 
A
E
 
H
Y
 
Y
G
 
G
R
 
D
D
 
Q
G
 
G
I
 
I
L
 
R
T
 
A
N
 
V
A
 
A
I
 
V
A
 
L
P
|
P
G
 
G
A
 
T
I
x
V
L
 
K
T
|
T
P
 
-
M
 
-
V
 
-
A
 
-
E
 
-
A
 
-
F
 
-
K
 
-
Q
 
-
V
 
-
N
|
N
P
x
I
A
 
G
D
 
L
P
 
G
K
 
S
A
 
S
A
 
K
E
 
P
S
|
S
E
 
E
Y
 
L
A
 
G
Q
 
M
R
 
R
N
 
T
P
 
L
T
 
T
K
 
K
-
 
L
-
 
M
-
 
S
-
 
L
-
 
S
-
 
S
R
 
R
L
 
L
G
 
A
K
 
E
P
 
P
E
 
E
E
 
D
V
 
I
A
 
A
K
 
N
L
 
V
V
 
I
A
 
V
F
 
F
L
 
L
L
 
A
S
 
S
E
 
D
D
 
E
N
 
A
G
 
S
Y
 
F
V
 
V
S
 
N
G
 
G
Q
 
D
T
 
A
I
 
V
A
 
V
I
 
V
D
 
D
G
 
G
G
 
G

1zemA Crystal structure of NAD+-bound xylitol dehydrogenase (see paper)
35% identity, 96% coverage: 4:252/260 of query aligns to 6:260/260 of 1zemA

query
sites
1zemA
K
 
K
V
 
V
M
 
C
I
 
L
I
 
V
T
 
T
G
|
G
A
 
A
A
 
G
M
x
G
G
x
N
L
x
I
G
 
G
Y
 
L
A
 
A
A
 
T
A
 
A
K
 
L
E
 
R
L
 
L
A
 
A
S
 
E
K
 
E
G
 
G
A
 
T
H
 
A
L
 
I
V
 
A
L
 
L
V
 
L
D
|
D
Y
x
M
N
 
N
Q
 
R
K
 
E
S
 
A
L
 
L
E
 
E
D
 
K
A
 
A
K
 
E
S
 
A
E
 
S
I
 
V
I
 
R
K
 
E
E
 
K
F
 
G
P
 
V
Q
 
E
A
 
A
K
 
R
I
 
-
I
 
-
T
 
S
V
 
Y
I
 
V
A
 
C
D
|
D
V
|
V
S
 
T
K
 
S
E
 
E
D
 
E
A
 
A
V
 
V
K
 
I
N
 
G
Y
 
T
V
 
V
D
 
D
E
 
S
A
 
V
V
 
V
K
 
R
A
 
D
F
 
F
G
 
G
R
 
K
I
 
I
D
 
D
G
 
F
F
 
L
Y
 
F
N
 
N
N
|
N
A
|
A
G
|
G
I
 
Y
E
 
Q
G
 
G
R
 
A
Q
 
F
A
 
A
P
 
P
I
 
V
T
 
Q
E
 
D
Y
 
Y
D
 
P
V
 
S
D
 
D
V
 
D
F
 
F
K
 
A
K
 
R
V
 
V
I
 
L
D
 
T
I
 
I
N
 
N
L
 
V
M
 
T
G
 
G
V
 
A
Y
 
F
Y
 
H
G
 
V
M
 
L
R
 
K
Y
 
A
V
 
V
I
 
S
P
 
R
V
 
Q
M
 
M
Q
 
I
K
 
T
Q
 
Q
Q
 
N
F
 
Y
G
 
G
R
 
R
I
 
I
V
 
V
N
 
N
V
x
T
A
 
A
S
|
S
V
 
M
G
 
A
G
 
G
I
 
V
R
 
K
G
 
G
V
 
P
L
 
P
N
 
N
Q
 
M
T
 
A
P
 
A
Y
|
Y
V
 
G
A
 
T
S
 
S
K
|
K
H
 
G
A
 
A
V
 
I
S
 
I
G
 
A
M
 
L
T
 
T
K
 
E
N
 
T
A
 
A
A
 
A
L
 
L
E
 
D
Y
 
L
G
 
A
R
 
P
D
 
Y
G
 
N
I
 
I
L
 
R
T
 
V
N
 
N
A
 
A
I
 
I
A
 
S
P
|
P
G
 
G
A
 
Y
I
x
M
-
 
G
-
 
P
-
 
G
-
 
F
-
 
M
-
 
W
-
 
E
-
 
R
L
 
Q
T
 
V
P
 
E
M
 
L
V
 
Q
A
 
A
E
 
K
A
 
V
F
 
G
K
 
S
Q
 
Q
V
 
Y
N
 
F
P
 
S
A
 
T
D
|
D
P
 
P
K
 
K
A
 
V
A
 
V
E
 
A
S
 
Q
E
 
Q
Y
 
M
A
 
I
Q
 
G
R
 
S
N
 
V
P
 
P
T
 
M
K
 
R
R
 
R
L
 
Y
G
 
G
K
 
D
P
 
I
E
 
N
E
 
E
V
 
I
A
 
P
K
 
G
L
 
V
V
 
V
A
 
A
F
 
F
L
 
L
L
 
L
S
 
G
E
 
D
D
 
D
N
 
S
G
 
S
Y
 
F
V
 
M
S
 
T
G
 
G
Q
 
V
T
 
N
I
 
L
A
 
P
I
 
I
D
 
A
G
 
G
G
 
G

7pcsB Structure of the heterotetrameric sdr family member bbscd (see paper)
36% identity, 99% coverage: 1:258/260 of query aligns to 2:247/247 of 7pcsB

query
sites
7pcsB
M
 
I
K
 
Q
N
 
N
K
 
R
V
 
V
M
 
A
I
 
L
I
 
I
T
 
T
G
|
G
A
 
S
A
 
A
M
 
S
G
 
G
L
x
M
G
 
G
Y
 
K
A
 
Q
A
 
T
A
 
A
K
 
L
E
 
R
L
 
F
A
 
A
S